AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0280007178.01

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MsG0280007178.01.T01 AT3G12770 23.789 227 166 5 104 326 94 317 6.66e-13 71.6
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MsG0280007178.01.T01 AT3G22690 30.513 390 237 4 111 483 451 823 5.33e-50 184
MsG0280007178.01.T01 AT5G50990 29.480 346 238 3 139 483 175 515 5.99e-50 179
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MsG0280007178.01.T01 AT1G08070 21.296 216 168 2 101 315 134 348 1.16e-14 77.0
MsG0280007178.01.T01 AT5G52630 31.073 354 232 4 135 483 223 569 2.74e-48 176
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MsG0280007178.01.T01 AT1G11290 23.774 265 185 6 101 362 309 559 1.36e-12 70.9
MsG0280007178.01.T01 AT1G11290 25.424 236 141 7 104 307 79 311 2.42e-12 70.1
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MsG0280007178.01.T01 AT1G08070 30.252 357 242 4 133 485 371 724 9.84e-48 176
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MsG0280007178.01.T01 AT4G18750 28.831 385 270 3 101 483 470 852 3.87e-47 176
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MsG0280007178.01.T01 AT1G18485 24.490 196 138 3 135 326 502 691 5.75e-11 65.9
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MsG0280007178.01.T01 AT3G13770 27.035 344 246 4 145 485 270 611 4.47e-43 162
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MsG0280007178.01.T01 AT2G42920 31.004 229 158 0 101 329 230 458 3.07e-42 158
MsG0280007178.01.T01 AT2G42920 23.636 165 121 3 168 332 196 355 1.22e-11 67.4
MsG0280007178.01.T01 AT4G37170 28.371 356 240 6 135 483 325 672 4.92e-42 159
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MsG0280007178.01.T01 AT5G44230 27.182 401 253 9 104 483 256 638 1.10e-40 155
MsG0280007178.01.T01 AT5G46460 28.483 323 215 5 168 483 365 678 2.06e-40 155
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MsG0280007178.01.T01 AT1G34160 27.044 159 108 2 170 328 103 253 1.16e-14 77.0
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MsG0280007178.01.T01 AT2G13600 30.043 233 157 1 104 330 361 593 3.51e-37 145
MsG0280007178.01.T01 AT1G28690 30.172 232 161 1 101 331 244 475 4.55e-37 143
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MsG0280007178.01.T01 AT3G53360 31.333 300 178 6 134 415 478 767 7.40e-37 145
MsG0280007178.01.T01 AT3G53360 25.000 224 152 6 99 317 36 248 3.13e-16 82.4
MsG0280007178.01.T01 AT4G21300 26.648 349 233 6 113 455 526 857 8.57e-37 145
MsG0280007178.01.T01 AT4G21300 21.698 212 164 2 101 312 413 622 5.59e-11 65.9
MsG0280007178.01.T01 AT5G13270 28.049 328 206 6 170 486 428 736 2.64e-36 143
MsG0280007178.01.T01 AT3G15930 26.708 322 233 2 101 421 340 659 3.95e-36 142
MsG0280007178.01.T01 AT1G06140 26.006 323 216 4 13 331 211 514 6.82e-36 140
MsG0280007178.01.T01 AT3G13770 25.731 342 220 5 145 485 270 578 9.37e-36 140
MsG0280007178.01.T01 AT4G19191 27.988 343 217 7 101 431 329 653 1.80e-35 140
MsG0280007178.01.T01 AT4G15720 25.253 396 279 5 101 483 206 597 2.71e-35 139
MsG0280007178.01.T01 AT5G65570 26.648 349 245 6 139 483 378 719 3.88e-35 140
MsG0280007178.01.T01 AT3G56550 26.703 367 241 4 133 485 212 564 8.12e-35 137
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MsG0280007178.01.T01 AT3G09040 29.502 261 181 2 72 329 698 958 1.27e-34 139
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MsG0280007178.01.T01 AT3G02330 30.102 196 136 1 135 329 609 804 9.48e-27 115
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MsG0280007178.01.T01 AT1G53600 28.729 181 124 1 149 329 463 638 1.56e-25 110
MsG0280007178.01.T01 AT5G42450 30.539 167 111 3 168 329 182 348 3.15e-25 108
MsG0280007178.01.T01 AT4G25270 27.391 230 160 3 101 329 268 491 3.37e-25 109
MsG0280007178.01.T01 AT4G31070 25.442 283 202 4 51 329 287 564 3.65e-25 109
MsG0280007178.01.T01 AT4G31070 25.442 283 202 4 51 329 287 564 3.65e-25 109
MsG0280007178.01.T01 AT1G03540 25.217 230 167 2 101 329 338 563 4.26e-25 109
MsG0280007178.01.T01 AT5G42450 30.539 167 111 3 168 329 266 432 5.04e-25 108
MsG0280007178.01.T01 AT1G64310 27.948 229 159 2 101 326 280 505 5.45e-25 108
MsG0280007178.01.T01 AT1G56570 22.293 314 237 5 112 421 296 606 6.64e-25 108
MsG0280007178.01.T01 AT1G56570 22.293 314 237 5 112 421 296 606 6.64e-25 108
MsG0280007178.01.T01 AT3G18970 29.381 194 133 2 145 336 236 427 6.85e-25 107
MsG0280007178.01.T01 AT4G38010 26.341 205 149 2 111 313 287 491 8.74e-25 108
MsG0280007178.01.T01 AT4G38010 26.636 214 151 4 101 313 179 387 2.24e-17 85.5
MsG0280007178.01.T01 AT1G26900 24.891 229 166 2 101 323 300 528 1.83e-24 107
MsG0280007178.01.T01 AT1G26900 22.120 217 157 4 101 312 199 408 1.82e-11 67.0
MsG0280007178.01.T01 AT3G04750 28.261 230 158 3 105 331 346 571 3.48e-24 106
MsG0280007178.01.T01 AT2G36980 25.957 235 170 1 101 331 157 391 3.76e-24 105
MsG0280007178.01.T01 AT2G04860 28.571 224 159 1 106 328 425 648 3.96e-24 106
MsG0280007178.01.T01 AT3G58590 29.146 199 139 2 111 308 527 724 4.14e-24 106
MsG0280007178.01.T01 AT2G36980 26.068 234 169 1 101 330 309 542 5.23e-24 106
MsG0280007178.01.T01 AT2G46050 27.632 228 164 1 104 331 317 543 5.27e-24 105
MsG0280007178.01.T01 AT2G46050 23.404 235 171 5 101 332 215 443 2.47e-12 69.7
MsG0280007178.01.T01 AT2G36980 25.957 235 170 1 101 331 300 534 5.85e-24 105
MsG0280007178.01.T01 AT4G19220 25.455 220 163 1 111 329 680 899 1.56e-23 105
MsG0280007178.01.T01 AT4G19220 23.868 243 170 7 112 348 582 815 2.27e-13 73.6
MsG0280007178.01.T01 AT3G26540 27.660 188 136 0 135 322 502 689 1.65e-23 104
MsG0280007178.01.T01 AT4G04370 24.771 218 164 0 126 343 445 662 1.92e-23 104
MsG0280007178.01.T01 AT1G10330 27.551 196 133 2 172 362 266 457 2.17e-23 103
MsG0280007178.01.T01 AT1G71490 26.756 299 209 5 135 431 387 677 3.76e-23 103
MsG0280007178.01.T01 AT1G69350 27.928 222 146 3 101 316 477 690 3.81e-23 103
MsG0280007178.01.T01 AT3G63370 27.354 223 162 0 107 329 565 787 4.42e-23 103
MsG0280007178.01.T01 AT3G63370 24.171 211 155 3 105 314 59 265 2.43e-12 70.1
MsG0280007178.01.T01 AT3G51320 28.431 204 141 2 135 335 256 457 7.02e-23 102
MsG0280007178.01.T01 AT5G55740 26.522 230 168 1 101 329 518 747 7.93e-23 102
MsG0280007178.01.T01 AT5G55740 23.438 192 146 1 101 292 347 537 9.98e-13 71.2
MsG0280007178.01.T01 AT1G09220 27.234 235 166 4 101 330 227 461 1.38e-22 101
MsG0280007178.01.T01 AT2G39620 26.697 221 159 1 112 329 584 804 1.41e-22 102
MsG0280007178.01.T01 AT2G39620 21.296 216 167 2 101 315 373 586 7.92e-13 71.6
MsG0280007178.01.T01 AT3G25970 25.991 227 167 1 104 329 383 609 1.66e-22 101
MsG0280007178.01.T01 AT3G25970 21.078 204 158 2 111 312 287 489 2.74e-11 66.6
MsG0280007178.01.T01 AT1G09190 24.242 231 173 2 101 329 206 436 3.10e-22 100
MsG0280007178.01.T01 AT3G21470 24.000 225 170 1 101 325 246 469 1.93e-21 97.8
MsG0280007178.01.T01 AT3G20730 23.767 223 167 2 112 331 300 522 2.46e-21 97.8
MsG0280007178.01.T01 AT4G32430 26.882 186 136 0 144 329 489 674 5.02e-21 97.4
MsG0280007178.01.T01 AT4G32430 26.882 186 136 0 144 329 357 542 7.50e-21 96.3
MsG0280007178.01.T01 AT4G22760 26.407 231 165 5 104 330 304 533 1.05e-20 95.9
MsG0280007178.01.T01 AT3G50420 28.646 192 135 2 139 329 513 703 2.08e-20 95.5
MsG0280007178.01.T01 AT5G39350 21.654 254 188 2 80 329 378 624 2.76e-20 94.7
MsG0280007178.01.T01 AT5G39350 26.816 179 124 3 140 318 128 299 8.94e-11 64.7
MsG0280007178.01.T01 AT1G22830 28.571 196 135 2 168 362 463 654 6.73e-20 93.6
MsG0280007178.01.T01 AT1G22830 28.571 196 135 2 168 362 463 654 6.73e-20 93.6
MsG0280007178.01.T01 AT2G44880 24.522 314 223 5 104 411 288 593 7.86e-20 93.2
MsG0280007178.01.T01 AT2G44880 24.522 314 223 5 104 411 287 592 8.13e-20 93.2
MsG0280007178.01.T01 AT2G44880 25.000 316 219 6 104 411 248 553 9.29e-20 92.8
MsG0280007178.01.T01 AT2G44880 24.522 314 223 5 104 411 289 594 9.42e-20 92.8
MsG0280007178.01.T01 AT2G44880 24.522 314 223 5 104 411 289 594 9.42e-20 92.8
MsG0280007178.01.T01 AT2G44880 24.522 314 223 5 104 411 291 596 1.10e-19 92.8
MsG0280007178.01.T01 AT2G02750 26.724 232 165 3 101 329 340 569 2.72e-19 91.7
MsG0280007178.01.T01 AT2G37310 25.000 188 141 0 142 329 379 566 6.38e-19 90.5
MsG0280007178.01.T01 AT3G26630 24.365 197 148 1 101 296 223 419 1.43e-18 88.6
MsG0280007178.01.T01 AT5G08490 24.262 305 180 5 111 408 550 810 2.51e-18 89.0
MsG0280007178.01.T01 AT2G17210 23.832 214 143 6 99 309 433 629 3.59e-17 85.1
MsG0280007178.01.T01 AT1G47580 42.553 94 54 0 390 483 127 220 1.06e-16 80.1
MsG0280007178.01.T01 AT3G18840 24.199 281 211 2 133 412 397 676 2.13e-16 82.8
MsG0280007178.01.T01 AT3G18840 24.199 281 211 2 133 412 397 676 2.13e-16 82.8
MsG0280007178.01.T01 AT5G66500 26.471 170 116 4 168 329 320 488 3.54e-16 81.6
MsG0280007178.01.T01 AT2G35030 22.870 223 163 3 111 327 309 528 9.18e-16 80.5
MsG0280007178.01.T01 AT3G50420 32.800 125 82 2 206 329 555 678 5.54e-15 78.2
MsG0280007178.01.T01 AT1G71460 23.784 185 141 0 101 285 491 675 4.75e-14 75.1
MsG0280007178.01.T01 AT5G47460 31.206 141 95 2 170 308 361 501 1.05e-13 73.9
MsG0280007178.01.T01 AT5G47460 24.046 262 183 5 88 344 19 269 6.49e-13 71.6
MsG0280007178.01.T01 AT4G18520 20.690 203 153 3 106 305 362 559 6.03e-12 68.6
MsG0280007178.01.T01 AT4G18520 24.631 203 139 6 135 330 290 485 1.98e-11 67.0

Find 104 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 136 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CCTGATGGCCAAATGTTTAT+TGG 0.169942 2:-11498156 MsG0280007178.01.T01:CDS
GAACATCCTCTTTGCTTTCC+TGG 0.226806 2:+11497569 None:intergenic
ATCTTCTGCAAACCCATTCT+TGG 0.249838 2:+11498221 None:intergenic
GTGATACCTGCTATTTCTTA+TGG 0.251194 2:-11497532 MsG0280007178.01.T01:CDS
AAAATCCATGCTTTGCTTAG+AGG 0.260040 2:-11497658 MsG0280007178.01.T01:CDS
CTGATGGCCAAATGTTTATT+GGG 0.265406 2:-11498155 MsG0280007178.01.T01:CDS
ATGAATAGTTGCAGAATTCA+TGG 0.276641 2:-11497925 MsG0280007178.01.T01:CDS
AGAGTGCAAATGAAAGAAAT+TGG 0.291305 2:-11497631 MsG0280007178.01.T01:CDS
GTGATTCTGATTTACTCTAA+TGG 0.306649 2:+11497483 None:intergenic
CTGAAGTTTCTCCAAGTAAA+AGG 0.315073 2:+11497755 None:intergenic
CTTTCACTTGGAGAAACTTC+AGG 0.318277 2:-11497820 MsG0280007178.01.T01:CDS
CTATTTGCACTGCTGCTAAA+AGG 0.321199 2:-11498713 MsG0280007178.01.T01:CDS
TCTCTACTAGACTGACATAA+TGG 0.325760 2:+11498037 None:intergenic
TATGTCATGCAACACATATT+TGG 0.327223 2:+11497594 None:intergenic
TGATTCTGATTTACTCTAAT+GGG 0.345625 2:+11497484 None:intergenic
CCAATAAACATTTGGCCATC+AGG 0.346033 2:+11498156 None:intergenic
AACTCATCGTCCGAGCTAAA+AGG 0.347908 2:-11497402 MsG0280007178.01.T01:intron
TGGAACCAAGTGTAGAGATA+TGG 0.352085 2:-11497957 MsG0280007178.01.T01:CDS
CGATCTTAGAAATAATCTTC+AGG 0.366624 2:+11497434 None:intergenic
ATTCATGGAAACACCGAGTT+GGG 0.372168 2:-11497910 MsG0280007178.01.T01:CDS
CAGGGCCGTCCCTGAGAATT+CGG 0.383539 2:-11497203 MsG0280007178.01.T01:CDS
AGAATTCGGAGGCTCGGCTC+TGG 0.408724 2:-11497189 MsG0280007178.01.T01:CDS
ATCTCTACACTTGGTTCCAT+TGG 0.419468 2:+11497961 None:intergenic
AGCCGAGCCTCCGAATTCTC+AGG 0.422786 2:+11497193 None:intergenic
TAGAGATGATTGCTAGTATT+GGG 0.422876 2:-11498020 MsG0280007178.01.T01:CDS
GAATCCATGAGCAAGGACTA+TGG 0.425098 2:-11498078 MsG0280007178.01.T01:CDS
CTCTACTAGACTGACATAAT+GGG 0.425756 2:+11498038 None:intergenic
TTTGGTGCATGTAGTATGTT+GGG 0.431692 2:-11498129 MsG0280007178.01.T01:CDS
TTATCATGCGGATGATTCTT+CGG 0.433577 2:-11498667 MsG0280007178.01.T01:CDS
CATGATAACCACCAGAAAAT+CGG 0.434687 2:+11498682 None:intergenic
ACAATGCAACTCGCCAAGAA+TGG 0.436945 2:-11498234 MsG0280007178.01.T01:CDS
GCAACATTTGCATCCACTTA+CGG 0.439270 2:-11498370 MsG0280007178.01.T01:CDS
CTGAGTACGATTTGACTACT+TGG 0.442508 2:-11498266 MsG0280007178.01.T01:CDS
GAGAAGATCCACTAGCCCTT+TGG 0.446547 2:+11498610 None:intergenic
TTATGGTCTCCTTAACAGTA+AGG 0.449604 2:-11497515 MsG0280007178.01.T01:CDS
GTTAAAGCTGGCCTTTCACT+TGG 0.466819 2:-11497832 MsG0280007178.01.T01:CDS
GTAGAGATGATTGCTAGTAT+TGG 0.468314 2:-11498021 MsG0280007178.01.T01:CDS
TTGTTTGTGCTAACCGTAAG+TGG 0.471457 2:+11498357 None:intergenic
TTCAGGGCAGTATGACAATC+AGG 0.471490 2:+11497451 None:intergenic
GCAAATAGCCCTGGACGTAT+TGG 0.475589 2:+11498728 None:intergenic
TGCTGAACTAGTTCAGAAGT+TGG 0.479067 2:-11497878 MsG0280007178.01.T01:CDS
GATTATCAACAAAATCGTGC+TGG 0.483569 2:-11498645 MsG0280007178.01.T01:CDS
CAATGCAACTCGCCAAGAAT+GGG 0.485644 2:-11498233 MsG0280007178.01.T01:CDS
TGCAATTAATGCACATTTGT+GGG 0.485859 2:-11498440 MsG0280007178.01.T01:CDS
GGAACCAAGTGTAGAGATAT+GGG 0.489386 2:-11497956 MsG0280007178.01.T01:CDS
CTGACATAATGGGCCATTGT+TGG 0.494233 2:+11498048 None:intergenic
GATCTTAGAAATAATCTTCA+GGG 0.497840 2:+11497435 None:intergenic
GATCACGAACCTTACTGTTA+AGG 0.502744 2:+11497506 None:intergenic
TCCCTGAGAATTCGGAGGCT+CGG 0.507432 2:-11497195 MsG0280007178.01.T01:CDS
AGCAGCAGTGCAAATAGCCC+TGG 0.509545 2:+11498719 None:intergenic
TGCACTGCTGCTAAAAGGTG+GGG 0.512761 2:-11498708 MsG0280007178.01.T01:CDS
TGGGCATCTTGATGAAGCCT+TGG 0.514203 2:-11498001 MsG0280007178.01.T01:CDS
GAATTCGGAGGCTCGGCTCT+GGG 0.516262 2:-11497188 MsG0280007178.01.T01:CDS
TTGCACTGCTGCTAAAAGGT+GGG 0.521717 2:-11498709 MsG0280007178.01.T01:CDS
TACTATAACCAAAGGGCTAG+TGG 0.524890 2:-11498618 MsG0280007178.01.T01:CDS
TCAAAGGCACCAATACGTCC+AGG 0.527841 2:-11498737 MsG0280007178.01.T01:CDS
TAGCACAAACAATAGAGTAT+TGG 0.530010 2:-11498346 MsG0280007178.01.T01:CDS
GTCTCCCATATCTCTACACT+TGG 0.533129 2:+11497952 None:intergenic
GAAGATTATTTCTAAGATCG+TGG 0.535676 2:-11497431 MsG0280007178.01.T01:CDS
TTGCAATTAATGCACATTTG+TGG 0.538970 2:-11498441 MsG0280007178.01.T01:CDS
TTGAATGAGAAAGTTAAAGC+TGG 0.548718 2:-11497844 MsG0280007178.01.T01:CDS
TATGACAATCAGGACGAAAA+CGG 0.550462 2:+11497461 None:intergenic
CGGAGCATAATCATTAAAGC+TGG 0.554130 2:-11497778 MsG0280007178.01.T01:CDS
TTGCAGGGATGGTAAAGTGA+AGG 0.555790 2:-11498526 MsG0280007178.01.T01:CDS
AATTCATGGAAACACCGAGT+TGG 0.558442 2:-11497911 MsG0280007178.01.T01:CDS
TGGGAAGGCTAAGTCTCTTG+AGG 0.560690 2:-11498421 MsG0280007178.01.T01:CDS
ACTTTCTCATTCAAACGAGA+AGG 0.561195 2:+11497853 None:intergenic
AAGATTATTTCTAAGATCGT+GGG 0.562809 2:-11497430 MsG0280007178.01.T01:CDS
TTTGCACTGCTGCTAAAAGG+TGG 0.566739 2:-11498710 MsG0280007178.01.T01:CDS
AGCCTCCGAATTCTCAGGGA+CGG 0.567688 2:+11497198 None:intergenic
CGATATTCTATGATTATGCT+CGG 0.568602 2:+11497712 None:intergenic
AGGAGACCATAAGAAATAGC+AGG 0.568707 2:+11497526 None:intergenic
GTTCATTGAAAAGATGCCAA+TGG 0.571820 2:-11497977 MsG0280007178.01.T01:CDS
AATGCCATAGTCCTTGCTCA+TGG 0.573028 2:+11498074 None:intergenic
CTTTGATACAGTTCACAACA+TGG 0.573429 2:+11498754 None:intergenic
CTGAAGTTTCTCCAAGTGAA+AGG 0.579493 2:+11497821 None:intergenic
ATTAATGCACATTTGTGGGA+AGG 0.583342 2:-11498436 MsG0280007178.01.T01:CDS
TTCATGGAAACACCGAGTTG+GGG 0.584082 2:-11497909 MsG0280007178.01.T01:CDS
CATGTTGTGAACTGTATCAA+AGG 0.584495 2:-11498753 MsG0280007178.01.T01:CDS
TCAAACCTCTAAGCAAAGCA+TGG 0.587135 2:+11497653 None:intergenic
CTGGGTTGTACTATAACCAA+AGG 0.598034 2:-11498626 MsG0280007178.01.T01:CDS
ATTATCAACAAAATCGTGCT+GGG 0.600193 2:-11498644 MsG0280007178.01.T01:CDS
GGAAAAGCTTCATATTCATG+TGG 0.602740 2:-11498478 MsG0280007178.01.T01:CDS
TGATGGCCAAATGTTTATTG+GGG 0.605126 2:-11498154 MsG0280007178.01.T01:CDS
CAAGTAGTCAAATCGTACTC+AGG 0.605229 2:+11498267 None:intergenic
TGGGTTGTACTATAACCAAA+GGG 0.613562 2:-11498625 MsG0280007178.01.T01:CDS
GCACTTTGAATCCATGAGCA+AGG 0.615926 2:-11498085 MsG0280007178.01.T01:CDS
AATAGCAGGTATCACACCGC+GGG 0.617251 2:+11497540 None:intergenic
ATGTTGGGAGATATTAGTGA+GGG 0.618493 2:-11498114 MsG0280007178.01.T01:CDS
TATGTTGGGAGATATTAGTG+AGG 0.619219 2:-11498115 MsG0280007178.01.T01:CDS
GAGGATGTTCTCTTTGCCCG+CGG 0.623476 2:-11497556 MsG0280007178.01.T01:CDS
AACATGGGACTAAAACCTGA+TGG 0.629519 2:-11498171 MsG0280007178.01.T01:CDS
CATAGACCAGGAAAGCAAAG+AGG 0.634855 2:-11497575 MsG0280007178.01.T01:CDS
GCCGAGCCTCCGAATTCTCA+GGG 0.636149 2:+11497194 None:intergenic
GGCCGTCCCTGAGAATTCGG+AGG 0.643902 2:-11497200 MsG0280007178.01.T01:CDS
CTATGGCATTGTACCAACAA+TGG 0.644489 2:-11498061 MsG0280007178.01.T01:CDS
TGTGTTGCATGACATAGACC+AGG 0.659454 2:-11497587 MsG0280007178.01.T01:CDS
GCTTTACAAGCAAATATACT+CGG 0.659836 2:-11497798 MsG0280007178.01.T01:CDS
TCATGGAAACACCGAGTTGG+GGG 0.663429 2:-11497908 MsG0280007178.01.T01:CDS
AGTTCAAATAGTTCGTACAA+AGG 0.664954 2:-11498573 MsG0280007178.01.T01:CDS
CAAAGGCACCAATACGTCCA+GGG 0.665660 2:-11498736 MsG0280007178.01.T01:CDS
GAAGGCTAAGTCTCTTGAGG+AGG 0.679340 2:-11498418 MsG0280007178.01.T01:CDS
ATAATCATAGAATATCGAGA+CGG 0.685698 2:-11497706 MsG0280007178.01.T01:CDS
AAATAGCAGGTATCACACCG+CGG 0.755669 2:+11497539 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ATTTACTCAATTTAAAAACA+TGG - Chr2:11497833-11497852 MsG0280007178.01.T01:CDS 15.0%
!! TTTACTCAATTTAAAAACAT+GGG - Chr2:11497834-11497853 MsG0280007178.01.T01:CDS 15.0%
!!! TTTTTTTTGAATATTAACCT+AGG - Chr2:11498679-11498698 MsG0280007178.01.T01:CDS 15.0%
!! AACTTTATATATCTATAACC+AGG - Chr2:11498798-11498817 MsG0280007178.01.T01:CDS 20.0%
!! ACTTTATATATCTATAACCA+GGG - Chr2:11498799-11498818 MsG0280007178.01.T01:CDS 20.0%
! ATAATCATAGAATATCGAGA+CGG - Chr2:11498314-11498333 MsG0280007178.01.T01:CDS 25.0%
! GATCTTAGAAATAATCTTCA+GGG + Chr2:11498588-11498607 None:intergenic 25.0%
! TGATTCTGATTTACTCTAAT+GGG + Chr2:11498539-11498558 None:intergenic 25.0%
! TTTAACTATCAAAGATACCT+AGG + Chr2:11498699-11498718 None:intergenic 25.0%
!! GGATTTTATCATTTTCTAGA+TGG + Chr2:11498349-11498368 None:intergenic 25.0%
!!! AAGATTATTTCTAAGATCGT+GGG - Chr2:11498590-11498609 MsG0280007178.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATTTTAGTCAAAGACAATCA+TGG + Chr2:11498751-11498770 None:intergenic 25.0%
AGAGTGCAAATGAAAGAAAT+TGG - Chr2:11498389-11498408 MsG0280007178.01.T01:CDS 30.0%
AGTTCAAATAGTTCGTACAA+AGG - Chr2:11497447-11497466 MsG0280007178.01.T01:CDS 30.0%
ATGAATAGTTGCAGAATTCA+TGG - Chr2:11498095-11498114 MsG0280007178.01.T01:CDS 30.0%
ATTATCAACAAAATCGTGCT+GGG - Chr2:11497376-11497395 MsG0280007178.01.T01:intron 30.0%
CAAAAACCCCAATAAACATT+TGG + Chr2:11497875-11497894 None:intergenic 30.0%
CGATATTCTATGATTATGCT+CGG + Chr2:11498311-11498330 None:intergenic 30.0%
CGATCTTAGAAATAATCTTC+AGG + Chr2:11498589-11498608 None:intergenic 30.0%
GCTTTACAAGCAAATATACT+CGG - Chr2:11498222-11498241 MsG0280007178.01.T01:CDS 30.0%
GTGATTCTGATTTACTCTAA+TGG + Chr2:11498540-11498559 None:intergenic 30.0%
TAGAGATGATTGCTAGTATT+GGG - Chr2:11498000-11498019 MsG0280007178.01.T01:CDS 30.0%
TAGCACAAACAATAGAGTAT+TGG - Chr2:11497674-11497693 MsG0280007178.01.T01:CDS 30.0%
TATGTCATGCAACACATATT+TGG + Chr2:11498429-11498448 None:intergenic 30.0%
TGCAATTAATGCACATTTGT+GGG - Chr2:11497580-11497599 MsG0280007178.01.T01:CDS 30.0%
TTGAATGAGAAAGTTAAAGC+TGG - Chr2:11498176-11498195 MsG0280007178.01.T01:CDS 30.0%
TTGCAATTAATGCACATTTG+TGG - Chr2:11497579-11497598 MsG0280007178.01.T01:CDS 30.0%
! AAGAACTAGATAGTTTTTGC+AGG - Chr2:11497478-11497497 MsG0280007178.01.T01:CDS 30.0%
! AATTGAAGTTTTGCAAGTGT+TGG - Chr2:11497521-11497540 MsG0280007178.01.T01:CDS 30.0%
! AGAACTAGATAGTTTTTGCA+GGG - Chr2:11497479-11497498 MsG0280007178.01.T01:CDS 30.0%
! CAAATGTTTATTGGGGTTTT+TGG - Chr2:11497873-11497892 MsG0280007178.01.T01:CDS 30.0%
!! AGCATAGCCCATTTTTAAAA+TGG + Chr2:11498649-11498668 None:intergenic 30.0%
!! AGGTTCCACCATTTTAAAAA+TGG - Chr2:11498638-11498657 MsG0280007178.01.T01:CDS 30.0%
!! GAAGATTATTTCTAAGATCG+TGG - Chr2:11498589-11498608 MsG0280007178.01.T01:CDS 30.0%
!! GGTTCCACCATTTTAAAAAT+GGG - Chr2:11498639-11498658 MsG0280007178.01.T01:CDS 30.0%
!! TTACAGTTAGTTCTCTTTTG+AGG - Chr2:11497220-11497239 MsG0280007178.01.T01:intron 30.0%
!! TTGGAGATGTATTTTGAATG+TGG - Chr2:11497693-11497712 MsG0280007178.01.T01:CDS 30.0%
!!! ATAGCCCATTTTTAAAATGG+TGG + Chr2:11498646-11498665 None:intergenic 30.0%
AAAATCCATGCTTTGCTTAG+AGG - Chr2:11498362-11498381 MsG0280007178.01.T01:CDS 35.0%
ACTTTCTCATTCAAACGAGA+AGG + Chr2:11498170-11498189 None:intergenic 35.0%
ATGTTGGGAGATATTAGTGA+GGG - Chr2:11497906-11497925 MsG0280007178.01.T01:CDS 35.0%
ATTAATGCACATTTGTGGGA+AGG - Chr2:11497584-11497603 MsG0280007178.01.T01:CDS 35.0%
CATGATAACCACCAGAAAAT+CGG + Chr2:11497341-11497360 None:intergenic 35.0%
CATGTTGTGAACTGTATCAA+AGG - Chr2:11497267-11497286 MsG0280007178.01.T01:intron 35.0%
CTCTACTAGACTGACATAAT+GGG + Chr2:11497985-11498004 None:intergenic 35.0%
CTGAAGTTTCTCCAAGTAAA+AGG + Chr2:11498268-11498287 None:intergenic 35.0%
CTGATGGCCAAATGTTTATT+GGG - Chr2:11497865-11497884 MsG0280007178.01.T01:CDS 35.0%
CTTTGATACAGTTCACAACA+TGG + Chr2:11497269-11497288 None:intergenic 35.0%
GATTATCAACAAAATCGTGC+TGG - Chr2:11497375-11497394 MsG0280007178.01.T01:intron 35.0%
GGAAAAGCTTCATATTCATG+TGG - Chr2:11497542-11497561 MsG0280007178.01.T01:CDS 35.0%
GTAGAGATGATTGCTAGTAT+TGG - Chr2:11497999-11498018 MsG0280007178.01.T01:CDS 35.0%
GTTCATTGAAAAGATGCCAA+TGG - Chr2:11498043-11498062 MsG0280007178.01.T01:CDS 35.0%
TATGACAATCAGGACGAAAA+CGG + Chr2:11498562-11498581 None:intergenic 35.0%
TATGTTGGGAGATATTAGTG+AGG - Chr2:11497905-11497924 MsG0280007178.01.T01:CDS 35.0%
TCTCTACTAGACTGACATAA+TGG + Chr2:11497986-11498005 None:intergenic 35.0%
TGATGGCCAAATGTTTATTG+GGG - Chr2:11497866-11497885 MsG0280007178.01.T01:CDS 35.0%
TGGGTTGTACTATAACCAAA+GGG - Chr2:11497395-11497414 MsG0280007178.01.T01:intron 35.0%
TTATCATGCGGATGATTCTT+CGG - Chr2:11497353-11497372 MsG0280007178.01.T01:intron 35.0%
TTATGGTCTCCTTAACAGTA+AGG - Chr2:11498505-11498524 MsG0280007178.01.T01:CDS 35.0%
! CATCTTTTCAATGAACTCCA+AGG + Chr2:11498039-11498058 None:intergenic 35.0%
! CTTTTACTTGGAGAAACTTC+AGG - Chr2:11498266-11498285 MsG0280007178.01.T01:CDS 35.0%
! TTTGGTGCATGTAGTATGTT+GGG - Chr2:11497891-11497910 MsG0280007178.01.T01:CDS 35.0%
!! ATTTTCTGGTGGTTATCATG+CGG - Chr2:11497341-11497360 MsG0280007178.01.T01:intron 35.0%
!! GTGATACCTGCTATTTCTTA+TGG - Chr2:11498488-11498507 MsG0280007178.01.T01:CDS 35.0%
!! TTTTGGTGCATGTAGTATGT+TGG - Chr2:11497890-11497909 MsG0280007178.01.T01:CDS 35.0%
!!! ATTAAAGCTGGCCTTTTACT+TGG - Chr2:11498254-11498273 MsG0280007178.01.T01:CDS 35.0%
AACATGGGACTAAAACCTGA+TGG - Chr2:11497849-11497868 MsG0280007178.01.T01:CDS 40.0%
AATTCATGGAAACACCGAGT+TGG - Chr2:11498109-11498128 MsG0280007178.01.T01:CDS 40.0%
AGGAGACCATAAGAAATAGC+AGG + Chr2:11498497-11498516 None:intergenic 40.0%
ATCTCTACACTTGGTTCCAT+TGG + Chr2:11498062-11498081 None:intergenic 40.0%
ATCTTCTGCAAACCCATTCT+TGG + Chr2:11497802-11497821 None:intergenic 40.0%
ATTCATGGAAACACCGAGTT+GGG - Chr2:11498110-11498129 MsG0280007178.01.T01:CDS 40.0%
CAAGTAGTCAAATCGTACTC+AGG + Chr2:11497756-11497775 None:intergenic 40.0%
CCAATAAACATTTGGCCATC+AGG + Chr2:11497867-11497886 None:intergenic 40.0%
CCTGATGGCCAAATGTTTAT+TGG - Chr2:11497864-11497883 MsG0280007178.01.T01:CDS 40.0%
CGGAGCATAATCATTAAAGC+TGG - Chr2:11498242-11498261 MsG0280007178.01.T01:CDS 40.0%
CTATGGCATTGTACCAACAA+TGG - Chr2:11497959-11497978 MsG0280007178.01.T01:CDS 40.0%
CTATTTGCACTGCTGCTAAA+AGG - Chr2:11497307-11497326 MsG0280007178.01.T01:intron 40.0%
CTGAAGTTTCTCCAAGTGAA+AGG + Chr2:11498202-11498221 None:intergenic 40.0%
CTGAGTACGATTTGACTACT+TGG - Chr2:11497754-11497773 MsG0280007178.01.T01:CDS 40.0%
CTGGGTTGTACTATAACCAA+AGG - Chr2:11497394-11497413 MsG0280007178.01.T01:intron 40.0%
CTTTCACTTGGAGAAACTTC+AGG - Chr2:11498200-11498219 MsG0280007178.01.T01:CDS 40.0%
GATCACGAACCTTACTGTTA+AGG + Chr2:11498517-11498536 None:intergenic 40.0%
GCAACATTTGCATCCACTTA+CGG - Chr2:11497650-11497669 MsG0280007178.01.T01:CDS 40.0%
GGAACCAAGTGTAGAGATAT+GGG - Chr2:11498064-11498083 MsG0280007178.01.T01:CDS 40.0%
TACTATAACCAAAGGGCTAG+TGG - Chr2:11497402-11497421 MsG0280007178.01.T01:intron 40.0%
TCAAACCTCTAAGCAAAGCA+TGG + Chr2:11498370-11498389 None:intergenic 40.0%
TGCTGAACTAGTTCAGAAGT+TGG - Chr2:11498142-11498161 MsG0280007178.01.T01:CDS 40.0%
TGGAACCAAGTGTAGAGATA+TGG - Chr2:11498063-11498082 MsG0280007178.01.T01:CDS 40.0%
TTGTTTGTGCTAACCGTAAG+TGG + Chr2:11497666-11497685 None:intergenic 40.0%
! CTAGATAGTTTTTGCAGGGA+TGG - Chr2:11497483-11497502 MsG0280007178.01.T01:CDS 40.0%
!! AATGGTGGAACCTTTTAGCT+CGG + Chr2:11498631-11498650 None:intergenic 40.0%
!!! TCTCTTTTGAGGTTGTGCAA+TGG - Chr2:11497231-11497250 MsG0280007178.01.T01:intron 40.0%
AAATAGCAGGTATCACACCG+CGG + Chr2:11498484-11498503 None:intergenic 45.0%
AACTCATCGTCCGAGCTAAA+AGG - Chr2:11498618-11498637 MsG0280007178.01.T01:CDS 45.0%
AATGCCATAGTCCTTGCTCA+TGG + Chr2:11497949-11497968 None:intergenic 45.0%
ACAATGCAACTCGCCAAGAA+TGG - Chr2:11497786-11497805 MsG0280007178.01.T01:CDS 45.0%
CAATGCAACTCGCCAAGAAT+GGG - Chr2:11497787-11497806 MsG0280007178.01.T01:CDS 45.0%
CATAGACCAGGAAAGCAAAG+AGG - Chr2:11498445-11498464 MsG0280007178.01.T01:CDS 45.0%
GAACATCCTCTTTGCTTTCC+TGG + Chr2:11498454-11498473 None:intergenic 45.0%
GAATCCATGAGCAAGGACTA+TGG - Chr2:11497942-11497961 MsG0280007178.01.T01:CDS 45.0%
GCACTTTGAATCCATGAGCA+AGG - Chr2:11497935-11497954 MsG0280007178.01.T01:CDS 45.0%
GTCTCCCATATCTCTACACT+TGG + Chr2:11498071-11498090 None:intergenic 45.0%
TGTGTTGCATGACATAGACC+AGG - Chr2:11498433-11498452 MsG0280007178.01.T01:CDS 45.0%
TTCAGGGCAGTATGACAATC+AGG + Chr2:11498572-11498591 None:intergenic 45.0%
TTCATGGAAACACCGAGTTG+GGG - Chr2:11498111-11498130 MsG0280007178.01.T01:CDS 45.0%
TTGCACTGCTGCTAAAAGGT+GGG - Chr2:11497311-11497330 MsG0280007178.01.T01:intron 45.0%
TTGCAGGGATGGTAAAGTGA+AGG - Chr2:11497494-11497513 MsG0280007178.01.T01:CDS 45.0%
TTTGCACTGCTGCTAAAAGG+TGG - Chr2:11497310-11497329 MsG0280007178.01.T01:intron 45.0%
!! AAATGGGCTATGCTCTTGCA+AGG - Chr2:11498655-11498674 MsG0280007178.01.T01:CDS 45.0%
!! CTGACATAATGGGCCATTGT+TGG + Chr2:11497975-11497994 None:intergenic 45.0%
!! GTTAAAGCTGGCCTTTCACT+TGG - Chr2:11498188-11498207 MsG0280007178.01.T01:CDS 45.0%
AATAGCAGGTATCACACCGC+GGG + Chr2:11498483-11498502 None:intergenic 50.0%
GAAGGCTAAGTCTCTTGAGG+AGG - Chr2:11497602-11497621 MsG0280007178.01.T01:CDS 50.0%
GAGAAGATCCACTAGCCCTT+TGG + Chr2:11497413-11497432 None:intergenic 50.0%
GCAAATAGCCCTGGACGTAT+TGG + Chr2:11497295-11497314 None:intergenic 50.0%
TGCACTGCTGCTAAAAGGTG+GGG - Chr2:11497312-11497331 MsG0280007178.01.T01:intron 50.0%
TGGGAAGGCTAAGTCTCTTG+AGG - Chr2:11497599-11497618 MsG0280007178.01.T01:CDS 50.0%
TGGGCATCTTGATGAAGCCT+TGG - Chr2:11498019-11498038 MsG0280007178.01.T01:CDS 50.0%
! AGGTGGGGTTTCCGATTTTC+TGG - Chr2:11497327-11497346 MsG0280007178.01.T01:intron 50.0%
! TCATGGAAACACCGAGTTGG+GGG - Chr2:11498112-11498131 MsG0280007178.01.T01:CDS 50.0%
! TGGGGTTTCCGATTTTCTGG+TGG - Chr2:11497330-11497349 MsG0280007178.01.T01:intron 50.0%
!! CAAAGGCACCAATACGTCCA+GGG - Chr2:11497284-11497303 MsG0280007178.01.T01:intron 50.0%
!! TCAAAGGCACCAATACGTCC+AGG - Chr2:11497283-11497302 MsG0280007178.01.T01:intron 50.0%
AGCACAACGATCCCCCAACT+CGG + Chr2:11498126-11498145 None:intergenic 55.0%
AGCAGCAGTGCAAATAGCCC+TGG + Chr2:11497304-11497323 None:intergenic 55.0%
AGCCTCCGAATTCTCAGGGA+CGG + Chr2:11498825-11498844 None:intergenic 55.0%
GAGGATGTTCTCTTTGCCCG+CGG - Chr2:11498464-11498483 MsG0280007178.01.T01:CDS 55.0%
TCCCTGAGAATTCGGAGGCT+CGG - Chr2:11498825-11498844 MsG0280007178.01.T01:CDS 55.0%
AGAATTCGGAGGCTCGGCTC+TGG - Chr2:11498831-11498850 MsG0280007178.01.T01:CDS 60.0%
AGCCGAGCCTCCGAATTCTC+AGG + Chr2:11498830-11498849 None:intergenic 60.0%
CAGGGCCGTCCCTGAGAATT+CGG - Chr2:11498817-11498836 MsG0280007178.01.T01:CDS 60.0%
GAATTCGGAGGCTCGGCTCT+GGG - Chr2:11498832-11498851 MsG0280007178.01.T01:CDS 60.0%
GCCGAGCCTCCGAATTCTCA+GGG + Chr2:11498829-11498848 None:intergenic 60.0%
CGAATTCTCAGGGACGGCCC+TGG + Chr2:11498819-11498838 None:intergenic 65.0%
GGCCGTCCCTGAGAATTCGG+AGG - Chr2:11498820-11498839 MsG0280007178.01.T01:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr2 gene 11497183 11498859 11497183 ID=MsG0280007178.01;Name=MsG0280007178.01
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Chr2 exon 11497403 11498859 11497403 ID=MsG0280007178.01.T01:exon:3585;Parent=MsG0280007178.01.T01
Chr2 exon 11497183 11497222 11497183 ID=MsG0280007178.01.T01:exon:3584;Parent=MsG0280007178.01.T01
Chr2 CDS 11497403 11498859 11497403 ID=MsG0280007178.01.T01:cds;Parent=MsG0280007178.01.T01
Chr2 CDS 11497183 11497222 11497183 ID=MsG0280007178.01.T01:cds;Parent=MsG0280007178.01.T01
Gene Sequence

>MsG0280007178.01.T01

ATGTCACTCATGATATCTTCTAAAAAAGCATCACTAGTTACAGTTAGTTCTCTTTTGAGGTTGTGCAATGGATGTTGTTCACGCCATGTTGTGAACTGTATCAAAGGCACCAATACGTCCAGGGCTATTTGCACTGCTGCTAAAAGGTGGGGTTTCCGATTTTCTGGTGGTTATCATGCGGATGATTCTTCGGATTATCAACAAAATCGTGCTGGGTTGTACTATAACCAAAGGGCTAGTGGATCTTCTCGATATAAACATGCTAGTTCAAATAGTTCGTACAAAGGCACACTTGAAGAACTAGATAGTTTTTGCAGGGATGGTAAAGTGAAGGAAGCAATTGAAGTTTTGCAAGTGTTGGAAAAGCTTCATATTCATGTGGATTTGCAGCGTTGTTTGCAATTAATGCACATTTGTGGGAAGGCTAAGTCTCTTGAGGAGGTAAGAGTTGTACACAGACATGTTTTGCAACATTTGCATCCACTTACGGTTAGCACAAACAATAGAGTATTGGAGATGTATTTTGAATGTGGTTCTCTAGATGATGCAATCGACGTGTTCAAGAGCATGCCTGAGTACGATTTGACTACTTGGCATACTATGACAATGCAACTCGCCAAGAATGGGTTTGCAGAAGATTCAATTGATATATTTACTCAATTTAAAAACATGGGACTAAAACCTGATGGCCAAATGTTTATTGGGGTTTTTGGTGCATGTAGTATGTTGGGAGATATTAGTGAGGGAATGCTGCACTTTGAATCCATGAGCAAGGACTATGGCATTGTACCAACAATGGCCCATTATGTCAGTCTAGTAGAGATGATTGCTAGTATTGGGCATCTTGATGAAGCCTTGGAGTTCATTGAAAAGATGCCAATGGAACCAAGTGTAGAGATATGGGAGACTTTGATGAATAGTTGCAGAATTCATGGAAACACCGAGTTGGGGGATCGTTGTGCTGAACTAGTTCAGAAGTTGGATCCTTCTCGTTTGAATGAGAAAGTTAAAGCTGGCCTTTCACTTGGAGAAACTTCAGGCTTTACAAGCAAATATACTCGGAGCATAATCATTAAAGCTGGCCTTTTACTTGGAGAAACTTCAGGCTTTACAAGCAAATATACTCCGAGCATAATCATAGAATATCGAGACGGAGATACTTTCCATCTAGAAAATGATAAAATCCATGCTTTGCTTAGAGGTTTGAGAGTGCAAATGAAAGAAATTGGCTATATTGCAGAGACCAAATATGTGTTGCATGACATAGACCAGGAAAGCAAAGAGGATGTTCTCTTTGCCCGCGGTGTGATACCTGCTATTTCTTATGGTCTCCTTAACAGTAAGGTTCGTGATCCCATTAGAGTAAATCAGAATCACCGTTTTCGTCCTGATTGTCATACTGCCCTGAAGATTATTTCTAAGATCGTGGGAAGAGAACTCATCGTCCGAGCTAAAAGGGCCGTCCCTGAGAATTCGGAGGCTCGGCTCTGGGAATGA
Protein sequence

>MsG0280007178.01.T01

MSLMISSKKASLVTVSSLLRLCNGCCSRHVVNCIKGTNTSRAICTAAKRWGFRFSGGYHADDSSDYQQNRAGLYYNQRASGSSRYKHASSNSSYKGTLEELDSFCRDGKVKEAIEVLQVLEKLHIHVDLQRCLQLMHICGKAKSLEEVRVVHRHVLQHLHPLTVSTNNRVLEMYFECGSLDDAIDVFKSMPEYDLTTWHTMTMQLAKNGFAEDSIDIFTQFKNMGLKPDGQMFIGVFGACSMLGDISEGMLHFESMSKDYGIVPTMAHYVSLVEMIASIGHLDEALEFIEKMPMEPSVEIWETLMNSCRIHGNTELGDRCAELVQKLDPSRLNEKVKAGLSLGETSGFTSKYTRSIIIKAGLLLGETSGFTSKYTPSIIIEYRDGDTFHLENDKIHALLRGLRVQMKEIGYIAETKYVLHDIDQESKEDVLFARGVIPAISYGLLNSKVRDPIRVNQNHRFRPDCHTALKIISKIVGRELIVRAKRAVPENSEARLWE*