AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0480018527.01

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MsG0480018527.01.T01 AT5G45260 29.853 814 467 26 94 867 17 766 2.92e-71 262
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MsG0480018527.01.T01 AT5G20690 37.762 143 77 3 1095 1230 482 619 5.84e-19 93.2
MsG0480018527.01.T01 AT3G18810 42.857 119 60 3 1092 1205 429 544 6.20e-19 93.2
MsG0480018527.01.T01 AT4G01330 34.074 135 84 2 1095 1224 259 393 6.48e-19 91.7
MsG0480018527.01.T01 AT1G09440 35.556 135 82 2 1095 1224 254 388 7.00e-19 92.0
MsG0480018527.01.T01 AT1G09440 35.556 135 82 2 1095 1224 254 388 7.00e-19 92.0
MsG0480018527.01.T01 AT1G20650 41.509 106 59 2 1093 1195 173 278 7.11e-19 90.9
MsG0480018527.01.T01 AT1G31420 35.036 137 84 2 1093 1224 398 534 7.71e-19 92.4
MsG0480018527.01.T01 AT1G69790 43.243 111 60 3 1087 1196 171 279 7.77e-19 90.5
MsG0480018527.01.T01 AT4G04510 37.097 124 75 2 1090 1210 432 555 8.14e-19 92.8
MsG0480018527.01.T01 AT1G31420 35.036 137 84 2 1093 1224 399 535 8.15e-19 92.4
MsG0480018527.01.T01 AT1G31420 35.036 137 84 2 1093 1224 399 535 8.15e-19 92.4
MsG0480018527.01.T01 AT2G48010 35.762 151 86 3 1090 1232 378 525 8.28e-19 92.4
MsG0480018527.01.T01 AT1G51270 34.132 167 101 4 84 242 186 351 8.34e-19 90.1
MsG0480018527.01.T01 AT1G51270 34.132 167 101 4 84 242 186 351 8.34e-19 90.1
MsG0480018527.01.T01 AT1G51270 34.132 167 101 4 84 242 186 351 8.34e-19 90.1
MsG0480018527.01.T01 AT1G51270 34.132 167 101 4 84 242 186 351 8.34e-19 90.1
MsG0480018527.01.T01 AT4G04510 37.097 124 75 2 1090 1210 430 553 8.76e-19 92.8
MsG0480018527.01.T01 AT4G22130 43.810 105 57 1 1095 1197 494 598 8.80e-19 92.8
MsG0480018527.01.T01 AT4G01330 34.074 135 84 2 1095 1224 259 393 9.05e-19 91.7
MsG0480018527.01.T01 AT1G51270 34.132 167 101 4 84 242 187 352 9.09e-19 90.1
MsG0480018527.01.T01 AT2G28930 40.517 116 60 3 1093 1199 185 300 9.11e-19 90.9
MsG0480018527.01.T01 AT1G69790 43.243 111 60 3 1087 1196 182 290 9.21e-19 90.5
MsG0480018527.01.T01 AT4G01330 34.074 135 84 2 1095 1224 259 393 9.31e-19 91.7
MsG0480018527.01.T01 AT1G06700 37.333 150 88 3 1089 1232 165 314 9.52e-19 90.1
MsG0480018527.01.T01 AT1G06700 37.333 150 88 3 1089 1232 165 314 9.52e-19 90.1
MsG0480018527.01.T01 AT1G06700 37.333 150 88 3 1089 1232 165 314 9.52e-19 90.1
MsG0480018527.01.T01 AT1G48210 36.364 154 90 4 1085 1232 161 312 9.94e-19 90.1
MsG0480018527.01.T01 AT1G48210 36.364 154 90 4 1085 1232 161 312 9.94e-19 90.1
MsG0480018527.01.T01 AT1G48210 36.364 154 90 4 1085 1232 161 312 9.94e-19 90.1
MsG0480018527.01.T01 AT1G48210 36.364 154 90 4 1085 1232 161 312 9.94e-19 90.1
MsG0480018527.01.T01 AT2G47060 38.000 150 87 3 1089 1232 168 317 1.11e-18 90.5
MsG0480018527.01.T01 AT4G00960 38.739 111 63 2 1090 1195 60 170 1.13e-18 88.6
MsG0480018527.01.T01 AT2G28930 40.517 116 60 3 1093 1199 174 289 1.16e-18 90.5
MsG0480018527.01.T01 AT4G13190 41.509 106 59 2 1093 1195 20 125 1.25e-18 87.4
MsG0480018527.01.T01 AT4G13190 41.509 106 59 2 1093 1195 20 125 1.25e-18 87.4
MsG0480018527.01.T01 AT3G19700 40.876 137 74 4 1087 1216 777 913 1.31e-18 92.8
MsG0480018527.01.T01 AT2G28930 40.517 116 60 3 1093 1199 177 292 1.32e-18 90.5
MsG0480018527.01.T01 AT2G20300 42.727 110 61 1 1090 1197 436 545 1.34e-18 92.4
MsG0480018527.01.T01 AT1G09970 41.007 139 71 5 1095 1224 776 912 1.40e-18 92.4
MsG0480018527.01.T01 AT4G02410 38.053 113 68 1 1089 1199 445 557 1.44e-18 92.0
MsG0480018527.01.T01 AT2G37710 38.053 113 68 1 1089 1199 437 549 1.48e-18 92.0
MsG0480018527.01.T01 AT4G13190 37.795 127 73 3 1093 1213 167 293 1.50e-18 88.2
MsG0480018527.01.T01 AT4G00960 38.739 111 63 2 1090 1195 53 163 1.50e-18 88.2
MsG0480018527.01.T01 AT2G47060 38.000 150 87 3 1089 1232 168 317 1.66e-18 89.4
MsG0480018527.01.T01 AT2G47060 38.000 150 87 3 1089 1232 168 317 1.66e-18 89.4
MsG0480018527.01.T01 AT1G51270 34.132 167 101 4 84 242 117 282 1.70e-18 89.7
MsG0480018527.01.T01 AT1G49270 43.636 110 58 3 1091 1197 428 536 1.71e-18 92.0
MsG0480018527.01.T01 AT2G28590 35.417 144 81 4 1083 1223 187 321 1.91e-18 90.1
MsG0480018527.01.T01 AT1G23540 42.593 108 60 1 1092 1197 463 570 2.14e-18 91.7
MsG0480018527.01.T01 AT1G01540 38.095 105 63 1 1095 1197 251 355 2.16e-18 89.4
MsG0480018527.01.T01 AT2G47060 44.643 112 59 2 1089 1197 168 279 2.21e-18 88.2
MsG0480018527.01.T01 AT4G00960 39.091 110 62 2 1091 1195 148 257 2.22e-18 89.4

Find 220 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 468 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
AGGCCCCTGTTATTGGAATT+TGG 0.133598 4:+6161473 MsG0480018527.01.T01:CDS
TTCAAGATCACTTTGTTTAA+AGG 0.147333 4:-6161911 None:intergenic
GATCAGCTGGAAAAGTTATT+TGG 0.165936 4:+6161739 MsG0480018527.01.T01:CDS
CTGTTTGAGGTTGGGGTATT+GGG 0.200579 4:+6161853 MsG0480018527.01.T01:CDS
GAAAGTTCTCTCATAAATAT+TGG 0.215702 4:+6163513 MsG0480018527.01.T01:CDS
TTGATATGTTGACTGGTTTA+TGG 0.222022 4:-6163997 None:intergenic
TGCAGAGAATCTTGTTATAT+TGG 0.222936 4:+6162737 MsG0480018527.01.T01:CDS
AACCCTCACATCACAGATTT+TGG 0.228477 4:+6166356 MsG0480018527.01.T01:CDS
GGCCATTCAACAACGATTTC+AGG 0.228549 4:-6166218 None:intergenic
ACATCATCTCTCCCCTTTGC+TGG 0.239856 4:+6163671 MsG0480018527.01.T01:CDS
TAAGGGAATCACAATTATTT+AGG 0.242621 4:-6163074 None:intergenic
GGCCCCTGTTATTGGAATTT+GGG 0.245136 4:+6161474 MsG0480018527.01.T01:CDS
CAGCCTCGGTGTTATCCTTT+TGG 0.248528 4:+6166499 MsG0480018527.01.T01:CDS
TCCATTAGTTCTTAAAGTTT+TGG 0.248934 4:+6161987 MsG0480018527.01.T01:CDS
TCACACAAGGCCCCTGTTAT+TGG 0.259687 4:+6161466 MsG0480018527.01.T01:CDS
TCTTGACAAGCTTGTGCATT+TGG 0.260130 4:+6163050 MsG0480018527.01.T01:CDS
CATCATATTCAGAACAAATT+TGG 0.262756 4:-6161543 None:intergenic
TGAGAATATGACCAATAAAA+TGG 0.263733 4:-6160421 None:intergenic
AATGCACTGCCATCATCTTT+TGG 0.276507 4:+6163225 MsG0480018527.01.T01:CDS
TCTGTTTGAGGTTGGGGTAT+TGG 0.285818 4:+6161852 MsG0480018527.01.T01:CDS
GTACTATATTCTCTTGGTTA+TGG 0.286120 4:-6166289 None:intergenic
ATATGATGGTTGCTGTTTCT+TGG 0.293621 4:+6161558 MsG0480018527.01.T01:CDS
TTACAATGATCTTGATTGTT+TGG 0.301810 4:+6162110 MsG0480018527.01.T01:CDS
GATATTGCTTGTTTCTTCAA+TGG 0.308115 4:+6162150 MsG0480018527.01.T01:CDS
ACTTGGAAATGCAGCCATTA+GGG 0.309892 4:+6159258 MsG0480018527.01.T01:CDS
ATAAAGGAGGGAGCTTAAAT+TGG 0.312235 4:-6163115 None:intergenic
GACAAATGAAGTGTTTGATT+TGG 0.323614 4:+6166607 MsG0480018527.01.T01:CDS
AAAGCTTTGGTGTGGAGTTC+AGG 0.323885 4:+6162782 MsG0480018527.01.T01:CDS
TGGCTGCATTTCCAAGTTAG+AGG 0.326386 4:-6159252 None:intergenic
GCATGACATTCTACAAGAAA+TGG 0.326557 4:+6162305 MsG0480018527.01.T01:CDS
GCCAAAACTTTAAGAACTAA+TGG 0.326653 4:-6161988 None:intergenic
ACAAGAAAAGGGTTGAGTTC+TGG 0.328081 4:+6163472 MsG0480018527.01.T01:CDS
ATTGATTGCAAAGAGAAATA+TGG 0.331008 4:+6160492 MsG0480018527.01.T01:CDS
CACCTCAAGCAACGTACTAT+TGG 0.332521 4:+6166322 MsG0480018527.01.T01:CDS
TTCAGAAGCCCTAAAACTTA+AGG 0.339592 4:+6162972 MsG0480018527.01.T01:CDS
ATACCCCAAATTCCAATAAC+AGG 0.345832 4:-6161478 None:intergenic
AAAGTTCTCTCATAAATATT+GGG 0.346817 4:+6163514 MsG0480018527.01.T01:CDS
AAAATCCAAGGTTGAGATAA+AGG 0.347352 4:-6163131 None:intergenic
ATGGCATATGCCAGTCGATA+TGG 0.348615 4:-6163794 None:intergenic
GGATCTACCCCATAGAAAAT+AGG 0.356591 4:-6160528 None:intergenic
ATGCCATTTGTTGGTTCTCC+TGG 0.362960 4:-6166542 None:intergenic
GGAGCTTAAATTGGAATTGC+TGG 0.363466 4:-6163106 None:intergenic
ATTTGGGGTATGGGCGGTAT+TGG 0.365443 4:+6161490 MsG0480018527.01.T01:CDS
ATATTGCTTGTTTCTTCAAT+GGG 0.366097 4:+6162151 MsG0480018527.01.T01:CDS
GTAAGATTCTTGATGCTTGA+AGG 0.368326 4:-6163303 None:intergenic
AAGATTTCAAAAGAACTTGT+TGG 0.368394 4:+6161397 MsG0480018527.01.T01:CDS
AATACATCATAAATTTCATC+AGG 0.370510 4:-6162390 None:intergenic
CAGGGTCTTTACTAGATTCT+CGG 0.371792 4:-6162344 None:intergenic
AAGAACTAATGGAATTCCTT+TGG 0.376934 4:-6161977 None:intergenic
ACGACGTTGCTCAAAGCTTC+TGG 0.377335 4:+6163347 MsG0480018527.01.T01:CDS
AACAGTTGCTGAACAATTCA+AGG 0.377803 4:+6163446 MsG0480018527.01.T01:CDS
CTTTCTAAGCCATTTGGTTA+AGG 0.377964 4:+6160302 MsG0480018527.01.T01:CDS
AAAAGTCTGGTAACTCCTTC+AGG 0.382664 4:-6162951 None:intergenic
TGATATGTTGACTGGTTTAT+GGG 0.383090 4:-6163996 None:intergenic
AGATGATCTGTTTGAGGTTG+GGG 0.385133 4:+6161846 MsG0480018527.01.T01:CDS
TTAATGAAGTTTGCTAACTT+TGG 0.387368 4:+6163555 MsG0480018527.01.T01:CDS
AAGATGATCTGTTTGAGGTT+GGG 0.389607 4:+6161845 MsG0480018527.01.T01:CDS
CATCATCTCTCCCCTTTGCT+GGG 0.391935 4:+6163672 MsG0480018527.01.T01:CDS
TCAGACAAGCTTTAAAATCA+AGG 0.392673 4:+6163914 MsG0480018527.01.T01:CDS
CCACGACTTTCTAAGCCATT+TGG 0.396143 4:+6160296 MsG0480018527.01.T01:CDS
TTGAAAATTACTATAATTGA+GGG 0.396640 4:+6163750 MsG0480018527.01.T01:CDS
CAATCTGGAACACTACTTCC+AGG 0.396876 4:-6163600 None:intergenic
TCCGGCTGTAGCAATGATAT+TGG 0.404260 4:-6166411 None:intergenic
AACTTGGAAATGCAGCCATT+AGG 0.406695 4:+6159257 MsG0480018527.01.T01:CDS
GTTCTGGAATTGCTTGAACT+TGG 0.408558 4:+6163488 MsG0480018527.01.T01:CDS
ATTGAAAATTACTATAATTG+AGG 0.411319 4:+6163749 MsG0480018527.01.T01:CDS
AAGGAGAAGTTAAAAGCGTT+TGG 0.412575 4:+6163966 MsG0480018527.01.T01:CDS
TTTAGGGCTTCTGAAAAGTC+TGG 0.413832 4:-6162964 None:intergenic
TGTTATTGGAATTTGGGGTA+TGG 0.414853 4:+6161480 MsG0480018527.01.T01:CDS
TGCATTGTATCCAAGACTTC+CGG 0.418206 4:-6166429 None:intergenic
AATTGCTGGTAAATGTTGTA+AGG 0.424335 4:-6163092 None:intergenic
CAGTGCATTGATGGGACATC+TGG 0.424684 4:-6163211 None:intergenic
GGCAAGTCCATGCCATTTGT+TGG 0.425256 4:-6166551 None:intergenic
TGTATTTCTTCAGAGAAGTA+AGG 0.427186 4:+6159199 MsG0480018527.01.T01:intron
GTGGTATAAAATATCTTCAT+TGG 0.428403 4:+6162676 MsG0480018527.01.T01:CDS
GAGGAAAAGCCTTAACCAAA+TGG 0.430403 4:-6160311 None:intergenic
ACTTATGCTTCTAATAGCTT+TGG 0.430858 4:-6162526 None:intergenic
TCAAAATCTCATTCAACAAA+TGG 0.432794 4:+6164016 MsG0480018527.01.T01:CDS
ACTATTGATGCAACATATTG+AGG 0.434119 4:-6166572 None:intergenic
ACAAGGATGAAAATAGCAAT+TGG 0.434911 4:+6166242 MsG0480018527.01.T01:CDS
GTTGAAGGGTGCAGCAGAAA+AGG 0.435147 4:+6160203 MsG0480018527.01.T01:intron
AGTTATTTGGAACTCGTGAT+TGG 0.435610 4:+6161752 MsG0480018527.01.T01:CDS
TTCCATGTACTATATTCTCT+TGG 0.436209 4:-6166295 None:intergenic
AATTGTTCAGCAACTGTTGA+AGG 0.437550 4:-6163441 None:intergenic
AATTCAAGGAAAACAAGAAA+AGG 0.439511 4:+6163460 MsG0480018527.01.T01:CDS
GAATGAGGAGTATTGTTGTT+TGG 0.441688 4:-6160231 None:intergenic
TTCTTTGTCTTTGAAAGCTC+CGG 0.445593 4:-6166452 None:intergenic
TTTATATCAGAGACCCCTAA+TGG 0.446413 4:-6159272 None:intergenic
TGCTGCTGGAACCTCTAACT+TGG 0.450589 4:+6159241 MsG0480018527.01.T01:CDS
GTCTTGTACTCAAACCAATC+TGG 0.451199 4:-6163615 None:intergenic
ATAGCAATTGGAATCAGAAA+TGG 0.451249 4:+6166254 MsG0480018527.01.T01:CDS
CATCAATAGTTAAAGAAGAA+TGG 0.451806 4:+6166585 MsG0480018527.01.T01:CDS
AATATTAAAGCAGTGTATCC+TGG 0.456594 4:+6163582 MsG0480018527.01.T01:CDS
TATTAGAAGTTCATCTCCTA+TGG 0.459938 4:-6166651 None:intergenic
TTGTTATTGCGCCGTGGTCA+AGG 0.460971 4:+6159073 MsG0480018527.01.T01:CDS
ATTGCTACAGCCGGAAGTCT+TGG 0.461698 4:+6166419 MsG0480018527.01.T01:CDS
TCACTTGTTGAAGCAATTGA+AGG 0.462253 4:+6160393 MsG0480018527.01.T01:CDS
ATAGCCTACTGGAAAAGCTT+TGG 0.464784 4:+6162769 MsG0480018527.01.T01:CDS
AGATGATGGCAGTGCATTGA+TGG 0.466209 4:-6163220 None:intergenic
TAAAAGAAGTTAAACTCAGT+TGG 0.470906 4:+6162923 MsG0480018527.01.T01:CDS
TCAAGAATCTTACAAGACTA+AGG 0.474731 4:+6163313 MsG0480018527.01.T01:CDS
TTTATTAGTACCTCAACCTC+AGG 0.474935 4:-6159121 None:intergenic
GACAGAATTCCTTTCCATCA+AGG 0.477525 4:+6163947 MsG0480018527.01.T01:CDS
TTGTCGATGACAAACTTAAG+AGG 0.479081 4:+6160352 MsG0480018527.01.T01:CDS
TCAAAGCAATCTAGAAATCC+TGG 0.479255 4:+6163251 MsG0480018527.01.T01:CDS
TTAACTTCTCCTTGATGGAA+AGG 0.479568 4:-6163956 None:intergenic
CTGGAAGTAGTGTTCCAGAT+TGG 0.481548 4:+6163601 MsG0480018527.01.T01:CDS
CAATGGGTTGAATTTGAAAG+TGG 0.484815 4:+6162167 MsG0480018527.01.T01:CDS
GTTATTGGAATTTGGGGTAT+GGG 0.486868 4:+6161481 MsG0480018527.01.T01:CDS
AATTGAGGGTGACGATGAAA+AGG 0.489688 4:+6163764 MsG0480018527.01.T01:CDS
CATGACATTCTACAAGAAAT+GGG 0.493289 4:+6162306 MsG0480018527.01.T01:CDS
TATCGTTCTTGATGACATCA+AGG 0.493680 4:+6161711 MsG0480018527.01.T01:CDS
TTGTCAAGAGAGAAAATAGA+TGG 0.494813 4:-6163036 None:intergenic
CATCAAGGGTACAGATCAGC+TGG 0.495389 4:+6161726 MsG0480018527.01.T01:CDS
ATCGACTGGCATATGCCATC+GGG 0.495477 4:+6163798 MsG0480018527.01.T01:CDS
CAAGGAACACGTGATGGGGC+GGG 0.497390 4:+6159091 MsG0480018527.01.T01:CDS
CTTTGACATCCAAAAGATGA+TGG 0.498763 4:-6163234 None:intergenic
TGATAAAGATGATCTGTTTG+AGG 0.499194 4:+6161840 MsG0480018527.01.T01:CDS
CAACCTCATCAACACAACTT+TGG 0.502981 4:-6161353 None:intergenic
TCCCTCCTTTATCTCAACCT+TGG 0.504484 4:+6163126 MsG0480018527.01.T01:CDS
GGACTTGTCATATAGCCTAC+TGG 0.505424 4:+6162758 MsG0480018527.01.T01:CDS
ACCAATATCATTGCTACAGC+CGG 0.508084 4:+6166410 MsG0480018527.01.T01:CDS
ACAAATATTGAGAGACGGAT+TGG 0.508116 4:+6161673 MsG0480018527.01.T01:CDS
AAAGATGATCTGTTTGAGGT+TGG 0.508125 4:+6161844 MsG0480018527.01.T01:CDS
GGGTCTTATTCCTGAGGTTG+AGG 0.509105 4:+6159111 MsG0480018527.01.T01:CDS
CAAATTTGTTCTGAATATGA+TGG 0.509517 4:+6161544 MsG0480018527.01.T01:CDS
ATAACAACGCAACAAATTTG+AGG 0.510097 4:-6159057 None:intergenic
TGGTTGCTGTTTCTTGGAAA+AGG 0.511299 4:+6161564 MsG0480018527.01.T01:CDS
GTGGTCAAGGAACACGTGAT+GGG 0.511712 4:+6159086 MsG0480018527.01.T01:CDS
ATTCAAGGAAAACAAGAAAA+GGG 0.512593 4:+6163461 MsG0480018527.01.T01:CDS
CCAGATGGAATTGTTGCTGC+TGG 0.517895 4:+6159227 MsG0480018527.01.T01:CDS
TGTCGATGACAAACTTAAGA+GGG 0.520029 4:+6160353 MsG0480018527.01.T01:CDS
GCCCCTGTTATTGGAATTTG+GGG 0.520035 4:+6161475 MsG0480018527.01.T01:CDS
ACTATGCTTCTTCACGTTGG+TGG 0.521073 4:+6160448 MsG0480018527.01.T01:CDS
TCAACTGATGAAGGAAGCTC+AGG 0.521394 4:-6163375 None:intergenic
AGTAGAGTTTCAACTGATGA+AGG 0.524578 4:-6163384 None:intergenic
ATTTCAGGTCCACGAGCAGC+AGG 0.524758 4:-6166203 None:intergenic
CGTGGTCAAGGAACACGTGA+TGG 0.529052 4:+6159085 MsG0480018527.01.T01:CDS
AGAGTTAACAAGACATGGAA+TGG 0.529676 4:+6161594 MsG0480018527.01.T01:CDS
TATCGACTGGCATATGCCAT+CGG 0.534115 4:+6163797 MsG0480018527.01.T01:CDS
CCAGCAGCAACAATTCCATC+TGG 0.534692 4:-6159227 None:intergenic
CTATATTCTCTTGGTTATGG+AGG 0.534951 4:-6166286 None:intergenic
GATTTGGAACTCATGAGGGA+TGG 0.537502 4:+6166623 MsG0480018527.01.T01:CDS
CAATAGGAATGATGCCGTGC+TGG 0.537770 4:+6161318 MsG0480018527.01.T01:intron
CCACCAGGAGAACCAACAAA+TGG 0.539629 4:+6166539 MsG0480018527.01.T01:CDS
TCAAGGAACACGTGATGGGG+CGG 0.546112 4:+6159090 MsG0480018527.01.T01:CDS
CCATTTGTTGGTTCTCCTGG+TGG 0.548920 4:-6166539 None:intergenic
TACCAGTTAAGAGTTCCAAA+AGG 0.550195 4:-6166514 None:intergenic
AGAAGTTCATCTCCTATGGT+TGG 0.558646 4:-6166647 None:intergenic
ATCCAATAGTACGTTGCTTG+AGG 0.559829 4:-6166324 None:intergenic
GACCAAAATCTGTGATGTGA+GGG 0.562006 4:-6166358 None:intergenic
TTTCAGTATCATTTAAAACC+AGG 0.563152 4:-6163269 None:intergenic
CTCTTAACTGGTAAACCACC+AGG 0.563734 4:+6166524 MsG0480018527.01.T01:CDS
CATTCTACAAGAAATGGGTC+GGG 0.566704 4:+6162311 MsG0480018527.01.T01:CDS
CAAGAGAGAAAATAGATGGA+TGG 0.567202 4:-6163032 None:intergenic
AAAACATCATACTTTGAATG+AGG 0.568272 4:-6160246 None:intergenic
GGTGATTTCTTCCACCAGCA+CGG 0.572617 4:-6161332 None:intergenic
ACATTCTACAAGAAATGGGT+CGG 0.572708 4:+6162310 MsG0480018527.01.T01:CDS
TGTTTGATTTGGAACTCATG+AGG 0.576156 4:+6166618 MsG0480018527.01.T01:CDS
GATATGTTGACTGGTTTATG+GGG 0.577773 4:-6163995 None:intergenic
AGCAAAGGGGAGAGATGATG+TGG 0.580323 4:-6163669 None:intergenic
GTCATCTTATCAAATACATG+AGG 0.580605 4:-6162579 None:intergenic
AGTGAAGAGTTAACAAGACA+TGG 0.581079 4:+6161589 MsG0480018527.01.T01:CDS
TTTGCTTTGTTATTGCTTGG+GGG 0.581651 4:+6163703 MsG0480018527.01.T01:CDS
TTGATACAAATATTGAGAGA+CGG 0.581682 4:+6161668 MsG0480018527.01.T01:CDS
GTCTCTCCACATTTGAACCT+CGG 0.582496 4:-6160616 None:intergenic
AACCAAGAGAATATAGTACA+TGG 0.582559 4:+6166293 MsG0480018527.01.T01:CDS
ATTGTTCAGCAACTGTTGAA+GGG 0.582840 4:-6163440 None:intergenic
AAAACCGACGTTTACAGCCT+CGG 0.583782 4:+6166485 MsG0480018527.01.T01:CDS
GAGACGGATTGGCCGCATGA+AGG 0.585167 4:+6161684 MsG0480018527.01.T01:CDS
ACTCAGTTGGTCAAGCCTGA+AGG 0.587081 4:+6162936 MsG0480018527.01.T01:CDS
AGGATGGCGTCCATATCGAC+TGG 0.589765 4:+6163784 MsG0480018527.01.T01:CDS
AGAAGTAAGGCATCGCCAGA+TGG 0.590590 4:+6159212 MsG0480018527.01.T01:CDS
TAGGAATGATGCCGTGCTGG+TGG 0.594502 4:+6161321 MsG0480018527.01.T01:intron
CTTGGAAATGCAGCCATTAG+GGG 0.598459 4:+6159259 MsG0480018527.01.T01:CDS
TACCCCAAATTCCAATAACA+GGG 0.599494 4:-6161477 None:intergenic
AAAAGCGCAAGTTCTTCAGT+AGG 0.599729 4:-6161877 None:intergenic
TGGTCAAGGAACACGTGATG+GGG 0.603631 4:+6159087 MsG0480018527.01.T01:CDS
GACCTGAAATCGTTGTTGAA+TGG 0.604394 4:+6166216 MsG0480018527.01.T01:CDS
AGGAGAACCAACAAATGGCA+TGG 0.605960 4:+6166544 MsG0480018527.01.T01:CDS
TTAAAATCAAGGTTTCAGCA+TGG 0.606364 4:+6163925 MsG0480018527.01.T01:CDS
TCGTTGTTGAATGGCCAACA+AGG 0.606962 4:+6166225 MsG0480018527.01.T01:CDS
ATGAGGGATGGACCAACCAT+AGG 0.609052 4:+6166635 MsG0480018527.01.T01:CDS
ATTGGAATTTGGGGTATGGG+CGG 0.609082 4:+6161484 MsG0480018527.01.T01:CDS
ATCGTTCTTGATGACATCAA+GGG 0.609223 4:+6161712 MsG0480018527.01.T01:CDS
GATGATGGCAGTGCATTGAT+GGG 0.610191 4:-6163219 None:intergenic
AGGGTGATCAATTATGCCAA+AGG 0.611347 4:+6161961 MsG0480018527.01.T01:CDS
GGAAAAGATTGAAGCCCTTG+AGG 0.612410 4:-6162651 None:intergenic
TCCAAGGTTGAGATAAAGGA+GGG 0.612783 4:-6163127 None:intergenic
GTCGATGACAAACTTAAGAG+GGG 0.613742 4:+6160354 MsG0480018527.01.T01:CDS
TCACCAAAGTTGTGTTGATG+AGG 0.616578 4:+6161350 MsG0480018527.01.T01:CDS
ATTGCTGGTAAATGTTGTAA+GGG 0.623172 4:-6163091 None:intergenic
TGTAGCAATGATATTGGTGT+TGG 0.624788 4:-6166405 None:intergenic
GTTTGATTTGGAACTCATGA+GGG 0.628775 4:+6166619 MsG0480018527.01.T01:CDS
AAACATATACCTGCTGCTCG+TGG 0.631247 4:+6166194 MsG0480018527.01.T01:CDS
AAAACTATGCTTCTTCACGT+TGG 0.633254 4:+6160445 MsG0480018527.01.T01:CDS
CCAAATGGCTTAGAAAGTCG+TGG 0.633670 4:-6160296 None:intergenic
GAGGGTGACGATGAAAAGGA+TGG 0.637736 4:+6163768 MsG0480018527.01.T01:CDS
AAGTCTTGGATACAATGCAC+CGG 0.639160 4:+6166433 MsG0480018527.01.T01:CDS
ATCCAAGGTTGAGATAAAGG+AGG 0.640608 4:-6163128 None:intergenic
TCATCTTATCAAATACATGA+GGG 0.643769 4:-6162578 None:intergenic
ATACATCATAAATTTCATCA+GGG 0.644546 4:-6162389 None:intergenic
TTCTAACAGTGATAAGTCAG+TGG 0.649700 4:+6162215 MsG0480018527.01.T01:CDS
GGTACTGAGAAGAACATCGT+TGG 0.650989 4:-6163872 None:intergenic
GCATAAGTCTGTCAACAATG+AGG 0.654248 4:+6162541 MsG0480018527.01.T01:CDS
TGGGGCGGGTCTTATTCCTG+AGG 0.654829 4:+6159105 MsG0480018527.01.T01:CDS
TCTACAAGAAATGGGTCGGG+AGG 0.659201 4:+6162314 MsG0480018527.01.T01:CDS
ATGGAACACGAATGTGCTGA+AGG 0.665077 4:+6164035 MsG0480018527.01.T01:CDS
AATTGTCCGAGGTTCAAATG+TGG 0.665277 4:+6160610 MsG0480018527.01.T01:CDS
CTACTGGAAAAGCTTTGGTG+TGG 0.669108 4:+6162774 MsG0480018527.01.T01:CDS
GAACGATAAGAGCCTTCATG+CGG 0.676407 4:-6161696 None:intergenic
AGACCAAAATCTGTGATGTG+AGG 0.676993 4:-6166359 None:intergenic
ACCCCAAATTCCAATAACAG+GGG 0.702687 4:-6161476 None:intergenic
CATCACGTGTTCCTTGACCA+CGG 0.709447 4:-6159084 None:intergenic
ACTGAGAACTGAGAACCCGA+TGG 0.717007 4:-6163813 None:intergenic
GTTGCGTTGTTATTGCGCCG+TGG 0.727975 4:+6159067 MsG0480018527.01.T01:CDS
AACACCGAGGCTGTAAACGT+CGG 0.738905 4:-6166489 None:intergenic
GTTAAAGAAAGAGTCACACA+AGG 0.754499 4:+6161453 MsG0480018527.01.T01:CDS
AATGGCTTAGAAAGTCGTGG+CGG 0.764780 4:-6160293 None:intergenic
GTTCCAAAAGGATAACACCG+AGG 0.781912 4:-6166502 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AATAAGAAAATAAATAGTTA+AGG - Chr4:6161200-6161219 None:intergenic 10.0%
!! AATAATTACTAAAAATTGTA+TGG + Chr4:6165480-6165499 MsG0480018527.01.T01:intron 10.0%
!! ATTATAAAATATAAGCAAAA+GGG + Chr4:6159990-6160009 MsG0480018527.01.T01:intron 10.0%
!! GTTGAAATAATTAAATATTA+TGG + Chr4:6164267-6164286 MsG0480018527.01.T01:intron 10.0%
!! TATTACCTAAAATTAATAAA+AGG + Chr4:6161108-6161127 MsG0480018527.01.T01:intron 10.0%
!!! GATTTAAGATAAATTTAATT+TGG - Chr4:6162826-6162845 None:intergenic 10.0%
!!! TTTATCCTTTTATTAATTTT+AGG - Chr4:6161116-6161135 None:intergenic 10.0%
!! AAAACTAGACAATTAAAAAA+TGG - Chr4:6160794-6160813 None:intergenic 15.0%
!! AAAATTCAAAAATTGAAGTT+CGG - Chr4:6162604-6162623 None:intergenic 15.0%
!! AAGAAGAATATTTCTTTAAA+AGG + Chr4:6164751-6164770 MsG0480018527.01.T01:intron 15.0%
!! AAGAATAATATTTGTTTATG+AGG + Chr4:6164065-6164084 MsG0480018527.01.T01:intron 15.0%
!! AATCCATTTATAAAACATTA+GGG + Chr4:6159323-6159342 MsG0480018527.01.T01:intron 15.0%
!! AGAATAATATTTGTTTATGA+GGG + Chr4:6164066-6164085 MsG0480018527.01.T01:intron 15.0%
!! ATAAAAGAAAAAGAAAAAGA+AGG + Chr4:6164099-6164118 MsG0480018527.01.T01:intron 15.0%
!! ATTGAAAATTACTATAATTG+AGG + Chr4:6163749-6163768 MsG0480018527.01.T01:CDS 15.0%
!! CATTATAAAATATAAGCAAA+AGG + Chr4:6159989-6160008 MsG0480018527.01.T01:intron 15.0%
!! GATGTATTTAGTTAAAAATT+TGG - Chr4:6160042-6160061 None:intergenic 15.0%
!! TAATCCATTTATAAAACATT+AGG + Chr4:6159322-6159341 MsG0480018527.01.T01:intron 15.0%
!! TTACAAAGAAAAATCAATTA+TGG - Chr4:6164432-6164451 None:intergenic 15.0%
!! TTGAAAATTACTATAATTGA+GGG + Chr4:6163750-6163769 MsG0480018527.01.T01:CDS 15.0%
!! TTTAACATAAAAGACTAAAT+TGG + Chr4:6161059-6161078 MsG0480018527.01.T01:intron 15.0%
!!! AGAAGAATATTTCTTTAAAA+GGG + Chr4:6164752-6164771 MsG0480018527.01.T01:intron 15.0%
!!! ATCTTTTGACTTATAAATTA+GGG - Chr4:6166157-6166176 None:intergenic 15.0%
!!! ATGTTCAAAATTATTTTCTT+AGG + Chr4:6159618-6159637 MsG0480018527.01.T01:intron 15.0%
!!! CTTTTGCTTATATTTTATAA+TGG - Chr4:6159991-6160010 None:intergenic 15.0%
!!! TAAACTTTTTTCTAAACTAT+TGG + Chr4:6161630-6161649 MsG0480018527.01.T01:CDS 15.0%
!!! TATATTTGTTAAAAGTTGAA+GGG + Chr4:6160189-6160208 MsG0480018527.01.T01:intron 15.0%
!!! TATTATTTTTAGCTTCAAAT+AGG - Chr4:6164347-6164366 None:intergenic 15.0%
!!! TCCAAAAAATTTAAAATAGA+GGG - Chr4:6160819-6160838 None:intergenic 15.0%
!!! TTATATTTGTTAAAAGTTGA+AGG + Chr4:6160188-6160207 MsG0480018527.01.T01:intron 15.0%
!!! TTGGATTTGTTTTAAAAAAT+GGG - Chr4:6160964-6160983 None:intergenic 15.0%
!!! TTTAATTTTGCTAAAAAATC+CGG - Chr4:6163730-6163749 None:intergenic 15.0%
!!! TTTGGATTTGTTTTAAAAAA+TGG - Chr4:6160965-6160984 None:intergenic 15.0%
!!! TTTTATCACAAGTAATAAAA+TGG - Chr4:6161152-6161171 None:intergenic 15.0%
!!! TTTTATTTTTGAAGAATTAG+CGG - Chr4:6159748-6159767 None:intergenic 15.0%
!! AAAATAGTATCATTTGGAAA+TGG - Chr4:6161272-6161291 None:intergenic 20.0%
!! AAAGTTCTCTCATAAATATT+GGG + Chr4:6163514-6163533 MsG0480018527.01.T01:CDS 20.0%
!! AAATCAAATAAAACGATACA+AGG - Chr4:6160903-6160922 None:intergenic 20.0%
!! AAATGATTGATATCAATGAT+GGG - Chr4:6164955-6164974 None:intergenic 20.0%
!! AAATTTGTATGATGAAGATT+TGG - Chr4:6160983-6161002 None:intergenic 20.0%
!! AATACATCATAAATTTCATC+AGG - Chr4:6162393-6162412 None:intergenic 20.0%
!! ATACATCATAAATTTCATCA+GGG - Chr4:6162392-6162411 None:intergenic 20.0%
!! ATCCATTTATAAAACATTAG+GGG + Chr4:6159324-6159343 MsG0480018527.01.T01:intron 20.0%
!! ATTCATTTCATATAGACTTA+TGG + Chr4:6165404-6165423 MsG0480018527.01.T01:intron 20.0%
!! ATTTATTAGGTGAAGTTAAA+AGG + Chr4:6164639-6164658 MsG0480018527.01.T01:intron 20.0%
!! CAGTAAAACATATATACTAT+GGG - Chr4:6160706-6160725 None:intergenic 20.0%
!! GAATAATATTTGTTTATGAG+GGG + Chr4:6164067-6164086 MsG0480018527.01.T01:intron 20.0%
!! TGATATAAAGATAAATGAGT+TGG - Chr4:6159830-6159849 None:intergenic 20.0%
!! TTGAATCATATATTCTTTGA+AGG + Chr4:6164496-6164515 MsG0480018527.01.T01:intron 20.0%
!! TTTATTAGGTGAAGTTAAAA+GGG + Chr4:6164640-6164659 MsG0480018527.01.T01:intron 20.0%
!!! ATACATATTGAAAGTACTTT+TGG + Chr4:6165451-6165470 MsG0480018527.01.T01:intron 20.0%
!!! ATTCAATACCTTAAGTTTTA+GGG - Chr4:6162983-6163002 None:intergenic 20.0%
!!! ATTGTAATACCTATTTTCTA+TGG + Chr4:6160519-6160538 MsG0480018527.01.T01:CDS 20.0%
!!! CGTTTTATTTGATTTTTTCT+TGG + Chr4:6160908-6160927 MsG0480018527.01.T01:intron 20.0%
!!! GATCTTTTGACTTATAAATT+AGG - Chr4:6166158-6166177 None:intergenic 20.0%
!!! GTCCAAAAAATTTAAAATAG+AGG - Chr4:6160820-6160839 None:intergenic 20.0%
!!! TATTCAATACCTTAAGTTTT+AGG - Chr4:6162984-6163003 None:intergenic 20.0%
!!! TGTTTTACTGCTTAATTTTT+AGG + Chr4:6160716-6160735 MsG0480018527.01.T01:intron 20.0%
!!! TTGTAATACCTATTTTCTAT+GGG + Chr4:6160520-6160539 MsG0480018527.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTGTTTATATTTTGTAACAG+AGG + Chr4:6160083-6160102 MsG0480018527.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTATTTTTGAAGAATTAGC+GGG - Chr4:6159747-6159766 None:intergenic 20.0%
! AAAACATCATACTTTGAATG+AGG - Chr4:6160249-6160268 None:intergenic 25.0%
! AAGATTTCAAAAGAACTTGT+TGG + Chr4:6161397-6161416 MsG0480018527.01.T01:CDS 25.0%
! AATAAATATGTTGGGCAATA+AGG - Chr4:6164626-6164645 None:intergenic 25.0%
! AATTCAAGGAAAACAAGAAA+AGG + Chr4:6163460-6163479 MsG0480018527.01.T01:CDS 25.0%
! ACTTCACCTAATAAATATGT+TGG - Chr4:6164635-6164654 None:intergenic 25.0%
! ACTTCTAATACATTGCAATT+AGG + Chr4:6166664-6166683 MsG0480018527.01.T01:CDS 25.0%
! ATGAAAAGACAGTTATCAAA+CGG - Chr4:6165743-6165762 None:intergenic 25.0%
! ATTCAAGGAAAACAAGAAAA+GGG + Chr4:6163461-6163480 MsG0480018527.01.T01:CDS 25.0%
! ATTGATTGCAAAGAGAAATA+TGG + Chr4:6160492-6160511 MsG0480018527.01.T01:CDS 25.0%
! CAAATGATTGATATCAATGA+TGG - Chr4:6164956-6164975 None:intergenic 25.0%
! CATCAATAGTTAAAGAAGAA+TGG + Chr4:6166585-6166604 MsG0480018527.01.T01:CDS 25.0%
! CATCATATTCAGAACAAATT+TGG - Chr4:6161546-6161565 None:intergenic 25.0%
! CTTCACCTAATAAATATGTT+GGG - Chr4:6164634-6164653 None:intergenic 25.0%
! GAAAGTTCTCTCATAAATAT+TGG + Chr4:6163513-6163532 MsG0480018527.01.T01:CDS 25.0%
! GACTTAGTACTATATCATTA+TGG + Chr4:6165765-6165784 MsG0480018527.01.T01:intron 25.0%
! GCAGTAAAACATATATACTA+TGG - Chr4:6160707-6160726 None:intergenic 25.0%
! GTAAACAATTATGACACTTT+CGG + Chr4:6164544-6164563 MsG0480018527.01.T01:intron 25.0%
! GTCTCAAAAATAGTATCATT+TGG - Chr4:6161278-6161297 None:intergenic 25.0%
! GTGGTATAAAATATCTTCAT+TGG + Chr4:6162676-6162695 MsG0480018527.01.T01:CDS 25.0%
! TAAAAGAAGTTAAACTCAGT+TGG + Chr4:6162923-6162942 MsG0480018527.01.T01:CDS 25.0%
! TAAACAATTATGACACTTTC+GGG + Chr4:6164545-6164564 MsG0480018527.01.T01:intron 25.0%
! TAAATGATTCAGACACTTTA+AGG + Chr4:6165264-6165283 MsG0480018527.01.T01:intron 25.0%
! TAAGGGAATCACAATTATTT+AGG - Chr4:6163077-6163096 None:intergenic 25.0%
! TATTGCCCAACATATTTATT+AGG + Chr4:6164626-6164645 MsG0480018527.01.T01:intron 25.0%
! TCAAAATCTCATTCAACAAA+TGG + Chr4:6164016-6164035 MsG0480018527.01.T01:CDS 25.0%
! TCAAACACAATTATGTAATC+AGG - Chr4:6165842-6165861 None:intergenic 25.0%
! TCATCTTATCAAATACATGA+GGG - Chr4:6162581-6162600 None:intergenic 25.0%
! TCTAATTTCGAAGTAAGTTT+GGG - Chr4:6166096-6166115 None:intergenic 25.0%
! TCTTGTAGTATTAGGAAATA+GGG - Chr4:6159387-6159406 None:intergenic 25.0%
! TGAGAATATGACCAATAAAA+TGG - Chr4:6160424-6160443 None:intergenic 25.0%
! TGATGTATTGAAAAATGACA+AGG + Chr4:6162404-6162423 MsG0480018527.01.T01:CDS 25.0%
! TTACAATGATCTTGATTGTT+TGG + Chr4:6162110-6162129 MsG0480018527.01.T01:CDS 25.0%
! TTAGATAATGTTTGTCATGT+TGG + Chr4:6162444-6162463 MsG0480018527.01.T01:intron 25.0%
! TTCATAAGTAGATTCTTTGA+AGG + Chr4:6165214-6165233 MsG0480018527.01.T01:intron 25.0%
! TTCTAATTTCGAAGTAAGTT+TGG - Chr4:6166097-6166116 None:intergenic 25.0%
! TTCTTGTAGTATTAGGAAAT+AGG - Chr4:6159388-6159407 None:intergenic 25.0%
! TTGATACAAATATTGAGAGA+CGG + Chr4:6161668-6161687 MsG0480018527.01.T01:CDS 25.0%
! TTTCCTAATACTACAAGAAT+TGG + Chr4:6159389-6159408 MsG0480018527.01.T01:intron 25.0%
! TTTGTATGACTAAAAAAGAC+TGG + Chr4:6165620-6165639 MsG0480018527.01.T01:intron 25.0%
!! AAAAAATCAGCTAATTTGTC+GGG + Chr4:6160645-6160664 MsG0480018527.01.T01:CDS 25.0%
!! ATATTGCTTGTTTCTTCAAT+GGG + Chr4:6162151-6162170 MsG0480018527.01.T01:CDS 25.0%
!! ATTTCTTTAAAAGGGAACAT+AGG + Chr4:6164760-6164779 MsG0480018527.01.T01:intron 25.0%
!! ATTTTACTTTCATGATTGCA+GGG + Chr4:6162501-6162520 MsG0480018527.01.T01:intron 25.0%
!! CAAATTTGTTCTGAATATGA+TGG + Chr4:6161544-6161563 MsG0480018527.01.T01:CDS 25.0%
!! CTTTGTTTACATTAAGGAAA+AGG + Chr4:6159515-6159534 MsG0480018527.01.T01:intron 25.0%
!! GAAAAAATCAGCTAATTTGT+CGG + Chr4:6160644-6160663 MsG0480018527.01.T01:CDS 25.0%
!! TAGGTTGAAAATGAAACTAA+AGG + Chr4:6165069-6165088 MsG0480018527.01.T01:intron 25.0%
!! TATTTTACTTTCATGATTGC+AGG + Chr4:6162500-6162519 MsG0480018527.01.T01:intron 25.0%
!! TGGAAAAAGTAAAGAAGTAT+GGG + Chr4:6162023-6162042 MsG0480018527.01.T01:CDS 25.0%
!! TGTAATACCTATTTTCTATG+GGG + Chr4:6160521-6160540 MsG0480018527.01.T01:CDS 25.0%
!! TTCAAGATCACTTTGTTTAA+AGG - Chr4:6161914-6161933 None:intergenic 25.0%
!! TTGAATTTTCGTGATATAGA+GGG + Chr4:6162615-6162634 MsG0480018527.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTCAGTATCATTTAAAACC+AGG - Chr4:6163272-6163291 None:intergenic 25.0%
!! TTTGAATTTTCGTGATATAG+AGG + Chr4:6162614-6162633 MsG0480018527.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTTCTTGATTTTACCTTCT+AGG + Chr4:6165050-6165069 MsG0480018527.01.T01:intron 25.0%
!!! AAAGCATTTATTTGCTTTTG+AGG - Chr4:6160333-6160352 None:intergenic 25.0%
!!! AAATGGGTTGTTATTATTCA+TGG - Chr4:6160948-6160967 None:intergenic 25.0%
!!! ATATTTTATAATGGAGTGAC+CGG - Chr4:6159982-6160001 None:intergenic 25.0%
!!! ATGATGTTTTTGTAAGCTTT+AGG + Chr4:6160259-6160278 MsG0480018527.01.T01:CDS 25.0%
!!! GATTTTTTGCTATTCTAGTT+AGG - Chr4:6163896-6163915 None:intergenic 25.0%
!!! GCCCTCTATTTTAAATTTTT+TGG + Chr4:6160815-6160834 MsG0480018527.01.T01:intron 25.0%
!!! TAAGTTTTTTGCAAAATCCA+AGG - Chr4:6163146-6163165 None:intergenic 25.0%
!!! TCCATTAGTTCTTAAAGTTT+TGG + Chr4:6161987-6162006 MsG0480018527.01.T01:CDS 25.0%
!!! TGATGTTTTTGTAAGCTTTA+GGG + Chr4:6160260-6160279 MsG0480018527.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTAATGAAGTTTGCTAACTT+TGG + Chr4:6163555-6163574 MsG0480018527.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTATTTTTGAAGAATTAGCG+GGG - Chr4:6159746-6159765 None:intergenic 25.0%
!!! TTTTTGCTTTGTTATTGCTT+GGG + Chr4:6163701-6163720 MsG0480018527.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTTTTGCTTTGTTATTGCT+TGG + Chr4:6163700-6163719 MsG0480018527.01.T01:CDS 25.0%
AAAATCCAAGGTTGAGATAA+AGG - Chr4:6163134-6163153 None:intergenic 30.0%
AAAGCTATACGAGAAACTAT+TGG - Chr4:6159856-6159875 None:intergenic 30.0%
AAAGGACAAAATGAGAATCA+AGG + Chr4:6165537-6165556 MsG0480018527.01.T01:intron 30.0%
AAATAACTTCTCCCAAACAT+TGG - Chr4:6164847-6164866 None:intergenic 30.0%
AACCAAGAGAATATAGTACA+TGG + Chr4:6166293-6166312 MsG0480018527.01.T01:CDS 30.0%
AAGAACTAATGGAATTCCTT+TGG - Chr4:6161980-6161999 None:intergenic 30.0%
AAGCTATACGAGAAACTATT+GGG - Chr4:6159855-6159874 None:intergenic 30.0%
AAGGACAAAATGAGAATCAA+GGG + Chr4:6165538-6165557 MsG0480018527.01.T01:intron 30.0%
AATATTAAAGCAGTGTATCC+TGG + Chr4:6163582-6163601 MsG0480018527.01.T01:CDS 30.0%
AATCAGTTGCATATACAAAG+AGG - Chr4:6164992-6165011 None:intergenic 30.0%
AATTGCTGGTAAATGTTGTA+AGG - Chr4:6163095-6163114 None:intergenic 30.0%
ACAAGGATGAAAATAGCAAT+TGG + Chr4:6166242-6166261 MsG0480018527.01.T01:CDS 30.0%
ACTATTGATGCAACATATTG+AGG - Chr4:6166575-6166594 None:intergenic 30.0%
ACTTATGCTTCTAATAGCTT+TGG - Chr4:6162529-6162548 None:intergenic 30.0%
ACTTTGCATAAAAGTCAACA+TGG - Chr4:6164884-6164903 None:intergenic 30.0%
ATAACAACGCAACAAATTTG+AGG - Chr4:6159060-6159079 None:intergenic 30.0%
ATAGAGAGAAATTAGTTGGT+AGG + Chr4:6165309-6165328 MsG0480018527.01.T01:intron 30.0%
ATAGCAATTGGAATCAGAAA+TGG + Chr4:6166254-6166273 MsG0480018527.01.T01:CDS 30.0%
ATTAATAGAAGCAGAATCAG+AGG - Chr4:6159178-6159197 None:intergenic 30.0%
ATTATGGTTGAGTGTATGAA+TGG + Chr4:6164283-6164302 MsG0480018527.01.T01:intron 30.0%
ATTGCTGGTAAATGTTGTAA+GGG - Chr4:6163094-6163113 None:intergenic 30.0%
ATTTGTTTATGAGGGGAAAA+AGG + Chr4:6164074-6164093 MsG0480018527.01.T01:intron 30.0%
CATGACATTCTACAAGAAAT+GGG + Chr4:6162306-6162325 MsG0480018527.01.T01:CDS 30.0%
CTGAACACAATTACATGATA+TGG - Chr4:6166047-6166066 None:intergenic 30.0%
GACCTTTCAATTTGATTACA+TGG + Chr4:6160853-6160872 MsG0480018527.01.T01:intron 30.0%
GGTTGACAAAATGTATTGTT+TGG + Chr4:6165425-6165444 MsG0480018527.01.T01:intron 30.0%
GTACCAATTCTTGTAGTATT+AGG - Chr4:6159395-6159414 None:intergenic 30.0%
GTACTATATTCTCTTGGTTA+TGG - Chr4:6166292-6166311 None:intergenic 30.0%
GTCATCTTATCAAATACATG+AGG - Chr4:6162582-6162601 None:intergenic 30.0%
GTGGAAAAAGTAAAGAAGTA+TGG + Chr4:6162022-6162041 MsG0480018527.01.T01:CDS 30.0%
TACAAGAATTGGTACAAACA+TGG + Chr4:6159400-6159419 MsG0480018527.01.T01:intron 30.0%
TAGAGGTAATTGAAAGTTGT+AGG + Chr4:6165102-6165121 MsG0480018527.01.T01:intron 30.0%
TAGGAAATAGGGTAAAGTAA+AGG - Chr4:6159376-6159395 None:intergenic 30.0%
TATGTTATAAGCTAGCATAG+TGG - Chr4:6165579-6165598 None:intergenic 30.0%
TATTAGAAGTTCATCTCCTA+TGG - Chr4:6166654-6166673 None:intergenic 30.0%
TCAAGAATCTTACAAGACTA+AGG + Chr4:6163313-6163332 MsG0480018527.01.T01:CDS 30.0%
TCACAATCTCATTCAACAAA+TGG + Chr4:6164702-6164721 MsG0480018527.01.T01:intron 30.0%
TCATTCGTCAAGAAATTTGT+TGG - Chr4:6165349-6165368 None:intergenic 30.0%
TCTGCTACCAATAAAAAAGA+CGG - Chr4:6162891-6162910 None:intergenic 30.0%
TCTTTGTATATGCAACTGAT+TGG + Chr4:6164991-6165010 MsG0480018527.01.T01:intron 30.0%
TGAAAAGACAGTTATCAAAC+GGG - Chr4:6165742-6165761 None:intergenic 30.0%
TGATAAAGATGATCTGTTTG+AGG + Chr4:6161840-6161859 MsG0480018527.01.T01:CDS 30.0%
TGATAAATGAAACCTCTCAA+AGG + Chr4:6165519-6165538 MsG0480018527.01.T01:intron 30.0%
TGCCATGTAATCAAATTGAA+AGG - Chr4:6160858-6160877 None:intergenic 30.0%
TGGACTTAATTCAACAAAGT+TGG + Chr4:6165785-6165804 MsG0480018527.01.T01:intron 30.0%
TGTATTTCTTCAGAGAAGTA+AGG + Chr4:6159199-6159218 MsG0480018527.01.T01:intron 30.0%
TTAAAATCAAGGTTTCAGCA+TGG + Chr4:6163925-6163944 MsG0480018527.01.T01:CDS 30.0%
TTCCATGTACTATATTCTCT+TGG - Chr4:6166298-6166317 None:intergenic 30.0%
TTGTCAAGAGAGAAAATAGA+TGG - Chr4:6163039-6163058 None:intergenic 30.0%
! AAAAAAGTATGAATTGTCCG+AGG + Chr4:6160599-6160618 MsG0480018527.01.T01:CDS 30.0%
! AAAAGTCTTATCCCATTAAG+TGG + Chr4:6159764-6159783 MsG0480018527.01.T01:intron 30.0%
! AAACTTTTCCCAACATTTCA+AGG - Chr4:6164173-6164192 None:intergenic 30.0%
! AAAGTCTTATCCCATTAAGT+GGG + Chr4:6159765-6159784 MsG0480018527.01.T01:intron 30.0%
! AAATGGTTGATATCAAATGC+GGG - Chr4:6164310-6164329 None:intergenic 30.0%
! AGTTTCATTTTCAACCTAGA+AGG - Chr4:6165067-6165086 None:intergenic 30.0%
! GAAATGGTTGATATCAAATG+CGG - Chr4:6164311-6164330 None:intergenic 30.0%
! GACAAATGAAGTGTTTGATT+TGG + Chr4:6166607-6166626 MsG0480018527.01.T01:CDS 30.0%
! GACCCCTAATGTTTTATAAA+TGG - Chr4:6159329-6159348 None:intergenic 30.0%
! GATATTGCTTGTTTCTTCAA+TGG + Chr4:6162150-6162169 MsG0480018527.01.T01:CDS 30.0%
! GCCAAAACTTTAAGAACTAA+TGG - Chr4:6161991-6162010 None:intergenic 30.0%
! GGTTTGATTATTTTCCTCAA+GGG + Chr4:6162637-6162656 MsG0480018527.01.T01:CDS 30.0%
! GTTTTGTGATGTATCAAAGA+GGG + Chr4:6161942-6161961 MsG0480018527.01.T01:CDS 30.0%
! TGAAGATATTTTATACCACG+TGG - Chr4:6162675-6162694 None:intergenic 30.0%
! TGAAGGATCATCCATTTTAT+TGG + Chr4:6160410-6160429 MsG0480018527.01.T01:CDS 30.0%
! TGAATTTTCGTGATATAGAG+GGG + Chr4:6162616-6162635 MsG0480018527.01.T01:CDS 30.0%
! TGCAGAGAATCTTGTTATAT+TGG + Chr4:6162737-6162756 MsG0480018527.01.T01:CDS 30.0%
! TGTGATATTGCCATTTGAAT+GGG + Chr4:6164929-6164948 MsG0480018527.01.T01:intron 30.0%
! TTGTGATATTGCCATTTGAA+TGG + Chr4:6164928-6164947 MsG0480018527.01.T01:intron 30.0%
!! AGTTTTGTGATGTATCAAAG+AGG + Chr4:6161941-6161960 MsG0480018527.01.T01:CDS 30.0%
!! GATGTTTTTGTAAGCTTTAG+GGG + Chr4:6160261-6160280 MsG0480018527.01.T01:CDS 30.0%
!! TCAGACAAGCTTTAAAATCA+AGG + Chr4:6163914-6163933 MsG0480018527.01.T01:CDS 30.0%
!! TGAGATTTTGATATGTTGAC+TGG - Chr4:6164007-6164026 None:intergenic 30.0%
!! TGATATGTTGACTGGTTTAT+GGG - Chr4:6163999-6164018 None:intergenic 30.0%
!! TTGATATGTTGACTGGTTTA+TGG - Chr4:6164000-6164019 None:intergenic 30.0%
!! TTTCTGGCAATGATTTTAGA+GGG - Chr4:6162710-6162729 None:intergenic 30.0%
!! TTTTCTGGCAATGATTTTAG+AGG - Chr4:6162711-6162730 None:intergenic 30.0%
!!! ATTGCTATTTTCATCCTTGT+TGG - Chr4:6166242-6166261 None:intergenic 30.0%
!!! TATCTCACCGTCTTTTTTAT+TGG + Chr4:6162881-6162900 MsG0480018527.01.T01:intron 30.0%
!!! TTGTTTTTGCTTTTCAGACT+CGG + Chr4:6159491-6159510 MsG0480018527.01.T01:intron 30.0%
!!! TTTTGCTTTGTTATTGCTTG+GGG + Chr4:6163702-6163721 MsG0480018527.01.T01:CDS 30.0%
AAAAAACAAAGCCCAGCAAA+GGG - Chr4:6163686-6163705 None:intergenic 35.0%
AAAACTATGCTTCTTCACGT+TGG + Chr4:6160445-6160464 MsG0480018527.01.T01:CDS 35.0%
AAAATGGAGAACCAAAACTG+CGG - Chr4:6160778-6160797 None:intergenic 35.0%
AACAGTTGCTGAACAATTCA+AGG + Chr4:6163446-6163465 MsG0480018527.01.T01:CDS 35.0%
AATTGTTCAGCAACTGTTGA+AGG - Chr4:6163444-6163463 None:intergenic 35.0%
ACAAATATTGAGAGACGGAT+TGG + Chr4:6161673-6161692 MsG0480018527.01.T01:CDS 35.0%
ACATGTAGAGAGAAGACATA+TGG - Chr4:6159933-6159952 None:intergenic 35.0%
ACATTCTACAAGAAATGGGT+CGG + Chr4:6162310-6162329 MsG0480018527.01.T01:CDS 35.0%
AGAGAAGACATATGGATGTA+AGG - Chr4:6159925-6159944 None:intergenic 35.0%
AGAGTTAACAAGACATGGAA+TGG + Chr4:6161594-6161613 MsG0480018527.01.T01:CDS 35.0%
AGGACAAAATGAGAATCAAG+GGG + Chr4:6165539-6165558 MsG0480018527.01.T01:intron 35.0%
AGGCAACATCAGAAATGAAA+TGG - Chr4:6164327-6164346 None:intergenic 35.0%
AGTAGAGTTTCAACTGATGA+AGG - Chr4:6163387-6163406 None:intergenic 35.0%
AGTGAAGAGTTAACAAGACA+TGG + Chr4:6161589-6161608 MsG0480018527.01.T01:CDS 35.0%
ATAAAGGAGGGAGCTTAAAT+TGG - Chr4:6163118-6163137 None:intergenic 35.0%
ATACCCCAAATTCCAATAAC+AGG - Chr4:6161481-6161500 None:intergenic 35.0%
ATTGTTCAGCAACTGTTGAA+GGG - Chr4:6163443-6163462 None:intergenic 35.0%
CAAGAGAGAAAATAGATGGA+TGG - Chr4:6163035-6163054 None:intergenic 35.0%
CGATACATCCTTCAATCAAT+AGG + Chr4:6161302-6161321 MsG0480018527.01.T01:intron 35.0%
CTAAAGGACAATGACTTTAG+AGG + Chr4:6165085-6165104 MsG0480018527.01.T01:intron 35.0%
CTATATTCTCTTGGTTATGG+AGG - Chr4:6166289-6166308 None:intergenic 35.0%
CTTACCTAATCATGATTCGA+TGG + Chr4:6165987-6166006 MsG0480018527.01.T01:intron 35.0%
CTTTCTAAGCCATTTGGTTA+AGG + Chr4:6160302-6160321 MsG0480018527.01.T01:CDS 35.0%
CTTTGACATCCAAAAGATGA+TGG - Chr4:6163237-6163256 None:intergenic 35.0%
GAAAGAAGCAGGATCATTTA+AGG - Chr4:6164825-6164844 None:intergenic 35.0%
GACTTCTAATCTTGATCCAT+TGG - Chr4:6165913-6165932 None:intergenic 35.0%
GATCAGCTGGAAAAGTTATT+TGG + Chr4:6161739-6161758 MsG0480018527.01.T01:CDS 35.0%
GCACATAGAGAGAAATTAGT+TGG + Chr4:6165305-6165324 MsG0480018527.01.T01:intron 35.0%
GCATGACATTCTACAAGAAA+TGG + Chr4:6162305-6162324 MsG0480018527.01.T01:CDS 35.0%
GTAAGATTCTTGATGCTTGA+AGG - Chr4:6163306-6163325 None:intergenic 35.0%
GTAGAGAGAAATTAGTTCGT+CGG + Chr4:6164590-6164609 MsG0480018527.01.T01:intron 35.0%
GTGATATGTTGAGTGGTTTA+TGG - Chr4:6164679-6164698 None:intergenic 35.0%
GTTAAAGAAAGAGTCACACA+AGG + Chr4:6161453-6161472 MsG0480018527.01.T01:CDS 35.0%
GTTTAACCGAAGATGATTTG+AGG + Chr4:6164389-6164408 MsG0480018527.01.T01:intron 35.0%
TAAACGCCTCAAATCATCTT+CGG - Chr4:6164398-6164417 None:intergenic 35.0%
TACCAGTTAAGAGTTCCAAA+AGG - Chr4:6166517-6166536 None:intergenic 35.0%
TACCCCAAATTCCAATAACA+GGG - Chr4:6161480-6161499 None:intergenic 35.0%
TAGACCATCGAATCATGATT+AGG - Chr4:6165994-6166013 None:intergenic 35.0%
TAGGTGAAGTTAAAAGGGTT+TGG + Chr4:6164645-6164664 MsG0480018527.01.T01:intron 35.0%
TCAAAGCAATCTAGAAATCC+TGG + Chr4:6163251-6163270 MsG0480018527.01.T01:CDS 35.0%
TGAAAAACGCAGTCACTTAT+GGG + Chr4:6162365-6162384 MsG0480018527.01.T01:CDS 35.0%
TGACAAAGCCTTGAAATGTT+GGG + Chr4:6164162-6164181 MsG0480018527.01.T01:intron 35.0%
TGTAGCAATGATATTGGTGT+TGG - Chr4:6166408-6166427 None:intergenic 35.0%
TGTCGATGACAAACTTAAGA+GGG + Chr4:6160353-6160372 MsG0480018527.01.T01:CDS 35.0%
TTAACTTCTCCTTGATGGAA+AGG - Chr4:6163959-6163978 None:intergenic 35.0%
TTCAGAAGCCCTAAAACTTA+AGG + Chr4:6162972-6162991 MsG0480018527.01.T01:CDS 35.0%
TTCTAACAGTGATAAGTCAG+TGG + Chr4:6162215-6162234 MsG0480018527.01.T01:CDS 35.0%
TTGAAGGAAAAACCAATGTG+TGG + Chr4:6165230-6165249 MsG0480018527.01.T01:intron 35.0%
TTGTATATGCAACTGATTGG+AGG + Chr4:6164994-6165013 MsG0480018527.01.T01:intron 35.0%
TTGTCGATGACAAACTTAAG+AGG + Chr4:6160352-6160371 MsG0480018527.01.T01:CDS 35.0%
TTTATATCAGAGACCCCTAA+TGG - Chr4:6159275-6159294 None:intergenic 35.0%
TTTATTAGTACCTCAACCTC+AGG - Chr4:6159124-6159143 None:intergenic 35.0%
! AAAGATGATCTGTTTGAGGT+TGG + Chr4:6161844-6161863 MsG0480018527.01.T01:CDS 35.0%
! AAATGAGTTGGAGAAAGACA+TGG - Chr4:6159818-6159837 None:intergenic 35.0%
! AAGATGATCTGTTTGAGGTT+GGG + Chr4:6161845-6161864 MsG0480018527.01.T01:CDS 35.0%
! AGTTATTTGGAACTCGTGAT+TGG + Chr4:6161752-6161771 MsG0480018527.01.T01:CDS 35.0%
! ATAAGTGACTGCGTTTTTCA+GGG - Chr4:6162365-6162384 None:intergenic 35.0%
! ATCGTTCTTGATGACATCAA+GGG + Chr4:6161712-6161731 MsG0480018527.01.T01:CDS 35.0%
! CTCGGTCTTTGTTTACATTA+AGG + Chr4:6159509-6159528 MsG0480018527.01.T01:intron 35.0%
! GCATCATTCCTATTGATTGA+AGG - Chr4:6161313-6161332 None:intergenic 35.0%
! GGGTTTGATTATTTTCCTCA+AGG + Chr4:6162636-6162655 MsG0480018527.01.T01:CDS 35.0%
! GTTATTGGAATTTGGGGTAT+GGG + Chr4:6161481-6161500 MsG0480018527.01.T01:CDS 35.0%
! GTTTCTCGTATAGCTTTTCT+AGG + Chr4:6159859-6159878 MsG0480018527.01.T01:intron 35.0%
! TAAGACTTGGTTGTTGTTGT+TGG - Chr4:6159723-6159742 None:intergenic 35.0%
! TATCGTTCTTGATGACATCA+AGG + Chr4:6161711-6161730 MsG0480018527.01.T01:CDS 35.0%
! TCACTTGTTGAAGCAATTGA+AGG + Chr4:6160393-6160412 MsG0480018527.01.T01:CDS 35.0%
! TGTTATTGGAATTTGGGGTA+TGG + Chr4:6161480-6161499 MsG0480018527.01.T01:CDS 35.0%
! TTCTCATTTTGTCCTTTGAG+AGG - Chr4:6165534-6165553 None:intergenic 35.0%
! TTCTCTGCAGAAAACTTTTC+TGG - Chr4:6162726-6162745 None:intergenic 35.0%
! TTCTTTGTCTTTGAAAGCTC+CGG - Chr4:6166455-6166474 None:intergenic 35.0%
! TTTTGATGTCGTACTTCTGT+AGG - Chr4:6160552-6160571 None:intergenic 35.0%
!! AAGGAGAAGTTAAAAGCGTT+TGG + Chr4:6163966-6163985 MsG0480018527.01.T01:CDS 35.0%
!! ATATGATGGTTGCTGTTTCT+TGG + Chr4:6161558-6161577 MsG0480018527.01.T01:CDS 35.0%
!! CAATGGGTTGAATTTGAAAG+TGG + Chr4:6162167-6162186 MsG0480018527.01.T01:CDS 35.0%
!! GAATGAGGAGTATTGTTGTT+TGG - Chr4:6160234-6160253 None:intergenic 35.0%
!! GATATGTTGACTGGTTTATG+GGG - Chr4:6163998-6164017 None:intergenic 35.0%
!! GTTTGATTTGGAACTCATGA+GGG + Chr4:6166619-6166638 MsG0480018527.01.T01:CDS 35.0%
!! TGTTTGATTTGGAACTCATG+AGG + Chr4:6166618-6166637 MsG0480018527.01.T01:CDS 35.0%
!! TTTGCTTTGTTATTGCTTGG+GGG + Chr4:6163703-6163722 MsG0480018527.01.T01:CDS 35.0%
!! TTTTGCTATAACCGCAGTTT+TGG + Chr4:6160764-6160783 MsG0480018527.01.T01:intron 35.0%
!!! ATCCTTTTGGAACTCTTAAC+TGG + Chr4:6166512-6166531 MsG0480018527.01.T01:CDS 35.0%
!!! TTTTCTTGGCTTTGTATGCT+TGG + Chr4:6160922-6160941 MsG0480018527.01.T01:intron 35.0%
AAAAACAAAGCCCAGCAAAG+GGG - Chr4:6163685-6163704 None:intergenic 40.0%
AAAAGTCTGGTAACTCCTTC+AGG - Chr4:6162954-6162973 None:intergenic 40.0%
AAACATTAGGGGTCTCAGTA+AGG + Chr4:6159335-6159354 MsG0480018527.01.T01:intron 40.0%
AAACTAGACCTATGGTGGTT+TGG - Chr4:6159956-6159975 None:intergenic 40.0%
AACTTGGAAATGCAGCCATT+AGG + Chr4:6159257-6159276 MsG0480018527.01.T01:CDS 40.0%
AAGGAGAGTAGATCAGTTGT+AGG - Chr4:6159906-6159925 None:intergenic 40.0%
AAGTCTTGGATACAATGCAC+CGG + Chr4:6166433-6166452 MsG0480018527.01.T01:CDS 40.0%
AATTGAGGGTGACGATGAAA+AGG + Chr4:6163764-6163783 MsG0480018527.01.T01:CDS 40.0%
AATTGTCCGAGGTTCAAATG+TGG + Chr4:6160610-6160629 MsG0480018527.01.T01:CDS 40.0%
ACAAGAAAAGGGTTGAGTTC+TGG + Chr4:6163472-6163491 MsG0480018527.01.T01:CDS 40.0%
ACACAATCACACATTGTCGT+TGG + Chr4:6165881-6165900 MsG0480018527.01.T01:intron 40.0%
ACCAATATCATTGCTACAGC+CGG + Chr4:6166410-6166429 MsG0480018527.01.T01:CDS 40.0%
ACCCCAAATTCCAATAACAG+GGG - Chr4:6161479-6161498 None:intergenic 40.0%
ACTTGGAAATGCAGCCATTA+GGG + Chr4:6159258-6159277 MsG0480018527.01.T01:CDS 40.0%
AGAAGTTCATCTCCTATGGT+TGG - Chr4:6166650-6166669 None:intergenic 40.0%
AGACCAAAATCTGTGATGTG+AGG - Chr4:6166362-6166381 None:intergenic 40.0%
AGCAAAAACCAACCACACAT+TGG - Chr4:6165245-6165264 None:intergenic 40.0%
AGGAAAAACCAATGTGTGGT+TGG + Chr4:6165234-6165253 MsG0480018527.01.T01:intron 40.0%
AGGAGAGTAGATCAGTTGTA+GGG - Chr4:6159905-6159924 None:intergenic 40.0%
AGGGTGATCAATTATGCCAA+AGG + Chr4:6161961-6161980 MsG0480018527.01.T01:CDS 40.0%
ATAGCCTACTGGAAAAGCTT+TGG + Chr4:6162769-6162788 MsG0480018527.01.T01:CDS 40.0%
ATCCAAGGTTGAGATAAAGG+AGG - Chr4:6163131-6163150 None:intergenic 40.0%
ATCCAATAGTACGTTGCTTG+AGG - Chr4:6166327-6166346 None:intergenic 40.0%
ATTACAGACTCTACCAAAGC+TGG + Chr4:6165956-6165975 MsG0480018527.01.T01:intron 40.0%
CAAAAAACAAAGCCCAGCAA+AGG - Chr4:6163687-6163706 None:intergenic 40.0%
CAACCTCATCAACACAACTT+TGG - Chr4:6161356-6161375 None:intergenic 40.0%
CAGGGTCTTTACTAGATTCT+CGG - Chr4:6162347-6162366 None:intergenic 40.0%
CATTCTACAAGAAATGGGTC+GGG + Chr4:6162311-6162330 MsG0480018527.01.T01:CDS 40.0%
CCTGCTTCTTTCCAATGTTT+GGG + Chr4:6164833-6164852 MsG0480018527.01.T01:intron 40.0%
CTGAAAAACGCAGTCACTTA+TGG + Chr4:6162364-6162383 MsG0480018527.01.T01:CDS 40.0%
GACAGAATTCCTTTCCATCA+AGG + Chr4:6163947-6163966 MsG0480018527.01.T01:CDS 40.0%
GACCAAAATCTGTGATGTGA+GGG - Chr4:6166361-6166380 None:intergenic 40.0%
GACCTGAAATCGTTGTTGAA+TGG + Chr4:6166216-6166235 MsG0480018527.01.T01:CDS 40.0%
GAGGAAAAGCCTTAACCAAA+TGG - Chr4:6160314-6160333 None:intergenic 40.0%
GCATAAGTCTGTCAACAATG+AGG + Chr4:6162541-6162560 MsG0480018527.01.T01:CDS 40.0%
GGAGCTTAAATTGGAATTGC+TGG - Chr4:6163109-6163128 None:intergenic 40.0%
GGATCTACCCCATAGAAAAT+AGG - Chr4:6160531-6160550 None:intergenic 40.0%
GTCGATGACAAACTTAAGAG+GGG + Chr4:6160354-6160373 MsG0480018527.01.T01:CDS 40.0%
GTCTTGTACTCAAACCAATC+TGG - Chr4:6163618-6163637 None:intergenic 40.0%
GTGACAAAGCCTTGAAATGT+TGG + Chr4:6164161-6164180 MsG0480018527.01.T01:intron 40.0%
GTGATCTGTGATATGTTGAG+TGG - Chr4:6164686-6164705 None:intergenic 40.0%
GTTGGAGAAAGACATGGTTA+TGG - Chr4:6159812-6159831 None:intergenic 40.0%
TCATAGTCGACCCACTTAAT+GGG - Chr4:6159778-6159797 None:intergenic 40.0%
TCCAAGGTTGAGATAAAGGA+GGG - Chr4:6163130-6163149 None:intergenic 40.0%
TCCTGCTTCTTTCCAATGTT+TGG + Chr4:6164832-6164851 MsG0480018527.01.T01:intron 40.0%
TCTTGACAAGCTTGTGCATT+TGG + Chr4:6163050-6163069 MsG0480018527.01.T01:CDS 40.0%
TGCATTGTATCCAAGACTTC+CGG - Chr4:6166432-6166451 None:intergenic 40.0%
TTCATAGTCGACCCACTTAA+TGG - Chr4:6159779-6159798 None:intergenic 40.0%
TTTGAAGGAGAACCAATGTG+TGG + Chr4:6164511-6164530 MsG0480018527.01.T01:intron 40.0%
! AAAAGCGCAAGTTCTTCAGT+AGG - Chr4:6161880-6161899 None:intergenic 40.0%
! AACCCTCACATCACAGATTT+TGG + Chr4:6166356-6166375 MsG0480018527.01.T01:CDS 40.0%
! AATGCACTGCCATCATCTTT+TGG + Chr4:6163225-6163244 MsG0480018527.01.T01:CDS 40.0%
! ACCATAGGTCTAGTTTCTAC+CGG + Chr4:6159960-6159979 MsG0480018527.01.T01:intron 40.0%
! ACTTGGTTGTTGTTGTTGGA+AGG - Chr4:6159719-6159738 None:intergenic 40.0%
! AGATGATCTGTTTGAGGTTG+GGG + Chr4:6161846-6161865 MsG0480018527.01.T01:CDS 40.0%
! CAGTGGCTTTTGTGTTAGAA+AGG + Chr4:6162232-6162251 MsG0480018527.01.T01:CDS 40.0%
! CATAAGTGACTGCGTTTTTC+AGG - Chr4:6162366-6162385 None:intergenic 40.0%
! GGCTTTTGTGTTAGAAAGGT+TGG + Chr4:6162236-6162255 MsG0480018527.01.T01:CDS 40.0%
! GTAAGTTCAAGTTCCAGCTT+TGG - Chr4:6165972-6165991 None:intergenic 40.0%
! TCACCAAAGTTGTGTTGATG+AGG + Chr4:6161350-6161369 MsG0480018527.01.T01:CDS 40.0%
! TTTAGGGCTTCTGAAAAGTC+TGG - Chr4:6162967-6162986 None:intergenic 40.0%
!! GAGAGAAATTAGTTGGTAGG+AGG + Chr4:6165312-6165331 MsG0480018527.01.T01:intron 40.0%
!! GTTCTGGAATTGCTTGAACT+TGG + Chr4:6163488-6163507 MsG0480018527.01.T01:CDS 40.0%
!! TGGTTGCTGTTTCTTGGAAA+AGG + Chr4:6161564-6161583 MsG0480018527.01.T01:CDS 40.0%
!!! CGCTTTTAACTTCTCCTTGA+TGG - Chr4:6163964-6163983 None:intergenic 40.0%
!!! GTTTTGGCTAATATGCTTCG+TGG + Chr4:6162003-6162022 MsG0480018527.01.T01:CDS 40.0%
!!! TAAACGTCGGTTTTTGTCGT+AGG - Chr4:6166479-6166498 None:intergenic 40.0%
!!! TTTTGTAAGCTTTAGGGGTG+AGG + Chr4:6160266-6160285 MsG0480018527.01.T01:CDS 40.0%
AAAACCGACGTTTACAGCCT+CGG + Chr4:6166485-6166504 MsG0480018527.01.T01:CDS 45.0%
AAACATATACCTGCTGCTCG+TGG + Chr4:6166194-6166213 MsG0480018527.01.T01:CDS 45.0%
AAGGAGAACCAATGTGTGGT+GGG + Chr4:6164515-6164534 MsG0480018527.01.T01:intron 45.0%
AATGGCTTAGAAAGTCGTGG+CGG - Chr4:6160296-6160315 None:intergenic 45.0%
ACCATAAACCCACCACACAT+TGG - Chr4:6164526-6164545 None:intergenic 45.0%
ACCGGTAGAAACTAGACCTA+TGG - Chr4:6159964-6159983 None:intergenic 45.0%
ACTATGCTTCTTCACGTTGG+TGG + Chr4:6160448-6160467 MsG0480018527.01.T01:CDS 45.0%
AGAATTAGCGGGGTAAGACT+TGG - Chr4:6159736-6159755 None:intergenic 45.0%
AGGAGAACCAACAAATGGCA+TGG + Chr4:6166544-6166563 MsG0480018527.01.T01:CDS 45.0%
AGGCCCCTGTTATTGGAATT+TGG + Chr4:6161473-6161492 MsG0480018527.01.T01:CDS 45.0%
ATGGAACACGAATGTGCTGA+AGG + Chr4:6164035-6164054 MsG0480018527.01.T01:CDS 45.0%
ATGGAATACGACTGTGCTGA+AGG + Chr4:6164721-6164740 MsG0480018527.01.T01:intron 45.0%
ATGGCATATGCCAGTCGATA+TGG - Chr4:6163797-6163816 None:intergenic 45.0%
CACCTCAAGCAACGTACTAT+TGG + Chr4:6166322-6166341 MsG0480018527.01.T01:CDS 45.0%
CCAAATGGCTTAGAAAGTCG+TGG - Chr4:6160299-6160318 None:intergenic 45.0%
CCACGACTTTCTAAGCCATT+TGG + Chr4:6160296-6160315 MsG0480018527.01.T01:CDS 45.0%
CCCAAACATTGGAAAGAAGC+AGG - Chr4:6164836-6164855 None:intergenic 45.0%
CGACAAAACAAAGTGTGTCG+AGG + Chr4:6164124-6164143 MsG0480018527.01.T01:intron 45.0%
CTACATGTCCAAACCACCAT+AGG + Chr4:6159945-6159964 MsG0480018527.01.T01:intron 45.0%
CTCTTAACTGGTAAACCACC+AGG + Chr4:6166524-6166543 MsG0480018527.01.T01:CDS 45.0%
CTGGAAGTAGTGTTCCAGAT+TGG + Chr4:6163601-6163620 MsG0480018527.01.T01:CDS 45.0%
CTTGGAAATGCAGCCATTAG+GGG + Chr4:6159259-6159278 MsG0480018527.01.T01:CDS 45.0%
GAACGATAAGAGCCTTCATG+CGG - Chr4:6161699-6161718 None:intergenic 45.0%
GAGAATCAAGGGGTCTCTTT+GGG + Chr4:6165549-6165568 MsG0480018527.01.T01:intron 45.0%
GAGAGAAATTAGTTCGTCGG+AGG + Chr4:6164593-6164612 MsG0480018527.01.T01:intron 45.0%
GCCCCTGTTATTGGAATTTG+GGG + Chr4:6161475-6161494 MsG0480018527.01.T01:CDS 45.0%
GGAAAAGATTGAAGCCCTTG+AGG - Chr4:6162654-6162673 None:intergenic 45.0%
GGACTTGTCATATAGCCTAC+TGG + Chr4:6162758-6162777 MsG0480018527.01.T01:CDS 45.0%
GGAGAGTAGATCAGTTGTAG+GGG - Chr4:6159904-6159923 None:intergenic 45.0%
GGCCATTCAACAACGATTTC+AGG - Chr4:6166221-6166240 None:intergenic 45.0%
GGCCCCTGTTATTGGAATTT+GGG + Chr4:6161474-6161493 MsG0480018527.01.T01:CDS 45.0%
GGTAGAAACTAGACCTATGG+TGG - Chr4:6159961-6159980 None:intergenic 45.0%
GTCTCTCCACATTTGAACCT+CGG - Chr4:6160619-6160638 None:intergenic 45.0%
GTTCCAAAAGGATAACACCG+AGG - Chr4:6166505-6166524 None:intergenic 45.0%
TCAACTGATGAAGGAAGCTC+AGG - Chr4:6163378-6163397 None:intergenic 45.0%
TCCCTCCTTTATCTCAACCT+TGG + Chr4:6163126-6163145 MsG0480018527.01.T01:CDS 45.0%
TCCGGCTGTAGCAATGATAT+TGG - Chr4:6166414-6166433 None:intergenic 45.0%
TCGTTGTTGAATGGCCAACA+AGG + Chr4:6166225-6166244 MsG0480018527.01.T01:CDS 45.0%
TGAGAATCAAGGGGTCTCTT+TGG + Chr4:6165548-6165567 MsG0480018527.01.T01:intron 45.0%
TGCAACTGATTGGAGGTGAA+TGG + Chr4:6165001-6165020 MsG0480018527.01.T01:intron 45.0%
TGGCTGCATTTCCAAGTTAG+AGG - Chr4:6159255-6159274 None:intergenic 45.0%
TGGTGTGGAGTTCAGGTAAT+TGG + Chr4:6162789-6162808 MsG0480018527.01.T01:intron 45.0%
TTGTCGTTGGTATGTGCCAA+TGG + Chr4:6165894-6165913 MsG0480018527.01.T01:intron 45.0%
! AAAGCTTTGGTGTGGAGTTC+AGG + Chr4:6162782-6162801 MsG0480018527.01.T01:CDS 45.0%
! AGATGATGGCAGTGCATTGA+TGG - Chr4:6163223-6163242 None:intergenic 45.0%
! ATTGGAATTTGGGGTATGGG+CGG + Chr4:6161484-6161503 MsG0480018527.01.T01:CDS 45.0%
! CAATCTGGAACACTACTTCC+AGG - Chr4:6163603-6163622 None:intergenic 45.0%
! CACACCAAAGCTTTTCCAGT+AGG - Chr4:6162776-6162795 None:intergenic 45.0%
! CTACTGGAAAAGCTTTGGTG+TGG + Chr4:6162774-6162793 MsG0480018527.01.T01:CDS 45.0%
! CTGTTTGAGGTTGGGGTATT+GGG + Chr4:6161853-6161872 MsG0480018527.01.T01:CDS 45.0%
! GATGATGGCAGTGCATTGAT+GGG - Chr4:6163222-6163241 None:intergenic 45.0%
! GATTTGGAACTCATGAGGGA+TGG + Chr4:6166623-6166642 MsG0480018527.01.T01:CDS 45.0%
! GGTACTGAGAAGAACATCGT+TGG - Chr4:6163875-6163894 None:intergenic 45.0%
! TATCGACTGGCATATGCCAT+CGG + Chr4:6163797-6163816 MsG0480018527.01.T01:CDS 45.0%
! TCTGTTTGAGGTTGGGGTAT+TGG + Chr4:6161852-6161871 MsG0480018527.01.T01:CDS 45.0%
!! ACCAATGTGTGGTGGGTTTA+TGG + Chr4:6164522-6164541 MsG0480018527.01.T01:intron 45.0%
!! ATGCCATTTGTTGGTTCTCC+TGG - Chr4:6166545-6166564 None:intergenic 45.0%
!! CAATGATGGGCCCATTCAAA+TGG - Chr4:6164942-6164961 None:intergenic 45.0%
!! TTTGTTATTGCTTGGGGGAC+CGG + Chr4:6163708-6163727 MsG0480018527.01.T01:CDS 45.0%
!!! AATATTTTATTATTTAAACA+TGG - Chr4:6164910-6164929 None:intergenic 5.0%
AACACCGAGGCTGTAAACGT+CGG - Chr4:6166492-6166511 None:intergenic 50.0%
ACACGAATGTGCTGAAGGTG+AGG + Chr4:6164040-6164059 MsG0480018527.01.T01:intron 50.0%
ACATCATCTCTCCCCTTTGC+TGG + Chr4:6163671-6163690 MsG0480018527.01.T01:CDS 50.0%
ACGAATGTGCTGAAGGTGAG+GGG + Chr4:6164042-6164061 MsG0480018527.01.T01:intron 50.0%
ACGACGTTGCTCAAAGCTTC+TGG + Chr4:6163347-6163366 MsG0480018527.01.T01:CDS 50.0%
ACTCAGTTGGTCAAGCCTGA+AGG + Chr4:6162936-6162955 MsG0480018527.01.T01:CDS 50.0%
ACTGAGAACTGAGAACCCGA+TGG - Chr4:6163816-6163835 None:intergenic 50.0%
AGCAAAGGGGAGAGATGATG+TGG - Chr4:6163672-6163691 None:intergenic 50.0%
ATCGACTGGCATATGCCATC+GGG + Chr4:6163798-6163817 MsG0480018527.01.T01:CDS 50.0%
ATGAGGGATGGACCAACCAT+AGG + Chr4:6166635-6166654 MsG0480018527.01.T01:CDS 50.0%
ATTGCTACAGCCGGAAGTCT+TGG + Chr4:6166419-6166438 MsG0480018527.01.T01:CDS 50.0%
CAATAGGAATGATGCCGTGC+TGG + Chr4:6161318-6161337 MsG0480018527.01.T01:intron 50.0%
CACGAATGTGCTGAAGGTGA+GGG + Chr4:6164041-6164060 MsG0480018527.01.T01:intron 50.0%
CATCACGTGTTCCTTGACCA+CGG - Chr4:6159087-6159106 None:intergenic 50.0%
CATCATCTCTCCCCTTTGCT+GGG + Chr4:6163672-6163691 MsG0480018527.01.T01:CDS 50.0%
CCACCAGGAGAACCAACAAA+TGG + Chr4:6166539-6166558 MsG0480018527.01.T01:CDS 50.0%
CCAGATGGAATTGTTGCTGC+TGG + Chr4:6159227-6159246 MsG0480018527.01.T01:CDS 50.0%
CCAGCAGCAACAATTCCATC+TGG - Chr4:6159230-6159249 None:intergenic 50.0%
GAAGGAGAACCAATGTGTGG+TGG + Chr4:6164514-6164533 MsG0480018527.01.T01:intron 50.0%
GAGGGTGACGATGAAAAGGA+TGG + Chr4:6163768-6163787 MsG0480018527.01.T01:CDS 50.0%
GGTGATTTCTTCCACCAGCA+CGG - Chr4:6161335-6161354 None:intergenic 50.0%
GTGGTCAAGGAACACGTGAT+GGG + Chr4:6159086-6159105 MsG0480018527.01.T01:CDS 50.0%
TCACACAAGGCCCCTGTTAT+TGG + Chr4:6161466-6161485 MsG0480018527.01.T01:CDS 50.0%
TCTACAAGAAATGGGTCGGG+AGG + Chr4:6162314-6162333 MsG0480018527.01.T01:CDS 50.0%
TGCTGCTGGAACCTCTAACT+TGG + Chr4:6159241-6159260 MsG0480018527.01.T01:CDS 50.0%
TGGTCAAGGAACACGTGATG+GGG + Chr4:6159087-6159106 MsG0480018527.01.T01:CDS 50.0%
TGTAGGGGAGTCAGATCACA+TGG - Chr4:6159889-6159908 None:intergenic 50.0%
! ATCAAGGGGTCTCTTTGGGA+AGG + Chr4:6165553-6165572 MsG0480018527.01.T01:intron 50.0%
! ATTTGGGGTATGGGCGGTAT+TGG + Chr4:6161490-6161509 MsG0480018527.01.T01:CDS 50.0%
! CAGTGCATTGATGGGACATC+TGG - Chr4:6163214-6163233 None:intergenic 50.0%
! CATCAAGGGTACAGATCAGC+TGG + Chr4:6161726-6161745 MsG0480018527.01.T01:CDS 50.0%
! GGCAAGTCCATGCCATTTGT+TGG - Chr4:6166554-6166573 None:intergenic 50.0%
! GGGCTTCAATCTTTTCCACG+TGG + Chr4:6162657-6162676 MsG0480018527.01.T01:CDS 50.0%
! GTTGAAGGGTGCAGCAGAAA+AGG + Chr4:6160203-6160222 MsG0480018527.01.T01:intron 50.0%
! TTGTTATTGCGCCGTGGTCA+AGG + Chr4:6159073-6159092 MsG0480018527.01.T01:CDS 50.0%
!! AGAAGTAAGGCATCGCCAGA+TGG + Chr4:6159212-6159231 MsG0480018527.01.T01:CDS 50.0%
!! CCATTTGTTGGTTCTCCTGG+TGG - Chr4:6166542-6166561 None:intergenic 50.0%
!! GGGTCTTATTCCTGAGGTTG+AGG + Chr4:6159111-6159130 MsG0480018527.01.T01:CDS 50.0%
!!! CAGCCTCGGTGTTATCCTTT+TGG + Chr4:6166499-6166518 MsG0480018527.01.T01:CDS 50.0%
ACGACTGTGCTGAAGGTGAG+AGG + Chr4:6164728-6164747 MsG0480018527.01.T01:intron 55.0%
AGGATGGCGTCCATATCGAC+TGG + Chr4:6163784-6163803 MsG0480018527.01.T01:CDS 55.0%
CGTGGTCAAGGAACACGTGA+TGG + Chr4:6159085-6159104 MsG0480018527.01.T01:CDS 55.0%
TAGGAATGATGCCGTGCTGG+TGG + Chr4:6161321-6161340 MsG0480018527.01.T01:intron 55.0%
! ATTTCAGGTCCACGAGCAGC+AGG - Chr4:6166206-6166225 None:intergenic 55.0%
! GTTGCGTTGTTATTGCGCCG+TGG + Chr4:6159067-6159086 MsG0480018527.01.T01:CDS 55.0%
! TCAAGGAACACGTGATGGGG+CGG + Chr4:6159090-6159109 MsG0480018527.01.T01:CDS 55.0%
! CAAGGAACACGTGATGGGGC+GGG + Chr4:6159091-6159110 MsG0480018527.01.T01:CDS 60.0%
!! GAGACGGATTGGCCGCATGA+AGG + Chr4:6161684-6161703 MsG0480018527.01.T01:CDS 60.0%
!! TGGGGCGGGTCTTATTCCTG+AGG + Chr4:6159105-6159124 MsG0480018527.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr4 gene 6159016 6166685 6159016 ID=MsG0480018527.01;Name=MsG0480018527.01
Chr4 mRNA 6159016 6166685 6159016 ID=MsG0480018527.01.T01;Parent=MsG0480018527.01;Name=MsG0480018527.01.T01;_AED=0.46;_eAED=0.47;_QI=0|0.66|0.42|1|1|1|7|0|1243
Chr4 exon 6159016 6159132 6159016 ID=MsG0480018527.01.T01:exon:1595;Parent=MsG0480018527.01.T01
Chr4 exon 6159212 6159298 6159212 ID=MsG0480018527.01.T01:exon:1596;Parent=MsG0480018527.01.T01
Chr4 exon 6160210 6160688 6160210 ID=MsG0480018527.01.T01:exon:1597;Parent=MsG0480018527.01.T01
Chr4 exon 6161324 6162425 6161324 ID=MsG0480018527.01.T01:exon:1598;Parent=MsG0480018527.01.T01
Chr4 exon 6162522 6162803 6162522 ID=MsG0480018527.01.T01:exon:1599;Parent=MsG0480018527.01.T01
Chr4 exon 6162910 6164056 6162910 ID=MsG0480018527.01.T01:exon:1600;Parent=MsG0480018527.01.T01
Chr4 exon 6166168 6166685 6166168 ID=MsG0480018527.01.T01:exon:1601;Parent=MsG0480018527.01.T01
Chr4 CDS 6159016 6159132 6159016 ID=MsG0480018527.01.T01:cds;Parent=MsG0480018527.01.T01
Chr4 CDS 6159212 6159298 6159212 ID=MsG0480018527.01.T01:cds;Parent=MsG0480018527.01.T01
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Chr4 CDS 6166168 6166685 6166168 ID=MsG0480018527.01.T01:cds;Parent=MsG0480018527.01.T01
Gene Sequence

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