AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0480018568.01

Query id Subject id identity % alignment length mismatches gap openings q. start q. end s. start s. end e-value bit score
MsG0480018568.01.T01 MTR_4g014440 97.805 410 9 0 1 410 1 410 0.0 841
MsG0480018568.01.T01 MTR_7g070060 78.676 408 84 1 6 410 5 412 0.0 689
MsG0480018568.01.T01 MTR_7g070060 82.432 296 52 0 115 410 15 310 0.0 530
MsG0480018568.01.T01 MTR_7g070060 78.498 293 60 1 6 295 5 297 2.13e-174 489
MsG0480018568.01.T01 MTR_4g014430 55.372 363 152 4 45 407 94 446 8.64e-146 422
MsG0480018568.01.T01 MTR_3g071650 52.149 349 161 3 62 409 89 432 2.93e-134 392
MsG0480018568.01.T01 MTR_5g083260 51.862 349 162 3 62 409 83 426 2.50e-133 389
MsG0480018568.01.T01 MTR_8g463790 46.633 401 193 7 21 408 18 410 8.83e-126 370
MsG0480018568.01.T01 MTR_3g070900 49.857 349 167 5 62 407 106 449 1.08e-121 361
MsG0480018568.01.T01 MTR_4g016940 46.000 350 179 6 61 407 85 427 3.35e-111 333
MsG0480018568.01.T01 MTR_5g082880 45.480 354 184 5 62 410 165 514 2.27e-110 334
MsG0480018568.01.T01 MTR_7g068920 45.559 349 182 5 61 407 79 421 1.69e-105 318
MsG0480018568.01.T01 MTR_0136s0010 39.612 361 198 8 57 410 165 512 5.22e-88 276
MsG0480018568.01.T01 MTR_7g093450 37.950 361 204 8 57 410 243 590 7.10e-82 263
MsG0480018568.01.T01 MTR_4g121560 37.088 364 205 9 54 408 106 454 2.40e-81 258
MsG0480018568.01.T01 MTR_8g069790 38.525 366 204 8 50 408 166 517 3.41e-81 259
MsG0480018568.01.T01 MTR_5g033800 37.746 355 200 8 61 408 144 484 1.41e-80 256
MsG0480018568.01.T01 MTR_3g464570 35.311 354 209 8 60 409 41 378 1.42e-80 253
MsG0480018568.01.T01 MTR_1g112210 36.723 354 202 9 54 407 51 382 1.44e-79 250
MsG0480018568.01.T01 MTR_5g071350 36.288 361 204 8 60 409 56 401 5.88e-79 249
MsG0480018568.01.T01 MTR_1g050448 37.143 350 197 9 58 407 49 375 6.33e-78 246
MsG0480018568.01.T01 MTR_7g109550 37.853 354 195 8 62 410 137 470 2.78e-76 244
MsG0480018568.01.T01 MTR_1g112210 35.593 354 193 9 54 407 51 369 1.86e-75 239
MsG0480018568.01.T01 MTR_7g094750 36.927 371 198 10 56 410 85 435 2.99e-75 241
MsG0480018568.01.T01 MTR_2g022560 38.462 364 191 13 56 405 91 435 8.69e-75 240
MsG0480018568.01.T01 MTR_3g049330 34.383 381 215 9 25 405 3 348 2.02e-74 236
MsG0480018568.01.T01 MTR_2g073510 35.677 384 207 11 26 407 8 353 1.57e-72 231
MsG0480018568.01.T01 MTR_3g035830 35.734 361 196 9 49 407 22 348 4.49e-72 230
MsG0480018568.01.T01 MTR_5g059400 34.278 353 217 7 62 409 175 517 3.17e-71 233
MsG0480018568.01.T01 MTR_1g116130 34.278 353 217 7 62 409 175 517 3.17e-71 233
MsG0480018568.01.T01 MTR_3g021090 35.876 354 192 9 52 403 24 344 1.36e-70 228
MsG0480018568.01.T01 MTR_4g087730 32.481 391 235 10 17 407 1 362 1.59e-70 226
MsG0480018568.01.T01 MTR_4g088030 35.028 354 202 8 54 407 25 350 2.01e-70 226
MsG0480018568.01.T01 MTR_3g021060 33.983 359 205 8 49 407 37 363 5.20e-70 225
MsG0480018568.01.T01 MTR_4g126950 35.262 363 201 11 58 407 105 446 4.07e-69 225
MsG0480018568.01.T01 MTR_1g058380 34.865 370 219 7 49 410 42 397 1.90e-68 223
MsG0480018568.01.T01 MTR_5g034810 33.947 380 218 13 31 407 3 352 8.10e-68 219
MsG0480018568.01.T01 MTR_4g079700 32.759 348 205 8 62 409 47 365 1.87e-65 213
MsG0480018568.01.T01 MTR_2g091175 33.143 350 203 9 60 408 48 367 1.09e-64 211
MsG0480018568.01.T01 MTR_2g073500 31.990 397 212 12 19 408 1 346 1.58e-64 210
MsG0480018568.01.T01 MTR_2g015720 34.682 346 197 10 62 407 42 358 4.76e-64 209
MsG0480018568.01.T01 MTR_3g090120 30.541 370 224 8 50 410 117 462 7.17e-62 207
MsG0480018568.01.T01 MTR_8g093530 29.839 372 224 9 46 408 74 417 7.77e-60 201
MsG0480018568.01.T01 MTR_1g111010 32.044 362 208 11 48 408 18 342 7.19e-59 196
MsG0480018568.01.T01 MTR_3g464570 34.146 287 170 7 127 409 3 274 3.78e-58 191
MsG0480018568.01.T01 MTR_5g033800 37.083 240 143 3 61 295 144 380 1.06e-50 175
MsG0480018568.01.T01 MTR_7g094750 36.000 250 144 5 56 295 85 328 7.97e-49 169
MsG0480018568.01.T01 MTR_6g016875 31.818 396 237 13 26 403 24 404 1.39e-46 165
MsG0480018568.01.T01 MTR_5g035090 31.421 366 214 13 60 407 81 427 4.38e-42 154
MsG0480018568.01.T01 MTR_5g035150 31.389 360 212 16 62 403 85 427 1.05e-41 152
MsG0480018568.01.T01 MTR_8g027900 30.081 369 219 16 54 403 203 551 3.79e-41 153
MsG0480018568.01.T01 MTR_6g016880 31.436 369 222 14 49 403 64 415 7.22e-41 150
MsG0480018568.01.T01 MTR_7g033230 30.073 409 249 17 14 403 215 605 4.55e-40 151
MsG0480018568.01.T01 MTR_4g125060 28.846 364 217 10 62 407 132 471 5.84e-40 149
MsG0480018568.01.T01 MTR_4g125060 28.846 364 217 10 62 407 171 510 6.52e-40 149
MsG0480018568.01.T01 MTR_4g125060 28.846 364 217 10 62 407 200 539 8.45e-40 149
MsG0480018568.01.T01 MTR_7g033230 30.073 409 249 17 14 403 285 675 8.99e-40 150
MsG0480018568.01.T01 MTR_6g061710 28.495 372 234 14 53 407 158 514 2.90e-39 147
MsG0480018568.01.T01 MTR_1g076690 29.235 366 225 14 60 407 221 570 2.58e-38 145
MsG0480018568.01.T01 MTR_7g019120 30.495 364 217 14 56 403 73 416 3.35e-38 143
MsG0480018568.01.T01 MTR_8g104970 30.952 378 230 17 42 403 99 461 3.40e-38 144
MsG0480018568.01.T01 MTR_5g035070 31.551 374 216 15 50 403 76 429 4.91e-38 143
MsG0480018568.01.T01 MTR_8g093870 27.749 382 220 14 51 407 122 472 7.12e-38 143
MsG0480018568.01.T01 MTR_5g035080 30.084 359 217 17 62 403 75 416 9.44e-36 136
MsG0480018568.01.T01 MTR_8g099300 27.123 365 222 16 61 403 73 415 7.92e-35 134
MsG0480018568.01.T01 MTR_3g109840 29.167 408 223 19 24 403 42 411 1.03e-34 133
MsG0480018568.01.T01 MTR_4g092830 29.024 379 202 16 62 407 48 392 9.41e-34 130
MsG0480018568.01.T01 MTR_2g016060 27.493 371 231 13 50 403 47 396 6.13e-30 120
MsG0480018568.01.T01 MTR_6g007777 25.895 363 231 10 62 407 116 457 2.71e-29 119
MsG0480018568.01.T01 MTR_6g016240 29.491 373 209 16 62 407 71 416 1.06e-27 114
MsG0480018568.01.T01 MTR_5g069320 25.083 303 153 8 109 400 147 386 8.95e-25 105
MsG0480018568.01.T01 MTR_7g019140 44.792 96 52 1 56 151 73 167 6.98e-23 95.1
MsG0480018568.01.T01 MTR_5g035120 35.878 131 83 1 23 153 36 165 9.39e-21 89.4
MsG0480018568.01.T01 MTR_2g022580 37.903 124 68 3 123 239 2 123 2.76e-19 83.6
MsG0480018568.01.T01 MTR_3g021150 37.963 108 62 2 259 366 4 106 6.30e-17 77.0
MsG0480018568.01.T01 MTR_5g035140 29.876 241 144 12 178 403 31 261 5.41e-14 72.4
Query id Subject id identity % alignment length mismatches gap openings q. start q. end s. start s. end e-value bit score
MsG0480018568.01.T01 AT2G38320 66.332 398 127 3 17 408 9 405 0.0 557
MsG0480018568.01.T01 AT2G38320 70.898 323 92 2 87 408 1 322 2.00e-173 488
MsG0480018568.01.T01 AT5G01620 55.747 348 146 4 61 407 109 449 5.51e-144 417
MsG0480018568.01.T01 AT5G01620 55.747 348 146 4 61 407 109 449 5.51e-144 417
MsG0480018568.01.T01 AT5G01620 55.747 348 146 4 61 407 117 457 9.13e-144 417
MsG0480018568.01.T01 AT2G40320 51.862 349 162 3 62 409 81 424 3.06e-134 392
MsG0480018568.01.T01 AT3G11030 50.000 350 168 4 62 409 106 450 8.89e-127 374
MsG0480018568.01.T01 AT2G40150 49.582 359 167 5 61 410 70 423 1.47e-126 372
MsG0480018568.01.T01 AT3G55990 49.858 353 169 5 61 410 139 486 1.24e-123 367
MsG0480018568.01.T01 AT1G73140 49.716 352 166 6 62 410 67 410 5.78e-122 360
MsG0480018568.01.T01 AT5G01360 45.272 349 184 4 61 407 35 378 7.92e-113 335
MsG0480018568.01.T01 AT5G01360 45.272 349 184 4 61 407 91 434 3.50e-112 336
MsG0480018568.01.T01 AT2G40160 45.205 365 191 7 51 410 66 426 1.32e-109 329
MsG0480018568.01.T01 AT2G40160 45.205 365 191 7 51 410 66 426 2.99e-109 328
MsG0480018568.01.T01 AT5G06700 40.223 358 192 9 56 405 249 592 4.51e-84 269
MsG0480018568.01.T01 AT5G58600 38.136 354 200 8 60 409 64 402 3.73e-82 258
MsG0480018568.01.T01 AT3G12060 38.265 392 214 11 28 408 162 536 1.28e-81 261
MsG0480018568.01.T01 AT3G54260 36.111 396 221 10 22 408 3 375 2.31e-81 255
MsG0480018568.01.T01 AT5G49340 37.778 360 206 8 56 408 94 442 4.27e-81 256
MsG0480018568.01.T01 AT3G06080 39.444 360 193 10 57 405 98 443 2.97e-80 255
MsG0480018568.01.T01 AT1G60790 35.385 390 234 8 25 408 156 533 5.90e-80 256
MsG0480018568.01.T01 AT5G19160 37.534 365 196 9 57 405 94 442 2.26e-78 250
MsG0480018568.01.T01 AT3G62390 35.013 397 233 9 20 410 97 474 1.36e-77 248
MsG0480018568.01.T01 AT1G78710 34.375 352 204 8 57 408 33 357 3.16e-76 241
MsG0480018568.01.T01 AT2G40160 46.988 249 126 5 51 295 66 312 4.17e-76 239
MsG0480018568.01.T01 AT2G30010 36.842 361 201 11 60 409 54 398 2.39e-75 240
MsG0480018568.01.T01 AT2G30010 36.842 361 201 11 60 409 97 441 4.05e-75 241
MsG0480018568.01.T01 AT5G20590 36.915 363 200 9 57 408 136 480 5.78e-74 239
MsG0480018568.01.T01 AT1G29050 32.888 374 222 8 34 407 34 378 1.26e-73 235
MsG0480018568.01.T01 AT3G14850 35.613 351 201 8 57 407 29 354 3.79e-73 233
MsG0480018568.01.T01 AT2G30900 35.897 351 196 10 62 409 43 367 1.82e-72 231
MsG0480018568.01.T01 AT5G06230 35.561 374 212 7 49 408 7 365 4.23e-71 228
MsG0480018568.01.T01 AT5G06230 35.561 374 212 7 49 408 48 406 8.01e-71 229
MsG0480018568.01.T01 AT2G34070 33.524 349 203 9 60 407 63 383 1.66e-69 224
MsG0480018568.01.T01 AT3G11570 35.484 341 191 8 79 408 98 420 4.22e-67 219
MsG0480018568.01.T01 AT2G31110 33.505 388 229 9 21 407 3 362 3.31e-66 215
MsG0480018568.01.T01 AT2G42570 33.238 349 205 9 60 408 45 365 2.12e-63 208
MsG0480018568.01.T01 AT1G48880 31.618 408 231 12 19 410 67 442 2.01e-60 202
MsG0480018568.01.T01 AT5G19160 39.754 244 141 2 57 295 94 336 4.77e-59 196
MsG0480018568.01.T01 AT3G06080 40.486 247 135 5 57 295 98 340 1.70e-56 189
MsG0480018568.01.T01 AT1G78710 30.966 352 163 10 57 408 26 297 5.78e-56 186
MsG0480018568.01.T01 AT5G58600 38.819 237 135 5 60 295 64 291 5.86e-53 178
MsG0480018568.01.T01 AT3G62390 35.106 282 174 5 20 296 97 374 7.13e-52 179
MsG0480018568.01.T01 AT5G20590 36.400 250 141 4 57 295 136 378 1.41e-47 167
MsG0480018568.01.T01 AT3G14850 34.182 275 157 7 133 407 1 251 8.62e-47 161
MsG0480018568.01.T01 AT5G06230 34.749 259 156 4 49 295 48 305 1.88e-46 162
MsG0480018568.01.T01 AT2G30900 34.956 226 137 5 62 286 43 259 9.80e-44 154
MsG0480018568.01.T01 AT2G34070 31.159 276 162 8 133 407 1 249 5.81e-43 151
MsG0480018568.01.T01 AT5G20680 29.570 372 204 11 62 407 118 457 1.46e-42 155
MsG0480018568.01.T01 AT5G64020 29.759 373 214 16 62 407 57 408 2.33e-42 154
MsG0480018568.01.T01 AT5G20680 29.570 372 204 11 62 407 194 533 4.50e-42 155
MsG0480018568.01.T01 AT5G20680 29.570 372 204 11 62 407 212 551 6.59e-42 155
MsG0480018568.01.T01 AT5G20680 29.570 372 204 11 62 407 212 551 6.59e-42 155
MsG0480018568.01.T01 AT5G20680 29.570 372 204 11 62 407 212 551 6.59e-42 155
MsG0480018568.01.T01 AT5G20680 29.570 372 204 11 62 407 212 551 6.59e-42 155
MsG0480018568.01.T01 AT5G51640 27.487 382 232 13 51 407 127 488 1.26e-41 154
MsG0480018568.01.T01 AT1G01430 28.421 380 232 15 53 410 89 450 1.69e-41 152
MsG0480018568.01.T01 AT3G02440 30.471 361 209 12 62 403 127 464 1.89e-41 153
MsG0480018568.01.T01 AT3G02440 30.471 361 209 12 62 403 135 472 2.02e-41 153
MsG0480018568.01.T01 AT2G31110 32.210 267 170 5 21 286 3 259 2.58e-41 147
MsG0480018568.01.T01 AT2G37720 28.610 367 214 15 62 407 143 482 4.88e-40 149
MsG0480018568.01.T01 AT4G25360 28.385 384 221 14 53 407 166 524 1.00e-39 149
MsG0480018568.01.T01 AT4G25360 28.385 384 221 14 53 407 166 524 1.00e-39 149
MsG0480018568.01.T01 AT5G15890 28.912 377 214 13 49 403 174 518 8.50e-39 146
MsG0480018568.01.T01 AT5G64470 30.133 375 218 15 53 408 46 395 1.10e-38 144
MsG0480018568.01.T01 AT1G70230 28.056 360 210 11 62 403 79 407 3.40e-38 142
MsG0480018568.01.T01 AT5G64470 29.396 381 219 15 53 408 46 401 3.39e-37 140
MsG0480018568.01.T01 AT4G01080 27.941 408 246 14 23 410 54 433 3.56e-36 137
MsG0480018568.01.T01 AT4G23790 28.378 370 226 17 59 407 76 427 1.64e-35 135
MsG0480018568.01.T01 AT4G11090 27.596 366 232 17 59 407 76 425 3.92e-35 134
MsG0480018568.01.T01 AT5G15900 27.206 408 259 13 19 407 21 409 9.68e-35 133
MsG0480018568.01.T01 AT2G14530 27.248 367 228 12 60 407 60 406 1.26e-34 133
MsG0480018568.01.T01 AT5G15900 27.206 408 259 13 19 407 40 428 1.27e-34 133
MsG0480018568.01.T01 AT2G31110 32.906 234 128 6 174 405 6 212 4.69e-32 121
MsG0480018568.01.T01 AT3G28150 26.446 363 230 11 61 407 69 410 4.04e-31 123
MsG0480018568.01.T01 AT5G64470 28.626 262 163 11 53 299 46 298 8.15e-22 95.5
MsG0480018568.01.T01 AT5G64470 28.626 262 163 11 53 299 46 298 9.37e-22 95.5

Find 106 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 174 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ATGCAATCTGCATAAGATTT+TGG 0.172517 4:+6757777 None:intergenic
AGTAGTGTTACACACCAATT+TGG 0.225456 4:-6760344 MsG0480018568.01.T01:CDS
AGTGATTCTGATTCCCAAAT+TGG 0.231314 4:+6760330 None:intergenic
TTGAATGCAAATGGCAATTA+AGG 0.251462 4:-6760377 None:intergenic
TATCAAATGTTTGTCATCTA+TGG 0.258736 4:+6757694 None:intergenic
GATATTTGCTCTTCTGTTAG+AGG 0.262790 4:+6757804 None:intergenic
GGGTCTTGTTACGATTAATA+TGG 0.277488 4:+6758264 None:intergenic
CCTTGAGGACTTGGTCTGAT+TGG 0.293874 4:-6758295 MsG0480018568.01.T01:CDS
CATTGCTTCCTATATATTGA+TGG 0.315991 4:+6757831 None:intergenic
CAGTCCTATCTGGCACCTTA+TGG 0.327002 4:+6758997 None:intergenic
TCCTTCTTGTGTTAGATATA+TGG 0.335216 4:+6760261 None:intergenic
ATGCAACCATCGAATTCTAT+TGG 0.338688 4:-6759061 MsG0480018568.01.T01:CDS
AGAAGCTCATTCCAAGTATC+AGG 0.342301 4:+6757732 None:intergenic
GAGGCTTCCACCTCCAATTC+TGG 0.343204 4:+6760065 None:intergenic
TCCCTGGTGTGCCTGATACT+TGG 0.347343 4:-6757743 MsG0480018568.01.T01:CDS
CAGTTGGCTTGTGTGAAGTT+TGG 0.347389 4:-6760106 MsG0480018568.01.T01:CDS
ACAAGAGGCTTGTGTTTGTT+GGG 0.354831 4:-6759476 MsG0480018568.01.T01:CDS
ATGAAATGGCCTTGAGGACT+TGG 0.370232 4:-6758304 MsG0480018568.01.T01:CDS
CCCTAATGGAGTATACAAAA+AGG 0.376155 4:-6758345 MsG0480018568.01.T01:CDS
CTTATGCAGATTGCATTCAT+TGG 0.381074 4:-6757770 MsG0480018568.01.T01:CDS
TGAACTCTCACAGTCCTATC+TGG 0.381080 4:+6758987 None:intergenic
CAATATGTTACATTTATGTT+TGG 0.385627 4:-6757655 MsG0480018568.01.T01:three_prime_UTR
TGGTGTGTAACACTACTATT+TGG 0.394186 4:+6760350 None:intergenic
CAGAGGACAATGGGTTTCAA+TGG 0.399093 4:-6759442 MsG0480018568.01.T01:CDS
TTGCATGGATTTGAGACTTA+GGG 0.400745 4:+6759395 None:intergenic
TGTTACATTTATGTTTGGTT+TGG 0.402267 4:-6757650 MsG0480018568.01.T01:three_prime_UTR
GAAGAGGGATATAGTGGAAA+TGG 0.403660 4:-6757972 MsG0480018568.01.T01:CDS
AACAAGAGGCTTGTGTTTGT+TGG 0.403969 4:-6759477 MsG0480018568.01.T01:CDS
AGGATCTTAGCTACCAGAAT+TGG 0.416193 4:-6760078 MsG0480018568.01.T01:CDS
TTGTCATCTATGGAAAATAT+AGG 0.423330 4:+6757704 None:intergenic
CAAGTGGTAGAAAATGTTCT+AGG 0.431915 4:-6757930 MsG0480018568.01.T01:CDS
ATTAAAGAAGAGGGATATAG+TGG 0.432155 4:-6757978 MsG0480018568.01.T01:CDS
GGGTCATTTGGAAGCCCTAA+TGG 0.439990 4:-6758359 MsG0480018568.01.T01:CDS
TTCACTCAACAGAGGACAAT+GGG 0.446487 4:-6759451 MsG0480018568.01.T01:CDS
TAGTCTTCAACACATTCCTT+TGG 0.448265 4:-6758920 MsG0480018568.01.T01:CDS
AATTTGATTCTACAAGCAAT+GGG 0.448640 4:+6759036 None:intergenic
AAGGTCATCCATCAATATAT+AGG 0.449509 4:-6757839 MsG0480018568.01.T01:CDS
TGATTTCAGGGCTCATGAAT+GGG 0.451288 4:-6758042 MsG0480018568.01.T01:intron
TGCAACCATCGAATTCTATT+GGG 0.454306 4:-6759060 MsG0480018568.01.T01:CDS
ATGATTTCAGGGCTCATGAA+TGG 0.456632 4:-6758043 MsG0480018568.01.T01:intron
ATACTTAGCATGTTTCTCAA+TGG 0.461652 4:+6758962 None:intergenic
GAATTTGATTCTACAAGCAA+TGG 0.465234 4:+6759035 None:intergenic
TGCATTCATTGGTGTCTCCC+TGG 0.467577 4:-6757759 MsG0480018568.01.T01:CDS
TTCCAAGTATCAGGCACACC+AGG 0.469992 4:+6757741 None:intergenic
GAGGACTTGGTCTGATTGGT+TGG 0.470409 4:-6758291 MsG0480018568.01.T01:CDS
ACCATTGGCAATGGTTTGCA+TGG 0.470878 4:+6759380 None:intergenic
GTAGTGTTACACACCAATTT+GGG 0.474579 4:-6760343 MsG0480018568.01.T01:CDS
TTTGCATGGATTTGAGACTT+AGG 0.475132 4:+6759394 None:intergenic
TAAGTTCATGTCTGATCAGT+TGG 0.476841 4:-6760122 MsG0480018568.01.T01:CDS
TCTTCAACACATTCCTTTGG+TGG 0.479202 4:-6758917 MsG0480018568.01.T01:CDS
TTGAGAAACATGCTAAGTAT+TGG 0.480376 4:-6758959 MsG0480018568.01.T01:CDS
ACACATTCCTTTGGTGGAGA+AGG 0.487193 4:-6758911 MsG0480018568.01.T01:CDS
TCATGAATGGGGAGGAGCAA+AGG 0.487502 4:-6758030 MsG0480018568.01.T01:CDS
GTGACTTATTCGATGGTAAG+TGG 0.487950 4:-6760189 MsG0480018568.01.T01:CDS
ATGCCACAACATTGCTTGAA+AGG 0.488238 4:-6759506 MsG0480018568.01.T01:CDS
TCTGGCACCTTATGGTTCAC+TGG 0.494756 4:+6759005 None:intergenic
ATAGATCAAATTAAAGAAGA+GGG 0.498846 4:-6757987 MsG0480018568.01.T01:CDS
TGAACCATAAGGTGCCAGAT+AGG 0.499653 4:-6759001 MsG0480018568.01.T01:CDS
ATCTTAGCTACCAGAATTGG+AGG 0.500091 4:-6760075 MsG0480018568.01.T01:CDS
CATGAATGGGGAGGAGCAAA+GGG 0.500571 4:-6758029 MsG0480018568.01.T01:CDS
TTTGGCCTTGAAAATGTTGA+GGG 0.501664 4:+6759356 None:intergenic
GAAAATGTTGAGGGAACCAT+TGG 0.502111 4:+6759365 None:intergenic
CTATCAGAGTACAGAAAAGA+AGG 0.502508 4:-6757858 MsG0480018568.01.T01:CDS
CATTGTTGTTCTTTGTAGAG+TGG 0.508085 4:+6760145 None:intergenic
TTGCTTTCCTTCTCCACCAA+AGG 0.511894 4:+6758904 None:intergenic
CAAGAGGCTTGTGTTTGTTG+GGG 0.515415 4:-6759475 MsG0480018568.01.T01:CDS
ATCAATATATAGGAAGCAAT+GGG 0.515450 4:-6757829 MsG0480018568.01.T01:CDS
CTTTGGCCTTGAAAATGTTG+AGG 0.517150 4:+6759355 None:intergenic
AATAGATCAAATTAAAGAAG+AGG 0.518199 4:-6757988 MsG0480018568.01.T01:CDS
CATCAATATATAGGAAGCAA+TGG 0.529787 4:-6757830 MsG0480018568.01.T01:CDS
GTGGTTTATAATACCTTGGT+AGG 0.530810 4:+6760032 None:intergenic
AATGGTGAGAGTCTATGAAA+TGG 0.539914 4:-6758318 MsG0480018568.01.T01:CDS
AGATGATCCAGTGAACCATA+AGG 0.542200 4:-6759012 MsG0480018568.01.T01:CDS
CTAGGAGATTTGAAATCAAG+AGG 0.546012 4:-6757912 MsG0480018568.01.T01:CDS
GTTGAGGGAACCATTGGCAA+TGG 0.550716 4:+6759371 None:intergenic
TAGCCTTTCAAGCAATGTTG+TGG 0.553731 4:+6759503 None:intergenic
GCCATATATCTAACACAAGA+AGG 0.556284 4:-6760262 MsG0480018568.01.T01:CDS
CTTGATGTTGACTGAGGTGA+GGG 0.559073 4:-6757609 MsG0480018568.01.T01:three_prime_UTR
CAACATTGCTTGAAAGGCTA+AGG 0.559276 4:-6759500 MsG0480018568.01.T01:CDS
TGGCTTGTGTGAAGTTTGGA+AGG 0.562230 4:-6760102 MsG0480018568.01.T01:CDS
TCAAAATGTGACTTATTCGA+TGG 0.564211 4:-6760196 MsG0480018568.01.T01:CDS
TTCACATACCTTTGGTGAGT+AGG 0.571938 4:+6758218 None:intergenic
CCAATCAGACCAAGTCCTCA+AGG 0.574225 4:+6758295 None:intergenic
GGCTTGTGTGAAGTTTGGAA+GGG 0.576956 4:-6760101 MsG0480018568.01.T01:CDS
TGACTTATTCGATGGTAAGT+GGG 0.583755 4:-6760188 MsG0480018568.01.T01:CDS
TTGAAAGGCTAAGGAACAAG+AGG 0.590198 4:-6759491 MsG0480018568.01.T01:CDS
TCTTGATGTTGACTGAGGTG+AGG 0.592402 4:-6757610 MsG0480018568.01.T01:three_prime_UTR
CTCATCAATGTGACCTACCA+AGG 0.596342 4:-6760045 MsG0480018568.01.T01:intron
TTAGCTACCAGAATTGGAGG+TGG 0.598246 4:-6760072 MsG0480018568.01.T01:CDS
TGCATGGATTTGAGACTTAG+GGG 0.614048 4:+6759396 None:intergenic
TGTTCCTAAAATGATGCAAG+TGG 0.616326 4:-6757946 MsG0480018568.01.T01:CDS
GAGTCTATGAAATGGCCTTG+AGG 0.620084 4:-6758310 MsG0480018568.01.T01:CDS
TCCATGCAAACCATTGCCAA+TGG 0.622962 4:-6759381 MsG0480018568.01.T01:CDS
TTGTGTGAAGTTTGGAAGGG+AGG 0.625851 4:-6760098 MsG0480018568.01.T01:CDS
GATTTCAGGGCTCATGAATG+GGG 0.627429 4:-6758041 MsG0480018568.01.T01:intron
ATTCACTCAACAGAGGACAA+TGG 0.631990 4:-6759452 MsG0480018568.01.T01:CDS
CTATGTCACCTACTCACCAA+AGG 0.632176 4:-6758226 MsG0480018568.01.T01:intron
CTTGGTAGGTCACATTGATG+AGG 0.636464 4:+6760046 None:intergenic
TTCAGGGCTCATGAATGGGG+AGG 0.647228 4:-6758038 MsG0480018568.01.T01:intron
TGGGGCCCAATAGAATTCGA+TGG 0.651099 4:+6759055 None:intergenic
TAACACAAGAAGGAGGACAA+TGG 0.671835 4:-6760252 MsG0480018568.01.T01:CDS
TCCAAGTATCAGGCACACCA+GGG 0.675454 4:+6757742 None:intergenic
GTTGGGGATTCACTCAACAG+AGG 0.678403 4:-6759459 MsG0480018568.01.T01:CDS
GGGGAATTGAAGATTCAACA+AGG 0.704401 4:+6759415 None:intergenic
ATATATCTAACACAAGAAGG+AGG 0.717732 4:-6760259 MsG0480018568.01.T01:CDS
ATTTGATTCTACAAGCAATG+GGG 0.736941 4:+6759037 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! TACTTTTTAATGTTAATATA+AGG - Chr4:6758376-6758395 MsG0480018568.01.T01:intron 10.0%
!! ACATAGAAACAAAAAATAAT+TGG + Chr4:6759669-6759688 None:intergenic 15.0%
!! CATAGAAACAAAAAATAATT+GGG + Chr4:6759668-6759687 None:intergenic 15.0%
!!! AAATATTTGAAATGAGAATA+TGG - Chr4:6758241-6758260 MsG0480018568.01.T01:CDS 15.0%
!!! AAATATTTTAAAATTTGAGC+CGG - Chr4:6758015-6758034 MsG0480018568.01.T01:CDS 15.0%
!!! ATTTAAGATAAAATGATTTC+AGG - Chr4:6759854-6759873 MsG0480018568.01.T01:intron 15.0%
!!! TTTAAGATAAAATGATTTCA+GGG - Chr4:6759855-6759874 MsG0480018568.01.T01:intron 15.0%
!! AATAGATCAAATTAAAGAAG+AGG - Chr4:6759921-6759940 MsG0480018568.01.T01:intron 20.0%
!! ACTAAAAAAGAGTTTGATAT+AGG + Chr4:6759078-6759097 None:intergenic 20.0%
!! ATAGATCAAATTAAAGAAGA+GGG - Chr4:6759922-6759941 MsG0480018568.01.T01:intron 20.0%
!! ATATTGGATTAATTGTTGAT+AGG + Chr4:6759408-6759427 None:intergenic 20.0%
!! CAATATGTTACATTTATGTT+TGG - Chr4:6760254-6760273 MsG0480018568.01.T01:CDS 20.0%
!! TATTACAACACTATCATATT+TGG + Chr4:6759442-6759461 None:intergenic 20.0%
!! TCTCATTTCAAATATTTACA+TGG + Chr4:6758238-6758257 None:intergenic 20.0%
!! TTTACATGGAAAATCAATTT+AGG + Chr4:6758224-6758243 None:intergenic 20.0%
!!! AAACTCAATCTATAATGTTT+TGG + Chr4:6759199-6759218 None:intergenic 20.0%
!!! GAAAATCAATTTAGGTTATA+TGG + Chr4:6758216-6758235 None:intergenic 20.0%
! AATTGTTCGAAACTTTAATG+AGG + Chr4:6759347-6759366 None:intergenic 25.0%
! AATTTGATTCTACAAGCAAT+GGG + Chr4:6758876-6758895 None:intergenic 25.0%
! ATCAATATATAGGAAGCAAT+GGG - Chr4:6760080-6760099 MsG0480018568.01.T01:CDS 25.0%
! ATTGTTCGAAACTTTAATGA+GGG + Chr4:6759346-6759365 None:intergenic 25.0%
! GAATTGACACATTTAATCAA+AGG - Chr4:6758819-6758838 MsG0480018568.01.T01:intron 25.0%
! GATAGGAATCATTCTATATT+TGG + Chr4:6759471-6759490 None:intergenic 25.0%
! GATTGAGACAATAATATGAT+TGG - Chr4:6759157-6759176 MsG0480018568.01.T01:intron 25.0%
! TATCAAATGTTTGTCATCTA+TGG + Chr4:6760218-6760237 None:intergenic 25.0%
! TGTGTCAATTCAAAAAATCT+TGG + Chr4:6758810-6758829 None:intergenic 25.0%
! TGTTACATTTATGTTTGGTT+TGG - Chr4:6760259-6760278 MsG0480018568.01.T01:CDS 25.0%
! TTGAACCGTATAATTAAATC+CGG + Chr4:6758037-6758056 None:intergenic 25.0%
! TTGTCATCTATGGAAAATAT+AGG + Chr4:6760208-6760227 None:intergenic 25.0%
! TTTAATTATACGGTTCAACT+TGG - Chr4:6758039-6758058 MsG0480018568.01.T01:intron 25.0%
!! TTGGTCATAAAACATTTTGT+AGG + Chr4:6758791-6758810 None:intergenic 25.0%
!!! TTGTTGATAGGCAATTTTTA+AGG + Chr4:6759396-6759415 None:intergenic 25.0%
AAGGTCATCCATCAATATAT+AGG - Chr4:6760070-6760089 MsG0480018568.01.T01:CDS 30.0%
ACAACACTATCATATTTGGT+GGG + Chr4:6759438-6759457 None:intergenic 30.0%
AGATGTGGTTTATAATACCT+TGG + Chr4:6757884-6757903 None:intergenic 30.0%
AGTATACAAAAAGGTAGCAA+TGG - Chr4:6759573-6759592 MsG0480018568.01.T01:intron 30.0%
AGTTGATCAAAGAAAGTGAT+TGG + Chr4:6759053-6759072 None:intergenic 30.0%
ATACTTAGCATGTTTCTCAA+TGG + Chr4:6758950-6758969 None:intergenic 30.0%
ATATATCTAACACAAGAAGG+AGG - Chr4:6757650-6757669 MsG0480018568.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
ATTAAAGAAGAGGGATATAG+TGG - Chr4:6759931-6759950 MsG0480018568.01.T01:intron 30.0%
ATTTGATTCTACAAGCAATG+GGG + Chr4:6758875-6758894 None:intergenic 30.0%
CATCAATATATAGGAAGCAA+TGG - Chr4:6760079-6760098 MsG0480018568.01.T01:CDS 30.0%
CATTGCTTCCTATATATTGA+TGG + Chr4:6760081-6760100 None:intergenic 30.0%
GAATTTGATTCTACAAGCAA+TGG + Chr4:6758877-6758896 None:intergenic 30.0%
TACAACACTATCATATTTGG+TGG + Chr4:6759439-6759458 None:intergenic 30.0%
TCAAAATGTGACTTATTCGA+TGG - Chr4:6757713-6757732 MsG0480018568.01.T01:CDS 30.0%
TCCTTCTTGTGTTAGATATA+TGG + Chr4:6757651-6757670 None:intergenic 30.0%
TCTCTTTGTTACAACTTATG+AGG + Chr4:6759285-6759304 None:intergenic 30.0%
TTATCTGATCAACATAGATG+TGG + Chr4:6757899-6757918 None:intergenic 30.0%
TTGAGAAACATGCTAAGTAT+TGG - Chr4:6758950-6758969 MsG0480018568.01.T01:CDS 30.0%
TTGAGCCGGATTTAATTATA+CGG - Chr4:6758029-6758048 MsG0480018568.01.T01:CDS 30.0%
! ACCTTTTTGTATACTCCATT+AGG + Chr4:6759568-6759587 None:intergenic 30.0%
! ATGCAATCTGCATAAGATTT+TGG + Chr4:6760135-6760154 None:intergenic 30.0%
! CCTTTTTGTATACTCCATTA+GGG + Chr4:6759567-6759586 None:intergenic 30.0%
! TATGGTGCAGTTTGTTTAAT+TGG + Chr4:6758198-6758217 None:intergenic 30.0%
! TATTTAGGTTCACATACCTT+TGG + Chr4:6759702-6759721 None:intergenic 30.0%
!! AAAATCAACTTGCTAACTAG+TGG + Chr4:6759500-6759519 None:intergenic 30.0%
!!! ATGCATGTTTTTTGAGGATT+AGG + Chr4:6760354-6760373 None:intergenic 30.0%
!!! ATGTTTTGGTTTTGTCAAAC+TGG + Chr4:6759185-6759204 None:intergenic 30.0%
!!! TAGCATATGCATGTTTTTTG+AGG + Chr4:6760360-6760379 None:intergenic 30.0%
!!! TGCATGTTTTTTGAGGATTA+GGG + Chr4:6760353-6760372 None:intergenic 30.0%
!!! TTTTGACATTGATTCAGAAG+TGG + Chr4:6757699-6757718 None:intergenic 30.0%
AATGGTGAGAGTCTATGAAA+TGG - Chr4:6759591-6759610 MsG0480018568.01.T01:intron 35.0%
AGAGAGGGTGATATAGTTTA+TGG + Chr4:6758698-6758717 None:intergenic 35.0%
AGTAGTGTTACACACCAATT+TGG - Chr4:6757565-6757584 MsG0480018568.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
AGTCAAATGATCTCGACAAT+TGG + Chr4:6757990-6758009 None:intergenic 35.0%
AGTGATTCTGATTCCCAAAT+TGG + Chr4:6757582-6757601 None:intergenic 35.0%
ATGCAACCATCGAATTCTAT+TGG - Chr4:6758848-6758867 MsG0480018568.01.T01:intron 35.0%
CAACTTGGTAAACCAAGAAA+CGG - Chr4:6758054-6758073 MsG0480018568.01.T01:intron 35.0%
CAAGTGGTAGAAAATGTTCT+AGG - Chr4:6759979-6759998 MsG0480018568.01.T01:intron 35.0%
CCCTAATGGAGTATACAAAA+AGG - Chr4:6759564-6759583 MsG0480018568.01.T01:intron 35.0%
CTATCAGAGTACAGAAAAGA+AGG - Chr4:6760051-6760070 MsG0480018568.01.T01:CDS 35.0%
CTTATGCAGATTGCATTCAT+TGG - Chr4:6760139-6760158 MsG0480018568.01.T01:CDS 35.0%
GATATTTGCTCTTCTGTTAG+AGG + Chr4:6760108-6760127 None:intergenic 35.0%
GATCTTCATCATACGTAGTA+TGG - Chr4:6758096-6758115 MsG0480018568.01.T01:intron 35.0%
GCCATATATCTAACACAAGA+AGG - Chr4:6757647-6757666 MsG0480018568.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
GTAGTGTTACACACCAATTT+GGG - Chr4:6757566-6757585 MsG0480018568.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
GTGGTTTATAATACCTTGGT+AGG + Chr4:6757880-6757899 None:intergenic 35.0%
TAAGTTCATGTCTGATCAGT+TGG - Chr4:6757787-6757806 MsG0480018568.01.T01:CDS 35.0%
TAGAGACTAAGTAGAAGAGA+GGG + Chr4:6758713-6758732 None:intergenic 35.0%
TAGTCTTCAACACATTCCTT+TGG - Chr4:6758989-6759008 MsG0480018568.01.T01:CDS 35.0%
TGACTTATTCGATGGTAAGT+GGG - Chr4:6757721-6757740 MsG0480018568.01.T01:CDS 35.0%
TGCAACCATCGAATTCTATT+GGG - Chr4:6758849-6758868 MsG0480018568.01.T01:intron 35.0%
TGGTGTGTAACACTACTATT+TGG + Chr4:6757562-6757581 None:intergenic 35.0%
TGTTCCTAAAATGATGCAAG+TGG - Chr4:6759963-6759982 MsG0480018568.01.T01:intron 35.0%
TTAGAGACTAAGTAGAAGAG+AGG + Chr4:6758714-6758733 None:intergenic 35.0%
TTAGCAAATTGACCGTTTCT+TGG + Chr4:6758069-6758088 None:intergenic 35.0%
! CATTGTTGTTCTTTGTAGAG+TGG + Chr4:6757767-6757786 None:intergenic 35.0%
! CTAGGAGATTTGAAATCAAG+AGG - Chr4:6759997-6760016 MsG0480018568.01.T01:intron 35.0%
! TCTACCACTTGCATCATTTT+AGG + Chr4:6759970-6759989 None:intergenic 35.0%
! TTGCATGGATTTGAGACTTA+GGG + Chr4:6758517-6758536 None:intergenic 35.0%
! TTTGCATGGATTTGAGACTT+AGG + Chr4:6758518-6758537 None:intergenic 35.0%
! TTTGGTGGGTGGAAATATAT+TGG + Chr4:6759424-6759443 None:intergenic 35.0%
!! GAAACGGTCAATTTGCTAAT+TGG - Chr4:6758070-6758089 MsG0480018568.01.T01:intron 35.0%
!! GGGTCTTGTTACGATTAATA+TGG + Chr4:6759648-6759667 None:intergenic 35.0%
!! TTTGGCCTTGAAAATGTTGA+GGG + Chr4:6758556-6758575 None:intergenic 35.0%
!! TTTTCTCTTGATGTTGACTG+AGG - Chr4:6760294-6760313 MsG0480018568.01.T01:CDS 35.0%
!!! ACATTTTAACTACAAGCAGG+TGG - Chr4:6759527-6759546 MsG0480018568.01.T01:intron 35.0%
!!! ATTTTAACTACAAGCAGGTG+GGG - Chr4:6759529-6759548 MsG0480018568.01.T01:intron 35.0%
!!! ATTTTTAAGGCGATATGACG+TGG + Chr4:6759383-6759402 None:intergenic 35.0%
!!! CATTTTAACTACAAGCAGGT+GGG - Chr4:6759528-6759547 MsG0480018568.01.T01:intron 35.0%
!!! GTGACATTTTAACTACAAGC+AGG - Chr4:6759524-6759543 MsG0480018568.01.T01:intron 35.0%
AACAAGAGGCTTGTGTTTGT+TGG - Chr4:6758432-6758451 MsG0480018568.01.T01:intron 40.0%
ACAAGAGGCTTGTGTTTGTT+GGG - Chr4:6758433-6758452 MsG0480018568.01.T01:intron 40.0%
AGAAGCTCATTCCAAGTATC+AGG + Chr4:6760180-6760199 None:intergenic 40.0%
AGATGATCCAGTGAACCATA+AGG - Chr4:6758897-6758916 MsG0480018568.01.T01:CDS 40.0%
AGGATCTTAGCTACCAGAAT+TGG - Chr4:6757831-6757850 MsG0480018568.01.T01:CDS 40.0%
ATCTTAGCTACCAGAATTGG+AGG - Chr4:6757834-6757853 MsG0480018568.01.T01:CDS 40.0%
ATGATTTCAGGGCTCATGAA+TGG - Chr4:6759866-6759885 MsG0480018568.01.T01:intron 40.0%
ATGCCACAACATTGCTTGAA+AGG - Chr4:6758403-6758422 MsG0480018568.01.T01:intron 40.0%
ATTCACTCAACAGAGGACAA+TGG - Chr4:6758457-6758476 MsG0480018568.01.T01:intron 40.0%
CAACATTGCTTGAAAGGCTA+AGG - Chr4:6758409-6758428 MsG0480018568.01.T01:intron 40.0%
CTAACTAGTGGAGTTAGGAT+AGG + Chr4:6759488-6759507 None:intergenic 40.0%
GAAAATGTTGAGGGAACCAT+TGG + Chr4:6758547-6758566 None:intergenic 40.0%
GGGGAATTGAAGATTCAACA+AGG + Chr4:6758497-6758516 None:intergenic 40.0%
GTGACTTATTCGATGGTAAG+TGG - Chr4:6757720-6757739 MsG0480018568.01.T01:CDS 40.0%
TAACACAAGAAGGAGGACAA+TGG - Chr4:6757657-6757676 MsG0480018568.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
TAGCCTTTCAAGCAATGTTG+TGG + Chr4:6758409-6758428 None:intergenic 40.0%
TCTTCAACACATTCCTTTGG+TGG - Chr4:6758992-6759011 MsG0480018568.01.T01:CDS 40.0%
TGATTTCAGGGCTCATGAAT+GGG - Chr4:6759867-6759886 MsG0480018568.01.T01:intron 40.0%
TTCACATACCTTTGGTGAGT+AGG + Chr4:6759694-6759713 None:intergenic 40.0%
TTCACTCAACAGAGGACAAT+GGG - Chr4:6758458-6758477 MsG0480018568.01.T01:intron 40.0%
TTGAAAGGCTAAGGAACAAG+AGG - Chr4:6758418-6758437 MsG0480018568.01.T01:intron 40.0%
! ACACTATCATATTTGGTGGG+TGG + Chr4:6759435-6759454 None:intergenic 40.0%
! ACTTGCTAACTAGTGGAGTT+AGG + Chr4:6759493-6759512 None:intergenic 40.0%
! GAAGAGGGATATAGTGGAAA+TGG - Chr4:6759937-6759956 MsG0480018568.01.T01:intron 40.0%
! TGCATGGATTTGAGACTTAG+GGG + Chr4:6758516-6758535 None:intergenic 40.0%
! TGGTTCCCTCAACATTTTCA+AGG - Chr4:6758548-6758567 MsG0480018568.01.T01:intron 40.0%
!! CTTTGGCCTTGAAAATGTTG+AGG + Chr4:6758557-6758576 None:intergenic 40.0%
!! TTTTAACTACAAGCAGGTGG+GGG - Chr4:6759530-6759549 MsG0480018568.01.T01:intron 40.0%
ACACATTCCTTTGGTGGAGA+AGG - Chr4:6758998-6759017 MsG0480018568.01.T01:CDS 45.0%
CTATGTCACCTACTCACCAA+AGG - Chr4:6759683-6759702 MsG0480018568.01.T01:intron 45.0%
CTCATCAATGTGACCTACCA+AGG - Chr4:6757864-6757883 MsG0480018568.01.T01:CDS 45.0%
CTTGGTAGGTCACATTGATG+AGG + Chr4:6757866-6757885 None:intergenic 45.0%
GATTTCAGGGCTCATGAATG+GGG - Chr4:6759868-6759887 MsG0480018568.01.T01:intron 45.0%
GGCTTGTGTGAAGTTTGGAA+GGG - Chr4:6757808-6757827 MsG0480018568.01.T01:CDS 45.0%
TCCATGCAAACCATTGCCAA+TGG - Chr4:6758528-6758547 MsG0480018568.01.T01:intron 45.0%
TCCTATAGACCTACGCACTT+TGG + Chr4:6758574-6758593 None:intergenic 45.0%
TGAACTCTCACAGTCCTATC+TGG + Chr4:6758925-6758944 None:intergenic 45.0%
TTAGCTACCAGAATTGGAGG+TGG - Chr4:6757837-6757856 MsG0480018568.01.T01:CDS 45.0%
TTGCTTTCCTTCTCCACCAA+AGG + Chr4:6759008-6759027 None:intergenic 45.0%
TTGTGTGAAGTTTGGAAGGG+AGG - Chr4:6757811-6757830 MsG0480018568.01.T01:CDS 45.0%
! ACCATTGGCAATGGTTTGCA+TGG + Chr4:6758532-6758551 None:intergenic 45.0%
! ATGAAATGGCCTTGAGGACT+TGG - Chr4:6759605-6759624 MsG0480018568.01.T01:intron 45.0%
! CAAGAGGCTTGTGTTTGTTG+GGG - Chr4:6758434-6758453 MsG0480018568.01.T01:intron 45.0%
! CAGAGGACAATGGGTTTCAA+TGG - Chr4:6758467-6758486 MsG0480018568.01.T01:intron 45.0%
! CTTGATGTTGACTGAGGTGA+GGG - Chr4:6760300-6760319 MsG0480018568.01.T01:CDS 45.0%
! GAGTCTATGAAATGGCCTTG+AGG - Chr4:6759599-6759618 MsG0480018568.01.T01:intron 45.0%
! TCTTGATGTTGACTGAGGTG+AGG - Chr4:6760299-6760318 MsG0480018568.01.T01:CDS 45.0%
! TGAACCATAAGGTGCCAGAT+AGG - Chr4:6758908-6758927 MsG0480018568.01.T01:CDS 45.0%
! TGGCTTGTGTGAAGTTTGGA+AGG - Chr4:6757807-6757826 MsG0480018568.01.T01:CDS 45.0%
!! CAGTTGGCTTGTGTGAAGTT+TGG - Chr4:6757803-6757822 MsG0480018568.01.T01:CDS 45.0%
!! TTTTCAAGGCCAAAGTGCGT+AGG - Chr4:6758562-6758581 MsG0480018568.01.T01:intron 45.0%
!! AGTTATAATTTATTATATTT+AGG + Chr4:6759717-6759736 None:intergenic 5.0%
!!! TTTTTTTTAATAATTAAGTT+TGG - Chr4:6758319-6758338 MsG0480018568.01.T01:CDS 5.0%
CAGTCCTATCTGGCACCTTA+TGG + Chr4:6758915-6758934 None:intergenic 50.0%
CATGAATGGGGAGGAGCAAA+GGG - Chr4:6759880-6759899 MsG0480018568.01.T01:intron 50.0%
CCAATCAGACCAAGTCCTCA+AGG + Chr4:6759617-6759636 None:intergenic 50.0%
GCCAAAGTGCGTAGGTCTAT+AGG - Chr4:6758570-6758589 MsG0480018568.01.T01:intron 50.0%
GGGTCATTTGGAAGCCCTAA+TGG - Chr4:6759550-6759569 MsG0480018568.01.T01:intron 50.0%
GTTGAGGGAACCATTGGCAA+TGG + Chr4:6758541-6758560 None:intergenic 50.0%
GTTGGGGATTCACTCAACAG+AGG - Chr4:6758450-6758469 MsG0480018568.01.T01:intron 50.0%
TCATGAATGGGGAGGAGCAA+AGG - Chr4:6759879-6759898 MsG0480018568.01.T01:intron 50.0%
TCCAAGTATCAGGCACACCA+GGG + Chr4:6760170-6760189 None:intergenic 50.0%
TCTGGCACCTTATGGTTCAC+TGG + Chr4:6758907-6758926 None:intergenic 50.0%
TGGGGCCCAATAGAATTCGA+TGG + Chr4:6758857-6758876 None:intergenic 50.0%
TTCCAAGTATCAGGCACACC+AGG + Chr4:6760171-6760190 None:intergenic 50.0%
! CCTTGAGGACTTGGTCTGAT+TGG - Chr4:6759614-6759633 MsG0480018568.01.T01:intron 50.0%
! GAGGACTTGGTCTGATTGGT+TGG - Chr4:6759618-6759637 MsG0480018568.01.T01:intron 50.0%
! TGCATTCATTGGTGTCTCCC+TGG - Chr4:6760150-6760169 MsG0480018568.01.T01:CDS 50.0%
ACAAGCAGGTGGGGGTCATT+TGG - Chr4:6759538-6759557 MsG0480018568.01.T01:intron 55.0%
GAGGCTTCCACCTCCAATTC+TGG + Chr4:6757847-6757866 None:intergenic 55.0%
TCCCTGGTGTGCCTGATACT+TGG - Chr4:6760166-6760185 MsG0480018568.01.T01:CDS 55.0%
TTCAGGGCTCATGAATGGGG+AGG - Chr4:6759871-6759890 MsG0480018568.01.T01:intron 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr4 gene 6757536 6760395 6757536 ID=MsG0480018568.01;Name=MsG0480018568.01
Chr4 mRNA 6757536 6760395 6757536 ID=MsG0480018568.01.T01;Parent=MsG0480018568.01;Name=MsG0480018568.01.T01;_AED=0.48;_eAED=0.48;_QI=0|1|0.8|1|1|1|5|171|410
Chr4 exon 6757536 6758055 6757536 ID=MsG0480018568.01.T01:exon:2256;Parent=MsG0480018568.01.T01
Chr4 exon 6758227 6758385 6758227 ID=MsG0480018568.01.T01:exon:2255;Parent=MsG0480018568.01.T01
Chr4 exon 6758894 6759090 6758894 ID=MsG0480018568.01.T01:exon:2254;Parent=MsG0480018568.01.T01
Chr4 exon 6759356 6759533 6759356 ID=MsG0480018568.01.T01:exon:2253;Parent=MsG0480018568.01.T01
Chr4 exon 6760046 6760395 6760046 ID=MsG0480018568.01.T01:exon:2252;Parent=MsG0480018568.01.T01
Chr4 CDS 6760046 6760395 6760046 ID=MsG0480018568.01.T01:cds;Parent=MsG0480018568.01.T01
Chr4 CDS 6759356 6759533 6759356 ID=MsG0480018568.01.T01:cds;Parent=MsG0480018568.01.T01
Chr4 CDS 6758894 6759090 6758894 ID=MsG0480018568.01.T01:cds;Parent=MsG0480018568.01.T01
Chr4 CDS 6758227 6758385 6758227 ID=MsG0480018568.01.T01:cds;Parent=MsG0480018568.01.T01
Chr4 CDS 6757707 6758055 6757707 ID=MsG0480018568.01.T01:cds;Parent=MsG0480018568.01.T01
Chr4 three_prime_UTR 6757536 6757706 6757536 ID=MsG0480018568.01.T01:three_prime_utr;Parent=MsG0480018568.01.T01
Gene Sequence

>MsG0480018568.01.T01

ATGCAAATGGCAATTAAGGAACACCAAATAGTAGTGTTACACACCAATTTGGGAATCAGAATCACTTTTCATTCTCTTGTAGCATTTTTAACAACTATTCTAGTTGTCACTGCCATATATCTAACACAAGAAGGAGGACAATGGTCTCTTGAAAAGACTACCACTTCTGAATCAATGTCAAAATGTGACTTATTCGATGGTAAGTGGGTTTTTGACAATGAATCTTATCCACTCTACAAAGAACAACAATGTAAGTTCATGTCTGATCAGTTGGCTTGTGTGAAGTTTGGAAGGGAGGATCTTAGCTACCAGAATTGGAGGTGGAAGCCTCATCAATGTGACCTACCAAGGTTCAATGCCACAACATTGCTTGAAAGGCTAAGGAACAAGAGGCTTGTGTTTGTTGGGGATTCACTCAACAGAGGACAATGGGTTTCAATGGTTTGCCTTGTTGAATCTTCAATTCCCCTAAGTCTCAAATCCATGCAAACCATTGCCAATGGTTCCCTCAACATTTTCAAGGCCAAAGAATACAATGCAACCATCGAATTCTATTGGGCCCCATTGCTTGTAGAATCAAATTCAGATGATCCAGTGAACCATAAGGTGCCAGATAGGACTGTGAGAGTTCAAGCCATTGAGAAACATGCTAAGTATTGGACTGATGCAGATATTATAGTCTTCAACACATTCCTTTGGTGGAGAAGGAAAGCAATGAATGTTTTGTGGGGGTCATTTGGAAGCCCTAATGGAGTATACAAAAAGGTAGCAATGGTGAGAGTCTATGAAATGGCCTTGAGGACTTGGTCTGATTGGTTGGAAGTCCATATTAATCGTAACAAGACCCAATTATTTTTTGTTTCTATGTCACCTACTCACCAAAGGGCTCATGAATGGGGAGGAGCAAAGGGTGAAAATTGTTACAAAGAAATAGATCAAATTAAAGAAGAGGGATATAGTGGAAATGGTTCTGTTCCTAAAATGATGCAAGTGGTAGAAAATGTTCTAGGAGATTTGAAATCAAGAGGTTTGAATGTTCAATTGCTTAACATAACACAGCTATCAGAGTACAGAAAAGAAGGTCATCCATCAATATATAGGAAGCAATGGGAGCCTCTAACAGAAGAGCAAATATCAAATCCAAAATCTTATGCAGATTGCATTCATTGGTGTCTCCCTGGTGTGCCTGATACTTGGAATGAGCTTCTTTATGCCTATATTTTCCATAGATGA
Protein sequence

>MsG0480018568.01.T01

MQMAIKEHQIVVLHTNLGIRITFHSLVAFLTTILVVTAIYLTQEGGQWSLEKTTTSESMSKCDLFDGKWVFDNESYPLYKEQQCKFMSDQLACVKFGREDLSYQNWRWKPHQCDLPRFNATTLLERLRNKRLVFVGDSLNRGQWVSMVCLVESSIPLSLKSMQTIANGSLNIFKAKEYNATIEFYWAPLLVESNSDDPVNHKVPDRTVRVQAIEKHAKYWTDADIIVFNTFLWWRRKAMNVLWGSFGSPNGVYKKVAMVRVYEMALRTWSDWLEVHINRNKTQLFFVSMSPTHQRAHEWGGAKGENCYKEIDQIKEEGYSGNGSVPKMMQVVENVLGDLKSRGLNVQLLNITQLSEYRKEGHPSIYRKQWEPLTEEQISNPKSYADCIHWCLPGVPDTWNELLYAYIFHR*