AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780038082.01

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MsG0780038082.01.T01 AT4G39400 28.236 1066 547 36 46 942 39 1055 9.04e-90 311
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MsG0780038082.01.T01 AT2G24130 32.558 559 327 16 70 608 69 597 2.41e-45 177
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MsG0780038082.01.T01 AT1G62950 28.750 720 439 14 280 942 80 782 3.99e-67 242
MsG0780038082.01.T01 AT1G62950 29.400 500 297 11 38 534 28 474 5.28e-39 157
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MsG0780038082.01.T01 AT1G34420 31.280 422 248 10 94 487 168 575 8.22e-36 147
MsG0780038082.01.T01 AT1G34420 30.269 446 271 8 213 654 96 505 2.17e-34 142
MsG0780038082.01.T01 AT1G34420 29.236 537 300 17 61 534 56 575 5.39e-34 141
MsG0780038082.01.T01 AT3G51740 29.341 668 371 16 309 942 106 706 5.63e-62 226
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MsG0780038082.01.T01 AT1G17240 26.667 375 194 11 5 332 362 702 5.16e-12 70.5
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MsG0780038082.01.T01 AT4G22730 29.130 460 253 13 484 882 82 529 1.86e-43 166
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MsG0780038082.01.T01 AT1G74180 30.556 468 274 17 218 671 132 562 9.63e-31 131
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MsG0780038082.01.T01 AT1G16110 41.081 185 103 3 761 942 423 604 2.78e-34 140
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MsG0780038082.01.T01 AT5G40170 27.932 469 266 18 258 672 49 499 2.28e-18 90.9
MsG0780038082.01.T01 AT4G32000 36.893 206 123 2 737 942 143 341 3.19e-34 137
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MsG0780038082.01.T01 AT4G13810 29.235 366 198 12 105 415 87 446 2.23e-26 115
MsG0780038082.01.T01 AT4G13810 26.415 371 186 9 360 677 56 392 6.27e-15 79.3
MsG0780038082.01.T01 AT4G13810 38.393 112 66 1 87 198 335 443 9.27e-12 69.3
MsG0780038082.01.T01 AT5G37450 34.420 276 153 4 313 568 69 336 3.69e-34 142
MsG0780038082.01.T01 AT5G37450 31.511 311 197 8 61 358 50 357 1.93e-26 117
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MsG0780038082.01.T01 AT5G14210 28.472 288 176 5 131 417 93 351 1.94e-18 91.3
MsG0780038082.01.T01 AT5G14210 30.719 153 106 0 518 670 94 246 8.47e-13 73.2
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MsG0780038082.01.T01 AT1G01540 38.919 185 108 3 760 942 144 325 2.09e-32 132
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MsG0780038082.01.T01 AT1G68690 39.891 183 104 4 761 942 368 545 5.60e-32 134
MsG0780038082.01.T01 AT2G19210 30.130 385 210 13 565 942 413 745 5.70e-32 134
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MsG0780038082.01.T01 AT1G53430 27.700 213 142 2 275 487 106 306 1.15e-15 82.4
MsG0780038082.01.T01 AT1G07650 39.474 190 109 3 756 942 670 856 1.53e-31 134
MsG0780038082.01.T01 AT1G07650 30.579 242 133 5 103 314 116 352 4.41e-20 97.1
MsG0780038082.01.T01 AT1G07650 29.091 275 123 4 468 670 94 368 2.24e-19 94.7
MsG0780038082.01.T01 AT1G07650 28.402 338 204 8 392 699 95 424 1.29e-18 92.0
MsG0780038082.01.T01 AT1G07650 29.851 268 175 7 126 386 91 352 6.67e-16 83.2
MsG0780038082.01.T01 AT1G07650 27.273 330 203 8 199 525 95 390 1.53e-13 75.5
MsG0780038082.01.T01 AT1G07650 39.474 190 109 3 756 942 638 824 1.56e-31 133
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MsG0780038082.01.T01 AT1G07650 29.924 264 149 6 81 314 89 346 1.55e-20 98.2
MsG0780038082.01.T01 AT1G07650 29.323 266 116 4 477 670 97 362 1.17e-18 92.0
MsG0780038082.01.T01 AT1G07650 27.742 310 187 8 219 525 109 384 1.73e-13 75.5
MsG0780038082.01.T01 AT1G07650 31.852 135 91 1 521 655 94 227 2.16e-13 75.1
MsG0780038082.01.T01 AT4G22130 26.966 445 265 12 540 942 1 427 1.62e-31 131
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MsG0780038082.01.T01 AT1G07650 39.474 190 109 3 756 942 664 850 1.67e-31 133
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MsG0780038082.01.T01 AT1G56720 39.785 186 105 4 760 942 169 350 8.40e-31 128
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MsG0780038082.01.T01 AT1G21210 36.979 192 116 3 753 942 392 580 1.67e-30 129
MsG0780038082.01.T01 AT1G49100 29.016 386 220 10 565 942 413 752 1.67e-30 130
MsG0780038082.01.T01 AT5G20050 36.735 196 108 5 757 942 92 281 1.70e-30 126
MsG0780038082.01.T01 AT5G12940 29.759 373 207 8 26 391 23 347 1.71e-30 124
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MsG0780038082.01.T01 AT4G28670 38.919 185 101 4 765 942 326 505 2.43e-30 128
MsG0780038082.01.T01 AT1G29750 39.153 189 110 3 756 942 667 852 2.50e-30 129
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MsG0780038082.01.T01 AT1G09440 39.247 186 106 4 760 942 147 328 2.52e-30 126
MsG0780038082.01.T01 AT4G23180 37.838 185 108 3 761 942 339 519 2.58e-30 128
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MsG0780038082.01.T01 AT1G29750 39.153 189 110 3 756 942 652 837 3.47e-30 129
MsG0780038082.01.T01 AT1G29750 28.613 346 188 6 243 588 101 387 3.25e-22 103
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MsG0780038082.01.T01 AT1G29750 32.526 289 179 8 347 632 87 362 7.64e-22 102
MsG0780038082.01.T01 AT1G29750 30.847 295 179 10 78 362 81 360 1.85e-19 94.7
MsG0780038082.01.T01 AT5G10520 39.130 184 107 3 761 942 144 324 3.52e-30 125
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MsG0780038082.01.T01 AT2G42960 38.503 187 108 4 759 942 172 354 3.69e-30 126
MsG0780038082.01.T01 AT2G42960 38.503 187 108 4 759 942 172 354 3.69e-30 126
MsG0780038082.01.T01 AT4G11530 36.216 185 113 3 760 942 342 523 3.74e-30 128
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MsG0780038082.01.T01 AT2G43700 35.638 188 114 4 757 942 299 481 4.97e-30 127
MsG0780038082.01.T01 AT2G43700 35.638 188 114 4 757 942 299 481 4.97e-30 127
MsG0780038082.01.T01 AT1G11300 37.912 182 108 3 763 942 487 665 5.06e-30 128
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MsG0780038082.01.T01 AT4G00330 39.412 170 95 3 757 922 106 271 5.80e-30 124
MsG0780038082.01.T01 AT3G18810 37.097 186 112 3 758 942 325 506 5.86e-30 127
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MsG0780038082.01.T01 AT4G23190 31.855 248 146 7 701 942 213 443 1.09e-29 125
MsG0780038082.01.T01 AT4G23190 31.855 248 146 7 701 942 213 443 1.09e-29 125
MsG0780038082.01.T01 AT5G16900 27.865 384 226 8 561 942 224 558 1.14e-29 126
MsG0780038082.01.T01 AT4G04960 36.316 190 114 5 757 942 334 520 1.17e-29 125
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Find 192 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 231 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
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TTTAGGGACAATGATCTTTC+TGG 0.191761 7:+39739990 MsG0780038082.01.T01:CDS
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GGTAATAGTCTTTCCATTAA+TGG 0.210319 7:+39739705 MsG0780038082.01.T01:CDS
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TGGCCAACTTTCCTAGAAAA+TGG 0.219457 7:-39739806 None:intergenic
TTGGAGGATAGGACCATTAA+TGG 0.220440 7:-39739718 None:intergenic
TATGACCTGATATATTATTA+TGG 0.222334 7:-39740442 None:intergenic
TTCCATGAGAAACATTTAAT+TGG 0.222879 7:+39741316 MsG0780038082.01.T01:CDS
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TTGTTGTCATATTTGTATTT+AGG 0.226156 7:+39739535 MsG0780038082.01.T01:CDS
TTCCCAACTTCAAAATTTCT+TGG 0.231028 7:-39739737 None:intergenic
AGGAATTGTGACTTATGTTT+AGG 0.234900 7:-39739258 None:intergenic
TTCAACTGTGTTAGCATTGA+TGG 0.236793 7:-39740824 None:intergenic
ATGTTTAGGGTTTGGATATT+TGG 0.238426 7:-39739244 None:intergenic
GGAAATATAACACAAGATTT+TGG 0.247704 7:+39740314 MsG0780038082.01.T01:CDS
GTTTGGACAACATTCCAATA+TGG 0.248739 7:-39739300 None:intergenic
CTTGAAAGAGTTAAGGTTTA+GGG 0.266590 7:+39739974 MsG0780038082.01.T01:CDS
ATAAGTCACAATTCCTTAAA+TGG 0.273410 7:+39739265 MsG0780038082.01.T01:CDS
GGAAGTATTCCTTCCCATAT+TGG 0.276960 7:+39739286 MsG0780038082.01.T01:CDS
CTTAATTCACCTATTTCTTC+AGG 0.280122 7:-39739439 None:intergenic
TAGTGTCCCAACAGCTATAA+AGG 0.282326 7:-39741128 None:intergenic
ATCAACTGTGTTATTTCATA+TGG 0.283687 7:-39739367 None:intergenic
TATTTCTACAGGAATGTTTC+CGG 0.292699 7:-39740597 None:intergenic
GGTCAAGTCTAAGTTGGTTT+TGG 0.293592 7:-39740277 None:intergenic
ATCAAGCAAGAATATTCTTC+TGG 0.298436 7:+39741705 MsG0780038082.01.T01:CDS
GACAAGTTGCTTAACTCCTT+TGG 0.298846 7:-39740539 None:intergenic
CTCAAAATGTATTTACAATA+TGG 0.301692 7:+39741242 MsG0780038082.01.T01:CDS
GGAATTGTGACTTATGTTTA+GGG 0.306164 7:-39739257 None:intergenic
TATTTCACATAATAATCTTT+CGG 0.310554 7:+39740865 MsG0780038082.01.T01:CDS
TTGCAAATTTGCCTAAGATA+TGG 0.311562 7:+39740690 MsG0780038082.01.T01:CDS
CGTAATATTGTGAAGTTGTA+TGG 0.312489 7:+39741487 MsG0780038082.01.T01:CDS
GGGCAATGATGAAGCTTGTT+AGG 0.313002 7:-39740421 None:intergenic
TTGCATTTGATTGGAACAAT+AGG 0.317035 7:+39741602 MsG0780038082.01.T01:CDS
ATCTCATTTGCATGCACATT+TGG 0.318648 7:+39741799 MsG0780038082.01.T01:CDS
AAGAAGCAATTGCATTTGAT+TGG 0.319939 7:+39741593 MsG0780038082.01.T01:CDS
CTTGACCAAAACCAACTTAC+TGG 0.322573 7:+39740293 MsG0780038082.01.T01:CDS
GTAGGATTCCTGTGGAAATT+GGG 0.324646 7:+39739940 MsG0780038082.01.T01:CDS
AAATGTTGGTCAAATTGATT+TGG 0.328471 7:+39740043 MsG0780038082.01.T01:CDS
AAGATCAAGATGAGCAAGTT+TGG 0.329087 7:-39739317 None:intergenic
AAATTTAAGTTCCATATCTT+AGG 0.329692 7:-39740701 None:intergenic
CTTCAAAGCCTTGATCTTAG+TGG 0.333127 7:+39740779 MsG0780038082.01.T01:CDS
ATTATTTGATGCAAGGTCTA+AGG 0.338590 7:-39740642 None:intergenic
ACAGGAAGGTGGCCAGAAAT+AGG 0.339099 7:-39739858 None:intergenic
TATTTCCAGTAAGTTGGTTT+TGG 0.344642 7:-39740298 None:intergenic
CGGACACCTTTCATCCAATT+GGG 0.347933 7:+39740385 MsG0780038082.01.T01:CDS
AATAGGAAGGGCACCAAACT+TGG 0.354400 7:+39740475 MsG0780038082.01.T01:CDS
ACTTGAAAGAGTTAAGGTTT+AGG 0.354521 7:+39739973 MsG0780038082.01.T01:CDS
GTTGTTGCTTATCAAAAGAT+TGG 0.355047 7:-39740567 None:intergenic
ACGGACACCTTTCATCCAAT+TGG 0.356345 7:+39740384 MsG0780038082.01.T01:CDS
TGTGACTTATGTTTAGGGTT+TGG 0.357880 7:-39739252 None:intergenic
GGTCATATACCACCAGAAAT+AGG 0.362376 7:+39740458 MsG0780038082.01.T01:CDS
TTTACAATATGGAACTTTGA+TGG 0.362512 7:+39741253 MsG0780038082.01.T01:CDS
AGATTCCATTTCTGTCTCTA+AGG 0.365830 7:+39739162 MsG0780038082.01.T01:CDS
AATATTACGATGTCGAATTT+CGG 0.368062 7:-39741473 None:intergenic
CTTAGTGACAATCTTCTATC+AGG 0.372592 7:+39739337 MsG0780038082.01.T01:CDS
CTGTGGAAATTGGAAAGTTA+AGG 0.380229 7:+39739877 MsG0780038082.01.T01:CDS
GGTTCCATTCCTGAAGAAAT+AGG 0.381937 7:+39739430 MsG0780038082.01.T01:CDS
GTGGCTTGTGTCTCGGACTT+TGG 0.382350 7:+39741739 MsG0780038082.01.T01:CDS
GTTCGTAGAGAAAGGTAGTA+TGG 0.384198 7:+39741549 MsG0780038082.01.T01:CDS
TGCTGATAAAGTACGTAGTT+GGG 0.385115 7:-39739020 None:intergenic
AAGATAGCAAAACTTGGCTT+TGG 0.386256 7:-39739090 None:intergenic
TGCATTTGATTGGAACAATA+GGG 0.389474 7:+39741603 MsG0780038082.01.T01:CDS
TAAGGTCTCAAGCTCATCTA+AGG 0.392286 7:-39740624 None:intergenic
CTTGCATCAAATAATTTAAG+TGG 0.395294 7:+39740650 MsG0780038082.01.T01:CDS
GATATATCTCTGTGAACAAT+TGG 0.406873 7:-39741685 None:intergenic
TGGTGAACTTGAAAGAGTTA+AGG 0.408288 7:+39739967 MsG0780038082.01.T01:CDS
ATGACCTGATATATTATTAT+GGG 0.410248 7:-39740441 None:intergenic
GGTGAAATCCCACCGACAAT+TGG 0.410681 7:+39740083 MsG0780038082.01.T01:CDS
TTACTGAAAGCTCGAATGTC+AGG 0.415571 7:-39740968 None:intergenic
ATTGCCCATAATAATATATC+AGG 0.417545 7:+39740437 MsG0780038082.01.T01:CDS
CACTAAGATCAAGGCTTTGA+AGG 0.418472 7:-39740778 None:intergenic
TCTTCTGGATTTAGAATATG+TGG 0.423532 7:+39741720 MsG0780038082.01.T01:CDS
CCTCACAACATTTGCATTGG+TGG 0.428984 7:+39740236 MsG0780038082.01.T01:CDS
GAGAAACATTTAATTGGAGT+TGG 0.429830 7:+39741322 MsG0780038082.01.T01:CDS
TGGTGGGAATTTGAAATACT+TGG 0.432467 7:+39740253 MsG0780038082.01.T01:CDS
TTTGGACAACATTCCAATAT+GGG 0.437840 7:-39739299 None:intergenic
GTTTATGAGTTCGTAGAGAA+AGG 0.440686 7:+39741541 MsG0780038082.01.T01:CDS
TTTCGCCATTTGCCACTGAA+TGG 0.444160 7:-39741408 None:intergenic
GTGTTATATTTCCAGTAAGT+TGG 0.444639 7:-39740304 None:intergenic
GTCGAATTTCGGTTAGAGCT+TGG 0.445500 7:-39741462 None:intergenic
ATTTACCTTAGAGACAGAAA+TGG 0.446390 7:-39739167 None:intergenic
AAGTCAAGTAAACCCAAGTT+TGG 0.448785 7:-39740488 None:intergenic
TTCAATGCTTGATGTTGGGC+AGG 0.449815 7:-39741053 None:intergenic
ATGTTTCTCATGGAAATCTT+CGG 0.450826 7:-39741308 None:intergenic
TTGCTGATAAAGTACGTAGT+TGG 0.452692 7:-39739021 None:intergenic
AAGCAAGTGCTTTGTTGAAG+TGG 0.454651 7:+39739050 MsG0780038082.01.T01:CDS
AAGGTAAATCTCACAAATAT+GGG 0.456428 7:+39739181 MsG0780038082.01.T01:CDS
TTCACCTATTTCTTCAGGAA+TGG 0.456757 7:-39739434 None:intergenic
TTAAGAAAATTCATTTCCAT+TGG 0.461948 7:-39740164 None:intergenic
TTCAAAATTTCTTGGAGGAT+AGG 0.463112 7:-39739729 None:intergenic
ATATATGATAATGACTTCAT+TGG 0.464085 7:+39740206 MsG0780038082.01.T01:CDS
TGACTCAAGTTTCCAATTGT+CGG 0.466034 7:-39740095 None:intergenic
CCAACTTCAAAATTTCTTGG+AGG 0.469891 7:-39739734 None:intergenic
AAACATTTAATTGGAGTTGG+AGG 0.472101 7:+39741325 MsG0780038082.01.T01:CDS
CTCCAATTAAATGTTTCTCA+TGG 0.473566 7:-39741318 None:intergenic
TCTAAGGATGATATTTCTAC+AGG 0.475530 7:-39740608 None:intergenic
GTCAGATTCCCAATGGAAGT+TGG 0.476788 7:-39739511 None:intergenic
TGATATATCATATAACCAAT+TGG 0.477098 7:+39740934 MsG0780038082.01.T01:CDS
ACAAAAGGATAGCAGCTTCA+AGG 0.479092 7:-39738954 None:intergenic
ACCACCAACGAAAACCAGTC+TGG 0.479167 7:+39741202 MsG0780038082.01.T01:CDS
ATCTCAAATGCAAATATCAC+AGG 0.479641 7:+39739481 MsG0780038082.01.T01:CDS
CAGATAGAGACTCTTGATCT+TGG 0.480867 7:+39739681 MsG0780038082.01.T01:CDS
GGCCTGTGTGGTAATGTCTC+TGG 0.483513 7:+39741022 MsG0780038082.01.T01:CDS
GTGGCAATAATTCATGCAAA+TGG 0.486233 7:+39739119 MsG0780038082.01.T01:CDS
CACTTAAATTATTTGATGCA+AGG 0.486593 7:-39740649 None:intergenic
GAAGTGTTGAGAAATAATAA+AGG 0.486960 7:+39741001 MsG0780038082.01.T01:CDS
TCAGATTCCCAATGGAAGTT+GGG 0.490149 7:-39739510 None:intergenic
GGGACTATCCCAACTTCCAT+TGG 0.490525 7:+39739502 MsG0780038082.01.T01:CDS
TTAATTGGAGTTGGAGGGCA+TGG 0.494185 7:+39741331 MsG0780038082.01.T01:CDS
GCTAACACAGTTGAAATACT+TGG 0.497998 7:+39740832 MsG0780038082.01.T01:CDS
AAAGAAGTAGCCAAAACAAA+AGG 0.499944 7:-39738969 None:intergenic
CAATTGGAGGTGAGCAATCA+TGG 0.500227 7:-39741669 None:intergenic
AGTGTCCCAACAGCTATAAA+GGG 0.503830 7:-39741127 None:intergenic
CTCACAAATATGGGATTGAA+AGG 0.504165 7:+39739190 MsG0780038082.01.T01:CDS
AAGCTCCATTCAGTGGCAAA+TGG 0.507502 7:+39741403 MsG0780038082.01.T01:CDS
CAGGGAGTGAACCCTCCAAT+TGG 0.510990 7:-39740949 None:intergenic
CTTAACTTTCCAATTTCCAC+AGG 0.511434 7:-39739876 None:intergenic
TTGAGTCATAACAAATTCAC+AGG 0.512424 7:+39740722 MsG0780038082.01.T01:CDS
GAGATTCAATGCTTGATGTT+GGG 0.513396 7:-39741057 None:intergenic
TTGTCATATTTGTATTTAGG+AGG 0.517129 7:+39739538 MsG0780038082.01.T01:CDS
CAGGAATGTTTCCGGAGAGA+TGG 0.521218 7:-39740589 None:intergenic
TTTGCTCAAAACCATCTCAA+TGG 0.523035 7:+39740134 MsG0780038082.01.T01:CDS
ATAGCAGCTTCAAGGATTGA+AGG 0.523511 7:-39738946 None:intergenic
AGAATATGTGGCTTGTGTCT+CGG 0.523531 7:+39741732 MsG0780038082.01.T01:CDS
CTGCCTCACAACATTTGCAT+TGG 0.525891 7:+39740233 MsG0780038082.01.T01:CDS
CTCACAACATTTGCATTGGT+GGG 0.527428 7:+39740237 MsG0780038082.01.T01:CDS
TTGACAATAACTTATCTGGT+AGG 0.529951 7:+39739922 MsG0780038082.01.T01:CDS
TTGGTAATTTGCCATTGAGA+TGG 0.532446 7:-39740145 None:intergenic
ATAGAGACTCTTGATCTTGG+TGG 0.533588 7:+39739684 MsG0780038082.01.T01:CDS
TGAGATTCAATGCTTGATGT+TGG 0.533771 7:-39741058 None:intergenic
TAGGATTCCTGTGGAAATTG+GGG 0.534059 7:+39739941 MsG0780038082.01.T01:CDS
TTATCTTCAAACTATCTCAC+GGG 0.537165 7:+39740509 MsG0780038082.01.T01:CDS
ACTTTCCCCAATTGGATGAA+AGG 0.540040 7:-39740391 None:intergenic
AATAATTCATGCAAATGGCT+TGG 0.541495 7:+39739124 MsG0780038082.01.T01:CDS
AATTGTGTTGGAAAACATTG+TGG 0.542356 7:+39741279 MsG0780038082.01.T01:CDS
AACATTTAATTGGAGTTGGA+GGG 0.542469 7:+39741326 MsG0780038082.01.T01:CDS
GGTGCCCTTCCTATTTCTGG+TGG 0.543164 7:-39740467 None:intergenic
CAATGATGTTCTCTCCAGAC+TGG 0.543284 7:-39741216 None:intergenic
GGACTATCCCAACTTCCATT+GGG 0.544389 7:+39739503 MsG0780038082.01.T01:CDS
ATAAGCAACAACCATCTCTC+CGG 0.550290 7:+39740578 MsG0780038082.01.T01:CDS
ACATTTGGTTATGCTGCACC+AGG 0.552111 7:+39741814 MsG0780038082.01.T01:CDS
CTTATCTTCAAACTATCTCA+CGG 0.554561 7:+39740508 MsG0780038082.01.T01:CDS
TAAATTTAGATATGACAAGT+TGG 0.560740 7:-39739826 None:intergenic
CTCAAGTTTCCAATTGTCGG+TGG 0.560902 7:-39740092 None:intergenic
TCCATGAAGATAGCAAAACT+TGG 0.562794 7:-39739096 None:intergenic
CTCAGTATTCCAATTTCACG+AGG 0.565139 7:-39740020 None:intergenic
ACTTTCCAATTTCCACAGGA+AGG 0.568935 7:-39739872 None:intergenic
GACAACATTCCAATATGGGA+AGG 0.571870 7:-39739295 None:intergenic
ATAGGAAGGGCACCAAACTT+GGG 0.571892 7:+39740476 MsG0780038082.01.T01:CDS
ATTGGAATACTGAGAAATGT+TGG 0.571998 7:+39740029 MsG0780038082.01.T01:CDS
CTACAAAGCAATGTTGCACA+CGG 0.576148 7:+39741360 MsG0780038082.01.T01:CDS
TATTTCTGGCCACCTTCCTG+TGG 0.578399 7:+39739860 MsG0780038082.01.T01:CDS
TTTCTCATGGAAATCTTCGG+TGG 0.580736 7:-39741305 None:intergenic
TTTGGCTACTTCTTTCAATG+TGG 0.586094 7:+39738977 MsG0780038082.01.T01:CDS
TCTCAATGGCAAATTACCAA+TGG 0.587848 7:+39740148 MsG0780038082.01.T01:CDS
ATATACCACCAGAAATAGGA+AGG 0.589955 7:+39740462 MsG0780038082.01.T01:CDS
TCAATGCTTGATGTTGGGCA+GGG 0.599918 7:-39741052 None:intergenic
TCAAGTTTCCAATTGTCGGT+GGG 0.600256 7:-39740091 None:intergenic
ATATCTCTGTGAACAATTGG+AGG 0.601272 7:-39741682 None:intergenic
GTTTGAAAATAGGAATCTCA+TGG 0.602465 7:-39738924 None:intergenic
GGACACCTTTCATCCAATTG+GGG 0.603097 7:+39740386 MsG0780038082.01.T01:CDS
TTCCAATTTCCACAGGAAGG+TGG 0.605738 7:-39739869 None:intergenic
TATATCATATAACCAATTGG+AGG 0.607552 7:+39740937 MsG0780038082.01.T01:CDS
GCTGATAAAGTACGTAGTTG+GGG 0.617250 7:-39739019 None:intergenic
CAACAAGGTCAGATTCCCAA+TGG 0.617608 7:-39739518 None:intergenic
ATATCATATAACCAATTGGA+GGG 0.620219 7:+39740938 MsG0780038082.01.T01:CDS
TACTGAAAGCTCGAATGTCA+GGG 0.621056 7:-39740967 None:intergenic
CTTATCTGGTAGGATTCCTG+TGG 0.635254 7:+39739932 MsG0780038082.01.T01:CDS
AGAAATAATAAAGGCCTGTG+TGG 0.635682 7:+39741010 MsG0780038082.01.T01:CDS
GAGCATTTGATCAAAGCTAG+AGG 0.637191 7:-39740897 None:intergenic
AGGATTCCTGTGGAAATTGG+GGG 0.640120 7:+39739942 MsG0780038082.01.T01:CDS
AGCATTTGATCAAAGCTAGA+GGG 0.656419 7:-39740896 None:intergenic
CCACCAATGCAAATGTTGTG+AGG 0.658569 7:-39740236 None:intergenic
GACCAGAGACATTACCACAC+AGG 0.665397 7:-39741024 None:intergenic
TACAAAGCAATGTTGCACAC+GGG 0.682081 7:+39741361 MsG0780038082.01.T01:CDS
TCTCACGGGGAAAATTCCAA+AGG 0.682575 7:+39740523 MsG0780038082.01.T01:CDS
TCTCAAATGCAAATATCACA+GGG 0.686442 7:+39739482 MsG0780038082.01.T01:CDS
TAAATACAAATATGACAACA+AGG 0.687682 7:-39739533 None:intergenic
TATACCACCAGAAATAGGAA+GGG 0.718640 7:+39740463 MsG0780038082.01.T01:CDS
TATCTTCAAACTATCTCACG+GGG 0.719045 7:+39740510 MsG0780038082.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! GTTGAATTAAATAAAATTAA+TGG + Chr7:39739624-39739643 MsG0780038082.01.T01:intron 10.0%
!! AAATCTATGTAATTCAAATT+TGG - Chr7:39740347-39740366 None:intergenic 15.0%
!! TATTTCACATAATAATCTTT+CGG + Chr7:39740865-39740884 MsG0780038082.01.T01:CDS 15.0%
!!! AATGAATTTTCTTAACAATT+TGG + Chr7:39740172-39740191 MsG0780038082.01.T01:CDS 15.0%
!!! ATTTAATTCAACTCTAAAAT+AGG - Chr7:39739616-39739635 None:intergenic 15.0%
!!! TAATCTTCAAACTTATATTT+TGG + Chr7:39739390-39739409 MsG0780038082.01.T01:CDS 15.0%
!!! TTAAGTGAAAACAATTTTTA+CGG + Chr7:39740365-39740384 MsG0780038082.01.T01:CDS 15.0%
!! ATGACCTGATATATTATTAT+GGG - Chr7:39740444-39740463 None:intergenic 20.0%
!! ATTTCACATAATAATCTTTC+GGG + Chr7:39740866-39740885 MsG0780038082.01.T01:CDS 20.0%
!! CTCAAAATGTATTTACAATA+TGG + Chr7:39741242-39741261 MsG0780038082.01.T01:CDS 20.0%
!! TAAATACAAATATGACAACA+AGG - Chr7:39739536-39739555 None:intergenic 20.0%
!! TAAATTTAGATATGACAAGT+TGG - Chr7:39739829-39739848 None:intergenic 20.0%
!! TATGACCTGATATATTATTA+TGG - Chr7:39740445-39740464 None:intergenic 20.0%
!! TGATATATCATATAACCAAT+TGG + Chr7:39740934-39740953 MsG0780038082.01.T01:CDS 20.0%
!! TTAAGAAAATTCATTTCCAT+TGG - Chr7:39740167-39740186 None:intergenic 20.0%
!! TTGTTGTCATATTTGTATTT+AGG + Chr7:39739535-39739554 MsG0780038082.01.T01:CDS 20.0%
!!! AAATTTAAGTTCCATATCTT+AGG - Chr7:39740704-39740723 None:intergenic 20.0%
!!! ATATATGATAATGACTTCAT+TGG + Chr7:39740206-39740225 MsG0780038082.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATTTGTGAAAGATTTTAGAT+TGG - Chr7:39741437-39741456 None:intergenic 20.0%
!!! ATTTTTGACAATAACTTATC+TGG + Chr7:39739918-39739937 MsG0780038082.01.T01:CDS 20.0%
!!! CATATTGTAAATACATTTTG+AGG - Chr7:39741244-39741263 None:intergenic 20.0%
!!! TGAAATTTTCCAAATTCAAT+AGG - Chr7:39740755-39740774 None:intergenic 20.0%
!!! TTGGATAATAATCTTTTTAG+TGG + Chr7:39739409-39739428 MsG0780038082.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTGTGAAAGATTTTAGATT+GGG - Chr7:39741436-39741455 None:intergenic 20.0%
! AAAAATTTCCACTAAGATCA+AGG - Chr7:39740790-39740809 None:intergenic 25.0%
! AAATGTTGGTCAAATTGATT+TGG + Chr7:39740043-39740062 MsG0780038082.01.T01:CDS 25.0%
! AAGGTAAATCTCACAAATAT+GGG + Chr7:39739181-39739200 MsG0780038082.01.T01:CDS 25.0%
! AATATTACGATGTCGAATTT+CGG - Chr7:39741476-39741495 None:intergenic 25.0%
! ATAAGTCACAATTCCTTAAA+TGG + Chr7:39739265-39739284 MsG0780038082.01.T01:CDS 25.0%
! ATATCATATAACCAATTGGA+GGG + Chr7:39740938-39740957 MsG0780038082.01.T01:CDS 25.0%
! ATTGCCCATAATAATATATC+AGG + Chr7:39740437-39740456 MsG0780038082.01.T01:CDS 25.0%
! CACTTAAATTATTTGATGCA+AGG - Chr7:39740652-39740671 None:intergenic 25.0%
! CATTGCATTGAAAAAAAGAA+AGG - Chr7:39739773-39739792 None:intergenic 25.0%
! CTTGCATCAAATAATTTAAG+TGG + Chr7:39740650-39740669 MsG0780038082.01.T01:CDS 25.0%
! GGAAATATTCCTATTGAATT+TGG + Chr7:39740743-39740762 MsG0780038082.01.T01:CDS 25.0%
! TAAGGTAAATCTCACAAATA+TGG + Chr7:39739180-39739199 MsG0780038082.01.T01:CDS 25.0%
! TATATCATATAACCAATTGG+AGG + Chr7:39740937-39740956 MsG0780038082.01.T01:CDS 25.0%
! TTCCATGAGAAACATTTAAT+TGG + Chr7:39741316-39741335 MsG0780038082.01.T01:CDS 25.0%
! TTGTCATATTTGTATTTAGG+AGG + Chr7:39739538-39739557 MsG0780038082.01.T01:CDS 25.0%
! TTTACAATATGGAACTTTGA+TGG + Chr7:39741253-39741272 MsG0780038082.01.T01:CDS 25.0%
!! GGAAATATAACACAAGATTT+TGG + Chr7:39740314-39740333 MsG0780038082.01.T01:CDS 25.0%
!! TTCAAATTCCAAAGTTCTTT+TGG - Chr7:39739586-39739605 None:intergenic 25.0%
!!! ATCAACTGTGTTATTTCATA+TGG - Chr7:39739370-39739389 None:intergenic 25.0%
!!! CTTAGTGGAAATTTTTTGTA+TGG + Chr7:39740794-39740813 MsG0780038082.01.T01:CDS 25.0%
!!! GAAGTGTTGAGAAATAATAA+AGG + Chr7:39741001-39741020 MsG0780038082.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTTTTTCAATGCAATGTCA+GGG + Chr7:39739776-39739795 MsG0780038082.01.T01:CDS 25.0%
AAACATTTAATTGGAGTTGG+AGG + Chr7:39741325-39741344 MsG0780038082.01.T01:CDS 30.0%
AAAGAAGTAGCCAAAACAAA+AGG - Chr7:39738972-39738991 None:intergenic 30.0%
AACATTTAATTGGAGTTGGA+GGG + Chr7:39741326-39741345 MsG0780038082.01.T01:CDS 30.0%
AAGAAGCAATTGCATTTGAT+TGG + Chr7:39741593-39741612 MsG0780038082.01.T01:CDS 30.0%
AAGCATTAGCTACATCTTTA+AGG - Chr7:39741636-39741655 None:intergenic 30.0%
AATAATTCATGCAAATGGCT+TGG + Chr7:39739124-39739143 MsG0780038082.01.T01:CDS 30.0%
AATTGTGTTGGAAAACATTG+TGG + Chr7:39741279-39741298 MsG0780038082.01.T01:CDS 30.0%
ACTTGAAAGAGTTAAGGTTT+AGG + Chr7:39739973-39739992 MsG0780038082.01.T01:CDS 30.0%
AGGAATTGTGACTTATGTTT+AGG - Chr7:39739261-39739280 None:intergenic 30.0%
AGGATTGAAGGTTTGAAAAT+AGG - Chr7:39738937-39738956 None:intergenic 30.0%
ATCAAGCAAGAATATTCTTC+TGG + Chr7:39741705-39741724 MsG0780038082.01.T01:CDS 30.0%
ATCTCAAATGCAAATATCAC+AGG + Chr7:39739481-39739500 MsG0780038082.01.T01:CDS 30.0%
ATGTTTCTCATGGAAATCTT+CGG - Chr7:39741311-39741330 None:intergenic 30.0%
ATTATTTGATGCAAGGTCTA+AGG - Chr7:39740645-39740664 None:intergenic 30.0%
ATTGGAATACTGAGAAATGT+TGG + Chr7:39740029-39740048 MsG0780038082.01.T01:CDS 30.0%
ATTTACCTTAGAGACAGAAA+TGG - Chr7:39739170-39739189 None:intergenic 30.0%
CGTAATATTGTGAAGTTGTA+TGG + Chr7:39741487-39741506 MsG0780038082.01.T01:CDS 30.0%
CTCCAATTAAATGTTTCTCA+TGG - Chr7:39741321-39741340 None:intergenic 30.0%
CTTATCTTCAAACTATCTCA+CGG + Chr7:39740508-39740527 MsG0780038082.01.T01:CDS 30.0%
CTTGAAAGAGTTAAGGTTTA+GGG + Chr7:39739974-39739993 MsG0780038082.01.T01:CDS 30.0%
CTTTGATGGAAAAATTGTGT+TGG + Chr7:39741267-39741286 MsG0780038082.01.T01:CDS 30.0%
GAGAAACATTTAATTGGAGT+TGG + Chr7:39741322-39741341 MsG0780038082.01.T01:CDS 30.0%
GATATATCTCTGTGAACAAT+TGG - Chr7:39741688-39741707 None:intergenic 30.0%
GGAATTGTGACTTATGTTTA+GGG - Chr7:39739260-39739279 None:intergenic 30.0%
GGTAATAGTCTTTCCATTAA+TGG + Chr7:39739705-39739724 MsG0780038082.01.T01:CDS 30.0%
GTAACATTCCAAAAGAACTT+TGG + Chr7:39739575-39739594 MsG0780038082.01.T01:intron 30.0%
GTGTTATATTTCCAGTAAGT+TGG - Chr7:39740307-39740326 None:intergenic 30.0%
TCTCAAATGCAAATATCACA+GGG + Chr7:39739482-39739501 MsG0780038082.01.T01:CDS 30.0%
TGCATTTGATTGGAACAATA+GGG + Chr7:39741603-39741622 MsG0780038082.01.T01:CDS 30.0%
TTATCTTCAAACTATCTCAC+GGG + Chr7:39740509-39740528 MsG0780038082.01.T01:CDS 30.0%
TTCAAAATTTCTTGGAGGAT+AGG - Chr7:39739732-39739751 None:intergenic 30.0%
TTCCCAACTTCAAAATTTCT+TGG - Chr7:39739740-39739759 None:intergenic 30.0%
TTGACAATAACTTATCTGGT+AGG + Chr7:39739922-39739941 MsG0780038082.01.T01:CDS 30.0%
TTGAGTCATAACAAATTCAC+AGG + Chr7:39740722-39740741 MsG0780038082.01.T01:CDS 30.0%
TTGCAAATTTGCCTAAGATA+TGG + Chr7:39740690-39740709 MsG0780038082.01.T01:CDS 30.0%
TTGCATTTGATTGGAACAAT+AGG + Chr7:39741602-39741621 MsG0780038082.01.T01:CDS 30.0%
TTTGGACAACATTCCAATAT+GGG - Chr7:39739302-39739321 None:intergenic 30.0%
! ATGTTTAGGGTTTGGATATT+TGG - Chr7:39739247-39739266 None:intergenic 30.0%
! CTTAATTCACCTATTTCTTC+AGG - Chr7:39739442-39739461 None:intergenic 30.0%
! GTTGTTGCTTATCAAAAGAT+TGG - Chr7:39740570-39740589 None:intergenic 30.0%
! TATTTCTACAGGAATGTTTC+CGG - Chr7:39740600-39740619 None:intergenic 30.0%
! TCTAAGGATGATATTTCTAC+AGG - Chr7:39740611-39740630 None:intergenic 30.0%
! TCTTCTGGATTTAGAATATG+TGG + Chr7:39741720-39741739 MsG0780038082.01.T01:CDS 30.0%
!! ATTCCATTTTCTAGGAAAGT+TGG + Chr7:39739803-39739822 MsG0780038082.01.T01:CDS 30.0%
!!! CTCCAAGAAATTTTGAAGTT+GGG + Chr7:39739735-39739754 MsG0780038082.01.T01:CDS 30.0%
!!! CTTTTGGAATGTTACCATAA+AGG - Chr7:39739570-39739589 None:intergenic 30.0%
!!! CTTTTTTTCAATGCAATGTC+AGG + Chr7:39739775-39739794 MsG0780038082.01.T01:CDS 30.0%
!!! TATTTCCAGTAAGTTGGTTT+TGG - Chr7:39740301-39740320 None:intergenic 30.0%
!!! TTTTTTCAATGCAATGTCAG+GGG + Chr7:39739777-39739796 MsG0780038082.01.T01:CDS 30.0%
AAGATAGCAAAACTTGGCTT+TGG - Chr7:39739093-39739112 None:intergenic 35.0%
AAGATCAAGATGAGCAAGTT+TGG - Chr7:39739320-39739339 None:intergenic 35.0%
AAGTCAAGTAAACCCAAGTT+TGG - Chr7:39740491-39740510 None:intergenic 35.0%
AGAAATAATAAAGGCCTGTG+TGG + Chr7:39741010-39741029 MsG0780038082.01.T01:CDS 35.0%
AGATTCCATTTCTGTCTCTA+AGG + Chr7:39739162-39739181 MsG0780038082.01.T01:CDS 35.0%
AGCATTTGATCAAAGCTAGA+GGG - Chr7:39740899-39740918 None:intergenic 35.0%
ATATACCACCAGAAATAGGA+AGG + Chr7:39740462-39740481 MsG0780038082.01.T01:CDS 35.0%
ATATCTCTGTGAACAATTGG+AGG - Chr7:39741685-39741704 None:intergenic 35.0%
ATCTCATTTGCATGCACATT+TGG + Chr7:39741799-39741818 MsG0780038082.01.T01:CDS 35.0%
CCAACTTCAAAATTTCTTGG+AGG - Chr7:39739737-39739756 None:intergenic 35.0%
CTCACAAATATGGGATTGAA+AGG + Chr7:39739190-39739209 MsG0780038082.01.T01:CDS 35.0%
CTGTGGAAATTGGAAAGTTA+AGG + Chr7:39739877-39739896 MsG0780038082.01.T01:CDS 35.0%
CTTAACTTTCCAATTTCCAC+AGG - Chr7:39739879-39739898 None:intergenic 35.0%
CTTAGTGACAATCTTCTATC+AGG + Chr7:39739337-39739356 MsG0780038082.01.T01:CDS 35.0%
GAGATTCAATGCTTGATGTT+GGG - Chr7:39741060-39741079 None:intergenic 35.0%
GCTAACACAGTTGAAATACT+TGG + Chr7:39740832-39740851 MsG0780038082.01.T01:CDS 35.0%
GGAAGGAATACTTCCATTTA+AGG - Chr7:39739281-39739300 None:intergenic 35.0%
GTGGCAATAATTCATGCAAA+TGG + Chr7:39739119-39739138 MsG0780038082.01.T01:CDS 35.0%
GTTTATGAGTTCGTAGAGAA+AGG + Chr7:39741541-39741560 MsG0780038082.01.T01:CDS 35.0%
GTTTGGACAACATTCCAATA+TGG - Chr7:39739303-39739322 None:intergenic 35.0%
TATACCACCAGAAATAGGAA+GGG + Chr7:39740463-39740482 MsG0780038082.01.T01:CDS 35.0%
TATCTTCAAACTATCTCACG+GGG + Chr7:39740510-39740529 MsG0780038082.01.T01:CDS 35.0%
TCCATGAAGATAGCAAAACT+TGG - Chr7:39739099-39739118 None:intergenic 35.0%
TCTCAATGGCAAATTACCAA+TGG + Chr7:39740148-39740167 MsG0780038082.01.T01:CDS 35.0%
TGACTCAAGTTTCCAATTGT+CGG - Chr7:39740098-39740117 None:intergenic 35.0%
TGAGATTCAATGCTTGATGT+TGG - Chr7:39741061-39741080 None:intergenic 35.0%
TGCTGATAAAGTACGTAGTT+GGG - Chr7:39739023-39739042 None:intergenic 35.0%
TGGTGAACTTGAAAGAGTTA+AGG + Chr7:39739967-39739986 MsG0780038082.01.T01:CDS 35.0%
TTAGCACACAATCCTATTTC+TGG + Chr7:39739846-39739865 MsG0780038082.01.T01:CDS 35.0%
TTAGGAGGAAACAACCTTTA+TGG + Chr7:39739553-39739572 MsG0780038082.01.T01:CDS 35.0%
TTGCTGATAAAGTACGTAGT+TGG - Chr7:39739024-39739043 None:intergenic 35.0%
TTGGACAATAACTCTCTTTC+AGG + Chr7:39740062-39740081 MsG0780038082.01.T01:CDS 35.0%
TTTAGGGACAATGATCTTTC+TGG + Chr7:39739990-39740009 MsG0780038082.01.T01:CDS 35.0%
TTTGCTCAAAACCATCTCAA+TGG + Chr7:39740134-39740153 MsG0780038082.01.T01:CDS 35.0%
TTTGGCTACTTCTTTCAATG+TGG + Chr7:39738977-39738996 MsG0780038082.01.T01:CDS 35.0%
! ATGGATTTTGCACACATTCT+TGG + Chr7:39741506-39741525 MsG0780038082.01.T01:CDS 35.0%
! TGGTGGGAATTTGAAATACT+TGG + Chr7:39740253-39740272 MsG0780038082.01.T01:CDS 35.0%
! TGTGACTTATGTTTAGGGTT+TGG - Chr7:39739255-39739274 None:intergenic 35.0%
! TTCAACTGTGTTAGCATTGA+TGG - Chr7:39740827-39740846 None:intergenic 35.0%
! TTCACCTATTTCTTCAGGAA+TGG - Chr7:39739437-39739456 None:intergenic 35.0%
! TTGGTAATTTGCCATTGAGA+TGG - Chr7:39740148-39740167 None:intergenic 35.0%
! TTTTGCCCTTTATAGCTGTT+GGG + Chr7:39741122-39741141 MsG0780038082.01.T01:CDS 35.0%
!! AAGCTGCTATCCTTTTGTTT+TGG + Chr7:39738959-39738978 MsG0780038082.01.T01:CDS 35.0%
!!! ACATTCTTGGTTGTCGTTTT+TGG + Chr7:39741519-39741538 MsG0780038082.01.T01:CDS 35.0%
!!! CCTCCAAGAAATTTTGAAGT+TGG + Chr7:39739734-39739753 MsG0780038082.01.T01:CDS 35.0%
ACAAAAGGATAGCAGCTTCA+AGG - Chr7:39738957-39738976 None:intergenic 40.0%
ACTTTCCAATTTCCACAGGA+AGG - Chr7:39739875-39739894 None:intergenic 40.0%
ACTTTCCCCAATTGGATGAA+AGG - Chr7:39740394-39740413 None:intergenic 40.0%
AGTGTCCCAACAGCTATAAA+GGG - Chr7:39741130-39741149 None:intergenic 40.0%
ATAAGCAACAACCATCTCTC+CGG + Chr7:39740578-39740597 MsG0780038082.01.T01:CDS 40.0%
ATAGAGACTCTTGATCTTGG+TGG + Chr7:39739684-39739703 MsG0780038082.01.T01:CDS 40.0%
ATAGCAGCTTCAAGGATTGA+AGG - Chr7:39738949-39738968 None:intergenic 40.0%
CAGATAGAGACTCTTGATCT+TGG + Chr7:39739681-39739700 MsG0780038082.01.T01:CDS 40.0%
CTACAAAGCAATGTTGCACA+CGG + Chr7:39741360-39741379 MsG0780038082.01.T01:CDS 40.0%
CTCAGTATTCCAATTTCACG+AGG - Chr7:39740023-39740042 None:intergenic 40.0%
CTTCAAAGCCTTGATCTTAG+TGG + Chr7:39740779-39740798 MsG0780038082.01.T01:CDS 40.0%
CTTGACCAAAACCAACTTAC+TGG + Chr7:39740293-39740312 MsG0780038082.01.T01:CDS 40.0%
GACAACATTCCAATATGGGA+AGG - Chr7:39739298-39739317 None:intergenic 40.0%
GACAAGTTGCTTAACTCCTT+TGG - Chr7:39740542-39740561 None:intergenic 40.0%
GAGCATTTGATCAAAGCTAG+AGG - Chr7:39740900-39740919 None:intergenic 40.0%
GCTGATAAAGTACGTAGTTG+GGG - Chr7:39739022-39739041 None:intergenic 40.0%
GGTCATATACCACCAGAAAT+AGG + Chr7:39740458-39740477 MsG0780038082.01.T01:CDS 40.0%
GGTTCCATTCCTGAAGAAAT+AGG + Chr7:39739430-39739449 MsG0780038082.01.T01:CDS 40.0%
GTAGGATTCCTGTGGAAATT+GGG + Chr7:39739940-39739959 MsG0780038082.01.T01:CDS 40.0%
GTTCGTAGAGAAAGGTAGTA+TGG + Chr7:39741549-39741568 MsG0780038082.01.T01:CDS 40.0%
TAAGGTCTCAAGCTCATCTA+AGG - Chr7:39740627-39740646 None:intergenic 40.0%
TACAAAGCAATGTTGCACAC+GGG + Chr7:39741361-39741380 MsG0780038082.01.T01:CDS 40.0%
TACTGAAAGCTCGAATGTCA+GGG - Chr7:39740970-39740989 None:intergenic 40.0%
TAGGATTCCTGTGGAAATTG+GGG + Chr7:39739941-39739960 MsG0780038082.01.T01:CDS 40.0%
TAGTGTCCCAACAGCTATAA+AGG - Chr7:39741131-39741150 None:intergenic 40.0%
TCAAGTTTCCAATTGTCGGT+GGG - Chr7:39740094-39740113 None:intergenic 40.0%
TCAGATTCCCAATGGAAGTT+GGG - Chr7:39739513-39739532 None:intergenic 40.0%
TGGCCAACTTTCCTAGAAAA+TGG - Chr7:39739809-39739828 None:intergenic 40.0%
TGTGAAAAAGCTCCATTCAG+TGG + Chr7:39741396-39741415 MsG0780038082.01.T01:CDS 40.0%
TTACTGAAAGCTCGAATGTC+AGG - Chr7:39740971-39740990 None:intergenic 40.0%
TTGGAGGATAGGACCATTAA+TGG - Chr7:39739721-39739740 None:intergenic 40.0%
TTTCTCATGGAAATCTTCGG+TGG - Chr7:39741308-39741327 None:intergenic 40.0%
! AAGCAAGTGCTTTGTTGAAG+TGG + Chr7:39739050-39739069 MsG0780038082.01.T01:CDS 40.0%
! AGAATATGTGGCTTGTGTCT+CGG + Chr7:39741732-39741751 MsG0780038082.01.T01:CDS 40.0%
! AGGGGTCTATTCCATTTTCT+AGG + Chr7:39739795-39739814 MsG0780038082.01.T01:CDS 40.0%
! CACTAAGATCAAGGCTTTGA+AGG - Chr7:39740781-39740800 None:intergenic 40.0%
! CTCACAACATTTGCATTGGT+GGG + Chr7:39740237-39740256 MsG0780038082.01.T01:CDS 40.0%
! GTTTTGCCCTTTATAGCTGT+TGG + Chr7:39741121-39741140 MsG0780038082.01.T01:CDS 40.0%
!! GCCAAGTTTTGCTATCTTCA+TGG + Chr7:39739095-39739114 MsG0780038082.01.T01:CDS 40.0%
!! GGAAGTATTCCTTCCCATAT+TGG + Chr7:39739286-39739305 MsG0780038082.01.T01:CDS 40.0%
!! GGTTTTGGTCAAGTCTAAGT+TGG - Chr7:39740286-39740305 None:intergenic 40.0%
!! GTTTTGACACTTTCCCCAAT+TGG - Chr7:39740402-39740421 None:intergenic 40.0%
!! GTTTTGCTATCTTCATGGAG+TGG + Chr7:39739100-39739119 MsG0780038082.01.T01:CDS 40.0%
!!! GCTTTTTCACAGCAACTACT+TGG - Chr7:39741387-39741406 None:intergenic 40.0%
!!! GGTCAAGTCTAAGTTGGTTT+TGG - Chr7:39740280-39740299 None:intergenic 40.0%
AAGCTCCATTCAGTGGCAAA+TGG + Chr7:39741403-39741422 MsG0780038082.01.T01:CDS 45.0%
ACATTTGGTTATGCTGCACC+AGG + Chr7:39741814-39741833 MsG0780038082.01.T01:CDS 45.0%
ACGGACACCTTTCATCCAAT+TGG + Chr7:39740384-39740403 MsG0780038082.01.T01:CDS 45.0%
AGGATTCCTGTGGAAATTGG+GGG + Chr7:39739942-39739961 MsG0780038082.01.T01:CDS 45.0%
CAACAAGGTCAGATTCCCAA+TGG - Chr7:39739521-39739540 None:intergenic 45.0%
CAATGATGTTCTCTCCAGAC+TGG - Chr7:39741219-39741238 None:intergenic 45.0%
CAATTGGAGGTGAGCAATCA+TGG - Chr7:39741672-39741691 None:intergenic 45.0%
CCACCAATGCAAATGTTGTG+AGG - Chr7:39740239-39740258 None:intergenic 45.0%
CCTCACAACATTTGCATTGG+TGG + Chr7:39740236-39740255 MsG0780038082.01.T01:CDS 45.0%
CGGACACCTTTCATCCAATT+GGG + Chr7:39740385-39740404 MsG0780038082.01.T01:CDS 45.0%
CTCAAGTTTCCAATTGTCGG+TGG - Chr7:39740095-39740114 None:intergenic 45.0%
CTGCCTCACAACATTTGCAT+TGG + Chr7:39740233-39740252 MsG0780038082.01.T01:CDS 45.0%
CTTATCTGGTAGGATTCCTG+TGG + Chr7:39739932-39739951 MsG0780038082.01.T01:CDS 45.0%
GGACACCTTTCATCCAATTG+GGG + Chr7:39740386-39740405 MsG0780038082.01.T01:CDS 45.0%
GGACTATCCCAACTTCCATT+GGG + Chr7:39739503-39739522 MsG0780038082.01.T01:CDS 45.0%
GGTAGGATTCCTGTGGAAAT+TGG + Chr7:39739939-39739958 MsG0780038082.01.T01:CDS 45.0%
GGTTCGATTCCTCGTGAAAT+TGG + Chr7:39740011-39740030 MsG0780038082.01.T01:CDS 45.0%
GTCAGATTCCCAATGGAAGT+TGG - Chr7:39739514-39739533 None:intergenic 45.0%
GTCGAATTTCGGTTAGAGCT+TGG - Chr7:39741465-39741484 None:intergenic 45.0%
TCAATGCTTGATGTTGGGCA+GGG - Chr7:39741055-39741074 None:intergenic 45.0%
TCTCACGGGGAAAATTCCAA+AGG + Chr7:39740523-39740542 MsG0780038082.01.T01:CDS 45.0%
TTAATTGGAGTTGGAGGGCA+TGG + Chr7:39741331-39741350 MsG0780038082.01.T01:CDS 45.0%
TTCAATGCTTGATGTTGGGC+AGG - Chr7:39741056-39741075 None:intergenic 45.0%
TTCCAATTTCCACAGGAAGG+TGG - Chr7:39739872-39739891 None:intergenic 45.0%
TTTCGCCATTTGCCACTGAA+TGG - Chr7:39741411-39741430 None:intergenic 45.0%
! GGGCAATGATGAAGCTTGTT+AGG - Chr7:39740424-39740443 None:intergenic 45.0%
!! AATAGGAAGGGCACCAAACT+TGG + Chr7:39740475-39740494 MsG0780038082.01.T01:CDS 45.0%
!! ATAGGAAGGGCACCAAACTT+GGG + Chr7:39740476-39740495 MsG0780038082.01.T01:CDS 45.0%
!! TTTGGTGCCCTTCCTATTTC+TGG - Chr7:39740473-39740492 None:intergenic 45.0%
!! TTGAATTAAATAAAATTAAT+GGG + Chr7:39739625-39739644 MsG0780038082.01.T01:intron 5.0%
ACAGGAAGGTGGCCAGAAAT+AGG - Chr7:39739861-39739880 None:intergenic 50.0%
ACCAATCCCCCAATTTCCAC+AGG - Chr7:39739951-39739970 None:intergenic 50.0%
ACCACCAACGAAAACCAGTC+TGG + Chr7:39741202-39741221 MsG0780038082.01.T01:CDS 50.0%
CAGGAATGTTTCCGGAGAGA+TGG - Chr7:39740592-39740611 None:intergenic 50.0%
GACCAGAGACATTACCACAC+AGG - Chr7:39741027-39741046 None:intergenic 50.0%
GGGACTATCCCAACTTCCAT+TGG + Chr7:39739502-39739521 MsG0780038082.01.T01:CDS 50.0%
GGTGAAATCCCACCGACAAT+TGG + Chr7:39740083-39740102 MsG0780038082.01.T01:CDS 50.0%
TCCTGTGGAAATTGGGGGAT+TGG + Chr7:39739947-39739966 MsG0780038082.01.T01:CDS 50.0%
!! TATTTCTGGCCACCTTCCTG+TGG + Chr7:39739860-39739879 MsG0780038082.01.T01:CDS 50.0%
!!! CTCTCCAGACTGGTTTTCGT+TGG - Chr7:39741209-39741228 None:intergenic 50.0%
!!! TCCAGACTGGTTTTCGTTGG+TGG - Chr7:39741206-39741225 None:intergenic 50.0%
CAGGGAGTGAACCCTCCAAT+TGG - Chr7:39740952-39740971 None:intergenic 55.0%
GGCCACCTTCCTGTGGAAAT+TGG + Chr7:39739867-39739886 MsG0780038082.01.T01:CDS 55.0%
! GGCCTGTGTGGTAATGTCTC+TGG + Chr7:39741022-39741041 MsG0780038082.01.T01:CDS 55.0%
! GTGGCTTGTGTCTCGGACTT+TGG + Chr7:39741739-39741758 MsG0780038082.01.T01:CDS 55.0%
!! GGTGCCCTTCCTATTTCTGG+TGG - Chr7:39740470-39740489 None:intergenic 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 39738926 39741840 39738926 ID=MsG0780038082.01;Name=MsG0780038082.01
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Chr7 CDS 39738926 39739574 39738926 ID=MsG0780038082.01.T01:cds;Parent=MsG0780038082.01.T01
Chr7 CDS 39739658 39741840 39739658 ID=MsG0780038082.01.T01:cds;Parent=MsG0780038082.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780038082.01.T01

ATGAGATTCCTATTTTCAAACCTTCAATCCTTGAAGCTGCTATCCTTTTGTTTTGGCTACTTCTTTCAATGTGGTTCTGTGCATTCACAACAGCCCCAACTACGTACTTTATCAGCAACGTCACAAGCAAGTGCTTTGTTGAAGTGGAAAACAAGTCTTGACAACCAAAGCCAAGTTTTGCTATCTTCATGGAGTGGCAATAATTCATGCAAATGGCTTGGAATTTCTTGTAATGAAGATTCCATTTCTGTCTCTAAGGTAAATCTCACAAATATGGGATTGAAAGGTACGCTTGAAAGTCTTAACTTCTCATCACTTCCAAATATCCAAACCCTAAACATAAGTCACAATTCCTTAAATGGAAGTATTCCTTCCCATATTGGAATGTTGTCCAAACTTGCTCATCTTGATCTTAGTGACAATCTTCTATCAGGAACAATTCCATATGAAATAACACAGTTGATTAATCTTCAAACTTATATTTTGGATAATAATCTTTTTAGTGGTTCCATTCCTGAAGAAATAGGTGAATTAAGAAATCTGAGAGAACTTAGTATCTCAAATGCAAATATCACAGGGACTATCCCAACTTCCATTGGGAATCTGACCTTGTTGTCATATTTGTATTTAGGAGGAAACAACCTTTATGCTCAAGAAATTGTGAAGTTGCATCAGATAGAGACTCTTGATCTTGGTGGTAATAGTCTTTCCATTAATGGTCCTATCCTCCAAGAAATTTTGAAGTTGGGAAATTTAAACTACCTTTCTTTTTTTCAATGCAATGTCAGGGGTCTATTCCATTTTCTAGGAAAGTTGGCCAACTTGTCATATCTAAATTTAGCACACAATCCTATTTCTGGCCACCTTCCTGTGGAAATTGGAAAGTTAAGGAAGCTAGAATATCTATATATTTTTGACAATAACTTATCTGGTAGGATTCCTGTGGAAATTGGGGGATTGGTGAACTTGAAAGAGTTAAGGTTTAGGGACAATGATCTTTCTGGTTCGATTCCTCGTGAAATTGGAATACTGAGAAATGTTGGTCAAATTGATTTGGACAATAACTCTCTTTCAGGTGAAATCCCACCGACAATTGGAAACTTGAGTCATATACAATTTCTTTCATTTGCTCAAAACCATCTCAATGGCAAATTACCAATGGAAATGAATTTTCTTAACAATTTGGTACAACTGCAAATATATGATAATGACTTCATTGGTCAGCTGCCTCACAACATTTGCATTGGTGGGAATTTGAAATACTTGGACCAAAACCAACTTAGACTTGACCAAAACCAACTTACTGGAAATATAACACAAGATTTTGGTGTTTATCCAAATTTGAATTACATAGATTTAAGTGAAAACAATTTTTACGGACACCTTTCATCCAATTGGGGAAAGTGTCAAAACCTAACAAGCTTCATCATTGCCCATAATAATATATCAGGTCATATACCACCAGAAATAGGAAGGGCACCAAACTTGGGTTTACTTGACTTATCTTCAAACTATCTCACGGGGAAAATTCCAAAGGAGTTAAGCAACTTGTCTTTGTCCAATCTTTTGATAAGCAACAACCATCTCTCCGGAAACATTCCTGTAGAAATATCATCCTTAGATGAGCTTGAGACCTTAGACCTTGCATCAAATAATTTAAGTGGATTCATCACAAAACAACTTGCAAATTTGCCTAAGATATGGAACTTAAATTTGAGTCATAACAAATTCACAGGAAATATTCCTATTGAATTTGGAAAATTTCAAATCCTTCAAAGCCTTGATCTTAGTGGAAATTTTTTGTATGGAACAATACCATCAATGCTAACACAGTTGAAATACTTGGAAACATTGAATATTTCACATAATAATCTTTCGGGTTTTATTCCCTCTAGCTTTGATCAAATGCTCAGCTTGACGTCTGTTGATATATCATATAACCAATTGGAGGGTTCACTCCCTGACATTCGAGCTTTCAGTAACGCTACAATTGAAGTGTTGAGAAATAATAAAGGCCTGTGTGGTAATGTCTCTGGTCTAGAACCCTGCCCAACATCAAGCATTGAATCTCATCATCATCATCATCATCATATTAACAAAGTCTTATTGATAGTTTTGCCCTTTATAGCTGTTGGGACACTAATGTTAGTATTATTTTGCTTCAAATACTCATATCATCTCTTTCAAACATCAACCACCAACGAAAACCAGTCTGGAGAGAACATCATTGTACCTCAAAATGTATTTACAATATGGAACTTTGATGGAAAAATTGTGTTGGAAAACATTGTGGAAGCCACCGAAGATTTCCATGAGAAACATTTAATTGGAGTTGGAGGGCATGGAAGTGTCTACAAAGCAATGTTGCACACGGGCCAAGTAGTTGCTGTGAAAAAGCTCCATTCAGTGGCAAATGGCGAAAATCCCAATCTAAAATCTTTCACAAATGAGATCCAAGCTCTAACCGAAATTCGACATCGTAATATTGTGAAGTTGTATGGATTTTGCACACATTCTTGGTTGTCGTTTTTGGTTTATGAGTTCGTAGAGAAAGGTAGTATGGAAAAGATTTTGAAAGATGATGAAGAAGCAATTGCATTTGATTGGAACAATAGGGTGAATGTCCTTAAAGATGTAGCTAATGCTTTATGCTATATGCACCATGATTGCTCACCTCCAATTGTTCACAGAGATATATCAAGCAAGAATATTCTTCTGGATTTAGAATATGTGGCTTGTGTCTCGGACTTTGGAACAGCAAAGCTTCTTGATCTTAATTTAACTAGCTCAATCTCATTTGCATGCACATTTGGTTATGCTGCACCAGGTTAA
Protein sequence

>MsG0780038082.01.T01

MRFLFSNLQSLKLLSFCFGYFFQCGSVHSQQPQLRTLSATSQASALLKWKTSLDNQSQVLLSSWSGNNSCKWLGISCNEDSISVSKVNLTNMGLKGTLESLNFSSLPNIQTLNISHNSLNGSIPSHIGMLSKLAHLDLSDNLLSGTIPYEITQLINLQTYILDNNLFSGSIPEEIGELRNLRELSISNANITGTIPTSIGNLTLLSYLYLGGNNLYAQEIVKLHQIETLDLGGNSLSINGPILQEILKLGNLNYLSFFQCNVRGLFHFLGKLANLSYLNLAHNPISGHLPVEIGKLRKLEYLYIFDNNLSGRIPVEIGGLVNLKELRFRDNDLSGSIPREIGILRNVGQIDLDNNSLSGEIPPTIGNLSHIQFLSFAQNHLNGKLPMEMNFLNNLVQLQIYDNDFIGQLPHNICIGGNLKYLDQNQLRLDQNQLTGNITQDFGVYPNLNYIDLSENNFYGHLSSNWGKCQNLTSFIIAHNNISGHIPPEIGRAPNLGLLDLSSNYLTGKIPKELSNLSLSNLLISNNHLSGNIPVEISSLDELETLDLASNNLSGFITKQLANLPKIWNLNLSHNKFTGNIPIEFGKFQILQSLDLSGNFLYGTIPSMLTQLKYLETLNISHNNLSGFIPSSFDQMLSLTSVDISYNQLEGSLPDIRAFSNATIEVLRNNKGLCGNVSGLEPCPTSSIESHHHHHHHINKVLLIVLPFIAVGTLMLVLFCFKYSYHLFQTSTTNENQSGENIIVPQNVFTIWNFDGKIVLENIVEATEDFHEKHLIGVGGHGSVYKAMLHTGQVVAVKKLHSVANGENPNLKSFTNEIQALTEIRHRNIVKLYGFCTHSWLSFLVYEFVEKGSMEKILKDDEEAIAFDWNNRVNVLKDVANALCYMHHDCSPPIVHRDISSKNILLDLEYVACVSDFGTAKLLDLNLTSSISFACTFGYAAPG*