AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0280008210.01

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MsG0280008210.01.T01 AT2G18470 31.765 255 118 5 2 201 309 562 8.97e-28 112
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MsG0280008210.01.T01 AT1G68690 30.962 239 110 5 16 199 415 653 2.97e-27 110
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MsG0280008210.01.T01 AT5G16900 30.677 251 121 5 2 200 598 847 4.30e-27 110
MsG0280008210.01.T01 AT1G68690 46.087 115 61 1 16 129 415 529 4.62e-27 110
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MsG0280008210.01.T01 AT5G18500 46.218 119 61 1 16 131 204 322 6.06e-27 108
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MsG0280008210.01.T01 AT1G56720 30.290 241 102 5 16 196 217 451 8.85e-26 105
MsG0280008210.01.T01 AT1G56720 30.290 241 102 5 16 196 217 451 8.85e-26 105
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MsG0280008210.01.T01 AT4G11890 44.628 121 64 2 2 120 62 181 1.93e-25 103
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MsG0280008210.01.T01 AT1G61490 29.615 260 128 6 2 207 515 773 1.97e-25 105
MsG0280008210.01.T01 AT1G61490 29.615 260 128 6 2 207 515 773 1.97e-25 105
MsG0280008210.01.T01 AT1G61490 29.615 260 128 6 2 207 515 773 1.97e-25 105
MsG0280008210.01.T01 AT3G46400 44.186 129 69 2 2 128 601 728 1.99e-25 105
MsG0280008210.01.T01 AT1G61490 29.615 260 128 6 2 207 489 747 2.15e-25 105
MsG0280008210.01.T01 AT1G61490 29.615 260 128 6 2 207 489 747 2.15e-25 105
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MsG0280008210.01.T01 AT1G61420 30.385 260 126 7 2 207 521 779 2.15e-25 105
MsG0280008210.01.T01 AT1G61420 30.385 260 126 7 2 207 519 777 2.22e-25 105
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MsG0280008210.01.T01 AT3G18810 46.774 124 64 2 2 124 362 484 2.38e-25 105
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MsG0280008210.01.T01 AT1G29740 45.082 122 65 2 1 121 701 821 2.56e-25 105
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MsG0280008210.01.T01 AT5G54590 31.579 247 122 8 1 201 137 382 3.66e-25 103
MsG0280008210.01.T01 AT5G54590 31.579 247 122 8 1 201 137 382 3.66e-25 103
MsG0280008210.01.T01 AT4G32710 46.364 110 58 1 16 124 427 536 3.72e-25 104
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MsG0280008210.01.T01 AT5G65700 33.594 256 114 8 1 203 718 970 5.96e-25 104
MsG0280008210.01.T01 AT2G18890 44.961 129 65 4 2 126 94 220 6.25e-25 100
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MsG0280008210.01.T01 AT2G43700 43.750 128 69 2 2 127 336 462 7.67e-25 103
MsG0280008210.01.T01 AT2G43700 43.750 128 69 2 2 127 336 462 7.67e-25 103
MsG0280008210.01.T01 AT2G43700 43.750 128 69 2 2 127 336 462 7.67e-25 103
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MsG0280008210.01.T01 AT2G35620 30.165 242 113 5 16 204 342 580 7.80e-25 103
MsG0280008210.01.T01 AT2G35620 30.165 242 113 5 16 204 342 580 7.80e-25 103
MsG0280008210.01.T01 AT2G35620 30.165 242 113 5 16 204 342 580 7.80e-25 103
MsG0280008210.01.T01 AT2G43700 43.750 128 69 2 2 127 360 486 8.33e-25 103
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MsG0280008210.01.T01 AT4G23190 44.262 122 65 2 2 121 297 417 1.16e-24 103
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MsG0280008210.01.T01 AT2G42960 44.348 115 61 1 16 127 221 335 1.30e-24 102
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MsG0280008210.01.T01 AT1G48210 27.099 262 127 4 3 203 94 352 1.52e-24 100
MsG0280008210.01.T01 AT1G48210 27.099 262 127 4 3 203 94 352 1.52e-24 100
MsG0280008210.01.T01 AT1G48210 27.099 262 127 4 3 203 94 352 1.52e-24 100
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MsG0280008210.01.T01 AT4G23210 48.361 122 60 2 2 121 383 503 1.64e-24 102
MsG0280008210.01.T01 AT2G18890 44.961 129 65 4 2 126 94 220 1.66e-24 101
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MsG0280008210.01.T01 AT1G55610 45.238 126 61 2 16 133 897 1022 1.80e-24 102
MsG0280008210.01.T01 AT4G23180 46.721 122 62 2 2 121 373 493 1.84e-24 102
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MsG0280008210.01.T01 AT3G13690 29.482 251 121 6 1 197 435 683 2.16e-24 102
MsG0280008210.01.T01 AT3G13690 29.482 251 121 6 1 197 435 683 2.16e-24 102
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MsG0280008210.01.T01 AT4G23210 48.361 122 60 2 2 121 383 503 2.43e-24 102
MsG0280008210.01.T01 AT3G46420 41.860 129 72 2 2 128 556 683 2.56e-24 102
MsG0280008210.01.T01 AT4G23220 42.424 132 73 2 2 131 361 491 2.56e-24 102
MsG0280008210.01.T01 AT5G60270 29.388 245 107 6 17 203 383 619 2.64e-24 102
MsG0280008210.01.T01 AT3G24240 40.441 136 72 2 1 127 810 945 2.68e-24 102
MsG0280008210.01.T01 AT2G28970 42.520 127 70 2 2 126 504 629 2.71e-24 102
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MsG0280008210.01.T01 AT4G23270 41.791 134 75 2 2 133 351 483 2.81e-24 102
MsG0280008210.01.T01 AT1G11330 32.000 250 111 6 2 195 547 793 2.81e-24 102
MsG0280008210.01.T01 AT4G23180 46.721 122 62 2 2 121 373 493 2.92e-24 102
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MsG0280008210.01.T01 AT4G23270 41.791 134 75 2 2 133 351 483 2.99e-24 102
MsG0280008210.01.T01 AT4G11900 46.721 122 62 2 2 121 562 682 3.13e-24 102
MsG0280008210.01.T01 AT4G02630 42.336 137 70 3 1 131 186 319 3.21e-24 101
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MsG0280008210.01.T01 AT4G11900 46.721 122 62 2 2 121 562 682 3.33e-24 102
MsG0280008210.01.T01 AT4G11900 46.721 122 62 2 2 121 562 682 3.40e-24 102
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MsG0280008210.01.T01 AT4G11900 46.721 122 62 2 2 121 562 682 4.04e-24 101
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MsG0280008210.01.T01 AT3G45440 28.431 306 153 8 2 247 367 666 4.76e-24 101
MsG0280008210.01.T01 AT3G45440 28.431 306 153 8 2 247 367 666 4.76e-24 101
MsG0280008210.01.T01 AT1G76360 41.085 129 73 3 2 129 198 324 4.93e-24 100
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MsG0280008210.01.T01 AT3G05140 30.769 247 119 5 1 197 167 411 3.37e-23 98.2
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MsG0280008210.01.T01 AT1G61430 45.082 122 64 2 2 121 514 634 5.50e-23 98.2
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MsG0280008210.01.T01 AT5G01950 45.794 107 57 1 16 121 664 770 5.53e-23 98.6
MsG0280008210.01.T01 AT5G01950 45.794 107 57 1 16 121 664 770 5.53e-23 98.6
MsG0280008210.01.T01 AT3G20530 42.478 113 61 1 16 124 121 233 5.55e-23 95.9
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MsG0280008210.01.T01 AT3G45430 27.509 269 140 4 17 234 383 647 5.66e-23 98.2
MsG0280008210.01.T01 AT5G25930 39.394 132 71 2 2 124 711 842 5.82e-23 98.6
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MsG0280008210.01.T01 AT5G53890 29.600 250 121 6 3 198 780 1028 6.14e-23 98.2
MsG0280008210.01.T01 AT1G01540 27.660 235 116 2 16 196 192 426 6.15e-23 97.8
MsG0280008210.01.T01 AT5G38990 43.200 125 66 2 1 121 550 673 6.19e-23 98.2
MsG0280008210.01.T01 AT5G01950 45.794 107 57 1 16 121 664 770 6.62e-23 98.2
MsG0280008210.01.T01 AT3G20530 42.478 113 61 1 16 124 121 233 6.66e-23 96.7
MsG0280008210.01.T01 AT1G61480 29.771 262 125 7 2 207 521 779 6.71e-23 98.2
MsG0280008210.01.T01 AT2G28960 42.636 129 71 2 2 128 598 725 6.74e-23 98.2
MsG0280008210.01.T01 AT5G24010 45.000 120 64 2 4 121 514 633 6.74e-23 98.2
MsG0280008210.01.T01 AT2G30940 28.326 233 129 3 2 196 191 423 6.87e-23 97.4
MsG0280008210.01.T01 AT1G01540 42.105 114 63 1 16 126 192 305 7.00e-23 96.7
MsG0280008210.01.T01 AT1G70530 46.721 122 62 2 2 121 348 468 7.37e-23 97.8
MsG0280008210.01.T01 AT1G70740 45.082 122 64 2 2 121 75 195 9.92e-23 96.7
MsG0280008210.01.T01 AT1G66150 29.435 248 111 6 18 204 630 874 1.00e-22 97.8
MsG0280008210.01.T01 AT2G25220 43.363 113 62 1 17 127 185 297 1.08e-22 96.7
MsG0280008210.01.T01 AT5G54380 46.296 108 57 1 18 124 550 657 1.11e-22 97.4
MsG0280008210.01.T01 AT4G05200 28.295 258 129 8 2 204 372 628 1.11e-22 97.4
MsG0280008210.01.T01 AT4G11460 42.308 130 69 2 2 126 371 499 1.15e-22 97.4
MsG0280008210.01.T01 AT5G49770 45.370 108 58 1 18 124 674 781 1.16e-22 97.4
MsG0280008210.01.T01 AT1G72540 29.478 268 128 11 2 212 116 379 1.17e-22 96.7
MsG0280008210.01.T01 AT5G56460 40.800 125 72 2 2 125 110 233 1.18e-22 96.3
MsG0280008210.01.T01 AT4G05200 28.295 258 129 8 2 204 390 646 1.22e-22 97.4
MsG0280008210.01.T01 AT5G01950 45.536 112 55 2 16 121 664 775 1.24e-22 97.4
MsG0280008210.01.T01 AT3G26700 32.549 255 113 9 17 215 115 366 1.25e-22 95.9
MsG0280008210.01.T01 AT3G26700 32.549 255 113 9 17 215 115 366 1.25e-22 95.9
MsG0280008210.01.T01 AT3G26700 32.549 255 113 9 17 215 115 366 1.25e-22 95.9
MsG0280008210.01.T01 AT1G70530 46.721 122 62 2 2 121 348 468 1.27e-22 97.1
MsG0280008210.01.T01 AT2G25220 43.363 113 62 1 17 127 136 248 1.31e-22 95.9
MsG0280008210.01.T01 AT1G07560 40.157 127 74 2 2 128 595 719 1.34e-22 97.4
MsG0280008210.01.T01 AT4G21230 30.534 262 125 8 2 207 358 618 1.36e-22 97.1
MsG0280008210.01.T01 AT4G23250 43.077 130 71 2 2 129 384 512 1.37e-22 97.1
MsG0280008210.01.T01 AT1G70530 46.721 122 62 2 2 121 348 468 1.40e-22 97.1
MsG0280008210.01.T01 AT4G23250 45.082 122 64 2 2 121 379 499 1.45e-22 97.1
MsG0280008210.01.T01 AT5G49780 45.714 105 56 1 18 121 673 777 1.46e-22 97.4
MsG0280008210.01.T01 AT5G49780 45.714 105 56 1 18 121 574 678 1.50e-22 97.1
MsG0280008210.01.T01 AT4G23290 41.481 135 76 2 2 134 345 478 1.50e-22 97.1
MsG0280008210.01.T01 AT2G25220 43.363 113 62 1 17 127 190 302 1.55e-22 96.3
MsG0280008210.01.T01 AT2G25220 43.363 113 62 1 17 127 185 297 1.55e-22 95.5

Find 54 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 76 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
AACCCTAAAGTTGCTGATTT+TGG 0.134710 2:-27211649 MsG0280008210.01.T01:intron
ATCCTAAGATATTGTATTCT+TGG 0.173391 2:+27211797 None:intergenic
CTCATTGTAGGTCTTGATTT+TGG 0.190436 2:+27211291 None:intergenic
TTCAATCTTGTCAGGCTATA+TGG 0.235142 2:-27211895 MsG0280008210.01.T01:CDS
AAACCAAAATCAGCAACTTT+AGG 0.237796 2:+27211646 None:intergenic
ACTTGGTACTTCGTCATTAC+AGG 0.267350 2:+27211087 None:intergenic
TTCCAAGAATACAATATCTT+AGG 0.294237 2:-27211799 MsG0280008210.01.T01:CDS
AACCAAAATCAGCAACTTTA+GGG 0.294506 2:+27211647 None:intergenic
TGAAAAGGATTCAAAGGCTT+TGG 0.315068 2:+27211231 None:intergenic
AATGGTTTCCAATGTGGGTT+TGG 0.361374 2:-27211431 MsG0280008210.01.T01:CDS
AAAATTTGATGCTGAAAAGT+TGG 0.369076 2:-27211406 MsG0280008210.01.T01:CDS
ATGGCAGAAGTTGGCACAAT+AGG 0.394505 2:-27211931 MsG0280008210.01.T01:CDS
CTTTGGCATGTGTTCAATAT+AGG 0.403404 2:-27211314 MsG0280008210.01.T01:CDS
GATTGTAGAGAGAATGGTTA+AGG 0.411870 2:-27211340 MsG0280008210.01.T01:CDS
TCAGTATTGATCTGTGATAT+TGG 0.415216 2:+27211171 None:intergenic
TTCACCATTTCAATCTTGTC+AGG 0.416832 2:-27211903 MsG0280008210.01.T01:CDS
GAGAATGGTTAAGGTAGCTT+TGG 0.419204 2:-27211331 MsG0280008210.01.T01:CDS
AAGAATTGATCAACAGTTCA+TGG 0.426232 2:-27211950 MsG0280008210.01.T01:CDS
AAGCTTCAAGAGATTGCAAT+TGG 0.434260 2:-27211769 MsG0280008210.01.T01:CDS
TGTACCACAAGACTCATTGT+AGG 0.435771 2:+27211279 None:intergenic
ACTGATACAAGTATTGGTTC+TGG 0.438560 2:-27211153 MsG0280008210.01.T01:CDS
GTAACTGAATCTAGTGTTGA+AGG 0.440753 2:-27211117 MsG0280008210.01.T01:CDS
AGTAGCAGCTTGTGGGATAG+AGG 0.448065 2:-27211376 MsG0280008210.01.T01:CDS
TATAGAGATTGTAGAGAGAA+TGG 0.448458 2:-27211346 MsG0280008210.01.T01:CDS
TAGAACCTTGACAGCTATCA+TGG 0.470996 2:+27211990 None:intergenic
AAAACCAGGAAATATTCTCT+TGG 0.471067 2:-27211683 MsG0280008210.01.T01:CDS
TTTCTGAAAGGTTTACATCA+AGG 0.476976 2:+27211460 None:intergenic
CCATCAATCATATATTGAAA+AGG 0.479015 2:+27211216 None:intergenic
GTATCCAAGAGAATATTTCC+TGG 0.481066 2:+27211679 None:intergenic
ACCTTTCAGAAAGTCAAGAA+TGG 0.489826 2:-27211449 MsG0280008210.01.T01:CDS
TCAAGAATGGTTTCCAATGT+GGG 0.510113 2:-27211436 MsG0280008210.01.T01:CDS
CAACAGTTCATGGCAGAAGT+TGG 0.512948 2:-27211940 MsG0280008210.01.T01:CDS
ATAGCCTGACAAGATTGAAA+TGG 0.515188 2:+27211899 None:intergenic
CGTAGTGGATTATTCTCTGT+TGG 0.517981 2:+27211710 None:intergenic
ACCATTCTTGACTTTCTGAA+AGG 0.519834 2:+27211448 None:intergenic
TTGATCTGTGATATTGGCAT+TGG 0.523176 2:+27211177 None:intergenic
ATCAATACTGATACAAGTAT+TGG 0.527215 2:-27211159 MsG0280008210.01.T01:CDS
AGCGAGATGCTGATTCGACT+TGG 0.527513 2:+27211070 None:intergenic
ATTTGATGCTGAAAAGTTGG+AGG 0.532834 2:-27211403 MsG0280008210.01.T01:CDS
GAGGAGTTAGTAGCAGCTTG+TGG 0.540066 2:-27211384 MsG0280008210.01.T01:CDS
GTCAAGAATGGTTTCCAATG+TGG 0.543673 2:-27211437 MsG0280008210.01.T01:CDS
ATATATTGAAAAGGATTCAA+AGG 0.545732 2:+27211225 None:intergenic
GAGTCTTGTGGTACAAATGT+TGG 0.548077 2:-27211271 MsG0280008210.01.T01:CDS
AGGAGTTAGTAGCAGCTTGT+GGG 0.549040 2:-27211383 MsG0280008210.01.T01:CDS
TCAAGAGATTGCAATTGGTA+CGG 0.559817 2:-27211764 MsG0280008210.01.T01:CDS
ATTGCAATTGGTACGGCAAG+AGG 0.569913 2:-27211757 MsG0280008210.01.T01:CDS
CTTGTGGTACAAATGTTGGA+AGG 0.579324 2:-27211267 MsG0280008210.01.T01:CDS
ATAGCTGTCAAGGTTCTACA+TGG 0.580091 2:-27211985 MsG0280008210.01.T01:CDS
TGGAACCATGATAGCTGTCA+AGG 0.597568 2:-27211995 None:intergenic
GTTTATGAATACATGAGGAA+CGG 0.598734 2:-27211841 MsG0280008210.01.T01:CDS
ATCCACTACGATATAAAACC+AGG 0.600095 2:-27211697 MsG0280008210.01.T01:CDS
TGAGGAACGGATCTCTTGAT+CGG 0.614434 2:-27211828 MsG0280008210.01.T01:CDS
CACTTGTTTATGAATACATG+AGG 0.628138 2:-27211846 MsG0280008210.01.T01:CDS
AAGACCTACAATGAGTCTTG+TGG 0.664150 2:-27211283 MsG0280008210.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! ATACTATTATTTGAAATTAT+AGG - Chr2:27211561-27211580 MsG0280008210.01.T01:intron 10.0%
!!! TATTATTTGAAATTATAGGT+AGG - Chr2:27211565-27211584 MsG0280008210.01.T01:intron 15.0%
!! ATATATTGAAAAGGATTCAA+AGG + Chr2:27211834-27211853 None:intergenic 20.0%
! AAAATTTGATGCTGAAAAGT+TGG - Chr2:27211650-27211669 MsG0280008210.01.T01:CDS 25.0%
! ATCAATACTGATACAAGTAT+TGG - Chr2:27211897-27211916 MsG0280008210.01.T01:CDS 25.0%
! ATCCTAAGATATTGTATTCT+TGG + Chr2:27211262-27211281 None:intergenic 25.0%
! CCATCAATCATATATTGAAA+AGG + Chr2:27211843-27211862 None:intergenic 25.0%
! TTCCAAGAATACAATATCTT+AGG - Chr2:27211257-27211276 MsG0280008210.01.T01:CDS 25.0%
!! CCTTTTCAATATATGATTGA+TGG - Chr2:27211840-27211859 MsG0280008210.01.T01:CDS 25.0%
AAAACCAGGAAATATTCTCT+TGG - Chr2:27211373-27211392 MsG0280008210.01.T01:CDS 30.0%
AAACCAAAATCAGCAACTTT+AGG + Chr2:27211413-27211432 None:intergenic 30.0%
AACCAAAATCAGCAACTTTA+GGG + Chr2:27211412-27211431 None:intergenic 30.0%
AAGAATTGATCAACAGTTCA+TGG - Chr2:27211106-27211125 MsG0280008210.01.T01:CDS 30.0%
CACTTGTTTATGAATACATG+AGG - Chr2:27211210-27211229 MsG0280008210.01.T01:CDS 30.0%
GTTTATGAATACATGAGGAA+CGG - Chr2:27211215-27211234 MsG0280008210.01.T01:CDS 30.0%
TATAGAGATTGTAGAGAGAA+TGG - Chr2:27211710-27211729 MsG0280008210.01.T01:CDS 30.0%
! ATTTTCCCTATTGCAAAGTT+TGG + Chr2:27211438-27211457 None:intergenic 30.0%
! TTTCTGAAAGGTTTACATCA+AGG + Chr2:27211599-27211618 None:intergenic 30.0%
!! TCAGTATTGATCTGTGATAT+TGG + Chr2:27211888-27211907 None:intergenic 30.0%
!!! AATTTTTTCCAAACCCACAT+TGG + Chr2:27211636-27211655 None:intergenic 30.0%
!!! TAAAGTTGCTGATTTTGGTT+TGG - Chr2:27211412-27211431 MsG0280008210.01.T01:CDS 30.0%
AAGCTTCAAGAGATTGCAAT+TGG - Chr2:27211287-27211306 MsG0280008210.01.T01:CDS 35.0%
AATACTCACATAACCATGAC+CGG - Chr2:27211455-27211474 MsG0280008210.01.T01:CDS 35.0%
ACCATTCTTGACTTTCTGAA+AGG + Chr2:27211611-27211630 None:intergenic 35.0%
ACCTTTCAGAAAGTCAAGAA+TGG - Chr2:27211607-27211626 MsG0280008210.01.T01:intron 35.0%
ATAGCCTGACAAGATTGAAA+TGG + Chr2:27211160-27211179 None:intergenic 35.0%
ATCCACTACGATATAAAACC+AGG - Chr2:27211359-27211378 MsG0280008210.01.T01:CDS 35.0%
ATTTGATGCTGAAAAGTTGG+AGG - Chr2:27211653-27211672 MsG0280008210.01.T01:CDS 35.0%
CAAGTGTGACGTTTATAGTT+TGG - Chr2:27211537-27211556 MsG0280008210.01.T01:intron 35.0%
CTTTGGCATGTGTTCAATAT+AGG - Chr2:27211742-27211761 MsG0280008210.01.T01:CDS 35.0%
GATTGTAGAGAGAATGGTTA+AGG - Chr2:27211716-27211735 MsG0280008210.01.T01:CDS 35.0%
GTATCCAAGAGAATATTTCC+TGG + Chr2:27211380-27211399 None:intergenic 35.0%
TCAAGAATGGTTTCCAATGT+GGG - Chr2:27211620-27211639 MsG0280008210.01.T01:intron 35.0%
TCAAGAGATTGCAATTGGTA+CGG - Chr2:27211292-27211311 MsG0280008210.01.T01:CDS 35.0%
TGAAAAGGATTCAAAGGCTT+TGG + Chr2:27211828-27211847 None:intergenic 35.0%
TTCAATCTTGTCAGGCTATA+TGG - Chr2:27211161-27211180 MsG0280008210.01.T01:CDS 35.0%
TTCACCATTTCAATCTTGTC+AGG - Chr2:27211153-27211172 MsG0280008210.01.T01:CDS 35.0%
TTGATCTGTGATATTGGCAT+TGG + Chr2:27211882-27211901 None:intergenic 35.0%
TTTGGCCAAACTTTGCAATA+GGG - Chr2:27211430-27211449 MsG0280008210.01.T01:CDS 35.0%
! CTCATTGTAGGTCTTGATTT+TGG + Chr2:27211768-27211787 None:intergenic 35.0%
! GTAACTGAATCTAGTGTTGA+AGG - Chr2:27211939-27211958 MsG0280008210.01.T01:CDS 35.0%
!! ACTGATACAAGTATTGGTTC+TGG - Chr2:27211903-27211922 MsG0280008210.01.T01:CDS 35.0%
!!! AACCCTAAAGTTGCTGATTT+TGG - Chr2:27211407-27211426 MsG0280008210.01.T01:CDS 35.0%
!!! TTCCTGGTTTTATATCGTAG+TGG + Chr2:27211364-27211383 None:intergenic 35.0%
AAGACCTACAATGAGTCTTG+TGG - Chr2:27211773-27211792 MsG0280008210.01.T01:CDS 40.0%
AATGGTTTCCAATGTGGGTT+TGG - Chr2:27211625-27211644 MsG0280008210.01.T01:intron 40.0%
ACTTGGTACTTCGTCATTAC+AGG + Chr2:27211972-27211991 None:intergenic 40.0%
ATAGCTGTCAAGGTTCTACA+TGG - Chr2:27211071-27211090 MsG0280008210.01.T01:CDS 40.0%
CACTTGTGAGTTACAGGAAA+TGG + Chr2:27211523-27211542 None:intergenic 40.0%
CTTGTGGTACAAATGTTGGA+AGG - Chr2:27211789-27211808 MsG0280008210.01.T01:CDS 40.0%
GAGAATGGTTAAGGTAGCTT+TGG - Chr2:27211725-27211744 MsG0280008210.01.T01:CDS 40.0%
GTCAAGAATGGTTTCCAATG+TGG - Chr2:27211619-27211638 MsG0280008210.01.T01:intron 40.0%
GTTTGGCCAAACTTTGCAAT+AGG - Chr2:27211429-27211448 MsG0280008210.01.T01:CDS 40.0%
TGTACCACAAGACTCATTGT+AGG + Chr2:27211780-27211799 None:intergenic 40.0%
! GAGTCTTGTGGTACAAATGT+TGG - Chr2:27211785-27211804 MsG0280008210.01.T01:CDS 40.0%
!! CGTAGTGGATTATTCTCTGT+TGG + Chr2:27211349-27211368 None:intergenic 40.0%
ACGTCACACTTGTGAGTTAC+AGG + Chr2:27211529-27211548 None:intergenic 45.0%
AGGAGTTAGTAGCAGCTTGT+GGG - Chr2:27211673-27211692 MsG0280008210.01.T01:CDS 45.0%
ATGGCAGAAGTTGGCACAAT+AGG - Chr2:27211125-27211144 MsG0280008210.01.T01:CDS 45.0%
ATTGCAATTGGTACGGCAAG+AGG - Chr2:27211299-27211318 MsG0280008210.01.T01:CDS 45.0%
CAACAGTTCATGGCAGAAGT+TGG - Chr2:27211116-27211135 MsG0280008210.01.T01:CDS 45.0%
GGAAATGGCATCCAAAGTTC+AGG + Chr2:27211508-27211527 None:intergenic 45.0%
GTTATGCAGCACCTGAACTT+TGG - Chr2:27211494-27211513 MsG0280008210.01.T01:intron 45.0%
TGAGGAACGGATCTCTTGAT+CGG - Chr2:27211228-27211247 MsG0280008210.01.T01:CDS 45.0%
! AAGTTCAGGTGCTGCATAAC+CGG + Chr2:27211494-27211513 None:intergenic 45.0%
ACATAACCATGACCGGAGGA+AGG - Chr2:27211462-27211481 MsG0280008210.01.T01:CDS 50.0%
ACTCACATAACCATGACCGG+AGG - Chr2:27211458-27211477 MsG0280008210.01.T01:CDS 50.0%
AGTAGCAGCTTGTGGGATAG+AGG - Chr2:27211680-27211699 MsG0280008210.01.T01:CDS 50.0%
ATAACCATGACCGGAGGAAG+GGG - Chr2:27211464-27211483 MsG0280008210.01.T01:CDS 50.0%
CATAACCATGACCGGAGGAA+GGG - Chr2:27211463-27211482 MsG0280008210.01.T01:CDS 50.0%
GAGGAGTTAGTAGCAGCTTG+TGG - Chr2:27211672-27211691 MsG0280008210.01.T01:CDS 50.0%
!! AGCGAGATGCTGATTCGACT+TGG + Chr2:27211989-27212008 None:intergenic 50.0%
TAACCATGACCGGAGGAAGG+GGG - Chr2:27211465-27211484 MsG0280008210.01.T01:CDS 55.0%
AACCGGCGTCCCCCTTCCTC+CGG + Chr2:27211477-27211496 None:intergenic 70.0%
CGTCCCCCTTCCTCCGGTCA+TGG + Chr2:27211471-27211490 None:intergenic 70.0%
GACCGGAGGAAGGGGGACGC+CGG - Chr2:27211472-27211491 MsG0280008210.01.T01:CDS 75.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr2 gene 27211068 27212010 27211068 ID=MsG0280008210.01;Name=MsG0280008210.01
Chr2 mRNA 27211068 27212010 27211068 ID=MsG0280008210.01.T01;Parent=MsG0280008210.01;Name=MsG0280008210.01.T01;_AED=0.44;_eAED=0.44;_QI=0|0|0|1|1|1|2|0|262
Chr2 exon 27211650 27212010 27211650 ID=MsG0280008210.01.T01:exon:18795;Parent=MsG0280008210.01.T01
Chr2 exon 27211068 27211495 27211068 ID=MsG0280008210.01.T01:exon:18794;Parent=MsG0280008210.01.T01
Chr2 CDS 27211650 27212010 27211650 ID=MsG0280008210.01.T01:cds;Parent=MsG0280008210.01.T01
Chr2 CDS 27211068 27211495 27211068 ID=MsG0280008210.01.T01:cds;Parent=MsG0280008210.01.T01
Gene Sequence

>MsG0280008210.01.T01

ATGATAGCTGTCAAGGTTCTACATGGAAGCTCTGACAAAAGAATTGATCAACAGTTCATGGCAGAAGTTGGCACAATAGGTAAAGTTCACCATTTCAATCTTGTCAGGCTATATGGTTTTTGTTTTGAAAAGAACTTGATAGCACTTGTTTATGAATACATGAGGAACGGATCTCTTGATCGGTATTTGTTCCAAGAATACAATATCTTAGGATTTGAAAAGCTTCAAGAGATTGCAATTGGTACGGCAAGAGGCATTGCTTACTTACATGAAGAATGCCAACAGAGAATAATCCACTACGATATAAAACCAGGAAATATTCTCTTGGATACGAATTTCAACCCTAAAGTTGCTGATTTTGGTAGGAGAAAAAACCTTGATGTAAACCTTTCAGAAAGTCAAGAATGGTTTCCAATGTGGGTTTGGAAAAAATTTGATGCTGAAAAGTTGGAGGAGTTAGTAGCAGCTTGTGGGATAGAGGAGCAAAATATAGAGATTGTAGAGAGAATGGTTAAGGTAGCTTTGGCATGTGTTCAATATAGGCCAAAATCAAGACCTACAATGAGTCTTGTGGTACAAATGTTGGAAGGTTTAGTTGAAATTCCAAAGCCTTTGAATCCTTTTCAATATATGATTGATGGAACTTCTTCTTATCTTCCAATGCCAATATCACAGATCAATACTGATACAAGTATTGGTTCTGGCTCTTCTGCGATCGTAACTGAATCTAGTGTTGAAGGTGTTACTCCTGTAATGACGAAGTACCAAGTCGAATCAGCATCTCGCTAA
Protein sequence

>MsG0280008210.01.T01

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