AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680031511.01

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MsG0680031511.01.T01 AT1G56720 41.781 292 157 6 502 786 166 451 5.89e-59 209
MsG0680031511.01.T01 AT1G56720 41.781 292 157 6 502 786 166 451 5.89e-59 209
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MsG0680031511.01.T01 AT1G61430 27.160 810 459 33 42 797 17 749 6.75e-58 212
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MsG0680031511.01.T01 AT2G42960 40.550 291 162 4 502 786 170 455 1.20e-57 205
MsG0680031511.01.T01 AT2G42960 40.550 291 162 4 502 786 170 455 1.20e-57 205
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MsG0680031511.01.T01 AT1G71830 39.661 295 162 5 503 787 290 578 6.55e-57 206
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MsG0680031511.01.T01 AT5G38280 40.717 307 169 10 503 801 321 622 8.67e-57 207
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MsG0680031511.01.T01 AT1G61420 30.361 527 299 16 306 797 136 629 1.16e-56 206
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MsG0680031511.01.T01 AT5G38280 40.717 307 169 10 503 801 321 622 1.63e-56 206
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MsG0680031511.01.T01 AT2G13800 38.699 292 169 4 503 787 146 434 1.72e-56 202
MsG0680031511.01.T01 AT1G23540 37.086 302 177 5 493 786 349 645 1.75e-56 207
MsG0680031511.01.T01 AT1G16670 38.796 299 166 6 499 787 25 316 1.78e-56 199
MsG0680031511.01.T01 AT3G24790 39.661 295 158 7 503 785 53 339 3.00e-56 198
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MsG0680031511.01.T01 AT1G61490 31.181 542 305 20 285 797 245 747 4.57e-56 206
MsG0680031511.01.T01 AT1G61490 31.181 542 305 20 285 797 121 623 5.04e-56 204
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MsG0680031511.01.T01 AT1G56145 37.243 341 197 8 459 791 527 858 5.61e-55 205
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MsG0680031511.01.T01 AT3G59740 33.973 365 226 6 439 793 256 615 8.45e-55 201
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MsG0680031511.01.T01 AT2G43700 37.415 294 177 3 503 793 300 589 7.05e-54 198
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MsG0680031511.01.T01 AT4G23270 38.361 305 175 6 503 798 314 614 3.21e-53 196
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MsG0680031511.01.T01 AT1G07570 38.629 321 177 10 484 788 37 353 7.45e-53 189
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MsG0680031511.01.T01 AT4G11480 37.195 328 185 8 484 798 293 612 2.28e-52 194
MsG0680031511.01.T01 AT5G01020 40.468 299 155 9 503 786 57 347 2.45e-52 188
MsG0680031511.01.T01 AT5G38260 35.511 352 203 10 462 796 264 608 3.08e-52 193
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MsG0680031511.01.T01 AT4G00960 34.810 316 189 8 497 801 38 347 3.63e-52 187
MsG0680031511.01.T01 AT5G28680 37.748 302 177 6 496 791 501 797 3.65e-52 196
MsG0680031511.01.T01 AT5G28680 37.748 302 177 6 496 791 501 797 3.65e-52 196
MsG0680031511.01.T01 AT4G02410 35.667 300 185 5 505 800 345 640 4.05e-52 193
MsG0680031511.01.T01 AT1G11050 33.690 374 217 7 450 795 219 589 4.27e-52 192
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MsG0680031511.01.T01 AT5G54590 35.238 315 174 7 485 791 90 382 5.65e-52 188
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MsG0680031511.01.T01 AT5G01950 37.261 314 166 7 493 791 604 901 4.25e-51 193
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MsG0680031511.01.T01 AT2G18470 37.419 310 174 6 493 791 262 562 5.68e-51 189
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MsG0680031511.01.T01 AT4G23320 35.043 351 203 8 462 795 126 468 1.85e-50 185
MsG0680031511.01.T01 AT5G35580 39.806 309 165 10 494 788 55 356 1.98e-50 185
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MsG0680031511.01.T01 AT1G66930 36.964 303 180 7 503 797 545 844 2.05e-50 191
MsG0680031511.01.T01 AT1G69790 38.312 308 172 7 492 786 61 363 2.19e-50 182
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MsG0680031511.01.T01 AT1G61460 25.714 840 451 32 4 797 7 719 2.52e-50 189
MsG0680031511.01.T01 AT3G46340 35.275 309 186 6 491 793 563 863 2.54e-50 191
MsG0680031511.01.T01 AT3G01300 39.203 301 169 6 498 786 119 417 2.60e-50 184
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MsG0680031511.01.T01 AT1G68690 36.275 306 173 7 496 789 358 653 4.32e-49 185
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MsG0680031511.01.T01 AT3G20530 42.672 232 123 5 503 726 70 299 4.34e-48 173
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MsG0680031511.01.T01 AT4G32000 36.610 295 175 6 503 791 118 406 5.55e-48 176
MsG0680031511.01.T01 AT4G05200 35.505 307 186 6 495 794 327 628 5.64e-48 181
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MsG0680031511.01.T01 AT1G55200 37.457 291 172 5 502 787 366 651 8.24e-48 181
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MsG0680031511.01.T01 AT1G55200 37.457 291 172 5 502 787 366 651 8.24e-48 181
MsG0680031511.01.T01 AT1G55200 37.457 291 172 5 502 787 366 651 8.24e-48 181
MsG0680031511.01.T01 AT2G25220 36.667 300 170 7 502 791 84 373 8.26e-48 174
MsG0680031511.01.T01 AT2G25220 36.667 300 170 7 502 791 133 422 8.55e-48 176
MsG0680031511.01.T01 AT3G14840 37.278 338 185 8 465 787 620 945 8.77e-48 184
MsG0680031511.01.T01 AT2G28990 35.517 290 172 7 503 786 567 847 9.43e-48 183
MsG0680031511.01.T01 AT2G28990 35.517 290 172 7 503 786 567 847 9.43e-48 183
MsG0680031511.01.T01 AT2G39360 37.586 290 170 6 508 791 480 764 9.82e-48 182
MsG0680031511.01.T01 AT5G16900 34.796 319 190 7 481 793 358 664 1.15e-47 181
MsG0680031511.01.T01 AT2G25220 36.667 300 170 7 502 791 138 427 1.22e-47 176
MsG0680031511.01.T01 AT1G61360 29.423 520 321 17 306 798 203 703 1.22e-47 181
MsG0680031511.01.T01 AT1G61360 29.423 520 321 17 306 798 203 703 1.22e-47 181
MsG0680031511.01.T01 AT1G61360 29.423 520 321 17 306 798 203 703 1.22e-47 181
MsG0680031511.01.T01 AT2G19230 35.423 319 192 7 473 786 531 840 1.24e-47 183
MsG0680031511.01.T01 AT4G35600 36.250 320 186 8 492 796 63 379 1.26e-47 175
MsG0680031511.01.T01 AT1G51890 32.174 345 199 9 467 786 234 568 1.27e-47 179
MsG0680031511.01.T01 AT1G61360 29.423 520 321 17 306 798 284 784 1.29e-47 182
MsG0680031511.01.T01 AT4G35600 36.250 320 186 8 492 796 64 380 1.35e-47 175
MsG0680031511.01.T01 AT2G35620 33.333 354 207 10 461 794 236 580 1.44e-47 179
MsG0680031511.01.T01 AT2G35620 33.333 354 207 10 461 794 236 580 1.44e-47 179
MsG0680031511.01.T01 AT2G35620 33.333 354 207 10 461 794 236 580 1.44e-47 179
MsG0680031511.01.T01 AT2G35620 33.333 354 207 10 461 794 236 580 1.44e-47 179
MsG0680031511.01.T01 AT1G24030 42.609 230 119 6 508 727 1 227 1.55e-47 171
MsG0680031511.01.T01 AT4G23190 32.703 370 226 8 451 800 196 562 1.58e-47 179
MsG0680031511.01.T01 AT4G23190 32.703 370 226 8 451 800 196 562 1.58e-47 179
MsG0680031511.01.T01 AT3G58690 35.093 322 177 9 497 799 69 377 1.63e-47 174
MsG0680031511.01.T01 AT5G48740 35.530 349 200 12 452 786 541 878 1.72e-47 182
MsG0680031511.01.T01 AT5G13160 38.284 303 173 7 503 796 74 371 1.72e-47 176
MsG0680031511.01.T01 AT4G32000 36.610 295 175 6 503 791 160 448 1.78e-47 176
MsG0680031511.01.T01 AT2G19230 35.110 319 193 7 473 786 530 839 1.98e-47 182
MsG0680031511.01.T01 AT4G11530 35.000 320 195 6 485 795 322 637 2.10e-47 180
MsG0680031511.01.T01 AT5G15730 35.082 305 171 7 494 790 95 380 2.16e-47 175
MsG0680031511.01.T01 AT5G15730 35.082 305 171 7 494 790 95 380 2.16e-47 175
MsG0680031511.01.T01 AT4G23190 32.703 370 226 8 451 800 274 640 2.26e-47 179
MsG0680031511.01.T01 AT4G13190 43.379 219 115 4 503 714 59 275 2.31e-47 171
MsG0680031511.01.T01 AT1G31420 34.056 323 203 6 475 794 267 582 2.50e-47 178
MsG0680031511.01.T01 AT5G07280 36.928 306 176 5 496 788 891 1192 2.57e-47 182
MsG0680031511.01.T01 AT5G49770 36.719 256 155 4 540 791 658 910 2.80e-47 182
MsG0680031511.01.T01 AT3G46400 32.584 356 211 9 458 793 507 853 2.84e-47 181
MsG0680031511.01.T01 AT5G56890 38.851 296 165 7 503 788 711 1000 2.93e-47 182
MsG0680031511.01.T01 AT1G24030 41.702 235 124 6 503 727 50 281 3.14e-47 172
MsG0680031511.01.T01 AT1G26150 36.601 306 161 7 503 790 418 708 3.28e-47 180
MsG0680031511.01.T01 AT1G20650 37.884 293 167 7 503 786 66 352 3.30e-47 173
MsG0680031511.01.T01 AT5G59670 34.769 325 197 7 475 793 526 841 3.39e-47 181
MsG0680031511.01.T01 AT5G59670 34.769 325 197 7 475 793 526 841 3.39e-47 181
MsG0680031511.01.T01 AT1G66920 36.977 311 154 10 503 804 297 574 4.07e-47 177
MsG0680031511.01.T01 AT4G23250 35.238 315 185 8 496 798 335 642 4.14e-47 179
MsG0680031511.01.T01 AT1G51880 32.934 334 207 7 467 793 519 842 4.28e-47 181
MsG0680031511.01.T01 AT1G51880 32.934 334 207 7 467 793 537 860 4.30e-47 181
MsG0680031511.01.T01 AT1G31420 33.951 324 203 6 475 794 267 583 4.59e-47 177
MsG0680031511.01.T01 AT1G31420 33.951 324 203 6 475 794 267 583 4.59e-47 177
MsG0680031511.01.T01 AT5G16900 34.796 319 190 7 481 793 544 850 5.07e-47 181
MsG0680031511.01.T01 AT5G16900 34.796 319 190 7 481 793 544 850 5.07e-47 181
MsG0680031511.01.T01 AT2G29000 34.323 303 188 4 488 786 540 835 5.63e-47 181
MsG0680031511.01.T01 AT1G51880 34.343 297 179 6 503 793 582 868 5.65e-47 181
MsG0680031511.01.T01 AT4G23230 35.370 311 185 8 496 797 318 621 5.91e-47 177
MsG0680031511.01.T01 AT2G01820 35.161 310 177 9 495 788 565 866 5.99e-47 181
MsG0680031511.01.T01 AT4G23250 35.127 316 186 8 495 798 339 647 6.68e-47 178
MsG0680031511.01.T01 AT1G51860 34.680 297 178 6 503 793 430 716 7.04e-47 179
MsG0680031511.01.T01 AT1G24030 41.702 235 124 6 503 727 64 295 7.19e-47 172
MsG0680031511.01.T01 AT1G51890 32.174 345 199 9 467 786 442 776 8.41e-47 179
MsG0680031511.01.T01 AT1G51890 32.174 345 199 9 467 786 506 840 1.13e-46 179
MsG0680031511.01.T01 AT2G26290 36.482 307 174 8 499 791 72 371 1.25e-46 172
MsG0680031511.01.T01 AT2G19190 34.114 299 183 6 496 789 557 846 1.39e-46 179
MsG0680031511.01.T01 AT1G51860 34.680 297 178 6 503 793 574 860 1.41e-46 179

Find 170 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 195 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CTCATTGTTGGCCTCATTTC+AGG 0.081724 6:+21375691 None:intergenic
AGAGCAACACTTGATTATTA+TGG 0.224452 6:-21377224 MsG0680031511.01.T01:CDS
GTTGTCTTTATTCAAATTAT+TGG 0.234688 6:+21376665 None:intergenic
CAAAGGATTGGATTTGCTTT+GGG 0.255413 6:-21376174 MsG0680031511.01.T01:CDS
CACCCGCCAAATTGATTACT+TGG 0.259684 6:+21377005 None:intergenic
TGTTGTTGCTGTTAAGAAAT+TGG 0.264118 6:-21376388 MsG0680031511.01.T01:CDS
ACAACAAATCTGTTATTGTT+TGG 0.270168 6:-21377598 MsG0680031511.01.T01:CDS
GAACCTTCCACTTGTGAAAT+TGG 0.271202 6:+21377490 None:intergenic
CGTTCCTCGGATCATGGTTT+TGG 0.282567 6:+21375996 None:intergenic
GTTGCTGTTGTTCATGTCTT+TGG 0.296343 6:+21377775 None:intergenic
CACTGCTATATTCAATGAAA+TGG 0.297220 6:-21377117 MsG0680031511.01.T01:CDS
CAACAAATCTGTTATTGTTT+GGG 0.299746 6:-21377597 MsG0680031511.01.T01:CDS
CCTACTTGTAGATGTCCTTA+TGG 0.302263 6:-21377044 MsG0680031511.01.T01:CDS
CCTTCTGGTGAATTCGCTTT+CGG 0.302513 6:-21377878 MsG0680031511.01.T01:CDS
ATTCTTCGAGGTCTACTAAT+TGG 0.318078 6:-21376630 MsG0680031511.01.T01:CDS
GGAACATTCTTAAACCATTC+AGG 0.319636 6:+21375958 None:intergenic
ACTTCTTCATGCTTGCAATA+TGG 0.322846 6:-21377835 MsG0680031511.01.T01:CDS
ATAGATCCAAGTAATCAATT+TGG 0.330365 6:-21377011 MsG0680031511.01.T01:CDS
GGAATCAAACTGAAGGAAAA+AGG 0.340634 6:+21375616 None:intergenic
AGAAGTTTGTTGTTGTATTA+CGG 0.341903 6:+21377852 None:intergenic
GTAAACTCATATAAATCTTC+TGG 0.343410 6:+21376924 None:intergenic
TATGGAACCATGCTTGATAA+TGG 0.344619 6:-21377638 MsG0680031511.01.T01:CDS
TTGGGCTTGCGATTGTTATA+TGG 0.346850 6:-21375818 MsG0680031511.01.T01:CDS
TCAAAGGATTGGATTTGCTT+TGG 0.348350 6:-21376175 MsG0680031511.01.T01:CDS
CTTCAACTTGTGTTAGCCTT+TGG 0.349175 6:-21377962 MsG0680031511.01.T01:CDS
TGCATGACCATCCTCATTGT+TGG 0.349392 6:+21375679 None:intergenic
CCTAATCAATCGCTTGAGTT+AGG 0.354045 6:-21377542 MsG0680031511.01.T01:CDS
TGACAGTCATGTTGAGAATA+AGG 0.364539 6:+21376852 None:intergenic
TGGATTGTTGTTGTTGTTAG+TGG 0.366938 6:+21377910 None:intergenic
GAACTAGGTCGAGGTTCCTT+TGG 0.371170 6:-21376453 MsG0680031511.01.T01:CDS
AAAGTGGATGTTTACAGCTT+TGG 0.374429 6:-21375925 MsG0680031511.01.T01:CDS
AGTGGATAAAGATAGCAATT+TGG 0.379762 6:-21375729 MsG0680031511.01.T01:CDS
TCCTCGCGTTCCTCGGATCA+TGG 0.379944 6:+21375990 None:intergenic
AGCCTTGCAAACATCTTGTT+TGG 0.383123 6:-21376219 MsG0680031511.01.T01:CDS
TACATGATCAAACCATTGTT+TGG 0.383435 6:-21377802 MsG0680031511.01.T01:CDS
ATAGCAGTGCAGATGTTATC+AGG 0.385024 6:+21377131 None:intergenic
CTCAATTTCACACTTGGTTG+TGG 0.386954 6:-21376978 MsG0680031511.01.T01:CDS
AAAAGATCACCTCTAGCTAA+TGG 0.387672 6:-21376765 MsG0680031511.01.T01:CDS
GTGGAAATTACAAATAATAA+TGG 0.389711 6:-21377317 MsG0680031511.01.T01:CDS
CTCTGAGAATCTTGAAGTTA+AGG 0.391832 6:+21377514 None:intergenic
CTGTTCTTACTAATGTGAAT+TGG 0.399101 6:-21376902 MsG0680031511.01.T01:CDS
TGTCTTTAATAGCTTACTCT+TGG 0.399840 6:-21376601 MsG0680031511.01.T01:CDS
CCATAGGAAACAATATCGTT+TGG 0.401223 6:+21377656 None:intergenic
CAAGCGATTGATTAGGCAAA+AGG 0.405236 6:+21377549 None:intergenic
CCAAACGATATTGTTTCCTA+TGG 0.416018 6:-21377656 MsG0680031511.01.T01:CDS
GGAAGGGAGAATAGATGCTT+TGG 0.417284 6:-21375797 MsG0680031511.01.T01:CDS
CTGCACAAAATGAATCCATT+TGG 0.419572 6:-21377688 MsG0680031511.01.T01:CDS
ATTAGTAGACCTCGAAGAAT+CGG 0.421793 6:+21376633 None:intergenic
CGAGTTAACCCGATTCTTCG+AGG 0.426122 6:-21376642 MsG0680031511.01.T01:CDS
TGTCGTAGGCGCAACTCTCT+TGG 0.431085 6:-21376538 MsG0680031511.01.T01:CDS
AAGAATGGAAATTATGTAAA+GGG 0.432434 6:+21377988 None:intergenic
CTTGGTTGTGGAGCTGATAA+TGG 0.435800 6:-21376966 MsG0680031511.01.T01:CDS
TGACTTTGTTGAAGCCGAAA+AGG 0.438890 6:-21376563 MsG0680031511.01.T01:CDS
AAGACAAGAGTTTCTCCTCT+TGG 0.439949 6:-21376708 MsG0680031511.01.T01:CDS
AGAAGGCAATATTGACAGAT+TGG 0.441848 6:-21375837 MsG0680031511.01.T01:CDS
CATCATCATTAAAATAAAGT+TGG 0.444997 6:+21377468 None:intergenic
ACGGCGAAGATTTCTGACTT+TGG 0.445400 6:-21376054 MsG0680031511.01.T01:CDS
GAAGGCAATATTGACAGATT+GGG 0.447284 6:-21375836 MsG0680031511.01.T01:CDS
CCCACTTGGAATCAAAGGAT+TGG 0.451317 6:-21376186 MsG0680031511.01.T01:CDS
GACTTTGTTGAAGCCGAAAA+GGG 0.452895 6:-21376562 MsG0680031511.01.T01:CDS
AGGCTGCATCCGTTCATAAT+CGG 0.453105 6:+21376872 None:intergenic
CTCGAAGAATCGGGTTAACT+CGG 0.456924 6:+21376643 None:intergenic
AATCCATGGTTATCACCTTC+TGG 0.462875 6:-21377893 MsG0680031511.01.T01:CDS
CAGCTTTGGTGCCATGTTGT+TGG 0.466280 6:-21375911 MsG0680031511.01.T01:CDS
ATCCGTTCATAATCGGCTAA+TGG 0.467153 6:+21376879 None:intergenic
TGGATTGGCTAAATTGTTGT+TGG 0.467829 6:-21376034 MsG0680031511.01.T01:CDS
ACTGCTATATTCAATGAAAT+GGG 0.469189 6:-21377116 MsG0680031511.01.T01:CDS
CTACATATCCTCGCGTTCCT+CGG 0.474206 6:+21375983 None:intergenic
AGTGTGGTGCTGATGGAGTC+AGG 0.477854 6:-21375868 MsG0680031511.01.T01:CDS
GAAGATTTCTGACTTTGGAT+TGG 0.479184 6:-21376049 MsG0680031511.01.T01:CDS
GGAAATTATGTAAAGGGTAG+AGG 0.482909 6:+21377994 None:intergenic
TCTTGGAAACAAATTTATGT+TGG 0.483454 6:-21376521 MsG0680031511.01.T01:CDS
TGTTCCAGTGACGGCTAAAG+TGG 0.484951 6:-21375941 MsG0680031511.01.T01:CDS
CTTTATGTCACAATGAATGA+TGG 0.487951 6:+21376107 None:intergenic
ATGCCTTGGATGACTTTGAC+AGG 0.488332 6:-21375759 MsG0680031511.01.T01:CDS
ACATCCACTTTAGCCGTCAC+TGG 0.489140 6:+21375937 None:intergenic
AAGACTGAGTTGCGAGCCAT+TGG 0.489620 6:-21376333 MsG0680031511.01.T01:CDS
TACTGCTAGAATCAAACCTC+AGG 0.493322 6:-21377294 MsG0680031511.01.T01:CDS
AGGGAGAATAGATGCTTTGG+TGG 0.495057 6:-21375794 MsG0680031511.01.T01:CDS
CAAAACCCACTTGGAATCAA+AGG 0.496549 6:-21376191 MsG0680031511.01.T01:CDS
GTTTGGTTGTGCTGTCCAAA+TGG 0.500759 6:+21377673 None:intergenic
GCTCTATAATAATACAACTT+AGG 0.501136 6:+21377242 None:intergenic
TCCAATCCTTTGATTCCAAG+TGG 0.502300 6:+21376185 None:intergenic
AAAGAATGGAAATTATGTAA+AGG 0.503583 6:+21377987 None:intergenic
AAAGTTTCCATTATCAAGCA+TGG 0.505441 6:+21377631 None:intergenic
ATATTCAATGAAATGGGAAG+TGG 0.505674 6:-21377110 MsG0680031511.01.T01:CDS
GGAGTCAGGGGAGGAAGAGA+AGG 0.508513 6:-21375854 MsG0680031511.01.T01:CDS
AACCTCGTACTAGCACCAAC+AGG 0.509463 6:-21377752 MsG0680031511.01.T01:CDS
ATTATCAAGCATGGTTCCAT+AGG 0.512303 6:+21377640 None:intergenic
TGTCAACTCAATTTCACACT+TGG 0.515793 6:-21376984 MsG0680031511.01.T01:CDS
TTTGGGGATTGCAAGAGGAT+TGG 0.518849 6:-21376157 MsG0680031511.01.T01:CDS
ATTGTTGTTGTTGTTAGTGG+TGG 0.524218 6:+21377913 None:intergenic
GGAGAATGATCAAGATGCCT+TGG 0.527823 6:-21375773 MsG0680031511.01.T01:CDS
TCTATCAATGAATAACCATA+AGG 0.530290 6:+21377029 None:intergenic
TCTTTATTCAAATTATTGGA+AGG 0.533604 6:+21376669 None:intergenic
ACTCATAGATGAGTACTTCA+CGG 0.533667 6:-21376073 MsG0680031511.01.T01:CDS
TCACATGTTCAGCTAACATC+AGG 0.536342 6:-21377728 MsG0680031511.01.T01:CDS
TGACACAATATTCTCATCCA+AGG 0.539740 6:-21377196 MsG0680031511.01.T01:CDS
TTAGTAGACCTCGAAGAATC+GGG 0.539806 6:+21376634 None:intergenic
ACCTTTGAAAACAATTCCAA+AGG 0.539869 6:+21376437 None:intergenic
GTCTTTGGCGCTCCAAACAA+TGG 0.540627 6:+21377790 None:intergenic
GGCCATTAGCCGATTATGAA+CGG 0.541732 6:-21376881 MsG0680031511.01.T01:CDS
GTCCAAACAAGATGTTTGCA+AGG 0.544090 6:+21376217 None:intergenic
AAAGGATTGGATTTGCTTTG+GGG 0.544509 6:-21376173 MsG0680031511.01.T01:CDS
TCAGAGACCAATTTCACAAG+TGG 0.544525 6:-21377497 MsG0680031511.01.T01:CDS
GATCCAAGTAATCAATTTGG+CGG 0.546725 6:-21377008 MsG0680031511.01.T01:CDS
CCTAACTCAAGCGATTGATT+AGG 0.547040 6:+21377542 None:intergenic
AACAAGGATGGACTAGTATG+AGG 0.547394 6:-21377160 MsG0680031511.01.T01:CDS
TCTTCTCTTCCATTAGCTAG+AGG 0.550318 6:+21376756 None:intergenic
TTGGACAAACAAAACCCACT+TGG 0.553403 6:-21376200 MsG0680031511.01.T01:CDS
TTTATTGAAGAACTAGGTCG+AGG 0.554005 6:-21376462 MsG0680031511.01.T01:CDS
ACGCGTTAAAAGAAGCTACA+AGG 0.554132 6:-21376488 MsG0680031511.01.T01:CDS
AAGCGATTGATTAGGCAAAA+GGG 0.554283 6:+21377550 None:intergenic
GAGGATATGTAGCTCCTGAA+TGG 0.556805 6:-21375972 MsG0680031511.01.T01:CDS
CTATAATAGCTATTGTTCCA+TGG 0.559466 6:-21377078 MsG0680031511.01.T01:CDS
TTGATTGGATATTGTGATGA+GGG 0.559703 6:-21376282 MsG0680031511.01.T01:CDS
GACACAATATTCTCATCCAA+GGG 0.563057 6:-21377195 MsG0680031511.01.T01:CDS
CCAATCCTTTGATTCCAAGT+GGG 0.563468 6:+21376186 None:intergenic
CTTGCGATTGTTATATGGAA+GGG 0.564380 6:-21375813 MsG0680031511.01.T01:CDS
TTTATGTCACAATGAATGAT+GGG 0.565957 6:+21376108 None:intergenic
ATCCAAGTAATCAATTTGGC+GGG 0.566714 6:-21377007 MsG0680031511.01.T01:CDS
GTGGTGGAGAGTCTTGAACT+TGG 0.570049 6:+21377929 None:intergenic
CTAACAACAACAACAATCCA+TGG 0.571011 6:-21377907 MsG0680031511.01.T01:CDS
TTCAAGAACATCCTGAAATG+AGG 0.572226 6:-21375702 MsG0680031511.01.T01:CDS
ATGGTCATGCAAATGCTAGA+AGG 0.573747 6:-21375667 MsG0680031511.01.T01:CDS
CGCGTTAAAAGAAGCTACAA+GGG 0.576466 6:-21376487 MsG0680031511.01.T01:CDS
TCATGTTAAGTCCACTTGCA+TGG 0.579811 6:-21377433 MsG0680031511.01.T01:CDS
GCTTGCGATTGTTATATGGA+AGG 0.586026 6:-21375814 MsG0680031511.01.T01:CDS
ACACTAAAGCAAAACAAGGA+TGG 0.586253 6:-21377172 MsG0680031511.01.T01:CDS
TTTGCTTTGGGGATTGCAAG+AGG 0.588856 6:-21376162 MsG0680031511.01.T01:CDS
ACTTTGACAGGTTAGCAAAG+TGG 0.590334 6:-21375747 MsG0680031511.01.T01:CDS
GTTTAAGAATGTTCCAGTGA+CGG 0.593324 6:-21375950 MsG0680031511.01.T01:CDS
TGAGGGAATGCATAGAATGT+TGG 0.594810 6:-21376265 MsG0680031511.01.T01:CDS
ACCATGATCCGAGGAACGCG+AGG 0.597961 6:-21375991 MsG0680031511.01.T01:CDS
TGAATCAGGAGATATTTATG+TGG 0.601671 6:-21377336 MsG0680031511.01.T01:CDS
AGACCAATTTCACAAGTGGA+AGG 0.602296 6:-21377493 MsG0680031511.01.T01:CDS
AATTTGTAACGAAATTGAGT+AGG 0.609342 6:+21377410 None:intergenic
ACTTGGAGAAACGTTTCCAA+AGG 0.611342 6:+21377946 None:intergenic
AAGTCAAGGAATCAAACTGA+AGG 0.612037 6:+21375609 None:intergenic
CCATAAGGACATCTACAAGT+AGG 0.612603 6:+21377044 None:intergenic
AGCTGAACATGTGATCCTGT+TGG 0.613140 6:+21377737 None:intergenic
TTGCTGTTAAGAAATTGGAT+CGG 0.623848 6:-21376383 MsG0680031511.01.T01:CDS
CTGAAATGAGGCCAACAATG+AGG 0.624246 6:-21375690 MsG0680031511.01.T01:CDS
GTTAGCGCAAGATCGCGAGA+AGG 0.635336 6:-21376361 MsG0680031511.01.T01:CDS
TGAGAATCTTGAAGTTAAGG+TGG 0.635720 6:+21377517 None:intergenic
AATGAGGCCAACAATGAGGA+TGG 0.635945 6:-21375686 MsG0680031511.01.T01:CDS
GCTAATGGAAGAGAAGAAAG+TGG 0.636558 6:-21376750 MsG0680031511.01.T01:CDS
TTAGGCAAAAGGGTGTCAGT+AGG 0.639454 6:+21377560 None:intergenic
GGTGCTGATGGAGTCAGGGG+AGG 0.640134 6:-21375863 MsG0680031511.01.T01:CDS
GTGTGGTGCTGATGGAGTCA+GGG 0.645422 6:-21375867 MsG0680031511.01.T01:CDS
TGTGGAGCTGATAATGGTGA+AGG 0.645657 6:-21376960 MsG0680031511.01.T01:CDS
TAACCTGTCAAAGTCATCCA+AGG 0.645853 6:+21375756 None:intergenic
CCGAAAGCGAATTCACCAGA+AGG 0.646876 6:+21377878 None:intergenic
GTTGATTGGATATTGTGATG+AGG 0.649134 6:-21376283 MsG0680031511.01.T01:CDS
CATGTTCAGCTAACATCAGG+TGG 0.649139 6:-21377725 MsG0680031511.01.T01:CDS
AAGCCGAAAAGGGTTGTCGT+AGG 0.653078 6:-21376552 MsG0680031511.01.T01:CDS
AATTGAGTAGGCCATGCAAG+TGG 0.656289 6:+21377422 None:intergenic
CATGCAAATGCTAGAAGGTG+TGG 0.663425 6:-21375662 MsG0680031511.01.T01:CDS
TCACCAGAAGGTGATAACCA+TGG 0.665151 6:+21377890 None:intergenic
TGTGGTGCTGATGGAGTCAG+GGG 0.670613 6:-21375866 MsG0680031511.01.T01:CDS
GCGTTAAAAGAAGCTACAAG+GGG 0.675299 6:-21376486 MsG0680031511.01.T01:CDS
TCAAACCTCAGGGTACACAA+TGG 0.679857 6:-21377283 MsG0680031511.01.T01:CDS
GAAATGGGAAGTGGAACTTG+TGG 0.684314 6:-21377101 MsG0680031511.01.T01:CDS
GTGTATGAGTTCATGAACAA+TGG 0.684533 6:-21376243 MsG0680031511.01.T01:CDS
ACTGCTAGAATCAAACCTCA+GGG 0.685277 6:-21377293 MsG0680031511.01.T01:CDS
AATGGAAGAGAAGAAAGTGG+TGG 0.687566 6:-21376747 MsG0680031511.01.T01:CDS
ATCCTGTTGGTGCTAGTACG+AGG 0.687632 6:+21377750 None:intergenic
GCAAACAATTTCCAACAACA+TGG 0.689003 6:+21375900 None:intergenic
AGGGACACTAAAGCAAAACA+AGG 0.696719 6:-21377176 MsG0680031511.01.T01:CDS
AGAACCAAAACCATGATCCG+AGG 0.697074 6:-21376000 MsG0680031511.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! TACAAATTTTACTATAGTAT+TGG - Chr6:21376221-21376240 MsG0680031511.01.T01:CDS 15.0%
!! AAAGAATGGAAATTATGTAA+AGG + Chr6:21375632-21375651 None:intergenic 20.0%
!! AAGAATGGAAATTATGTAAA+GGG + Chr6:21375631-21375650 None:intergenic 20.0%
!! CATCATCATTAAAATAAAGT+TGG + Chr6:21376151-21376170 None:intergenic 20.0%
!! GTGGAAATTACAAATAATAA+TGG - Chr6:21376299-21376318 MsG0680031511.01.T01:CDS 20.0%
!! GTTGTCTTTATTCAAATTAT+TGG + Chr6:21376954-21376973 None:intergenic 20.0%
!! TCTTTATTCAAATTATTGGA+AGG + Chr6:21376950-21376969 None:intergenic 20.0%
! AATTTGTAACGAAATTGAGT+AGG + Chr6:21376209-21376228 None:intergenic 25.0%
! ACAACAAATCTGTTATTGTT+TGG - Chr6:21376018-21376037 MsG0680031511.01.T01:CDS 25.0%
! ACTGCTATATTCAATGAAAT+GGG - Chr6:21376500-21376519 MsG0680031511.01.T01:CDS 25.0%
! ATAGATCCAAGTAATCAATT+TGG - Chr6:21376605-21376624 MsG0680031511.01.T01:CDS 25.0%
! CAACAAATCTGTTATTGTTT+GGG - Chr6:21376019-21376038 MsG0680031511.01.T01:CDS 25.0%
! GCTCTATAATAATACAACTT+AGG + Chr6:21376377-21376396 None:intergenic 25.0%
! GTAAACTCATATAAATCTTC+TGG + Chr6:21376695-21376714 None:intergenic 25.0%
! TCTATCAATGAATAACCATA+AGG + Chr6:21376590-21376609 None:intergenic 25.0%
! TCTTGGAAACAAATTTATGT+TGG - Chr6:21377095-21377114 MsG0680031511.01.T01:CDS 25.0%
! TTTATGTCACAATGAATGAT+GGG + Chr6:21377511-21377530 None:intergenic 25.0%
!! ATCTTTTCTTCCAACATTTT+TGG + Chr6:21376838-21376857 None:intergenic 25.0%
!! TCATCTATGAGTATATTTTG+AGG + Chr6:21377535-21377554 None:intergenic 25.0%
!!! AGAAGTTTGTTGTTGTATTA+CGG + Chr6:21375767-21375786 None:intergenic 25.0%
!!! AGTTTAGTTTTTGATGAATC+AGG - Chr6:21376266-21376285 MsG0680031511.01.T01:CDS 25.0%
AAAGTTTCCATTATCAAGCA+TGG + Chr6:21375988-21376007 None:intergenic 30.0%
AGAGCAACACTTGATTATTA+TGG - Chr6:21376392-21376411 MsG0680031511.01.T01:CDS 30.0%
AGTGGATAAAGATAGCAATT+TGG - Chr6:21377887-21377906 MsG0680031511.01.T01:CDS 30.0%
ATATTCAATGAAATGGGAAG+TGG - Chr6:21376506-21376525 MsG0680031511.01.T01:CDS 30.0%
CACTGCTATATTCAATGAAA+TGG - Chr6:21376499-21376518 MsG0680031511.01.T01:CDS 30.0%
CTATAATAGCTATTGTTCCA+TGG - Chr6:21376538-21376557 MsG0680031511.01.T01:CDS 30.0%
CTGTTCTTACTAATGTGAAT+TGG - Chr6:21376714-21376733 MsG0680031511.01.T01:CDS 30.0%
CTTTATGTCACAATGAATGA+TGG + Chr6:21377512-21377531 None:intergenic 30.0%
TACATGATCAAACCATTGTT+TGG - Chr6:21375814-21375833 MsG0680031511.01.T01:CDS 30.0%
TGAATCAGGAGATATTTATG+TGG - Chr6:21376280-21376299 MsG0680031511.01.T01:CDS 30.0%
TGTCTTTAATAGCTTACTCT+TGG - Chr6:21377015-21377034 MsG0680031511.01.T01:CDS 30.0%
TTGATTGGATATTGTGATGA+GGG - Chr6:21377334-21377353 MsG0680031511.01.T01:CDS 30.0%
! ACCTTTGAAAACAATTCCAA+AGG + Chr6:21377182-21377201 None:intergenic 30.0%
! CACAAGTTGAAGAAAAAGAA+TGG + Chr6:21375646-21375665 None:intergenic 30.0%
! TGTTGTTGCTGTTAAGAAAT+TGG - Chr6:21377228-21377247 MsG0680031511.01.T01:CDS 30.0%
! TTGCTGTTAAGAAATTGGAT+CGG - Chr6:21377233-21377252 MsG0680031511.01.T01:CDS 30.0%
!! AAAAACTTGGTCAAGTTGAT+TGG - Chr6:21377319-21377338 MsG0680031511.01.T01:CDS 30.0%
!!! TCCTTTGGAATTGTTTTCAA+AGG - Chr6:21377178-21377197 MsG0680031511.01.T01:CDS 30.0%
AAAAGATCACCTCTAGCTAA+TGG - Chr6:21376851-21376870 MsG0680031511.01.T01:CDS 35.0%
AAAGTGGATGTTTACAGCTT+TGG - Chr6:21377691-21377710 MsG0680031511.01.T01:CDS 35.0%
AAGCGATTGATTAGGCAAAA+GGG + Chr6:21376069-21376088 None:intergenic 35.0%
ACACTAAAGCAAAACAAGGA+TGG - Chr6:21376444-21376463 MsG0680031511.01.T01:CDS 35.0%
ACTCATAGATGAGTACTTCA+CGG - Chr6:21377543-21377562 MsG0680031511.01.T01:CDS 35.0%
ACTTCTTCATGCTTGCAATA+TGG - Chr6:21375781-21375800 MsG0680031511.01.T01:CDS 35.0%
AGAAGGCAATATTGACAGAT+TGG - Chr6:21377779-21377798 MsG0680031511.01.T01:CDS 35.0%
ATCCAAGTAATCAATTTGGC+GGG - Chr6:21376609-21376628 MsG0680031511.01.T01:CDS 35.0%
ATTAGTAGACCTCGAAGAAT+CGG + Chr6:21376986-21377005 None:intergenic 35.0%
ATTATCAAGCATGGTTCCAT+AGG + Chr6:21375979-21375998 None:intergenic 35.0%
ATTCTTCGAGGTCTACTAAT+TGG - Chr6:21376986-21377005 MsG0680031511.01.T01:CDS 35.0%
CCAAACGATATTGTTTCCTA+TGG - Chr6:21375960-21375979 MsG0680031511.01.T01:CDS 35.0%
CCATAGGAAACAATATCGTT+TGG + Chr6:21375963-21375982 None:intergenic 35.0%
CTAACAACAACAACAATCCA+TGG - Chr6:21375709-21375728 MsG0680031511.01.T01:CDS 35.0%
CTGCACAAAATGAATCCATT+TGG - Chr6:21375928-21375947 MsG0680031511.01.T01:CDS 35.0%
CTTGCGATTGTTATATGGAA+GGG - Chr6:21377803-21377822 MsG0680031511.01.T01:CDS 35.0%
GAAGATTTCTGACTTTGGAT+TGG - Chr6:21377567-21377586 MsG0680031511.01.T01:CDS 35.0%
GAAGGCAATATTGACAGATT+GGG - Chr6:21377780-21377799 MsG0680031511.01.T01:CDS 35.0%
GACACAATATTCTCATCCAA+GGG - Chr6:21376421-21376440 MsG0680031511.01.T01:CDS 35.0%
GATCCAAGTAATCAATTTGG+CGG - Chr6:21376608-21376627 MsG0680031511.01.T01:CDS 35.0%
GCAAACAATTTCCAACAACA+TGG + Chr6:21377719-21377738 None:intergenic 35.0%
GGAAATTATGTAAAGGGTAG+AGG + Chr6:21375625-21375644 None:intergenic 35.0%
GGAACATTCTTAAACCATTC+AGG + Chr6:21377661-21377680 None:intergenic 35.0%
GGAATCAAACTGAAGGAAAA+AGG + Chr6:21378003-21378022 None:intergenic 35.0%
GTGTATGAGTTCATGAACAA+TGG - Chr6:21377373-21377392 MsG0680031511.01.T01:CDS 35.0%
GTTGATTGGATATTGTGATG+AGG - Chr6:21377333-21377352 MsG0680031511.01.T01:CDS 35.0%
GTTTAAGAATGTTCCAGTGA+CGG - Chr6:21377666-21377685 MsG0680031511.01.T01:CDS 35.0%
TAAAACCTGCCACAAAAACT+TGG - Chr6:21377306-21377325 MsG0680031511.01.T01:CDS 35.0%
TATGGAACCATGCTTGATAA+TGG - Chr6:21375978-21375997 MsG0680031511.01.T01:CDS 35.0%
TCTTCAGAGACCAAAAATGT+TGG - Chr6:21376825-21376844 MsG0680031511.01.T01:CDS 35.0%
TGACACAATATTCTCATCCA+AGG - Chr6:21376420-21376439 MsG0680031511.01.T01:CDS 35.0%
TGACAGTCATGTTGAGAATA+AGG + Chr6:21376767-21376786 None:intergenic 35.0%
TGAGAATCTTGAAGTTAAGG+TGG + Chr6:21376102-21376121 None:intergenic 35.0%
TGTCAACTCAATTTCACACT+TGG - Chr6:21376632-21376651 MsG0680031511.01.T01:CDS 35.0%
TTCAAGAACATCCTGAAATG+AGG - Chr6:21377914-21377933 MsG0680031511.01.T01:CDS 35.0%
TTTATTGAAGAACTAGGTCG+AGG - Chr6:21377154-21377173 MsG0680031511.01.T01:CDS 35.0%
! AAAGGATTGGATTTGCTTTG+GGG - Chr6:21377443-21377462 MsG0680031511.01.T01:CDS 35.0%
! ATTGTTGTTGTTGTTAGTGG+TGG + Chr6:21375706-21375725 None:intergenic 35.0%
! CAAAGGATTGGATTTGCTTT+GGG - Chr6:21377442-21377461 MsG0680031511.01.T01:CDS 35.0%
! CTAGTACGTATTTTACCAAG+AGG + Chr6:21376926-21376945 None:intergenic 35.0%
! CTCTGAGAATCTTGAAGTTA+AGG + Chr6:21376105-21376124 None:intergenic 35.0%
! TCAAAGGATTGGATTTGCTT+TGG - Chr6:21377441-21377460 MsG0680031511.01.T01:CDS 35.0%
! TCAACTTGACCAAGTTTTTG+TGG + Chr6:21377318-21377337 None:intergenic 35.0%
! TGGATTGTTGTTGTTGTTAG+TGG + Chr6:21375709-21375728 None:intergenic 35.0%
!! TGGATTGGCTAAATTGTTGT+TGG - Chr6:21377582-21377601 MsG0680031511.01.T01:CDS 35.0%
!!! AGGGGTTTTATTGAAGAACT+AGG - Chr6:21377148-21377167 MsG0680031511.01.T01:CDS 35.0%
!!! GGTTTTGGTTCTACTTTGTT+CGG + Chr6:21377608-21377627 None:intergenic 35.0%
AAACTGAAGGAAAAAGGCGA+TGG + Chr6:21377997-21378016 None:intergenic 40.0%
AAGACAAGAGTTTCTCCTCT+TGG - Chr6:21376908-21376927 MsG0680031511.01.T01:CDS 40.0%
AATCCATGGTTATCACCTTC+TGG - Chr6:21375723-21375742 MsG0680031511.01.T01:CDS 40.0%
AATGGAAGAGAAGAAAGTGG+TGG - Chr6:21376869-21376888 MsG0680031511.01.T01:CDS 40.0%
ACGCGTTAAAAGAAGCTACA+AGG - Chr6:21377128-21377147 MsG0680031511.01.T01:CDS 40.0%
ACTGCTAGAATCAAACCTCA+GGG - Chr6:21376323-21376342 MsG0680031511.01.T01:CDS 40.0%
ACTTGGAGAAACGTTTCCAA+AGG + Chr6:21375673-21375692 None:intergenic 40.0%
ACTTTGACAGGTTAGCAAAG+TGG - Chr6:21377869-21377888 MsG0680031511.01.T01:CDS 40.0%
AGACCAATTTCACAAGTGGA+AGG - Chr6:21376123-21376142 MsG0680031511.01.T01:CDS 40.0%
AGCCTTGCAAACATCTTGTT+TGG - Chr6:21377397-21377416 MsG0680031511.01.T01:CDS 40.0%
AGGGACACTAAAGCAAAACA+AGG - Chr6:21376440-21376459 MsG0680031511.01.T01:CDS 40.0%
ATAGCAGTGCAGATGTTATC+AGG + Chr6:21376488-21376507 None:intergenic 40.0%
ATCCGTTCATAATCGGCTAA+TGG + Chr6:21376740-21376759 None:intergenic 40.0%
ATGGTCATGCAAATGCTAGA+AGG - Chr6:21377949-21377968 MsG0680031511.01.T01:CDS 40.0%
CAAAACCCACTTGGAATCAA+AGG - Chr6:21377425-21377444 MsG0680031511.01.T01:CDS 40.0%
CAAGCGATTGATTAGGCAAA+AGG + Chr6:21376070-21376089 None:intergenic 40.0%
CCAATCCTTTGATTCCAAGT+GGG + Chr6:21377433-21377452 None:intergenic 40.0%
CCATAAGGACATCTACAAGT+AGG + Chr6:21376575-21376594 None:intergenic 40.0%
CCTAACTCAAGCGATTGATT+AGG + Chr6:21376077-21376096 None:intergenic 40.0%
CCTAATCAATCGCTTGAGTT+AGG - Chr6:21376074-21376093 MsG0680031511.01.T01:CDS 40.0%
CCTACTTGTAGATGTCCTTA+TGG - Chr6:21376572-21376591 MsG0680031511.01.T01:CDS 40.0%
CGCGTTAAAAGAAGCTACAA+GGG - Chr6:21377129-21377148 MsG0680031511.01.T01:CDS 40.0%
CTCAATTTCACACTTGGTTG+TGG - Chr6:21376638-21376657 MsG0680031511.01.T01:CDS 40.0%
GAACCTTCCACTTGTGAAAT+TGG + Chr6:21376129-21376148 None:intergenic 40.0%
GACTTTGTTGAAGCCGAAAA+GGG - Chr6:21377054-21377073 MsG0680031511.01.T01:CDS 40.0%
GCGTTAAAAGAAGCTACAAG+GGG - Chr6:21377130-21377149 MsG0680031511.01.T01:CDS 40.0%
GCTAATGGAAGAGAAGAAAG+TGG - Chr6:21376866-21376885 MsG0680031511.01.T01:CDS 40.0%
GCTTGCGATTGTTATATGGA+AGG - Chr6:21377802-21377821 MsG0680031511.01.T01:CDS 40.0%
GTCCAAACAAGATGTTTGCA+AGG + Chr6:21377402-21377421 None:intergenic 40.0%
TAACCTGTCAAAGTCATCCA+AGG + Chr6:21377863-21377882 None:intergenic 40.0%
TACTGCTAGAATCAAACCTC+AGG - Chr6:21376322-21376341 MsG0680031511.01.T01:CDS 40.0%
TCACATGTTCAGCTAACATC+AGG - Chr6:21375888-21375907 MsG0680031511.01.T01:CDS 40.0%
TCAGAGACCAATTTCACAAG+TGG - Chr6:21376119-21376138 MsG0680031511.01.T01:CDS 40.0%
TCATGTTAAGTCCACTTGCA+TGG - Chr6:21376183-21376202 MsG0680031511.01.T01:CDS 40.0%
TCCAATCCTTTGATTCCAAG+TGG + Chr6:21377434-21377453 None:intergenic 40.0%
TCTTCTCTTCCATTAGCTAG+AGG + Chr6:21376863-21376882 None:intergenic 40.0%
TGACTTTGTTGAAGCCGAAA+AGG - Chr6:21377053-21377072 MsG0680031511.01.T01:CDS 40.0%
TGAGGGAATGCATAGAATGT+TGG - Chr6:21377351-21377370 MsG0680031511.01.T01:CDS 40.0%
TTAGTAGACCTCGAAGAATC+GGG + Chr6:21376985-21377004 None:intergenic 40.0%
TTGGACAAACAAAACCCACT+TGG - Chr6:21377416-21377435 MsG0680031511.01.T01:CDS 40.0%
TTGGGCTTGCGATTGTTATA+TGG - Chr6:21377798-21377817 MsG0680031511.01.T01:CDS 40.0%
! AGTAGGTCTCTGATTTTCCA+TGG + Chr6:21376558-21376577 None:intergenic 40.0%
! GTTGCTGTTGTTCATGTCTT+TGG + Chr6:21375844-21375863 None:intergenic 40.0%
! TGTTTGCTGCAGAAAAAGTG+TGG - Chr6:21377732-21377751 MsG0680031511.01.T01:CDS 40.0%
! TGTTTTGCTTTAGTGTCCCT+TGG + Chr6:21376440-21376459 None:intergenic 40.0%
! TTTGTGGCAGGTTTTACCAA+TGG + Chr6:21377302-21377321 None:intergenic 40.0%
! TTTTTCCATTGTGTACCCTG+AGG + Chr6:21376341-21376360 None:intergenic 40.0%
!! AACAAGGATGGACTAGTATG+AGG - Chr6:21376456-21376475 MsG0680031511.01.T01:CDS 40.0%
!! CTTCAACTTGTGTTAGCCTT+TGG - Chr6:21375654-21375673 MsG0680031511.01.T01:CDS 40.0%
AATGAGGCCAACAATGAGGA+TGG - Chr6:21377930-21377949 MsG0680031511.01.T01:CDS 45.0%
AATTGAGTAGGCCATGCAAG+TGG + Chr6:21376197-21376216 None:intergenic 45.0%
ACGGCGAAGATTTCTGACTT+TGG - Chr6:21377562-21377581 MsG0680031511.01.T01:CDS 45.0%
AGAACCAAAACCATGATCCG+AGG - Chr6:21377616-21377635 MsG0680031511.01.T01:CDS 45.0%
AGCTGAACATGTGATCCTGT+TGG + Chr6:21375882-21375901 None:intergenic 45.0%
AGGCTGCATCCGTTCATAAT+CGG + Chr6:21376747-21376766 None:intergenic 45.0%
AGGGAGAATAGATGCTTTGG+TGG - Chr6:21377822-21377841 MsG0680031511.01.T01:CDS 45.0%
ATGCCTTGGATGACTTTGAC+AGG - Chr6:21377857-21377876 MsG0680031511.01.T01:CDS 45.0%
CACCCGCCAAATTGATTACT+TGG + Chr6:21376614-21376633 None:intergenic 45.0%
CATGCAAATGCTAGAAGGTG+TGG - Chr6:21377954-21377973 MsG0680031511.01.T01:CDS 45.0%
CATGTTCAGCTAACATCAGG+TGG - Chr6:21375891-21375910 MsG0680031511.01.T01:CDS 45.0%
CCCACTTGGAATCAAAGGAT+TGG - Chr6:21377430-21377449 MsG0680031511.01.T01:CDS 45.0%
CCTTCTGGTGAATTCGCTTT+CGG - Chr6:21375738-21375757 MsG0680031511.01.T01:CDS 45.0%
CTCGAAGAATCGGGTTAACT+CGG + Chr6:21376976-21376995 None:intergenic 45.0%
CTGAAATGAGGCCAACAATG+AGG - Chr6:21377926-21377945 MsG0680031511.01.T01:CDS 45.0%
CTTGGTTGTGGAGCTGATAA+TGG - Chr6:21376650-21376669 MsG0680031511.01.T01:CDS 45.0%
GAAATGGGAAGTGGAACTTG+TGG - Chr6:21376515-21376534 MsG0680031511.01.T01:CDS 45.0%
GAGGATATGTAGCTCCTGAA+TGG - Chr6:21377644-21377663 MsG0680031511.01.T01:CDS 45.0%
GGAAGGGAGAATAGATGCTT+TGG - Chr6:21377819-21377838 MsG0680031511.01.T01:CDS 45.0%
GGAGAATGATCAAGATGCCT+TGG - Chr6:21377843-21377862 MsG0680031511.01.T01:CDS 45.0%
GGCCATTAGCCGATTATGAA+CGG - Chr6:21376735-21376754 MsG0680031511.01.T01:CDS 45.0%
GTTTGGTTGTGCTGTCCAAA+TGG + Chr6:21375946-21375965 None:intergenic 45.0%
TCAAACCTCAGGGTACACAA+TGG - Chr6:21376333-21376352 MsG0680031511.01.T01:CDS 45.0%
TCACCAGAAGGTGATAACCA+TGG + Chr6:21375729-21375748 None:intergenic 45.0%
TGAAGGAAAAAGGCGATGGT+GGG + Chr6:21377993-21378012 None:intergenic 45.0%
TGCATGACCATCCTCATTGT+TGG + Chr6:21377940-21377959 None:intergenic 45.0%
TTTGGGGATTGCAAGAGGAT+TGG - Chr6:21377459-21377478 MsG0680031511.01.T01:CDS 45.0%
! CAGAAAAAGTGTGGTGCTGA+TGG - Chr6:21377741-21377760 MsG0680031511.01.T01:CDS 45.0%
! CTCATTGTTGGCCTCATTTC+AGG + Chr6:21377928-21377947 None:intergenic 45.0%
! CTTGACCAAGTTTTTGTGGC+AGG + Chr6:21377314-21377333 None:intergenic 45.0%
!! AAAAAGGCGATGGTGGGTTA+GGG + Chr6:21377987-21378006 None:intergenic 45.0%
!! TGTGGAGCTGATAATGGTGA+AGG - Chr6:21376656-21376675 MsG0680031511.01.T01:CDS 45.0%
!! TTAGGCAAAAGGGTGTCAGT+AGG + Chr6:21376059-21376078 None:intergenic 45.0%
!! TTTGCTTTGGGGATTGCAAG+AGG - Chr6:21377454-21377473 MsG0680031511.01.T01:CDS 45.0%
AACCTCGTACTAGCACCAAC+AGG - Chr6:21375864-21375883 MsG0680031511.01.T01:CDS 50.0%
AAGACTGAGTTGCGAGCCAT+TGG - Chr6:21377283-21377302 MsG0680031511.01.T01:CDS 50.0%
AAGCCGAAAAGGGTTGTCGT+AGG - Chr6:21377064-21377083 MsG0680031511.01.T01:CDS 50.0%
ACATCCACTTTAGCCGTCAC+TGG + Chr6:21377682-21377701 None:intergenic 50.0%
CCGAAAGCGAATTCACCAGA+AGG + Chr6:21375741-21375760 None:intergenic 50.0%
CGAGTTAACCCGATTCTTCG+AGG - Chr6:21376974-21376993 MsG0680031511.01.T01:CDS 50.0%
CTACATATCCTCGCGTTCCT+CGG + Chr6:21377636-21377655 None:intergenic 50.0%
CTGAAGGAAAAAGGCGATGG+TGG + Chr6:21377994-21378013 None:intergenic 50.0%
GAACTAGGTCGAGGTTCCTT+TGG - Chr6:21377163-21377182 MsG0680031511.01.T01:CDS 50.0%
GTCTTTGGCGCTCCAAACAA+TGG + Chr6:21375829-21375848 None:intergenic 50.0%
TGTTCCAGTGACGGCTAAAG+TGG - Chr6:21377675-21377694 MsG0680031511.01.T01:CDS 50.0%
! CGTTCCTCGGATCATGGTTT+TGG + Chr6:21377623-21377642 None:intergenic 50.0%
! GTGGTGGAGAGTCTTGAACT+TGG + Chr6:21375690-21375709 None:intergenic 50.0%
!! ATCCTGTTGGTGCTAGTACG+AGG + Chr6:21375869-21375888 None:intergenic 50.0%
!! CAGCTTTGGTGCCATGTTGT+TGG - Chr6:21377705-21377724 MsG0680031511.01.T01:CDS 50.0%
!! GAAAAAGGCGATGGTGGGTT+AGG + Chr6:21377988-21378007 None:intergenic 50.0%
GTTAGCGCAAGATCGCGAGA+AGG - Chr6:21377255-21377274 MsG0680031511.01.T01:CDS 55.0%
TGTCGTAGGCGCAACTCTCT+TGG - Chr6:21377078-21377097 MsG0680031511.01.T01:CDS 55.0%
! GCGCCTACGACAACCCTTTT+CGG + Chr6:21377070-21377089 None:intergenic 55.0%
!! AGTGTGGTGCTGATGGAGTC+AGG - Chr6:21377748-21377767 MsG0680031511.01.T01:CDS 55.0%
!! GTGTGGTGCTGATGGAGTCA+GGG - Chr6:21377749-21377768 MsG0680031511.01.T01:CDS 55.0%
!! TGTGGTGCTGATGGAGTCAG+GGG - Chr6:21377750-21377769 MsG0680031511.01.T01:CDS 55.0%
ACCATGATCCGAGGAACGCG+AGG - Chr6:21377625-21377644 MsG0680031511.01.T01:CDS 60.0%
GGAGTCAGGGGAGGAAGAGA+AGG - Chr6:21377762-21377781 MsG0680031511.01.T01:CDS 60.0%
TCCTCGCGTTCCTCGGATCA+TGG + Chr6:21377629-21377648 None:intergenic 60.0%
!! GGTGCTGATGGAGTCAGGGG+AGG - Chr6:21377753-21377772 MsG0680031511.01.T01:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 21375612 21378026 21375612 ID=MsG0680031511.01;Name=MsG0680031511.01
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Chr6 exon 21375612 21378026 21375612 ID=MsG0680031511.01.T01:exon:13570;Parent=MsG0680031511.01.T01
Chr6 CDS 21375612 21378026 21375612 ID=MsG0680031511.01.T01:cds;Parent=MsG0680031511.01.T01
Gene Sequence

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Protein sequence

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