AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380015506.01

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MsG0380015506.01.T01 AT5G58540 46.209 277 121 5 226 486 186 450 3.08e-80 258
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MsG0380015506.01.T01 AT1G63430 31.358 523 273 9 37 475 98 618 6.99e-74 246
MsG0380015506.01.T01 AT5G07150 45.517 290 109 8 216 486 263 522 1.10e-72 240
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MsG0380015506.01.T01 AT1G10620 31.449 283 152 11 238 487 368 641 2.07e-35 140
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MsG0380015506.01.T01 AT1G49100 26.392 485 279 16 33 488 414 849 4.95e-35 139
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MsG0380015506.01.T01 AT1G23540 31.707 287 154 12 236 487 363 642 4.42e-34 136
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MsG0380015506.01.T01 AT1G56720 30.169 295 146 12 236 487 171 448 7.34e-34 134
MsG0380015506.01.T01 AT1G70460 31.579 304 166 12 219 487 328 624 1.39e-33 135
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MsG0380015506.01.T01 AT5G18500 29.605 304 182 10 213 487 135 435 1.54e-33 132
MsG0380015506.01.T01 AT5G18500 29.605 304 182 10 213 487 135 435 1.54e-33 132
MsG0380015506.01.T01 AT5G18500 29.605 304 182 10 213 487 135 435 1.54e-33 132
MsG0380015506.01.T01 AT5G18500 29.605 304 182 10 213 487 135 435 1.54e-33 132
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MsG0380015506.01.T01 AT3G26940 32.986 288 151 11 236 486 66 348 2.52e-33 131
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MsG0380015506.01.T01 AT2G42960 29.114 316 189 11 204 487 140 452 2.83e-33 132
MsG0380015506.01.T01 AT2G42960 29.114 316 189 11 204 487 140 452 2.83e-33 132
MsG0380015506.01.T01 AT5G38560 29.474 285 165 9 236 487 331 612 2.85e-33 134
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MsG0380015506.01.T01 AT5G65700 29.329 283 166 9 237 487 683 963 4.37e-33 134
MsG0380015506.01.T01 AT3G49670 24.498 498 312 15 34 487 482 959 8.71e-33 133
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MsG0380015506.01.T01 AT3G26700 27.835 291 178 9 226 488 61 347 1.33e-32 128
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MsG0380015506.01.T01 AT1G06700 30.449 312 172 12 218 487 36 344 1.64e-32 127
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MsG0380015506.01.T01 AT1G31420 24.481 482 322 14 36 487 102 571 6.61e-32 129
MsG0380015506.01.T01 AT5G63930 24.673 535 327 17 12 486 557 1075 7.54e-32 130
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MsG0380015506.01.T01 AT2G02800 28.710 310 179 10 217 486 53 360 7.94e-32 127
MsG0380015506.01.T01 AT5G02290 28.896 308 174 11 221 487 45 348 9.57e-32 126
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MsG0380015506.01.T01 AT1G20650 28.618 304 174 10 215 486 56 348 1.12e-31 125
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MsG0380015506.01.T01 AT1G16120 32.491 277 158 9 236 485 421 695 1.55e-31 129
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MsG0380015506.01.T01 AT5G58940 32.509 283 156 10 235 485 138 417 4.31e-31 125
MsG0380015506.01.T01 AT5G58940 32.509 283 156 10 235 485 138 417 4.31e-31 125
MsG0380015506.01.T01 AT1G07870 32.394 284 155 11 236 488 95 372 4.50e-31 126
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MsG0380015506.01.T01 AT3G18810 32.982 285 152 11 236 487 329 607 6.18e-31 127
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MsG0380015506.01.T01 AT3G59350 30.573 314 167 13 214 487 87 389 6.28e-31 124
MsG0380015506.01.T01 AT5G02800 30.526 285 161 9 235 486 64 344 8.10e-31 123
MsG0380015506.01.T01 AT2G28960 28.720 289 166 10 231 488 562 841 8.61e-31 127
MsG0380015506.01.T01 AT3G59350 30.573 314 167 13 214 487 102 404 8.77e-31 124
MsG0380015506.01.T01 AT3G59420 30.000 300 168 13 224 485 486 781 9.05e-31 127
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MsG0380015506.01.T01 AT1G52290 28.622 283 169 9 236 487 135 415 1.59e-30 124
MsG0380015506.01.T01 AT1G68690 28.402 338 199 13 184 487 319 647 1.64e-30 125
MsG0380015506.01.T01 AT1G68690 28.402 338 199 13 184 487 319 647 1.64e-30 125
MsG0380015506.01.T01 AT1G68690 28.402 338 199 13 184 487 319 647 1.64e-30 125
MsG0380015506.01.T01 AT2G29000 29.758 289 163 10 231 488 554 833 1.64e-30 126
MsG0380015506.01.T01 AT2G18470 29.299 314 184 12 204 487 249 554 2.03e-30 125
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MsG0380015506.01.T01 AT2G18470 29.299 314 184 12 204 487 249 554 2.03e-30 125
MsG0380015506.01.T01 AT1G52540 27.957 279 170 9 236 486 29 304 2.61e-30 121
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MsG0380015506.01.T01 AT1G51850 27.305 282 175 10 231 486 567 844 1.23e-28 120
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MsG0380015506.01.T01 AT1G16260 29.110 292 175 11 221 485 370 656 1.50e-28 120
MsG0380015506.01.T01 AT2G04300 27.526 287 168 10 231 486 530 807 1.55e-28 120
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MsG0380015506.01.T01 AT3G24790 28.873 284 165 10 236 486 39 318 1.97e-28 116
MsG0380015506.01.T01 AT2G43230 28.889 315 172 13 218 487 80 387 2.01e-28 117
MsG0380015506.01.T01 AT4G23130 30.142 282 162 11 237 487 337 614 2.05e-28 119
MsG0380015506.01.T01 AT4G23130 30.142 282 162 11 237 487 333 610 2.12e-28 119
MsG0380015506.01.T01 AT3G09780 30.449 312 176 14 192 485 473 761 2.22e-28 119
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MsG0380015506.01.T01 AT5G24080 26.573 286 166 8 236 487 397 672 1.85e-26 114
MsG0380015506.01.T01 AT1G16110 35.135 222 114 9 236 430 424 642 1.85e-26 113
MsG0380015506.01.T01 AT4G22130 26.910 301 184 12 221 487 369 667 1.93e-26 113
MsG0380015506.01.T01 AT1G16150 28.058 278 171 9 235 485 415 690 1.94e-26 113
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MsG0380015506.01.T01 AT1G51805 26.950 282 176 10 231 486 566 843 2.25e-26 113
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MsG0380015506.01.T01 AT1G70450 27.875 287 166 11 236 487 41 321 3.03e-26 110
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MsG0380015506.01.T01 AT5G28680 27.113 284 176 9 231 486 508 788 3.17e-26 113
MsG0380015506.01.T01 AT3G17410 29.653 317 172 15 211 487 38 343 3.29e-26 110
MsG0380015506.01.T01 AT3G17410 29.653 317 172 15 211 487 38 343 3.29e-26 110
MsG0380015506.01.T01 AT1G51830 27.875 287 174 11 229 486 377 659 3.31e-26 112
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MsG0380015506.01.T01 AT5G54590 28.364 275 167 9 236 487 107 374 3.97e-26 110
MsG0380015506.01.T01 AT4G29990 28.929 280 168 10 235 488 567 841 4.10e-26 112
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MsG0380015506.01.T01 AT1G51910 26.690 281 179 11 231 488 562 838 1.31e-25 111
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MsG0380015506.01.T01 AT4G23740 25.626 519 307 21 36 487 97 603 1.33e-25 110
MsG0380015506.01.T01 AT2G47060 30.943 265 137 12 229 455 58 314 1.38e-25 108
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MsG0380015506.01.T01 AT4G00330 28.671 286 162 11 236 484 111 391 1.64e-25 108
MsG0380015506.01.T01 AT4G00340 27.645 293 160 12 236 487 476 757 1.72e-25 110
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MsG0380015506.01.T01 AT1G77280 28.065 310 186 12 212 487 369 675 1.94e-25 110
MsG0380015506.01.T01 AT1G56130 28.571 280 167 10 235 486 537 811 1.96e-25 110
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MsG0380015506.01.T01 AT4G33430 25.253 297 183 11 225 487 317 608 2.34e-25 110
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MsG0380015506.01.T01 AT3G09830 27.431 288 173 10 235 486 75 362 2.44e-25 108
MsG0380015506.01.T01 AT3G09830 27.431 288 173 10 235 486 75 362 2.44e-25 108
MsG0380015506.01.T01 AT5G57670 28.655 342 194 13 180 486 205 531 2.44e-25 109
MsG0380015506.01.T01 AT1G66880 30.208 288 166 11 229 486 954 1236 2.64e-25 110
MsG0380015506.01.T01 AT3G28690 27.055 292 168 12 235 486 17 303 2.67e-25 107
MsG0380015506.01.T01 AT4G17660 28.349 321 177 11 213 486 51 365 2.79e-25 107
MsG0380015506.01.T01 AT5G15080 27.575 301 163 12 231 486 129 419 3.20e-25 108
MsG0380015506.01.T01 AT2G21480 27.957 279 171 10 235 486 516 791 3.22e-25 110
MsG0380015506.01.T01 AT1G56130 28.571 280 167 10 235 486 685 959 3.26e-25 110
MsG0380015506.01.T01 AT5G01950 26.950 282 172 8 236 488 618 894 3.60e-25 110
MsG0380015506.01.T01 AT5G01950 26.950 282 172 8 236 488 618 894 3.60e-25 110
MsG0380015506.01.T01 AT5G01950 26.950 282 172 8 236 488 618 894 3.60e-25 110
MsG0380015506.01.T01 AT5G01950 26.950 282 172 8 236 488 618 894 3.60e-25 110
MsG0380015506.01.T01 AT5G05160 27.113 284 162 12 236 487 341 611 3.98e-25 109
MsG0380015506.01.T01 AT4G39400 26.962 293 175 11 227 486 866 1152 4.31e-25 110
MsG0380015506.01.T01 AT3G28690 26.462 325 191 13 205 486 33 352 4.60e-25 107
MsG0380015506.01.T01 AT3G62220 29.293 297 165 12 229 487 54 343 4.77e-25 106
MsG0380015506.01.T01 AT3G62220 29.293 297 165 12 229 487 54 343 4.77e-25 106
MsG0380015506.01.T01 AT4G20450 26.056 284 170 10 236 488 585 859 4.94e-25 109
MsG0380015506.01.T01 AT1G56145 28.846 312 152 10 235 486 678 979 4.96e-25 109
MsG0380015506.01.T01 AT5G35580 26.804 291 169 7 234 486 66 350 5.69e-25 108
MsG0380015506.01.T01 AT1G09970 27.719 285 158 9 246 487 670 949 5.90e-25 109
MsG0380015506.01.T01 AT5G53890 26.502 283 178 8 232 486 742 1022 6.67e-25 109
MsG0380015506.01.T01 AT5G35580 26.804 291 169 7 234 486 78 362 6.71e-25 108
MsG0380015506.01.T01 AT3G46290 27.473 273 163 10 243 486 486 752 7.61e-25 108
MsG0380015506.01.T01 AT1G66150 29.268 287 161 12 237 486 581 862 7.78e-25 108
MsG0380015506.01.T01 AT1G48480 26.715 277 174 10 236 487 365 637 8.01e-25 108
MsG0380015506.01.T01 AT1G05700 25.249 301 185 9 219 487 545 837 8.04e-25 108
MsG0380015506.01.T01 AT1G09970 27.622 286 158 9 246 487 670 950 8.10e-25 108
MsG0380015506.01.T01 AT2G48010 24.746 295 193 7 222 487 261 555 8.43e-25 108
MsG0380015506.01.T01 AT4G23200 29.514 288 166 12 231 486 323 605 8.53e-25 108
MsG0380015506.01.T01 AT3G28690 26.462 325 191 13 205 486 84 403 8.98e-25 107
MsG0380015506.01.T01 AT1G05700 25.249 301 185 9 219 487 576 868 1.02e-24 108
MsG0380015506.01.T01 AT1G34300 26.502 283 171 10 236 487 478 754 1.05e-24 108
MsG0380015506.01.T01 AT1G70530 28.723 282 162 13 237 487 316 589 1.15e-24 108
MsG0380015506.01.T01 AT2G23450 29.514 288 170 10 228 485 332 616 1.17e-24 108
MsG0380015506.01.T01 AT2G23450 29.514 288 170 10 228 485 332 616 1.17e-24 108
MsG0380015506.01.T01 AT5G16000 26.621 293 179 10 226 487 294 581 1.32e-24 107
MsG0380015506.01.T01 AT5G06820 29.730 296 172 10 225 486 395 688 1.34e-24 108
MsG0380015506.01.T01 AT5G15730 26.148 283 175 10 228 487 100 371 1.48e-24 106
MsG0380015506.01.T01 AT3G53590 27.211 294 178 8 225 488 602 889 1.49e-24 108
MsG0380015506.01.T01 AT4G23240 27.562 283 168 10 237 487 328 605 1.51e-24 107
MsG0380015506.01.T01 AT5G01950 27.368 285 172 9 236 488 618 899 1.53e-24 108
MsG0380015506.01.T01 AT1G80640 30.612 245 146 9 198 420 98 340 1.69e-24 105
MsG0380015506.01.T01 AT1G07650 31.915 282 157 11 236 486 676 953 1.72e-24 108
MsG0380015506.01.T01 AT1G07650 31.915 282 157 11 236 486 457 734 1.75e-24 107
MsG0380015506.01.T01 AT1G26970 29.075 227 136 6 280 486 23 244 1.75e-24 103
MsG0380015506.01.T01 AT1G07650 31.915 282 157 11 236 486 670 947 1.76e-24 108
MsG0380015506.01.T01 AT5G15730 26.056 284 176 10 228 487 100 373 1.87e-24 105
MsG0380015506.01.T01 AT5G15730 26.056 284 176 10 228 487 100 373 1.87e-24 105
MsG0380015506.01.T01 AT1G07650 31.915 282 157 11 236 486 644 921 1.92e-24 107
MsG0380015506.01.T01 AT5G03320 26.644 289 174 10 235 486 72 359 1.92e-24 105
MsG0380015506.01.T01 AT5G03320 26.644 289 174 10 235 486 72 359 1.92e-24 105
MsG0380015506.01.T01 AT3G51550 27.402 281 172 10 235 486 527 804 2.00e-24 107
MsG0380015506.01.T01 AT4G11460 29.123 285 166 10 236 487 338 619 2.09e-24 107
MsG0380015506.01.T01 AT1G73080 27.797 295 174 11 230 487 813 1105 2.33e-24 107
MsG0380015506.01.T01 AT4G13190 29.386 228 138 6 280 486 28 253 2.36e-24 103
MsG0380015506.01.T01 AT1G01540 30.522 249 141 9 201 422 112 355 2.40e-24 105
MsG0380015506.01.T01 AT1G10850 23.077 546 329 15 25 487 88 625 2.82e-24 107
MsG0380015506.01.T01 AT5G38210 28.440 327 186 14 203 486 306 627 2.97e-24 107
MsG0380015506.01.T01 AT1G12460 26.408 284 170 8 240 487 452 732 3.00e-24 107
MsG0380015506.01.T01 AT5G39000 26.897 290 164 12 236 486 510 790 3.06e-24 107
MsG0380015506.01.T01 AT1G17750 27.174 276 165 9 247 488 799 1072 3.11e-24 107
MsG0380015506.01.T01 AT4G11460 29.682 283 164 11 236 487 263 541 3.26e-24 106
MsG0380015506.01.T01 AT2G19230 26.408 284 175 10 233 488 560 837 3.30e-24 107
MsG0380015506.01.T01 AT4G11460 29.682 283 164 11 236 487 338 616 3.31e-24 106
MsG0380015506.01.T01 AT1G79620 32.990 194 117 5 221 404 615 805 3.33e-24 107
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MsG0380015506.01.T01 AT1G12460 26.408 284 170 8 240 487 591 871 3.49e-24 107
MsG0380015506.01.T01 AT4G20450 27.138 269 171 11 236 488 585 844 3.76e-24 107
MsG0380015506.01.T01 AT2G19230 26.408 284 175 10 233 488 561 838 3.82e-24 107
MsG0380015506.01.T01 AT5G38210 28.135 327 187 14 203 486 300 621 3.96e-24 106
MsG0380015506.01.T01 AT1G29720 31.071 280 161 11 236 487 665 940 4.09e-24 107
MsG0380015506.01.T01 AT5G38210 28.135 327 187 14 203 486 318 639 4.34e-24 106
MsG0380015506.01.T01 AT2G47060 31.441 229 115 10 229 422 58 279 4.63e-24 103
MsG0380015506.01.T01 AT1G21230 29.323 266 161 10 245 485 411 674 5.72e-24 106
MsG0380015506.01.T01 AT1G66980 26.855 283 172 9 235 486 798 1076 6.14e-24 106
MsG0380015506.01.T01 AT5G10290 26.073 303 188 11 219 487 262 562 6.23e-24 105
MsG0380015506.01.T01 AT5G10290 26.073 303 188 11 219 487 262 562 6.23e-24 105
MsG0380015506.01.T01 AT1G66980 26.855 283 172 9 235 486 781 1059 6.61e-24 106
MsG0380015506.01.T01 AT2G23200 27.138 269 165 10 247 488 493 757 7.16e-24 105
MsG0380015506.01.T01 AT1G66980 26.855 283 172 9 235 486 827 1105 7.24e-24 106
MsG0380015506.01.T01 AT4G21410 27.660 282 167 10 237 485 225 502 7.56e-24 105
MsG0380015506.01.T01 AT2G26330 24.165 509 306 17 34 487 429 912 7.71e-24 105
MsG0380015506.01.T01 AT2G26730 27.536 276 170 12 236 487 345 614 8.05e-24 105
MsG0380015506.01.T01 AT1G66980 26.855 283 172 9 235 486 825 1103 8.13e-24 105

Find 126 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 199 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GAAACTCAAGTCCGAGATTT+TGG 0.181579 3:+71181001 None:intergenic
AAGAATTTCGTAAATCTTCT+TGG 0.198188 3:-71181355 MsG0380015506.01.T01:CDS
CTCACAATTTGTTTCATTGT+TGG 0.239712 3:+71180684 None:intergenic
TTTGTACCAGCTGATCTTCT+TGG 0.245950 3:+71180754 None:intergenic
CGTCGGTGATGGCGCTAAAA+AGG 0.248498 3:-71180500 MsG0380015506.01.T01:three_prime_UTR
ATTGAAGGAATTGGAGGTTT+TGG 0.260985 3:-71182742 MsG0380015506.01.T01:CDS
CAAATCACATGTACATAATA+AGG 0.262645 3:-71180431 MsG0380015506.01.T01:three_prime_UTR
GGAGAAGGAAAAGGAGTATC+AGG 0.265260 3:+71182105 None:intergenic
ACAAATTGTGAGAGATTAAG+AGG 0.281856 3:-71180673 MsG0380015506.01.T01:exon
CATTTGTTCAGTCAGTTATT+TGG 0.291684 3:-71180312 MsG0380015506.01.T01:three_prime_UTR
TTCAATGATGTCACTGTAAC+AGG 0.306241 3:+71181535 None:intergenic
GGACCTCTACCTAAAGATAT+TGG 0.312047 3:-71182696 MsG0380015506.01.T01:CDS
CTCTCATGAAATTAATGAAT+TGG 0.322266 3:-71182463 MsG0380015506.01.T01:CDS
ATATTACTCCCAATATCTTT+AGG 0.326083 3:+71182687 None:intergenic
ATCACCGACGGAAAATTAAA+AGG 0.345827 3:+71180513 None:intergenic
TTCAATCGTACAATTCCTTC+AGG 0.347021 3:+71182759 None:intergenic
CCTAGGCGATCATCCCTAAA+AGG 0.348062 3:+71183214 None:intergenic
CCATCTTTATCCATCGAATA+AGG 0.348534 3:+71180858 None:intergenic
ATATTACTCGAAATTGTAAC+AGG 0.362272 3:-71180888 MsG0380015506.01.T01:CDS
GCTCAAAGAGTGTTCCATTA+GGG 0.368869 3:+71181281 None:intergenic
TACAAGAGGTATCAACTTAC+AGG 0.369873 3:+71180471 None:intergenic
CCTTCTCCCTTGCCTGCACC+AGG 0.371747 3:-71181949 MsG0380015506.01.T01:CDS
AATTGTACGATTGAAGGAAT+TGG 0.386262 3:-71182751 MsG0380015506.01.T01:CDS
AGCTCTGATCTCTTTAGCTT+CGG 0.390128 3:+71181656 None:intergenic
CCACTATTTCTTTGAGAGGC+TGG 0.390275 3:+71180796 None:intergenic
GCTGGACAGATGAAGTATTT+AGG 0.392909 3:+71181042 None:intergenic
CATGAATAATGATTATAAAC+TGG 0.402607 3:-71183242 MsG0380015506.01.T01:CDS
CCAACTGGTGCATATGTTGC+AGG 0.410837 3:+71181087 None:intergenic
GACCTCTACCTAAAGATATT+GGG 0.416919 3:-71182695 MsG0380015506.01.T01:CDS
CAGTGACATCATTGAAAGAT+TGG 0.420142 3:-71181528 MsG0380015506.01.T01:intron
GCAAGTAACATTTACAGCTT+CGG 0.422598 3:-71180915 MsG0380015506.01.T01:CDS
ACATTTCGATCTGGGGAAGC+TGG 0.424153 3:+71181982 None:intergenic
GGAAAATTGCCAGGTTGTAC+AGG 0.433522 3:-71182393 MsG0380015506.01.T01:CDS
GAATCAGAAACATTTCGATC+TGG 0.436840 3:+71181973 None:intergenic
TGTTGGTCTTTGCTCTTGAT+CGG 0.440540 3:+71180701 None:intergenic
TGCTCAAAGAGTGTTCCATT+AGG 0.441482 3:+71181280 None:intergenic
TTCCTAAACTTTCACCACTT+TGG 0.445497 3:-71180620 MsG0380015506.01.T01:three_prime_UTR
TATGAAATTGCACCAACAAA+AGG 0.447794 3:-71180361 MsG0380015506.01.T01:three_prime_UTR
CACCAAAGTGGTGAAAGTTT+AGG 0.449836 3:+71180618 None:intergenic
TGAAGGAATTGTACGATTGA+AGG 0.451073 3:-71182757 MsG0380015506.01.T01:CDS
AGTTTAGGAACAGCTACTTC+AGG 0.451414 3:+71180633 None:intergenic
CCCTTTGTATATATTACCAA+TGG 0.456408 3:+71181589 None:intergenic
AGAAGCTGAGCATTTAGATT+GGG 0.459870 3:-71181147 MsG0380015506.01.T01:CDS
TTGAGTTGTGGTACAGAGCC+TGG 0.461223 3:+71181931 None:intergenic
ATACCTCTTGTATCTATGTA+GGG 0.461610 3:-71180460 MsG0380015506.01.T01:three_prime_UTR
AAGAAGCTGAGCATTTAGAT+TGG 0.466464 3:-71181148 MsG0380015506.01.T01:CDS
AAGGTGAAGGAGACGGAGAT+GGG 0.467102 3:+71182043 None:intergenic
CCAGCCTCTCAAAGAAATAG+TGG 0.469616 3:-71180796 MsG0380015506.01.T01:CDS
GATGGAGATGGAGAAGGAAA+AGG 0.470674 3:+71182096 None:intergenic
GTGCGAAAGGAGGGTCCAAC+TGG 0.473656 3:+71181072 None:intergenic
GACGGAGATGGGAAAGGTGA+AGG 0.475501 3:+71182054 None:intergenic
GATACCTCTTGTATCTATGT+AGG 0.477152 3:-71180461 MsG0380015506.01.T01:three_prime_UTR
GAAGGTGAAGGAGACGGAGA+TGG 0.478843 3:+71182042 None:intergenic
TACAAATCGATGCGTTGATT+AGG 0.487642 3:-71180737 MsG0380015506.01.T01:CDS
AATCAGAAACATTTCGATCT+GGG 0.487765 3:+71181974 None:intergenic
TACAGAGCCTGGTGCAGGCA+AGG 0.487837 3:+71181942 None:intergenic
ACAAGACTTAGAGTTGCAAT+TGG 0.492220 3:-71181122 MsG0380015506.01.T01:CDS
CTCCCAATATCTTTAGGTAG+AGG 0.493053 3:+71182693 None:intergenic
CTAAACTTTCACCACTTTGG+TGG 0.496913 3:-71180617 MsG0380015506.01.T01:three_prime_UTR
CCTGGTGCAGGCAAGGGAGA+AGG 0.498113 3:+71181949 None:intergenic
TGTACGATTGAAGGAATTGG+AGG 0.500702 3:-71182748 MsG0380015506.01.T01:CDS
TGGGCTTCACGCTATTTACA+AGG 0.501563 3:-71180822 MsG0380015506.01.T01:CDS
TAAAATCTAGATTTGAACCT+AGG 0.502394 3:+71183197 None:intergenic
TTGGTGTTTCTGAGGCAGAC+GGG 0.502588 3:+71182019 None:intergenic
AAATCACATGTACATAATAA+GGG 0.503332 3:-71180430 MsG0380015506.01.T01:three_prime_UTR
ATCTTTCCAAGAAGATCAGC+TGG 0.505853 3:-71180760 MsG0380015506.01.T01:CDS
ATGAAATTGCACCAACAAAA+GGG 0.507572 3:-71180360 MsG0380015506.01.T01:three_prime_UTR
CCTTATTCGATGGATAAAGA+TGG 0.514484 3:-71180858 MsG0380015506.01.T01:CDS
TTTGGTGTTTCTGAGGCAGA+CGG 0.516828 3:+71182018 None:intergenic
ACAGAGCCTGGTGCAGGCAA+GGG 0.518967 3:+71181943 None:intergenic
TCTTGGAAAGATGCTAGTGT+TGG 0.519207 3:+71180771 None:intergenic
GTACAGGAAAATCTACCAAA+TGG 0.519256 3:-71182377 MsG0380015506.01.T01:intron
GAAGGAGACGGAGATGGGAA+AGG 0.522176 3:+71182048 None:intergenic
CCTTTGTATATATTACCAAT+GGG 0.523818 3:+71181590 None:intergenic
TGTTCAGTCAGTTATTTGGT+TGG 0.527390 3:-71180308 MsG0380015506.01.T01:three_prime_UTR
GAAGGAGACGGAGACGGAGA+CGG 0.529157 3:+71182072 None:intergenic
AGGATCTTCACGAGGAGCAC+GGG 0.529584 3:+71182149 None:intergenic
GGATCCACTATTTCTTTGAG+AGG 0.530835 3:+71180792 None:intergenic
GAAAAGCAGCTAACTAGTGC+AGG 0.533456 3:-71182414 MsG0380015506.01.T01:CDS
TGTGGTACAGAGCCTGGTGC+AGG 0.535461 3:+71181937 None:intergenic
CAGCGTAGTCATCAGTGAGC+TGG 0.539010 3:+71181024 None:intergenic
GACGGGGAAGGTGAAGGAGA+CGG 0.541363 3:+71182036 None:intergenic
GACGGAGACGGAGACGGAGA+TGG 0.542582 3:+71182078 None:intergenic
GTATATATTACCAATGGGTG+AGG 0.547832 3:+71181595 None:intergenic
TAAACTTTCACCACTTTGGT+GGG 0.551672 3:-71180616 MsG0380015506.01.T01:three_prime_UTR
GAGGCAGACGGGGAAGGTGA+AGG 0.558059 3:+71182030 None:intergenic
AGGCCGTGTTCCTTATTCGA+TGG 0.558360 3:-71180868 MsG0380015506.01.T01:CDS
AGATGGCTCACTTGAAGAGT+GGG 0.558803 3:-71180841 MsG0380015506.01.T01:CDS
ACTAGTGCAGGAAAATTGCC+AGG 0.561889 3:-71182402 MsG0380015506.01.T01:CDS
CCCATTGGTAATATATACAA+AGG 0.564502 3:-71181590 MsG0380015506.01.T01:CDS
GTAATTGGCACCTCACCCAT+TGG 0.565845 3:-71181605 MsG0380015506.01.T01:CDS
TTGGGCTATAACAACTTCAG+TGG 0.568073 3:-71182717 MsG0380015506.01.T01:CDS
TGACTACGCTGCCAAAATCT+CGG 0.568466 3:-71181012 MsG0380015506.01.T01:CDS
GTTTCTGAGGCAGACGGGGA+AGG 0.568493 3:+71182024 None:intergenic
GAAGATTTACGAAATTCTTG+TGG 0.569588 3:+71181359 None:intergenic
GACGGAGACGGAGATGGAGA+TGG 0.572524 3:+71182084 None:intergenic
CCATTGGTAATATATACAAA+GGG 0.574648 3:-71181589 MsG0380015506.01.T01:CDS
AGACGAGCCTTTCACCAGAA+TGG 0.576016 3:-71181320 MsG0380015506.01.T01:CDS
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ACACTCTTTGAGCATTTACA+CGG 0.576521 3:-71181271 MsG0380015506.01.T01:intron
GGTCGCTATGTGCGAAAGGA+GGG 0.576550 3:+71181063 None:intergenic
GAGGATCTTCACGAGGAGCA+CGG 0.579305 3:+71182148 None:intergenic
CAAATTGTGAGAGATTAAGA+GGG 0.582529 3:-71180672 MsG0380015506.01.T01:exon
AAAACCACCATTCTGGTGAA+AGG 0.585001 3:+71181313 None:intergenic
ATCAGAAACATTTCGATCTG+GGG 0.587143 3:+71181975 None:intergenic
AAGATGGCTCACTTGAAGAG+TGG 0.595701 3:-71180842 MsG0380015506.01.T01:CDS
TTTCATGGGATCATTCCTGA+AGG 0.596236 3:-71182774 MsG0380015506.01.T01:CDS
AGGTCGCTATGTGCGAAAGG+AGG 0.597937 3:+71181062 None:intergenic
CTCAAAGAGTGTTCCATTAG+GGG 0.599562 3:+71181282 None:intergenic
TCAAGTTCTGCCCACCAAAG+TGG 0.599583 3:+71180606 None:intergenic
AAAGGTGAAGGAGACGGAGA+CGG 0.605966 3:+71182066 None:intergenic
GATGTCACTGTAACAGGCCA+CGG 0.607346 3:+71181541 None:intergenic
GACGGAGATGGAGATGGAGA+AGG 0.608081 3:+71182090 None:intergenic
GATGGGAAAGGTGAAGGAGA+CGG 0.610896 3:+71182060 None:intergenic
CCTGCAACATATGCACCAGT+TGG 0.611268 3:-71181087 MsG0380015506.01.T01:CDS
GGCTTCACGCTATTTACAAG+GGG 0.614613 3:-71180820 MsG0380015506.01.T01:CDS
TGGTGTTTCTGAGGCAGACG+GGG 0.619432 3:+71182020 None:intergenic
CTCCCCTACATAGATACAAG+AGG 0.627731 3:+71180457 None:intergenic
TTTAGGTCGCTATGTGCGAA+AGG 0.627934 3:+71181059 None:intergenic
TACCTCTTGTATCTATGTAG+GGG 0.639760 3:-71180459 MsG0380015506.01.T01:three_prime_UTR
TTAATAGCTGCACGATTACG+AGG 0.656564 3:+71182129 None:intergenic
GGGCTTCACGCTATTTACAA+GGG 0.660635 3:-71180821 MsG0380015506.01.T01:CDS
TAGCGGTGTTGAAATAGCCG+TGG 0.678464 3:-71181558 MsG0380015506.01.T01:CDS
TACAAAGGGACTCTATCTAG+CGG 0.689930 3:-71181575 MsG0380015506.01.T01:CDS
TATCCATCGAATAAGGAACA+CGG 0.717044 3:+71180865 None:intergenic
CGATTACGAGGATCTTCACG+AGG 0.720668 3:+71182141 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! TTAAATTTTTAAACTAGTGT+TGG - Chr3:71180480-71180499 MsG0380015506.01.T01:three_prime_UTR 15.0%
!! AAATCACATGTACATAATAA+GGG - Chr3:71183080-71183099 MsG0380015506.01.T01:intron 20.0%
!! AATTAAATCTAACACAAGAA+CGG + Chr3:71180407-71180426 None:intergenic 20.0%
!! GTTAATATCATGGTATATAA+TGG + Chr3:71181274-71181293 None:intergenic 20.0%
!! TGACATAAAAGTTAATATCA+TGG + Chr3:71181284-71181303 None:intergenic 20.0%
!!! AGTTGATATTTTGTAATATC+AGG - Chr3:71180367-71180386 MsG0380015506.01.T01:three_prime_UTR 20.0%
!!! GAAGATTTTAGTAATGTAAT+TGG - Chr3:71181890-71181909 MsG0380015506.01.T01:intron 20.0%
! AAAGGAAGGAATCTTATATT+TGG + Chr3:71181798-71181817 None:intergenic 25.0%
! AAGAATTTCGTAAATCTTCT+TGG - Chr3:71182155-71182174 MsG0380015506.01.T01:CDS 25.0%
! AGTAAATTGCTGCTATTATT+TGG - Chr3:71182298-71182317 MsG0380015506.01.T01:intron 25.0%
! ATATTACTCCCAATATCTTT+AGG + Chr3:71180826-71180845 None:intergenic 25.0%
! ATATTACTCGAAATTGTAAC+AGG - Chr3:71182622-71182641 MsG0380015506.01.T01:intron 25.0%
! ATTAAATCTAACACAAGAAC+GGG + Chr3:71180406-71180425 None:intergenic 25.0%
! CAAATCACATGTACATAATA+AGG - Chr3:71183079-71183098 MsG0380015506.01.T01:intron 25.0%
! CCTTTGTATATATTACCAAT+GGG + Chr3:71181923-71181942 None:intergenic 25.0%
! CTCTCATGAAATTAATGAAT+TGG - Chr3:71181047-71181066 MsG0380015506.01.T01:CDS 25.0%
! GAAATTTGCAAATATAGACT+CGG + Chr3:71180933-71180952 None:intergenic 25.0%
! TAAAATCTAGATTTGAACCT+AGG + Chr3:71180316-71180335 None:intergenic 25.0%
! TAATAGCAACACTAAGTAAT+AGG + Chr3:71182271-71182290 None:intergenic 25.0%
! TCATAATAAGTACCTTCTTA+CGG + Chr3:71182031-71182050 None:intergenic 25.0%
!! CCATTGGTAATATATACAAA+GGG - Chr3:71181921-71181940 MsG0380015506.01.T01:intron 25.0%
!! GACAATAATGATTTTCTTTG+CGG - Chr3:71181021-71181040 MsG0380015506.01.T01:CDS 25.0%
!! TGGTATATAATGGAGAAAAA+CGG + Chr3:71181264-71181283 None:intergenic 25.0%
!! TTTATGTCATTCTCTTTTCA+AGG - Chr3:71181295-71181314 MsG0380015506.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATATCTCTTTAAAACCAACA+AGG - Chr3:71181687-71181706 MsG0380015506.01.T01:intron 25.0%
!!! TTCAAAGAGTATTATCTTAC+AGG + Chr3:71180861-71180880 None:intergenic 25.0%
AATCAGAAACATTTCGATCT+GGG + Chr3:71181539-71181558 None:intergenic 30.0%
AATTGTACGATTGAAGGAAT+TGG - Chr3:71180759-71180778 MsG0380015506.01.T01:CDS 30.0%
ACAAATTGTGAGAGATTAAG+AGG - Chr3:71182837-71182856 MsG0380015506.01.T01:intron 30.0%
AGTAGCAACAATTACTTACA+TGG + Chr3:71180608-71180627 None:intergenic 30.0%
ATACCTCTTGTATCTATGTA+GGG - Chr3:71183050-71183069 MsG0380015506.01.T01:intron 30.0%
ATATTCAAAAACCACCATTC+TGG + Chr3:71182207-71182226 None:intergenic 30.0%
ATGAAATTGCACCAACAAAA+GGG - Chr3:71183150-71183169 MsG0380015506.01.T01:intron 30.0%
ATGCTTAAAGACATACCATT+TGG + Chr3:71181151-71181170 None:intergenic 30.0%
CAAATTGTGAGAGATTAAGA+GGG - Chr3:71182838-71182857 MsG0380015506.01.T01:intron 30.0%
CATAATCGTCGAAGTAAAAA+AGG - Chr3:71181318-71181337 MsG0380015506.01.T01:CDS 30.0%
CATTTGTTCAGTCAGTTATT+TGG - Chr3:71183198-71183217 MsG0380015506.01.T01:CDS 30.0%
CCCTTTGTATATATTACCAA+TGG + Chr3:71181924-71181943 None:intergenic 30.0%
GAAGATTTACGAAATTCTTG+TGG + Chr3:71182154-71182173 None:intergenic 30.0%
TATGAAATTGCACCAACAAA+AGG - Chr3:71183149-71183168 MsG0380015506.01.T01:intron 30.0%
TTTGAAAAACCTTTGTCTTG+AGG - Chr3:71180541-71180560 MsG0380015506.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
! ATAAACTGGACAAACCTTTT+AGG - Chr3:71180282-71180301 MsG0380015506.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
! CCCATTGGTAATATATACAA+AGG - Chr3:71181920-71181939 MsG0380015506.01.T01:intron 30.0%
! CTCACAATTTGTTTCATTGT+TGG + Chr3:71182829-71182848 None:intergenic 30.0%
! GAGAAAATATTTTGTTGCTC+AGG - Chr3:71180516-71180535 MsG0380015506.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
! TAAACTGGACAAACCTTTTA+GGG - Chr3:71180283-71180302 MsG0380015506.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
! TGCGGAATAATTCTTTTCAT+GGG - Chr3:71180722-71180741 MsG0380015506.01.T01:CDS 30.0%
! TTGCGGAATAATTCTTTTCA+TGG - Chr3:71180721-71180740 MsG0380015506.01.T01:CDS 30.0%
!! TAACGGAGTTTTATGTTTTC+AGG - Chr3:71181827-71181846 MsG0380015506.01.T01:intron 30.0%
!!! TCATCCTTTTAATTTTCCGT+CGG - Chr3:71182993-71183012 MsG0380015506.01.T01:intron 30.0%
!!! TTTGACTTACTTTTGAGTTG+TGG + Chr3:71181594-71181613 None:intergenic 30.0%
!!! TTTGTTTTATTGCAGTTTGC+TGG - Chr3:71180999-71181018 MsG0380015506.01.T01:CDS 30.0%
AACGAAGCACACGAAAAAAA+TGG + Chr3:71183118-71183137 None:intergenic 35.0%
AAGAAGCTGAGCATTTAGAT+TGG - Chr3:71182362-71182381 MsG0380015506.01.T01:intron 35.0%
ACAAGACTTAGAGTTGCAAT+TGG - Chr3:71182388-71182407 MsG0380015506.01.T01:CDS 35.0%
ACACTCTTTGAGCATTTACA+CGG - Chr3:71182239-71182258 MsG0380015506.01.T01:intron 35.0%
ACATGGACTTTATGTGAACA+AGG + Chr3:71180591-71180610 None:intergenic 35.0%
AGAAGCTGAGCATTTAGATT+GGG - Chr3:71182363-71182382 MsG0380015506.01.T01:intron 35.0%
ATCACCGACGGAAAATTAAA+AGG + Chr3:71183000-71183019 None:intergenic 35.0%
ATCAGAAACATTTCGATCTG+GGG + Chr3:71181538-71181557 None:intergenic 35.0%
CAGTGACATCATTGAAAGAT+TGG - Chr3:71181982-71182001 MsG0380015506.01.T01:CDS 35.0%
CCATCTTTATCCATCGAATA+AGG + Chr3:71182655-71182674 None:intergenic 35.0%
CCTTATTCGATGGATAAAGA+TGG - Chr3:71182652-71182671 MsG0380015506.01.T01:intron 35.0%
CTTCCTTTGTACATGCATAA+CGG - Chr3:71181810-71181829 MsG0380015506.01.T01:intron 35.0%
GAATCAGAAACATTTCGATC+TGG + Chr3:71181540-71181559 None:intergenic 35.0%
GACCTCTACCTAAAGATATT+GGG - Chr3:71180815-71180834 MsG0380015506.01.T01:CDS 35.0%
GATACCTCTTGTATCTATGT+AGG - Chr3:71183049-71183068 MsG0380015506.01.T01:intron 35.0%
GCAAGTAACATTTACAGCTT+CGG - Chr3:71182595-71182614 MsG0380015506.01.T01:intron 35.0%
GTACAGGAAAATCTACCAAA+TGG - Chr3:71181133-71181152 MsG0380015506.01.T01:CDS 35.0%
GTATATATTACCAATGGGTG+AGG + Chr3:71181918-71181937 None:intergenic 35.0%
GTCGAAGTAAAAAAGGTCTT+CGG - Chr3:71181325-71181344 MsG0380015506.01.T01:CDS 35.0%
TAAACTTTCACCACTTTGGT+GGG - Chr3:71182894-71182913 MsG0380015506.01.T01:intron 35.0%
TAAGTACCTTCTTACGGAAT+TGG + Chr3:71182025-71182044 None:intergenic 35.0%
TACCTCTTGTATCTATGTAG+GGG - Chr3:71183051-71183070 MsG0380015506.01.T01:intron 35.0%
TATCCATCGAATAAGGAACA+CGG + Chr3:71182648-71182667 None:intergenic 35.0%
TGAAGGAATTGTACGATTGA+AGG - Chr3:71180753-71180772 MsG0380015506.01.T01:CDS 35.0%
TGTTCAGTCAGTTATTTGGT+TGG - Chr3:71183202-71183221 MsG0380015506.01.T01:CDS 35.0%
TTCAATCGTACAATTCCTTC+AGG + Chr3:71180754-71180773 None:intergenic 35.0%
TTCAATGATGTCACTGTAAC+AGG + Chr3:71181978-71181997 None:intergenic 35.0%
TTCCTAAACTTTCACCACTT+TGG - Chr3:71182890-71182909 MsG0380015506.01.T01:intron 35.0%
! AAATGCTCAGCTTCTTTTAC+TGG + Chr3:71182358-71182377 None:intergenic 35.0%
! ATAGTATGACACCCTTTTGT+TGG + Chr3:71183164-71183183 None:intergenic 35.0%
! ATATTCTGTGCAGAGTTTTG+CGG - Chr3:71180704-71180723 MsG0380015506.01.T01:CDS 35.0%
! ATTGAAGGAATTGGAGGTTT+TGG - Chr3:71180768-71180787 MsG0380015506.01.T01:CDS 35.0%
! CTTAGCAGCAGCTTTTATAT+CGG + Chr3:71182554-71182573 None:intergenic 35.0%
! GTTTTTGAATATGCCCCTAA+TGG - Chr3:71182215-71182234 MsG0380015506.01.T01:intron 35.0%
!! CTCAGTTGCTTTGTTTATTG+TGG - Chr3:71180626-71180645 MsG0380015506.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
!! TACAAATCGATGCGTTGATT+AGG - Chr3:71182773-71182792 MsG0380015506.01.T01:CDS 35.0%
!! TACAAGAGGTATCAACTTAC+AGG + Chr3:71183042-71183061 None:intergenic 35.0%
!! TCTCATTTCGCAATTTTAGC+TGG + Chr3:71182947-71182966 None:intergenic 35.0%
!!! GAATTGGAGGTTTTGGATTT+GGG - Chr3:71180775-71180794 MsG0380015506.01.T01:CDS 35.0%
!!! TTTTAATTTTCCGTCGGTGA+TGG - Chr3:71182999-71183018 MsG0380015506.01.T01:intron 35.0%
AAAACCACCATTCTGGTGAA+AGG + Chr3:71182200-71182219 None:intergenic 40.0%
ACTCCGTTATGCATGTACAA+AGG + Chr3:71181816-71181835 None:intergenic 40.0%
AGAAGTCCAATTCCGTAAGA+AGG - Chr3:71182016-71182035 MsG0380015506.01.T01:CDS 40.0%
AGTTTAGGAACAGCTACTTC+AGG + Chr3:71182880-71182899 None:intergenic 40.0%
ATCTTTCCAAGAAGATCAGC+TGG - Chr3:71182750-71182769 MsG0380015506.01.T01:CDS 40.0%
CACCAAAGTGGTGAAAGTTT+AGG + Chr3:71182895-71182914 None:intergenic 40.0%
CGTTATGCATGTACAAAGGA+AGG + Chr3:71181812-71181831 None:intergenic 40.0%
CTAAACTTTCACCACTTTGG+TGG - Chr3:71182893-71182912 MsG0380015506.01.T01:intron 40.0%
CTCCCAATATCTTTAGGTAG+AGG + Chr3:71180820-71180839 None:intergenic 40.0%
GAAGTAAAAAAGGTCTTCGG+AGG - Chr3:71181328-71181347 MsG0380015506.01.T01:CDS 40.0%
GCTAGATTTCCTCAAGACAA+AGG + Chr3:71180553-71180572 None:intergenic 40.0%
GGACCTCTACCTAAAGATAT+TGG - Chr3:71180814-71180833 MsG0380015506.01.T01:CDS 40.0%
TACAAAGGGACTCTATCTAG+CGG - Chr3:71181935-71181954 MsG0380015506.01.T01:CDS 40.0%
TCTTGGAAAGATGCTAGTGT+TGG + Chr3:71182742-71182761 None:intergenic 40.0%
TGTACGATTGAAGGAATTGG+AGG - Chr3:71180762-71180781 MsG0380015506.01.T01:CDS 40.0%
TTAATAGCTGCACGATTACG+AGG + Chr3:71181384-71181403 None:intergenic 40.0%
TTGGGCTATAACAACTTCAG+TGG - Chr3:71180793-71180812 MsG0380015506.01.T01:CDS 40.0%
TTTCATGGGATCATTCCTGA+AGG - Chr3:71180736-71180755 MsG0380015506.01.T01:CDS 40.0%
TTTGTACCAGCTGATCTTCT+TGG + Chr3:71182759-71182778 None:intergenic 40.0%
! AGCTCTGATCTCTTTAGCTT+CGG + Chr3:71181857-71181876 None:intergenic 40.0%
! GAAACTCAAGTCCGAGATTT+TGG + Chr3:71182512-71182531 None:intergenic 40.0%
! GAATCATCACGTTGCTATTG+TGG - Chr3:71181614-71181633 MsG0380015506.01.T01:CDS 40.0%
! GCTGGACAGATGAAGTATTT+AGG + Chr3:71182471-71182490 None:intergenic 40.0%
! GGATCCACTATTTCTTTGAG+AGG + Chr3:71182721-71182740 None:intergenic 40.0%
! GTAGATTTTCCTGTACAACC+TGG + Chr3:71181129-71181148 None:intergenic 40.0%
! TTGCTATTGTGGTGGAATTG+TGG - Chr3:71181625-71181644 MsG0380015506.01.T01:CDS 40.0%
!! CTCAAAGAGTGTTCCATTAG+GGG + Chr3:71182231-71182250 None:intergenic 40.0%
!! GCTCAAAGAGTGTTCCATTA+GGG + Chr3:71182232-71182251 None:intergenic 40.0%
!! TGCTCAAAGAGTGTTCCATT+AGG + Chr3:71182233-71182252 None:intergenic 40.0%
!! TGTTGGTCTTTGCTCTTGAT+CGG + Chr3:71182812-71182831 None:intergenic 40.0%
!!! CACTGTTTTTGGTGTTTCTG+AGG + Chr3:71181502-71181521 None:intergenic 40.0%
!!! GGAATTGGAGGTTTTGGATT+TGG - Chr3:71180774-71180793 MsG0380015506.01.T01:CDS 40.0%
AAGATGGCTCACTTGAAGAG+TGG - Chr3:71182668-71182687 MsG0380015506.01.T01:intron 45.0%
ACTAGTGCAGGAAAATTGCC+AGG - Chr3:71181108-71181127 MsG0380015506.01.T01:CDS 45.0%
AGATGGCTCACTTGAAGAGT+GGG - Chr3:71182669-71182688 MsG0380015506.01.T01:intron 45.0%
ATTAAGTGGCCAGCTTCAGA+AGG - Chr3:71181738-71181757 MsG0380015506.01.T01:intron 45.0%
CCAGCCTCTCAAAGAAATAG+TGG - Chr3:71182714-71182733 MsG0380015506.01.T01:CDS 45.0%
CTCCCCTACATAGATACAAG+AGG + Chr3:71183056-71183075 None:intergenic 45.0%
GAAAAGCAGCTAACTAGTGC+AGG - Chr3:71181096-71181115 MsG0380015506.01.T01:CDS 45.0%
GATGGAGATGGAGAAGGAAA+AGG + Chr3:71181417-71181436 None:intergenic 45.0%
GGAAAATTGCCAGGTTGTAC+AGG - Chr3:71181117-71181136 MsG0380015506.01.T01:CDS 45.0%
GGAAATCTAGCACATGAGCT+CGG - Chr3:71180562-71180581 MsG0380015506.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
GGCTTCACGCTATTTACAAG+GGG - Chr3:71182690-71182709 MsG0380015506.01.T01:CDS 45.0%
GGGCTTCACGCTATTTACAA+GGG - Chr3:71182689-71182708 MsG0380015506.01.T01:CDS 45.0%
TGACTACGCTGCCAAAATCT+CGG - Chr3:71182498-71182517 MsG0380015506.01.T01:CDS 45.0%
TGGGCTTCACGCTATTTACA+AGG - Chr3:71182688-71182707 MsG0380015506.01.T01:CDS 45.0%
TTTAACGGTGGCTACCTTGT+TGG + Chr3:71181704-71181723 None:intergenic 45.0%
TTTAGGTCGCTATGTGCGAA+AGG + Chr3:71182454-71182473 None:intergenic 45.0%
! CCACTATTTCTTTGAGAGGC+TGG + Chr3:71182717-71182736 None:intergenic 45.0%
! CTATTGTGGTGGAATTGTGG+TGG - Chr3:71181628-71181647 MsG0380015506.01.T01:CDS 45.0%
! TCATCACGTTGCTATTGTGG+TGG - Chr3:71181617-71181636 MsG0380015506.01.T01:CDS 45.0%
!! CTTCAGAAGGCATTTGTGAC+AGG - Chr3:71181751-71181770 MsG0380015506.01.T01:intron 45.0%
!! GCTGGCTTCTTCACTGTTTT+TGG + Chr3:71181513-71181532 None:intergenic 45.0%
!! GGAGAAGGAAAAGGAGTATC+AGG + Chr3:71181408-71181427 None:intergenic 45.0%
!! TCACAAATGCCTTCTGAAGC+TGG + Chr3:71181750-71181769 None:intergenic 45.0%
!! TTTGGTGTTTCTGAGGCAGA+CGG + Chr3:71181495-71181514 None:intergenic 45.0%
!!! GCAATTTTAGCTGGCGTCAA+AGG + Chr3:71182938-71182957 None:intergenic 45.0%
AAAGGTGAAGGAGACGGAGA+CGG + Chr3:71181447-71181466 None:intergenic 50.0%
AAGGTGAAGGAGACGGAGAT+GGG + Chr3:71181470-71181489 None:intergenic 50.0%
ACATTTCGATCTGGGGAAGC+TGG + Chr3:71181531-71181550 None:intergenic 50.0%
AGACGAGCCTTTCACCAGAA+TGG - Chr3:71182190-71182209 MsG0380015506.01.T01:CDS 50.0%
AGGCCGTGTTCCTTATTCGA+TGG - Chr3:71182642-71182661 MsG0380015506.01.T01:intron 50.0%
CCAACTGGTGCATATGTTGC+AGG + Chr3:71182426-71182445 None:intergenic 50.0%
CCACTTAATCCTGTAGCCCA+CGG + Chr3:71181727-71181746 None:intergenic 50.0%
CCTAGGCGATCATCCCTAAA+AGG + Chr3:71180299-71180318 None:intergenic 50.0%
CCTGCAACATATGCACCAGT+TGG - Chr3:71182423-71182442 MsG0380015506.01.T01:CDS 50.0%
CGATTACGAGGATCTTCACG+AGG + Chr3:71181372-71181391 None:intergenic 50.0%
GATGGGAAAGGTGAAGGAGA+CGG + Chr3:71181453-71181472 None:intergenic 50.0%
GATGTCACTGTAACAGGCCA+CGG + Chr3:71181972-71181991 None:intergenic 50.0%
GTAATTGGCACCTCACCCAT+TGG - Chr3:71181905-71181924 MsG0380015506.01.T01:intron 50.0%
TCAAGTTCTGCCCACCAAAG+TGG + Chr3:71182907-71182926 None:intergenic 50.0%
TCCTGTAGCCCACGGTTTAA+CGG + Chr3:71181719-71181738 None:intergenic 50.0%
! TAGCGGTGTTGAAATAGCCG+TGG - Chr3:71181952-71181971 MsG0380015506.01.T01:CDS 50.0%
! TTGAGTTGTGGTACAGAGCC+TGG + Chr3:71181582-71181601 None:intergenic 50.0%
! TTGTGGTGGAATTGTGGTGG+TGG - Chr3:71181631-71181650 MsG0380015506.01.T01:CDS 50.0%
!! CCTTTTAGGGATGATCGCCT+AGG - Chr3:71180296-71180315 MsG0380015506.01.T01:three_prime_UTR 50.0%
!! CTTTTTAGCGCCATCACCGA+CGG + Chr3:71183012-71183031 None:intergenic 50.0%
!! TTGGTGTTTCTGAGGCAGAC+GGG + Chr3:71181494-71181513 None:intergenic 50.0%
AGGTAGCCACCGTTAAACCG+TGG - Chr3:71181707-71181726 MsG0380015506.01.T01:intron 55.0%
AGGTCGCTATGTGCGAAAGG+AGG + Chr3:71182451-71182470 None:intergenic 55.0%
CAGCGTAGTCATCAGTGAGC+TGG + Chr3:71182489-71182508 None:intergenic 55.0%
CGAGCCTTTCACCAGAATGG+TGG - Chr3:71182193-71182212 MsG0380015506.01.T01:CDS 55.0%
GAAGGAGACGGAGATGGGAA+AGG + Chr3:71181465-71181484 None:intergenic 55.0%
GAAGGTGAAGGAGACGGAGA+TGG + Chr3:71181471-71181490 None:intergenic 55.0%
GACGGAGATGGAGATGGAGA+AGG + Chr3:71181423-71181442 None:intergenic 55.0%
GACGGAGATGGGAAAGGTGA+AGG + Chr3:71181459-71181478 None:intergenic 55.0%
GAGGATCTTCACGAGGAGCA+CGG + Chr3:71181365-71181384 None:intergenic 55.0%
GGTAGCCACCGTTAAACCGT+GGG - Chr3:71181708-71181727 MsG0380015506.01.T01:intron 55.0%
GGTCGCTATGTGCGAAAGGA+GGG + Chr3:71182450-71182469 None:intergenic 55.0%
TGTAGCCCACGGTTTAACGG+TGG + Chr3:71181716-71181735 None:intergenic 55.0%
! ACCGTTAAACCGTGGGCTAC+AGG - Chr3:71181715-71181734 MsG0380015506.01.T01:intron 55.0%
! AGGATCTTCACGAGGAGCAC+GGG + Chr3:71181364-71181383 None:intergenic 55.0%
! CCGTGGGCTACAGGATTAAG+TGG - Chr3:71181724-71181743 MsG0380015506.01.T01:intron 55.0%
! CGTCGGTGATGGCGCTAAAA+AGG - Chr3:71183010-71183029 MsG0380015506.01.T01:intron 55.0%
!! TGGTGTTTCTGAGGCAGACG+GGG + Chr3:71181493-71181512 None:intergenic 55.0%
ACAGAGCCTGGTGCAGGCAA+GGG + Chr3:71181570-71181589 None:intergenic 60.0%
GAAGGAGACGGAGACGGAGA+CGG + Chr3:71181441-71181460 None:intergenic 60.0%
GACGGAGACGGAGATGGAGA+TGG + Chr3:71181429-71181448 None:intergenic 60.0%
GACGGGGAAGGTGAAGGAGA+CGG + Chr3:71181477-71181496 None:intergenic 60.0%
GTGCGAAAGGAGGGTCCAAC+TGG + Chr3:71182441-71182460 None:intergenic 60.0%
TACAGAGCCTGGTGCAGGCA+AGG + Chr3:71181571-71181590 None:intergenic 60.0%
TGTGGTACAGAGCCTGGTGC+AGG + Chr3:71181576-71181595 None:intergenic 60.0%
!! GTTTCTGAGGCAGACGGGGA+AGG + Chr3:71181489-71181508 None:intergenic 60.0%
CCTGGTGCAGGCAAGGGAGA+AGG + Chr3:71181564-71181583 None:intergenic 65.0%
CCTTCTCCCTTGCCTGCACC+AGG - Chr3:71181561-71181580 MsG0380015506.01.T01:CDS 65.0%
GACGGAGACGGAGACGGAGA+TGG + Chr3:71181435-71181454 None:intergenic 65.0%
GAGGCAGACGGGGAAGGTGA+AGG + Chr3:71181483-71181502 None:intergenic 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr3 gene 71180269 71183263 71180269 ID=MsG0380015506.01;Name=MsG0380015506.01
Chr3 mRNA 71180269 71183263 71180269 ID=MsG0380015506.01.T01;Parent=MsG0380015506.01;Name=MsG0380015506.01.T01;_AED=0.32;_eAED=0.32;_QI=0|0.5|0.57|0.85|1|1|7|408|488
Chr3 exon 71180269 71181173 71180269 ID=MsG0380015506.01.T01:exon:520;Parent=MsG0380015506.01.T01
Chr3 exon 71181272 71181404 71181272 ID=MsG0380015506.01.T01:exon:519;Parent=MsG0380015506.01.T01
Chr3 exon 71181529 71181683 71181529 ID=MsG0380015506.01.T01:exon:518;Parent=MsG0380015506.01.T01
Chr3 exon 71181929 71182215 71181929 ID=MsG0380015506.01.T01:exon:517;Parent=MsG0380015506.01.T01
Chr3 exon 71182378 71182518 71182378 ID=MsG0380015506.01.T01:exon:516;Parent=MsG0380015506.01.T01
Chr3 exon 71182672 71182815 71182672 ID=MsG0380015506.01.T01:exon:515;Parent=MsG0380015506.01.T01
Chr3 exon 71183154 71183263 71183154 ID=MsG0380015506.01.T01:exon:514;Parent=MsG0380015506.01.T01
Chr3 CDS 71183154 71183263 71183154 ID=MsG0380015506.01.T01:cds;Parent=MsG0380015506.01.T01
Chr3 CDS 71182672 71182815 71182672 ID=MsG0380015506.01.T01:cds;Parent=MsG0380015506.01.T01
Chr3 CDS 71182378 71182518 71182378 ID=MsG0380015506.01.T01:cds;Parent=MsG0380015506.01.T01
Chr3 CDS 71181929 71182215 71181929 ID=MsG0380015506.01.T01:cds;Parent=MsG0380015506.01.T01
Chr3 CDS 71181529 71181683 71181529 ID=MsG0380015506.01.T01:cds;Parent=MsG0380015506.01.T01
Chr3 CDS 71181272 71181404 71181272 ID=MsG0380015506.01.T01:cds;Parent=MsG0380015506.01.T01
Chr3 CDS 71180677 71181173 71180677 ID=MsG0380015506.01.T01:cds;Parent=MsG0380015506.01.T01
Chr3 three_prime_UTR 71180269 71180676 71180269 ID=MsG0380015506.01.T01:three_prime_utr;Parent=MsG0380015506.01.T01
Gene Sequence

>MsG0380015506.01.T01

ATGAATAATGATTATAAACTGGACAAACCTTTTAGGGATGATCGCCTAGGTTCAAATCTAGATTTTAATCGTCATGAATCAACTGATCAATTCTATACAGTTGATATTTTAGTTTTGCGGAATAATTCTTTTCATGGGATCATTCCTGAAGGAATTGTACGATTGAAGGAATTGGAGGTTTTGGATTTGGGCTATAACAACTTCAGTGGACCTCTACCTAAAGATATTGGGAGTAATATCTCACTAGCAATCCTTTTGCTGGACAATAATGATTTTCTTTGCGGATTCTCTCATGAAATTAATGAATTGGTGATGATTTCTGAATCTCAAGTAGATGAAAAGCAGCTAACTAGTGCAGGAAAATTGCCAGGTTGTACAGGAAAATCTACCAAATGGCATAATCGTCGAAGTAAAAAAGGTCTTCGGAGGCTACTGCAATCCCGTGCTCCTCGTGAAGATCCTCGTAATCGTGCAGCTATTAATCCTGATACTCCTTTTCCTTCTCCATCTCCATCTCCGTCTCCGTCTCCGTCTCCTTCACCTTTCCCATCTCCGTCTCCTTCACCTTCCCCGTCTGCCTCAGAAACACCAAAAACAGTGAAGAAGCCAGCTTCCCCAGATCGAAATGTTTCTGATTCTCCTTCTCCCTTGCCTGCACCAGGCTCTGTACCACAACTCAAAAGTGTGCCGAAGCTAAAGAGATCAGAGCTTGAAGCAGCATGCGAAGATTTTAGTAATGTAATTGGCACCTCACCCATTGGTAATATATACAAAGGGACTCTATCTAGCGGTGTTGAAATAGCCGTGGCCTGTTACAGTGACATCATTGAAAGATTGATAGATACATTATCAAAGATGAACCACAAGAATTTCGTAAATCTTCTTGGATTTTGTGAAGAAGACGAGCCTTTCACCAGAATGGTGGTTTTTGAATATGCCCCTAATGGAACACTCTTTGAGCATTTACACGTAAAAGAAGCTGAGCATTTAGATTGGGCAACAAGACTTAGAGTTGCAATTGGCACAGCTTACTGCCTGCAACATATGCACCAGTTGGACCCTCCTTTCGCACATAGCGACCTAAATACTTCATCTGTCCAGCTCACTGATGACTACGCTGCCAAAATCTCGGACTTGAGTTTCTTGAACGAAATAGCTTCAGCCGATATAAAAGCTGCTGCTAAGAAACACACTGACGCAACATTAGCAAGTAACATTTACAGCTTCGGCATTATATTACTCGAAATTGTAACAGGCCGTGTTCCTTATTCGATGGATAAAGATGGCTCACTTGAAGAGTGGGCTTCACGCTATTTACAAGGGGACCAGCCTCTCAAAGAAATAGTGGATCCAACACTAGCATCTTTCCAAGAAGATCAGCTGGTACAAATCGATGCGTTGATTAGGTCTTGCGTCAATGCCGATCAAGAGCAAAGACCAACAATGAAACAAATTGTGAGAGATTAA
Protein sequence

>MsG0380015506.01.T01

MNNDYKLDKPFRDDRLGSNLDFNRHESTDQFYTVDILVLRNNSFHGIIPEGIVRLKELEVLDLGYNNFSGPLPKDIGSNISLAILLLDNNDFLCGFSHEINELVMISESQVDEKQLTSAGKLPGCTGKSTKWHNRRSKKGLRRLLQSRAPREDPRNRAAINPDTPFPSPSPSPSPSPSPSPFPSPSPSPSPSASETPKTVKKPASPDRNVSDSPSPLPAPGSVPQLKSVPKLKRSELEAACEDFSNVIGTSPIGNIYKGTLSSGVEIAVACYSDIIERLIDTLSKMNHKNFVNLLGFCEEDEPFTRMVVFEYAPNGTLFEHLHVKEAEHLDWATRLRVAIGTAYCLQHMHQLDPPFAHSDLNTSSVQLTDDYAAKISDLSFLNEIASADIKAAAKKHTDATLASNIYSFGIILLEIVTGRVPYSMDKDGSLEEWASRYLQGDQPLKEIVDPTLASFQEDQLVQIDALIRSCVNADQEQRPTMKQIVRD*