AlfalfaGEDB | MsG0380012088.01

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380012088.01

KEGG: -
GO: GO:0016747
PFAM: PF02458

Nr:

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Swissprot:

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Trembl:

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TFs/TRs:

Gene ID	Type	Classification

Protein Kinases:

Gene ID	Type	Classification

Network:

Co-expression Network

Gene1	Gene2	correlation coefficient	p_value	FDR
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PPI

Gene1	Gene2	Type

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MsG0380012088.01.T01	AT5G23940	37.968	187	111	2	6	190	267	450	3.91e-32	121
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CRISPR-Local

CRISPR-Local
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CRISPR-GE

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!!!	TTAAATGGAAGGTTGATAAT+TGG	-	Chr3:10759571-10759590	None:intergenic	25.0%
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	ATCCAGGTCAAGAAGGAGGA+GGG	+	Chr3:10760164-10760183	MsG0380012088.01.T01:CDS	50.0%
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!	ATGATCTAGGATGGGCAGCA+TGG	+	Chr3:10759912-10759931	MsG0380012088.01.T01:CDS	50.0%
!	CATGCACGTCGACTACAACA+GGG	+	Chr3:10759761-10759780	MsG0380012088.01.T01:CDS	50.0%
!	TCATGCACGTCGACTACAAC+AGG	+	Chr3:10759760-10759779	MsG0380012088.01.T01:CDS	50.0%
	AACGACGGTAGGAGAGTTGC+TGG	+	Chr3:10759886-10759905	MsG0380012088.01.T01:CDS	55.0%
!!	GTGAGTGCTGAAACGACGGT+AGG	+	Chr3:10759875-10759894	MsG0380012088.01.T01:CDS	55.0%
	CTCCCTCCTCCTTCTTGACC+TGG	-	Chr3:10760169-10760188	None:intergenic	60.0%

Chromosome	Type	Strat	End	Strand	Name
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Chr3	three_prime_UTR	10760289	10760349	10760289	ID=MsG0380012088.01.T01:three_prime_utr;Parent=MsG0380012088.01.T01
Chr3	mRNA	10759827	10760288	10759827	ID=MsG0380012088.01.T02;Parent=MsG0380012088.01;Name=MsG0380012088.01.T02;_AED=0.38;_eAED=0.38;_QI=0\|-1\|0\|1\|-1\|0\|1\|0\|153
Chr3	exon	10759827	10760288	10759827	ID=MsG0380012088.01.T02:exon:23015;Parent=MsG0380012088.01.T02
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Gene Sequence

>MsG0380012088.01.T01

ATGCAGAGTGTATACAAACAAATTTCTTCGTTTCAATCTTTATCAGCATTAGTTTGGAGATCTATAACTCATGCACGTCGACTACAACAGGGTCAGAGAACAACTTGCAAAATGGCTACAAACAACCGAACAAGAATGGAACCACCTCTTCCTAAGGAATATTTTGGGAATTCAATTTATGTAGTGAGTGCTGAAACGACGGTAGGAGAGTTGCTGGAGAATGATCTAGGATGGGCAGCATGGAAAATTCATGAGGCTATTGCAAATCATGATAATAAAGTGGTGCTTAGGTCGGTTGAAGAGTGGTTTCGTTCTCCTTTTTTGTATCGATTAGATTTGTTTTTTGATCCTTATACTGTGATGATAAGTGGTTCATCGAGGTTTAATACGTATGGAAATGAATTTGGAATGGGAAAAGCTTTGGCAGTTAGAAGTGGATATGCTAACAAATTTGATGGAAAAGTAATTTCATATCCAGGTCAAGAAGGAGGAGGGAGCATAGATCTTGAAGTGTGTCTTTCACCTGAGAAAATGATGGTGCTGGAGACAGATGAAGAGTTCATGAACTCAGTTTCTGTGTTTAATCCTTTGTTCTAA

>MsG0380012088.01.T02

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Protein sequence

>MsG0380012088.01.T01

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>MsG0380012088.01.T02

MEPPLPKEYFGNSIYVVSAETTVGELLENDLGWAAWKIHEAIANHDNKVVLRSVEEWFRSPFLYRLDLFFDPYTVMISGSSRFNTYGNEFGMGKALAVRSGYANKFDGKVISYPGQEGGGSIDLEVCLSPEKMMVLETDEEFMNSVSVFNPLF*