AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0480018531.01


Find 304 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 650 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-GE

Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr4 gene 6210489 6220952 6210489 ID=MsG0480018531.01;Name=MsG0480018531.01
Chr4 mRNA 6210489 6220952 6210489 ID=MsG0480018531.01.T01;Parent=MsG0480018531.01;Name=MsG0480018531.01.T01;_AED=0.43;_eAED=0.44;_QI=122|0.25|0.22|1|1|1|9|0|1887
Chr4 exon 6210489 6211720 6210489 ID=MsG0480018531.01.T01:exon:1622;Parent=MsG0480018531.01.T01
Chr4 exon 6211797 6212096 6211797 ID=MsG0480018531.01.T01:exon:1623;Parent=MsG0480018531.01.T01
Chr4 exon 6212201 6213207 6212201 ID=MsG0480018531.01.T01:exon:1624;Parent=MsG0480018531.01.T01
Chr4 exon 6215690 6215780 6215690 ID=MsG0480018531.01.T01:exon:1625;Parent=MsG0480018531.01.T01
Chr4 exon 6215937 6216017 6215937 ID=MsG0480018531.01.T01:exon:1626;Parent=MsG0480018531.01.T01
Chr4 exon 6216312 6216799 6216312 ID=MsG0480018531.01.T01:exon:1627;Parent=MsG0480018531.01.T01
Chr4 exon 6218200 6219301 6218200 ID=MsG0480018531.01.T01:exon:1628;Parent=MsG0480018531.01.T01
Chr4 exon 6219382 6219669 6219382 ID=MsG0480018531.01.T01:exon:1629;Parent=MsG0480018531.01.T01
Chr4 exon 6219756 6220952 6219756 ID=MsG0480018531.01.T01:exon:1630;Parent=MsG0480018531.01.T01
Chr4 five_prime_UTR 6210489 6210610 6210489 ID=MsG0480018531.01.T01:five_prime_utr;Parent=MsG0480018531.01.T01
Chr4 CDS 6210611 6211720 6210611 ID=MsG0480018531.01.T01:cds;Parent=MsG0480018531.01.T01
Chr4 CDS 6211797 6212096 6211797 ID=MsG0480018531.01.T01:cds;Parent=MsG0480018531.01.T01
Chr4 CDS 6212201 6213207 6212201 ID=MsG0480018531.01.T01:cds;Parent=MsG0480018531.01.T01
Chr4 CDS 6215690 6215780 6215690 ID=MsG0480018531.01.T01:cds;Parent=MsG0480018531.01.T01
Chr4 CDS 6215937 6216017 6215937 ID=MsG0480018531.01.T01:cds;Parent=MsG0480018531.01.T01
Chr4 CDS 6216312 6216799 6216312 ID=MsG0480018531.01.T01:cds;Parent=MsG0480018531.01.T01
Chr4 CDS 6218200 6219301 6218200 ID=MsG0480018531.01.T01:cds;Parent=MsG0480018531.01.T01
Chr4 CDS 6219382 6219669 6219382 ID=MsG0480018531.01.T01:cds;Parent=MsG0480018531.01.T01
Chr4 CDS 6219756 6220952 6219756 ID=MsG0480018531.01.T01:cds;Parent=MsG0480018531.01.T01
Gene Sequence

>MsG0480018531.01.T01

ATGGATAGGAATGATGCTCAGCTGCTTGATGAAATCATCACTCGTGTGTTGGAGAAATTGAGTAAGCATCGGTCGTGTGTTAAATCAAAAAGACTTGTTGGAATTGACAAACCAGTTGCAGATTTGAATTCATTGTTAAAGAAAGAGTCAGAACAGGTCCGTGTTATTGGAATTTGGGGCATGGGCGGTATTGGCAAGACAACTATTGCACAAGAAATATTTAGCCGAAATCGTTCCGATTATGAAGGTTGTTGTTTTTTGGAAAAGGTCAGTGAAAGGTTAAAAACACATGGTGGAGTTGGATGTTTAATGGAAAGCCTTTTATCTGAACTATTGAAAGAATCCAAGAAAGAATTGTCCAGTGATATAAAGAGACGGATTGGCCGCATGAAGGTTCTTATCGTTCTTGATGATGTCAAGGATACAGACCAGCTGGAAGAGTTATTTGGAACTCTTGATTGGTTTCGATCCGATAGTAGAATAATTCTAACAACCAGAGATAAGCAAGTACTTATCACTAATGAAGTTGATGATGATGATCTATATGAGGTTAGGGTATTGGATTCTAATGAAGCACTTGAGCTTTTCAATTTGAATGTCTTTAAACAAAGTCATCTTGAAATGGAGTACTATGAGCTATCAAAGAGGGTGGTCGATTATGCCAAAGGAATTCCATTAGTTCTTAAAGTTTTGGCTCATCTGCTTCGTGGAAAAGATAAGGAAGTATGGGAAAGTCAGCTGGACAGACTTAAAAGACTGCCAAGTAAAAAAGTTCATGATGTAATGAGACTCAGTTATGATGATCTTGATCGTTTAGACCAACAATATTTTTTAGATATAGCATGTTTCTTCAATGGGTTGAATTTGAAAGTGGATTACATGAAACTTTTATTGAAAAATTCTGATAGTGATAATTCTGTGGCTGGTGGGTTAGAAACTTTGAAAGATAGAGCTCTTATAACCATTTCTGAAGATAATGTTATATCTATGCATGACATTCTACAAGAAATGGGTCAGGAGGTTGTTCGCCAAGAATCTATTGAAGACCCTACAAAATGCAGTCGATTATGGGATCCTGATATTATTTTTGATGTATTGAAAAATGACAAGGGTTCTGATGCCATTAGAAGCATAGATGGTTGCTTGTCAGCATGTAGAAATCTGAATTTAAGCCGTCATGTATTTGATAAGATGACCAACCTGAAATTTTTGCATTTGTCAGAAAGTGGGTACAGTAAAGACTGTTCGGTTCTTCTTCCTCAAGGGCTTCAATCTTTTCCAACTAATCTAAGATATCTTTCTTGGATGAATTACCCTCTAAAATCATTGCCAGAGAAGTTTTCTGCAGAGAATCTTGTTACATTGATCTTGTTTGATAGTCGAGTGGAAAAGCTTTGGTGTGGAGTGCAGGATCTAGTTAATTTAAAAAAAGTTACACTCGCTTATTCAAGAAACCTGAAGGAGTTACCAGACTTTTCAAAAGCCACAAATCTTGAAGTATTCGAAATTGCAGGTTGTTTAAATTTGAATAGCGTCCATCCATCTATTTTCTCTCTTAACAAGCTTGTGCAATTGAATCTATCGTATTGTCCCATCAATGCACTTCCATCATCTATTGGATGTCAAAGCAATCTAGAAACCCTGGATTTAGGTAGAACTGATATTGAGATCATACCTTCAAGCATCAAGAATCTTACAAAACTAAGAAAACTAGACATACACTGTTGCACAAAGCTTCTGGCTCTACCCGAGCTTTCTTCATCGATTGAAACTCTACTTGTTGAAGACTGTAAGTCACTGAAGACTGTATTGTTCCCTTCAACAGTTGCTGAACAATTCAATGAAAACAAGAAAAGGGTTGAGTTCTGGAATTGCTTCAACTTGGATGAACTTTCTCTCTTTAATATTGGGCTGAATCTGCAAATCAATTTGTTGAGGTTTACACATCAACATTTATCAACACTGGAACATGACGATTATGTTGAAAGTTATGTTGATTACAACAAAGATAACTTTGATTCTCATCAAGCAGTGTATGTGTATCCAGGAAGTAGTGTTCCAGAGTGGTTTGAGTACAAGACAACACAGGATGATATGATTATTGATCTCTCTCAGCCTCATCTCTCCCCTTTGTCGGGCTTTGTTTTTTGCTTTGTTATTGCTAAGGATTCCAAATTGTTTTTCGAAATGAAATTGAAAATCTCTACAATTGAGGGTGGCGATGAAAAGGATAGTATCGATATCTACTTGCATAGGTCATTGGAAATTGAATCAGATCATGTGTGCATGATATTCAACCAACCATGTTCTCAGTACCTAACTAGAATAGCAAAAAATCAGACAAGCTTCAAAATCAAGGTTACAGCATGGTCAATATCCTGGTTTGATGAAGTAGAAAGAGAGATAAAGTTAAAAGGAGACAATACAGGCATTATGGAAGTAAGGCATTTCCAGATGGAATTTTCGCTAGAACATCTAAATCGGAAATGCAGCCATTATGGGACTTCGAGAGTTTCAAGGCATGAGTTAAACTTGTGGTCTATTGCAGGAGTTAAGAAGAAAGAAATGGTCAATAAAACAGTCACAAAGGTGAAGGGTGTAGCAGAAAAGGCAATGTCAAACAATGCTCCCGAATCAAAGTATGATGTTTTTGTAAGCTTTAGGGGAGAGGACATCCGCCACGGCTTTCTTGGTCATTTGGCTAAGGCTTTTCCTCAAAAGCAAATAAATGCCTTTGTTGATGACAAACTTAAGAGGGGAGATGACATACCACATTCACTTTTTGAAGCAATTGAAGGATCGTTCATTTCATTGATCATATTCTCAGAAAACTATGCTTCTTCACGTTGGTGTTTAGAAGAACTTGTGAAAATAATTGAGTGCAAAGAGAAATATGGACAGATTGTAATACCTGTTTTCTATGAGGTAGATCCTACAGATGTACGGCATCAAAAGAAGAGTTATGAAAATGCACTTGTAGGGCATGAAAAAAAGTATATTTTGTCAAGGGTTCAGAAATGGAGACAAGCTTTGGAAAAATCTGCTAATTTGTCAGGAATTAAGTCATTAGATTTTCGGAATGATGCTGAGCTACTTGAAGAAATCATCAATCTTGTGTTGAAGAGGTTGAGTAAGTATCCTATTAACACGAAAGGATTTATTGGAATTGCCAAACCAGTTGGACATTTAGAATCATTGTTACGTCAGAAGTCAGAAAAGGTTCGTGTCATTGGAATTTGGGGTATGGGAGGTATTGGAAAGACAACTATTGCTGAAGAAGTTTATAACCGAAGTTGCTCTGAATATGAAGGTTGTTGTTTTCTGGCAAAGGTGAGTGACGAATTAGGAAGGCATGGAATATCATTTTTAAAAAAAGAGCTTTTTTCTACACTATTAGCAGAAGATGTGAAAATCGATTCACCAAATGGGTTGTCTAATAATATTCAAAGAAGGATTGGCCGTATGAAGGTTCTTATTGTTCTTGATGATGTTAAGGAAGAAGATCAACTAGAGATTTTATTTGGAACTCTTGATTGGTTTCGATCTGATAGTAGAATAATTGTAACAACTAGAGACAAGCAAGTACTTATTACTAATGAAGTTGATGATATATATGAAGTTGGGGTACTGAATTATAGCGAAGCACTTGAGCTTTTTAATTTGAACGCTTTTAAACAAAGTCATCTTGAAATGGAGTACTATGAGCTTTCAAAGAAGGTGATCGATTATGCGAAAGGAATTCCATTAGTTCTTAAAGTTTTGGCTCATCTGCTTCGTGGAAAAGATAAGGAAGTATGGAAAAGTCAGCTGGACAAACTTAAAAGACTGCCAAGTAAAAAGGTTCATGATGTAATGAGACTCAGTTATGATGATCTTGATCGTTTAGAGCGAAAGTATTTTTTGGATATTGCATGTTTCTTCAACGGGTTGAGGTTGAAAGTGGATTACATGAAACTTTTATTGAAAGATTTTGAAAGTGATAATGCAGTGGTTGTTGGGTTAGAAAGGTTGAAAGATAAAGCTCTAATAACTATTTCTGAAGATAATGTTATATCTATGCATGACATTCTACAAGAAATGGGTCGGGAGGTTGTTCGTCAAGAATCTAGTGAAGACCCTCGAAAATGCAGTCGATTATCAGATCCTGATATTGTCTATGATGTATTGAAAAATGACAGGGGTACTGATGCTATTAGAAGCATAAGTCTAGACTTGTCAGCAATAAGGAACCTGAAGTTAAGCCCCAATGTATTTGATAAGATGACCAACCTGCAGTTTTTGGATTTTCGTGACATAGATGGTTTGGATCGTATTCCTGAACGACTTCAATCTTTTCCAACTGATCTAAAATATCTTCATTGGATATGTTACCCTCTAAAATCACTCCCAGAGAAGTTTTCTGCAGAGAATCTTGTTATATTGGACTTGTCAGGTAGCCTACTGGAAAAGCTTTGGTGTGGAGTGCAGGATCTGGTTAATTTAAAAGAAGTTACACTCTCACAATCAGGATTCCTGAAGGAGTTACCAGACTTTTCAAAAGCCACAAATCTTAATGTATTGAATATCCGAGGTTGTTATGGGTTGACAAGCGTCCATCCATCTATTTTCTCTCTTGACAAACTTGTGAAATTGGACCTAAGTTTTTGCCTTTCCCTTGCACCGTTTACAATCAACTGTAATTTAAGCTCCCACCATTTGCCTTCATCTCTAGAATTTCAAGGCAAGCTAGAAATCCTGGATTTAGTATTCACTGCAATTGAGAGCATACCGTCAAGCATCAAGAATCTTACAAGACTAAGAAAATTAGACATACGATTTTGCTCAAAGCTTGTGGCTCTACCCGAGCTTCCTTCATCAATTGAAACTCTACTTGTTGAATGTGAATCATTGAAGACTGTATTTTTCCCTTCTGTTGCTCAACAATTCAAGGAAAACAAGAAAAGGATTGAGTTCTGGAATTGCTTGAACTTGGATGAACGCTCTCTCATAAACATTGGGTTGAATGTGCAGATCAATTTGATGAAGTTTGCATATCGACATTCAGCGGCACTGTTACATCATGCTAAAAACAATGAAAGAAATGTTGATTACAAAGATAAATTTGATTCTTGTCAAGCAGTGTATTTGTATCCTGGAAGTAGTGTTCCAGAGTGGTTCGAGTACAAGACAACAAAGGATGATATGATTATTGATCTCTCTTCTTTTCTTCTCTCCCCTTTGTTGGGCTTTGTTTTTTGCTTCATCCTTGCCAAGGACTCCCAATTTTGTTACCAAATTGAATTGAATATCACTACAATTGATGTTGTGGATGACGATGAAAAGGATGGTGTCAGTATCTTCATGTATAGGGATTTTTTCTCTAGTTTTTCAGATCATGTATGCATGATATACGACCCACCATGTTCACGCTACCTAACTAGCATAGCAAAAAATCAGACAAGGTTTAAAATCAAGGTTACAGCAAGGACAGCACCCGGCTTTGATAGAGAGAGACCAGAGGTGGAGTTAAAAGGGTTTGGCATCAGACCCATAATCCCCTTGAGAGATAAAAACATCGTTGAACAAATGGAATTGTTTGATTATGTTAACAAATGGAGTAGGACTGTGCTTAGCATCATCATATGTATTTCTTTCCTCCGGCTGAAGATGAAGAAGTTGATTTAG

Protein sequence

>MsG0480018531.01.T01

MDRNDAQLLDEIITRVLEKLSKHRSCVKSKRLVGIDKPVADLNSLLKKESEQVRVIGIWGMGGIGKTTIAQEIFSRNRSDYEGCCFLEKVSERLKTHGGVGCLMESLLSELLKESKKELSSDIKRRIGRMKVLIVLDDVKDTDQLEELFGTLDWFRSDSRIILTTRDKQVLITNEVDDDDLYEVRVLDSNEALELFNLNVFKQSHLEMEYYELSKRVVDYAKGIPLVLKVLAHLLRGKDKEVWESQLDRLKRLPSKKVHDVMRLSYDDLDRLDQQYFLDIACFFNGLNLKVDYMKLLLKNSDSDNSVAGGLETLKDRALITISEDNVISMHDILQEMGQEVVRQESIEDPTKCSRLWDPDIIFDVLKNDKGSDAIRSIDGCLSACRNLNLSRHVFDKMTNLKFLHLSESGYSKDCSVLLPQGLQSFPTNLRYLSWMNYPLKSLPEKFSAENLVTLILFDSRVEKLWCGVQDLVNLKKVTLAYSRNLKELPDFSKATNLEVFEIAGCLNLNSVHPSIFSLNKLVQLNLSYCPINALPSSIGCQSNLETLDLGRTDIEIIPSSIKNLTKLRKLDIHCCTKLLALPELSSSIETLLVEDCKSLKTVLFPSTVAEQFNENKKRVEFWNCFNLDELSLFNIGLNLQINLLRFTHQHLSTLEHDDYVESYVDYNKDNFDSHQAVYVYPGSSVPEWFEYKTTQDDMIIDLSQPHLSPLSGFVFCFVIAKDSKLFFEMKLKISTIEGGDEKDSIDIYLHRSLEIESDHVCMIFNQPCSQYLTRIAKNQTSFKIKVTAWSISWFDEVEREIKLKGDNTGIMEVRHFQMEFSLEHLNRKCSHYGTSRVSRHELNLWSIAGVKKKEMVNKTVTKVKGVAEKAMSNNAPESKYDVFVSFRGEDIRHGFLGHLAKAFPQKQINAFVDDKLKRGDDIPHSLFEAIEGSFISLIIFSENYASSRWCLEELVKIIECKEKYGQIVIPVFYEVDPTDVRHQKKSYENALVGHEKKYILSRVQKWRQALEKSANLSGIKSLDFRNDAELLEEIINLVLKRLSKYPINTKGFIGIAKPVGHLESLLRQKSEKVRVIGIWGMGGIGKTTIAEEVYNRSCSEYEGCCFLAKVSDELGRHGISFLKKELFSTLLAEDVKIDSPNGLSNNIQRRIGRMKVLIVLDDVKEEDQLEILFGTLDWFRSDSRIIVTTRDKQVLITNEVDDIYEVGVLNYSEALELFNLNAFKQSHLEMEYYELSKKVIDYAKGIPLVLKVLAHLLRGKDKEVWKSQLDKLKRLPSKKVHDVMRLSYDDLDRLERKYFLDIACFFNGLRLKVDYMKLLLKDFESDNAVVVGLERLKDKALITISEDNVISMHDILQEMGREVVRQESSEDPRKCSRLSDPDIVYDVLKNDRGTDAIRSISLDLSAIRNLKLSPNVFDKMTNLQFLDFRDIDGLDRIPERLQSFPTDLKYLHWICYPLKSLPEKFSAENLVILDLSGSLLEKLWCGVQDLVNLKEVTLSQSGFLKELPDFSKATNLNVLNIRGCYGLTSVHPSIFSLDKLVKLDLSFCLSLAPFTINCNLSSHHLPSSLEFQGKLEILDLVFTAIESIPSSIKNLTRLRKLDIRFCSKLVALPELPSSIETLLVECESLKTVFFPSVAQQFKENKKRIEFWNCLNLDERSLINIGLNVQINLMKFAYRHSAALLHHAKNNERNVDYKDKFDSCQAVYLYPGSSVPEWFEYKTTKDDMIIDLSSFLLSPLLGFVFCFILAKDSQFCYQIELNITTIDVVDDDEKDGVSIFMYRDFFSSFSDHVCMIYDPPCSRYLTSIAKNQTRFKIKVTARTAPGFDRERPEVELKGFGIRPIIPLRDKNIVEQMELFDYVNKWSRTVLSIIICISFLRLKMKKLI*