AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380016428.01

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MsG0380016428.01.T01 AT1G16480 27.877 617 374 14 110 689 94 676 1.41e-63 228
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MsG0380016428.01.T01 AT3G49740 25.872 344 242 4 92 425 305 645 6.15e-37 148
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MsG0380016428.01.T01 AT3G49740 26.752 157 112 3 71 225 486 641 8.39e-11 65.9
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MsG0380016428.01.T01 AT1G11290 31.106 479 295 6 67 544 128 572 4.71e-69 242
MsG0380016428.01.T01 AT1G11290 27.687 549 318 10 180 689 41 549 7.12e-55 202
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MsG0380016428.01.T01 AT1G74600 24.872 587 375 8 110 665 84 635 1.34e-54 202
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MsG0380016428.01.T01 AT1G56570 25.408 551 355 11 72 612 14 518 1.36e-55 201
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MsG0380016428.01.T01 AT4G38010 32.609 184 123 1 114 296 243 426 5.82e-23 103
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MsG0380016428.01.T01 AT2G40720 26.880 532 344 9 178 697 62 560 6.11e-52 194
MsG0380016428.01.T01 AT2G40720 26.880 532 336 13 107 626 305 795 3.55e-44 171
MsG0380016428.01.T01 AT2G40720 28.316 392 247 8 246 630 28 392 1.57e-39 157
MsG0380016428.01.T01 AT2G40720 23.934 305 225 3 55 352 451 755 2.37e-25 112
MsG0380016428.01.T01 AT3G23330 30.171 527 344 8 193 705 22 538 1.08e-72 250
MsG0380016428.01.T01 AT3G23330 28.537 417 229 5 143 522 72 456 5.49e-52 192
MsG0380016428.01.T01 AT3G23330 27.446 368 237 4 126 493 192 529 8.20e-42 162
MsG0380016428.01.T01 AT3G23330 32.301 226 152 1 107 331 274 499 8.03e-32 132
MsG0380016428.01.T01 AT2G39620 27.482 564 377 2 117 679 241 773 1.68e-72 252
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MsG0380016428.01.T01 AT2G39620 24.765 638 401 9 110 707 135 733 3.01e-50 189
MsG0380016428.01.T01 AT3G63370 28.991 545 350 7 74 614 79 590 2.05e-72 252
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MsG0380016428.01.T01 AT3G63370 28.767 365 214 8 265 620 68 395 3.36e-36 146
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MsG0380016428.01.T01 AT2G34400 31.633 294 201 0 78 371 135 428 5.77e-46 174
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MsG0380016428.01.T01 AT3G22690 27.368 190 131 4 479 664 102 288 3.18e-15 80.1
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MsG0380016428.01.T01 AT5G39680 25.573 524 347 8 72 586 28 517 8.20e-49 183
MsG0380016428.01.T01 AT5G19020 26.889 569 348 7 178 679 43 610 3.79e-65 229
MsG0380016428.01.T01 AT5G19020 25.641 507 340 6 114 583 111 617 3.48e-50 187
MsG0380016428.01.T01 AT5G19020 23.958 480 250 12 85 493 192 627 2.09e-25 112
MsG0380016428.01.T01 AT1G56690 26.182 592 345 6 121 709 28 530 8.07e-65 228
MsG0380016428.01.T01 AT1G56690 23.415 615 373 17 114 685 52 611 1.12e-33 138
MsG0380016428.01.T01 AT1G56690 28.625 269 184 4 109 370 264 531 5.23e-29 123
MsG0380016428.01.T01 AT1G56690 21.684 392 236 11 319 701 24 353 8.82e-13 72.4
MsG0380016428.01.T01 AT3G25060 29.651 516 318 10 197 705 35 512 1.00e-64 226
MsG0380016428.01.T01 AT3G25060 25.268 467 310 9 129 591 69 500 2.18e-43 166
MsG0380016428.01.T01 AT3G25060 29.057 265 187 1 110 374 151 414 1.13e-38 152
MsG0380016428.01.T01 AT3G25060 26.077 418 263 11 326 709 44 449 7.06e-31 129
MsG0380016428.01.T01 AT3G25060 24.364 275 176 7 110 383 252 495 3.29e-19 92.4
MsG0380016428.01.T01 AT2G41080 28.361 476 332 5 237 709 8 477 1.18e-64 226
MsG0380016428.01.T01 AT2G41080 26.667 405 267 2 114 518 114 488 5.43e-43 166
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MsG0380016428.01.T01 AT1G74630 25.268 467 272 10 129 590 73 467 4.12e-37 148
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MsG0380016428.01.T01 AT5G37570 25.270 463 295 13 132 586 65 484 5.92e-40 155
MsG0380016428.01.T01 AT5G37570 24.603 378 246 6 117 493 152 491 3.91e-26 114
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MsG0380016428.01.T01 AT3G46790 27.887 459 289 9 42 493 48 471 1.03e-45 173
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MsG0380016428.01.T01 AT3G21470 27.500 400 260 9 157 549 27 403 5.63e-42 160
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MsG0380016428.01.T01 AT3G21470 28.571 231 165 0 111 341 209 439 8.73e-25 109
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MsG0380016428.01.T01 AT4G31070 26.512 562 373 11 155 709 35 563 3.68e-53 194
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MsG0380016428.01.T01 AT5G48910 27.409 467 244 12 84 493 32 460 1.64e-37 149
MsG0380016428.01.T01 AT5G48910 26.667 405 264 8 106 499 204 586 5.21e-31 129
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MsG0380016428.01.T01 AT3G56550 26.220 492 300 12 85 547 15 472 2.91e-35 142
MsG0380016428.01.T01 AT3G56550 27.715 267 191 2 82 346 114 380 3.40e-29 123
MsG0380016428.01.T01 AT5G52630 26.291 426 280 5 284 708 22 414 9.28e-41 158
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MsG0380016428.01.T01 AT5G52630 29.670 273 187 2 104 371 145 417 1.50e-29 124
MsG0380016428.01.T01 AT5G52630 22.959 392 268 4 197 586 36 395 3.09e-24 108
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MsG0380016428.01.T01 AT1G33350 27.491 291 192 7 117 393 200 485 1.14e-25 112
MsG0380016428.01.T01 AT1G33350 24.561 399 234 8 129 489 76 445 7.12e-25 109
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MsG0380016428.01.T01 AT1G33350 27.321 377 259 10 227 590 73 447 9.58e-33 134
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MsG0380016428.01.T01 AT1G64100 23.744 577 384 16 125 672 86 635 2.40e-31 130
MsG0380016428.01.T01 AT5G61800 29.963 267 181 3 408 673 151 412 4.91e-31 128
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MsG0380016428.01.T01 AT4G19440 23.191 539 382 13 160 673 223 754 7.29e-27 117
MsG0380016428.01.T01 AT4G19440 19.928 557 414 8 99 627 262 814 6.99e-15 79.3
MsG0380016428.01.T01 AT4G19440 23.191 539 382 13 160 673 223 754 7.29e-27 117
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MsG0380016428.01.T01 AT1G31840 20.284 493 334 10 191 659 232 689 8.21e-21 98.2
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MsG0380016428.01.T01 AT1G62670 22.028 572 365 15 126 680 62 569 1.16e-24 109
MsG0380016428.01.T01 AT1G62670 22.098 448 302 9 260 692 64 479 1.89e-14 77.4
MsG0380016428.01.T01 AT2G15690 31.214 173 119 0 506 678 232 404 1.35e-23 106
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MsG0380016428.01.T01 AT1G12620 23.429 525 374 10 127 625 54 576 1.75e-23 105
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MsG0380016428.01.T01 AT5G02860 20.604 563 394 10 140 683 278 806 2.05e-23 106
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MsG0380016428.01.T02 AT4G35130 30.130 614 384 9 88 696 58 631 4.07e-95 312
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MsG0380016428.01.T02 AT3G09040 26.695 236 165 3 413 647 78 306 2.55e-19 93.6
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MsG0380016428.01.T02 AT1G03540 27.130 575 362 13 16 575 12 544 6.91e-62 218
MsG0380016428.01.T02 AT1G03540 24.749 299 216 4 62 358 266 557 3.14e-27 117
MsG0380016428.01.T02 AT1G08070 35.088 456 292 3 243 695 10 464 4.43e-85 281
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MsG0380016428.01.T02 AT1G08070 26.829 410 234 5 143 518 11 388 7.82e-40 156
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MsG0380016428.01.T02 AT3G49170 26.943 386 236 14 234 607 32 383 5.27e-29 124
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MsG0380016428.01.T02 AT3G01580 25.200 500 335 8 90 583 90 556 1.83e-53 196
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MsG0380016428.01.T02 AT1G16480 29.048 630 407 7 71 695 170 764 7.19e-83 282
MsG0380016428.01.T02 AT1G16480 27.877 617 374 14 96 675 94 676 1.39e-63 228
MsG0380016428.01.T02 AT1G16480 28.350 515 332 8 106 616 2 483 1.54e-57 211
MsG0380016428.01.T02 AT1G16480 27.361 413 266 4 206 616 1 381 5.57e-42 164
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MsG0380016428.01.T02 AT5G13230 22.785 395 285 7 259 650 23 400 6.77e-23 104
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MsG0380016428.01.T02 AT5G09950 25.347 505 329 11 167 659 2 470 3.73e-37 149
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MsG0380016428.01.T02 AT5G09950 26.199 584 378 13 93 660 33 579 7.10e-56 206
MsG0380016428.01.T02 AT5G09950 25.257 487 318 10 185 659 24 476 5.09e-37 149
MsG0380016428.01.T02 AT5G09950 29.364 613 386 9 96 695 243 821 2.51e-82 281
MsG0380016428.01.T02 AT5G09950 26.199 584 378 13 93 660 33 579 7.10e-56 206
MsG0380016428.01.T02 AT5G09950 25.257 487 318 10 185 659 24 476 5.09e-37 149
MsG0380016428.01.T02 AT2G27610 29.272 591 381 5 103 691 135 690 4.81e-82 278
MsG0380016428.01.T02 AT2G27610 27.667 553 356 6 110 657 41 554 1.50e-66 236
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MsG0380016428.01.T02 AT2G27610 26.531 294 213 3 338 630 36 327 6.24e-26 114
MsG0380016428.01.T02 AT3G13880 27.442 645 419 9 64 695 50 658 6.51e-82 275
MsG0380016428.01.T02 AT3G13880 24.923 325 203 8 58 377 356 644 2.47e-24 108
MsG0380016428.01.T02 AT3G47840 28.904 602 393 5 97 695 41 610 7.65e-82 274
MsG0380016428.01.T02 AT3G47840 24.408 549 367 10 49 583 90 604 2.47e-48 181
MsG0380016428.01.T02 AT3G47840 25.424 472 315 8 64 534 212 647 9.10e-44 168
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MsG0380016428.01.T02 AT1G74600 25.636 550 372 7 103 651 192 705 3.53e-54 201
MsG0380016428.01.T02 AT1G74600 25.439 342 233 6 328 659 83 412 4.63e-24 108
MsG0380016428.01.T02 AT1G74600 24.638 276 206 2 71 344 561 836 8.16e-23 104
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MsG0380016428.01.T02 AT3G49740 23.844 411 294 9 252 653 41 441 6.52e-33 135
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MsG0380016428.01.T02 AT1G19720 25.000 560 332 11 145 692 64 547 6.39e-44 170
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MsG0380016428.01.T02 AT3G05240 25.352 426 281 3 64 481 110 506 2.10e-40 156
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MsG0380016428.01.T02 AT4G37170 26.720 378 212 4 164 508 87 432 1.51e-39 155
MsG0380016428.01.T02 AT4G37170 27.097 310 219 4 75 378 232 540 5.64e-32 132
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MsG0380016428.01.T02 AT3G22690 27.350 468 297 7 167 629 37 466 4.24e-48 182
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MsG0380016428.01.T02 AT2G29760 25.728 412 244 6 96 475 166 547 1.87e-38 152
MsG0380016428.01.T02 AT3G22690 29.766 598 352 7 130 692 102 666 8.14e-77 265
MsG0380016428.01.T02 AT3G22690 26.930 531 378 8 75 598 146 673 6.64e-70 246
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MsG0380016428.01.T02 AT1G06140 24.064 374 253 5 103 475 151 494 4.05e-38 150
MsG0380016428.01.T02 AT1G06140 26.178 382 247 7 270 647 11 361 5.13e-31 129
MsG0380016428.01.T02 AT1G06140 24.818 274 175 3 97 369 247 490 3.52e-25 110
MsG0380016428.01.T02 AT4G02750 28.930 598 335 9 100 695 99 608 1.06e-75 259
MsG0380016428.01.T02 AT4G02750 24.675 539 329 12 100 576 68 591 1.26e-38 153
MsG0380016428.01.T02 AT4G02750 24.859 177 131 2 61 235 409 585 2.93e-14 77.0
MsG0380016428.01.T02 AT4G02750 22.741 343 228 12 323 659 58 369 2.02e-13 74.3
MsG0380016428.01.T02 AT4G33170 28.650 548 356 5 150 695 303 817 3.58e-75 261
MsG0380016428.01.T02 AT4G33170 24.711 692 431 18 67 675 45 729 3.73e-51 192
MsG0380016428.01.T02 AT4G33170 27.536 414 265 5 98 509 352 732 3.62e-46 177
MsG0380016428.01.T02 AT4G33170 28.571 210 150 0 65 274 521 730 2.32e-21 100
MsG0380016428.01.T02 AT1G68930 31.388 497 333 5 203 695 52 544 4.04e-75 256
MsG0380016428.01.T02 AT1G68930 27.176 563 335 11 57 584 10 532 1.84e-57 207
MsG0380016428.01.T02 AT1G68930 26.214 412 272 5 285 665 2 412 3.58e-44 169
MsG0380016428.01.T02 AT1G68930 25.075 335 236 4 28 356 220 545 1.74e-34 140
MsG0380016428.01.T02 AT3G61170 28.904 602 358 6 97 695 60 594 4.96e-75 258
MsG0380016428.01.T02 AT3G61170 28.924 446 267 9 38 469 94 503 1.08e-49 186
MsG0380016428.01.T02 AT3G61170 30.556 324 219 2 282 604 17 335 1.60e-45 174
MsG0380016428.01.T02 AT3G61170 31.469 286 195 1 71 355 237 522 4.55e-42 164
MsG0380016428.01.T02 AT4G01030 26.582 632 353 8 106 695 33 595 5.42e-75 257
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MsG0380016428.01.T02 AT4G01030 21.530 562 294 11 40 491 65 589 5.27e-30 127
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MsG0380016428.01.T02 AT1G56570 30.677 502 311 7 198 695 46 514 2.59e-74 251
MsG0380016428.01.T02 AT1G56570 25.408 551 355 11 58 598 14 518 1.34e-55 201
MsG0380016428.01.T02 AT5G27110 27.962 633 417 8 67 693 9 608 3.93e-74 253
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MsG0380016428.01.T02 AT3G22150 25.503 447 281 13 216 647 58 467 1.21e-30 129
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MsG0380016428.01.T02 AT3G57430 27.959 583 366 9 96 659 133 680 2.47e-73 254
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MsG0380016428.01.T02 AT3G57430 30.916 262 172 7 363 618 65 323 3.86e-28 121
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MsG0380016428.01.T02 AT4G38010 29.836 305 201 4 52 355 106 398 1.03e-39 154
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MsG0380016428.01.T02 AT2G40720 28.316 392 247 8 232 616 28 392 1.05e-39 157
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MsG0380016428.01.T02 AT3G23330 27.446 368 237 4 112 479 192 529 8.51e-42 162
MsG0380016428.01.T02 AT3G23330 32.301 226 152 1 93 317 274 499 9.81e-32 132
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MsG0380016428.01.T02 AT5G52850 28.698 338 207 4 282 618 42 346 1.81e-39 156
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MsG0380016428.01.T02 AT5G03800 27.288 612 430 7 92 691 110 718 3.79e-70 246
MsG0380016428.01.T02 AT5G03800 24.397 373 205 10 284 613 92 430 1.41e-19 94.4
MsG0380016428.01.T02 AT1G71460 28.053 606 391 11 57 653 107 676 5.39e-70 242
MsG0380016428.01.T02 AT1G71460 25.819 519 347 8 134 647 83 568 1.29e-53 196
MsG0380016428.01.T02 AT1G71420 29.181 562 343 13 146 694 45 564 6.88e-70 243
MsG0380016428.01.T02 AT1G71420 26.748 572 358 18 23 576 20 548 2.31e-49 185
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MsG0380016428.01.T02 AT4G19191 25.280 447 281 5 217 651 6 411 1.15e-36 146
MsG0380016428.01.T02 AT4G19191 25.670 448 283 9 41 475 130 540 3.00e-32 133
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MsG0380016428.01.T02 AT4G39952 25.113 665 424 10 71 695 34 664 6.71e-56 204
MsG0380016428.01.T02 AT4G39952 28.349 321 209 7 71 379 443 754 1.50e-25 113
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MsG0380016428.01.T02 AT3G50420 24.433 573 382 9 97 654 23 559 9.62e-51 189
MsG0380016428.01.T02 AT2G34400 31.447 477 290 6 203 677 71 512 9.03e-69 237
MsG0380016428.01.T02 AT2G34400 25.992 504 333 6 76 577 49 514 7.33e-50 184
MsG0380016428.01.T02 AT2G34400 31.633 294 201 0 64 357 135 428 5.31e-46 174
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MsG0380016428.01.T02 AT4G18840 29.151 518 291 6 182 694 56 502 3.10e-68 233
MsG0380016428.01.T02 AT4G18840 25.700 393 221 5 115 506 93 415 3.28e-35 141
MsG0380016428.01.T02 AT4G18840 32.620 187 125 1 100 285 241 427 8.28e-25 109
MsG0380016428.01.T02 AT4G18840 29.151 518 291 6 182 694 56 502 3.10e-68 233
MsG0380016428.01.T02 AT4G18840 25.700 393 221 5 115 506 93 415 3.28e-35 141
MsG0380016428.01.T02 AT4G18840 32.620 187 125 1 100 285 241 427 8.28e-25 109
MsG0380016428.01.T02 AT3G20730 29.344 518 327 7 184 695 35 519 4.33e-68 234
MsG0380016428.01.T02 AT3G20730 29.522 481 302 6 98 572 50 499 1.55e-64 224
MsG0380016428.01.T02 AT3G20730 26.804 388 250 7 266 651 16 371 4.22e-33 135
MsG0380016428.01.T02 AT3G20730 26.441 295 215 2 64 356 117 411 3.07e-32 132
MsG0380016428.01.T02 AT3G20730 25.000 208 146 5 65 264 321 526 1.50e-12 71.2
MsG0380016428.01.T02 AT3G29230 28.083 527 325 8 169 687 26 506 4.34e-68 234
MsG0380016428.01.T02 AT3G29230 24.478 527 326 12 74 580 27 501 5.46e-44 167
MsG0380016428.01.T02 AT3G29230 26.000 350 188 8 100 412 220 535 3.26e-25 111
MsG0380016428.01.T02 AT3G29230 25.664 226 146 7 97 303 351 573 4.49e-13 72.8
MsG0380016428.01.T02 AT3G49142 29.490 529 306 9 168 694 44 507 1.07e-67 235
MsG0380016428.01.T02 AT3G49142 24.494 445 270 8 61 504 140 519 8.84e-35 141
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MsG0380016428.01.T02 AT2G21090 28.480 467 298 6 145 576 29 494 7.25e-58 206
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MsG0380016428.01.T02 AT3G58590 26.942 605 372 7 106 677 159 726 4.02e-67 235
MsG0380016428.01.T02 AT3G58590 28.889 495 340 8 84 572 236 724 1.92e-58 211
MsG0380016428.01.T02 AT3G58590 27.210 577 337 14 71 607 22 555 3.77e-57 207
MsG0380016428.01.T02 AT3G58590 25.078 319 233 5 335 651 55 369 9.99e-21 97.8
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MsG0380016428.01.T02 AT5G65570 31.894 301 201 2 57 355 162 460 3.94e-41 160
MsG0380016428.01.T02 AT5G65570 25.407 307 228 1 45 351 252 557 1.38e-30 128
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MsG0380016428.01.T02 AT4G14820 27.875 287 174 4 84 369 268 522 1.67e-31 131
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MsG0380016428.01.T02 AT1G20230 27.113 284 162 6 86 367 324 564 4.21e-22 102
MsG0380016428.01.T02 AT3G22690 26.415 530 351 9 75 598 146 642 2.59e-66 234
MsG0380016428.01.T02 AT3G22690 29.423 537 306 8 130 626 102 605 1.88e-62 223
MsG0380016428.01.T02 AT3G22690 28.358 469 291 8 167 629 37 466 3.58e-50 188
MsG0380016428.01.T02 AT3G22690 27.368 190 131 4 465 650 102 288 3.09e-15 80.1
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MsG0380016428.01.T02 AT5G55740 26.783 575 348 10 41 607 47 556 5.86e-64 228
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MsG0380016428.01.T02 AT5G55740 26.073 303 174 5 75 362 389 656 3.09e-25 112
MsG0380016428.01.T02 AT5G55740 24.516 310 210 9 94 386 474 776 1.19e-17 88.2
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MsG0380016428.01.T02 AT3G25060 24.364 275 176 7 96 369 252 495 3.36e-19 92.4
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MsG0380016428.01.T02 AT1G69350 24.535 269 200 3 71 338 415 681 4.14e-21 99.0
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MsG0380016428.01.T02 AT3G26782 27.686 484 287 11 122 584 36 477 2.01e-46 175
MsG0380016428.01.T02 AT3G26782 29.648 398 231 8 96 479 111 473 5.05e-44 168
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MsG0380016428.01.T02 AT3G14730 30.653 199 134 1 88 282 289 487 6.72e-22 101
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MsG0380016428.01.T02 AT1G71490 24.736 473 278 9 83 518 74 505 2.80e-37 149
MsG0380016428.01.T02 AT3G50420 26.799 653 411 12 51 695 84 677 4.79e-63 224
MsG0380016428.01.T02 AT3G50420 24.316 621 410 11 97 693 23 607 7.21e-52 192
MsG0380016428.01.T02 AT1G31430 28.346 508 297 8 223 695 6 481 9.03e-63 219
MsG0380016428.01.T02 AT1G31430 28.935 432 294 10 130 554 14 439 1.54e-54 197
MsG0380016428.01.T02 AT1G31430 28.743 334 198 4 54 355 46 371 2.02e-38 150
MsG0380016428.01.T02 AT1G31430 27.602 221 159 1 105 324 222 442 8.59e-23 103
MsG0380016428.01.T02 AT1G31430 28.346 508 297 8 223 695 6 481 9.03e-63 219
MsG0380016428.01.T02 AT1G31430 28.935 432 294 10 130 554 14 439 1.54e-54 197
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MsG0380016428.01.T02 AT1G31430 27.602 221 159 1 105 324 222 442 8.59e-23 103
MsG0380016428.01.T02 AT3G24000 29.204 452 281 6 250 695 42 460 1.08e-62 221
MsG0380016428.01.T02 AT3G24000 28.103 427 268 4 57 479 56 447 8.76e-51 187
MsG0380016428.01.T02 AT3G24000 27.368 285 195 4 103 379 203 483 4.83e-30 126
MsG0380016428.01.T02 AT1G09410 25.944 609 360 9 89 695 12 531 1.29e-62 222
MsG0380016428.01.T02 AT4G32430 27.256 543 349 6 153 689 33 535 6.15e-62 218
MsG0380016428.01.T02 AT4G32430 26.061 495 308 8 39 524 26 471 6.24e-55 199
MsG0380016428.01.T02 AT4G32430 28.509 228 159 3 100 324 279 505 2.27e-24 108
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MsG0380016428.01.T02 AT1G22830 23.786 597 358 13 16 554 27 584 1.40e-39 155
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MsG0380016428.01.T02 AT1G17630 26.059 307 187 2 65 331 298 604 1.42e-27 119
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MsG0380016428.01.T02 AT3G49710 26.257 179 124 4 84 254 366 544 7.66e-12 69.3
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MsG0380016428.01.T02 AT1G53600 26.677 626 350 12 103 695 88 637 4.37e-57 207
MsG0380016428.01.T02 AT2G37310 28.145 469 317 8 63 518 28 489 5.84e-56 202
MsG0380016428.01.T02 AT2G37310 24.820 556 342 8 183 695 43 565 1.68e-49 184
MsG0380016428.01.T02 AT2G37310 23.209 349 230 5 68 379 241 588 9.06e-22 100
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MsG0380016428.01.T02 AT1G62260 25.977 435 248 7 97 507 137 521 6.98e-38 150
MsG0380016428.01.T02 AT1G62260 26.923 182 127 4 86 261 433 614 2.35e-11 67.4
MsG0380016428.01.T02 AT3G05340 26.506 498 332 5 197 693 90 554 1.93e-55 201
MsG0380016428.01.T02 AT3G05340 29.193 483 299 11 100 576 94 539 1.88e-51 190
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MsG0380016428.01.T02 AT1G06143 23.747 379 218 6 98 475 161 469 5.69e-30 125
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MsG0380016428.01.T02 AT2G02980 25.185 135 99 2 103 235 272 406 3.11e-11 67.0
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MsG0380016428.01.T02 AT1G28690 24.681 470 279 9 70 497 44 480 1.58e-34 139
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MsG0380016428.01.T02 AT5G40410 25.208 361 232 5 160 517 32 357 2.57e-25 111
MsG0380016428.01.T02 AT5G40410 25.490 306 174 10 422 685 63 356 1.40e-14 77.8
MsG0380016428.01.T02 AT2G42920 27.948 458 260 10 273 695 35 457 1.03e-49 183
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MsG0380016428.01.T02 AT2G42920 26.166 386 236 7 107 450 69 447 3.89e-34 138
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MsG0380016428.01.T02 AT5G40405 27.851 377 258 9 215 584 58 427 1.12e-37 149
MsG0380016428.01.T02 AT5G40405 28.269 283 171 5 94 375 172 423 1.45e-26 115
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MsG0380016428.01.T02 AT1G77170 29.386 228 159 1 130 355 85 312 5.98e-33 133
MsG0380016428.01.T02 AT1G77170 24.279 416 252 12 203 601 50 419 5.04e-25 109
MsG0380016428.01.T02 AT1G77170 27.485 171 100 3 90 247 249 408 6.28e-13 72.0
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MsG0380016428.01.T02 AT5G42450 26.706 337 236 6 180 506 6 341 3.80e-34 137
MsG0380016428.01.T02 AT5G42450 29.391 279 162 4 112 355 43 321 1.76e-29 123
MsG0380016428.01.T02 AT5G42450 26.667 285 175 7 91 369 154 410 2.52e-22 101
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MsG0380016428.01.T02 AT5G15340 29.282 362 227 7 168 509 12 364 4.05e-41 159
MsG0380016428.01.T02 AT5G15340 26.362 459 257 12 67 479 12 435 4.16e-39 153
MsG0380016428.01.T02 AT5G06540 26.591 440 307 8 167 596 17 450 2.15e-43 166
MsG0380016428.01.T02 AT5G06540 26.984 378 239 6 348 689 70 446 2.96e-42 162
MsG0380016428.01.T02 AT5G06540 28.571 287 175 2 105 391 192 448 1.02e-30 128
MsG0380016428.01.T02 AT5G06540 23.953 430 262 6 115 510 70 468 1.77e-28 121
MsG0380016428.01.T02 AT5G66520 26.555 418 294 5 280 689 28 440 2.74e-43 166
MsG0380016428.01.T02 AT5G66520 29.248 359 240 5 167 518 19 370 1.69e-41 160
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MsG0380016428.01.T02 AT5G66520 26.568 271 168 3 100 369 185 425 3.29e-26 114
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MsG0380016428.01.T02 AT2G37320 24.451 319 206 4 257 572 114 400 5.37e-26 112
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MsG0380016428.01.T02 AT3G51320 26.780 295 205 4 39 330 133 419 4.67e-25 110
MsG0380016428.01.T02 AT3G51320 22.034 295 191 3 131 388 87 379 6.05e-20 94.4
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MsG0380016428.01.T02 AT5G50990 24.629 337 218 6 93 427 95 397 2.19e-24 108
MsG0380016428.01.T02 AT5G50990 24.199 281 176 6 203 479 104 351 7.10e-20 94.4
MsG0380016428.01.T02 AT5G50990 26.971 241 167 7 335 569 104 341 1.43e-18 90.1
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MsG0380016428.01.T02 AT1G34160 28.270 237 162 4 103 336 104 335 9.02e-27 115
MsG0380016428.01.T02 AT1G34160 31.156 199 130 3 159 355 59 252 4.19e-25 110
MsG0380016428.01.T02 AT1G34160 30.270 185 121 4 324 506 93 271 1.60e-19 93.2
MsG0380016428.01.T02 AT1G31790 26.935 323 224 5 55 367 82 402 4.03e-33 132
MsG0380016428.01.T02 AT1G31790 26.953 256 177 7 349 595 143 397 4.24e-16 81.6
MsG0380016428.01.T02 AT1G31790 24.164 269 186 7 410 666 103 365 4.99e-11 65.9
MsG0380016428.01.T02 AT4G16470 28.223 287 204 2 410 695 123 408 5.81e-33 134
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MsG0380016428.01.T02 AT1G64100 23.744 577 384 16 111 658 86 635 2.40e-31 130
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MsG0380016428.01.T02 AT4G19440 23.191 539 382 13 146 659 223 754 8.36e-27 117
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MsG0380016428.01.T02 AT1G62670 22.098 448 302 9 246 678 64 479 2.28e-14 77.0
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MsG0380016428.01.T02 AT1G63330 20.751 506 373 9 130 611 13 514 4.26e-22 101
MsG0380016428.01.T02 AT1G63330 21.944 319 234 6 359 666 79 393 1.30e-11 68.2
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MsG0380016428.01.T02 AT1G05670 20.384 417 297 8 129 527 283 682 1.47e-21 100
MsG0380016428.01.T02 AT1G05670 20.624 417 315 5 226 626 279 695 2.94e-19 93.2
MsG0380016428.01.T02 AT1G05670 20.384 417 297 8 129 527 283 682 1.47e-21 100
MsG0380016428.01.T02 AT1G05670 20.624 417 315 5 226 626 279 695 2.94e-19 93.2
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MsG0380016428.01.T02 AT3G09060 21.333 675 459 18 34 640 11 681 5.29e-21 98.6
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MsG0380016428.01.T02 AT1G64580 18.681 455 315 8 109 543 57 476 2.97e-12 70.1
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MsG0380016428.01.T02 AT3G16710 21.914 397 289 8 223 601 114 507 4.01e-14 75.9
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MsG0380016428.01.T02 AT1G63080 21.186 354 257 7 56 391 168 517 3.27e-19 92.4
MsG0380016428.01.T02 AT1G63080 21.142 473 312 12 57 505 94 529 7.99e-15 78.6
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MsG0380016428.01.T02 AT3G06920 21.429 350 219 9 62 359 501 846 7.47e-14 75.9
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MsG0380016428.01.T02 AT5G41170 23.466 277 197 5 94 355 245 521 2.72e-12 70.1
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MsG0380016428.01.T02 AT1G74750 24.221 289 200 8 240 511 368 654 2.66e-11 67.8
MsG0380016428.01.T02 AT1G74750 22.826 276 201 4 124 387 356 631 2.82e-14 77.0
MsG0380016428.01.T02 AT1G74750 24.221 289 200 8 240 511 368 654 2.66e-11 67.8
MsG0380016428.01.T02 AT1G74750 22.826 276 201 4 124 387 356 631 2.82e-14 77.0
MsG0380016428.01.T02 AT1G74750 24.221 289 200 8 240 511 368 654 2.66e-11 67.8
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MsG0380016428.01.T02 AT3G23020 20.455 528 379 14 202 695 227 747 5.66e-14 76.3
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MsG0380016428.01.T02 AT5G14770 20.375 373 285 4 87 450 122 491 6.32e-14 76.3
MsG0380016428.01.T02 AT5G14770 19.890 543 359 11 129 659 298 776 6.27e-14 76.3
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MsG0380016428.01.T02 AT5G14770 19.890 543 359 11 129 659 298 776 6.27e-14 76.3
MsG0380016428.01.T02 AT5G14770 20.375 373 285 4 87 450 122 491 6.32e-14 76.3
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MsG0380016428.01.T02 AT5G14770 20.375 373 285 4 87 450 122 491 6.32e-14 76.3
MsG0380016428.01.T02 AT1G74580 19.869 609 422 14 94 673 109 680 7.65e-14 75.9
MsG0380016428.01.T02 AT1G74580 19.869 609 422 14 94 673 109 680 7.65e-14 75.9
MsG0380016428.01.T02 AT1G74580 19.869 609 422 14 94 673 109 680 7.65e-14 75.9
MsG0380016428.01.T02 AT2G19280 19.872 468 352 8 159 606 198 662 1.65e-13 74.7
MsG0380016428.01.T02 AT2G19280 19.872 468 352 8 159 606 198 662 1.65e-13 74.7
MsG0380016428.01.T02 AT2G19280 19.872 468 352 8 159 606 198 662 1.65e-13 74.7
MsG0380016428.01.T02 AT2G19280 19.872 468 352 8 159 606 198 662 1.65e-13 74.7
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MsG0380016428.01.T02 AT1G09820 21.429 280 196 6 114 372 206 482 4.34e-13 73.2
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MsG0380016428.01.T02 AT1G06580 25.163 306 205 8 129 417 10 308 5.27e-13 72.0
MsG0380016428.01.T02 AT1G06580 17.043 487 295 9 157 631 3 392 1.73e-12 70.1
MsG0380016428.01.T02 AT3G16890 23.153 203 146 3 129 324 298 497 7.48e-13 72.0
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MsG0380016428.01.T02 AT3G16890 23.153 203 146 3 129 324 427 626 1.12e-12 71.6
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MsG0380016428.01.T02 AT2G06000 21.875 352 251 8 100 431 175 522 1.41e-12 71.2
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MsG0380016428.01.T02 AT1G18900 22.420 281 179 5 117 387 385 636 1.41e-11 68.6
MsG0380016428.01.T02 AT1G18900 22.420 281 179 5 117 387 385 636 1.41e-11 68.6
MsG0380016428.01.T02 AT4G16390 19.706 340 250 7 96 415 175 511 2.01e-11 67.8
MsG0380016428.01.T02 AT1G79540 21.875 480 325 11 126 585 126 575 2.12e-11 67.8
MsG0380016428.01.T02 AT1G53330 19.792 288 219 4 108 383 26 313 2.15e-11 66.6
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MsG0380016428.01.T02 AT5G57250 19.700 533 359 14 106 612 144 633 3.32e-11 67.4
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MsG0380016428.01.T02 AT5G25630 22.074 299 211 7 93 370 96 393 5.20e-11 66.2
MsG0380016428.01.T02 AT5G25630 22.074 299 211 7 93 370 147 444 6.51e-11 65.9
MsG0380016428.01.T02 AT1G52620 23.077 442 312 13 246 666 119 553 7.48e-11 66.2
MsG0380016428.01.T02 AT3G49730 19.749 319 244 4 56 362 162 480 7.50e-11 65.9

Find 186 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 211 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
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GGTTTCTTGGAATGCTTTAT+TGG 0.182488 3:+83288494 MsG0380016428.01.T01:CDS
TGGGCTGCGGCGATGGATTT+TGG 0.202232 3:-83287328 None:intergenic
CATGGGCTTGTGGTGAAATT+TGG 0.211193 3:+83287661 MsG0380016428.01.T01:CDS
GATATACCCGATTCTTTAAA+TGG 0.216211 3:+83288214 MsG0380016428.01.T01:CDS
AATGTGGAATACCTTAATTT+TGG 0.236991 3:+83288797 MsG0380016428.01.T01:CDS
CGATTACCCATTCGTTCTTA+TGG 0.243562 3:+83287079 MsG0380016428.01.T01:CDS
AAATGTGTCTGCTGGCCTTT+TGG 0.249634 3:+83288314 MsG0380016428.01.T01:CDS
ACTCCCCAAGACTGGGAAAA+TGG 0.260342 3:+83289144 MsG0380016428.01.T01:CDS
TATTTGCACATGCTGCTAAA+AGG 0.264481 3:-83288611 None:intergenic
TGGGATGTTGTCACAATCAT+AGG 0.266239 3:+83288817 MsG0380016428.01.T01:CDS
TTCTGAAAGGGGCGGTTTCT+AGG 0.271647 3:+83288766 MsG0380016428.01.T01:CDS
CTAAGTGGAACTCGACTTTA+TGG 0.275212 3:-83287348 None:intergenic
ATCACATTTGCCAGTGTTCT+TGG 0.285493 3:+83287595 MsG0380016428.01.T01:CDS
GGTTTAACCTGATGAGTAAT+TGG 0.292125 3:+83288463 MsG0380016428.01.T01:CDS
AAACCAAGCAAGTATACTTT+TGG 0.294834 3:+83288585 MsG0380016428.01.T01:CDS
TTTGTTTCTTTCGATGAATA+AGG 0.300672 3:+83287552 MsG0380016428.01.T01:CDS
GGGTGGATGGCGGTGGTTCG+TGG 0.307214 3:-83287143 None:intergenic
GTGACAACATCCCAAAATTA+AGG 0.309015 3:-83288808 None:intergenic
TCATGGGGTTGTTGTGAAAC+AGG 0.325489 3:+83287963 MsG0380016428.01.T01:CDS
TCTTTGTCGCAGCAGATTCA+TGG 0.326914 3:+83287643 MsG0380016428.01.T01:CDS
TTATGCTAAATGTGGGATTA+TGG 0.332769 3:+83287726 MsG0380016428.01.T01:CDS
ATGGCGGTGGTTCGTGGTGG+GGG 0.344125 3:-83287137 None:intergenic
ACATTCCAAGTAACGGCATT+TGG 0.345349 3:-83287784 None:intergenic
CTCGTCCAAATGCCGTTACT+TGG 0.345432 3:+83287779 MsG0380016428.01.T01:CDS
TGGTTTCCACTCGAACCTTA+TGG 0.347083 3:+83288380 MsG0380016428.01.T01:CDS
GATGGCGGTGGTTCGTGGTG+GGG 0.355972 3:-83287138 None:intergenic
AGAGAGTGAGGGACGGGTAG+TGG 0.358141 3:-83287274 None:intergenic
CCCTCAAAGGTCACACGGTC+TGG 0.360797 3:-83288891 None:intergenic
CTGCCTCGGTTGGAGCATTA+TGG 0.361503 3:+83288996 MsG0380016428.01.T01:CDS
GCACGGTTGCGGAGGAATAT+AGG 0.365322 3:-83287391 None:intergenic
ATTGGCGTGACAGGGTTTCT+TGG 0.372474 3:+83288481 MsG0380016428.01.T01:CDS
GACTTTATGGGCTGCGGCGA+TGG 0.376017 3:-83287335 None:intergenic
TTAGACAGTTGAGGATTGAT+TGG 0.382320 3:-83287207 None:intergenic
CGCCTCGGCAAGCAAATTCA+TGG 0.384058 3:+83288645 MsG0380016428.01.T01:CDS
CGGTGATGGTGGTGGGTGGA+TGG 0.385961 3:-83287156 None:intergenic
ATGCAATGAGTGGGAAAACT+TGG 0.387329 3:+83288124 MsG0380016428.01.T01:CDS
CATAAGAACGAATGGGTAAT+CGG 0.393067 3:-83287078 None:intergenic
CTTCTTGCTTGTGTTGAAGA+AGG 0.395814 3:+83288918 MsG0380016428.01.T01:CDS
ACTTGAACAGTGCCCGAGTT+TGG 0.397563 3:+83288442 MsG0380016428.01.T01:CDS
CCTCAGACCATTTAAAGAAT+CGG 0.402409 3:-83288221 None:intergenic
GGTGGTGACGGTGATGGTGG+TGG 0.402502 3:-83287164 None:intergenic
TGGATGGCGGTGGTTCGTGG+TGG 0.403010 3:-83287140 None:intergenic
TGTTGGACTTGCATTGTGTC+AGG 0.403165 3:+83288099 MsG0380016428.01.T01:CDS
GGATGGCGGTGGTTCGTGGT+GGG 0.404726 3:-83287139 None:intergenic
ACTGGCAAATGTGATGTTAT+TGG 0.407356 3:-83287587 None:intergenic
AACAAAGAAATAGCTTCATC+TGG 0.407665 3:-83287535 None:intergenic
GTATTTCAAGTGTGGTGAAT+TGG 0.408169 3:+83288029 MsG0380016428.01.T01:CDS
GAAGAAGGCCTTGTTGAGTT+TGG 0.409769 3:+83288933 MsG0380016428.01.T01:CDS
ATCCTCAACTGTCTAAAATC+TGG 0.410453 3:+83287214 MsG0380016428.01.T01:CDS
CCAGACCGTGTGACCTTTGA+GGG 0.412740 3:+83288891 MsG0380016428.01.T01:CDS
TGATGAGTAATTGGCGTGAC+AGG 0.413610 3:+83288472 MsG0380016428.01.T01:CDS
GGCGGTGGTGACGGTGATGG+TGG 0.414868 3:-83287167 None:intergenic
TTACTTGGAATGTTATTGTA+AGG 0.420026 3:+83287794 MsG0380016428.01.T01:CDS
TCTCTAGCAATGTGATAATT+GGG 0.420679 3:+83287686 MsG0380016428.01.T01:CDS
GAGGAGGGGATGCAAATTCA+TGG 0.425986 3:+83287946 MsG0380016428.01.T01:CDS
ATCCTGGGTGGCGGTGGTGA+CGG 0.435192 3:-83287176 None:intergenic
TCACATTTGCCAGTGTTCTT+GGG 0.436373 3:+83287596 MsG0380016428.01.T01:CDS
TTGATTGGATTACTTCATCC+TGG 0.436595 3:-83287192 None:intergenic
GAGAGTGAGGGACGGGTAGT+GGG 0.436769 3:-83287273 None:intergenic
CTCAGACCATTTAAAGAATC+GGG 0.439698 3:-83288220 None:intergenic
TACTTCATCCTGGGTGGCGG+TGG 0.442987 3:-83287182 None:intergenic
GACTTGGACCATGTCACTCT+TGG 0.443290 3:+83288282 MsG0380016428.01.T01:CDS
TTCAGATAGATAGTGTAATC+AGG 0.444992 3:+83288688 MsG0380016428.01.T01:CDS
TGATGGTGGTGGGTGGATGG+CGG 0.449039 3:-83287153 None:intergenic
GAAATGGGGAAACAGCTTCA+TGG 0.452614 3:+83288342 MsG0380016428.01.T01:CDS
AAGCTTCAAGCGCACGGTTG+CGG 0.454398 3:-83287402 None:intergenic
CTTTGTCGCAGCAGATTCAT+GGG 0.458780 3:+83287644 MsG0380016428.01.T01:CDS
TTTGTTCGCTTGAATAATGA+AGG 0.459995 3:-83288527 None:intergenic
AAGTGCACGCATACTAGAAC+AGG 0.462895 3:-83287923 None:intergenic
ATTTGCACATGCTGCTAAAA+GGG 0.463046 3:-83288610 None:intergenic
GGTGGCGGTGGTGACGGTGA+TGG 0.465188 3:-83287170 None:intergenic
GTGACGGTGATGGTGGTGGG+TGG 0.467733 3:-83287160 None:intergenic
TGGTGGTGGGTGGATGGCGG+TGG 0.469103 3:-83287150 None:intergenic
TTCTAGTATGCGTGCACTTG+AGG 0.469540 3:+83287927 MsG0380016428.01.T01:CDS
GTTCCAAAAGTATACTTGCT+TGG 0.473176 3:-83288588 None:intergenic
TCTGAAAGGGGCGGTTTCTA+GGG 0.479502 3:+83288767 MsG0380016428.01.T01:CDS
GTGGTGACGGTGATGGTGGT+GGG 0.482333 3:-83287163 None:intergenic
GTGAATTGGAGAATGGTTCT+CGG 0.482701 3:+83288043 MsG0380016428.01.T01:CDS
TGATTGGATTACTTCATCCT+GGG 0.483477 3:-83287191 None:intergenic
GGGATGTTGTCACAATCATA+GGG 0.489003 3:+83288818 MsG0380016428.01.T01:CDS
TAAGTGGAACTCGACTTTAT+GGG 0.489570 3:-83287347 None:intergenic
CTATAGTCGGCATGGATACA+TGG 0.490759 3:+83289034 MsG0380016428.01.T01:CDS
CATAATGCTCCAACCGAGGC+AGG 0.492575 3:-83288995 None:intergenic
CATGGATTTGTCTATCGACA+TGG 0.494500 3:+83288360 MsG0380016428.01.T01:CDS
TCGTGGAATGCTATGTTGGC+TGG 0.502391 3:+83288192 MsG0380016428.01.T01:CDS
TCCCCATTTCATGATCCAAA+AGG 0.503198 3:-83288329 None:intergenic
GCCAGACCGTGTGACCTTTG+AGG 0.503809 3:+83288890 MsG0380016428.01.T01:CDS
TGTCACGCCAATTACTCATC+AGG 0.509743 3:-83288470 None:intergenic
CAAGTAACGGCATTTGGACG+AGG 0.510255 3:-83287778 None:intergenic
GTTCGAAAGATTTAGTGTGT+TGG 0.511089 3:+83288082 MsG0380016428.01.T01:CDS
GAATGGCATTGCCAACCATA+AGG 0.513007 3:-83288395 None:intergenic
TGAATTGGAGAATGGTTCTC+GGG 0.515344 3:+83288044 MsG0380016428.01.T01:CDS
AGCGACAGTGACGGAAGAAG+TGG 0.519877 3:-83287303 None:intergenic
AAGTGTGGTGAATTGGAGAA+TGG 0.522289 3:+83288036 MsG0380016428.01.T01:CDS
GATTACTTCATCCTGGGTGG+CGG 0.525620 3:-83287185 None:intergenic
CACGATATCACATTTCGTAC+AGG 0.525821 3:-83288174 None:intergenic
TAGTGGGAAGTCGAAGAGAA+TGG 0.526746 3:-83287257 None:intergenic
CTCCTCTCTTCACGATGCAC+AGG 0.527564 3:+83287435 MsG0380016428.01.T01:CDS
TTTGATGCTTGACACTGTAA+AGG 0.529196 3:+83288260 MsG0380016428.01.T01:CDS
CATGGATTTATCATTAGACA+TGG 0.531339 3:+83288663 MsG0380016428.01.T01:CDS
TACAATAACATTCCAAGTAA+CGG 0.532261 3:-83287791 None:intergenic
CACCGTCACCACCGCCACCC+AGG 0.533497 3:+83287174 MsG0380016428.01.T01:CDS
AGGAGGGGATGCAAATTCAT+GGG 0.537158 3:+83287947 MsG0380016428.01.T01:CDS
GCGTAGAGAGAGTGAGGGAC+GGG 0.541639 3:-83287280 None:intergenic
ATCCATGAATTTGCTTGCCG+AGG 0.545332 3:-83288647 None:intergenic
AATGCTTTATTGGCTAGTTG+TGG 0.546965 3:+83288504 MsG0380016428.01.T01:CDS
ATCAAGGGCTCGTTCCAACA+TGG 0.547412 3:-83289105 None:intergenic
TTTACGGCCATAAGAACGAA+TGG 0.547565 3:-83287086 None:intergenic
AATGCCATTCTTGACATGTA+TGG 0.547830 3:+83288408 MsG0380016428.01.T01:CDS
GTTGATGTTTATGCTAAATG+TGG 0.548002 3:+83287718 MsG0380016428.01.T01:CDS
GAGTCTATGAGCAATGAATA+CGG 0.548618 3:+83288969 MsG0380016428.01.T01:CDS
TTACGGCCATAAGAACGAAT+GGG 0.548986 3:-83287085 None:intergenic
TGCGAGTGGTGGCGACTAAG+TGG 0.549254 3:-83287363 None:intergenic
ATGAATACGGTGTCCTGCCT+CGG 0.550806 3:+83288982 MsG0380016428.01.T01:CDS
AATACTTATTCGCTACGCCT+CGG 0.552790 3:+83288630 MsG0380016428.01.T01:CDS
TTAGAGAATGTAAAATTCAA+CGG 0.554074 3:-83287889 None:intergenic
ATACGGTGTCCTGCCTCGGT+TGG 0.556661 3:+83288986 MsG0380016428.01.T01:CDS
TTCCACTCGAACCTTATGGT+TGG 0.557503 3:+83288384 MsG0380016428.01.T01:CDS
TTTACCATACATGTCAAGAA+TGG 0.558686 3:-83288412 None:intergenic
ATGCTGTTGAGATTCTGAAA+GGG 0.559518 3:+83288754 MsG0380016428.01.T01:CDS
CTCAACGAGATGGTGGGTCA+TGG 0.559659 3:+83287476 MsG0380016428.01.T01:CDS
AAGTGGGCGTAGAGAGAGTG+AGG 0.559988 3:-83287286 None:intergenic
TTGATGATAAATGTGTCTGC+TGG 0.560044 3:+83288306 MsG0380016428.01.T01:CDS
TCATCAGGTTAAACCAAACT+CGG 0.561492 3:-83288455 None:intergenic
GCTTGACACTGTAAAGGACT+TGG 0.562175 3:+83288266 MsG0380016428.01.T01:CDS
ATCAATATGTATTTCAAGTG+TGG 0.563469 3:+83288021 MsG0380016428.01.T01:CDS
TTTCTTTCGATGAATAAGGA+TGG 0.565182 3:+83287556 MsG0380016428.01.T01:CDS
CTTCAAGCGCACGGTTGCGG+AGG 0.567161 3:-83287399 None:intergenic
ATTGAACTCTATAGTCGGCA+TGG 0.567430 3:+83289026 MsG0380016428.01.T01:CDS
TAGTATGCGTGCACTTGAGG+AGG 0.574826 3:+83287930 MsG0380016428.01.T01:CDS
CGTTCCAACATGGGAAGTGT+AGG 0.577535 3:-83289095 None:intergenic
TCGCATAAGCTTCAAGCGCA+CGG 0.577848 3:-83287408 None:intergenic
AGCAAGAAGAATGCCCTCAA+AGG 0.579038 3:-83288904 None:intergenic
GGATTATGGTTTATGCTCGC+AGG 0.579455 3:+83287740 MsG0380016428.01.T01:CDS
GTTGGACTTGCATTGTGTCA+GGG 0.582240 3:+83288100 MsG0380016428.01.T01:CDS
AGTATGCGTGCACTTGAGGA+GGG 0.584965 3:+83287931 MsG0380016428.01.T01:CDS
TGCAATGAGTGGGAAAACTT+GGG 0.587971 3:+83288125 MsG0380016428.01.T01:CDS
AGAGCCTACACTTCCCATGT+TGG 0.588999 3:+83289091 MsG0380016428.01.T01:CDS
CATGGGGTTGTTGTGAAACA+GGG 0.589245 3:+83287964 MsG0380016428.01.T01:CDS
TTTGGGATAATGGAAGCAGA+AGG 0.594360 3:+83288861 MsG0380016428.01.T01:CDS
CTTGGAATGTTATTGTAAGG+CGG 0.594632 3:+83287797 MsG0380016428.01.T01:CDS
TGCCAACCATAAGGTTCGAG+TGG 0.595175 3:-83288386 None:intergenic
CCGATTCTTTAAATGGTCTG+AGG 0.597075 3:+83288221 MsG0380016428.01.T01:CDS
TTGATGTTTATGCTAAATGT+GGG 0.597342 3:+83287719 MsG0380016428.01.T01:CDS
GATATCGTGGAATGCTATGT+TGG 0.597381 3:+83288188 MsG0380016428.01.T01:CDS
CTTGACATGTATGGTAAATG+TGG 0.597972 3:+83288417 MsG0380016428.01.T01:CDS
TTTCTAGGGACGTGATAATG+TGG 0.598791 3:+83288781 MsG0380016428.01.T01:CDS
GATGAGTAATTGGCGTGACA+GGG 0.598883 3:+83288473 MsG0380016428.01.T01:CDS
GTAAGGCGGTATCTTGATGT+TGG 0.600537 3:+83287811 MsG0380016428.01.T01:CDS
TTACTGCTTATTCTCGATTG+CGG 0.602721 3:+83287509 MsG0380016428.01.T01:CDS
TCAAGGGCTCGTTCCAACAT+GGG 0.604946 3:-83289104 None:intergenic
TGCTGTTGAGATTCTGAAAG+GGG 0.606407 3:+83288755 MsG0380016428.01.T01:CDS
AGCACACGACCCAAGAACAC+TGG 0.606828 3:-83287605 None:intergenic
GGCGTAGAGAGAGTGAGGGA+CGG 0.608627 3:-83287281 None:intergenic
TGTGAAACAGGGACTTCATG+AGG 0.609684 3:+83287975 MsG0380016428.01.T01:CDS
CAGCCATAATGCTCCAACCG+AGG 0.610910 3:-83288999 None:intergenic
GTATGCGTGCACTTGAGGAG+GGG 0.612768 3:+83287932 MsG0380016428.01.T01:CDS
GCATGATTGAACTCTATAGT+CGG 0.614772 3:+83289021 MsG0380016428.01.T01:CDS
GAAATGCCTCAACGAGATGG+TGG 0.617040 3:+83287469 MsG0380016428.01.T01:CDS
TTCCTGTGCATCGTGAAGAG+AGG 0.622154 3:-83287437 None:intergenic
TTGGATTACTTCATCCTGGG+TGG 0.626253 3:-83287188 None:intergenic
GAAGTCGAAGAGAATGGATG+CGG 0.627882 3:-83287251 None:intergenic
TCTTGATGTTGGTGATGCAA+AGG 0.633250 3:+83287822 MsG0380016428.01.T01:CDS
TATAGGTGGATTGCGAGTGG+TGG 0.638367 3:-83287374 None:intergenic
AAATGCCTCAACGAGATGGT+GGG 0.638391 3:+83287470 MsG0380016428.01.T01:CDS
GCGACAGTGACGGAAGAAGT+GGG 0.641365 3:-83287302 None:intergenic
GCAGCAGATTCATGGGCTTG+TGG 0.645436 3:+83287651 MsG0380016428.01.T01:CDS
GATGAAATGCCTCAACGAGA+TGG 0.646185 3:+83287466 MsG0380016428.01.T01:CDS
ATTGAGTGCCAAACTCAACA+AGG 0.647591 3:-83288941 None:intergenic
CATCAGGTTAAACCAAACTC+GGG 0.650008 3:-83288454 None:intergenic
GAATATAGGTGGATTGCGAG+TGG 0.655245 3:-83287377 None:intergenic
TATGCTGTTGAGATTCTGAA+AGG 0.660068 3:+83288753 MsG0380016428.01.T01:CDS
TCATCAAACCAAGAGTGACA+TGG 0.667102 3:-83288290 None:intergenic
CGGTTGCGGAGGAATATAGG+TGG 0.671321 3:-83287388 None:intergenic
GAATGCCCTCAAAGGTCACA+CGG 0.672875 3:-83288896 None:intergenic
TGTTGAGATTCTGAAAGGGG+CGG 0.673695 3:+83288758 MsG0380016428.01.T01:CDS
GTGTCAGGGTATGCAATGAG+TGG 0.677004 3:+83288114 MsG0380016428.01.T01:CDS
TGTCAGGGTATGCAATGAGT+GGG 0.678488 3:+83288115 MsG0380016428.01.T01:CDS
AGTGGGCGTAGAGAGAGTGA+GGG 0.681257 3:-83287285 None:intergenic
CTGTACGAAATGTGATATCG+TGG 0.682806 3:+83288175 MsG0380016428.01.T01:CDS
GGAGGGGATGCAAATTCATG+GGG 0.691497 3:+83287948 MsG0380016428.01.T01:CDS
GGATGTTGTCACAATCATAG+GGG 0.694034 3:+83288819 MsG0380016428.01.T01:CDS
CATGACCCACCATCTCGTTG+AGG 0.694768 3:-83287475 None:intergenic
GAACTCGACTTTATGGGCTG+CGG 0.699157 3:-83287341 None:intergenic
TTGACATGTATGGTAAATGT+GGG 0.706642 3:+83288418 MsG0380016428.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! TTAGAGAATGTAAAATTCAA+CGG - Chr3:83287892-83287911 None:intergenic 20.0%
! TACAATAACATTCCAAGTAA+CGG - Chr3:83287794-83287813 None:intergenic 25.0%
! TTACTTGGAATGTTATTGTA+AGG + Chr3:83287794-83287813 MsG0380016428.01.T01:CDS 25.0%
! TTGATGTTTATGCTAAATGT+GGG + Chr3:83287719-83287738 MsG0380016428.01.T01:CDS 25.0%
!! AATGTGGAATACCTTAATTT+TGG + Chr3:83288797-83288816 MsG0380016428.01.T01:CDS 25.0%
!! ATCAATATGTATTTCAAGTG+TGG + Chr3:83288021-83288040 MsG0380016428.01.T01:CDS 25.0%
!! ATGTGGAATACCTTAATTTT+GGG + Chr3:83288798-83288817 MsG0380016428.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTGTTTCTTTCGATGAATA+AGG + Chr3:83287552-83287571 MsG0380016428.01.T01:CDS 25.0%
AACAAAGAAATAGCTTCATC+TGG - Chr3:83287538-83287557 None:intergenic 30.0%
CATGGATTTATCATTAGACA+TGG + Chr3:83288663-83288682 MsG0380016428.01.T01:CDS 30.0%
GATATACCCGATTCTTTAAA+TGG + Chr3:83288214-83288233 MsG0380016428.01.T01:CDS 30.0%
GTTGATGTTTATGCTAAATG+TGG + Chr3:83287718-83287737 MsG0380016428.01.T01:CDS 30.0%
TCTCTAGCAATGTGATAATT+GGG + Chr3:83287686-83287705 MsG0380016428.01.T01:CDS 30.0%
TTATGCTAAATGTGGGATTA+TGG + Chr3:83287726-83287745 MsG0380016428.01.T01:CDS 30.0%
TTCAGATAGATAGTGTAATC+AGG + Chr3:83288688-83288707 MsG0380016428.01.T01:CDS 30.0%
TTCTCTAGCAATGTGATAAT+TGG + Chr3:83287685-83287704 MsG0380016428.01.T01:CDS 30.0%
TTGACATGTATGGTAAATGT+GGG + Chr3:83288418-83288437 MsG0380016428.01.T01:CDS 30.0%
TTTACCATACATGTCAAGAA+TGG - Chr3:83288415-83288434 None:intergenic 30.0%
TTTCTTTCGATGAATAAGGA+TGG + Chr3:83287556-83287575 MsG0380016428.01.T01:CDS 30.0%
TTTGTTCGCTTGAATAATGA+AGG - Chr3:83288530-83288549 None:intergenic 30.0%
! AAACCAAGCAAGTATACTTT+TGG + Chr3:83288585-83288604 MsG0380016428.01.T01:CDS 30.0%
! AATGTTTTCAGAGATGCAAT+GGG + Chr3:83288557-83288576 MsG0380016428.01.T01:CDS 30.0%
! ATTTTTCTGACAAGCATCAA+GGG - Chr3:83289123-83289142 None:intergenic 30.0%
!!! ACTTGAACTTTTTGGGATAA+TGG + Chr3:83288851-83288870 MsG0380016428.01.T01:CDS 30.0%
AATGCCATTCTTGACATGTA+TGG + Chr3:83288408-83288427 MsG0380016428.01.T01:CDS 35.0%
ACTGGCAAATGTGATGTTAT+TGG - Chr3:83287590-83287609 None:intergenic 35.0%
ATTTGCACATGCTGCTAAAA+GGG - Chr3:83288613-83288632 None:intergenic 35.0%
CATAAGAACGAATGGGTAAT+CGG - Chr3:83287081-83287100 None:intergenic 35.0%
CCTCAGACCATTTAAAGAAT+CGG - Chr3:83288224-83288243 None:intergenic 35.0%
CTCAGACCATTTAAAGAATC+GGG - Chr3:83288223-83288242 None:intergenic 35.0%
CTTGACATGTATGGTAAATG+TGG + Chr3:83288417-83288436 MsG0380016428.01.T01:CDS 35.0%
CTTGGAATGTTATTGTAAGG+CGG + Chr3:83287797-83287816 MsG0380016428.01.T01:CDS 35.0%
GAGTCTATGAGCAATGAATA+CGG + Chr3:83288969-83288988 MsG0380016428.01.T01:CDS 35.0%
GCATGATTGAACTCTATAGT+CGG + Chr3:83289021-83289040 MsG0380016428.01.T01:CDS 35.0%
GGTTTAACCTGATGAGTAAT+TGG + Chr3:83288463-83288482 MsG0380016428.01.T01:CDS 35.0%
GGTTTCTTGGAATGCTTTAT+TGG + Chr3:83288494-83288513 MsG0380016428.01.T01:CDS 35.0%
GTGACAACATCCCAAAATTA+AGG - Chr3:83288811-83288830 None:intergenic 35.0%
GTTCGAAAGATTTAGTGTGT+TGG + Chr3:83288082-83288101 MsG0380016428.01.T01:CDS 35.0%
TAAGTGGAACTCGACTTTAT+GGG - Chr3:83287350-83287369 None:intergenic 35.0%
TATGCTGTTGAGATTCTGAA+AGG + Chr3:83288753-83288772 MsG0380016428.01.T01:CDS 35.0%
TATTTGCACATGCTGCTAAA+AGG - Chr3:83288614-83288633 None:intergenic 35.0%
TCATCAGGTTAAACCAAACT+CGG - Chr3:83288458-83288477 None:intergenic 35.0%
TGATTGGATTACTTCATCCT+GGG - Chr3:83287194-83287213 None:intergenic 35.0%
TTACTGCTTATTCTCGATTG+CGG + Chr3:83287509-83287528 MsG0380016428.01.T01:CDS 35.0%
TTAGACAGTTGAGGATTGAT+TGG - Chr3:83287210-83287229 None:intergenic 35.0%
TTGATTGGATTACTTCATCC+TGG - Chr3:83287195-83287214 None:intergenic 35.0%
TTTGATGCTTGACACTGTAA+AGG + Chr3:83288260-83288279 MsG0380016428.01.T01:CDS 35.0%
! AATGCTTTATTGGCTAGTTG+TGG + Chr3:83288504-83288523 MsG0380016428.01.T01:CDS 35.0%
! AGAGATGCACTTGAACTTTT+TGG + Chr3:83288843-83288862 MsG0380016428.01.T01:CDS 35.0%
! ATCCTCAACTGTCTAAAATC+TGG + Chr3:83287214-83287233 MsG0380016428.01.T01:CDS 35.0%
! ATGCTGTTGAGATTCTGAAA+GGG + Chr3:83288754-83288773 MsG0380016428.01.T01:CDS 35.0%
! CAATGTTTTCAGAGATGCAA+TGG + Chr3:83288556-83288575 MsG0380016428.01.T01:CDS 35.0%
! CATTTTTCTGACAAGCATCA+AGG - Chr3:83289124-83289143 None:intergenic 35.0%
! GAGATGCACTTGAACTTTTT+GGG + Chr3:83288844-83288863 MsG0380016428.01.T01:CDS 35.0%
! GTATTTCAAGTGTGGTGAAT+TGG + Chr3:83288029-83288048 MsG0380016428.01.T01:CDS 35.0%
! GTTCCAAAAGTATACTTGCT+TGG - Chr3:83288591-83288610 None:intergenic 35.0%
! TTCATGCGTATGTTTTCTGA+TGG + Chr3:83287859-83287878 MsG0380016428.01.T01:CDS 35.0%
! TTGATGATAAATGTGTCTGC+TGG + Chr3:83288306-83288325 MsG0380016428.01.T01:CDS 35.0%
AAAAATGACTCCCCAAGACT+GGG + Chr3:83289137-83289156 MsG0380016428.01.T01:CDS 40.0%
AAGTGTGGTGAATTGGAGAA+TGG + Chr3:83288036-83288055 MsG0380016428.01.T01:CDS 40.0%
AATACTTATTCGCTACGCCT+CGG + Chr3:83288630-83288649 MsG0380016428.01.T01:CDS 40.0%
ACATTCCAAGTAACGGCATT+TGG - Chr3:83287787-83287806 None:intergenic 40.0%
ATCACATTTGCCAGTGTTCT+TGG + Chr3:83287595-83287614 MsG0380016428.01.T01:CDS 40.0%
ATGCAATGAGTGGGAAAACT+TGG + Chr3:83288124-83288143 MsG0380016428.01.T01:CDS 40.0%
ATTGAACTCTATAGTCGGCA+TGG + Chr3:83289026-83289045 MsG0380016428.01.T01:CDS 40.0%
ATTGAGTGCCAAACTCAACA+AGG - Chr3:83288944-83288963 None:intergenic 40.0%
CACGATATCACATTTCGTAC+AGG - Chr3:83288177-83288196 None:intergenic 40.0%
CATCAGGTTAAACCAAACTC+GGG - Chr3:83288457-83288476 None:intergenic 40.0%
CATGGATTTGTCTATCGACA+TGG + Chr3:83288360-83288379 MsG0380016428.01.T01:CDS 40.0%
CCGATTCTTTAAATGGTCTG+AGG + Chr3:83288221-83288240 MsG0380016428.01.T01:CDS 40.0%
CGATTACCCATTCGTTCTTA+TGG + Chr3:83287079-83287098 MsG0380016428.01.T01:CDS 40.0%
CTAAGTGGAACTCGACTTTA+TGG - Chr3:83287351-83287370 None:intergenic 40.0%
CTGTACGAAATGTGATATCG+TGG + Chr3:83288175-83288194 MsG0380016428.01.T01:CDS 40.0%
CTTCTTGCTTGTGTTGAAGA+AGG + Chr3:83288918-83288937 MsG0380016428.01.T01:CDS 40.0%
GATATCGTGGAATGCTATGT+TGG + Chr3:83288188-83288207 MsG0380016428.01.T01:CDS 40.0%
GGATGTTGTCACAATCATAG+GGG + Chr3:83288819-83288838 MsG0380016428.01.T01:CDS 40.0%
GGGATGTTGTCACAATCATA+GGG + Chr3:83288818-83288837 MsG0380016428.01.T01:CDS 40.0%
GTGAATTGGAGAATGGTTCT+CGG + Chr3:83288043-83288062 MsG0380016428.01.T01:CDS 40.0%
TCACATTTGCCAGTGTTCTT+GGG + Chr3:83287596-83287615 MsG0380016428.01.T01:CDS 40.0%
TCATCAAACCAAGAGTGACA+TGG - Chr3:83288293-83288312 None:intergenic 40.0%
TCCCCATTTCATGATCCAAA+AGG - Chr3:83288332-83288351 None:intergenic 40.0%
TGAATTGGAGAATGGTTCTC+GGG + Chr3:83288044-83288063 MsG0380016428.01.T01:CDS 40.0%
TGCAATGAGTGGGAAAACTT+GGG + Chr3:83288125-83288144 MsG0380016428.01.T01:CDS 40.0%
TGGGATGTTGTCACAATCAT+AGG + Chr3:83288817-83288836 MsG0380016428.01.T01:CDS 40.0%
TTACGGCCATAAGAACGAAT+GGG - Chr3:83287088-83287107 None:intergenic 40.0%
TTTACGGCCATAAGAACGAA+TGG - Chr3:83287089-83287108 None:intergenic 40.0%
! AATCCATTTTCCCAGTCTTG+GGG - Chr3:83289150-83289169 None:intergenic 40.0%
! CAATCCATTTTCCCAGTCTT+GGG - Chr3:83289151-83289170 None:intergenic 40.0%
! GCAAAAGCAGCGACATTTTA+CGG - Chr3:83287105-83287124 None:intergenic 40.0%
! GCCTTTTGGATCATGAAATG+GGG + Chr3:83288328-83288347 MsG0380016428.01.T01:CDS 40.0%
! GGCCTTTTGGATCATGAAAT+GGG + Chr3:83288327-83288346 MsG0380016428.01.T01:CDS 40.0%
! TGCTGTTGAGATTCTGAAAG+GGG + Chr3:83288755-83288774 MsG0380016428.01.T01:CDS 40.0%
! TGGCCTTTTGGATCATGAAA+TGG + Chr3:83288326-83288345 MsG0380016428.01.T01:CDS 40.0%
! TTTCTAGGGACGTGATAATG+TGG + Chr3:83288781-83288800 MsG0380016428.01.T01:CDS 40.0%
!! TCTTGATGTTGGTGATGCAA+AGG + Chr3:83287822-83287841 MsG0380016428.01.T01:CDS 40.0%
!! TTTGGGATAATGGAAGCAGA+AGG + Chr3:83288861-83288880 MsG0380016428.01.T01:CDS 40.0%
AAATGCCTCAACGAGATGGT+GGG + Chr3:83287470-83287489 MsG0380016428.01.T01:CDS 45.0%
AAGTGCACGCATACTAGAAC+AGG - Chr3:83287926-83287945 None:intergenic 45.0%
AGCAAGAAGAATGCCCTCAA+AGG - Chr3:83288907-83288926 None:intergenic 45.0%
AGGAGGGGATGCAAATTCAT+GGG + Chr3:83287947-83287966 MsG0380016428.01.T01:CDS 45.0%
CATGGGCTTGTGGTGAAATT+TGG + Chr3:83287661-83287680 MsG0380016428.01.T01:CDS 45.0%
CATGGGGTTGTTGTGAAACA+GGG + Chr3:83287964-83287983 MsG0380016428.01.T01:CDS 45.0%
CTATAGTCGGCATGGATACA+TGG + Chr3:83289034-83289053 MsG0380016428.01.T01:CDS 45.0%
CTTTGTCGCAGCAGATTCAT+GGG + Chr3:83287644-83287663 MsG0380016428.01.T01:CDS 45.0%
GAAAAATGACTCCCCAAGAC+TGG + Chr3:83289136-83289155 MsG0380016428.01.T01:CDS 45.0%
GAAATGGGGAAACAGCTTCA+TGG + Chr3:83288342-83288361 MsG0380016428.01.T01:CDS 45.0%
GAAGTCGAAGAGAATGGATG+CGG - Chr3:83287254-83287273 None:intergenic 45.0%
GAATGGCATTGCCAACCATA+AGG - Chr3:83288398-83288417 None:intergenic 45.0%
GATGAAATGCCTCAACGAGA+TGG + Chr3:83287466-83287485 MsG0380016428.01.T01:CDS 45.0%
GATGAGTAATTGGCGTGACA+GGG + Chr3:83288473-83288492 MsG0380016428.01.T01:CDS 45.0%
GCTTGACACTGTAAAGGACT+TGG + Chr3:83288266-83288285 MsG0380016428.01.T01:CDS 45.0%
GGATTATGGTTTATGCTCGC+AGG + Chr3:83287740-83287759 MsG0380016428.01.T01:CDS 45.0%
GTAAGGCGGTATCTTGATGT+TGG + Chr3:83287811-83287830 MsG0380016428.01.T01:CDS 45.0%
GTTGGACTTGCATTGTGTCA+GGG + Chr3:83288100-83288119 MsG0380016428.01.T01:CDS 45.0%
TAGTGGGAAGTCGAAGAGAA+TGG - Chr3:83287260-83287279 None:intergenic 45.0%
TCATGGGGTTGTTGTGAAAC+AGG + Chr3:83287963-83287982 MsG0380016428.01.T01:CDS 45.0%
TCTTTGTCGCAGCAGATTCA+TGG + Chr3:83287643-83287662 MsG0380016428.01.T01:CDS 45.0%
TGATGAGTAATTGGCGTGAC+AGG + Chr3:83288472-83288491 MsG0380016428.01.T01:CDS 45.0%
TGGTTTCCACTCGAACCTTA+TGG + Chr3:83288380-83288399 MsG0380016428.01.T01:CDS 45.0%
TGTCACGCCAATTACTCATC+AGG - Chr3:83288473-83288492 None:intergenic 45.0%
TGTCAGGGTATGCAATGAGT+GGG + Chr3:83288115-83288134 MsG0380016428.01.T01:CDS 45.0%
TGTGAAACAGGGACTTCATG+AGG + Chr3:83287975-83287994 MsG0380016428.01.T01:CDS 45.0%
TGTTGGACTTGCATTGTGTC+AGG + Chr3:83288099-83288118 MsG0380016428.01.T01:CDS 45.0%
TTCCACTCGAACCTTATGGT+TGG + Chr3:83288384-83288403 MsG0380016428.01.T01:CDS 45.0%
TTCTAGTATGCGTGCACTTG+AGG + Chr3:83287927-83287946 MsG0380016428.01.T01:CDS 45.0%
TTGGATTACTTCATCCTGGG+TGG - Chr3:83287191-83287210 None:intergenic 45.0%
! AGAGAATGGATGCGGCTTTT+TGG - Chr3:83287246-83287265 None:intergenic 45.0%
! ATCCATGAATTTGCTTGCCG+AGG - Chr3:83288650-83288669 None:intergenic 45.0%
! GCAATCCATTTTCCCAGTCT+TGG - Chr3:83289152-83289171 None:intergenic 45.0%
! GGCCAGATTTTAGACAGTTG+AGG - Chr3:83287219-83287238 None:intergenic 45.0%
! GTTTTCAGAGATGCAATGGG+AGG + Chr3:83288560-83288579 MsG0380016428.01.T01:CDS 45.0%
! TCTCGGGTTTTTCATCAGCT+TGG + Chr3:83288060-83288079 MsG0380016428.01.T01:CDS 45.0%
! TGTTGAGATTCTGAAAGGGG+CGG + Chr3:83288758-83288777 MsG0380016428.01.T01:CDS 45.0%
!! ATTTTGGAGAGCGACAGTGA+CGG - Chr3:83287315-83287334 None:intergenic 45.0%
!! GAAGAAGGCCTTGTTGAGTT+TGG + Chr3:83288933-83288952 MsG0380016428.01.T01:CDS 45.0%
!! GAATATAGGTGGATTGCGAG+TGG - Chr3:83287380-83287399 None:intergenic 45.0%
!!! AAATGTGTCTGCTGGCCTTT+TGG + Chr3:83288314-83288333 MsG0380016428.01.T01:CDS 45.0%
ACTCCCCAAGACTGGGAAAA+TGG + Chr3:83289144-83289163 MsG0380016428.01.T01:CDS 50.0%
ACTTGAACAGTGCCCGAGTT+TGG + Chr3:83288442-83288461 MsG0380016428.01.T01:CDS 50.0%
AGAGCCTACACTTCCCATGT+TGG + Chr3:83289091-83289110 MsG0380016428.01.T01:CDS 50.0%
AGTATGCGTGCACTTGAGGA+GGG + Chr3:83287931-83287950 MsG0380016428.01.T01:CDS 50.0%
ATCAAGGGCTCGTTCCAACA+TGG - Chr3:83289108-83289127 None:intergenic 50.0%
ATGAATACGGTGTCCTGCCT+CGG + Chr3:83288982-83289001 MsG0380016428.01.T01:CDS 50.0%
ATTGGCGTGACAGGGTTTCT+TGG + Chr3:83288481-83288500 MsG0380016428.01.T01:CDS 50.0%
CAAGTAACGGCATTTGGACG+AGG - Chr3:83287781-83287800 None:intergenic 50.0%
CTCGTCCAAATGCCGTTACT+TGG + Chr3:83287779-83287798 MsG0380016428.01.T01:CDS 50.0%
GAAATGCCTCAACGAGATGG+TGG + Chr3:83287469-83287488 MsG0380016428.01.T01:CDS 50.0%
GAATGCCCTCAAAGGTCACA+CGG - Chr3:83288899-83288918 None:intergenic 50.0%
GACTTGGACCATGTCACTCT+TGG + Chr3:83288282-83288301 MsG0380016428.01.T01:CDS 50.0%
GAGGAGGGGATGCAAATTCA+TGG + Chr3:83287946-83287965 MsG0380016428.01.T01:CDS 50.0%
GATTACTTCATCCTGGGTGG+CGG - Chr3:83287188-83287207 None:intergenic 50.0%
GGAGGGGATGCAAATTCATG+GGG + Chr3:83287948-83287967 MsG0380016428.01.T01:CDS 50.0%
GTGTCAGGGTATGCAATGAG+TGG + Chr3:83288114-83288133 MsG0380016428.01.T01:CDS 50.0%
TAGTATGCGTGCACTTGAGG+AGG + Chr3:83287930-83287949 MsG0380016428.01.T01:CDS 50.0%
TCAAGGGCTCGTTCCAACAT+GGG - Chr3:83289107-83289126 None:intergenic 50.0%
TCGCATAAGCTTCAAGCGCA+CGG - Chr3:83287411-83287430 None:intergenic 50.0%
TCGTGGAATGCTATGTTGGC+TGG + Chr3:83288192-83288211 MsG0380016428.01.T01:CDS 50.0%
TCTGAAAGGGGCGGTTTCTA+GGG + Chr3:83288767-83288786 MsG0380016428.01.T01:CDS 50.0%
TGCCAACCATAAGGTTCGAG+TGG - Chr3:83288389-83288408 None:intergenic 50.0%
TTCCTGTGCATCGTGAAGAG+AGG - Chr3:83287440-83287459 None:intergenic 50.0%
! CGTTCCAACATGGGAAGTGT+AGG - Chr3:83289098-83289117 None:intergenic 50.0%
! GAACTCGACTTTATGGGCTG+CGG - Chr3:83287344-83287363 None:intergenic 50.0%
! TGGATGCGGCTTTTTGGATG+TGG - Chr3:83287240-83287259 None:intergenic 50.0%
! TTCTGAAAGGGGCGGTTTCT+AGG + Chr3:83288766-83288785 MsG0380016428.01.T01:CDS 50.0%
!! TATAGGTGGATTGCGAGTGG+TGG - Chr3:83287377-83287396 None:intergenic 50.0%
AAGCTTCAAGCGCACGGTTG+CGG - Chr3:83287405-83287424 None:intergenic 55.0%
AAGTGGGCGTAGAGAGAGTG+AGG - Chr3:83287289-83287308 None:intergenic 55.0%
AGCACACGACCCAAGAACAC+TGG - Chr3:83287608-83287627 None:intergenic 55.0%
AGTGGGCGTAGAGAGAGTGA+GGG - Chr3:83287288-83287307 None:intergenic 55.0%
CAGCCATAATGCTCCAACCG+AGG - Chr3:83289002-83289021 None:intergenic 55.0%
CATAATGCTCCAACCGAGGC+AGG - Chr3:83288998-83289017 None:intergenic 55.0%
CATGACCCACCATCTCGTTG+AGG - Chr3:83287478-83287497 None:intergenic 55.0%
CCAGACCGTGTGACCTTTGA+GGG + Chr3:83288891-83288910 MsG0380016428.01.T01:CDS 55.0%
CGCCTCGGCAAGCAAATTCA+TGG + Chr3:83288645-83288664 MsG0380016428.01.T01:CDS 55.0%
CGGTTGCGGAGGAATATAGG+TGG - Chr3:83287391-83287410 None:intergenic 55.0%
CTCCTCTCTTCACGATGCAC+AGG + Chr3:83287435-83287454 MsG0380016428.01.T01:CDS 55.0%
GCACGGTTGCGGAGGAATAT+AGG - Chr3:83287394-83287413 None:intergenic 55.0%
GCAGCAGATTCATGGGCTTG+TGG + Chr3:83287651-83287670 MsG0380016428.01.T01:CDS 55.0%
GTATGCGTGCACTTGAGGAG+GGG + Chr3:83287932-83287951 MsG0380016428.01.T01:CDS 55.0%
! AGCGACAGTGACGGAAGAAG+TGG - Chr3:83287306-83287325 None:intergenic 55.0%
! CTGCCTCGGTTGGAGCATTA+TGG + Chr3:83288996-83289015 MsG0380016428.01.T01:CDS 55.0%
! GCGACAGTGACGGAAGAAGT+GGG - Chr3:83287305-83287324 None:intergenic 55.0%
! TCGTGGTGGGGGAGTTTGTT+CGG - Chr3:83287129-83287148 None:intergenic 55.0%
!! CTCAACGAGATGGTGGGTCA+TGG + Chr3:83287476-83287495 MsG0380016428.01.T01:CDS 55.0%
AGAGAGTGAGGGACGGGTAG+TGG - Chr3:83287277-83287296 None:intergenic 60.0%
ATACGGTGTCCTGCCTCGGT+TGG + Chr3:83288986-83289005 MsG0380016428.01.T01:CDS 60.0%
CCCTCAAAGGTCACACGGTC+TGG - Chr3:83288894-83288913 None:intergenic 60.0%
GAGAGTGAGGGACGGGTAGT+GGG - Chr3:83287276-83287295 None:intergenic 60.0%
GCCAGACCGTGTGACCTTTG+AGG + Chr3:83288890-83288909 MsG0380016428.01.T01:CDS 60.0%
GCGTAGAGAGAGTGAGGGAC+GGG - Chr3:83287283-83287302 None:intergenic 60.0%
GGCGTAGAGAGAGTGAGGGA+CGG - Chr3:83287284-83287303 None:intergenic 60.0%
! GACTTTATGGGCTGCGGCGA+TGG - Chr3:83287338-83287357 None:intergenic 60.0%
! TACTTCATCCTGGGTGGCGG+TGG - Chr3:83287185-83287204 None:intergenic 60.0%
! TGCGAGTGGTGGCGACTAAG+TGG - Chr3:83287366-83287385 None:intergenic 60.0%
!! GTGGTGACGGTGATGGTGGT+GGG - Chr3:83287166-83287185 None:intergenic 60.0%
!! TGATGGTGGTGGGTGGATGG+CGG - Chr3:83287156-83287175 None:intergenic 60.0%
!! TGGGCTGCGGCGATGGATTT+TGG - Chr3:83287331-83287350 None:intergenic 60.0%
ATGGCGGTGGTTCGTGGTGG+GGG - Chr3:83287140-83287159 None:intergenic 65.0%
CTTCAAGCGCACGGTTGCGG+AGG - Chr3:83287402-83287421 None:intergenic 65.0%
! ATCCTGGGTGGCGGTGGTGA+CGG - Chr3:83287179-83287198 None:intergenic 65.0%
! GATGGCGGTGGTTCGTGGTG+GGG - Chr3:83287141-83287160 None:intergenic 65.0%
! GGATGGCGGTGGTTCGTGGT+GGG - Chr3:83287142-83287161 None:intergenic 65.0%
! TGGATGGCGGTGGTTCGTGG+TGG - Chr3:83287143-83287162 None:intergenic 65.0%
!! CGGTGATGGTGGTGGGTGGA+TGG - Chr3:83287159-83287178 None:intergenic 65.0%
!! GGTGGTGACGGTGATGGTGG+TGG - Chr3:83287167-83287186 None:intergenic 65.0%
!! GTGACGGTGATGGTGGTGGG+TGG - Chr3:83287163-83287182 None:intergenic 65.0%
! GGGTGGATGGCGGTGGTTCG+TGG - Chr3:83287146-83287165 None:intergenic 70.0%
!! GGCGGTGGTGACGGTGATGG+TGG - Chr3:83287170-83287189 None:intergenic 70.0%
!! GGTGGCGGTGGTGACGGTGA+TGG - Chr3:83287173-83287192 None:intergenic 70.0%
!! TGGTGGTGGGTGGATGGCGG+TGG - Chr3:83287153-83287172 None:intergenic 70.0%
CACCGTCACCACCGCCACCC+AGG + Chr3:83287174-83287193 MsG0380016428.01.T01:CDS 75.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr3 gene 83287067 83289199 83287067 ID=MsG0380016428.01;Name=MsG0380016428.01
Chr3 mRNA 83287067 83289199 83287067 ID=MsG0380016428.01.T01;Parent=MsG0380016428.01;Name=MsG0380016428.01.T01;_AED=0.00;_eAED=0.00;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|710
Chr3 exon 83287067 83289199 83287067 ID=MsG0380016428.01.T01:exon:11018;Parent=MsG0380016428.01.T01
Chr3 CDS 83287067 83289199 83287067 ID=MsG0380016428.01.T01:cds;Parent=MsG0380016428.01.T01
Chr3 mRNA 83287109 83289199 83287109 ID=MsG0380016428.01.T02;Parent=MsG0380016428.01;Name=MsG0380016428.01.T02;_AED=0.01;_eAED=0.01;_QI=0|-1|0|1|-1|0|1|0|696
Chr3 exon 83287109 83289199 83287109 ID=MsG0380016428.01.T02:exon:11019;Parent=MsG0380016428.01.T02
Chr3 CDS 83287109 83289199 83287109 ID=MsG0380016428.01.T02:cds;Parent=MsG0380016428.01.T02
Gene Sequence

>MsG0380016428.01.T01

ATGAGTGATCGCCGATTACCCATTCGTTCTTATGGCCGTAAAATGTCGCTGCTTTTGCGCCGAACAAACTCCCCCACCACGAACCACCGCCATCCACCCACCACCATCACCGTCACCACCGCCACCCAGGATGAAGTAATCCAATCAATCCTCAACTGTCTAAAATCTGGCCACATCCAAAAAGCCGCATCCATTCTCTTCGACTTCCCACTACCCGTCCCTCACTCTCTCTACGCCCACTTCTTCCGTCACTGTCGCTCTCCAAAATCCATCGCCGCAGCCCATAAAGTCGAGTTCCACTTAGTCGCCACCACTCGCAATCCACCTATATTCCTCCGCAACCGTGCGCTTGAAGCTTATGCGAAATGCTCCTCTCTTCACGATGCACAGGAACTGTTTGATGAAATGCCTCAACGAGATGGTGGGTCATGGAATGCTTTGATTACTGCTTATTCTCGATTGCGGTATCCAGATGAAGCTATTTCTTTGTTTCTTTCGATGAATAAGGATGGTGTTCGCGCCAATAACATCACATTTGCCAGTGTTCTTGGGTCGTGTGCTGATGTTTATGAGCTTTCTTTGTCGCAGCAGATTCATGGGCTTGTGGTGAAATTTGGTTTCTCTAGCAATGTGATAATTGGGAGTGCTCTTGTTGATGTTTATGCTAAATGTGGGATTATGGTTTATGCTCGCAGGATGTTTCATGAAATTCCTCGTCCAAATGCCGTTACTTGGAATGTTATTGTAAGGCGGTATCTTGATGTTGGTGATGCAAAGGAAGCTGTTTTGTTGTTCATGCGTATGTTTTCTGATGGAGTTAAGCCGTTGAATTTTACATTCTCTAATGCTCTTGTTGCCTGTTCTAGTATGCGTGCACTTGAGGAGGGGATGCAAATTCATGGGGTTGTTGTGAAACAGGGACTTCATGAGGATAATGTTGTTTCGAGCTCGCTAATCAATATGTATTTCAAGTGTGGTGAATTGGAGAATGGTTCTCGGGTTTTTCATCAGCTTGGTTCGAAAGATTTAGTGTGTTGGACTTGCATTGTGTCAGGGTATGCAATGAGTGGGAAAACTTGGGACGCAAGAAAGCTTTTTGATCAGATGCCTGTACGAAATGTGATATCGTGGAATGCTATGTTGGCTGGATATACCCGATTCTTTAAATGGTCTGAGGCATTAGATTTTGTTTGTTTGATGCTTGACACTGTAAAGGACTTGGACCATGTCACTCTTGGTTTGATGATAAATGTGTCTGCTGGCCTTTTGGATCATGAAATGGGGAAACAGCTTCATGGATTTGTCTATCGACATGGTTTCCACTCGAACCTTATGGTTGGCAATGCCATTCTTGACATGTATGGTAAATGTGGGAACTTGAACAGTGCCCGAGTTTGGTTTAACCTGATGAGTAATTGGCGTGACAGGGTTTCTTGGAATGCTTTATTGGCTAGTTGTGGCCTTCATTATTCAAGCGAACAAACACTAACAATGTTTTCAGAGATGCAATGGGAGGCAAAACCAAGCAAGTATACTTTTGGAACCCTTTTAGCAGCATGTGCAAATACTTATTCGCTACGCCTCGGCAAGCAAATTCATGGATTTATCATTAGACATGGATTTCAGATAGATAGTGTAATCAGGACTGCTTTGATTTACATGTACTGTAAATGCTACTGTCTTGAGTATGCTGTTGAGATTCTGAAAGGGGCGGTTTCTAGGGACGTGATAATGTGGAATACCTTAATTTTGGGATGTTGTCACAATCATAGGGGAAGAGATGCACTTGAACTTTTTGGGATAATGGAAGCAGAAGGCATCAAGCCAGACCGTGTGACCTTTGAGGGCATTCTTCTTGCTTGTGTTGAAGAAGGCCTTGTTGAGTTTGGCACTCAATGCTTCGAGTCTATGAGCAATGAATACGGTGTCCTGCCTCGGTTGGAGCATTATGGCTGCATGATTGAACTCTATAGTCGGCATGGATACATGGATGAGCTCGAGAGTTTTATGAAAACAATGACAATAGAGCCTACACTTCCCATGTTGGAACGAGCCCTTGATGCTTGTCAGAAAAATGACTCCCCAAGACTGGGAAAATGGATTGCAAAAAAAATTCATGAATTTGAACATTGA

>MsG0380016428.01.T02

ATGTCGCTGCTTTTGCGCCGAACAAACTCCCCCACCACGAACCACCGCCATCCACCCACCACCATCACCGTCACCACCGCCACCCAGGATGAAGTAATCCAATCAATCCTCAACTGTCTAAAATCTGGCCACATCCAAAAAGCCGCATCCATTCTCTTCGACTTCCCACTACCCGTCCCTCACTCTCTCTACGCCCACTTCTTCCGTCACTGTCGCTCTCCAAAATCCATCGCCGCAGCCCATAAAGTCGAGTTCCACTTAGTCGCCACCACTCGCAATCCACCTATATTCCTCCGCAACCGTGCGCTTGAAGCTTATGCGAAATGCTCCTCTCTTCACGATGCACAGGAACTGTTTGATGAAATGCCTCAACGAGATGGTGGGTCATGGAATGCTTTGATTACTGCTTATTCTCGATTGCGGTATCCAGATGAAGCTATTTCTTTGTTTCTTTCGATGAATAAGGATGGTGTTCGCGCCAATAACATCACATTTGCCAGTGTTCTTGGGTCGTGTGCTGATGTTTATGAGCTTTCTTTGTCGCAGCAGATTCATGGGCTTGTGGTGAAATTTGGTTTCTCTAGCAATGTGATAATTGGGAGTGCTCTTGTTGATGTTTATGCTAAATGTGGGATTATGGTTTATGCTCGCAGGATGTTTCATGAAATTCCTCGTCCAAATGCCGTTACTTGGAATGTTATTGTAAGGCGGTATCTTGATGTTGGTGATGCAAAGGAAGCTGTTTTGTTGTTCATGCGTATGTTTTCTGATGGAGTTAAGCCGTTGAATTTTACATTCTCTAATGCTCTTGTTGCCTGTTCTAGTATGCGTGCACTTGAGGAGGGGATGCAAATTCATGGGGTTGTTGTGAAACAGGGACTTCATGAGGATAATGTTGTTTCGAGCTCGCTAATCAATATGTATTTCAAGTGTGGTGAATTGGAGAATGGTTCTCGGGTTTTTCATCAGCTTGGTTCGAAAGATTTAGTGTGTTGGACTTGCATTGTGTCAGGGTATGCAATGAGTGGGAAAACTTGGGACGCAAGAAAGCTTTTTGATCAGATGCCTGTACGAAATGTGATATCGTGGAATGCTATGTTGGCTGGATATACCCGATTCTTTAAATGGTCTGAGGCATTAGATTTTGTTTGTTTGATGCTTGACACTGTAAAGGACTTGGACCATGTCACTCTTGGTTTGATGATAAATGTGTCTGCTGGCCTTTTGGATCATGAAATGGGGAAACAGCTTCATGGATTTGTCTATCGACATGGTTTCCACTCGAACCTTATGGTTGGCAATGCCATTCTTGACATGTATGGTAAATGTGGGAACTTGAACAGTGCCCGAGTTTGGTTTAACCTGATGAGTAATTGGCGTGACAGGGTTTCTTGGAATGCTTTATTGGCTAGTTGTGGCCTTCATTATTCAAGCGAACAAACACTAACAATGTTTTCAGAGATGCAATGGGAGGCAAAACCAAGCAAGTATACTTTTGGAACCCTTTTAGCAGCATGTGCAAATACTTATTCGCTACGCCTCGGCAAGCAAATTCATGGATTTATCATTAGACATGGATTTCAGATAGATAGTGTAATCAGGACTGCTTTGATTTACATGTACTGTAAATGCTACTGTCTTGAGTATGCTGTTGAGATTCTGAAAGGGGCGGTTTCTAGGGACGTGATAATGTGGAATACCTTAATTTTGGGATGTTGTCACAATCATAGGGGAAGAGATGCACTTGAACTTTTTGGGATAATGGAAGCAGAAGGCATCAAGCCAGACCGTGTGACCTTTGAGGGCATTCTTCTTGCTTGTGTTGAAGAAGGCCTTGTTGAGTTTGGCACTCAATGCTTCGAGTCTATGAGCAATGAATACGGTGTCCTGCCTCGGTTGGAGCATTATGGCTGCATGATTGAACTCTATAGTCGGCATGGATACATGGATGAGCTCGAGAGTTTTATGAAAACAATGACAATAGAGCCTACACTTCCCATGTTGGAACGAGCCCTTGATGCTTGTCAGAAAAATGACTCCCCAAGACTGGGAAAATGGATTGCAAAAAAAATTCATGAATTTGAACATTGA
Protein sequence

>MsG0380016428.01.T01

MSDRRLPIRSYGRKMSLLLRRTNSPTTNHRHPPTTITVTTATQDEVIQSILNCLKSGHIQKAASILFDFPLPVPHSLYAHFFRHCRSPKSIAAAHKVEFHLVATTRNPPIFLRNRALEAYAKCSSLHDAQELFDEMPQRDGGSWNALITAYSRLRYPDEAISLFLSMNKDGVRANNITFASVLGSCADVYELSLSQQIHGLVVKFGFSSNVIIGSALVDVYAKCGIMVYARRMFHEIPRPNAVTWNVIVRRYLDVGDAKEAVLLFMRMFSDGVKPLNFTFSNALVACSSMRALEEGMQIHGVVVKQGLHEDNVVSSSLINMYFKCGELENGSRVFHQLGSKDLVCWTCIVSGYAMSGKTWDARKLFDQMPVRNVISWNAMLAGYTRFFKWSEALDFVCLMLDTVKDLDHVTLGLMINVSAGLLDHEMGKQLHGFVYRHGFHSNLMVGNAILDMYGKCGNLNSARVWFNLMSNWRDRVSWNALLASCGLHYSSEQTLTMFSEMQWEAKPSKYTFGTLLAACANTYSLRLGKQIHGFIIRHGFQIDSVIRTALIYMYCKCYCLEYAVEILKGAVSRDVIMWNTLILGCCHNHRGRDALELFGIMEAEGIKPDRVTFEGILLACVEEGLVEFGTQCFESMSNEYGVLPRLEHYGCMIELYSRHGYMDELESFMKTMTIEPTLPMLERALDACQKNDSPRLGKWIAKKIHEFEH*

>MsG0380016428.01.T02

MSLLLRRTNSPTTNHRHPPTTITVTTATQDEVIQSILNCLKSGHIQKAASILFDFPLPVPHSLYAHFFRHCRSPKSIAAAHKVEFHLVATTRNPPIFLRNRALEAYAKCSSLHDAQELFDEMPQRDGGSWNALITAYSRLRYPDEAISLFLSMNKDGVRANNITFASVLGSCADVYELSLSQQIHGLVVKFGFSSNVIIGSALVDVYAKCGIMVYARRMFHEIPRPNAVTWNVIVRRYLDVGDAKEAVLLFMRMFSDGVKPLNFTFSNALVACSSMRALEEGMQIHGVVVKQGLHEDNVVSSSLINMYFKCGELENGSRVFHQLGSKDLVCWTCIVSGYAMSGKTWDARKLFDQMPVRNVISWNAMLAGYTRFFKWSEALDFVCLMLDTVKDLDHVTLGLMINVSAGLLDHEMGKQLHGFVYRHGFHSNLMVGNAILDMYGKCGNLNSARVWFNLMSNWRDRVSWNALLASCGLHYSSEQTLTMFSEMQWEAKPSKYTFGTLLAACANTYSLRLGKQIHGFIIRHGFQIDSVIRTALIYMYCKCYCLEYAVEILKGAVSRDVIMWNTLILGCCHNHRGRDALELFGIMEAEGIKPDRVTFEGILLACVEEGLVEFGTQCFESMSNEYGVLPRLEHYGCMIELYSRHGYMDELESFMKTMTIEPTLPMLERALDACQKNDSPRLGKWIAKKIHEFEH*