AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0280008055.01

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MsG0280008055.01.T07 AT1G56380 27.143 210 100 3 34 190 21 230 1.08e-12 68.2
MsG0280008055.01.T07 AT1G61960 43.590 78 44 0 40 117 53 130 1.53e-12 67.8
MsG0280008055.01.T07 AT1G62150 36.364 88 56 0 40 127 59 146 3.87e-11 63.5
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MsG0280008055.01.T01 AT1G21150 34.167 240 156 1 40 277 121 360 1.01e-35 134
MsG0280008055.01.T01 AT3G46950 32.959 267 165 6 11 271 20 278 1.89e-35 132
MsG0280008055.01.T01 AT1G21150 33.197 244 161 1 36 277 17 260 4.84e-35 130
MsG0280008055.01.T01 AT1G61980 33.610 241 152 4 40 277 53 288 2.08e-32 124
MsG0280008055.01.T01 AT1G61980 33.610 241 152 4 40 277 53 288 2.08e-32 124
MsG0280008055.01.T01 AT1G61980 33.610 241 152 4 40 277 53 288 2.08e-32 124
MsG0280008055.01.T01 AT1G62120 34.231 260 163 3 31 286 48 303 3.29e-32 124
MsG0280008055.01.T01 AT1G61960 31.890 254 170 2 40 292 53 304 6.81e-31 120
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MsG0280008055.01.T01 AT1G61970 34.322 236 145 5 40 271 53 282 6.83e-31 120
MsG0280008055.01.T01 AT1G61970 34.322 236 145 5 40 271 53 282 6.83e-31 120
MsG0280008055.01.T01 AT1G61970 34.322 236 145 5 40 271 53 282 6.83e-31 120
MsG0280008055.01.T01 AT1G61970 34.322 236 145 5 40 271 53 282 6.83e-31 120
MsG0280008055.01.T01 AT1G61970 34.322 236 145 5 40 271 53 282 6.83e-31 120
MsG0280008055.01.T01 AT1G61970 34.322 236 145 5 40 271 53 282 6.83e-31 120
MsG0280008055.01.T01 AT1G62150 31.783 258 168 3 40 293 59 312 1.33e-29 117
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MsG0280008055.01.T01 AT1G61990 31.799 239 152 3 40 277 53 281 3.31e-29 115
MsG0280008055.01.T01 AT1G62085 33.473 239 151 3 40 274 56 290 1.97e-28 114
MsG0280008055.01.T01 AT1G62085 33.473 239 151 3 40 274 56 290 1.97e-28 114
MsG0280008055.01.T01 AT1G62110 30.502 259 172 3 40 294 53 307 3.27e-27 110
MsG0280008055.01.T01 AT5G64950 26.820 261 182 5 25 277 22 281 4.07e-21 92.8
MsG0280008055.01.T01 AT5G23930 30.901 233 152 3 40 271 56 280 7.64e-21 92.4
MsG0280008055.01.T01 AT1G62010 30.415 217 143 4 72 286 71 281 1.27e-17 82.8
MsG0280008055.01.T01 AT1G56380 28.897 263 163 7 34 286 10 258 1.69e-17 82.4
MsG0280008055.01.T01 AT1G56380 28.897 263 163 7 34 286 21 269 2.20e-17 82.0
MsG0280008055.01.T06 AT5G07900 33.632 223 137 4 62 276 180 399 2.16e-32 124
MsG0280008055.01.T06 AT1G21150 29.719 249 163 4 25 266 95 338 3.68e-20 89.7
MsG0280008055.01.T06 AT1G21150 29.719 249 163 4 25 266 131 374 4.55e-20 89.7
MsG0280008055.01.T06 AT1G21150 29.719 249 163 4 25 266 195 438 6.90e-20 89.7
MsG0280008055.01.T06 AT5G64950 32.086 187 121 2 86 266 176 362 7.45e-20 89.0
MsG0280008055.01.T06 AT1G61990 27.907 215 116 4 92 267 183 397 5.42e-17 80.9
MsG0280008055.01.T06 AT1G61990 27.907 215 116 4 92 267 183 397 5.42e-17 80.9
MsG0280008055.01.T06 AT1G61970 25.118 211 119 5 92 264 190 399 6.48e-13 68.9
MsG0280008055.01.T06 AT1G61970 25.118 211 119 5 92 264 190 399 6.48e-13 68.9
MsG0280008055.01.T06 AT1G61970 25.118 211 119 5 92 264 190 399 6.48e-13 68.9
MsG0280008055.01.T06 AT1G61970 25.118 211 119 5 92 264 190 399 6.48e-13 68.9
MsG0280008055.01.T06 AT1G61970 25.118 211 119 5 92 264 190 399 6.48e-13 68.9
MsG0280008055.01.T06 AT1G61970 25.118 211 119 5 92 264 190 399 6.48e-13 68.9
MsG0280008055.01.T06 AT1G61970 25.118 211 119 5 92 264 190 399 6.48e-13 68.9
MsG0280008055.01.T05 AT5G07900 29.730 333 177 5 40 318 70 399 1.74e-43 154
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MsG0280008055.01.T05 AT1G21150 29.814 322 177 6 36 308 17 338 1.61e-30 119
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MsG0280008055.01.T05 AT1G61990 28.779 344 170 8 40 308 53 396 9.29e-30 118
MsG0280008055.01.T05 AT1G61980 27.324 355 178 8 40 314 53 407 7.04e-27 110
MsG0280008055.01.T05 AT1G61980 27.324 355 178 8 40 314 53 407 7.04e-27 110
MsG0280008055.01.T05 AT1G61980 27.324 355 178 8 40 314 53 407 7.04e-27 110
MsG0280008055.01.T05 AT1G62120 26.954 371 181 7 31 315 48 414 1.66e-26 109
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MsG0280008055.01.T05 AT1G61970 25.862 348 176 9 40 306 53 399 4.52e-24 102
MsG0280008055.01.T05 AT1G61970 25.862 348 176 9 40 306 53 399 4.52e-24 102
MsG0280008055.01.T05 AT1G61970 25.862 348 176 9 40 306 53 399 4.52e-24 102
MsG0280008055.01.T05 AT1G61970 25.862 348 176 9 40 306 53 399 4.52e-24 102
MsG0280008055.01.T05 AT1G61970 25.862 348 176 9 40 306 53 399 4.52e-24 102
MsG0280008055.01.T05 AT1G61970 25.862 348 176 9 40 306 53 399 4.52e-24 102
MsG0280008055.01.T05 AT5G64950 27.193 342 190 9 25 308 22 362 2.76e-22 97.1
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MsG0280008055.01.T03 AT1G21150 34.591 318 205 2 40 354 121 438 4.50e-50 174
MsG0280008055.01.T03 AT1G21150 33.851 322 210 2 36 354 17 338 8.70e-50 171
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MsG0280008055.01.T03 AT1G61980 31.111 360 204 7 40 360 53 407 1.22e-41 151
MsG0280008055.01.T03 AT1G61980 31.111 360 204 7 40 360 53 407 1.22e-41 151
MsG0280008055.01.T03 AT1G62120 30.997 371 212 6 31 361 48 414 1.93e-40 148
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MsG0280008055.01.T03 AT1G61990 30.226 354 198 6 40 354 53 396 7.73e-40 146
MsG0280008055.01.T03 AT1G61970 30.312 353 200 8 40 352 53 399 2.12e-39 145
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MsG0280008055.01.T03 AT1G61970 30.312 353 200 8 40 352 53 399 2.12e-39 145
MsG0280008055.01.T03 AT1G61970 30.312 353 200 8 40 352 53 399 2.12e-39 145
MsG0280008055.01.T03 AT1G61970 30.312 353 200 8 40 352 53 399 2.12e-39 145
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MsG0280008055.01.T03 AT1G61970 30.312 353 200 8 40 352 53 399 2.12e-39 145
MsG0280008055.01.T03 AT5G64950 29.532 342 228 6 25 354 22 362 9.65e-36 135
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MsG0280008055.01.T03 AT1G61960 33.197 244 160 2 40 282 53 294 9.29e-30 119
MsG0280008055.01.T03 AT1G62150 32.927 246 157 3 40 281 59 300 1.30e-28 116
MsG0280008055.01.T03 AT1G62085 30.631 333 209 9 40 362 56 376 5.64e-28 114
MsG0280008055.01.T03 AT1G62085 30.631 333 209 9 40 362 56 376 5.64e-28 114
MsG0280008055.01.T03 AT1G62110 32.389 247 159 3 40 282 53 295 7.97e-27 111
MsG0280008055.01.T03 AT1G62010 28.049 328 192 7 72 361 71 392 6.62e-26 108
MsG0280008055.01.T03 AT5G23930 31.330 233 151 3 40 271 56 280 4.66e-20 92.0
MsG0280008055.01.T03 AT1G56380 24.607 382 220 11 34 361 10 377 4.26e-17 82.4
MsG0280008055.01.T03 AT1G56380 24.607 382 220 11 34 361 21 388 5.40e-17 82.4
MsG0280008055.01.T03 AT1G79220 23.620 326 224 11 73 381 82 399 5.07e-11 64.3

Find 71 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 96 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
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GCCATCTATATTTGGTTTAA+AGG 0.141804 2:-24877454 MsG0280008055.01.T01:CDS
GATCCTAAGTTGACTACTTT+TGG 0.155784 2:-24877390 MsG0280008055.01.T01:CDS
CAGTCAAGGCCATCTATATT+TGG 0.179813 2:-24877462 MsG0280008055.01.T01:CDS
AAACTATAACAAAACATATT+TGG 0.239296 2:+24877156 None:intergenic
TTGGAGGAAGTTAAGTGTTT+AGG 0.257551 2:-24877417 MsG0280008055.01.T01:CDS
TGGAGGAAGTTAAGTGTTTA+GGG 0.262883 2:-24877416 MsG0280008055.01.T01:CDS
TCCTACCTCATCGGCAAATT+CGG 0.270473 2:-24878041 MsG0280008055.01.T01:CDS
TCTCTGCTTAATTCGATATT+CGG 0.275206 2:-24877580 MsG0280008055.01.T01:CDS
AGACCAACCCCATTTCTTAA+AGG 0.307244 2:+24877308 None:intergenic
TTTGTTATAGTTTACATAAA+AGG 0.315414 2:-24877146 MsG0280008055.01.T01:intron
GCAGAGAATGGTGTCCTTGC+TGG 0.321424 2:+24877596 None:intergenic
CTTGAGCAAGTTTGTCTTGA+AGG 0.325723 2:-24877022 MsG0280008055.01.T07:CDS
AAAGGATTTGATTAAGTCAT+TGG 0.335353 2:-24877436 MsG0280008055.01.T01:CDS
CTCTGCTTAATTCGATATTC+GGG 0.336261 2:-24877579 MsG0280008055.01.T01:CDS
AAACTAATCTGTAAAATTGC+AGG 0.337554 2:+24877669 None:intergenic
TGTAGGTAACCCTAAGTTCT+TGG 0.343348 2:-24877784 MsG0280008055.01.T01:intron
AAGCTTAATTCCAAGAACTT+AGG 0.347303 2:+24877774 None:intergenic
AAGTTGATACCTTTAAGAAA+TGG 0.365182 2:-24877317 MsG0280008055.01.T01:CDS
AGTTGATACCTTTAAGAAAT+GGG 0.365271 2:-24877316 MsG0280008055.01.T01:CDS
ATTGAAGCCAACATCAAATT+AGG 0.374513 2:+24877252 None:intergenic
ATATCTTCAGAATAAGTAAA+TGG 0.375368 2:+24877048 None:intergenic
AAGAAGTTGAGAACTGAATC+TGG 0.386478 2:+24877957 None:intergenic
AATTGATATTAGCCACAATA+AGG 0.389243 2:+24877532 None:intergenic
TGTGGCTAATATCAATTTGA+TGG 0.392207 2:-24877526 MsG0280008055.01.T01:CDS
AGCTTAATTCCAAGAACTTA+GGG 0.393617 2:+24877775 None:intergenic
TCCTTTAAACCAAATATAGA+TGG 0.404648 2:+24877453 None:intergenic
GTCAGAGGAAGAAGCACCTT+TGG 0.409246 2:+24877821 None:intergenic
TCAATTAGGTTGGGATTCCT+TGG 0.416390 2:-24877193 MsG0280008055.01.T01:intron
AATTGCAAAACTGAGGCTCT+TGG 0.425012 2:+24877117 None:intergenic
TTGGGTCAATCAATTAGGTT+GGG 0.436055 2:-24877202 MsG0280008055.01.T01:intron
ACATACGCAATATCATCAAA+AGG 0.441484 2:-24877908 MsG0280008055.01.T01:CDS
GACATTGTCCGCATGGTTGT+AGG 0.452422 2:-24877801 MsG0280008055.01.T01:intron
GAAATCACATATTAAATGAA+TGG 0.472745 2:+24876925 None:intergenic
TTTGGGTCAATCAATTAGGT+TGG 0.477232 2:-24877203 MsG0280008055.01.T01:intron
GTTGCTTTGGTAGCCAAGAA+AGG 0.483813 2:-24877366 MsG0280008055.01.T01:CDS
ATGAGGTAGGAAACGGTGAA+TGG 0.498531 2:+24878053 None:intergenic
TTCCTCTGACATTGTCCGCA+TGG 0.499055 2:-24877808 MsG0280008055.01.T01:intron
AACTAATCTGTAAAATTGCA+GGG 0.522503 2:+24877670 None:intergenic
ATATCAGCCTAATTTGATGT+TGG 0.524802 2:-24877259 MsG0280008055.01.T01:CDS
CATACGCAATATCATCAAAA+GGG 0.533856 2:-24877907 MsG0280008055.01.T01:CDS
ATTAGCCACAATAAGGCGAT+AGG 0.536156 2:+24877539 None:intergenic
TGAGGTAGGAAACGGTGAAT+GGG 0.540099 2:+24878054 None:intergenic
TTGCAAGTTTGCTTCAGTCA+AGG 0.549052 2:-24877476 MsG0280008055.01.T01:CDS
TGGAAATTTAGCAAGTGCCA+AGG 0.550727 2:+24877176 None:intergenic
GTTGATACCTTTAAGAAATG+GGG 0.553181 2:-24877315 MsG0280008055.01.T01:CDS
CGGCAAATTCGGATTCTCGC+AGG 0.558102 2:-24878030 MsG0280008055.01.T01:CDS
GGATTTGATTAAGTCATTGG+AGG 0.561173 2:-24877433 MsG0280008055.01.T01:CDS
AAATTTGAGAGAAAATAGGA+AGG 0.566350 2:+24878103 None:intergenic
ATATCGAATTAAGCAGAGAA+TGG 0.572002 2:+24877584 None:intergenic
AAATCCCTATCGCCTTATTG+TGG 0.576235 2:-24877544 MsG0280008055.01.T01:CDS
TTCACCGTTTCCTACCTCAT+CGG 0.587137 2:-24878050 MsG0280008055.01.T01:CDS
ACCCCAAAAGTAGTCAACTT+AGG 0.587643 2:+24877387 None:intergenic
ATACCTTTAAGAAATGGGGT+TGG 0.587688 2:-24877311 MsG0280008055.01.T01:CDS
GAGCAAGTTTGTCTTGAAGG+AGG 0.590871 2:-24877019 MsG0280008055.01.T07:CDS
TAGGTTCTTTAATTCCAGCA+AGG 0.604223 2:-24877610 MsG0280008055.01.T01:CDS
TTAGCCACAATAAGGCGATA+GGG 0.609256 2:+24877540 None:intergenic
ATATCATCAAAAGGGAACCA+TGG 0.612508 2:-24877899 MsG0280008055.01.T01:CDS
TTTGCCGATGAGGTAGGAAA+CGG 0.624046 2:+24878046 None:intergenic
CAAAAGAAATTGCAAAACTG+AGG 0.625549 2:+24877110 None:intergenic
AGAATCCGAATTTGCCGATG+AGG 0.626280 2:+24878036 None:intergenic
TCCGAATTTGCCGATGAGGT+AGG 0.627507 2:+24878040 None:intergenic
GTATCGCAGGAAAGAATCCA+TGG 0.639912 2:+24877882 None:intergenic
AATTTGAGAGAAAATAGGAA+GGG 0.640674 2:+24878104 None:intergenic
GTGTGAATGTGAATTTGAAG+TGG 0.648017 2:+24878076 None:intergenic
AACCATGCGGACAATGTCAG+AGG 0.652596 2:+24877806 None:intergenic
AATGAAACTTGCATACACAA+AGG 0.663379 2:-24876962 MsG0280008055.01.T07:CDS
CTATCTATTAAAGTTATACG+AGG 0.674399 2:-24876989 MsG0280008055.01.T07:CDS
GATATTGCGTATGTGTGAGT+CGG 0.676436 2:+24877917 None:intergenic
GCATACACAAAGGAGAACAA+TGG 0.692068 2:-24876952 MsG0280008055.01.T07:CDS
TAGGGTTACCTACAACCATG+CGG 0.768933 2:+24877793 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAACTATAACAAAACATATT+TGG + Chr2:24877950-24877969 None:intergenic 15.0%
!! TATTTAACAATTCAAAAAGA+GGG + Chr2:24877475-24877494 None:intergenic 15.0%
!!! TTTGTTATAGTTTACATAAA+AGG - Chr2:24877957-24877976 MsG0280008055.01.T01:CDS 15.0%
!! AAGGTTTAAGTAAAAAACTT+TGG - Chr2:24877756-24877775 MsG0280008055.01.T01:intron 20.0%
!! AGAAAAATTTGAGAGAAAAT+AGG + Chr2:24877007-24877026 None:intergenic 20.0%
!! AGATTAAAAACTGAAACTTT+GGG + Chr2:24877262-24877281 None:intergenic 20.0%
!! AGGTTTAAGTAAAAAACTTT+GGG - Chr2:24877757-24877776 MsG0280008055.01.T01:intron 20.0%
!! ATATCTTCAGAATAAGTAAA+TGG + Chr2:24878058-24878077 None:intergenic 20.0%
!! CTATTTAACAATTCAAAAAG+AGG + Chr2:24877476-24877495 None:intergenic 20.0%
!!! CTCTTTTTGAATTGTTAAAT+AGG - Chr2:24877474-24877493 MsG0280008055.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTGAATATTTTCTATCCAA+AGG - Chr2:24877371-24877390 MsG0280008055.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTTTTACTTAAACCTTTCT+TGG + Chr2:24877753-24877772 None:intergenic 20.0%
! AAACTAATCTGTAAAATTGC+AGG + Chr2:24877437-24877456 None:intergenic 25.0%
! AAAGGATTTGATTAAGTCAT+TGG - Chr2:24877667-24877686 MsG0280008055.01.T01:CDS 25.0%
! AAATTTGAGAGAAAATAGGA+AGG + Chr2:24877003-24877022 None:intergenic 25.0%
! AACTAATCTGTAAAATTGCA+GGG + Chr2:24877436-24877455 None:intergenic 25.0%
! AATTGATATTAGCCACAATA+AGG + Chr2:24877574-24877593 None:intergenic 25.0%
! AATTTGAGAGAAAATAGGAA+GGG + Chr2:24877002-24877021 None:intergenic 25.0%
! CTATCTATTAAAGTTATACG+AGG - Chr2:24878114-24878133 MsG0280008055.01.T01:CDS 25.0%
! CTCAACTTCTTAAAAAATCA+CGG - Chr2:24877158-24877177 MsG0280008055.01.T01:intron 25.0%
! GAGATTAAAAACTGAAACTT+TGG + Chr2:24877263-24877282 None:intergenic 25.0%
! TCCTTTAAACCAAATATAGA+TGG + Chr2:24877653-24877672 None:intergenic 25.0%
!! AGTTGATACCTTTAAGAAAT+GGG - Chr2:24877787-24877806 MsG0280008055.01.T01:intron 25.0%
!! TTGCAATTTCTTTTGATGAA+AGG - Chr2:24878001-24878020 MsG0280008055.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTCAGTTTTTAATCTCCAA+AGG - Chr2:24877266-24877285 MsG0280008055.01.T01:CDS 25.0%
!!! AAGTTGATACCTTTAAGAAA+TGG - Chr2:24877786-24877805 MsG0280008055.01.T01:intron 25.0%
!!! TGCAATTTTACAGATTAGTT+TGG - Chr2:24877436-24877455 MsG0280008055.01.T01:CDS 25.0%
AAGCTTAATTCCAAGAACTT+AGG + Chr2:24877332-24877351 None:intergenic 30.0%
AATGAAACTTGCATACACAA+AGG - Chr2:24878141-24878160 MsG0280008055.01.T01:CDS 30.0%
ACATACGCAATATCATCAAA+AGG - Chr2:24877195-24877214 MsG0280008055.01.T01:intron 30.0%
AGCTTAATTCCAAGAACTTA+GGG + Chr2:24877331-24877350 None:intergenic 30.0%
ATATCAGCCTAATTTGATGT+TGG - Chr2:24877844-24877863 MsG0280008055.01.T01:CDS 30.0%
ATATCGAATTAAGCAGAGAA+TGG + Chr2:24877522-24877541 None:intergenic 30.0%
ATTGAAGCCAACATCAAATT+AGG + Chr2:24877854-24877873 None:intergenic 30.0%
CAAAAGAAATTGCAAAACTG+AGG + Chr2:24877996-24878015 None:intergenic 30.0%
CATACGCAATATCATCAAAA+GGG - Chr2:24877196-24877215 MsG0280008055.01.T01:intron 30.0%
TCTCTGCTTAATTCGATATT+CGG - Chr2:24877523-24877542 MsG0280008055.01.T01:CDS 30.0%
TGTGGCTAATATCAATTTGA+TGG - Chr2:24877577-24877596 MsG0280008055.01.T01:CDS 30.0%
! GCCATCTATATTTGGTTTAA+AGG - Chr2:24877649-24877668 MsG0280008055.01.T01:CDS 30.0%
! GTTGATACCTTTAAGAAATG+GGG - Chr2:24877788-24877807 MsG0280008055.01.T01:intron 30.0%
!! ATCAATTTGATGGCTGATTT+TGG - Chr2:24877587-24877606 MsG0280008055.01.T01:CDS 30.0%
!! ATCCTAAGTTGACTACTTTT+GGG - Chr2:24877714-24877733 MsG0280008055.01.T01:intron 30.0%
!!! AGTTTTTGGGTCAATCAATT+AGG - Chr2:24877896-24877915 MsG0280008055.01.T01:CDS 30.0%
!!! GGTTTTGAAATAAAGCTCTT+TGG + Chr2:24877117-24877136 None:intergenic 30.0%
!!! TAGTTTGCTGATGAGTTTTT+GGG - Chr2:24877883-24877902 MsG0280008055.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTAGTTTGCTGATGAGTTTT+TGG - Chr2:24877882-24877901 MsG0280008055.01.T01:CDS 30.0%
AAGAAGTTGAGAACTGAATC+TGG + Chr2:24877149-24877168 None:intergenic 35.0%
ATATCATCAAAAGGGAACCA+TGG - Chr2:24877204-24877223 MsG0280008055.01.T01:intron 35.0%
CTCTGCTTAATTCGATATTC+GGG - Chr2:24877524-24877543 MsG0280008055.01.T01:CDS 35.0%
GGATTTGATTAAGTCATTGG+AGG - Chr2:24877670-24877689 MsG0280008055.01.T01:CDS 35.0%
GTGTGAATGTGAATTTGAAG+TGG + Chr2:24877030-24877049 None:intergenic 35.0%
TAGGTTCTTTAATTCCAGCA+AGG - Chr2:24877493-24877512 MsG0280008055.01.T01:CDS 35.0%
TGGAGGAAGTTAAGTGTTTA+GGG - Chr2:24877687-24877706 MsG0280008055.01.T01:CDS 35.0%
TTGGAGGAAGTTAAGTGTTT+AGG - Chr2:24877686-24877705 MsG0280008055.01.T01:CDS 35.0%
TTGGGTCAATCAATTAGGTT+GGG - Chr2:24877901-24877920 MsG0280008055.01.T01:CDS 35.0%
TTTGGGTCAATCAATTAGGT+TGG - Chr2:24877900-24877919 MsG0280008055.01.T01:CDS 35.0%
! ATACCTTTAAGAAATGGGGT+TGG - Chr2:24877792-24877811 MsG0280008055.01.T01:intron 35.0%
!! GATCCTAAGTTGACTACTTT+TGG - Chr2:24877713-24877732 MsG0280008055.01.T01:CDS 35.0%
!! TCCTAAGTTGACTACTTTTG+GGG - Chr2:24877715-24877734 MsG0280008055.01.T01:intron 35.0%
!!! AACTGAATCTGGTTTTTGTG+AGG + Chr2:24877138-24877157 None:intergenic 35.0%
AATTGCAAAACTGAGGCTCT+TGG + Chr2:24877989-24878008 None:intergenic 40.0%
ACCCCAAAAGTAGTCAACTT+AGG + Chr2:24877719-24877738 None:intergenic 40.0%
AGACCAACCCCATTTCTTAA+AGG + Chr2:24877798-24877817 None:intergenic 40.0%
ATTAGCCACAATAAGGCGAT+AGG + Chr2:24877567-24877586 None:intergenic 40.0%
CAGTCAAGGCCATCTATATT+TGG - Chr2:24877641-24877660 MsG0280008055.01.T01:CDS 40.0%
CTTGAGCAAGTTTGTCTTGA+AGG - Chr2:24878081-24878100 MsG0280008055.01.T01:CDS 40.0%
GATATTGCGTATGTGTGAGT+CGG + Chr2:24877189-24877208 None:intergenic 40.0%
GCATACACAAAGGAGAACAA+TGG - Chr2:24878151-24878170 MsG0280008055.01.T01:CDS 40.0%
TGGAAATTTAGCAAGTGCCA+AGG + Chr2:24877930-24877949 None:intergenic 40.0%
TGTAGGTAACCCTAAGTTCT+TGG - Chr2:24877319-24877338 MsG0280008055.01.T01:CDS 40.0%
TTAGCCACAATAAGGCGATA+GGG + Chr2:24877566-24877585 None:intergenic 40.0%
! AAATCCCTATCGCCTTATTG+TGG - Chr2:24877559-24877578 MsG0280008055.01.T01:CDS 40.0%
! TTGCAAGTTTGCTTCAGTCA+AGG - Chr2:24877627-24877646 MsG0280008055.01.T01:CDS 40.0%
!! ACTTTGGGAGAATCGTTTTG+TGG + Chr2:24877247-24877266 None:intergenic 40.0%
!! CTTTGGGAGAATCGTTTTGT+GGG + Chr2:24877246-24877265 None:intergenic 40.0%
!! TCAATTAGGTTGGGATTCCT+TGG - Chr2:24877910-24877929 MsG0280008055.01.T01:CDS 40.0%
AGAATCCGAATTTGCCGATG+AGG + Chr2:24877070-24877089 None:intergenic 45.0%
ATGAGGTAGGAAACGGTGAA+TGG + Chr2:24877053-24877072 None:intergenic 45.0%
GAGCAAGTTTGTCTTGAAGG+AGG - Chr2:24878084-24878103 MsG0280008055.01.T01:CDS 45.0%
GTATCGCAGGAAAGAATCCA+TGG + Chr2:24877224-24877243 None:intergenic 45.0%
TAGGGTTACCTACAACCATG+CGG + Chr2:24877313-24877332 None:intergenic 45.0%
TCCTACCTCATCGGCAAATT+CGG - Chr2:24877062-24877081 MsG0280008055.01.T07:CDS 45.0%
TGAGGTAGGAAACGGTGAAT+GGG + Chr2:24877052-24877071 None:intergenic 45.0%
TTCACCGTTTCCTACCTCAT+CGG - Chr2:24877053-24877072 MsG0280008055.01.T07:CDS 45.0%
TTTGCCGATGAGGTAGGAAA+CGG + Chr2:24877060-24877079 None:intergenic 45.0%
! GTTGCTTTGGTAGCCAAGAA+AGG - Chr2:24877737-24877756 MsG0280008055.01.T01:intron 45.0%
!! AATCGTTTTGTGGGTATCGC+AGG + Chr2:24877237-24877256 None:intergenic 45.0%
!! ATCAGATGAAGAAGCGCCTT+TGG + Chr2:24877390-24877409 None:intergenic 45.0%
!!! GACTACTTTTGGGGTTGCTT+TGG - Chr2:24877724-24877743 MsG0280008055.01.T01:intron 45.0%
AACCATGCGGACAATGTCAG+AGG + Chr2:24877300-24877319 None:intergenic 50.0%
GACATTGTCCGCATGGTTGT+AGG - Chr2:24877302-24877321 MsG0280008055.01.T01:CDS 50.0%
TCCGAATTTGCCGATGAGGT+AGG + Chr2:24877066-24877085 None:intergenic 50.0%
TTCCTCTGACATTGTCCGCA+TGG - Chr2:24877295-24877314 MsG0280008055.01.T01:CDS 50.0%
!! GTCAGAGGAAGAAGCACCTT+TGG + Chr2:24877285-24877304 None:intergenic 50.0%
CGGCAAATTCGGATTCTCGC+AGG - Chr2:24877073-24877092 MsG0280008055.01.T07:CDS 55.0%
GCAGAGAATGGTGTCCTTGC+TGG + Chr2:24877510-24877529 None:intergenic 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr2 gene 24876936 24878189 24876936 ID=MsG0280008055.01;Name=MsG0280008055.01
Chr2 mRNA 24877109 24878189 24877109 ID=MsG0280008055.01.T01;Parent=MsG0280008055.01;Name=MsG0280008055.01.T01;_AED=0.49;_eAED=0.49;_QI=0|0|0|1|0|0|3|0|294
Chr2 exon 24877109 24877158 24877109 ID=MsG0280008055.01.T01:exon:34888;Parent=MsG0280008055.01.T01
Chr2 exon 24877250 24877732 24877250 ID=MsG0280008055.01.T01:exon:34887;Parent=MsG0280008055.01.T01
Chr2 CDS 24877838 24878189 24877838 ID=MsG0280008055.01.T01:cds;Parent=MsG0280008055.01.T01
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