AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680032070.01

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MsG0680032070.01.T01 AT1G72840 40.268 149 80 3 16 159 11 155 4.95e-27 115
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MsG0680032070.01.T01 AT1G27180 41.667 144 79 3 20 160 12 153 2.38e-28 119
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MsG0680032070.01.T01 AT3G44480 35.583 163 103 2 197 358 98 259 3.51e-27 115
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MsG0680032070.01.T01 AT4G16990 40.659 182 91 5 1 179 1 168 2.58e-28 118
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MsG0680032070.01.T01 AT3G44480 35.583 163 103 2 197 358 98 259 4.44e-27 115
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MsG0680032070.01.T01 AT5G41750 42.593 162 87 3 197 355 13 171 9.10e-30 123
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MsG0680032070.01.T01 AT5G41750 42.593 162 87 3 197 355 13 171 9.10e-30 123
MsG0680032070.01.T01 AT5G41750 41.667 168 81 5 1 161 1 158 2.05e-28 119
MsG0680032070.01.T01 AT3G04220 40.449 178 95 5 20 191 63 235 9.45e-30 123
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MsG0680032070.01.T01 AT4G16990 39.877 163 96 2 196 357 8 169 9.72e-30 123
MsG0680032070.01.T01 AT4G16990 39.779 181 94 4 1 179 1 168 4.46e-28 118
MsG0680032070.01.T01 AT4G16990 39.877 163 96 2 196 357 8 169 1.02e-29 123
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MsG0680032070.01.T01 AT5G46510 41.958 143 79 4 20 161 9 148 1.21e-26 114
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MsG0680032070.01.T01 AT1G65850 37.705 183 109 4 12 191 25 205 1.58e-27 116
MsG0680032070.01.T01 AT1G65850 34.444 180 115 3 180 358 17 194 3.92e-27 115
MsG0680032070.01.T01 AT1G63730 40.361 166 95 2 197 362 13 174 1.66e-27 116
MsG0680032070.01.T01 AT1G63730 40.719 167 84 4 1 161 1 158 4.78e-26 112
MsG0680032070.01.T01 AT1G63880 38.889 162 97 2 197 357 14 174 1.85e-27 116
MsG0680032070.01.T01 AT1G63880 36.810 163 94 3 1 162 1 155 7.77e-24 105
MsG0680032070.01.T01 AT4G19500 39.490 157 92 2 20 175 11 165 1.93e-27 116
MsG0680032070.01.T01 AT4G19500 41.379 145 84 1 197 341 11 154 3.50e-25 109
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MsG0680032070.01.T01 AT2G17060 32.911 158 101 3 199 356 20 172 3.52e-18 88.2
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MsG0680032070.01.T01 AT2G17060 32.911 158 101 3 199 356 20 172 3.99e-18 88.2
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MsG0680032070.01.T01 AT5G41740 34.568 162 87 4 197 355 16 161 2.16e-17 85.9
MsG0680032070.01.T01 AT5G41740 33.557 149 76 5 20 161 16 148 2.55e-15 79.3
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MsG0680032070.01.T01 AT5G51630 36.449 107 67 1 252 357 1 107 1.41e-13 73.9
MsG0680032070.01.T01 AT1G57850 34.211 114 71 3 52 165 33 142 1.89e-13 68.2
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MsG0680032070.01.T01 AT5G45210 31.288 163 98 7 198 355 8 161 4.23e-13 72.0
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MsG0680032070.01.T01 AT4G23510 27.907 172 107 4 199 355 12 181 4.68e-11 65.5
MsG0680032070.01.T01 AT4G09420 36.691 139 83 3 20 157 12 146 3.53e-12 68.6
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MsG0680032070.01.T01 AT5G45240 29.752 121 77 3 253 369 44 160 5.98e-11 65.5
MsG0680032070.01.T01 AT2G17050 31.481 162 101 6 4 159 1138 1295 9.28e-11 65.1
MsG0680032070.01.T01 AT2G17050 31.481 162 101 6 4 159 1107 1264 9.48e-11 65.1

Find 80 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 320 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
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AACTTGGTGCTTGCGAGAAT+TGG 0.285119 6:-33057217 MsG0680032070.01.T01:CDS
GTGAAATTGAAGCGTGTGTC+TGG 0.294203 6:+33057396 None:intergenic
TCCAAGTCGTACAAAAGATT+TGG 0.337720 6:-33057457 MsG0680032070.01.T01:CDS
TAGCACATACAAACGACTTT+TGG 0.338642 6:+33054793 None:intergenic
GAGGAACATATGAACATAAT+AGG 0.338695 6:-33052454 MsG0680032070.01.T01:CDS
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TTGGTATCTCTCTCCAAGTT+TGG 0.359907 6:+33057842 None:intergenic
TTCAGAGATGAACTTCAAAA+AGG 0.368955 6:-33058083 MsG0680032070.01.T01:CDS
TTCAATTGCATTAAAGAGTC+CGG 0.376979 6:+33057287 None:intergenic
ATACCAAGATGACTCAAATA+AGG 0.378671 6:-33057826 MsG0680032070.01.T01:CDS
TTTAACTGTAGTGTATTGTA+TGG 0.381414 6:-33057945 MsG0680032070.01.T01:CDS
CAAGATGAAGCAGCATATTT+CGG 0.383779 6:+33057993 None:intergenic
GGTGAATCCCTTGCCAAACT+TGG 0.392781 6:-33057855 MsG0680032070.01.T01:CDS
ATTCTAGCGTCGCCTCTGTT+TGG 0.398249 6:+33052569 None:intergenic
GAACTCTTTCGCGCAATTGA+AGG 0.402183 6:-33058044 MsG0680032070.01.T01:CDS
TCATAATCATTCTTTCTCCT+TGG 0.403489 6:+33058194 None:intergenic
GCACCTTATTTGAGTCATCT+TGG 0.408619 6:+33057823 None:intergenic
TCTGAGGTGCGAAAGCAAAA+TGG 0.414107 6:-33057885 MsG0680032070.01.T01:CDS
AACATAATAGGAGGAAATCA+TGG 0.414763 6:-33052442 MsG0680032070.01.T01:CDS
TAATGCAATTGAAGCCTCTC+AGG 0.423127 6:-33057277 MsG0680032070.01.T01:CDS
GTCATGTTCGAATCCATGTT+TGG 0.427725 6:+33057083 None:intergenic
CGCAATATAATGCGACTTCA+AGG 0.440132 6:-33052489 MsG0680032070.01.T01:CDS
TCGCGCAATTGAAGGCTCTC+AGG 0.442611 6:-33058036 MsG0680032070.01.T01:CDS
AGCGGAAGAGCTGCTACTGC+TGG 0.446175 6:+33058229 None:intergenic
CGAAATATGCTGCTTCATCT+TGG 0.453164 6:-33057992 MsG0680032070.01.T01:CDS
GGATCAACATCATAGAAAAC+AGG 0.462692 6:+33057150 None:intergenic
TTCGAATCCATGTTTGGATA+GGG 0.468995 6:+33057089 None:intergenic
AGAATTATGCTTCTTCAACT+TGG 0.476893 6:-33057233 MsG0680032070.01.T01:CDS
TAGTGGGTAATATCGTTGGC+TGG 0.481150 6:-33057776 MsG0680032070.01.T01:CDS
CGAAAGCAAAATGGTGGTTA+TGG 0.487117 6:-33057876 MsG0680032070.01.T01:CDS
GTTCGAATCCATGTTTGGAT+AGG 0.489203 6:+33057088 None:intergenic
GAAATCATGGGAGGAAAGCA+TGG 0.491854 6:-33052429 MsG0680032070.01.T01:CDS
ACTCAAATAAGGTGCAAAGA+TGG 0.498129 6:-33057815 MsG0680032070.01.T01:CDS
GAAGAAACAGCGGAGAAAGA+AGG 0.507297 6:-33052541 MsG0680032070.01.T01:CDS
CAACTAGTGGGTAATATCGT+TGG 0.521821 6:-33057780 MsG0680032070.01.T01:CDS
CTATGATGTTGATCCTTCTG+AGG 0.525723 6:-33057142 MsG0680032070.01.T01:CDS
ATCTCTCTCCAAGTTTGGCA+AGG 0.528603 6:+33057847 None:intergenic
TTATGACGTAGATTCAAGCT+AGG 0.529476 6:+33057009 None:intergenic
TCAATTGCATTAAAGAGTCC+GGG 0.550620 6:+33057288 None:intergenic
GAGAGAATCTCTACAACTAG+TGG 0.551370 6:-33057793 MsG0680032070.01.T01:CDS
GACGTGTTTGTGAGCTTCAG+AGG 0.554378 6:-33058173 MsG0680032070.01.T01:CDS
ACTCAAATACAGTGCAAGGA+TGG 0.555169 6:-33057062 MsG0680032070.01.T01:CDS
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AGTGGGTAATATCGTTGGCT+GGG 0.569126 6:-33057775 MsG0680032070.01.T01:CDS
TTTGTATGTGCTAAAAGCCG+TGG 0.569283 6:-33054783 MsG0680032070.01.T01:CDS
CAACGTGAACAACAATGGCA+TGG 0.583927 6:-33052602 MsG0680032070.01.T01:CDS
TTATGATGTTGATCCTTCTG+AGG 0.584386 6:-33057901 MsG0680032070.01.T01:CDS
GTGTTCTATCTAGGATTGGA+AGG 0.584998 6:-33052631 MsG0680032070.01.T01:intron
TCTCTCTCCAAGTTTGGCAA+GGG 0.590612 6:+33057848 None:intergenic
AGAGAAACTCTCACACAAGT+GGG 0.591432 6:-33057039 MsG0680032070.01.T01:CDS
GCGAAAGAGTTCAGATACTA+CGG 0.592055 6:+33058055 None:intergenic
GAGAGAAACTCTCACACAAG+TGG 0.592098 6:-33057040 MsG0680032070.01.T01:CDS
TGAAATTGAAGCGTGTGTCT+GGG 0.592148 6:+33057397 None:intergenic
TGTAACAAAGTTAACGTCAT+CGG 0.592406 6:-33052515 MsG0680032070.01.T01:CDS
TTTGGTGCGCTACAAAGAAG+AGG 0.599641 6:-33057363 MsG0680032070.01.T01:CDS
AACTTGCAGGCCACAACACG+CGG 0.604815 6:-33057526 MsG0680032070.01.T01:intron
CATGACTCAAATACAGTGCA+AGG 0.608295 6:-33057066 MsG0680032070.01.T01:CDS
TATGACGTAGATTCAAGCTA+GGG 0.608388 6:+33057010 None:intergenic
GAGGAGAAGAGACTCCAACT+AGG 0.610910 6:-33052407 None:intergenic
GAACATATGAACATAATAGG+AGG 0.614873 6:-33052451 MsG0680032070.01.T01:CDS
ACATAATAGGAGGAAATCAT+GGG 0.619534 6:-33052441 MsG0680032070.01.T01:CDS
AGAGAATCTCTACAACTAGT+GGG 0.620797 6:-33057792 MsG0680032070.01.T01:CDS
AAAGGTGAATTCATAGAACC+CGG 0.628065 6:-33057306 MsG0680032070.01.T01:CDS
CCGCTCTAGTGACATCTCCA+AGG 0.636765 6:-33058211 MsG0680032070.01.T01:CDS
TTGTATGTGCTAAAAGCCGT+GGG 0.644210 6:-33054782 MsG0680032070.01.T01:intron
TTCAAGGACAACACAAACAG+AGG 0.650733 6:-33052473 MsG0680032070.01.T01:CDS
AGTTTCAACGTGAACAACAA+TGG 0.651060 6:-33052607 MsG0680032070.01.T01:CDS
GCTGAAGCCCTATCCAAACA+TGG 0.655567 6:-33057096 MsG0680032070.01.T01:CDS
GAGGTGCAAAAGCAAAGTGG+TGG 0.664822 6:-33057123 MsG0680032070.01.T01:CDS
CCTTGGAGATGTCACTAGAG+CGG 0.672157 6:+33058211 None:intergenic
TAATAGGAGGAAATCATGGG+AGG 0.676912 6:-33052438 MsG0680032070.01.T01:CDS
TCTGAGGTGCAAAAGCAAAG+TGG 0.678739 6:-33057126 MsG0680032070.01.T01:CDS
TACAACAATGTAAACCTGAG+AGG 0.682721 6:+33057263 None:intergenic
GAGGTGCGAAAGCAAAATGG+TGG 0.683009 6:-33057882 MsG0680032070.01.T01:CDS
GAGAAACTCTCACACAAGTG+GGG 0.686144 6:-33057038 MsG0680032070.01.T01:CDS
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ATCATGGGAGGAAAGCATGG+AGG 0.712608 6:-33052426 MsG0680032070.01.T01:CDS
GGATTGCGACATCCAAACAG+AGG 0.714394 6:-33052581 MsG0680032070.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAAACTATTAAAATTAAGTA+AGG - Chr6:33054154-33054173 MsG0680032070.01.T01:intron 10.0%
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!!! GAGTGCATAATTTTTTTGCA+AGG - Chr6:33054125-33054144 MsG0680032070.01.T01:intron 30.0%
!!! GGTTTTGTTGTTTAGTTCTA+TGG + Chr6:33056695-33056714 None:intergenic 30.0%
!!! GTTTTTAAAATCAAGCCTAG+AGG - Chr6:33055534-33055553 MsG0680032070.01.T01:intron 30.0%
!!! GTTTTTGGTCCCTATAAAAT+TGG - Chr6:33053698-33053717 MsG0680032070.01.T01:intron 30.0%
!!! TTTGCGATATTTTTTTGCTG+AGG - Chr6:33054001-33054020 MsG0680032070.01.T01:intron 30.0%
AAAGGTGAATTCATAGAACC+CGG - Chr6:33053335-33053354 MsG0680032070.01.T01:intron 35.0%
AAATTACCCACGACTTATCA+AGG - Chr6:33055888-33055907 MsG0680032070.01.T01:intron 35.0%
AAGTAAGCAATCTTCCCTAT+TGG - Chr6:33052900-33052919 MsG0680032070.01.T01:intron 35.0%
AATTACACTTGGTTATGCCA+TGG - Chr6:33055974-33055993 MsG0680032070.01.T01:intron 35.0%
AATTACCCACGACTTATCAA+GGG - Chr6:33055889-33055908 MsG0680032070.01.T01:intron 35.0%
ACTCAAATAAGGTGCAAAGA+TGG - Chr6:33052826-33052845 MsG0680032070.01.T01:intron 35.0%
ACTGTCAATAAAGTTACGCA+TGG - Chr6:33056059-33056078 MsG0680032070.01.T01:intron 35.0%
AGAGAATCTCTACAACTAGT+GGG - Chr6:33052849-33052868 MsG0680032070.01.T01:intron 35.0%
AGATGACGATTGGATTACAT+AGG + Chr6:33055282-33055301 None:intergenic 35.0%
AGTTTAGCCATGGGTAATAT+AGG + Chr6:33056042-33056061 None:intergenic 35.0%
AGTTTCAACGTGAACAACAA+TGG - Chr6:33058034-33058053 MsG0680032070.01.T01:CDS 35.0%
ATATTGCTTAACTGCGTCAA+GGG + Chr6:33056911-33056930 None:intergenic 35.0%
ATGTGATGATTTCGTGTTGT+TGG - Chr6:33053080-33053099 MsG0680032070.01.T01:intron 35.0%
CAAGATGAAGCAGCATATTT+CGG + Chr6:33052651-33052670 None:intergenic 35.0%
CACATAACTTACCAAAGACT+TGG + Chr6:33056085-33056104 None:intergenic 35.0%
CATGCTAACTTATGCCTTTA+GGG + Chr6:33054670-33054689 None:intergenic 35.0%
CATTCAATGGGTGAGTTATT+TGG - Chr6:33056846-33056865 MsG0680032070.01.T01:intron 35.0%
CGACAAAACCTTCACAATTA+AGG - Chr6:33056738-33056757 MsG0680032070.01.T01:intron 35.0%
CTAAGCATGTAGTGATAAGT+TGG - Chr6:33057460-33057479 MsG0680032070.01.T01:CDS 35.0%
CTTCATTGCAGTCAAAAACA+TGG - Chr6:33053455-33053474 MsG0680032070.01.T01:intron 35.0%
CTTTATTGACAGTTTAGCCA+TGG + Chr6:33056052-33056071 None:intergenic 35.0%
GAGGAACCAAAAATACAATG+AGG - Chr6:33055553-33055572 MsG0680032070.01.T01:intron 35.0%
GATTACCCACAAATTATCCA+TGG + Chr6:33055994-33056013 None:intergenic 35.0%
GGATCAACATCATAGAAAAC+AGG + Chr6:33053494-33053513 None:intergenic 35.0%
GTTATGCCATGGATAATTTG+TGG - Chr6:33055985-33056004 MsG0680032070.01.T01:intron 35.0%
GTTTGATCCCTTAATTGTGA+AGG + Chr6:33056749-33056768 None:intergenic 35.0%
TACAACAATGTAAACCTGAG+AGG + Chr6:33053381-33053400 None:intergenic 35.0%
TAGTCCACTGTAATTACACT+TGG - Chr6:33055963-33055982 MsG0680032070.01.T01:intron 35.0%
TATGACGTAGATTCAAGCTA+GGG + Chr6:33053634-33053653 None:intergenic 35.0%
TATGAGTCCTCATAGATTCA+TGG + Chr6:33056616-33056635 None:intergenic 35.0%
TATTGGTCCTATATTACCCA+TGG - Chr6:33056032-33056051 MsG0680032070.01.T01:intron 35.0%
TCAATTGCATTAAAGAGTCC+GGG + Chr6:33053356-33053375 None:intergenic 35.0%
TCATGCTAACTTATGCCTTT+AGG + Chr6:33054671-33054690 None:intergenic 35.0%
TCCAAGTCGTACAAAAGATT+TGG - Chr6:33053184-33053203 MsG0680032070.01.T01:intron 35.0%
TGTTGTGTTACATCTCTCAA+AGG - Chr6:33056225-33056244 MsG0680032070.01.T01:intron 35.0%
TTATGACGTAGATTCAAGCT+AGG + Chr6:33053635-33053654 None:intergenic 35.0%
TTATGATGTTGATCCTTCTG+AGG - Chr6:33052740-33052759 MsG0680032070.01.T01:intron 35.0%
TTCGAATCCATGTTTGGATA+GGG + Chr6:33053555-33053574 None:intergenic 35.0%
TTGGTCTACCATAGACATTT+GGG - Chr6:33055364-33055383 MsG0680032070.01.T01:intron 35.0%
! ACCAAATCTTTTGTACGACT+TGG + Chr6:33053188-33053207 None:intergenic 35.0%
! TAGCACATACAAACGACTTT+TGG + Chr6:33055851-33055870 None:intergenic 35.0%
!! ATGTGATGATTTGGTGTTGT+TGG - Chr6:33055709-33055728 MsG0680032070.01.T01:intron 35.0%
!! CATGTTTTTGACTGCAATGA+AGG + Chr6:33053457-33053476 None:intergenic 35.0%
!! TTGATGGTGTTTGATGTTTC+TGG - Chr6:33055077-33055096 MsG0680032070.01.T01:intron 35.0%
!!! ATTTGGCTTGGGATTTTATG+TGG - Chr6:33056863-33056882 MsG0680032070.01.T01:intron 35.0%
!!! TGGGTAATTTTGATTACCCA+CGG + Chr6:33055878-33055897 None:intergenic 35.0%
AAGAAACAGCGGAGAAAGAA+GGG - Chr6:33058101-33058120 MsG0680032070.01.T01:CDS 40.0%
AATACAACGAGCAAGAGGTT+CGG - Chr6:33054981-33055000 MsG0680032070.01.T01:intron 40.0%
AATGGGTGAGTTATTTGGCT+TGG - Chr6:33056851-33056870 MsG0680032070.01.T01:intron 40.0%
ACTCAAATACAGTGCAAGGA+TGG - Chr6:33053579-33053598 MsG0680032070.01.T01:intron 40.0%
AGAACAATACAACGAGCAAG+AGG - Chr6:33054976-33054995 MsG0680032070.01.T01:intron 40.0%
AGAGAAACTCTCACACAAGT+GGG - Chr6:33053602-33053621 MsG0680032070.01.T01:intron 40.0%
ATCCATGGTTCCTCAGTTAA+TGG + Chr6:33057926-33057945 None:intergenic 40.0%
ATGGGGATCATTCTTAAGGT+TGG - Chr6:33055345-33055364 MsG0680032070.01.T01:intron 40.0%
CACAATGCCATGAATCTATG+AGG - Chr6:33056606-33056625 MsG0680032070.01.T01:intron 40.0%
CATATTGCTTAACTGCGTCA+AGG + Chr6:33056912-33056931 None:intergenic 40.0%
CATGACTCAAATACAGTGCA+AGG - Chr6:33053575-33053594 MsG0680032070.01.T01:intron 40.0%
CCTCATTCCATCATGTTTCT+CGG - Chr6:33057870-33057889 MsG0680032070.01.T01:CDS 40.0%
CGAAAGCAAAATGGTGGTTA+TGG - Chr6:33052765-33052784 MsG0680032070.01.T01:intron 40.0%
CGCAATATAATGCGACTTCA+AGG - Chr6:33058152-33058171 MsG0680032070.01.T01:CDS 40.0%
CTATGATGTTGATCCTTCTG+AGG - Chr6:33053499-33053518 MsG0680032070.01.T01:intron 40.0%
CTATTTGCCACAATTCAAGG+AGG + Chr6:33054819-33054838 None:intergenic 40.0%
CTCTACCTGATGCATTCAAT+GGG - Chr6:33056834-33056853 MsG0680032070.01.T01:intron 40.0%
CTTTACCTCACCATTAACTG+AGG - Chr6:33057913-33057932 MsG0680032070.01.T01:CDS 40.0%
GAGAGAATCTCTACAACTAG+TGG - Chr6:33052848-33052867 MsG0680032070.01.T01:intron 40.0%
GCACTATTTGCCACAATTCA+AGG + Chr6:33054822-33054841 None:intergenic 40.0%
GCGAAAGAGTTCAGATACTA+CGG + Chr6:33052589-33052608 None:intergenic 40.0%
GGCAAATAGTGCATTGTGAT+TGG - Chr6:33054830-33054849 MsG0680032070.01.T01:CDS 40.0%
GTCATGTTCGAATCCATGTT+TGG + Chr6:33053561-33053580 None:intergenic 40.0%
GTTCGAATCCATGTTTGGAT+AGG + Chr6:33053556-33053575 None:intergenic 40.0%
TAATAGGAGGAAATCATGGG+AGG - Chr6:33058203-33058222 MsG0680032070.01.T01:CDS 40.0%
TAATGCAATTGAAGCCTCTC+AGG - Chr6:33053364-33053383 MsG0680032070.01.T01:intron 40.0%
TAGCGCACCAAAAAGATGAT+CGG + Chr6:33053270-33053289 None:intergenic 40.0%
TGAAATTGAAGCGTGTGTCT+GGG + Chr6:33053247-33053266 None:intergenic 40.0%
TGCAAAACGGAGTAGAAGAA+CGG + Chr6:33057411-33057430 None:intergenic 40.0%
TGGTCTACCATAGACATTTG+GGG - Chr6:33055365-33055384 MsG0680032070.01.T01:intron 40.0%
TGTGGCTGAAAAATAGGAAG+TGG + Chr6:33054796-33054815 None:intergenic 40.0%
TTCAAGGACAACACAAACAG+AGG - Chr6:33058168-33058187 MsG0680032070.01.T01:CDS 40.0%
TTGGTATCTCTCTCCAAGTT+TGG + Chr6:33052802-33052821 None:intergenic 40.0%
TTGTATGTGCTAAAAGCCGT+GGG - Chr6:33055859-33055878 MsG0680032070.01.T01:intron 40.0%
TTTGTATGTGCTAAAAGCCG+TGG - Chr6:33055858-33055877 MsG0680032070.01.T01:intron 40.0%
! ATGGGTGAGTTATTTGGCTT+GGG - Chr6:33056852-33056871 MsG0680032070.01.T01:intron 40.0%
! CAACTAGTGGGTAATATCGT+TGG - Chr6:33052861-33052880 MsG0680032070.01.T01:intron 40.0%
! CGAAATATGCTGCTTCATCT+TGG - Chr6:33052649-33052668 MsG0680032070.01.T01:intron 40.0%
! GCACCTTATTTGAGTCATCT+TGG + Chr6:33052821-33052840 None:intergenic 40.0%
! GGAAGAAAGTGAGAGTACAT+GGG + Chr6:33057226-33057245 None:intergenic 40.0%
! GTGTGCACTCTCTTTATTTG+CGG + Chr6:33056662-33056681 None:intergenic 40.0%
! GTGTTCTATCTAGGATTGGA+AGG - Chr6:33058010-33058029 MsG0680032070.01.T01:CDS 40.0%
! GTTGATTCCGAGAAACATGA+TGG + Chr6:33057880-33057899 None:intergenic 40.0%
! GTTGGTCTACCATAGACATT+TGG - Chr6:33055363-33055382 MsG0680032070.01.T01:intron 40.0%
! TGGAAGAAAGTGAGAGTACA+TGG + Chr6:33057227-33057246 None:intergenic 40.0%
!! AAGGAAGGAGTGTTCTATCT+AGG - Chr6:33058001-33058020 MsG0680032070.01.T01:CDS 40.0%
!! AGGAGTGTTCTATCTAGGAT+TGG - Chr6:33058006-33058025 MsG0680032070.01.T01:CDS 40.0%
AATGCGCTCAAGGCTTAATC+AGG + Chr6:33054361-33054380 None:intergenic 45.0%
ACGGAAAAGACACCTGCTTT+AGG - Chr6:33057082-33057101 MsG0680032070.01.T01:CDS 45.0%
ACTAGAATAACCGTGTTGCG+CGG + Chr6:33055615-33055634 None:intergenic 45.0%
ACTCACCCATTGAATGCATC+AGG + Chr6:33056842-33056861 None:intergenic 45.0%
AGATTTGCACGCAACAACAC+AGG - Chr6:33057179-33057198 MsG0680032070.01.T01:CDS 45.0%
ATCTCTCTCCAAGTTTGGCA+AGG + Chr6:33052797-33052816 None:intergenic 45.0%
CAACGTGAACAACAATGGCA+TGG - Chr6:33058039-33058058 MsG0680032070.01.T01:CDS 45.0%
CACCATTAACTGAGGAACCA+TGG - Chr6:33057921-33057940 MsG0680032070.01.T01:CDS 45.0%
CACCTCAAAGTTATTGCAGC+TGG - Chr6:33056519-33056538 MsG0680032070.01.T01:intron 45.0%
CCATTGAATGCATCAGGTAG+AGG + Chr6:33056836-33056855 None:intergenic 45.0%
CCATTTATGCAATGCGCTCA+AGG + Chr6:33054371-33054390 None:intergenic 45.0%
CCTCTACCTGATGCATTCAA+TGG - Chr6:33056833-33056852 MsG0680032070.01.T01:intron 45.0%
CCTTGAGCGCATTGCATAAA+TGG - Chr6:33054368-33054387 MsG0680032070.01.T01:intron 45.0%
CGGAAAAGACACCTGCTTTA+GGG - Chr6:33057083-33057102 MsG0680032070.01.T01:CDS 45.0%
CTCCAGCTGCAATAACTTTG+AGG + Chr6:33056524-33056543 None:intergenic 45.0%
GAAATCATGGGAGGAAAGCA+TGG - Chr6:33058212-33058231 MsG0680032070.01.T01:CDS 45.0%
GAACTCTTTCGCGCAATTGA+AGG - Chr6:33052597-33052616 MsG0680032070.01.T01:CDS 45.0%
GAAGAAACAGCGGAGAAAGA+AGG - Chr6:33058100-33058119 MsG0680032070.01.T01:CDS 45.0%
GAGAAACTCTCACACAAGTG+GGG - Chr6:33053603-33053622 MsG0680032070.01.T01:intron 45.0%
GAGAGAAACTCTCACACAAG+TGG - Chr6:33053601-33053620 MsG0680032070.01.T01:intron 45.0%
GTGAAATTGAAGCGTGTGTC+TGG + Chr6:33053248-33053267 None:intergenic 45.0%
TCTCTCTCCAAGTTTGGCAA+GGG + Chr6:33052796-33052815 None:intergenic 45.0%
TGGTTCCTCAGTTAATGGTG+AGG + Chr6:33057921-33057940 None:intergenic 45.0%
TTGGTAGGGACATCTCTCAA+AGG - Chr6:33056255-33056274 MsG0680032070.01.T01:intron 45.0%
! AGGAGGTGTGGCTGAAAAAT+AGG + Chr6:33054802-33054821 None:intergenic 45.0%
! AGTGGGTAATATCGTTGGCT+GGG - Chr6:33052866-33052885 MsG0680032070.01.T01:intron 45.0%
! CCGAGAAACATGATGGAATG+AGG + Chr6:33057873-33057892 None:intergenic 45.0%
! GACGTGTTTGTGAGCTTTAG+AGG - Chr6:33053221-33053240 MsG0680032070.01.T01:intron 45.0%
! GCAGTAGGAAAAAGCCTTGT+CGG - Chr6:33055919-33055938 MsG0680032070.01.T01:intron 45.0%
! TAGTGGGTAATATCGTTGGC+TGG - Chr6:33052865-33052884 MsG0680032070.01.T01:intron 45.0%
! TCTGAGGTGCAAAAGCAAAG+TGG - Chr6:33053515-33053534 MsG0680032070.01.T01:intron 45.0%
! TCTGAGGTGCGAAAGCAAAA+TGG - Chr6:33052756-33052775 MsG0680032070.01.T01:intron 45.0%
! TTTGGTGCGCTACAAAGAAG+AGG - Chr6:33053278-33053297 MsG0680032070.01.T01:intron 45.0%
! TTTTGCTTTCGCACCTCAGA+AGG + Chr6:33052756-33052775 None:intergenic 45.0%
!! AACTTGGTGCTTGCGAGAAT+TGG - Chr6:33053424-33053443 MsG0680032070.01.T01:intron 45.0%
!! AGACACCTGCTTTAGGGAAA+CGG - Chr6:33057089-33057108 MsG0680032070.01.T01:CDS 45.0%
!! CTTTGCTTTTGCACCTCAGA+AGG + Chr6:33053515-33053534 None:intergenic 45.0%
!!! ACAGTGGACTATTTTTGCCG+TGG + Chr6:33055954-33055973 None:intergenic 45.0%
!!! CAGTGGACTATTTTTGCCGT+GGG + Chr6:33055953-33055972 None:intergenic 45.0%
!! TAGATTAAAATAATTAATAT+GGG - Chr6:33055327-33055346 MsG0680032070.01.T01:intron 5.0%
!! TTAGATTAAAATAATTAATA+TGG - Chr6:33055326-33055345 MsG0680032070.01.T01:intron 5.0%
ACGACTTATCAAGGGCCTCA+GGG - Chr6:33055897-33055916 MsG0680032070.01.T01:intron 50.0%
AGCCACACCTCCTTGAATTG+TGG - Chr6:33054809-33054828 MsG0680032070.01.T01:CDS 50.0%
ATTCTAGCGTCGCCTCTGTT+TGG + Chr6:33058075-33058094 None:intergenic 50.0%
CCTTGGAGATGTCACTAGAG+CGG + Chr6:33052433-33052452 None:intergenic 50.0%
GACGTGTTTGTGAGCTTCAG+AGG - Chr6:33052468-33052487 MsG0680032070.01.T01:CDS 50.0%
GAGGTGCAAAAGCAAAGTGG+TGG - Chr6:33053518-33053537 MsG0680032070.01.T01:intron 50.0%
GAGGTGCGAAAGCAAAATGG+TGG - Chr6:33052759-33052778 MsG0680032070.01.T01:intron 50.0%
GCTGAAGCCCTATCCAAACA+TGG - Chr6:33053545-33053564 MsG0680032070.01.T01:intron 50.0%
GGATTGCGACATCCAAACAG+AGG - Chr6:33058060-33058079 MsG0680032070.01.T01:CDS 50.0%
GGGGAAAGTGATCTTCACAC+TGG - Chr6:33057110-33057129 MsG0680032070.01.T01:CDS 50.0%
GGTGAATCCCTTGCCAAACT+TGG - Chr6:33052786-33052805 MsG0680032070.01.T01:intron 50.0%
GTTACGCATGGCCAAGTCTT+TGG - Chr6:33056071-33056090 MsG0680032070.01.T01:intron 50.0%
TGAGGCCCTTGATAAGTCGT+GGG + Chr6:33055897-33055916 None:intergenic 50.0%
TGCCACAATTCAAGGAGGTG+TGG + Chr6:33054814-33054833 None:intergenic 50.0%
TTTACCCATCGCTAAGCCCT+CGG - Chr6:33056120-33056139 MsG0680032070.01.T01:intron 50.0%
TTTCCCCGTTTCCCTAAAGC+AGG + Chr6:33057097-33057116 None:intergenic 50.0%
! ATCATGGGAGGAAAGCATGG+AGG - Chr6:33058215-33058234 MsG0680032070.01.T01:CDS 50.0%
!! ACACCTGCTTTAGGGAAACG+GGG - Chr6:33057091-33057110 MsG0680032070.01.T01:CDS 50.0%
!! GACACCTGCTTTAGGGAAAC+GGG - Chr6:33057090-33057109 MsG0680032070.01.T01:CDS 50.0%
!! TTTTCAAGCTCCGCGTGTTG+TGG + Chr6:33053128-33053147 None:intergenic 50.0%
AACTTGCAGGCCACAACACG+CGG - Chr6:33053115-33053134 MsG0680032070.01.T01:intron 55.0%
ATAACCTCGTCCGCGCAACA+CGG - Chr6:33055602-33055621 MsG0680032070.01.T01:intron 55.0%
CACGACTTATCAAGGGCCTC+AGG - Chr6:33055896-33055915 MsG0680032070.01.T01:intron 55.0%
CCGCTCTAGTGACATCTCCA+AGG - Chr6:33052430-33052449 MsG0680032070.01.T01:CDS 55.0%
CTGAGGCCCTTGATAAGTCG+TGG + Chr6:33055898-33055917 None:intergenic 55.0%
CTTGTCGGAAACGTCACCCA+CGG - Chr6:33055934-33055953 MsG0680032070.01.T01:intron 55.0%
GTTACCGAGGGCTTAGCGAT+GGG + Chr6:33056127-33056146 None:intergenic 55.0%
TCGCGCAATTGAAGGCTCTC+AGG - Chr6:33052605-33052624 MsG0680032070.01.T01:CDS 55.0%
TGTTACCGAGGGCTTAGCGA+TGG + Chr6:33056128-33056147 None:intergenic 55.0%
!! GGCTTTTTCCTACTGCCCTG+AGG + Chr6:33055915-33055934 None:intergenic 55.0%
AGCGGAAGAGCTGCTACTGC+TGG + Chr6:33052415-33052434 None:intergenic 60.0%
ATAACCGTGTTGCGCGGACG+AGG + Chr6:33055609-33055628 None:intergenic 60.0%
ATCAAGGGCCTCAGGGCAGT+AGG - Chr6:33055904-33055923 MsG0680032070.01.T01:intron 60.0%
CGTGGGTGACGTTTCCGACA+AGG + Chr6:33055936-33055955 None:intergenic 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
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Gene Sequence

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Protein sequence

>MsG0680032070.01.T01

MASSSSSSALVTSPRRKNDYDVFVSFRGRDTRNNFTAHLYGALQRKRIVTFRDELQKGESVVSELFRAIEGSQVFIVVFSPKYAASSWCLQELAYIFNCSVLYGKRVLPVFYDVDPSEVRKQNGGYGESLAKLGERYQDDSNKVQRWRESLQLVGNIVGWDLCHKPQHAELENIIEHISILGCKFPSRTKDLVEINYDVFVSFRGPDTRFNFTDHLFGALQRRGINAFRDDTKLKKGEFIEPGLFNAIEASQVYIVVFSKNYASSTWCLRELEYILHCSQKHGKRVLPVFYDVDPSEVQKQSGGYAEALSKHGFEHDSNTVQGWRETLTQVGNIPSLNLRHKSQYEEIQKIIEEIINIKRNKHKKYLHSFRAKSRLYVLKAVGLEGSFNVNNNGMDCDIQTEATLEFDEETAEKEGHVTKLTSSATQYNATSRTTQTEEHMNIIGGNHGRKAWRRRDSN*