AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780039160.01

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MsG0780039160.01.T01 AT1G12620 28.166 458 326 3 4 460 160 615 6.88e-60 211
MsG0780039160.01.T01 AT1G12620 27.236 246 174 3 354 597 54 296 4.58e-24 107
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MsG0780039160.01.T01 AT1G22960 26.403 481 340 9 115 590 191 662 1.59e-50 186
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MsG0780039160.01.T01 AT1G03560 28.302 477 291 10 70 501 124 594 5.71e-53 192
MsG0780039160.01.T01 AT1G03560 29.330 433 265 6 186 580 141 570 9.64e-49 180
MsG0780039160.01.T01 AT1G03560 27.869 427 302 5 52 476 217 639 4.35e-47 176
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MsG0780039160.01.T01 AT5G16420 26.764 411 291 5 194 598 79 485 5.28e-40 154
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MsG0780039160.01.T01 AT5G16420 26.764 411 291 5 194 598 79 485 5.28e-40 154
MsG0780039160.01.T01 AT5G16420 24.670 454 330 7 28 474 52 500 1.06e-35 141
MsG0780039160.01.T01 AT5G16420 27.744 328 232 4 3 328 172 496 4.46e-35 139
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MsG0780039160.01.T01 AT2G41720 21.858 366 280 4 237 598 147 510 1.43e-19 93.6
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MsG0780039160.01.T01 AT1G63630 26.715 277 165 4 182 456 10 250 2.59e-32 126
MsG0780039160.01.T01 AT1G63630 27.397 292 176 3 216 507 9 264 6.33e-30 119
MsG0780039160.01.T01 AT1G63630 26.070 257 188 2 110 365 9 264 1.43e-29 118
MsG0780039160.01.T01 AT1G63630 28.794 257 175 5 74 326 8 260 2.38e-29 117
MsG0780039160.01.T01 AT1G63630 27.966 236 162 4 360 590 11 243 1.89e-25 106
MsG0780039160.01.T01 AT1G63630 27.684 177 127 1 20 196 94 269 3.27e-23 100
MsG0780039160.01.T01 AT1G63630 24.883 213 155 3 388 598 7 216 1.46e-19 89.7
MsG0780039160.01.T01 AT3G18110 24.161 596 412 12 2 578 278 852 9.21e-38 150
MsG0780039160.01.T01 AT3G18110 22.586 611 423 9 24 592 404 1006 2.67e-36 146
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MsG0780039160.01.T01 AT3G18110 21.875 384 296 3 217 598 771 1152 1.46e-25 112
MsG0780039160.01.T01 AT3G18110 25.260 289 177 4 305 590 228 480 2.26e-25 112
MsG0780039160.01.T01 AT3G18110 19.071 409 322 4 16 423 749 1149 4.00e-23 105
MsG0780039160.01.T01 AT3G18110 24.064 187 138 4 371 555 190 374 4.64e-12 70.1
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MsG0780039160.01.T01 AT3G62540 20.657 426 298 6 36 459 173 560 2.10e-24 108
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MsG0780039160.01.T01 AT1G74900 26.761 213 152 3 387 598 141 350 3.39e-28 118
MsG0780039160.01.T01 AT1G74900 22.549 306 230 4 289 590 110 412 3.73e-28 118
MsG0780039160.01.T01 AT1G74900 24.189 339 219 4 79 416 113 414 1.10e-25 110
MsG0780039160.01.T01 AT1G74900 24.506 253 176 5 351 598 140 382 2.92e-24 106
MsG0780039160.01.T01 AT1G74900 29.245 212 142 2 20 231 228 431 9.54e-24 105
MsG0780039160.01.T01 AT1G74900 22.632 190 145 1 409 598 93 280 2.08e-11 67.0
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MsG0780039160.01.T01 AT4G26680 25.163 306 208 4 304 590 117 420 7.55e-28 118
MsG0780039160.01.T01 AT4G26680 24.176 364 273 3 3 364 148 510 1.24e-34 138
MsG0780039160.01.T01 AT4G26680 24.505 404 280 7 182 563 98 498 1.52e-33 135
MsG0780039160.01.T01 AT4G26680 25.163 306 208 4 304 590 117 420 7.55e-28 118
MsG0780039160.01.T01 AT4G01570 23.933 539 384 9 3 532 265 786 4.44e-34 138
MsG0780039160.01.T01 AT4G01570 23.278 421 280 3 47 452 82 474 5.56e-32 132
MsG0780039160.01.T01 AT4G01570 24.606 508 303 12 62 552 59 503 2.47e-26 114
MsG0780039160.01.T01 AT4G01570 24.823 282 185 4 337 594 92 370 3.47e-18 89.4
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MsG0780039160.01.T01 AT4G01570 23.496 349 240 7 265 589 90 435 4.37e-16 82.4
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MsG0780039160.01.T01 AT3G60050 25.571 219 160 2 373 590 220 436 2.89e-17 85.5
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MsG0780039160.01.T01 AT3G15200 24.286 420 246 9 60 466 146 506 6.30e-25 109
MsG0780039160.01.T01 AT3G15200 22.973 444 303 9 90 511 62 488 5.67e-23 103
MsG0780039160.01.T01 AT3G15200 25.769 260 187 3 5 263 232 486 2.92e-17 85.5
MsG0780039160.01.T01 AT3G15200 24.090 357 223 10 9 323 162 512 5.99e-15 78.2
MsG0780039160.01.T01 AT3G15200 24.887 221 162 3 374 593 145 362 1.53e-13 73.9
MsG0780039160.01.T01 AT1G53600 24.658 511 332 16 97 597 86 553 5.92e-31 129
MsG0780039160.01.T01 AT1G53600 21.384 477 334 12 94 564 114 555 1.82e-27 118
MsG0780039160.01.T01 AT1G53600 21.856 334 237 7 61 391 314 626 4.26e-16 82.4
MsG0780039160.01.T01 AT1G53600 21.253 447 308 14 153 593 40 448 5.29e-16 82.0
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MsG0780039160.01.T01 AT1G22830 23.645 406 289 8 157 557 145 534 1.33e-26 115
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MsG0780039160.01.T01 AT4G16390 20.000 310 241 4 292 599 165 469 6.01e-11 65.9
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MsG0780039160.01.T01 AT1G11630 28.315 279 192 4 245 519 123 397 1.39e-23 103
MsG0780039160.01.T01 AT1G11630 22.903 310 235 4 60 366 78 386 3.62e-17 84.3
MsG0780039160.01.T01 AT1G11630 24.911 281 206 3 161 436 106 386 4.15e-17 84.3
MsG0780039160.01.T01 AT1G11630 23.232 297 217 7 297 586 70 362 3.59e-11 65.9
MsG0780039160.01.T01 AT1G11290 22.266 503 311 12 25 459 103 593 4.11e-26 114
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MsG0780039160.01.T01 AT1G56690 24.176 455 293 15 10 454 99 511 2.67e-17 86.3
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MsG0780039160.01.T01 AT5G48910 22.927 410 253 12 103 498 70 430 1.31e-15 80.9
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MsG0780039160.01.T01 AT3G04130 25.000 300 220 5 165 460 192 490 8.71e-22 99.8
MsG0780039160.01.T01 AT3G04130 24.797 246 175 4 20 259 222 463 3.49e-19 91.7
MsG0780039160.01.T01 AT3G04130 26.210 248 174 4 19 261 256 499 4.65e-16 81.6
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MsG0780039160.01.T01 AT3G02650 25.764 229 164 4 40 263 316 543 1.46e-13 73.9
MsG0780039160.01.T01 AT3G02650 25.357 280 151 8 359 591 217 485 9.67e-13 71.6
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MsG0780039160.01.T01 AT2G01390 26.316 228 160 4 367 593 84 304 8.69e-15 77.8
MsG0780039160.01.T01 AT2G01390 23.529 289 200 6 205 492 64 332 1.30e-14 77.4
MsG0780039160.01.T01 AT2G01390 25.749 167 119 3 436 600 116 279 1.46e-11 67.8
MsG0780039160.01.T01 AT5G03800 20.459 567 377 18 2 558 130 632 4.32e-22 101
MsG0780039160.01.T01 AT5G03800 23.385 325 229 10 131 451 118 426 2.01e-13 73.9
MsG0780039160.01.T01 AT2G34400 24.454 458 302 16 20 465 94 519 4.73e-22 100
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MsG0780039160.01.T01 AT4G18840 22.698 467 338 10 81 545 60 505 4.89e-22 100
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MsG0780039160.01.T01 AT1G63320 35.294 102 56 3 499 590 1 102 1.55e-14 72.8
MsG0780039160.01.T01 AT1G63320 26.857 175 120 3 392 558 1 175 5.65e-14 71.2
MsG0780039160.01.T01 AT1G63320 26.630 184 120 6 220 391 3 183 7.38e-14 70.9
MsG0780039160.01.T01 AT1G63320 31.250 128 79 1 24 142 18 145 4.40e-13 68.6
MsG0780039160.01.T01 AT1G63320 28.022 182 120 3 43 215 2 181 1.66e-12 67.0
MsG0780039160.01.T01 AT1G63320 25.346 217 117 4 254 460 2 183 3.80e-12 65.9
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MsG0780039160.01.T01 AT3G23330 22.531 324 231 9 155 473 88 396 2.63e-16 82.8
MsG0780039160.01.T01 AT3G23330 19.481 385 297 5 56 439 97 469 5.45e-16 82.0
MsG0780039160.01.T01 AT3G23330 22.335 394 256 8 14 369 88 469 7.02e-16 81.6
MsG0780039160.01.T01 AT1G60770 21.053 266 207 3 24 287 125 389 2.96e-16 82.4
MsG0780039160.01.T01 AT1G60770 21.408 341 263 4 64 402 62 399 8.44e-13 71.2
MsG0780039160.01.T01 AT1G60770 20.427 328 238 5 11 323 147 466 2.59e-12 69.7
MsG0780039160.01.T01 AT1G60770 20.370 378 290 5 29 398 97 471 3.53e-12 69.3
MsG0780039160.01.T01 AT1G69350 23.016 504 344 13 91 581 166 638 3.52e-16 82.8
MsG0780039160.01.T01 AT1G69350 21.681 452 282 11 61 451 241 681 1.10e-15 81.3
MsG0780039160.01.T01 AT1G69350 20.675 474 292 11 26 465 140 563 2.45e-13 73.6
MsG0780039160.01.T01 AT1G17630 19.018 489 347 7 22 508 123 564 3.70e-16 82.8
MsG0780039160.01.T01 AT1G17630 19.565 460 346 11 133 585 95 537 2.69e-13 73.6
MsG0780039160.01.T01 AT1G17630 19.018 489 347 7 22 508 123 564 3.70e-16 82.8
MsG0780039160.01.T01 AT1G17630 19.565 460 346 11 133 585 95 537 2.69e-13 73.6
MsG0780039160.01.T01 AT5G39680 21.111 450 305 11 26 457 73 490 3.80e-16 82.4
MsG0780039160.01.T01 AT4G21065 21.801 422 270 10 26 439 89 458 3.99e-16 82.4
MsG0780039160.01.T01 AT3G18840 20.980 510 353 16 98 592 29 503 5.09e-16 82.0
MsG0780039160.01.T01 AT3G18840 21.192 453 331 10 6 451 70 503 9.00e-14 75.1
MsG0780039160.01.T01 AT3G18840 20.980 510 353 16 98 592 29 503 5.09e-16 82.0
MsG0780039160.01.T01 AT3G18840 21.192 453 331 10 6 451 70 503 9.00e-14 75.1
MsG0780039160.01.T01 AT3G26540 21.192 453 296 13 20 435 226 654 5.14e-16 82.0
MsG0780039160.01.T01 AT3G26540 19.753 567 347 17 3 493 113 647 2.81e-14 76.6
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MsG0780039160.01.T01 AT4G33990 19.931 582 350 20 22 590 117 595 5.12e-14 75.9
MsG0780039160.01.T01 AT2G03380 19.132 622 400 16 16 558 60 657 5.63e-16 82.0
MsG0780039160.01.T01 AT2G03380 21.277 376 276 9 3 373 325 685 2.50e-12 70.5
MsG0780039160.01.T01 AT1G74630 21.446 415 297 13 14 421 75 467 5.84e-16 82.0
MsG0780039160.01.T01 AT1G74630 22.195 410 257 12 89 458 82 469 3.25e-15 79.3
MsG0780039160.01.T01 AT1G74630 20.619 388 281 9 124 505 82 448 6.30e-15 78.6
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MsG0780039160.01.T01 AT1G74600 20.710 507 328 14 20 462 314 810 7.08e-16 82.0
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MsG0780039160.01.T01 AT1G74630 22.195 410 257 12 89 458 67 454 4.43e-15 79.0
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MsG0780039160.01.T01 AT5G43790 27.803 223 154 4 6 227 166 382 8.39e-16 80.9
MsG0780039160.01.T01 AT5G43790 22.540 315 220 9 20 321 69 372 4.21e-12 68.9
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MsG0780039160.01.T01 AT2G21090 19.347 398 299 9 202 597 50 427 9.25e-12 68.6
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MsG0780039160.01.T01 AT5G47460 21.320 394 278 13 213 598 105 474 1.63e-13 73.9
MsG0780039160.01.T01 AT3G57430 20.242 578 364 19 52 566 92 635 2.46e-15 80.1
MsG0780039160.01.T01 AT3G57430 21.869 535 365 18 87 597 92 597 8.83e-13 72.0
MsG0780039160.01.T01 AT1G77170 24.422 389 232 10 15 391 70 408 2.63e-15 79.3
MsG0780039160.01.T01 AT2G27800 25.306 245 155 9 216 436 183 423 2.63e-15 79.0
MsG0780039160.01.T01 AT2G27800 26.190 210 142 4 270 466 210 419 3.38e-15 78.6
MsG0780039160.01.T01 AT2G27800 21.236 259 174 2 25 280 210 441 1.45e-14 76.6
MsG0780039160.01.T01 AT2G27800 25.701 214 144 6 371 571 206 417 4.65e-12 68.9
MsG0780039160.01.T01 AT5G15300 22.737 475 280 17 176 597 22 462 2.77e-15 79.3
MsG0780039160.01.T01 AT5G15300 20.769 390 256 10 5 356 61 435 1.89e-14 76.6
MsG0780039160.01.T01 AT5G15300 21.324 408 292 10 54 454 74 459 5.99e-13 72.0
MsG0780039160.01.T01 AT1G33350 21.067 375 264 10 20 374 86 448 3.55e-15 79.0
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MsG0780039160.01.T01 AT1G33350 20.896 268 196 5 94 356 195 451 1.14e-11 68.2
MsG0780039160.01.T01 AT1G33350 21.067 375 264 10 20 374 86 448 3.55e-15 79.0
MsG0780039160.01.T01 AT1G33350 20.776 438 306 15 90 508 14 429 5.17e-12 68.9
MsG0780039160.01.T01 AT1G33350 20.896 268 196 5 94 356 195 451 1.14e-11 68.2

Find 146 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 180 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CTTAATGGGTTGTTTGAAAA+TGG 0.126906 7:+58897931 MsG0780039160.01.T01:CDS
ACTTATAATATTGTTATAAA+TGG 0.154261 7:+58898336 MsG0780039160.01.T01:CDS
TTAAGGAGAGTTTGGAGATA+TGG 0.215191 7:+58897647 MsG0780039160.01.T01:CDS
GTGTAAGTGTGGGAGGTTTA+AGG 0.221300 7:+58897630 MsG0780039160.01.T01:CDS
AGTTATAATGTGTTTCTTAA+TGG 0.242628 7:+58897916 MsG0780039160.01.T01:CDS
ACTTGTAATGCAATGCTTAA+TGG 0.245345 7:+58897814 MsG0780039160.01.T01:CDS
TGGGAGGTTTAAGGAGAGTT+TGG 0.254462 7:+58897639 MsG0780039160.01.T01:CDS
CTAAACGATGCTTTGGATAA+TGG 0.273885 7:+58898822 MsG0780039160.01.T01:CDS
GTGAAAAGGCATCAAAGATT+TGG 0.287196 7:+58898697 MsG0780039160.01.T01:CDS
GTTCCATAAGTAAACTTATC+AGG 0.291642 7:-58897379 None:intergenic
AAGCCTGATAAGTTTACTTA+TGG 0.291955 7:+58897376 MsG0780039160.01.T01:CDS
ATCCATAGACTTTGTTCTTC+TGG 0.292478 7:+58898567 MsG0780039160.01.T01:CDS
TAAGGAGAGTTTGGAGATAT+GGG 0.304228 7:+58897648 MsG0780039160.01.T01:CDS
ACATTATAGGTCTGCACATT+TGG 0.308643 7:-58897274 None:intergenic
GTTATAATGTGTTTCTTAAT+GGG 0.310939 7:+58897917 MsG0780039160.01.T01:CDS
ATGTTATGCATTGTAATATC+AGG 0.311270 7:-58898540 None:intergenic
CTCTCAATGGTCTCTGCACT+TGG 0.322320 7:+58898772 MsG0780039160.01.T01:CDS
TGTTATAATATTATTATTGA+TGG 0.324948 7:+58897496 MsG0780039160.01.T01:CDS
CTTGTAATGCAATGCTTAAT+GGG 0.332007 7:+58897815 MsG0780039160.01.T01:CDS
ACAGTGCTATTCAAGTCTTT+TGG 0.349164 7:+58898277 MsG0780039160.01.T01:CDS
ATTATGCTTTGCAGCTCTAT+TGG 0.350061 7:+58898598 MsG0780039160.01.T01:CDS
AACCTTCATCAACACATTAT+AGG 0.352943 7:-58897287 None:intergenic
ACATATAGTGCGTTGATTCA+TGG 0.358100 7:+58897709 MsG0780039160.01.T01:CDS
TGGGTTTCTAAACGATGCTT+TGG 0.372874 7:+58898815 MsG0780039160.01.T01:CDS
TTATGCCAACTGTTATTACT+TGG 0.373359 7:+58898847 MsG0780039160.01.T01:CDS
GTCTATAATGCACTCATTGA+TGG 0.375258 7:+58898231 MsG0780039160.01.T01:CDS
GTCGGCAACTTATGGAATAT+TGG 0.379169 7:+58898014 MsG0780039160.01.T01:CDS
GTTCATGGTTTATGTAAGAA+TGG 0.381462 7:+58898036 MsG0780039160.01.T01:CDS
TGCCAGAAGAACAAAGTCTA+TGG 0.395674 7:-58898569 None:intergenic
TTAATGGGTTGTTTGAAAAT+GGG 0.395909 7:+58897932 MsG0780039160.01.T01:CDS
ACTTATGGAATATTGGTTCA+TGG 0.398092 7:+58898021 MsG0780039160.01.T01:CDS
TGAAAAGGCATCAAAGATTT+GGG 0.407210 7:+58898698 MsG0780039160.01.T01:CDS
GCGTACTCGTCAATGATAAA+CGG 0.414336 7:+58898126 MsG0780039160.01.T01:CDS
AACATTCGGTGAGCAACCTT+TGG 0.418298 7:-58898310 None:intergenic
AGTTATAATATTATGATTAG+TGG 0.419247 7:+58897604 MsG0780039160.01.T01:CDS
CATATAGTGCGTTGATTCAT+GGG 0.421704 7:+58897710 MsG0780039160.01.T01:CDS
TTTGAGCTGTGGGAGGAGAT+GGG 0.423048 7:+58897868 MsG0780039160.01.T01:CDS
GTTGTGTGAAGGTGGTGATT+TGG 0.423151 7:+58897732 MsG0780039160.01.T01:CDS
GATGTAGAGTCGGCAACTTA+TGG 0.426376 7:+58898006 MsG0780039160.01.T01:CDS
TGATTTGGATGGAGCGAAAA+GGG 0.431999 7:+58897747 MsG0780039160.01.T01:CDS
AGAGGATGAAGATGAATGAT+TGG 0.433558 7:+58897671 MsG0780039160.01.T01:CDS
AGCATTAAGAAGTGTGTTGA+AGG 0.435846 7:-58897182 None:intergenic
GAGGTTGTTAAGGGTGGAAA+CGG 0.436962 7:+58897564 MsG0780039160.01.T01:CDS
TCATATAATATTACTCTCAA+TGG 0.442117 7:+58898759 MsG0780039160.01.T01:CDS
TGTGACCCACAATACTGTTA+TGG 0.444434 7:+58898650 MsG0780039160.01.T01:CDS
GTGCTGTATGTGATAATATC+TGG 0.445195 7:-58898429 None:intergenic
GTGACGTGGATGTGGAGTGC+TGG 0.454039 7:+58897349 MsG0780039160.01.T01:CDS
TTCATGGTTTATGTAAGAAT+GGG 0.454659 7:+58898037 MsG0780039160.01.T01:CDS
GTATGTGACTAAGGCTTTGC+GGG 0.456904 7:+58898059 MsG0780039160.01.T01:CDS
AAAAGCTTCAACGCTTGATC+AGG 0.456985 7:-58897115 None:intergenic
CTTAATGGGTTGTGTAAAGC+AGG 0.460768 7:+58897829 MsG0780039160.01.T01:CDS
TGTGTTGAAGGAACGAATAC+CGG 0.462545 7:-58897170 None:intergenic
CTGAGTCTCATCAATGGGAT+AGG 0.463055 7:+58897209 MsG0780039160.01.T01:CDS
GTTGATAGATGGTCTTTGCC+AGG 0.463290 7:+58898452 MsG0780039160.01.T01:CDS
TGATGTGGGAGAGGTTGTTA+AGG 0.463624 7:+58897554 MsG0780039160.01.T01:CDS
TGTTATCAGTTTCTTGCAAA+GGG 0.466533 7:+58898510 MsG0780039160.01.T01:CDS
GTTATAATATTATGATTAGT+GGG 0.466935 7:+58897605 MsG0780039160.01.T01:CDS
CGTACTCGTCAATGATAAAC+GGG 0.467067 7:+58898127 MsG0780039160.01.T01:CDS
TCTCAATGGTCTCTGCACTT+GGG 0.467440 7:+58898773 MsG0780039160.01.T01:CDS
TGGAGCGAAAAGGGTTTATG+AGG 0.468147 7:+58897756 MsG0780039160.01.T01:CDS
CGATTTGAATTCCGCGTTGG+AGG 0.477837 7:+58897429 MsG0780039160.01.T01:CDS
TGGGCTCAAATCTCAGAAGA+TGG 0.480725 7:+58898717 MsG0780039160.01.T01:CDS
ACCCTCCATAACAGTATTGT+GGG 0.486232 7:-58898655 None:intergenic
CATTCTCATTCATCTTGCCC+TGG 0.487579 7:-58898470 None:intergenic
ATATTATATGAGATGATGTC+GGG 0.488651 7:-58898747 None:intergenic
GTGATTTGGATGGAGCGAAA+AGG 0.495042 7:+58897746 MsG0780039160.01.T01:CDS
TAAGAATGGGTATGTGACTA+AGG 0.496607 7:+58898050 MsG0780039160.01.T01:CDS
GACTAAGGCTTTGCGGGTGT+TGG 0.497366 7:+58898065 MsG0780039160.01.T01:CDS
ATATTATAAGTCACAACATT+CGG 0.501760 7:-58898324 None:intergenic
CTCAATGGTCTCTGCACTTG+GGG 0.501901 7:+58898774 MsG0780039160.01.T01:CDS
AACGAATACCGGGCCGGCAT+CGG 0.502449 7:-58897159 None:intergenic
ATTCATGGGTTGTGTGAAGG+TGG 0.502502 7:+58897724 MsG0780039160.01.T01:CDS
GTTATAATATTATTATTGAT+GGG 0.502904 7:+58897497 MsG0780039160.01.T01:CDS
ACATACAGCACGTTGATAGA+TGG 0.507080 7:+58898441 MsG0780039160.01.T01:CDS
TTGAGCTGTGGGAGGAGATG+GGG 0.508781 7:+58897869 MsG0780039160.01.T01:CDS
TGTGAAGGTGGTGATTTGGA+TGG 0.510235 7:+58897736 MsG0780039160.01.T01:CDS
AACCCTCCATAACAGTATTG+TGG 0.510794 7:-58898656 None:intergenic
AGAGTTTGGAGATATGGGAG+AGG 0.510930 7:+58897653 MsG0780039160.01.T01:CDS
CAAAATTGGAGACTGTGAAA+AGG 0.511381 7:+58898683 MsG0780039160.01.T01:CDS
ACGAGGTGTGGAGCCGGATG+TGG 0.513253 7:+58897471 MsG0780039160.01.T01:CDS
AATATTATATGAGATGATGT+CGG 0.514225 7:-58898748 None:intergenic
CCATTGCGTTGAGGAAATGC+TGG 0.517684 7:+58898392 MsG0780039160.01.T01:CDS
ATTAGTGGGTTGTGTAAGTG+TGG 0.518767 7:+58897619 MsG0780039160.01.T01:CDS
TCTATAATGCACTCATTGAT+GGG 0.519795 7:+58898232 MsG0780039160.01.T01:CDS
GTGTTATCAGTTTCTTGCAA+AGG 0.519825 7:+58898509 MsG0780039160.01.T01:CDS
TTGTGAAGGGTAAGATGATG+TGG 0.522205 7:+58897539 MsG0780039160.01.T01:CDS
AGAAATTGGTGACGTGGATG+TGG 0.523127 7:+58897341 MsG0780039160.01.T01:CDS
GAAAAGGGTTTATGAGGAGA+TGG 0.525198 7:+58897762 MsG0780039160.01.T01:CDS
GTGTTGAAGGAACGAATACC+GGG 0.525466 7:-58897169 None:intergenic
GATGTGGGAGAGGTTGTTAA+GGG 0.526540 7:+58897555 MsG0780039160.01.T01:CDS
ATATTATAACAAGCCACATC+CGG 0.526759 7:-58897484 None:intergenic
GTGGGAGAGGTTGTTAAGGG+TGG 0.538016 7:+58897558 MsG0780039160.01.T01:CDS
TGGGAGGAGATGGGGAAGTG+TGG 0.538045 7:+58897877 MsG0780039160.01.T01:CDS
GTGGGTTGTGTAAGTGTGGG+AGG 0.538080 7:+58897623 MsG0780039160.01.T01:CDS
GACCTATAATGTGTTGATGA+AGG 0.538445 7:+58897285 MsG0780039160.01.T01:CDS
GTCTGAACGAGGTGTGGAGC+CGG 0.538735 7:+58897465 MsG0780039160.01.T01:CDS
GGTAGAGTAACGGATGCAGT+TGG 0.538942 7:+58898795 MsG0780039160.01.T01:CDS
CAGAGCAGAGAGGTTTCCTG+AGG 0.541347 7:+58898365 MsG0780039160.01.T01:CDS
TGGGTTGTGTAAAGCAGGGA+AGG 0.541453 7:+58897834 MsG0780039160.01.T01:CDS
TCAACGCAATGGTATGCCTC+AGG 0.543566 7:-58898381 None:intergenic
TTCGCTTATTATGAGACGGC+AGG 0.546887 7:+58897244 MsG0780039160.01.T01:CDS
AAGGCTTTGCGGGTGTTGGA+AGG 0.550753 7:+58898069 MsG0780039160.01.T01:CDS
TTGGAAGGAGCTGATGATAG+AGG 0.550764 7:+58898084 MsG0780039160.01.T01:CDS
GGTATGTGACTAAGGCTTTG+CGG 0.551997 7:+58898058 MsG0780039160.01.T01:CDS
AGAAGGAAGGTTAGATGAAG+CGG 0.553363 7:+58898158 MsG0780039160.01.T01:CDS
AGGAAATGCTGGAGAAAGGG+TGG 0.554643 7:+58898403 MsG0780039160.01.T01:CDS
TGAGTCTCATCAATGGGATA+GGG 0.554925 7:+58897210 MsG0780039160.01.T01:CDS
TGTGAAGGGTAAGATGATGT+GGG 0.558195 7:+58897540 MsG0780039160.01.T01:CDS
CTGCACTTGGGGTAGAGTAA+CGG 0.562177 7:+58898785 MsG0780039160.01.T01:CDS
TTGATAGATGGTCTTTGCCA+GGG 0.574645 7:+58898453 MsG0780039160.01.T01:CDS
TTGATTCATGGGTTGTGTGA+AGG 0.576635 7:+58897721 MsG0780039160.01.T01:CDS
GTAGAGTAACGGATGCAGTT+GGG 0.577617 7:+58898796 MsG0780039160.01.T01:CDS
GTTGAGGAAATGCTGGAGAA+AGG 0.577836 7:+58898399 MsG0780039160.01.T01:CDS
TGACGTGGATGTGGAGTGCT+GGG 0.579102 7:+58897350 MsG0780039160.01.T01:CDS
ACTTTGTTCTTCTGGCAAAG+TGG 0.581057 7:+58898575 MsG0780039160.01.T01:CDS
TCGCGATTTGAATTCCGCGT+TGG 0.581789 7:+58897426 MsG0780039160.01.T01:CDS
GGGCTCAAATCTCAGAAGAT+GGG 0.585166 7:+58898718 MsG0780039160.01.T01:CDS
TGGGTTGTTTGAAAATGGGA+AGG 0.586990 7:+58897936 MsG0780039160.01.T01:CDS
GTTGTTTGAAAATGGGAAGG+TGG 0.587553 7:+58897939 MsG0780039160.01.T01:CDS
TTGAGGAAATGCTGGAGAAA+GGG 0.590783 7:+58898400 MsG0780039160.01.T01:CDS
AGGGTAAGATGATGTGGGAG+AGG 0.596074 7:+58897545 MsG0780039160.01.T01:CDS
ATGAGAATGACACGGCACTT+AGG 0.598245 7:+58898484 MsG0780039160.01.T01:CDS
CCAGCATTTCCTCAACGCAA+TGG 0.599695 7:-58898392 None:intergenic
ATATTATAACTAACAACACT+CGG 0.604481 7:-58897592 None:intergenic
GACCCACAATACTGTTATGG+AGG 0.605948 7:+58898653 MsG0780039160.01.T01:CDS
ATAAACGGGTTATGCAGAGA+AGG 0.607334 7:+58898141 MsG0780039160.01.T01:CDS
ACCCACAATACTGTTATGGA+GGG 0.613481 7:+58898654 MsG0780039160.01.T01:CDS
ACGGGTTATGCAGAGAAGGA+AGG 0.613709 7:+58898145 MsG0780039160.01.T01:CDS
TATCATTGACGAGTACGCAA+AGG 0.622389 7:-58898121 None:intergenic
TGAAATGTCTGAACGAGGTG+TGG 0.633784 7:+58897459 MsG0780039160.01.T01:CDS
ATGTTCCAAGTAATAACAGT+TGG 0.637211 7:-58898852 None:intergenic
GGATGAAGCGATTAATGTGT+GGG 0.639414 7:+58897960 MsG0780039160.01.T01:CDS
TGAGGCATACCATTGCGTTG+AGG 0.643204 7:+58898383 MsG0780039160.01.T01:CDS
GAAGTGTGGTTCGCGTAATG+TGG 0.644025 7:+58897891 MsG0780039160.01.T01:CDS
TTGAATTTGATGGATAAGCG+TGG 0.648217 7:+58898189 MsG0780039160.01.T01:CDS
TGAAGGAACGAATACCGGGC+CGG 0.649823 7:-58897165 None:intergenic
CAAGATGAATGAGAATGACA+CGG 0.666273 7:+58898476 MsG0780039160.01.T01:CDS
TGATGATAGAGGTGATGATG+TGG 0.667595 7:+58898095 MsG0780039160.01.T01:CDS
GATGGATTGTGATGTAGAGT+CGG 0.668424 7:+58897996 MsG0780039160.01.T01:CDS
TTAATGGGTTGTGTAAAGCA+GGG 0.669976 7:+58897830 MsG0780039160.01.T01:CDS
TGAAGCGATTAATGTGTGGG+AGG 0.685791 7:+58897963 MsG0780039160.01.T01:CDS
TTAGTGGGTTGTGTAAGTGT+GGG 0.687295 7:+58897620 MsG0780039160.01.T01:CDS
AGGCGAAGAAATTGGTGACG+TGG 0.689345 7:+58897335 MsG0780039160.01.T01:CDS
TGGATGAAGCGATTAATGTG+TGG 0.695613 7:+58897959 MsG0780039160.01.T01:CDS
TTCATCAAACACCTCCAACG+CGG 0.726107 7:-58897440 None:intergenic
TTTGATGAAATGTCTGAACG+AGG 0.791827 7:+58897454 MsG0780039160.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ACTTATAATATTGTTATAAA+TGG + Chr7:58898336-58898355 MsG0780039160.01.T01:CDS 10.0%
!! GTTATAATATTATTATTGAT+GGG + Chr7:58897497-58897516 MsG0780039160.01.T01:CDS 10.0%
!! TGTTATAATATTATTATTGA+TGG + Chr7:58897496-58897515 MsG0780039160.01.T01:CDS 10.0%
!! AGTTATAATATTATGATTAG+TGG + Chr7:58897604-58897623 MsG0780039160.01.T01:CDS 15.0%
!! GTTATAATATTATGATTAGT+GGG + Chr7:58897605-58897624 MsG0780039160.01.T01:CDS 15.0%
!! AATATTATATGAGATGATGT+CGG - Chr7:58898751-58898770 None:intergenic 20.0%
!! AGTTATAATGTGTTTCTTAA+TGG + Chr7:58897916-58897935 MsG0780039160.01.T01:CDS 20.0%
!! ATATTATAACTAACAACACT+CGG - Chr7:58897595-58897614 None:intergenic 20.0%
!! ATATTATAAGTCACAACATT+CGG - Chr7:58898327-58898346 None:intergenic 20.0%
!! GTTATAATGTGTTTCTTAAT+GGG + Chr7:58897917-58897936 MsG0780039160.01.T01:CDS 20.0%
!! TCATATAATATTACTCTCAA+TGG + Chr7:58898759-58898778 MsG0780039160.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATTGATGGGTTTTTTAAAAT+GGG + Chr7:58897511-58897530 MsG0780039160.01.T01:CDS 20.0%
!!! TATTGATGGGTTTTTTAAAA+TGG + Chr7:58897510-58897529 MsG0780039160.01.T01:CDS 20.0%
! ATATTATATGAGATGATGTC+GGG - Chr7:58898750-58898769 None:intergenic 25.0%
! ATGTTATGCATTGTAATATC+AGG - Chr7:58898543-58898562 None:intergenic 25.0%
! TGGGTTTATGAAAAATAACA+AGG + Chr7:58898251-58898270 MsG0780039160.01.T01:CDS 25.0%
! TTCATGGTTTATGTAAGAAT+GGG + Chr7:58898037-58898056 MsG0780039160.01.T01:CDS 25.0%
!!! AGCTTTTTCAGAATATGTTT+CGG + Chr7:58897131-58897150 MsG0780039160.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTAATGGGTTGTTTGAAAAT+GGG + Chr7:58897932-58897951 MsG0780039160.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTAGAGCTGTGATTTTTTAT+GGG + Chr7:58898880-58898899 MsG0780039160.01.T01:CDS 25.0%
AACCTTCATCAACACATTAT+AGG - Chr7:58897290-58897309 None:intergenic 30.0%
AAGCCTGATAAGTTTACTTA+TGG + Chr7:58897376-58897395 MsG0780039160.01.T01:CDS 30.0%
ACTTGTAATGCAATGCTTAA+TGG + Chr7:58897814-58897833 MsG0780039160.01.T01:CDS 30.0%
ATATTATAACAAGCCACATC+CGG - Chr7:58897487-58897506 None:intergenic 30.0%
ATGTTCCAAGTAATAACAGT+TGG - Chr7:58898855-58898874 None:intergenic 30.0%
CTTGTAATGCAATGCTTAAT+GGG + Chr7:58897815-58897834 MsG0780039160.01.T01:CDS 30.0%
GTTCATGGTTTATGTAAGAA+TGG + Chr7:58898036-58898055 MsG0780039160.01.T01:CDS 30.0%
GTTCCATAAGTAAACTTATC+AGG - Chr7:58897382-58897401 None:intergenic 30.0%
TCTATAATGCACTCATTGAT+GGG + Chr7:58898232-58898251 MsG0780039160.01.T01:CDS 30.0%
TGTTATCAGTTTCTTGCAAA+GGG + Chr7:58898510-58898529 MsG0780039160.01.T01:CDS 30.0%
TTATGCCAACTGTTATTACT+TGG + Chr7:58898847-58898866 MsG0780039160.01.T01:CDS 30.0%
! AAAATGGGTGATTTTGTGAA+GGG + Chr7:58897526-58897545 MsG0780039160.01.T01:CDS 30.0%
! ATGGAGGGTTTTTACAAAAT+TGG + Chr7:58898669-58898688 MsG0780039160.01.T01:CDS 30.0%
! GTTTTTCGCTTATTATGAGA+CGG + Chr7:58897240-58897259 MsG0780039160.01.T01:CDS 30.0%
! TAAAATGGGTGATTTTGTGA+AGG + Chr7:58897525-58897544 MsG0780039160.01.T01:CDS 30.0%
!! ACTTATGGAATATTGGTTCA+TGG + Chr7:58898021-58898040 MsG0780039160.01.T01:CDS 30.0%
!! ATGAAGGTTTTGTGTAAGAA+AGG + Chr7:58897301-58897320 MsG0780039160.01.T01:CDS 30.0%
!! CTTAATGGGTTGTTTGAAAA+TGG + Chr7:58897931-58897950 MsG0780039160.01.T01:CDS 30.0%
!! TGAAAAGGCATCAAAGATTT+GGG + Chr7:58898698-58898717 MsG0780039160.01.T01:CDS 30.0%
!! TGAAGGTTTTGTGTAAGAAA+GGG + Chr7:58897302-58897321 MsG0780039160.01.T01:CDS 30.0%
!!! GCTTTTTCAGAATATGTTTC+GGG + Chr7:58897132-58897151 MsG0780039160.01.T01:CDS 30.0%
!!! GGCTAAAGTTTTGAATTTGA+TGG + Chr7:58898179-58898198 MsG0780039160.01.T01:CDS 30.0%
!!! GTTAGAGCTGTGATTTTTTA+TGG + Chr7:58898879-58898898 MsG0780039160.01.T01:CDS 30.0%
!!! TAGAGCTGTGATTTTTTATG+GGG + Chr7:58898881-58898900 MsG0780039160.01.T01:CDS 30.0%
ACATTATAGGTCTGCACATT+TGG - Chr7:58897277-58897296 None:intergenic 35.0%
AGAGGATGAAGATGAATGAT+TGG + Chr7:58897671-58897690 MsG0780039160.01.T01:CDS 35.0%
ATCCATAGACTTTGTTCTTC+TGG + Chr7:58898567-58898586 MsG0780039160.01.T01:CDS 35.0%
ATTATGCTTTGCAGCTCTAT+TGG + Chr7:58898598-58898617 MsG0780039160.01.T01:CDS 35.0%
CAAAATTGGAGACTGTGAAA+AGG + Chr7:58898683-58898702 MsG0780039160.01.T01:CDS 35.0%
CAAGATGAATGAGAATGACA+CGG + Chr7:58898476-58898495 MsG0780039160.01.T01:CDS 35.0%
GTCTATAATGCACTCATTGA+TGG + Chr7:58898231-58898250 MsG0780039160.01.T01:CDS 35.0%
GTGCTGTATGTGATAATATC+TGG - Chr7:58898432-58898451 None:intergenic 35.0%
GTGTTATCAGTTTCTTGCAA+AGG + Chr7:58898509-58898528 MsG0780039160.01.T01:CDS 35.0%
TAAGAATGGGTATGTGACTA+AGG + Chr7:58898050-58898069 MsG0780039160.01.T01:CDS 35.0%
TAAGGAGAGTTTGGAGATAT+GGG + Chr7:58897648-58897667 MsG0780039160.01.T01:CDS 35.0%
TTAAGGAGAGTTTGGAGATA+TGG + Chr7:58897647-58897666 MsG0780039160.01.T01:CDS 35.0%
TTTGATGAAATGTCTGAACG+AGG + Chr7:58897454-58897473 MsG0780039160.01.T01:CDS 35.0%
! AGCATTAAGAAGTGTGTTGA+AGG - Chr7:58897185-58897204 None:intergenic 35.0%
! CTAAACGATGCTTTGGATAA+TGG + Chr7:58898822-58898841 MsG0780039160.01.T01:CDS 35.0%
! GACCTATAATGTGTTGATGA+AGG + Chr7:58897285-58897304 MsG0780039160.01.T01:CDS 35.0%
! TAAGAAAGGGGAGTTTTTGA+AGG + Chr7:58897315-58897334 MsG0780039160.01.T01:CDS 35.0%
! TTGAATTTGATGGATAAGCG+TGG + Chr7:58898189-58898208 MsG0780039160.01.T01:CDS 35.0%
! TTTTGCTGAGTCTCATCAAT+GGG + Chr7:58897204-58897223 MsG0780039160.01.T01:CDS 35.0%
!! ACAGTGCTATTCAAGTCTTT+TGG + Chr7:58898277-58898296 MsG0780039160.01.T01:CDS 35.0%
!! ACATATAGTGCGTTGATTCA+TGG + Chr7:58897709-58897728 MsG0780039160.01.T01:CDS 35.0%
!! CATATAGTGCGTTGATTCAT+GGG + Chr7:58897710-58897729 MsG0780039160.01.T01:CDS 35.0%
!! GAAGGTTTTGTGTAAGAAAG+GGG + Chr7:58897303-58897322 MsG0780039160.01.T01:CDS 35.0%
!! GTGAAAAGGCATCAAAGATT+TGG + Chr7:58898697-58898716 MsG0780039160.01.T01:CDS 35.0%
!! GTTTTTGAAGGCGAAGAAAT+TGG + Chr7:58897327-58897346 MsG0780039160.01.T01:CDS 35.0%
!! TTAATGGGTTGTGTAAAGCA+GGG + Chr7:58897830-58897849 MsG0780039160.01.T01:CDS 35.0%
!! TTTTGGAAAATGAGCACCAA+AGG + Chr7:58898294-58898313 MsG0780039160.01.T01:CDS 35.0%
AAAAGCTTCAACGCTTGATC+AGG - Chr7:58897118-58897137 None:intergenic 40.0%
AACCCTCCATAACAGTATTG+TGG - Chr7:58898659-58898678 None:intergenic 40.0%
ACCCACAATACTGTTATGGA+GGG + Chr7:58898654-58898673 MsG0780039160.01.T01:CDS 40.0%
ACCCTCCATAACAGTATTGT+GGG - Chr7:58898658-58898677 None:intergenic 40.0%
ACTTTGTTCTTCTGGCAAAG+TGG + Chr7:58898575-58898594 MsG0780039160.01.T01:CDS 40.0%
AGAAGGAAGGTTAGATGAAG+CGG + Chr7:58898158-58898177 MsG0780039160.01.T01:CDS 40.0%
CGTACTCGTCAATGATAAAC+GGG + Chr7:58898127-58898146 MsG0780039160.01.T01:CDS 40.0%
GAAAAGGGTTTATGAGGAGA+TGG + Chr7:58897762-58897781 MsG0780039160.01.T01:CDS 40.0%
GCGTACTCGTCAATGATAAA+CGG + Chr7:58898126-58898145 MsG0780039160.01.T01:CDS 40.0%
GGATGAAGCGATTAATGTGT+GGG + Chr7:58897960-58897979 MsG0780039160.01.T01:CDS 40.0%
GTCGGCAACTTATGGAATAT+TGG + Chr7:58898014-58898033 MsG0780039160.01.T01:CDS 40.0%
GTTGTTTGAAAATGGGAAGG+TGG + Chr7:58897939-58897958 MsG0780039160.01.T01:CDS 40.0%
TATCATTGACGAGTACGCAA+AGG - Chr7:58898124-58898143 None:intergenic 40.0%
TGAGTCTCATCAATGGGATA+GGG + Chr7:58897210-58897229 MsG0780039160.01.T01:CDS 40.0%
TGCCAGAAGAACAAAGTCTA+TGG - Chr7:58898572-58898591 None:intergenic 40.0%
TGGATGAAGCGATTAATGTG+TGG + Chr7:58897959-58897978 MsG0780039160.01.T01:CDS 40.0%
TGGGTTGTTTGAAAATGGGA+AGG + Chr7:58897936-58897955 MsG0780039160.01.T01:CDS 40.0%
TGGGTTTCTAAACGATGCTT+TGG + Chr7:58898815-58898834 MsG0780039160.01.T01:CDS 40.0%
TGTGAAGGGTAAGATGATGT+GGG + Chr7:58897540-58897559 MsG0780039160.01.T01:CDS 40.0%
TGTGACCCACAATACTGTTA+TGG + Chr7:58898650-58898669 MsG0780039160.01.T01:CDS 40.0%
TGTGTTGAAGGAACGAATAC+CGG - Chr7:58897173-58897192 None:intergenic 40.0%
TTGAGGAAATGCTGGAGAAA+GGG + Chr7:58898400-58898419 MsG0780039160.01.T01:CDS 40.0%
TTGATAGATGGTCTTTGCCA+GGG + Chr7:58898453-58898472 MsG0780039160.01.T01:CDS 40.0%
TTGTGAAGGGTAAGATGATG+TGG + Chr7:58897539-58897558 MsG0780039160.01.T01:CDS 40.0%
! ACATACAGCACGTTGATAGA+TGG + Chr7:58898441-58898460 MsG0780039160.01.T01:CDS 40.0%
! CTTTTGCTGAGTCTCATCAA+TGG + Chr7:58897203-58897222 MsG0780039160.01.T01:CDS 40.0%
! TGATGATAGAGGTGATGATG+TGG + Chr7:58898095-58898114 MsG0780039160.01.T01:CDS 40.0%
! TGATTTGGATGGAGCGAAAA+GGG + Chr7:58897747-58897766 MsG0780039160.01.T01:CDS 40.0%
! TTGATTCATGGGTTGTGTGA+AGG + Chr7:58897721-58897740 MsG0780039160.01.T01:CDS 40.0%
!! ATAAACGGGTTATGCAGAGA+AGG + Chr7:58898141-58898160 MsG0780039160.01.T01:CDS 40.0%
!! ATTAGTGGGTTGTGTAAGTG+TGG + Chr7:58897619-58897638 MsG0780039160.01.T01:CDS 40.0%
!! CTTAATGGGTTGTGTAAAGC+AGG + Chr7:58897829-58897848 MsG0780039160.01.T01:CDS 40.0%
!! GATGGATTGTGATGTAGAGT+CGG + Chr7:58897996-58898015 MsG0780039160.01.T01:CDS 40.0%
!! TTAGTGGGTTGTGTAAGTGT+GGG + Chr7:58897620-58897639 MsG0780039160.01.T01:CDS 40.0%
!!! ATGAGGAGATGGTTTTGAGA+GGG + Chr7:58897773-58897792 MsG0780039160.01.T01:CDS 40.0%
!!! TATGAGGAGATGGTTTTGAG+AGG + Chr7:58897772-58897791 MsG0780039160.01.T01:CDS 40.0%
!!! TGATGAGAGTTTTGAGCTGT+GGG + Chr7:58897858-58897877 MsG0780039160.01.T01:CDS 40.0%
!!! TTGATGAGAGTTTTGAGCTG+TGG + Chr7:58897857-58897876 MsG0780039160.01.T01:CDS 40.0%
AGAGTTTGGAGATATGGGAG+AGG + Chr7:58897653-58897672 MsG0780039160.01.T01:CDS 45.0%
ATGAGAATGACACGGCACTT+AGG + Chr7:58898484-58898503 MsG0780039160.01.T01:CDS 45.0%
CATTCTCATTCATCTTGCCC+TGG - Chr7:58898473-58898492 None:intergenic 45.0%
CTGAGTCTCATCAATGGGAT+AGG + Chr7:58897209-58897228 MsG0780039160.01.T01:CDS 45.0%
GACCCACAATACTGTTATGG+AGG + Chr7:58898653-58898672 MsG0780039160.01.T01:CDS 45.0%
GAGGTTGTTAAGGGTGGAAA+CGG + Chr7:58897564-58897583 MsG0780039160.01.T01:CDS 45.0%
GATGTAGAGTCGGCAACTTA+TGG + Chr7:58898006-58898025 MsG0780039160.01.T01:CDS 45.0%
GATGTGGGAGAGGTTGTTAA+GGG + Chr7:58897555-58897574 MsG0780039160.01.T01:CDS 45.0%
GGGCTCAAATCTCAGAAGAT+GGG + Chr7:58898718-58898737 MsG0780039160.01.T01:CDS 45.0%
GGTATGTGACTAAGGCTTTG+CGG + Chr7:58898058-58898077 MsG0780039160.01.T01:CDS 45.0%
GTATGTGACTAAGGCTTTGC+GGG + Chr7:58898059-58898078 MsG0780039160.01.T01:CDS 45.0%
GTGTAAGTGTGGGAGGTTTA+AGG + Chr7:58897630-58897649 MsG0780039160.01.T01:CDS 45.0%
GTGTTGAAGGAACGAATACC+GGG - Chr7:58897172-58897191 None:intergenic 45.0%
GTTGAGGAAATGCTGGAGAA+AGG + Chr7:58898399-58898418 MsG0780039160.01.T01:CDS 45.0%
GTTGTGTGAAGGTGGTGATT+TGG + Chr7:58897732-58897751 MsG0780039160.01.T01:CDS 45.0%
TCTCAATGGTCTCTGCACTT+GGG + Chr7:58898773-58898792 MsG0780039160.01.T01:CDS 45.0%
TGAAATGTCTGAACGAGGTG+TGG + Chr7:58897459-58897478 MsG0780039160.01.T01:CDS 45.0%
TGAAGCGATTAATGTGTGGG+AGG + Chr7:58897963-58897982 MsG0780039160.01.T01:CDS 45.0%
TGATGTGGGAGAGGTTGTTA+AGG + Chr7:58897554-58897573 MsG0780039160.01.T01:CDS 45.0%
TGGAGCGAAAAGGGTTTATG+AGG + Chr7:58897756-58897775 MsG0780039160.01.T01:CDS 45.0%
TGGGAGGTTTAAGGAGAGTT+TGG + Chr7:58897639-58897658 MsG0780039160.01.T01:CDS 45.0%
TGGGCTCAAATCTCAGAAGA+TGG + Chr7:58898717-58898736 MsG0780039160.01.T01:CDS 45.0%
TTCATCAAACACCTCCAACG+CGG - Chr7:58897443-58897462 None:intergenic 45.0%
TTCGCTTATTATGAGACGGC+AGG + Chr7:58897244-58897263 MsG0780039160.01.T01:CDS 45.0%
TTGGAAGGAGCTGATGATAG+AGG + Chr7:58898084-58898103 MsG0780039160.01.T01:CDS 45.0%
! AACATTCGGTGAGCAACCTT+TGG - Chr7:58898313-58898332 None:intergenic 45.0%
! ATGGATTTTGCAGAGCAGAG+AGG + Chr7:58898355-58898374 MsG0780039160.01.T01:CDS 45.0%
! ATTCATGGGTTGTGTGAAGG+TGG + Chr7:58897724-58897743 MsG0780039160.01.T01:CDS 45.0%
! GTGATTTGGATGGAGCGAAA+AGG + Chr7:58897746-58897765 MsG0780039160.01.T01:CDS 45.0%
! GTTGATAGATGGTCTTTGCC+AGG + Chr7:58898452-58898471 MsG0780039160.01.T01:CDS 45.0%
! TGTGAAGGTGGTGATTTGGA+TGG + Chr7:58897736-58897755 MsG0780039160.01.T01:CDS 45.0%
!! AGAAATTGGTGACGTGGATG+TGG + Chr7:58897341-58897360 MsG0780039160.01.T01:CDS 45.0%
!! GTAGAGTAACGGATGCAGTT+GGG + Chr7:58898796-58898815 MsG0780039160.01.T01:CDS 45.0%
!!! GATGGTTTTGAGAGGGGTTA+AGG + Chr7:58897780-58897799 MsG0780039160.01.T01:CDS 45.0%
!!! TGAGGAGATGGTTTTGAGAG+GGG + Chr7:58897774-58897793 MsG0780039160.01.T01:CDS 45.0%
AGGAAATGCTGGAGAAAGGG+TGG + Chr7:58898403-58898422 MsG0780039160.01.T01:CDS 50.0%
AGGGTAAGATGATGTGGGAG+AGG + Chr7:58897545-58897564 MsG0780039160.01.T01:CDS 50.0%
CCAGCATTTCCTCAACGCAA+TGG - Chr7:58898395-58898414 None:intergenic 50.0%
CCATTGCGTTGAGGAAATGC+TGG + Chr7:58898392-58898411 MsG0780039160.01.T01:CDS 50.0%
CGATTTGAATTCCGCGTTGG+AGG + Chr7:58897429-58897448 MsG0780039160.01.T01:CDS 50.0%
CTCAATGGTCTCTGCACTTG+GGG + Chr7:58898774-58898793 MsG0780039160.01.T01:CDS 50.0%
CTCTCAATGGTCTCTGCACT+TGG + Chr7:58898772-58898791 MsG0780039160.01.T01:CDS 50.0%
CTGCACTTGGGGTAGAGTAA+CGG + Chr7:58898785-58898804 MsG0780039160.01.T01:CDS 50.0%
GAAGTGTGGTTCGCGTAATG+TGG + Chr7:58897891-58897910 MsG0780039160.01.T01:CDS 50.0%
TCAACGCAATGGTATGCCTC+AGG - Chr7:58898384-58898403 None:intergenic 50.0%
TCGCGATTTGAATTCCGCGT+TGG + Chr7:58897426-58897445 MsG0780039160.01.T01:CDS 50.0%
TGAGGCATACCATTGCGTTG+AGG + Chr7:58898383-58898402 MsG0780039160.01.T01:CDS 50.0%
TGGGTTGTGTAAAGCAGGGA+AGG + Chr7:58897834-58897853 MsG0780039160.01.T01:CDS 50.0%
TTTGAGCTGTGGGAGGAGAT+GGG + Chr7:58897868-58897887 MsG0780039160.01.T01:CDS 50.0%
! ACGGGTTATGCAGAGAAGGA+AGG + Chr7:58898145-58898164 MsG0780039160.01.T01:CDS 50.0%
! TTTTGAGCTGTGGGAGGAGA+TGG + Chr7:58897867-58897886 MsG0780039160.01.T01:CDS 50.0%
!! AGGCGAAGAAATTGGTGACG+TGG + Chr7:58897335-58897354 MsG0780039160.01.T01:CDS 50.0%
!! GGTAGAGTAACGGATGCAGT+TGG + Chr7:58898795-58898814 MsG0780039160.01.T01:CDS 50.0%
!!! GGTTTTGAGAGGGGTTAAGG+CGG + Chr7:58897783-58897802 MsG0780039160.01.T01:CDS 50.0%
!!! TGAGAGTTTTGAGCTGTGGG+AGG + Chr7:58897861-58897880 MsG0780039160.01.T01:CDS 50.0%
!!! TGTTTCGGGTTTTCCGATGC+CGG + Chr7:58897146-58897165 MsG0780039160.01.T01:CDS 50.0%
CAGAGCAGAGAGGTTTCCTG+AGG + Chr7:58898365-58898384 MsG0780039160.01.T01:CDS 55.0%
GACTAAGGCTTTGCGGGTGT+TGG + Chr7:58898065-58898084 MsG0780039160.01.T01:CDS 55.0%
GTGGGAGAGGTTGTTAAGGG+TGG + Chr7:58897558-58897577 MsG0780039160.01.T01:CDS 55.0%
TGAAGGAACGAATACCGGGC+CGG - Chr7:58897168-58897187 None:intergenic 55.0%
TTGAGCTGTGGGAGGAGATG+GGG + Chr7:58897869-58897888 MsG0780039160.01.T01:CDS 55.0%
! GTGGGAGGTTTTGCGTGAGA+TGG + Chr7:58897978-58897997 MsG0780039160.01.T01:CDS 55.0%
! GTGGGTTGTGTAAGTGTGGG+AGG + Chr7:58897623-58897642 MsG0780039160.01.T01:CDS 55.0%
! TGACGTGGATGTGGAGTGCT+GGG + Chr7:58897350-58897369 MsG0780039160.01.T01:CDS 55.0%
!! AAGGCTTTGCGGGTGTTGGA+AGG + Chr7:58898069-58898088 MsG0780039160.01.T01:CDS 55.0%
AACGAATACCGGGCCGGCAT+CGG - Chr7:58897162-58897181 None:intergenic 60.0%
GTCTGAACGAGGTGTGGAGC+CGG + Chr7:58897465-58897484 MsG0780039160.01.T01:CDS 60.0%
GTGACGTGGATGTGGAGTGC+TGG + Chr7:58897349-58897368 MsG0780039160.01.T01:CDS 60.0%
TGGGAGGAGATGGGGAAGTG+TGG + Chr7:58897877-58897896 MsG0780039160.01.T01:CDS 60.0%
ACGAGGTGTGGAGCCGGATG+TGG + Chr7:58897471-58897490 MsG0780039160.01.T01:CDS 65.0%
! CGGGTTTTCCGATGCCGGCC+CGG + Chr7:58897151-58897170 MsG0780039160.01.T01:CDS 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 58897112 58898914 58897112 ID=MsG0780039160.01;Name=MsG0780039160.01
Chr7 mRNA 58897112 58898914 58897112 ID=MsG0780039160.01.T01;Parent=MsG0780039160.01;Name=MsG0780039160.01.T01;_AED=0.27;_eAED=0.27;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|600
Chr7 exon 58897112 58898914 58897112 ID=MsG0780039160.01.T01:exon:6875;Parent=MsG0780039160.01.T01
Chr7 CDS 58897112 58898914 58897112 ID=MsG0780039160.01.T01:cds;Parent=MsG0780039160.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780039160.01.T01

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Protein sequence

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