AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0480023813.01

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MsG0480023813.01.T01 AT5G02860 23.986 296 216 4 145 435 490 781 2.64e-19 92.0
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MsG0480023813.01.T01 AT1G77405 27.362 307 190 8 189 487 137 418 6.33e-24 105
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MsG0480023813.01.T01 AT3G54980 25.714 280 203 2 117 395 561 836 5.69e-23 103
MsG0480023813.01.T01 AT3G54980 24.171 422 290 9 89 502 88 487 1.49e-22 102
MsG0480023813.01.T01 AT3G54980 25.000 216 161 1 161 375 636 851 4.11e-19 91.7
MsG0480023813.01.T01 AT3G54980 25.369 339 244 4 134 467 367 701 2.47e-30 126
MsG0480023813.01.T01 AT3G54980 24.316 329 237 4 154 471 514 841 3.38e-28 119
MsG0480023813.01.T01 AT3G54980 25.402 311 229 3 161 469 460 769 3.60e-28 119
MsG0480023813.01.T01 AT3G54980 25.723 346 252 4 149 491 238 581 1.08e-25 112
MsG0480023813.01.T01 AT3G54980 25.714 280 203 2 117 395 561 836 5.69e-23 103
MsG0480023813.01.T01 AT3G54980 24.171 422 290 9 89 502 88 487 1.49e-22 102
MsG0480023813.01.T01 AT3G54980 25.000 216 161 1 161 375 636 851 4.11e-19 91.7
MsG0480023813.01.T01 AT1G31840 25.143 350 231 4 110 459 464 782 2.98e-30 125
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MsG0480023813.01.T01 AT1G52620 25.758 330 204 4 174 463 235 563 1.36e-24 108
MsG0480023813.01.T01 AT1G52620 23.939 330 247 3 109 436 347 674 1.78e-23 105
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MsG0480023813.01.T01 AT5G14080 22.477 436 263 12 67 463 41 440 7.59e-18 87.4
MsG0480023813.01.T01 AT5G14080 28.856 201 135 3 252 447 328 525 1.84e-15 79.7
MsG0480023813.01.T01 AT5G14080 24.066 241 181 2 172 411 286 525 2.12e-15 79.7
MsG0480023813.01.T01 AT4G01030 22.772 303 226 3 173 475 118 412 7.60e-18 87.4
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MsG0480023813.01.T01 AT3G53170 23.077 273 199 4 83 349 225 492 3.84e-11 65.9
MsG0480023813.01.T01 AT1G14470 24.727 275 195 5 144 416 263 527 8.58e-18 87.0
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MsG0480023813.01.T01 AT1G25360 23.841 302 197 9 186 480 329 604 1.47e-12 70.9
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MsG0480023813.01.T01 AT1G05750 22.857 315 219 10 191 501 121 415 1.95e-12 70.1
MsG0480023813.01.T01 AT1G11900 22.222 207 160 1 211 416 140 346 2.03e-12 69.3
MsG0480023813.01.T01 AT3G47530 21.257 334 232 9 117 432 145 465 2.30e-12 70.1
MsG0480023813.01.T01 AT2G29760 22.626 358 222 13 166 486 256 595 2.58e-12 70.1
MsG0480023813.01.T01 AT3G24000 22.684 313 215 9 198 500 215 510 2.84e-12 69.7
MsG0480023813.01.T01 AT1G60770 20.677 266 176 2 170 435 81 311 3.27e-12 69.3
MsG0480023813.01.T01 AT3G23330 21.569 306 229 5 150 453 213 509 5.00e-12 68.9
MsG0480023813.01.T01 AT3G28660 22.984 248 175 8 198 441 171 406 5.14e-12 68.6
MsG0480023813.01.T01 AT5G50390 24.567 289 192 7 219 501 265 533 5.49e-12 68.9
MsG0480023813.01.T01 AT3G23330 21.569 306 229 5 150 453 104 400 5.67e-12 68.6
MsG0480023813.01.T01 AT1G76280 22.261 283 195 3 147 425 406 667 5.85e-12 68.9
MsG0480023813.01.T01 AT4G18520 27.461 193 131 4 217 409 424 607 6.06e-12 68.6
MsG0480023813.01.T01 AT5G36300 23.232 198 126 3 271 467 103 275 7.44e-12 67.0
MsG0480023813.01.T01 AT5G36300 22.275 211 157 4 246 453 9 215 4.69e-11 64.7
MsG0480023813.01.T01 AT1G80270 22.335 197 142 2 215 407 300 489 8.82e-12 68.2
MsG0480023813.01.T01 AT1G80270 22.335 197 142 2 215 407 300 489 8.82e-12 68.2
MsG0480023813.01.T01 AT1G80270 22.335 197 142 2 215 407 300 489 8.82e-12 68.2
MsG0480023813.01.T01 AT1G80270 22.335 197 142 2 215 407 300 489 8.82e-12 68.2
MsG0480023813.01.T01 AT1G80270 22.335 197 142 2 215 407 300 489 8.82e-12 68.2
MsG0480023813.01.T01 AT4G04790 22.741 343 216 9 113 450 307 605 8.83e-12 68.2
MsG0480023813.01.T01 AT2G34400 23.333 300 202 9 161 450 114 395 8.93e-12 68.2
MsG0480023813.01.T01 AT5G08305 21.563 371 244 8 150 485 79 437 9.90e-12 67.8
MsG0480023813.01.T01 AT4G04790 22.741 343 216 9 113 450 303 601 1.05e-11 68.2
MsG0480023813.01.T01 AT4G04790 21.930 342 220 7 113 450 170 468 1.24e-11 67.8
MsG0480023813.01.T01 AT2G27610 20.124 323 241 8 142 462 359 666 1.29e-11 67.8
MsG0480023813.01.T01 AT5G15980 19.194 422 265 8 59 456 239 608 1.48e-11 67.4
MsG0480023813.01.T01 AT5G27300 26.601 203 131 7 88 278 121 317 1.54e-11 66.6
MsG0480023813.01.T01 AT1G09190 22.015 268 193 7 197 461 85 339 1.60e-11 67.0
MsG0480023813.01.T01 AT5G27300 26.768 198 127 7 93 278 126 317 1.69e-11 67.0
MsG0480023813.01.T01 AT1G10270 24.427 262 160 6 197 434 305 552 1.79e-11 67.4
MsG0480023813.01.T01 AT1G10270 24.038 208 155 3 252 457 184 390 5.05e-11 65.9
MsG0480023813.01.T01 AT4G22760 22.295 305 215 7 177 479 232 516 1.86e-11 67.0
MsG0480023813.01.T01 AT5G27300 26.768 198 127 7 93 278 151 342 1.91e-11 67.0
MsG0480023813.01.T01 AT1G06270 26.042 192 136 3 300 490 153 339 2.23e-11 65.9
MsG0480023813.01.T01 AT1G26900 22.887 284 202 8 187 467 170 439 2.23e-11 66.6
MsG0480023813.01.T01 AT1G11290 22.687 335 241 6 150 479 207 528 2.80e-11 66.6
MsG0480023813.01.T01 AT2G37310 23.592 284 198 6 198 480 288 553 3.25e-11 66.2
MsG0480023813.01.T01 AT1G08070 21.257 334 213 9 181 476 166 487 3.58e-11 66.2
MsG0480023813.01.T01 AT4G14190 27.128 188 128 4 277 455 122 309 3.82e-11 65.9
MsG0480023813.01.T01 AT1G08070 20.958 334 214 9 181 476 62 383 4.52e-11 65.9
MsG0480023813.01.T01 AT2G36730 22.823 333 215 11 133 450 71 376 4.97e-11 65.5
MsG0480023813.01.T01 AT2G01510 22.508 311 216 7 150 450 80 375 5.48e-11 65.5
MsG0480023813.01.T01 AT2G01510 22.508 311 216 7 150 450 80 375 5.48e-11 65.5
MsG0480023813.01.T01 AT2G21090 22.327 318 192 11 178 458 219 518 6.35e-11 65.5
MsG0480023813.01.T01 AT5G06540 23.256 301 216 7 190 488 194 481 6.70e-11 65.5
MsG0480023813.01.T01 AT1G15480 23.387 248 171 6 215 454 298 534 6.72e-11 65.5
MsG0480023813.01.T01 AT5G59600 24.696 247 158 8 224 462 65 291 6.98e-11 65.1
MsG0480023813.01.T01 AT4G21880 24.434 221 148 6 239 450 415 625 7.04e-11 65.5
MsG0480023813.01.T01 AT3G60040 30.935 139 91 1 260 398 482 615 7.55e-11 65.1
MsG0480023813.01.T01 AT4G21880 24.434 221 148 6 239 450 371 581 8.61e-11 65.1
MsG0480023813.01.T01 AT3G60040 30.935 139 91 1 260 398 702 835 9.03e-11 65.1
MsG0480023813.01.T01 AT3G03580 22.384 344 213 10 150 488 279 573 9.13e-11 65.1
MsG0480023813.01.T01 AT3G60040 30.935 139 91 1 260 398 701 834 9.18e-11 65.1

Find 105 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 116 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CAGCTCACAGATTCTTTCTT+TGG 0.115268 4:+90107808 MsG0480023813.01.T01:CDS
ACTTACAGCATTCTGATTAA+TGG 0.166765 4:+90108185 MsG0480023813.01.T01:CDS
TCATAATATTTGCCAATTCT+TGG 0.216663 4:-90109021 None:intergenic
ATAATGTGCATTCAGCTTTC+GGG 0.248731 4:+90108432 MsG0480023813.01.T01:CDS
GCTATTGGGCTTAGGGCTTT+TGG 0.274952 4:+90108946 MsG0480023813.01.T01:CDS
TCTTTGGGCTAAATCAATTC+CGG 0.290045 4:+90107824 MsG0480023813.01.T01:CDS
GCGACTTTGTAAGATTAAAA+AGG 0.290684 4:+90108520 MsG0480023813.01.T01:CDS
TTTGTTAGAATGGATGAATT+TGG 0.295393 4:+90108041 MsG0480023813.01.T01:CDS
TTGACAAGGCAACTGAAGTT+TGG 0.296143 4:+90108753 MsG0480023813.01.T01:CDS
AATAATGTGCATTCAGCTTT+CGG 0.297164 4:+90108431 MsG0480023813.01.T01:CDS
TGCATATAATAATTTGTTAG+AGG 0.299811 4:+90108289 MsG0480023813.01.T01:CDS
CACATATTGGTAGAAATCTT+AGG 0.301294 4:+90107873 MsG0480023813.01.T01:CDS
AGCTCACAGATTCTTTCTTT+GGG 0.306613 4:+90107809 MsG0480023813.01.T01:CDS
TGGAATCAAGCCGAGTATTA+TGG 0.307428 4:+90108061 MsG0480023813.01.T01:CDS
GCGATCATTGTGAGGTCAAT+AGG 0.321344 4:+90108633 MsG0480023813.01.T01:CDS
ATCAACAGATTTAGTTGAAC+AGG 0.340494 4:+90107755 MsG0480023813.01.T01:CDS
AATGCTAAGGAATCGGCTAT+TGG 0.350363 4:+90108931 MsG0480023813.01.T01:CDS
TAAGCAATTCGCCATACTTT+GGG 0.351729 4:+90107902 MsG0480023813.01.T01:CDS
TGACAAGGCAACTGAAGTTT+GGG 0.368145 4:+90108754 MsG0480023813.01.T01:CDS
GATATCTCATTGACAAGTTC+AGG 0.369417 4:-90107660 None:intergenic
TATAAGAAAATCCCAAAGTA+TGG 0.369758 4:-90107913 None:intergenic
CTTTGGGCTAAATCAATTCC+GGG 0.370888 4:+90107825 MsG0480023813.01.T01:CDS
ATCATGTTCAATCCAAGAAT+TGG 0.379147 4:+90109009 MsG0480023813.01.T01:CDS
CTAAGCAATTCGCCATACTT+TGG 0.381128 4:+90107901 MsG0480023813.01.T01:CDS
CAATTGTATGTAAACACATT+TGG 0.381621 4:-90108488 None:intergenic
TGGTTCTTAAATTATTGATC+AGG 0.384507 4:+90108720 MsG0480023813.01.T01:CDS
TAAGAACCATGTTATATGTA+TGG 0.394677 4:-90108706 None:intergenic
ACATATTCCGTCATGATTCA+TGG 0.396327 4:+90108815 MsG0480023813.01.T01:CDS
TGATGAAAGCTTCCACATAT+TGG 0.396884 4:+90107860 MsG0480023813.01.T01:CDS
AGGAATCGGCTATTGGGCTT+AGG 0.408499 4:+90108938 MsG0480023813.01.T01:CDS
TTGACAAGTTCAGGTAATAA+TGG 0.413443 4:-90107651 None:intergenic
ATGCTAAGGAATCGGCTATT+GGG 0.417277 4:+90108932 MsG0480023813.01.T01:CDS
GCATTATAACTCCAAGTGTC+TGG 0.417527 4:-90108593 None:intergenic
GGCGCAGAAATTTGTTGGGT+TGG 0.417607 4:-90107630 None:intergenic
GAATTGGCAAATATTATGAT+TGG 0.419943 4:+90109025 MsG0480023813.01.T01:CDS
ATGTTATATGTATGGCGATC+AGG 0.426579 4:-90108698 None:intergenic
TTGAAAAGGTGCAATCATCT+TGG 0.435051 4:+90107780 MsG0480023813.01.T01:CDS
ATGTAAACACATTTGGCAAA+AGG 0.442381 4:-90108481 None:intergenic
ATGGGGTAAGATTGGTGATT+CGG 0.444816 4:+90108208 MsG0480023813.01.T01:CDS
ATAAATTTGTGTTGAACAAG+AGG 0.446419 4:-90107597 None:intergenic
TATGCTTAGAGAAAAGTGAT+TGG 0.449171 4:-90107551 None:intergenic
TCATGGTCTTTGCAAGAAGA+AGG 0.455210 4:+90108832 MsG0480023813.01.T01:CDS
GGAATCGGCTATTGGGCTTA+GGG 0.461104 4:+90108939 MsG0480023813.01.T01:CDS
CGATCATTGTGAGGTCAATA+GGG 0.461554 4:+90108634 MsG0480023813.01.T01:CDS
ATAATGGCGCAGAAATTTGT+TGG 0.467942 4:-90107635 None:intergenic
CTAAGATTTCTACCAATATG+TGG 0.469332 4:-90107872 None:intergenic
TAATGGCGCAGAAATTTGTT+GGG 0.470549 4:-90107634 None:intergenic
CAGCATTCTGATTAATGGAT+GGG 0.477148 4:+90108190 MsG0480023813.01.T01:CDS
CCATCGAAATGCTAAGGAAT+CGG 0.479128 4:+90108924 MsG0480023813.01.T01:CDS
TGTGTTGAACAAGAGGGAAA+AGG 0.483476 4:-90107590 None:intergenic
GGAAGAAGCATATCAATTGT+TGG 0.497461 4:+90108544 MsG0480023813.01.T01:CDS
ATTAATGGATGGGGTAAGAT+TGG 0.502011 4:+90108200 MsG0480023813.01.T01:CDS
ATTTGCCAGACGGTGCAATT+CGG 0.505265 4:+90108015 MsG0480023813.01.T01:CDS
TACTTCGAGACGTGACGACT+CGG 0.506920 4:+90109066 MsG0480023813.01.T01:CDS
AGGCCATGTGGACGAAGCTA+TGG 0.509199 4:+90108325 MsG0480023813.01.T01:CDS
ATTGAGTAAGTAAAAGCATC+CGG 0.513237 4:-90108383 None:intergenic
ATTTCGATGGTAGTGTCATA+AGG 0.514262 4:-90108911 None:intergenic
CTAAGTCATGGCGAGGGTGG+CGG 0.514641 4:-90107701 None:intergenic
ACAGCATTCTGATTAATGGA+TGG 0.514783 4:+90108189 MsG0480023813.01.T01:CDS
TCTGAAGTTAATATCTAGAA+TGG 0.530712 4:+90108658 MsG0480023813.01.T01:CDS
AACAAGAGGGAAAAGGTAAG+AGG 0.535229 4:-90107583 None:intergenic
AAAGACCGAATTGCACCGTC+TGG 0.535524 4:-90108020 None:intergenic
CATGGTCTTTGCAAGAAGAA+GGG 0.537066 4:+90108833 MsG0480023813.01.T01:CDS
TTGGATGAAATGATTTCTAG+TGG 0.542781 4:+90108563 MsG0480023813.01.T01:CDS
AATTATTGATCAGGATAGGA+AGG 0.546162 4:+90108729 MsG0480023813.01.T01:CDS
TTTGAGATGATGATTGATGA+AGG 0.550997 4:+90108881 MsG0480023813.01.T01:CDS
CTTAAATTATTGATCAGGAT+AGG 0.551203 4:+90108725 MsG0480023813.01.T01:CDS
TAAATTTGTGTTGAACAAGA+GGG 0.553612 4:-90107596 None:intergenic
TTGTTAGAGGCTCTTTGCAA+AGG 0.556447 4:+90108302 MsG0480023813.01.T01:CDS
TTAGAGGCTCTTTGCAAAGG+AGG 0.557569 4:+90108305 MsG0480023813.01.T01:CDS
GTTGTCAAAGAAAGTTGAGC+CGG 0.558890 4:+90108364 MsG0480023813.01.T01:CDS
AATCCATAGCTTCGTCCACA+TGG 0.574399 4:-90108328 None:intergenic
TAATGTGCATTCAGCTTTCG+GGG 0.575387 4:+90108433 MsG0480023813.01.T01:CDS
AGCATTCTGATTAATGGATG+GGG 0.575596 4:+90108191 MsG0480023813.01.T01:CDS
CCGATTCCTTAGCATTTCGA+TGG 0.577946 4:-90108924 None:intergenic
ATGGTCTTTGCAAGAAGAAG+GGG 0.579385 4:+90108834 MsG0480023813.01.T01:CDS
TAAGATTGGTGATTCGGAGA+AGG 0.581078 4:+90108214 MsG0480023813.01.T01:CDS
CTGAAGTTTGGGAAAGCATG+AGG 0.581337 4:+90108765 MsG0480023813.01.T01:CDS
CACCGTCTGGCAAATCAGCT+CGG 0.583964 4:-90108007 None:intergenic
ACACTACCATCGAAATGCTA+AGG 0.585401 4:+90108918 MsG0480023813.01.T01:CDS
GTGGATTAAAACCAGACACT+TGG 0.585960 4:+90108582 MsG0480023813.01.T01:CDS
TTAGAGAGAGTTCTAAGTCA+TGG 0.588803 4:-90107713 None:intergenic
AGCCGAGCTGATTTGCCAGA+CGG 0.592550 4:+90108005 MsG0480023813.01.T01:CDS
CATTGTGTCAAACAGCTCAC+GGG 0.593688 4:-90108237 None:intergenic
AAATCAACATCCATAATACT+CGG 0.595500 4:-90108071 None:intergenic
GAGAGTTCTAAGTCATGGCG+AGG 0.600492 4:-90107708 None:intergenic
ACGGAATATGTCGAGACAGA+AGG 0.602354 4:-90108803 None:intergenic
TTGCTGCTAAGATGAGGCAG+AGG 0.602626 4:+90108984 MsG0480023813.01.T01:CDS
GCATTGTGTCAAACAGCTCA+CGG 0.604635 4:-90108238 None:intergenic
TCATCACTATGCTGAAAACC+CGG 0.616037 4:-90107843 None:intergenic
AAATACTTGCTGCTAAGATG+AGG 0.623468 4:+90108978 MsG0480023813.01.T01:CDS
TGACCTCACAATGATCGCAA+TGG 0.625250 4:-90108628 None:intergenic
AGAGTTCTAAGTCATGGCGA+GGG 0.627598 4:-90107707 None:intergenic
CAAGAAGAAGGGGAAGCTAG+AGG 0.629838 4:+90108844 MsG0480023813.01.T01:CDS
TGAAGTTTGGGAAAGCATGA+GGG 0.631948 4:+90108766 MsG0480023813.01.T01:CDS
CAGGATAGGAAGGTTTGACA+AGG 0.643664 4:+90108739 MsG0480023813.01.T01:CDS
TTACCATTGCGATCATTGTG+AGG 0.651001 4:+90108625 MsG0480023813.01.T01:CDS
GCAAAGACCATGAATCATGA+CGG 0.651226 4:-90108822 None:intergenic
GTTCTAAGTCATGGCGAGGG+TGG 0.651674 4:-90107704 None:intergenic
TTTGACACAATGCTTGAGCA+AGG 0.654693 4:+90108248 MsG0480023813.01.T01:CDS
TGATCGCCATACATATAACA+TGG 0.664145 4:+90108700 MsG0480023813.01.T01:CDS
GAAGAAGGGGAAGCTAGAGG+AGG 0.685923 4:+90108847 MsG0480023813.01.T01:CDS
TCGATGGTAGTGTCATAAGG+TGG 0.694454 4:-90108908 None:intergenic
GCTTGAGCAAGGATGTCATG+TGG 0.713822 4:+90108259 MsG0480023813.01.T01:CDS
TCTTTGCAAAGGAGGCCATG+TGG 0.743721 4:+90108313 MsG0480023813.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! GTTGATATTTGTGTTAAAAA+TGG - Chr4:90107741-90107760 None:intergenic 20.0%
!!! TGCATATAATAATTTGTTAG+AGG + Chr4:90108289-90108308 MsG0480023813.01.T01:CDS 20.0%
! AAATCAACATCCATAATACT+CGG - Chr4:90108074-90108093 None:intergenic 25.0%
! ACTTTGTAAGATTAAAAAGG+TGG + Chr4:90108523-90108542 MsG0480023813.01.T01:CDS 25.0%
! ATAAATTTGTGTTGAACAAG+AGG - Chr4:90107600-90107619 None:intergenic 25.0%
! CAATTGTATGTAAACACATT+TGG - Chr4:90108491-90108510 None:intergenic 25.0%
! CTTAAATTATTGATCAGGAT+AGG + Chr4:90108725-90108744 MsG0480023813.01.T01:CDS 25.0%
! GAATTGGCAAATATTATGAT+TGG + Chr4:90109025-90109044 MsG0480023813.01.T01:CDS 25.0%
! TAAATTTGTGTTGAACAAGA+GGG - Chr4:90107599-90107618 None:intergenic 25.0%
! TAAGAACCATGTTATATGTA+TGG - Chr4:90108709-90108728 None:intergenic 25.0%
! TATAAGAAAATCCCAAAGTA+TGG - Chr4:90107916-90107935 None:intergenic 25.0%
! TCATAATATTTGCCAATTCT+TGG - Chr4:90109024-90109043 None:intergenic 25.0%
! TGGTTCTTAAATTATTGATC+AGG + Chr4:90108720-90108739 MsG0480023813.01.T01:CDS 25.0%
! TTTGTTAGAATGGATGAATT+TGG + Chr4:90108041-90108060 MsG0480023813.01.T01:CDS 25.0%
!! AAATCACTAATGAGATTTTC+TGG + Chr4:90107964-90107983 MsG0480023813.01.T01:CDS 25.0%
!! ATATCTAGAATGGAAAAAGA+TGG + Chr4:90108668-90108687 MsG0480023813.01.T01:CDS 25.0%
!! GGATTTTCTTATAGAAATGA+GGG + Chr4:90107923-90107942 MsG0480023813.01.T01:CDS 25.0%
!! TCTGAAGTTAATATCTAGAA+TGG + Chr4:90108658-90108677 MsG0480023813.01.T01:CDS 25.0%
AATAATGTGCATTCAGCTTT+CGG + Chr4:90108431-90108450 MsG0480023813.01.T01:CDS 30.0%
AATTATTGATCAGGATAGGA+AGG + Chr4:90108729-90108748 MsG0480023813.01.T01:CDS 30.0%
ACTTACAGCATTCTGATTAA+TGG + Chr4:90108185-90108204 MsG0480023813.01.T01:CDS 30.0%
ATCAACAGATTTAGTTGAAC+AGG + Chr4:90107755-90107774 MsG0480023813.01.T01:CDS 30.0%
ATCATGTTCAATCCAAGAAT+TGG + Chr4:90109009-90109028 MsG0480023813.01.T01:CDS 30.0%
ATGTAAACACATTTGGCAAA+AGG - Chr4:90108484-90108503 None:intergenic 30.0%
CACATATTGGTAGAAATCTT+AGG + Chr4:90107873-90107892 MsG0480023813.01.T01:CDS 30.0%
CTAAGATTTCTACCAATATG+TGG - Chr4:90107875-90107894 None:intergenic 30.0%
GCGACTTTGTAAGATTAAAA+AGG + Chr4:90108520-90108539 MsG0480023813.01.T01:CDS 30.0%
TATGCTTAGAGAAAAGTGAT+TGG - Chr4:90107554-90107573 None:intergenic 30.0%
TTGACAAGTTCAGGTAATAA+TGG - Chr4:90107654-90107673 None:intergenic 30.0%
! AATTCGGTCTTTTGTTAGAA+TGG + Chr4:90108031-90108050 MsG0480023813.01.T01:CDS 30.0%
! GGGATTTTCTTATAGAAATG+AGG + Chr4:90107922-90107941 MsG0480023813.01.T01:CDS 30.0%
! TTGGATGAAATGATTTCTAG+TGG + Chr4:90108563-90108582 MsG0480023813.01.T01:CDS 30.0%
! TTTGAGATGATGATTGATGA+AGG + Chr4:90108881-90108900 MsG0480023813.01.T01:CDS 30.0%
! TTTTTGCGGTTAACAAGAAA+CGG - Chr4:90108166-90108185 None:intergenic 30.0%
!! ATTGAGTAAGTAAAAGCATC+CGG - Chr4:90108386-90108405 None:intergenic 30.0%
!!! TAGTTGAACAGGTTTTGAAA+AGG + Chr4:90107766-90107785 MsG0480023813.01.T01:CDS 30.0%
ACAGCATTCTGATTAATGGA+TGG + Chr4:90108189-90108208 MsG0480023813.01.T01:CDS 35.0%
ACATATTCCGTCATGATTCA+TGG + Chr4:90108815-90108834 MsG0480023813.01.T01:CDS 35.0%
AGCTCACAGATTCTTTCTTT+GGG + Chr4:90107809-90107828 MsG0480023813.01.T01:CDS 35.0%
ATAATGGCGCAGAAATTTGT+TGG - Chr4:90107638-90107657 None:intergenic 35.0%
ATAATGTGCATTCAGCTTTC+GGG + Chr4:90108432-90108451 MsG0480023813.01.T01:CDS 35.0%
ATGTTATATGTATGGCGATC+AGG - Chr4:90108701-90108720 None:intergenic 35.0%
CAAAAAGAAACATGTCAAGC+AGG + Chr4:90108112-90108131 MsG0480023813.01.T01:CDS 35.0%
GATATCTCATTGACAAGTTC+AGG - Chr4:90107663-90107682 None:intergenic 35.0%
TAAGCAATTCGCCATACTTT+GGG + Chr4:90107902-90107921 MsG0480023813.01.T01:CDS 35.0%
TCTTTGGGCTAAATCAATTC+CGG + Chr4:90107824-90107843 MsG0480023813.01.T01:CDS 35.0%
TGATCGCCATACATATAACA+TGG + Chr4:90108700-90108719 MsG0480023813.01.T01:CDS 35.0%
TGATGAAAGCTTCCACATAT+TGG + Chr4:90107860-90107879 MsG0480023813.01.T01:CDS 35.0%
! AAATACTTGCTGCTAAGATG+AGG + Chr4:90108978-90108997 MsG0480023813.01.T01:CDS 35.0%
! AGCATTCTGATTAATGGATG+GGG + Chr4:90108191-90108210 MsG0480023813.01.T01:CDS 35.0%
! ATTAATGGATGGGGTAAGAT+TGG + Chr4:90108200-90108219 MsG0480023813.01.T01:CDS 35.0%
! ATTTCGATGGTAGTGTCATA+AGG - Chr4:90108914-90108933 None:intergenic 35.0%
! CAGAATGCTGTAAGTTTTTG+CGG - Chr4:90108180-90108199 None:intergenic 35.0%
! CAGCATTCTGATTAATGGAT+GGG + Chr4:90108190-90108209 MsG0480023813.01.T01:CDS 35.0%
! GGAAGAAGCATATCAATTGT+TGG + Chr4:90108544-90108563 MsG0480023813.01.T01:CDS 35.0%
! TAATGGCGCAGAAATTTGTT+GGG - Chr4:90107637-90107656 None:intergenic 35.0%
! TTGAAAAGGTGCAATCATCT+TGG + Chr4:90107780-90107799 MsG0480023813.01.T01:CDS 35.0%
!! TTAGAGAGAGTTCTAAGTCA+TGG - Chr4:90107716-90107735 None:intergenic 35.0%
AACAAGAGGGAAAAGGTAAG+AGG - Chr4:90107586-90107605 None:intergenic 40.0%
AATGCTAAGGAATCGGCTAT+TGG + Chr4:90108931-90108950 MsG0480023813.01.T01:CDS 40.0%
ACACTACCATCGAAATGCTA+AGG + Chr4:90108918-90108937 MsG0480023813.01.T01:CDS 40.0%
ATGCTAAGGAATCGGCTATT+GGG + Chr4:90108932-90108951 MsG0480023813.01.T01:CDS 40.0%
ATGGTCTTTGCAAGAAGAAG+GGG + Chr4:90108834-90108853 MsG0480023813.01.T01:CDS 40.0%
CAGCTCACAGATTCTTTCTT+TGG + Chr4:90107808-90107827 MsG0480023813.01.T01:CDS 40.0%
CATGGTCTTTGCAAGAAGAA+GGG + Chr4:90108833-90108852 MsG0480023813.01.T01:CDS 40.0%
CCATCGAAATGCTAAGGAAT+CGG + Chr4:90108924-90108943 MsG0480023813.01.T01:CDS 40.0%
CGATCATTGTGAGGTCAATA+GGG + Chr4:90108634-90108653 MsG0480023813.01.T01:CDS 40.0%
CTAAGCAATTCGCCATACTT+TGG + Chr4:90107901-90107920 MsG0480023813.01.T01:CDS 40.0%
CTTTGGGCTAAATCAATTCC+GGG + Chr4:90107825-90107844 MsG0480023813.01.T01:CDS 40.0%
GCAAAGACCATGAATCATGA+CGG - Chr4:90108825-90108844 None:intergenic 40.0%
GCATTATAACTCCAAGTGTC+TGG - Chr4:90108596-90108615 None:intergenic 40.0%
GTTGTCAAAGAAAGTTGAGC+CGG + Chr4:90108364-90108383 MsG0480023813.01.T01:CDS 40.0%
TAATGTGCATTCAGCTTTCG+GGG + Chr4:90108433-90108452 MsG0480023813.01.T01:CDS 40.0%
TCATCACTATGCTGAAAACC+CGG - Chr4:90107846-90107865 None:intergenic 40.0%
TCATGGTCTTTGCAAGAAGA+AGG + Chr4:90108832-90108851 MsG0480023813.01.T01:CDS 40.0%
TGACAAGGCAACTGAAGTTT+GGG + Chr4:90108754-90108773 MsG0480023813.01.T01:CDS 40.0%
TGGAATCAAGCCGAGTATTA+TGG + Chr4:90108061-90108080 MsG0480023813.01.T01:CDS 40.0%
TGTGTTGAACAAGAGGGAAA+AGG - Chr4:90107593-90107612 None:intergenic 40.0%
TTACCATTGCGATCATTGTG+AGG + Chr4:90108625-90108644 MsG0480023813.01.T01:CDS 40.0%
TTGACAAGGCAACTGAAGTT+TGG + Chr4:90108753-90108772 MsG0480023813.01.T01:CDS 40.0%
TTGTTAGAGGCTCTTTGCAA+AGG + Chr4:90108302-90108321 MsG0480023813.01.T01:CDS 40.0%
TTTGACACAATGCTTGAGCA+AGG + Chr4:90108248-90108267 MsG0480023813.01.T01:CDS 40.0%
! ATGGGGTAAGATTGGTGATT+CGG + Chr4:90108208-90108227 MsG0480023813.01.T01:CDS 40.0%
! GTGGATTAAAACCAGACACT+TGG + Chr4:90108582-90108601 MsG0480023813.01.T01:CDS 40.0%
! TAAGATTGGTGATTCGGAGA+AGG + Chr4:90108214-90108233 MsG0480023813.01.T01:CDS 40.0%
! TGAAGTTTGGGAAAGCATGA+GGG + Chr4:90108766-90108785 MsG0480023813.01.T01:CDS 40.0%
AATCCATAGCTTCGTCCACA+TGG - Chr4:90108331-90108350 None:intergenic 45.0%
ACGGAATATGTCGAGACAGA+AGG - Chr4:90108806-90108825 None:intergenic 45.0%
ATTTGCCAGACGGTGCAATT+CGG + Chr4:90108015-90108034 MsG0480023813.01.T01:CDS 45.0%
CAGGATAGGAAGGTTTGACA+AGG + Chr4:90108739-90108758 MsG0480023813.01.T01:CDS 45.0%
CATTGTGTCAAACAGCTCAC+GGG - Chr4:90108240-90108259 None:intergenic 45.0%
CCGATTCCTTAGCATTTCGA+TGG - Chr4:90108927-90108946 None:intergenic 45.0%
GCATTGTGTCAAACAGCTCA+CGG - Chr4:90108241-90108260 None:intergenic 45.0%
GCGATCATTGTGAGGTCAAT+AGG + Chr4:90108633-90108652 MsG0480023813.01.T01:CDS 45.0%
TGACCTCACAATGATCGCAA+TGG - Chr4:90108631-90108650 None:intergenic 45.0%
TTAGAGGCTCTTTGCAAAGG+AGG + Chr4:90108305-90108324 MsG0480023813.01.T01:CDS 45.0%
! CTGAAGTTTGGGAAAGCATG+AGG + Chr4:90108765-90108784 MsG0480023813.01.T01:CDS 45.0%
! TCGATGGTAGTGTCATAAGG+TGG - Chr4:90108911-90108930 None:intergenic 45.0%
!! AGAGTTCTAAGTCATGGCGA+GGG - Chr4:90107710-90107729 None:intergenic 45.0%
AAAGACCGAATTGCACCGTC+TGG - Chr4:90108023-90108042 None:intergenic 50.0%
AGGAATCGGCTATTGGGCTT+AGG + Chr4:90108938-90108957 MsG0480023813.01.T01:CDS 50.0%
CAAGAAGAAGGGGAAGCTAG+AGG + Chr4:90108844-90108863 MsG0480023813.01.T01:CDS 50.0%
GCTTGAGCAAGGATGTCATG+TGG + Chr4:90108259-90108278 MsG0480023813.01.T01:CDS 50.0%
GGAATCGGCTATTGGGCTTA+GGG + Chr4:90108939-90108958 MsG0480023813.01.T01:CDS 50.0%
TACTTCGAGACGTGACGACT+CGG + Chr4:90109066-90109085 MsG0480023813.01.T01:CDS 50.0%
TCTTTGCAAAGGAGGCCATG+TGG + Chr4:90108313-90108332 MsG0480023813.01.T01:CDS 50.0%
TTGCTGCTAAGATGAGGCAG+AGG + Chr4:90108984-90109003 MsG0480023813.01.T01:CDS 50.0%
! GCTATTGGGCTTAGGGCTTT+TGG + Chr4:90108946-90108965 MsG0480023813.01.T01:CDS 50.0%
!! GAGAGTTCTAAGTCATGGCG+AGG - Chr4:90107711-90107730 None:intergenic 50.0%
!! GGCGCAGAAATTTGTTGGGT+TGG - Chr4:90107633-90107652 None:intergenic 50.0%
AGGCCATGTGGACGAAGCTA+TGG + Chr4:90108325-90108344 MsG0480023813.01.T01:CDS 55.0%
CACCGTCTGGCAAATCAGCT+CGG - Chr4:90108010-90108029 None:intergenic 55.0%
GAAGAAGGGGAAGCTAGAGG+AGG + Chr4:90108847-90108866 MsG0480023813.01.T01:CDS 55.0%
! GTTCTAAGTCATGGCGAGGG+TGG - Chr4:90107707-90107726 None:intergenic 55.0%
!! AGCCGAGCTGATTTGCCAGA+CGG + Chr4:90108005-90108024 MsG0480023813.01.T01:CDS 55.0%
CTAAGTCATGGCGAGGGTGG+CGG - Chr4:90107704-90107723 None:intergenic 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr4 gene 90107543 90109105 90107543 ID=MsG0480023813.01;Name=MsG0480023813.01
Chr4 mRNA 90107543 90109105 90107543 ID=MsG0480023813.01.T01;Parent=MsG0480023813.01;Name=MsG0480023813.01.T01;_AED=0.27;_eAED=0.27;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|520
Chr4 exon 90107543 90109105 90107543 ID=MsG0480023813.01.T01:exon:8105;Parent=MsG0480023813.01.T01
Chr4 CDS 90107543 90109105 90107543 ID=MsG0480023813.01.T01:cds;Parent=MsG0480023813.01.T01
Gene Sequence

>MsG0480023813.01.T01

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Protein sequence

>MsG0480023813.01.T01

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