AlfalfaGEDB | MsG0180003188.01

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180003188.01

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
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CRISPR-GE

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!	GTACATGGTTTATTACAAAA+GGG	+	Chr1:58125969-58125988	MsG0180003188.01.T01:intron	25.0%
!	TGTACATGGTTTATTACAAA+AGG	+	Chr1:58125968-58125987	MsG0180003188.01.T01:intron	25.0%
!	TGTTGAAATTATGAAGAGAA+GGG	+	Chr1:58124544-58124563	MsG0180003188.01.T01:CDS	25.0%
!	TTATCTCCATAACAAATTCT+GGG	-	Chr1:58125327-58125346	None:intergenic	25.0%
!	TTATTGTGAATTGAATGTTG+AGG	+	Chr1:58123831-58123850	MsG0180003188.01.T01:CDS	25.0%
!	TTCTTCTCATTTCATATAAC+AGG	-	Chr1:58125493-58125512	None:intergenic	25.0%
!	TTGTTGAAATTATGAAGAGA+AGG	+	Chr1:58124543-58124562	MsG0180003188.01.T01:CDS	25.0%
!	TTTGAAAATATGCAAAAGTG+TGG	+	Chr1:58124123-58124142	MsG0180003188.01.T01:CDS	25.0%
!!	ATATACGATTTTGTGAAACA+TGG	-	Chr1:58124820-58124839	None:intergenic	25.0%
!!	TACTTATCTCTAACTTTTCT+TGG	-	Chr1:58125291-58125310	None:intergenic	25.0%
!!!	TGTTTTAAAATTCCGCATTT+GGG	+	Chr1:58123877-58123896	MsG0180003188.01.T01:CDS	25.0%
!!!	TTTTCGATAGAGTTTTGAAA+AGG	+	Chr1:58123854-58123873	MsG0180003188.01.T01:CDS	25.0%
	AACATTGCAATCAAAATTGC+AGG	+	Chr1:58125437-58125456	MsG0180003188.01.T01:intron	30.0%
	ACATTGCAATCAAAATTGCA+GGG	+	Chr1:58125438-58125457	MsG0180003188.01.T01:intron	30.0%
	ACGATCATGATCATGATTTA+CGG	+	Chr1:58125542-58125561	MsG0180003188.01.T01:intron	30.0%
	ACTAAGGTCTCAAAATATTC+AGG	-	Chr1:58124479-58124498	None:intergenic	30.0%
	AGGAATTAAACCAGATATTG+TGG	+	Chr1:58124772-58124791	MsG0180003188.01.T01:CDS	30.0%
	AGGTTTCAATCAATTCTTTG+TGG	-	Chr1:58125742-58125761	None:intergenic	30.0%
	ATAACTTACATGGAAACCAA+GGG	+	Chr1:58125019-58125038	MsG0180003188.01.T01:CDS	30.0%
	ATATGAGGAAATGCTAGAAT+CGG	+	Chr1:58126122-58126141	MsG0180003188.01.T01:intron	30.0%
	ATATTGCTATGGAGTTCTAT+AGG	+	Chr1:58124211-58124230	MsG0180003188.01.T01:CDS	30.0%
	ATCCAATAACATCAGAAACA+TGG	+	Chr1:58125519-58125538	MsG0180003188.01.T01:intron	30.0%
	ATGGTCCTTTGAATTTCATA+CGG	-	Chr1:58126235-58126254	None:intergenic	30.0%
	ATTTATTAAGGAGCTTTGCA+AGG	+	Chr1:58124910-58124929	MsG0180003188.01.T01:CDS	30.0%
	CAATACTTTGACAATGTCAT+CGG	-	Chr1:58124945-58124964	None:intergenic	30.0%
	GAAATAATTCGAGGTGAAAA+TGG	+	Chr1:58123772-58123791	MsG0180003188.01.T01:CDS	30.0%
	GAGATTATGGAAATAATTCG+AGG	+	Chr1:58123763-58123782	MsG0180003188.01.T01:CDS	30.0%
	GATGTGTAAACATGTATTGT+AGG	-	Chr1:58126051-58126070	None:intergenic	30.0%
	GGTTTCAATCAATTCTTTGT+GGG	-	Chr1:58125741-58125760	None:intergenic	30.0%
	GTCGTATTCGGTATTTATTA+AGG	+	Chr1:58124898-58124917	MsG0180003188.01.T01:CDS	30.0%
	GTGAATACAATGAAACAAGA+AGG	+	Chr1:58126017-58126036	MsG0180003188.01.T01:intron	30.0%
	GTTCAAGGGATTATCATAAA+TGG	+	Chr1:58124584-58124603	MsG0180003188.01.T01:CDS	30.0%
	TAAGATGCTTATGAACTGTA+TGG	+	Chr1:58124278-58124297	MsG0180003188.01.T01:CDS	30.0%
	TATAACTTACATGGAAACCA+AGG	+	Chr1:58125018-58125037	MsG0180003188.01.T01:CDS	30.0%
	TATCTCCATAACAAATTCTG+GGG	-	Chr1:58125326-58125345	None:intergenic	30.0%
	TATTGCTATGGAGTTCTATA+GGG	+	Chr1:58124212-58124231	MsG0180003188.01.T01:CDS	30.0%
	TGTTTCAAAGAGATGAAAGA+TGG	+	Chr1:58125596-58125615	MsG0180003188.01.T01:CDS	30.0%
	TTCAAAAGGATGTAAATACG+TGG	+	Chr1:58124043-58124062	MsG0180003188.01.T01:CDS	30.0%
	TTCTACCGTATGAAATTCAA+AGG	+	Chr1:58126227-58126246	MsG0180003188.01.T01:CDS	30.0%
	TTGTTTCATTGTATTCACCT+TGG	-	Chr1:58126015-58126034	None:intergenic	30.0%
	TTTCAAAGCATGAAAGAATC+TGG	+	Chr1:58124647-58124666	MsG0180003188.01.T01:CDS	30.0%
!	ACTCTATCCTGAAAATTTTG+AGG	+	Chr1:58125090-58125109	MsG0180003188.01.T01:CDS	30.0%
!	AGATGAAAACTTTACCGTTT+TGG	+	Chr1:58123687-58123706	MsG0180003188.01.T01:CDS	30.0%
!	CATACTCTTGAAAATTTTCC+AGG	-	Chr1:58124849-58124868	None:intergenic	30.0%
!	CTTAAGAGCTTTTGTATTTC+TGG	+	Chr1:58124393-58124412	MsG0180003188.01.T01:intron	30.0%
!	TGATGATGCTCTCAAATATA+CGG	+	Chr1:58125691-58125710	MsG0180003188.01.T01:CDS	30.0%
!	TTTATGGGTTGAATAGAGAA+GGG	+	Chr1:58126390-58126409	MsG0180003188.01.T01:CDS	30.0%
!!	ACATTGTACTTGATGATGTA+AGG	+	Chr1:58124250-58124269	MsG0180003188.01.T01:CDS	30.0%
!!	ACTTATGGAAGTATTGTACA+TGG	+	Chr1:58125954-58125973	MsG0180003188.01.T01:intron	30.0%
!!	CATCTCTTTGAAACAATTCA+TGG	-	Chr1:58125591-58125610	None:intergenic	30.0%
!!	CTGGAAAATTTTCAAGAGTA+TGG	+	Chr1:58124847-58124866	MsG0180003188.01.T01:CDS	30.0%
!!	GTTCTAAAGTTAACAGTACT+AGG	-	Chr1:58126365-58126384	None:intergenic	30.0%
!!	TTTTAACTGGTTGAAGCTTA+AGG	+	Chr1:58123909-58123928	MsG0180003188.01.T01:CDS	30.0%
!!	TTTTATGGGTTGAATAGAGA+AGG	+	Chr1:58126389-58126408	MsG0180003188.01.T01:CDS	30.0%
!!!	GTGTTTTAAAATTCCGCATT+TGG	+	Chr1:58123876-58123895	MsG0180003188.01.T01:CDS	30.0%
	AATTCGAGGTGAAAATGGTT+CGG	+	Chr1:58123777-58123796	MsG0180003188.01.T01:CDS	35.0%
	ACCATTCTTGTGTCTCTTTA+TGG	+	Chr1:58124066-58124085	MsG0180003188.01.T01:CDS	35.0%
	ACTTGTATGTACTCCTACTT+GGG	-	Chr1:58125631-58125650	None:intergenic	35.0%
	AGAAGAAGATATGTGTCGAA+TGG	+	Chr1:58123735-58123754	MsG0180003188.01.T01:CDS	35.0%
	ATAAACAACGAGTAGCTAAG+AGG	-	Chr1:58125848-58125867	None:intergenic	35.0%
	ATTCGTTTGCTTTGTAGTTC+GGG	+	Chr1:58124180-58124199	MsG0180003188.01.T01:CDS	35.0%
	CAACTTTGCAAAGACAAGAA+AGG	-	Chr1:58126286-58126305	None:intergenic	35.0%
	CATTCGTTTGCTTTGTAGTT+CGG	+	Chr1:58124179-58124198	MsG0180003188.01.T01:CDS	35.0%
	CCATGTAAGTTATAACCCAA+CGG	-	Chr1:58125012-58125031	None:intergenic	35.0%
	CCATTCTTGTGTCTCTTTAT+GGG	+	Chr1:58124067-58124086	MsG0180003188.01.T01:CDS	35.0%
	CTGTATCAGTTCAGTATATG+AGG	-	Chr1:58124690-58124709	None:intergenic	35.0%
	CTTGGTTGCTTATGTGAAAT+GGG	+	Chr1:58125764-58125783	MsG0180003188.01.T01:intron	35.0%
	CTTTCTTGTCTTTGCAAAGT+TGG	+	Chr1:58126284-58126303	MsG0180003188.01.T01:CDS	35.0%
	GAAGAGCGATTAGAAAAGAT+GGG	+	Chr1:58123808-58123827	MsG0180003188.01.T01:CDS	35.0%
	GAATTGATTGAAACCTACCT+TGG	+	Chr1:58125746-58125765	MsG0180003188.01.T01:intron	35.0%
	GAGACTTCTTACTGAAATGT+TGG	+	Chr1:58126325-58126344	MsG0180003188.01.T01:CDS	35.0%
	GCCGAATATGTAACAACATT+TGG	-	Chr1:58126155-58126174	None:intergenic	35.0%
	TAAACAACGAGTAGCTAAGA+GGG	-	Chr1:58125847-58125866	None:intergenic	35.0%
	TAACTTACATGGAAACCAAG+GGG	+	Chr1:58125020-58125039	MsG0180003188.01.T01:CDS	35.0%
	TACGGTGAGATGATTAATTC+CGG	+	Chr1:58125709-58125728	MsG0180003188.01.T01:intron	35.0%
	TACTTGTATGTACTCCTACT+TGG	-	Chr1:58125632-58125651	None:intergenic	35.0%
	TCACTGTAAGTCTTGAGAAT+TGG	-	Chr1:58125211-58125230	None:intergenic	35.0%
	TCAGTATATGAGGAAACTGT+AGG	-	Chr1:58124680-58124699	None:intergenic	35.0%
	TCTTTGTAGAGCTAGAAAAG+TGG	+	Chr1:58125872-58125891	MsG0180003188.01.T01:intron	35.0%
	TGACCAACCAAAATCAGAAA+AGG	+	Chr1:58125165-58125184	MsG0180003188.01.T01:CDS	35.0%
	TGCAATGTTGTATGATTCTG+TGG	-	Chr1:58125426-58125445	None:intergenic	35.0%
	TTACTGAAATGTTGGAGAGT+GGG	+	Chr1:58126333-58126352	MsG0180003188.01.T01:CDS	35.0%
	TTCAAAGAGATGAAAGATGG+TGG	+	Chr1:58125599-58125618	MsG0180003188.01.T01:CDS	35.0%
	TTCTTTCATCCTCTCTAGAT+TGG	+	Chr1:58125257-58125276	MsG0180003188.01.T01:CDS	35.0%
!	CAAAGATGAAGTATTCCGTT+GGG	+	Chr1:58124994-58125013	MsG0180003188.01.T01:CDS	35.0%
!	CAGTCTACCTTTTCTGATTT+TGG	-	Chr1:58125175-58125194	None:intergenic	35.0%
!	CTAAATTTCTTTTCGTGGGT+GGG	+	Chr1:58125379-58125398	MsG0180003188.01.T01:intron	35.0%
!	CTTGAAAATTTTCCAGGCTT+CGG	-	Chr1:58124843-58124862	None:intergenic	35.0%
!	GAAAATCAGTGAAGCTTTGT+TGG	+	Chr1:58124098-58124117	MsG0180003188.01.T01:CDS	35.0%
!	GGTGCTAAATTTCTTTTCGT+GGG	+	Chr1:58125375-58125394	MsG0180003188.01.T01:intron	35.0%
!	GTCCATGTTTCTGATGTTAT+TGG	-	Chr1:58125524-58125543	None:intergenic	35.0%
!	TCAAAGATGAAGTATTCCGT+TGG	+	Chr1:58124993-58125012	MsG0180003188.01.T01:CDS	35.0%
!	TCAGACTCCTCAAAATTTTC+AGG	-	Chr1:58125100-58125119	None:intergenic	35.0%
!!	ACTAGAAGAAGCATTAACCA+AGG	+	Chr1:58125995-58126014	MsG0180003188.01.T01:intron	35.0%
!!	AGCATCTGTTTAAGTTGAGT+AGG	+	Chr1:58124708-58124727	MsG0180003188.01.T01:CDS	35.0%
!!	CTACCTTTTCTGATTTTGGT+TGG	-	Chr1:58125171-58125190	None:intergenic	35.0%
!!	TTCTCCCATTTTAACCAACT+GGG	-	Chr1:58123719-58123738	None:intergenic	35.0%
!!!	AGAGCTTTTGTATTTCTGGT+AGG	+	Chr1:58124397-58124416	MsG0180003188.01.T01:intron	35.0%
!!!	ATTTTGAGACCTTAGTGAGA+GGG	+	Chr1:58124483-58124502	MsG0180003188.01.T01:CDS	35.0%
!!!	TATTTTGAGACCTTAGTGAG+AGG	+	Chr1:58124482-58124501	MsG0180003188.01.T01:CDS	35.0%
	AAAACCCTCAAACCCAAATG+CGG	-	Chr1:58123892-58123911	None:intergenic	40.0%
	AAAATCGTATATCCGAAGCC+TGG	+	Chr1:58124828-58124847	MsG0180003188.01.T01:CDS	40.0%
	AACTGGTTGAAGCTTAAGGA+TGG	+	Chr1:58123913-58123932	MsG0180003188.01.T01:CDS	40.0%
	AACTTACATGGAAACCAAGG+GGG	+	Chr1:58125021-58125040	MsG0180003188.01.T01:CDS	40.0%
	AAGAGAAGGGACATTGTTGT+GGG	+	Chr1:58124557-58124576	MsG0180003188.01.T01:CDS	40.0%
	AAGATGTTCGCGATGTATGT+AGG	+	Chr1:58125233-58125252	MsG0180003188.01.T01:CDS	40.0%
	AATACCATGTTGTGTCTTGC+CGG	+	Chr1:58123961-58123980	MsG0180003188.01.T01:CDS	40.0%
	AATGAGGTGGAAGAAGATAG+AGG	+	Chr1:58125139-58125158	MsG0180003188.01.T01:CDS	40.0%
	AATTCTTTGTGGGACATGTC+CGG	-	Chr1:58125731-58125750	None:intergenic	40.0%
	ACATATTCGGCACTTATACG+TGG	+	Chr1:58126164-58126183	MsG0180003188.01.T01:intron	40.0%
	ACTTCAAAGATTCGGCTACA+CGG	+	Chr1:58125820-58125839	MsG0180003188.01.T01:intron	40.0%
	AGAAGATATGTGTCGAATGG+TGG	+	Chr1:58123738-58123757	MsG0180003188.01.T01:CDS	40.0%
	AGATGCCCAGTTGGTTAAAA+TGG	+	Chr1:58123711-58123730	MsG0180003188.01.T01:CDS	40.0%
	ATCTGATCATCGCCTTATGT+GGG	+	Chr1:58125651-58125670	MsG0180003188.01.T01:CDS	40.0%
	ATGAACTGTATGGCAGAATC+AGG	+	Chr1:58124288-58124307	MsG0180003188.01.T01:CDS	40.0%
	ATGCTGTATGATGAGATGCT+CGG	+	Chr1:58124746-58124765	MsG0180003188.01.T01:CDS	40.0%
	CATATTCGGCACTTATACGT+GGG	+	Chr1:58126165-58126184	MsG0180003188.01.T01:intron	40.0%
	CCATTTCACATAAGCAACCA+AGG	-	Chr1:58125766-58125785	None:intergenic	40.0%
	CCCATAAAGAGACACAAGAA+TGG	-	Chr1:58124070-58124089	None:intergenic	40.0%
	CCGTTGGGTTATAACTTACA+TGG	+	Chr1:58125009-58125028	MsG0180003188.01.T01:CDS	40.0%
	CCTTGGTTGCTTATGTGAAA+TGG	+	Chr1:58125763-58125782	MsG0180003188.01.T01:intron	40.0%
	CTGGTAGGATTAAGAAGCTT+TGG	+	Chr1:58124412-58124431	MsG0180003188.01.T01:intron	40.0%
	CTTACTGAAATGTTGGAGAG+TGG	+	Chr1:58126332-58126351	MsG0180003188.01.T01:CDS	40.0%
	GAAGATATGTGTCGAATGGT+GGG	+	Chr1:58123739-58123758	MsG0180003188.01.T01:CDS	40.0%
	GATGCCCAGTTGGTTAAAAT+GGG	+	Chr1:58123712-58123731	MsG0180003188.01.T01:CDS	40.0%
	GATTGAAGACCAATCTAGAG+AGG	-	Chr1:58125269-58125288	None:intergenic	40.0%
	GCATGAATAGTTGAAGAAGC+TGG	+	Chr1:58125903-58125922	MsG0180003188.01.T01:intron	40.0%
	GGAAGAGCGATTAGAAAAGA+TGG	+	Chr1:58123807-58123826	MsG0180003188.01.T01:CDS	40.0%
	GGATGAATGTGGAGTTCAAA+AGG	+	Chr1:58124029-58124048	MsG0180003188.01.T01:CDS	40.0%
	GTTCTATACGAAACCACATC+AGG	-	Chr1:58124156-58124175	None:intergenic	40.0%
	GTTGAATAGAGAAGGGAACA+AGG	+	Chr1:58126397-58126416	MsG0180003188.01.T01:CDS	40.0%
	TATCTGATCATCGCCTTATG+TGG	+	Chr1:58125650-58125669	MsG0180003188.01.T01:CDS	40.0%
	TATGATGAGATGCTCGGAAA+AGG	+	Chr1:58124752-58124771	MsG0180003188.01.T01:CDS	40.0%
	TATGGAGTTCTATAGGGACA+TGG	+	Chr1:58124218-58124237	MsG0180003188.01.T01:CDS	40.0%
	TCTTGTGTCTCTTTATGGGA+AGG	+	Chr1:58124071-58124090	MsG0180003188.01.T01:CDS	40.0%
	TGAAATGGGTAGCATTGTAG+AGG	+	Chr1:58125778-58125797	MsG0180003188.01.T01:intron	40.0%
	TGCTTGGAAATGACATGACT+CGG	+	Chr1:58124331-58124350	MsG0180003188.01.T01:intron	40.0%
	TTCACATAAGCAACCAAGGT+AGG	-	Chr1:58125762-58125781	None:intergenic	40.0%
	TTGCTTTGTAGTTCGGGTAA+GGG	+	Chr1:58124186-58124205	MsG0180003188.01.T01:CDS	40.0%
	TTTGCTTTGTAGTTCGGGTA+AGG	+	Chr1:58124185-58124204	MsG0180003188.01.T01:CDS	40.0%
!	AAATTCCGCATTTGGGTTTG+AGG	+	Chr1:58123884-58123903	MsG0180003188.01.T01:CDS	40.0%
!	AATTCCGCATTTGGGTTTGA+GGG	+	Chr1:58123885-58123904	MsG0180003188.01.T01:CDS	40.0%
!	ACGAGTGTCATTGAGAAATG+AGG	+	Chr1:58125123-58125142	MsG0180003188.01.T01:CDS	40.0%
!	AGTGTCATTGAGAAATGAGG+TGG	+	Chr1:58125126-58125145	MsG0180003188.01.T01:CDS	40.0%
!	ATGCCGGAAAACAGTGTTTT+TGG	+	Chr1:58124363-58124382	MsG0180003188.01.T01:intron	40.0%
!	CACCCAAAAACACTGTTTTC+CGG	-	Chr1:58124369-58124388	None:intergenic	40.0%
!	GCTAAATTTCTTTTCGTGGG+TGG	+	Chr1:58125378-58125397	MsG0180003188.01.T01:intron	40.0%
!	TGCCGGAAAACAGTGTTTTT+GGG	+	Chr1:58124364-58124383	MsG0180003188.01.T01:intron	40.0%
!	TGGAGAGGTATAATGATGCA+TGG	+	Chr1:58126198-58126217	MsG0180003188.01.T01:intron	40.0%
!	TGGGTTTGAGGGTTTTTAAC+TGG	+	Chr1:58123896-58123915	MsG0180003188.01.T01:CDS	40.0%
!	TTCAAGAGTATGGAAAGCCA+AGG	+	Chr1:58124857-58124876	MsG0180003188.01.T01:CDS	40.0%
!!	CGGTGCTAAATTTCTTTTCG+TGG	+	Chr1:58125374-58125393	MsG0180003188.01.T01:intron	40.0%
!!	CTTCTCCCATTTTAACCAAC+TGG	-	Chr1:58123720-58123739	None:intergenic	40.0%
!!	GTTCACCCCAGAATTTGTTA+TGG	+	Chr1:58125318-58125337	MsG0180003188.01.T01:CDS	40.0%
!!	TGAAAATGGTTCGGTTTCTG+TGG	+	Chr1:58123786-58123805	MsG0180003188.01.T01:CDS	40.0%
!!!	TTTTAAAGCAAACTCCCCCT+TGG	-	Chr1:58125038-58125057	None:intergenic	40.0%
	ACCGAATACGACTTCCATGT+AGG	-	Chr1:58124890-58124909	None:intergenic	45.0%
	ACGGAGAAACGATGTTTGCT+TGG	+	Chr1:58124613-58124632	MsG0180003188.01.T01:CDS	45.0%
	AGAAGGTAAGGAGTTTGGGT+TGG	+	Chr1:58123984-58124003	MsG0180003188.01.T01:CDS	45.0%
	AGAGAAGGGACATTGTTGTG+GGG	+	Chr1:58124558-58124577	MsG0180003188.01.T01:CDS	45.0%
	ATCAAGAACCACACTCTCTG+CGG	-	Chr1:58123665-58123684	None:intergenic	45.0%
	ATCATGATTTACGGCCGAAC+AGG	+	Chr1:58125551-58125570	MsG0180003188.01.T01:intron	45.0%
	ATGCAAAGCTGCAGTATGCA+TGG	+	Chr1:58125346-58125365	MsG0180003188.01.T01:intron	45.0%
	ATGGTGGTTATTGCCCAAGT+AGG	+	Chr1:58125615-58125634	MsG0180003188.01.T01:CDS	45.0%
	ATTGTTGTGGGGAACGTTCA+AGG	+	Chr1:58124569-58124588	MsG0180003188.01.T01:CDS	45.0%
	CAACTGGGCATCTTCCAAAA+CGG	-	Chr1:58123704-58123723	None:intergenic	45.0%
	CCATCTCTGTCAAACCTGTT+CGG	-	Chr1:58125568-58125587	None:intergenic	45.0%
	CTATAGGGACATGGTCAAGA+AGG	+	Chr1:58124227-58124246	MsG0180003188.01.T01:CDS	45.0%
	GAAGAGAAGGGACATTGTTG+TGG	+	Chr1:58124556-58124575	MsG0180003188.01.T01:CDS	45.0%
	GCCTACATGGAAGTCGTATT+CGG	+	Chr1:58124886-58124905	MsG0180003188.01.T01:CDS	45.0%
	GCTGTTATGGCCACAATATC+TGG	-	Chr1:58124785-58124804	None:intergenic	45.0%
	GGGTAAGGGTGATATTGCTA+TGG	+	Chr1:58124200-58124219	MsG0180003188.01.T01:CDS	45.0%
	GTGGAGGAAATGGATGAATG+TGG	+	Chr1:58124018-58124037	MsG0180003188.01.T01:CDS	45.0%
	TATACGTGGGTACATGAACG+TGG	+	Chr1:58126178-58126197	MsG0180003188.01.T01:intron	45.0%
	TATTGTGGCCATAACAGCCA+TGG	+	Chr1:58124787-58124806	MsG0180003188.01.T01:CDS	45.0%
	TTGTTGTGGGGAACGTTCAA+GGG	+	Chr1:58124570-58124589	MsG0180003188.01.T01:CDS	45.0%
!	TCTGCGGCATTTTCACAAAC+AGG	-	Chr1:58123649-58123668	None:intergenic	45.0%
!!	GAAGAAGTTGGTGGAGGAAA+TGG	+	Chr1:58124008-58124027	MsG0180003188.01.T01:CDS	45.0%
!!	GTTTGGGTTGGTGAAGAAGT+TGG	+	Chr1:58123996-58124015	MsG0180003188.01.T01:CDS	45.0%
!!	TCGAATGGTGGGTGAGATTA+TGG	+	Chr1:58123750-58123769	MsG0180003188.01.T01:CDS	45.0%
	ATCGCCTTATGTGGGAGGAA+AGG	+	Chr1:58125659-58125678	MsG0180003188.01.T01:CDS	50.0%
	ATGTTGTGTCTTGCCGGAGA+AGG	+	Chr1:58123967-58123986	MsG0180003188.01.T01:CDS	50.0%
	CAATCAAAATTGCAGGGCGC+GGG	+	Chr1:58125444-58125463	MsG0180003188.01.T01:intron	50.0%
	CCCAAACTCCTTACCTTCTC+CGG	-	Chr1:58123983-58124002	None:intergenic	50.0%
	CCGAACAGGTTTGACAGAGA+TGG	+	Chr1:58125565-58125584	MsG0180003188.01.T01:intron	50.0%
	CCGGAGAAGGTAAGGAGTTT+GGG	+	Chr1:58123980-58123999	MsG0180003188.01.T01:CDS	50.0%
	CCTTATGTGGGAGGAAAGGA+AGG	+	Chr1:58125663-58125682	MsG0180003188.01.T01:CDS	50.0%
	CCTTCCTTTCCTCCCACATA+AGG	-	Chr1:58125666-58125685	None:intergenic	50.0%
	CTTACACAGCCCTCTCACTA+AGG	-	Chr1:58124495-58124514	None:intergenic	50.0%
	CTTAGTGAGAGGGCTGTGTA+AGG	+	Chr1:58124493-58124512	MsG0180003188.01.T01:CDS	50.0%
	GCAATCAAAATTGCAGGGCG+CGG	+	Chr1:58125443-58125462	MsG0180003188.01.T01:intron	50.0%
	TCAGGAGATGTTGCAGCTGT+TGG	+	Chr1:58124306-58124325	MsG0180003188.01.T01:CDS	50.0%
	TCCATGTAGGCTTGATGCCT+TGG	-	Chr1:58124877-58124896	None:intergenic	50.0%
	TGAAAATGCCGCAGAGAGTG+TGG	+	Chr1:58123654-58123673	MsG0180003188.01.T01:CDS	50.0%
	TGATCATCGCCTTATGTGGG+AGG	+	Chr1:58125654-58125673	MsG0180003188.01.T01:CDS	50.0%
	TGGGTAGCATTGTAGAGGCT+AGG	+	Chr1:58125783-58125802	MsG0180003188.01.T01:intron	50.0%
	TTCTCCGGCAAGACACAACA+TGG	-	Chr1:58123968-58123987	None:intergenic	50.0%
!!	GTTGCAGCTGTTGGTTTGCT+TGG	+	Chr1:58124315-58124334	MsG0180003188.01.T01:intron	50.0%
!!	GTTGGTGAAGAAGTTGGTGG+AGG	+	Chr1:58124002-58124021	MsG0180003188.01.T01:CDS	50.0%
!!	TGGGTTGGTGAAGAAGTTGG+TGG	+	Chr1:58123999-58124018	MsG0180003188.01.T01:CDS	50.0%
!!!	CGTTTTGGAAGATGCCCAGT+TGG	+	Chr1:58123702-58123721	MsG0180003188.01.T01:CDS	50.0%
	CTGCAGTATGCATGGCTGCT+CGG	+	Chr1:58125354-58125373	MsG0180003188.01.T01:intron	55.0%
	GCCGGAGAAGGTAAGGAGTT+TGG	+	Chr1:58123979-58123998	MsG0180003188.01.T01:CDS	55.0%
	GTGGGTACATGAACGTGGAG+AGG	+	Chr1:58126183-58126202	MsG0180003188.01.T01:intron	55.0%
	GTGTCTTGCCGGAGAAGGTA+AGG	+	Chr1:58123972-58123991	MsG0180003188.01.T01:CDS	55.0%
	GTGTGGCTGTGAACCTGATG+TGG	+	Chr1:58124140-58124159	MsG0180003188.01.T01:CDS	55.0%
	TCTGTGGTGTGTCTGTAGCC+AGG	-	Chr1:58125410-58125429	None:intergenic	55.0%
	TGAAACATGGCCTGCAGCCA+TGG	-	Chr1:58124807-58124826	None:intergenic	55.0%
	TTTCGTGGGTGGGAAAGACC+TGG	+	Chr1:58125389-58125408	MsG0180003188.01.T01:intron	55.0%
!	GACTCGGTTGTGTCTGATGC+CGG	+	Chr1:58124347-58124366	MsG0180003188.01.T01:intron	55.0%
!	GCCAAGGCATCAAGCCTACA+TGG	+	Chr1:58124873-58124892	MsG0180003188.01.T01:CDS	55.0%
	GAGGGCTGTGTAAGGCAGGA+AGG	+	Chr1:58124501-58124520	MsG0180003188.01.T01:CDS	60.0%
	GCCATAACAGCCATGGCTGC+AGG	+	Chr1:58124794-58124813	MsG0180003188.01.T01:CDS	60.0%
	GCCTGCAGCCATGGCTGTTA+TGG	-	Chr1:58124798-58124817	None:intergenic	60.0%
	GTGAGAGGGCTGTGTAAGGC+AGG	+	Chr1:58124497-58124516	MsG0180003188.01.T01:CDS	60.0%

Chromosome	Type	Strat	End	Strand	Name
Chr1	gene	58123613	58126424	58123613	ID=MsG0180003188.01;
Chr1	mRNA	58123613	58126424	58123613	ID=MsG0180003188.01.T01;Parent=MsG0180003188.01
Chr1	CDS	58123613	58124327	58123613	ID=MsG0180003188.01.T01.cds;Parent=MsG0180003188.01.T01
Chr1	CDS	58124426	58125358	58124426	ID=MsG0180003188.01.T01.cds;Parent=MsG0180003188.01.T01
Chr1	CDS	58125573	58125712	58125573	ID=MsG0180003188.01.T01.cds;Parent=MsG0180003188.01.T01
Chr1	CDS	58126203	58126424	58126203	ID=MsG0180003188.01.T01.cds;Parent=MsG0180003188.01.T01

Gene Sequence

>MsG0180003188.01.T01

ATGGGTTTTAAGGAGAAACATGAGTGCACTGAACCTGTTTGTGAAAATGCCGCAGAGAGTGTGGTTCTTGATAAAGATGAAAACTTTACCGTTTTGGAAGATGCCCAGTTGGTTAAAATGGGAGAAGAAGATATGTGTCGAATGGTGGGTGAGATTATGGAAATAATTCGAGGTGAAAATGGTTCGGTTTCTGTGGAAGAGCGATTAGAAAAGATGGGTTATTGTGAATTGAATGTTGAGGTTTTCGATAGAGTTTTGAAAAGGTGTTTTAAAATTCCGCATTTGGGTTTGAGGGTTTTTAACTGGTTGAAGCTTAAGGATGGTTTTCGTCATACAACACAGACTTATAATACCATGTTGTGTCTTGCCGGAGAAGGTAAGGAGTTTGGGTTGGTGAAGAAGTTGGTGGAGGAAATGGATGAATGTGGAGTTCAAAAGGATGTAAATACGTGGACCATTCTTGTGTCTCTTTATGGGAAGGCGAAGAAAATCAGTGAAGCTTTGTTGGCGTTTGAAAATATGCAAAAGTGTGGCTGTGAACCTGATGTGGTTTCGTATAGAACGATCATTCGTTTGCTTTGTAGTTCGGGTAAGGGTGATATTGCTATGGAGTTCTATAGGGACATGGTCAAGAAGGACATTGTACTTGATGATGTAAGGTTGTATAAGATGCTTATGAACTGTATGGCAGAATCAGGAGATGTTGCAGCTGTTGAAGCTTTGGAATTGATTCGTGACCTCAAATATAAAGATGTAGTTCTTGAACCTGAATATTTTGAGACCTTAGTGAGAGGGCTGTGTAAGGCAGGAAGGATTTCAGACGCTTTAGAGATTGTTGAAATTATGAAGAGAAGGGACATTGTTGTGGGGAACGTTCAAGGGATTATCATAAATGGCTATTTACGGAGAAACGATGTTTGCTTGGCACTTGATGTGTTTCAAAGCATGAAAGAATCTGGTTATGTGCCTACAGTTTCCTCATATACTGAACTGATACAGCATCTGTTTAAGTTGAGTAGGAATGAAGAAGCTTGCATGCTGTATGATGAGATGCTCGGAAAAGGAATTAAACCAGATATTGTGGCCATAACAGCCATGGCTGCAGGCCATGTTTCACAAAATCGTATATCCGAAGCCTGGAAAATTTTCAAGAGTATGGAAAGCCAAGGCATCAAGCCTACATGGAAGTCGTATTCGGTATTTATTAAGGAGCTTTGCAAGGCTTCAAAGACCGATGACATTGTCAAAGTATTGTATGAAATGCAGTCTTCAAAGATTGTAATCAAAGATGAAGTATTCCGTTGGGTTATAACTTACATGGAAACCAAGGGGGAGTTTGCTTTAAAAGAGAGAGTGCAAAAGATGCATACAACATCTAAACTCTATCCTGAAAATTTTGAGGAGTCTGAAAAACGAGTGTCATTGAGAAATGAGGTGGAAGAAGATAGAGGAGTTGACCAACCAAAATCAGAAAAGGTAGACTGCTCATTACTAATTCCAATTCTCAAGACTTACAGTGAGCAAGATGTTCGCGATGTATGTAGGATTCTTTCATCCTCTCTAGATTGGTCTTCAATCCAAGAAAAGTTAGAGATAAGTAACATTGAGTTCACCCCAGAATTTGTTATGGAGATAATGCAAAGCTGCAGTTTGACAGAGATGGCCATGAATTGTTTCAAAGAGATGAAAGATGGTGGTTATTGCCCAAGTAGGAGTACATACAAGTATCTGATCATCGCCTTATGTGGGAGGAAAGGAAGGAAAATTGATGATGCTCTCAAATATACGAGGTATAATGATGCATGGAATGTGTTCTACCGTATGAAATTCAAAGGACCATTTCCTGATTTTAAAACATATTCTATGTTCCTTTCTTGTCTTTGCAAAGTTGGAAGATCTGAAGAAGCAATGAGACTTCTTACTGAAATGTTGGAGAGTGGGATTGTTCCTAGTACTGTTAACTTTAGAACAGTTTTTTATGGGTTGAATAGAGAAGGGAACAAGGTTTAG

Protein sequence

>MsG0180003188.01.T01

MGFKEKHECTEPVCENAAESVVLDKDENFTVLEDAQLVKMGEEDMCRMVGEIMEIIRGENGSVSVEERLEKMGYCELNVEVFDRVLKRCFKIPHLGLRVFNWLKLKDGFRHTTQTYNTMLCLAGEGKEFGLVKKLVEEMDECGVQKDVNTWTILVSLYGKAKKISEALLAFENMQKCGCEPDVVSYRTIIRLLCSSGKGDIAMEFYRDMVKKDIVLDDVRLYKMLMNCMAESGDVAAVEALELIRDLKYKDVVLEPEYFETLVRGLCKAGRISDALEIVEIMKRRDIVVGNVQGIIINGYLRRNDVCLALDVFQSMKESGYVPTVSSYTELIQHLFKLSRNEEACMLYDEMLGKGIKPDIVAITAMAAGHVSQNRISEAWKIFKSMESQGIKPTWKSYSVFIKELCKASKTDDIVKVLYEMQSSKIVIKDEVFRWVITYMETKGEFALKERVQKMHTTSKLYPENFEESEKRVSLRNEVEEDRGVDQPKSEKVDCSLLIPILKTYSEQDVRDVCRILSSSLDWSSIQEKLEISNIEFTPEFVMEIMQSCSLTEMAMNCFKEMKDGGYCPSRSTYKYLIIALCGRKGRKIDDALKYTRYNDAWNVFYRMKFKGPFPDFKTYSMFLSCLCKVGRSEEAMRLLTEMLESGIVPSTVNFRTVFYGLNREGNKV*