AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0480018538.01

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MsG0480018538.01.T01 AT5G17880 31.124 845 484 27 76 843 11 834 5.50e-80 287
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MsG0480018538.01.T01 AT5G45260 29.141 827 452 26 93 855 17 773 4.87e-63 235
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MsG0480018538.01.T01 AT5G44870 30.508 590 367 14 274 826 8 591 2.66e-57 215
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MsG0480018538.01.T01 AT1G27180 29.161 679 357 17 258 827 25 688 3.77e-57 217
MsG0480018538.01.T01 AT5G45050 30.154 650 384 23 258 855 4 635 2.34e-56 214
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MsG0480018538.01.T01 AT3G25510 28.184 369 220 11 581 905 627 994 7.96e-17 87.0
MsG0480018538.01.T01 AT3G25510 32.222 270 167 10 596 852 500 766 2.10e-13 75.9
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MsG0480018538.01.T01 AT1G72940 36.620 355 187 14 82 411 7 348 4.20e-45 168
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MsG0480018538.01.T01 AT3G02880 34.254 181 111 3 1040 1217 440 615 4.57e-27 119
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MsG0480018538.01.T01 AT5G62710 35.870 184 107 5 1039 1216 406 584 3.16e-25 112
MsG0480018538.01.T01 AT1G57830 41.727 139 78 2 86 222 23 160 3.89e-25 103
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MsG0480018538.01.T01 AT1G34110 41.176 187 100 5 1040 1218 869 1053 5.60e-25 113
MsG0480018538.01.T01 AT5G44900 37.349 166 95 4 83 240 17 181 5.97e-25 105
MsG0480018538.01.T01 AT3G19700 40.102 197 102 8 1034 1219 777 968 1.01e-24 112
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MsG0480018538.01.T01 AT4G20940 38.071 197 108 7 1031 1217 845 1037 2.04e-24 111
MsG0480018538.01.T01 AT1G60320 41.667 144 81 2 80 221 20 162 2.83e-24 101
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MsG0480018538.01.T01 AT5G18500 36.872 179 105 4 1042 1215 263 438 1.41e-22 103
MsG0480018538.01.T01 AT5G18500 36.872 179 105 4 1042 1215 263 438 1.41e-22 103
MsG0480018538.01.T01 AT5G18500 36.872 179 105 4 1042 1215 263 438 1.41e-22 103
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MsG0480018538.01.T01 AT3G20190 35.678 199 111 5 1040 1231 279 467 2.47e-22 102
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MsG0480018538.01.T01 AT1G31420 34.759 187 111 6 1034 1215 395 575 3.15e-22 103
MsG0480018538.01.T01 AT1G09970 36.364 187 104 7 1042 1219 776 956 3.37e-22 104
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MsG0480018538.01.T01 AT3G26940 33.511 188 115 5 1039 1217 168 354 9.72e-22 100
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MsG0480018538.01.T01 AT2G35620 34.574 188 110 6 1034 1215 392 572 1.55e-21 101
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MsG0480018538.01.T01 AT2G17220 33.696 184 115 5 1040 1218 189 370 1.86e-21 99.0
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MsG0480018538.01.T01 AT2G17220 33.696 184 115 5 1040 1218 190 371 2.00e-21 99.0
MsG0480018538.01.T01 AT3G15890 29.018 224 141 7 1005 1214 92 311 2.28e-21 97.8
MsG0480018538.01.T01 AT5G49770 35.263 190 106 6 1038 1217 725 907 2.33e-21 101
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MsG0480018538.01.T01 AT1G52540 29.596 223 139 7 1005 1214 93 310 2.40e-21 97.8
MsG0480018538.01.T01 AT2G37710 33.155 187 114 5 1036 1215 437 619 2.67e-21 100
MsG0480018538.01.T01 AT1G52540 27.305 282 181 9 946 1214 37 307 2.84e-21 97.4
MsG0480018538.01.T01 AT2G01950 32.692 208 121 5 1029 1218 924 1130 2.84e-21 101
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MsG0480018538.01.T01 AT1G68690 34.031 191 116 6 1035 1217 464 652 3.13e-21 100
MsG0480018538.01.T01 AT1G68690 34.031 191 116 6 1035 1217 464 652 3.13e-21 100
MsG0480018538.01.T01 AT1G68690 34.031 191 116 6 1035 1217 464 652 3.13e-21 100
MsG0480018538.01.T01 AT1G72180 34.694 196 115 7 1036 1225 781 969 3.89e-21 100
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MsG0480018538.01.T01 AT4G33430 33.880 183 111 4 1040 1215 432 611 4.15e-21 100
MsG0480018538.01.T01 AT1G51830 34.653 202 112 8 1025 1216 473 664 4.38e-21 100
MsG0480018538.01.T01 AT5G03140 34.783 184 105 6 1042 1214 468 647 4.53e-21 100
MsG0480018538.01.T01 AT1G51830 34.653 202 112 8 1025 1216 466 657 4.54e-21 100
MsG0480018538.01.T01 AT4G00960 31.183 186 118 5 1037 1214 147 330 4.63e-21 97.4
MsG0480018538.01.T01 AT5G45070 36.478 159 92 4 68 222 2 155 4.79e-21 97.1
MsG0480018538.01.T01 AT5G20690 31.522 184 112 5 1042 1218 482 658 5.67e-21 99.8
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MsG0480018538.01.T01 AT1G51810 34.158 202 113 8 1025 1216 530 721 6.16e-21 99.8
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MsG0480018538.01.T01 AT1G69990 30.811 185 118 4 1040 1217 385 566 6.90e-21 99.0
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MsG0480018538.01.T01 AT3G46370 33.173 208 125 6 1014 1216 560 758 8.94e-21 99.4
MsG0480018538.01.T01 AT1G09970 36.170 188 104 8 1042 1219 776 957 8.98e-21 99.8
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MsG0480018538.01.T01 AT1G27190 32.984 191 115 5 1037 1217 392 579 1.08e-20 98.6
MsG0480018538.01.T01 AT1G53430 36.058 208 106 10 1040 1231 723 919 1.18e-20 99.4
MsG0480018538.01.T01 AT1G75820 34.973 183 110 5 1040 1214 786 967 1.21e-20 99.4
MsG0480018538.01.T01 AT5G49780 36.979 192 101 8 1038 1217 724 907 1.24e-20 99.4
MsG0480018538.01.T01 AT3G09010 32.105 190 120 4 1032 1216 133 318 1.31e-20 96.3
MsG0480018538.01.T01 AT1G24030 38.235 136 75 4 1037 1167 155 286 1.31e-20 94.4
MsG0480018538.01.T01 AT2G23950 25.000 464 290 15 778 1215 138 569 1.42e-20 98.2
MsG0480018538.01.T01 AT4G31100 31.282 195 127 3 1028 1217 527 719 1.43e-20 98.6
MsG0480018538.01.T01 AT3G46410 31.313 198 127 5 1022 1216 64 255 1.46e-20 94.0
MsG0480018538.01.T01 AT5G10290 27.391 230 150 5 1000 1215 339 565 1.56e-20 98.2
MsG0480018538.01.T01 AT5G10290 27.391 230 150 5 1000 1215 339 565 1.56e-20 98.2
MsG0480018538.01.T01 AT4G29050 30.481 187 124 3 1036 1217 448 633 1.58e-20 98.2
MsG0480018538.01.T01 AT3G58690 33.871 186 105 6 1040 1214 185 363 1.61e-20 95.9

Find 226 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 466 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
AGGCCCCTGTTATTGGAATT+TGG 0.133598 4:+6317122 MsG0480018538.01.T01:CDS
TTCAAGATCACTTTGTTTAA+AGG 0.147333 4:-6317577 None:intergenic
TTTAATGATGATTATCCTTT+TGG 0.190258 4:+6314622 None:intergenic
CAGCCTCAGCGTTATTCTTT+TGG 0.193766 4:+6321814 MsG0480018538.01.T01:CDS
CTGTTTGAGGTTGGGGTATT+GGG 0.200579 4:+6317519 MsG0480018538.01.T01:CDS
GGCCATTCAACGACAATTTC+AGG 0.211739 4:-6321533 None:intergenic
TTGATATGTTGACTGGTTTA+TGG 0.222022 4:-6319667 None:intergenic
TGCAGAGAATCTTGTTATAT+TGG 0.222936 4:+6318403 MsG0480018538.01.T01:CDS
AACCCTCACATCACAGATTT+TGG 0.228477 4:+6321671 MsG0480018538.01.T01:CDS
ACATCATCTCTCCCCTTTGC+TGG 0.239856 4:+6319341 MsG0480018538.01.T01:CDS
TAAGGGAATCACAATTATTT+AGG 0.242621 4:-6318740 None:intergenic
GGCCCCTGTTATTGGAATTT+GGG 0.245136 4:+6317123 MsG0480018538.01.T01:CDS
TCCATTAGTTCTTAAAGTTT+TGG 0.248934 4:+6317653 MsG0480018538.01.T01:CDS
TCACACAAGGCCCCTGTTAT+TGG 0.259687 4:+6317115 MsG0480018538.01.T01:CDS
TCTTGACAAGCTTGTGCATT+TGG 0.260130 4:+6318716 MsG0480018538.01.T01:CDS
CATCATATTCAGAACAAATT+TGG 0.262756 4:-6317192 None:intergenic
TGAGAATATGACCAATAAAA+TGG 0.263733 4:-6316067 None:intergenic
AATGCACTGCCATCATCTTT+TGG 0.276507 4:+6318891 MsG0480018538.01.T01:CDS
TCTGTTTGAGGTTGGGGTAT+TGG 0.285818 4:+6317518 MsG0480018538.01.T01:CDS
GTACTATATTCTCTTGGTTA+TGG 0.286120 4:-6321604 None:intergenic
TTACAATGATCTTGATTGTT+TGG 0.301810 4:+6317776 MsG0480018538.01.T01:CDS
ATATGATGGTTGTTGTTTCT+TGG 0.303239 4:+6317207 MsG0480018538.01.T01:CDS
GATATTGCTTGTTTCTTCAA+TGG 0.308115 4:+6317816 MsG0480018538.01.T01:CDS
ACTTGGAAATGCAGCCATTA+GGG 0.309892 4:+6314868 MsG0480018538.01.T01:CDS
ATAAAGGAGGGAGCTTAAAT+TGG 0.312235 4:-6318781 None:intergenic
ACTTGAACTTCGACCAATAC+TGG 0.320537 4:-6322082 None:intergenic
GACAAATGAAGTGTTTGATT+TGG 0.323614 4:+6321925 MsG0480018538.01.T01:CDS
TGGCTGCATTTCCAAGTTAG+AGG 0.326386 4:-6314862 None:intergenic
GCATGACATTCTACAAGAAA+TGG 0.326557 4:+6317971 MsG0480018538.01.T01:CDS
GCCAAAACTTTAAGAACTAA+TGG 0.326653 4:-6317654 None:intergenic
ATTGATTGCAAAGAGAAATA+TGG 0.331008 4:+6316138 MsG0480018538.01.T01:CDS
GCATAAGTCTGTCAACAATA+TGG 0.336932 4:+6318207 MsG0480018538.01.T01:CDS
TTCAGAAGCCCTAAAACTTA+AGG 0.339592 4:+6318638 MsG0480018538.01.T01:CDS
ATGCCATTTGTTGGTTCTCC+TGG 0.340182 4:-6321860 None:intergenic
ATACCCCAAATTCCAATAAC+AGG 0.345832 4:-6317127 None:intergenic
AAAATCCAAGGTTGAGATAA+AGG 0.347352 4:-6318797 None:intergenic
ATGGCATATGCCAGTCGATA+TGG 0.348615 4:-6319464 None:intergenic
CACCTCAAGTAACATACTAT+TGG 0.354627 4:+6321637 MsG0480018538.01.T01:CDS
GGATCTACCCCATAGAAAAT+AGG 0.356591 4:-6316174 None:intergenic
ATATCACTAGGCAACCAATT+TGG 0.358855 4:-6317325 None:intergenic
GGAGCTTAAATTGGAATTGC+TGG 0.363466 4:-6318772 None:intergenic
ATTTGGGGTATGGGCGGTAT+TGG 0.365443 4:+6317139 MsG0480018538.01.T01:CDS
ATATTGCTTGTTTCTTCAAT+GGG 0.366097 4:+6317817 MsG0480018538.01.T01:CDS
GTAAGATTCTTGATGCTTGA+AGG 0.368326 4:-6318969 None:intergenic
AATACATCATAAATTTCATC+AGG 0.370510 4:-6318056 None:intergenic
CAGGGTCTTTACTAGATTCT+CGG 0.371792 4:-6318010 None:intergenic
TGAAAATTGATACACCAAAT+TGG 0.373158 4:+6317311 MsG0480018538.01.T01:CDS
AGGTTCAAACAGATGAATAA+AGG 0.376118 4:+6322122 MsG0480018538.01.T01:CDS
AAGAACTAATGGAATTCCTT+TGG 0.376934 4:-6317643 None:intergenic
ACGACGTTGCTCAAAGCTTC+TGG 0.377335 4:+6319013 MsG0480018538.01.T01:CDS
AACAGTTGCTGAACAATTCA+AGG 0.377803 4:+6319112 MsG0480018538.01.T01:CDS
CTTTCTAAGCCATTTGGTTA+AGG 0.377964 4:+6315948 MsG0480018538.01.T01:CDS
AAAAGTCTGGTAACTCCTTC+AGG 0.382664 4:-6318617 None:intergenic
TGATATGTTGACTGGTTTAT+GGG 0.383090 4:-6319666 None:intergenic
AGATGATCTGTTTGAGGTTG+GGG 0.385133 4:+6317512 MsG0480018538.01.T01:CDS
AAGATGATCTGTTTGAGGTT+GGG 0.389607 4:+6317511 MsG0480018538.01.T01:CDS
CATCATCTCTCCCCTTTGCT+GGG 0.391935 4:+6319342 MsG0480018538.01.T01:CDS
TCAGACAAGCTTTAAAATCA+AGG 0.392673 4:+6319584 MsG0480018538.01.T01:CDS
CCACGACTTTCTAAGCCATT+TGG 0.396143 4:+6315942 MsG0480018538.01.T01:CDS
TTGAAAATTACTATAATTGA+GGG 0.396640 4:+6319420 MsG0480018538.01.T01:CDS
CAATCTGGAACACTACTTCC+AGG 0.396876 4:-6319270 None:intergenic
TGCAAAACTTGTTTAACTTC+AGG 0.401562 4:-6322040 None:intergenic
CATCCATTGTTAAAGAAGAA+TGG 0.404547 4:+6321903 MsG0480018538.01.T01:CDS
AACTTGGAAATGCAGCCATT+AGG 0.406695 4:+6314867 MsG0480018538.01.T01:CDS
GGCAAGTCTATGCCATTTGT+TGG 0.409831 4:-6321869 None:intergenic
ATTGAAAATTACTATAATTG+AGG 0.411319 4:+6319419 MsG0480018538.01.T01:CDS
AAGGAGAAGTTAAAAGCGTT+TGG 0.412575 4:+6319636 MsG0480018538.01.T01:CDS
TTTAGGGCTTCTGAAAAGTC+TGG 0.413832 4:-6318630 None:intergenic
TCAAAATCTCATTCAACAAA+TGG 0.414187 4:+6319686 MsG0480018538.01.T01:CDS
TGTTATTGGAATTTGGGGTA+TGG 0.414853 4:+6317129 MsG0480018538.01.T01:CDS
AATTGCTGGTAAATGTTGTA+AGG 0.424335 4:-6318758 None:intergenic
CAGTGCATTGATGGGACATC+TGG 0.424684 4:-6318877 None:intergenic
TCGCCAGATGGAATTGTTGC+TGG 0.426717 4:+6314837 MsG0480018538.01.T01:CDS
TGTATTTCTTCAGAGAAGTA+AGG 0.427186 4:+6314812 MsG0480018538.01.T01:intron
GTGGTATAAAATATCTTCAT+TGG 0.428403 4:+6318342 MsG0480018538.01.T01:CDS
GAGGAAAAGCCTTAACCAAA+TGG 0.430403 4:-6315957 None:intergenic
ACAAGGATGAAAATAGCAAT+TGG 0.434911 4:+6321557 MsG0480018538.01.T01:CDS
GTTGAAGGGTGCAGCAGAAA+AGG 0.435147 4:+6315849 MsG0480018538.01.T01:intron
TTCCATGTACTATATTCTCT+TGG 0.436209 4:-6321610 None:intergenic
AATTGTTCAGCAACTGTTGA+AGG 0.437550 4:-6319107 None:intergenic
GAATGAGGAGTATTGTTGTT+TGG 0.441688 4:-6315877 None:intergenic
TTCTTTGTCTTTGAAAGCTC+CGG 0.445593 4:-6321767 None:intergenic
TTTATATCAGAGACCCCTAA+TGG 0.446413 4:-6314882 None:intergenic
GTCTTGTACTCAAACCAATC+TGG 0.451199 4:-6319285 None:intergenic
AATAAGTACTTGCTTATCTC+TGG 0.451229 4:-6317472 None:intergenic
TGTTGCTGGAACCTCTAACT+TGG 0.454828 4:+6314851 MsG0480018538.01.T01:CDS
TGTCCATTCTTCTTTAACAA+TGG 0.458354 4:-6321906 None:intergenic
ACAATGGATGCAACATATTG+AGG 0.461356 4:-6321890 None:intergenic
ATAGCCTACTGGAAAAGCTT+TGG 0.464784 4:+6318435 MsG0480018538.01.T01:CDS
AGATGATGGCAGTGCATTGA+TGG 0.466209 4:-6318886 None:intergenic
TTCTCTGCAGAAAACTTCTC+TGG 0.469658 4:-6318389 None:intergenic
TAAAAGAAGTTAAACTCAGT+TGG 0.470906 4:+6318589 MsG0480018538.01.T01:CDS
TCAAGAATCTTACAAGACTA+AGG 0.474731 4:+6318979 MsG0480018538.01.T01:CDS
GACAGAATTCCTTTCCATCA+AGG 0.477525 4:+6319617 MsG0480018538.01.T01:CDS
TTGTCGATGACAAACTTAAG+AGG 0.479081 4:+6315998 MsG0480018538.01.T01:CDS
TCAAAGCAATCTAGAAATCC+TGG 0.479255 4:+6318917 MsG0480018538.01.T01:CDS
TTAACTTCTCCTTGATGGAA+AGG 0.479568 4:-6319626 None:intergenic
CTGGAAGTAGTGTTCCAGAT+TGG 0.481548 4:+6319271 MsG0480018538.01.T01:CDS
ATTTCAGGCCCTCGAGCAGC+AGG 0.482888 4:-6321518 None:intergenic
GAGCAATGATCCAGCCCAAA+AGG 0.483871 4:-6314637 None:intergenic
CAATGGGTTGAATTTGAAAG+TGG 0.484815 4:+6317833 MsG0480018538.01.T01:CDS
GTTATTGGAATTTGGGGTAT+GGG 0.486868 4:+6317130 MsG0480018538.01.T01:CDS
TAAACGTCGGTCTTTGTGGT+AGG 0.487257 4:-6321791 None:intergenic
GCTGTAAACGTCGGTCTTTG+TGG 0.487651 4:-6321795 None:intergenic
AATTGAGGGTGACGATGAAA+AGG 0.489688 4:+6319434 MsG0480018538.01.T01:CDS
AGAGGAGATTAAGCCAGTAT+TGG 0.491558 4:+6322069 MsG0480018538.01.T01:CDS
CATGACATTCTACAAGAAAT+GGG 0.493289 4:+6317972 MsG0480018538.01.T01:CDS
TTAACTTCAGGCCTAGCAAA+AGG 0.494747 4:-6322028 None:intergenic
TTGTCAAGAGAGAAAATAGA+TGG 0.494813 4:-6318702 None:intergenic
ATCGACTGGCATATGCCATC+GGG 0.495477 4:+6319468 MsG0480018538.01.T01:CDS
TCACTTGTTGAAGCAATTGA+AGG 0.495670 4:+6316039 MsG0480018538.01.T01:CDS
CAAGGAACACGTGATGGGGC+GGG 0.497390 4:+6314704 MsG0480018538.01.T01:CDS
CTTTGACATCCAAAAGATGA+TGG 0.498763 4:-6318900 None:intergenic
TGATAAAGATGATCTGTTTG+AGG 0.499194 4:+6317506 MsG0480018538.01.T01:CDS
TGGTTGTTGTTTCTTGGAAA+AGG 0.500575 4:+6317213 MsG0480018538.01.T01:CDS
TTTATTAGTACCTCAACCTC+AGG 0.503952 4:-6314734 None:intergenic
TCCCTCCTTTATCTCAACCT+TGG 0.504484 4:+6318792 MsG0480018538.01.T01:CDS
GGACTTGTCATATAGCCTAC+TGG 0.505424 4:+6318424 MsG0480018538.01.T01:CDS
AAAGATGATCTGTTTGAGGT+TGG 0.508125 4:+6317510 MsG0480018538.01.T01:CDS
GGGTCTTATTCCTGAGGTTG+AGG 0.509105 4:+6314724 MsG0480018538.01.T01:CDS
CAAATTTGTTCTGAATATGA+TGG 0.509517 4:+6317193 MsG0480018538.01.T01:CDS
GGCCTGAAATTGTCGTTGAA+TGG 0.510769 4:+6321531 MsG0480018538.01.T01:CDS
CATGGTCAAGGAACACGTGA+TGG 0.512576 4:+6314698 MsG0480018538.01.T01:CDS
CAATTCAAGGAAAACAAGAA+AGG 0.517181 4:+6319125 MsG0480018538.01.T01:CDS
TGTCGATGACAAACTTAAGA+GGG 0.520029 4:+6315999 MsG0480018538.01.T01:CDS
GCCCCTGTTATTGGAATTTG+GGG 0.520035 4:+6317124 MsG0480018538.01.T01:CDS
TCAACTGATGAAGGAAGCTC+AGG 0.521394 4:-6319041 None:intergenic
ATAACAACACAACAAATTTG+AGG 0.522000 4:-6314670 None:intergenic
ATAGCAATTGGAATCGTCAA+TGG 0.522270 4:+6321569 MsG0480018538.01.T01:CDS
AGTAGAGTTTCAACTGATGA+AGG 0.524578 4:-6319050 None:intergenic
AGAGCAGTGTATGCTTATCC+TGG 0.524916 4:+6319252 MsG0480018538.01.T01:intron
ATGGTCAAGGAACACGTGAT+GGG 0.526619 4:+6314699 MsG0480018538.01.T01:CDS
AGAGTTAACAAGACATGGAA+TGG 0.529676 4:+6317243 MsG0480018538.01.T01:CDS
GTTCCAGCAACAATTCCATC+TGG 0.530011 4:-6314840 None:intergenic
AAAGCTTTGGTGTGGAGTGC+AGG 0.532118 4:+6318448 MsG0480018538.01.T01:CDS
TCCTGCTGTAGCAATGATGT+TGG 0.533607 4:-6321726 None:intergenic
TATCGACTGGCATATGCCAT+CGG 0.534115 4:+6319467 MsG0480018538.01.T01:CDS
CTATATTCTCTTGGTTATGG+AGG 0.534951 4:-6321601 None:intergenic
AATTCAAGGAAAACAAGAAA+GGG 0.535044 4:+6319126 MsG0480018538.01.T01:CDS
GATTTGGAACTCATGAGGGA+TGG 0.537502 4:+6321941 MsG0480018538.01.T01:CDS
CAATAGGAATGATGCCGTGC+TGG 0.537770 4:+6316967 MsG0480018538.01.T01:intron
CCACCAGGAGAACCAACAAA+TGG 0.539629 4:+6321857 MsG0480018538.01.T01:CDS
AGTGATATTGAGAGGCGGAT+TGG 0.541232 4:+6317340 MsG0480018538.01.T01:CDS
ACCAACATCATTGCTACAGC+AGG 0.542435 4:+6321725 MsG0480018538.01.T01:CDS
GAAGTTCAAGTTGATGATGA+TGG 0.544891 4:+6322094 MsG0480018538.01.T01:CDS
TCAAGGAACACGTGATGGGG+CGG 0.548132 4:+6314703 MsG0480018538.01.T01:CDS
TGTAGCAATGATGTTGGTGT+TGG 0.550967 4:-6321720 None:intergenic
TAAGAGGGGAGATGACATAT+CGG 0.552330 4:+6316014 MsG0480018538.01.T01:CDS
GAGGCGGATTGGCCGCATGA+AGG 0.552710 4:+6317351 MsG0480018538.01.T01:CDS
AGAAGTTCATCTCCTATCGT+TGG 0.555851 4:-6321965 None:intergenic
TTGTTATTGCGCCATGGTCA+AGG 0.558833 4:+6314686 MsG0480018538.01.T01:CDS
TATCGTTCTTGATGACGTCA+AGG 0.561457 4:+6317378 MsG0480018538.01.T01:CDS
GACCAAAATCTGTGATGTGA+GGG 0.562006 4:-6321673 None:intergenic
TTTCAGTATCATTTAAAACC+AGG 0.563152 4:-6318935 None:intergenic
ATTGCTACAGCAGGAAGTCT+CGG 0.564926 4:+6321734 MsG0480018538.01.T01:CDS
CATTCTACAAGAAATGGGTC+GGG 0.566704 4:+6317977 MsG0480018538.01.T01:CDS
CAAGAGAGAAAATAGATGGA+TGG 0.567202 4:-6318698 None:intergenic
CCATTTGTTGGTTCTCCTGG+TGG 0.568155 4:-6321857 None:intergenic
AAAACATCATACTTTGAATG+AGG 0.568272 4:-6315892 None:intergenic
ATCCAATAGTATGTTACTTG+AGG 0.571821 4:-6321639 None:intergenic
GGTGATTTCTTCCACCAGCA+CGG 0.572617 4:-6316981 None:intergenic
ACATTCTACAAGAAATGGGT+CGG 0.572708 4:+6317976 MsG0480018538.01.T01:CDS
ACTTATGCTTCTAATAACAT+TGG 0.575356 4:-6318192 None:intergenic
TGTTTGATTTGGAACTCATG+AGG 0.576156 4:+6321936 MsG0480018538.01.T01:CDS
GATATGTTGACTGGTTTATG+GGG 0.577773 4:-6319665 None:intergenic
AGCAAAGGGGAGAGATGATG+TGG 0.580323 4:-6319339 None:intergenic
GTCATCTTATCAAATACATG+AGG 0.580605 4:-6318245 None:intergenic
AGTGAAGAGTTAACAAGACA+TGG 0.581079 4:+6317238 MsG0480018538.01.T01:CDS
TTTGCTTTGTTATTGCTTGG+GGG 0.581651 4:+6319373 MsG0480018538.01.T01:CDS
AGTTGATGATGATGGAGCAA+AGG 0.582416 4:+6322102 MsG0480018538.01.T01:CDS
GTCTCTCCACATTTGAACCT+CGG 0.582496 4:-6316262 None:intergenic
AACCAAGAGAATATAGTACA+TGG 0.582559 4:+6321608 MsG0480018538.01.T01:CDS
AACATATACCTGCTGCTCGA+GGG 0.582736 4:+6321510 MsG0480018538.01.T01:CDS
ATTGTTCAGCAACTGTTGAA+GGG 0.582840 4:-6319106 None:intergenic
ACTCAGTTGGTCAAGCCTGA+AGG 0.587081 4:+6318602 MsG0480018538.01.T01:CDS
TCAGGCCTAGCAAAAGGTGA+TGG 0.589457 4:-6322022 None:intergenic
AGGATGGCGTCCATATCGAC+TGG 0.589765 4:+6319454 MsG0480018538.01.T01:CDS
AGAAGTAAGGCATCGCCAGA+TGG 0.590590 4:+6314825 MsG0480018538.01.T01:CDS
TTGTCGTTGAATGGCCAACA+AGG 0.591957 4:+6321540 MsG0480018538.01.T01:CDS
TGGTCAAGGAACACGTGATG+GGG 0.593194 4:+6314700 MsG0480018538.01.T01:CDS
TAGGAATGATGCCGTGCTGG+TGG 0.594502 4:+6316970 MsG0480018538.01.T01:intron
GTTGTGTTGTTATTGCGCCA+TGG 0.594942 4:+6314680 MsG0480018538.01.T01:CDS
ATCGTTCTTGATGACGTCAA+GGG 0.595696 4:+6317379 MsG0480018538.01.T01:CDS
CAACCTCATCAACACAACCT+TGG 0.596220 4:-6317002 None:intergenic
AAACATATACCTGCTGCTCG+AGG 0.597492 4:+6321509 MsG0480018538.01.T01:CDS
CTTGGAAATGCAGCCATTAG+GGG 0.598459 4:+6314869 MsG0480018538.01.T01:CDS
TACCCCAAATTCCAATAACA+GGG 0.599494 4:-6317126 None:intergenic
ATGAGGGATGGACCAACGAT+AGG 0.605785 4:+6321953 MsG0480018538.01.T01:CDS
TTAAAATCAAGGTTTCAGCA+TGG 0.606364 4:+6319595 MsG0480018538.01.T01:CDS
ATTGGAATTTGGGGTATGGG+CGG 0.609082 4:+6317133 MsG0480018538.01.T01:CDS
TTAATAACTGGTAAACCACC+AGG 0.610151 4:+6321842 MsG0480018538.01.T01:CDS
GATGATGGCAGTGCATTGAT+GGG 0.610191 4:-6318885 None:intergenic
AGGGTGATCAATTATGCCAA+AGG 0.611347 4:+6317627 MsG0480018538.01.T01:CDS
GGAAAAGATTGAAGCCCTTG+AGG 0.612410 4:-6318317 None:intergenic
TCCAAGGTTGAGATAAAGGA+GGG 0.612783 4:-6318793 None:intergenic
GTCGATGACAAACTTAAGAG+GGG 0.613742 4:+6316000 MsG0480018538.01.T01:CDS
ATTGCTGGTAAATGTTGTAA+GGG 0.623172 4:-6318757 None:intergenic
ATCCGCCTCTCAATATCACT+AGG 0.627765 4:-6317337 None:intergenic
GTTTGATTTGGAACTCATGA+GGG 0.628775 4:+6321937 MsG0480018538.01.T01:CDS
CCAAATGGCTTAGAAAGTCG+TGG 0.633670 4:-6315942 None:intergenic
CATCACGTGTTCCTTGACCA+TGG 0.635085 4:-6314697 None:intergenic
TCACCAAGGTTGTGTTGATG+AGG 0.636267 4:+6316999 MsG0480018538.01.T01:CDS
GGTTGCCTAGTGATATTGAG+AGG 0.637034 4:+6317332 MsG0480018538.01.T01:CDS
GAGGGTGACGATGAAAAGGA+TGG 0.637736 4:+6319438 MsG0480018538.01.T01:CDS
AAGTCTCGGATACAATGCAC+CGG 0.639160 4:+6321748 MsG0480018538.01.T01:CDS
ATCCAAGGTTGAGATAAAGG+AGG 0.640608 4:-6318794 None:intergenic
TCATCTTATCAAATACATGA+GGG 0.643769 4:-6318244 None:intergenic
ATACATCATAAATTTCATCA+GGG 0.644546 4:-6318055 None:intergenic
TTCTAACAGTGATAAGTCAG+TGG 0.649700 4:+6317881 MsG0480018538.01.T01:CDS
GGTACTGAGAAGAACATCGT+TGG 0.650989 4:-6319542 None:intergenic
AAAACTATGCTTCTTCACGT+TGG 0.652736 4:+6316091 MsG0480018538.01.T01:CDS
TGGGGCGGGTCTTATTCCTG+AGG 0.654829 4:+6314718 MsG0480018538.01.T01:CDS
ATGGAATACGAATGTGCTGA+AGG 0.655101 4:+6319705 MsG0480018538.01.T01:CDS
TGCCTAGTGATATTGAGAGG+CGG 0.656285 4:+6317335 MsG0480018538.01.T01:CDS
TCTACAAGAAATGGGTCGGG+AGG 0.659201 4:+6317980 MsG0480018538.01.T01:CDS
AATTGTCCGAGGTTCAAATG+TGG 0.665277 4:+6316256 MsG0480018538.01.T01:CDS
CTACTGGAAAAGCTTTGGTG+TGG 0.669108 4:+6318440 MsG0480018538.01.T01:CDS
AGACCAAAATCTGTGATGTG+AGG 0.676993 4:-6321674 None:intergenic
AACGCTGAGGCTGTAAACGT+CGG 0.692624 4:-6321804 None:intergenic
ACCCCAAATTCCAATAACAG+GGG 0.702687 4:-6317125 None:intergenic
GAACGATAAGAACCTTCATG+CGG 0.713047 4:-6317363 None:intergenic
ACTGAGAACTGAGAACCCGA+TGG 0.717007 4:-6319483 None:intergenic
GCTCCAAAAGAATAACGCTG+AGG 0.720184 4:-6321817 None:intergenic
GTTAAAGAAAGAGTCACACA+AGG 0.754499 4:+6317102 MsG0480018538.01.T01:CDS
AATGGCTTAGAAAGTCGTGG+CGG 0.764780 4:-6315939 None:intergenic
GCTGGTGGAAGAAATCACCA+AGG 0.778167 4:+6316985 MsG0480018538.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AATAAGAAAATAAATAGTTA+AGG - Chr4:6316849-6316868 None:intergenic 10.0%
!! ATTATAAAATATAAGCAAAA+GGG + Chr4:6315638-6315657 MsG0480018538.01.T01:intron 10.0%
!!! GATTTAAGATAAATTTAATT+TGG - Chr4:6318492-6318511 None:intergenic 10.0%
!!! TTTATCCTTTTATTAATTTT+AGG - Chr4:6316765-6316784 None:intergenic 10.0%
!! AAAACTAGACAATTAAAAAA+TGG - Chr4:6316438-6316457 None:intergenic 15.0%
!! AAAATTCAAAAATTGAAGAT+CGG - Chr4:6318270-6318289 None:intergenic 15.0%
!! AATAATTACTAAAAACTGTA+TGG + Chr4:6321077-6321096 MsG0480018538.01.T01:intron 15.0%
!! ATTGAAAATTACTATAATTG+AGG + Chr4:6319419-6319438 MsG0480018538.01.T01:CDS 15.0%
!! CATTATAAAATATAAGCAAA+AGG + Chr4:6315637-6315656 MsG0480018538.01.T01:intron 15.0%
!! GATGTATTTAGTTAAAAATT+TGG - Chr4:6315690-6315709 None:intergenic 15.0%
!! GTTGAAATAATTACATATTA+TGG + Chr4:6319939-6319958 MsG0480018538.01.T01:intron 15.0%
!! TGTTACCTAAAATTAATAAA+AGG + Chr4:6316757-6316776 MsG0480018538.01.T01:intron 15.0%
!! TTAAATAATTATGACACTTT+CGG + Chr4:6320145-6320164 MsG0480018538.01.T01:intron 15.0%
!! TTGAAAATTACTATAATTGA+GGG + Chr4:6319420-6319439 MsG0480018538.01.T01:CDS 15.0%
!! TTTAACATAAAAGACTAAAT+TGG + Chr4:6316708-6316727 MsG0480018538.01.T01:intron 15.0%
!!! ATCTTTTGACTTATAAATTA+GGG - Chr4:6321472-6321491 None:intergenic 15.0%
!!! ATGTTCAAAATTATTTTCTT+AGG + Chr4:6315265-6315284 MsG0480018538.01.T01:intron 15.0%
!!! ATTTTATTTGATCTTTTTCT+TGG + Chr4:6316556-6316575 MsG0480018538.01.T01:intron 15.0%
!!! CTTTTGCTTATATTTTATAA+TGG - Chr4:6315639-6315658 None:intergenic 15.0%
!!! TATATTTGTTAAAAGTTGAA+GGG + Chr4:6315835-6315854 MsG0480018538.01.T01:intron 15.0%
!!! TATTATTTTTAGCTTCAAAT+AGG - Chr4:6320019-6320038 None:intergenic 15.0%
!!! TCCAAAAAATTTAAAATAGA+GGG - Chr4:6316466-6316485 None:intergenic 15.0%
!!! TGGATTTGTTTTAAAAAAAT+GGG - Chr4:6316612-6316631 None:intergenic 15.0%
!!! TTATATTTGTTAAAAGTTGA+AGG + Chr4:6315834-6315853 MsG0480018538.01.T01:intron 15.0%
!!! TTGGATTTGTTTTAAAAAAA+TGG - Chr4:6316613-6316632 None:intergenic 15.0%
!!! TTTAATTTTGCTAAAAAATC+CGG - Chr4:6319400-6319419 None:intergenic 15.0%
!!! TTTTATCACAAGTAATAAAA+TGG - Chr4:6316801-6316820 None:intergenic 15.0%
!!! TTTTATTTTTGAAGAATTAG+CGG - Chr4:6315395-6315414 None:intergenic 15.0%
!! AAAATAGTATCATTTGGAAA+TGG - Chr4:6316921-6316940 None:intergenic 20.0%
!! AAATTTGTATGATGAAGATT+TGG - Chr4:6316632-6316651 None:intergenic 20.0%
!! AAGAATAATACTTGTTTATG+AGG + Chr4:6319735-6319754 MsG0480018538.01.T01:intron 20.0%
!! AATACATCATAAATTTCATC+AGG - Chr4:6318059-6318078 None:intergenic 20.0%
!! AGAATAATACTTGTTTATGA+GGG + Chr4:6319736-6319755 MsG0480018538.01.T01:intron 20.0%
!! AGATCAAATAAAATGATACA+AGG - Chr4:6316550-6316569 None:intergenic 20.0%
!! ATAAAAGAAAACGAAAAAGA+AGG + Chr4:6319769-6319788 MsG0480018538.01.T01:intron 20.0%
!! ATACATATATAAACTCAGTA+AGG + Chr4:6314982-6315001 MsG0480018538.01.T01:intron 20.0%
!! ATACATCATAAATTTCATCA+GGG - Chr4:6318058-6318077 None:intergenic 20.0%
!! ATTCATTTCATATAGACTTA+TGG + Chr4:6321001-6321020 MsG0480018538.01.T01:intron 20.0%
!! ATTTATTAGGTGAAGTTAAA+AGG + Chr4:6320240-6320259 MsG0480018538.01.T01:intron 20.0%
!! TAAATAATTATGACACTTTC+GGG + Chr4:6320146-6320165 MsG0480018538.01.T01:intron 20.0%
!! TATGTATGTATGTAAATAGA+TGG - Chr4:6314939-6314958 None:intergenic 20.0%
!! TCTAATTTCAAAGTAAGTTT+GGG - Chr4:6321412-6321431 None:intergenic 20.0%
!! TGATATAAAGATAAATGAGT+TGG - Chr4:6315478-6315497 None:intergenic 20.0%
!! TTCTAATTTCAAAGTAAGTT+TGG - Chr4:6321413-6321432 None:intergenic 20.0%
!! TTTATTAGGTGAAGTTAAAA+GGG + Chr4:6320241-6320260 MsG0480018538.01.T01:intron 20.0%
!!! AAAAAATTTAAAATAGAGGG+CGG - Chr4:6316463-6316482 None:intergenic 20.0%
!!! AAATGGTTGATATCAAATAT+GGG - Chr4:6320552-6320571 None:intergenic 20.0%
!!! AGGAGAATATTTCTTTAAAA+GGG + Chr4:6320349-6320368 MsG0480018538.01.T01:intron 20.0%
!!! ATACATATTGAAAGTACTTT+TGG + Chr4:6321048-6321067 MsG0480018538.01.T01:intron 20.0%
!!! ATTCAATACCTTAAGTTTTA+GGG - Chr4:6318649-6318668 None:intergenic 20.0%
!!! ATTGTAATACCTATTTTCTA+TGG + Chr4:6316165-6316184 MsG0480018538.01.T01:CDS 20.0%
!!! GATCTTTTGACTTATAAATT+AGG - Chr4:6321473-6321492 None:intergenic 20.0%
!!! GATTAAAAAAGTACAAAATG+AGG + Chr4:6316730-6316749 MsG0480018538.01.T01:intron 20.0%
!!! GTCCAAAAAATTTAAAATAG+AGG - Chr4:6316467-6316486 None:intergenic 20.0%
!!! TAAACTTTTTTCTGAACTAT+TGG + Chr4:6317279-6317298 MsG0480018538.01.T01:CDS 20.0%
!!! TATTCAATACCTTAAGTTTT+AGG - Chr4:6318650-6318669 None:intergenic 20.0%
!!! TGTTTTACTGCTTAATTTTT+AGG + Chr4:6316360-6316379 MsG0480018538.01.T01:intron 20.0%
!!! TTGTAATACCTATTTTCTAT+GGG + Chr4:6316166-6316185 MsG0480018538.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTGTTTATATTTTGTAACAG+AGG + Chr4:6315731-6315750 MsG0480018538.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTATTTTTGAAGAATTAGC+GGG - Chr4:6315394-6315413 None:intergenic 20.0%
! AAAACATCATACTTTGAATG+AGG - Chr4:6315895-6315914 None:intergenic 25.0%
! AAGCAGTAAAACATATACTA+TGG - Chr4:6316353-6316372 None:intergenic 25.0%
! AATAAATATGTTGGGCAATA+AGG - Chr4:6320227-6320246 None:intergenic 25.0%
! AATTCAAGGAAAACAAGAAA+GGG + Chr4:6319126-6319145 MsG0480018538.01.T01:CDS 25.0%
! ACTTATGCTTCTAATAACAT+TGG - Chr4:6318195-6318214 None:intergenic 25.0%
! ACTTCACCTAATAAATATGT+TGG - Chr4:6320236-6320255 None:intergenic 25.0%
! AGCAGTAAAACATATACTAT+GGG - Chr4:6316352-6316371 None:intergenic 25.0%
! ATAACAACACAACAAATTTG+AGG - Chr4:6314673-6314692 None:intergenic 25.0%
! ATATCACTGGAAAAGTTATT+TGG + Chr4:6317405-6317424 MsG0480018538.01.T01:intron 25.0%
! ATTGATTGCAAAGAGAAATA+TGG + Chr4:6316138-6316157 MsG0480018538.01.T01:CDS 25.0%
! CATCATATTCAGAACAAATT+TGG - Chr4:6317195-6317214 None:intergenic 25.0%
! CTTCACCTAATAAATATGTT+GGG - Chr4:6320235-6320254 None:intergenic 25.0%
! GAAAGTTCTCTCATAAATAT+GGG + Chr4:6319178-6319197 MsG0480018538.01.T01:intron 25.0%
! GAATAATACTTGTTTATGAG+GGG + Chr4:6319737-6319756 MsG0480018538.01.T01:intron 25.0%
! GAGGAGAATATTTCTTTAAA+AGG + Chr4:6320348-6320367 MsG0480018538.01.T01:intron 25.0%
! GTCTCAAAAATAGTATCATT+TGG - Chr4:6316927-6316946 None:intergenic 25.0%
! GTGGTATAAAATATCTTCAT+TGG + Chr4:6318342-6318361 MsG0480018538.01.T01:CDS 25.0%
! GTTAACTCAAAAAAACTTGT+TGG + Chr4:6317046-6317065 MsG0480018538.01.T01:CDS 25.0%
! TAAAAGAAGTTAAACTCAGT+TGG + Chr4:6318589-6318608 MsG0480018538.01.T01:CDS 25.0%
! TAAATGATTCAGACACTTTA+AGG + Chr4:6320861-6320880 MsG0480018538.01.T01:intron 25.0%
! TAAGGGAATCACAATTATTT+AGG - Chr4:6318743-6318762 None:intergenic 25.0%
! TATTGCCCAACATATTTATT+AGG + Chr4:6320227-6320246 MsG0480018538.01.T01:intron 25.0%
! TCAAAATCTCATTCAACAAA+TGG + Chr4:6319686-6319705 MsG0480018538.01.T01:CDS 25.0%
! TCATCTTATCAAATACATGA+GGG - Chr4:6318247-6318266 None:intergenic 25.0%
! TCTTGTAGTATTAGGAAATA+GGG - Chr4:6315034-6315053 None:intergenic 25.0%
! TGAAAATTGATACACCAAAT+TGG + Chr4:6317311-6317330 MsG0480018538.01.T01:CDS 25.0%
! TGAAAGTTCTCTCATAAATA+TGG + Chr4:6319177-6319196 MsG0480018538.01.T01:intron 25.0%
! TGAGAATATGACCAATAAAA+TGG - Chr4:6316070-6316089 None:intergenic 25.0%
! TGATGTATTGAAAAATGACA+TGG + Chr4:6318070-6318089 MsG0480018538.01.T01:CDS 25.0%
! TTACAATGATCTTGATTGTT+TGG + Chr4:6317776-6317795 MsG0480018538.01.T01:CDS 25.0%
! TTAGATAATGTTTGTCATGT+TGG + Chr4:6318110-6318129 MsG0480018538.01.T01:intron 25.0%
! TTCATAAGTAGATTCTTTGA+AGG + Chr4:6320811-6320830 MsG0480018538.01.T01:intron 25.0%
! TTCTTGTAGTATTAGGAAAT+AGG - Chr4:6315035-6315054 None:intergenic 25.0%
! TTTCCTAATACTACAAGAAT+TGG + Chr4:6315036-6315055 MsG0480018538.01.T01:intron 25.0%
!! AAAAAATCAGCTAATTTGTC+GGG + Chr4:6316291-6316310 MsG0480018538.01.T01:CDS 25.0%
!! ATATTGCTTGTTTCTTCAAT+GGG + Chr4:6317817-6317836 MsG0480018538.01.T01:CDS 25.0%
!! ATTTCTTTAAAAGGGAACAT+AGG + Chr4:6320357-6320376 MsG0480018538.01.T01:intron 25.0%
!! CAAATGGTTGATATCAAATA+TGG - Chr4:6320553-6320572 None:intergenic 25.0%
!! CAAATTTGTTCTGAATATGA+TGG + Chr4:6317193-6317212 MsG0480018538.01.T01:CDS 25.0%
!! CTTTGTTTACATTAAGGAAA+AGG + Chr4:6315162-6315181 MsG0480018538.01.T01:intron 25.0%
!! GAAAAAATCAGCTAATTTGT+CGG + Chr4:6316290-6316309 MsG0480018538.01.T01:CDS 25.0%
!! TAGGTTGAAAATGAAACTAA+AGG + Chr4:6320666-6320685 MsG0480018538.01.T01:intron 25.0%
!! TGGAAAAAGTAAAGAAGTAT+GGG + Chr4:6317689-6317708 MsG0480018538.01.T01:CDS 25.0%
!! TGTAATACCTATTTTCTATG+GGG + Chr4:6316167-6316186 MsG0480018538.01.T01:CDS 25.0%
!! TTCAAGATCACTTTGTTTAA+AGG - Chr4:6317580-6317599 None:intergenic 25.0%
!! TTGAATTTTCGTGATATAGA+GGG + Chr4:6318281-6318300 MsG0480018538.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTCAGTATCATTTAAAACC+AGG - Chr4:6318938-6318957 None:intergenic 25.0%
!! TTTGAATTTTCGTGATATAG+AGG + Chr4:6318280-6318299 MsG0480018538.01.T01:CDS 25.0%
!!! AAAGCATTTATTTGCTTTTG+AGG - Chr4:6315979-6315998 None:intergenic 25.0%
!!! AAATGGGTTGTTATTATTCA+TGG - Chr4:6316596-6316615 None:intergenic 25.0%
!!! ACAAGTTTTTTTGAGTTAAC+TGG - Chr4:6317046-6317065 None:intergenic 25.0%
!!! ATATTTTATAATGGAGTGAC+CGG - Chr4:6315630-6315649 None:intergenic 25.0%
!!! ATGATGTTTTTGTAAGCTTT+AGG + Chr4:6315905-6315924 MsG0480018538.01.T01:CDS 25.0%
!!! GATTTTTTGCTATTCTAGTT+AGG - Chr4:6319566-6319585 None:intergenic 25.0%
!!! GCCCTCTATTTTAAATTTTT+TGG + Chr4:6316462-6316481 MsG0480018538.01.T01:intron 25.0%
!!! TAAGTTTTTTGCAAAATCCA+AGG - Chr4:6318812-6318831 None:intergenic 25.0%
!!! TATCTCACCATCTTTTTTAT+TGG + Chr4:6318547-6318566 MsG0480018538.01.T01:intron 25.0%
!!! TCCATTAGTTCTTAAAGTTT+TGG + Chr4:6317653-6317672 MsG0480018538.01.T01:CDS 25.0%
!!! TGATGTTTTTGTAAGCTTTA+GGG + Chr4:6315906-6315925 MsG0480018538.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTAATGAAGTTTGCTAACTT+TGG + Chr4:6319219-6319238 MsG0480018538.01.T01:intron 25.0%
!!! TTTTTGCTTTGTTATTGCTT+GGG + Chr4:6319371-6319390 MsG0480018538.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTTTTGCTTTGTTATTGCT+TGG + Chr4:6319370-6319389 MsG0480018538.01.T01:CDS 25.0%
AAAATCCAAGGTTGAGATAA+AGG - Chr4:6318800-6318819 None:intergenic 30.0%
AAAGCTATACGAGAAACTAT+TGG - Chr4:6315504-6315523 None:intergenic 30.0%
AAAGGACAAAATGAGAATCA+AGG + Chr4:6321134-6321153 MsG0480018538.01.T01:intron 30.0%
AACCAAGAGAATATAGTACA+TGG + Chr4:6321608-6321627 MsG0480018538.01.T01:CDS 30.0%
AAGAACTAATGGAATTCCTT+TGG - Chr4:6317646-6317665 None:intergenic 30.0%
AAGCTATACGAGAAACTATT+GGG - Chr4:6315503-6315522 None:intergenic 30.0%
AAGGACAAAATGAGAATCAA+GGG + Chr4:6321135-6321154 MsG0480018538.01.T01:intron 30.0%
AATAAGTACTTGCTTATCTC+TGG - Chr4:6317475-6317494 None:intergenic 30.0%
AATCAGTTGCATATACAAAG+AGG - Chr4:6320589-6320608 None:intergenic 30.0%
AATTGCTGGTAAATGTTGTA+AGG - Chr4:6318761-6318780 None:intergenic 30.0%
ACAAGGATGAAAATAGCAAT+TGG + Chr4:6321557-6321576 MsG0480018538.01.T01:CDS 30.0%
ACTTCTAATCTTGATCCATT+GGG - Chr4:6321218-6321237 None:intergenic 30.0%
ACTTTGCATAAAAGTCAACA+TGG - Chr4:6319883-6319902 None:intergenic 30.0%
AGGCAATATCACAAATCAAA+TGG - Chr4:6320569-6320588 None:intergenic 30.0%
ATAGAGAGAAATTAGTTGGT+AGG + Chr4:6320906-6320925 MsG0480018538.01.T01:intron 30.0%
ATTAATAGAAGCAGAATCAG+AGG - Chr4:6314791-6314810 None:intergenic 30.0%
ATTATGGTTGAGTGTATGAA+TGG + Chr4:6319955-6319974 MsG0480018538.01.T01:intron 30.0%
ATTGCTGGTAAATGTTGTAA+GGG - Chr4:6318760-6318779 None:intergenic 30.0%
CAATTCAAGGAAAACAAGAA+AGG + Chr4:6319125-6319144 MsG0480018538.01.T01:CDS 30.0%
CATCCATTGTTAAAGAAGAA+TGG + Chr4:6321903-6321922 MsG0480018538.01.T01:CDS 30.0%
CATGACATTCTACAAGAAAT+GGG + Chr4:6317972-6317991 MsG0480018538.01.T01:CDS 30.0%
CTGAACACAATTACATGATA+TGG - Chr4:6321363-6321382 None:intergenic 30.0%
GACCTTTCAATTTGATTACA+TGG + Chr4:6316500-6316519 MsG0480018538.01.T01:intron 30.0%
GGTTGACAAAATGTATTGTT+TGG + Chr4:6321022-6321041 MsG0480018538.01.T01:intron 30.0%
GTACCAATTCTTGTAGTATT+AGG - Chr4:6315042-6315061 None:intergenic 30.0%
GTACTATATTCTCTTGGTTA+TGG - Chr4:6321607-6321626 None:intergenic 30.0%
GTAGAGATAAATTAGTTCGT+CGG + Chr4:6320191-6320210 MsG0480018538.01.T01:intron 30.0%
GTCATCTTATCAAATACATG+AGG - Chr4:6318248-6318267 None:intergenic 30.0%
GTGGAAAAAGTAAAGAAGTA+TGG + Chr4:6317688-6317707 MsG0480018538.01.T01:CDS 30.0%
TACAAGAATTGGTACAAACA+TGG + Chr4:6315047-6315066 MsG0480018538.01.T01:intron 30.0%
TAGAGGTAATTGAAAGTTGT+AGG + Chr4:6320699-6320718 MsG0480018538.01.T01:intron 30.0%
TAGGAAATAGGGTAAAGTAA+AGG - Chr4:6315023-6315042 None:intergenic 30.0%
TCAAGAATCTTACAAGACTA+AGG + Chr4:6318979-6318998 MsG0480018538.01.T01:CDS 30.0%
TCACAATCTCATTCAACAAA+TGG + Chr4:6320303-6320322 MsG0480018538.01.T01:intron 30.0%
TCATTCGTCAAGAAATTTGT+TGG - Chr4:6320946-6320965 None:intergenic 30.0%
TCTGCTACCAATAAAAAAGA+TGG - Chr4:6318557-6318576 None:intergenic 30.0%
TCTTTGTATATGCAACTGAT+TGG + Chr4:6320588-6320607 MsG0480018538.01.T01:intron 30.0%
TGATAAAGATGATCTGTTTG+AGG + Chr4:6317506-6317525 MsG0480018538.01.T01:CDS 30.0%
TGATAAATGAAACCTCTCAA+AGG + Chr4:6321116-6321135 MsG0480018538.01.T01:intron 30.0%
TGCCATGTAATCAAATTGAA+AGG - Chr4:6316505-6316524 None:intergenic 30.0%
TGTATTTCTTCAGAGAAGTA+AGG + Chr4:6314812-6314831 MsG0480018538.01.T01:intron 30.0%
TGTCCATTCTTCTTTAACAA+TGG - Chr4:6321909-6321928 None:intergenic 30.0%
TTAAAATCAAGGTTTCAGCA+TGG + Chr4:6319595-6319614 MsG0480018538.01.T01:CDS 30.0%
TTCCATGTACTATATTCTCT+TGG - Chr4:6321613-6321632 None:intergenic 30.0%
TTGTCAAGAGAGAAAATAGA+TGG - Chr4:6318705-6318724 None:intergenic 30.0%
! AAAAAAGTATGAATTGTCCG+AGG + Chr4:6316245-6316264 MsG0480018538.01.T01:CDS 30.0%
! AAAAGTCTTATCCCATTAAG+TGG + Chr4:6315411-6315430 MsG0480018538.01.T01:intron 30.0%
! AAACTTTTCCCAACATTTCA+AGG - Chr4:6319843-6319862 None:intergenic 30.0%
! AAAGTCTTATCCCATTAAGT+GGG + Chr4:6315412-6315431 MsG0480018538.01.T01:intron 30.0%
! AGTTTCATTTTCAACCTAGA+AGG - Chr4:6320664-6320683 None:intergenic 30.0%
! ATCCAATAGTATGTTACTTG+AGG - Chr4:6321642-6321661 None:intergenic 30.0%
! ATGATATGGACTATTGAATC+AGG - Chr4:6321349-6321368 None:intergenic 30.0%
! ATTTTACTTTCATGACTGCA+GGG + Chr4:6318167-6318186 MsG0480018538.01.T01:intron 30.0%
! GACAAATGAAGTGTTTGATT+TGG + Chr4:6321925-6321944 MsG0480018538.01.T01:CDS 30.0%
! GATATTGCTTGTTTCTTCAA+TGG + Chr4:6317816-6317835 MsG0480018538.01.T01:CDS 30.0%
! GCCAAAACTTTAAGAACTAA+TGG - Chr4:6317657-6317676 None:intergenic 30.0%
! GTTTCTTGATTTTACCTTCT+AGG + Chr4:6320647-6320666 MsG0480018538.01.T01:intron 30.0%
! GTTTTGTGATGTATCAAAGA+GGG + Chr4:6317608-6317627 MsG0480018538.01.T01:CDS 30.0%
! TATTTTACTTTCATGACTGC+AGG + Chr4:6318166-6318185 MsG0480018538.01.T01:intron 30.0%
! TGAAGATATTTTATACCACG+TGG - Chr4:6318341-6318360 None:intergenic 30.0%
! TGAAGGATCATCCATTTTAT+TGG + Chr4:6316056-6316075 MsG0480018538.01.T01:CDS 30.0%
! TGAATTTTCGTGATATAGAG+GGG + Chr4:6318282-6318301 MsG0480018538.01.T01:CDS 30.0%
! TGCAAAACTTGTTTAACTTC+AGG - Chr4:6322043-6322062 None:intergenic 30.0%
! TGCAGAGAATCTTGTTATAT+TGG + Chr4:6318403-6318422 MsG0480018538.01.T01:CDS 30.0%
! TGTGATATTGCCATTTGAAT+GGG + Chr4:6320526-6320545 MsG0480018538.01.T01:intron 30.0%
! TTGTGATATTGCCATTTGAA+TGG + Chr4:6320525-6320544 MsG0480018538.01.T01:intron 30.0%
!! AGTTTTGTGATGTATCAAAG+AGG + Chr4:6317607-6317626 MsG0480018538.01.T01:CDS 30.0%
!! ATATGATGGTTGTTGTTTCT+TGG + Chr4:6317207-6317226 MsG0480018538.01.T01:CDS 30.0%
!! GATGTTTTTGTAAGCTTTAG+GGG + Chr4:6315907-6315926 MsG0480018538.01.T01:CDS 30.0%
!! TCAGACAAGCTTTAAAATCA+AGG + Chr4:6319584-6319603 MsG0480018538.01.T01:CDS 30.0%
!! TGAGATTTTGATATGTTGAC+TGG - Chr4:6319677-6319696 None:intergenic 30.0%
!! TGATATGTTGACTGGTTTAT+GGG - Chr4:6319669-6319688 None:intergenic 30.0%
!! TTGATATGTTGACTGGTTTA+TGG - Chr4:6319670-6319689 None:intergenic 30.0%
!!! ATTGCTATTTTCATCCTTGT+TGG - Chr4:6321557-6321576 None:intergenic 30.0%
!!! CTTTTGGAGCTTTTAATAAC+TGG + Chr4:6321830-6321849 MsG0480018538.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTGTTTTTGCTTTTCAGACT+CGG + Chr4:6315138-6315157 MsG0480018538.01.T01:intron 30.0%
!!! TTTTGCTTTGTTATTGCTTG+GGG + Chr4:6319372-6319391 MsG0480018538.01.T01:CDS 30.0%
AAAAAACAAAGCCCAGCAAA+GGG - Chr4:6319356-6319375 None:intergenic 35.0%
AAAACTATGCTTCTTCACGT+TGG + Chr4:6316091-6316110 MsG0480018538.01.T01:CDS 35.0%
AAAATGGAGAACCAAAACTG+CGG - Chr4:6316422-6316441 None:intergenic 35.0%
AACAGTTGCTGAACAATTCA+AGG + Chr4:6319112-6319131 MsG0480018538.01.T01:CDS 35.0%
AAGTAACTTCTCCCAAACAT+TGG - Chr4:6320444-6320463 None:intergenic 35.0%
AATTGTTCAGCAACTGTTGA+AGG - Chr4:6319110-6319129 None:intergenic 35.0%
ACAATGGATGCAACATATTG+AGG - Chr4:6321893-6321912 None:intergenic 35.0%
ACATGTAGAGAGAAGACATA+TGG - Chr4:6315581-6315600 None:intergenic 35.0%
ACATTCTACAAGAAATGGGT+CGG + Chr4:6317976-6317995 MsG0480018538.01.T01:CDS 35.0%
ACTTGTTTATGAGGGGAAAA+AGG + Chr4:6319744-6319763 MsG0480018538.01.T01:intron 35.0%
AGAGAAGACATATGGATGTA+AGG - Chr4:6315573-6315592 None:intergenic 35.0%
AGAGTTAACAAGACATGGAA+TGG + Chr4:6317243-6317262 MsG0480018538.01.T01:CDS 35.0%
AGGACAAAATGAGAATCAAG+GGG + Chr4:6321136-6321155 MsG0480018538.01.T01:intron 35.0%
AGGCAACATCACAAATGAAA+TGG - Chr4:6319999-6320018 None:intergenic 35.0%
AGTAGAGTTTCAACTGATGA+AGG - Chr4:6319053-6319072 None:intergenic 35.0%
AGTGAAGAGTTAACAAGACA+TGG + Chr4:6317238-6317257 MsG0480018538.01.T01:CDS 35.0%
AGTTATTTGGAAGTCGTGAT+TGG + Chr4:6317418-6317437 MsG0480018538.01.T01:intron 35.0%
ATAAAGGAGGGAGCTTAAAT+TGG - Chr4:6318784-6318803 None:intergenic 35.0%
ATACCCCAAATTCCAATAAC+AGG - Chr4:6317130-6317149 None:intergenic 35.0%
ATAGCAATTGGAATCGTCAA+TGG + Chr4:6321569-6321588 MsG0480018538.01.T01:CDS 35.0%
ATATCACTAGGCAACCAATT+TGG - Chr4:6317328-6317347 None:intergenic 35.0%
ATTGTTCAGCAACTGTTGAA+GGG - Chr4:6319109-6319128 None:intergenic 35.0%
CAAGAGAGAAAATAGATGGA+TGG - Chr4:6318701-6318720 None:intergenic 35.0%
CACCTCAAGTAACATACTAT+TGG + Chr4:6321637-6321656 MsG0480018538.01.T01:CDS 35.0%
CGATACATCCTTCAATCAAT+AGG + Chr4:6316951-6316970 MsG0480018538.01.T01:intron 35.0%
CTAAAGGACAATGACTTTAG+AGG + Chr4:6320682-6320701 MsG0480018538.01.T01:intron 35.0%
CTATATTCTCTTGGTTATGG+AGG - Chr4:6321604-6321623 None:intergenic 35.0%
CTTACCTAATCATGATTCGA+TGG + Chr4:6321293-6321312 MsG0480018538.01.T01:intron 35.0%
CTTTCTAAGCCATTTGGTTA+AGG + Chr4:6315948-6315967 MsG0480018538.01.T01:CDS 35.0%
CTTTGACATCCAAAAGATGA+TGG - Chr4:6318903-6318922 None:intergenic 35.0%
GAAAGAAGCAGGATCATTTA+AGG - Chr4:6320422-6320441 None:intergenic 35.0%
GACTTCTAATCTTGATCCAT+TGG - Chr4:6321219-6321238 None:intergenic 35.0%
GCACATAGAGAGAAATTAGT+TGG + Chr4:6320902-6320921 MsG0480018538.01.T01:intron 35.0%
GCATAAGTCTGTCAACAATA+TGG + Chr4:6318207-6318226 MsG0480018538.01.T01:CDS 35.0%
GCATGACATTCTACAAGAAA+TGG + Chr4:6317971-6317990 MsG0480018538.01.T01:CDS 35.0%
GTAAGATTCTTGATGCTTGA+AGG - Chr4:6318972-6318991 None:intergenic 35.0%
GTGATATGTTGAGTGGTTTA+TGG - Chr4:6320280-6320299 None:intergenic 35.0%
GTTAAAGAAAGAGTCACACA+AGG + Chr4:6317102-6317121 MsG0480018538.01.T01:CDS 35.0%
GTTTAACCGAAGATGATTTG+AGG + Chr4:6320061-6320080 MsG0480018538.01.T01:intron 35.0%
TAAACGCCTCAAATCATCTT+CGG - Chr4:6320070-6320089 None:intergenic 35.0%
TACCCCAAATTCCAATAACA+GGG - Chr4:6317129-6317148 None:intergenic 35.0%
TAGACCATCGAATCATGATT+AGG - Chr4:6321300-6321319 None:intergenic 35.0%
TAGGTGAAGTTAAAAGGGTT+TGG + Chr4:6320246-6320265 MsG0480018538.01.T01:intron 35.0%
TCAAAGCAATCTAGAAATCC+TGG + Chr4:6318917-6318936 MsG0480018538.01.T01:CDS 35.0%
TGAAAAACGCAGTCACTTAT+GGG + Chr4:6318031-6318050 MsG0480018538.01.T01:CDS 35.0%
TGACAAAGCCTTGAAATGTT+GGG + Chr4:6319832-6319851 MsG0480018538.01.T01:intron 35.0%
TGTCGATGACAAACTTAAGA+GGG + Chr4:6315999-6316018 MsG0480018538.01.T01:CDS 35.0%
TTAACTTCTCCTTGATGGAA+AGG - Chr4:6319629-6319648 None:intergenic 35.0%
TTAATAACTGGTAAACCACC+AGG + Chr4:6321842-6321861 MsG0480018538.01.T01:CDS 35.0%
TTCAGAAGCCCTAAAACTTA+AGG + Chr4:6318638-6318657 MsG0480018538.01.T01:CDS 35.0%
TTCTAACAGTGATAAGTCAG+TGG + Chr4:6317881-6317900 MsG0480018538.01.T01:CDS 35.0%
TTGAAGGAAAAACCAATGTG+TGG + Chr4:6320827-6320846 MsG0480018538.01.T01:intron 35.0%
TTGTATATGCAACTGATTGG+AGG + Chr4:6320591-6320610 MsG0480018538.01.T01:intron 35.0%
TTGTCGATGACAAACTTAAG+AGG + Chr4:6315998-6316017 MsG0480018538.01.T01:CDS 35.0%
TTTATATCAGAGACCCCTAA+TGG - Chr4:6314885-6314904 None:intergenic 35.0%
TTTATTAGTACCTCAACCTC+AGG - Chr4:6314737-6314756 None:intergenic 35.0%
! AAAGATGATCTGTTTGAGGT+TGG + Chr4:6317510-6317529 MsG0480018538.01.T01:CDS 35.0%
! AAATGAGTTGGAGAAAGACA+AGG - Chr4:6315466-6315485 None:intergenic 35.0%
! AAATGGTTGATACCAAATGC+GGG - Chr4:6319982-6320001 None:intergenic 35.0%
! AAGATGATCTGTTTGAGGTT+GGG + Chr4:6317511-6317530 MsG0480018538.01.T01:CDS 35.0%
! AAGTCTTATCCCATTAAGTG+GGG + Chr4:6315413-6315432 MsG0480018538.01.T01:intron 35.0%
! ACAAGTTTTGCAACAGTTAG+AGG + Chr4:6322051-6322070 MsG0480018538.01.T01:CDS 35.0%
! ATAAGTGACTGCGTTTTTCA+GGG - Chr4:6318031-6318050 None:intergenic 35.0%
! CTCGGTCTTTGTTTACATTA+AGG + Chr4:6315156-6315175 MsG0480018538.01.T01:intron 35.0%
! GAAATGGTTGATACCAAATG+CGG - Chr4:6319983-6320002 None:intergenic 35.0%
! GCATCATTCCTATTGATTGA+AGG - Chr4:6316962-6316981 None:intergenic 35.0%
! GGTTTGATTGTTTTCCTCAA+GGG + Chr4:6318303-6318322 MsG0480018538.01.T01:CDS 35.0%
! GTTATTGGAATTTGGGGTAT+GGG + Chr4:6317130-6317149 MsG0480018538.01.T01:CDS 35.0%
! TAAGACTTGGTTGTTGTTGT+TGG - Chr4:6315370-6315389 None:intergenic 35.0%
! TCACTTGTTGAAGCAATTGA+AGG + Chr4:6316039-6316058 MsG0480018538.01.T01:CDS 35.0%
! TCTCTGGCAATGATTTTAGA+GGG - Chr4:6318376-6318395 None:intergenic 35.0%
! TGTTATTGGAATTTGGGGTA+TGG + Chr4:6317129-6317148 MsG0480018538.01.T01:CDS 35.0%
! TTCTCATTTTGTCCTTTGAG+AGG - Chr4:6321131-6321150 None:intergenic 35.0%
! TTCTCTGGCAATGATTTTAG+AGG - Chr4:6318377-6318396 None:intergenic 35.0%
! TTCTTTGTCTTTGAAAGCTC+CGG - Chr4:6321770-6321789 None:intergenic 35.0%
! TTGTTGTTAGTATGTCCCAA+TGG + Chr4:6321200-6321219 MsG0480018538.01.T01:intron 35.0%
! TTTTGATGTCGTACTTCTGT+AGG - Chr4:6316198-6316217 None:intergenic 35.0%
!! AAAAGCGCAAGTTTTTCAGT+AGG - Chr4:6317546-6317565 None:intergenic 35.0%
!! AAGGAGAAGTTAAAAGCGTT+TGG + Chr4:6319636-6319655 MsG0480018538.01.T01:CDS 35.0%
!! CAATGGGTTGAATTTGAAAG+TGG + Chr4:6317833-6317852 MsG0480018538.01.T01:CDS 35.0%
!! GAAGTTCAAGTTGATGATGA+TGG + Chr4:6322094-6322113 MsG0480018538.01.T01:CDS 35.0%
!! GAATGAGGAGTATTGTTGTT+TGG - Chr4:6315880-6315899 None:intergenic 35.0%
!! GATATGTTGACTGGTTTATG+GGG - Chr4:6319668-6319687 None:intergenic 35.0%
!! GTTTGATTTGGAACTCATGA+GGG + Chr4:6321937-6321956 MsG0480018538.01.T01:CDS 35.0%
!! TGGTTGTTGTTTCTTGGAAA+AGG + Chr4:6317213-6317232 MsG0480018538.01.T01:CDS 35.0%
!! TGTTTGATTTGGAACTCATG+AGG + Chr4:6321936-6321955 MsG0480018538.01.T01:CDS 35.0%
!! TTTGCTTTGTTATTGCTTGG+GGG + Chr4:6319373-6319392 MsG0480018538.01.T01:CDS 35.0%
!! TTTTGCTATAACCGCAGTTT+TGG + Chr4:6316408-6316427 MsG0480018538.01.T01:intron 35.0%
!!! TTTTCTTGGCTTTGTATGCT+TGG + Chr4:6316570-6316589 MsG0480018538.01.T01:intron 35.0%
AAAAACAAAGCCCAGCAAAG+GGG - Chr4:6319355-6319374 None:intergenic 40.0%
AAACTAGACCTAAGGTGGTT+TGG - Chr4:6315604-6315623 None:intergenic 40.0%
AACAAGAAAGGGTTGAGTTC+TGG + Chr4:6319137-6319156 MsG0480018538.01.T01:intron 40.0%
AACTTGGAAATGCAGCCATT+AGG + Chr4:6314867-6314886 MsG0480018538.01.T01:CDS 40.0%
AAGGAGAGTAGATCAGATGT+AGG - Chr4:6315554-6315573 None:intergenic 40.0%
AATTGAGGGTGACGATGAAA+AGG + Chr4:6319434-6319453 MsG0480018538.01.T01:CDS 40.0%
AATTGTCCGAGGTTCAAATG+TGG + Chr4:6316256-6316275 MsG0480018538.01.T01:CDS 40.0%
ACCCCAAATTCCAATAACAG+GGG - Chr4:6317128-6317147 None:intergenic 40.0%
ACTTGAACTTCGACCAATAC+TGG - Chr4:6322085-6322104 None:intergenic 40.0%
ACTTGGAAATGCAGCCATTA+GGG + Chr4:6314868-6314887 MsG0480018538.01.T01:CDS 40.0%
AGAAGTTCATCTCCTATCGT+TGG - Chr4:6321968-6321987 None:intergenic 40.0%
AGAATTAGCGGGATAAGACT+TGG - Chr4:6315383-6315402 None:intergenic 40.0%
AGACCAAAATCTGTGATGTG+AGG - Chr4:6321677-6321696 None:intergenic 40.0%
AGAGGAGATTAAGCCAGTAT+TGG + Chr4:6322069-6322088 MsG0480018538.01.T01:CDS 40.0%
AGCAAAAACCAACCACACAT+TGG - Chr4:6320842-6320861 None:intergenic 40.0%
AGGAAAAACCAATGTGTGGT+TGG + Chr4:6320831-6320850 MsG0480018538.01.T01:intron 40.0%
AGGAGAGTAGATCAGATGTA+GGG - Chr4:6315553-6315572 None:intergenic 40.0%
AGGGTGATCAATTATGCCAA+AGG + Chr4:6317627-6317646 MsG0480018538.01.T01:CDS 40.0%
ATAGCCTACTGGAAAAGCTT+TGG + Chr4:6318435-6318454 MsG0480018538.01.T01:CDS 40.0%
ATCCAAGGTTGAGATAAAGG+AGG - Chr4:6318797-6318816 None:intergenic 40.0%
ATGGAATACGAATGTGCTGA+AGG + Chr4:6319705-6319724 MsG0480018538.01.T01:CDS 40.0%
ATTACAGACTCTACCAAAGC+TGG + Chr4:6321262-6321281 MsG0480018538.01.T01:intron 40.0%
CAAAAAACAAAGCCCAGCAA+AGG - Chr4:6319357-6319376 None:intergenic 40.0%
CAAATATGGGCCCATTCAAA+TGG - Chr4:6320539-6320558 None:intergenic 40.0%
CAGGGTCTTTACTAGATTCT+CGG - Chr4:6318013-6318032 None:intergenic 40.0%
CATTCTACAAGAAATGGGTC+GGG + Chr4:6317977-6317996 MsG0480018538.01.T01:CDS 40.0%
CCTGCTTCTTTCCAATGTTT+GGG + Chr4:6320430-6320449 MsG0480018538.01.T01:intron 40.0%
CTGAAAAACGCAGTCACTTA+TGG + Chr4:6318030-6318049 MsG0480018538.01.T01:CDS 40.0%
GAACGATAAGAACCTTCATG+CGG - Chr4:6317366-6317385 None:intergenic 40.0%
GACAGAATTCCTTTCCATCA+AGG + Chr4:6319617-6319636 MsG0480018538.01.T01:CDS 40.0%
GACCAAAATCTGTGATGTGA+GGG - Chr4:6321676-6321695 None:intergenic 40.0%
GAGATAAATTAGTTCGTCGG+AGG + Chr4:6320194-6320213 MsG0480018538.01.T01:intron 40.0%
GAGGAAAAGCCTTAACCAAA+TGG - Chr4:6315960-6315979 None:intergenic 40.0%
GGAGCTTAAATTGGAATTGC+TGG - Chr4:6318775-6318794 None:intergenic 40.0%
GGATCTACCCCATAGAAAAT+AGG - Chr4:6316177-6316196 None:intergenic 40.0%
GTCGATGACAAACTTAAGAG+GGG + Chr4:6316000-6316019 MsG0480018538.01.T01:CDS 40.0%
GTCTTGTACTCAAACCAATC+TGG - Chr4:6319288-6319307 None:intergenic 40.0%
GTGACAAAGCCTTGAAATGT+TGG + Chr4:6319831-6319850 MsG0480018538.01.T01:intron 40.0%
GTGATCTGTGATATGTTGAG+TGG - Chr4:6320287-6320306 None:intergenic 40.0%
GTTGGAGAAAGACAAGGTTA+TGG - Chr4:6315460-6315479 None:intergenic 40.0%
TAAGAGGGGAGATGACATAT+CGG + Chr4:6316014-6316033 MsG0480018538.01.T01:CDS 40.0%
TCCAAGGTTGAGATAAAGGA+GGG - Chr4:6318796-6318815 None:intergenic 40.0%
TCCTGCTTCTTTCCAATGTT+TGG + Chr4:6320429-6320448 MsG0480018538.01.T01:intron 40.0%
TCTTGACAAGCTTGTGCATT+TGG + Chr4:6318716-6318735 MsG0480018538.01.T01:CDS 40.0%
TGTAGCAATGATGTTGGTGT+TGG - Chr4:6321723-6321742 None:intergenic 40.0%
TTAACTTCAGGCCTAGCAAA+AGG - Chr4:6322031-6322050 None:intergenic 40.0%
TTCTCTGCAGAAAACTTCTC+TGG - Chr4:6318392-6318411 None:intergenic 40.0%
! AACCCTCACATCACAGATTT+TGG + Chr4:6321671-6321690 MsG0480018538.01.T01:CDS 40.0%
! AATGCACTGCCATCATCTTT+TGG + Chr4:6318891-6318910 MsG0480018538.01.T01:CDS 40.0%
! ACCTTAGGTCTAGTTTCTAC+CGG + Chr4:6315608-6315627 MsG0480018538.01.T01:intron 40.0%
! ACTTGGTTGTTGTTGTTGGA+AGG - Chr4:6315366-6315385 None:intergenic 40.0%
! AGATGATCTGTTTGAGGTTG+GGG + Chr4:6317512-6317531 MsG0480018538.01.T01:CDS 40.0%
! CAGTGGCTTTTGTGTTAGAA+AGG + Chr4:6317898-6317917 MsG0480018538.01.T01:CDS 40.0%
! CATAAGTGACTGCGTTTTTC+AGG - Chr4:6318032-6318051 None:intergenic 40.0%
! GGCTTTTGTGTTAGAAAGGT+TGG + Chr4:6317902-6317921 MsG0480018538.01.T01:CDS 40.0%
! GGGTTTGATTGTTTTCCTCA+AGG + Chr4:6318302-6318321 MsG0480018538.01.T01:CDS 40.0%
! GTAAGTTCAAGTTCCAGCTT+TGG - Chr4:6321278-6321297 None:intergenic 40.0%
! TTGATCCATCACCTTTTGCT+AGG + Chr4:6322017-6322036 MsG0480018538.01.T01:CDS 40.0%
! TTTAGGGCTTCTGAAAAGTC+TGG - Chr4:6318633-6318652 None:intergenic 40.0%
!! AGTTGATGATGATGGAGCAA+AGG + Chr4:6322102-6322121 MsG0480018538.01.T01:CDS 40.0%
!! ATCGTTCTTGATGACGTCAA+GGG + Chr4:6317379-6317398 MsG0480018538.01.T01:CDS 40.0%
!! GAGAGAAATTAGTTGGTAGG+AGG + Chr4:6320909-6320928 MsG0480018538.01.T01:intron 40.0%
!! GTTCTGGAATTGCTTGAACT+TGG + Chr4:6319153-6319172 MsG0480018538.01.T01:intron 40.0%
!! TATCGTTCTTGATGACGTCA+AGG + Chr4:6317378-6317397 MsG0480018538.01.T01:CDS 40.0%
!!! CGCTTTTAACTTCTCCTTGA+TGG - Chr4:6319634-6319653 None:intergenic 40.0%
!!! GTTTTGGCTAATATGCTTCG+TGG + Chr4:6317669-6317688 MsG0480018538.01.T01:CDS 40.0%
!!! TTTTGTAAGCTTTAGGGGTG+AGG + Chr4:6315912-6315931 MsG0480018538.01.T01:CDS 40.0%
AAACATATACCTGCTGCTCG+AGG + Chr4:6321509-6321528 MsG0480018538.01.T01:CDS 45.0%
AACATATACCTGCTGCTCGA+GGG + Chr4:6321510-6321529 MsG0480018538.01.T01:CDS 45.0%
AAGTCTCGGATACAATGCAC+CGG + Chr4:6321748-6321767 MsG0480018538.01.T01:CDS 45.0%
AATGGCTTAGAAAGTCGTGG+CGG - Chr4:6315942-6315961 None:intergenic 45.0%
ACCAACATCATTGCTACAGC+AGG + Chr4:6321725-6321744 MsG0480018538.01.T01:CDS 45.0%
ACCGGTAGAAACTAGACCTA+AGG - Chr4:6315612-6315631 None:intergenic 45.0%
AGAGCAGTGTATGCTTATCC+TGG + Chr4:6319252-6319271 MsG0480018538.01.T01:intron 45.0%
AGGCCCCTGTTATTGGAATT+TGG + Chr4:6317122-6317141 MsG0480018538.01.T01:CDS 45.0%
AGTGATATTGAGAGGCGGAT+TGG + Chr4:6317340-6317359 MsG0480018538.01.T01:CDS 45.0%
ATACGAATGTGCTGAAGGTG+AGG + Chr4:6319710-6319729 MsG0480018538.01.T01:intron 45.0%
ATCCGCCTCTCAATATCACT+AGG - Chr4:6317340-6317359 None:intergenic 45.0%
ATGGAATACGACTGTGCTGA+AGG + Chr4:6320322-6320341 MsG0480018538.01.T01:intron 45.0%
ATGGCATATGCCAGTCGATA+TGG - Chr4:6319467-6319486 None:intergenic 45.0%
ATGGTCAAGGAACACGTGAT+GGG + Chr4:6314699-6314718 MsG0480018538.01.T01:CDS 45.0%
ATTGCTACAGCAGGAAGTCT+CGG + Chr4:6321734-6321753 MsG0480018538.01.T01:CDS 45.0%
CAACCTCATCAACACAACCT+TGG - Chr4:6317005-6317024 None:intergenic 45.0%
CATAGTCGACCCCACTTAAT+GGG - Chr4:6315425-6315444 None:intergenic 45.0%
CCAAATGGCTTAGAAAGTCG+TGG - Chr4:6315945-6315964 None:intergenic 45.0%
CCACGACTTTCTAAGCCATT+TGG + Chr4:6315942-6315961 MsG0480018538.01.T01:CDS 45.0%
CCCAAACATTGGAAAGAAGC+AGG - Chr4:6320433-6320452 None:intergenic 45.0%
CGACAAAACAAAGTGTGTCG+AGG + Chr4:6319794-6319813 MsG0480018538.01.T01:intron 45.0%
CTACATGTCCAAACCACCTT+AGG + Chr4:6315593-6315612 MsG0480018538.01.T01:intron 45.0%
CTGGAAGTAGTGTTCCAGAT+TGG + Chr4:6319271-6319290 MsG0480018538.01.T01:CDS 45.0%
CTTGGAAATGCAGCCATTAG+GGG + Chr4:6314869-6314888 MsG0480018538.01.T01:CDS 45.0%
GCCCCTGTTATTGGAATTTG+GGG + Chr4:6317124-6317143 MsG0480018538.01.T01:CDS 45.0%
GCTCCAAAAGAATAACGCTG+AGG - Chr4:6321820-6321839 None:intergenic 45.0%
GGAAAAGATTGAAGCCCTTG+AGG - Chr4:6318320-6318339 None:intergenic 45.0%
GGACTTGTCATATAGCCTAC+TGG + Chr4:6318424-6318443 MsG0480018538.01.T01:CDS 45.0%
GGAGAGTAGATCAGATGTAG+GGG - Chr4:6315552-6315571 None:intergenic 45.0%
GGCCATTCAACGACAATTTC+AGG - Chr4:6321536-6321555 None:intergenic 45.0%
GGCCCCTGTTATTGGAATTT+GGG + Chr4:6317123-6317142 MsG0480018538.01.T01:CDS 45.0%
GGCCTGAAATTGTCGTTGAA+TGG + Chr4:6321531-6321550 MsG0480018538.01.T01:CDS 45.0%
GGTAGAAACTAGACCTAAGG+TGG - Chr4:6315609-6315628 None:intergenic 45.0%
GGTTGCCTAGTGATATTGAG+AGG + Chr4:6317332-6317351 MsG0480018538.01.T01:CDS 45.0%
GTCTCTCCACATTTGAACCT+CGG - Chr4:6316265-6316284 None:intergenic 45.0%
GTTCCAGCAACAATTCCATC+TGG - Chr4:6314843-6314862 None:intergenic 45.0%
TAAACGTCGGTCTTTGTGGT+AGG - Chr4:6321794-6321813 None:intergenic 45.0%
TACGAATGTGCTGAAGGTGA+GGG + Chr4:6319711-6319730 MsG0480018538.01.T01:intron 45.0%
TCAACTGATGAAGGAAGCTC+AGG - Chr4:6319044-6319063 None:intergenic 45.0%
TCATAGTCGACCCCACTTAA+TGG - Chr4:6315426-6315445 None:intergenic 45.0%
TCCCTCCTTTATCTCAACCT+TGG + Chr4:6318792-6318811 MsG0480018538.01.T01:CDS 45.0%
TCCTGCTGTAGCAATGATGT+TGG - Chr4:6321729-6321748 None:intergenic 45.0%
TGAGAATCAAGGGGTCTCTT+TGG + Chr4:6321145-6321164 MsG0480018538.01.T01:intron 45.0%
TGCAACTGATTGGAGGTGAA+TGG + Chr4:6320598-6320617 MsG0480018538.01.T01:intron 45.0%
TGCCTAGTGATATTGAGAGG+CGG + Chr4:6317335-6317354 MsG0480018538.01.T01:CDS 45.0%
TGGCTGCATTTCCAAGTTAG+AGG - Chr4:6314865-6314884 None:intergenic 45.0%
TGTATGAATGGACCCGCATT+TGG + Chr4:6319967-6319986 MsG0480018538.01.T01:intron 45.0%
TGTTGCTGGAACCTCTAACT+TGG + Chr4:6314851-6314870 MsG0480018538.01.T01:CDS 45.0%
TTGTCGTTGAATGGCCAACA+AGG + Chr4:6321540-6321559 MsG0480018538.01.T01:CDS 45.0%
! ACGTCAAGGGTACATATCAC+TGG + Chr4:6317392-6317411 MsG0480018538.01.T01:intron 45.0%
! AGATGATGGCAGTGCATTGA+TGG - Chr4:6318889-6318908 None:intergenic 45.0%
! ATTGGAATTTGGGGTATGGG+CGG + Chr4:6317133-6317152 MsG0480018538.01.T01:CDS 45.0%
! CAATCTGGAACACTACTTCC+AGG - Chr4:6319273-6319292 None:intergenic 45.0%
! CACACCAAAGCTTTTCCAGT+AGG - Chr4:6318442-6318461 None:intergenic 45.0%
! CAGCCTCAGCGTTATTCTTT+TGG + Chr4:6321814-6321833 MsG0480018538.01.T01:CDS 45.0%
! CTACTGGAAAAGCTTTGGTG+TGG + Chr4:6318440-6318459 MsG0480018538.01.T01:CDS 45.0%
! CTGTTTGAGGTTGGGGTATT+GGG + Chr4:6317519-6317538 MsG0480018538.01.T01:CDS 45.0%
! GATGATGGCAGTGCATTGAT+GGG - Chr4:6318888-6318907 None:intergenic 45.0%
! GATTTGGAACTCATGAGGGA+TGG + Chr4:6321941-6321960 MsG0480018538.01.T01:CDS 45.0%
! GGCAAGTCTATGCCATTTGT+TGG - Chr4:6321872-6321891 None:intergenic 45.0%
! GGTACTGAGAAGAACATCGT+TGG - Chr4:6319545-6319564 None:intergenic 45.0%
! GTTGTGTTGTTATTGCGCCA+TGG + Chr4:6314680-6314699 MsG0480018538.01.T01:CDS 45.0%
! TATCGACTGGCATATGCCAT+CGG + Chr4:6319467-6319486 MsG0480018538.01.T01:CDS 45.0%
! TCACCAAGGTTGTGTTGATG+AGG + Chr4:6316999-6317018 MsG0480018538.01.T01:CDS 45.0%
! TCTGTTTGAGGTTGGGGTAT+TGG + Chr4:6317518-6317537 MsG0480018538.01.T01:CDS 45.0%
! TTGTTATTGCGCCATGGTCA+AGG + Chr4:6314686-6314705 MsG0480018538.01.T01:CDS 45.0%
!! ATGCCATTTGTTGGTTCTCC+TGG - Chr4:6321863-6321882 None:intergenic 45.0%
!! TTTGTTATTGCTTGGGGGAC+CGG + Chr4:6319378-6319397 MsG0480018538.01.T01:CDS 45.0%
!!! AATATTTTATTATTTAAACA+TGG - Chr4:6320507-6320526 None:intergenic 5.0%
AACGCTGAGGCTGTAAACGT+CGG - Chr4:6321807-6321826 None:intergenic 50.0%
ACATCATCTCTCCCCTTTGC+TGG + Chr4:6319341-6319360 MsG0480018538.01.T01:CDS 50.0%
ACGAATGTGCTGAAGGTGAG+GGG + Chr4:6319712-6319731 MsG0480018538.01.T01:intron 50.0%
ACGACGTTGCTCAAAGCTTC+TGG + Chr4:6319013-6319032 MsG0480018538.01.T01:CDS 50.0%
ACTCAGTTGGTCAAGCCTGA+AGG + Chr4:6318602-6318621 MsG0480018538.01.T01:CDS 50.0%
ACTGAGAACTGAGAACCCGA+TGG - Chr4:6319486-6319505 None:intergenic 50.0%
AGCAAAGGGGAGAGATGATG+TGG - Chr4:6319342-6319361 None:intergenic 50.0%
ATCGACTGGCATATGCCATC+GGG + Chr4:6319468-6319487 MsG0480018538.01.T01:CDS 50.0%
ATGAGGGATGGACCAACGAT+AGG + Chr4:6321953-6321972 MsG0480018538.01.T01:CDS 50.0%
CAATAGGAATGATGCCGTGC+TGG + Chr4:6316967-6316986 MsG0480018538.01.T01:intron 50.0%
CATCACGTGTTCCTTGACCA+TGG - Chr4:6314700-6314719 None:intergenic 50.0%
CATCATCTCTCCCCTTTGCT+GGG + Chr4:6319342-6319361 MsG0480018538.01.T01:CDS 50.0%
CATGGTCAAGGAACACGTGA+TGG + Chr4:6314698-6314717 MsG0480018538.01.T01:CDS 50.0%
CCACCAGGAGAACCAACAAA+TGG + Chr4:6321857-6321876 MsG0480018538.01.T01:CDS 50.0%
GAGCAATGATCCAGCCCAAA+AGG - Chr4:6314640-6314659 None:intergenic 50.0%
GAGGGTGACGATGAAAAGGA+TGG + Chr4:6319438-6319457 MsG0480018538.01.T01:CDS 50.0%
GCTGGTGGAAGAAATCACCA+AGG + Chr4:6316985-6317004 MsG0480018538.01.T01:CDS 50.0%
GCTGTAAACGTCGGTCTTTG+TGG - Chr4:6321798-6321817 None:intergenic 50.0%
GGTGATTTCTTCCACCAGCA+CGG - Chr4:6316984-6317003 None:intergenic 50.0%
TCACACAAGGCCCCTGTTAT+TGG + Chr4:6317115-6317134 MsG0480018538.01.T01:CDS 50.0%
TCAGGCCTAGCAAAAGGTGA+TGG - Chr4:6322025-6322044 None:intergenic 50.0%
TCGCCAGATGGAATTGTTGC+TGG + Chr4:6314837-6314856 MsG0480018538.01.T01:CDS 50.0%
TCTACAAGAAATGGGTCGGG+AGG + Chr4:6317980-6317999 MsG0480018538.01.T01:CDS 50.0%
TGGTCAAGGAACACGTGATG+GGG + Chr4:6314700-6314719 MsG0480018538.01.T01:CDS 50.0%
TGGTGTGGAGTGCAGGTAAT+TGG + Chr4:6318455-6318474 MsG0480018538.01.T01:intron 50.0%
TGTAGGGGAGTCAGATCACA+TGG - Chr4:6315537-6315556 None:intergenic 50.0%
! AAAGCTTTGGTGTGGAGTGC+AGG + Chr4:6318448-6318467 MsG0480018538.01.T01:CDS 50.0%
! ATTTGGGGTATGGGCGGTAT+TGG + Chr4:6317139-6317158 MsG0480018538.01.T01:CDS 50.0%
! CAGTGCATTGATGGGACATC+TGG - Chr4:6318880-6318899 None:intergenic 50.0%
! GGGCTTCAATCTTTTCCACG+TGG + Chr4:6318323-6318342 MsG0480018538.01.T01:CDS 50.0%
! GTTGAAGGGTGCAGCAGAAA+AGG + Chr4:6315849-6315868 MsG0480018538.01.T01:intron 50.0%
!! AGAAGTAAGGCATCGCCAGA+TGG + Chr4:6314825-6314844 MsG0480018538.01.T01:CDS 50.0%
!! CCATTTGTTGGTTCTCCTGG+TGG - Chr4:6321860-6321879 None:intergenic 50.0%
!! GGGTCTTATTCCTGAGGTTG+AGG + Chr4:6314724-6314743 MsG0480018538.01.T01:CDS 50.0%
ACGACTGTGCTGAAGGTGAG+AGG + Chr4:6320329-6320348 MsG0480018538.01.T01:intron 55.0%
AGGATGGCGTCCATATCGAC+TGG + Chr4:6319454-6319473 MsG0480018538.01.T01:CDS 55.0%
TAGGAATGATGCCGTGCTGG+TGG + Chr4:6316970-6316989 MsG0480018538.01.T01:intron 55.0%
! TCAAGGAACACGTGATGGGG+CGG + Chr4:6314703-6314722 MsG0480018538.01.T01:CDS 55.0%
ATTTCAGGCCCTCGAGCAGC+AGG - Chr4:6321521-6321540 None:intergenic 60.0%
! CAAGGAACACGTGATGGGGC+GGG + Chr4:6314704-6314723 MsG0480018538.01.T01:CDS 60.0%
!! TGGGGCGGGTCTTATTCCTG+AGG + Chr4:6314718-6314737 MsG0480018538.01.T01:CDS 60.0%
!! GAGGCGGATTGGCCGCATGA+AGG + Chr4:6317351-6317370 MsG0480018538.01.T01:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr4 gene 6314629 6322141 6314629 ID=MsG0480018538.01;Name=MsG0480018538.01
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Chr4 exon 6314629 6314745 6314629 ID=MsG0480018538.01.T01:exon:2188;Parent=MsG0480018538.01.T01
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Chr4 exon 6315856 6316334 6315856 ID=MsG0480018538.01.T01:exon:2190;Parent=MsG0480018538.01.T01
Chr4 exon 6316973 6317400 6316973 ID=MsG0480018538.01.T01:exon:2191;Parent=MsG0480018538.01.T01
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Chr4 exon 6318576 6319147 6318576 ID=MsG0480018538.01.T01:exon:2194;Parent=MsG0480018538.01.T01
Chr4 exon 6319254 6319726 6319254 ID=MsG0480018538.01.T01:exon:2195;Parent=MsG0480018538.01.T01
Chr4 exon 6321483 6322141 6321483 ID=MsG0480018538.01.T01:exon:2196;Parent=MsG0480018538.01.T01
Chr4 CDS 6314629 6314745 6314629 ID=MsG0480018538.01.T01:cds;Parent=MsG0480018538.01.T01
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Chr4 CDS 6321483 6322141 6321483 ID=MsG0480018538.01.T01:cds;Parent=MsG0480018538.01.T01
Gene Sequence

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