AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0480018955.01

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MsG0480018955.01.T01 AT5G11250 26.694 487 287 13 54 487 7 476 4.72e-36 149
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MsG0480018955.01.T01 AT2G16870 29.245 212 147 2 269 480 17 225 5.14e-23 106
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MsG0480018955.01.T01 AT4G12020 26.124 467 263 14 74 493 706 1137 3.95e-27 120
MsG0480018955.01.T01 AT4G12020 34.404 436 270 5 698 1124 910 1338 2.98e-62 234
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MsG0480018955.01.T01 AT4G12020 34.404 436 270 5 698 1124 910 1338 4.39e-62 233
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MsG0480018955.01.T01 AT4G12020 34.404 436 270 5 698 1124 843 1271 4.91e-62 233
MsG0480018955.01.T01 AT4G12020 26.124 467 263 14 74 493 639 1070 3.49e-27 120
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MsG0480018955.01.T01 AT5G40910 33.566 429 274 7 700 1124 92 513 1.33e-61 228
MsG0480018955.01.T01 AT5G40910 32.082 293 164 7 220 487 31 313 7.58e-32 135
MsG0480018955.01.T01 AT5G40910 33.566 429 274 7 700 1124 92 513 1.79e-61 228
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MsG0480018955.01.T01 AT5G41740 32.246 276 155 9 220 468 54 324 1.13e-26 118
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MsG0480018955.01.T01 AT3G04210 27.093 454 216 17 25 401 64 479 2.93e-25 112
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MsG0480018955.01.T01 AT3G51570 27.381 504 298 13 701 1142 306 803 1.25e-41 167
MsG0480018955.01.T01 AT3G51570 32.099 243 131 10 488 704 16 250 3.56e-24 110
MsG0480018955.01.T01 AT3G51570 30.169 295 172 8 221 488 240 527 1.85e-23 108
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MsG0480018955.01.T01 AT4G09430 35.377 212 122 3 481 682 2 208 1.94e-29 125
MsG0480018955.01.T01 AT1G72910 31.288 326 166 6 491 762 9 330 2.89e-39 151
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MsG0480018955.01.T01 AT2G17060 32.778 180 107 5 477 649 7 179 4.40e-18 90.9
MsG0480018955.01.T01 AT2G17060 28.633 461 281 14 720 1143 335 784 2.78e-38 156
MsG0480018955.01.T01 AT2G17060 24.281 556 308 17 22 485 5 539 5.97e-27 119
MsG0480018955.01.T01 AT2G17060 32.778 180 107 5 477 649 7 179 2.59e-18 91.7
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MsG0480018955.01.T01 AT5G45220 37.681 138 84 2 487 624 327 462 3.49e-20 96.3
MsG0480018955.01.T01 AT5G45220 30.573 157 90 5 481 632 6 148 9.22e-12 69.7
MsG0480018955.01.T01 AT5G45000 34.320 169 102 3 488 649 12 178 9.43e-20 94.0
MsG0480018955.01.T01 AT5G45000 31.609 174 106 4 485 649 212 381 4.32e-15 79.3
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MsG0480018955.01.T01 AT2G20142 30.964 197 124 5 488 679 5 194 9.84e-19 89.0
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MsG0480018955.01.T01 AT2G03030 34.659 176 109 4 493 668 9 178 2.25e-18 85.5
MsG0480018955.01.T01 AT4G19925 38.525 122 70 2 493 609 14 135 6.94e-18 85.1
MsG0480018955.01.T01 AT4G19920 34.028 144 92 2 493 635 52 193 1.12e-17 85.1
MsG0480018955.01.T01 AT1G57670 36.800 125 77 2 493 617 11 133 3.78e-17 85.5
MsG0480018955.01.T01 AT1G51270 32.530 166 103 3 491 649 187 350 7.09e-17 84.3
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MsG0480018955.01.T01 AT1G51270 32.530 166 103 3 491 649 187 350 7.09e-17 84.3
MsG0480018955.01.T01 AT1G51270 32.530 166 103 3 491 649 187 350 7.09e-17 84.3
MsG0480018955.01.T01 AT1G51270 32.530 166 103 3 491 649 188 351 8.45e-17 84.0
MsG0480018955.01.T01 AT1G51270 32.530 166 103 3 491 649 118 281 1.19e-16 84.0
MsG0480018955.01.T01 AT1G51270 32.530 166 103 3 491 649 187 350 1.47e-16 84.3
MsG0480018955.01.T01 AT1G72870 30.594 219 96 5 661 827 253 467 1.54e-16 84.7
MsG0480018955.01.T01 AT1G72870 30.645 186 108 4 221 388 284 466 4.75e-13 73.6
MsG0480018955.01.T01 AT1G72870 39.286 112 65 2 493 603 12 121 1.14e-12 72.4
MsG0480018955.01.T01 AT1G51270 32.530 166 103 3 491 649 358 521 2.48e-16 84.3
MsG0480018955.01.T01 AT1G51270 32.530 166 103 3 491 649 358 521 2.48e-16 84.3
MsG0480018955.01.T01 AT1G51270 32.530 166 103 3 491 649 310 473 2.49e-16 84.3
MsG0480018955.01.T01 AT1G51270 32.530 166 103 3 491 649 310 473 2.49e-16 84.3
MsG0480018955.01.T01 AT1G51270 32.530 166 103 3 491 649 310 473 2.49e-16 84.3
MsG0480018955.01.T01 AT1G51270 32.530 166 103 3 491 649 310 473 2.49e-16 84.3
MsG0480018955.01.T01 AT1G51270 32.530 166 103 3 491 649 358 521 2.59e-16 84.3
MsG0480018955.01.T01 AT4G23510 29.043 303 167 16 484 747 3 296 7.03e-16 83.2
MsG0480018955.01.T01 AT4G23510 29.043 303 167 16 484 747 3 296 7.53e-16 82.8
MsG0480018955.01.T01 AT5G44920 31.973 147 89 3 487 624 7 151 8.84e-16 79.0
MsG0480018955.01.T01 AT4G23510 29.043 303 167 16 484 747 3 296 1.13e-15 82.4
MsG0480018955.01.T01 AT4G23515 33.696 184 96 7 484 649 7 182 1.61e-15 79.0
MsG0480018955.01.T01 AT5G44910 34.483 145 93 1 493 637 13 155 1.92e-15 77.8
MsG0480018955.01.T01 AT4G23515 33.696 184 96 7 484 649 7 182 2.08e-15 79.3
MsG0480018955.01.T01 AT4G19910 30.488 164 107 4 493 651 9 170 6.80e-15 76.3
MsG0480018955.01.T01 AT4G11340 30.481 187 102 6 488 650 221 403 1.82e-14 78.2
MsG0480018955.01.T01 AT5G44920 37.037 108 66 2 487 594 7 112 1.84e-14 75.1
MsG0480018955.01.T01 AT1G51270 31.928 166 109 4 491 656 358 519 4.21e-14 77.4
MsG0480018955.01.T01 AT4G16990 29.208 202 107 4 214 388 50 242 1.01e-13 75.9
MsG0480018955.01.T01 AT4G16990 27.586 145 100 1 700 844 116 255 1.06e-11 69.3
MsG0480018955.01.T01 AT4G16990 29.208 202 107 4 214 388 50 242 1.01e-13 75.9
MsG0480018955.01.T01 AT4G16990 27.586 145 100 1 700 844 116 255 1.06e-11 69.3
MsG0480018955.01.T01 AT4G16990 29.208 202 107 4 214 388 50 242 1.37e-13 75.9
MsG0480018955.01.T01 AT4G16990 27.586 145 100 1 700 844 116 255 1.29e-11 69.3
MsG0480018955.01.T01 AT4G16990 29.208 202 107 4 214 388 50 242 1.41e-13 75.9
MsG0480018955.01.T01 AT4G16990 27.586 145 100 1 700 844 116 255 1.36e-11 69.3
MsG0480018955.01.T01 AT4G16990 29.208 202 107 4 214 388 50 242 1.41e-13 75.9
MsG0480018955.01.T01 AT4G16990 27.586 145 100 1 700 844 116 255 1.36e-11 69.3
MsG0480018955.01.T01 AT4G16990 29.208 202 107 4 214 388 50 242 1.41e-13 75.9
MsG0480018955.01.T01 AT4G16990 27.586 145 100 1 700 844 116 255 1.36e-11 69.3
MsG0480018955.01.T01 AT4G16990 29.208 202 107 4 214 388 50 242 1.41e-13 75.9
MsG0480018955.01.T01 AT4G16990 27.586 145 100 1 700 844 116 255 1.36e-11 69.3
MsG0480018955.01.T01 AT4G16990 29.208 202 107 4 214 388 50 242 1.42e-13 75.9
MsG0480018955.01.T01 AT4G16990 27.586 145 100 1 700 844 116 255 1.29e-11 69.3
MsG0480018955.01.T01 AT1G57850 38.298 94 56 2 521 614 29 120 1.13e-12 67.0
MsG0480018955.01.T01 AT5G45240 23.839 323 188 8 82 366 44 346 1.54e-12 72.8
MsG0480018955.01.T01 AT5G45240 23.986 296 171 7 82 339 44 323 1.61e-12 72.4
MsG0480018955.01.T01 AT1G52900 33.645 107 66 3 487 592 33 135 1.04e-11 65.9
MsG0480018955.01.T01 AT4G33300 25.714 280 159 9 220 464 209 474 2.25e-11 68.9
MsG0480018955.01.T01 AT4G33300 25.714 280 159 9 220 464 209 474 2.25e-11 68.9
MsG0480018955.01.T01 AT4G09435 32.540 126 80 2 977 1098 18 142 4.66e-11 67.0
MsG0480018955.01.T01 AT4G09435 32.540 126 80 2 977 1098 18 142 4.81e-11 67.0

Find 220 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 429 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TTAGAAACTTTGATTCTTTC+TGG 0.071335 4:-12347115 MsG0480018955.01.T01:CDS
GATATTGCTTGTTTCTTTAT+TGG 0.128179 4:-12348491 MsG0480018955.01.T01:CDS
TTCAAATTCCTGGCAGATTT+TGG 0.135600 4:+12353429 None:intergenic
TAACTACCCCAATGTCTTTA+AGG 0.162472 4:+12352518 None:intergenic
CTCAGATTGCTTCGCCTTGC+TGG 0.189989 4:-12347641 MsG0480018955.01.T01:CDS
ATCAATTACGGATTATATTA+AGG 0.192256 4:-12352769 MsG0480018955.01.T01:CDS
AAGACCAATTTGATCGTAAA+TGG 0.205200 4:+12352561 None:intergenic
ATATTGCTTGTTTCTTTATT+GGG 0.217525 4:-12348490 MsG0480018955.01.T01:CDS
TTGATGACTTTGTGATAAAA+TGG 0.223887 4:+12352474 None:intergenic
TGTCTTCAAGGTTACTTATC+TGG 0.226452 4:+12351918 None:intergenic
ATATTTGCTGTACATCATTT+AGG 0.234869 4:+12351969 None:intergenic
ACTTGACAATGTTGATAAAT+TGG 0.241324 4:-12352431 MsG0480018955.01.T01:CDS
AACTTAAAATTACCTGTATA+CGG 0.241506 4:+12352916 None:intergenic
TTAAAACATCATCTGAGTTT+TGG 0.241766 4:+12349199 None:intergenic
ACATTGTACCTTCTCTTCTT+TGG 0.242795 4:+12353388 None:intergenic
ACAGATGTGATTGCTTATTC+TGG 0.246425 4:-12348686 MsG0480018955.01.T01:CDS
ACTAAAGCTAACAAATATTT+AGG 0.253883 4:-12352962 MsG0480018955.01.T01:CDS
TGAAGTCCTTGGATCCTATT+TGG 0.254933 4:-12348645 MsG0480018955.01.T01:CDS
CTTTGGATCAGTAGTAAATA+TGG 0.255292 4:+12353405 None:intergenic
GATATAGCATGTTTCTTTGT+TGG 0.255821 4:-12351998 MsG0480018955.01.T01:CDS
TTCATCCTTACTATTGAAAA+TGG 0.268111 4:+12347002 None:intergenic
GATGTAATACAGATATTAAA+TGG 0.282780 4:-12348455 MsG0480018955.01.T01:CDS
ATGAATCCACAAAGAGTAAT+TGG 0.282788 4:-12351101 MsG0480018955.01.T01:CDS
ACACAAGAAGAACCCTATTC+TGG 0.283647 4:+12348939 None:intergenic
GCATGATCTGTTAAGAGATA+TGG 0.287646 4:-12348348 MsG0480018955.01.T01:CDS
TTTAATTTATAGATGCTTCT+TGG 0.290326 4:+12347142 None:intergenic
AACAGAGTGGCAATATGTTT+TGG 0.291122 4:-12348609 MsG0480018955.01.T01:CDS
CGCCATCAGGAAGGTCAGTT+TGG 0.302165 4:-12351162 MsG0480018955.01.T01:CDS
CCTCTTGCTCTTAAAGAACT+TGG 0.306527 4:-12352166 MsG0480018955.01.T01:CDS
ATTCATCTTCTTAAATGCTT+TGG 0.309305 4:+12347667 None:intergenic
CTTTATTGGGATGGACAAAA+AGG 0.310693 4:-12348477 MsG0480018955.01.T01:CDS
AAAAGAGAACTCTTTGATAT+TGG 0.311607 4:-12351078 MsG0480018955.01.T01:CDS
TATTTCACAGTCAGCCAAAT+AGG 0.313189 4:+12348631 None:intergenic
TGTGCCCACGAAGTCGTAAA+TGG 0.314228 4:-12352393 MsG0480018955.01.T01:CDS
TTGGAGAAGATAATGGAAAT+TGG 0.320682 4:-12351243 MsG0480018955.01.T01:CDS
ACATCACCCGTTTGTTAGAT+AGG 0.321156 4:-12349296 MsG0480018955.01.T01:CDS
ATTCTTTCACTCTATATATA+TGG 0.325856 4:+12352305 None:intergenic
AGCTGTCAAGGGACTGGCTT+TGG 0.326612 4:-12347717 MsG0480018955.01.T01:CDS
GACAGGTAGTTGCTTATTCT+AGG 0.327917 4:-12352195 MsG0480018955.01.T01:CDS
CAAGCCATTTACGATCAAAT+TGG 0.328319 4:-12352565 MsG0480018955.01.T01:CDS
AAAGACATTGGGGTAGTTAT+GGG 0.332411 4:-12352514 MsG0480018955.01.T01:CDS
TAATGGAAATTGGCAGAAAC+AGG 0.338573 4:-12351233 MsG0480018955.01.T01:CDS
GGATGGTATAGATGAAAATT+AGG 0.340101 4:+12353474 None:intergenic
TTAGAAAGCTCTTGTCTTCA+AGG 0.344399 4:+12351906 None:intergenic
AAACATATCTCCATGATAGA+AGG 0.351006 4:+12353078 None:intergenic
GTTTCCAAGAAAAGATTGTT+TGG 0.355326 4:-12347693 MsG0480018955.01.T01:CDS
GTACGAACATTTATCAATTA+CGG 0.358055 4:-12352781 MsG0480018955.01.T01:CDS
TAAAGACATTGGGGTAGTTA+TGG 0.366211 4:-12352515 MsG0480018955.01.T01:CDS
TTAGGTAAGTAGGAAAAGTC+TGG 0.369515 4:+12347283 None:intergenic
CACAAAGTCATCAACATCAT+AGG 0.374243 4:-12352465 MsG0480018955.01.T01:CDS
TTAATTTATAGATGCTTCTT+GGG 0.375969 4:+12347143 None:intergenic
AATGTATACAATAGAAGAAA+TGG 0.378985 4:-12348789 MsG0480018955.01.T01:CDS
TCAGATTGCTTCGCCTTGCT+GGG 0.379063 4:-12347640 MsG0480018955.01.T01:CDS
AATCACTTAAGCTGTTTAGT+TGG 0.382608 4:-12348757 MsG0480018955.01.T01:CDS
AAGAACACATCATACATCTT+TGG 0.383211 4:+12351477 None:intergenic
TTCTATCATGGAGATATGTT+TGG 0.384641 4:-12353076 MsG0480018955.01.T01:CDS
ATAGTAAGCTCAAACAATTA+TGG 0.388397 4:-12347490 MsG0480018955.01.T01:CDS
AAGTTCGTGTATACAAGAAT+TGG 0.390780 4:-12353170 MsG0480018955.01.T01:CDS
GCAAAATCTTCTTTCGGACT+TGG 0.395221 4:+12348719 None:intergenic
AGAGCTTCCTTAAAGACATT+GGG 0.397536 4:-12352525 MsG0480018955.01.T01:CDS
ATGTACAGCAAATATTAAAT+AGG 0.397573 4:-12351961 MsG0480018955.01.T01:CDS
GTTCTGCCTGTGTTCTATCA+AGG 0.400201 4:-12353109 MsG0480018955.01.T01:CDS
CTTCTTGTGGAGTTGTTGCT+TGG 0.406903 4:+12352236 None:intergenic
CAGATGTGATTGCTTATTCT+GGG 0.408518 4:-12348685 MsG0480018955.01.T01:CDS
GTTTGATGATGTGAATGAAT+TGG 0.410995 4:-12348918 MsG0480018955.01.T01:CDS
TAAATATGGATTCAAATTCC+TGG 0.411280 4:+12353419 None:intergenic
AGCCGTGATTGGTTTGGTCC+GGG 0.411450 4:-12348872 MsG0480018955.01.T01:CDS
GCTAGAGTTGGAGAAGATAA+TGG 0.411550 4:-12351250 MsG0480018955.01.T01:CDS
AAGCTTGTTATTCTCGTCAA+TGG 0.413008 4:+12351883 None:intergenic
TAGCCGTGATTGGTTTGGTC+CGG 0.413733 4:-12348873 MsG0480018955.01.T01:CDS
CCCTTGTAACTGTTGACAAT+AGG 0.414841 4:-12348385 MsG0480018955.01.T01:CDS
CTTTGTGTGGTAGCCGTGAT+TGG 0.416333 4:-12348883 MsG0480018955.01.T01:CDS
GTTAATTGTTCATTGTAAAT+GGG 0.418189 4:-12353620 None:intergenic
TGAGAGGCTGCACAGGTCTT+CGG 0.419428 4:-12347171 MsG0480018955.01.T01:CDS
TATATATAGAGTGAAAGAAT+TGG 0.426223 4:-12352302 MsG0480018955.01.T01:CDS
CAATTTGATCGTAAATGGCT+TGG 0.427485 4:+12352566 None:intergenic
GAGGTTTCAACATGTAGAAC+AGG 0.430271 4:-12353266 MsG0480018955.01.T01:CDS
CTCTTGCTCTTAAAGAACTT+GGG 0.431284 4:-12352165 MsG0480018955.01.T01:CDS
GCAGTAGGTTGTGGCGCCAT+GGG 0.431458 4:-12348280 MsG0480018955.01.T01:CDS
GAGATCTTAAGTGGCTGTAT+TGG 0.431793 4:-12347583 MsG0480018955.01.T01:CDS
TGCTTGTTTCTTTATTGGGA+TGG 0.432772 4:-12348486 MsG0480018955.01.T01:CDS
TTTGGGGATATGGGGAATGG+GGG 0.435844 4:-12349175 MsG0480018955.01.T01:CDS
CACAACCTACTGCGTTTCTC+AGG 0.439822 4:+12348290 None:intergenic
TGTACACCCAGTGTCAAATC+TGG 0.441158 4:-12352687 MsG0480018955.01.T01:intron
CCACTAGCACTTGAAGTCCT+TGG 0.444095 4:-12348656 MsG0480018955.01.T01:CDS
TTTGATATTGGTGGAATAGC+AGG 0.444457 4:-12351066 MsG0480018955.01.T01:CDS
AGAGAACTCTTTGATATTGG+TGG 0.445363 4:-12351075 MsG0480018955.01.T01:CDS
CGCAGTAGGTTGTGGCGCCA+TGG 0.446668 4:-12348281 MsG0480018955.01.T01:CDS
CGGGAGACCGTAGACAAACT+TGG 0.448788 4:+12347232 None:intergenic
GTGTTGCCGAACCTCAGATT+TGG 0.449410 4:-12353134 MsG0480018955.01.T01:CDS
CATGATCTGTTAAGAGATAT+GGG 0.449549 4:-12348347 MsG0480018955.01.T01:CDS
CTCTGTCCTATCTAACAAAC+GGG 0.452415 4:+12349290 None:intergenic
TGCGTAGCAAAATCTTCTTT+CGG 0.455016 4:+12348713 None:intergenic
GGAGCTACCTCATAAAATAC+TGG 0.455442 4:+12351195 None:intergenic
TCCATCAGAAGTACGCCATC+AGG 0.461275 4:-12351175 MsG0480018955.01.T01:CDS
GCCATCAGGAAGGTCAGTTT+GGG 0.461668 4:-12351161 MsG0480018955.01.T01:CDS
TTGTTCATTGTAAATGGGAC+CGG 0.462757 4:-12353615 None:intergenic
ACAGGTAGTTGCTTATTCTA+GGG 0.463609 4:-12352194 MsG0480018955.01.T01:CDS
CTGAAATTCTGCAGGAACGC+AGG 0.465354 4:+12347544 None:intergenic
CCTTGCTGGGGTGAAGCTGA+AGG 0.467157 4:-12347627 MsG0480018955.01.T01:CDS
ACTCTGTCCTATCTAACAAA+CGG 0.469343 4:+12349289 None:intergenic
ATCAAGTAATAACACTGATC+AGG 0.470422 4:-12351810 MsG0480018955.01.T01:intron
CGAAGTCGTAAATGGTTTGA+AGG 0.475861 4:-12352385 MsG0480018955.01.T01:CDS
ATAAATTTGAGAGGCTGCAC+AGG 0.476541 4:-12347178 MsG0480018955.01.T01:CDS
TCTACGGTCTCCCGTAGCAT+TGG 0.477519 4:-12347223 MsG0480018955.01.T01:CDS
TCCTATTGTCAACAGTTACA+AGG 0.478424 4:+12348384 None:intergenic
TTGGGGATATGGGGAATGGG+GGG 0.478532 4:-12349174 MsG0480018955.01.T01:CDS
CACAAGAAGAACCCTATTCT+GGG 0.479388 4:+12348940 None:intergenic
GCTTCTTGTAGTCGTGGAGC+TGG 0.479776 4:+12352073 None:intergenic
GGCAGTCTTATCGGCAATCA+AGG 0.480349 4:+12347036 None:intergenic
TCCTGATGGCGTACTTCTGA+TGG 0.481227 4:+12351174 None:intergenic
TGTGGTAGCCGTGATTGGTT+TGG 0.482003 4:-12348878 MsG0480018955.01.T01:CDS
TTTAGTGATCGCTGCTACCC+AGG 0.482996 4:+12352979 None:intergenic
GTTTCAGAGGAGAAGACAAT+CGG 0.483432 4:-12351452 MsG0480018955.01.T01:CDS
AATTTGATCGTAAATGGCTT+GGG 0.483861 4:+12352567 None:intergenic
TATTCCTCTCTTCAAAATGC+GGG 0.485409 4:-12351408 MsG0480018955.01.T01:CDS
TCATACTCAAACCCGTATAC+AGG 0.488256 4:-12352928 MsG0480018955.01.T01:intron
ACTTAAAATTACCTGTATAC+GGG 0.492112 4:+12352917 None:intergenic
TGATGACTTTGTGATAAAAT+GGG 0.492300 4:+12352475 None:intergenic
AGTCATCTCAATACTTTCTC+CGG 0.493140 4:+12353596 None:intergenic
AGATTTGACACTGGGTGTAC+AGG 0.495037 4:+12352689 None:intergenic
ATGTAATACAGATATTAAAT+GGG 0.496082 4:-12348454 MsG0480018955.01.T01:CDS
GAACAACCAAATCTGAGGTT+CGG 0.498412 4:+12353128 None:intergenic
GGGAAGACAAATAATTTATG+AGG 0.500613 4:-12348327 MsG0480018955.01.T01:CDS
TAGGTAAGTAGGAAAAGTCT+GGG 0.500855 4:+12347284 None:intergenic
AAGCTAAAAGTAAGCTTCCA+TGG 0.501811 4:-12348548 MsG0480018955.01.T01:CDS
CTGAGAAACGCAGTAGGTTG+TGG 0.505676 4:-12348289 MsG0480018955.01.T01:CDS
TAAAGAAACAAGCAATATCA+AGG 0.505708 4:+12348495 None:intergenic
TCAAACCATTTACGACTTCG+TGG 0.506533 4:+12352388 None:intergenic
ATACAGATATTAAATGGGTG+TGG 0.506551 4:-12348449 MsG0480018955.01.T01:CDS
GGTGTCGCTCCCTTCTATCA+TGG 0.506824 4:-12353088 MsG0480018955.01.T01:CDS
CAAAGAAACATGCTATATCA+AGG 0.507356 4:+12352002 None:intergenic
TTGTAGTCGTGGAGCTGGAA+TGG 0.507613 4:+12352078 None:intergenic
ATCTTTCAGGAGATCTTAAG+TGG 0.508656 4:-12347592 MsG0480018955.01.T01:CDS
AAGAGCTTCCTTAAAGACAT+TGG 0.508881 4:-12352526 MsG0480018955.01.T01:CDS
TATCATGGAGATATGTTTGG+AGG 0.509812 4:-12353073 MsG0480018955.01.T01:CDS
GAGTTTCTGCGCTCAAGACA+AGG 0.511504 4:-12353359 MsG0480018955.01.T01:CDS
CTTGCTTGCTGAAATTCTGC+AGG 0.514383 4:+12347536 None:intergenic
TTCCTCCTCCAAAATCTGCC+AGG 0.515672 4:-12353437 MsG0480018955.01.T01:CDS
GGAGGAGGACTTGGAACAGA+TGG 0.516310 4:-12347071 MsG0480018955.01.T01:CDS
TAGGTTGTGGCGCCATGGGG+AGG 0.522845 4:-12348276 MsG0480018955.01.T01:CDS
CTGCGTTTCTCAGGATCTGA+TGG 0.524067 4:+12348299 None:intergenic
AATTGGCAGAAACAGGGGTC+TGG 0.524914 4:-12351226 MsG0480018955.01.T01:CDS
ATCGTAAATGGCTTGGGCAA+TGG 0.525393 4:+12352573 None:intergenic
AACAGAAGCTGTCAAGGGAC+TGG 0.529860 4:-12347723 MsG0480018955.01.T01:CDS
ACAATTATGGAACAAGTGCC+AGG 0.531604 4:-12347477 MsG0480018955.01.T01:intron
TCAGGGAACAGAAGCTGTCA+AGG 0.533576 4:-12347729 MsG0480018955.01.T01:intron
TGCACACCAGATTTGACACT+GGG 0.533641 4:+12352681 None:intergenic
TACAGATATTAAATGGGTGT+GGG 0.534310 4:-12348448 MsG0480018955.01.T01:CDS
GATGTGTTCTTGAGTTTCAG+AGG 0.535383 4:-12351465 MsG0480018955.01.T01:CDS
CTTAAGTGGCTGTATTGGCA+TGG 0.538556 4:-12347578 MsG0480018955.01.T01:CDS
GTGATTATTATTCTACTCCC+CGG 0.538825 4:+12348854 None:intergenic
ACAAAGTCATCAACATCATA+GGG 0.538989 4:-12352464 MsG0480018955.01.T01:CDS
TTGATATTGGTGGAATAGCA+GGG 0.539140 4:-12351065 MsG0480018955.01.T01:intron
CCAAGTTCTTTAAGAGCAAG+AGG 0.542159 4:+12352166 None:intergenic
TCTAGAGCTTCTTGTAGTCG+TGG 0.543969 4:+12352067 None:intergenic
CAAACCATTTACGACTTCGT+GGG 0.545251 4:+12352389 None:intergenic
GGAGGAAGTGAAGGAAGACA+TGG 0.545523 4:+12353453 None:intergenic
ATGCATCTTCTTAGATTGTG+TGG 0.547922 4:-12348821 MsG0480018955.01.T01:CDS
CATTCCTCATGATCAAGTAC+AGG 0.549463 4:-12348573 MsG0480018955.01.T01:CDS
CAGGTAGTTGCTTATTCTAG+GGG 0.549893 4:-12352193 MsG0480018955.01.T01:CDS
AAGATGGTGTATGCTAGAGT+TGG 0.551069 4:-12351262 MsG0480018955.01.T01:CDS
TTCTCCTGTACTTGATCATG+AGG 0.551527 4:+12348569 None:intergenic
GCCGTGATTGGTTTGGTCCG+GGG 0.551649 4:-12348871 MsG0480018955.01.T01:CDS
TCATGTTCTGCTACAAGCCA+TGG 0.552973 4:-12351855 MsG0480018955.01.T01:CDS
GAATGAATTGGAGCAGCTAA+AGG 0.553536 4:-12348906 MsG0480018955.01.T01:CDS
TGATATATTAGAAAAGCGTA+AGG 0.555262 4:-12348249 MsG0480018955.01.T01:intron
ATGTAGAGATCCAATGCTAC+GGG 0.556787 4:+12347213 None:intergenic
ATGGAGAGGAAGCACTTAAG+TGG 0.557668 4:-12352132 MsG0480018955.01.T01:CDS
CTTGCTGGGGTGAAGCTGAA+GGG 0.558469 4:-12347626 MsG0480018955.01.T01:CDS
ATTGACGAGAATAACAAGCT+TGG 0.560131 4:-12351881 MsG0480018955.01.T01:CDS
GAGGCTCTTAGTTTAGAAGC+TGG 0.562486 4:-12353313 MsG0480018955.01.T01:CDS
CAAATTATGCTAATTCAAGA+TGG 0.565652 4:-12351278 MsG0480018955.01.T01:CDS
TATGTAGAGATCCAATGCTA+CGG 0.567006 4:+12347212 None:intergenic
AACATATCTCCATGATAGAA+GGG 0.567338 4:+12353079 None:intergenic
ACACGAGATTCTACACCCAC+TGG 0.567498 4:+12349249 None:intergenic
TTTAATGATATCTCTCGCCA+TGG 0.567890 4:+12351838 None:intergenic
TCCCAAACTGACCTTCCTGA+TGG 0.575780 4:+12351160 None:intergenic
CAGATTGCTTCGCCTTGCTG+GGG 0.577169 4:-12347639 MsG0480018955.01.T01:CDS
CTACTGATCCAAAGAAGAGA+AGG 0.578333 4:-12353396 MsG0480018955.01.T01:CDS
TGAAATTCTGCAGGAACGCA+GGG 0.578995 4:+12347545 None:intergenic
TTTCAGAGGAGAAGACAATC+GGG 0.581494 4:-12351451 MsG0480018955.01.T01:CDS
GATGTGATTGCTTATTCTGG+GGG 0.582330 4:-12348683 MsG0480018955.01.T01:CDS
AAACTGTCCAAGTTTGTCTA+CGG 0.582572 4:-12347239 MsG0480018955.01.T01:CDS
TGTTCTTTCGTGTCTCGAAG+AGG 0.587468 4:-12353332 MsG0480018955.01.T01:CDS
CCTTCAGCTTCACCCCAGCA+AGG 0.587492 4:+12347627 None:intergenic
CTATTCCTCTCTTCAAAATG+CGG 0.592789 4:-12351409 MsG0480018955.01.T01:CDS
AGTTCACTAAAATCTTCTTG+TGG 0.598434 4:+12352223 None:intergenic
TTTGTTGCTGAACATCCAGT+GGG 0.599779 4:-12349264 MsG0480018955.01.T01:CDS
AGTCAGCCAAATAGGATCCA+AGG 0.601293 4:+12348639 None:intergenic
CCAAGGACTTCAAGTGCTAG+TGG 0.601960 4:+12348656 None:intergenic
TTGCACACCAGATTTGACAC+TGG 0.604643 4:+12352680 None:intergenic
TCCCCGGACCAAACCAATCA+CGG 0.605638 4:+12348870 None:intergenic
AGACATCTACTCAAGAAGCA+TGG 0.613863 4:-12352334 MsG0480018955.01.T01:CDS
AATGGAAATTGGCAGAAACA+GGG 0.615256 4:-12351232 MsG0480018955.01.T01:CDS
AGATGTGATTGCTTATTCTG+GGG 0.622875 4:-12348684 MsG0480018955.01.T01:CDS
AGTTTCTGCGCTCAAGACAA+GGG 0.625667 4:-12353358 MsG0480018955.01.T01:CDS
CAGTAGGTTGTGGCGCCATG+GGG 0.627617 4:-12348279 MsG0480018955.01.T01:CDS
AGATACGTGATCTAGAATCA+GGG 0.630788 4:-12348988 MsG0480018955.01.T01:intron
CAGGGAACAGAAGCTGTCAA+GGG 0.631721 4:-12347728 MsG0480018955.01.T01:CDS
ATTCCTCTCTTCAAAATGCG+GGG 0.632010 4:-12351407 MsG0480018955.01.T01:CDS
AGAAGACAAGCTCATGACCT+GGG 0.633721 4:-12352996 MsG0480018955.01.T01:CDS
CCTATTGTCAACAGTTACAA+GGG 0.633925 4:+12348385 None:intergenic
AAGAAGACAAGCTCATGACC+TGG 0.638129 4:-12352997 MsG0480018955.01.T01:CDS
ATTTGTTGCTGAACATCCAG+TGG 0.642203 4:-12349265 MsG0480018955.01.T01:CDS
GAAATGATGAAGCAAAACAC+TGG 0.643074 4:+12353549 None:intergenic
TCTGGATAGAATATCAATGG+AGG 0.644188 4:-12353032 MsG0480018955.01.T01:CDS
GAGCTTCCTTAAAGACATTG+GGG 0.648862 4:-12352524 MsG0480018955.01.T01:CDS
ATGGAAATTGGCAGAAACAG+GGG 0.651761 4:-12351231 MsG0480018955.01.T01:CDS
ATATATCAAACACCTCCCCA+TGG 0.654409 4:+12348264 None:intergenic
GAGCAGCTAAAGGCTTTGTG+TGG 0.656699 4:-12348896 MsG0480018955.01.T01:CDS
AGTGGGTGTAGAATCTCGTG+TGG 0.659655 4:-12349247 MsG0480018955.01.T01:CDS
CAGATCCTGAGAAACGCAGT+AGG 0.662999 4:-12348295 MsG0480018955.01.T01:CDS
TCAGAAGTACGCCATCAGGA+AGG 0.666277 4:-12351171 MsG0480018955.01.T01:CDS
AGGCAGAACAACCAAATCTG+AGG 0.671877 4:+12353123 None:intergenic
GCGACACCTTGATAGAACAC+AGG 0.698300 4:+12353103 None:intergenic
GAAGTGAAGGAAGACATGGA+TGG 0.703550 4:+12353457 None:intergenic
AGGTAAGTAGGAAAAGTCTG+GGG 0.711150 4:+12347285 None:intergenic
GACGATGACGAGATTCAACG+AGG 0.761041 4:-12351369 MsG0480018955.01.T01:CDS
CTGACTGTGAAATAACAGAG+TGG 0.792261 4:-12348622 MsG0480018955.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAATATAGAGATAATAAATT+AGG - Chr4:12350422-12350441 MsG0480018955.01.T01:intron 10.0%
!! AAGAAAAAAAAAAAAAAGAT+CGG + Chr4:12353213-12353232 None:intergenic 10.0%
!! AATATAGAGATAATAAATTA+GGG - Chr4:12350423-12350442 MsG0480018955.01.T01:intron 10.0%
!! AATTGAAAATTTATGAAAAT+TGG - Chr4:12352397-12352416 MsG0480018955.01.T01:CDS 10.0%
!! TTCAAATATTACATATATTA+AGG + Chr4:12350403-12350422 None:intergenic 10.0%
!!! AATTTTGAATGATTTTTTTT+AGG - Chr4:12352584-12352603 MsG0480018955.01.T01:CDS 10.0%
!!! ATTTTGAATGATTTTTTTTA+GGG - Chr4:12352585-12352604 MsG0480018955.01.T01:CDS 10.0%
!!! TAAATATAGAAACATTTTAT+TGG + Chr4:12352727-12352746 None:intergenic 10.0%
!! AAAGCAATTTATAATCAAAT+TGG - Chr4:12351488-12351507 MsG0480018955.01.T01:intron 15.0%
!! AAAGTAATAGTATATAAAGA+AGG + Chr4:12349696-12349715 None:intergenic 15.0%
!! AAGCAATTTATAATCAAATT+GGG - Chr4:12351489-12351508 MsG0480018955.01.T01:intron 15.0%
!! AAGTATATACTCAAATAATT+TGG - Chr4:12350544-12350563 MsG0480018955.01.T01:intron 15.0%
!! AATTTGATTATAAATTGCTT+TGG + Chr4:12351489-12351508 None:intergenic 15.0%
!! ATATAGAGATAATAAATTAG+GGG - Chr4:12350424-12350443 MsG0480018955.01.T01:intron 15.0%
!! ATGTAATACAGATATTAAAT+GGG - Chr4:12352163-12352182 MsG0480018955.01.T01:CDS 15.0%
!! TAAAATATGAAACAATGAAA+AGG + Chr4:12351263-12351282 None:intergenic 15.0%
!! TATTAGTTGTTATATAATAG+AGG + Chr4:12350951-12350970 None:intergenic 15.0%
!! TGAAAAAGCTATTAAAATTA+AGG + Chr4:12352488-12352507 None:intergenic 15.0%
!!! AGATATATTGAACATTTTTA+GGG + Chr4:12350380-12350399 None:intergenic 15.0%
!!! ATATTTTAGATAAAGATTCA+TGG + Chr4:12350755-12350774 None:intergenic 15.0%
!!! ATTTCTTTTTCTTAATTTCA+GGG - Chr4:12352871-12352890 MsG0480018955.01.T01:intron 15.0%
!!! CTTACTATATTTTAATTCAA+CGG + Chr4:12353115-12353134 None:intergenic 15.0%
!!! TATTCCAATGTATTTTTTTT+TGG - Chr4:12348887-12348906 MsG0480018955.01.T01:CDS 15.0%
!!! TCACTTAAAGTTTTTAATTT+AGG - Chr4:12348349-12348368 MsG0480018955.01.T01:CDS 15.0%
!!! TTCATTGTTTCATATTTTAT+AGG - Chr4:12351264-12351283 MsG0480018955.01.T01:CDS 15.0%
!! AAAAAAATACCTATCTATCT+TGG + Chr4:12350644-12350663 None:intergenic 20.0%
!! AAAATCTTAGCTTAGATATA+TGG + Chr4:12349106-12349125 None:intergenic 20.0%
!! AAATCATTCAGTAAGAAAAA+AGG + Chr4:12352790-12352809 None:intergenic 20.0%
!! AACTTAAAATTACCTGTATA+CGG + Chr4:12347704-12347723 None:intergenic 20.0%
!! AATCATTCAGTAAGAAAAAA+GGG + Chr4:12352789-12352808 None:intergenic 20.0%
!! AATGTATACAATAGAAGAAA+TGG - Chr4:12351828-12351847 MsG0480018955.01.T01:CDS 20.0%
!! ACTAAAGCTAACAAATATTT+AGG - Chr4:12347655-12347674 MsG0480018955.01.T01:CDS 20.0%
!! AGAAAATAATAGATATAACC+AGG + Chr4:12350599-12350618 None:intergenic 20.0%
!! AGACAAATAAATAAATAACC+TGG + Chr4:12349594-12349613 None:intergenic 20.0%
!! ATGTACAGCAAATATTAAAT+AGG - Chr4:12348656-12348675 MsG0480018955.01.T01:CDS 20.0%
!! ATGTTCTATGATTGAAAAAT+TGG - Chr4:12353525-12353544 MsG0480018955.01.T01:five_prime_UTR 20.0%
!! ATTCTTTCACTCTATATATA+TGG + Chr4:12348315-12348334 None:intergenic 20.0%
!! ATTGAATGATTATTTGTTTG+AGG - Chr4:12350121-12350140 MsG0480018955.01.T01:intron 20.0%
!! ATTTAAAAACTCTTCTATCA+TGG - Chr4:12350329-12350348 MsG0480018955.01.T01:intron 20.0%
!! GAAAATAATAGATATAACCA+GGG + Chr4:12350598-12350617 None:intergenic 20.0%
!! GATGTAATACAGATATTAAA+TGG - Chr4:12352162-12352181 MsG0480018955.01.T01:CDS 20.0%
!! GCTATACATATATTAAAGAT+GGG + Chr4:12350076-12350095 None:intergenic 20.0%
!! TATATATAGAGTGAAAGAAT+TGG - Chr4:12348315-12348334 MsG0480018955.01.T01:CDS 20.0%
!! TGCTATACATATATTAAAGA+TGG + Chr4:12350077-12350096 None:intergenic 20.0%
!! TTAATTTATAGATGCTTCTT+GGG + Chr4:12353477-12353496 None:intergenic 20.0%
!!! AAAGAAGGTAAATTTTAAGA+TGG + Chr4:12349681-12349700 None:intergenic 20.0%
!!! AAATTGGTTTCATTCATTTT+AGG - Chr4:12352413-12352432 MsG0480018955.01.T01:CDS 20.0%
!!! AATTGGTTTCATTCATTTTA+GGG - Chr4:12352414-12352433 MsG0480018955.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATATTGCTTGTTTCTTTATT+GGG - Chr4:12352127-12352146 MsG0480018955.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATCAATTACGGATTATATTA+AGG - Chr4:12347848-12347867 MsG0480018955.01.T01:intron 20.0%
!!! ATTTTTAACTAGAAGTAACA+TGG - Chr4:12349849-12349868 MsG0480018955.01.T01:intron 20.0%
!!! CATCATTTTAACTGAATAAT+TGG - Chr4:12350848-12350867 MsG0480018955.01.T01:intron 20.0%
!!! CTTATTTTGATAAATTTGAG+AGG - Chr4:12353430-12353449 MsG0480018955.01.T01:CDS 20.0%
!!! CTTTTGTTCATATATTATAC+AGG - Chr4:12347814-12347833 MsG0480018955.01.T01:intron 20.0%
!!! GAAAACAAATACACTAATTT+TGG + Chr4:12352841-12352860 None:intergenic 20.0%
!!! GAGATATATTGAACATTTTT+AGG + Chr4:12350381-12350400 None:intergenic 20.0%
!!! GATTTCTTTTTCTTAATTTC+AGG - Chr4:12352870-12352889 MsG0480018955.01.T01:intron 20.0%
!!! TATGTATAGCATATTTTTCT+AGG - Chr4:12350086-12350105 MsG0480018955.01.T01:intron 20.0%
!!! TCAGATGATGTTTTAATTTT+GGG - Chr4:12351425-12351444 MsG0480018955.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTAATTTACACCTATCTTT+TGG - Chr4:12347752-12347771 MsG0480018955.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTAATTTATAGATGCTTCT+TGG + Chr4:12353478-12353497 None:intergenic 20.0%
!!! TTTAGGGTTAAATATGTTTT+TGG - Chr4:12352430-12352449 MsG0480018955.01.T01:CDS 20.0%
! AAAAGAGAACTCTTTGATAT+TGG - Chr4:12349539-12349558 MsG0480018955.01.T01:intron 25.0%
! AAATTAAGGACTAAACTTAG+AGG + Chr4:12352474-12352493 None:intergenic 25.0%
! ACAACAAACATAGTTGAATT+CGG + Chr4:12350818-12350837 None:intergenic 25.0%
! ACAAGTTAAGAAGCTAAAAA+TGG - Chr4:12352633-12352652 MsG0480018955.01.T01:intron 25.0%
! ACTAATACATCATCAACTAT+GGG + Chr4:12349063-12349082 None:intergenic 25.0%
! ACTTAAAATTACCTGTATAC+GGG + Chr4:12347703-12347722 None:intergenic 25.0%
! AGTAAGTCTATGAATTTACA+TGG + Chr4:12350985-12351004 None:intergenic 25.0%
! ATAGTAAGCTCAAACAATTA+TGG - Chr4:12353127-12353146 MsG0480018955.01.T01:CDS 25.0%
! ATTATAAATTGCTTTGGCAA+GGG + Chr4:12351483-12351502 None:intergenic 25.0%
! ATTCATCTTCTTAAATGCTT+TGG + Chr4:12352953-12352972 None:intergenic 25.0%
! CAAAATCATTACAAGAACAT+TGG - Chr4:12348979-12348998 MsG0480018955.01.T01:intron 25.0%
! CAAATTATGCTAATTCAAGA+TGG - Chr4:12349339-12349358 MsG0480018955.01.T01:intron 25.0%
! CAGTATGGAAAAATTATTTG+TGG - Chr4:12350281-12350300 MsG0480018955.01.T01:intron 25.0%
! GGAACCAAAAAAAAATACAT+TGG + Chr4:12348894-12348913 None:intergenic 25.0%
! GTAATAACAAAACGAATTGT+TGG - Chr4:12349031-12349050 MsG0480018955.01.T01:intron 25.0%
! GTACGAACATTTATCAATTA+CGG - Chr4:12347836-12347855 MsG0480018955.01.T01:intron 25.0%
! GTATATGTGCATAACTTAAA+TGG + Chr4:12351164-12351183 None:intergenic 25.0%
! TAAAGAAACAAGCAATATCA+AGG + Chr4:12352125-12352144 None:intergenic 25.0%
! TAAATATGGATTCAAATTCC+TGG + Chr4:12347201-12347220 None:intergenic 25.0%
! TAGTGATGCTAAAAATTCTT+AGG - Chr4:12349629-12349648 MsG0480018955.01.T01:intron 25.0%
! TCTGAATATAAGAGAGTTAT+GGG - Chr4:12351538-12351557 MsG0480018955.01.T01:intron 25.0%
! TGATGACTTTGTGATAAAAT+GGG + Chr4:12348145-12348164 None:intergenic 25.0%
! TTACTGAAAATCATTATTGC+TGG + Chr4:12351046-12351065 None:intergenic 25.0%
! TTAGAAACTTTGATTCTTTC+TGG - Chr4:12353502-12353521 MsG0480018955.01.T01:five_prime_UTR 25.0%
! TTCTATGATTGAAAAATTGG+AGG - Chr4:12353528-12353547 MsG0480018955.01.T01:five_prime_UTR 25.0%
! TTCTGAATATAAGAGAGTTA+TGG - Chr4:12351537-12351556 MsG0480018955.01.T01:intron 25.0%
! TTTAATAAGCTTGGTAAATG+AGG - Chr4:12349873-12349892 MsG0480018955.01.T01:intron 25.0%
! TTTACTTGTAAGTTATATCG+AGG - Chr4:12350013-12350032 MsG0480018955.01.T01:intron 25.0%
!! ACTTGACAATGTTGATAAAT+TGG - Chr4:12348186-12348205 MsG0480018955.01.T01:intron 25.0%
!! AGGGTCATTAGATAAATTTT+TGG + Chr4:12350361-12350380 None:intergenic 25.0%
!! CTGTAAAATCTTTTAAACCA+TGG + Chr4:12352089-12352108 None:intergenic 25.0%
!! GATATTGCTTGTTTCTTTAT+TGG - Chr4:12352126-12352145 MsG0480018955.01.T01:CDS 25.0%
!! TCAAAAACTTCAAAGTATCT+TGG + Chr4:12349729-12349748 None:intergenic 25.0%
!! TGATATATTAGAAAAGCGTA+AGG - Chr4:12352368-12352387 MsG0480018955.01.T01:CDS 25.0%
!! TTAAAACATCATCTGAGTTT+TGG + Chr4:12351421-12351440 None:intergenic 25.0%
!! TTGATGACTTTGTGATAAAA+TGG + Chr4:12348146-12348165 None:intergenic 25.0%
!! TTTTCTGGATAGAATATCAA+TGG - Chr4:12347582-12347601 MsG0480018955.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTTTGACAGAAAGATAGAT+AGG - Chr4:12350665-12350684 MsG0480018955.01.T01:intron 25.0%
!!! ATATTTGCTGTACATCATTT+AGG + Chr4:12348651-12348670 None:intergenic 25.0%
!!! ATGTTTTAATTTTGGGGATA+TGG - Chr4:12351432-12351451 MsG0480018955.01.T01:CDS 25.0%
!!! CAGATGATGTTTTAATTTTG+GGG - Chr4:12351426-12351445 MsG0480018955.01.T01:CDS 25.0%
!!! CTCAGATGATGTTTTAATTT+TGG - Chr4:12351424-12351443 MsG0480018955.01.T01:CDS 25.0%
!!! TAACATGGTTTTAATAAGCT+TGG - Chr4:12349864-12349883 MsG0480018955.01.T01:intron 25.0%
!!! TGTTTTAATTTTGGGGATAT+GGG - Chr4:12351433-12351452 MsG0480018955.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTTTTGCACACATGTTTAT+AGG - Chr4:12352807-12352826 MsG0480018955.01.T01:intron 25.0%
AAACATATCTCCATGATAGA+AGG + Chr4:12347542-12347561 None:intergenic 30.0%
AACAAACATAGTTGAATTCG+GGG + Chr4:12350816-12350835 None:intergenic 30.0%
AACATATCTCCATGATAGAA+GGG + Chr4:12347541-12347560 None:intergenic 30.0%
AACTTAAATGGCATTGCAAT+GGG + Chr4:12351152-12351171 None:intergenic 30.0%
AAGAACACATCATACATCTT+TGG + Chr4:12349143-12349162 None:intergenic 30.0%
AAGACCAATTTGATCGTAAA+TGG + Chr4:12348059-12348078 None:intergenic 30.0%
AAGATCGGAATTTGAAAGAA+TGG + Chr4:12353198-12353217 None:intergenic 30.0%
AAGTTCGTGTATACAAGAAT+TGG - Chr4:12347447-12347466 MsG0480018955.01.T01:intron 30.0%
AATCAAAAAGTCCTCTCATA+AGG - Chr4:12347982-12348001 MsG0480018955.01.T01:intron 30.0%
AATCACTTAAGCTGTTTAGT+TGG - Chr4:12351860-12351879 MsG0480018955.01.T01:CDS 30.0%
AATCATTATAGAGAGCAGTA+TGG - Chr4:12350266-12350285 MsG0480018955.01.T01:intron 30.0%
AATTTGATCGTAAATGGCTT+GGG + Chr4:12348053-12348072 None:intergenic 30.0%
ACAAAGTCATCAACATCATA+GGG - Chr4:12348153-12348172 MsG0480018955.01.T01:intron 30.0%
AGTTCACTAAAATCTTCTTG+TGG + Chr4:12348397-12348416 None:intergenic 30.0%
ATAACAAAACGAATTGTTGG+TGG - Chr4:12349034-12349053 MsG0480018955.01.T01:intron 30.0%
ATAATAGATATAACCAGGGA+TGG + Chr4:12350594-12350613 None:intergenic 30.0%
ATACAGATATTAAATGGGTG+TGG - Chr4:12352168-12352187 MsG0480018955.01.T01:CDS 30.0%
ATCAAAAAGTCCTCTCATAA+GGG - Chr4:12347983-12348002 MsG0480018955.01.T01:intron 30.0%
ATCAAGTAATAACACTGATC+AGG - Chr4:12348807-12348826 MsG0480018955.01.T01:CDS 30.0%
ATCAGGGAAAAATATGTTGA+AGG - Chr4:12351645-12351664 MsG0480018955.01.T01:intron 30.0%
ATCCAAGAATTTAGTAAAGG+GGG + Chr4:12350571-12350590 None:intergenic 30.0%
ATGAATCCACAAAGAGTAAT+TGG - Chr4:12349516-12349535 MsG0480018955.01.T01:intron 30.0%
ATGCAGAAGAATAGTATTTG+AGG - Chr4:12350913-12350932 MsG0480018955.01.T01:intron 30.0%
ATTTCCCATCTTTATAGGAT+TGG - Chr4:12350191-12350210 MsG0480018955.01.T01:intron 30.0%
CAAAAATTGTCATGGTTTAG+CGG - Chr4:12353165-12353184 MsG0480018955.01.T01:CDS 30.0%
CAAAGAAACATGCTATATCA+AGG + Chr4:12348618-12348637 None:intergenic 30.0%
CAAATATTATTACACCACCA+AGG + Chr4:12349655-12349674 None:intergenic 30.0%
CAACAAACATAGTTGAATTC+GGG + Chr4:12350817-12350836 None:intergenic 30.0%
CACTAATACATCATCAACTA+TGG + Chr4:12349064-12349083 None:intergenic 30.0%
CATGATCTGTTAAGAGATAT+GGG - Chr4:12352270-12352289 MsG0480018955.01.T01:CDS 30.0%
CTGAAATTTCCAAGATAGAT+AGG - Chr4:12350632-12350651 MsG0480018955.01.T01:intron 30.0%
CTTTGGATCAGTAGTAAATA+TGG + Chr4:12347215-12347234 None:intergenic 30.0%
GAGATAATAAATTAGGGGAA+TGG - Chr4:12350429-12350448 MsG0480018955.01.T01:intron 30.0%
GATATAGCATGTTTCTTTGT+TGG - Chr4:12348619-12348638 MsG0480018955.01.T01:CDS 30.0%
GATCCAAGAATTTAGTAAAG+GGG + Chr4:12350572-12350591 None:intergenic 30.0%
GATTATAAATTGCTTTGGCA+AGG + Chr4:12351484-12351503 None:intergenic 30.0%
GGATCCAAGAATTTAGTAAA+GGG + Chr4:12350573-12350592 None:intergenic 30.0%
GGATGGTATAGATGAAAATT+AGG + Chr4:12347146-12347165 None:intergenic 30.0%
GGGAAGACAAATAATTTATG+AGG - Chr4:12352290-12352309 MsG0480018955.01.T01:CDS 30.0%
GTGTTCATAAATCCTACATT+TGG - Chr4:12350687-12350706 MsG0480018955.01.T01:intron 30.0%
GTTTAGTTGTTTGTACATTG+TGG - Chr4:12350726-12350745 MsG0480018955.01.T01:intron 30.0%
GTTTCCAAGAAAAGATTGTT+TGG - Chr4:12352924-12352943 MsG0480018955.01.T01:intron 30.0%
TAAAAACTCTTCTATCATGG+AGG - Chr4:12350332-12350351 MsG0480018955.01.T01:intron 30.0%
TAAATAACCTGGAATCTATG+AGG + Chr4:12349583-12349602 None:intergenic 30.0%
TAAATTAGGGGAATGGAAAA+AGG - Chr4:12350436-12350455 MsG0480018955.01.T01:intron 30.0%
TAACTTAAATGGCATTGCAA+TGG + Chr4:12351153-12351172 None:intergenic 30.0%
TACAGATATTAAATGGGTGT+GGG - Chr4:12352169-12352188 MsG0480018955.01.T01:CDS 30.0%
TATGATTGAAAAATTGGAGG+AGG - Chr4:12353531-12353550 MsG0480018955.01.T01:five_prime_UTR 30.0%
TCCAAACTATGTAACAGAAA+AGG - Chr4:12348911-12348930 MsG0480018955.01.T01:CDS 30.0%
TGAATAATTGGCAACACTAT+AGG - Chr4:12350860-12350879 MsG0480018955.01.T01:intron 30.0%
TGATCCAATCCTATAAAGAT+GGG + Chr4:12350198-12350217 None:intergenic 30.0%
TGGATCCAAGAATTTAGTAA+AGG + Chr4:12350574-12350593 None:intergenic 30.0%
TTCTATCATGGAGATATGTT+TGG - Chr4:12347541-12347560 MsG0480018955.01.T01:CDS 30.0%
TTGATCCAATCCTATAAAGA+TGG + Chr4:12350199-12350218 None:intergenic 30.0%
TTGTAAGTTATATCGAGGAA+CGG - Chr4:12350018-12350037 MsG0480018955.01.T01:intron 30.0%
! AAGCTGGTATCAATGTTTTT+GGG - Chr4:12347320-12347339 MsG0480018955.01.T01:CDS 30.0%
! AGACACTTTTCATGATTTTC+TGG - Chr4:12347567-12347586 MsG0480018955.01.T01:CDS 30.0%
! ATTCTAGAAATGCCAAATGT+AGG + Chr4:12350702-12350721 None:intergenic 30.0%
! GTTTCCAAACAATCTTTTCT+TGG + Chr4:12352931-12352950 None:intergenic 30.0%
! TCCTTTTCTGTTACATAGTT+TGG + Chr4:12348915-12348934 None:intergenic 30.0%
! TCTTTTCCAATTACTCTTTG+TGG + Chr4:12349525-12349544 None:intergenic 30.0%
! TTTTAGTGAACTTTCTAGAC+AGG - Chr4:12348405-12348424 MsG0480018955.01.T01:CDS 30.0%
!! AATGTTAACTTGTTCCCTTA+AGG + Chr4:12352765-12352784 None:intergenic 30.0%
!! ATCTCTTAATTTGTGCCTTA+AGG - Chr4:12352747-12352766 MsG0480018955.01.T01:CDS 30.0%
!! ATGCTATTTCCCATCTTTAT+AGG - Chr4:12350186-12350205 MsG0480018955.01.T01:intron 30.0%
!! CATAGTTGATGATGTATTAG+TGG - Chr4:12349062-12349081 MsG0480018955.01.T01:intron 30.0%
!! CTATGTTTGTTGTATTCTTG+AGG - Chr4:12350825-12350844 MsG0480018955.01.T01:intron 30.0%
!! CTTTTCAAGATTAGGTAAGT+AGG + Chr4:12353347-12353366 None:intergenic 30.0%
!! GGAGATTTTAAGTATCTTTC+AGG - Chr4:12353012-12353031 MsG0480018955.01.T01:CDS 30.0%
!! GTTTGATGATGTGAATGAAT+TGG - Chr4:12351699-12351718 MsG0480018955.01.T01:intron 30.0%
!! TCTCTTAATTTGTGCCTTAA+GGG - Chr4:12352748-12352767 MsG0480018955.01.T01:CDS 30.0%
!! TTGAAAATGGCACTTTTTGA+TGG + Chr4:12353605-12353624 None:intergenic 30.0%
!! TTGGAGAAGATAATGGAAAT+TGG - Chr4:12349374-12349393 MsG0480018955.01.T01:intron 30.0%
!!! GCGTGAGAATTTATTTTGTA+GGG + Chr4:12352513-12352532 None:intergenic 30.0%
!!! GTTTTAATTTTGGGGATATG+GGG - Chr4:12351434-12351453 MsG0480018955.01.T01:CDS 30.0%
!!! TGCGTGAGAATTTATTTTGT+AGG + Chr4:12352514-12352533 None:intergenic 30.0%
AAACTGTCCAAGTTTGTCTA+CGG - Chr4:12353378-12353397 MsG0480018955.01.T01:CDS 35.0%
AAAGACATTGGGGTAGTTAT+GGG - Chr4:12348103-12348122 MsG0480018955.01.T01:intron 35.0%
AAGAGCTTCCTTAAAGACAT+TGG - Chr4:12348091-12348110 MsG0480018955.01.T01:intron 35.0%
AAGCTAAAAGTAAGCTTCCA+TGG - Chr4:12352069-12352088 MsG0480018955.01.T01:CDS 35.0%
AATGGAAATTGGCAGAAACA+GGG - Chr4:12349385-12349404 MsG0480018955.01.T01:intron 35.0%
ACAGATGTGATTGCTTATTC+TGG - Chr4:12351931-12351950 MsG0480018955.01.T01:CDS 35.0%
ACAGGTAGTTGCTTATTCTA+GGG - Chr4:12348423-12348442 MsG0480018955.01.T01:CDS 35.0%
ACATATGCTTCTACCAAAAG+AGG + Chr4:12351205-12351224 None:intergenic 35.0%
ACATTGTACCTTCTCTTCTT+TGG + Chr4:12347232-12347251 None:intergenic 35.0%
ACTCTGTCCTATCTAACAAA+CGG + Chr4:12351331-12351350 None:intergenic 35.0%
AGAGAACTCTTTGATATTGG+TGG - Chr4:12349542-12349561 MsG0480018955.01.T01:intron 35.0%
AGAGCTTCCTTAAAGACATT+GGG - Chr4:12348092-12348111 MsG0480018955.01.T01:intron 35.0%
AGATGTGATTGCTTATTCTG+GGG - Chr4:12351933-12351952 MsG0480018955.01.T01:CDS 35.0%
AGGAAAAACTTTCCCAGAAT+AGG - Chr4:12351665-12351684 MsG0480018955.01.T01:intron 35.0%
AGTCATCTCAATACTTTCTC+CGG + Chr4:12347024-12347043 None:intergenic 35.0%
ATCTTTCAGGAGATCTTAAG+TGG - Chr4:12353025-12353044 MsG0480018955.01.T01:CDS 35.0%
ATGCATCTTCTTAGATTGTG+TGG - Chr4:12351796-12351815 MsG0480018955.01.T01:intron 35.0%
ATTGACGAGAATAACAAGCT+TGG - Chr4:12348736-12348755 MsG0480018955.01.T01:CDS 35.0%
CAAATTGGGAGCAAATTTGA+GGG - Chr4:12351503-12351522 MsG0480018955.01.T01:intron 35.0%
CAAGCCATTTACGATCAAAT+TGG - Chr4:12348052-12348071 MsG0480018955.01.T01:intron 35.0%
CAATTTGATCGTAAATGGCT+TGG + Chr4:12348054-12348073 None:intergenic 35.0%
CACAAAGTCATCAACATCAT+AGG - Chr4:12348152-12348171 MsG0480018955.01.T01:intron 35.0%
CAGATGTGATTGCTTATTCT+GGG - Chr4:12351932-12351951 MsG0480018955.01.T01:CDS 35.0%
CCTATTGTCAACAGTTACAA+GGG + Chr4:12352235-12352254 None:intergenic 35.0%
CTATTCCTCTCTTCAAAATG+CGG - Chr4:12349208-12349227 MsG0480018955.01.T01:CDS 35.0%
CTCTTGCTCTTAAAGAACTT+GGG - Chr4:12348452-12348471 MsG0480018955.01.T01:CDS 35.0%
CTTTATTGGGATGGACAAAA+AGG - Chr4:12352140-12352159 MsG0480018955.01.T01:CDS 35.0%
GAAATGATGAAGCAAAACAC+TGG + Chr4:12347071-12347090 None:intergenic 35.0%
GCAACACTATAGGATATGTT+GGG - Chr4:12350870-12350889 MsG0480018955.01.T01:intron 35.0%
GCATGATCTGTTAAGAGATA+TGG - Chr4:12352269-12352288 MsG0480018955.01.T01:CDS 35.0%
GGAAAAACTTTCCCAGAATA+GGG - Chr4:12351666-12351685 MsG0480018955.01.T01:intron 35.0%
GTGATTATTATTCTACTCCC+CGG + Chr4:12351766-12351785 None:intergenic 35.0%
TAAAAATTCTTAGGCCTTGG+TGG - Chr4:12349638-12349657 MsG0480018955.01.T01:intron 35.0%
TAAAGACATTGGGGTAGTTA+TGG - Chr4:12348102-12348121 MsG0480018955.01.T01:intron 35.0%
TAACTACCCCAATGTCTTTA+AGG + Chr4:12348102-12348121 None:intergenic 35.0%
TAATGGAAATTGGCAGAAAC+AGG - Chr4:12349384-12349403 MsG0480018955.01.T01:intron 35.0%
TAATTCTCCTACATGTGCAT+AGG + Chr4:12347778-12347797 None:intergenic 35.0%
TAGGTAAGTAGGAAAAGTCT+GGG + Chr4:12353336-12353355 None:intergenic 35.0%
TATCATGGAGATATGTTTGG+AGG - Chr4:12347544-12347563 MsG0480018955.01.T01:CDS 35.0%
TATGTAGAGATCCAATGCTA+CGG + Chr4:12353408-12353427 None:intergenic 35.0%
TATTCCTCTCTTCAAAATGC+GGG - Chr4:12349209-12349228 MsG0480018955.01.T01:CDS 35.0%
TATTTCACAGTCAGCCAAAT+AGG + Chr4:12351989-12352008 None:intergenic 35.0%
TCAAATTGGGAGCAAATTTG+AGG - Chr4:12351502-12351521 MsG0480018955.01.T01:intron 35.0%
TCATAAGGGATATGGGATAT+GGG - Chr4:12347997-12348016 MsG0480018955.01.T01:intron 35.0%
TCCAAGAATTTAGTAAAGGG+GGG + Chr4:12350570-12350589 None:intergenic 35.0%
TCCTATTGTCAACAGTTACA+AGG + Chr4:12352236-12352255 None:intergenic 35.0%
TCTGGATAGAATATCAATGG+AGG - Chr4:12347585-12347604 MsG0480018955.01.T01:CDS 35.0%
TGCGTAGCAAAATCTTCTTT+CGG + Chr4:12351907-12351926 None:intergenic 35.0%
TGCTAAAAATTCTTAGGCCT+TGG - Chr4:12349635-12349654 MsG0480018955.01.T01:intron 35.0%
TGTCTTCAAGGTTACTTATC+TGG + Chr4:12348702-12348721 None:intergenic 35.0%
TTAGAAAGCTCTTGTCTTCA+AGG + Chr4:12348714-12348733 None:intergenic 35.0%
TTAGGTAAGTAGGAAAAGTC+TGG + Chr4:12353337-12353356 None:intergenic 35.0%
TTGATATTGGTGGAATAGCA+GGG - Chr4:12349552-12349571 MsG0480018955.01.T01:intron 35.0%
TTTAATGATATCTCTCGCCA+TGG + Chr4:12348782-12348801 None:intergenic 35.0%
TTTGATATTGGTGGAATAGC+AGG - Chr4:12349551-12349570 MsG0480018955.01.T01:intron 35.0%
! AACAGAGTGGCAATATGTTT+TGG - Chr4:12352008-12352027 MsG0480018955.01.T01:CDS 35.0%
! AAGATACGTGATCTAGAATC+AGG - Chr4:12351628-12351647 MsG0480018955.01.T01:intron 35.0%
! ACCATGACAATTTTTGTACC+TGG + Chr4:12353161-12353180 None:intergenic 35.0%
! AGATACGTGATCTAGAATCA+GGG - Chr4:12351629-12351648 MsG0480018955.01.T01:intron 35.0%
! GAACTTGGGTTCTTTTTGTA+TGG - Chr4:12348466-12348485 MsG0480018955.01.T01:CDS 35.0%
! GAAGCTGGTATCAATGTTTT+TGG - Chr4:12347319-12347338 MsG0480018955.01.T01:CDS 35.0%
! TGCTTGTTTCTTTATTGGGA+TGG - Chr4:12352131-12352150 MsG0480018955.01.T01:CDS 35.0%
! TTAGAGGATCCCAATTTTGT+CGG + Chr4:12352458-12352477 None:intergenic 35.0%
! TTCAAATTCCTGGCAGATTT+TGG + Chr4:12347191-12347210 None:intergenic 35.0%
!! AAGCTTGTTATTCTCGTCAA+TGG + Chr4:12348737-12348756 None:intergenic 35.0%
!! AGCACAAGCTTTTCAAGATT+AGG + Chr4:12353355-12353374 None:intergenic 35.0%
!! AGCTGGTATCAATGTTTTTG+GGG - Chr4:12347321-12347340 MsG0480018955.01.T01:CDS 35.0%
!! CTTTTGGTAGAAGCATATGT+TGG - Chr4:12351205-12351224 MsG0480018955.01.T01:CDS 35.0%
!! CTTTTTGATGGCAGTCTTAT+CGG + Chr4:12353593-12353612 None:intergenic 35.0%
!! TTTTTGGTCCCGACAAAATT+GGG - Chr4:12352446-12352465 MsG0480018955.01.T01:CDS 35.0%
!!! ATGTTTTTGGGGACATTAAG+AGG - Chr4:12347332-12347351 MsG0480018955.01.T01:CDS 35.0%
!!! GTGGGTTTTTTGCTGATATT+GGG - Chr4:12352187-12352206 MsG0480018955.01.T01:CDS 35.0%
!!! TGTGGGTTTTTTGCTGATAT+TGG - Chr4:12352186-12352205 MsG0480018955.01.T01:CDS 35.0%
AAGATGGTGTATGCTAGAGT+TGG - Chr4:12349355-12349374 MsG0480018955.01.T01:intron 40.0%
AAGTCCTCTCATAAGGGATA+TGG - Chr4:12347989-12348008 MsG0480018955.01.T01:intron 40.0%
AATAACACTGATCAGGTGAG+TGG - Chr4:12348814-12348833 MsG0480018955.01.T01:CDS 40.0%
ACAATTATGGAACAAGTGCC+AGG - Chr4:12353140-12353159 MsG0480018955.01.T01:CDS 40.0%
ACACAAGAAGAACCCTATTC+TGG + Chr4:12351681-12351700 None:intergenic 40.0%
AGACATCTACTCAAGAAGCA+TGG - Chr4:12348283-12348302 MsG0480018955.01.T01:CDS 40.0%
AGGTAAGTAGGAAAAGTCTG+GGG + Chr4:12353335-12353354 None:intergenic 40.0%
AGTCCTCTCATAAGGGATAT+GGG - Chr4:12347990-12348009 MsG0480018955.01.T01:intron 40.0%
ATAAATTTGAGAGGCTGCAC+AGG - Chr4:12353439-12353458 MsG0480018955.01.T01:CDS 40.0%
ATAAGGGATATGGGATATGG+GGG - Chr4:12347999-12348018 MsG0480018955.01.T01:intron 40.0%
ATATATCAAACACCTCCCCA+TGG + Chr4:12352356-12352375 None:intergenic 40.0%
ATGCTTCTACCAAAAGAGGA+GGG + Chr4:12351201-12351220 None:intergenic 40.0%
ATGGAAATTGGCAGAAACAG+GGG - Chr4:12349386-12349405 MsG0480018955.01.T01:intron 40.0%
ATGTAGAGATCCAATGCTAC+GGG + Chr4:12353407-12353426 None:intergenic 40.0%
ATGTGCATAGGCCAAAAGAT+AGG + Chr4:12347766-12347785 None:intergenic 40.0%
ATTCCTCTCTTCAAAATGCG+GGG - Chr4:12349210-12349229 MsG0480018955.01.T01:CDS 40.0%
CAAACCATTTACGACTTCGT+GGG + Chr4:12348231-12348250 None:intergenic 40.0%
CACAAGAAGAACCCTATTCT+GGG + Chr4:12351680-12351699 None:intergenic 40.0%
CAGGTAGTTGCTTATTCTAG+GGG - Chr4:12348424-12348443 MsG0480018955.01.T01:CDS 40.0%
CATAAGGGATATGGGATATG+GGG - Chr4:12347998-12348017 MsG0480018955.01.T01:intron 40.0%
CATTCCTCATGATCAAGTAC+AGG - Chr4:12352044-12352063 MsG0480018955.01.T01:CDS 40.0%
CCCTTGTAACTGTTGACAAT+AGG - Chr4:12352232-12352251 MsG0480018955.01.T01:CDS 40.0%
CCTCTTGCTCTTAAAGAACT+TGG - Chr4:12348451-12348470 MsG0480018955.01.T01:CDS 40.0%
CGAAGTCGTAAATGGTTTGA+AGG - Chr4:12348232-12348251 MsG0480018955.01.T01:intron 40.0%
CTACTGATCCAAAGAAGAGA+AGG - Chr4:12347221-12347240 MsG0480018955.01.T01:CDS 40.0%
CTCATAAGGGATATGGGATA+TGG - Chr4:12347996-12348015 MsG0480018955.01.T01:intron 40.0%
CTCTGTCCTATCTAACAAAC+GGG + Chr4:12351330-12351349 None:intergenic 40.0%
CTGACTGTGAAATAACAGAG+TGG - Chr4:12351995-12352014 MsG0480018955.01.T01:CDS 40.0%
GAATGAATTGGAGCAGCTAA+AGG - Chr4:12351711-12351730 MsG0480018955.01.T01:intron 40.0%
GACAGGTAGTTGCTTATTCT+AGG - Chr4:12348422-12348441 MsG0480018955.01.T01:CDS 40.0%
GAGATCTTAAGTGGCTGTAT+TGG - Chr4:12353034-12353053 MsG0480018955.01.T01:CDS 40.0%
GAGCTTCCTTAAAGACATTG+GGG - Chr4:12348093-12348112 MsG0480018955.01.T01:intron 40.0%
GAGGGGTAAATCATCATCTT+GGG - Chr4:12350048-12350067 MsG0480018955.01.T01:intron 40.0%
GAGGTTTCAACATGTAGAAC+AGG - Chr4:12347351-12347370 MsG0480018955.01.T01:intron 40.0%
GATGTGATTGCTTATTCTGG+GGG - Chr4:12351934-12351953 MsG0480018955.01.T01:CDS 40.0%
GATGTGTTCTTGAGTTTCAG+AGG - Chr4:12349152-12349171 MsG0480018955.01.T01:intron 40.0%
GCAAAATCTTCTTTCGGACT+TGG + Chr4:12351901-12351920 None:intergenic 40.0%
GCCAGGTACAAAAATTGTCA+TGG - Chr4:12353157-12353176 MsG0480018955.01.T01:CDS 40.0%
GCTAGAGTTGGAGAAGATAA+TGG - Chr4:12349367-12349386 MsG0480018955.01.T01:intron 40.0%
GGAGCTACCTCATAAAATAC+TGG + Chr4:12349425-12349444 None:intergenic 40.0%
GGCAACACTATAGGATATGT+TGG - Chr4:12350869-12350888 MsG0480018955.01.T01:intron 40.0%
GTTTCAGAGGAGAAGACAAT+CGG - Chr4:12349165-12349184 MsG0480018955.01.T01:intron 40.0%
TAAATTCTTGGATCCATCCC+TGG - Chr4:12350578-12350597 MsG0480018955.01.T01:intron 40.0%
TATCCCATATCCCTTATGAG+AGG + Chr4:12347996-12348015 None:intergenic 40.0%
TATGCTTCTACCAAAAGAGG+AGG + Chr4:12351202-12351221 None:intergenic 40.0%
TCAAACCATTTACGACTTCG+TGG + Chr4:12348232-12348251 None:intergenic 40.0%
TCATACTCAAACCCGTATAC+AGG - Chr4:12347689-12347708 MsG0480018955.01.T01:CDS 40.0%
TCGTGACAATGGTGGTTAAA+CGG - Chr4:12350494-12350513 MsG0480018955.01.T01:intron 40.0%
TGAAAAATTGGAGGAGGACT+TGG - Chr4:12353537-12353556 MsG0480018955.01.T01:five_prime_UTR 40.0%
TGAAGTCCTTGGATCCTATT+TGG - Chr4:12351972-12351991 MsG0480018955.01.T01:CDS 40.0%
TGTTGGGTTTATACTAACGC+AGG - Chr4:12350886-12350905 MsG0480018955.01.T01:intron 40.0%
TTCTCCTGTACTTGATCATG+AGG + Chr4:12352051-12352070 None:intergenic 40.0%
TTTCAGAGGAGAAGACAATC+GGG - Chr4:12349166-12349185 MsG0480018955.01.T01:intron 40.0%
TTTGTTGCTGAACATCCAGT+GGG - Chr4:12351353-12351372 MsG0480018955.01.T01:CDS 40.0%
! AAATTCCTGGCAGATTTTGG+AGG + Chr4:12347188-12347207 None:intergenic 40.0%
! ACATCACCCGTTTGTTAGAT+AGG - Chr4:12351321-12351340 MsG0480018955.01.T01:CDS 40.0%
! ATTTGTTGCTGAACATCCAG+TGG - Chr4:12351352-12351371 MsG0480018955.01.T01:CDS 40.0%
! CCAAGTTCTTTAAGAGCAAG+AGG + Chr4:12348454-12348473 None:intergenic 40.0%
! CGTTGTGCCAGTATTTTATG+AGG - Chr4:12349415-12349434 MsG0480018955.01.T01:intron 40.0%
! GAACAACCAAATCTGAGGTT+CGG + Chr4:12347492-12347511 None:intergenic 40.0%
! TAGAGGATCCCAATTTTGTC+GGG + Chr4:12352457-12352476 None:intergenic 40.0%
! TATAGTTCTCCCTCCTCTTT+TGG - Chr4:12351189-12351208 MsG0480018955.01.T01:CDS 40.0%
! TGAAAGAGAAGCACAGGAAT+CGG + Chr4:12351126-12351145 None:intergenic 40.0%
! TGGGTTCTTTTTGTATGGAG+AGG - Chr4:12348471-12348490 MsG0480018955.01.T01:CDS 40.0%
! TGTGTGTGTGTGTGATTTTG+AGG - Chr4:12348848-12348867 MsG0480018955.01.T01:CDS 40.0%
!! AATTTTGGGGATATGGGGAA+TGG - Chr4:12351439-12351458 MsG0480018955.01.T01:CDS 40.0%
!! ATTTTGGGGATATGGGGAAT+GGG - Chr4:12351440-12351459 MsG0480018955.01.T01:CDS 40.0%
!! CTTCTTAACTTGTGCCCTTA+GGG + Chr4:12352626-12352645 None:intergenic 40.0%
!! TGTGTTAACTTGTGCCCTAA+GGG - Chr4:12352609-12352628 MsG0480018955.01.T01:intron 40.0%
!! TTGTGTTAACTTGTGCCCTA+AGG - Chr4:12352608-12352627 MsG0480018955.01.T01:intron 40.0%
!!! GTTTTTGGTCCCGACAAAAT+TGG - Chr4:12352445-12352464 MsG0480018955.01.T01:CDS 40.0%
AAGAAGACAAGCTCATGACC+TGG - Chr4:12347620-12347639 MsG0480018955.01.T01:CDS 45.0%
AGAAGACAAGCTCATGACCT+GGG - Chr4:12347621-12347640 MsG0480018955.01.T01:CDS 45.0%
AGATTTGACACTGGGTGTAC+AGG + Chr4:12347931-12347950 None:intergenic 45.0%
AGGCAGAACAACCAAATCTG+AGG + Chr4:12347497-12347516 None:intergenic 45.0%
AGGGGAATGGAAAAAGGCTA+GGG - Chr4:12350442-12350461 MsG0480018955.01.T01:intron 45.0%
AGTCAGCCAAATAGGATCCA+AGG + Chr4:12351981-12352000 None:intergenic 45.0%
AGTTTCTGCGCTCAAGACAA+GGG - Chr4:12347259-12347278 MsG0480018955.01.T01:CDS 45.0%
CTTCTTGTGGAGTTGTTGCT+TGG + Chr4:12348384-12348403 None:intergenic 45.0%
GAAAGTCTTCGTGACAATGG+TGG - Chr4:12350486-12350505 MsG0480018955.01.T01:intron 45.0%
GAAGTGAAGGAAGACATGGA+TGG + Chr4:12347163-12347182 None:intergenic 45.0%
GAGGCTCTTAGTTTAGAAGC+TGG - Chr4:12347304-12347323 MsG0480018955.01.T01:CDS 45.0%
GCCCCCCTTTACTAAATTCT+TGG - Chr4:12350566-12350585 MsG0480018955.01.T01:intron 45.0%
GGAGGGGTAAATCATCATCT+TGG - Chr4:12350047-12350066 MsG0480018955.01.T01:intron 45.0%
GGTTTGTCCTCATAGATTCC+AGG - Chr4:12349573-12349592 MsG0480018955.01.T01:intron 45.0%
GTCGAAAGTCTTCGTGACAA+TGG - Chr4:12350483-12350502 MsG0480018955.01.T01:intron 45.0%
GTTCTGCCTGTGTTCTATCA+AGG - Chr4:12347508-12347527 MsG0480018955.01.T01:CDS 45.0%
TAGGGGAATGGAAAAAGGCT+AGG - Chr4:12350441-12350460 MsG0480018955.01.T01:intron 45.0%
TATATCGAGGAACGGATGCT+GGG - Chr4:12350026-12350045 MsG0480018955.01.T01:intron 45.0%
TCATGTTCTGCTACAAGCCA+TGG - Chr4:12348762-12348781 MsG0480018955.01.T01:CDS 45.0%
TGAAATTCTGCAGGAACGCA+GGG + Chr4:12353075-12353094 None:intergenic 45.0%
TGCACACCAGATTTGACACT+GGG + Chr4:12347939-12347958 None:intergenic 45.0%
TGTACACCCAGTGTCAAATC+TGG - Chr4:12347930-12347949 MsG0480018955.01.T01:intron 45.0%
TGTTCTTTCGTGTCTCGAAG+AGG - Chr4:12347285-12347304 MsG0480018955.01.T01:CDS 45.0%
TTATATCGAGGAACGGATGC+TGG - Chr4:12350025-12350044 MsG0480018955.01.T01:intron 45.0%
TTGCACACCAGATTTGACAC+TGG + Chr4:12347940-12347959 None:intergenic 45.0%
TTGGGAGCAAATTTGAGGGA+AGG - Chr4:12351507-12351526 MsG0480018955.01.T01:intron 45.0%
! ATCGTAAATGGCTTGGGCAA+TGG + Chr4:12348047-12348066 None:intergenic 45.0%
! CTTAAGTGGCTGTATTGGCA+TGG - Chr4:12353039-12353058 MsG0480018955.01.T01:CDS 45.0%
! CTTGCTTGCTGAAATTCTGC+AGG + Chr4:12353084-12353103 None:intergenic 45.0%
! CTTTTGGCCTATGCACATGT+AGG - Chr4:12347768-12347787 MsG0480018955.01.T01:intron 45.0%
! GGGAAATGAAAGAGAAGCAC+AGG + Chr4:12351132-12351151 None:intergenic 45.0%
! TCTAGAGCTTCTTGTAGTCG+TGG + Chr4:12348553-12348572 None:intergenic 45.0%
!! AATCCCCGCATTTTGAAGAG+AGG + Chr4:12349216-12349235 None:intergenic 45.0%
!! ATGGAGAGGAAGCACTTAAG+TGG - Chr4:12348485-12348504 MsG0480018955.01.T01:CDS 45.0%
!! GATTTTGGAGGAGGAAGTGA+AGG + Chr4:12347176-12347195 None:intergenic 45.0%
!! GCTTCTTAACTTGTGCCCTT+AGG + Chr4:12352627-12352646 None:intergenic 45.0%
!! TTTTGGGGATATGGGGAATG+GGG - Chr4:12351441-12351460 MsG0480018955.01.T01:CDS 45.0%
!!! ATTCAAAATTTTATATTTAA+AGG + Chr4:12352574-12352593 None:intergenic 5.0%
AACAGAAGCTGTCAAGGGAC+TGG - Chr4:12352894-12352913 MsG0480018955.01.T01:intron 50.0%
AATTGGCAGAAACAGGGGTC+TGG - Chr4:12349391-12349410 MsG0480018955.01.T01:intron 50.0%
ACACGAGATTCTACACCCAC+TGG + Chr4:12351371-12351390 None:intergenic 50.0%
AGTGGGTGTAGAATCTCGTG+TGG - Chr4:12351370-12351389 MsG0480018955.01.T01:CDS 50.0%
ATATGGGGGATGACAGGGAT+TGG - Chr4:12348013-12348032 MsG0480018955.01.T01:intron 50.0%
ATGGGATATGGGGGATGACA+GGG - Chr4:12348008-12348027 MsG0480018955.01.T01:intron 50.0%
CACAACCTACTGCGTTTCTC+AGG + Chr4:12352330-12352349 None:intergenic 50.0%
CAGATCCTGAGAAACGCAGT+AGG - Chr4:12352322-12352341 MsG0480018955.01.T01:CDS 50.0%
CAGGGAACAGAAGCTGTCAA+GGG - Chr4:12352889-12352908 MsG0480018955.01.T01:intron 50.0%
CCAAGGACTTCAAGTGCTAG+TGG + Chr4:12351964-12351983 None:intergenic 50.0%
CCACTAGCACTTGAAGTCCT+TGG - Chr4:12351961-12351980 MsG0480018955.01.T01:CDS 50.0%
CTGAAATTCTGCAGGAACGC+AGG + Chr4:12353076-12353095 None:intergenic 50.0%
CTGAGAAACGCAGTAGGTTG+TGG - Chr4:12352328-12352347 MsG0480018955.01.T01:CDS 50.0%
CTGCGTTTCTCAGGATCTGA+TGG + Chr4:12352321-12352340 None:intergenic 50.0%
CTTTGTGTGGTAGCCGTGAT+TGG - Chr4:12351734-12351753 MsG0480018955.01.T01:intron 50.0%
GACGATGACGAGATTCAACG+AGG - Chr4:12349248-12349267 MsG0480018955.01.T01:CDS 50.0%
GAGTTTCTGCGCTCAAGACA+AGG - Chr4:12347258-12347277 MsG0480018955.01.T01:CDS 50.0%
GCCATCAGGAAGGTCAGTTT+GGG - Chr4:12349456-12349475 MsG0480018955.01.T01:intron 50.0%
GCGACACCTTGATAGAACAC+AGG + Chr4:12347517-12347536 None:intergenic 50.0%
GGAGGAAGTGAAGGAAGACA+TGG + Chr4:12347167-12347186 None:intergenic 50.0%
GTGTTGCCGAACCTCAGATT+TGG - Chr4:12347483-12347502 MsG0480018955.01.T01:CDS 50.0%
TATGGGATATGGGGGATGAC+AGG - Chr4:12348007-12348026 MsG0480018955.01.T01:intron 50.0%
TCAGATTGCTTCGCCTTGCT+GGG - Chr4:12352977-12352996 MsG0480018955.01.T01:CDS 50.0%
TCAGGGAACAGAAGCTGTCA+AGG - Chr4:12352888-12352907 MsG0480018955.01.T01:intron 50.0%
TCCCAAACTGACCTTCCTGA+TGG + Chr4:12349460-12349479 None:intergenic 50.0%
TGTGCCCACGAAGTCGTAAA+TGG - Chr4:12348224-12348243 MsG0480018955.01.T01:intron 50.0%
TTCCTCCTCCAAAATCTGCC+AGG - Chr4:12347180-12347199 MsG0480018955.01.T01:CDS 50.0%
TTGTAGTCGTGGAGCTGGAA+TGG + Chr4:12348542-12348561 None:intergenic 50.0%
TTTAGTGATCGCTGCTACCC+AGG + Chr4:12347641-12347660 None:intergenic 50.0%
TTTGGGGATATGGGGAATGG+GGG - Chr4:12351442-12351461 MsG0480018955.01.T01:CDS 50.0%
! ATATGGGGAATGGGGGGTAT+GGG - Chr4:12351449-12351468 MsG0480018955.01.T01:CDS 50.0%
! GAGCAGCTAAAGGCTTTGTG+TGG - Chr4:12351721-12351740 MsG0480018955.01.T01:intron 50.0%
! GGCAGTCTTATCGGCAATCA+AGG + Chr4:12353584-12353603 None:intergenic 50.0%
! TCAGAAGTACGCCATCAGGA+AGG - Chr4:12349446-12349465 MsG0480018955.01.T01:intron 50.0%
! TCCATCAGAAGTACGCCATC+AGG - Chr4:12349442-12349461 MsG0480018955.01.T01:intron 50.0%
! TCCTGATGGCGTACTTCTGA+TGG + Chr4:12349446-12349465 None:intergenic 50.0%
! TGTGGTAGCCGTGATTGGTT+TGG - Chr4:12351739-12351758 MsG0480018955.01.T01:intron 50.0%
!! TAGCCGTGATTGGTTTGGTC+CGG - Chr4:12351744-12351763 MsG0480018955.01.T01:intron 50.0%
!! TTCCTGGCAGATTTTGGAGG+AGG + Chr4:12347185-12347204 None:intergenic 50.0%
CAGATTGCTTCGCCTTGCTG+GGG - Chr4:12352978-12352997 MsG0480018955.01.T01:CDS 55.0%
CGCCATCAGGAAGGTCAGTT+TGG - Chr4:12349455-12349474 MsG0480018955.01.T01:intron 55.0%
CGGGAGACCGTAGACAAACT+TGG + Chr4:12353388-12353407 None:intergenic 55.0%
CTCAGATTGCTTCGCCTTGC+TGG - Chr4:12352976-12352995 MsG0480018955.01.T01:CDS 55.0%
CTTGCTGGGGTGAAGCTGAA+GGG - Chr4:12352991-12353010 MsG0480018955.01.T01:CDS 55.0%
GATATGGGGAATGGGGGGTA+TGG - Chr4:12351448-12351467 MsG0480018955.01.T01:CDS 55.0%
GCTTCTTGTAGTCGTGGAGC+TGG + Chr4:12348547-12348566 None:intergenic 55.0%
GGAGGAGGACTTGGAACAGA+TGG - Chr4:12353546-12353565 MsG0480018955.01.T01:five_prime_UTR 55.0%
TCCCCGGACCAAACCAATCA+CGG + Chr4:12351750-12351769 None:intergenic 55.0%
TCTACGGTCTCCCGTAGCAT+TGG - Chr4:12353394-12353413 MsG0480018955.01.T01:CDS 55.0%
TGAGAGGCTGCACAGGTCTT+CGG - Chr4:12353446-12353465 MsG0480018955.01.T01:CDS 55.0%
TTGGGGATATGGGGAATGGG+GGG - Chr4:12351443-12351462 MsG0480018955.01.T01:CDS 55.0%
!! AGCCGTGATTGGTTTGGTCC+GGG - Chr4:12351745-12351764 MsG0480018955.01.T01:intron 55.0%
!! AGCTGTCAAGGGACTGGCTT+TGG - Chr4:12352900-12352919 MsG0480018955.01.T01:intron 55.0%
!! GGTGTCGCTCCCTTCTATCA+TGG - Chr4:12347529-12347548 MsG0480018955.01.T01:CDS 55.0%
ATCGAGGAACGGATGCTGGG+AGG - Chr4:12350029-12350048 MsG0480018955.01.T01:intron 60.0%
CAGTAGGTTGTGGCGCCATG+GGG - Chr4:12352338-12352357 MsG0480018955.01.T01:CDS 60.0%
CCTTCAGCTTCACCCCAGCA+AGG + Chr4:12352993-12353012 None:intergenic 60.0%
CCTTGCTGGGGTGAAGCTGA+AGG - Chr4:12352990-12353009 MsG0480018955.01.T01:CDS 60.0%
GCAGTAGGTTGTGGCGCCAT+GGG - Chr4:12352337-12352356 MsG0480018955.01.T01:CDS 60.0%
TCGAGGAACGGATGCTGGGA+GGG - Chr4:12350030-12350049 MsG0480018955.01.T01:intron 60.0%
!! GCCGTGATTGGTTTGGTCCG+GGG - Chr4:12351746-12351765 MsG0480018955.01.T01:intron 60.0%
CGAGGAACGGATGCTGGGAG+GGG - Chr4:12350031-12350050 MsG0480018955.01.T01:intron 65.0%
CGCAGTAGGTTGTGGCGCCA+TGG - Chr4:12352336-12352355 MsG0480018955.01.T01:CDS 65.0%
TAGGTTGTGGCGCCATGGGG+AGG - Chr4:12352341-12352360 MsG0480018955.01.T01:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr4 gene 12347012 12353627 12347012 ID=MsG0480018955.01;Name=MsG0480018955.01
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Chr4 exon 12347012 12347362 12347012 ID=MsG0480018955.01.T01:exon:7731;Parent=MsG0480018955.01.T01
Chr4 exon 12347478 12347747 12347478 ID=MsG0480018955.01.T01:exon:7730;Parent=MsG0480018955.01.T01
Chr4 exon 12348250 12348995 12348250 ID=MsG0480018955.01.T01:exon:7729;Parent=MsG0480018955.01.T01
Chr4 exon 12349169 12349353 12349169 ID=MsG0480018955.01.T01:exon:7728;Parent=MsG0480018955.01.T01
Chr4 exon 12351066 12351499 12351066 ID=MsG0480018955.01.T01:exon:7727;Parent=MsG0480018955.01.T01
Chr4 exon 12351811 12352610 12351811 ID=MsG0480018955.01.T01:exon:7726;Parent=MsG0480018955.01.T01
Chr4 exon 12352688 12352803 12352688 ID=MsG0480018955.01.T01:exon:7725;Parent=MsG0480018955.01.T01
Chr4 exon 12352929 12353627 12352929 ID=MsG0480018955.01.T01:exon:7724;Parent=MsG0480018955.01.T01
Chr4 five_prime_UTR 12353474 12353627 12353474 ID=MsG0480018955.01.T01:five_prime_utr;Parent=MsG0480018955.01.T01
Chr4 CDS 12352929 12353473 12352929 ID=MsG0480018955.01.T01:cds;Parent=MsG0480018955.01.T01
Chr4 CDS 12352688 12352803 12352688 ID=MsG0480018955.01.T01:cds;Parent=MsG0480018955.01.T01
Chr4 CDS 12351811 12352610 12351811 ID=MsG0480018955.01.T01:cds;Parent=MsG0480018955.01.T01
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Chr4 CDS 12347012 12347362 12347012 ID=MsG0480018955.01.T01:cds;Parent=MsG0480018955.01.T01
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