AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680031519.01

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MsG0680031519.01.T01 AT5G45780 41.528 301 160 8 398 689 284 577 4.69e-64 224
MsG0680031519.01.T01 AT4G11900 28.194 720 423 24 33 696 139 820 7.39e-64 228
MsG0680031519.01.T01 AT1G60800 41.275 298 160 7 398 686 285 576 1.26e-63 223
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MsG0680031519.01.T01 AT1G61490 29.589 730 410 30 22 696 93 773 2.55e-62 223
MsG0680031519.01.T01 AT1G61490 29.589 730 410 30 22 696 93 773 2.55e-62 223
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MsG0680031519.01.T01 AT3G25560 39.116 294 168 6 398 686 296 583 1.69e-60 215
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MsG0680031519.01.T01 AT3G53380 36.182 351 209 7 356 694 314 661 2.30e-59 213
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MsG0680031519.01.T01 AT1G56120 38.710 341 196 7 361 695 490 823 7.17e-59 214
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MsG0680031519.01.T01 AT1G56720 41.237 291 158 6 402 685 167 451 1.61e-57 203
MsG0680031519.01.T01 AT1G56720 41.237 291 158 6 402 685 167 451 1.61e-57 203
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MsG0680031519.01.T01 AT5G18500 40.345 290 162 4 402 685 154 438 2.58e-56 199
MsG0680031519.01.T01 AT5G18500 40.345 290 162 4 402 685 154 438 2.58e-56 199
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MsG0680031519.01.T01 AT1G53430 39.193 347 197 6 356 693 608 949 5.48e-56 207
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MsG0680031519.01.T01 AT2G42960 40.000 290 163 4 402 685 171 455 6.56e-56 199
MsG0680031519.01.T01 AT2G42960 40.000 290 163 4 402 685 171 455 6.56e-56 199
MsG0680031519.01.T01 AT1G61550 27.321 754 436 26 4 696 70 772 6.62e-56 204
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MsG0680031519.01.T01 AT5G59270 38.926 298 167 7 402 692 340 629 8.09e-56 202
MsG0680031519.01.T01 AT1G70740 36.422 313 174 6 402 694 38 345 9.56e-56 196
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MsG0680031519.01.T01 AT2G13800 38.356 292 170 4 402 686 263 551 1.04e-55 201
MsG0680031519.01.T01 AT5G59270 38.926 298 167 7 402 692 356 645 1.08e-55 202
MsG0680031519.01.T01 AT1G34210 38.591 298 167 5 399 686 290 581 1.11e-55 201
MsG0680031519.01.T01 AT1G34210 38.591 298 167 5 399 686 290 581 1.11e-55 201
MsG0680031519.01.T01 AT1G56145 37.243 341 197 8 358 690 527 858 1.94e-55 204
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MsG0680031519.01.T01 AT5G38250 37.017 362 204 13 343 694 244 591 2.08e-55 200
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MsG0680031519.01.T01 AT2G43700 34.848 330 206 4 368 692 264 589 5.94e-54 196
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MsG0680031519.01.T01 AT1G61430 27.838 740 409 29 22 696 70 749 1.22e-53 198
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MsG0680031519.01.T01 AT1G07570 38.629 321 177 10 383 687 37 353 1.44e-53 190
MsG0680031519.01.T01 AT3G59700 33.718 347 218 6 353 692 276 617 1.46e-53 196
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MsG0680031519.01.T01 AT4G23270 38.361 305 175 6 402 697 314 614 2.26e-53 195
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MsG0680031519.01.T01 AT2G28930 38.782 312 173 8 391 687 49 357 2.13e-52 187
MsG0680031519.01.T01 AT1G61430 27.297 740 416 27 22 696 93 775 2.15e-52 194
MsG0680031519.01.T01 AT5G38240 36.857 350 199 10 357 694 209 548 2.21e-52 191
MsG0680031519.01.T01 AT1G29730 39.610 308 175 5 401 701 660 963 2.89e-52 196
MsG0680031519.01.T01 AT1G56145 34.783 368 196 8 358 690 630 988 3.26e-52 196
MsG0680031519.01.T01 AT5G01020 40.134 299 156 9 402 685 57 347 3.65e-52 186
MsG0680031519.01.T01 AT5G28680 37.417 302 178 6 395 690 501 797 3.68e-52 194
MsG0680031519.01.T01 AT5G28680 37.417 302 178 6 395 690 501 797 3.68e-52 194
MsG0680031519.01.T01 AT5G38240 36.857 350 199 10 357 694 255 594 3.84e-52 191
MsG0680031519.01.T01 AT1G29740 40.972 288 162 4 401 684 664 947 3.85e-52 196
MsG0680031519.01.T01 AT1G70250 34.853 373 214 11 340 697 390 748 4.02e-52 194
MsG0680031519.01.T01 AT4G04540 37.621 311 165 8 399 696 309 603 4.12e-52 191
MsG0680031519.01.T01 AT2G28930 38.782 312 173 8 391 687 57 365 4.29e-52 186
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MsG0680031519.01.T01 AT1G17230 37.627 295 163 7 402 684 787 1072 2.13e-51 193
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MsG0680031519.01.T01 AT1G67520 36.928 306 176 8 402 695 276 576 5.08e-50 185
MsG0680031519.01.T01 AT1G67520 36.928 306 176 8 402 695 276 576 5.08e-50 185
MsG0680031519.01.T01 AT5G35580 39.482 309 166 10 393 687 67 368 5.32e-50 182
MsG0680031519.01.T01 AT1G70520 34.483 348 208 7 362 694 273 615 5.36e-50 186
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MsG0680031519.01.T01 AT4G27290 36.964 303 179 6 405 700 456 753 5.93e-50 187
MsG0680031519.01.T01 AT4G11470 36.570 309 175 8 402 697 327 627 6.14e-50 186
MsG0680031519.01.T01 AT1G11050 33.155 374 219 7 349 694 219 589 6.20e-50 185
MsG0680031519.01.T01 AT2G05940 38.742 302 172 7 393 684 66 364 6.86e-50 181
MsG0680031519.01.T01 AT4G11470 36.570 309 175 8 402 697 332 632 7.20e-50 186
MsG0680031519.01.T01 AT5G42440 36.577 298 176 8 395 685 62 353 8.04e-50 178
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MsG0680031519.01.T01 AT1G51890 31.884 345 200 9 366 685 234 568 1.43e-47 178
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MsG0680031519.01.T01 AT4G13190 43.182 220 116 4 401 613 58 275 1.60e-47 170
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MsG0680031519.01.T01 AT4G35600 35.938 320 187 8 391 695 63 379 2.40e-47 173
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MsG0680031519.01.T01 AT5G07280 36.184 304 184 4 390 687 893 1192 2.46e-47 181
MsG0680031519.01.T01 AT5G56890 38.644 295 165 7 401 685 710 998 2.88e-47 181
MsG0680031519.01.T01 AT1G66920 36.825 315 157 10 398 703 293 574 2.96e-47 177
MsG0680031519.01.T01 AT5G48740 35.159 347 204 11 351 685 541 878 3.01e-47 180
MsG0680031519.01.T01 AT2G25220 36.455 299 170 7 402 690 85 373 3.15e-47 172
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MsG0680031519.01.T01 AT5G15730 34.754 305 172 7 393 689 95 380 3.46e-47 173
MsG0680031519.01.T01 AT5G15730 34.754 305 172 7 393 689 95 380 3.46e-47 173
MsG0680031519.01.T01 AT3G46400 32.303 356 212 9 357 692 507 853 3.57e-47 180
MsG0680031519.01.T01 AT1G26150 36.275 306 162 7 402 689 418 708 3.62e-47 179
MsG0680031519.01.T01 AT5G59670 34.462 325 198 7 374 692 526 841 3.73e-47 180
MsG0680031519.01.T01 AT5G59670 34.462 325 198 7 374 692 526 841 3.73e-47 180
MsG0680031519.01.T01 AT4G23250 35.238 315 185 8 395 697 335 642 3.76e-47 178
MsG0680031519.01.T01 AT2G25220 36.455 299 170 7 402 690 134 422 3.80e-47 173
MsG0680031519.01.T01 AT1G51880 32.635 334 208 7 366 692 537 860 4.39e-47 179
MsG0680031519.01.T01 AT3G58690 34.783 322 178 9 396 698 69 377 4.89e-47 172
MsG0680031519.01.T01 AT1G51880 32.635 334 208 7 366 692 519 842 5.16e-47 179
MsG0680031519.01.T01 AT4G23230 35.370 311 185 8 395 696 318 621 5.25e-47 177
MsG0680031519.01.T01 AT2G35620 35.484 279 169 5 418 693 310 580 5.35e-47 176
MsG0680031519.01.T01 AT2G35620 35.484 279 169 5 418 693 310 580 5.35e-47 176
MsG0680031519.01.T01 AT2G35620 35.484 279 169 5 418 693 310 580 5.35e-47 176
MsG0680031519.01.T01 AT2G35620 35.484 279 169 5 418 693 310 580 5.35e-47 176
MsG0680031519.01.T01 AT2G29000 33.993 303 189 4 387 685 540 835 5.56e-47 179
MsG0680031519.01.T01 AT1G31420 35.971 278 169 5 418 693 312 582 5.61e-47 176
MsG0680031519.01.T01 AT1G24030 41.277 235 125 6 402 626 50 281 6.25e-47 170
MsG0680031519.01.T01 AT2G25220 36.455 299 170 7 402 690 139 427 6.41e-47 172
MsG0680031519.01.T01 AT4G23250 35.127 316 186 8 394 697 339 647 6.47e-47 177
MsG0680031519.01.T01 AT1G11330 26.259 735 421 27 24 684 106 793 6.66e-47 179
MsG0680031519.01.T01 AT2G19230 35.110 319 193 7 372 685 531 840 6.67e-47 179
MsG0680031519.01.T01 AT1G51880 32.635 334 208 7 366 692 545 868 6.70e-47 179
MsG0680031519.01.T01 AT1G61360 30.454 463 270 14 257 697 271 703 6.99e-47 178
MsG0680031519.01.T01 AT1G61360 30.454 463 270 14 257 697 271 703 6.99e-47 178
MsG0680031519.01.T01 AT1G61360 30.454 463 270 14 257 697 271 703 6.99e-47 178
MsG0680031519.01.T01 AT4G20450 33.660 306 192 4 384 685 563 861 7.28e-47 179
MsG0680031519.01.T01 AT5G16900 34.483 319 191 7 380 692 544 850 7.69e-47 179
MsG0680031519.01.T01 AT5G16900 34.483 319 191 7 380 692 544 850 7.69e-47 179
MsG0680031519.01.T01 AT1G51890 31.884 345 200 9 366 685 442 776 7.91e-47 178
MsG0680031519.01.T01 AT1G11330 26.459 737 419 28 24 684 106 795 8.27e-47 179
MsG0680031519.01.T01 AT5G49770 36.328 256 156 4 439 690 658 910 8.52e-47 179
MsG0680031519.01.T01 AT1G61360 30.454 463 270 14 257 697 352 784 1.01e-46 178
MsG0680031519.01.T01 AT1G51890 31.884 345 200 9 366 685 506 840 1.03e-46 178
MsG0680031519.01.T01 AT2G19230 34.796 319 194 7 372 685 530 839 1.06e-46 178
MsG0680031519.01.T01 AT1G31420 35.842 279 169 5 418 693 312 583 1.16e-46 175
MsG0680031519.01.T01 AT1G31420 35.842 279 169 5 418 693 312 583 1.16e-46 175
MsG0680031519.01.T01 AT2G01820 35.430 302 171 9 402 687 573 866 1.21e-46 179
MsG0680031519.01.T01 AT1G24030 41.277 235 125 6 402 626 64 295 1.44e-46 170
MsG0680031519.01.T01 AT5G18610 36.275 306 180 8 401 695 70 371 1.55e-46 173
MsG0680031519.01.T01 AT5G18610 36.275 306 180 8 401 695 70 371 1.55e-46 173
MsG0680031519.01.T01 AT5G18610 36.275 306 180 8 401 695 70 371 1.55e-46 173
MsG0680031519.01.T01 AT1G51860 34.343 297 179 6 402 692 430 716 1.55e-46 177
MsG0680031519.01.T01 AT4G04570 44.498 209 107 4 410 612 180 385 1.87e-46 170
MsG0680031519.01.T01 AT1G76370 41.772 237 126 5 401 630 62 293 1.94e-46 169
MsG0680031519.01.T01 AT2G18470 42.920 226 122 3 392 613 262 484 2.14e-46 173
MsG0680031519.01.T01 AT2G28960 34.106 302 184 6 397 692 426 718 2.15e-46 176
MsG0680031519.01.T01 AT4G04500 32.773 357 221 8 361 703 289 640 2.28e-46 175
MsG0680031519.01.T01 AT2G07180 35.570 298 179 7 398 685 74 368 2.31e-46 171
MsG0680031519.01.T01 AT2G07180 35.570 298 179 7 398 685 74 368 2.31e-46 171
MsG0680031519.01.T01 AT3G16030 35.082 305 183 7 402 695 392 692 2.34e-46 176
MsG0680031519.01.T01 AT3G16030 35.082 305 183 7 402 695 515 815 2.42e-46 177
MsG0680031519.01.T01 AT1G11340 30.735 449 252 15 289 696 368 798 2.59e-46 177
MsG0680031519.01.T01 AT1G51860 34.343 297 179 6 402 692 574 860 2.79e-46 177
MsG0680031519.01.T01 AT3G21340 34.615 286 172 6 402 681 582 858 2.81e-46 177
MsG0680031519.01.T01 AT1G61460 26.265 731 414 26 4 696 76 719 2.97e-46 176
MsG0680031519.01.T01 AT3G16030 35.082 305 183 7 402 695 536 836 3.13e-46 177
MsG0680031519.01.T01 AT2G26290 36.304 303 172 8 402 690 76 371 3.16e-46 170
MsG0680031519.01.T01 AT4G23250 35.238 315 185 8 395 697 335 642 3.24e-46 177
MsG0680031519.01.T01 AT3G46330 33.438 320 192 7 374 681 499 809 3.26e-46 177
MsG0680031519.01.T01 AT3G45420 34.343 297 181 7 402 692 338 626 3.46e-46 175

Find 149 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 179 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CTCATTGTTGGCCTCATTTC+AGG 0.081724 6:-21456264 None:intergenic
AGAGCAACACTTGATTATTA+TGG 0.224452 6:+21454727 MsG0680031519.01.T01:CDS
AAAAGATCACCTCTAGTTAA+TGG 0.231262 6:+21455190 MsG0680031519.01.T01:CDS
GTTGTCTTTATTCAAATTAT+TGG 0.234688 6:-21455290 None:intergenic
GTTTCTCCTCTTGGTAAAAT+AGG 0.242279 6:+21455256 MsG0680031519.01.T01:CDS
CAAAGGATTGGATTTGCTTT+GGG 0.255413 6:+21455781 MsG0680031519.01.T01:CDS
CACCCGCCAAATTGATTACT+TGG 0.259684 6:-21454950 None:intergenic
TGTTGTTGCTGTTAAGAAAT+TGG 0.264118 6:+21455567 MsG0680031519.01.T01:CDS
ACAACAAATCTGTTATTGTT+TGG 0.270168 6:+21454353 MsG0680031519.01.T01:CDS
GAACCTTCCACTTGTGAAAT+TGG 0.271202 6:-21454461 None:intergenic
CGTTCCTCGGATCATGGTTT+TGG 0.282567 6:-21455959 None:intergenic
CACTGCTATATTCAATGAAA+TGG 0.297220 6:+21454834 MsG0680031519.01.T01:CDS
CAACAAATCTGTTATTGTTT+GGG 0.299746 6:+21454354 MsG0680031519.01.T01:CDS
ATTCTTCGAGGTCTACTAAT+TGG 0.318078 6:+21455325 MsG0680031519.01.T01:CDS
GGAACATTCTTAAACCATTC+AGG 0.319636 6:-21455997 None:intergenic
GTTAACTCATATAAATCTTC+TGG 0.322994 6:-21455031 None:intergenic
ATAGATCCAAGTAATCAATT+TGG 0.330365 6:+21454944 MsG0680031519.01.T01:intron
GGAATCAAACTGAAGGAAAA+AGG 0.340634 6:-21456339 None:intergenic
TATGGAACCATGCTTGATAA+TGG 0.344619 6:+21454313 MsG0680031519.01.T01:CDS
TTGGGCTTGCGATTGTTATA+TGG 0.346850 6:+21456137 MsG0680031519.01.T01:CDS
TCAAAGGATTGGATTTGCTT+TGG 0.348350 6:+21455780 MsG0680031519.01.T01:CDS
TGCATGACCATCCTCATTGT+TGG 0.349392 6:-21456276 None:intergenic
CCTAATCAATCGCTTGAGTT+AGG 0.354045 6:+21454409 MsG0680031519.01.T01:CDS
TGACAGTCATGTTGAGAATA+AGG 0.364539 6:-21455103 None:intergenic
AAAGTGGATGTTTACAGCTT+TGG 0.374429 6:+21456030 MsG0680031519.01.T01:CDS
AGTGGATAAAGATAGCAATT+TGG 0.379762 6:+21456226 MsG0680031519.01.T01:CDS
TCCTCGCGTTCCTCGGATCA+TGG 0.379944 6:-21455965 None:intergenic
AGCCTTGCAAACATCTTGTT+TGG 0.383123 6:+21455736 MsG0680031519.01.T01:CDS
ATAGCAGTGCAGATGTTATC+AGG 0.385024 6:-21454820 None:intergenic
CTCAATTTCACACTTGGTTG+TGG 0.386954 6:+21454977 MsG0680031519.01.T01:CDS
GTGGAAATTACAAATAATAA+TGG 0.389711 6:+21454634 MsG0680031519.01.T01:CDS
CTCTGAGAATCTTGAAGTTA+AGG 0.391832 6:-21454437 None:intergenic
CTGTTCTTACTAATGTGAAT+TGG 0.399101 6:+21455053 MsG0680031519.01.T01:CDS
TGTCTTTAATAGCTTACTCT+TGG 0.399840 6:+21455354 MsG0680031519.01.T01:CDS
CCATAGGAAACAATATCGTT+TGG 0.401223 6:-21454295 None:intergenic
GAACTAGGTAGAGGTTCCTT+TGG 0.404011 6:+21455502 MsG0680031519.01.T01:CDS
CAAGCGATTGATTAGGCAAA+AGG 0.405236 6:-21454402 None:intergenic
CCAAACGATATTGTTTCCTA+TGG 0.416018 6:+21454295 MsG0680031519.01.T01:CDS
GGAAGGGAGAATAGATGCTT+TGG 0.417284 6:+21456158 MsG0680031519.01.T01:CDS
CTGCACAAAATGAATCCATT+TGG 0.419572 6:+21454263 MsG0680031519.01.T01:CDS
ATTAGTAGACCTCGAAGAAT+CGG 0.421793 6:-21455322 None:intergenic
CGAGTTAACCCGATTCTTCG+AGG 0.426122 6:+21455313 MsG0680031519.01.T01:CDS
TGTCGTAGGCGCAACTCTCT+TGG 0.431085 6:+21455417 MsG0680031519.01.T01:CDS
CTTGGTTGTGGAGCTGATAA+TGG 0.435800 6:+21454989 MsG0680031519.01.T01:CDS
TGACTTTGTTGAAGCCGAAA+AGG 0.438890 6:+21455392 MsG0680031519.01.T01:CDS
AAGACAAGAGTTTCTCCTCT+TGG 0.439949 6:+21455247 MsG0680031519.01.T01:CDS
AGAAGGCAATATTGACAGAT+TGG 0.441848 6:+21456118 MsG0680031519.01.T01:CDS
CATCATCATTAAAATAAAGT+TGG 0.444997 6:-21454483 None:intergenic
GAAGGCAATATTGACAGATT+GGG 0.447284 6:+21456119 MsG0680031519.01.T01:CDS
CCCACTTGGAATCAAAGGAT+TGG 0.451317 6:+21455769 MsG0680031519.01.T01:CDS
GACTTTGTTGAAGCCGAAAA+GGG 0.452895 6:+21455393 MsG0680031519.01.T01:CDS
AGGCTGCATCCGTTCATAAT+CGG 0.453105 6:-21455083 None:intergenic
ACGGTGAAGATTTCTGACTT+TGG 0.454702 6:+21455901 MsG0680031519.01.T01:CDS
CTCGAAGAATCGGGTTAACT+CGG 0.456924 6:-21455312 None:intergenic
CAGCTTTGGTGCCATGTTGT+TGG 0.466280 6:+21456044 MsG0680031519.01.T01:CDS
ATCCGTTCATAATCGGCTAA+TGG 0.467153 6:-21455076 None:intergenic
TGGATTGGCTAAATTGTTGT+TGG 0.467829 6:+21455921 MsG0680031519.01.T01:CDS
ACTGCTATATTCAATGAAAT+GGG 0.469189 6:+21454835 MsG0680031519.01.T01:CDS
GAAGATTTCTGACTTTGGAT+TGG 0.471579 6:+21455906 MsG0680031519.01.T01:CDS
CTACATATCCTCGCGTTCCT+CGG 0.474206 6:-21455972 None:intergenic
AGTGTGGTGCTGATGGAGTC+AGG 0.477854 6:+21456087 MsG0680031519.01.T01:CDS
TGTTCCAGTGACGGCTAAAG+TGG 0.484951 6:+21456014 MsG0680031519.01.T01:CDS
CTTTATGTCACAATGAATGA+TGG 0.487951 6:-21455848 None:intergenic
ATGCCTTGGATGACTTTGAC+AGG 0.488332 6:+21456196 MsG0680031519.01.T01:CDS
ACATCCACTTTAGCCGTCAC+TGG 0.489140 6:-21456018 None:intergenic
AAGACTGAGTTGCGAGCCAT+TGG 0.489620 6:+21455622 MsG0680031519.01.T01:CDS
TACTGCTAGAATCAAACCTC+AGG 0.493322 6:+21454657 MsG0680031519.01.T01:CDS
AGGGAGAATAGATGCTTTGG+TGG 0.495057 6:+21456161 MsG0680031519.01.T01:CDS
CAAAACCCACTTGGAATCAA+AGG 0.496549 6:+21455764 MsG0680031519.01.T01:CDS
GTTTGGTTGTGCTGTCCAAA+TGG 0.500759 6:-21454278 None:intergenic
GCTCTATAATAATACAACTT+AGG 0.501136 6:-21454709 None:intergenic
TCCAATCCTTTGATTCCAAG+TGG 0.502300 6:-21455770 None:intergenic
AAAGTTTCCATTATCAAGCA+TGG 0.505441 6:-21454320 None:intergenic
ATATTCAATGAAATGGGAAG+TGG 0.505674 6:+21454841 MsG0680031519.01.T01:CDS
TTTATTGAAGAACTAGGTAG+AGG 0.507800 6:+21455493 MsG0680031519.01.T01:CDS
GGAGTCAGGGGAGGAAGAGA+AGG 0.508513 6:+21456101 MsG0680031519.01.T01:CDS
AACCTCGTACTAGCACCAAC+AGG 0.509463 6:+21454199 MsG0680031519.01.T01:CDS
ATTATCAAGCATGGTTCCAT+AGG 0.512303 6:-21454311 None:intergenic
TGTCAACTCAATTTCACACT+TGG 0.515793 6:+21454971 MsG0680031519.01.T01:CDS
TTTGGGGATTGCAAGAGGAT+TGG 0.518849 6:+21455798 MsG0680031519.01.T01:CDS
GGAGAATGATCAAGATGCCT+TGG 0.527823 6:+21456182 MsG0680031519.01.T01:CDS
TCTTTATTCAAATTATTGGA+AGG 0.533604 6:-21455286 None:intergenic
ACTCATAGATGAGTACTTCA+CGG 0.534339 6:+21455882 MsG0680031519.01.T01:CDS
TCACATGTTCAGCTAACATC+AGG 0.536342 6:+21454223 MsG0680031519.01.T01:CDS
TGACACAATATTCTCATCCA+AGG 0.539740 6:+21454755 MsG0680031519.01.T01:CDS
TTAGTAGACCTCGAAGAATC+GGG 0.539806 6:-21455321 None:intergenic
ACCTTTGAAAACAATTCCAA+AGG 0.539869 6:-21455518 None:intergenic
GGCCATTAGCCGATTATGAA+CGG 0.541732 6:+21455074 MsG0680031519.01.T01:CDS
GTCCAAACAAGATGTTTGCA+AGG 0.544090 6:-21455738 None:intergenic
AAAGGATTGGATTTGCTTTG+GGG 0.544509 6:+21455782 MsG0680031519.01.T01:CDS
TCAGAGACCAATTTCACAAG+TGG 0.544525 6:+21454454 MsG0680031519.01.T01:CDS
GATCCAAGTAATCAATTTGG+CGG 0.546725 6:+21454947 MsG0680031519.01.T01:intron
CCTAACTCAAGCGATTGATT+AGG 0.547040 6:-21454409 None:intergenic
AACAAGGATGGACTAGTATG+AGG 0.547394 6:+21454791 MsG0680031519.01.T01:CDS
TTGGACAAACAAAACCCACT+TGG 0.553403 6:+21455755 MsG0680031519.01.T01:CDS
ACGCGTTAAAAGAAGCTACA+AGG 0.554132 6:+21455467 MsG0680031519.01.T01:CDS
AAGCGATTGATTAGGCAAAA+GGG 0.554283 6:-21454401 None:intergenic
GTTAATGGAAGAGAAGAAAG+TGG 0.554908 6:+21455205 MsG0680031519.01.T01:CDS
GAGGATATGTAGCTCCTGAA+TGG 0.556805 6:+21455983 MsG0680031519.01.T01:CDS
TTGATTGGATATTGTGATGA+GGG 0.556831 6:+21455673 MsG0680031519.01.T01:CDS
TCTTCAGAGACCAAATATGT+TGG 0.561683 6:+21455164 MsG0680031519.01.T01:CDS
GACACAATATTCTCATCCAA+GGG 0.563057 6:+21454756 MsG0680031519.01.T01:CDS
CCAATCCTTTGATTCCAAGT+GGG 0.563468 6:-21455769 None:intergenic
CTTGCGATTGTTATATGGAA+GGG 0.564380 6:+21456142 MsG0680031519.01.T01:CDS
TTTATGTCACAATGAATGAT+GGG 0.565957 6:-21455847 None:intergenic
ATCCAAGTAATCAATTTGGC+GGG 0.566714 6:+21454948 MsG0680031519.01.T01:CDS
TCTTCTCTTCCATTAACTAG+AGG 0.567892 6:-21455199 None:intergenic
TTCAAGAACATCCTGAAATG+AGG 0.572226 6:+21456253 MsG0680031519.01.T01:CDS
ATGGTCATGCAAATGCTAGA+AGG 0.573747 6:+21456288 MsG0680031519.01.T01:CDS
CGCGTTAAAAGAAGCTACAA+GGG 0.576466 6:+21455468 MsG0680031519.01.T01:CDS
TCATGTTAAGTCCACTTGCA+TGG 0.579811 6:+21454518 MsG0680031519.01.T01:CDS
GCTTGCGATTGTTATATGGA+AGG 0.586026 6:+21456141 MsG0680031519.01.T01:CDS
ACACTAAAGCAAAACAAGGA+TGG 0.586253 6:+21454779 MsG0680031519.01.T01:CDS
TTTGCTTTGGGGATTGCAAG+AGG 0.588856 6:+21455793 MsG0680031519.01.T01:CDS
ACTTTGACAGGTTAGCAAAG+TGG 0.590334 6:+21456208 MsG0680031519.01.T01:CDS
GTTTAAGAATGTTCCAGTGA+CGG 0.593324 6:+21456005 MsG0680031519.01.T01:CDS
TGAGGGAATGCATAGAATGT+TGG 0.594810 6:+21455690 MsG0680031519.01.T01:CDS
GTGCTAGTACGAGGTTGTTG+AGG 0.595374 6:-21454192 None:intergenic
ACCATGATCCGAGGAACGCG+AGG 0.597961 6:+21455964 MsG0680031519.01.T01:CDS
TGAATCAGGAGATATTTATG+TGG 0.601671 6:+21454615 MsG0680031519.01.T01:CDS
AGACCAATTTCACAAGTGGA+AGG 0.602296 6:+21454458 MsG0680031519.01.T01:CDS
AATTTGTAACGAAATTGAGT+AGG 0.609342 6:-21454541 None:intergenic
AAGTCAAGGAATCAAACTGA+AGG 0.612037 6:-21456346 None:intergenic
AGCTGAACATGTGATCCTGT+TGG 0.613140 6:-21454214 None:intergenic
TTGCTGTTAAGAAATTGGAT+CGG 0.623848 6:+21455572 MsG0680031519.01.T01:CDS
CTGAAATGAGGCCAACAATG+AGG 0.624246 6:+21456265 MsG0680031519.01.T01:CDS
GTTAGCGCAAGATCGCGAGA+AGG 0.635336 6:+21455594 MsG0680031519.01.T01:CDS
TGAGAATCTTGAAGTTAAGG+TGG 0.635720 6:-21454434 None:intergenic
AATGAGGCCAACAATGAGGA+TGG 0.635945 6:+21456269 MsG0680031519.01.T01:CDS
TTAGGCAAAAGGGTGTCAGT+AGG 0.639454 6:-21454391 None:intergenic
GGTGCTGATGGAGTCAGGGG+AGG 0.640134 6:+21456092 MsG0680031519.01.T01:CDS
GTGTGGTGCTGATGGAGTCA+GGG 0.645422 6:+21456088 MsG0680031519.01.T01:CDS
TGTGGAGCTGATAATGGTGA+AGG 0.645657 6:+21454995 MsG0680031519.01.T01:CDS
TAACCTGTCAAAGTCATCCA+AGG 0.645853 6:-21456199 None:intergenic
GTTGATTGGATATTGTGATG+AGG 0.649134 6:+21455672 MsG0680031519.01.T01:CDS
CATGTTCAGCTAACATCAGG+TGG 0.649139 6:+21454226 MsG0680031519.01.T01:CDS
AAGCCGAAAAGGGTTGTCGT+AGG 0.653078 6:+21455403 MsG0680031519.01.T01:CDS
AATTGAGTAGGCCATGCAAG+TGG 0.656289 6:-21454529 None:intergenic
CATGCAAATGCTAGAAGGTG+TGG 0.663425 6:+21456293 MsG0680031519.01.T01:CDS
AATGGAAGAGAAGAAAGTGG+TGG 0.665028 6:+21455208 MsG0680031519.01.T01:CDS
TGTGGTGCTGATGGAGTCAG+GGG 0.670613 6:+21456089 MsG0680031519.01.T01:CDS
GCGTTAAAAGAAGCTACAAG+GGG 0.675299 6:+21455469 MsG0680031519.01.T01:CDS
TCAAACCTCAGGGTACACAA+TGG 0.679857 6:+21454668 MsG0680031519.01.T01:CDS
GTGTATGAGTTCATGAACAA+TGG 0.684533 6:+21455712 MsG0680031519.01.T01:CDS
ACTGCTAGAATCAAACCTCA+GGG 0.685277 6:+21454658 MsG0680031519.01.T01:CDS
ATCCTGTTGGTGCTAGTACG+AGG 0.687632 6:-21454201 None:intergenic
GCAAACAATTTCCAACAACA+TGG 0.689003 6:-21456055 None:intergenic
AGGGACACTAAAGCAAAACA+AGG 0.696719 6:+21454775 MsG0680031519.01.T01:CDS
AGAACCAAAACCATGATCCG+AGG 0.697074 6:+21455955 MsG0680031519.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! TACAAATTTTACTATAGTAT+TGG + Chr6:21454556-21454575 MsG0680031519.01.T01:CDS 15.0%
!! CATCATCATTAAAATAAAGT+TGG - Chr6:21454486-21454505 None:intergenic 20.0%
!! GTGGAAATTACAAATAATAA+TGG + Chr6:21454634-21454653 MsG0680031519.01.T01:CDS 20.0%
!! GTTGTCTTTATTCAAATTAT+TGG - Chr6:21455293-21455312 None:intergenic 20.0%
!! TCTTTATTCAAATTATTGGA+AGG - Chr6:21455289-21455308 None:intergenic 20.0%
! AATTTGTAACGAAATTGAGT+AGG - Chr6:21454544-21454563 None:intergenic 25.0%
! ACAACAAATCTGTTATTGTT+TGG + Chr6:21454353-21454372 MsG0680031519.01.T01:CDS 25.0%
! ACTGCTATATTCAATGAAAT+GGG + Chr6:21454835-21454854 MsG0680031519.01.T01:CDS 25.0%
! ATAGATCCAAGTAATCAATT+TGG + Chr6:21454944-21454963 MsG0680031519.01.T01:intron 25.0%
! CAACAAATCTGTTATTGTTT+GGG + Chr6:21454354-21454373 MsG0680031519.01.T01:CDS 25.0%
! GCTCTATAATAATACAACTT+AGG - Chr6:21454712-21454731 None:intergenic 25.0%
! GTTAACTCATATAAATCTTC+TGG - Chr6:21455034-21455053 None:intergenic 25.0%
! TCTATCAATGAATAACCATA+AGG - Chr6:21454929-21454948 None:intergenic 25.0%
! TTTATGTCACAATGAATGAT+GGG - Chr6:21455850-21455869 None:intergenic 25.0%
!! ATCTTTTCTTCCAACATATT+TGG - Chr6:21455177-21455196 None:intergenic 25.0%
!! TCATCTATGAGTATATTTTG+AGG - Chr6:21455874-21455893 None:intergenic 25.0%
!!! AGTTTAGTTTTTGATGAATC+AGG + Chr6:21454601-21454620 MsG0680031519.01.T01:CDS 25.0%
AAAAGATCACCTCTAGTTAA+TGG + Chr6:21455190-21455209 MsG0680031519.01.T01:CDS 30.0%
AAAGTTTCCATTATCAAGCA+TGG - Chr6:21454323-21454342 None:intergenic 30.0%
AGAGCAACACTTGATTATTA+TGG + Chr6:21454727-21454746 MsG0680031519.01.T01:CDS 30.0%
AGTGGATAAAGATAGCAATT+TGG + Chr6:21456226-21456245 MsG0680031519.01.T01:CDS 30.0%
ATATTCAATGAAATGGGAAG+TGG + Chr6:21454841-21454860 MsG0680031519.01.T01:CDS 30.0%
CACTGCTATATTCAATGAAA+TGG + Chr6:21454834-21454853 MsG0680031519.01.T01:CDS 30.0%
CTATAATAGCTATTGTTCCA+TGG + Chr6:21454877-21454896 MsG0680031519.01.T01:intron 30.0%
CTGTTCTTACTAATGTGAAT+TGG + Chr6:21455053-21455072 MsG0680031519.01.T01:CDS 30.0%
CTTTATGTCACAATGAATGA+TGG - Chr6:21455851-21455870 None:intergenic 30.0%
TGAATCAGGAGATATTTATG+TGG + Chr6:21454615-21454634 MsG0680031519.01.T01:CDS 30.0%
TGTCTTTAATAGCTTACTCT+TGG + Chr6:21455354-21455373 MsG0680031519.01.T01:CDS 30.0%
TTGATTGGATATTGTGATGA+GGG + Chr6:21455673-21455692 MsG0680031519.01.T01:CDS 30.0%
TTTATTGAAGAACTAGGTAG+AGG + Chr6:21455493-21455512 MsG0680031519.01.T01:CDS 30.0%
! AAAAACTTGGTGAAGTTGAT+TGG + Chr6:21455658-21455677 MsG0680031519.01.T01:CDS 30.0%
! ACCTTTGAAAACAATTCCAA+AGG - Chr6:21455521-21455540 None:intergenic 30.0%
! ATTAGGTATCTGATTTTCCA+TGG - Chr6:21454897-21454916 None:intergenic 30.0%
! TGTTGTTGCTGTTAAGAAAT+TGG + Chr6:21455567-21455586 MsG0680031519.01.T01:CDS 30.0%
! TTGCTGTTAAGAAATTGGAT+CGG + Chr6:21455572-21455591 MsG0680031519.01.T01:CDS 30.0%
!!! TCCTTTGGAATTGTTTTCAA+AGG + Chr6:21455517-21455536 MsG0680031519.01.T01:CDS 30.0%
AAAGTGGATGTTTACAGCTT+TGG + Chr6:21456030-21456049 MsG0680031519.01.T01:CDS 35.0%
AAGCGATTGATTAGGCAAAA+GGG - Chr6:21454404-21454423 None:intergenic 35.0%
ACACTAAAGCAAAACAAGGA+TGG + Chr6:21454779-21454798 MsG0680031519.01.T01:CDS 35.0%
ACTCATAGATGAGTACTTCA+CGG + Chr6:21455882-21455901 MsG0680031519.01.T01:CDS 35.0%
AGAAGGCAATATTGACAGAT+TGG + Chr6:21456118-21456137 MsG0680031519.01.T01:CDS 35.0%
ATCCAAGTAATCAATTTGGC+GGG + Chr6:21454948-21454967 MsG0680031519.01.T01:CDS 35.0%
ATTAGTAGACCTCGAAGAAT+CGG - Chr6:21455325-21455344 None:intergenic 35.0%
ATTATCAAGCATGGTTCCAT+AGG - Chr6:21454314-21454333 None:intergenic 35.0%
ATTCTTCGAGGTCTACTAAT+TGG + Chr6:21455325-21455344 MsG0680031519.01.T01:CDS 35.0%
CCAAACGATATTGTTTCCTA+TGG + Chr6:21454295-21454314 MsG0680031519.01.T01:CDS 35.0%
CCATAAGGACATCTACAATT+AGG - Chr6:21454914-21454933 None:intergenic 35.0%
CCATAGGAAACAATATCGTT+TGG - Chr6:21454298-21454317 None:intergenic 35.0%
CCTAATTGTAGATGTCCTTA+TGG + Chr6:21454911-21454930 MsG0680031519.01.T01:intron 35.0%
CTGCACAAAATGAATCCATT+TGG + Chr6:21454263-21454282 MsG0680031519.01.T01:CDS 35.0%
CTTGCGATTGTTATATGGAA+GGG + Chr6:21456142-21456161 MsG0680031519.01.T01:CDS 35.0%
GAAGATTTCTGACTTTGGAT+TGG + Chr6:21455906-21455925 MsG0680031519.01.T01:CDS 35.0%
GAAGGCAATATTGACAGATT+GGG + Chr6:21456119-21456138 MsG0680031519.01.T01:CDS 35.0%
GACACAATATTCTCATCCAA+GGG + Chr6:21454756-21454775 MsG0680031519.01.T01:CDS 35.0%
GATCCAAGTAATCAATTTGG+CGG + Chr6:21454947-21454966 MsG0680031519.01.T01:intron 35.0%
GCAAACAATTTCCAACAACA+TGG - Chr6:21456058-21456077 None:intergenic 35.0%
GGAACATTCTTAAACCATTC+AGG - Chr6:21456000-21456019 None:intergenic 35.0%
GGAATCAAACTGAAGGAAAA+AGG - Chr6:21456342-21456361 None:intergenic 35.0%
GTGTATGAGTTCATGAACAA+TGG + Chr6:21455712-21455731 MsG0680031519.01.T01:CDS 35.0%
GTTAATGGAAGAGAAGAAAG+TGG + Chr6:21455205-21455224 MsG0680031519.01.T01:CDS 35.0%
GTTGATTGGATATTGTGATG+AGG + Chr6:21455672-21455691 MsG0680031519.01.T01:CDS 35.0%
GTTTAAGAATGTTCCAGTGA+CGG + Chr6:21456005-21456024 MsG0680031519.01.T01:CDS 35.0%
GTTTCTCCTCTTGGTAAAAT+AGG + Chr6:21455256-21455275 MsG0680031519.01.T01:CDS 35.0%
TAAAACCTGCCACAAAAACT+TGG + Chr6:21455645-21455664 MsG0680031519.01.T01:CDS 35.0%
TATGGAACCATGCTTGATAA+TGG + Chr6:21454313-21454332 MsG0680031519.01.T01:CDS 35.0%
TCTTCAGAGACCAAATATGT+TGG + Chr6:21455164-21455183 MsG0680031519.01.T01:CDS 35.0%
TCTTCTCTTCCATTAACTAG+AGG - Chr6:21455202-21455221 None:intergenic 35.0%
TGACACAATATTCTCATCCA+AGG + Chr6:21454755-21454774 MsG0680031519.01.T01:CDS 35.0%
TGACAGTCATGTTGAGAATA+AGG - Chr6:21455106-21455125 None:intergenic 35.0%
TGAGAATCTTGAAGTTAAGG+TGG - Chr6:21454437-21454456 None:intergenic 35.0%
TGTCAACTCAATTTCACACT+TGG + Chr6:21454971-21454990 MsG0680031519.01.T01:CDS 35.0%
TTCAAGAACATCCTGAAATG+AGG + Chr6:21456253-21456272 MsG0680031519.01.T01:CDS 35.0%
! AAAGGATTGGATTTGCTTTG+GGG + Chr6:21455782-21455801 MsG0680031519.01.T01:CDS 35.0%
! CAAAGGATTGGATTTGCTTT+GGG + Chr6:21455781-21455800 MsG0680031519.01.T01:CDS 35.0%
! CTAGTACCTATTTTACCAAG+AGG - Chr6:21455265-21455284 None:intergenic 35.0%
! CTCTGAGAATCTTGAAGTTA+AGG - Chr6:21454440-21454459 None:intergenic 35.0%
! TCAAAGGATTGGATTTGCTT+TGG + Chr6:21455780-21455799 MsG0680031519.01.T01:CDS 35.0%
! TCAACTTCACCAAGTTTTTG+TGG - Chr6:21455657-21455676 None:intergenic 35.0%
!! TGGATTGGCTAAATTGTTGT+TGG + Chr6:21455921-21455940 MsG0680031519.01.T01:CDS 35.0%
!!! AGGGGTTTTATTGAAGAACT+AGG + Chr6:21455487-21455506 MsG0680031519.01.T01:CDS 35.0%
!!! GGTTTTGGTTCTACTTTGTT+CGG - Chr6:21455947-21455966 None:intergenic 35.0%
AAACTGAAGGAAAAAGGCGA+TGG - Chr6:21456336-21456355 None:intergenic 40.0%
AAATGGGAAGTGGAACTTGT+GGG + Chr6:21454851-21454870 MsG0680031519.01.T01:intron 40.0%
AAGACAAGAGTTTCTCCTCT+TGG + Chr6:21455247-21455266 MsG0680031519.01.T01:CDS 40.0%
AATGGAAGAGAAGAAAGTGG+TGG + Chr6:21455208-21455227 MsG0680031519.01.T01:CDS 40.0%
ACGCGTTAAAAGAAGCTACA+AGG + Chr6:21455467-21455486 MsG0680031519.01.T01:CDS 40.0%
ACGGTGAAGATTTCTGACTT+TGG + Chr6:21455901-21455920 MsG0680031519.01.T01:CDS 40.0%
ACTGCTAGAATCAAACCTCA+GGG + Chr6:21454658-21454677 MsG0680031519.01.T01:CDS 40.0%
ACTTTGACAGGTTAGCAAAG+TGG + Chr6:21456208-21456227 MsG0680031519.01.T01:CDS 40.0%
AGACCAATTTCACAAGTGGA+AGG + Chr6:21454458-21454477 MsG0680031519.01.T01:CDS 40.0%
AGCCTTGCAAACATCTTGTT+TGG + Chr6:21455736-21455755 MsG0680031519.01.T01:CDS 40.0%
AGGGACACTAAAGCAAAACA+AGG + Chr6:21454775-21454794 MsG0680031519.01.T01:CDS 40.0%
ATAGCAGTGCAGATGTTATC+AGG - Chr6:21454823-21454842 None:intergenic 40.0%
ATCCGTTCATAATCGGCTAA+TGG - Chr6:21455079-21455098 None:intergenic 40.0%
ATGGTCATGCAAATGCTAGA+AGG + Chr6:21456288-21456307 MsG0680031519.01.T01:CDS 40.0%
CAAAACCCACTTGGAATCAA+AGG + Chr6:21455764-21455783 MsG0680031519.01.T01:CDS 40.0%
CAAGCGATTGATTAGGCAAA+AGG - Chr6:21454405-21454424 None:intergenic 40.0%
CCAATCCTTTGATTCCAAGT+GGG - Chr6:21455772-21455791 None:intergenic 40.0%
CCTAACTCAAGCGATTGATT+AGG - Chr6:21454412-21454431 None:intergenic 40.0%
CCTAATCAATCGCTTGAGTT+AGG + Chr6:21454409-21454428 MsG0680031519.01.T01:CDS 40.0%
CGCGTTAAAAGAAGCTACAA+GGG + Chr6:21455468-21455487 MsG0680031519.01.T01:CDS 40.0%
CTCAATTTCACACTTGGTTG+TGG + Chr6:21454977-21454996 MsG0680031519.01.T01:CDS 40.0%
GAACCTTCCACTTGTGAAAT+TGG - Chr6:21454464-21454483 None:intergenic 40.0%
GACTTTGTTGAAGCCGAAAA+GGG + Chr6:21455393-21455412 MsG0680031519.01.T01:CDS 40.0%
GCGTTAAAAGAAGCTACAAG+GGG + Chr6:21455469-21455488 MsG0680031519.01.T01:CDS 40.0%
GCTTGCGATTGTTATATGGA+AGG + Chr6:21456141-21456160 MsG0680031519.01.T01:CDS 40.0%
GTCCAAACAAGATGTTTGCA+AGG - Chr6:21455741-21455760 None:intergenic 40.0%
TAACCTGTCAAAGTCATCCA+AGG - Chr6:21456202-21456221 None:intergenic 40.0%
TACTGCTAGAATCAAACCTC+AGG + Chr6:21454657-21454676 MsG0680031519.01.T01:CDS 40.0%
TCACATGTTCAGCTAACATC+AGG + Chr6:21454223-21454242 MsG0680031519.01.T01:CDS 40.0%
TCAGAGACCAATTTCACAAG+TGG + Chr6:21454454-21454473 MsG0680031519.01.T01:CDS 40.0%
TCATGTTAAGTCCACTTGCA+TGG + Chr6:21454518-21454537 MsG0680031519.01.T01:CDS 40.0%
TCCAATCCTTTGATTCCAAG+TGG - Chr6:21455773-21455792 None:intergenic 40.0%
TGACTTTGTTGAAGCCGAAA+AGG + Chr6:21455392-21455411 MsG0680031519.01.T01:CDS 40.0%
TGAGGGAATGCATAGAATGT+TGG + Chr6:21455690-21455709 MsG0680031519.01.T01:CDS 40.0%
TTAGTAGACCTCGAAGAATC+GGG - Chr6:21455324-21455343 None:intergenic 40.0%
TTGGACAAACAAAACCCACT+TGG + Chr6:21455755-21455774 MsG0680031519.01.T01:CDS 40.0%
TTGGGCTTGCGATTGTTATA+TGG + Chr6:21456137-21456156 MsG0680031519.01.T01:CDS 40.0%
! TGTTTGCTGCAGAAAAAGTG+TGG + Chr6:21456071-21456090 MsG0680031519.01.T01:CDS 40.0%
! TGTTTTGCTTTAGTGTCCCT+TGG - Chr6:21454775-21454794 None:intergenic 40.0%
! TTTGTGGCAGGTTTTACCAA+TGG - Chr6:21455641-21455660 None:intergenic 40.0%
! TTTTTCCATTGTGTACCCTG+AGG - Chr6:21454676-21454695 None:intergenic 40.0%
!! AACAAGGATGGACTAGTATG+AGG + Chr6:21454791-21454810 MsG0680031519.01.T01:CDS 40.0%
AATGAGGCCAACAATGAGGA+TGG + Chr6:21456269-21456288 MsG0680031519.01.T01:CDS 45.0%
AATTGAGTAGGCCATGCAAG+TGG - Chr6:21454532-21454551 None:intergenic 45.0%
AGAACCAAAACCATGATCCG+AGG + Chr6:21455955-21455974 MsG0680031519.01.T01:CDS 45.0%
AGCTGAACATGTGATCCTGT+TGG - Chr6:21454217-21454236 None:intergenic 45.0%
AGGCTGCATCCGTTCATAAT+CGG - Chr6:21455086-21455105 None:intergenic 45.0%
AGGGAGAATAGATGCTTTGG+TGG + Chr6:21456161-21456180 MsG0680031519.01.T01:CDS 45.0%
ATGCCTTGGATGACTTTGAC+AGG + Chr6:21456196-21456215 MsG0680031519.01.T01:CDS 45.0%
CACCCGCCAAATTGATTACT+TGG - Chr6:21454953-21454972 None:intergenic 45.0%
CATGCAAATGCTAGAAGGTG+TGG + Chr6:21456293-21456312 MsG0680031519.01.T01:CDS 45.0%
CATGTTCAGCTAACATCAGG+TGG + Chr6:21454226-21454245 MsG0680031519.01.T01:CDS 45.0%
CCCACTTGGAATCAAAGGAT+TGG + Chr6:21455769-21455788 MsG0680031519.01.T01:CDS 45.0%
CTCGAAGAATCGGGTTAACT+CGG - Chr6:21455315-21455334 None:intergenic 45.0%
CTGAAATGAGGCCAACAATG+AGG + Chr6:21456265-21456284 MsG0680031519.01.T01:CDS 45.0%
CTTGGTTGTGGAGCTGATAA+TGG + Chr6:21454989-21455008 MsG0680031519.01.T01:CDS 45.0%
GAAATGGGAAGTGGAACTTG+TGG + Chr6:21454850-21454869 MsG0680031519.01.T01:intron 45.0%
GAACTAGGTAGAGGTTCCTT+TGG + Chr6:21455502-21455521 MsG0680031519.01.T01:CDS 45.0%
GAGGATATGTAGCTCCTGAA+TGG + Chr6:21455983-21456002 MsG0680031519.01.T01:CDS 45.0%
GGAAGGGAGAATAGATGCTT+TGG + Chr6:21456158-21456177 MsG0680031519.01.T01:CDS 45.0%
GGAGAATGATCAAGATGCCT+TGG + Chr6:21456182-21456201 MsG0680031519.01.T01:CDS 45.0%
GGCCATTAGCCGATTATGAA+CGG + Chr6:21455074-21455093 MsG0680031519.01.T01:CDS 45.0%
GTTTGGTTGTGCTGTCCAAA+TGG - Chr6:21454281-21454300 None:intergenic 45.0%
TCAAACCTCAGGGTACACAA+TGG + Chr6:21454668-21454687 MsG0680031519.01.T01:CDS 45.0%
TGAAGGAAAAAGGCGATGGT+GGG - Chr6:21456332-21456351 None:intergenic 45.0%
TGCATGACCATCCTCATTGT+TGG - Chr6:21456279-21456298 None:intergenic 45.0%
TTTGGGGATTGCAAGAGGAT+TGG + Chr6:21455798-21455817 MsG0680031519.01.T01:CDS 45.0%
! CAGAAAAAGTGTGGTGCTGA+TGG + Chr6:21456080-21456099 MsG0680031519.01.T01:CDS 45.0%
! CTCATTGTTGGCCTCATTTC+AGG - Chr6:21456267-21456286 None:intergenic 45.0%
! CTTCACCAAGTTTTTGTGGC+AGG - Chr6:21455653-21455672 None:intergenic 45.0%
!! AAAAAGGCGATGGTGGGTTA+GGG - Chr6:21456326-21456345 None:intergenic 45.0%
!! TGTGGAGCTGATAATGGTGA+AGG + Chr6:21454995-21455014 MsG0680031519.01.T01:CDS 45.0%
!! TTAGGCAAAAGGGTGTCAGT+AGG - Chr6:21454394-21454413 None:intergenic 45.0%
!! TTTGCTTTGGGGATTGCAAG+AGG + Chr6:21455793-21455812 MsG0680031519.01.T01:CDS 45.0%
AACCTCGTACTAGCACCAAC+AGG + Chr6:21454199-21454218 MsG0680031519.01.T01:CDS 50.0%
AAGACTGAGTTGCGAGCCAT+TGG + Chr6:21455622-21455641 MsG0680031519.01.T01:CDS 50.0%
AAGCCGAAAAGGGTTGTCGT+AGG + Chr6:21455403-21455422 MsG0680031519.01.T01:CDS 50.0%
ACATCCACTTTAGCCGTCAC+TGG - Chr6:21456021-21456040 None:intergenic 50.0%
CGAGTTAACCCGATTCTTCG+AGG + Chr6:21455313-21455332 MsG0680031519.01.T01:CDS 50.0%
CTACATATCCTCGCGTTCCT+CGG - Chr6:21455975-21455994 None:intergenic 50.0%
CTGAAGGAAAAAGGCGATGG+TGG - Chr6:21456333-21456352 None:intergenic 50.0%
GTGCTAGTACGAGGTTGTTG+AGG - Chr6:21454195-21454214 None:intergenic 50.0%
TGTTCCAGTGACGGCTAAAG+TGG + Chr6:21456014-21456033 MsG0680031519.01.T01:CDS 50.0%
! CGTTCCTCGGATCATGGTTT+TGG - Chr6:21455962-21455981 None:intergenic 50.0%
!! ATCCTGTTGGTGCTAGTACG+AGG - Chr6:21454204-21454223 None:intergenic 50.0%
!! CAGCTTTGGTGCCATGTTGT+TGG + Chr6:21456044-21456063 MsG0680031519.01.T01:CDS 50.0%
!! GAAAAAGGCGATGGTGGGTT+AGG - Chr6:21456327-21456346 None:intergenic 50.0%
GTTAGCGCAAGATCGCGAGA+AGG + Chr6:21455594-21455613 MsG0680031519.01.T01:CDS 55.0%
TGGGAAGTGGAACTTGTGGG+TGG + Chr6:21454854-21454873 MsG0680031519.01.T01:intron 55.0%
TGTCGTAGGCGCAACTCTCT+TGG + Chr6:21455417-21455436 MsG0680031519.01.T01:CDS 55.0%
! GCGCCTACGACAACCCTTTT+CGG - Chr6:21455409-21455428 None:intergenic 55.0%
!! AGTGTGGTGCTGATGGAGTC+AGG + Chr6:21456087-21456106 MsG0680031519.01.T01:CDS 55.0%
!! GTGTGGTGCTGATGGAGTCA+GGG + Chr6:21456088-21456107 MsG0680031519.01.T01:CDS 55.0%
!! TGTGGTGCTGATGGAGTCAG+GGG + Chr6:21456089-21456108 MsG0680031519.01.T01:CDS 55.0%
ACCATGATCCGAGGAACGCG+AGG + Chr6:21455964-21455983 MsG0680031519.01.T01:CDS 60.0%
GGAGTCAGGGGAGGAAGAGA+AGG + Chr6:21456101-21456120 MsG0680031519.01.T01:CDS 60.0%
TCCTCGCGTTCCTCGGATCA+TGG - Chr6:21455968-21455987 None:intergenic 60.0%
!! GGTGCTGATGGAGTCAGGGG+AGG + Chr6:21456092-21456111 MsG0680031519.01.T01:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 21454175 21456365 21454175 ID=MsG0680031519.01;Name=MsG0680031519.01
Chr6 mRNA 21454175 21456365 21454175 ID=MsG0680031519.01.T01;Parent=MsG0680031519.01;Name=MsG0680031519.01.T01;_AED=0.20;_eAED=0.20;_QI=0|0|0|1|1|1|2|0|703
Chr6 exon 21454175 21454868 21454175 ID=MsG0680031519.01.T01:exon:13568;Parent=MsG0680031519.01.T01
Chr6 exon 21454948 21456365 21454948 ID=MsG0680031519.01.T01:exon:13569;Parent=MsG0680031519.01.T01
Chr6 CDS 21454175 21454868 21454175 ID=MsG0680031519.01.T01:cds;Parent=MsG0680031519.01.T01
Chr6 CDS 21454948 21456365 21454948 ID=MsG0680031519.01.T01:cds;Parent=MsG0680031519.01.T01
Gene Sequence

>MsG0680031519.01.T01

ATGAACAACATCAACAACCTCAACAACCTCGTACTAGCACCAACAGGATCACATGTTCAGCTAACATCAGGTGGACTCACGTTGACAACTGCACAAAATGAATCCATTTGGACAGCACAACCAAACGATATTGTTTCCTATGGAACCATGCTTGATAATGGAAACTTTGTTCTTGTAAACAACAAATCTGTTATTGTTTGGGAAAGTTTTAACTTTCCTACTGACACCCTTTTGCCTAATCAATCGCTTGAGTTAGGCGCCACCTTAACTTCAAGATTCTCAGAGACCAATTTCACAAGTGGAAGGTTCCAACTTTATTTTAATGATGATGATGATCATAATCTCATGTTAAGTCCACTTGCATGGCCTACTCAATTTCGTTACAAATTTTACTATAGTATTGGTGTTAATAACTCTGCATCTTCAAGTTTAGTTTTTGATGAATCAGGAGATATTTATGTGGAAATTACAAATAATAATGGTACTGCTAGAATCAAACCTCAGGGTACACAATGGAAAAATTTAATTCTTGATCCTAAGTTGTATTATTATAGAGCAACACTTGATTATTATGGAGTTTTGACACAATATTCTCATCCAAGGGACACTAAAGCAAAACAAGGATGGACTAGTATGAGGTATGTTCCTGATAACATCTGCACTGCTATATTCAATGAAATGGGAAGTGGAACTTATCCAAGTAATCAATTTGGCGGGTGTCAACTCAATTTCACACTTGGTTGTGGAGCTGATAATGGTGAAGGATTGAATGTGAAGCCAGAAGATTTATATGAGTTAACTGTTCTTACTAATGTGAATTGGCCATTAGCCGATTATGAACGGATGCAGCCTTATTCTCAACATGACTGTCAACAATCTTGTTTGCATGATTGTATGTGTTCTGTTGTTGTCTTCAGAGACCAAATATGTTGGAAGAAAAGATCACCTCTAGTTAATGGAAGAGAAGAAAGTGGTGGTGATTTAGTACTTATCAAGACAAGAGTTTCTCCTCTTGGTAAAATAGGTACTAGTCCTTCCAATAATTTGAATAAAGACAACCGAGTTAACCCGATTCTTCGAGGTCTACTAATTGGTTCAGCTGTCTTTAATAGCTTACTCTTGGCTGCAGTTGTTTTAGTGACTTTGTTGAAGCCGAAAAGGGTTGTCGTAGGCGCAACTCTCTTGGAAACAAATTTATGTTCGTTTAGTTATGACGCGTTAAAAGAAGCTACAAGGGGTTTTATTGAAGAACTAGGTAGAGGTTCCTTTGGAATTGTTTTCAAAGGTGAATTGAAAGCAGCAACGTCTTGTAATGTTGTTGCTGTTAAGAAATTGGATCGGTTAGCGCAAGATCGCGAGAAGGAATTTAAGACTGAGTTGCGAGCCATTGGTAAAACCTGCCACAAAAACTTGGTGAAGTTGATTGGATATTGTGATGAGGGAATGCATAGAATGTTGGTGTATGAGTTCATGAACAATGGCAGCCTTGCAAACATCTTGTTTGGACAAACAAAACCCACTTGGAATCAAAGGATTGGATTTGCTTTGGGGATTGCAAGAGGATTGGTGTATTTACATGAAGAGTGTGACACTCCCATCATTCATTGTGACATAAAGCCTCAAAATATACTCATAGATGAGTACTTCACGGTGAAGATTTCTGACTTTGGATTGGCTAAATTGTTGTTGGCCGAACAAAGTAGAACCAAAACCATGATCCGAGGAACGCGAGGATATGTAGCTCCTGAATGGTTTAAGAATGTTCCAGTGACGGCTAAAGTGGATGTTTACAGCTTTGGTGCCATGTTGTTGGAAATTGTTTGCTGCAGAAAAAGTGTGGTGCTGATGGAGTCAGGGGAGGAAGAGAAGGCAATATTGACAGATTGGGCTTGCGATTGTTATATGGAAGGGAGAATAGATGCTTTGGTGGAGAATGATCAAGATGCCTTGGATGACTTTGACAGGTTAGCAAAGTGGATAAAGATAGCAATTTGGTGCATTCAAGAACATCCTGAAATGAGGCCAACAATGAGGATGGTCATGCAAATGCTAGAAGGTGTGGTTCAAGTCCCTAACCCACCATCGCCTTTTTCCTTCAGTTTGATTCCTTGA
Protein sequence

>MsG0680031519.01.T01

MNNINNLNNLVLAPTGSHVQLTSGGLTLTTAQNESIWTAQPNDIVSYGTMLDNGNFVLVNNKSVIVWESFNFPTDTLLPNQSLELGATLTSRFSETNFTSGRFQLYFNDDDDHNLMLSPLAWPTQFRYKFYYSIGVNNSASSSLVFDESGDIYVEITNNNGTARIKPQGTQWKNLILDPKLYYYRATLDYYGVLTQYSHPRDTKAKQGWTSMRYVPDNICTAIFNEMGSGTYPSNQFGGCQLNFTLGCGADNGEGLNVKPEDLYELTVLTNVNWPLADYERMQPYSQHDCQQSCLHDCMCSVVVFRDQICWKKRSPLVNGREESGGDLVLIKTRVSPLGKIGTSPSNNLNKDNRVNPILRGLLIGSAVFNSLLLAAVVLVTLLKPKRVVVGATLLETNLCSFSYDALKEATRGFIEELGRGSFGIVFKGELKAATSCNVVAVKKLDRLAQDREKEFKTELRAIGKTCHKNLVKLIGYCDEGMHRMLVYEFMNNGSLANILFGQTKPTWNQRIGFALGIARGLVYLHEECDTPIIHCDIKPQNILIDEYFTVKISDFGLAKLLLAEQSRTKTMIRGTRGYVAPEWFKNVPVTAKVDVYSFGAMLLEIVCCRKSVVLMESGEEEKAILTDWACDCYMEGRIDALVENDQDALDDFDRLAKWIKIAIWCIQEHPEMRPTMRMVMQMLEGVVQVPNPPSPFSFSLIP*