AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380014268.01

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MsG0380014268.01.T01 AT5G65560 30.000 320 158 5 1 255 209 527 1.01e-37 140
MsG0380014268.01.T01 AT5G65560 31.390 223 118 2 48 255 186 388 5.21e-30 118
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MsG0380014268.01.T01 AT3G06920 25.424 236 141 2 35 255 137 352 1.50e-13 70.5
MsG0380014268.01.T01 AT3G06920 25.949 158 97 2 1 158 697 834 5.90e-12 65.9
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MsG0380014268.01.T01 AT2G02150 27.215 316 165 2 1 251 253 568 1.89e-34 131
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MsG0380014268.01.T01 AT2G02150 25.573 262 165 4 24 255 206 467 7.58e-23 97.8
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MsG0380014268.01.T01 AT1G07740 29.461 241 155 1 6 231 182 422 3.31e-31 120
MsG0380014268.01.T01 AT1G07740 23.549 293 159 2 28 255 64 356 3.55e-19 86.7
MsG0380014268.01.T01 AT1G03560 29.259 270 156 4 1 255 213 462 6.44e-31 120
MsG0380014268.01.T01 AT1G03560 27.532 316 163 4 6 255 253 568 1.10e-28 114
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MsG0380014268.01.T01 AT1G03560 30.729 192 98 2 79 255 186 357 5.69e-20 89.4
MsG0380014268.01.T01 AT2G16880 28.114 281 172 3 5 255 375 655 8.19e-31 120
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MsG0380014268.01.T01 AT2G16880 27.362 307 151 7 1 255 195 481 7.93e-26 106
MsG0380014268.01.T01 AT2G16880 25.084 299 170 4 1 246 442 739 4.82e-24 101
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MsG0380014268.01.T01 AT2G19280 30.000 230 144 3 1 214 434 662 1.11e-26 108
MsG0380014268.01.T01 AT2G19280 24.907 269 169 4 17 255 348 613 4.15e-23 98.6
MsG0380014268.01.T01 AT2G19280 23.050 282 190 2 1 255 262 543 8.07e-21 91.7
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MsG0380014268.01.T01 AT5G08310 28.780 205 124 2 1 203 640 824 8.34e-18 83.2
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MsG0380014268.01.T01 AT5G08310 23.013 239 155 4 43 252 175 413 1.82e-11 64.3
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MsG0380014268.01.T01 AT2G41720 24.815 270 168 2 1 255 346 595 1.48e-24 102
MsG0380014268.01.T01 AT2G41720 24.060 266 169 3 1 251 204 451 2.75e-18 84.3
MsG0380014268.01.T01 AT2G41720 24.903 257 157 6 26 248 159 413 9.00e-17 80.1
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MsG0380014268.01.T01 AT1G77360 22.124 226 142 2 44 255 131 336 2.78e-14 72.4
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MsG0380014268.01.T01 AT1G11710 23.028 317 173 5 6 255 258 570 8.24e-22 94.7
MsG0380014268.01.T01 AT1G11710 24.554 224 156 2 10 220 402 625 5.74e-16 77.4
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MsG0380014268.01.T01 AT2G36240 26.201 229 154 1 1 214 254 482 1.22e-21 94.0
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MsG0380014268.01.T01 AT3G18020 25.275 273 163 5 2 236 154 423 8.22e-15 74.3
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MsG0380014268.01.T01 AT5G25630 21.875 320 176 6 3 255 73 385 7.91e-16 77.0
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MsG0380014268.01.T01 AT5G50280 25.379 264 171 6 1 245 405 661 7.10e-20 89.0
MsG0380014268.01.T01 AT5G50280 25.743 202 129 2 14 214 277 458 8.28e-14 71.2
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MsG0380014268.01.T01 AT1G61870 31.250 208 113 4 77 254 184 391 3.56e-17 80.5
MsG0380014268.01.T01 AT1G61870 29.464 112 79 0 1 112 283 394 2.83e-13 69.3
MsG0380014268.01.T01 AT2G35130 26.829 246 163 4 7 236 296 540 7.87e-22 94.7
MsG0380014268.01.T01 AT2G35130 23.792 269 170 2 1 254 255 503 2.30e-17 81.6
MsG0380014268.01.T01 AT2G35130 24.254 268 164 5 3 251 148 395 5.25e-16 77.8
MsG0380014268.01.T01 AT2G35130 26.829 246 163 4 7 236 293 537 7.99e-22 94.7
MsG0380014268.01.T01 AT2G35130 24.528 265 164 4 3 251 148 392 6.54e-18 83.2
MsG0380014268.01.T01 AT2G35130 26.829 246 163 4 7 236 318 562 8.94e-22 94.4
MsG0380014268.01.T01 AT2G35130 23.954 263 165 2 7 254 283 525 2.27e-17 81.6
MsG0380014268.01.T01 AT2G35130 24.254 268 164 5 3 251 170 417 5.08e-16 77.8
MsG0380014268.01.T01 AT4G39620 25.287 261 160 4 23 248 146 406 2.22e-21 93.2
MsG0380014268.01.T01 AT5G46680 29.630 216 135 3 13 212 16 230 2.32e-21 92.8
MsG0380014268.01.T01 AT5G46680 33.333 150 84 2 118 251 31 180 1.26e-17 82.0
MsG0380014268.01.T01 AT5G46680 25.843 267 143 6 2 217 180 442 1.07e-16 79.3
MsG0380014268.01.T01 AT2G15980 28.632 234 127 4 42 255 242 455 2.39e-21 93.2
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MsG0380014268.01.T01 AT1G16830 22.556 266 173 4 1 254 203 447 1.04e-11 65.1
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MsG0380014268.01.T01 AT1G62260 24.658 219 140 5 10 214 312 519 4.69e-15 74.7
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MsG0380014268.01.T01 AT5G15280 25.828 151 92 2 7 157 320 450 2.18e-12 67.0
MsG0380014268.01.T01 AT2G18520 25.735 272 157 9 1 254 128 372 8.66e-15 73.6
MsG0380014268.01.T01 AT1G68930 24.400 250 167 5 5 239 204 446 9.41e-15 73.9
MsG0380014268.01.T01 AT1G68930 22.707 229 162 3 7 223 307 532 9.95e-14 70.9
MsG0380014268.01.T01 AT1G68930 24.400 250 167 5 5 239 230 472 9.60e-15 73.9
MsG0380014268.01.T01 AT1G68930 22.707 229 162 3 7 223 333 558 9.42e-14 71.2
MsG0380014268.01.T01 AT1G79490 24.257 202 133 1 12 213 315 496 1.16e-14 73.9
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MsG0380014268.01.T01 AT4G16835 23.154 298 162 7 10 248 155 444 1.29e-14 73.6
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MsG0380014268.01.T01 AT1G80880 29.050 179 102 4 48 223 261 417 5.68e-12 65.5
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MsG0380014268.01.T01 AT3G53170 23.902 205 136 1 8 212 284 468 3.42e-11 63.2
MsG0380014268.01.T01 AT3G53170 24.409 254 176 2 7 244 212 465 2.71e-11 63.5
MsG0380014268.01.T01 AT3G53170 23.902 205 136 1 8 212 284 468 3.42e-11 63.2
MsG0380014268.01.T01 AT3G01580 25.877 228 149 6 1 214 118 339 2.74e-11 63.5
MsG0380014268.01.T01 AT5G10690 27.632 228 127 8 13 221 75 283 3.21e-11 63.5
MsG0380014268.01.T01 AT5G10690 27.632 228 127 8 13 221 75 283 3.21e-11 63.5
MsG0380014268.01.T01 AT2G34400 23.556 225 156 4 1 213 87 307 3.38e-11 63.5
MsG0380014268.01.T01 AT5G27270 24.454 229 138 2 35 248 8 216 4.16e-11 63.2
MsG0380014268.01.T01 AT5G27270 24.454 229 138 2 35 248 8 216 4.16e-11 63.2
MsG0380014268.01.T01 AT4G02750 20.724 304 168 8 1 251 86 369 4.17e-11 63.2
MsG0380014268.01.T01 AT4G22760 23.346 257 155 7 28 251 246 493 5.19e-11 62.8
MsG0380014268.01.T01 AT1G56570 22.764 246 145 5 10 254 279 480 6.32e-11 62.4
MsG0380014268.01.T01 AT1G56570 22.764 246 145 5 10 254 279 480 6.32e-11 62.4
MsG0380014268.01.T01 AT1G11900 23.243 185 126 2 30 198 162 346 7.49e-11 62.0
MsG0380014268.01.T01 AT3G29230 23.843 281 169 7 1 248 207 475 7.84e-11 62.4
MsG0380014268.01.T01 AT3G25210 29.524 105 74 0 5 109 253 357 7.86e-11 62.0
MsG0380014268.01.T01 AT1G13410 26.339 224 136 5 2 208 82 293 8.27e-11 62.0

Find 58 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 93 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GTTAATGGTTTGTGTAAAAT+TGG 0.215784 3:+52213774 MsG0380014268.01.T01:CDS
TATAAAAGTGTTTCGTTTGA+TGG 0.218031 3:+52214230 MsG0380014268.01.T01:CDS
ACATTTGGAGCGTTGGTTAA+TGG 0.244912 3:+52213759 MsG0380014268.01.T01:CDS
CTTGCACGTTTACTGGTTAA+AGG 0.278853 3:+52214659 MsG0380014268.01.T01:CDS
GAAGGTTCTTGCACGTTTAC+TGG 0.279229 3:+52214652 MsG0380014268.01.T01:CDS
GAAGTGCTTGTGGTTGTCTT+AGG 0.281345 3:+52213805 MsG0380014268.01.T01:CDS
TTTGCGGAAATGAATGAAAA+AGG 0.290466 3:+52213927 MsG0380014268.01.T01:CDS
ACTCTGAACACGATCGTTAA+TGG 0.297062 3:+52213654 MsG0380014268.01.T01:CDS
TTTGTGTAAAATTGGGGATA+TGG 0.310699 3:+52213782 MsG0380014268.01.T01:CDS
TTGTGGTTGTCTTAGGGATA+TGG 0.316818 3:+52213812 MsG0380014268.01.T01:CDS
GAACCAAATGGTTACACATT+TGG 0.319185 3:+52213744 MsG0380014268.01.T01:CDS
TTGTAAAGAAGGGTTAATTT+TGG 0.326267 3:+52214098 MsG0380014268.01.T01:intron
ATTTATAATGTTATGATTGA+TGG 0.335472 3:+52214596 MsG0380014268.01.T01:CDS
GCATTATAAACAACAACATT+TGG 0.354487 3:-52213852 None:intergenic
GATGTTATTGTTTAGGGCTT+TGG 0.363813 3:+52214544 MsG0380014268.01.T01:intron
CTCTGAACACGATCGTTAAT+GGG 0.390072 3:+52213655 MsG0380014268.01.T01:CDS
ACTTATAATTCACTGATTCA+TGG 0.398451 3:+52214282 MsG0380014268.01.T01:CDS
TTAATGGTTTGTGTAAAATT+GGG 0.414774 3:+52213775 MsG0380014268.01.T01:CDS
TTGTGTAAAATTGGGGATAT+GGG 0.428786 3:+52213783 MsG0380014268.01.T01:CDS
GTTAATGGGCTTTGTGTTGA+AGG 0.432018 3:+52213669 MsG0380014268.01.T01:CDS
TTGAGCCAGATGTTTAAAAC+GGG 0.436480 3:+52213612 None:intergenic
ACTGATTCATGGTTGGTGTA+AGG 0.436633 3:+52214293 MsG0380014268.01.T01:CDS
GTGACTTATAACTCATTGAT+TGG 0.439923 3:+52214174 MsG0380014268.01.T01:CDS
GCTCCAAATGTGTAACCATT+TGG 0.441387 3:-52213747 None:intergenic
AAGTGCTTGTGGTTGTCTTA+GGG 0.446455 3:+52213806 MsG0380014268.01.T01:CDS
ATTGATGGTTTGTGTAAAGA+TGG 0.455005 3:+52214611 MsG0380014268.01.T01:CDS
TTGTAAAGGAGGGTTTGTTT+CGG 0.456552 3:+52213890 MsG0380014268.01.T01:CDS
GAGTTATAAGTCACAACATT+CGG 0.460873 3:-52214165 None:intergenic
GGTTAGTTTAACCCGTGAAA+TGG 0.464164 3:+52213707 MsG0380014268.01.T01:CDS
GGAGGCTTTGAGTTTGTTTG+CGG 0.470472 3:+52213911 MsG0380014268.01.T01:CDS
GTTGTCCAAGTCACAACATC+AGG 0.475981 3:-52214375 None:intergenic
TTTGAGCCAGATGTTTAAAA+CGG 0.476817 3:+52213611 None:intergenic
GTTATTGTTTAGGGCTTTGG+AGG 0.477814 3:+52214547 MsG0380014268.01.T01:intron
TATGTGTTTGTTGAATGAAA+TGG 0.482055 3:+52214335 MsG0380014268.01.T01:CDS
AACCCGCGTTCTCCATTTCA+CGG 0.503201 3:-52213719 None:intergenic
TTGAATGAAATGGTTAATGA+AGG 0.503293 3:+52214345 MsG0380014268.01.T01:CDS
TTATTGTTTGATGAATGAAA+TGG 0.504933 3:+52214200 MsG0380014268.01.T01:CDS
CTTGGACAACACTTGTTAGT+GGG 0.507587 3:+52214388 MsG0380014268.01.T01:CDS
TGGTTACACATTTGGAGCGT+TGG 0.514235 3:+52213752 MsG0380014268.01.T01:CDS
GGGGATATGGGAAGTGCTTG+TGG 0.522621 3:+52213795 MsG0380014268.01.T01:CDS
ACCCGCGTTCTCCATTTCAC+GGG 0.525315 3:-52213718 None:intergenic
ATAATTCACTGATTCATGGT+TGG 0.526475 3:+52214286 MsG0380014268.01.T01:CDS
GTTTATAATGCAATTATCGA+TGG 0.529176 3:+52213864 MsG0380014268.01.T01:CDS
ACTTGGACAACACTTGTTAG+TGG 0.529843 3:+52214387 MsG0380014268.01.T01:CDS
TAATGGTTTGTGTAAAATTG+GGG 0.529963 3:+52213776 MsG0380014268.01.T01:CDS
TAAAGGAGGGTTTGTTTCGG+AGG 0.548180 3:+52213893 MsG0380014268.01.T01:CDS
TGTATCCTGATGTTGTGACT+TGG 0.551249 3:+52214370 MsG0380014268.01.T01:CDS
AAAGTTGAATGATGCAAGGA+AGG 0.577102 3:+52214634 MsG0380014268.01.T01:CDS
ACTTATAACTCATTGATTGG+TGG 0.585477 3:+52214177 MsG0380014268.01.T01:CDS
AACGCGGGTTATGAACCAAA+TGG 0.590649 3:+52213732 MsG0380014268.01.T01:CDS
TGAAGGTAATGTTGCACAAG+CGG 0.590846 3:+52213686 MsG0380014268.01.T01:CDS
ATGGAAAGTTGAATGATGCA+AGG 0.601221 3:+52214630 MsG0380014268.01.T01:CDS
GAATTATAAGTCACAACACT+CGG 0.630148 3:-52214270 None:intergenic
ACCCGTGAAATGGAGAACGC+GGG 0.642077 3:+52213717 MsG0380014268.01.T01:CDS
GTGTTCAGAGTCACCACTGT+CGG 0.645147 3:-52213642 None:intergenic
AACCCGTGAAATGGAGAACG+CGG 0.653716 3:+52213716 MsG0380014268.01.T01:CDS
TGAGCCAGATGTTTAAAACG+GGG 0.685928 3:+52213613 None:intergenic
AACGGGGTTAAAGCCGACAG+TGG 0.687401 3:+52213629 MsG0380014268.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ATTTATAATGTTATGATTGA+TGG + Chr3:52214596-52214615 MsG0380014268.01.T01:CDS 15.0%
!! TTATTGTTTGATGAATGAAA+TGG + Chr3:52214200-52214219 MsG0380014268.01.T01:CDS 20.0%
!!! TAAAAGTGTGATTTGTTTTA+TGG + Chr3:52214125-52214144 MsG0380014268.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTAATGGTTTGTGTAAAATT+GGG + Chr3:52213775-52213794 MsG0380014268.01.T01:CDS 20.0%
! ACTTACAATTGTTTGATTCA+GGG + Chr3:52213969-52213988 MsG0380014268.01.T01:intron 25.0%
! GCATTATAAACAACAACATT+TGG - Chr3:52213855-52213874 None:intergenic 25.0%
! GTTTATAATGCAATTATCGA+TGG + Chr3:52213864-52213883 MsG0380014268.01.T01:CDS 25.0%
! TACTTACAATTGTTTGATTC+AGG + Chr3:52213968-52213987 MsG0380014268.01.T01:intron 25.0%
! TTCTTTACTATGAAGCAATA+TGG + Chr3:52214449-52214468 MsG0380014268.01.T01:intron 25.0%
! TTGAATGAAATGGTTAATGA+AGG + Chr3:52214345-52214364 MsG0380014268.01.T01:CDS 25.0%
!! ATTATCGATGGTTTTTGTAA+AGG + Chr3:52213876-52213895 MsG0380014268.01.T01:CDS 25.0%
!! GTTAATGGTTTGTGTAAAAT+TGG + Chr3:52213774-52213793 MsG0380014268.01.T01:CDS 25.0%
!! TAAATGTCATTATCGTTTTG+AGG + Chr3:52214520-52214539 MsG0380014268.01.T01:intron 25.0%
!! TAATGGTTTGTGTAAAATTG+GGG + Chr3:52213776-52213795 MsG0380014268.01.T01:CDS 25.0%
!! TATGTGTTTGTTGAATGAAA+TGG + Chr3:52214335-52214354 MsG0380014268.01.T01:CDS 25.0%
!! TGTTCAAACTTTTACGATTT+TGG + Chr3:52214065-52214084 MsG0380014268.01.T01:intron 25.0%
!! TTGTAAAGAAGGGTTAATTT+TGG + Chr3:52214098-52214117 MsG0380014268.01.T01:intron 25.0%
!!! AATGAATGAAAAAGGTGTTA+AGG + Chr3:52213935-52213954 MsG0380014268.01.T01:CDS 25.0%
!!! ACTTATAATTCACTGATTCA+TGG + Chr3:52214282-52214301 MsG0380014268.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATGAATGAAAAAGGTGTTAA+GGG + Chr3:52213936-52213955 MsG0380014268.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATTTGTTTTATGGTGCAAAT+GGG + Chr3:52214135-52214154 MsG0380014268.01.T01:CDS 25.0%
!!! TATAAAAGTGTTTCGTTTGA+TGG + Chr3:52214230-52214249 MsG0380014268.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTTTTGTTGAATGAGATGA+TGG + Chr3:52214023-52214042 MsG0380014268.01.T01:intron 25.0%
ATCGTAAAAGTTTGAACATC+AGG - Chr3:52214063-52214082 None:intergenic 30.0%
CTTACAATTGTTTGATTCAG+GGG + Chr3:52213970-52213989 MsG0380014268.01.T01:intron 30.0%
GAATTATAAGTCACAACACT+CGG - Chr3:52214273-52214292 None:intergenic 30.0%
GAGTTATAAGTCACAACATT+CGG - Chr3:52214168-52214187 None:intergenic 30.0%
GTGACTTATAACTCATTGAT+TGG + Chr3:52214174-52214193 MsG0380014268.01.T01:CDS 30.0%
TACTATGAAGCAATATGGTA+TGG + Chr3:52214454-52214473 MsG0380014268.01.T01:intron 30.0%
TTGTGTAAAATTGGGGATAT+GGG + Chr3:52213783-52213802 MsG0380014268.01.T01:CDS 30.0%
TTTGCGGAAATGAATGAAAA+AGG + Chr3:52213927-52213946 MsG0380014268.01.T01:CDS 30.0%
TTTGTGTAAAATTGGGGATA+TGG + Chr3:52213782-52213801 MsG0380014268.01.T01:CDS 30.0%
! ACTTATAACTCATTGATTGG+TGG + Chr3:52214177-52214196 MsG0380014268.01.T01:CDS 30.0%
! ATTGATGGTTTGTGTAAAGA+TGG + Chr3:52214611-52214630 MsG0380014268.01.T01:CDS 30.0%
! TAAAGAAGGGTTAATTTTGG+AGG + Chr3:52214101-52214120 MsG0380014268.01.T01:intron 30.0%
! TCAAACTTTTACGATTTTGG+TGG + Chr3:52214068-52214087 MsG0380014268.01.T01:intron 30.0%
! TGGATGGTTTTTGTAAAGAA+GGG + Chr3:52214088-52214107 MsG0380014268.01.T01:intron 30.0%
!! ATAATTCACTGATTCATGGT+TGG + Chr3:52214286-52214305 MsG0380014268.01.T01:CDS 30.0%
!! TTGAATGAGATGATGGAAAA+GGG + Chr3:52214030-52214049 MsG0380014268.01.T01:intron 30.0%
!!! GATTTGTTTTATGGTGCAAA+TGG + Chr3:52214134-52214153 MsG0380014268.01.T01:CDS 30.0%
AAAGTTGAATGATGCAAGGA+AGG + Chr3:52214634-52214653 MsG0380014268.01.T01:CDS 35.0%
AACAATTCTTTAGCAGCCAA+AGG - Chr3:52214431-52214450 None:intergenic 35.0%
ATGGAAAGTTGAATGATGCA+AGG + Chr3:52214630-52214649 MsG0380014268.01.T01:CDS 35.0%
GAACCAAATGGTTACACATT+TGG + Chr3:52213744-52213763 MsG0380014268.01.T01:CDS 35.0%
TGAGGCGATGTTATTGTTTA+GGG + Chr3:52214538-52214557 MsG0380014268.01.T01:intron 35.0%
TTGAGGCGATGTTATTGTTT+AGG + Chr3:52214537-52214556 MsG0380014268.01.T01:intron 35.0%
! ATCGATGGTTTTTGTAAAGG+AGG + Chr3:52213879-52213898 MsG0380014268.01.T01:CDS 35.0%
! GATGTTATTGTTTAGGGCTT+TGG + Chr3:52214544-52214563 MsG0380014268.01.T01:intron 35.0%
! GTGGATGGTTTTTGTAAAGA+AGG + Chr3:52214087-52214106 MsG0380014268.01.T01:intron 35.0%
! TCGATGGTTTTTGTAAAGGA+GGG + Chr3:52213880-52213899 MsG0380014268.01.T01:CDS 35.0%
! TTGTAAAGGAGGGTTTGTTT+CGG + Chr3:52213890-52213909 MsG0380014268.01.T01:CDS 35.0%
!! AAAAGGTGTTAAGGGTAGTT+TGG + Chr3:52213944-52213963 MsG0380014268.01.T01:intron 35.0%
!! ACTTTTACGATTTTGGTGGA+TGG + Chr3:52214072-52214091 MsG0380014268.01.T01:intron 35.0%
!! GTTGAATGAGATGATGGAAA+AGG + Chr3:52214029-52214048 MsG0380014268.01.T01:intron 35.0%
!!! TTTGACTTGTGCTGTTGTTT+TGG + Chr3:52214487-52214506 MsG0380014268.01.T01:intron 35.0%
AAGTGCTTGTGGTTGTCTTA+GGG + Chr3:52213806-52213825 MsG0380014268.01.T01:CDS 40.0%
ACAGCACAAGTCAAAAGAGT+CGG - Chr3:52214482-52214501 None:intergenic 40.0%
ACTCTGAACACGATCGTTAA+TGG + Chr3:52213654-52213673 MsG0380014268.01.T01:CDS 40.0%
CTCTGAACACGATCGTTAAT+GGG + Chr3:52213655-52213674 MsG0380014268.01.T01:CDS 40.0%
GCTCCAAATGTGTAACCATT+TGG - Chr3:52213750-52213769 None:intergenic 40.0%
TGAAGGTAATGTTGCACAAG+CGG + Chr3:52213686-52213705 MsG0380014268.01.T01:CDS 40.0%
TGTATCCTGATGTTGTGACT+TGG + Chr3:52214370-52214389 MsG0380014268.01.T01:CDS 40.0%
TTGTGGTTGTCTTAGGGATA+TGG + Chr3:52213812-52213831 MsG0380014268.01.T01:CDS 40.0%
! ACTGATTCATGGTTGGTGTA+AGG + Chr3:52214293-52214312 MsG0380014268.01.T01:CDS 40.0%
! ACTTGGACAACACTTGTTAG+TGG + Chr3:52214387-52214406 MsG0380014268.01.T01:CDS 40.0%
! CTTGCACGTTTACTGGTTAA+AGG + Chr3:52214659-52214678 MsG0380014268.01.T01:CDS 40.0%
! CTTGGACAACACTTGTTAGT+GGG + Chr3:52214388-52214407 MsG0380014268.01.T01:CDS 40.0%
! GTTATTGTTTAGGGCTTTGG+AGG + Chr3:52214547-52214566 MsG0380014268.01.T01:intron 40.0%
! TTTTATGGTGCAAATGGGTG+TGG + Chr3:52214140-52214159 MsG0380014268.01.T01:CDS 40.0%
!! ACATTTGGAGCGTTGGTTAA+TGG + Chr3:52213759-52213778 MsG0380014268.01.T01:CDS 40.0%
!! GGTTAGTTTAACCCGTGAAA+TGG + Chr3:52213707-52213726 MsG0380014268.01.T01:CDS 40.0%
!! GTTAATGGGCTTTGTGTTGA+AGG + Chr3:52213669-52213688 MsG0380014268.01.T01:CDS 40.0%
!!! ACTTGTGCTGTTGTTTTGGA+TGG + Chr3:52214491-52214510 MsG0380014268.01.T01:intron 40.0%
!!! ACTTGTTAGTGGGTTTTGTG+AGG + Chr3:52214398-52214417 MsG0380014268.01.T01:intron 40.0%
!!! TTAGTGGGTTTTGTGAGGTT+GGG + Chr3:52214403-52214422 MsG0380014268.01.T01:intron 40.0%
GAAGGTTCTTGCACGTTTAC+TGG + Chr3:52214652-52214671 MsG0380014268.01.T01:CDS 45.0%
GTTGTCCAAGTCACAACATC+AGG - Chr3:52214378-52214397 None:intergenic 45.0%
TTTGTGAGGTTGGGAACCTT+TGG + Chr3:52214412-52214431 MsG0380014268.01.T01:intron 45.0%
! AACGCGGGTTATGAACCAAA+TGG + Chr3:52213732-52213751 MsG0380014268.01.T01:CDS 45.0%
! GAAGTGCTTGTGGTTGTCTT+AGG + Chr3:52213805-52213824 MsG0380014268.01.T01:CDS 45.0%
! TAAAGGAGGGTTTGTTTCGG+AGG + Chr3:52213893-52213912 MsG0380014268.01.T01:CDS 45.0%
! TGGTTACACATTTGGAGCGT+TGG + Chr3:52213752-52213771 MsG0380014268.01.T01:CDS 45.0%
!! GGAGGCTTTGAGTTTGTTTG+CGG + Chr3:52213911-52213930 MsG0380014268.01.T01:CDS 45.0%
!!! GTTAGTGGGTTTTGTGAGGT+TGG + Chr3:52214402-52214421 MsG0380014268.01.T01:intron 45.0%
AACCCGCGTTCTCCATTTCA+CGG - Chr3:52213722-52213741 None:intergenic 50.0%
AACCCGTGAAATGGAGAACG+CGG + Chr3:52213716-52213735 MsG0380014268.01.T01:CDS 50.0%
GATTCAGGGGTTTGTAGCGT+TGG + Chr3:52213983-52214002 MsG0380014268.01.T01:intron 50.0%
GTGTTCAGAGTCACCACTGT+CGG - Chr3:52213645-52213664 None:intergenic 50.0%
!! GGGTTTGTAGCGTTGGTGAA+TGG + Chr3:52213990-52214009 MsG0380014268.01.T01:intron 50.0%
AACGGGGTTAAAGCCGACAG+TGG + Chr3:52213629-52213648 MsG0380014268.01.T01:CDS 55.0%
ACCCGCGTTCTCCATTTCAC+GGG - Chr3:52213721-52213740 None:intergenic 55.0%
ACCCGTGAAATGGAGAACGC+GGG + Chr3:52213717-52213736 MsG0380014268.01.T01:CDS 55.0%
!! GGGGATATGGGAAGTGCTTG+TGG + Chr3:52213795-52213814 MsG0380014268.01.T01:CDS 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr3 gene 52213621 52214685 52213621 ID=MsG0380014268.01;Name=MsG0380014268.01
Chr3 mRNA 52213621 52214685 52213621 ID=MsG0380014268.01.T01;Parent=MsG0380014268.01;Name=MsG0380014268.01.T01;_AED=0.35;_eAED=0.35;_QI=0|0|0|1|1|1|3|0|255
Chr3 exon 52213621 52213957 52213621 ID=MsG0380014268.01.T01:exon:10200;Parent=MsG0380014268.01.T01
Chr3 exon 52214106 52214409 52214106 ID=MsG0380014268.01.T01:exon:10201;Parent=MsG0380014268.01.T01
Chr3 exon 52214559 52214685 52214559 ID=MsG0380014268.01.T01:exon:10202;Parent=MsG0380014268.01.T01
Chr3 CDS 52213621 52213957 52213621 ID=MsG0380014268.01.T01:cds;Parent=MsG0380014268.01.T01
Chr3 CDS 52214106 52214409 52214106 ID=MsG0380014268.01.T01:cds;Parent=MsG0380014268.01.T01
Chr3 CDS 52214559 52214685 52214559 ID=MsG0380014268.01.T01:cds;Parent=MsG0380014268.01.T01
Gene Sequence

>MsG0380014268.01.T01

ATGTTTAAAACGGGGTTAAAGCCGACAGTGGTGACTCTGAACACGATCGTTAATGGGCTTTGTGTTGAAGGTAATGTTGCACAAGCGGTTAGTTTAACCCGTGAAATGGAGAACGCGGGTTATGAACCAAATGGTTACACATTTGGAGCGTTGGTTAATGGTTTGTGTAAAATTGGGGATATGGGAAGTGCTTGTGGTTGTCTTAGGGATATGGTTGAGAGAAACTATGAACCAAATGTTGTTGTTTATAATGCAATTATCGATGGTTTTTGTAAAGGAGGGTTTGTTTCGGAGGCTTTGAGTTTGTTTGCGGAAATGAATGAAAAAGGTGTTAAGGAAGGGTTAATTTTGGAGGCTAAAAGTGTGATTTGTTTTATGGTGCAAATGGGTGTGGAACCGAATGTTGTGACTTATAACTCATTGATTGGTGGTTATTGTTTGATGAATGAAATGGATGAAGCTATAAAAGTGTTTCGTTTGATGGTTTTGAAGAAGTGTTTGCCGAGTGTTGTGACTTATAATTCACTGATTCATGGTTGGTGTAAGGTTAAAGATGTTGATAAAGCTATGTGTTTGTTGAATGAAATGGTTAATGAAGGTTTGTATCCTGATGTTGTGACTTGGACAACACTTGTTAGTGGGGCTTTGGAGGAAAGTGATTTAGATCTTGATATTGTGATTTATAATGTTATGATTGATGGTTTGTGTAAAGATGGAAAGTTGAATGATGCAAGGAAGGTTCTTGCACGTTTACTGGTTAAAGGTTGA
Protein sequence

>MsG0380014268.01.T01

MFKTGLKPTVVTLNTIVNGLCVEGNVAQAVSLTREMENAGYEPNGYTFGALVNGLCKIGDMGSACGCLRDMVERNYEPNVVVYNAIIDGFCKGGFVSEALSLFAEMNEKGVKEGLILEAKSVICFMVQMGVEPNVVTYNSLIGGYCLMNEMDEAIKVFRLMVLKKCLPSVVTYNSLIHGWCKVKDVDKAMCLLNEMVNEGLYPDVVTWTTLVSGALEESDLDLDIVIYNVMIDGLCKDGKLNDARKVLARLLVKG*