AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0580029431.01

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MsG0580029431.01.T01 AT3G25010 26.591 707 344 20 8 615 206 836 5.20e-31 131
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MsG0580029431.01.T01 AT1G71390 26.783 687 385 20 2 644 80 692 2.07e-32 135
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MsG0580029431.01.T01 AT2G34930 28.466 678 362 24 215 782 64 728 1.98e-35 145
MsG0580029431.01.T01 AT2G15042 45.062 324 158 8 552 865 96 409 6.27e-74 249
MsG0580029431.01.T01 AT2G15042 28.758 306 193 12 18 318 41 326 3.37e-13 73.2
MsG0580029431.01.T01 AT2G15042 28.014 282 174 10 259 532 59 319 5.16e-12 69.3
MsG0580029431.01.T01 AT2G15042 27.542 236 144 6 129 342 96 326 1.16e-11 68.6
MsG0580029431.01.T01 AT2G15042 25.392 319 190 9 327 644 55 326 3.05e-11 67.0
MsG0580029431.01.T01 AT5G46330 30.182 825 438 24 4 803 73 784 9.93e-70 252
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MsG0580029431.01.T01 AT5G46330 30.182 825 438 24 4 803 73 784 9.93e-70 252
MsG0580029431.01.T01 AT5G46330 27.830 424 251 13 369 782 70 448 7.48e-24 108
MsG0580029431.01.T01 AT3G23010 35.992 514 281 12 263 756 6 491 2.51e-67 234
MsG0580029431.01.T01 AT3G23010 28.125 384 210 7 66 393 8 381 8.68e-22 100
MsG0580029431.01.T01 AT3G23010 26.835 436 258 12 1 409 89 490 1.19e-19 94.0
MsG0580029431.01.T01 AT3G23010 26.303 422 222 14 376 781 1 349 1.56e-18 90.5
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MsG0580029431.01.T01 AT1G74180 30.189 477 217 17 8 385 420 879 4.21e-19 93.6
MsG0580029431.01.T01 AT1G74180 27.830 212 129 5 571 779 118 308 2.15e-13 75.1
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MsG0580029431.01.T01 AT5G65700 30.303 561 302 16 4 513 70 592 1.80e-39 159
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MsG0580029431.01.T01 AT4G39400 27.821 647 389 16 2 594 121 743 1.90e-34 143
MsG0580029431.01.T01 AT4G39400 31.183 465 243 13 355 782 105 529 5.80e-28 122
MsG0580029431.01.T01 AT4G39400 29.535 430 218 10 8 386 370 765 1.08e-25 115
MsG0580029431.01.T01 AT4G39400 30.346 491 309 15 8 485 274 744 1.47e-22 104
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MsG0580029431.01.T01 AT1G28440 31.829 421 264 10 8 409 161 577 6.89e-34 140
MsG0580029431.01.T01 AT1G28440 28.130 583 348 16 5 575 62 585 1.78e-31 133
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MsG0580029431.01.T01 AT5G23400 28.814 413 228 11 28 386 179 579 4.43e-22 102
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MsG0580029431.01.T01 AT1G34110 32.234 546 327 15 8 536 144 663 8.80e-34 140
MsG0580029431.01.T01 AT1G34110 28.257 591 327 16 143 650 101 677 1.84e-32 136
MsG0580029431.01.T01 AT1G34110 34.826 402 250 6 13 412 294 685 7.96e-30 128
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MsG0580029431.01.T01 AT1G09970 34.271 391 225 10 25 391 191 573 2.43e-27 120
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MsG0580029431.01.T01 AT1G65380 28.291 509 235 17 147 533 111 611 7.05e-28 121
MsG0580029431.01.T01 AT1G65380 30.103 485 252 13 9 446 201 645 1.95e-25 113
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MsG0580029431.01.T01 AT1G65380 29.245 424 212 11 362 781 64 403 8.11e-20 95.5
MsG0580029431.01.T01 AT5G49660 32.439 410 236 9 8 411 150 524 4.12e-38 154
MsG0580029431.01.T01 AT5G49660 27.083 576 326 20 337 860 83 616 3.47e-29 125
MsG0580029431.01.T01 AT5G49660 31.429 350 192 11 5 323 221 553 5.05e-22 102
MsG0580029431.01.T01 AT5G49660 28.276 435 257 11 397 782 73 501 9.09e-21 99.0
MsG0580029431.01.T01 AT4G28490 30.368 517 294 12 4 491 115 594 5.80e-38 154
MsG0580029431.01.T01 AT4G28490 30.325 554 312 18 306 802 70 606 1.31e-35 146
MsG0580029431.01.T01 AT4G28490 30.517 580 327 18 55 617 66 586 1.74e-33 139
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MsG0580029431.01.T01 AT3G47580 29.472 587 333 17 245 803 82 615 2.87e-36 148
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MsG0580029431.01.T01 AT3G02130 27.403 697 377 23 217 824 132 788 6.98e-28 122
MsG0580029431.01.T01 AT3G02130 26.158 669 424 23 7 646 120 747 8.65e-27 118
MsG0580029431.01.T01 AT3G02130 27.788 565 323 18 161 647 122 679 1.24e-24 111
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MsG0580029431.01.T01 AT5G10020 30.969 423 237 12 8 391 104 510 8.24e-22 102
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MsG0580029431.01.T01 AT3G51740 31.956 363 221 13 209 559 100 448 2.11e-21 100
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MsG0580029431.01.T01 AT1G62950 28.855 454 256 14 372 810 98 499 1.82e-30 129
MsG0580029431.01.T01 AT1G62950 30.137 438 266 12 215 644 69 474 2.51e-30 129
MsG0580029431.01.T01 AT1G62950 31.888 392 230 13 167 539 82 455 2.40e-26 116
MsG0580029431.01.T01 AT1G62950 31.317 463 213 17 133 544 97 505 2.98e-26 116
MsG0580029431.01.T01 AT1G62950 33.434 332 193 7 8 318 150 474 1.38e-24 110
MsG0580029431.01.T01 AT1G62950 26.720 378 247 12 26 381 118 487 1.10e-17 89.0
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MsG0580029431.01.T01 AT1G34420 33.568 426 241 9 8 432 186 570 2.00e-29 126
MsG0580029431.01.T01 AT1G34420 28.697 568 296 20 227 782 105 575 4.67e-27 119
MsG0580029431.01.T01 AT1G34420 33.263 472 281 17 27 488 132 579 6.68e-26 115
MsG0580029431.01.T01 AT1G34420 29.481 424 262 11 372 783 108 506 2.61e-22 103
MsG0580029431.01.T01 AT1G34420 29.288 379 232 10 448 815 136 489 6.92e-20 95.9
MsG0580029431.01.T01 AT1G34420 28.909 339 196 10 13 348 285 581 2.23e-16 84.7
MsG0580029431.01.T01 AT5G12940 35.918 245 148 4 193 433 122 361 5.82e-30 123
MsG0580029431.01.T01 AT5G12940 32.234 273 153 7 217 484 97 342 1.06e-19 92.4
MsG0580029431.01.T01 AT5G12940 33.184 223 146 3 144 365 121 341 3.02e-19 91.3
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MsG0580029431.01.T01 AT1G29730 26.510 298 143 11 467 757 122 350 1.99e-11 68.6
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MsG0580029431.01.T01 AT2G27060 31.549 355 202 15 8 336 221 560 3.53e-15 80.9
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MsG0580029431.01.T01 AT4G39270 27.796 313 161 7 53 363 125 374 5.19e-12 70.1
MsG0580029431.01.T01 AT4G39270 26.087 230 125 4 554 782 127 312 5.26e-11 67.0
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MsG0580029431.01.T01 AT2G27060 28.144 501 264 18 351 807 2 450 2.01e-19 94.4
MsG0580029431.01.T01 AT2G27060 31.549 355 202 15 8 336 128 467 3.78e-15 80.5
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MsG0580029431.01.T01 AT4G22730 35.329 167 106 2 135 300 70 235 8.94e-14 75.5
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MsG0580029431.01.T01 AT1G03440 27.106 273 172 4 193 442 87 355 3.68e-16 82.0
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MsG0580029431.01.T01 AT5G16590 29.801 151 103 1 230 380 64 211 3.29e-11 67.4
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MsG0580029431.01.T01 AT4G28380 28.571 224 113 3 186 362 95 318 3.25e-15 79.3
MsG0580029431.01.T01 AT3G57830 42.500 120 62 3 698 813 121 237 1.55e-15 81.6
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MsG0580029431.01.T01 AT4G30520 44.211 95 53 0 224 318 96 190 2.06e-13 74.7
MsG0580029431.01.T01 AT4G30520 31.073 177 113 3 692 865 100 270 2.18e-11 68.2
MsG0580029431.01.T01 AT5G48380 32.597 181 106 4 681 860 88 253 2.25e-13 74.3
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MsG0580029431.01.T01 AT1G49750 30.568 229 150 7 124 348 187 410 4.46e-13 73.2
MsG0580029431.01.T01 AT1G49750 30.151 199 116 2 135 311 224 421 8.42e-12 68.9
MsG0580029431.01.T01 AT3G50230 42.063 126 69 3 241 365 86 208 4.78e-13 73.6
MsG0580029431.01.T01 AT3G50230 34.228 149 75 2 684 810 90 237 8.65e-11 66.2
MsG0580029431.01.T01 AT1G11130 33.333 192 118 4 210 397 50 235 4.82e-13 73.6
MsG0580029431.01.T01 AT3G50230 42.063 126 69 3 241 365 98 220 5.38e-13 73.6
MsG0580029431.01.T01 AT3G50230 34.228 149 75 2 684 810 102 249 8.61e-11 66.2
MsG0580029431.01.T01 AT2G26730 39.552 134 77 2 210 342 71 201 5.43e-13 73.2
MsG0580029431.01.T01 AT2G26730 35.211 142 68 3 692 812 90 228 7.86e-11 66.2
MsG0580029431.01.T01 AT1G28340 40.000 115 67 1 698 810 426 540 5.81e-13 73.2
MsG0580029431.01.T01 AT1G69550 32.659 346 199 10 24 351 903 1232 5.98e-13 73.6
MsG0580029431.01.T01 AT5G06870 28.030 264 143 7 548 811 114 330 8.61e-13 70.9
MsG0580029431.01.T01 AT5G06870 34.348 230 141 6 169 392 81 306 2.75e-12 69.3
MsG0580029431.01.T01 AT5G24100 34.646 127 83 0 270 396 90 216 9.57e-13 72.4
MsG0580029431.01.T01 AT5G16000 37.190 121 68 2 692 810 104 218 1.15e-12 72.4
MsG0580029431.01.T01 AT5G16000 40.777 103 61 0 216 318 92 194 1.62e-11 68.6
MsG0580029431.01.T01 AT3G08680 36.076 158 91 5 702 857 125 274 1.25e-12 72.0
MsG0580029431.01.T01 AT3G08680 36.076 158 91 5 702 857 125 274 1.25e-12 72.0
MsG0580029431.01.T01 AT3G02880 35.032 157 92 5 211 365 51 199 1.59e-12 71.6
MsG0580029431.01.T01 AT1G11130 34.810 158 101 1 240 397 2 157 1.65e-12 72.0
MsG0580029431.01.T01 AT2G13790 37.168 113 70 1 230 342 76 187 1.75e-12 71.6
MsG0580029431.01.T01 AT2G13790 37.168 113 70 1 207 319 77 188 2.51e-12 71.2
MsG0580029431.01.T01 AT2G13790 41.748 103 59 1 698 800 104 205 5.45e-12 70.1
MsG0580029431.01.T01 AT5G37450 37.419 155 69 5 167 319 3 131 1.76e-12 72.0
MsG0580029431.01.T01 AT1G10850 32.911 158 96 3 692 847 117 266 1.76e-12 71.6
MsG0580029431.01.T01 AT5G10290 47.126 87 46 0 696 782 73 159 1.97e-12 71.6
MsG0580029431.01.T01 AT5G10290 40.171 117 70 0 186 302 75 191 3.78e-11 67.4
MsG0580029431.01.T01 AT5G10290 47.126 87 46 0 696 782 73 159 1.97e-12 71.6
MsG0580029431.01.T01 AT5G10290 40.171 117 70 0 186 302 75 191 3.78e-11 67.4
MsG0580029431.01.T01 AT1G53730 30.909 165 109 3 229 391 71 232 2.02e-12 71.6
MsG0580029431.01.T01 AT1G53730 30.909 165 109 3 229 391 71 232 2.07e-12 71.6
MsG0580029431.01.T01 AT5G45780 32.911 158 95 3 702 857 69 217 2.60e-12 70.9
MsG0580029431.01.T01 AT5G45780 32.911 158 95 3 702 857 112 260 2.79e-12 70.9
MsG0580029431.01.T01 AT3G22800 27.778 216 132 4 560 761 130 335 3.11e-12 70.5
MsG0580029431.01.T01 AT3G22800 27.917 240 146 6 186 399 104 342 6.66e-12 69.3
MsG0580029431.01.T01 AT1G27190 40.310 129 74 2 681 808 84 210 4.74e-12 70.1
MsG0580029431.01.T01 AT4G23740 35.484 155 95 4 253 402 68 222 5.63e-12 70.1
MsG0580029431.01.T01 AT4G23740 35.484 155 95 4 253 402 68 222 5.63e-12 70.1
MsG0580029431.01.T01 AT3G42880 36.250 160 86 3 700 858 121 265 6.26e-12 69.7
MsG0580029431.01.T01 AT3G28450 36.296 135 84 2 186 319 83 216 6.97e-12 69.7
MsG0580029431.01.T01 AT3G28450 36.975 119 74 1 693 810 102 220 8.00e-12 69.3
MsG0580029431.01.T01 AT4G03390 28.492 179 124 4 133 311 74 248 7.52e-12 69.7
MsG0580029431.01.T01 AT4G03390 28.492 179 124 4 133 311 74 248 7.52e-12 69.7
MsG0580029431.01.T01 AT5G05160 34.194 155 97 3 177 328 69 221 8.53e-12 69.3
MsG0580029431.01.T01 AT3G49750 39.669 121 68 1 693 808 97 217 9.92e-12 67.0
MsG0580029431.01.T01 AT3G49750 35.156 128 83 0 217 344 61 188 5.32e-11 64.7
MsG0580029431.01.T01 AT1G48480 37.063 143 83 4 177 318 71 207 1.03e-11 69.3
MsG0580029431.01.T01 AT1G48480 35.971 139 83 3 207 343 74 208 2.27e-11 68.2
MsG0580029431.01.T01 AT5G20690 32.515 163 88 6 615 776 85 226 1.27e-11 68.9
MsG0580029431.01.T01 AT3G14350 30.488 164 109 3 229 391 71 230 1.38e-11 68.9
MsG0580029431.01.T01 AT2G23300 32.796 186 99 6 628 810 124 286 1.39e-11 68.9
MsG0580029431.01.T01 AT2G23300 34.071 226 141 4 94 318 40 258 2.55e-11 68.2
MsG0580029431.01.T01 AT3G14350 30.488 164 109 3 229 391 71 230 1.63e-11 68.6
MsG0580029431.01.T01 AT4G06744 24.333 300 218 8 84 378 70 365 1.70e-11 67.8
MsG0580029431.01.T01 AT5G58300 36.066 122 76 1 270 391 105 224 1.95e-11 68.2
MsG0580029431.01.T01 AT5G58300 36.066 122 76 1 270 391 105 224 1.95e-11 68.2
MsG0580029431.01.T01 AT5G58300 36.066 122 76 1 270 391 105 224 1.95e-11 68.2
MsG0580029431.01.T01 AT3G14350 30.488 164 109 3 229 391 34 193 1.98e-11 68.2
MsG0580029431.01.T01 AT5G63710 35.043 117 74 1 694 810 58 172 3.03e-11 67.4
MsG0580029431.01.T01 AT5G63710 35.043 117 74 1 694 810 58 172 3.03e-11 67.4
MsG0580029431.01.T01 AT2G36570 30.688 189 100 4 224 411 83 241 3.05e-11 67.8
MsG0580029431.01.T01 AT5G63710 35.043 117 74 1 694 810 93 207 3.36e-11 67.4
MsG0580029431.01.T01 AT3G19020 29.744 195 126 6 158 345 163 353 3.37e-11 67.8
MsG0580029431.01.T01 AT5G63710 35.043 117 74 1 694 810 94 208 3.39e-11 67.4
MsG0580029431.01.T01 AT5G65240 40.517 116 68 1 188 302 70 185 4.34e-11 67.0
MsG0580029431.01.T01 AT3G19020 29.744 195 126 6 158 345 163 353 4.43e-11 67.4
MsG0580029431.01.T01 AT5G65240 40.517 116 68 1 188 302 70 185 5.19e-11 67.0
MsG0580029431.01.T01 AT2G07040 40.769 130 70 4 682 810 101 224 6.37e-11 66.6
MsG0580029431.01.T01 AT1G24650 24.084 382 192 10 124 411 51 428 7.28e-11 66.6
MsG0580029431.01.T01 AT5G35390 32.353 204 125 6 690 889 118 312 7.89e-11 66.2

Find 177 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 218 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TTTCCCATGAATGTTGTTAT+TGG 0.154296 5:+96904999 None:intergenic
GGAGAATTACATTCTCTTAA+AGG 0.171358 5:-96904176 MsG0580029431.01.T01:CDS
AAATTTCGTGCTAGGAATTT+AGG 0.184967 5:+96905039 None:intergenic
AATCTAAGTCGGTAAGATTT+TGG 0.200512 5:+96905241 None:intergenic
TTGCATTATAACATGTTAAA+TGG 0.212506 5:-96905429 MsG0580029431.01.T01:CDS
TACAGAATCATTGTAGTAAT+TGG 0.215089 5:+96904307 None:intergenic
TGTAGAGTTTCAAGCCAATT+TGG 0.226132 5:+96904536 None:intergenic
CCATGTATTCCAAACCAATT+TGG 0.231894 5:+96904336 None:intergenic
CCTCACACAACTAACATATT+TGG 0.243517 5:-96905742 MsG0580029431.01.T01:CDS
TAAAGGACACATTTCCAAAT+TGG 0.251198 5:-96904550 MsG0580029431.01.T01:CDS
TAATTTAAGTGAGCTTTATC+TGG 0.257194 5:-96906108 MsG0580029431.01.T01:CDS
AAGATAAAGTGATACTAATT+TGG 0.269654 5:+96906190 None:intergenic
GGCAATATTCGGGTTGCTCT+TGG 0.281641 5:-96903787 MsG0580029431.01.T01:CDS
AAAGAATTTGTCATCCTCTT+TGG 0.284335 5:-96906039 MsG0580029431.01.T01:CDS
TTTCAAAATTAAACAAACTA+TGG 0.285453 5:-96905176 MsG0580029431.01.T01:CDS
TCTTGGTCTTCAATGCCTAT+TGG 0.294378 5:-96906299 MsG0580029431.01.T01:CDS
CTATCAAGAAATAAACTTAA+TGG 0.303016 5:-96905717 MsG0580029431.01.T01:CDS
GAATGTTCTTCCACGAGTTT+AGG 0.306247 5:+96904950 None:intergenic
GTGCACTGAGCCAATGATTT+TGG 0.306343 5:+96904608 None:intergenic
TATGCATGTGGGGCAATATT+CGG 0.308708 5:-96903798 MsG0580029431.01.T01:CDS
TTAAGATCAAATAAATTTCA+TGG 0.309789 5:-96904494 MsG0580029431.01.T01:CDS
TTCTGCAATACATGGGGCTT+GGG 0.312069 5:-96904814 MsG0580029431.01.T01:CDS
TTCAAATGGCCTATAGAATT+AGG 0.313307 5:+96905831 None:intergenic
GAGCTTCTTATGAAACCATT+TGG 0.322077 5:+96904972 None:intergenic
CGCTAAATTTATTATATTCA+AGG 0.322382 5:+96905646 None:intergenic
GGTCAACAGTTTGGTACATT+TGG 0.328932 5:-96903966 MsG0580029431.01.T01:CDS
GGCCTTAACCTTTCGATCAA+TGG 0.329016 5:-96904155 MsG0580029431.01.T01:CDS
CATTAAGTTTATTTCTTGAT+AGG 0.334709 5:+96905718 None:intergenic
CTGTCTTTGATCACTTTCTC+AGG 0.335811 5:-96905861 MsG0580029431.01.T01:CDS
AAAATTCTCAACTTGGGAAA+TGG 0.353962 5:+96904443 None:intergenic
GAAGATGATGAAGAAGAATC+TGG 0.358717 5:-96903849 MsG0580029431.01.T01:CDS
TCATCTAATTATGACCTTAG+TGG 0.362501 5:-96905930 MsG0580029431.01.T01:CDS
TCTTCAATGCCTATTGGTAT+TGG 0.366430 5:-96906293 MsG0580029431.01.T01:CDS
CCAATTGGACCACTCCTCTA+AGG 0.370842 5:-96905893 MsG0580029431.01.T01:CDS
CAACTTGGGAAATGGATGTT+TGG 0.372865 5:+96904451 None:intergenic
CTTTCCAATAACAACATTCA+TGG 0.373268 5:-96905003 MsG0580029431.01.T01:CDS
TGAATGCCATCAGGTGGAAT+TGG 0.373775 5:+96904886 None:intergenic
ATGCATGTGGGGCAATATTC+GGG 0.379147 5:-96903797 MsG0580029431.01.T01:CDS
GCAATATTCGGGTTGCTCTT+GGG 0.381344 5:-96903786 MsG0580029431.01.T01:CDS
TTCAAAATTGCAACCTGAAA+AGG 0.383857 5:+96905791 None:intergenic
CCAAATTGGTTTGGAATACA+TGG 0.388536 5:-96904336 MsG0580029431.01.T01:CDS
ATGATGGAACTTGGCCTGTT+AGG 0.389472 5:+96905559 None:intergenic
CAAATATTGAATGTGGTTGC+TGG 0.390225 5:+96903871 None:intergenic
GGTGAAATTCCTAATTCTAT+AGG 0.392591 5:-96905840 MsG0580029431.01.T01:CDS
AGCTTCTTATGAAACCATTT+GGG 0.394700 5:+96904973 None:intergenic
TTCCATTGATCGAAAGGTTA+AGG 0.398779 5:+96904153 None:intergenic
TTTGTGATTTCAATTGGAAT+TGG 0.404301 5:+96905477 None:intergenic
TAAATATAAATATTCAAGGT+TGG 0.407168 5:+96905086 None:intergenic
TTGGTAGTGGTCCTTCCAAT+TGG 0.408453 5:+96904627 None:intergenic
AACCACCTCACAGGGTTCAT+TGG 0.414989 5:-96905348 MsG0580029431.01.T01:CDS
TGGAGTGGTTAGACCTTTCA+AGG 0.418766 5:-96904088 MsG0580029431.01.T01:CDS
TATAATGTATTCTTCTTCAC+TGG 0.420540 5:-96903762 MsG0580029431.01.T01:CDS
GATGAAGAAGAATCTGGATT+TGG 0.421129 5:-96903843 MsG0580029431.01.T01:CDS
ATGATAAATATAAATATTCA+AGG 0.425802 5:+96905082 None:intergenic
TCATATATTAAGAACTTTCA+AGG 0.428148 5:-96904380 MsG0580029431.01.T01:CDS
TTGTGATTTCAATTGGAATT+GGG 0.428710 5:+96905478 None:intergenic
ATTCTGCAATACATGGGGCT+TGG 0.430825 5:-96904815 MsG0580029431.01.T01:CDS
GACAGGTCCAAGTACCTTAG+AGG 0.431580 5:+96905879 None:intergenic
GGCTGGAAAGCGGTTGCAAT+AGG 0.432086 5:-96903822 MsG0580029431.01.T01:CDS
GTGACCACCGATGTAACAAT+TGG 0.432440 5:+96906238 None:intergenic
CTTTACTCTAACAACCTAAC+AGG 0.433631 5:-96905573 MsG0580029431.01.T01:CDS
CCTTTCGATCAATGGAATCA+AGG 0.435310 5:-96904147 MsG0580029431.01.T01:CDS
AAATATAAATATTCAAGGTT+GGG 0.437351 5:+96905087 None:intergenic
AATGTGAATGACAGCCAAAT+TGG 0.441061 5:-96904350 MsG0580029431.01.T01:CDS
GAATGACAGCCAAATTGGTT+TGG 0.444428 5:-96904345 MsG0580029431.01.T01:CDS
AAAGCTGAATGGCAACCAAT+TGG 0.446256 5:-96904642 MsG0580029431.01.T01:CDS
ACTAAATCTCCAATACCAAT+AGG 0.446625 5:+96906284 None:intergenic
GGAGAAATTCCACAAGTCAT+TGG 0.447675 5:-96904197 MsG0580029431.01.T01:CDS
TTATCAAATAACATGTTTGA+AGG 0.449060 5:-96904218 MsG0580029431.01.T01:CDS
CTTCAACATTCTGCAATACA+TGG 0.449915 5:-96904822 MsG0580029431.01.T01:CDS
CTCAGTTTCAACAAGTTACA+AGG 0.453146 5:-96904916 MsG0580029431.01.T01:CDS
CCTTAGAGGAGTGGTCCAAT+TGG 0.454967 5:+96905893 None:intergenic
CTCTTAGTCTATCAAACACT+GGG 0.456028 5:-96906013 MsG0580029431.01.T01:CDS
AGCTGGAAGATTGTGCTGTT+GGG 0.457531 5:+96906362 None:intergenic
CGTTCTTCTACCATTTGTGT+TGG 0.457633 5:+96903668 None:intergenic
TGGTGAGATTCCTATGGCTT+TGG 0.460501 5:-96904054 MsG0580029431.01.T01:CDS
ATACCTACAGGTCAACAGTT+TGG 0.468626 5:-96903975 MsG0580029431.01.T01:CDS
CTTTCAGAAAACCACCTTGT+GGG 0.469448 5:-96904002 MsG0580029431.01.T01:CDS
GACCACTCCTCTAAGGTACT+TGG 0.472625 5:-96905886 MsG0580029431.01.T01:CDS
TAGGAATCTCACCAGTCAAC+TGG 0.472833 5:+96904063 None:intergenic
TTATCATTTAACAAACTAGT+TGG 0.473362 5:-96905501 MsG0580029431.01.T01:CDS
GGATGGTTCCTCTATCTTTG+AGG 0.473365 5:-96905767 MsG0580029431.01.T01:CDS
GTCAACTTCCAATGTCCAAT+TGG 0.474080 5:-96905908 MsG0580029431.01.T01:CDS
CTTGAATATAATAAATTTAG+CGG 0.475385 5:-96905645 MsG0580029431.01.T01:CDS
CTCTCAAACAACAACTTCAC+AGG 0.476103 5:-96904853 MsG0580029431.01.T01:CDS
GTCAGATCACGTGATTGGTC+TGG 0.476613 5:-96906420 MsG0580029431.01.T01:CDS
TTTGAAGATTAGGTAAAGAG+AGG 0.477721 5:+96905964 None:intergenic
CAGTCAACTGGTTCCTTGAA+AGG 0.481638 5:+96904075 None:intergenic
CTGAAAGATTCAAGAATGAG+AGG 0.483683 5:+96904018 None:intergenic
AAGCCAGGTTGAGTTGTTGA+AGG 0.485036 5:+96906333 None:intergenic
AAGAAGAATCTGGATTTGGC+TGG 0.487128 5:-96903839 MsG0580029431.01.T01:CDS
TTCATGGGAAAATTCCCAAA+TGG 0.491187 5:-96904987 MsG0580029431.01.T01:CDS
ATGTTAGCAAATTTCGTGCT+AGG 0.492152 5:+96905031 None:intergenic
AAATTGGCTTGAAACTCTAC+AGG 0.493799 5:-96904534 MsG0580029431.01.T01:CDS
ATTGAGAAAGATACTTCAAA+TGG 0.494948 5:+96905817 None:intergenic
AGAAATAACTCTAACAATGA+AGG 0.496904 5:+96905378 None:intergenic
CCTTGATTCCATTGATCGAA+AGG 0.497250 5:+96904147 None:intergenic
CCTTGGAGAAAACAACATAA+AGG 0.498172 5:-96904567 MsG0580029431.01.T01:CDS
GTTGTTGAAGGTGTTTAAGC+TGG 0.498186 5:+96906345 None:intergenic
AACAACAGAGCCAACACAAA+TGG 0.502149 5:-96903678 MsG0580029431.01.T01:CDS
TCTCTTAGTCTATCAAACAC+TGG 0.504139 5:-96906014 MsG0580029431.01.T01:CDS
TTATCTTAGCTTTAACTATG+TGG 0.504449 5:-96906174 MsG0580029431.01.T01:CDS
CTCAGCGACAACCACCTCAC+AGG 0.505539 5:-96905357 MsG0580029431.01.T01:CDS
ACCATGTCAGATCACGTGAT+TGG 0.508416 5:-96906425 MsG0580029431.01.T01:CDS
AAGCTGGAAGATTGTGCTGT+TGG 0.510989 5:+96906361 None:intergenic
AGGACCACTACCAAAATCAT+TGG 0.511286 5:-96904618 MsG0580029431.01.T01:CDS
AACAAATTTGAGTGGTGTTG+TGG 0.511530 5:-96905211 MsG0580029431.01.T01:CDS
ATATTCAAGGTTGGGTAACA+TGG 0.518904 5:+96905095 None:intergenic
TTTCCAATAACAACATTCAT+GGG 0.519476 5:-96905002 MsG0580029431.01.T01:CDS
AATTTGGAAAATGACCTTGT+AGG 0.519817 5:+96905277 None:intergenic
CTTTCAGATTGTTGCAACTG+AGG 0.523593 5:+96906396 None:intergenic
GTTGACTGGTGAGATTCCTA+TGG 0.527736 5:-96904060 MsG0580029431.01.T01:CDS
TTCAAATTTGCCAAAGCCAT+AGG 0.528563 5:+96904044 None:intergenic
CTTTCGATCAATGGAATCAA+GGG 0.529715 5:-96904146 MsG0580029431.01.T01:CDS
TTCAAATGGCTCAAAGATTG+CGG 0.529855 5:+96904116 None:intergenic
CTCTCTAATAACAACCTACA+AGG 0.537302 5:-96905291 MsG0580029431.01.T01:CDS
CTATCAAACACTGGGTTGCA+AGG 0.537809 5:-96906005 MsG0580029431.01.T01:CDS
TTTGAGACTATAAAGCTGAA+TGG 0.539297 5:-96904653 MsG0580029431.01.T01:CDS
GTGAGGTTCCTCAAAGATAG+AGG 0.539584 5:+96905759 None:intergenic
CTTAATATATGATGTTGGCA+AGG 0.540162 5:+96904391 None:intergenic
CTTTCAAGGAACCAGTTGAC+TGG 0.540512 5:-96904074 MsG0580029431.01.T01:CDS
TTTGGACAAATGAGAGATTG+TGG 0.546284 5:+96906208 None:intergenic
TGTAATTCTCCAATGACTTG+TGG 0.546879 5:+96904188 None:intergenic
TCATCTTCAAATATTGAATG+TGG 0.556059 5:+96903864 None:intergenic
TCTGTAGTGGTCATAATGAA+AGG 0.556505 5:-96904290 MsG0580029431.01.T01:CDS
TTAATATATGATGTTGGCAA+GGG 0.566116 5:+96904392 None:intergenic
AATCTATCCAATTGTTACAT+CGG 0.566719 5:-96906245 MsG0580029431.01.T01:CDS
GACAAATGAGAGATTGTGGA+GGG 0.567744 5:+96906212 None:intergenic
GATCTTCCAATTCCACCTGA+TGG 0.569494 5:-96904892 MsG0580029431.01.T01:CDS
AAGTTCTTAATATATGATGT+TGG 0.569963 5:+96904386 None:intergenic
TCTGCAATACATGGGGCTTG+GGG 0.570343 5:-96904813 MsG0580029431.01.T01:intron
TGTTGATGACAAATCTAAGT+CGG 0.572308 5:+96905230 None:intergenic
TTCAACATTCTGCAATACAT+GGG 0.573056 5:-96904821 MsG0580029431.01.T01:CDS
GTACCAAACTGTTGACCTGT+AGG 0.574772 5:+96903972 None:intergenic
CTGAGAAAGTGATCAAAGAC+AGG 0.576269 5:+96905862 None:intergenic
CCAAATATGTTAGTTGTGTG+AGG 0.578963 5:+96905742 None:intergenic
CTTGTGGGAATCATACCTAC+AGG 0.579592 5:-96903987 MsG0580029431.01.T01:CDS
TTGCAATAGGATATGCATGT+GGG 0.579673 5:-96903809 MsG0580029431.01.T01:CDS
TGGAGTTTGATTCATTCACA+TGG 0.581341 5:-96906154 MsG0580029431.01.T01:CDS
ATAAGAAGCTCCTAAACTCG+TGG 0.584267 5:-96904960 MsG0580029431.01.T01:CDS
CTCAGTTGCAACAATCTGAA+AGG 0.587185 5:-96906395 MsG0580029431.01.T01:CDS
ACACCTTCAACAACTCAACC+TGG 0.590413 5:-96906336 MsG0580029431.01.T01:CDS
ATTCAAGGTCACAATGAATG+AGG 0.591825 5:+96905661 None:intergenic
ACCAATCACGTGATCTGACA+TGG 0.592796 5:+96906424 None:intergenic
ATCTGGATTTGGCTGGAAAG+CGG 0.594039 5:-96903832 MsG0580029431.01.T01:CDS
GAAGGAAATACAATGTTGTG+TGG 0.597061 5:-96903930 MsG0580029431.01.T01:CDS
CTGAATGGCAACCAATTGGA+AGG 0.600277 5:-96904638 MsG0580029431.01.T01:CDS
TCAGCGACAACCACCTCACA+GGG 0.601424 5:-96905356 MsG0580029431.01.T01:CDS
CAAATTGGTTTGGAATACAT+GGG 0.604074 5:-96904335 MsG0580029431.01.T01:CDS
CTTGTAACTTGTTGAAACTG+AGG 0.604433 5:+96904917 None:intergenic
TTGTCATCAACAAATTTGAG+TGG 0.605697 5:-96905219 MsG0580029431.01.T01:CDS
AAGTATTGAATGCCATCAGG+TGG 0.614234 5:+96904880 None:intergenic
TTACTACAATGATTCTGTAG+TGG 0.620716 5:-96904303 MsG0580029431.01.T01:CDS
ACATTGGAAGTTGACCACTA+AGG 0.620807 5:+96905916 None:intergenic
CTATCCAATTGTTACATCGG+TGG 0.626306 5:-96906242 MsG0580029431.01.T01:CDS
GTTGCAATAGGATATGCATG+TGG 0.626351 5:-96903810 MsG0580029431.01.T01:CDS
GGAGTTTGATTCATTCACAT+GGG 0.631395 5:-96906153 MsG0580029431.01.T01:CDS
GGACAAATGAGAGATTGTGG+AGG 0.632626 5:+96906211 None:intergenic
GGAGTGGTCCAATTGGACAT+TGG 0.634433 5:+96905900 None:intergenic
TCAACATTCTGCAATACATG+GGG 0.650484 5:-96904820 MsG0580029431.01.T01:CDS
GTCCAAGTACCTTAGAGGAG+TGG 0.651578 5:+96905884 None:intergenic
CACAATGAATGAGGTGTGTG+AGG 0.656340 5:+96905670 None:intergenic
TGCAATAGGATATGCATGTG+GGG 0.656658 5:-96903808 MsG0580029431.01.T01:CDS
TCTTTCAGAAAACCACCTTG+TGG 0.658696 5:-96904003 MsG0580029431.01.T01:CDS
ATGGCTCAAAGATTGCGGAA+TGG 0.663718 5:+96904121 None:intergenic
TAGACTAAGAGAAACCAAAG+AGG 0.669854 5:+96906025 None:intergenic
AAATCTAAATGAGAAAGCTG+AGG 0.677007 5:+96905522 None:intergenic
TAGGTATGATTCCCACAAGG+TGG 0.681947 5:+96903991 None:intergenic
TGTGTGAGGTTTGAAAGTAA+TGG 0.682436 5:+96905684 None:intergenic
CTGTAGGTATGATTCCCACA+AGG 0.683402 5:+96903988 None:intergenic
CACCAATGAACCCTGTGAGG+TGG 0.687836 5:+96905346 None:intergenic
TCTTCTTCACTGGAAAACCA+CGG 0.701848 5:-96903752 MsG0580029431.01.T01:CDS
GCTCACCAATGAACCCTGTG+AGG 0.718016 5:+96905343 None:intergenic
ACATTTCTTACAAGCCACCG+TGG 0.732532 5:+96903735 None:intergenic
TCTTCACTGGAAAACCACGG+TGG 0.742047 5:-96903749 MsG0580029431.01.T01:CDS
GGCAAAGAATAACACCACTG+TGG 0.743325 5:+96905399 None:intergenic
TAAATGGAACAATTCCACAG+TGG 0.787236 5:-96905413 MsG0580029431.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ATGATAAATATAAATATTCA+AGG + Chr5:96905005-96905024 None:intergenic 10.0%
!! AAATATAAATATTCAAGGTT+GGG + Chr5:96905000-96905019 None:intergenic 15.0%
!! CTTGAATATAATAAATTTAG+CGG - Chr5:96904439-96904458 MsG0580029431.01.T01:CDS 15.0%
!! TAAATATAAATATTCAAGGT+TGG + Chr5:96905001-96905020 None:intergenic 15.0%
!! TTAAATTTCCAAAAACATTT+GGG + Chr5:96904471-96904490 None:intergenic 15.0%
!! TTAAGATCAAATAAATTTCA+TGG - Chr5:96905590-96905609 MsG0580029431.01.T01:CDS 15.0%
!! TTTAAATTTCCAAAAACATT+TGG + Chr5:96904472-96904491 None:intergenic 15.0%
!! TTTCAAAATTAAACAAACTA+TGG - Chr5:96904908-96904927 MsG0580029431.01.T01:CDS 15.0%
!!! GTTTGTTTAATTTTGAAAAT+TGG + Chr5:96904906-96904925 None:intergenic 15.0%
!! AAATCCAATACAAAAAGAAT+GGG + Chr5:96905356-96905375 None:intergenic 20.0%
!! AAGAAAAATTATTAAAAGCC+AGG + Chr5:96903769-96903788 None:intergenic 20.0%
!! AAGATAAAGTGATACTAATT+TGG + Chr5:96903897-96903916 None:intergenic 20.0%
!! AAGTTCTTAATATATGATGT+TGG + Chr5:96905701-96905720 None:intergenic 20.0%
!! CGCTAAATTTATTATATTCA+AGG + Chr5:96904441-96904460 None:intergenic 20.0%
!! CTATCAAGAAATAAACTTAA+TGG - Chr5:96904367-96904386 MsG0580029431.01.T01:CDS 20.0%
!! TAAATCCAATACAAAAAGAA+TGG + Chr5:96905357-96905376 None:intergenic 20.0%
!! TCATATATTAAGAACTTTCA+AGG - Chr5:96905704-96905723 MsG0580029431.01.T01:CDS 20.0%
!! TTATCAAATAACATGTTTGA+AGG - Chr5:96905866-96905885 MsG0580029431.01.T01:CDS 20.0%
!! TTATCATTTAACAAACTAGT+TGG - Chr5:96904583-96904602 MsG0580029431.01.T01:CDS 20.0%
!! TTGCATTATAACATGTTAAA+TGG - Chr5:96904655-96904674 MsG0580029431.01.T01:CDS 20.0%
!!! AAATCTAGTTTTTGAAGATT+AGG + Chr5:96904133-96904152 None:intergenic 20.0%
!!! CATTAAGTTTATTTCTTGAT+AGG + Chr5:96904369-96904388 None:intergenic 20.0%
!!! TGGCTTTTAATAATTTTTCT+TGG - Chr5:96903768-96903787 MsG0580029431.01.T01:CDS 20.0%
! AATCTATCCAATTGTTACAT+CGG - Chr5:96903839-96903858 MsG0580029431.01.T01:CDS 25.0%
! ACATCAAAAATTCTCAACTT+GGG + Chr5:96905650-96905669 None:intergenic 25.0%
! AGAAATAACTCTAACAATGA+AGG + Chr5:96904709-96904728 None:intergenic 25.0%
! ATTGAGAAAGATACTTCAAA+TGG + Chr5:96904270-96904289 None:intergenic 25.0%
! TACAGAATCATTGTAGTAAT+TGG + Chr5:96905780-96905799 None:intergenic 25.0%
! TATAATGTATTCTTCTTCAC+TGG - Chr5:96906322-96906341 MsG0580029431.01.T01:CDS 25.0%
! TCATCTTCAAATATTGAATG+TGG + Chr5:96906223-96906242 None:intergenic 25.0%
! TGGAGTTCAAAAATTGAATT+TGG + Chr5:96904826-96904845 None:intergenic 25.0%
! TTAATATATGATGTTGGCAA+GGG + Chr5:96905695-96905714 None:intergenic 25.0%
! TTGTGATTTCAATTGGAATT+GGG + Chr5:96904609-96904628 None:intergenic 25.0%
! TTTCCAATAACAACATTCAT+GGG - Chr5:96905082-96905101 MsG0580029431.01.T01:CDS 25.0%
! TTTGAGCCATTTGAAAAATT+TGG - Chr5:96905976-96905995 MsG0580029431.01.T01:CDS 25.0%
! TTTGTGATTTCAATTGGAAT+TGG + Chr5:96904610-96904629 None:intergenic 25.0%
!! CATAATGAAAGGTTTTTATG+TGG - Chr5:96905805-96905824 MsG0580029431.01.T01:CDS 25.0%
!! GAATGTTTTGTGATTTCAAT+TGG + Chr5:96904616-96904635 None:intergenic 25.0%
!! TAATTTAAGTGAGCTTTATC+TGG - Chr5:96903976-96903995 MsG0580029431.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTGGAAATGATTCTTTTGA+AGG - Chr5:96906136-96906155 MsG0580029431.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTTTGCATGATTTAGACAA+TGG + Chr5:96906184-96906203 None:intergenic 25.0%
!!! TCTCTAACAACAATTTTAGT+GGG - Chr5:96905669-96905688 MsG0580029431.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTATCTTAGCTTTAACTATG+TGG - Chr5:96903910-96903929 MsG0580029431.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTTCTTTGGAAAAAGTTCT+AGG + Chr5:96905407-96905426 None:intergenic 25.0%
AAAATTCTCAACTTGGGAAA+TGG + Chr5:96905644-96905663 None:intergenic 30.0%
AAAGAATTTGTCATCCTCTT+TGG - Chr5:96904045-96904064 MsG0580029431.01.T01:CDS 30.0%
AAATCTAAATGAGAAAGCTG+AGG + Chr5:96904565-96904584 None:intergenic 30.0%
AAATTTCGTGCTAGGAATTT+AGG + Chr5:96905048-96905067 None:intergenic 30.0%
AATTTGGAAAATGACCTTGT+AGG + Chr5:96904810-96904829 None:intergenic 30.0%
ACTAAATCTCCAATACCAAT+AGG + Chr5:96903803-96903822 None:intergenic 30.0%
AGCTTCTTATGAAACCATTT+GGG + Chr5:96905114-96905133 None:intergenic 30.0%
CTTAATATATGATGTTGGCA+AGG + Chr5:96905696-96905715 None:intergenic 30.0%
CTTTCCAATAACAACATTCA+TGG - Chr5:96905081-96905100 MsG0580029431.01.T01:CDS 30.0%
GACATCAAAAATTCTCAACT+TGG + Chr5:96905651-96905670 None:intergenic 30.0%
GGAGAATTACATTCTCTTAA+AGG - Chr5:96905908-96905927 MsG0580029431.01.T01:CDS 30.0%
GGTGAAATTCCTAATTCTAT+AGG - Chr5:96904244-96904263 MsG0580029431.01.T01:CDS 30.0%
GTCTAAATCATGCAAAAATG+AGG - Chr5:96906186-96906205 MsG0580029431.01.T01:CDS 30.0%
TAAAGGACACATTTCCAAAT+TGG - Chr5:96905534-96905553 MsG0580029431.01.T01:CDS 30.0%
TCATCTAATTATGACCTTAG+TGG - Chr5:96904154-96904173 MsG0580029431.01.T01:CDS 30.0%
TTACAAATGAACAACCTCTA+TGG - Chr5:96905374-96905393 MsG0580029431.01.T01:CDS 30.0%
TTACTACAATGATTCTGTAG+TGG - Chr5:96905781-96905800 MsG0580029431.01.T01:CDS 30.0%
TTCAAAATTGCAACCTGAAA+AGG + Chr5:96904296-96904315 None:intergenic 30.0%
TTCAAATGGCCTATAGAATT+AGG + Chr5:96904256-96904275 None:intergenic 30.0%
TTCAACATTCTGCAATACAT+GGG - Chr5:96905263-96905282 MsG0580029431.01.T01:CDS 30.0%
TTGTCATCAACAAATTTGAG+TGG - Chr5:96904865-96904884 MsG0580029431.01.T01:CDS 30.0%
TTTCCCATGAATGTTGTTAT+TGG + Chr5:96905088-96905107 None:intergenic 30.0%
TTTGAAGATTAGGTAAAGAG+AGG + Chr5:96904123-96904142 None:intergenic 30.0%
! AATCTAAGTCGGTAAGATTT+TGG + Chr5:96904846-96904865 None:intergenic 30.0%
! ACTTCCCATTCTTTTTGTAT+TGG - Chr5:96905349-96905368 MsG0580029431.01.T01:CDS 30.0%
! AGTCTCAAATGCATTTTCTT+TGG + Chr5:96905420-96905439 None:intergenic 30.0%
! GTCTCTAACAACAATTTTAG+TGG - Chr5:96905668-96905687 MsG0580029431.01.T01:CDS 30.0%
! TTTGAGACTATAAAGCTGAA+TGG - Chr5:96905431-96905450 MsG0580029431.01.T01:CDS 30.0%
!! AAAAAGTATTGAATGCCATC+AGG + Chr5:96905210-96905229 None:intergenic 30.0%
!! ACCACTCCAAATTTTTCAAA+TGG + Chr5:96905985-96906004 None:intergenic 30.0%
!! CAAATTGGTTTGGAATACAT+GGG - Chr5:96905749-96905768 MsG0580029431.01.T01:CDS 30.0%
!! TGTTGATGACAAATCTAAGT+CGG + Chr5:96904857-96904876 None:intergenic 30.0%
!!! AAACTTGAAGTTTTAGACCT+TGG - Chr5:96905500-96905519 MsG0580029431.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTTCAGGTTGCAATTTTGAA+GGG - Chr5:96904296-96904315 MsG0580029431.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTTTCAGGTTGCAATTTTGA+AGG - Chr5:96904295-96904314 MsG0580029431.01.T01:CDS 30.0%
AATGTGAATGACAGCCAAAT+TGG - Chr5:96905734-96905753 MsG0580029431.01.T01:CDS 35.0%
ATATTCAAGGTTGGGTAACA+TGG + Chr5:96904992-96905011 None:intergenic 35.0%
ATGTTAGCAAATTTCGTGCT+AGG + Chr5:96905056-96905075 None:intergenic 35.0%
ATTCAAGGTCACAATGAATG+AGG + Chr5:96904426-96904445 None:intergenic 35.0%
CAAATATTGAATGTGGTTGC+TGG + Chr5:96906216-96906235 None:intergenic 35.0%
CCAAATATGTTAGTTGTGTG+AGG + Chr5:96904345-96904364 None:intergenic 35.0%
CCATGTATTCCAAACCAATT+TGG + Chr5:96905751-96905770 None:intergenic 35.0%
CCTCACACAACTAACATATT+TGG - Chr5:96904342-96904361 MsG0580029431.01.T01:CDS 35.0%
CCTTGGAGAAAACAACATAA+AGG - Chr5:96905517-96905536 MsG0580029431.01.T01:CDS 35.0%
CTCAGTTTCAACAAGTTACA+AGG - Chr5:96905168-96905187 MsG0580029431.01.T01:CDS 35.0%
CTCTCTAATAACAACCTACA+AGG - Chr5:96904793-96904812 MsG0580029431.01.T01:intron 35.0%
CTCTTAGTCTATCAAACACT+GGG - Chr5:96904071-96904090 MsG0580029431.01.T01:CDS 35.0%
CTGAAAGATTCAAGAATGAG+AGG + Chr5:96906069-96906088 None:intergenic 35.0%
CTTCAACATTCTGCAATACA+TGG - Chr5:96905262-96905281 MsG0580029431.01.T01:CDS 35.0%
CTTTACTCTAACAACCTAAC+AGG - Chr5:96904511-96904530 MsG0580029431.01.T01:CDS 35.0%
CTTTCGATCAATGGAATCAA+GGG - Chr5:96905938-96905957 MsG0580029431.01.T01:CDS 35.0%
GAAGATGATGAAGAAGAATC+TGG - Chr5:96906235-96906254 MsG0580029431.01.T01:CDS 35.0%
GAAGGAAATACAATGTTGTG+TGG - Chr5:96906154-96906173 MsG0580029431.01.T01:CDS 35.0%
GAGCTTCTTATGAAACCATT+TGG + Chr5:96905115-96905134 None:intergenic 35.0%
GATGAAGAAGAATCTGGATT+TGG - Chr5:96906241-96906260 MsG0580029431.01.T01:CDS 35.0%
GCCATTTGAAAAATTTGGAG+TGG - Chr5:96905981-96906000 MsG0580029431.01.T01:CDS 35.0%
GGAGTTTGATTCATTCACAT+GGG - Chr5:96903931-96903950 MsG0580029431.01.T01:CDS 35.0%
GGTAGATGAAAAAGTGATGA+TGG + Chr5:96904544-96904563 None:intergenic 35.0%
TAAATGGAACAATTCCACAG+TGG - Chr5:96904671-96904690 MsG0580029431.01.T01:CDS 35.0%
TAGACTAAGAGAAACCAAAG+AGG + Chr5:96904062-96904081 None:intergenic 35.0%
TCAACATTCTGCAATACATG+GGG - Chr5:96905264-96905283 MsG0580029431.01.T01:CDS 35.0%
TCTCTTAGTCTATCAAACAC+TGG - Chr5:96904070-96904089 MsG0580029431.01.T01:CDS 35.0%
TCTGTAGTGGTCATAATGAA+AGG - Chr5:96905794-96905813 MsG0580029431.01.T01:CDS 35.0%
TCTTCAATGCCTATTGGTAT+TGG - Chr5:96903791-96903810 MsG0580029431.01.T01:CDS 35.0%
TGGAGTTTGATTCATTCACA+TGG - Chr5:96903930-96903949 MsG0580029431.01.T01:CDS 35.0%
TGTAATTCTCCAATGACTTG+TGG + Chr5:96905899-96905918 None:intergenic 35.0%
TGTAGAGTTTCAAGCCAATT+TGG + Chr5:96905551-96905570 None:intergenic 35.0%
TGTGTGAGGTTTGAAAGTAA+TGG + Chr5:96904403-96904422 None:intergenic 35.0%
TTCAAATGGCTCAAAGATTG+CGG + Chr5:96905971-96905990 None:intergenic 35.0%
TTCAAATTTGCCAAAGCCAT+AGG + Chr5:96906043-96906062 None:intergenic 35.0%
TTCATGGGAAAATTCCCAAA+TGG - Chr5:96905097-96905116 MsG0580029431.01.T01:CDS 35.0%
TTCCATTGATCGAAAGGTTA+AGG + Chr5:96905934-96905953 None:intergenic 35.0%
TTGCAATAGGATATGCATGT+GGG - Chr5:96906275-96906294 MsG0580029431.01.T01:CDS 35.0%
TTGGCACACAACAAATTAAC+AGG - Chr5:96905302-96905321 MsG0580029431.01.T01:CDS 35.0%
TTTGGACAAATGAGAGATTG+TGG + Chr5:96903879-96903898 None:intergenic 35.0%
! AACAAATTTGAGTGGTGTTG+TGG - Chr5:96904873-96904892 MsG0580029431.01.T01:CDS 35.0%
! GGTAACATCCCAAATGTTTT+TGG - Chr5:96904460-96904479 MsG0580029431.01.T01:CDS 35.0%
!! AAATTGGCTTGAAACTCTAC+AGG - Chr5:96905550-96905569 MsG0580029431.01.T01:CDS 35.0%
!! CCAAATTGGTTTGGAATACA+TGG - Chr5:96905748-96905767 MsG0580029431.01.T01:CDS 35.0%
!! CTTGTAACTTGTTGAAACTG+AGG + Chr5:96905170-96905189 None:intergenic 35.0%
!! GAAAAAGTGATGATGGAACT+TGG + Chr5:96904537-96904556 None:intergenic 35.0%
!!! CCTTTATGTTGTTTTCTCCA+AGG + Chr5:96905520-96905539 None:intergenic 35.0%
!!! CTTTCTCAATTAGCCTTTTC+AGG - Chr5:96904280-96904299 MsG0580029431.01.T01:CDS 35.0%
AAAGCTGAATGGCAACCAAT+TGG - Chr5:96905442-96905461 MsG0580029431.01.T01:CDS 40.0%
AACAACAGAGCCAACACAAA+TGG - Chr5:96906406-96906425 MsG0580029431.01.T01:CDS 40.0%
AAGAAGAATCTGGATTTGGC+TGG - Chr5:96906245-96906264 MsG0580029431.01.T01:CDS 40.0%
ACATTGGAAGTTGACCACTA+AGG + Chr5:96904171-96904190 None:intergenic 40.0%
AGGAATGATCCCAGATTGTT+TGG - Chr5:96905322-96905341 MsG0580029431.01.T01:CDS 40.0%
AGGACCACTACCAAAATCAT+TGG - Chr5:96905466-96905485 MsG0580029431.01.T01:CDS 40.0%
ATAAGAAGCTCCTAAACTCG+TGG - Chr5:96905124-96905143 MsG0580029431.01.T01:CDS 40.0%
ATACCTACAGGTCAACAGTT+TGG - Chr5:96906109-96906128 MsG0580029431.01.T01:CDS 40.0%
CAACTTGGGAAATGGATGTT+TGG + Chr5:96905636-96905655 None:intergenic 40.0%
CCTTGATTCCATTGATCGAA+AGG + Chr5:96905940-96905959 None:intergenic 40.0%
CCTTTCGATCAATGGAATCA+AGG - Chr5:96905937-96905956 MsG0580029431.01.T01:CDS 40.0%
CGTTCTTCTACCATTTGTGT+TGG + Chr5:96906419-96906438 None:intergenic 40.0%
CTATCCAATTGTTACATCGG+TGG - Chr5:96903842-96903861 MsG0580029431.01.T01:CDS 40.0%
CTCAGTTGCAACAATCTGAA+AGG - Chr5:96903689-96903708 MsG0580029431.01.T01:CDS 40.0%
CTCTCAAACAACAACTTCAC+AGG - Chr5:96905231-96905250 MsG0580029431.01.T01:CDS 40.0%
CTGAGAAAGTGATCAAAGAC+AGG + Chr5:96904225-96904244 None:intergenic 40.0%
CTGTCTTTGATCACTTTCTC+AGG - Chr5:96904223-96904242 MsG0580029431.01.T01:CDS 40.0%
CTTTCAGAAAACCACCTTGT+GGG - Chr5:96906082-96906101 MsG0580029431.01.T01:CDS 40.0%
CTTTCAGATTGTTGCAACTG+AGG + Chr5:96903691-96903710 None:intergenic 40.0%
GAATGACAGCCAAATTGGTT+TGG - Chr5:96905739-96905758 MsG0580029431.01.T01:CDS 40.0%
GAATGTTCTTCCACGAGTTT+AGG + Chr5:96905137-96905156 None:intergenic 40.0%
GACAAATGAGAGATTGTGGA+GGG + Chr5:96903875-96903894 None:intergenic 40.0%
GGAATGATCCCAGATTGTTT+GGG - Chr5:96905323-96905342 MsG0580029431.01.T01:CDS 40.0%
GGAGAAATTCCACAAGTCAT+TGG - Chr5:96905887-96905906 MsG0580029431.01.T01:CDS 40.0%
GGTCAACAGTTTGGTACATT+TGG - Chr5:96906118-96906137 MsG0580029431.01.T01:CDS 40.0%
GTCAACTTCCAATGTCCAAT+TGG - Chr5:96904176-96904195 MsG0580029431.01.T01:CDS 40.0%
GTTGCAATAGGATATGCATG+TGG - Chr5:96906274-96906293 MsG0580029431.01.T01:CDS 40.0%
TATGCATGTGGGGCAATATT+CGG - Chr5:96906286-96906305 MsG0580029431.01.T01:CDS 40.0%
TCTTCTTCACTGGAAAACCA+CGG - Chr5:96906332-96906351 MsG0580029431.01.T01:CDS 40.0%
TCTTTCAGAAAACCACCTTG+TGG - Chr5:96906081-96906100 MsG0580029431.01.T01:CDS 40.0%
TGCAATAGGATATGCATGTG+GGG - Chr5:96906276-96906295 MsG0580029431.01.T01:CDS 40.0%
! GAAGTGTTCCCAAACAATCT+GGG + Chr5:96905334-96905353 None:intergenic 40.0%
! TCTTGGTCTTCAATGCCTAT+TGG - Chr5:96903785-96903804 MsG0580029431.01.T01:CDS 40.0%
!! AAGTATTGAATGCCATCAGG+TGG + Chr5:96905207-96905226 None:intergenic 40.0%
!! AGGTTGCAATTTTGAAGGGA+TGG - Chr5:96904300-96904319 MsG0580029431.01.T01:CDS 40.0%
!! GTTGTTGAAGGTGTTTAAGC+TGG + Chr5:96903742-96903761 None:intergenic 40.0%
!! TGAGCCAATGATTTTGGTAG+TGG + Chr5:96905473-96905492 None:intergenic 40.0%
AAGCTGGAAGATTGTGCTGT+TGG + Chr5:96903726-96903745 None:intergenic 45.0%
ACACCTTCAACAACTCAACC+TGG - Chr5:96903748-96903767 MsG0580029431.01.T01:CDS 45.0%
ACATTTCTTACAAGCCACCG+TGG + Chr5:96906352-96906371 None:intergenic 45.0%
ATCTGGATTTGGCTGGAAAG+CGG - Chr5:96906252-96906271 MsG0580029431.01.T01:CDS 45.0%
ATGCATGTGGGGCAATATTC+GGG - Chr5:96906287-96906306 MsG0580029431.01.T01:CDS 45.0%
ATGGCTCAAAGATTGCGGAA+TGG + Chr5:96905966-96905985 None:intergenic 45.0%
ATTCTGCAATACATGGGGCT+TGG - Chr5:96905269-96905288 MsG0580029431.01.T01:CDS 45.0%
CACAATGAATGAGGTGTGTG+AGG + Chr5:96904417-96904436 None:intergenic 45.0%
CTATCAAACACTGGGTTGCA+AGG - Chr5:96904079-96904098 MsG0580029431.01.T01:CDS 45.0%
CTGAATGGCAACCAATTGGA+AGG - Chr5:96905446-96905465 MsG0580029431.01.T01:CDS 45.0%
CTGTAGGTATGATTCCCACA+AGG + Chr5:96906099-96906118 None:intergenic 45.0%
CTTGTGGGAATCATACCTAC+AGG - Chr5:96906097-96906116 MsG0580029431.01.T01:CDS 45.0%
CTTTCAAGGAACCAGTTGAC+TGG - Chr5:96906010-96906029 MsG0580029431.01.T01:CDS 45.0%
GATCTTCCAATTCCACCTGA+TGG - Chr5:96905192-96905211 MsG0580029431.01.T01:CDS 45.0%
GGACAAATGAGAGATTGTGG+AGG + Chr5:96903876-96903895 None:intergenic 45.0%
GGATGGTTCCTCTATCTTTG+AGG - Chr5:96904317-96904336 MsG0580029431.01.T01:CDS 45.0%
GGCAAAGAATAACACCACTG+TGG + Chr5:96904688-96904707 None:intergenic 45.0%
GGCCTTAACCTTTCGATCAA+TGG - Chr5:96905929-96905948 MsG0580029431.01.T01:CDS 45.0%
GTACCAAACTGTTGACCTGT+AGG + Chr5:96906115-96906134 None:intergenic 45.0%
GTGACCACCGATGTAACAAT+TGG + Chr5:96903849-96903868 None:intergenic 45.0%
GTGAGGTTCCTCAAAGATAG+AGG + Chr5:96904328-96904347 None:intergenic 45.0%
GTTGACTGGTGAGATTCCTA+TGG - Chr5:96906024-96906043 MsG0580029431.01.T01:CDS 45.0%
TAGGAATCTCACCAGTCAAC+TGG + Chr5:96906024-96906043 None:intergenic 45.0%
TAGGTATGATTCCCACAAGG+TGG + Chr5:96906096-96906115 None:intergenic 45.0%
TGAATGCCATCAGGTGGAAT+TGG + Chr5:96905201-96905220 None:intergenic 45.0%
TGGAGTGGTTAGACCTTTCA+AGG - Chr5:96905996-96906015 MsG0580029431.01.T01:CDS 45.0%
TGGTGAGATTCCTATGGCTT+TGG - Chr5:96906030-96906049 MsG0580029431.01.T01:CDS 45.0%
TTCTAGGCATGCTTCCATAG+AGG + Chr5:96905391-96905410 None:intergenic 45.0%
TTCTGCAATACATGGGGCTT+GGG - Chr5:96905270-96905289 MsG0580029431.01.T01:CDS 45.0%
! AAGCCAGGTTGAGTTGTTGA+AGG + Chr5:96903754-96903773 None:intergenic 45.0%
! AGCTGGAAGATTGTGCTGTT+GGG + Chr5:96903725-96903744 None:intergenic 45.0%
! ATGATGGAACTTGGCCTGTT+AGG + Chr5:96904528-96904547 None:intergenic 45.0%
! CAGTCAACTGGTTCCTTGAA+AGG + Chr5:96906012-96906031 None:intergenic 45.0%
! GTGCACTGAGCCAATGATTT+TGG + Chr5:96905479-96905498 None:intergenic 45.0%
!! GCAATATTCGGGTTGCTCTT+GGG - Chr5:96906298-96906317 MsG0580029431.01.T01:CDS 45.0%
!! GGAAGTGTTCCCAAACAATC+TGG + Chr5:96905335-96905354 None:intergenic 45.0%
!! TTGGTAGTGGTCCTTCCAAT+TGG + Chr5:96905460-96905479 None:intergenic 45.0%
AACCACCTCACAGGGTTCAT+TGG - Chr5:96904736-96904755 MsG0580029431.01.T01:intron 50.0%
CCAATTGGACCACTCCTCTA+AGG - Chr5:96904191-96904210 MsG0580029431.01.T01:CDS 50.0%
CCTTAGAGGAGTGGTCCAAT+TGG + Chr5:96904194-96904213 None:intergenic 50.0%
GACAGGTCCAAGTACCTTAG+AGG + Chr5:96904208-96904227 None:intergenic 50.0%
GGAGTGGTCCAATTGGACAT+TGG + Chr5:96904187-96904206 None:intergenic 50.0%
GTCCAAGTACCTTAGAGGAG+TGG + Chr5:96904203-96904222 None:intergenic 50.0%
TCTGCAATACATGGGGCTTG+GGG - Chr5:96905271-96905290 MsG0580029431.01.T01:CDS 50.0%
TCTTCACTGGAAAACCACGG+TGG - Chr5:96906335-96906354 MsG0580029431.01.T01:CDS 50.0%
! GTCAGATCACGTGATTGGTC+TGG - Chr5:96903664-96903683 MsG0580029431.01.T01:CDS 50.0%
!! GACCACTCCTCTAAGGTACT+TGG - Chr5:96904198-96904217 MsG0580029431.01.T01:CDS 50.0%
!! GGCAATATTCGGGTTGCTCT+TGG - Chr5:96906297-96906316 MsG0580029431.01.T01:CDS 50.0%
CACCAATGAACCCTGTGAGG+TGG + Chr5:96904741-96904760 None:intergenic 55.0%
GCTCACCAATGAACCCTGTG+AGG + Chr5:96904744-96904763 None:intergenic 55.0%
GGCTGGAAAGCGGTTGCAAT+AGG - Chr5:96906262-96906281 MsG0580029431.01.T01:CDS 55.0%
TCAGCGACAACCACCTCACA+GGG - Chr5:96904728-96904747 MsG0580029431.01.T01:intron 55.0%
! GGGGCTTGGGGTACTCAATT+TGG - Chr5:96905283-96905302 MsG0580029431.01.T01:CDS 55.0%
CTCAGCGACAACCACCTCAC+AGG - Chr5:96904727-96904746 MsG0580029431.01.T01:intron 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr5 gene 96903662 96906444 96903662 ID=MsG0580029431.01;Name=MsG0580029431.01
Chr5 mRNA 96903662 96906444 96903662 ID=MsG0580029431.01.T01;Parent=MsG0580029431.01;Name=MsG0580029431.01.T01;_AED=0.09;_eAED=0.09;_QI=0|0|0|1|1|1|2|0|891
Chr5 exon 96904814 96906444 96904814 ID=MsG0580029431.01.T01:exon:24724;Parent=MsG0580029431.01.T01
Chr5 exon 96903662 96904706 96903662 ID=MsG0580029431.01.T01:exon:24723;Parent=MsG0580029431.01.T01
Chr5 CDS 96904814 96906444 96904814 ID=MsG0580029431.01.T01:cds;Parent=MsG0580029431.01.T01
Chr5 CDS 96903662 96904706 96903662 ID=MsG0580029431.01.T01:cds;Parent=MsG0580029431.01.T01
Gene Sequence

>MsG0580029431.01.T01

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Protein sequence

>MsG0580029431.01.T01

MSDHVIGLDLSCNNLKGELHPNSTIFQLKHLQQLNLAFNNFSWSSMPIGIGDLVNLTHLNLSNCYIGGHIPSTISHLSKLVSLYLSFNYVEFDSFTWEKLIHNATNLSELYLDYVNMSSIRESSLLMLKNLSSSLVSLSLSNTGLQGNLSSDILSLPNLQKLDLSSNYDLSGQLPMSNWTTPLRYLDLSLITFSGEIPNSIGHLKYLSQLAFSGCNFEGMVPLSLRNLTQLTYLDLSRNKLNGEISPLLSNLTHLIHCDLEYNKFSGNIPNVFGNLNKIIFLSLYSNNLTGQVPSSLFHLPQLSHLDLSFNKLVGPIPIEITKHSKLSSVRLHYNMLNGTIPQWCYSLPSLLELFLSDNHLTGFIGELSTYSLQSLYLSNNNLQGHFPNSIFELQNLTDLDLSSTNLSGVVDFHQFSKLNKLWYLNLAHNSFLSINTNSSADSMLPNLEYLYLSSSNISSFPKFLARNLLTLDLSNNNIHGKIPKWFHKKLLNSWKNIQHIDLSFNKLQGDLPIPPDGIQYFLLSNNNFTGNISSTFCNTWGLGMPRTFSKENAFETIKLNGNQLEGPLPKSLAQCTKLEVLDLGENNIKDTFPNWLETLQELQVLSLRSNKFHGAITCSSTKHPFPKLRIFDVSNNNFSGPLPTSYIKNFQGMMNVNDSQIGLEYMGKANYYNDSVVVIMKGFYVELTKILTTFTTIDLSNNMFEGEIPQVIGELHSLKGLNLSINGIKGTIPQSLSHLKNLEWLDLSRNQLTGEIPMALANLNFLSFLNLSENHLVGIIPTGQQFGTFGNDSFEGNTMLCGFPLSKSCKNEEDQQPHSIFEDDEEESGFGWKAVAIGYACGAIFGLLLGYNVFFFTGKPRWLVRNVEHMFNIRLKRTNNRANTNGRRTN*