AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380017160.01

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MsG0380017160.01.T01 AT2G26730 34.703 657 374 17 10 645 5 627 4.19e-103 328
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MsG0380017160.01.T01 AT3G08680 34.769 650 363 21 12 638 4 615 3.63e-92 299
MsG0380017160.01.T01 AT2G36570 33.384 656 345 20 42 638 24 646 2.22e-90 295
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MsG0380017160.01.T01 AT5G58300 32.883 666 369 21 16 654 28 642 2.25e-88 289
MsG0380017160.01.T01 AT5G58300 32.883 666 369 21 16 654 28 642 2.25e-88 289
MsG0380017160.01.T01 AT3G17840 33.280 628 370 19 41 639 33 640 5.56e-88 288
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MsG0380017160.01.T01 AT4G23740 31.077 650 366 21 40 655 27 628 2.65e-80 267
MsG0380017160.01.T01 AT1G25320 30.435 690 344 21 54 637 40 699 2.00e-78 264
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MsG0380017160.01.T01 AT3G20190 31.836 512 318 8 69 576 85 569 3.16e-67 233
MsG0380017160.01.T01 AT2G42290 29.925 665 355 23 41 638 26 646 5.32e-67 232
MsG0380017160.01.T01 AT4G31250 28.571 658 363 17 35 637 35 640 5.26e-66 230
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MsG0380017160.01.T01 AT1G31420 30.159 630 333 21 34 635 25 575 2.97e-64 223
MsG0380017160.01.T01 AT3G57830 29.047 661 367 23 40 638 40 660 5.70e-63 221
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MsG0380017160.01.T01 AT1G72460 29.817 654 382 20 39 650 21 639 1.84e-62 219
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MsG0380017160.01.T01 AT2G35620 31.303 591 304 17 68 635 61 572 6.51e-59 208
MsG0380017160.01.T01 AT2G35620 31.303 591 304 17 68 635 61 572 6.51e-59 208
MsG0380017160.01.T01 AT2G15300 28.375 726 382 27 41 637 26 742 9.51e-57 205
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MsG0380017160.01.T01 AT5G48940 36.364 121 75 2 74 193 270 389 5.82e-12 69.7
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MsG0380017160.01.T01 AT5G07180 33.047 233 117 8 11 214 12 234 3.30e-17 86.7
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MsG0380017160.01.T01 AT2G26330 29.964 554 307 16 100 634 423 914 6.54e-52 194
MsG0380017160.01.T01 AT2G26330 33.182 220 113 7 50 237 35 252 2.33e-15 80.5
MsG0380017160.01.T01 AT2G26330 38.168 131 78 2 86 214 219 348 1.47e-12 71.6
MsG0380017160.01.T01 AT2G26330 38.938 113 66 2 105 214 260 372 2.72e-11 67.4
MsG0380017160.01.T01 AT5G01890 29.655 580 336 18 91 638 421 960 9.30e-52 193
MsG0380017160.01.T01 AT5G01890 40.132 152 86 4 90 237 127 277 1.94e-14 77.8
MsG0380017160.01.T01 AT5G01890 36.752 117 71 2 103 216 188 304 2.19e-13 74.3
MsG0380017160.01.T01 AT1G17230 29.983 587 318 22 86 638 549 1076 2.33e-51 192
MsG0380017160.01.T01 AT1G17230 38.583 127 74 3 91 214 415 540 1.88e-14 77.8
MsG0380017160.01.T01 AT1G17230 29.694 229 123 6 12 214 12 228 9.94e-13 72.4
MsG0380017160.01.T01 AT1G17230 36.735 147 87 4 80 223 284 427 1.14e-11 68.9
MsG0380017160.01.T01 AT1G17230 34.815 135 84 3 83 214 167 300 8.41e-11 65.9
MsG0380017160.01.T01 AT3G25560 28.571 630 323 24 37 635 50 583 3.00e-51 188
MsG0380017160.01.T01 AT1G55610 29.160 583 315 23 98 649 633 1148 1.87e-50 190
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MsG0380017160.01.T01 AT1G55610 37.984 129 75 3 90 214 437 564 2.76e-11 67.4
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MsG0380017160.01.T01 AT3G02130 30.648 571 313 20 99 638 629 1147 1.55e-45 175
MsG0380017160.01.T01 AT3G02130 27.925 265 122 8 12 214 22 279 1.05e-14 78.6
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MsG0380017160.01.T01 AT1G35710 33.668 199 96 8 77 243 316 510 1.25e-11 68.6
MsG0380017160.01.T01 AT1G35710 38.129 139 76 3 86 214 293 431 4.76e-11 66.6
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MsG0380017160.01.T01 AT3G47570 30.326 521 256 18 79 575 481 918 3.15e-43 167
MsG0380017160.01.T01 AT3G47570 29.630 270 114 8 19 233 13 261 1.41e-15 81.3
MsG0380017160.01.T01 AT3G28040 27.883 581 343 16 103 641 462 1008 8.81e-43 166
MsG0380017160.01.T01 AT3G28040 35.484 217 129 8 16 223 9 223 8.90e-17 85.1
MsG0380017160.01.T01 AT3G28040 32.474 194 119 5 83 265 275 467 8.60e-12 69.3
MsG0380017160.01.T01 AT3G28040 36.196 163 70 3 86 214 150 312 2.45e-11 67.8
MsG0380017160.01.T01 AT3G28040 36.522 115 70 2 103 214 222 336 3.85e-11 67.0
MsG0380017160.01.T01 AT5G53890 28.519 540 302 19 131 637 540 1028 4.28e-42 164
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MsG0380017160.01.T01 AT3G57830 29.505 444 260 16 40 466 40 447 3.73e-41 156
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MsG0380017160.01.T01 AT5G10020 36.567 134 69 3 106 227 437 566 3.20e-11 67.4
MsG0380017160.01.T01 AT5G10020 33.143 175 85 5 69 211 63 237 4.35e-11 67.0
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MsG0380017160.01.T01 AT5G20480 35.071 211 122 7 12 214 7 210 5.80e-22 101
MsG0380017160.01.T01 AT3G20190 36.797 231 137 4 349 576 156 380 3.56e-38 148
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MsG0380017160.01.T01 AT5G46330 36.029 136 79 3 86 214 386 520 2.38e-13 74.3
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MsG0380017160.01.T01 AT1G68690 26.684 386 242 12 281 637 279 652 1.03e-33 137
MsG0380017160.01.T01 AT1G68690 26.684 386 242 12 281 637 279 652 1.03e-33 137
MsG0380017160.01.T01 AT2G28970 27.586 522 278 19 152 646 274 722 1.07e-33 138
MsG0380017160.01.T01 AT2G28970 27.586 522 278 19 152 646 309 757 1.24e-33 138
MsG0380017160.01.T01 AT5G42440 31.159 276 165 8 381 637 86 355 1.57e-33 132
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MsG0380017160.01.T01 AT1G73080 28.923 325 194 10 349 641 795 1114 4.16e-32 134
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MsG0380017160.01.T01 AT1G34210 38.220 191 92 4 53 240 44 211 2.14e-22 102
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MsG0380017160.01.T01 AT2G43690 30.132 302 177 12 377 656 336 625 1.34e-29 125
MsG0380017160.01.T01 AT5G61570 29.321 324 203 9 339 639 41 361 1.68e-29 120
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MsG0380017160.01.T01 AT2G13800 29.373 303 173 10 364 635 141 433 7.23e-29 121
MsG0380017160.01.T01 AT1G70460 32.542 295 154 13 381 650 358 632 7.85e-29 122
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MsG0380017160.01.T01 AT2G13790 35.135 185 90 4 51 230 44 203 3.14e-19 92.4
MsG0380017160.01.T01 AT1G80640 35.514 214 123 6 383 594 159 359 8.79e-29 118
MsG0380017160.01.T01 AT2G13800 29.373 303 173 10 364 635 258 550 1.22e-28 121
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MsG0380017160.01.T01 AT2G13800 29.373 303 173 10 364 635 258 550 1.22e-28 121
MsG0380017160.01.T01 AT2G13800 34.021 194 95 4 45 230 30 198 3.22e-18 89.4
MsG0380017160.01.T01 AT1G53420 32.759 290 167 10 378 647 626 907 1.87e-28 122
MsG0380017160.01.T01 AT1G53420 35.714 140 87 3 77 214 61 199 2.07e-12 71.2
MsG0380017160.01.T01 AT3G24550 29.831 295 171 10 369 635 268 554 1.98e-28 121
MsG0380017160.01.T01 AT1G49100 32.639 288 158 10 381 646 586 859 2.10e-28 122
MsG0380017160.01.T01 AT1G24030 29.470 302 177 9 366 637 61 356 2.27e-28 117
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MsG0380017160.01.T01 AT3G08870 31.023 303 177 9 379 657 392 686 2.91e-28 121
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MsG0380017160.01.T01 AT5G06740 30.820 305 170 11 362 634 323 618 3.04e-28 120
MsG0380017160.01.T01 AT5G01560 30.526 285 171 9 381 646 368 644 3.25e-28 120
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MsG0380017160.01.T01 AT3G03770 24.452 593 364 23 86 640 208 754 7.34e-28 120
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MsG0380017160.01.T01 AT2G18470 31.183 279 162 10 379 635 287 557 2.42e-26 114
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MsG0380017160.01.T01 AT2G43700 28.713 303 186 11 376 658 310 602 3.03e-26 114
MsG0380017160.01.T01 AT2G43700 28.713 303 186 11 376 658 310 602 3.03e-26 114
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MsG0380017160.01.T01 AT1G69790 30.000 310 169 13 381 659 89 381 1.72e-25 109
MsG0380017160.01.T01 AT4G29050 28.070 285 175 9 378 640 346 622 2.01e-25 112
MsG0380017160.01.T01 AT4G29050 28.070 285 175 9 378 640 360 636 2.09e-25 112
MsG0380017160.01.T01 AT5G16500 32.500 280 154 12 381 634 79 349 2.18e-25 111
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MsG0380017160.01.T01 AT1G53440 34.646 127 78 4 91 214 124 248 1.00e-11 68.9
MsG0380017160.01.T01 AT5G41180 25.847 561 326 24 68 593 62 567 2.36e-25 112
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MsG0380017160.01.T01 AT5G18500 29.682 283 176 9 381 645 171 448 2.93e-25 110
MsG0380017160.01.T01 AT5G18500 29.682 283 176 9 381 645 171 448 2.93e-25 110
MsG0380017160.01.T01 AT5G18500 29.682 283 176 9 381 645 171 448 2.93e-25 110
MsG0380017160.01.T01 AT5G18500 29.682 283 176 9 381 645 171 448 2.93e-25 110
MsG0380017160.01.T01 AT5G18500 29.682 283 176 9 381 645 171 448 2.93e-25 110
MsG0380017160.01.T01 AT1G66880 29.293 297 179 10 367 639 334 623 3.13e-25 111
MsG0380017160.01.T01 AT1G53430 28.966 290 178 9 369 635 657 941 3.27e-25 112
MsG0380017160.01.T01 AT1G53430 32.323 198 114 5 15 210 186 365 2.15e-13 74.3
MsG0380017160.01.T01 AT1G53430 32.298 161 82 4 80 214 91 250 8.12e-13 72.4
MsG0380017160.01.T01 AT1G07650 27.119 295 186 8 365 635 449 738 3.27e-25 111
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MsG0380017160.01.T01 AT1G53430 32.298 161 82 4 80 214 58 217 6.50e-13 72.8
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MsG0380017160.01.T01 AT1G07650 28.319 226 140 6 7 214 5 226 3.54e-11 67.0
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MsG0380017160.01.T01 AT4G28350 24.808 391 217 13 280 645 289 627 6.16e-25 110
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MsG0380017160.01.T01 AT1G55200 29.603 277 167 9 379 635 382 650 6.53e-25 110
MsG0380017160.01.T01 AT1G55200 29.603 277 167 9 379 635 382 650 6.53e-25 110
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MsG0380017160.01.T01 AT5G58940 29.712 313 183 12 357 642 131 433 6.74e-25 108
MsG0380017160.01.T01 AT5G58940 29.712 313 183 12 357 642 131 433 6.74e-25 108
MsG0380017160.01.T01 AT5G58940 29.712 313 183 12 357 642 131 433 6.74e-25 108
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MsG0380017160.01.T01 AT1G66980 30.796 289 168 9 371 635 800 1080 7.16e-25 111
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MsG0380017160.01.T01 AT2G42960 29.455 275 167 7 381 635 188 455 7.63e-25 108
MsG0380017160.01.T01 AT2G42960 29.455 275 167 7 381 635 188 455 7.63e-25 108
MsG0380017160.01.T01 AT2G42960 29.455 275 167 7 381 635 188 455 7.63e-25 108
MsG0380017160.01.T01 AT1G66980 30.796 289 168 9 371 635 829 1109 7.87e-25 110
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MsG0380017160.01.T01 AT4G23270 31.636 275 158 10 382 634 332 598 9.58e-25 109
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MsG0380017160.01.T01 AT5G01950 30.374 214 110 7 35 212 27 237 3.01e-14 77.0
MsG0380017160.01.T01 AT5G01950 36.719 128 77 4 90 214 161 287 1.67e-12 71.2
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MsG0380017160.01.T01 AT1G53730 30.588 170 92 4 69 214 62 229 1.06e-12 72.0
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MsG0380017160.01.T01 AT3G14350 29.289 239 156 8 345 575 347 580 3.34e-24 108
MsG0380017160.01.T01 AT5G38210 24.645 422 270 14 252 639 228 635 3.36e-24 108
MsG0380017160.01.T01 AT1G21590 30.449 312 167 13 381 654 374 673 3.38e-24 108
MsG0380017160.01.T01 AT5G15730 28.782 271 172 8 381 639 119 380 3.51e-24 106
MsG0380017160.01.T01 AT5G15730 28.782 271 172 8 381 639 119 380 3.51e-24 106
MsG0380017160.01.T01 AT2G39110 31.618 272 144 11 398 639 103 362 3.55e-24 106
MsG0380017160.01.T01 AT4G11900 28.134 359 222 13 305 634 457 808 3.63e-24 108
MsG0380017160.01.T01 AT5G02290 27.273 286 174 8 381 637 73 353 3.65e-24 105
MsG0380017160.01.T01 AT5G02290 27.273 286 174 8 381 637 73 353 3.65e-24 105
MsG0380017160.01.T01 AT1G70450 30.070 286 152 10 381 634 54 323 3.69e-24 105
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MsG0380017160.01.T01 AT2G47060 34.742 213 116 7 377 575 74 277 3.76e-24 104
MsG0380017160.01.T01 AT1G01540 32.432 222 135 8 364 575 137 353 3.93e-24 105
MsG0380017160.01.T01 AT2G19130 27.586 290 185 6 371 640 488 772 4.06e-24 108
MsG0380017160.01.T01 AT1G70110 29.123 285 166 12 380 640 348 620 4.16e-24 107
MsG0380017160.01.T01 AT1G07870 29.210 291 175 11 365 631 87 370 4.33e-24 105
MsG0380017160.01.T01 AT4G23240 29.562 274 165 10 382 634 34 300 4.43e-24 104
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MsG0380017160.01.T01 AT3G59740 29.433 282 173 9 380 640 337 613 5.97e-24 107
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MsG0380017160.01.T01 AT4G11900 28.412 359 221 13 305 634 388 739 7.14e-24 107
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MsG0380017160.01.T01 AT5G38210 24.384 406 254 13 268 639 243 629 1.66e-23 106
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MsG0380017160.01.T01 AT1G56720 27.636 275 172 9 381 635 184 451 2.16e-23 104
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Find 184 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 280 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
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TAATCTCTCCACATAGATTA+GGG 0.360757 3:+92796464 None:intergenic
AATCAAAGAGATTGTACTCT+TGG 0.365228 3:-92794065 MsG0380017160.01.T01:CDS
ATAATCTCTCCACATAGATT+AGG 0.365567 3:+92796463 None:intergenic
CTATTAGGAAGAGGGTGTTT+AGG 0.366446 3:-92796013 MsG0380017160.01.T01:CDS
ATCCGAATTTAGTTGCGGTT+AGG 0.369916 3:-92795859 MsG0380017160.01.T01:CDS
CAAGCCTAATAAAGGAAGTT+AGG 0.373105 3:+92793834 None:intergenic
CAGAATGGATATGCTTCTTC+AGG 0.374420 3:-92794161 MsG0380017160.01.T01:CDS
CCGCAGAACCTTTCATCAAT+TGG 0.374553 3:+92796038 None:intergenic
GCCCTAACCGCAACTAAATT+CGG 0.381100 3:+92795857 None:intergenic
AACCAGAGTGCAAAGGTTCA+TGG 0.382502 3:-92796376 MsG0380017160.01.T01:CDS
TCCGAATTTAGTTGCGGTTA+GGG 0.383648 3:-92795858 MsG0380017160.01.T01:CDS
AGGATCTGAGAGAGAGGGTT+TGG 0.383654 3:+92797047 None:intergenic
GATCGTAGAGCGGTGATAAT+CGG 0.387394 3:-92796322 MsG0380017160.01.T01:CDS
ATATGCATAAACGTCGGATT+TGG 0.391026 3:+92794303 None:intergenic
CAACCAGACAAGCCTAATAA+AGG 0.401301 3:+92793826 None:intergenic
CCAAAACCCCATTCTGCAAC+TGG 0.405309 3:-92796966 MsG0380017160.01.T01:CDS
TGATTTGGATTGCGAGTCTC+CGG 0.406511 3:+92794337 None:intergenic
GTGACGCAAGCTTCGAAATC+AGG 0.408924 3:+92794433 None:intergenic
TGTTATAGAAGGAGGATAGA+AGG 0.420018 3:-92793972 MsG0380017160.01.T01:three_prime_UTR
CTCGATAATAACTACTTCAC+TGG 0.427226 3:-92796754 MsG0380017160.01.T01:CDS
ATCTATGATTATCAGCCTAA+TGG 0.427812 3:-92795803 MsG0380017160.01.T01:CDS
CCAACCGTCGGAGGCGTTGC+CGG 0.431309 3:+92796403 None:intergenic
TACACGGAGTTGGTCGAGAT+TGG 0.432813 3:+92796852 None:intergenic
GTTGAAGAGACCGTAGAGAT+TGG 0.433150 3:+92796792 None:intergenic
AATGGGTGGGCATGTTAGTA+AGG 0.433951 3:-92795924 MsG0380017160.01.T01:CDS
ATCTATGTGGAGAGATTATC+CGG 0.448039 3:-92796459 MsG0380017160.01.T01:CDS
TTCCGACACGGCGGCGGCGA+CGG 0.450449 3:-92796188 MsG0380017160.01.T01:CDS
AAATCCGACGTTTATGCATA+TGG 0.451140 3:-92794301 MsG0380017160.01.T01:CDS
CACCGTCGCCGCCGCCGTGT+CGG 0.453377 3:+92796186 None:intergenic
GACAAAAGAGTAGTATGAAC+TGG 0.459145 3:-92793950 MsG0380017160.01.T01:three_prime_UTR
TAGATAATGTACCGTGTATG+AGG 0.460161 3:+92795768 None:intergenic
TTCAAGACCTGCCACATTGT+GGG 0.460176 3:+92794100 None:intergenic
TTCTCTCATAACAATCTCTC+TGG 0.462010 3:-92796682 MsG0380017160.01.T01:CDS
TGCATAAACGTCGGATTTGG+TGG 0.467338 3:+92794306 None:intergenic
GATTTGGATTGCGAGTCTCC+GGG 0.468378 3:+92794338 None:intergenic
ACACCTTGCCAGTTGCAGAA+TGG 0.468902 3:+92796958 None:intergenic
CATGGACCAGTCTCCATGCC+TGG 0.471804 3:+92794488 None:intergenic
CAAAGAGATTGTACTCTTGG+AGG 0.479305 3:-92794062 MsG0380017160.01.T01:CDS
TTGAAGAGACCGTAGAGATT+GGG 0.484287 3:+92796793 None:intergenic
CCGGCAACGCCTCCGACGGT+TGG 0.484558 3:-92796403 MsG0380017160.01.T01:CDS
CGTCTTGATTGTGGGAAAAT+GGG 0.485112 3:-92795941 MsG0380017160.01.T01:CDS
TGCTCCGGCAACGCCTCCGA+CGG 0.486969 3:-92796407 MsG0380017160.01.T01:CDS
GGGTTTAAAGCAAAAGAAGA+AGG 0.488999 3:+92796484 None:intergenic
CAAAGGTTCATGGATTAATC+CGG 0.490941 3:-92796366 MsG0380017160.01.T01:CDS
TATCGAGAAAGAGTGATTTG+AGG 0.492930 3:+92796770 None:intergenic
GATTGGAGAGTGTATGAGAA+GGG 0.493859 3:+92796869 None:intergenic
ATATCACCAGGAACCATGAA+TGG 0.497401 3:+92794232 None:intergenic
TTGATCGTCTCTACTATCTT+CGG 0.498398 3:-92796633 MsG0380017160.01.T01:CDS
CAGTGAAGCGTCTTGATTGT+GGG 0.498706 3:-92795949 MsG0380017160.01.T01:CDS
GGATGTAGGATCTGAGAGAG+AGG 0.501675 3:+92797041 None:intergenic
GGAAGCCATCACACTCGATC+CGG 0.501676 3:+92796207 None:intergenic
GTAGAGATTGGGTATCGTTC+CGG 0.501809 3:+92796804 None:intergenic
TTGAATGCTAAGAGGGATGT+AGG 0.502817 3:+92797027 None:intergenic
ACTTTCTCTAGCGTGTTTCG+CGG 0.503899 3:-92796272 MsG0380017160.01.T01:CDS
ATCCATGAACCTTTGCACTC+TGG 0.506773 3:+92796374 None:intergenic
GCTTTAAACCCTAATCTATG+TGG 0.508725 3:-92796472 MsG0380017160.01.T01:CDS
TTTGGGTATGTTATAGAAGG+AGG 0.513160 3:-92793980 MsG0380017160.01.T01:three_prime_UTR
AAGCATGAGGTCCAATGTAA+TGG 0.513431 3:+92794553 None:intergenic
CTGCAGGTTCCAGGTCAAGT+AGG 0.515595 3:-92794582 MsG0380017160.01.T01:intron
CATCCACCAGGCATGGAGAC+TGG 0.516702 3:-92794494 MsG0380017160.01.T01:CDS
ATTCTGTGCGGGTGAGTCGC+AGG 0.518707 3:-92796074 MsG0380017160.01.T01:CDS
GCAGAGGCCCACAATGTGGC+AGG 0.519118 3:-92794107 MsG0380017160.01.T01:CDS
CCATCTACCTTTGACGAGGT+TGG 0.519309 3:-92794382 MsG0380017160.01.T01:CDS
TAAACGTCGGATTTGGTGGT+TGG 0.523422 3:+92794310 None:intergenic
AAGCTTCGAAATCAGGTCCT+AGG 0.523555 3:+92794440 None:intergenic
CGACACGGCGGCGGCGACGG+TGG 0.525308 3:-92796185 MsG0380017160.01.T01:CDS
ATTGGGTATCGTTCCGGTGA+GGG 0.525649 3:+92796810 None:intergenic
AAGTCGACCAATGTTCTCCT+AGG 0.534549 3:-92794457 MsG0380017160.01.T01:CDS
TGCACCGGAGAGATTGTTAC+CGG 0.535033 3:+92796540 None:intergenic
TCTCCATGCCTGGTGGATGT+AGG 0.537406 3:+92794498 None:intergenic
GCTTCACTGTTACAATCAAA+CGG 0.539293 3:+92795963 None:intergenic
TCCTGGTGATATGTCAAAAT+GGG 0.540728 3:-92794221 MsG0380017160.01.T01:CDS
TGGCCTTGCCCTACTTGACC+TGG 0.547665 3:+92794573 None:intergenic
GATGGCTTCCGACACGGCGG+CGG 0.548779 3:-92796194 MsG0380017160.01.T01:CDS
GATCTATCAGGGATGACAAT+GGG 0.550843 3:-92794195 MsG0380017160.01.T01:CDS
CTGAAAACGCGACAAGGCAG+TGG 0.550977 3:+92796507 None:intergenic
CTTTGAATGTTGATAGAATG+TGG 0.550992 3:-92793863 MsG0380017160.01.T01:three_prime_UTR
TGGTCGACTTGAGATTTCCA+TGG 0.553121 3:+92794470 None:intergenic
CTCGTCAAAGGTAGATGGGT+TGG 0.553558 3:+92794387 None:intergenic
TCTTCACAGACTTAAAACAT+TGG 0.553604 3:-92796707 MsG0380017160.01.T01:CDS
GAGCGTCACATGGAATCAGT+TGG 0.553994 3:-92795893 MsG0380017160.01.T01:CDS
AGGGAGAAGAGACTTCCATT+AGG 0.555328 3:+92795788 None:intergenic
GGCGGCGACGGTGGAAGAAG+CGG 0.555524 3:-92796176 MsG0380017160.01.T01:CDS
CTTCAAGACCTGCCACATTG+TGG 0.555668 3:+92794099 None:intergenic
TGCAGGTTCCAGGTCAAGTA+GGG 0.557859 3:-92794581 MsG0380017160.01.T01:intron
AGAAGCGGTGGTGATGCAAA+TGG 0.561562 3:-92796161 MsG0380017160.01.T01:CDS
CAGGCATGGAGACTGGTCCA+TGG 0.562297 3:-92794487 MsG0380017160.01.T01:CDS
GGGAGTTTAATATTCTGTGC+GGG 0.565196 3:-92796085 MsG0380017160.01.T01:CDS
ATGGGTTGGTCAACACAGAC+AGG 0.565303 3:+92794401 None:intergenic
AGATTGGAGAGTGTATGAGA+AGG 0.565693 3:+92796868 None:intergenic
CAACCTCGTCAAAGGTAGAT+GGG 0.566021 3:+92794383 None:intergenic
AGAGCGCAAGTTGCAAAGAG+TGG 0.566712 3:-92796106 MsG0380017160.01.T01:CDS
CTTGATTGTGGGAAAATGGG+TGG 0.567212 3:-92795938 MsG0380017160.01.T01:CDS
GAGCGCAAGTTGCAAAGAGT+GGG 0.567406 3:-92796105 MsG0380017160.01.T01:CDS
TTCTGCACCTTATAGAGCCC+CGG 0.570047 3:-92794356 MsG0380017160.01.T01:CDS
GTAGGGCAAGGCCATTACAT+TGG 0.576189 3:-92794564 MsG0380017160.01.T01:CDS
TCTGCGGAGCTATTAGGAAG+AGG 0.577240 3:-92796022 MsG0380017160.01.T01:CDS
ACCCCATTCTGCAACTGGCA+AGG 0.577261 3:-92796961 MsG0380017160.01.T01:CDS
GATGTAGGATCTGAGAGAGA+GGG 0.578111 3:+92797042 None:intergenic
AGTGGTTAACGGAACTGCAC+CGG 0.580873 3:+92796525 None:intergenic
TTACAGAACAACTCCCTCAC+CGG 0.581845 3:-92796823 MsG0380017160.01.T01:CDS
GTTTCCGGTAACAATCTCTC+CGG 0.585120 3:-92796544 MsG0380017160.01.T01:CDS
TTTGAATGTTGATAGAATGT+GGG 0.586551 3:-92793862 MsG0380017160.01.T01:three_prime_UTR
ACCTTGCCAGTTGCAGAATG+GGG 0.596520 3:+92796960 None:intergenic
AGAAGGCTGAAAACGCGACA+AGG 0.596600 3:+92796501 None:intergenic
TTAAGCTTCAACTCTTTCAA+CGG 0.597616 3:-92796610 MsG0380017160.01.T01:CDS
AGAGAAGATTGATTAAACGG+AGG 0.597902 3:+92796580 None:intergenic
TAGATGGACGACATTCTCTC+CGG 0.598082 3:+92796440 None:intergenic
TTTCCTACATCCACCAGGCA+TGG 0.599414 3:-92794501 MsG0380017160.01.T01:CDS
CTGCGGAGCTATTAGGAAGA+GGG 0.601411 3:-92796021 MsG0380017160.01.T01:CDS
GTAAACTGAGTACACGGAGT+TGG 0.601463 3:+92796842 None:intergenic
AACTTCCGGATCGAGTGTGA+TGG 0.602696 3:-92796212 MsG0380017160.01.T01:CDS
AGATGATGAAAGTGTTTGAG+TGG 0.603733 3:+92797136 None:intergenic
AGATAATGTACCGTGTATGA+GGG 0.605439 3:+92795769 None:intergenic
AGAATCACCAACCTCGTCAA+AGG 0.605616 3:+92794375 None:intergenic
CGTCACATGGAATCAGTTGG+TGG 0.606247 3:-92795890 MsG0380017160.01.T01:CDS
TTGATTGTGGGAAAATGGGT+GGG 0.607334 3:-92795937 MsG0380017160.01.T01:CDS
TCGTCATCCGAATTTAGTTG+CGG 0.608099 3:-92795864 MsG0380017160.01.T01:CDS
CTCCGCAACTTAGATCTCGC+CGG 0.608460 3:-92796898 MsG0380017160.01.T01:CDS
ACTCTTGGAGGATAGTGAGT+TGG 0.609573 3:-92794050 MsG0380017160.01.T01:CDS
GAGTGTGATGGCTTCCGACA+CGG 0.612529 3:-92796200 MsG0380017160.01.T01:CDS
GGCGACGGTGGAAGAAGCGG+TGG 0.613950 3:-92796173 MsG0380017160.01.T01:CDS
TCAACGTTGATAAAATGTGT+AGG 0.614241 3:+92796652 None:intergenic
ACGCTGGACCAATTGATGAA+AGG 0.615860 3:-92796046 MsG0380017160.01.T01:CDS
AGATCTATCAGGGATGACAA+TGG 0.616040 3:-92794196 MsG0380017160.01.T01:CDS
AATGGATATGCTTCTTCAGG+TGG 0.616332 3:-92794158 MsG0380017160.01.T01:CDS
TGGACTTAACCAGAGTGCAA+AGG 0.617721 3:-92796383 MsG0380017160.01.T01:CDS
AAAATGGGTGAGATCTATCA+GGG 0.620843 3:-92794206 MsG0380017160.01.T01:CDS
ATCAGGTCCTAGGAGAACAT+TGG 0.621054 3:+92794450 None:intergenic
ATAGCAGAGGACGTAGCACA+AGG 0.625060 3:-92794526 MsG0380017160.01.T01:CDS
TGGGAGCGAAGATAACAGAA+TGG 0.627206 3:-92794176 MsG0380017160.01.T01:CDS
ACAGTGAAGCGTCTTGATTG+TGG 0.632837 3:-92795950 MsG0380017160.01.T01:CDS
TTTAGGAACAACTTATAAAG+CGG 0.633188 3:-92795996 MsG0380017160.01.T01:CDS
CGATGGCATTACTACTACGT+AGG 0.634187 3:+92794026 None:intergenic
CACCGGCGAGATCTAAGTTG+CGG 0.637168 3:+92796896 None:intergenic
AGTCTCTTCTCCCTCATACA+CGG 0.639936 3:-92795779 MsG0380017160.01.T01:intron
CCAATTGATGAAAGGTTCTG+CGG 0.641050 3:-92796038 MsG0380017160.01.T01:CDS
GGACCAGTCTCCATGCCTGG+TGG 0.641206 3:+92794491 None:intergenic
GATTGGGTATCGTTCCGGTG+AGG 0.641749 3:+92796809 None:intergenic
CAACCCATCTACCTTTGACG+AGG 0.642698 3:-92794386 MsG0380017160.01.T01:CDS
GTTCCAGGTCAAGTAGGGCA+AGG 0.644794 3:-92794576 MsG0380017160.01.T01:CDS
GGAACGATACCCAATCTCTA+CGG 0.646182 3:-92796802 MsG0380017160.01.T01:CDS
GTGTAAAACAATTAAGAGTG+AGG 0.646670 3:-92793928 MsG0380017160.01.T01:three_prime_UTR
AGAATACTAAGACATGGCGA+TGG 0.657360 3:+92794009 None:intergenic
ATTTGGATTGCGAGTCTCCG+GGG 0.660235 3:+92794339 None:intergenic
TGAGTCGCAGGTGTATACGC+TGG 0.661497 3:-92796062 MsG0380017160.01.T01:CDS
GCTTGATCTCTCCAGAGCAG+AGG 0.662929 3:-92794123 MsG0380017160.01.T01:CDS
CTCTGGTTAAGTCCAACCGT+CGG 0.664512 3:+92796391 None:intergenic
TTGAATGTTGATAGAATGTG+GGG 0.665609 3:-92793861 MsG0380017160.01.T01:three_prime_UTR
TGGGAGTTTAATATTCTGTG+CGG 0.666180 3:-92796086 MsG0380017160.01.T01:CDS
CAGAGCAGAGGCCCACAATG+TGG 0.666435 3:-92794111 MsG0380017160.01.T01:CDS
TGTTCTGTAAACTGAGTACA+CGG 0.668660 3:+92796836 None:intergenic
TGGTTAAGTCCAACCGTCGG+AGG 0.668970 3:+92796394 None:intergenic
TAGCAGAGGACGTAGCACAA+GGG 0.677474 3:-92794525 MsG0380017160.01.T01:CDS
CTCATGCTTGAAAATAGCAG+AGG 0.678964 3:-92794539 MsG0380017160.01.T01:CDS
AACAAAAGAATACTAAGACA+TGG 0.680879 3:+92794003 None:intergenic
AGGGCTTTCCTACATCCACC+AGG 0.681813 3:-92794506 MsG0380017160.01.T01:CDS
AATACCATATGCATAAACGT+CGG 0.701877 3:+92794297 None:intergenic
ATAAGGGTCAGGACTCTGTG+AGG 0.706864 3:+92793791 None:intergenic
TGTGATGGCTTCCGACACGG+CGG 0.724721 3:-92796197 MsG0380017160.01.T01:CDS
TGTATGAGAAGGGAAAACAC+CGG 0.772236 3:+92796879 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! TGATGATCTAATTTATTTTA+AGG - Chr3:92795578-92795597 MsG0380017160.01.T01:intron 15.0%
!! AAAAAAACTAAGTCTGAATT+AGG + Chr3:92796093-92796112 None:intergenic 20.0%
!! AATAATAGTGACTTGATATT+TGG - Chr3:92795427-92795446 MsG0380017160.01.T01:intron 20.0%
!!! AGCCTTTTTAAATAGAATAA+GGG + Chr3:92797049-92797068 None:intergenic 20.0%
!!! ATTTTAAGGTATAAGATAGT+AGG - Chr3:92795592-92795611 MsG0380017160.01.T01:intron 20.0%
!!! CTTAGTATTCTTTTGTTTTT+GGG - Chr3:92796824-92796843 MsG0380017160.01.T01:CDS 20.0%
!!! TAGCCTTTTTAAATAGAATA+AGG + Chr3:92797050-92797069 None:intergenic 20.0%
!!! TATTCATACTATTGTGTTTT+TGG - Chr3:92795348-92795367 MsG0380017160.01.T01:intron 20.0%
!!! TCTTAGTATTCTTTTGTTTT+TGG - Chr3:92796823-92796842 MsG0380017160.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTAAATCAACTGCATTATTT+TGG - Chr3:92795825-92795844 MsG0380017160.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTAGTTGATATAAAGAGAA+GGG - Chr3:92795377-92795396 MsG0380017160.01.T01:intron 20.0%
! AAAAATCTAATCTTGTCCTT+TGG - Chr3:92795906-92795925 MsG0380017160.01.T01:CDS 25.0%
! AAAATCTAATCTTGTCCTTT+GGG - Chr3:92795907-92795926 MsG0380017160.01.T01:CDS 25.0%
! AAACTATCTTATGTTATGAC+TGG - Chr3:92795668-92795687 MsG0380017160.01.T01:intron 25.0%
! AAAGAAACAGAGAAAGAAAA+AGG - Chr3:92794579-92794598 MsG0380017160.01.T01:CDS 25.0%
! AAATTATGAGTATGTTCAAG+TGG - Chr3:92795978-92795997 MsG0380017160.01.T01:CDS 25.0%
! AACAAAAGAATACTAAGACA+TGG + Chr3:92796821-92796840 None:intergenic 25.0%
! AAGAAACAGAGAAAGAAAAA+GGG - Chr3:92794580-92794599 MsG0380017160.01.T01:intron 25.0%
! AAGTGCATTCATTATATAGT+AGG - Chr3:92795325-92795344 MsG0380017160.01.T01:intron 25.0%
! GACCCTTATTCTATTTAAAA+AGG - Chr3:92797044-92797063 MsG0380017160.01.T01:CDS 25.0%
! GGAAATAGTTGTTAATTAGT+TGG - Chr3:92795689-92795708 MsG0380017160.01.T01:intron 25.0%
! TGAAGAGAGAAAATAGAAAA+TGG + Chr3:92794100-92794119 None:intergenic 25.0%
! TGTTGACACATTAATTTCTA+AGG - Chr3:92795248-92795267 MsG0380017160.01.T01:intron 25.0%
! TTGAGAGAAGATTGATTAAA+CGG + Chr3:92794247-92794266 None:intergenic 25.0%
! TTTAGGAACAACTTATAAAG+CGG - Chr3:92794825-92794844 MsG0380017160.01.T01:intron 25.0%
!! AATTTTACTCTGACTTCAAT+TGG + Chr3:92795205-92795224 None:intergenic 25.0%
!! GAATTTAGATTTTAGATTGG+AGG - Chr3:92795731-92795750 MsG0380017160.01.T01:intron 25.0%
!! GCTGAATTTAGATTTTAGAT+TGG - Chr3:92795728-92795747 MsG0380017160.01.T01:intron 25.0%
!! GTTTAGTTGATATAAAGAGA+AGG - Chr3:92795376-92795395 MsG0380017160.01.T01:intron 25.0%
!! TTTGAATGTTGATAGAATGT+GGG - Chr3:92796959-92796978 MsG0380017160.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTTAAATAGAATAAGGGTC+AGG + Chr3:92797044-92797063 None:intergenic 25.0%
!!! GTTAGCAAGCAATTATTTTA+AGG - Chr3:92797086-92797105 MsG0380017160.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTTGATTTGAATGCTAAGA+GGG + Chr3:92793804-92793823 None:intergenic 25.0%
AAAAAGGCTATATCTGTTGA+GGG - Chr3:92797060-92797079 MsG0380017160.01.T01:CDS 30.0%
AAAGAAAAATGATCGTAGAG+CGG - Chr3:92794489-92794508 MsG0380017160.01.T01:CDS 30.0%
AATACCATATGCATAAACGT+CGG + Chr3:92796527-92796546 None:intergenic 30.0%
AATCAAAGAGATTGTACTCT+TGG - Chr3:92796756-92796775 MsG0380017160.01.T01:CDS 30.0%
ATAATCTCTCCACATAGATT+AGG + Chr3:92794361-92794380 None:intergenic 30.0%
ATCCAATGATCGACTAATAT+CGG - Chr3:92795130-92795149 MsG0380017160.01.T01:intron 30.0%
ATCTATGATTATCAGCCTAA+TGG - Chr3:92795018-92795037 MsG0380017160.01.T01:intron 30.0%
CTCAATTCTTCTTTCAGATT+CGG - Chr3:92797109-92797128 MsG0380017160.01.T01:CDS 30.0%
GAATCATAATCACTCCAATT+AGG + Chr3:92796148-92796167 None:intergenic 30.0%
GGTAGTTGATTAATACAGTT+TGG + Chr3:92796039-92796058 None:intergenic 30.0%
GTGTAAAACAATTAAGAGTG+AGG - Chr3:92796893-92796912 MsG0380017160.01.T01:CDS 30.0%
GTGTCAACAATTTATGTGTT+GGG + Chr3:92795237-92795256 None:intergenic 30.0%
TAAAAAGGCTATATCTGTTG+AGG - Chr3:92797059-92797078 MsG0380017160.01.T01:CDS 30.0%
TAATCTCTCCACATAGATTA+GGG + Chr3:92794360-92794379 None:intergenic 30.0%
TCTTCACAGACTTAAAACAT+TGG - Chr3:92794114-92794133 MsG0380017160.01.T01:CDS 30.0%
TGTGTCAACAATTTATGTGT+TGG + Chr3:92795238-92795257 None:intergenic 30.0%
TTAAGCTTCAACTCTTTCAA+CGG - Chr3:92794211-92794230 MsG0380017160.01.T01:CDS 30.0%
! CTCAAAACTTTTGATGTTTC+CGG - Chr3:92794262-92794281 MsG0380017160.01.T01:CDS 30.0%
! CTTTGAATGTTGATAGAATG+TGG - Chr3:92796958-92796977 MsG0380017160.01.T01:CDS 30.0%
! TCAACGTTGATAAAATGTGT+AGG + Chr3:92794172-92794191 None:intergenic 30.0%
! TGATTTAAAACTCTTCACTC+AGG + Chr3:92795813-92795832 None:intergenic 30.0%
! TTGAATGTTGATAGAATGTG+GGG - Chr3:92796960-92796979 MsG0380017160.01.T01:CDS 30.0%
! TTGTTACTAGAGCTTTTAAC+TGG - Chr3:92796547-92796566 MsG0380017160.01.T01:CDS 30.0%
!! CGATCATTTTTCTTTGCATA+CGG + Chr3:92794484-92794503 None:intergenic 30.0%
!! GTTAATTGTTAATTTGCTGC+AGG - Chr3:92796223-92796242 MsG0380017160.01.T01:CDS 30.0%
!! TGTTACTAGAGCTTTTAACT+GGG - Chr3:92796548-92796567 MsG0380017160.01.T01:CDS 30.0%
!!! CTTTTGATTTGAATGCTAAG+AGG + Chr3:92793805-92793824 None:intergenic 30.0%
!!! GTTTTTGGGTATGTTATAGA+AGG - Chr3:92796838-92796857 MsG0380017160.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTTGGTTTTGTTGTTGAGTT+TGG + Chr3:92793759-92793778 None:intergenic 30.0%
AAAAAGGGTAAAGGAACTTC+CGG - Chr3:92794595-92794614 MsG0380017160.01.T01:intron 35.0%
AAAATGGGTGAGATCTATCA+GGG - Chr3:92796615-92796634 MsG0380017160.01.T01:CDS 35.0%
AAATCCGACGTTTATGCATA+TGG - Chr3:92796520-92796539 MsG0380017160.01.T01:CDS 35.0%
AGAGAAGATTGATTAAACGG+AGG + Chr3:92794244-92794263 None:intergenic 35.0%
AGATAATGTACCGTGTATGA+GGG + Chr3:92795055-92795074 None:intergenic 35.0%
ATAATCAACCAAGCACCTTT+GGG + Chr3:92795870-92795889 None:intergenic 35.0%
ATATGCATAAACGTCGGATT+TGG + Chr3:92796521-92796540 None:intergenic 35.0%
ATCACTCCAATTAGGAAAGA+AGG + Chr3:92796140-92796159 None:intergenic 35.0%
ATCTATGTGGAGAGATTATC+CGG - Chr3:92794362-92794381 MsG0380017160.01.T01:CDS 35.0%
CAAGCCTAATAAAGGAAGTT+AGG + Chr3:92796990-92797009 None:intergenic 35.0%
CAGAGAAAGAAAAAGGGTAA+AGG - Chr3:92794586-92794605 MsG0380017160.01.T01:intron 35.0%
CTCGATAATAACTACTTCAC+TGG - Chr3:92794067-92794086 MsG0380017160.01.T01:CDS 35.0%
GAATACTAGTGTTGTAGTCA+TGG + Chr3:92796060-92796079 None:intergenic 35.0%
GACAAAAGAGTAGTATGAAC+TGG - Chr3:92796871-92796890 MsG0380017160.01.T01:CDS 35.0%
GCTTCACTGTTACAATCAAA+CGG + Chr3:92794861-92794880 None:intergenic 35.0%
TAGATAATGTACCGTGTATG+AGG + Chr3:92795056-92795075 None:intergenic 35.0%
TATAATCAACCAAGCACCTT+TGG + Chr3:92795871-92795890 None:intergenic 35.0%
TATCGAGAAAGAGTGATTTG+AGG + Chr3:92794054-92794073 None:intergenic 35.0%
TCCAATGATCGACTAATATC+GGG - Chr3:92795131-92795150 MsG0380017160.01.T01:intron 35.0%
TCCTGGTGATATGTCAAAAT+GGG - Chr3:92796600-92796619 MsG0380017160.01.T01:CDS 35.0%
TCGTTATGACTCATCAATTC+TGG + Chr3:92795768-92795787 None:intergenic 35.0%
TGATGAGTCATAACGAAATC+TGG - Chr3:92795772-92795791 MsG0380017160.01.T01:intron 35.0%
TGCACCTAACTTCCTTTATT+AGG - Chr3:92796983-92797002 MsG0380017160.01.T01:CDS 35.0%
TGGGAGTTTAATATTCTGTG+CGG - Chr3:92794735-92794754 MsG0380017160.01.T01:intron 35.0%
TGTTATAGAAGGAGGATAGA+AGG - Chr3:92796849-92796868 MsG0380017160.01.T01:CDS 35.0%
TGTTCTGTAAACTGAGTACA+CGG + Chr3:92793988-92794007 None:intergenic 35.0%
TTACTCTGACTTCAATTGGA+TGG + Chr3:92795201-92795220 None:intergenic 35.0%
TTCAAGTGGTTAAATGAGAC+AGG - Chr3:92795992-92796011 MsG0380017160.01.T01:CDS 35.0%
TTCCTGGTGATATGTCAAAA+TGG - Chr3:92796599-92796618 MsG0380017160.01.T01:CDS 35.0%
TTCTCTCATAACAATCTCTC+TGG - Chr3:92794139-92794158 MsG0380017160.01.T01:CDS 35.0%
TTGATCGTCTCTACTATCTT+CGG - Chr3:92794188-92794207 MsG0380017160.01.T01:CDS 35.0%
TTTAGATTGGAGGTGATGAT+AGG - Chr3:92795741-92795760 MsG0380017160.01.T01:intron 35.0%
TTTGGGTATGTTATAGAAGG+AGG - Chr3:92796841-92796860 MsG0380017160.01.T01:CDS 35.0%
! CAAAGGTTCATGGATTAATC+CGG - Chr3:92794455-92794474 MsG0380017160.01.T01:CDS 35.0%
! CAATTAGGAAAGAAGGTACA+GGG + Chr3:92796133-92796152 None:intergenic 35.0%
! GCTTTAAACCCTAATCTATG+TGG - Chr3:92794349-92794368 MsG0380017160.01.T01:CDS 35.0%
! GGGTTTAAAGCAAAAGAAGA+AGG + Chr3:92794340-92794359 None:intergenic 35.0%
! GTGATAATCGGATTTTCAAC+TGG - Chr3:92794511-92794530 MsG0380017160.01.T01:CDS 35.0%
!! AGATGATGAAAGTGTTTGAG+TGG + Chr3:92793688-92793707 None:intergenic 35.0%
!! ATTTTCAGGCTAATCAAGAG+AGG - Chr3:92794989-92795008 MsG0380017160.01.T01:intron 35.0%
!! TTGATATTTGGTTTGTAGCG+TGG - Chr3:92795439-92795458 MsG0380017160.01.T01:intron 35.0%
!!! TTATTTTGGCTGTACACATG+AGG - Chr3:92795839-92795858 MsG0380017160.01.T01:CDS 35.0%
AAACTCTTCACTCAGGAATC+AGG + Chr3:92795806-92795825 None:intergenic 40.0%
AAGCATGAGGTCCAATGTAA+TGG + Chr3:92796271-92796290 None:intergenic 40.0%
AATGGATATGCTTCTTCAGG+TGG - Chr3:92796663-92796682 MsG0380017160.01.T01:CDS 40.0%
AGAATACTAAGACATGGCGA+TGG + Chr3:92796815-92796834 None:intergenic 40.0%
AGATCTATCAGGGATGACAA+TGG - Chr3:92796625-92796644 MsG0380017160.01.T01:CDS 40.0%
ATAGTCAGCAGCAAGATTCT+CGG + Chr3:92795529-92795548 None:intergenic 40.0%
ATATCACCAGGAACCATGAA+TGG + Chr3:92796592-92796611 None:intergenic 40.0%
ATCCGAATTTAGTTGCGGTT+AGG - Chr3:92794962-92794981 MsG0380017160.01.T01:intron 40.0%
CAAAATGGGTGAGATCTATC+AGG - Chr3:92796614-92796633 MsG0380017160.01.T01:CDS 40.0%
CAAAGAGATTGTACTCTTGG+AGG - Chr3:92796759-92796778 MsG0380017160.01.T01:CDS 40.0%
CAACCAGACAAGCCTAATAA+AGG + Chr3:92796998-92797017 None:intergenic 40.0%
CAGAATGGATATGCTTCTTC+AGG - Chr3:92796660-92796679 MsG0380017160.01.T01:CDS 40.0%
CCAATTGATGAAAGGTTCTG+CGG - Chr3:92794783-92794802 MsG0380017160.01.T01:intron 40.0%
CCTGTACCTTCTTTCCTAAT+TGG - Chr3:92796131-92796150 MsG0380017160.01.T01:CDS 40.0%
CGTCTTGATTGTGGGAAAAT+GGG - Chr3:92794880-92794899 MsG0380017160.01.T01:intron 40.0%
CTCATGCTTGAAAATAGCAG+AGG - Chr3:92796282-92796301 MsG0380017160.01.T01:CDS 40.0%
CTGACTTCAATTGGATGGTT+TGG + Chr3:92795196-92795215 None:intergenic 40.0%
CTTCCTTTATTAGGCTTGTC+TGG - Chr3:92796992-92797011 MsG0380017160.01.T01:CDS 40.0%
GATCTATCAGGGATGACAAT+GGG - Chr3:92796626-92796645 MsG0380017160.01.T01:CDS 40.0%
GGGAGTTTAATATTCTGTGC+GGG - Chr3:92794736-92794755 MsG0380017160.01.T01:intron 40.0%
TCCCGATATTAGTCGATCAT+TGG + Chr3:92795135-92795154 None:intergenic 40.0%
TCCGAATTTAGTTGCGGTTA+GGG - Chr3:92794963-92794982 MsG0380017160.01.T01:intron 40.0%
TCGTCATCCGAATTTAGTTG+CGG - Chr3:92794957-92794976 MsG0380017160.01.T01:intron 40.0%
TGAAGTTGAGGTGGTTGTTT+GGG + Chr3:92793832-92793851 None:intergenic 40.0%
TGGTTAAATGAGACAGGTCA+TGG - Chr3:92795998-92796017 MsG0380017160.01.T01:CDS 40.0%
TGTATGAGAAGGGAAAACAC+CGG + Chr3:92793945-92793964 None:intergenic 40.0%
TTGAAGAGACCGTAGAGATT+GGG + Chr3:92794031-92794050 None:intergenic 40.0%
TTGAATGCTAAGAGGGATGT+AGG + Chr3:92793797-92793816 None:intergenic 40.0%
TTGATTGTGGGAAAATGGGT+GGG - Chr3:92794884-92794903 MsG0380017160.01.T01:intron 40.0%
! AGATTGGAGAGTGTATGAGA+AGG + Chr3:92793956-92793975 None:intergenic 40.0%
! CCAATTAGGAAAGAAGGTAC+AGG + Chr3:92796134-92796153 None:intergenic 40.0%
! CTGCTGACTATAGTTAGACT+AGG - Chr3:92795538-92795557 MsG0380017160.01.T01:intron 40.0%
! GATTGGAGAGTGTATGAGAA+GGG + Chr3:92793955-92793974 None:intergenic 40.0%
!! ACCCATTTTGACATATCACC+AGG + Chr3:92796604-92796623 None:intergenic 40.0%
!! CTATTAGGAAGAGGGTGTTT+AGG - Chr3:92794808-92794827 MsG0380017160.01.T01:intron 40.0%
!! GGTTGATTATAGCTTGCTGT+TGG - Chr3:92795880-92795899 MsG0380017160.01.T01:CDS 40.0%
!! TTGGATGGTTTGGTTCACTA+AGG + Chr3:92795186-92795205 None:intergenic 40.0%
!! TTTTGGTTGTGAAGTTGAGG+TGG + Chr3:92793841-92793860 None:intergenic 40.0%
!!! CTCTGCTATTTTCAAGCATG+AGG + Chr3:92796284-92796303 None:intergenic 40.0%
AAAGGTTCTGCGGAGCTATT+AGG - Chr3:92794793-92794812 MsG0380017160.01.T01:intron 45.0%
AACCAGAGTGCAAAGGTTCA+TGG - Chr3:92794445-92794464 MsG0380017160.01.T01:CDS 45.0%
AAGCTTCGAAATCAGGTCCT+AGG + Chr3:92796384-92796403 None:intergenic 45.0%
AAGTCGACCAATGTTCTCCT+AGG - Chr3:92796364-92796383 MsG0380017160.01.T01:CDS 45.0%
AATGGGTGGGCATGTTAGTA+AGG - Chr3:92794897-92794916 MsG0380017160.01.T01:intron 45.0%
ACGCTGGACCAATTGATGAA+AGG - Chr3:92794775-92794794 MsG0380017160.01.T01:intron 45.0%
ACTCTTGGAGGATAGTGAGT+TGG - Chr3:92796771-92796790 MsG0380017160.01.T01:CDS 45.0%
ACTTTCTCTAGCGTGTTTCG+CGG - Chr3:92794549-92794568 MsG0380017160.01.T01:CDS 45.0%
AGAATCACCAACCTCGTCAA+AGG + Chr3:92796449-92796468 None:intergenic 45.0%
AGAGAAGGGAAATGCTAACG+TGG - Chr3:92795391-92795410 MsG0380017160.01.T01:intron 45.0%
AGGGAGAAGAGACTTCCATT+AGG + Chr3:92795036-92795055 None:intergenic 45.0%
AGTCTCTTCTCCCTCATACA+CGG - Chr3:92795042-92795061 MsG0380017160.01.T01:intron 45.0%
ATCAGGTCCTAGGAGAACAT+TGG + Chr3:92796374-92796393 None:intergenic 45.0%
ATCCATGAACCTTTGCACTC+TGG + Chr3:92794450-92794469 None:intergenic 45.0%
CAACCTCGTCAAAGGTAGAT+GGG + Chr3:92796441-92796460 None:intergenic 45.0%
CCGCAGAACCTTTCATCAAT+TGG + Chr3:92794786-92794805 None:intergenic 45.0%
CGATGGCATTACTACTACGT+AGG + Chr3:92796798-92796817 None:intergenic 45.0%
CTTGATTGTGGGAAAATGGG+TGG - Chr3:92794883-92794902 MsG0380017160.01.T01:intron 45.0%
GATCGTAGAGCGGTGATAAT+CGG - Chr3:92794499-92794518 MsG0380017160.01.T01:CDS 45.0%
GATGTAGGATCTGAGAGAGA+GGG + Chr3:92793782-92793801 None:intergenic 45.0%
GCCCTAACCGCAACTAAATT+CGG + Chr3:92794967-92794986 None:intergenic 45.0%
GCGTCTTGATTGTGGGAAAA+TGG - Chr3:92794879-92794898 MsG0380017160.01.T01:intron 45.0%
GGAACGATACCCAATCTCTA+CGG - Chr3:92794019-92794038 MsG0380017160.01.T01:CDS 45.0%
GTAAACTGAGTACACGGAGT+TGG + Chr3:92793982-92794001 None:intergenic 45.0%
GTGAAGTTGAGGTGGTTGTT+TGG + Chr3:92793833-92793852 None:intergenic 45.0%
GTTGAAGAGACCGTAGAGAT+TGG + Chr3:92794032-92794051 None:intergenic 45.0%
GTTTCCGGTAACAATCTCTC+CGG - Chr3:92794277-92794296 MsG0380017160.01.T01:CDS 45.0%
TAGATGGACGACATTCTCTC+CGG + Chr3:92794384-92794403 None:intergenic 45.0%
TGCATAAACGTCGGATTTGG+TGG + Chr3:92796518-92796537 None:intergenic 45.0%
TGCTTCTGAGCTTCCATTCA+TGG - Chr3:92796576-92796595 MsG0380017160.01.T01:CDS 45.0%
TGGACTTAACCAGAGTGCAA+AGG - Chr3:92794438-92794457 MsG0380017160.01.T01:CDS 45.0%
TGGGAGCGAAGATAACAGAA+TGG - Chr3:92796645-92796664 MsG0380017160.01.T01:CDS 45.0%
TGTATGCAGCAGAGATGGTA+GGG + Chr3:92795935-92795954 None:intergenic 45.0%
TTACAGAACAACTCCCTCAC+CGG - Chr3:92793998-92794017 MsG0380017160.01.T01:exon 45.0%
TTCAAGACCTGCCACATTGT+GGG + Chr3:92796724-92796743 None:intergenic 45.0%
! ACAGTGAAGCGTCTTGATTG+TGG - Chr3:92794871-92794890 MsG0380017160.01.T01:intron 45.0%
! CAGTGAAGCGTCTTGATTGT+GGG - Chr3:92794872-92794891 MsG0380017160.01.T01:intron 45.0%
! GTAGAGATTGGGTATCGTTC+CGG + Chr3:92794020-92794039 None:intergenic 45.0%
! TGATTTGGATTGCGAGTCTC+CGG + Chr3:92796487-92796506 None:intergenic 45.0%
! TTGGTGGTTGGCTGATGATT+TGG + Chr3:92796502-92796521 None:intergenic 45.0%
! TTTTCTTTGCATACGGCTGC+CGG + Chr3:92794477-92794496 None:intergenic 45.0%
!! GGATGTTTTTGAGCGTCACA+TGG - Chr3:92794918-92794937 MsG0380017160.01.T01:intron 45.0%
!! GTTAATTTGCTGCAGGTTCC+AGG - Chr3:92796230-92796249 MsG0380017160.01.T01:CDS 45.0%
!! TAAACGTCGGATTTGGTGGT+TGG + Chr3:92796514-92796533 None:intergenic 45.0%
!! TGCGGTTAGGGCTTATTTTC+AGG - Chr3:92794975-92794994 MsG0380017160.01.T01:intron 45.0%
!! TGGTCGACTTGAGATTTCCA+TGG + Chr3:92796354-92796373 None:intergenic 45.0%
!! TTTTGGCTGTACACATGAGG+TGG - Chr3:92795842-92795861 MsG0380017160.01.T01:CDS 45.0%
!!! ATCTACGCCGTTTTTTGCTC+CGG - Chr3:92794399-92794418 MsG0380017160.01.T01:CDS 45.0%
!!! GGGTTTTGGTTGTGAAGTTG+AGG + Chr3:92793844-92793863 None:intergenic 45.0%
AACTTCCGGATCGAGTGTGA+TGG - Chr3:92794609-92794628 MsG0380017160.01.T01:intron 50.0%
ACACATGAGGTGGAACCCAA+AGG - Chr3:92795852-92795871 MsG0380017160.01.T01:CDS 50.0%
ACACCTTGCCAGTTGCAGAA+TGG + Chr3:92793866-92793885 None:intergenic 50.0%
ACCTTGCCAGTTGCAGAATG+GGG + Chr3:92793864-92793883 None:intergenic 50.0%
AGAAGGCTGAAAACGCGACA+AGG + Chr3:92794323-92794342 None:intergenic 50.0%
AGAGCGCAAGTTGCAAAGAG+TGG - Chr3:92794715-92794734 MsG0380017160.01.T01:intron 50.0%
AGCAGTGTATGCAGCAGAGA+TGG + Chr3:92795940-92795959 None:intergenic 50.0%
AGGATCTGAGAGAGAGGGTT+TGG + Chr3:92793777-92793796 None:intergenic 50.0%
AGTGGTTAACGGAACTGCAC+CGG + Chr3:92794299-92794318 None:intergenic 50.0%
ATAAGGGTCAGGACTCTGTG+AGG + Chr3:92797033-92797052 None:intergenic 50.0%
ATAGCAGAGGACGTAGCACA+AGG - Chr3:92796295-92796314 MsG0380017160.01.T01:CDS 50.0%
ATTTGGATTGCGAGTCTCCG+GGG + Chr3:92796485-92796504 None:intergenic 50.0%
CAACCCATCTACCTTTGACG+AGG - Chr3:92796435-92796454 MsG0380017160.01.T01:CDS 50.0%
CACCTTGCCAGTTGCAGAAT+GGG + Chr3:92793865-92793884 None:intergenic 50.0%
CCAAAACCCCATTCTGCAAC+TGG - Chr3:92793855-92793874 MsG0380017160.01.T01:three_prime_UTR 50.0%
CCAACCTCGTCAAAGGTAGA+TGG + Chr3:92796442-92796461 None:intergenic 50.0%
CCATCTACCTTTGACGAGGT+TGG - Chr3:92796439-92796458 MsG0380017160.01.T01:CDS 50.0%
CGTCACATGGAATCAGTTGG+TGG - Chr3:92794931-92794950 MsG0380017160.01.T01:intron 50.0%
CTCGTCAAAGGTAGATGGGT+TGG + Chr3:92796437-92796456 None:intergenic 50.0%
CTCTGGTTAAGTCCAACCGT+CGG + Chr3:92794433-92794452 None:intergenic 50.0%
CTGCGGAGCTATTAGGAAGA+GGG - Chr3:92794800-92794819 MsG0380017160.01.T01:intron 50.0%
CTTCAAGACCTGCCACATTG+TGG + Chr3:92796725-92796744 None:intergenic 50.0%
GAGCGCAAGTTGCAAAGAGT+GGG - Chr3:92794716-92794735 MsG0380017160.01.T01:intron 50.0%
GAGCGTCACATGGAATCAGT+TGG - Chr3:92794928-92794947 MsG0380017160.01.T01:intron 50.0%
GAGCTTCCATTCATGGTTCC+TGG - Chr3:92796583-92796602 MsG0380017160.01.T01:CDS 50.0%
GATTTGGATTGCGAGTCTCC+GGG + Chr3:92796486-92796505 None:intergenic 50.0%
GGAGCAAAAAACGGCGTAGA+TGG + Chr3:92794400-92794419 None:intergenic 50.0%
GGATGTAGGATCTGAGAGAG+AGG + Chr3:92793783-92793802 None:intergenic 50.0%
GTAGGGCAAGGCCATTACAT+TGG - Chr3:92796257-92796276 MsG0380017160.01.T01:CDS 50.0%
GTATGCAGCAGAGATGGTAG+GGG + Chr3:92795934-92795953 None:intergenic 50.0%
GTGACGCAAGCTTCGAAATC+AGG + Chr3:92796391-92796410 None:intergenic 50.0%
GTGTATGCAGCAGAGATGGT+AGG + Chr3:92795936-92795955 None:intergenic 50.0%
TAGCAGAGGACGTAGCACAA+GGG - Chr3:92796296-92796315 MsG0380017160.01.T01:CDS 50.0%
TCAATCCCAACATCCGCTAG+CGG - Chr3:92795157-92795176 MsG0380017160.01.T01:intron 50.0%
TCTGCGGAGCTATTAGGAAG+AGG - Chr3:92794799-92794818 MsG0380017160.01.T01:intron 50.0%
TGCACCGGAGAGATTGTTAC+CGG + Chr3:92794284-92794303 None:intergenic 50.0%
TGCAGGTTCCAGGTCAAGTA+GGG - Chr3:92796240-92796259 MsG0380017160.01.T01:CDS 50.0%
TTCTGCACCTTATAGAGCCC+CGG - Chr3:92796465-92796484 MsG0380017160.01.T01:CDS 50.0%
TTTCCTACATCCACCAGGCA+TGG - Chr3:92796320-92796339 MsG0380017160.01.T01:CDS 50.0%
! AGAAGCGGTGGTGATGCAAA+TGG - Chr3:92794660-92794679 MsG0380017160.01.T01:intron 50.0%
! ATTGGGTATCGTTCCGGTGA+GGG + Chr3:92794014-92794033 None:intergenic 50.0%
! CCAGTTGCAGAATGGGGTTT+TGG + Chr3:92793858-92793877 None:intergenic 50.0%
! TACACGGAGTTGGTCGAGAT+TGG + Chr3:92793972-92793991 None:intergenic 50.0%
!! ATGGGTTGGTCAACACAGAC+AGG + Chr3:92796423-92796442 None:intergenic 50.0%
AATCCCAACATCCGCTAGCG+GGG - Chr3:92795159-92795178 MsG0380017160.01.T01:intron 55.0%
ACCCCATTCTGCAACTGGCA+AGG - Chr3:92793860-92793879 MsG0380017160.01.T01:three_prime_UTR 55.0%
AGAGATGGTAGGGGACCCAA+AGG + Chr3:92795925-92795944 None:intergenic 55.0%
AGGGCTTTCCTACATCCACC+AGG - Chr3:92796315-92796334 MsG0380017160.01.T01:CDS 55.0%
CAATCCCAACATCCGCTAGC+GGG - Chr3:92795158-92795177 MsG0380017160.01.T01:intron 55.0%
CACCGGCGAGATCTAAGTTG+CGG + Chr3:92793928-92793947 None:intergenic 55.0%
CGCGACAAGGCAGTGGTTAA+CGG + Chr3:92794310-92794329 None:intergenic 55.0%
CTCCGCAACTTAGATCTCGC+CGG - Chr3:92793923-92793942 MsG0380017160.01.T01:three_prime_UTR 55.0%
CTGAAAACGCGACAAGGCAG+TGG + Chr3:92794317-92794336 None:intergenic 55.0%
CTGCAGGTTCCAGGTCAAGT+AGG - Chr3:92796239-92796258 MsG0380017160.01.T01:CDS 55.0%
GAGTGTGATGGCTTCCGACA+CGG - Chr3:92794621-92794640 MsG0380017160.01.T01:intron 55.0%
GCTTGATCTCTCCAGAGCAG+AGG - Chr3:92796698-92796717 MsG0380017160.01.T01:CDS 55.0%
GGAAGCCATCACACTCGATC+CGG + Chr3:92794617-92794636 None:intergenic 55.0%
GGCGTTGCCGGAGCAAAAAA+CGG + Chr3:92794409-92794428 None:intergenic 55.0%
GTTCCAGGTCAAGTAGGGCA+AGG - Chr3:92796245-92796264 MsG0380017160.01.T01:CDS 55.0%
TGAGTCGCAGGTGTATACGC+TGG - Chr3:92794759-92794778 MsG0380017160.01.T01:intron 55.0%
TGGTTAAGTCCAACCGTCGG+AGG + Chr3:92794430-92794449 None:intergenic 55.0%
TTCACTAAGGACCCCGCTAG+CGG + Chr3:92795173-92795192 None:intergenic 55.0%
! AGCAGCAAGATTCTCGGTGC+TGG + Chr3:92795523-92795542 None:intergenic 55.0%
! GATTGGGTATCGTTCCGGTG+AGG + Chr3:92794015-92794034 None:intergenic 55.0%
! TCTCCATGCCTGGTGGATGT+AGG + Chr3:92796326-92796345 None:intergenic 55.0%
!! AGGTGGAACCCAAAGGTGCT+TGG - Chr3:92795859-92795878 MsG0380017160.01.T01:CDS 55.0%
ATTCTGTGCGGGTGAGTCGC+AGG - Chr3:92794747-92794766 MsG0380017160.01.T01:intron 60.0%
CACATTGTGGGCCTCTGCTC+TGG + Chr3:92796712-92796731 None:intergenic 60.0%
CAGAGCAGAGGCCCACAATG+TGG - Chr3:92796710-92796729 MsG0380017160.01.T01:CDS 60.0%
CATCCACCAGGCATGGAGAC+TGG - Chr3:92796327-92796346 MsG0380017160.01.T01:CDS 60.0%
CATGGACCAGTCTCCATGCC+TGG + Chr3:92796336-92796355 None:intergenic 60.0%
CGAGTCTCCGGGGCTCTATA+AGG + Chr3:92796475-92796494 None:intergenic 60.0%
TGTGATGGCTTCCGACACGG+CGG - Chr3:92794624-92794643 MsG0380017160.01.T01:intron 60.0%
! CAGGCATGGAGACTGGTCCA+TGG - Chr3:92796334-92796353 MsG0380017160.01.T01:CDS 60.0%
! TGGCCTTGCCCTACTTGACC+TGG + Chr3:92796251-92796270 None:intergenic 60.0%
GCAGAGGCCCACAATGTGGC+AGG - Chr3:92796714-92796733 MsG0380017160.01.T01:CDS 65.0%
GGACCAGTCTCCATGCCTGG+TGG + Chr3:92796333-92796352 None:intergenic 65.0%
! AGGACCCCGCTAGCGGATGT+TGG + Chr3:92795166-92795185 None:intergenic 65.0%
! GGACCCCGCTAGCGGATGTT+GGG + Chr3:92795165-92795184 None:intergenic 65.0%
GATGGCTTCCGACACGGCGG+CGG - Chr3:92794627-92794646 MsG0380017160.01.T01:intron 70.0%
GGCGACGGTGGAAGAAGCGG+TGG - Chr3:92794648-92794667 MsG0380017160.01.T01:intron 70.0%
GGCGGCGACGGTGGAAGAAG+CGG - Chr3:92794645-92794664 MsG0380017160.01.T01:intron 70.0%
TGCTCCGGCAACGCCTCCGA+CGG - Chr3:92794414-92794433 MsG0380017160.01.T01:CDS 70.0%
!! CCAACCGTCGGAGGCGTTGC+CGG + Chr3:92794421-92794440 None:intergenic 70.0%
CCGGCAACGCCTCCGACGGT+TGG - Chr3:92794418-92794437 MsG0380017160.01.T01:CDS 75.0%
TTCCGACACGGCGGCGGCGA+CGG - Chr3:92794633-92794652 MsG0380017160.01.T01:intron 75.0%
! CACCGTCGCCGCCGCCGTGT+CGG + Chr3:92794638-92794657 None:intergenic 80.0%
! CGACACGGCGGCGGCGACGG+TGG - Chr3:92794636-92794655 MsG0380017160.01.T01:intron 85.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr3 gene 92793668 92797175 92793668 ID=MsG0380017160.01;Name=MsG0380017160.01
Chr3 mRNA 92793668 92797175 92793668 ID=MsG0380017160.01.T01;Parent=MsG0380017160.01;Name=MsG0380017160.01.T01;_AED=0.27;_eAED=0.27;_QI=0|1|0.5|1|0|1|2|347|659
Chr3 exon 92793668 92794598 92793668 ID=MsG0380017160.01.T01:exon:12667;Parent=MsG0380017160.01.T01
Chr3 exon 92795780 92797175 92795780 ID=MsG0380017160.01.T01:exon:12666;Parent=MsG0380017160.01.T01
Chr3 CDS 92795780 92797175 92795780 ID=MsG0380017160.01.T01:cds;Parent=MsG0380017160.01.T01
Chr3 CDS 92794015 92794598 92794015 ID=MsG0380017160.01.T01:cds;Parent=MsG0380017160.01.T01
Chr3 three_prime_UTR 92793668 92794014 92793668 ID=MsG0380017160.01.T01:three_prime_utr;Parent=MsG0380017160.01.T01
Gene Sequence

>MsG0380017160.01.T01

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Protein sequence

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