AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0480018932.01

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MsG0480018932.01.T01 AT3G44480 38.028 142 85 2 480 621 98 236 1.36e-22 103
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MsG0480018932.01.T01 AT3G44480 38.028 142 85 2 480 621 98 236 1.30e-22 103
MsG0480018932.01.T01 AT3G44480 27.768 569 314 20 19 527 90 621 7.92e-41 160
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MsG0480018932.01.T01 AT5G46270 41.447 152 83 3 470 621 2 147 1.20e-25 113
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MsG0480018932.01.T01 AT5G46490 40.559 143 79 3 479 621 51 187 5.73e-23 103
MsG0480018932.01.T01 AT5G46490 28.265 513 282 16 27 473 12 504 9.68e-41 157
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MsG0480018932.01.T01 AT5G46270 28.627 517 279 21 27 477 23 515 1.24e-40 159
MsG0480018932.01.T01 AT5G46270 43.357 143 75 3 479 621 22 158 1.96e-25 112
MsG0480018932.01.T01 AT5G46490 28.265 513 282 16 27 473 52 544 1.32e-40 157
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MsG0480018932.01.T01 AT5G46270 28.627 517 279 21 27 477 23 515 1.36e-40 159
MsG0480018932.01.T01 AT5G46270 43.357 143 75 3 479 621 22 158 1.98e-25 112
MsG0480018932.01.T01 AT5G11250 27.048 525 303 16 27 490 62 567 1.41e-40 159
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MsG0480018932.01.T01 AT5G46490 28.265 513 282 16 27 473 69 561 1.72e-40 157
MsG0480018932.01.T01 AT5G46490 40.559 143 79 3 479 621 68 204 7.25e-23 103
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MsG0480018932.01.T01 AT3G04220 38.514 148 88 2 478 625 61 205 2.95e-23 105
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MsG0480018932.01.T01 AT1G31540 28.488 516 283 18 27 477 12 506 4.04e-40 157
MsG0480018932.01.T01 AT1G31540 42.763 152 82 3 470 621 2 148 2.44e-27 118
MsG0480018932.01.T01 AT2G14080 26.172 512 304 14 25 476 54 551 4.67e-40 158
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MsG0480018932.01.T01 AT1G31540 42.763 152 82 3 470 621 2 148 3.51e-27 118
MsG0480018932.01.T01 AT5G46450 26.996 526 310 16 27 491 13 525 6.79e-40 157
MsG0480018932.01.T01 AT5G46450 40.845 142 81 2 480 621 13 151 3.35e-26 115
MsG0480018932.01.T01 AT5G46490 28.101 516 285 16 27 476 12 507 1.07e-39 156
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MsG0480018932.01.T01 AT5G11250 26.844 488 281 13 61 490 16 485 1.42e-39 156
MsG0480018932.01.T01 AT5G11250 38.136 118 70 2 504 621 4 118 2.23e-16 84.0
MsG0480018932.01.T01 AT4G19510 31.250 496 283 13 24 470 14 500 1.86e-39 155
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MsG0480018932.01.T01 AT4G19510 31.250 496 283 13 24 470 14 500 2.42e-39 155
MsG0480018932.01.T01 AT4G19510 40.141 142 83 2 480 621 17 156 2.58e-19 93.2
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MsG0480018932.01.T01 AT4G19510 31.250 496 283 13 24 470 54 540 3.62e-39 155
MsG0480018932.01.T01 AT4G19510 40.141 142 83 2 480 621 57 196 2.45e-19 93.6
MsG0480018932.01.T01 AT4G19510 31.250 496 283 13 24 470 54 540 3.62e-39 155
MsG0480018932.01.T01 AT4G19510 40.141 142 83 2 480 621 57 196 2.45e-19 93.6
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MsG0480018932.01.T01 AT5G41750 28.063 506 292 17 25 472 11 502 5.98e-39 154
MsG0480018932.01.T01 AT5G41750 40.972 144 82 2 478 621 11 151 1.07e-24 110
MsG0480018932.01.T01 AT5G46510 27.647 510 299 17 27 476 9 508 6.80e-39 154
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MsG0480018932.01.T01 AT5G46520 27.586 522 282 21 27 476 50 547 8.28e-39 154
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MsG0480018932.01.T01 AT1G72860 42.958 142 77 2 480 621 12 149 2.35e-28 122
MsG0480018932.01.T01 AT5G45250 29.412 544 297 22 13 480 2 534 1.07e-38 154
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MsG0480018932.01.T01 AT4G08450 27.096 513 285 16 27 470 11 503 1.23e-38 154
MsG0480018932.01.T01 AT4G08450 40.559 143 78 3 479 621 10 145 1.14e-24 110
MsG0480018932.01.T01 AT4G16900 28.715 498 279 18 25 470 10 483 1.28e-38 152
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MsG0480018932.01.T01 AT5G44510 41.096 146 83 2 476 621 36 178 9.02e-24 107
MsG0480018932.01.T01 AT5G44510 27.976 504 287 19 27 470 40 527 2.21e-38 153
MsG0480018932.01.T01 AT5G44510 41.096 146 83 2 476 621 36 178 8.55e-24 107
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MsG0480018932.01.T01 AT1G65850 37.255 153 89 3 471 621 24 171 6.16e-24 107
MsG0480018932.01.T01 AT5G22690 27.767 515 281 18 27 470 10 504 3.19e-38 152
MsG0480018932.01.T01 AT5G22690 44.056 143 77 2 479 621 9 148 2.26e-26 115
MsG0480018932.01.T01 AT5G22690 27.767 515 281 18 27 470 10 504 3.22e-38 152
MsG0480018932.01.T01 AT5G22690 44.056 143 77 2 479 621 9 148 2.54e-26 115
MsG0480018932.01.T01 AT4G16900 28.715 498 279 18 25 470 10 483 3.69e-38 152
MsG0480018932.01.T01 AT4G16900 40.278 144 83 2 478 621 10 150 1.39e-21 100
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MsG0480018932.01.T01 AT4G16900 28.715 498 279 18 25 470 10 483 7.39e-38 150
MsG0480018932.01.T01 AT4G16900 40.278 144 83 2 478 621 10 150 9.40e-22 100
MsG0480018932.01.T01 AT3G51560 30.159 441 239 18 77 470 54 472 2.32e-37 150
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MsG0480018932.01.T01 AT1G72840 28.685 502 286 19 25 470 13 498 2.37e-37 149
MsG0480018932.01.T01 AT1G72840 41.667 144 83 1 478 621 13 155 3.98e-30 127
MsG0480018932.01.T01 AT1G72840 28.685 502 286 19 25 470 13 498 2.77e-37 149
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MsG0480018932.01.T01 AT1G27180 31.193 327 189 6 183 479 27 347 1.91e-36 147
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MsG0480018932.01.T01 AT5G38340 38.194 144 86 2 478 621 55 195 1.83e-20 97.1
MsG0480018932.01.T01 AT1G69550 27.800 500 294 18 27 470 80 568 3.74e-34 140
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MsG0480018932.01.T01 AT3G51570 26.843 529 299 18 22 477 14 527 4.73e-34 139
MsG0480018932.01.T01 AT3G51570 36.552 145 87 3 477 621 16 155 4.96e-21 99.0
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MsG0480018932.01.T01 AT5G45200 38.686 137 79 3 477 613 16 147 1.74e-16 84.3
MsG0480018932.01.T01 AT5G45050 31.210 314 179 8 197 481 18 323 5.21e-33 136
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MsG0480018932.01.T01 AT4G19510 31.279 438 244 12 24 412 54 483 6.05e-33 136
MsG0480018932.01.T01 AT4G19510 40.141 142 83 2 480 621 57 196 2.61e-19 93.2
MsG0480018932.01.T01 AT2G16870 26.000 500 301 15 27 469 12 499 1.03e-32 135
MsG0480018932.01.T01 AT2G16870 38.816 152 90 2 470 621 2 150 2.41e-23 106
MsG0480018932.01.T01 AT1G63740 26.531 539 308 19 3 469 11 533 1.42e-32 135
MsG0480018932.01.T01 AT1G63740 43.662 142 77 2 480 621 42 180 5.31e-24 108
MsG0480018932.01.T01 AT5G38350 27.603 413 224 10 202 546 48 453 1.78e-32 134
MsG0480018932.01.T01 AT5G45210 27.378 431 270 11 78 470 82 507 2.58e-32 132
MsG0480018932.01.T01 AT1G64070 25.100 502 304 13 26 469 13 500 6.05e-32 133
MsG0480018932.01.T01 AT1G64070 43.662 142 77 2 480 621 14 152 1.78e-26 115
MsG0480018932.01.T01 AT4G16890 28.435 313 193 5 194 483 53 357 6.20e-32 133
MsG0480018932.01.T01 AT1G63870 25.703 498 303 16 26 469 16 500 6.69e-32 132
MsG0480018932.01.T01 AT1G63870 41.549 142 80 3 480 621 17 155 8.49e-24 107
MsG0480018932.01.T01 AT4G12020 26.518 494 277 15 41 485 684 1140 8.61e-32 132
MsG0480018932.01.T01 AT5G45210 27.378 431 270 11 78 470 82 507 8.67e-32 131
MsG0480018932.01.T01 AT4G12020 26.518 494 277 15 41 485 684 1140 9.15e-32 132
MsG0480018932.01.T01 AT4G12020 26.518 494 277 15 41 485 684 1140 9.54e-32 132
MsG0480018932.01.T01 AT4G12020 26.518 494 277 15 41 485 684 1140 9.59e-32 132
MsG0480018932.01.T01 AT4G12020 26.518 494 277 15 41 485 684 1140 9.59e-32 132
MsG0480018932.01.T01 AT4G12020 26.518 494 277 15 41 485 684 1140 1.03e-31 132
MsG0480018932.01.T01 AT2G14080 29.276 304 181 6 202 476 120 418 1.07e-31 132
MsG0480018932.01.T01 AT4G12020 26.518 494 277 15 41 485 684 1140 1.09e-31 132
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MsG0480018932.01.T01 AT4G12020 26.518 494 277 15 41 485 684 1140 1.11e-31 132
MsG0480018932.01.T01 AT4G12020 26.518 494 277 15 41 485 684 1140 1.17e-31 132
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MsG0480018932.01.T01 AT4G12020 26.518 494 277 15 41 485 617 1073 1.37e-31 132
MsG0480018932.01.T01 AT5G40060 29.688 320 186 9 197 482 9 323 1.41e-31 131
MsG0480018932.01.T01 AT5G45210 27.378 431 270 11 78 470 82 507 2.22e-31 130
MsG0480018932.01.T01 AT5G45210 27.378 431 270 11 78 470 54 479 2.22e-31 130
MsG0480018932.01.T01 AT5G45210 27.378 431 270 11 78 470 73 498 2.44e-31 130
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MsG0480018932.01.T01 AT4G19510 40.141 142 83 2 480 621 57 196 2.60e-19 93.2
MsG0480018932.01.T01 AT5G17880 27.696 473 260 17 16 411 6 473 9.80e-31 129
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MsG0480018932.01.T01 AT5G17880 41.667 132 73 3 482 613 19 146 3.09e-22 102
MsG0480018932.01.T01 AT5G40090 26.471 408 218 11 25 377 16 396 3.35e-30 124
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MsG0480018932.01.T01 AT3G25510 30.769 299 176 5 202 473 21 315 4.50e-30 127
MsG0480018932.01.T01 AT5G41740 31.615 291 151 10 202 457 47 324 6.17e-30 126
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MsG0480018932.01.T01 AT4G36150 37.857 140 83 3 477 616 16 151 2.67e-17 87.0
MsG0480018932.01.T01 AT1G63730 25.437 515 301 14 19 469 5 500 5.65e-29 123
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MsG0480018932.01.T01 AT1G63740 44.954 109 58 1 513 621 3 109 2.07e-18 90.5
MsG0480018932.01.T01 AT1G65850 30.640 297 170 7 202 467 120 411 1.18e-28 122
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MsG0480018932.01.T01 AT3G04210 28.146 437 222 18 25 390 64 479 1.20e-28 120
MsG0480018932.01.T01 AT3G04210 38.889 144 85 2 478 621 64 204 3.28e-23 104
MsG0480018932.01.T01 AT5G17890 31.457 302 169 9 193 465 182 474 2.49e-28 122
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MsG0480018932.01.T01 AT1G72890 26.111 360 197 12 25 326 37 385 1.24e-18 89.4
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MsG0480018932.01.T01 AT1G72890 32.667 150 75 4 202 326 263 411 1.78e-11 67.4
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MsG0480018932.01.T01 AT2G17060 34.615 156 95 4 466 621 7 155 6.70e-18 89.0
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MsG0480018932.01.T01 AT1G72900 25.872 344 205 12 27 326 10 347 3.87e-17 84.0
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MsG0480018932.01.T01 AT1G72930 39.437 142 84 1 480 621 9 148 2.06e-26 106
MsG0480018932.01.T01 AT1G72940 40.845 142 83 1 480 621 9 149 2.95e-26 111
MsG0480018932.01.T01 AT1G72940 27.874 348 204 12 20 326 2 343 6.44e-20 92.4
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MsG0480018932.01.T01 AT4G16990 43.662 142 77 2 480 621 9 147 7.08e-25 110
MsG0480018932.01.T01 AT4G16990 26.471 408 227 12 27 377 76 467 1.06e-25 113
MsG0480018932.01.T01 AT4G16990 43.662 142 77 2 480 621 76 214 6.77e-25 110
MsG0480018932.01.T01 AT4G16990 26.471 408 227 12 27 377 9 400 1.07e-25 113
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MsG0480018932.01.T01 AT4G16990 26.471 408 227 12 27 377 9 400 1.07e-25 113
MsG0480018932.01.T01 AT4G16990 43.662 142 77 2 480 621 9 147 9.45e-25 110
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MsG0480018932.01.T01 AT4G16990 26.471 408 227 12 27 377 9 400 1.09e-25 113
MsG0480018932.01.T01 AT4G16990 43.662 142 77 2 480 621 9 147 9.79e-25 110
MsG0480018932.01.T01 AT4G16990 26.471 408 227 12 27 377 9 400 1.21e-25 113
MsG0480018932.01.T01 AT4G16990 43.662 142 77 2 480 621 9 147 9.98e-25 110
MsG0480018932.01.T01 AT4G16990 26.471 408 227 12 27 377 9 400 1.21e-25 113
MsG0480018932.01.T01 AT4G16990 43.662 142 77 2 480 621 9 147 9.98e-25 110
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MsG0480018932.01.T01 AT2G17050 29.568 301 185 8 203 485 49 340 2.00e-25 112
MsG0480018932.01.T01 AT4G16990 27.147 361 192 10 73 377 55 400 2.52e-25 112
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MsG0480018932.01.T01 AT5G44870 28.528 326 197 9 179 474 254 573 8.29e-25 110
MsG0480018932.01.T01 AT5G44870 43.363 113 62 2 477 589 9 119 4.11e-21 99.0
MsG0480018932.01.T01 AT1G57830 37.255 153 86 5 476 625 20 165 1.22e-24 101
MsG0480018932.01.T01 AT1G72910 40.141 142 83 1 480 621 9 148 1.42e-24 106
MsG0480018932.01.T01 AT1G72910 26.061 330 194 11 26 312 8 330 4.43e-17 84.0
MsG0480018932.01.T01 AT1G17610 26.161 409 216 12 25 376 12 391 1.53e-24 107
MsG0480018932.01.T01 AT1G17610 26.161 409 216 12 25 376 12 391 1.53e-24 107
MsG0480018932.01.T01 AT5G38340 28.763 299 175 8 202 467 48 341 1.87e-24 109
MsG0480018932.01.T01 AT5G38344 36.986 146 89 2 476 621 56 198 1.88e-24 102
MsG0480018932.01.T01 AT5G45230 25.794 535 302 20 17 467 1 524 3.17e-24 108
MsG0480018932.01.T01 AT5G45230 40.336 119 64 3 482 595 13 129 1.01e-17 88.2
MsG0480018932.01.T01 AT5G46490 38.816 152 87 3 470 621 2 147 3.91e-24 104
MsG0480018932.01.T01 AT5G46490 28.000 350 170 13 27 310 12 345 5.17e-22 98.6
MsG0480018932.01.T01 AT5G45200 29.492 295 175 5 208 474 1 290 7.38e-24 107
MsG0480018932.01.T01 AT4G09360 28.315 279 152 6 213 465 33 289 1.11e-23 107
MsG0480018932.01.T01 AT1G66090 38.732 142 84 2 480 621 26 164 1.52e-23 104
MsG0480018932.01.T01 AT1G66090 27.889 398 223 13 22 363 21 410 3.56e-23 103
MsG0480018932.01.T01 AT1G63860 24.194 496 287 13 26 469 13 471 6.77e-23 104
MsG0480018932.01.T01 AT1G63860 39.437 142 83 2 480 621 14 152 4.34e-22 102
MsG0480018932.01.T01 AT1G63860 24.194 496 287 13 26 469 13 471 9.02e-23 104
MsG0480018932.01.T01 AT1G63860 39.437 142 83 2 480 621 14 152 5.03e-22 101
MsG0480018932.01.T01 AT1G63860 24.194 496 287 13 26 469 13 471 9.29e-23 104
MsG0480018932.01.T01 AT1G63860 39.437 142 83 2 480 621 14 152 4.87e-22 102
MsG0480018932.01.T01 AT1G09665 37.821 156 88 4 466 621 1 147 1.05e-22 95.9
MsG0480018932.01.T01 AT1G63860 24.194 496 287 13 26 469 13 471 1.30e-22 103
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MsG0480018932.01.T01 AT1G63860 24.194 496 287 13 26 469 13 471 1.30e-22 103
MsG0480018932.01.T01 AT1G63860 39.437 142 83 2 480 621 14 152 4.24e-22 102
MsG0480018932.01.T01 AT1G63860 24.194 496 287 13 26 469 13 471 1.30e-22 103
MsG0480018932.01.T01 AT1G63860 39.437 142 83 2 480 621 14 152 4.24e-22 102
MsG0480018932.01.T01 AT4G19530 26.346 520 294 21 25 465 13 522 3.27e-22 102
MsG0480018932.01.T01 AT4G19530 34.694 147 90 4 477 623 12 152 3.00e-19 93.2
MsG0480018932.01.T01 AT4G19530 26.346 520 294 21 25 465 13 522 4.10e-22 102
MsG0480018932.01.T01 AT4G19530 34.694 147 90 4 477 623 12 152 3.24e-19 93.2
MsG0480018932.01.T01 AT4G09420 25.231 432 230 13 26 377 11 429 4.96e-22 100
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MsG0480018932.01.T01 AT2G16870 28.638 213 147 4 258 469 17 225 5.62e-22 101
MsG0480018932.01.T01 AT5G44900 38.060 134 81 2 477 610 15 146 6.79e-22 95.9
MsG0480018932.01.T01 AT1G60320 38.961 154 89 4 476 626 18 169 8.76e-22 93.2
MsG0480018932.01.T01 AT1G57850 39.394 132 76 3 482 613 14 141 2.90e-21 91.3
MsG0480018932.01.T01 AT1G72850 27.518 407 213 13 26 377 6 385 4.80e-21 96.7
MsG0480018932.01.T01 AT2G03300 40.909 132 74 3 482 613 9 136 5.55e-21 92.0
MsG0480018932.01.T01 AT1G57630 38.194 144 83 3 480 621 22 161 6.02e-21 90.9
MsG0480018932.01.T01 AT4G04110 39.716 141 81 3 482 621 45 182 6.29e-21 92.8
MsG0480018932.01.T01 AT1G57850 38.806 134 78 3 480 613 12 141 7.25e-21 91.3
MsG0480018932.01.T01 AT5G45220 36.601 153 89 3 476 628 327 471 2.10e-20 95.5
MsG0480018932.01.T01 AT5G45220 30.573 157 90 5 470 621 6 148 1.01e-12 71.2
MsG0480018932.01.T01 AT5G45220 36.601 153 89 3 476 628 327 471 2.32e-20 95.5
MsG0480018932.01.T01 AT5G45220 30.573 157 90 5 470 621 6 148 8.37e-13 71.6
MsG0480018932.01.T01 AT3G25505 31.373 204 136 3 263 466 118 317 2.89e-20 95.5
MsG0480018932.01.T01 AT5G45070 34.868 152 97 1 470 621 4 153 3.02e-20 93.2
MsG0480018932.01.T01 AT5G45070 33.544 158 88 8 22 173 9 155 1.04e-11 67.4
MsG0480018932.01.T01 AT1G65390 36.429 140 87 2 477 616 19 156 3.86e-20 90.9
MsG0480018932.01.T01 AT5G45080 38.095 147 89 2 477 623 12 156 8.77e-20 92.4
MsG0480018932.01.T01 AT1G47370 43.333 120 63 3 473 592 10 124 1.07e-19 91.7
MsG0480018932.01.T01 AT5G45000 36.184 152 92 3 477 625 12 161 1.18e-19 92.4
MsG0480018932.01.T01 AT5G45000 31.429 140 92 2 474 613 212 347 4.96e-13 72.0
MsG0480018932.01.T01 AT1G65390 36.429 140 87 2 477 616 19 156 1.24e-19 90.1
MsG0480018932.01.T01 AT5G48780 37.143 140 85 1 482 621 14 150 3.75e-19 92.0
MsG0480018932.01.T01 AT5G48780 24.468 188 109 3 178 332 430 617 5.20e-13 72.8
MsG0480018932.01.T01 AT5G48780 37.143 140 85 1 482 621 14 150 3.79e-19 92.0
MsG0480018932.01.T01 AT5G48780 25.320 391 231 12 25 381 10 373 2.24e-16 83.2
MsG0480018932.01.T01 AT5G48780 24.468 188 109 3 178 332 400 587 5.12e-13 72.4
MsG0480018932.01.T01 AT1G65390 36.429 140 87 2 477 616 19 156 5.60e-19 90.1
MsG0480018932.01.T01 AT2G32140 38.261 115 69 2 482 596 23 135 3.55e-18 87.0
MsG0480018932.01.T01 AT2G20142 39.316 117 68 3 477 592 5 119 9.37e-18 85.1
MsG0480018932.01.T01 AT4G19925 37.705 122 71 2 482 598 14 135 2.35e-17 82.8
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MsG0480018932.01.T01 AT4G16990 28.700 223 125 4 183 377 26 242 2.29e-16 82.8
MsG0480018932.01.T01 AT4G16990 28.571 224 126 4 182 377 25 242 3.10e-16 82.8
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MsG0480018932.01.T01 AT4G16990 28.571 224 126 4 182 377 25 242 3.32e-16 82.8
MsG0480018932.01.T01 AT4G16990 28.571 224 126 4 182 377 25 242 3.32e-16 82.8
MsG0480018932.01.T01 AT4G16990 28.571 224 126 4 182 377 25 242 3.32e-16 82.8
MsG0480018932.01.T01 AT4G16990 28.571 224 126 4 182 377 25 242 3.32e-16 82.8
MsG0480018932.01.T01 AT5G44920 31.973 147 89 3 476 613 7 151 7.49e-16 78.2
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MsG0480018932.01.T01 AT4G23515 33.742 163 89 6 473 624 7 161 5.00e-15 76.3
MsG0480018932.01.T01 AT5G44920 35.652 115 72 2 476 590 7 119 1.63e-14 74.3
MsG0480018932.01.T01 AT1G51270 34.328 134 86 2 480 613 118 249 1.88e-14 76.3
MsG0480018932.01.T01 AT1G51270 33.577 137 89 2 480 616 187 321 2.27e-14 75.5
MsG0480018932.01.T01 AT1G51270 33.577 137 89 2 480 616 187 321 2.27e-14 75.5
MsG0480018932.01.T01 AT1G51270 33.577 137 89 2 480 616 187 321 2.27e-14 75.5
MsG0480018932.01.T01 AT1G51270 33.577 137 89 2 480 616 187 321 2.27e-14 75.5
MsG0480018932.01.T01 AT1G51270 34.328 134 86 2 480 613 188 319 2.46e-14 75.5
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MsG0480018932.01.T01 AT5G44910 34.074 135 87 1 482 616 13 145 2.64e-14 73.6
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MsG0480018932.01.T01 AT1G51270 34.328 134 86 2 480 613 310 441 4.05e-14 75.9
MsG0480018932.01.T01 AT1G51270 34.328 134 86 2 480 613 310 441 4.05e-14 75.9
MsG0480018932.01.T01 AT1G51270 34.328 134 86 2 480 613 310 441 4.05e-14 75.9
MsG0480018932.01.T01 AT1G51270 34.328 134 86 2 480 613 358 489 4.45e-14 75.9
MsG0480018932.01.T01 AT1G51270 34.328 134 86 2 480 613 358 489 4.91e-14 75.9
MsG0480018932.01.T01 AT1G51270 33.577 137 89 2 480 616 358 492 5.54e-14 75.5
MsG0480018932.01.T01 AT1G51270 33.577 137 89 2 480 616 358 492 5.54e-14 75.5
MsG0480018932.01.T01 AT4G33300 25.784 287 164 9 202 453 202 474 1.41e-13 74.7
MsG0480018932.01.T01 AT4G33300 25.784 287 164 9 202 453 202 474 1.41e-13 74.7
MsG0480018932.01.T01 AT5G45240 24.407 295 156 9 82 326 44 321 2.24e-13 73.9
MsG0480018932.01.T01 AT5G45240 24.407 295 156 9 82 326 44 321 2.51e-13 73.9
MsG0480018932.01.T01 AT1G57850 38.298 94 56 2 510 603 29 120 6.89e-13 67.0
MsG0480018932.01.T01 AT4G23510 32.335 167 88 8 473 621 3 162 9.79e-13 71.6
MsG0480018932.01.T01 AT4G23510 32.335 167 88 8 473 621 3 162 1.04e-12 71.6
MsG0480018932.01.T01 AT4G11340 38.739 111 61 3 477 584 221 327 1.04e-12 71.2
MsG0480018932.01.T01 AT4G23510 32.335 167 88 8 473 621 3 162 1.14e-12 71.6
MsG0480018932.01.T01 AT4G19910 31.579 133 88 3 482 613 9 139 5.27e-12 66.6
MsG0480018932.01.T01 AT1G52900 33.645 107 66 3 476 581 33 135 1.75e-11 64.3
MsG0480018932.01.T01 AT1G33560 24.128 344 211 10 143 456 127 450 5.78e-11 66.2

Find 110 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 156 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
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TAACTACCCCAATGTCTTTA+AGG 0.162472 4:+11919527 None:intergenic
AAGACCAATTTGATCGTAAA+TGG 0.205200 4:+11919570 None:intergenic
TTGATGACTTTGTGATAAAA+TGG 0.223887 4:+11919483 None:intergenic
ACATTGTACCTTCTCTTCTT+TGG 0.224151 4:+11920392 None:intergenic
TGTCTTCAAGGTTACTTATC+TGG 0.226452 4:+11918927 None:intergenic
ATATTTGCTGTACATCATTT+AGG 0.234869 4:+11918978 None:intergenic
ACTTGACAATGTTGATAAAT+TGG 0.241324 4:-11919440 MsG0480018932.01.T01:CDS
AACTTAAAATTACCTGTATA+CGG 0.241506 4:+11919920 None:intergenic
ACTAAAGCTAACAAATATTT+AGG 0.253883 4:-11919966 MsG0480018932.01.T01:CDS
CTTTGGATCAGTAGTAAATA+TGG 0.255292 4:+11920409 None:intergenic
GATATAGCATGTTTCTTTGT+TGG 0.255821 4:-11919007 MsG0480018932.01.T01:CDS
GTCCTCTCATAATAGGGATA+TGG 0.263879 4:-11919630 MsG0480018932.01.T01:CDS
ATGAATCCACAAAGAGTAAT+TGG 0.282788 4:-11918093 MsG0480018932.01.T01:CDS
CGCCATCAGGAAGGTCAGTT+TGG 0.302165 4:-11918154 MsG0480018932.01.T01:CDS
CCTCTTGCTCTTAAAGAACT+TGG 0.306527 4:-11919175 MsG0480018932.01.T01:CDS
GACAGATAGTTGCTTATTCT+AGG 0.308176 4:-11919204 MsG0480018932.01.T01:CDS
AAAAGAGAACTCTTTGATAT+TGG 0.311607 4:-11918070 MsG0480018932.01.T01:CDS
TGTGCCCACGAAGTCGTAAA+TGG 0.314228 4:-11919402 MsG0480018932.01.T01:CDS
TTGGAGAAGATAATGGAAAT+TGG 0.320682 4:-11918235 MsG0480018932.01.T01:CDS
ATTCTTTCACTCTATATATA+TGG 0.325856 4:+11919314 None:intergenic
CAAGCCATTTACGATCAAAT+TGG 0.328319 4:-11919574 MsG0480018932.01.T01:CDS
AAAGACATTGGGGTAGTTAT+GGG 0.332411 4:-11919523 MsG0480018932.01.T01:CDS
TAATGGAAATTGGCAGAAAC+AGG 0.338573 4:-11918225 MsG0480018932.01.T01:CDS
TTAGAAAGCTCTTGTCTTCA+AGG 0.344399 4:+11918915 None:intergenic
AAACATATCTCCATGATAGA+AGG 0.351006 4:+11920082 None:intergenic
TAAAGACATTGGGGTAGTTA+TGG 0.366211 4:-11919524 MsG0480018932.01.T01:CDS
CACAAAGTCATCAACATCAT+AGG 0.374243 4:-11919474 MsG0480018932.01.T01:CDS
TCCTCTCATAATAGGGATAT+GGG 0.377969 4:-11919629 MsG0480018932.01.T01:CDS
TTCTATCATGGAGATATGTT+TGG 0.384641 4:-11920080 MsG0480018932.01.T01:CDS
AAGTTCGTGTATACAAGAAT+TGG 0.390780 4:-11920174 MsG0480018932.01.T01:CDS
AGAGCTTCCTTAAAGACATT+GGG 0.397536 4:-11919534 MsG0480018932.01.T01:CDS
ATGTACAGCAAATATTAAAT+AGG 0.397573 4:-11918970 MsG0480018932.01.T01:CDS
AAGAACACATCATACATCTT+TGG 0.397786 4:+11918469 None:intergenic
GAGTTTCTGCGCTCACGATA+AGG 0.406629 4:-11920363 MsG0480018932.01.T01:CDS
GCTAGAGTTGGAGAAGATAA+TGG 0.411550 4:-11918242 MsG0480018932.01.T01:CDS
AAGCTTGTTATTCTCGTCAA+TGG 0.413008 4:+11918892 None:intergenic
TAAATATGGATTCAAATTCC+TGG 0.419180 4:+11920423 None:intergenic
TATATATAGAGTGAAAGAAT+TGG 0.426223 4:-11919311 MsG0480018932.01.T01:CDS
CAATTTGATCGTAAATGGCT+TGG 0.427485 4:+11919575 None:intergenic
GAGGTTTCAACATGTAGAAC+AGG 0.430271 4:-11920270 MsG0480018932.01.T01:CDS
AGTTTCTGCGCTCACGATAA+GGG 0.430942 4:-11920362 MsG0480018932.01.T01:CDS
CTCTTGCTCTTAAAGAACTT+GGG 0.431284 4:-11919174 MsG0480018932.01.T01:CDS
TGTACACCCAGTGTCAAATC+TGG 0.441158 4:-11919691 MsG0480018932.01.T01:intron
TTTGATATTGGTGGAATAGC+AGG 0.444457 4:-11918058 MsG0480018932.01.T01:CDS
AGAGAACTCTTTGATATTGG+TGG 0.445363 4:-11918067 MsG0480018932.01.T01:CDS
GTGTTGCCGAACCTCAGATT+TGG 0.449410 4:-11920138 MsG0480018932.01.T01:CDS
GGAGCTACCTCATAAAATAC+TGG 0.455442 4:+11918187 None:intergenic
TCCATCAGAAGTACGCCATC+AGG 0.461275 4:-11918167 MsG0480018932.01.T01:CDS
GCCATCAGGAAGGTCAGTTT+GGG 0.461668 4:-11918153 MsG0480018932.01.T01:CDS
ACAGATAGTTGCTTATTCTA+GGG 0.463609 4:-11919203 MsG0480018932.01.T01:CDS
ATCAAGTAATAACACTGATC+AGG 0.470422 4:-11918819 MsG0480018932.01.T01:intron
CGAAGTCGTAAATGGTTTGA+AGG 0.475861 4:-11919394 MsG0480018932.01.T01:CDS
AGGGTGTCCTCATAGATTCC+AGG 0.478410 4:-11918038 MsG0480018932.01.T01:CDS
GCTTCTTGTAGTCGTGGAGC+TGG 0.479776 4:+11919082 None:intergenic
TCCTGATGGCGTACTTCTGA+TGG 0.481227 4:+11918166 None:intergenic
TTTAGTGATCGCTGCTACCC+AGG 0.482996 4:+11919983 None:intergenic
AATTTGATCGTAAATGGCTT+GGG 0.483861 4:+11919576 None:intergenic
TATTCCTCTCTTCAAAATGC+GGG 0.485409 4:-11918400 MsG0480018932.01.T01:CDS
TCATACTCAAACCCGTATAC+AGG 0.488256 4:-11919932 MsG0480018932.01.T01:intron
ACTTAAAATTACCTGTATAC+GGG 0.492112 4:+11919921 None:intergenic
TGATGACTTTGTGATAAAAT+GGG 0.492300 4:+11919484 None:intergenic
GAACAACCAAATCTGAGGTT+CGG 0.498412 4:+11920132 None:intergenic
TCAAACCATTTACGACTTCG+TGG 0.506533 4:+11919397 None:intergenic
CAAAGAAACATGCTATATCA+AGG 0.507356 4:+11919011 None:intergenic
TTGTAGTCGTGGAGCTGGAA+TGG 0.507613 4:+11919087 None:intergenic
GATGTCGCTCCCTTCTATCA+TGG 0.508844 4:-11920092 MsG0480018932.01.T01:CDS
AAGAGCTTCCTTAAAGACAT+TGG 0.508881 4:-11919535 MsG0480018932.01.T01:CDS
TATCATGGAGATATGTTTGG+AGG 0.509812 4:-11920077 MsG0480018932.01.T01:CDS
TAAATAACCTGGAATCTATG+AGG 0.521556 4:+11918031 None:intergenic
AATTGGCAGAAACAGGGGTC+TGG 0.524914 4:-11918218 MsG0480018932.01.T01:CDS
ATCGTAAATGGCTTGGGCAA+TGG 0.525393 4:+11919582 None:intergenic
ACAAAGTCATCAACATCATA+GGG 0.538989 4:-11919473 MsG0480018932.01.T01:CDS
CCAAGTTCTTTAAGAGCAAG+AGG 0.542159 4:+11919175 None:intergenic
TCTAGAGCTTCTTGTAGTCG+TGG 0.543969 4:+11919076 None:intergenic
CAAACCATTTACGACTTCGT+GGG 0.545251 4:+11919398 None:intergenic
GGAGGAAGTGAAGGAAGACA+TGG 0.545523 4:+11920457 None:intergenic
CAGATAGTTGCTTATTCTAG+GGG 0.548324 4:-11919202 MsG0480018932.01.T01:CDS
AAGATGGTGTATGCTAGAGT+TGG 0.551069 4:-11918254 MsG0480018932.01.T01:CDS
TCATGTTCTGCTACAAGCCA+TGG 0.552973 4:-11918864 MsG0480018932.01.T01:CDS
CTTCTTGTGGAGTTGTTGCG+TGG 0.557622 4:+11919245 None:intergenic
ATGGAGAGGAAGCACTTAAG+TGG 0.557668 4:-11919141 MsG0480018932.01.T01:CDS
ATTGACGAGAATAACAAGCT+TGG 0.560131 4:-11918890 MsG0480018932.01.T01:CDS
GAGGCTCTTAGTTTAGAAGC+TGG 0.562486 4:-11920317 MsG0480018932.01.T01:CDS
CAAATTATGCTAATTCAAGA+TGG 0.565652 4:-11918270 MsG0480018932.01.T01:CDS
AACATATCTCCATGATAGAA+GGG 0.567338 4:+11920083 None:intergenic
TTTAATGATATCTCTCGCCA+TGG 0.567890 4:+11918847 None:intergenic
TTGATATTGGTGGAATAGCA+GGG 0.568157 4:-11918057 MsG0480018932.01.T01:CDS
TTTCAGAGGAGAAGACAATC+GGG 0.574501 4:-11918443 MsG0480018932.01.T01:CDS
TCCCAAACTGACCTTCCTGA+TGG 0.575780 4:+11918152 None:intergenic
CTACTGATCCAAAGAAGAGA+AGG 0.578333 4:-11920400 MsG0480018932.01.T01:CDS
CTCTCATAATAGGGATATGG+GGG 0.584096 4:-11919627 MsG0480018932.01.T01:CDS
TTCCTCCTCCAAAATCCACC+AGG 0.589216 4:-11920441 MsG0480018932.01.T01:CDS
CCCCATATCCCTATTATGAG+AGG 0.589661 4:+11919628 None:intergenic
CTATTCCTCTCTTCAAAATG+CGG 0.592789 4:-11918401 MsG0480018932.01.T01:CDS
AGTTCACTAAAATCTTCTTG+TGG 0.598434 4:+11919232 None:intergenic
AGACATCTACTCAAGAAGCA+TGG 0.613863 4:-11919343 MsG0480018932.01.T01:CDS
AATGGAAATTGGCAGAAACA+GGG 0.615256 4:-11918224 MsG0480018932.01.T01:CDS
CCTCTCATAATAGGGATATG+GGG 0.627523 4:-11919628 MsG0480018932.01.T01:CDS
ATATGGATTCAAATTCCTGG+TGG 0.628965 4:+11920426 None:intergenic
ATTCCTCTCTTCAAAATGCG+GGG 0.632010 4:-11918399 MsG0480018932.01.T01:CDS
AGAAGACAAGCTCATGACCT+GGG 0.633721 4:-11920000 MsG0480018932.01.T01:CDS
AAGAAGACAAGCTCATGACC+TGG 0.638129 4:-11920001 MsG0480018932.01.T01:CDS
TCTGGATAGAATATCAATGG+AGG 0.644188 4:-11920036 MsG0480018932.01.T01:CDS
GAGCTTCCTTAAAGACATTG+GGG 0.648862 4:-11919533 MsG0480018932.01.T01:CDS
ATGGAAATTGGCAGAAACAG+GGG 0.651761 4:-11918223 MsG0480018932.01.T01:CDS
TCAGAAGTACGCCATCAGGA+AGG 0.666277 4:-11918163 MsG0480018932.01.T01:CDS
AGGCAGAACAACCAAATCTG+AGG 0.671877 4:+11920127 None:intergenic
GCGACATCTTGATAGAACAC+AGG 0.696004 4:+11920107 None:intergenic
GACGATGACGAGATTCAACG+AGG 0.761041 4:-11918361 MsG0480018932.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ACAAAAATAAATAAATAACC+TGG + Chr4:11920441-11920460 None:intergenic 15.0%
!!! ATTCCAATGTTTTTTTTTTT+TGG - Chr4:11919736-11919755 MsG0480018932.01.T01:intron 15.0%
!!! TCACTTAAAGTTTTTAATTT+AGG - Chr4:11919181-11919200 MsG0480018932.01.T01:CDS 15.0%
!! AAAATCTTAGCTTAGATATA+TGG + Chr4:11919955-11919974 None:intergenic 20.0%
!! AACTTAAAATTACCTGTATA+CGG + Chr4:11918541-11918560 None:intergenic 20.0%
!! ACTAAAGCTAACAAATATTT+AGG - Chr4:11918492-11918511 MsG0480018932.01.T01:intron 20.0%
!! ATGTACAGCAAATATTAAAT+AGG - Chr4:11919488-11919507 MsG0480018932.01.T01:CDS 20.0%
!! ATTCTTTCACTCTATATATA+TGG + Chr4:11919147-11919166 None:intergenic 20.0%
!! GAACCAAAAAAAAAAAACAT+TGG + Chr4:11919742-11919761 None:intergenic 20.0%
!! TATATATAGAGTGAAAGAAT+TGG - Chr4:11919147-11919166 MsG0480018932.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATCAATTACGGATTATATTA+AGG - Chr4:11918685-11918704 MsG0480018932.01.T01:intron 20.0%
!!! CTTTTGTTCATATATTATAC+AGG - Chr4:11918651-11918670 MsG0480018932.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTAATTTACACCTATCTTT+TGG - Chr4:11918589-11918608 MsG0480018932.01.T01:intron 20.0%
! AAAAGAGAACTCTTTGATAT+TGG - Chr4:11920388-11920407 MsG0480018932.01.T01:CDS 25.0%
! ACTAATACATCATCAACTAT+GGG + Chr4:11919912-11919931 None:intergenic 25.0%
! ACTTAAAATTACCTGTATAC+GGG + Chr4:11918540-11918559 None:intergenic 25.0%
! CAAAATCATTACAAGAACTT+TGG - Chr4:11919828-11919847 MsG0480018932.01.T01:intron 25.0%
! CAAATTATGCTAATTCAAGA+TGG - Chr4:11920188-11920207 MsG0480018932.01.T01:CDS 25.0%
! GTAATAACAAAACGAATTGT+TGG - Chr4:11919880-11919899 MsG0480018932.01.T01:intron 25.0%
! TAAATATGGATTCAAATTCC+TGG + Chr4:11918038-11918057 None:intergenic 25.0%
! TGATGACTTTGTGATAAAAT+GGG + Chr4:11918977-11918996 None:intergenic 25.0%
!! ACTTGACAATGTTGATAAAT+TGG - Chr4:11919018-11919037 MsG0480018932.01.T01:CDS 25.0%
!! TTGATGACTTTGTGATAAAA+TGG + Chr4:11918978-11918997 None:intergenic 25.0%
!! TTTTCTGGATAGAATATCAA+TGG - Chr4:11918419-11918438 MsG0480018932.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATATTTGCTGTACATCATTT+AGG + Chr4:11919483-11919502 None:intergenic 25.0%
AAACATATCTCCATGATAGA+AGG + Chr4:11918379-11918398 None:intergenic 30.0%
AACATATCTCCATGATAGAA+GGG + Chr4:11918378-11918397 None:intergenic 30.0%
AAGAACACATCATACATCTT+TGG + Chr4:11919992-11920011 None:intergenic 30.0%
AAGACCAATTTGATCGTAAA+TGG + Chr4:11918891-11918910 None:intergenic 30.0%
AAGTTCGTGTATACAAGAAT+TGG - Chr4:11918284-11918303 MsG0480018932.01.T01:CDS 30.0%
AATTTGATCGTAAATGGCTT+GGG + Chr4:11918885-11918904 None:intergenic 30.0%
ACAAAGTCATCAACATCATA+GGG - Chr4:11918985-11919004 MsG0480018932.01.T01:CDS 30.0%
ACAGATAGTTGCTTATTCTA+GGG - Chr4:11919255-11919274 MsG0480018932.01.T01:CDS 30.0%
AGTTCACTAAAATCTTCTTG+TGG + Chr4:11919229-11919248 None:intergenic 30.0%
ATAACAAAACGAATTGTTGG+TGG - Chr4:11919883-11919902 MsG0480018932.01.T01:intron 30.0%
ATCAAGTAATAACACTGATC+AGG - Chr4:11919639-11919658 MsG0480018932.01.T01:CDS 30.0%
ATGAATCCACAAAGAGTAAT+TGG - Chr4:11920365-11920384 MsG0480018932.01.T01:CDS 30.0%
CAAAAAGTCCTCTCATAATA+GGG - Chr4:11918822-11918841 MsG0480018932.01.T01:CDS 30.0%
CAAAGAAACATGCTATATCA+AGG + Chr4:11919450-11919469 None:intergenic 30.0%
CACTAATACATCATCAACTA+TGG + Chr4:11919913-11919932 None:intergenic 30.0%
CTTTGGATCAGTAGTAAATA+TGG + Chr4:11918052-11918071 None:intergenic 30.0%
GATATAGCATGTTTCTTTGT+TGG - Chr4:11919451-11919470 MsG0480018932.01.T01:CDS 30.0%
GTACGAACATGTATCAATTA+CGG - Chr4:11918673-11918692 MsG0480018932.01.T01:intron 30.0%
TAAATAACCTGGAATCTATG+AGG + Chr4:11920430-11920449 None:intergenic 30.0%
TCAAAAAGTCCTCTCATAAT+AGG - Chr4:11918821-11918840 MsG0480018932.01.T01:CDS 30.0%
TCCAAACTATGTAACAGAAA+AGG - Chr4:11919760-11919779 MsG0480018932.01.T01:intron 30.0%
TTCTATCATGGAGATATGTT+TGG - Chr4:11918378-11918397 MsG0480018932.01.T01:CDS 30.0%
! AGACACTTTTCATGATTTTC+TGG - Chr4:11918404-11918423 MsG0480018932.01.T01:CDS 30.0%
! TCCTTTTCTGTTACATAGTT+TGG + Chr4:11919764-11919783 None:intergenic 30.0%
! TCTTTTCCAATTACTCTTTG+TGG + Chr4:11920374-11920393 None:intergenic 30.0%
!! CATAGTTGATGATGTATTAG+TGG - Chr4:11919911-11919930 MsG0480018932.01.T01:intron 30.0%
!! TTGGAGAAGATAATGGAAAT+TGG - Chr4:11920223-11920242 MsG0480018932.01.T01:CDS 30.0%
AAAGACATTGGGGTAGTTAT+GGG - Chr4:11918935-11918954 MsG0480018932.01.T01:CDS 35.0%
AAGAGCTTCCTTAAAGACAT+TGG - Chr4:11918923-11918942 MsG0480018932.01.T01:CDS 35.0%
AATGGAAATTGGCAGAAACA+GGG - Chr4:11920234-11920253 MsG0480018932.01.T01:CDS 35.0%
ACATTGTACCTTCTCTTCTT+TGG + Chr4:11918069-11918088 None:intergenic 35.0%
AGAGAACTCTTTGATATTGG+TGG - Chr4:11920391-11920410 MsG0480018932.01.T01:CDS 35.0%
AGAGCTTCCTTAAAGACATT+GGG - Chr4:11918924-11918943 MsG0480018932.01.T01:CDS 35.0%
ATATGGATTCAAATTCCTGG+TGG + Chr4:11918035-11918054 None:intergenic 35.0%
ATTGACGAGAATAACAAGCT+TGG - Chr4:11919568-11919587 MsG0480018932.01.T01:CDS 35.0%
CAAGCCATTTACGATCAAAT+TGG - Chr4:11918884-11918903 MsG0480018932.01.T01:CDS 35.0%
CAATTTGATCGTAAATGGCT+TGG + Chr4:11918886-11918905 None:intergenic 35.0%
CACAAAGTCATCAACATCAT+AGG - Chr4:11918984-11919003 MsG0480018932.01.T01:CDS 35.0%
CAGATAGTTGCTTATTCTAG+GGG - Chr4:11919256-11919275 MsG0480018932.01.T01:CDS 35.0%
CTATTCCTCTCTTCAAAATG+CGG - Chr4:11920057-11920076 MsG0480018932.01.T01:CDS 35.0%
CTCTTGCTCTTAAAGAACTT+GGG - Chr4:11919284-11919303 MsG0480018932.01.T01:CDS 35.0%
GACAGATAGTTGCTTATTCT+AGG - Chr4:11919254-11919273 MsG0480018932.01.T01:CDS 35.0%
TAAAGACATTGGGGTAGTTA+TGG - Chr4:11918934-11918953 MsG0480018932.01.T01:CDS 35.0%
TAACTACCCCAATGTCTTTA+AGG + Chr4:11918934-11918953 None:intergenic 35.0%
TAATGGAAATTGGCAGAAAC+AGG - Chr4:11920233-11920252 MsG0480018932.01.T01:CDS 35.0%
TAATTCTCCTACATGTGCAT+AGG + Chr4:11918615-11918634 None:intergenic 35.0%
TATCATGGAGATATGTTTGG+AGG - Chr4:11918381-11918400 MsG0480018932.01.T01:CDS 35.0%
TATTCCTCTCTTCAAAATGC+GGG - Chr4:11920058-11920077 MsG0480018932.01.T01:CDS 35.0%
TCCTCTCATAATAGGGATAT+GGG - Chr4:11918829-11918848 MsG0480018932.01.T01:CDS 35.0%
TCTGGATAGAATATCAATGG+AGG - Chr4:11918422-11918441 MsG0480018932.01.T01:CDS 35.0%
TGTCTTCAAGGTTACTTATC+TGG + Chr4:11919534-11919553 None:intergenic 35.0%
TTAGAAAGCTCTTGTCTTCA+AGG + Chr4:11919546-11919565 None:intergenic 35.0%
TTGATATTGGTGGAATAGCA+GGG - Chr4:11920401-11920420 MsG0480018932.01.T01:CDS 35.0%
TTTAATGATATCTCTCGCCA+TGG + Chr4:11919614-11919633 None:intergenic 35.0%
TTTGATATTGGTGGAATAGC+AGG - Chr4:11920400-11920419 MsG0480018932.01.T01:CDS 35.0%
! GAACTTGGGTTCTTTTTGTA+TGG - Chr4:11919298-11919317 MsG0480018932.01.T01:CDS 35.0%
! GATGTGTTCTTGATTTTCAG+AGG - Chr4:11920001-11920020 MsG0480018932.01.T01:CDS 35.0%
! TTTTCAGAGGAGAAGACAAT+CGG - Chr4:11920014-11920033 MsG0480018932.01.T01:CDS 35.0%
!! AAGCTTGTTATTCTCGTCAA+TGG + Chr4:11919569-11919588 None:intergenic 35.0%
!!! AAGCTGGTATCGATGTTTTT+GGG - Chr4:11918157-11918176 MsG0480018932.01.T01:CDS 35.0%
!!! ATGTTTTTGGGGTCATTAAG+AGG - Chr4:11918169-11918188 MsG0480018932.01.T01:CDS 35.0%
!!! TTCAAATTCCTGGTGGATTT+TGG + Chr4:11918028-11918047 None:intergenic 35.0%
AAGATGGTGTATGCTAGAGT+TGG - Chr4:11920204-11920223 MsG0480018932.01.T01:CDS 40.0%
AATAACACTGATCAGGTGAG+TGG - Chr4:11919646-11919665 MsG0480018932.01.T01:CDS 40.0%
AGACATCTACTCAAGAAGCA+TGG - Chr4:11919115-11919134 MsG0480018932.01.T01:CDS 40.0%
ATGGAAATTGGCAGAAACAG+GGG - Chr4:11920235-11920254 MsG0480018932.01.T01:CDS 40.0%
ATGTGCATAGGCCAAAAGAT+AGG + Chr4:11918603-11918622 None:intergenic 40.0%
ATTCCTCTCTTCAAAATGCG+GGG - Chr4:11920059-11920078 MsG0480018932.01.T01:CDS 40.0%
CAAACCATTTACGACTTCGT+GGG + Chr4:11919063-11919082 None:intergenic 40.0%
CCTCTCATAATAGGGATATG+GGG - Chr4:11918830-11918849 MsG0480018932.01.T01:CDS 40.0%
CCTCTTGCTCTTAAAGAACT+TGG - Chr4:11919283-11919302 MsG0480018932.01.T01:CDS 40.0%
CGAAGTCGTAAATGGTTTGA+AGG - Chr4:11919064-11919083 MsG0480018932.01.T01:CDS 40.0%
CTACTGATCCAAAGAAGAGA+AGG - Chr4:11918058-11918077 MsG0480018932.01.T01:CDS 40.0%
CTCTCATAATAGGGATATGG+GGG - Chr4:11918831-11918850 MsG0480018932.01.T01:CDS 40.0%
GAGCTTCCTTAAAGACATTG+GGG - Chr4:11918925-11918944 MsG0480018932.01.T01:CDS 40.0%
GAGGTTTCAACATGTAGAAC+AGG - Chr4:11918188-11918207 MsG0480018932.01.T01:CDS 40.0%
GCTAGAGTTGGAGAAGATAA+TGG - Chr4:11920216-11920235 MsG0480018932.01.T01:CDS 40.0%
GGAGCTACCTCATAAAATAC+TGG + Chr4:11920274-11920293 None:intergenic 40.0%
GTCCTCTCATAATAGGGATA+TGG - Chr4:11918828-11918847 MsG0480018932.01.T01:CDS 40.0%
TCAAACCATTTACGACTTCG+TGG + Chr4:11919064-11919083 None:intergenic 40.0%
TCATACTCAAACCCGTATAC+AGG - Chr4:11918526-11918545 MsG0480018932.01.T01:intron 40.0%
TTTCAGAGGAGAAGACAATC+GGG - Chr4:11920015-11920034 MsG0480018932.01.T01:CDS 40.0%
! CCAAGTTCTTTAAGAGCAAG+AGG + Chr4:11919286-11919305 None:intergenic 40.0%
! CGTTGTGCCAGTATTTTATG+AGG - Chr4:11920264-11920283 MsG0480018932.01.T01:CDS 40.0%
! GAACAACCAAATCTGAGGTT+CGG + Chr4:11918329-11918348 None:intergenic 40.0%
! TGGGTTCTTTTTGTATGGAG+AGG - Chr4:11919303-11919322 MsG0480018932.01.T01:CDS 40.0%
! TGTGTGTGTGTGTGATTTTG+AGG - Chr4:11919696-11919715 MsG0480018932.01.T01:intron 40.0%
!! TTTTCTTTCGAGTCTCGAAG+AGG - Chr4:11918122-11918141 MsG0480018932.01.T01:CDS 40.0%
!!! AAATTCCTGGTGGATTTTGG+AGG + Chr4:11918025-11918044 None:intergenic 40.0%
!!! AGCTGGTATCGATGTTTTTG+GGG - Chr4:11918158-11918177 MsG0480018932.01.T01:CDS 40.0%
!!! GAAGCTGGTATCGATGTTTT+TGG - Chr4:11918156-11918175 MsG0480018932.01.T01:CDS 40.0%
AAGAAGACAAGCTCATGACC+TGG - Chr4:11918457-11918476 MsG0480018932.01.T01:CDS 45.0%
AGAAGACAAGCTCATGACCT+GGG - Chr4:11918458-11918477 MsG0480018932.01.T01:CDS 45.0%
AGATTTGACACTGGGTGTAC+AGG + Chr4:11918768-11918787 None:intergenic 45.0%
AGGCAGAACAACCAAATCTG+AGG + Chr4:11918334-11918353 None:intergenic 45.0%
AGTTTCTGCGCTCACGATAA+GGG - Chr4:11918096-11918115 MsG0480018932.01.T01:CDS 45.0%
CCCCATATCCCTATTATGAG+AGG + Chr4:11918833-11918852 None:intergenic 45.0%
GAGGCTCTTAGTTTAGAAGC+TGG - Chr4:11918141-11918160 MsG0480018932.01.T01:CDS 45.0%
GCGACATCTTGATAGAACAC+AGG + Chr4:11918354-11918373 None:intergenic 45.0%
TCATGTTCTGCTACAAGCCA+TGG - Chr4:11919594-11919613 MsG0480018932.01.T01:CDS 45.0%
TGCACACCAGATTTGACACT+GGG + Chr4:11918776-11918795 None:intergenic 45.0%
TGTACACCCAGTGTCAAATC+TGG - Chr4:11918767-11918786 MsG0480018932.01.T01:intron 45.0%
TTGCACACCAGATTTGACAC+TGG + Chr4:11918777-11918796 None:intergenic 45.0%
! ATCGTAAATGGCTTGGGCAA+TGG + Chr4:11918879-11918898 None:intergenic 45.0%
! CTTTTGGCCTATGCACATGT+AGG - Chr4:11918605-11918624 MsG0480018932.01.T01:intron 45.0%
! TCTAGAGCTTCTTGTAGTCG+TGG + Chr4:11919385-11919404 None:intergenic 45.0%
!! AATCCCCGCATTTTGAAGAG+AGG + Chr4:11920065-11920084 None:intergenic 45.0%
!! ATGGAGAGGAAGCACTTAAG+TGG - Chr4:11919317-11919336 MsG0480018932.01.T01:CDS 45.0%
!! GATTTTGGAGGAGGAAGTGA+AGG + Chr4:11918013-11918032 None:intergenic 45.0%
AATTGGCAGAAACAGGGGTC+TGG - Chr4:11920240-11920259 MsG0480018932.01.T01:CDS 50.0%
ATAGGGATATGGGGGATGAC+AGG - Chr4:11918839-11918858 MsG0480018932.01.T01:CDS 50.0%
ATATGGGGGATGACAGGGAT+TGG - Chr4:11918845-11918864 MsG0480018932.01.T01:CDS 50.0%
CTTCTTGTGGAGTTGTTGCG+TGG + Chr4:11919216-11919235 None:intergenic 50.0%
GACGATGACGAGATTCAACG+AGG - Chr4:11920097-11920116 MsG0480018932.01.T01:CDS 50.0%
GAGTTTCTGCGCTCACGATA+AGG - Chr4:11918095-11918114 MsG0480018932.01.T01:CDS 50.0%
GATGTCGCTCCCTTCTATCA+TGG - Chr4:11918366-11918385 MsG0480018932.01.T01:CDS 50.0%
GCCATCAGGAAGGTCAGTTT+GGG - Chr4:11920305-11920324 MsG0480018932.01.T01:CDS 50.0%
GTGTTGCCGAACCTCAGATT+TGG - Chr4:11918320-11918339 MsG0480018932.01.T01:CDS 50.0%
TAGGGATATGGGGGATGACA+GGG - Chr4:11918840-11918859 MsG0480018932.01.T01:CDS 50.0%
TCCCAAACTGACCTTCCTGA+TGG + Chr4:11920309-11920328 None:intergenic 50.0%
TGTGCCCACGAAGTCGTAAA+TGG - Chr4:11919056-11919075 MsG0480018932.01.T01:CDS 50.0%
TTCCTCCTCCAAAATCCACC+AGG - Chr4:11918017-11918036 MsG0480018932.01.T01:CDS 50.0%
TTGTAGTCGTGGAGCTGGAA+TGG + Chr4:11919374-11919393 None:intergenic 50.0%
TTTAGTGATCGCTGCTACCC+AGG + Chr4:11918478-11918497 None:intergenic 50.0%
! AGGGTGTCCTCATAGATTCC+AGG - Chr4:11920420-11920439 MsG0480018932.01.T01:CDS 50.0%
! TCAGAAGTACGCCATCAGGA+AGG - Chr4:11920295-11920314 MsG0480018932.01.T01:CDS 50.0%
! TCCATCAGAAGTACGCCATC+AGG - Chr4:11920291-11920310 MsG0480018932.01.T01:CDS 50.0%
! TCCTGATGGCGTACTTCTGA+TGG + Chr4:11920295-11920314 None:intergenic 50.0%
!!! TTCCTGGTGGATTTTGGAGG+AGG + Chr4:11918022-11918041 None:intergenic 50.0%
CGCCATCAGGAAGGTCAGTT+TGG - Chr4:11920304-11920323 MsG0480018932.01.T01:CDS 55.0%
GCTTCTTGTAGTCGTGGAGC+TGG + Chr4:11919379-11919398 None:intergenic 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr4 gene 11918003 11920477 11918003 ID=MsG0480018932.01;Name=MsG0480018932.01
Chr4 mRNA 11918003 11920477 11918003 ID=MsG0480018932.01.T01;Parent=MsG0480018932.01;Name=MsG0480018932.01.T01;_AED=0.50;_eAED=0.50;_QI=0|0|0|1|1|1|3|0|638
Chr4 exon 11919933 11920477 11919933 ID=MsG0480018932.01.T01:exon:7587;Parent=MsG0480018932.01.T01
Chr4 exon 11918820 11919702 11918820 ID=MsG0480018932.01.T01:exon:7586;Parent=MsG0480018932.01.T01
Chr4 exon 11918003 11918491 11918003 ID=MsG0480018932.01.T01:exon:7585;Parent=MsG0480018932.01.T01
Chr4 CDS 11919933 11920477 11919933 ID=MsG0480018932.01.T01:cds;Parent=MsG0480018932.01.T01
Chr4 CDS 11918820 11919702 11918820 ID=MsG0480018932.01.T01:cds;Parent=MsG0480018932.01.T01
Chr4 CDS 11918003 11918491 11918003 ID=MsG0480018932.01.T01:cds;Parent=MsG0480018932.01.T01
Gene Sequence

>MsG0480018932.01.T01

ATGTCTTCCTTCACTTCCTCCTCCAAAATCCACCAGGAATTTGAATCCATATTTACTACTGATCCAAAGAAGAGAAGGTACAATGTGTTCTTGAGTTTCTGCGCTCACGATAAGGGTTATTTTCTTTCGAGTCTCGAAGAGGCTCTTAGTTTAGAAGCTGGTATCGATGTTTTTGGGGTCATTAAGAGGTTTCAACATGTAGAACAGGCAGAGTCTGTGCTGAATGTAATTCAAGACTGCAAAGTCGCTATAGTCTTGTTTTCAAAAAATTATACTAATTCAAGTTCGTGTATACAAGAATTGGAGAAAATAACTCAGTGTTGCCGAACCTCAGATTTGGTTGTTCTGCCTGTGTTCTATCAAGATGTCGCTCCCTTCTATCATGGAGATATGTTTGGAGGAGACACTTTTCATGATTTTCTGGATAGAATATCAATGGAGGAAATCTCTAAAGAAGAAGACAAGCTCATGACCTGGGTAGCAGCGATCACTAAAGCTAACAAATATTTAGGATCACGTGATCTCATACTCAAACCCGTATACAGTGTCAAATCTGGTGTGCAAGACGTGATTCAACTATTGAAACAATCAAAAAGTCCTCTCATAATAGGGATATGGGGGATGACAGGGATTGGTAAATCAACCATTGCCCAAGCCATTTACGATCAAATTGGTCTTTATTTTGAACACAAGAGCTTCCTTAAAGACATTGGGGTAGTTATGGGAAAATTTAATGATCATCCCATTTTATCACAAAGTCATCAACATCATAGGGTACTTCTTGTACTTGACAATGTTGATAAATTGGAGCAGCTGAGTGCTTTGTGCCCACGAAGTCGTAAATGGTTTGAAGGTAGCAAAATAGTTATCTCAACAAGAGATAGACATCTACTCAAGAAGCATGGAATTGACCATATATATAGAGTGAAAGAATTGGATGAAAGTGAATCACTTAAAGTTTTTAATTTAGGTGCATTCAGCCACGCAACAACTCCACAAGAAGATTTTAGTGAACTTTCTAGACAGATAGTTGCTTATTCTAGGGGATTGCCTCTTGCTCTTAAAGAACTTGGGTTCTTTTTGTATGGAGAGGAAGCACTTAAGTGGAAGAATGTGTTGAAGAGTCTCAAAAGACTTTCCATTCCAGCTCCACGACTACAAGAAGCTCTAGAAAAGAGTTTTAGTGATTTGAGTGATGAAGAGAAACGAATATTCCTTGATATAGCATGTTTCTTTGTTGGCATGAACCTAAATGATGTACAGCAAATATTAAATAGGTCAACACAATCTGCAGCTCTCCAGATAAGTAACCTTGAAGACAAGAGCTTTCTAACCATTGACGAGAATAACAAGCTTGGAATTCATGTTCTGCTACAAGCCATGGCGAGAGATATCATTAAAAGAAAATCAAGTAATAACACTGATCAGCCAAAGATGTATGATGTGTTCTTGATTTTCAGAGGAGAAGACAATCGGGCAAAGTTCATGTCACATCTCTATTCCTCTCTTCAAAATGCGGGGATTTATGTTTTCAGAGACGATGACGAGATTCAACGAGGAGATCATATCTCAATCTCACTGTTGCGAGCAATTGAACAGTCTAGAACTTGTATCGTTGTTTTGTCTACAAATTATGCTAATTCAAGATGGTGTATGCTAGAGTTGGAGAAGATAATGGAAATTGGCAGAAACAGGGGTCTGGTCGTTGTGCCAGTATTTTATGAGGTAGCTCCATCAGAAGTACGCCATCAGGAAGGTCAGTTTGGGAAATCTTTTGATGATCTTATATCAACAAATTCAGTAGATGAATCCACAAAGAGTAATTGGAAAAGAGAACTCTTTGATATTGGTGGAATAGCAGGGTGTCCTCATAGATTCCAGGTTATTTATTTATTTTTGTCTTTTAGAGTATTTTGA
Protein sequence

>MsG0480018932.01.T01

MSSFTSSSKIHQEFESIFTTDPKKRRYNVFLSFCAHDKGYFLSSLEEALSLEAGIDVFGVIKRFQHVEQAESVLNVIQDCKVAIVLFSKNYTNSSSCIQELEKITQCCRTSDLVVLPVFYQDVAPFYHGDMFGGDTFHDFLDRISMEEISKEEDKLMTWVAAITKANKYLGSRDLILKPVYSVKSGVQDVIQLLKQSKSPLIIGIWGMTGIGKSTIAQAIYDQIGLYFEHKSFLKDIGVVMGKFNDHPILSQSHQHHRVLLVLDNVDKLEQLSALCPRSRKWFEGSKIVISTRDRHLLKKHGIDHIYRVKELDESESLKVFNLGAFSHATTPQEDFSELSRQIVAYSRGLPLALKELGFFLYGEEALKWKNVLKSLKRLSIPAPRLQEALEKSFSDLSDEEKRIFLDIACFFVGMNLNDVQQILNRSTQSAALQISNLEDKSFLTIDENNKLGIHVLLQAMARDIIKRKSSNNTDQPKMYDVFLIFRGEDNRAKFMSHLYSSLQNAGIYVFRDDDEIQRGDHISISLLRAIEQSRTCIVVLSTNYANSRWCMLELEKIMEIGRNRGLVVVPVFYEVAPSEVRHQEGQFGKSFDDLISTNSVDESTKSNWKRELFDIGGIAGCPHRFQVIYLFLSFRVF*