AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680034723.01

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MsG0680034723.01.T01 AT3G25510 31.984 247 149 9 590 826 570 807 5.89e-16 83.6
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MsG0680034723.01.T01 AT5G17890 27.316 842 482 30 31 816 30 797 1.16e-52 202
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MsG0680034723.01.T01 AT5G45260 26.071 840 468 29 69 816 57 835 1.13e-50 195
MsG0680034723.01.T01 AT5G45260 25.983 839 470 28 69 816 57 835 1.31e-50 195
MsG0680034723.01.T01 AT5G45210 29.301 529 327 17 19 540 36 524 7.97e-50 186
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MsG0680034723.01.T01 AT5G48780 33.175 211 125 4 170 375 418 617 6.97e-24 108
MsG0680034723.01.T01 AT5G45200 26.613 744 389 22 229 847 3 714 2.58e-49 190
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MsG0680034723.01.T01 AT4G12020 27.592 598 366 18 12 594 662 1207 5.17e-44 174
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MsG0680034723.01.T01 AT2G17050 28.232 673 369 24 219 820 46 675 3.64e-43 172
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MsG0680034723.01.T01 AT1G17610 27.130 446 276 11 9 440 2 412 3.39e-33 134
MsG0680034723.01.T01 AT1G72870 28.632 475 240 12 18 415 10 462 3.74e-33 135
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MsG0680034723.01.T01 AT4G16990 28.622 283 186 8 174 454 1 269 1.51e-23 107
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MsG0680034723.01.T01 AT5G45000 34.545 165 103 3 18 182 15 174 4.37e-21 97.8
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MsG0680034723.01.T01 AT1G51270 33.149 181 113 4 5 182 172 347 3.22e-20 94.4
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MsG0680034723.01.T01 AT1G51480 28.523 298 170 15 185 461 145 420 4.33e-12 70.9
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MsG0680034723.01.T01 AT1G12280 27.200 250 166 6 215 455 172 414 2.09e-11 68.9
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Find 184 sgRNAs with CRISPR-Local

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
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AAAACACTTATCATTGAAAA+TGG 0.250048 6:+93460542 MsG0680034723.01.T01:CDS
TACTGAGTTCATTCAACTTC+AGG 0.256816 6:-93461963 None:intergenic
AATGGGAATCCACGTGTTAA+TGG 0.295740 6:+93462122 MsG0680034723.01.T01:CDS
CTTTGGTGCTCAAACCATTC+TGG 0.304311 6:-93461745 None:intergenic
CACAGCCTTTCCTTTATGAT+TGG 0.311111 6:-93459516 None:intergenic
GCTTCTTGATAAGGGATCTA+AGG 0.313024 6:+93459272 MsG0680034723.01.T01:CDS
GAAAGAACATATCTAGTAGA+AGG 0.322143 6:+93459684 MsG0680034723.01.T01:CDS
ATTGGTTTGGCCGTGGAAGC+AGG 0.336354 6:+93459613 MsG0680034723.01.T01:CDS
ACCCACTATTTCTAAAACTA+AGG 0.338317 6:-93459823 None:intergenic
ACAATATGAGTGTGATATAA+TGG 0.340271 6:+93461990 MsG0680034723.01.T01:CDS
GTGAAATTGCTTCTTGATAA+GGG 0.340459 6:+93459264 MsG0680034723.01.T01:CDS
GCAGAAAGCTCTTCAAGATT+TGG 0.344834 6:-93461453 None:intergenic
CTTGAAAGGTTAAGTGCAAT+TGG 0.347877 6:+93460961 MsG0680034723.01.T01:CDS
ATAGTGGGTTCCAACTTGTT+TGG 0.350658 6:+93459837 MsG0680034723.01.T01:CDS
CTTTGGCTGGAGGACCTGAT+TGG 0.351161 6:+93459595 MsG0680034723.01.T01:CDS
AGTGAAATTGCTTCTTGATA+AGG 0.364596 6:+93459263 MsG0680034723.01.T01:CDS
CGCGCAGTTTCATATGCTTC+GGG 0.371413 6:+93459795 MsG0680034723.01.T01:CDS
AATATTTAGAAGTGCTCAAA+TGG 0.372894 6:+93462104 MsG0680034723.01.T01:CDS
GAATGGAAGGGTACATTAGA+TGG 0.373088 6:+93459873 MsG0680034723.01.T01:CDS
CATGTTGCCAATTACCCAAT+TGG 0.377035 6:+93459219 MsG0680034723.01.T01:CDS
ATTAGTACTTGTTACCATTC+GGG 0.379210 6:+93460104 MsG0680034723.01.T01:CDS
TAAAGTAAGCTATGATGCTT+TGG 0.383220 6:+93459935 MsG0680034723.01.T01:CDS
TCTCGATGATGTTGACGATA+TGG 0.390729 6:+93459560 MsG0680034723.01.T01:CDS
TATCTAGTAGAAGGGTTGTA+TGG 0.391237 6:+93459693 MsG0680034723.01.T01:CDS
TTCTTCCGGAAGGTAATAAT+CGG 0.394628 6:+93461830 MsG0680034723.01.T01:CDS
AAAACATCTTCATAACTTGA+AGG 0.396860 6:-93459768 None:intergenic
GATTAGTACTTGTTACCATT+CGG 0.400220 6:+93460103 MsG0680034723.01.T01:CDS
TTTGTTGCTGATCAATTTGA+AGG 0.400905 6:+93459369 MsG0680034723.01.T01:CDS
TCGCGCAGTTTCATATGCTT+CGG 0.402936 6:+93459794 MsG0680034723.01.T01:CDS
ATCCTCGGCTCTGTTCCATT+TGG 0.403784 6:-93461721 None:intergenic
GTCTCCAAATATTTCTTAAG+TGG 0.406948 6:+93461295 MsG0680034723.01.T01:CDS
TGGGTAATTGGCAACATGTA+AGG 0.407642 6:-93459214 None:intergenic
ACATCTCTTGAGGAAATTAG+AGG 0.407992 6:+93461423 MsG0680034723.01.T01:CDS
CGAAACCAGAAAGAAATTGT+AGG 0.412019 6:-93461775 None:intergenic
ACTCGAGACTGCAATCCAAT+TGG 0.416836 6:-93459234 None:intergenic
TGAGGGGATTCCAATCATAA+AGG 0.417174 6:+93459506 MsG0680034723.01.T01:CDS
AAATTGTAGGTCCCCTGCTT+TGG 0.424973 6:-93461762 None:intergenic
GATATACTTCGTGTTCACTA+TGG 0.428210 6:+93460029 MsG0680034723.01.T01:CDS
GACATTGCTTGTTGCTTCAA+AGG 0.434227 6:+93459984 MsG0680034723.01.T01:CDS
TAGTGAATGTCACCATCTTA+AGG 0.438342 6:+93461380 MsG0680034723.01.T01:CDS
CCCTAAAACTGAGGAACACT+TGG 0.442490 6:-93458468 None:intergenic
GAGATTACATGACTTGATAA+AGG 0.442884 6:+93460142 MsG0680034723.01.T01:CDS
GCTGGAGGACCTGATTGGTT+TGG 0.443122 6:+93459600 MsG0680034723.01.T01:CDS
GGATGTGAAATTGAGTTAGA+TGG 0.444468 6:+93461886 MsG0680034723.01.T01:CDS
ATGGAAAGTGGCTCTGAGCC+AGG 0.449707 6:+93458861 MsG0680034723.01.T01:CDS
ACTGAGTTCATTCAACTTCA+GGG 0.451943 6:-93461962 None:intergenic
AAGATCATTGTCATCAATGA+AGG 0.456029 6:-93458557 None:intergenic
ATTACAATTCACAATTCGAT+TGG 0.462213 6:+93460925 MsG0680034723.01.T01:CDS
CTTCCACGGCCAAACCAATC+AGG 0.462904 6:-93459609 None:intergenic
CTGGTCTATTACAGATTCCA+TGG 0.463675 6:-93460486 None:intergenic
CTCGAGACTGCAATCCAATT+GGG 0.467864 6:-93459233 None:intergenic
TTGGAAAGAGCATAAAAGAA+TGG 0.470369 6:+93459856 MsG0680034723.01.T01:CDS
TTCAATACTATCAAACTGCT+TGG 0.470414 6:-93460593 None:intergenic
TCAAGGCCATTGAAGAATCT+AGG 0.472899 6:+93458611 MsG0680034723.01.T01:CDS
GTATGATGGCGCACATTAGT+AGG 0.473728 6:-93458760 None:intergenic
TGGAGCTTAAGTTGGATGAT+TGG 0.474615 6:+93462046 MsG0680034723.01.T01:CDS
GCTCTCTAGGCGATTCTTGT+CGG 0.475186 6:-93460184 None:intergenic
TTAAGAGATGCCAACCCTAA+AGG 0.476675 6:-93461009 None:intergenic
ATTTGAAAGGCCTGAGACAT+CGG 0.478448 6:-93460866 None:intergenic
TATGGAGCAACTACATGCTT+TGG 0.481711 6:+93459578 MsG0680034723.01.T01:CDS
TATGCTCTTTCCAAACAAGT+TGG 0.482257 6:-93459847 None:intergenic
GACGTCCGATTATTACCTTC+CGG 0.482899 6:-93461835 None:intergenic
AAGAAGGTTTCAAAATGATA+AGG 0.484385 6:+93458816 MsG0680034723.01.T01:CDS
GGATCCACACCAAAGAAAAC+AGG 0.487091 6:-93458739 None:intergenic
AGCTTACTTTAAGTATCTCA+TGG 0.489086 6:-93459923 None:intergenic
TCTTGAATTGTTGAGGTGGA+TGG 0.490622 6:+93459725 MsG0680034723.01.T01:CDS
ATGGTAGGACTTTATGGTAC+TGG 0.491103 6:+93459306 MsG0680034723.01.T01:CDS
AAATATGAATTTCCACTCCA+TGG 0.493075 6:+93460469 MsG0680034723.01.T01:CDS
AGATACGAATACAAGTTGAT+TGG 0.494814 6:+93459150 MsG0680034723.01.T01:intron
AATGGTTTGAGCACCAAAGC+AGG 0.494851 6:+93461749 MsG0680034723.01.T01:CDS
AGTAAGCTATGATGCTTTGG+AGG 0.495365 6:+93459938 MsG0680034723.01.T01:CDS
TGTTCTTTCTATATCATGAC+TGG 0.500333 6:-93459670 None:intergenic
ACTAATGTGCGCCATCATAC+AGG 0.506086 6:+93458763 MsG0680034723.01.T01:CDS
GAGGTTGGAGCGATGGAAAG+TGG 0.508832 6:+93458849 MsG0680034723.01.T01:CDS
TTTGAAAGGCCTGAGACATC+GGG 0.510329 6:-93460865 None:intergenic
TAAGGATAACATGGAGAGGT+TGG 0.511579 6:+93458834 MsG0680034723.01.T01:CDS
GGGCTGACGACTGATCTTGT+TGG 0.513917 6:-93459193 None:intergenic
CACCATAGCTACCTGTATGA+TGG 0.514796 6:-93458774 None:intergenic
TGGTTGAGTAATACTTCCAT+AGG 0.516151 6:+93461111 MsG0680034723.01.T01:CDS
CGCCATCATACAGGTAGCTA+TGG 0.517408 6:+93458772 MsG0680034723.01.T01:CDS
GCTTGTTGCTTCAAAGGATG+TGG 0.517482 6:+93459990 MsG0680034723.01.T01:CDS
TGACGATGGCAATTCTCCTA+TGG 0.517621 6:-93461127 None:intergenic
CATTGTCATCAATGAAGGTA+TGG 0.518547 6:-93458552 None:intergenic
TGTCTTTCTAATATAAGGAT+CGG 0.522370 6:-93462178 None:intergenic
GAAAGCTCTTCAAGATTTGG+TGG 0.524928 6:-93461450 None:intergenic
ACAAATCAAGATCCTTAAGA+TGG 0.525258 6:-93461392 None:intergenic
ACATGGAGAGGTTGGAGCGA+TGG 0.526138 6:+93458842 MsG0680034723.01.T01:CDS
AAAGAGCATAAAAGAATGGA+AGG 0.528076 6:+93459860 MsG0680034723.01.T01:CDS
AGCCAGGCTGCTAACTTGTC+CGG 0.528728 6:+93458877 MsG0680034723.01.T01:CDS
ATTCATTGCTACAAGACAAA+GGG 0.529950 6:+93458703 MsG0680034723.01.T01:CDS
GTCTTACTGCACATCTCTTG+AGG 0.530948 6:+93461413 MsG0680034723.01.T01:CDS
ATCTAGTAGAAGGGTTGTAT+GGG 0.532490 6:+93459694 MsG0680034723.01.T01:CDS
GACATCTAAATAAACTTGAA+AGG 0.534097 6:+93460947 MsG0680034723.01.T01:CDS
AACACATCATCTAGGAGTGT+TGG 0.534791 6:+93460061 MsG0680034723.01.T01:CDS
GAGCAACTACATGCTTTGGC+TGG 0.536408 6:+93459582 MsG0680034723.01.T01:CDS
ACACATATACCCGATGTCTC+AGG 0.539390 6:+93460856 MsG0680034723.01.T01:CDS
GGACCTGATTGGTTTGGCCG+TGG 0.539396 6:+93459606 MsG0680034723.01.T01:CDS
ATAGGAAAATGAAGAGGATG+AGG 0.540745 6:-93458434 None:intergenic
GATCCATGTGGAGCTTAAGT+TGG 0.541910 6:+93462038 MsG0680034723.01.T01:CDS
GGGTAATTGGCAACATGTAA+GGG 0.546744 6:-93459213 None:intergenic
CTTTATGGTACTGGAGGCAT+GGG 0.547598 6:+93459315 MsG0680034723.01.T01:CDS
CAGAAGCTCTTGAATTGTTG+AGG 0.547824 6:+93459718 MsG0680034723.01.T01:CDS
ACTTTATGGTACTGGAGGCA+TGG 0.548249 6:+93459314 MsG0680034723.01.T01:CDS
GAGTTATATCTGCGGGAATG+TGG 0.548448 6:+93461174 MsG0680034723.01.T01:CDS
TCAAACCATTCTGGTATCCT+CGG 0.553321 6:-93461736 None:intergenic
TCAATGGCCTTGATGAGTGA+TGG 0.553507 6:-93458601 None:intergenic
CAAAGAAAACAGGCAAGACG+AGG 0.553970 6:-93458729 None:intergenic
AAGTTAGATCATGTTTGTGA+GGG 0.555846 6:+93459489 MsG0680034723.01.T01:CDS
CTACATGGCTCTTATTGACA+AGG 0.558223 6:+93458525 MsG0680034723.01.T01:CDS
TAATGATAACCCTGCTTCCA+CGG 0.562554 6:-93459623 None:intergenic
CCCACTATTTCTAAAACTAA+GGG 0.563752 6:-93459822 None:intergenic
ACTTCATGAGTTATATCTGC+GGG 0.564004 6:+93461167 MsG0680034723.01.T01:CDS
GAAAATGAAGAGGATGAGGA+AGG 0.564131 6:-93458430 None:intergenic
CATTGCATAACACATCATCT+AGG 0.565157 6:+93460053 MsG0680034723.01.T01:CDS
GTTGCTTCAAAGGATGTGGA+TGG 0.566073 6:+93459994 MsG0680034723.01.T01:CDS
AGGGGAACTGACACTCGGTA+CGG 0.566461 6:+93458487 MsG0680034723.01.T01:CDS
CAAGTTAGATCATGTTTGTG+AGG 0.572602 6:+93459488 MsG0680034723.01.T01:CDS
AAATATGAAAGTCTTGACAT+TGG 0.573113 6:+93460816 MsG0680034723.01.T01:CDS
TTGGTTTGGCCGTGGAAGCA+GGG 0.573179 6:+93459614 MsG0680034723.01.T01:CDS
CATCTCTTGAGGAAATTAGA+GGG 0.575863 6:+93461424 MsG0680034723.01.T01:CDS
AGCCGGACAAGTTAGCAGCC+TGG 0.577346 6:-93458879 None:intergenic
CATTGGCTAAGCATGAAAGA+AGG 0.578270 6:+93458800 MsG0680034723.01.T01:CDS
GGTACCGAGGAGCACTATCA+TGG 0.581106 6:-93458903 None:intergenic
AAAGAACATATCTAGTAGAA+GGG 0.582316 6:+93459685 MsG0680034723.01.T01:CDS
ATATTTAGAAGTGCTCAAAT+GGG 0.583454 6:+93462105 MsG0680034723.01.T01:CDS
GATGACAATGATCTTCAAAG+AGG 0.585200 6:+93458565 MsG0680034723.01.T01:CDS
AAGCAACACGGAGGAGAATG+TGG 0.587211 6:+93462149 MsG0680034723.01.T01:CDS
CAGTAAATGTTTGTCTCGAG+TGG 0.588809 6:-93459646 None:intergenic
TATTCATTGCTACAAGACAA+AGG 0.588931 6:+93458702 MsG0680034723.01.T01:CDS
AGGAGCACTATCATGGTAGC+CGG 0.590081 6:-93458896 None:intergenic
ATGGTTTGAGCACCAAAGCA+GGG 0.594053 6:+93461750 MsG0680034723.01.T01:CDS
GTGACATTCACTAAGGCACT+CGG 0.595851 6:-93461370 None:intergenic
TAAGATGGTGACATTCACTA+AGG 0.596087 6:-93461377 None:intergenic
CAGAGCCGAGGATACCAGAA+TGG 0.599437 6:+93461731 MsG0680034723.01.T01:CDS
AAGGATGAGGTCCACATGGT+AGG 0.600567 6:+93459291 MsG0680034723.01.T01:CDS
ACATGACTTGATAAAGGACA+TGG 0.601945 6:+93460148 MsG0680034723.01.T01:CDS
ATCTAAGGATGAGGTCCACA+TGG 0.602309 6:+93459287 MsG0680034723.01.T01:CDS
AGGTAGCTATGGTGAAGCAT+TGG 0.602708 6:+93458783 MsG0680034723.01.T01:CDS
AATCACACCATCACTCATCA+AGG 0.603081 6:+93458594 MsG0680034723.01.T01:CDS
CAACTACATGCTTTGGCTGG+AGG 0.604069 6:+93459585 MsG0680034723.01.T01:CDS
CATCCAACTTAAGCTCCACA+TGG 0.606859 6:-93462041 None:intergenic
AGTTAGATCATGTTTGTGAG+GGG 0.607464 6:+93459490 MsG0680034723.01.T01:CDS
AGAGATGCCAACCCTAAAGG+TGG 0.608328 6:-93461006 None:intergenic
TGATAAGGGATCTAAGGATG+AGG 0.615221 6:+93459278 MsG0680034723.01.T01:CDS
CTATTACAGATTCCATGGAG+TGG 0.620634 6:-93460481 None:intergenic
TCAAAATGATAAGGATAACA+TGG 0.622065 6:+93458825 MsG0680034723.01.T01:CDS
GAATCTGTAATAGACCAGAA+AGG 0.622142 6:+93460491 MsG0680034723.01.T01:CDS
TTCCAAATGGAACAGAGCCG+AGG 0.622925 6:+93461719 MsG0680034723.01.T01:CDS
TGTAATAGACCAGAAAGGAA+AGG 0.624613 6:+93460496 MsG0680034723.01.T01:CDS
GGATTCCAATCATAAAGGAA+AGG 0.627808 6:+93459511 MsG0680034723.01.T01:CDS
CAGCATTAATAGATCCCGAA+TGG 0.628196 6:-93460118 None:intergenic
AATAATCGGACGTCTCACAT+AGG 0.629022 6:+93461844 MsG0680034723.01.T01:CDS
TTTGGAGACATTCATCTGAG+AGG 0.629358 6:-93461281 None:intergenic
TTGCTTCAAAGGATGTGGAT+GGG 0.637272 6:+93459995 MsG0680034723.01.T01:CDS
TGTCAGTTCCCCTAAAACTG+AGG 0.638241 6:-93458477 None:intergenic
AAACTAACAGCAACTACATG+AGG 0.643227 6:+93461672 MsG0680034723.01.T01:intron
ATGATAAGGATAACATGGAG+AGG 0.643629 6:+93458830 MsG0680034723.01.T01:CDS
AAGCTCTTGAATTGTTGAGG+TGG 0.645311 6:+93459721 MsG0680034723.01.T01:CDS
CTTCAAAGGATGTGGATGGG+AGG 0.646069 6:+93459998 MsG0680034723.01.T01:CDS
TACATGGCTCTTATTGACAA+GGG 0.646348 6:+93458526 MsG0680034723.01.T01:CDS
GTAGGACTTTATGGTACTGG+AGG 0.649476 6:+93459309 MsG0680034723.01.T01:CDS
TGGTTTGAGCACCAAAGCAG+GGG 0.650953 6:+93461751 MsG0680034723.01.T01:CDS
CTAGATGATGTGTTATGCAA+TGG 0.651440 6:-93460052 None:intergenic
AACTTCATGAGTTATATCTG+CGG 0.656047 6:+93461166 MsG0680034723.01.T01:CDS
GCTACCATGATAGTGCTCCT+CGG 0.663403 6:+93458899 MsG0680034723.01.T01:CDS
CTAACAGCAACTACATGAGG+CGG 0.667033 6:+93461675 MsG0680034723.01.T01:intron
CTATTTCTAAAACTAAGGGA+AGG 0.667716 6:-93459818 None:intergenic
GAATCCATAGGAAAATGAAG+AGG 0.667928 6:-93458440 None:intergenic
AAGAGCATAAAAGAATGGAA+GGG 0.671652 6:+93459861 MsG0680034723.01.T01:CDS
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CRISPR-GE

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!! TTTTTAGAAGAAGCTTCTCT+TGG - Chr6:93459452-93459471 None:intergenic 30.0%
!!! CCCTTAGTTTTAGAAATAGT+GGG + Chr6:93459822-93459841 MsG0680034723.01.T01:CDS 30.0%
!!! TCCCTTAGTTTTAGAAATAG+TGG + Chr6:93459821-93459840 MsG0680034723.01.T01:CDS 30.0%
AAACTAACAGCAACTACATG+AGG + Chr6:93461672-93461691 MsG0680034723.01.T01:intron 35.0%
ACATCTCTTGAGGAAATTAG+AGG + Chr6:93461423-93461442 MsG0680034723.01.T01:CDS 35.0%
ACATGACTTGATAAAGGACA+TGG + Chr6:93460148-93460167 MsG0680034723.01.T01:CDS 35.0%
ACTGAGTTCATTCAACTTCA+GGG - Chr6:93461965-93461984 None:intergenic 35.0%
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ATAGGAAAATGAAGAGGATG+AGG - Chr6:93458437-93458456 None:intergenic 35.0%
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GGATGTGAAATTGAGTTAGA+TGG + Chr6:93461886-93461905 MsG0680034723.01.T01:CDS 35.0%
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TAAGATGGTGACATTCACTA+AGG - Chr6:93461380-93461399 None:intergenic 35.0%
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TATGCTCTTTCCAAACAAGT+TGG - Chr6:93459850-93459869 None:intergenic 35.0%
TGGTTGAGTAATACTTCCAT+AGG + Chr6:93461111-93461130 MsG0680034723.01.T01:CDS 35.0%
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TTCTTCCGGAAGGTAATAAT+CGG + Chr6:93461830-93461849 MsG0680034723.01.T01:CDS 35.0%
! TCAAACGTTTTCCACCTTTA+GGG + Chr6:93460995-93461014 MsG0680034723.01.T01:CDS 35.0%
! TCATCCTCTTCATTTTCCTA+TGG + Chr6:93458436-93458455 MsG0680034723.01.T01:CDS 35.0%
! TGCCTCTTCAAAATTTTGCT+TGG + Chr6:93458663-93458682 MsG0680034723.01.T01:CDS 35.0%
!! CATAACCTACTTCGTTTTTC+AGG - Chr6:93460209-93460228 None:intergenic 35.0%
!! GCATAGTTGATAGAAAACAC+AGG - Chr6:93458646-93458665 None:intergenic 35.0%
!! GTCCAAGCAAAATTTTGAAG+AGG - Chr6:93458668-93458687 None:intergenic 35.0%
!!! CTGAGATTTTGAAATGACGA+TGG - Chr6:93461144-93461163 None:intergenic 35.0%
AAGCTCTTGAATTGTTGAGG+TGG + Chr6:93459721-93459740 MsG0680034723.01.T01:CDS 40.0%
AATAATCGGACGTCTCACAT+AGG + Chr6:93461844-93461863 MsG0680034723.01.T01:CDS 40.0%
AATCACACCATCACTCATCA+AGG + Chr6:93458594-93458613 MsG0680034723.01.T01:CDS 40.0%
AATGGGAATCCACGTGTTAA+TGG + Chr6:93462122-93462141 MsG0680034723.01.T01:CDS 40.0%
AGTAAGCTATGATGCTTTGG+AGG + Chr6:93459938-93459957 MsG0680034723.01.T01:CDS 40.0%
ATGGTAGGACTTTATGGTAC+TGG + Chr6:93459306-93459325 MsG0680034723.01.T01:CDS 40.0%
ATTTGAAAGGCCTGAGACAT+CGG - Chr6:93460869-93460888 None:intergenic 40.0%
CACAGCCTTTCCTTTATGAT+TGG - Chr6:93459519-93459538 None:intergenic 40.0%
CACTTGGTAAGTGAATCCAT+AGG - Chr6:93458455-93458474 None:intergenic 40.0%
CAGAAGCTCTTGAATTGTTG+AGG + Chr6:93459718-93459737 MsG0680034723.01.T01:CDS 40.0%
CAGCATTAATAGATCCCGAA+TGG - Chr6:93460121-93460140 None:intergenic 40.0%
CAGTAAATGTTTGTCTCGAG+TGG - Chr6:93459649-93459668 None:intergenic 40.0%
CATGTTGCCAATTACCCAAT+TGG + Chr6:93459219-93459238 MsG0680034723.01.T01:CDS 40.0%
CTACATGGCTCTTATTGACA+AGG + Chr6:93458525-93458544 MsG0680034723.01.T01:CDS 40.0%
CTATTACAGATTCCATGGAG+TGG - Chr6:93460484-93460503 None:intergenic 40.0%
CTGCAATCCAATTGGGTAAT+TGG - Chr6:93459229-93459248 None:intergenic 40.0%
CTGGTCTATTACAGATTCCA+TGG - Chr6:93460489-93460508 None:intergenic 40.0%
GAAAATGAAGAGGATGAGGA+AGG - Chr6:93458433-93458452 None:intergenic 40.0%
GAAAGCTCTTCAAGATTTGG+TGG - Chr6:93461453-93461472 None:intergenic 40.0%
GCAGAAAGCTCTTCAAGATT+TGG - Chr6:93461456-93461475 None:intergenic 40.0%
GCTTCTTGATAAGGGATCTA+AGG + Chr6:93459272-93459291 MsG0680034723.01.T01:CDS 40.0%
GGAACTTCTGCATAAACACA+AGG - Chr6:93460795-93460814 None:intergenic 40.0%
GGGTAATTGGCAACATGTAA+GGG - Chr6:93459216-93459235 None:intergenic 40.0%
TAAGGATAACATGGAGAGGT+TGG + Chr6:93458834-93458853 MsG0680034723.01.T01:CDS 40.0%
TAATGATAACCCTGCTTCCA+CGG - Chr6:93459626-93459645 None:intergenic 40.0%
TACCATAAAGTCCTACCATG+TGG - Chr6:93459305-93459324 None:intergenic 40.0%
TATGGAGCAACTACATGCTT+TGG + Chr6:93459578-93459597 MsG0680034723.01.T01:CDS 40.0%
TCAAACCATTCTGGTATCCT+CGG - Chr6:93461739-93461758 None:intergenic 40.0%
TCAAGGCCATTGAAGAATCT+AGG + Chr6:93458611-93458630 MsG0680034723.01.T01:CDS 40.0%
TCTCGATGATGTTGACGATA+TGG + Chr6:93459560-93459579 MsG0680034723.01.T01:CDS 40.0%
TCTTGAATTGTTGAGGTGGA+TGG + Chr6:93459725-93459744 MsG0680034723.01.T01:CDS 40.0%
TGAGGGGATTCCAATCATAA+AGG + Chr6:93459506-93459525 MsG0680034723.01.T01:CDS 40.0%
TGATAAGGGATCTAAGGATG+AGG + Chr6:93459278-93459297 MsG0680034723.01.T01:CDS 40.0%
TGGGTAATTGGCAACATGTA+AGG - Chr6:93459217-93459236 None:intergenic 40.0%
TTAAGAGATGCCAACCCTAA+AGG - Chr6:93461012-93461031 None:intergenic 40.0%
TTGCTTCAAAGGATGTGGAT+GGG + Chr6:93459995-93460014 MsG0680034723.01.T01:CDS 40.0%
TTTGGAGACATTCATCTGAG+AGG - Chr6:93461284-93461303 None:intergenic 40.0%
! AACACATCATCTAGGAGTGT+TGG + Chr6:93460061-93460080 MsG0680034723.01.T01:CDS 40.0%
! ACCAAGTGTTCCTCAGTTTT+AGG + Chr6:93458467-93458486 MsG0680034723.01.T01:CDS 40.0%
! CATTGGCTAAGCATGAAAGA+AGG + Chr6:93458800-93458819 MsG0680034723.01.T01:CDS 40.0%
! CCAAGTGTTCCTCAGTTTTA+GGG + Chr6:93458468-93458487 MsG0680034723.01.T01:CDS 40.0%
! CTCAAACGTTTTCCACCTTT+AGG + Chr6:93460994-93461013 MsG0680034723.01.T01:CDS 40.0%
! GAATGGAAGGGTACATTAGA+TGG + Chr6:93459873-93459892 MsG0680034723.01.T01:CDS 40.0%
! GACATTGCTTGTTGCTTCAA+AGG + Chr6:93459984-93460003 MsG0680034723.01.T01:CDS 40.0%
! TGCTTTTCTCCATTAACACG+TGG - Chr6:93462134-93462153 None:intergenic 40.0%
! TTAAGTAAAGTTGGGTACCG+AGG - Chr6:93458919-93458938 None:intergenic 40.0%
! TTTTACGGGCAATCTCTACA+TGG + Chr6:93458510-93458529 MsG0680034723.01.T01:CDS 40.0%
!! ATAGTGGGTTCCAACTTGTT+TGG + Chr6:93459837-93459856 MsG0680034723.01.T01:CDS 40.0%
!! CAAGTGTTCCTCAGTTTTAG+GGG + Chr6:93458469-93458488 MsG0680034723.01.T01:CDS 40.0%
!! TGGAGCTTAAGTTGGATGAT+TGG + Chr6:93462046-93462065 MsG0680034723.01.T01:CDS 40.0%
!! TTTTGAAGGCCTTTCCTTTC+TGG - Chr6:93460508-93460527 None:intergenic 40.0%
AAATTGTAGGTCCCCTGCTT+TGG - Chr6:93461765-93461784 None:intergenic 45.0%
AATGGAGAAAAGCAACACGG+AGG + Chr6:93462140-93462159 MsG0680034723.01.T01:CDS 45.0%
AATGGTTTGAGCACCAAAGC+AGG + Chr6:93461749-93461768 MsG0680034723.01.T01:CDS 45.0%
ACACATATACCCGATGTCTC+AGG + Chr6:93460856-93460875 MsG0680034723.01.T01:CDS 45.0%
ACTAATGTGCGCCATCATAC+AGG + Chr6:93458763-93458782 MsG0680034723.01.T01:CDS 45.0%
ACTCGAGACTGCAATCCAAT+TGG - Chr6:93459237-93459256 None:intergenic 45.0%
AGGTAGCTATGGTGAAGCAT+TGG + Chr6:93458783-93458802 MsG0680034723.01.T01:CDS 45.0%
ATCTAAGGATGAGGTCCACA+TGG + Chr6:93459287-93459306 MsG0680034723.01.T01:CDS 45.0%
ATGGTTTGAGCACCAAAGCA+GGG + Chr6:93461750-93461769 MsG0680034723.01.T01:CDS 45.0%
CAAAGAAAACAGGCAAGACG+AGG - Chr6:93458732-93458751 None:intergenic 45.0%
CACCATAGCTACCTGTATGA+TGG - Chr6:93458777-93458796 None:intergenic 45.0%
CATCCAACTTAAGCTCCACA+TGG - Chr6:93462044-93462063 None:intergenic 45.0%
CCCTAAAACTGAGGAACACT+TGG - Chr6:93458471-93458490 None:intergenic 45.0%
CTAACAGCAACTACATGAGG+CGG + Chr6:93461675-93461694 MsG0680034723.01.T01:intron 45.0%
CTCGAGACTGCAATCCAATT+GGG - Chr6:93459236-93459255 None:intergenic 45.0%
GACGTCCGATTATTACCTTC+CGG - Chr6:93461838-93461857 None:intergenic 45.0%
GAGAGCCTGAAAAACGAAGT+AGG + Chr6:93460201-93460220 MsG0680034723.01.T01:CDS 45.0%
GAGTTATATCTGCGGGAATG+TGG + Chr6:93461174-93461193 MsG0680034723.01.T01:CDS 45.0%
GATCCATGTGGAGCTTAAGT+TGG + Chr6:93462038-93462057 MsG0680034723.01.T01:CDS 45.0%
GGATCCACACCAAAGAAAAC+AGG - Chr6:93458742-93458761 None:intergenic 45.0%
GGGGACCTACAATTTCTTTC+TGG + Chr6:93461770-93461789 MsG0680034723.01.T01:CDS 45.0%
GTCCACATGGTAGGACTTTA+TGG + Chr6:93459300-93459319 MsG0680034723.01.T01:CDS 45.0%
GTCTTACTGCACATCTCTTG+AGG + Chr6:93461413-93461432 MsG0680034723.01.T01:CDS 45.0%
GTTGCTTCAAAGGATGTGGA+TGG + Chr6:93459994-93460013 MsG0680034723.01.T01:CDS 45.0%
TCGCGCAGTTTCATATGCTT+CGG + Chr6:93459794-93459813 MsG0680034723.01.T01:CDS 45.0%
TGACGATGGCAATTCTCCTA+TGG - Chr6:93461130-93461149 None:intergenic 45.0%
TGTCAGTTCCCCTAAAACTG+AGG - Chr6:93458480-93458499 None:intergenic 45.0%
TTTGAAAGGCCTGAGACATC+GGG - Chr6:93460868-93460887 None:intergenic 45.0%
! ACTTTATGGTACTGGAGGCA+TGG + Chr6:93459314-93459333 MsG0680034723.01.T01:CDS 45.0%
! CTCGTCTTGCCTGTTTTCTT+TGG + Chr6:93458730-93458749 MsG0680034723.01.T01:CDS 45.0%
! CTTGCCTGTTTTCTTTGGTG+TGG + Chr6:93458735-93458754 MsG0680034723.01.T01:CDS 45.0%
! CTTTATGGTACTGGAGGCAT+GGG + Chr6:93459315-93459334 MsG0680034723.01.T01:CDS 45.0%
! GCTTGTTGCTTCAAAGGATG+TGG + Chr6:93459990-93460009 MsG0680034723.01.T01:CDS 45.0%
! GTAGGACTTTATGGTACTGG+AGG + Chr6:93459309-93459328 MsG0680034723.01.T01:CDS 45.0%
! GTATGATGGCGCACATTAGT+AGG - Chr6:93458763-93458782 None:intergenic 45.0%
! GTGACATTCACTAAGGCACT+CGG - Chr6:93461373-93461392 None:intergenic 45.0%
! TCAATGGCCTTGATGAGTGA+TGG - Chr6:93458604-93458623 None:intergenic 45.0%
! TGACACTCGGTACGGTTTTA+CGG + Chr6:93458495-93458514 MsG0680034723.01.T01:CDS 45.0%
! TGACATTCACTAAGGCACTC+GGG - Chr6:93461372-93461391 None:intergenic 45.0%
!! CTTTGGTGCTCAAACCATTC+TGG - Chr6:93461748-93461767 None:intergenic 45.0%
!!! ACGTTTTCCACCTTTAGGGT+TGG + Chr6:93460999-93461018 MsG0680034723.01.T01:CDS 45.0%
!!! CTTCGTTTTTCAGGCTCTCT+AGG - Chr6:93460200-93460219 None:intergenic 45.0%
!!! GTTTTAGGGGAACTGACACT+CGG + Chr6:93458482-93458501 MsG0680034723.01.T01:CDS 45.0%
AAGCAACACGGAGGAGAATG+TGG + Chr6:93462149-93462168 MsG0680034723.01.T01:CDS 50.0%
AAGGATGAGGTCCACATGGT+AGG + Chr6:93459291-93459310 MsG0680034723.01.T01:CDS 50.0%
AGAGATGCCAACCCTAAAGG+TGG - Chr6:93461009-93461028 None:intergenic 50.0%
ATCCTCGGCTCTGTTCCATT+TGG - Chr6:93461724-93461743 None:intergenic 50.0%
CAACTACATGCTTTGGCTGG+AGG + Chr6:93459585-93459604 MsG0680034723.01.T01:CDS 50.0%
CGCCATCATACAGGTAGCTA+TGG + Chr6:93458772-93458791 MsG0680034723.01.T01:CDS 50.0%
CGCGCAGTTTCATATGCTTC+GGG + Chr6:93459795-93459814 MsG0680034723.01.T01:CDS 50.0%
CTTCAAAGGATGTGGATGGG+AGG + Chr6:93459998-93460017 MsG0680034723.01.T01:CDS 50.0%
GAGCAACTACATGCTTTGGC+TGG + Chr6:93459582-93459601 MsG0680034723.01.T01:CDS 50.0%
GCTCTCTAGGCGATTCTTGT+CGG - Chr6:93460187-93460206 None:intergenic 50.0%
TGGTTTGAGCACCAAAGCAG+GGG + Chr6:93461751-93461770 MsG0680034723.01.T01:CDS 50.0%
TTCCAAATGGAACAGAGCCG+AGG + Chr6:93461719-93461738 MsG0680034723.01.T01:CDS 50.0%
! GACACTCGGTACGGTTTTAC+GGG + Chr6:93458496-93458515 MsG0680034723.01.T01:CDS 50.0%
! GCTACCATGATAGTGCTCCT+CGG + Chr6:93458899-93458918 MsG0680034723.01.T01:CDS 50.0%
!! AGGAGCACTATCATGGTAGC+CGG - Chr6:93458899-93458918 None:intergenic 50.0%
ACATGGAGAGGTTGGAGCGA+TGG + Chr6:93458842-93458861 MsG0680034723.01.T01:CDS 55.0%
AGGGGAACTGACACTCGGTA+CGG + Chr6:93458487-93458506 MsG0680034723.01.T01:CDS 55.0%
CAGAGCCGAGGATACCAGAA+TGG + Chr6:93461731-93461750 MsG0680034723.01.T01:CDS 55.0%
CTTCCACGGCCAAACCAATC+AGG - Chr6:93459612-93459631 None:intergenic 55.0%
CTTTGGCTGGAGGACCTGAT+TGG + Chr6:93459595-93459614 MsG0680034723.01.T01:CDS 55.0%
GAGGTTGGAGCGATGGAAAG+TGG + Chr6:93458849-93458868 MsG0680034723.01.T01:CDS 55.0%
GGGCTGACGACTGATCTTGT+TGG - Chr6:93459196-93459215 None:intergenic 55.0%
TGCGGGAATGTGGAATGCTG+AGG + Chr6:93461184-93461203 MsG0680034723.01.T01:CDS 55.0%
! AGCCAGGCTGCTAACTTGTC+CGG + Chr6:93458877-93458896 MsG0680034723.01.T01:CDS 55.0%
! GCTGGAGGACCTGATTGGTT+TGG + Chr6:93459600-93459619 MsG0680034723.01.T01:CDS 55.0%
!! ATGGAAAGTGGCTCTGAGCC+AGG + Chr6:93458861-93458880 MsG0680034723.01.T01:CDS 55.0%
!! ATTGGTTTGGCCGTGGAAGC+AGG + Chr6:93459613-93459632 MsG0680034723.01.T01:CDS 55.0%
!! GGTACCGAGGAGCACTATCA+TGG - Chr6:93458906-93458925 None:intergenic 55.0%
!! TTGGTTTGGCCGTGGAAGCA+GGG + Chr6:93459614-93459633 MsG0680034723.01.T01:CDS 55.0%
AGCCGGACAAGTTAGCAGCC+TGG - Chr6:93458882-93458901 None:intergenic 60.0%
!! GGACCTGATTGGTTTGGCCG+TGG + Chr6:93459606-93459625 MsG0680034723.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 93458415 93462233 93458415 ID=MsG0680034723.01;Name=MsG0680034723.01
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Chr6 exon 93458415 93458920 93458415 ID=MsG0680034723.01.T01:exon:13026;Parent=MsG0680034723.01.T01
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Chr6 CDS 93460446 93460607 93460446 ID=MsG0680034723.01.T01:cds;Parent=MsG0680034723.01.T01
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Chr6 CDS 93461682 93462233 93461682 ID=MsG0680034723.01.T01:cds;Parent=MsG0680034723.01.T01
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