AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780037190.01

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MsG0780037190.01.T01 AT1G64580 28.826 281 190 5 54 334 232 502 3.65e-29 120
MsG0780037190.01.T01 AT1G64580 25.000 352 219 6 57 373 165 506 1.05e-26 113
MsG0780037190.01.T01 AT1G64580 25.581 215 150 5 57 271 305 509 1.65e-17 85.5
MsG0780037190.01.T01 AT1G64580 24.908 273 165 4 224 459 77 346 3.35e-16 81.3
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MsG0780037190.01.T01 AT2G32630 26.471 170 122 1 279 448 172 338 2.95e-14 75.5
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MsG0780037190.01.T01 AT1G64100 25.474 369 260 7 53 421 308 661 2.46e-31 127
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MsG0780037190.01.T01 AT2G01510 25.664 226 156 4 202 427 23 236 1.43e-12 70.1
MsG0780037190.01.T01 AT4G14050 24.910 277 190 7 170 442 186 448 1.56e-12 70.1
MsG0780037190.01.T01 AT3G29230 22.143 280 195 7 187 458 149 413 1.77e-12 70.1
MsG0780037190.01.T01 AT3G29230 22.105 285 185 5 168 423 198 474 2.26e-12 69.7
MsG0780037190.01.T01 AT5G67570 25.424 177 116 2 262 422 256 432 2.73e-12 69.7
MsG0780037190.01.T01 AT5G67570 22.846 267 181 7 163 426 263 507 8.44e-12 68.2
MsG0780037190.01.T01 AT5G27300 27.072 181 115 4 192 360 167 342 3.40e-12 68.9
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MsG0780037190.01.T01 AT3G09040 22.689 357 223 15 91 419 36 367 5.14e-11 65.5
MsG0780037190.01.T01 AT3G09040 20.149 268 203 3 169 431 633 894 3.59e-12 69.3
MsG0780037190.01.T01 AT3G09040 22.689 357 223 15 91 419 36 367 5.14e-11 65.5
MsG0780037190.01.T01 AT5G27300 27.072 181 115 4 192 360 142 317 4.09e-12 68.6
MsG0780037190.01.T01 AT3G09040 20.149 268 203 3 169 431 608 869 4.28e-12 68.9
MsG0780037190.01.T01 AT3G09040 22.689 357 223 15 91 419 11 342 5.57e-11 65.5
MsG0780037190.01.T01 AT3G09040 20.149 268 203 3 169 431 608 869 4.28e-12 68.9
MsG0780037190.01.T01 AT3G09040 22.689 357 223 15 91 419 11 342 5.57e-11 65.5
MsG0780037190.01.T01 AT1G30610 23.673 245 161 6 160 396 598 824 4.76e-12 68.9
MsG0780037190.01.T01 AT4G08210 24.576 236 154 7 187 417 37 253 4.91e-12 68.6
MsG0780037190.01.T01 AT5G27300 29.530 149 92 2 220 360 174 317 5.05e-12 67.8
MsG0780037190.01.T01 AT1G28690 23.077 234 167 6 211 438 220 446 5.20e-12 68.2
MsG0780037190.01.T01 AT1G30610 23.223 211 155 5 188 396 591 796 5.81e-12 68.6
MsG0780037190.01.T01 AT5G16860 22.969 357 247 12 81 425 299 639 6.34e-12 68.6
MsG0780037190.01.T01 AT1G32415 24.155 207 135 5 189 395 107 291 7.18e-12 68.2
MsG0780037190.01.T01 AT1G32415 23.246 228 163 5 168 392 413 631 9.67e-12 67.8
MsG0780037190.01.T01 AT4G18750 21.530 353 252 7 76 425 330 660 7.43e-12 68.2
MsG0780037190.01.T01 AT1G68930 17.808 365 272 8 57 420 164 501 9.05e-12 67.8
MsG0780037190.01.T01 AT1G05750 24.498 249 165 7 222 458 67 304 9.72e-12 67.4
MsG0780037190.01.T01 AT1G05750 24.498 249 165 7 222 458 67 304 9.72e-12 67.4
MsG0780037190.01.T01 AT1G68930 17.808 365 272 8 57 420 190 527 1.11e-11 67.4
MsG0780037190.01.T01 AT1G71490 25.738 237 123 6 233 424 314 542 1.36e-11 67.4
MsG0780037190.01.T01 AT2G21090 21.892 370 251 10 53 415 125 463 1.75e-11 66.6
MsG0780037190.01.T01 AT1G22830 24.554 224 160 4 203 424 368 584 1.89e-11 66.6
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MsG0780037190.01.T01 AT1G56690 24.413 213 139 6 215 425 66 258 1.99e-11 66.6
MsG0780037190.01.T01 AT2G41080 23.684 228 158 4 217 442 35 248 2.08e-11 66.6
MsG0780037190.01.T01 AT5G66520 22.022 277 193 8 188 459 78 336 3.12e-11 65.9
MsG0780037190.01.T01 AT2G03880 27.778 162 106 5 218 378 287 438 3.16e-11 65.9
MsG0780037190.01.T01 AT5G27110 21.569 204 155 2 228 430 377 576 3.25e-11 66.2
MsG0780037190.01.T01 AT2G44880 22.266 256 182 5 189 442 80 320 4.88e-11 65.5
MsG0780037190.01.T01 AT2G44880 22.266 256 182 5 189 442 82 322 5.38e-11 65.1
MsG0780037190.01.T01 AT2G44880 22.266 256 182 5 189 442 82 322 5.38e-11 65.1
MsG0780037190.01.T01 AT2G44880 22.266 256 182 5 189 442 41 281 5.39e-11 65.1
MsG0780037190.01.T01 AT2G44880 22.266 256 182 5 189 442 81 321 5.47e-11 65.1
MsG0780037190.01.T01 AT2G44880 22.266 256 182 5 189 442 84 324 6.05e-11 65.1
MsG0780037190.01.T01 AT1G08070 20.724 304 221 6 145 446 125 410 6.54e-11 65.1
MsG0780037190.01.T01 AT4G21065 24.255 235 167 4 190 422 23 248 7.10e-11 64.7
MsG0780037190.01.T01 AT3G49142 22.835 254 186 5 170 421 221 466 7.49e-11 65.1
MsG0780037190.01.T01 AT4G38010 23.305 236 167 5 192 423 241 466 9.94e-11 64.3

Find 123 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 158 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TGCTTACCAATTAAAATTTA+AGG 0.080618 7:-21505118 None:intergenic
CATGAGAAACCATCAAATTT+AGG 0.159946 7:-21504173 None:intergenic
GATGAACGGTGAATCAAATT+AGG 0.197164 7:-21503793 None:intergenic
CATTGGAAAGCACACTTAAA+TGG 0.207598 7:+21505072 MsG0780037190.01.T01:CDS
AATTTAGGGTTTGACGAATT+AGG 0.229884 7:-21504158 None:intergenic
CTGCTTACAGACAGAGTTTA+GGG 0.245273 7:-21503699 None:intergenic
ATGAGAAACCATCAAATTTA+GGG 0.256526 7:-21504172 None:intergenic
CCTTGTATCATGTTTAGATA+TGG 0.258152 7:-21505623 None:intergenic
ATTTAGGGTTTGACGAATTA+GGG 0.268165 7:-21504157 None:intergenic
TTGAATACAGAAGCGGGTTT+TGG 0.274120 7:-21503886 None:intergenic
TTCTGAAACCCGACCAGATT+TGG 0.303577 7:-21504670 None:intergenic
TCGTCAAACCCTAAATTTGA+TGG 0.315619 7:+21504164 MsG0780037190.01.T01:CDS
AAAAGCAATGGAATCGTTAA+TGG 0.321846 7:-21504025 None:intergenic
GCTGCTTACAGACAGAGTTT+AGG 0.325025 7:-21503700 None:intergenic
GAAGGAATTGAAGATGCTTT+TGG 0.329259 7:-21503929 None:intergenic
GAGGTATAAGTTACCTCATC+AGG 0.331950 7:-21504735 None:intergenic
AGGATTGAAGAAGGGAATTA+TGG 0.332954 7:-21503987 None:intergenic
CTTCTTATGCTACGTTTGTA+AGG 0.359261 7:+21504955 MsG0780037190.01.T01:CDS
ACATATAACACGCTGCTTCA+TGG 0.359361 7:+21504852 MsG0780037190.01.T01:CDS
GTGTTATATGTGCACGTATT+CGG 0.361381 7:-21504840 None:intergenic
CTTGTATCATGTTTAGATAT+GGG 0.369720 7:-21505622 None:intergenic
GACAAGGCCGTGGAATTCTA+TGG 0.374138 7:+21504897 MsG0780037190.01.T01:CDS
GGATGGTCTAAAGCTTGATA+TGG 0.382548 7:+21504932 MsG0780037190.01.T01:CDS
TAAGTCTCGCACTTTGAGTT+TGG 0.392873 7:+21504353 MsG0780037190.01.T01:CDS
CATATAACACGCTGCTTCAT+GGG 0.396551 7:+21504853 MsG0780037190.01.T01:CDS
CTTGGCTGCATTGGCATTGT+TGG 0.397921 7:+21504791 MsG0780037190.01.T01:CDS
ATGAACGGTGAATCAAATTA+GGG 0.400427 7:-21503792 None:intergenic
AAATTGTAAGTGTAAATATC+AGG 0.402438 7:-21504312 None:intergenic
ATAGTATATGTAACAAGATT+AGG 0.408210 7:-21504420 None:intergenic
AGGGGAGACCTTGGCTGCAT+TGG 0.413842 7:+21504782 MsG0780037190.01.T01:CDS
GTACTGTTGATTTAGCTGTT+AGG 0.416435 7:+21504214 MsG0780037190.01.T01:CDS
AAGAAGGGAATTATGGAAAC+GGG 0.422237 7:-21503980 None:intergenic
ACTGCGTGTTATGGCTGAAA+AGG 0.422524 7:+21504704 MsG0780037190.01.T01:CDS
TGATGTTCAAAGGTGCTTCA+AGG 0.426249 7:-21505591 None:intergenic
TTGTTGGGTTTGGGAGAAGA+AGG 0.427701 7:-21503826 None:intergenic
TAAGAAGTTACTGCGTGTTA+TGG 0.429221 7:+21504695 MsG0780037190.01.T01:CDS
AATCAGTTGGTTTGCAGCAA+TGG 0.431340 7:-21504116 None:intergenic
ATCAGTTGGTTTGCAGCAAT+GGG 0.433394 7:-21504115 None:intergenic
CTTATACCTCTCTGATGAAT+GGG 0.435733 7:+21504748 MsG0780037190.01.T01:CDS
CTCTGATGAATGGGATGTGC+AGG 0.437616 7:+21504757 MsG0780037190.01.T01:CDS
ACTTATACCTCTCTGATGAA+TGG 0.450710 7:+21504747 MsG0780037190.01.T01:CDS
CATGGGGTCAGTCCTCATAA+AGG 0.457255 7:+21504192 MsG0780037190.01.T01:CDS
TTATGGAAACGGGAATCAAT+AGG 0.460607 7:-21503970 None:intergenic
AGTAGATTTGTCAGGTGAGA+AGG 0.463216 7:-21504076 None:intergenic
ACGGGAATCAATAGGAGTAT+TGG 0.474179 7:-21503962 None:intergenic
GTTGAATCCTTTGAATCAGT+TGG 0.475994 7:-21504129 None:intergenic
CTGGCTTAAAACCTTCCTCT+TGG 0.477352 7:-21504506 None:intergenic
GTATTATAAAGAAAACAATC+TGG 0.481323 7:-21504525 None:intergenic
ATTCTATGGTGCGATGAAAT+CGG 0.487913 7:+21504911 MsG0780037190.01.T01:CDS
CTAAATTTGATGGTTTCTCA+TGG 0.488333 7:+21504174 MsG0780037190.01.T01:CDS
TAAATTTGATGGTTTCTCAT+GGG 0.491017 7:+21504175 MsG0780037190.01.T01:CDS
TGGGTTATCCAAATCTGGTC+GGG 0.493982 7:+21504662 MsG0780037190.01.T01:CDS
GATGTTCAAAGGTGCTTCAA+GGG 0.498748 7:-21505590 None:intergenic
CATTCGATTATAAACCTCAA+TGG 0.501647 7:-21504589 None:intergenic
AATATCAGGACTACAATGCT+TGG 0.506907 7:-21504298 None:intergenic
CTGCAAACCAACTGATTCAA+AGG 0.507298 7:+21504122 MsG0780037190.01.T01:CDS
GTTGGAAGAGATGGAAATGA+AGG 0.507477 7:+21504809 MsG0780037190.01.T01:CDS
CAGAAGCGTAGGATTGAAGA+AGG 0.507949 7:-21503996 None:intergenic
CTTTATAATACAATTATGAA+AGG 0.509755 7:+21504537 MsG0780037190.01.T01:CDS
GGCTTGTTCTTGATGTTCAA+AGG 0.510272 7:-21505601 None:intergenic
TGAATGGGATGTGCAGGAAA+GGG 0.514093 7:+21504763 MsG0780037190.01.T01:CDS
GTTTGATTCCATATGAAAAG+TGG 0.514607 7:-21505702 None:intergenic
GAAGAAGGGAATTATGGAAA+CGG 0.516235 7:-21503981 None:intergenic
GAATGGGATGTGCAGGAAAG+GGG 0.518096 7:+21504764 MsG0780037190.01.T01:CDS
CCATATCTAAACATGATACA+AGG 0.518470 7:+21505623 MsG0780037190.01.T01:three_prime_UTR
TTCTTATGCTACGTTTGTAA+GGG 0.520676 7:+21504956 MsG0780037190.01.T01:CDS
TAGAGGGAGTGAGGCCATTG+AGG 0.521089 7:+21504575 MsG0780037190.01.T01:CDS
GAGAGTGCGGATCGAAATGA+AGG 0.521409 7:-21503766 None:intergenic
TGAGGTTTATAATCGAATGA+AGG 0.522423 7:+21504593 MsG0780037190.01.T01:CDS
ATGAATGGGATGTGCAGGAA+AGG 0.523795 7:+21504762 MsG0780037190.01.T01:CDS
GGTTATTGTATGCTGAGTAG+AGG 0.525160 7:+21504558 MsG0780037190.01.T01:CDS
CTGCGTGTTATGGCTGAAAA+GGG 0.527859 7:+21504705 MsG0780037190.01.T01:CDS
TTTGGCATCTTGGAGATTTG+GGG 0.528616 7:-21503911 None:intergenic
ATATGATAAGTAGATTTGTC+AGG 0.529876 7:-21504084 None:intergenic
TTGGGTTATCCAAATCTGGT+CGG 0.536093 7:+21504661 MsG0780037190.01.T01:CDS
GTTATTGTATGCTGAGTAGA+GGG 0.538051 7:+21504559 MsG0780037190.01.T01:CDS
AAATCAACAGTACCTTTATG+AGG 0.538546 7:-21504204 None:intergenic
GTGCAGGAAAGGGGAGACCT+TGG 0.540805 7:+21504773 MsG0780037190.01.T01:CDS
AAATTTGATGGTTTCTCATG+GGG 0.541567 7:+21504176 MsG0780037190.01.T01:CDS
GTATTATAAGTAATAAGATC+AGG 0.545312 7:-21504630 None:intergenic
GATTTGTCAGGTGAGAAGGA+AGG 0.547172 7:-21504072 None:intergenic
GCGTGAGGCGACGAGGTTGG+TGG 0.550458 7:+21504476 MsG0780037190.01.T01:CDS
CAAATTAGGGTTTGAGAGTG+CGG 0.552244 7:-21503779 None:intergenic
ATTGGCATTGTTGGAAGAGA+TGG 0.554560 7:+21504800 MsG0780037190.01.T01:CDS
GTGGATATTCTCCAAGAGGA+AGG 0.556241 7:+21504495 MsG0780037190.01.T01:CDS
GGGGATTTGAATACAGAAGC+GGG 0.556985 7:-21503892 None:intergenic
CAACAATGCCAATGCAGCCA+AGG 0.559946 7:-21504790 None:intergenic
TTCAAGAAAGCAAAAGAAGA+AGG 0.560988 7:+21505095 MsG0780037190.01.T01:CDS
GTAAGGGCACTGTGTAGTGT+TGG 0.563424 7:+21504972 MsG0780037190.01.T01:CDS
TAGGATGTTTGACAAGGCCG+TGG 0.566164 7:+21504887 MsG0780037190.01.T01:CDS
TGTCGCTGCTTACTCTACAT+TGG 0.566914 7:+21505055 MsG0780037190.01.T01:CDS
TATAATCGAATGAAGGAGAA+GGG 0.569470 7:+21504600 MsG0780037190.01.T01:CDS
TCGAATGAAGGAGAAGGGTG+TGG 0.575433 7:+21504605 MsG0780037190.01.T01:CDS
TTTGCGTGAGGCGACGAGGT+TGG 0.576574 7:+21504473 MsG0780037190.01.T01:CDS
GTCAGGTGAGAAGGAAGGAT+GGG 0.577186 7:-21504067 None:intergenic
TTATAATCGAATGAAGGAGA+AGG 0.583385 7:+21504599 MsG0780037190.01.T01:CDS
CGACTGAGTCTGATTGAACA+GGG 0.583545 7:-21505728 None:intergenic
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AGCAATGGAATCGTTAATGG+TGG 0.600571 7:-21504022 None:intergenic
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CRISPR-GE

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!!! AGATTATTCCACTTTTCATA+TGG + Chr7:21505694-21505713 MsG0780037190.01.T01:three_prime_UTR 25.0%
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! ATTTAGGGTTTGACGAATTA+GGG - Chr7:21504160-21504179 None:intergenic 30.0%
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!!! TGAGATTGTTGTTTTTGTTG+GGG - Chr7:21503862-21503881 None:intergenic 30.0%
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AATATCAGGACTACAATGCT+TGG - Chr7:21504301-21504320 None:intergenic 35.0%
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AGGTATAAGTTACCTCATCA+GGG - Chr7:21504737-21504756 None:intergenic 35.0%
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CATATGACGAAGAAAAGCAA+TGG - Chr7:21504040-21504059 None:intergenic 35.0%
CTTATACCTCTCTGATGAAT+GGG + Chr7:21504748-21504767 MsG0780037190.01.T01:CDS 35.0%
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GTGTTATATGTGCACGTATT+CGG - Chr7:21504843-21504862 None:intergenic 35.0%
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TTATGGAAACGGGAATCAAT+AGG - Chr7:21503973-21503992 None:intergenic 35.0%
TTGGAAGAGATGGAAATGAA+GGG + Chr7:21504810-21504829 MsG0780037190.01.T01:CDS 35.0%
! CATTGGAAAGCACACTTAAA+TGG + Chr7:21505072-21505091 MsG0780037190.01.T01:CDS 35.0%
! GAAGGAATTGAAGATGCTTT+TGG - Chr7:21503932-21503951 None:intergenic 35.0%
! TAAGTCTAGGATGTTTGACA+AGG + Chr7:21504881-21504900 MsG0780037190.01.T01:CDS 35.0%
! TTTTGGCATCTTGGAGATTT+GGG - Chr7:21503915-21503934 None:intergenic 35.0%
!! GTACTGTTGATTTAGCTGTT+AGG + Chr7:21504214-21504233 MsG0780037190.01.T01:CDS 35.0%
!!! GTTGTTTTTGTTGGGGTTTT+CGG - Chr7:21503855-21503874 None:intergenic 35.0%
!!! GTTTGTTTTGGGTTTAACTC+AGG + Chr7:21505492-21505511 MsG0780037190.01.T01:intron 35.0%
!!! TTGTTTTTGTTGGGGTTTTC+GGG - Chr7:21503854-21503873 None:intergenic 35.0%
AAGGAACGAAGAAAGCAACA+TGG + Chr7:21503732-21503751 MsG0780037190.01.T01:exon 40.0%
ACAATATTGCACGTTGAGGT+AGG - Chr7:21505257-21505276 None:intergenic 40.0%
ACATATAACACGCTGCTTCA+TGG + Chr7:21504852-21504871 MsG0780037190.01.T01:CDS 40.0%
AGCAATGGAATCGTTAATGG+TGG - Chr7:21504025-21504044 None:intergenic 40.0%
AGGAACGAAGAAAGCAACAT+GGG + Chr7:21503733-21503752 MsG0780037190.01.T01:exon 40.0%
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CAAATTAGGGTTTGAGAGTG+CGG - Chr7:21503782-21503801 None:intergenic 40.0%
CATAAGACTCGTAATACCTG+TGG + Chr7:21505431-21505450 MsG0780037190.01.T01:intron 40.0%
CATATAACACGCTGCTTCAT+GGG + Chr7:21504853-21504872 MsG0780037190.01.T01:CDS 40.0%
CTAATTGTAAGTACAGCCAC+AGG - Chr7:21505450-21505469 None:intergenic 40.0%
CTGCTTACAGACAGAGTTTA+GGG - Chr7:21503702-21503721 None:intergenic 40.0%
GAGGTATAAGTTACCTCATC+AGG - Chr7:21504738-21504757 None:intergenic 40.0%
GGTTATTGTATGCTGAGTAG+AGG + Chr7:21504558-21504577 MsG0780037190.01.T01:CDS 40.0%
GTTGGAAGAGATGGAAATGA+AGG + Chr7:21504809-21504828 MsG0780037190.01.T01:CDS 40.0%
TACCTCAACGTGCAATATTG+TGG + Chr7:21505256-21505275 MsG0780037190.01.T01:intron 40.0%
TGGGGATTTGAATACAGAAG+CGG - Chr7:21503896-21503915 None:intergenic 40.0%
TGTAAGCAGCATAAGTCTGA+AGG + Chr7:21503713-21503732 MsG0780037190.01.T01:five_prime_UTR 40.0%
TGTTTCAACAGTGCGTAAAG+TGG - Chr7:21505206-21505225 None:intergenic 40.0%
TTCCACAATATTGCACGTTG+AGG - Chr7:21505261-21505280 None:intergenic 40.0%
TTGGGTTATCCAAATCTGGT+CGG + Chr7:21504661-21504680 MsG0780037190.01.T01:CDS 40.0%
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! ACGGGAATCAATAGGAGTAT+TGG - Chr7:21503965-21503984 None:intergenic 40.0%
! AGAAGCGTAGGATTGAAGAA+GGG - Chr7:21503998-21504017 None:intergenic 40.0%
! AGTATTGGAACTGTTGACGA+AGG - Chr7:21503950-21503969 None:intergenic 40.0%
! CTGCAAACCAACTGATTCAA+AGG + Chr7:21504122-21504141 MsG0780037190.01.T01:CDS 40.0%
! CTTTTGGCATCTTGGAGATT+TGG - Chr7:21503916-21503935 None:intergenic 40.0%
! GGATGGTCTAAAGCTTGATA+TGG + Chr7:21504932-21504951 MsG0780037190.01.T01:CDS 40.0%
! GGCTTGTTCTTGATGTTCAA+AGG - Chr7:21505604-21505623 None:intergenic 40.0%
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! TTCATGGGTTGTGTAAGTCT+AGG + Chr7:21504868-21504887 MsG0780037190.01.T01:CDS 40.0%
!! AATCAGTTGGTTTGCAGCAA+TGG - Chr7:21504119-21504138 None:intergenic 40.0%
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!! GATGTTCAAAGGTGCTTCAA+GGG - Chr7:21505593-21505612 None:intergenic 40.0%
!! GTGTAGTGTTGGTAGAATTG+CGG + Chr7:21504983-21505002 MsG0780037190.01.T01:CDS 40.0%
!! TGATGTTCAAAGGTGCTTCA+AGG - Chr7:21505594-21505613 None:intergenic 40.0%
!! TTGAATACAGAAGCGGGTTT+TGG - Chr7:21503889-21503908 None:intergenic 40.0%
!!! AGGGACAAAGAAGTGCTTTT+AGG + Chr7:21505643-21505662 MsG0780037190.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
!!! TTTCGGGTTTTGTTGGGTTT+GGG - Chr7:21503838-21503857 None:intergenic 40.0%
!!! TTTTCGGGTTTTGTTGGGTT+TGG - Chr7:21503839-21503858 None:intergenic 40.0%
AAAGGGTCATTTCCCTGATG+AGG + Chr7:21504722-21504741 MsG0780037190.01.T01:CDS 45.0%
ACGGTTTCTATTTCGCTCGA+GGG + Chr7:21505140-21505159 MsG0780037190.01.T01:intron 45.0%
ACTGCGTGTTATGGCTGAAA+AGG + Chr7:21504704-21504723 MsG0780037190.01.T01:CDS 45.0%
ATGAATGGGATGTGCAGGAA+AGG + Chr7:21504762-21504781 MsG0780037190.01.T01:CDS 45.0%
CATCGCACCATAGAATTCCA+CGG - Chr7:21504907-21504926 None:intergenic 45.0%
CTGCGTGTTATGGCTGAAAA+GGG + Chr7:21504705-21504724 MsG0780037190.01.T01:CDS 45.0%
CTGGCTTAAAACCTTCCTCT+TGG - Chr7:21504509-21504528 None:intergenic 45.0%
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GTGGATATTCTCCAAGAGGA+AGG + Chr7:21504495-21504514 MsG0780037190.01.T01:CDS 45.0%
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TGGGTTATCCAAATCTGGTC+GGG + Chr7:21504662-21504681 MsG0780037190.01.T01:CDS 45.0%
TGTCGCTGCTTACTCTACAT+TGG + Chr7:21505055-21505074 MsG0780037190.01.T01:CDS 45.0%
TTGTTGGGTTTGGGAGAAGA+AGG - Chr7:21503829-21503848 None:intergenic 45.0%
! AATGGTGGAAACAGAAGCGT+AGG - Chr7:21504010-21504029 None:intergenic 45.0%
! CAGAAGCGTAGGATTGAAGA+AGG - Chr7:21503999-21504018 None:intergenic 45.0%
! GTTGGTGGATATTCTCCAAG+AGG + Chr7:21504491-21504510 MsG0780037190.01.T01:CDS 45.0%
!! TTCTGAAACCCGACCAGATT+TGG - Chr7:21504673-21504692 None:intergenic 45.0%
!!! TGGGGTTTTCGGGTTTTGTT+GGG - Chr7:21503844-21503863 None:intergenic 45.0%
!!! TTGGGGTTTTCGGGTTTTGT+TGG - Chr7:21503845-21503864 None:intergenic 45.0%
AGTGCGGATCGAAATGAAGG+AGG - Chr7:21503766-21503785 None:intergenic 50.0%
CAACAATGCCAATGCAGCCA+AGG - Chr7:21504793-21504812 None:intergenic 50.0%
CACGGTTTCTATTTCGCTCG+AGG + Chr7:21505139-21505158 MsG0780037190.01.T01:intron 50.0%
CATGGGGTCAGTCCTCATAA+AGG + Chr7:21504192-21504211 MsG0780037190.01.T01:CDS 50.0%
CTCTGATGAATGGGATGTGC+AGG + Chr7:21504757-21504776 MsG0780037190.01.T01:CDS 50.0%
GAATGGGATGTGCAGGAAAG+GGG + Chr7:21504764-21504783 MsG0780037190.01.T01:CDS 50.0%
GACAAGGCCGTGGAATTCTA+TGG + Chr7:21504897-21504916 MsG0780037190.01.T01:CDS 50.0%
GCACATCCCATTCATCAGAG+AGG - Chr7:21504757-21504776 None:intergenic 50.0%
GTCAGGTGAGAAGGAAGGAT+GGG - Chr7:21504070-21504089 None:intergenic 50.0%
TAGGATGTTTGACAAGGCCG+TGG + Chr7:21504887-21504906 MsG0780037190.01.T01:CDS 50.0%
TATGCTGAGTAGAGGGAGTG+AGG + Chr7:21504566-21504585 MsG0780037190.01.T01:CDS 50.0%
TCGAATGAAGGAGAAGGGTG+TGG + Chr7:21504605-21504624 MsG0780037190.01.T01:CDS 50.0%
TGTCAGGTGAGAAGGAAGGA+TGG - Chr7:21504071-21504090 None:intergenic 50.0%
! CTTGGCTGCATTGGCATTGT+TGG + Chr7:21504791-21504810 MsG0780037190.01.T01:CDS 50.0%
! GAGAGTGCGGATCGAAATGA+AGG - Chr7:21503769-21503788 None:intergenic 50.0%
!! GTAAGGGCACTGTGTAGTGT+TGG + Chr7:21504972-21504991 MsG0780037190.01.T01:CDS 50.0%
AGAATTTGCGTGAGGCGACG+AGG + Chr7:21504469-21504488 MsG0780037190.01.T01:CDS 55.0%
TAGAGGGAGTGAGGCCATTG+AGG + Chr7:21504575-21504594 MsG0780037190.01.T01:CDS 55.0%
AGGGGAGACCTTGGCTGCAT+TGG + Chr7:21504782-21504801 MsG0780037190.01.T01:CDS 60.0%
GTGCAGGAAAGGGGAGACCT+TGG + Chr7:21504773-21504792 MsG0780037190.01.T01:CDS 60.0%
TTTGCGTGAGGCGACGAGGT+TGG + Chr7:21504473-21504492 MsG0780037190.01.T01:CDS 60.0%
GCGTGAGGCGACGAGGTTGG+TGG + Chr7:21504476-21504495 MsG0780037190.01.T01:CDS 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 21503688 21505735 21503688 ID=MsG0780037190.01;Name=MsG0780037190.01
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Chr7 exon 21503688 21505130 21503688 ID=MsG0780037190.01.T01:exon:5321;Parent=MsG0780037190.01.T01
Chr7 exon 21505579 21505735 21505579 ID=MsG0780037190.01.T01:exon:5322;Parent=MsG0780037190.01.T01
Chr7 five_prime_UTR 21503688 21503750 21503688 ID=MsG0780037190.01.T01:five_prime_utr;Parent=MsG0780037190.01.T01
Chr7 CDS 21503751 21505130 21503751 ID=MsG0780037190.01.T01:cds;Parent=MsG0780037190.01.T01
Chr7 three_prime_UTR 21505579 21505735 21505579 ID=MsG0780037190.01.T01:three_prime_utr;Parent=MsG0780037190.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780037190.01.T01

ATGGGAAAAATTCCTCCTTCATTTCGATCCGCACTCTCAAACCCTAATTTGATTCACCGTTCATCTTCATTGATTCCTTCTTCTCCCAAACCCAACAAAACCCGAAAACCCCAACAAAAACAACAATCTCAATCTCCAAAACCCGCTTCTGTATTCAAATCCCCAAATCTCCAAGATGCCAAAAGCATCTTCAATTCCTTCGTCAACAGTTCCAATACTCCTATTGATTCCCGTTTCCATAATTCCCTTCTTCAATCCTACGCTTCTGTTTCCACCATTAACGATTCCATTGCTTTTCTTCGTCATATGACAAAGACCCATCCTTCCTTCTCACCTGACAAATCTACTTATCATATCTTACTTACCCATTGCTGCAAACCAACTGATTCAAAGGATTCAACACTTTCCCTAATTCGTCAAACCCTAAATTTGATGGTTTCTCATGGGGTCAGTCCTCATAAAGGTACTGTTGATTTAGCTGTTAGGTCACTTTGTACTGCTGCTGATCGTGTTGACGATGCTGTTGAATTGATCAAAGAGCTGTCTTCCAAGCATTGTAGTCCTGATATTTACACTTACAATTTTCTTGTTAAGAATTTATGTAAGTCTCGCACTTTGAGTTTGGTTTATGCTTTTATTGATGAAATGCGTACTAAGTTTGATGTCAAGCCTAATCTTGTTACATATACTATTTTGATTGATAATGTCTGTAACACTAAGAATTTGCGTGAGGCGACGAGGTTGGTGGATATTCTCCAAGAGGAAGGTTTTAAGCCAGATTGTTTTCTTTATAATACAATTATGAAAGGTTATTGTATGCTGAGTAGAGGGAGTGAGGCCATTGAGGTTTATAATCGAATGAAGGAGAAGGGTGTGGAGCCTGATCTTATTACTTATAATACTTTGATTTTTGGGTTATCCAAATCTGGTCGGGTTTCAGAAGCTAAGAAGTTACTGCGTGTTATGGCTGAAAAGGGTCATTTCCCTGATGAGGTAACTTATACCTCTCTGATGAATGGGATGTGCAGGAAAGGGGAGACCTTGGCTGCATTGGCATTGTTGGAAGAGATGGAAATGAAGGGCTGCAGTCCGAATACGTGCACATATAACACGCTGCTTCATGGGTTGTGTAAGTCTAGGATGTTTGACAAGGCCGTGGAATTCTATGGTGCGATGAAATCGGATGGTCTAAAGCTTGATATGGCTTCTTATGCTACGTTTGTAAGGGCACTGTGTAGTGTTGGTAGAATTGCGGATGCTTATGAAGTGTTTGATTATGCAGTTGAAAGCAAGAGTTTGACAGATGTCGCTGCTTACTCTACATTGGAAAGCACACTTAAATGGTTCAAGAAAGCAAAAGAAGAAGGCCTTAAATTTTAA
Protein sequence

>MsG0780037190.01.T01

MGKIPPSFRSALSNPNLIHRSSSLIPSSPKPNKTRKPQQKQQSQSPKPASVFKSPNLQDAKSIFNSFVNSSNTPIDSRFHNSLLQSYASVSTINDSIAFLRHMTKTHPSFSPDKSTYHILLTHCCKPTDSKDSTLSLIRQTLNLMVSHGVSPHKGTVDLAVRSLCTAADRVDDAVELIKELSSKHCSPDIYTYNFLVKNLCKSRTLSLVYAFIDEMRTKFDVKPNLVTYTILIDNVCNTKNLREATRLVDILQEEGFKPDCFLYNTIMKGYCMLSRGSEAIEVYNRMKEKGVEPDLITYNTLIFGLSKSGRVSEAKKLLRVMAEKGHFPDEVTYTSLMNGMCRKGETLAALALLEEMEMKGCSPNTCTYNTLLHGLCKSRMFDKAVEFYGAMKSDGLKLDMASYATFVRALCSVGRIADAYEVFDYAVESKSLTDVAAYSTLESTLKWFKKAKEEGLKF*