AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680034372.01

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MsG0680034372.01.T01 AT1G33720 37.008 381 219 9 194 563 2 372 2.56e-74 241
MsG0680034372.01.T01 AT2G25160 31.384 513 306 15 73 559 13 505 8.92e-74 244
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MsG0680034372.01.T01 AT1G33730 36.800 375 210 10 201 561 5 366 1.08e-72 237
MsG0680034372.01.T01 AT3G20090 31.839 446 283 8 113 549 58 491 1.63e-72 241
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MsG0680034372.01.T01 AT1G01190 32.359 479 277 16 101 560 80 530 4.51e-71 238
MsG0680034372.01.T01 AT3G20120 32.415 472 288 13 110 561 52 512 1.54e-70 236
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MsG0680034372.01.T01 AT3G20960 32.110 436 275 8 124 550 67 490 5.56e-69 232
MsG0680034372.01.T01 AT3G61880 30.453 486 302 12 92 561 59 524 9.85e-69 231
MsG0680034372.01.T01 AT3G20130 32.494 437 245 10 110 534 53 451 3.82e-68 229
MsG0680034372.01.T01 AT3G61880 30.453 486 302 12 92 561 59 524 3.91e-68 230
MsG0680034372.01.T01 AT1G66540 33.838 396 224 12 187 568 6 377 5.08e-68 225
MsG0680034372.01.T01 AT1G13080 33.333 363 225 7 214 566 28 383 9.73e-68 224
MsG0680034372.01.T01 AT5G05260 31.793 541 305 16 69 567 4 522 1.12e-67 228
MsG0680034372.01.T01 AT5G42580 32.311 424 260 8 119 534 60 464 1.41e-67 228
MsG0680034372.01.T01 AT1G28430 32.075 477 286 13 110 567 51 508 4.73e-67 226
MsG0680034372.01.T01 AT5G09970 31.395 516 315 19 68 564 38 533 1.79e-66 226
MsG0680034372.01.T01 AT4G13310 34.444 360 222 5 100 453 33 384 2.35e-66 221
MsG0680034372.01.T01 AT1G74110 28.320 512 314 15 78 560 43 530 5.35e-65 221
MsG0680034372.01.T01 AT3G20080 32.340 470 292 10 100 554 43 501 1.79e-64 220
MsG0680034372.01.T01 AT3G20080 32.340 470 292 10 100 554 43 501 1.79e-64 220
MsG0680034372.01.T01 AT2G27000 32.456 456 279 12 113 553 54 495 5.46e-64 218
MsG0680034372.01.T01 AT1G13710 29.709 515 313 18 66 559 19 505 6.82e-64 218
MsG0680034372.01.T01 AT5G05260 31.461 534 284 16 69 567 4 490 6.99e-64 218
MsG0680034372.01.T01 AT1G79370 28.458 506 317 12 97 567 38 533 1.41e-63 218
MsG0680034372.01.T01 AT4G39950 29.652 489 310 12 100 567 57 532 3.09e-62 214
MsG0680034372.01.T01 AT2G45580 32.967 364 223 9 214 566 1 354 4.26e-62 209
MsG0680034372.01.T01 AT4G39950 29.652 489 310 12 100 567 97 572 6.42e-62 214
MsG0680034372.01.T01 AT3G26180 38.806 268 157 5 298 564 104 365 1.04e-61 208
MsG0680034372.01.T01 AT3G26180 50.526 95 46 1 75 168 5 99 1.20e-18 88.6
MsG0680034372.01.T01 AT1G58260 26.718 524 340 12 73 567 12 520 1.31e-61 212
MsG0680034372.01.T01 AT2G05180 34.824 425 253 10 73 485 13 425 4.14e-61 209
MsG0680034372.01.T01 AT2G30490 32.237 456 277 12 110 548 44 484 5.71e-61 210
MsG0680034372.01.T01 AT1G66540 37.785 307 164 9 265 568 36 318 1.37e-60 204
MsG0680034372.01.T01 AT4G15330 30.818 477 271 12 101 563 40 471 1.49e-60 208
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MsG0680034372.01.T01 AT2G22330 27.969 522 345 10 63 567 50 557 6.44e-60 209
MsG0680034372.01.T01 AT4G20240 34.254 362 221 6 98 453 32 382 2.81e-59 202
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MsG0680034372.01.T01 AT3G20120 32.041 387 233 12 194 561 1 376 3.29e-53 186
MsG0680034372.01.T01 AT1G16400 26.960 523 326 15 62 546 8 512 3.64e-52 187
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MsG0680034372.01.T01 AT3G20080 30.667 375 235 9 194 554 1 364 3.33e-46 167
MsG0680034372.01.T01 AT3G03470 27.165 508 326 15 72 551 2 493 4.29e-45 167
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MsG0680034372.01.T01 AT2G45560 33.617 235 143 5 72 294 7 240 3.86e-35 132
MsG0680034372.01.T01 AT3G53305 43.421 152 76 2 413 564 184 325 6.29e-34 132
MsG0680034372.01.T01 AT3G53305 28.485 165 109 2 134 289 1 165 8.35e-14 73.2
MsG0680034372.01.T01 AT1G31800 25.532 423 297 11 123 537 132 544 5.11e-28 119
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MsG0680034372.01.T01 AT4G20235 33.088 136 80 1 399 534 206 330 1.05e-16 82.0
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MsG0680034372.01.T01 AT3G14610 25.180 417 278 11 130 534 91 485 6.28e-23 102
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MsG0680034372.01.T01 AT2G29090 25.000 464 285 15 90 534 37 456 1.57e-22 101
MsG0680034372.01.T01 AT3G14630 25.837 418 273 12 130 534 88 481 2.49e-22 100
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MsG0680034372.01.T01 AT3G14660 23.716 409 277 13 138 534 100 485 3.32e-18 88.2
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MsG0680034372.01.T01 AT2G27690 23.168 423 281 13 129 530 61 460 6.44e-18 87.4
MsG0680034372.01.T01 AT1G19630 27.316 421 221 19 100 486 36 405 1.02e-17 86.3
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MsG0680034372.01.T01 AT4G39500 23.441 401 268 13 169 540 55 445 1.15e-17 86.3
MsG0680034372.01.T01 AT3G19270 24.524 473 310 17 67 532 6 438 3.06e-17 84.7
MsG0680034372.01.T01 AT4G39510 22.581 465 319 16 108 541 31 485 3.60e-17 85.1
MsG0680034372.01.T01 AT2G26170 27.236 246 160 7 299 535 181 416 4.81e-17 84.3
MsG0680034372.01.T01 AT1G55940 23.711 485 316 19 73 536 18 469 4.98e-17 84.7
MsG0680034372.01.T01 AT5G24900 21.480 419 304 12 128 534 95 500 5.84e-17 84.3
MsG0680034372.01.T01 AT1G01600 23.779 471 294 16 102 527 29 479 6.58e-17 84.3
MsG0680034372.01.T01 AT2G23180 22.266 256 190 3 295 541 237 492 1.03e-16 83.6
MsG0680034372.01.T01 AT1G57750 27.000 200 139 2 295 494 236 428 1.14e-16 83.2
MsG0680034372.01.T01 AT5G24900 25.751 233 160 6 306 534 160 383 1.42e-16 82.4
MsG0680034372.01.T01 AT5G02900 25.134 187 136 2 355 537 268 454 1.60e-16 82.8
MsG0680034372.01.T01 AT2G21910 23.529 255 184 5 295 541 235 486 2.89e-16 82.4
MsG0680034372.01.T01 AT4G27710 21.942 515 330 16 66 534 2 490 4.29e-16 81.6
MsG0680034372.01.T01 AT3G14660 24.671 304 211 8 236 534 49 339 5.45e-16 80.5
MsG0680034372.01.T01 AT3G26125 25.301 249 162 5 301 527 252 498 5.56e-16 81.6
MsG0680034372.01.T01 AT4G39490 22.727 264 184 5 295 541 236 496 6.58e-16 81.3
MsG0680034372.01.T01 AT5G23190 20.198 505 344 13 68 537 36 516 2.44e-15 79.3
MsG0680034372.01.T01 AT1G13150 26.131 199 129 3 344 527 288 483 4.54e-15 78.6
MsG0680034372.01.T01 AT1G47620 22.835 254 187 4 295 541 244 495 4.80e-15 78.6
MsG0680034372.01.T01 AT1G13140 24.696 247 157 5 298 527 256 490 4.85e-15 78.6
MsG0680034372.01.T01 AT2G45970 22.587 487 322 16 79 527 7 476 5.67e-15 78.2
MsG0680034372.01.T01 AT4G32170 22.088 249 190 4 295 540 235 482 1.24e-14 77.0
MsG0680034372.01.T01 AT4G39480 23.047 256 182 5 295 537 236 489 1.32e-14 77.0
MsG0680034372.01.T01 AT1G69500 20.276 508 340 13 76 534 5 496 2.02e-14 76.6
MsG0680034372.01.T01 AT1G73340 23.567 471 310 20 75 532 20 453 2.07e-14 76.3
MsG0680034372.01.T01 AT1G13140 26.131 199 129 3 344 527 269 464 2.63e-14 76.3
MsG0680034372.01.T01 AT3G14640 22.626 358 251 9 188 534 145 487 3.94e-14 75.5
MsG0680034372.01.T01 AT3G14640 22.626 358 251 9 188 534 167 509 4.83e-14 75.5
MsG0680034372.01.T01 AT3G01900 20.935 492 328 12 103 561 32 495 4.89e-14 75.1
MsG0680034372.01.T01 AT1G11680 19.958 476 335 15 74 534 14 458 5.85e-14 75.1
MsG0680034372.01.T01 AT5G38450 22.718 471 299 15 102 534 46 489 7.24e-14 74.7
MsG0680034372.01.T01 AT2G46960 22.706 436 286 16 118 532 82 487 7.93e-14 74.7
MsG0680034372.01.T01 AT1G75130 23.059 438 306 12 104 534 63 476 7.99e-14 74.7
MsG0680034372.01.T01 AT5G08250 20.543 258 181 4 295 536 202 451 1.78e-13 73.6
MsG0680034372.01.T01 AT3G61035 29.412 272 161 12 108 368 51 302 1.78e-13 72.0
MsG0680034372.01.T01 AT5G08250 20.543 258 181 4 295 536 264 513 1.84e-13 73.6
MsG0680034372.01.T01 AT2G46950 26.047 215 146 4 324 534 338 543 3.82e-13 72.8
MsG0680034372.01.T01 AT1G67110 23.109 476 298 16 97 536 42 485 8.06e-13 71.2
MsG0680034372.01.T01 AT2G46960 24.790 238 162 5 299 532 147 371 1.93e-12 69.7
MsG0680034372.01.T01 AT1G78490 22.737 453 299 18 98 534 34 451 1.04e-11 67.8
MsG0680034372.01.T01 AT5G58860 22.872 188 132 2 353 527 287 474 2.55e-11 66.6
MsG0680034372.01.T01 AT3G44970 24.742 194 137 4 346 534 262 451 8.29e-11 65.1

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TCCTAACTTCAAGGACATTA+TGG 0.160597 6:+86482224 None:intergenic
GGGCTACCCGGCACTGTTAC+TGG 0.172555 6:+86484364 None:intergenic
GATGATAGATTCAACATAAA+TGG 0.183922 6:-86481841 MsG0680034372.01.T01:CDS
CCAATTATTGGCAATGGTTT+TGG 0.201319 6:+86482312 None:intergenic
CCAAAACCATTGCCAATAAT+TGG 0.239588 6:-86482312 MsG0680034372.01.T01:CDS
CTCCCAGTACGGTGTGGTTC+GGG 0.243086 6:-86484434 MsG0680034372.01.T01:CDS
ATGTGAAGGTTACCAATTAT+TGG 0.259906 6:+86482300 None:intergenic
GTCTATTATAATAGCCTTGA+TGG 0.266383 6:+86480057 None:intergenic
GCTAGCCCCATTTGATCTTC+AGG 0.269187 6:-86481758 MsG0680034372.01.T01:intron
TGAAGTCTCTTCATTGTCTT+AGG 0.277227 6:+86479965 None:intergenic
TATTGGTCATAAAATGATAA+TGG 0.283462 6:-86481875 MsG0680034372.01.T01:CDS
AATATAACAAAGATCAATTC+AGG 0.288450 6:+86482408 None:intergenic
AACTACTGTGAAGTTTGTTC+TGG 0.294835 6:-86479582 MsG0680034372.01.T01:CDS
TTCACAACCATGGTCAAATA+AGG 0.306107 6:+86479878 None:intergenic
TTAATAAATGCATGGACAAT+AGG 0.308192 6:-86479752 MsG0680034372.01.T01:CDS
CTTCTTGGGATTCCATTTGT+TGG 0.315755 6:+86480104 None:intergenic
ATTGGTAACCTTCACATGAT+AGG 0.321640 6:-86482294 MsG0680034372.01.T01:CDS
AACTCGTGCACTGCTTCAAT+TGG 0.335158 6:-86479556 MsG0680034372.01.T01:CDS
CCTAACTTCAAGGACATTAT+GGG 0.348504 6:+86482225 None:intergenic
AGAATAGATAGAAATGGTTT+TGG 0.352682 6:+86482468 None:intergenic
GGCCTAACTTTCACCGAGTA+TGG 0.361254 6:-86482078 MsG0680034372.01.T01:CDS
CCTATCGTCTCTTTGCTTAG+TGG 0.363517 6:-86479439 None:intergenic
TCTCCCAGTACGGTGTGGTT+CGG 0.364814 6:-86484435 MsG0680034372.01.T01:CDS
GTTGATCTTATAGAGAATAT+TGG 0.367191 6:-86481892 MsG0680034372.01.T01:CDS
TAACATACCTGAAGATCAAA+TGG 0.390291 6:+86481751 None:intergenic
GTTAAACCCATCCGCATTCC+AGG 0.398251 6:+86479602 None:intergenic
ATGCTTACCGGGAAACTTCC+CGG 0.415902 6:+86484562 None:intergenic
ATTGGTCATAAAATGATAAT+GGG 0.416828 6:-86481874 MsG0680034372.01.T01:CDS
TTGGACTTGTCCTAACTTCA+AGG 0.419680 6:+86482215 None:intergenic
GTTTCAGATTATGTCACATA+TGG 0.425874 6:-86482108 MsG0680034372.01.T01:CDS
GGTGCTAACAAAGGTCCAAC+AGG 0.427036 6:+86479836 None:intergenic
TGACCTACCGGGAAGTTTCC+CGG 0.433832 6:-86484569 MsG0680034372.01.T01:intron
GGGATGAACCAGGCGGAAGC+TGG 0.435293 6:-86484413 MsG0680034372.01.T01:CDS
CCTTTGAGAAAGGAAGAGTT+GGG 0.436448 6:-86481982 MsG0680034372.01.T01:CDS
CCCATAATGTCCTTGAAGTT+AGG 0.438193 6:-86482225 MsG0680034372.01.T01:CDS
TGAAAGAGAATAGATAGAAA+TGG 0.438271 6:+86482462 None:intergenic
ATGATAGATTCAACATAAAT+GGG 0.439436 6:-86481840 MsG0680034372.01.T01:CDS
TCACCGAGTATGGTGACAAT+TGG 0.441727 6:-86482068 MsG0680034372.01.T01:CDS
GGCTACCCGGCACTGTTACT+GGG 0.446813 6:+86484365 None:intergenic
ATCTAGCTGACTTCGTGCCT+TGG 0.447737 6:-86481780 MsG0680034372.01.T01:CDS
CTGTTACTGGGCCACGTTGT+GGG 0.452000 6:+86484377 None:intergenic
ATCACTTATGAACCAACAAA+TGG 0.452006 6:-86480116 MsG0680034372.01.T01:CDS
TTACTATCTTCAAATCTCTC+TGG 0.455915 6:+86479686 None:intergenic
CACCATACTCGGTGAAAGTT+AGG 0.457742 6:+86482076 None:intergenic
CTTCAAGATGTTGTTGTGGA+TGG 0.462683 6:-86479803 MsG0680034372.01.T01:CDS
ATCCCCGAACCACACCGTAC+TGG 0.463846 6:+86484431 None:intergenic
TACTAGGATGGGTGACCTAC+CGG 0.465420 6:-86484581 None:intergenic
TAATAAATGCATGGACAATA+GGG 0.469785 6:-86479751 MsG0680034372.01.T01:CDS
GTGACAATTGGCGCAATATG+AGG 0.470749 6:-86482056 MsG0680034372.01.T01:CDS
TCCTTTGAGAAAGGAAGAGT+TGG 0.476606 6:-86481983 MsG0680034372.01.T01:CDS
TCCAACAGGGTACAACCTTA+AGG 0.477014 6:+86479850 None:intergenic
CAGACATGTCTAACTCATCA+AGG 0.479781 6:+86479513 None:intergenic
ATGAACCAGGCGGAAGCTGG+TGG 0.483173 6:-86484410 MsG0680034372.01.T01:CDS
ACCTTAAGGTTGTACCCTGT+TGG 0.485457 6:-86479851 MsG0680034372.01.T01:CDS
TCTCTTTGTTCTCCAATCGA+TGG 0.486722 6:+86480169 None:intergenic
TGTTGATGTCCACAAGGTTG+TGG 0.487203 6:-86481914 MsG0680034372.01.T01:CDS
TGGTTGTGAAAGAGACCTTA+AGG 0.489637 6:-86479865 MsG0680034372.01.T01:CDS
TTGGTAACCTTCACATGATA+GGG 0.492605 6:-86482293 MsG0680034372.01.T01:CDS
GTGTGGTTCGGGGATGAACC+AGG 0.496013 6:-86484423 MsG0680034372.01.T01:CDS
CATGCCCACCAGCTTCCGCC+TGG 0.497308 6:+86484405 None:intergenic
GATGTTTGCTCCTTTGAGAA+AGG 0.499244 6:-86481992 MsG0680034372.01.T01:CDS
AACATACCTGAAGATCAAAT+GGG 0.501775 6:+86481752 None:intergenic
TCCCCGAACCACACCGTACT+GGG 0.504311 6:+86484432 None:intergenic
ACTCGTGCACTGCTTCAATT+GGG 0.504340 6:-86479555 MsG0680034372.01.T01:CDS
TCAGGGATAGCTAATATTTG+AGG 0.507427 6:+86482426 None:intergenic
TAGGGAGAGATACTAAGGTT+TGG 0.508555 6:-86479733 MsG0680034372.01.T01:CDS
GTGATGAAACCACAATGGTT+TGG 0.508876 6:+86482196 None:intergenic
AAACACTATCATGGGTCTTG+AGG 0.509745 6:+86482154 None:intergenic
GACAATAGGGAGAGATACTA+AGG 0.510140 6:-86479738 MsG0680034372.01.T01:CDS
AAAATGTGGTTGGAATGAAT+AGG 0.520013 6:-86479931 MsG0680034372.01.T01:CDS
GAAGGAGTTTGACGAACTGT+TGG 0.520629 6:-86480218 MsG0680034372.01.T01:CDS
TCATCAAGGGACATACCATC+TGG 0.522922 6:+86479527 None:intergenic
TCAGGTCGAAGAGGTTGTCC+TGG 0.524331 6:-86479620 MsG0680034372.01.T01:CDS
AGGAATAGTTCAGCAGTTTG+AGG 0.525639 6:+86482174 None:intergenic
CCTCTTCGACCTGAACCAAA+TGG 0.527626 6:+86479629 None:intergenic
AGGTTACCAATTATTGGCAA+TGG 0.527655 6:+86482306 None:intergenic
TGAATCTATCATCCTTGCTC+CGG 0.530900 6:+86481851 None:intergenic
GCGCCAATTGTCACCATACT+CGG 0.536063 6:+86482065 None:intergenic
ATGTTGTGCTTGATGGAGAA+TGG 0.539384 6:+86482492 None:intergenic
ATCTATAGCTGTAATTGAGT+GGG 0.540205 6:-86480011 MsG0680034372.01.T01:CDS
GATAGTAATATAGACCTTCG+TGG 0.541542 6:-86479671 MsG0680034372.01.T01:CDS
CCCAACTCTTCCTTTCTCAA+AGG 0.542485 6:+86481982 None:intergenic
AAGATCAAAGAAAACAATGA+AGG 0.547334 6:-86480236 MsG0680034372.01.T01:CDS
GAGCGCGAGAATCCATCGAT+TGG 0.548585 6:-86480181 MsG0680034372.01.T01:CDS
GTCATAAAATGATAATGGGC+CGG 0.553047 6:-86481870 MsG0680034372.01.T01:CDS
CGTGGCCCAGTAACAGTGCC+GGG 0.556348 6:-86484370 MsG0680034372.01.T01:intron
ACGTGGCCCAGTAACAGTGC+CGG 0.557318 6:-86484371 MsG0680034372.01.T01:CDS
TGAACCAGGCGGAAGCTGGT+GGG 0.559964 6:-86484409 MsG0680034372.01.T01:CDS
AATGATAATGGGCCGGAGCA+AGG 0.560566 6:-86481863 MsG0680034372.01.T01:CDS
TGAAGCATGCAATAATTGCA+TGG 0.562058 6:+86482023 None:intergenic
CATCTATAGCTGTAATTGAG+TGG 0.562484 6:-86480012 MsG0680034372.01.T01:CDS
GAACCACACCGTACTGGGAG+AGG 0.563212 6:+86484437 None:intergenic
AGGTTGTCCTGGAATGCGGA+TGG 0.563988 6:-86479609 MsG0680034372.01.T01:CDS
GATGAGCTCGAAAATGTGGT+TGG 0.564967 6:-86479941 MsG0680034372.01.T01:CDS
ATAGGTTGGCACAGATAGCA+AGG 0.567708 6:+86479457 None:intergenic
ACTGTTACTGGGCCACGTTG+TGG 0.570208 6:+86484376 None:intergenic
TCCCAGTACGGTGTGGTTCG+GGG 0.575759 6:-86484433 MsG0680034372.01.T01:CDS
ATATAACAAAGATCAATTCA+GGG 0.583428 6:+86482409 None:intergenic
CATTGATAGAACAACCATCA+AGG 0.583983 6:-86480071 MsG0680034372.01.T01:CDS
TTATGTCACATATGGTAGCA+AGG 0.586238 6:-86482100 MsG0680034372.01.T01:CDS
ACTAGGATGGGTGACCTACC+GGG 0.587138 6:-86484580 None:intergenic
GGTTGTCCTGGAATGCGGAT+GGG 0.588101 6:-86479608 MsG0680034372.01.T01:CDS
GCAAGTTGAAGAGACCGACT+TGG 0.589764 6:-86479909 MsG0680034372.01.T01:CDS
TTCAATTGGGAGCTTCCAGA+TGG 0.593558 6:-86479542 MsG0680034372.01.T01:CDS
TATGTCACATATGGTAGCAA+GGG 0.593901 6:-86482099 MsG0680034372.01.T01:CDS
AAATTTGCCTTATTTGACCA+TGG 0.594164 6:-86479885 MsG0680034372.01.T01:CDS
CCATTTGGTTCAGGTCGAAG+AGG 0.601629 6:-86479629 MsG0680034372.01.T01:CDS
TCAAGATGAGCTCGAAAATG+TGG 0.602879 6:-86479945 MsG0680034372.01.T01:CDS
GAAGTTTCCCTATCATGTGA+AGG 0.603860 6:+86482286 None:intergenic
AGAGCAGACCTCTCCCAGTA+CGG 0.611198 6:-86484445 MsG0680034372.01.T01:CDS
AGGGATTGAAGGGAACGATG+TGG 0.619752 6:+86482264 None:intergenic
TAAGATCAACCACAACCTTG+TGG 0.621762 6:+86481905 None:intergenic
AGGACAAGTCCAAACCATTG+TGG 0.622465 6:-86482205 MsG0680034372.01.T01:CDS
AGATCAAATGGGGCTAGCCA+AGG 0.625734 6:+86481763 None:intergenic
TAAGCAAAGAGACGATAGGT+TGG 0.625992 6:+86479443 None:intergenic
CTTTGAGAAAGGAAGAGTTG+GGG 0.626053 6:-86481981 MsG0680034372.01.T01:CDS
TAAGGTCTCTTTCACAACCA+TGG 0.627760 6:+86479868 None:intergenic
CACTCATGAGGTGCTAACAA+AGG 0.634895 6:+86479827 None:intergenic
GAAGAGGTTGTCCTGGAATG+CGG 0.635659 6:-86479613 MsG0680034372.01.T01:CDS
CCACTAAGCAAAGAGACGAT+AGG 0.636138 6:+86479439 None:intergenic
GTGTCTTCAAGATGTTGTTG+TGG 0.639348 6:-86479807 MsG0680034372.01.T01:CDS
AGACATGTCTAACTCATCAA+GGG 0.642874 6:+86479514 None:intergenic
GAAATCATCTACATTACATG+AGG 0.650917 6:-86481938 MsG0680034372.01.T01:CDS
TTACCGGGAAACTTCCCGGT+AGG 0.653286 6:+86484566 None:intergenic
TTGAGGTGATGAAACCACAA+TGG 0.654905 6:+86482191 None:intergenic
AGACCTCTCCCAGTACGGTG+TGG 0.674891 6:-86484440 MsG0680034372.01.T01:CDS
ATTGGAGAACAAAGAGACCA+CGG 0.680485 6:-86480163 MsG0680034372.01.T01:CDS
TAGGTTGGCACAGATAGCAA+GGG 0.680764 6:+86479458 None:intergenic
GTTGAAAATCATGTCCACGA+AGG 0.681501 6:+86479657 None:intergenic
ACATCTTGAAGACACTCATG+AGG 0.693468 6:+86479815 None:intergenic
ACATACCTGAAGATCAAATG+GGG 0.696368 6:+86481753 None:intergenic
TGGTTCGGGGATGAACCAGG+CGG 0.696698 6:-86484420 MsG0680034372.01.T01:CDS
GGCATGTAACACCCACAACG+TGG 0.703766 6:-86484388 MsG0680034372.01.T01:CDS
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CRISPR-GE

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TGCAAATGACAAACCTAACT+TGG - Chr6:86481030-86481049 MsG0680034372.01.T01:intron 35.0%
TGGACTTAATTAACTGCAGA+AGG + Chr6:86483139-86483158 None:intergenic 35.0%
TTATGTCACATATGGTAGCA+AGG - Chr6:86481916-86481935 MsG0680034372.01.T01:CDS 35.0%
TTATTGTGTACCTAAACCAC+TGG - Chr6:86482714-86482733 MsG0680034372.01.T01:intron 35.0%
TTCACAACCATGGTCAAATA+AGG + Chr6:86484141-86484160 None:intergenic 35.0%
TTCTGCAGTTAATTAAGTCC+AGG - Chr6:86483138-86483157 MsG0680034372.01.T01:intron 35.0%
TTTGTTTCGACAGCAATACA+TGG - Chr6:86481412-86481431 MsG0680034372.01.T01:intron 35.0%
! AACTACTGTGAAGTTTGTTC+TGG - Chr6:86484434-86484453 MsG0680034372.01.T01:CDS 35.0%
! ACAAGATGCATCTTCTTTTC+GGG - Chr6:86479852-86479871 MsG0680034372.01.T01:CDS 35.0%
! ACTACCCTTTTGAATTCTTC+AGG - Chr6:86480365-86480384 MsG0680034372.01.T01:intron 35.0%
! ATTGGGCACAACTTCAATTT+TGG + Chr6:86481171-86481190 None:intergenic 35.0%
! ATTGGTAACCTTCACATGAT+AGG - Chr6:86481722-86481741 MsG0680034372.01.T01:intron 35.0%
! CCAATTATTGGCAATGGTTT+TGG + Chr6:86481707-86481726 None:intergenic 35.0%
! GTTATTAAGAAAGTGTGACG+TGG - Chr6:86483248-86483267 MsG0680034372.01.T01:intron 35.0%
! TTGGTAACCTTCACATGATA+GGG - Chr6:86481723-86481742 MsG0680034372.01.T01:intron 35.0%
! TTTTGGTATGTTGTGCTTGA+TGG + Chr6:86481534-86481553 None:intergenic 35.0%
!! CAACTTTTACCATTTGGTTC+AGG - Chr6:86484378-86484397 MsG0680034372.01.T01:CDS 35.0%
!! CTTCGTTTTATTCCCTTATG+AGG + Chr6:86483763-86483782 None:intergenic 35.0%
!! GGGTCCATATTTTTGAGAAA+GGG + Chr6:86481774-86481793 None:intergenic 35.0%
!! GTCATAAAATGATAATGGGC+CGG - Chr6:86482146-86482165 MsG0680034372.01.T01:CDS 35.0%
!! TGGGTCCATATTTTTGAGAA+AGG + Chr6:86481775-86481794 None:intergenic 35.0%
!! TGGTATGTTGATTTGAGTGT+TGG - Chr6:86482875-86482894 MsG0680034372.01.T01:intron 35.0%
!!! AATTGAGAGTGTTTTCGGAT+TGG + Chr6:86482615-86482634 None:intergenic 35.0%
!!! ATTGAGAGTGTTTTCGGATT+GGG + Chr6:86482614-86482633 None:intergenic 35.0%
!!! GATAGCAAGGGTTGATTTTT+TGG + Chr6:86484549-86484568 None:intergenic 35.0%
!!! TAAGGGGTATTTTGGTCATT+TGG + Chr6:86480106-86480125 None:intergenic 35.0%
AAACACTATCATGGGTCTTG+AGG + Chr6:86481865-86481884 None:intergenic 40.0%
AAATTTGACGAAGGGTGGAA+GGG + Chr6:86483007-86483026 None:intergenic 40.0%
AAGAGGAACATGGTTATGGT+TGG + Chr6:86481300-86481319 None:intergenic 40.0%
AATGGTAGGAAAAATCCACC+GGG - Chr6:86481680-86481699 MsG0680034372.01.T01:intron 40.0%
ACATCTTGAAGACACTCATG+AGG + Chr6:86484204-86484223 None:intergenic 40.0%
AGACAAGAGGAACATGGTTA+TGG + Chr6:86481304-86481323 None:intergenic 40.0%
AGCAAAAAACAGGCTGTTAC+AGG - Chr6:86480227-86480246 MsG0680034372.01.T01:CDS 40.0%
AGGAATAGTTCAGCAGTTTG+AGG + Chr6:86481845-86481864 None:intergenic 40.0%
ATGTTGTGCTTGATGGAGAA+TGG + Chr6:86481527-86481546 None:intergenic 40.0%
ATTGGAGAACAAAGAGACCA+CGG - Chr6:86483853-86483872 MsG0680034372.01.T01:intron 40.0%
CAAAAGACTTACATCCCTGA+AGG + Chr6:86480298-86480317 None:intergenic 40.0%
CACATGATGTTTGTGAATGG+TGG - Chr6:86481118-86481137 MsG0680034372.01.T01:intron 40.0%
CAGACATGTCTAACTCATCA+AGG + Chr6:86484506-86484525 None:intergenic 40.0%
CCCATAATGTCCTTGAAGTT+AGG - Chr6:86481791-86481810 MsG0680034372.01.T01:CDS 40.0%
CTTCAAGATGTTGTTGTGGA+TGG - Chr6:86484213-86484232 MsG0680034372.01.T01:intron 40.0%
CTTCTTGGGATTCCATTTGT+TGG + Chr6:86483915-86483934 None:intergenic 40.0%
GAAGTTTCCCTATCATGTGA+AGG + Chr6:86481733-86481752 None:intergenic 40.0%
GACAATAGGGAGAGATACTA+AGG - Chr6:86484278-86484297 MsG0680034372.01.T01:intron 40.0%
GAGATAAGTACAAGGGTTTG+TGG - Chr6:86480903-86480922 MsG0680034372.01.T01:intron 40.0%
GGAAACTGAAACTTGAAGGT+TGG - Chr6:86483058-86483077 MsG0680034372.01.T01:intron 40.0%
GTCATTTGCAATTTGGATCG+AGG + Chr6:86481020-86481039 None:intergenic 40.0%
GTGATGAAACCACAATGGTT+TGG + Chr6:86481823-86481842 None:intergenic 40.0%
GTGTCTTCAAGATGTTGTTG+TGG - Chr6:86484209-86484228 MsG0680034372.01.T01:intron 40.0%
GTTGAAAATCATGTCCACGA+AGG + Chr6:86484362-86484381 None:intergenic 40.0%
TAAGATCAACCACAACCTTG+TGG + Chr6:86482114-86482133 None:intergenic 40.0%
TAAGCAAAGAGACGATAGGT+TGG + Chr6:86484576-86484595 None:intergenic 40.0%
TAAGGTCTCTTTCACAACCA+TGG + Chr6:86484151-86484170 None:intergenic 40.0%
TAGGGAGAGATACTAAGGTT+TGG - Chr6:86484283-86484302 MsG0680034372.01.T01:intron 40.0%
TATGAGGAACCGAATCACAT+CGG - Chr6:86479743-86479762 MsG0680034372.01.T01:CDS 40.0%
TCAAGATGAGCTCGAAAATG+TGG - Chr6:86484071-86484090 MsG0680034372.01.T01:intron 40.0%
TCTCTTTGTTCTCCAATCGA+TGG + Chr6:86483850-86483869 None:intergenic 40.0%
TGAATCTATCATCCTTGCTC+CGG + Chr6:86482168-86482187 None:intergenic 40.0%
TGCACACTCTCTTGACTATA+GGG + Chr6:86483274-86483293 None:intergenic 40.0%
TGGTCACTCTCTCTTGTATT+GGG - Chr6:86482463-86482482 MsG0680034372.01.T01:CDS 40.0%
TGGTTGTGAAAGAGACCTTA+AGG - Chr6:86484151-86484170 MsG0680034372.01.T01:intron 40.0%
TGTATCTATGAGGCAGTGAT+TGG - Chr6:86480541-86480560 MsG0680034372.01.T01:intron 40.0%
TTCCACCCTTCGTCAAATTT+GGG - Chr6:86483007-86483026 MsG0680034372.01.T01:intron 40.0%
TTGAGGTGATGAAACCACAA+TGG + Chr6:86481828-86481847 None:intergenic 40.0%
TTGCACACTCTCTTGACTAT+AGG + Chr6:86483275-86483294 None:intergenic 40.0%
TTGGACTTGTCCTAACTTCA+AGG + Chr6:86481804-86481823 None:intergenic 40.0%
TTGGTCACTCTCTCTTGTAT+TGG - Chr6:86482462-86482481 MsG0680034372.01.T01:CDS 40.0%
TTTGGTCATTTGGCGAGTAA+GGG + Chr6:86480096-86480115 None:intergenic 40.0%
! AAAGGAAGAGTTGGGGTTTT+TGG - Chr6:86482042-86482061 MsG0680034372.01.T01:CDS 40.0%
! CCTTTGAGAAAGGAAGAGTT+GGG - Chr6:86482034-86482053 MsG0680034372.01.T01:CDS 40.0%
! CTTTGAGAAAGGAAGAGTTG+GGG - Chr6:86482035-86482054 MsG0680034372.01.T01:CDS 40.0%
! GATGTTTGCTCCTTTGAGAA+AGG - Chr6:86482024-86482043 MsG0680034372.01.T01:CDS 40.0%
! TACTGCTGCTTAACCAAGTT+AGG + Chr6:86481046-86481065 None:intergenic 40.0%
! TCCTTTGAGAAAGGAAGAGT+TGG - Chr6:86482033-86482052 MsG0680034372.01.T01:CDS 40.0%
! TTTTGGTCATTTGGCGAGTA+AGG + Chr6:86480097-86480116 None:intergenic 40.0%
!! AAAAGACTCGTGTTGGTTTG+TGG - Chr6:86479500-86479519 MsG0680034372.01.T01:CDS 40.0%
!! AAAGACTCGTGTTGGTTTGT+GGG - Chr6:86479501-86479520 MsG0680034372.01.T01:CDS 40.0%
!!! CAAGGGTTGATTTTTTGGCA+TGG + Chr6:86484544-86484563 None:intergenic 40.0%
AACTCGTGCACTGCTTCAAT+TGG - Chr6:86484460-86484479 MsG0680034372.01.T01:intron 45.0%
AAGCCAAGCACGCTTAACTA+TGG + Chr6:86479897-86479916 None:intergenic 45.0%
ACATGGTTATGGTTGGCGTA+AGG + Chr6:86481293-86481312 None:intergenic 45.0%
ACCTTAAGGTTGTACCCTGT+TGG - Chr6:86484165-86484184 MsG0680034372.01.T01:intron 45.0%
ACTCCATAGTTAAGCGTGCT+TGG - Chr6:86479891-86479910 MsG0680034372.01.T01:CDS 45.0%
ACTCGTGCACTGCTTCAATT+GGG - Chr6:86484461-86484480 MsG0680034372.01.T01:intron 45.0%
ACTGCAGAAGGAAGTTGTCT+AGG + Chr6:86483127-86483146 None:intergenic 45.0%
AGATTGCAAAGTCAGTCCAG+TGG + Chr6:86482733-86482752 None:intergenic 45.0%
AGGACAAGTCCAAACCATTG+TGG - Chr6:86481811-86481830 MsG0680034372.01.T01:CDS 45.0%
ATAGTTAAGCGTGCTTGGCT+TGG - Chr6:86479896-86479915 MsG0680034372.01.T01:CDS 45.0%
CAAAGTCAGTCCAGTGGTTT+AGG + Chr6:86482727-86482746 None:intergenic 45.0%
CAAATTTGACGAAGGGTGGA+AGG + Chr6:86483008-86483027 None:intergenic 45.0%
CATGAAGCATAAGGTGTGCT+TGG - Chr6:86481358-86481377 MsG0680034372.01.T01:intron 45.0%
CATGCTGAAAAGACTCGTGT+TGG - Chr6:86479493-86479512 MsG0680034372.01.T01:CDS 45.0%
CATGGTTATGGTTGGCGTAA+GGG + Chr6:86481292-86481311 None:intergenic 45.0%
CATGTAGTCCCATACCTACA+CGG + Chr6:86479788-86479807 None:intergenic 45.0%
CCATTGTTGCTACAGAAGGA+AGG - Chr6:86482643-86482662 MsG0680034372.01.T01:intron 45.0%
CCCAACTCTTCCTTTCTCAA+AGG + Chr6:86482037-86482056 None:intergenic 45.0%
CCTCTCATTCCGATGTGATT+CGG + Chr6:86479755-86479774 None:intergenic 45.0%
CCTTCCTTCTGTAGCAACAA+TGG + Chr6:86482646-86482665 None:intergenic 45.0%
CGAATCACATCGGAATGAGA+GGG - Chr6:86479753-86479772 MsG0680034372.01.T01:CDS 45.0%
CTCTCCATTGTTGCTACAGA+AGG - Chr6:86482639-86482658 MsG0680034372.01.T01:intron 45.0%
CTTCCACCCTTCGTCAAATT+TGG - Chr6:86483006-86483025 MsG0680034372.01.T01:intron 45.0%
CTTGGTTAAGCAGCAGTACA+TGG - Chr6:86481048-86481067 MsG0680034372.01.T01:intron 45.0%
GAAGGAGTTTGACGAACTGT+TGG - Chr6:86483798-86483817 MsG0680034372.01.T01:intron 45.0%
GATGAGCTCGAAAATGTGGT+TGG - Chr6:86484075-86484094 MsG0680034372.01.T01:intron 45.0%
GCAACCAGTTGAACAGGTAA+AGG - Chr6:86482518-86482537 MsG0680034372.01.T01:intron 45.0%
GCTTGGAGTAGTACTAGGAT+GGG - Chr6:86479913-86479932 MsG0680034372.01.T01:CDS 45.0%
GGCGAGTAAGGGAAAAGTAA+GGG + Chr6:86480085-86480104 None:intergenic 45.0%
GTATGGGACTACATGGTTGA+AGG - Chr6:86479793-86479812 MsG0680034372.01.T01:CDS 45.0%
GTCACTCTTGCACTCTCTAT+TGG - Chr6:86482443-86482462 MsG0680034372.01.T01:CDS 45.0%
GTCTCCTTTACCTGTTCAAC+TGG + Chr6:86482525-86482544 None:intergenic 45.0%
GTGACAATTGGCGCAATATG+AGG - Chr6:86481960-86481979 MsG0680034372.01.T01:CDS 45.0%
GTGCTAACAAAGGTCCAACA+GGG + Chr6:86484182-86484201 None:intergenic 45.0%
TAACATCCCAGACTGCTTAC+AGG + Chr6:86479540-86479559 None:intergenic 45.0%
TCACCGAGTATGGTGACAAT+TGG - Chr6:86481948-86481967 MsG0680034372.01.T01:CDS 45.0%
TCATCAAGGGACATACCATC+TGG + Chr6:86484492-86484511 None:intergenic 45.0%
TCCAACAGGGTACAACCTTA+AGG + Chr6:86484169-86484188 None:intergenic 45.0%
TCGGTTCCTCATATCAACGT+GGG + Chr6:86479736-86479755 None:intergenic 45.0%
TGAGGTTGTTGATGTCCACA+AGG - Chr6:86482096-86482115 MsG0680034372.01.T01:CDS 45.0%
TGGCGAGTAAGGGAAAAGTA+AGG + Chr6:86480086-86480105 None:intergenic 45.0%
TGTCCAAAAAGCTCTTTCCG+TGG + Chr6:86483873-86483892 None:intergenic 45.0%
TGTTGATGTCCACAAGGTTG+TGG - Chr6:86482102-86482121 MsG0680034372.01.T01:CDS 45.0%
TTACCTGTTCAACTGGTTGC+CGG + Chr6:86482518-86482537 None:intergenic 45.0%
TTCAATTGGGAGCTTCCAGA+TGG - Chr6:86484474-86484493 MsG0680034372.01.T01:intron 45.0%
TTCCCAAATTTGACGAAGGG+TGG + Chr6:86483012-86483031 None:intergenic 45.0%
TTCGGTTCCTCATATCAACG+TGG + Chr6:86479737-86479756 None:intergenic 45.0%
TTGTGCTTGATGGAGAATGG+AGG + Chr6:86481524-86481543 None:intergenic 45.0%
TTTCGTGACTGGGTAACAGT+AGG - Chr6:86482818-86482837 MsG0680034372.01.T01:intron 45.0%
! AGACCACGGAAAGAGCTTTT+TGG - Chr6:86483867-86483886 MsG0680034372.01.T01:intron 45.0%
! ATAGGTTGGCACAGATAGCA+AGG + Chr6:86484562-86484581 None:intergenic 45.0%
! CACCATACTCGGTGAAAGTT+AGG + Chr6:86481943-86481962 None:intergenic 45.0%
! CACTCATGAGGTGCTAACAA+AGG + Chr6:86484192-86484211 None:intergenic 45.0%
! TAGGTTGGCACAGATAGCAA+GGG + Chr6:86484561-86484580 None:intergenic 45.0%
!! AAGACTCGTGTTGGTTTGTG+GGG - Chr6:86479502-86479521 MsG0680034372.01.T01:CDS 45.0%
!! TGAATGGTGGGTAAGAGATG+CGG - Chr6:86481131-86481150 MsG0680034372.01.T01:intron 45.0%
!! TGTTGGTTTGTGGGGTTAGT+CGG - Chr6:86479510-86479529 MsG0680034372.01.T01:CDS 45.0%
!!! ATTGGCAATGGTTTTGGACC+CGG + Chr6:86481701-86481720 None:intergenic 45.0%
!!! AATGTATATAATTTAATTTT+AGG - Chr6:86482334-86482353 MsG0680034372.01.T01:CDS 5.0%
ACATCGGAATGAGAGGGATC+CGG - Chr6:86479759-86479778 MsG0680034372.01.T01:CDS 50.0%
AGGGATTGAAGGGAACGATG+TGG + Chr6:86481755-86481774 None:intergenic 50.0%
ATGCTTACCGGGAAACTTCC+CGG + Chr6:86479457-86479476 None:intergenic 50.0%
CACGAGACTCTAACCAACTG+AGG + Chr6:86480649-86480668 None:intergenic 50.0%
CCGAATCACATCGGAATGAG+AGG - Chr6:86479752-86479771 MsG0680034372.01.T01:CDS 50.0%
CCTCTTCGACCTGAACCAAA+TGG + Chr6:86484390-86484409 None:intergenic 50.0%
CGGTTCCTCATATCAACGTG+GGG + Chr6:86479735-86479754 None:intergenic 50.0%
CGTGTAGGTATGGGACTACA+TGG - Chr6:86479786-86479805 MsG0680034372.01.T01:CDS 50.0%
GAAGAGGTTGTCCTGGAATG+CGG - Chr6:86484403-86484422 MsG0680034372.01.T01:CDS 50.0%
GATGACCCCACGTTGATATG+AGG - Chr6:86479727-86479746 MsG0680034372.01.T01:CDS 50.0%
GCAGAAGGAAGTTGTCTAGG+TGG + Chr6:86483124-86483143 None:intergenic 50.0%
GCGCCAATTGTCACCATACT+CGG + Chr6:86481954-86481973 None:intergenic 50.0%
GCTACAGAAGGAAGGATCGA+AGG - Chr6:86482651-86482670 MsG0680034372.01.T01:intron 50.0%
GCTAGCCCCATTTGATCTTC+AGG - Chr6:86482258-86482277 MsG0680034372.01.T01:CDS 50.0%
GGAAGTTGTCTAGGTGGAAC+TGG + Chr6:86483118-86483137 None:intergenic 50.0%
GGCAATCCTGTAAGCAGTCT+GGG - Chr6:86479531-86479550 MsG0680034372.01.T01:CDS 50.0%
GGCCTAACTTTCACCGAGTA+TGG - Chr6:86481938-86481957 MsG0680034372.01.T01:CDS 50.0%
GGCTTGGAGTAGTACTAGGA+TGG - Chr6:86479912-86479931 MsG0680034372.01.T01:CDS 50.0%
GGGACTACATGGTTGAAGGA+AGG - Chr6:86479797-86479816 MsG0680034372.01.T01:CDS 50.0%
GGTGCTAACAAAGGTCCAAC+AGG + Chr6:86484183-86484202 None:intergenic 50.0%
GTCCTCACTCACATGCTTAC+CGG + Chr6:86479469-86479488 None:intergenic 50.0%
GTTAAACCCATCCGCATTCC+AGG + Chr6:86484417-86484436 None:intergenic 50.0%
TACCTGTTCAACTGGTTGCC+GGG + Chr6:86482517-86482536 None:intergenic 50.0%
TACTAGGATGGGTGACCTAC+CGG - Chr6:86479924-86479943 MsG0680034372.01.T01:CDS 50.0%
TCCTCACTCACATGCTTACC+GGG + Chr6:86479468-86479487 None:intergenic 50.0%
! AGCATAAGGTGTGCTTGGTG+TGG - Chr6:86481363-86481382 MsG0680034372.01.T01:intron 50.0%
! ATCTAGCTGACTTCGTGCCT+TGG - Chr6:86482236-86482255 MsG0680034372.01.T01:CDS 50.0%
! CCATTTGGTTCAGGTCGAAG+AGG - Chr6:86484387-86484406 MsG0680034372.01.T01:CDS 50.0%
! GCAAGTTGAAGAGACCGACT+TGG - Chr6:86484107-86484126 MsG0680034372.01.T01:intron 50.0%
! GCAGTCTGGGATGTTACACT+TGG - Chr6:86479544-86479563 MsG0680034372.01.T01:CDS 50.0%
!! AATGATAATGGGCCGGAGCA+AGG - Chr6:86482153-86482172 MsG0680034372.01.T01:CDS 50.0%
!! AGATCAAATGGGGCTAGCCA+AGG + Chr6:86482256-86482275 None:intergenic 50.0%
!! GCTTGGCTTGGAGTAGTACT+AGG - Chr6:86479908-86479927 MsG0680034372.01.T01:CDS 50.0%
ACCTGTTCAACTGGTTGCCG+GGG + Chr6:86482516-86482535 None:intergenic 55.0%
ACTAGGATGGGTGACCTACC+GGG - Chr6:86479925-86479944 MsG0680034372.01.T01:CDS 55.0%
ACTGTTACTGGGCCACGTTG+TGG + Chr6:86479643-86479662 None:intergenic 55.0%
AGAGCAGACCTCTCCCAGTA+CGG - Chr6:86479571-86479590 MsG0680034372.01.T01:CDS 55.0%
AGGTTGTCCTGGAATGCGGA+TGG - Chr6:86484407-86484426 MsG0680034372.01.T01:CDS 55.0%
AGTCCAGGTCGAAGCAGCTA+TGG - Chr6:86483153-86483172 MsG0680034372.01.T01:intron 55.0%
CGGCAATCCTGTAAGCAGTC+TGG - Chr6:86479530-86479549 MsG0680034372.01.T01:CDS 55.0%
CTGTTACTGGGCCACGTTGT+GGG + Chr6:86479642-86479661 None:intergenic 55.0%
GAGCGCGAGAATCCATCGAT+TGG - Chr6:86483835-86483854 MsG0680034372.01.T01:intron 55.0%
GGCATGTAACACCCACAACG+TGG - Chr6:86479628-86479647 MsG0680034372.01.T01:CDS 55.0%
GGTTGTCCTGGAATGCGGAT+GGG - Chr6:86484408-86484427 MsG0680034372.01.T01:CDS 55.0%
TCAGGTCGAAGAGGTTGTCC+TGG - Chr6:86484396-86484415 MsG0680034372.01.T01:CDS 55.0%
TCCCGGTAAGCATGTGAGTG+AGG - Chr6:86479464-86479483 MsG0680034372.01.T01:CDS 55.0%
TCTCCCAGTACGGTGTGGTT+CGG - Chr6:86479581-86479600 MsG0680034372.01.T01:CDS 55.0%
TGACCTACCGGGAAGTTTCC+CGG - Chr6:86479447-86479466 MsG0680034372.01.T01:CDS 55.0%
TGTAACAGCCCGACTTCCCT+GGG + Chr6:86479706-86479725 None:intergenic 55.0%
TTACCGGGAAACTTCCCGGT+AGG + Chr6:86479453-86479472 None:intergenic 55.0%
! CCTTGGCCGACTTCCACTAT+GGG + Chr6:86479675-86479694 None:intergenic 55.0%
! GACTTCCACTATGGGCTACC+CGG + Chr6:86479667-86479686 None:intergenic 55.0%
! GGGTAGCCCATAGTGGAAGT+CGG - Chr6:86479666-86479685 MsG0680034372.01.T01:CDS 55.0%
ACGCCATAGCTGCTTCGACC+TGG + Chr6:86483159-86483178 None:intergenic 60.0%
ACGTGGCCCAGTAACAGTGC+CGG - Chr6:86479645-86479664 MsG0680034372.01.T01:CDS 60.0%
AGACCTCTCCCAGTACGGTG+TGG - Chr6:86479576-86479595 MsG0680034372.01.T01:CDS 60.0%
ATCCCCGAACCACACCGTAC+TGG + Chr6:86479588-86479607 None:intergenic 60.0%
ATCCGGAGGCCGTGTAGGTA+TGG - Chr6:86479776-86479795 MsG0680034372.01.T01:CDS 60.0%
ATGAACCAGGCGGAAGCTGG+TGG - Chr6:86479606-86479625 MsG0680034372.01.T01:CDS 60.0%
CAGGGAAGTCGGGCTGTTAC+AGG - Chr6:86479705-86479724 MsG0680034372.01.T01:CDS 60.0%
CTCCCAGTACGGTGTGGTTC+GGG - Chr6:86479582-86479601 MsG0680034372.01.T01:CDS 60.0%
CTGTAACAGCCCGACTTCCC+TGG + Chr6:86479707-86479726 None:intergenic 60.0%
GAACCACACCGTACTGGGAG+AGG + Chr6:86479582-86479601 None:intergenic 60.0%
GGCTACCCGGCACTGTTACT+GGG + Chr6:86479654-86479673 None:intergenic 60.0%
TAGTGGAAGTCGGCCAAGGC+CGG - Chr6:86479676-86479695 MsG0680034372.01.T01:CDS 60.0%
TCCCAGTACGGTGTGGTTCG+GGG - Chr6:86479583-86479602 MsG0680034372.01.T01:CDS 60.0%
TCCCATACCTACACGGCCTC+CGG + Chr6:86479781-86479800 None:intergenic 60.0%
TCCCCGAACCACACCGTACT+GGG + Chr6:86479587-86479606 None:intergenic 60.0%
TCCCCGGCAACCAGTTGAAC+AGG - Chr6:86482512-86482531 MsG0680034372.01.T01:intron 60.0%
TCCGGAGGCCGTGTAGGTAT+GGG - Chr6:86479777-86479796 MsG0680034372.01.T01:CDS 60.0%
TCGGAATGAGAGGGATCCGG+AGG - Chr6:86479762-86479781 MsG0680034372.01.T01:CDS 60.0%
TGAACCAGGCGGAAGCTGGT+GGG - Chr6:86479607-86479626 MsG0680034372.01.T01:CDS 60.0%
! CCCATAGTGGAAGTCGGCCA+AGG - Chr6:86479672-86479691 MsG0680034372.01.T01:CDS 60.0%
! GCCTTGGCCGACTTCCACTA+TGG + Chr6:86479676-86479695 None:intergenic 60.0%
! GTGTGGTTCGGGGATGAACC+AGG - Chr6:86479593-86479612 MsG0680034372.01.T01:CDS 60.0%
! TGGTTCGGGGATGAACCAGG+CGG - Chr6:86479596-86479615 MsG0680034372.01.T01:CDS 60.0%
!!! GGCAATGGTTTTGGACCCGG+TGG + Chr6:86481698-86481717 None:intergenic 60.0%
AGTGGAAGTCGGCCAAGGCC+GGG - Chr6:86479677-86479696 MsG0680034372.01.T01:CDS 65.0%
CGTGGCCCAGTAACAGTGCC+GGG - Chr6:86479646-86479665 MsG0680034372.01.T01:CDS 65.0%
GGGATGAACCAGGCGGAAGC+TGG - Chr6:86479603-86479622 MsG0680034372.01.T01:CDS 65.0%
GGGCTACCCGGCACTGTTAC+TGG + Chr6:86479655-86479674 None:intergenic 65.0%
! CAGTGCCGGGTAGCCCATAG+TGG - Chr6:86479659-86479678 MsG0680034372.01.T01:CDS 65.0%
CATGCCCACCAGCTTCCGCC+TGG + Chr6:86479614-86479633 None:intergenic 70.0%
CCCGACTTCCCTGGGCTACC+CGG + Chr6:86479698-86479717 None:intergenic 70.0%
CCGGGTAGCCCAGGGAAGTC+GGG - Chr6:86479695-86479714 MsG0680034372.01.T01:CDS 70.0%
GAGGGATCCGGAGGCCGTGT+AGG - Chr6:86479771-86479790 MsG0680034372.01.T01:CDS 70.0%
GCCGGGTAGCCCAGGGAAGT+CGG - Chr6:86479694-86479713 MsG0680034372.01.T01:CDS 70.0%
TTCCCTGGGCTACCCGGCCT+TGG + Chr6:86479692-86479711 None:intergenic 70.0%
GGCCAAGGCCGGGTAGCCCA+GGG - Chr6:86479687-86479706 MsG0680034372.01.T01:CDS 75.0%
! CGGCCAAGGCCGGGTAGCCC+AGG - Chr6:86479686-86479705 MsG0680034372.01.T01:CDS 80.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 86479442 86484596 86479442 ID=MsG0680034372.01;Name=MsG0680034372.01
Chr6 mRNA 86479442 86484596 86479442 ID=MsG0680034372.01.T01;Parent=MsG0680034372.01;Name=MsG0680034372.01.T01;_AED=0.30;_eAED=0.30;_QI=0|0|0|0.5|0.66|0.75|4|0|569
Chr6 exon 86484570 86484596 86484570 ID=MsG0680034372.01.T01:exon:7346;Parent=MsG0680034372.01.T01
Chr6 exon 86484371 86484465 86484371 ID=MsG0680034372.01.T01:exon:7345;Parent=MsG0680034372.01.T01
Chr6 exon 86481759 86482518 86481759 ID=MsG0680034372.01.T01:exon:7344;Parent=MsG0680034372.01.T01
Chr6 exon 86479442 86480269 86479442 ID=MsG0680034372.01.T01:exon:7343;Parent=MsG0680034372.01.T01
Chr6 CDS 86484570 86484596 86484570 ID=MsG0680034372.01.T01:cds;Parent=MsG0680034372.01.T01
Chr6 CDS 86484371 86484465 86484371 ID=MsG0680034372.01.T01:cds;Parent=MsG0680034372.01.T01
Chr6 CDS 86481759 86482518 86481759 ID=MsG0680034372.01.T01:cds;Parent=MsG0680034372.01.T01
Chr6 CDS 86479442 86480269 86479442 ID=MsG0680034372.01.T01:cds;Parent=MsG0680034372.01.T01
Gene Sequence

>MsG0680034372.01.T01

ATGGGTGACCTACCGGGAAGTTTCCCGAGCAGACCTCTCCCAGTACGGTGTGGTTCGGGGATGAACCAGGCGGAAGCTGGTGGGCATGTAACACCCACAACGTGGCCCAGTAACAGTGCCGGTCCTCCATTCTCCATCAAGCACAACATACCAAAACCATTTCTATCTATTCTCTTTCAAGCAAACATGTTACCTCAAATATTAGCTATCCCTGAATTGATCTTTGTTATATTCATACTCATTCTATCAGCTACAATTTTTCACTCAAAATGGCATCACAAAAATGGTAGGAAAAATCCACCGGGTCCAAAACCATTGCCAATAATTGGTAACCTTCACATGATAGGGAAACTTCCACATCGTTCCCTTCAATCCCTTTCTCAAAAATATGGACCCATAATGTCCTTGAAGTTAGGACAAGTCCAAACCATTGTGGTTTCATCACCTCAAACTGCTGAACTATTCCTCAAGACCCATGATAGTGTTTTTGCTAGTAGGCCAAAAAATTTTGTTTCAGATTATGTCACATATGGTAGCAAGGGCCTAACTTTCACCGAGTATGGTGACAATTGGCGCAATATGAGGAAATTGTGTACCATGCAATTATTGCATGCTTCAAAAGTTGAGATGTTTGCTCCTTTGAGAAAGGAAGAGTTGGGGTTTTTGGTTAATTCACTAAGGAAATCATCTACATTACATGAGGTTGTTGATGTCCACAAGGTTGTGGTTGATCTTATAGAGAATATTGGTCATAAAATGATAATGGGCCGGAGCAAGGATGATAGATTCAACATAAATGGGATTATTCACGAAGCAATGAATTTGATTGAAGTTTTTAATCTAGCTGACTTCGTGCCTTGGCTAGCCCCATTTGATCTTCAGGGAATAAAACGAAGATCAAAGAAAACAATGAAGGAGTTTGACGAACTGTTGGAGCACATAATCAAAGAGCGCGAGAATCCATCGATTGGAGAACAAAGAGACCACGGAAAGAGCTTTTTGGACATATTGTTATCACTTATGAACCAACAAATGGAATCCCAAGAAGAAAATTATGTCATTGATAGAACAACCATCAAGGCTATTATAATAGACATGATTTTAGCAGCAACAGAATCATCTATAGCTGTAATTGAGTGGGCACTTTCAGAACTCATAAAGCATCCTAAGACAATGAAGAGACTTCAAGATGAGCTCGAAAATGTGGTTGGAATGAATAGGCAAGTTGAAGAGACCGACTTGGAAAATTTGCCTTATTTGACCATGGTTGTGAAAGAGACCTTAAGGTTGTACCCTGTTGGACCTTTGTTAGCACCTCATGAGTGTCTTCAAGATGTTGTTGTGGATGGTTATTATATAAAGAAAAAGTCAATAGTTTTAATAAATGCATGGACAATAGGGAGAGATACTAAGGTTTGGTCTGATAATGCTGAGAAGTTTTGTCCAGAGAGATTTGAAGATAGTAATATAGACCTTCGTGGACATGATTTTCAACTTTTACCATTTGGTTCAGGTCGAAGAGGTTGTCCTGGAATGCGGATGGGTTTAACTACTGTGAAGTTTGTTCTGGCTCAACTCGTGCACTGCTTCAATTGGGAGCTTCCAGATGGTATGTCCCTTGATGAGTTAGACATGTCTGAAAAGTTTGAATTCGCCATGCCAAAAAATCAACCCTTGCTATCTGTGCCAACCTATCGTCTCTTTGCTTAG
Protein sequence

>MsG0680034372.01.T01

MGDLPGSFPSRPLPVRCGSGMNQAEAGGHVTPTTWPSNSAGPPFSIKHNIPKPFLSILFQANMLPQILAIPELIFVIFILILSATIFHSKWHHKNGRKNPPGPKPLPIIGNLHMIGKLPHRSLQSLSQKYGPIMSLKLGQVQTIVVSSPQTAELFLKTHDSVFASRPKNFVSDYVTYGSKGLTFTEYGDNWRNMRKLCTMQLLHASKVEMFAPLRKEELGFLVNSLRKSSTLHEVVDVHKVVVDLIENIGHKMIMGRSKDDRFNINGIIHEAMNLIEVFNLADFVPWLAPFDLQGIKRRSKKTMKEFDELLEHIIKERENPSIGEQRDHGKSFLDILLSLMNQQMESQEENYVIDRTTIKAIIIDMILAATESSIAVIEWALSELIKHPKTMKRLQDELENVVGMNRQVEETDLENLPYLTMVVKETLRLYPVGPLLAPHECLQDVVVDGYYIKKKSIVLINAWTIGRDTKVWSDNAEKFCPERFEDSNIDLRGHDFQLLPFGSGRRGCPGMRMGLTTVKFVLAQLVHCFNWELPDGMSLDELDMSEKFEFAMPKNQPLLSVPTYRLFA*