AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780039262.01

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MsG0780039262.01.T01 AT5G46450 30.809 383 219 8 33 373 9 387 1.21e-40 162
MsG0780039262.01.T01 AT5G46450 29.213 267 152 10 418 656 594 851 4.22e-14 77.4
MsG0780039262.01.T01 AT5G46470 30.534 393 221 9 33 379 10 396 1.48e-40 162
MsG0780039262.01.T01 AT5G46470 29.496 278 135 6 418 639 599 871 5.67e-15 80.1
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MsG0780039262.01.T01 AT4G14370 31.198 359 199 6 33 349 10 362 1.98e-40 161
MsG0780039262.01.T01 AT5G40910 30.854 363 204 7 36 360 11 364 2.37e-40 161
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MsG0780039262.01.T01 AT5G46490 28.496 379 209 9 33 361 48 414 1.22e-31 131
MsG0780039262.01.T01 AT5G46490 28.496 379 209 9 33 361 65 431 1.81e-31 132
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MsG0780039262.01.T01 AT5G17880 29.434 265 145 6 418 646 626 884 1.92e-19 94.7
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MsG0780039262.01.T01 AT5G45210 29.714 350 192 9 38 351 36 367 3.74e-27 118
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MsG0780039262.01.T01 AT3G51570 28.846 260 151 6 418 656 618 864 1.41e-15 82.0
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MsG0780039262.01.T01 AT4G12020 34.468 235 108 3 418 608 1216 1448 1.98e-17 88.2
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MsG0780039262.01.T01 AT4G12020 26.822 343 206 9 34 349 598 922 1.77e-25 114
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MsG0780039262.01.T01 AT4G12020 26.822 343 206 9 34 349 665 989 1.88e-25 114
MsG0780039262.01.T01 AT4G12020 35.683 227 108 3 418 608 1216 1440 1.92e-18 91.7
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MsG0780039262.01.T01 AT5G45060 30.620 258 145 8 418 656 626 868 1.29e-16 85.5
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MsG0780039262.01.T01 AT3G25510 33.202 253 138 5 411 640 606 850 2.45e-23 107
MsG0780039262.01.T01 AT3G25510 30.314 287 137 5 420 643 428 714 9.25e-21 99.0
MsG0780039262.01.T01 AT3G25510 32.796 186 113 4 181 360 5 184 1.27e-18 92.0
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MsG0780039262.01.T01 AT4G19530 24.031 387 222 10 36 359 14 391 8.88e-23 105
MsG0780039262.01.T01 AT4G19530 29.818 275 151 6 418 656 631 899 4.44e-18 90.1
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MsG0780039262.01.T01 AT5G48780 33.708 178 113 2 172 349 440 612 1.94e-22 103
MsG0780039262.01.T01 AT5G48780 27.624 362 192 8 36 349 11 350 4.49e-22 102
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MsG0780039262.01.T01 AT5G45050 27.797 295 177 6 66 360 64 322 3.49e-22 103
MsG0780039262.01.T01 AT5G45050 27.797 295 177 6 66 360 64 322 3.61e-22 103
MsG0780039262.01.T01 AT4G16860 31.455 213 134 5 152 360 2 206 6.62e-22 102
MsG0780039262.01.T01 AT4G16860 28.691 359 191 14 418 720 571 920 3.44e-12 70.9
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MsG0780039262.01.T01 AT5G45250 28.571 273 155 6 418 656 626 892 1.44e-17 88.6
MsG0780039262.01.T01 AT5G40910 32.086 187 120 3 174 360 1 180 1.29e-21 101
MsG0780039262.01.T01 AT5G40910 32.086 187 120 3 174 360 1 180 1.29e-21 101
MsG0780039262.01.T01 AT5G40910 32.086 187 120 3 174 360 1 180 1.29e-21 101
MsG0780039262.01.T01 AT5G40910 32.086 187 120 3 174 360 1 180 1.29e-21 101
MsG0780039262.01.T01 AT5G40910 32.086 187 120 3 174 360 1 180 1.29e-21 101
MsG0780039262.01.T01 AT5G40910 32.086 187 120 3 174 360 1 180 1.40e-21 101
MsG0780039262.01.T01 AT5G40910 32.086 187 120 3 174 360 1 180 1.40e-21 101
MsG0780039262.01.T01 AT5G44870 32.075 265 138 5 418 646 667 925 1.49e-21 101
MsG0780039262.01.T01 AT5G44870 31.892 185 123 2 176 360 257 438 6.69e-18 89.7
MsG0780039262.01.T01 AT5G44870 32.075 265 138 5 418 646 403 661 2.02e-21 100
MsG0780039262.01.T01 AT5G44870 33.129 163 108 1 198 360 13 174 8.66e-17 85.9
MsG0780039262.01.T01 AT1G56540 32.673 202 126 5 152 349 2 197 8.84e-21 99.0
MsG0780039262.01.T01 AT1G56540 29.630 243 122 7 421 646 431 641 3.05e-13 74.3
MsG0780039262.01.T01 AT1G56520 30.435 207 124 5 152 349 2 197 2.15e-20 97.1
MsG0780039262.01.T01 AT5G45260 28.614 332 199 11 47 360 18 329 2.52e-20 97.4
MsG0780039262.01.T01 AT5G45260 28.614 332 199 11 47 360 18 329 2.52e-20 97.4
MsG0780039262.01.T01 AT5G45260 28.614 332 199 11 47 360 18 329 2.96e-20 97.4
MsG0780039262.01.T01 AT5G45050 33.871 186 117 3 175 360 4 183 2.97e-20 97.4
MsG0780039262.01.T01 AT1G72930 35.915 142 53 2 36 140 8 148 3.39e-20 88.6
MsG0780039262.01.T01 AT1G72850 27.746 346 205 10 34 348 4 335 4.90e-20 94.4
MsG0780039262.01.T01 AT1G72930 35.915 142 53 2 36 140 8 148 5.80e-20 88.6
MsG0780039262.01.T01 AT1G72840 39.205 176 103 2 173 348 23 194 6.43e-20 96.3
MsG0780039262.01.T01 AT5G45230 30.483 269 141 6 418 646 624 886 6.64e-20 96.3
MsG0780039262.01.T01 AT5G17890 28.986 207 143 2 154 360 150 352 3.37e-19 94.0
MsG0780039262.01.T01 AT2G17060 25.000 384 214 10 34 350 15 391 3.57e-19 93.6
MsG0780039262.01.T01 AT2G17060 27.333 300 151 5 418 656 647 940 1.08e-15 82.4
MsG0780039262.01.T01 AT2G17060 25.000 384 214 10 34 350 15 391 4.71e-19 93.6
MsG0780039262.01.T01 AT2G17060 27.667 300 150 6 418 656 647 940 8.97e-16 82.8
MsG0780039262.01.T01 AT4G16990 30.729 192 126 3 173 363 22 207 6.20e-18 88.6
MsG0780039262.01.T01 AT4G16990 30.729 192 126 3 173 363 22 207 6.20e-18 88.6
MsG0780039262.01.T01 AT1G27180 35.632 174 102 6 171 339 21 189 6.42e-18 89.7
MsG0780039262.01.T01 AT1G27180 30.566 265 147 10 387 643 593 828 8.36e-11 66.6
MsG0780039262.01.T01 AT1G27180 35.632 174 102 6 171 339 21 189 6.42e-18 89.7
MsG0780039262.01.T01 AT1G27180 30.566 265 147 10 387 643 593 828 8.36e-11 66.6
MsG0780039262.01.T01 AT1G27180 35.632 174 102 6 171 339 21 189 6.42e-18 89.7
MsG0780039262.01.T01 AT1G27180 30.566 265 147 10 387 643 593 828 8.36e-11 66.6
MsG0780039262.01.T01 AT4G16990 31.638 177 114 3 173 348 22 192 8.09e-18 88.6
MsG0780039262.01.T01 AT4G16990 31.638 177 114 3 173 348 22 192 8.09e-18 88.6
MsG0780039262.01.T01 AT4G16990 31.638 177 114 3 173 348 22 192 8.09e-18 88.6
MsG0780039262.01.T01 AT4G16990 31.638 177 114 3 173 348 22 192 8.09e-18 88.6
MsG0780039262.01.T01 AT4G16990 31.638 177 114 3 173 348 22 192 8.48e-18 88.6
MsG0780039262.01.T01 AT1G72870 33.702 181 106 4 171 349 249 417 8.78e-18 88.2
MsG0780039262.01.T01 AT4G16990 31.638 177 114 3 173 348 22 192 9.03e-18 88.6
MsG0780039262.01.T01 AT1G63750 29.557 203 132 5 152 349 2 198 8.85e-17 85.9
MsG0780039262.01.T01 AT1G63750 29.508 244 127 5 418 646 429 642 4.18e-15 80.5
MsG0780039262.01.T01 AT1G63750 29.557 203 132 5 152 349 2 198 8.85e-17 85.9
MsG0780039262.01.T01 AT1G63750 29.508 244 127 5 418 646 429 642 4.18e-15 80.5
MsG0780039262.01.T01 AT5G38344 32.653 147 60 3 36 145 59 203 1.04e-16 80.5
MsG0780039262.01.T01 AT2G17050 30.405 296 138 7 418 651 425 714 1.71e-16 85.1
MsG0780039262.01.T01 AT2G17050 27.946 297 156 9 154 447 7 248 1.48e-15 82.0
MsG0780039262.01.T01 AT2G17050 30.405 296 138 7 418 651 425 714 2.13e-16 84.7
MsG0780039262.01.T01 AT2G17050 27.946 297 156 9 154 447 7 248 1.30e-15 82.4
MsG0780039262.01.T01 AT2G17050 30.405 296 138 7 418 651 425 714 2.84e-16 84.3
MsG0780039262.01.T01 AT2G17050 27.946 297 156 9 154 447 7 248 1.15e-15 82.4
MsG0780039262.01.T01 AT2G20142 29.940 167 76 3 36 167 8 168 7.76e-16 80.1
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MsG0780039262.01.T01 AT4G19500 29.185 233 105 4 418 650 611 783 2.34e-15 81.3
MsG0780039262.01.T01 AT4G19500 21.942 278 197 8 72 346 124 384 7.24e-11 66.6
MsG0780039262.01.T01 AT5G40060 33.143 175 108 4 184 351 1 173 3.95e-15 80.5
MsG0780039262.01.T01 AT5G40060 26.774 310 154 8 404 642 388 695 5.89e-13 73.6
MsG0780039262.01.T01 AT5G40060 33.143 175 108 4 184 351 1 173 5.56e-15 80.1
MsG0780039262.01.T01 AT5G40060 26.774 310 154 8 404 642 388 695 8.46e-13 72.8
MsG0780039262.01.T01 AT1G17610 25.939 293 179 7 67 349 79 343 3.64e-14 76.3
MsG0780039262.01.T01 AT1G17610 25.939 293 179 7 67 349 79 343 3.64e-14 76.3
MsG0780039262.01.T01 AT4G19050 27.737 274 163 8 397 645 598 861 6.37e-14 76.6
MsG0780039262.01.T01 AT4G23515 31.148 183 74 9 32 164 3 183 6.47e-14 73.6
MsG0780039262.01.T01 AT4G23515 31.148 183 74 9 32 164 3 183 1.05e-13 73.6
MsG0780039262.01.T01 AT4G09360 36.905 168 103 3 181 348 5 169 4.58e-13 73.9
MsG0780039262.01.T01 AT2G16870 30.400 250 128 6 418 652 315 533 1.58e-12 72.0
MsG0780039262.01.T01 AT2G16870 30.400 250 128 6 418 652 315 533 1.58e-12 72.0
MsG0780039262.01.T01 AT1G57630 31.579 152 62 5 33 145 18 166 3.05e-11 63.5
MsG0780039262.01.T01 AT4G33300 33.679 193 108 8 390 566 574 762 3.99e-11 67.4
MsG0780039262.01.T01 AT4G33300 33.679 193 108 8 390 566 574 762 3.99e-11 67.4
MsG0780039262.01.T01 AT2G03300 27.711 166 78 5 39 164 9 172 7.29e-11 63.2

Find 139 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 316 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CTCTCTCAGGGAATCAATTT+TGG 0.057352 7:-60948172 MsG0780039262.01.T01:CDS
ACTACCCGTACCAAGAAATT+TGG 0.159085 7:+60946922 None:intergenic
TTTGAAGTATCTTCTATTAT+TGG 0.160784 7:-60944679 MsG0780039262.01.T01:CDS
GATCTAATATGAGCAATTTA+AGG 0.200847 7:+60945717 None:intergenic
CATATAATCCCCAAATTTCT+TGG 0.211501 7:-60946932 MsG0780039262.01.T01:CDS
ACCTGATAACTTCAATAAAA+TGG 0.212001 7:-60944740 MsG0780039262.01.T01:CDS
ATATGTCTATGTTATCTTCT+TGG 0.241257 7:-60948200 MsG0780039262.01.T01:CDS
GGGTTTGCTGACGACCTTAT+AGG 0.263589 7:-60947319 MsG0780039262.01.T01:CDS
TACTACTTATTGTGCAGAAT+TGG 0.266512 7:-60943637 MsG0780039262.01.T01:CDS
CCTTCCAAGATGATGATTCT+TGG 0.271103 7:-60946784 MsG0780039262.01.T01:CDS
TCCATGATTCATGAATCTAT+TGG 0.273329 7:-60944820 MsG0780039262.01.T01:CDS
CTTAAGTCAATAGAAATTAA+TGG 0.290450 7:+60944715 None:intergenic
TGCTTCCTCAACTTGGTGTT+TGG 0.293424 7:-60947897 MsG0780039262.01.T01:CDS
TGTAATGCTTCTTTGAAATC+TGG 0.300203 7:+60944880 None:intergenic
ACATCTTGAGTACCTTGATA+TGG 0.301603 7:-60944860 MsG0780039262.01.T01:CDS
CTACCCGTACCAAGAAATTT+GGG 0.311155 7:+60946923 None:intergenic
AAATCCAACTACCTTATAAC+TGG 0.313556 7:-60943265 MsG0780039262.01.T01:CDS
TATCTGGACTCATAAGAAAT+AGG 0.315590 7:-60947021 MsG0780039262.01.T01:CDS
GTTGCGTCTTTAACAATCAT+AGG 0.326489 7:+60944424 None:intergenic
CTTCATTGAAGACGGAAGTT+TGG 0.328317 7:+60944609 None:intergenic
CAGGCAAATATTGAAGCTTA+TGG 0.330931 7:+60944548 None:intergenic
CTAATTACTTTGGAACTAAA+CGG 0.342118 7:-60943531 MsG0780039262.01.T01:CDS
GCGCTCCTGTATTCACAAAA+TGG 0.344836 7:+60943457 None:intergenic
TAATTACTTTGGAACTAAAC+GGG 0.352332 7:-60943530 MsG0780039262.01.T01:CDS
ACACGTCGTATTTATAGCTT+TGG 0.353174 7:+60948103 None:intergenic
CCATGATTCATGAATCTATT+GGG 0.356680 7:-60944819 MsG0780039262.01.T01:CDS
AACTTGGTGTTTGGATGAAA+TGG 0.359284 7:-60947888 MsG0780039262.01.T01:CDS
TACAGTCCTTCTGAAATATC+TGG 0.360119 7:-60947037 MsG0780039262.01.T01:CDS
TGATATGCCACTAATTACTT+TGG 0.364926 7:-60943541 MsG0780039262.01.T01:CDS
CTTGAGTGGTTAGATCTTAC+CGG 0.367179 7:-60945072 MsG0780039262.01.T01:CDS
TCGGAAACAAACCAGTTATA+AGG 0.367669 7:+60943254 None:intergenic
CTTAGCTGGATTAGCTGGTT+GGG 0.380993 7:-60947690 MsG0780039262.01.T01:CDS
TTTAGTTCCAAAGTAATTAG+TGG 0.382847 7:+60943534 None:intergenic
AGGTATTTCAAAACAACATC+TGG 0.387491 7:-60944487 MsG0780039262.01.T01:CDS
GTTGTTGCTGCTGCTTTCTT+CGG 0.391271 7:+60943304 None:intergenic
CTTCTTGGACAACCTCTCTC+AGG 0.397812 7:-60948185 MsG0780039262.01.T01:CDS
ACATTGGGTCATAAGTTCTC+AGG 0.401373 7:-60947340 MsG0780039262.01.T01:CDS
CAAACCAGTTATAAGGTAGT+TGG 0.404776 7:+60943261 None:intergenic
GAAATTAATCTCTTCAATCT+AGG 0.405783 7:-60943194 MsG0780039262.01.T01:CDS
CACGAGTTTGCACTCCTATA+AGG 0.408689 7:+60947305 None:intergenic
TTGGTTGTGGATGCATCAAT+TGG 0.408807 7:-60945036 MsG0780039262.01.T01:CDS
TACCGGATGCATAAACTTGT+TGG 0.412214 7:-60945055 MsG0780039262.01.T01:CDS
CTTCTATTATTGGAGATTTG+AGG 0.417644 7:-60944669 MsG0780039262.01.T01:CDS
ACTACTTATTGTGCAGAATT+GGG 0.417791 7:-60943636 MsG0780039262.01.T01:CDS
ATATACGGGATGGGTGGAAT+AGG 0.419610 7:-60947220 MsG0780039262.01.T01:CDS
AGTGCTATGACTTGCTTAGC+TGG 0.422603 7:-60947704 MsG0780039262.01.T01:CDS
GTGGCTACTAAGATTAGTTA+AGG 0.426021 7:-60944380 MsG0780039262.01.T01:intron
TGAAAGGTTGCGAGTTTGAG+AGG 0.428657 7:+60945666 None:intergenic
AGTCTGGTCAGCCTCTCTTT+AGG 0.428884 7:-60944970 MsG0780039262.01.T01:CDS
CCCAATAGATTCATGAATCA+TGG 0.432896 7:+60944819 None:intergenic
ACCCATCCTCATTATGATCT+AGG 0.433268 7:+60945786 None:intergenic
GATTAGCTGGTTGGGATGTC+AGG 0.433968 7:-60947682 MsG0780039262.01.T01:CDS
GCTTAGCTGGATTAGCTGGT+TGG 0.434382 7:-60947691 MsG0780039262.01.T01:CDS
TGCGAGTTTGAGAGGGAAAT+CGG 0.439943 7:+60945674 None:intergenic
ACTTGCTTAGCTGGATTAGC+TGG 0.442629 7:-60947695 MsG0780039262.01.T01:CDS
TTGCATGATTGAAAATTTGA+AGG 0.443618 7:+60945635 None:intergenic
CTGAGAATTCTACGTCTCTC+TGG 0.445962 7:-60944925 MsG0780039262.01.T01:CDS
AAGATTATGCTTCCTCAACT+TGG 0.449188 7:-60947904 MsG0780039262.01.T01:CDS
ATCCCCAAATTTCTTGGTAC+GGG 0.451602 7:-60946926 MsG0780039262.01.T01:CDS
ACACTCTGCATTGGGAGATC+AGG 0.453556 7:+60944529 None:intergenic
AAGATGACTCCATGCTTTGA+AGG 0.460370 7:-60945105 MsG0780039262.01.T01:CDS
TAAAAGTACCTGCTACTGTT+AGG 0.463171 7:+60945593 None:intergenic
TACTCCAAGAATCATCATCT+TGG 0.464973 7:+60946780 None:intergenic
CTAATAATACACTCTGCATT+GGG 0.466519 7:+60944521 None:intergenic
TTCTTCTTTCGCACATGAGA+TGG 0.466697 7:+60947800 None:intergenic
TTGGAACTAAACGGGGTTGA+CGG 0.468102 7:-60943522 MsG0780039262.01.T01:CDS
GGATCAACATCATAGAAAAC+AGG 0.468739 7:+60947821 None:intergenic
TCAAGTGGATATAGTTTATG+AGG 0.469993 7:-60946855 MsG0780039262.01.T01:CDS
TACGCTCATCTTGTTAGAAA+AGG 0.471587 7:-60948030 MsG0780039262.01.T01:intron
TCTAATAATACACTCTGCAT+TGG 0.472357 7:+60944520 None:intergenic
ATCAGCAAAGTTTATGAAGA+TGG 0.476013 7:-60947124 MsG0780039262.01.T01:CDS
TCAAACCACTCTGGGATAGT+TGG 0.482462 7:+60943756 None:intergenic
AAATATATAATCCGGACCTA+TGG 0.482829 7:+60944455 None:intergenic
AATCCCCAAATTTCTTGGTA+CGG 0.484781 7:-60946927 MsG0780039262.01.T01:CDS
ATCGATGATCAAACCACTCT+GGG 0.490574 7:+60943748 None:intergenic
AAATAGGCTACACAACATAA+TGG 0.491246 7:-60947005 MsG0780039262.01.T01:CDS
GAACTAGAATCTGTACCTCT+TGG 0.491287 7:+60948147 None:intergenic
ATTCTCAACTTCATCTTCAT+CGG 0.493082 7:+60943235 None:intergenic
ATGCATAAACTTGTTGGTTG+TGG 0.495844 7:-60945049 MsG0780039262.01.T01:CDS
AATCGATGATCAAACCACTC+TGG 0.496996 7:+60943747 None:intergenic
AACCAACAAGTTTATGCATC+CGG 0.498602 7:+60945053 None:intergenic
GTTCAAATTCAATAAGTTGA+GGG 0.499623 7:-60945765 MsG0780039262.01.T01:CDS
TTTGCAAAACTGTAGCAGTC+TGG 0.509141 7:-60944986 MsG0780039262.01.T01:CDS
AACTTCCGTCTTCAATGAAG+AGG 0.509347 7:-60944606 MsG0780039262.01.T01:CDS
TGAATATGCCTAACAGTAGC+AGG 0.512362 7:-60945601 MsG0780039262.01.T01:intron
AGATTAAAGTCAGAGGATGA+TGG 0.515980 7:-60947259 MsG0780039262.01.T01:CDS
CATTGGGTCATAAGTTCTCA+GGG 0.517296 7:-60947339 MsG0780039262.01.T01:CDS
GTCCTAGATCATAATGAGGA+TGG 0.520780 7:-60945788 MsG0780039262.01.T01:CDS
GGATCTCGTGACCATAGGTC+CGG 0.522042 7:-60944466 MsG0780039262.01.T01:CDS
TCTCATGTGCGAAAGAAGAA+TGG 0.522145 7:-60947797 MsG0780039262.01.T01:CDS
TCAGAAACACAAGTTCTGTA+AGG 0.528469 7:+60945010 None:intergenic
TCGAAGAATTTGATTTAATG+TGG 0.531738 7:-60944399 MsG0780039262.01.T01:CDS
TTGCGTCTTTAACAATCATA+GGG 0.543290 7:+60944425 None:intergenic
TTTGGATAATCTACATCTCT+CGG 0.545179 7:-60943488 MsG0780039262.01.T01:CDS
GAGATTAATTTCTTTCCCCA+TGG 0.545971 7:+60943205 None:intergenic
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TTTGAAGGCAAAGAAATGAA+AGG 0.552841 7:+60945650 None:intergenic
AACAAAGGTGTTGCGAGTGT+CGG 0.556567 7:+60948062 None:intergenic
GAGACAAGCAGAGTGAAGGA+AGG 0.558990 7:+60943607 None:intergenic
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AGACAAGCAGAGTGAAGGAA+GGG 0.561197 7:+60943608 None:intergenic
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ATTGCGTTTAAAACATGCCA+AGG 0.566429 7:-60943432 MsG0780039262.01.T01:intron
TTAGAAAGATTAAATCTACA+AGG 0.567640 7:-60944643 MsG0780039262.01.T01:CDS
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GAAAGGTTGCGAGTTTGAGA+GGG 0.569532 7:+60945667 None:intergenic
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CCAAGAATCATCATCTTGGA+AGG 0.574411 7:+60946784 None:intergenic
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GAGTGTATTATTAGATCCAG+TGG 0.579130 7:-60944512 MsG0780039262.01.T01:CDS
AAACGAGACAAGCAGAGTGA+AGG 0.579505 7:+60943603 None:intergenic
CAAAATTGATTCCCTGAGAG+AGG 0.582444 7:+60948173 None:intergenic
ATGAGTCCAGATATTTCAGA+AGG 0.583055 7:+60947031 None:intergenic
GACAAGCAGAGTGAAGGAAG+GGG 0.593541 7:+60943609 None:intergenic
TAAAGCCTCTTCATTGAAGA+CGG 0.598222 7:+60944601 None:intergenic
TATAGGAGTGCAAACTCGTG+TGG 0.599996 7:-60947302 MsG0780039262.01.T01:CDS
TTCATCCAAACACCAAGTTG+AGG 0.606905 7:+60947892 None:intergenic
AGTTGAGAATGATGATGCCA+TGG 0.610747 7:-60943222 MsG0780039262.01.T01:CDS
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TACCCGTACCAAGAAATTTG+GGG 0.640836 7:+60946924 None:intergenic
GTTGAGAATGATGATGCCAT+GGG 0.643279 7:-60943221 MsG0780039262.01.T01:CDS
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TTGACACACTGCCTAAAGAG+AGG 0.667002 7:+60944959 None:intergenic
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AGCGTAGAGATGATCAACAA+AGG 0.680712 7:+60948047 None:intergenic
TCATGCAGAGCTGATTCCTG+AGG 0.687125 7:-60946756 MsG0780039262.01.T01:intron
AAGCCACATCGGAAATGACG+AGG 0.690971 7:+60943830 None:intergenic
TAGGCATATTCAATTCAACA+AGG 0.691306 7:+60945612 None:intergenic
GAAATCCAACTATCCCAGAG+TGG 0.735152 7:-60943761 MsG0780039262.01.T01:intron
TTGAGAATGATGATGCCATG+GGG 0.778922 7:-60943220 MsG0780039262.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AGACTTTAATATTATTATTA+AGG - Chr7:60945965-60945984 MsG0780039262.01.T01:intron 10.0%
!!! ATAATAATATTAAAGTCTTT+TGG + Chr7:60945963-60945982 None:intergenic 10.0%
!!! TATATGTAAGTTTATTTTAA+TGG + Chr7:60945147-60945166 None:intergenic 10.0%
!! AAACAAAAACATGTTATAAA+AGG + Chr7:60945538-60945557 None:intergenic 15.0%
!! AAACAATTTCTATTATCTTT+AGG - Chr7:60945118-60945137 MsG0780039262.01.T01:CDS 15.0%
!! AACAAAAACATGTTATAAAA+GGG + Chr7:60945537-60945556 None:intergenic 15.0%
!! AACAAAAACATGTTTATAAT+GGG + Chr7:60947400-60947419 None:intergenic 15.0%
!! ATTAAACTTTATAATGAAGT+CGG - Chr7:60945319-60945338 MsG0780039262.01.T01:intron 15.0%
!! CTTAAGTTAAAATATAGTAA+TGG + Chr7:60947082-60947101 None:intergenic 15.0%
!! TAAAGATAATAGAAATTGTT+TGG + Chr7:60945119-60945138 None:intergenic 15.0%
!!! TAACCATTTTTTACTTTTAA+GGG + Chr7:60946068-60946087 None:intergenic 15.0%
!! AACAACATATATATCTTCTT+TGG + Chr7:60945914-60945933 None:intergenic 20.0%
!! ACAACATATATATCTTCTTT+GGG + Chr7:60945913-60945932 None:intergenic 20.0%
!! CTGAAAATTTATCAAAAATG+AGG - Chr7:60945643-60945662 MsG0780039262.01.T01:CDS 20.0%
!! CTTAAGTCAATAGAAATTAA+TGG + Chr7:60946673-60946692 None:intergenic 20.0%
!! GAACAAAAACATGTTTATAA+TGG + Chr7:60947401-60947420 None:intergenic 20.0%
!! TAGAAGATACTTCAAAAATA+TGG + Chr7:60946702-60946721 None:intergenic 20.0%
!! TTAAGTCAGATTCAATAATA+AGG - Chr7:60947660-60947679 MsG0780039262.01.T01:intron 20.0%
!! TTAGAAAGATTAAATCTACA+AGG - Chr7:60946742-60946761 MsG0780039262.01.T01:intron 20.0%
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!! TTTGTGTAGCAAATAATATT+AGG + Chr7:60945203-60945222 None:intergenic 20.0%
!! TTTGTTTATTCTAACATTTC+AGG - Chr7:60945551-60945570 MsG0780039262.01.T01:intron 20.0%
!!! AACCATTTTTTACTTTTAAG+GGG + Chr7:60946067-60946086 None:intergenic 20.0%
!!! ACTTTTTAATCAACTTTATG+AGG + Chr7:60947366-60947385 None:intergenic 20.0%
!!! ATAAAGTTGATTAAAAAGTG+AGG - Chr7:60947367-60947386 MsG0780039262.01.T01:CDS 20.0%
!!! CTAATATATAAGATTAGTTG+AGG - Chr7:60947454-60947473 MsG0780039262.01.T01:intron 20.0%
!!! CTATTCAAATTTTATTGTTG+GGG + Chr7:60946007-60946026 None:intergenic 20.0%
!!! CTTGTTTTTCTTTTTATATC+AGG - Chr7:60947530-60947549 MsG0780039262.01.T01:intron 20.0%
!!! GAATTTTTCTTCACAAATAA+GGG + Chr7:60943855-60943874 None:intergenic 20.0%
!!! GCTATTCAAATTTTATTGTT+GGG + Chr7:60946008-60946027 None:intergenic 20.0%
!!! GTAACCATTTTTTACTTTTA+AGG + Chr7:60946069-60946088 None:intergenic 20.0%
!!! TCATAATTTTTCCAGTTTAT+CGG - Chr7:60947419-60947438 MsG0780039262.01.T01:intron 20.0%
!!! TGAATTTTTCTTCACAAATA+AGG + Chr7:60943856-60943875 None:intergenic 20.0%
!!! TGCTATTCAAATTTTATTGT+TGG + Chr7:60946009-60946028 None:intergenic 20.0%
!!! TTAGATCATAAGAATTTTTC+AGG - Chr7:60945684-60945703 MsG0780039262.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTGAAGTATCTTCTATTAT+TGG - Chr7:60946706-60946725 MsG0780039262.01.T01:intron 20.0%
! AAAAATGGTTACATAAGAGA+TGG - Chr7:60946077-60946096 MsG0780039262.01.T01:intron 25.0%
! ACCTGATAACTTCAATAAAA+TGG - Chr7:60946645-60946664 MsG0780039262.01.T01:intron 25.0%
! ATGTTATAAAAGGGAATGAA+AGG + Chr7:60945528-60945547 None:intergenic 25.0%
! ATTAAGAGCAAGAAATAAGA+TGG - Chr7:60945356-60945375 MsG0780039262.01.T01:intron 25.0%
! ATTTCTTGCTCTTAATGTAA+TGG + Chr7:60945352-60945371 None:intergenic 25.0%
! CAAGCTGTAATAAAAACATT+GGG - Chr7:60944030-60944049 MsG0780039262.01.T01:intron 25.0%
! GAAATTAATCTCTTCAATCT+AGG - Chr7:60948191-60948210 MsG0780039262.01.T01:CDS 25.0%
! GAGTCTATTCAAGATATAAT+GGG + Chr7:60947302-60947321 None:intergenic 25.0%
! GATCTAATATGAGCAATTTA+AGG + Chr7:60945671-60945690 None:intergenic 25.0%
! GCAGTCAAAAATATATAATC+CGG + Chr7:60946941-60946960 None:intergenic 25.0%
! TATATATCCTACAATGTAGA+GGG + Chr7:60947048-60947067 None:intergenic 25.0%
! TCAAGCTGTAATAAAAACAT+TGG - Chr7:60944029-60944048 MsG0780039262.01.T01:intron 25.0%
! TGAGTCTATTCAAGATATAA+TGG + Chr7:60947303-60947322 None:intergenic 25.0%
! TTGCATGATTGAAAATTTGA+AGG + Chr7:60945753-60945772 None:intergenic 25.0%
! TTGCTGAATAATTCAAATAG+TGG - Chr7:60944750-60944769 MsG0780039262.01.T01:CDS 25.0%
!! AAGGTAGTTTAGGTTAATAT+AGG - Chr7:60947216-60947235 MsG0780039262.01.T01:CDS 25.0%
!! GTTCAAATTCAATAAGTTGA+GGG - Chr7:60945620-60945639 MsG0780039262.01.T01:CDS 25.0%
!! TAGTTTAGGTTAATATAGGT+GGG - Chr7:60947220-60947239 MsG0780039262.01.T01:CDS 25.0%
!! TCCATTTTATTGAAGTTATC+AGG + Chr7:60946649-60946668 None:intergenic 25.0%
!! TCGAAGAATTTGATTTAATG+TGG - Chr7:60946986-60947005 MsG0780039262.01.T01:CDS 25.0%
!! TTAATGCAGAAGATTCATTT+TGG + Chr7:60945304-60945323 None:intergenic 25.0%
!! TTATAAGGTAGTTGGATTTT+AGG + Chr7:60948119-60948138 None:intergenic 25.0%
!! TTTAGTTCCAAAGTAATTAG+TGG + Chr7:60947854-60947873 None:intergenic 25.0%
!!! AAACATACTTGATTTGTAAG+TGG + Chr7:60943813-60943832 None:intergenic 25.0%
!!! AGTGATTTTTCAGTGATAAT+TGG + Chr7:60944932-60944951 None:intergenic 25.0%
!!! ATTTGCTACACAAAGTTTTA+GGG - Chr7:60945209-60945228 MsG0780039262.01.T01:intron 25.0%
!!! CAATGTTTTAGCATTGAATT+TGG - Chr7:60945480-60945499 MsG0780039262.01.T01:intron 25.0%
!!! CTAATTACTTTGGAACTAAA+CGG - Chr7:60947854-60947873 MsG0780039262.01.T01:CDS 25.0%
!!! CTTTCTTTTTTATGGAAGAA+AGG - Chr7:60947190-60947209 MsG0780039262.01.T01:CDS 25.0%
!!! TAATTACTTTGGAACTAAAC+GGG - Chr7:60947855-60947874 MsG0780039262.01.T01:CDS 25.0%
!!! TATTCTAAAACTGTATCAAG+TGG - Chr7:60944515-60944534 MsG0780039262.01.T01:CDS 25.0%
!!! TATTTGCTACACAAAGTTTT+AGG - Chr7:60945208-60945227 MsG0780039262.01.T01:intron 25.0%
!!! TCTTAGCTCTTTTTTCTTTT+TGG - Chr7:60947330-60947349 MsG0780039262.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTCGAGTTTTAGGAATATA+CGG - Chr7:60944150-60944169 MsG0780039262.01.T01:intron 25.0%
AAATAGGCTACACAACATAA+TGG - Chr7:60944380-60944399 MsG0780039262.01.T01:intron 30.0%
AAATATATAATCCGGACCTA+TGG + Chr7:60946933-60946952 None:intergenic 30.0%
AAATCCAACTACCTTATAAC+TGG - Chr7:60948120-60948139 MsG0780039262.01.T01:CDS 30.0%
AAGGATTCAACACTCTAATA+TGG - Chr7:60947679-60947698 MsG0780039262.01.T01:CDS 30.0%
AATGGACAGAAAAAGATGAA+AGG + Chr7:60945823-60945842 None:intergenic 30.0%
ACTACTTATTGTGCAGAATT+GGG - Chr7:60947749-60947768 MsG0780039262.01.T01:CDS 30.0%
ACTGCTTCATAATAAAACCT+TGG + Chr7:60947973-60947992 None:intergenic 30.0%
AGGTATTTCAAAACAACATC+TGG - Chr7:60946898-60946917 MsG0780039262.01.T01:CDS 30.0%
AGTGTATTATTAGATCCAGT+GGG - Chr7:60946874-60946893 MsG0780039262.01.T01:CDS 30.0%
ATAAAAGGGAATGAAAGGAA+AGG + Chr7:60945523-60945542 None:intergenic 30.0%
ATAATTGGAATCCCAATATC+AGG + Chr7:60944917-60944936 None:intergenic 30.0%
ATATATCCTACAATGTAGAG+GGG + Chr7:60947047-60947066 None:intergenic 30.0%
ATCAGCAAAGTTTATGAAGA+TGG - Chr7:60944261-60944280 MsG0780039262.01.T01:intron 30.0%
ATGAATTTCCTGGTTTCTAA+TGG + Chr7:60944960-60944979 None:intergenic 30.0%
ATGATACATTGCAATAGATG+GGG - Chr7:60944984-60945003 MsG0780039262.01.T01:CDS 30.0%
ATTCTCAACTTCATCTTCAT+CGG + Chr7:60948153-60948172 None:intergenic 30.0%
CATATAATCCCCAAATTTCT+TGG - Chr7:60944453-60944472 MsG0780039262.01.T01:CDS 30.0%
CATGATACATTGCAATAGAT+GGG - Chr7:60944983-60945002 MsG0780039262.01.T01:CDS 30.0%
CCATGATTCATGAATCTATT+GGG - Chr7:60946566-60946585 MsG0780039262.01.T01:intron 30.0%
CTAATAATACACTCTGCATT+GGG + Chr7:60946867-60946886 None:intergenic 30.0%
CTATATATCCTACAATGTAG+AGG + Chr7:60947049-60947068 None:intergenic 30.0%
CTCCCCTTAAAAGTAAAAAA+TGG - Chr7:60946062-60946081 MsG0780039262.01.T01:intron 30.0%
CTTCTATTATTGGAGATTTG+AGG - Chr7:60946716-60946735 MsG0780039262.01.T01:intron 30.0%
GGTTCAAATTCAATAAGTTG+AGG - Chr7:60945619-60945638 MsG0780039262.01.T01:CDS 30.0%
TAATTGGAATCCCAATATCA+GGG + Chr7:60944916-60944935 None:intergenic 30.0%
TACTACTTATTGTGCAGAAT+TGG - Chr7:60947748-60947767 MsG0780039262.01.T01:CDS 30.0%
TAGGCATATTCAATTCAACA+AGG + Chr7:60945776-60945795 None:intergenic 30.0%
TATAGTCCTAGATCATAATG+AGG - Chr7:60945593-60945612 MsG0780039262.01.T01:intron 30.0%
TATCATGCATATGAATTTCC+TGG + Chr7:60944970-60944989 None:intergenic 30.0%
TATCTGGACTCATAAGAAAT+AGG - Chr7:60944364-60944383 MsG0780039262.01.T01:intron 30.0%
TCAAGTGGATATAGTTTATG+AGG - Chr7:60944530-60944549 MsG0780039262.01.T01:CDS 30.0%
TCATGTGATGATAACAGAAA+AGG - Chr7:60945081-60945100 MsG0780039262.01.T01:CDS 30.0%
TCCATGATTCATGAATCTAT+TGG - Chr7:60946565-60946584 MsG0780039262.01.T01:intron 30.0%
TCTAATAATACACTCTGCAT+TGG + Chr7:60946868-60946887 None:intergenic 30.0%
TCTGTTAAGATTAAAGTCAG+AGG - Chr7:60944119-60944138 MsG0780039262.01.T01:intron 30.0%
TGAATTGCTTCAAAAAGTTG+AGG + Chr7:60943429-60943448 None:intergenic 30.0%
TGATATGCCACTAATTACTT+TGG - Chr7:60947844-60947863 MsG0780039262.01.T01:CDS 30.0%
TTGCGTCTTTAACAATCATA+GGG + Chr7:60946963-60946982 None:intergenic 30.0%
TTGTACATTGATCCATATCA+AGG + Chr7:60946540-60946559 None:intergenic 30.0%
TTTCTGTCCATTCAAATCAA+CGG - Chr7:60945831-60945850 MsG0780039262.01.T01:intron 30.0%
TTTGAAGGCAAAGAAATGAA+AGG + Chr7:60945738-60945757 None:intergenic 30.0%
TTTGGATAATCTACATCTCT+CGG - Chr7:60947897-60947916 MsG0780039262.01.T01:CDS 30.0%
! ACGTTGCTTGTTTCTTTAAA+GGG - Chr7:60944838-60944857 MsG0780039262.01.T01:CDS 30.0%
! CAAATTTTATTGTTGGGGAT+GGG + Chr7:60946002-60946021 None:intergenic 30.0%
! GTAGTTTAGGTTAATATAGG+TGG - Chr7:60947219-60947238 MsG0780039262.01.T01:CDS 30.0%
! TCAAATTTTATTGTTGGGGA+TGG + Chr7:60946003-60946022 None:intergenic 30.0%
! TTGTTTCTTTAAAGGGGAAA+GGG - Chr7:60944845-60944864 MsG0780039262.01.T01:CDS 30.0%
! TTTTATGGAAGAAAGGAAGA+AGG - Chr7:60947197-60947216 MsG0780039262.01.T01:CDS 30.0%
!! AAATCCATCCTTTTTAGAGA+GGG + Chr7:60946241-60946260 None:intergenic 30.0%
!! AATTACTTTGGAACTAAACG+GGG - Chr7:60947856-60947875 MsG0780039262.01.T01:CDS 30.0%
!! TAAATCCATCCTTTTTAGAG+AGG + Chr7:60946242-60946261 None:intergenic 30.0%
!! TCTCAAGTATGCTTTTAGTT+TGG + Chr7:60946115-60946134 None:intergenic 30.0%
!! TGTAATGCTTCTTTGAAATC+TGG + Chr7:60946508-60946527 None:intergenic 30.0%
!!! AAGGTTTTATTATGAAGCAG+TGG - Chr7:60947972-60947991 MsG0780039262.01.T01:intron 30.0%
!!! AGGTTTTATTATGAAGCAGT+GGG - Chr7:60947973-60947992 MsG0780039262.01.T01:intron 30.0%
!!! TGGGAAAATGTTGATTTTCA+TGG - Chr7:60947602-60947621 MsG0780039262.01.T01:intron 30.0%
!!! TTCGAGTTTTAGGAATATAC+GGG - Chr7:60944151-60944170 MsG0780039262.01.T01:intron 30.0%
AAACATTGAACGATCTGAGT+AGG + Chr7:60945468-60945487 None:intergenic 35.0%
AACCAACAAGTTTATGCATC+CGG + Chr7:60946335-60946354 None:intergenic 35.0%
AAGATTATGCTTCCTCAACT+TGG - Chr7:60943481-60943500 MsG0780039262.01.T01:CDS 35.0%
AAGGGTTGAAAAATCTTGAG+TGG - Chr7:60946299-60946318 MsG0780039262.01.T01:intron 35.0%
AATCCCCAAATTTCTTGGTA+CGG - Chr7:60944458-60944477 MsG0780039262.01.T01:CDS 35.0%
ACAAAAAGTCAAAGCCACAT+CGG + Chr7:60947569-60947588 None:intergenic 35.0%
ACACGTCGTATTTATAGCTT+TGG + Chr7:60943285-60943304 None:intergenic 35.0%
ACATCTTGAGTACCTTGATA+TGG - Chr7:60946525-60946544 MsG0780039262.01.T01:intron 35.0%
ACCATAAAACTGTTTGCAGT+TGG + Chr7:60945416-60945435 None:intergenic 35.0%
ACTCATAACCATTAGAAACC+AGG - Chr7:60944949-60944968 MsG0780039262.01.T01:CDS 35.0%
ACTCTAATATGGATGTTGAC+TGG - Chr7:60947690-60947709 MsG0780039262.01.T01:CDS 35.0%
AGAAAGGAAGAAGGTAGTTT+AGG - Chr7:60947206-60947225 MsG0780039262.01.T01:CDS 35.0%
AGATTAAAGTCAGAGGATGA+TGG - Chr7:60944126-60944145 MsG0780039262.01.T01:intron 35.0%
AGCAAAGTTTATGAAGATGG+TGG - Chr7:60944264-60944283 MsG0780039262.01.T01:intron 35.0%
ATGAGTCCAGATATTTCAGA+AGG + Chr7:60944357-60944376 None:intergenic 35.0%
CAAACCAGTTATAAGGTAGT+TGG + Chr7:60948127-60948146 None:intergenic 35.0%
CAAAGATGACAACTTCAGAA+AGG - Chr7:60943390-60943409 MsG0780039262.01.T01:intron 35.0%
CAGGCAAATATTGAAGCTTA+TGG + Chr7:60946840-60946859 None:intergenic 35.0%
CCATTAGCAGTTAGAGTAAT+GGG - Chr7:60944675-60944694 MsG0780039262.01.T01:CDS 35.0%
CCCAATAGATTCATGAATCA+TGG + Chr7:60946569-60946588 None:intergenic 35.0%
CCTGATGAATCAGTATGTAA+TGG + Chr7:60947139-60947158 None:intergenic 35.0%
CGACATGTGAATGCTTAAAT+TGG - Chr7:60945248-60945267 MsG0780039262.01.T01:intron 35.0%
CGTGAAAAACAAAGGCAAAT+TGG + Chr7:60943620-60943639 None:intergenic 35.0%
GAGATTAATTTCTTTCCCCA+TGG + Chr7:60948183-60948202 None:intergenic 35.0%
GAGTGTATTATTAGATCCAG+TGG - Chr7:60946873-60946892 MsG0780039262.01.T01:CDS 35.0%
GCATGATACATTGCAATAGA+TGG - Chr7:60944982-60945001 MsG0780039262.01.T01:CDS 35.0%
GGATCAACATCATAGAAAAC+AGG + Chr7:60943567-60943586 None:intergenic 35.0%
GTTGCGTCTTTAACAATCAT+AGG + Chr7:60946964-60946983 None:intergenic 35.0%
TAAAGCCTCTTCATTGAAGA+CGG + Chr7:60946787-60946806 None:intergenic 35.0%
TAACAAACATCTTCACGCTT+AGG - Chr7:60947248-60947267 MsG0780039262.01.T01:CDS 35.0%
TACCATAAAGTCGACTACAT+AGG + Chr7:60945390-60945409 None:intergenic 35.0%
TACGCTCATCTTGTTAGAAA+AGG - Chr7:60943355-60943374 MsG0780039262.01.T01:intron 35.0%
TACTCCAAGAATCATCATCT+TGG + Chr7:60944608-60944627 None:intergenic 35.0%
TATATCCTACAATGTAGAGG+GGG + Chr7:60947046-60947065 None:intergenic 35.0%
TATTATTAGATCCAGTGGGA+AGG - Chr7:60946878-60946897 MsG0780039262.01.T01:CDS 35.0%
TCAGAAACACAAGTTCTGTA+AGG + Chr7:60946378-60946397 None:intergenic 35.0%
TCCATTAGCAGTTAGAGTAA+TGG - Chr7:60944674-60944693 MsG0780039262.01.T01:CDS 35.0%
TCCTAGATCATAATGAGGAT+GGG - Chr7:60945598-60945617 MsG0780039262.01.T01:intron 35.0%
TCGGAAACAAACCAGTTATA+AGG + Chr7:60948134-60948153 None:intergenic 35.0%
TCTTAACAAGCATGTATGTG+TGG - Chr7:60943754-60943773 MsG0780039262.01.T01:intron 35.0%
TTAGGATTGAACATCTAGAG+TGG - Chr7:60947266-60947285 MsG0780039262.01.T01:CDS 35.0%
TTTCAGTGCGTGAAAAACAA+AGG + Chr7:60943628-60943647 None:intergenic 35.0%
! ACCAACTGCAAACAGTTTTA+TGG - Chr7:60945412-60945431 MsG0780039262.01.T01:intron 35.0%
! AGTATCTACCCTCTCTAAAA+AGG - Chr7:60946230-60946249 MsG0780039262.01.T01:intron 35.0%
! ATCCTATGTAGTCGACTTTA+TGG - Chr7:60945385-60945404 MsG0780039262.01.T01:intron 35.0%
! ATTGCGTTTAAAACATGCCA+AGG - Chr7:60947953-60947972 MsG0780039262.01.T01:intron 35.0%
! CACGTTGCTTGTTTCTTTAA+AGG - Chr7:60944837-60944856 MsG0780039262.01.T01:CDS 35.0%
! CGTTGCTTGTTTCTTTAAAG+GGG - Chr7:60944839-60944858 MsG0780039262.01.T01:CDS 35.0%
! CTCTAATATGGATGTTGACT+GGG - Chr7:60947691-60947710 MsG0780039262.01.T01:CDS 35.0%
! CTTGTTTCTTTAAAGGGGAA+AGG - Chr7:60944844-60944863 MsG0780039262.01.T01:CDS 35.0%
! GTGGCTACTAAGATTAGTTA+AGG - Chr7:60947005-60947024 MsG0780039262.01.T01:CDS 35.0%
! TCTCTCAGGGAATCAATTTT+GGG - Chr7:60943214-60943233 MsG0780039262.01.T01:CDS 35.0%
! TGGAGTCATCTTGAGATTTT+TGG + Chr7:60946272-60946291 None:intergenic 35.0%
! TTTTATTATGAAGCAGTGGG+GGG - Chr7:60947976-60947995 MsG0780039262.01.T01:intron 35.0%
! TTTTCGATCTCTTCAAACTC+TGG + Chr7:60944003-60944022 None:intergenic 35.0%
!! AAACAGTTTTATGGTGCAAC+AGG - Chr7:60945421-60945440 MsG0780039262.01.T01:intron 35.0%
!! AACTTGGTGTTTGGATGAAA+TGG - Chr7:60943497-60943516 MsG0780039262.01.T01:CDS 35.0%
!! ATACTGATTCATCAGGAAGA+AGG - Chr7:60947143-60947162 MsG0780039262.01.T01:CDS 35.0%
!! ATGCATAAACTTGTTGGTTG+TGG - Chr7:60946336-60946355 MsG0780039262.01.T01:intron 35.0%
!! CCATTACATACTGATTCATC+AGG - Chr7:60947136-60947155 MsG0780039262.01.T01:CDS 35.0%
!! GACGTGTTTATCAGTTTTAG+AGG - Chr7:60943298-60943317 MsG0780039262.01.T01:CDS 35.0%
!! GTTTTATTATGAAGCAGTGG+GGG - Chr7:60947975-60947994 MsG0780039262.01.T01:intron 35.0%
!! TAAAAGTACCTGCTACTGTT+AGG + Chr7:60945795-60945814 None:intergenic 35.0%
!! TACAGTCCTTCTGAAATATC+TGG - Chr7:60944348-60944367 MsG0780039262.01.T01:intron 35.0%
!! TTTTTCAACCCTTCAAAGCA+TGG + Chr7:60946292-60946311 None:intergenic 35.0%
!!! AGTTTTAGGAATATACGGGA+TGG - Chr7:60944155-60944174 MsG0780039262.01.T01:intron 35.0%
!!! GGTTTTATTATGAAGCAGTG+GGG - Chr7:60947974-60947993 MsG0780039262.01.T01:intron 35.0%
!!! GTTTTAGGAATATACGGGAT+GGG - Chr7:60944156-60944175 MsG0780039262.01.T01:intron 35.0%
!!! TGAGCATATTTTAGTACCTC+AGG + Chr7:60944648-60944667 None:intergenic 35.0%
AACTTCCGTCTTCAATGAAG+AGG - Chr7:60946779-60946798 MsG0780039262.01.T01:CDS 40.0%
AAGATGACTCCATGCTTTGA+AGG - Chr7:60946280-60946299 MsG0780039262.01.T01:intron 40.0%
AATCGATGATCAAACCACTC+TGG + Chr7:60947641-60947660 None:intergenic 40.0%
AATTCTAGACGCTTGTCTTG+TGG - Chr7:60944884-60944903 MsG0780039262.01.T01:CDS 40.0%
ACATTGGGTCATAAGTTCTC+AGG - Chr7:60944045-60944064 MsG0780039262.01.T01:intron 40.0%
ACCCATCCTCATTATGATCT+AGG + Chr7:60945602-60945621 None:intergenic 40.0%
ACTACCCGTACCAAGAAATT+TGG + Chr7:60944466-60944485 None:intergenic 40.0%
AGCGTAGAGATGATCAACAA+AGG + Chr7:60943341-60943360 None:intergenic 40.0%
ATAGCCAAAATACCAGACAG+TGG - Chr7:60944709-60944728 MsG0780039262.01.T01:CDS 40.0%
ATCCCCAAATTTCTTGGTAC+GGG - Chr7:60944459-60944478 MsG0780039262.01.T01:CDS 40.0%
ATCGATGATCAAACCACTCT+GGG + Chr7:60947640-60947659 None:intergenic 40.0%
ATTGAACGATCTGAGTAGGA+TGG + Chr7:60945464-60945483 None:intergenic 40.0%
CATTCAAATCAACGGAAGAG+AGG - Chr7:60945839-60945858 MsG0780039262.01.T01:intron 40.0%
CATTGGGTCATAAGTTCTCA+GGG - Chr7:60944046-60944065 MsG0780039262.01.T01:intron 40.0%
CCAAGAATCATCATCTTGGA+AGG + Chr7:60944604-60944623 None:intergenic 40.0%
CCCATTACTCTAACTGCTAA+TGG + Chr7:60944678-60944697 None:intergenic 40.0%
CCTTCCAAGATGATGATTCT+TGG - Chr7:60944601-60944620 MsG0780039262.01.T01:CDS 40.0%
CTAACCAAGGAAGACATAGA+GGG - Chr7:60948008-60948027 MsG0780039262.01.T01:intron 40.0%
CTACCCGTACCAAGAAATTT+GGG + Chr7:60944465-60944484 None:intergenic 40.0%
CTTCATTGAAGACGGAAGTT+TGG + Chr7:60946779-60946798 None:intergenic 40.0%
CTTGAGTGGTTAGATCTTAC+CGG - Chr7:60946313-60946332 MsG0780039262.01.T01:intron 40.0%
GAACTAGAATCTGTACCTCT+TGG + Chr7:60943241-60943260 None:intergenic 40.0%
GCATTATCGATGACTGCTAA+AGG + Chr7:60948062-60948081 None:intergenic 40.0%
GTCCTAGATCATAATGAGGA+TGG - Chr7:60945597-60945616 MsG0780039262.01.T01:intron 40.0%
GTTACATAAGAGATGGACAG+AGG - Chr7:60946084-60946103 MsG0780039262.01.T01:intron 40.0%
TACCCGTACCAAGAAATTTG+GGG + Chr7:60944464-60944483 None:intergenic 40.0%
TACCGGATGCATAAACTTGT+TGG - Chr7:60946330-60946349 MsG0780039262.01.T01:intron 40.0%
TAGAATATGCTCATCTCGAG+TGG + Chr7:60944502-60944521 None:intergenic 40.0%
TCTCATGTGCGAAAGAAGAA+TGG - Chr7:60943588-60943607 MsG0780039262.01.T01:CDS 40.0%
TGAATATGCCTAACAGTAGC+AGG - Chr7:60945784-60945803 MsG0780039262.01.T01:CDS 40.0%
TTCATCCAAACACCAAGTTG+AGG + Chr7:60943496-60943515 None:intergenic 40.0%
TTCTTCTTTCGCACATGAGA+TGG + Chr7:60943588-60943607 None:intergenic 40.0%
TTGGTTGTGGATGCATCAAT+TGG - Chr7:60946349-60946368 MsG0780039262.01.T01:intron 40.0%
TTTGCAAAACTGTAGCAGTC+TGG - Chr7:60946399-60946418 MsG0780039262.01.T01:intron 40.0%
! AATATGGATGTTGACTGGGT+TGG - Chr7:60947695-60947714 MsG0780039262.01.T01:CDS 40.0%
! AGATGACTCCATGCTTTGAA+GGG - Chr7:60946281-60946300 MsG0780039262.01.T01:intron 40.0%
! AGTTGAGAATGATGATGCCA+TGG - Chr7:60948163-60948182 MsG0780039262.01.T01:CDS 40.0%
! ATGGGGAAGCATATTGTCAA+GGG - Chr7:60945001-60945020 MsG0780039262.01.T01:CDS 40.0%
! CAAAATTGATTCCCTGAGAG+AGG + Chr7:60943215-60943234 None:intergenic 40.0%
! CTCTCTCAGGGAATCAATTT+TGG - Chr7:60943213-60943232 MsG0780039262.01.T01:CDS 40.0%
! GATTGAACATCTAGAGTGGT+CGG - Chr7:60947270-60947289 MsG0780039262.01.T01:CDS 40.0%
! GTGGATTGAACCCTGATATT+GGG - Chr7:60944903-60944922 MsG0780039262.01.T01:CDS 40.0%
! GTTGAGAATGATGATGCCAT+GGG - Chr7:60948164-60948183 MsG0780039262.01.T01:CDS 40.0%
! TCAACATTTTCCCAATGCCA+CGG + Chr7:60947596-60947615 None:intergenic 40.0%
! TCCAAAATGTGCCGATAAAC+TGG + Chr7:60947433-60947452 None:intergenic 40.0%
! TCCAGTTTATCGGCACATTT+TGG - Chr7:60947429-60947448 MsG0780039262.01.T01:intron 40.0%
! TCTACCCTCTCTAAAAAGGA+TGG - Chr7:60946234-60946253 MsG0780039262.01.T01:intron 40.0%
! TGTGGATTGAACCCTGATAT+TGG - Chr7:60944902-60944921 MsG0780039262.01.T01:CDS 40.0%
! TTGAGAATGATGATGCCATG+GGG - Chr7:60948165-60948184 MsG0780039262.01.T01:CDS 40.0%
! TTTCTTTAAAGGGGAAAGGG+TGG - Chr7:60944848-60944867 MsG0780039262.01.T01:CDS 40.0%
!! CTCTCTTCCGTTGATTTGAA+TGG + Chr7:60945841-60945860 None:intergenic 40.0%
!! GAATCAATTTTGGGTCCAAG+AGG - Chr7:60943223-60943242 MsG0780039262.01.T01:CDS 40.0%
!!! CACTGCCATTTTGTGAATAC+AGG - Chr7:60947923-60947942 MsG0780039262.01.T01:intron 40.0%
!!! GATGATGGCTTTCGAGTTTT+AGG - Chr7:60944141-60944160 MsG0780039262.01.T01:intron 40.0%
!!! GTTTTGAAATACCTTCCCAC+TGG + Chr7:60946892-60946911 None:intergenic 40.0%
AAACGAGACAAGCAGAGTGA+AGG + Chr7:60947785-60947804 None:intergenic 45.0%
AGACAAGCAGAGTGAAGGAA+GGG + Chr7:60947780-60947799 None:intergenic 45.0%
ATATACGGGATGGGTGGAAT+AGG - Chr7:60944165-60944184 MsG0780039262.01.T01:intron 45.0%
CACAACCTACTCGAAAATCC+TGG + Chr7:60945043-60945062 None:intergenic 45.0%
CACGAGTTTGCACTCCTATA+AGG + Chr7:60944083-60944102 None:intergenic 45.0%
CTAACCCCTCAAAACTAGTC+AGG + Chr7:60944791-60944810 None:intergenic 45.0%
CTGAGAATTCTACGTCTCTC+TGG - Chr7:60946460-60946479 MsG0780039262.01.T01:intron 45.0%
GAAAGGTTGCGAGTTTGAGA+GGG + Chr7:60945721-60945740 None:intergenic 45.0%
GAAATCCAACTATCCCAGAG+TGG - Chr7:60947624-60947643 MsG0780039262.01.T01:intron 45.0%
GAGTAGGTTGTGGCTTTCTT+GGG - Chr7:60945051-60945070 MsG0780039262.01.T01:CDS 45.0%
GCGCTCCTGTATTCACAAAA+TGG + Chr7:60947931-60947950 None:intergenic 45.0%
GCTAACCAAGGAAGACATAG+AGG - Chr7:60948007-60948026 MsG0780039262.01.T01:intron 45.0%
TGAAAGGTTGCGAGTTTGAG+AGG + Chr7:60945722-60945741 None:intergenic 45.0%
TGCGAGTTTGAGAGGGAAAT+CGG + Chr7:60945714-60945733 None:intergenic 45.0%
TTAGGAATATACGGGATGGG+TGG - Chr7:60944159-60944178 MsG0780039262.01.T01:intron 45.0%
TTCAAACTCTGGTCTGAGAG+TGG + Chr7:60943992-60944011 None:intergenic 45.0%
TTCTTGGACAACCTCTCTCA+GGG - Chr7:60943201-60943220 MsG0780039262.01.T01:CDS 45.0%
TTGACACACTGCCTAAAGAG+AGG + Chr7:60946429-60946448 None:intergenic 45.0%
TTGGAACTAAACGGGGTTGA+CGG - Chr7:60947863-60947882 MsG0780039262.01.T01:CDS 45.0%
! CTCTCCACTGTCTGGTATTT+TGG + Chr7:60944716-60944735 None:intergenic 45.0%
! GATGGGGAAGCATATTGTCA+AGG - Chr7:60945000-60945019 MsG0780039262.01.T01:CDS 45.0%
! TAGAGAGCGTGTGAAAGAGA+AGG + Chr7:60947495-60947514 None:intergenic 45.0%
! TATAGGAGTGCAAACTCGTG+TGG - Chr7:60944083-60944102 MsG0780039262.01.T01:intron 45.0%
!! AACAAAGGTGTTGCGAGTGT+CGG + Chr7:60943326-60943345 None:intergenic 45.0%
!! ACTTGCTTAGCTGGATTAGC+TGG - Chr7:60943690-60943709 MsG0780039262.01.T01:intron 45.0%
!! AGTGCTATGACTTGCTTAGC+TGG - Chr7:60943681-60943700 MsG0780039262.01.T01:intron 45.0%
!! CTTAGCTGGATTAGCTGGTT+GGG - Chr7:60943695-60943714 MsG0780039262.01.T01:intron 45.0%
!! GTTGTTGCTGCTGCTTTCTT+CGG + Chr7:60948084-60948103 None:intergenic 45.0%
!! TCAAACCACTCTGGGATAGT+TGG + Chr7:60947632-60947651 None:intergenic 45.0%
!! TGCTTCCTCAACTTGGTGTT+TGG - Chr7:60943488-60943507 MsG0780039262.01.T01:CDS 45.0%
!! TTTGACTTTTTGTCCTGCCG+TGG - Chr7:60947576-60947595 MsG0780039262.01.T01:intron 45.0%
!!! AGTGCTCCTGACTAGTTTTG+AGG - Chr7:60944782-60944801 MsG0780039262.01.T01:CDS 45.0%
!!! CAGGATTTTCGAGTAGGTTG+TGG - Chr7:60945041-60945060 MsG0780039262.01.T01:CDS 45.0%
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!!! GTGCTCCTGACTAGTTTTGA+GGG - Chr7:60944783-60944802 MsG0780039262.01.T01:CDS 45.0%
!!! TGCTCCTGACTAGTTTTGAG+GGG - Chr7:60944784-60944803 MsG0780039262.01.T01:CDS 45.0%
AAGCCACATCGGAAATGACG+AGG + Chr7:60947558-60947577 None:intergenic 50.0%
ACACTCTGCATTGGGAGATC+AGG + Chr7:60946859-60946878 None:intergenic 50.0%
ACCTTCCCCCTCTACATTGT+AGG - Chr7:60947038-60947057 MsG0780039262.01.T01:CDS 50.0%
AGTCTGGTCAGCCTCTCTTT+AGG - Chr7:60946415-60946434 MsG0780039262.01.T01:intron 50.0%
CAATGTAGCTCTCCACTGTC+TGG + Chr7:60944724-60944743 None:intergenic 50.0%
CAGACAGTGGAGAGCTACAT+TGG - Chr7:60944722-60944741 MsG0780039262.01.T01:CDS 50.0%
CAGTGGAGAGCTACATTGGA+TGG - Chr7:60944726-60944745 MsG0780039262.01.T01:CDS 50.0%
CATCTGGATCTCGTGACCAT+AGG - Chr7:60946914-60946933 MsG0780039262.01.T01:CDS 50.0%
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CTTCTTGGACAACCTCTCTC+AGG - Chr7:60943200-60943219 MsG0780039262.01.T01:CDS 50.0%
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GACAAGCAGAGTGAAGGAAG+GGG + Chr7:60947779-60947798 None:intergenic 50.0%
GAGACAAGCAGAGTGAAGGA+AGG + Chr7:60947781-60947800 None:intergenic 50.0%
TCCTACAATGTAGAGGGGGA+AGG + Chr7:60947042-60947061 None:intergenic 50.0%
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! CGATCTGAGTAGGATGGACT+TGG + Chr7:60945458-60945477 None:intergenic 50.0%
! GATTAGCTGGTTGGGATGTC+AGG - Chr7:60943703-60943722 MsG0780039262.01.T01:intron 50.0%
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! TTTTGTCCTGCCGTGGCATT+GGG - Chr7:60947583-60947602 MsG0780039262.01.T01:intron 50.0%
! TTTTTGTCCTGCCGTGGCAT+TGG - Chr7:60947582-60947601 MsG0780039262.01.T01:intron 50.0%
!! GCTTAGCTGGATTAGCTGGT+TGG - Chr7:60943694-60943713 MsG0780039262.01.T01:intron 50.0%
!! GGGTTTGCTGACGACCTTAT+AGG - Chr7:60944066-60944085 MsG0780039262.01.T01:intron 50.0%
!!! ACGAGCCAGGATTTTCGAGT+AGG - Chr7:60945035-60945054 MsG0780039262.01.T01:CDS 50.0%
GAGCCTCGTCATTTCCGATG+TGG - Chr7:60947552-60947571 MsG0780039262.01.T01:intron 55.0%
GGATCTCGTGACCATAGGTC+CGG - Chr7:60946919-60946938 MsG0780039262.01.T01:CDS 55.0%
! CATTTTCCCAATGCCACGGC+AGG + Chr7:60947592-60947611 None:intergenic 55.0%
! GCAGCAGCAAGGTTGATCGA+TGG - Chr7:60943655-60943674 MsG0780039262.01.T01:intron 55.0%
GGACAACATCTCGACGAGCC+AGG - Chr7:60945022-60945041 MsG0780039262.01.T01:CDS 60.0%
GGGGTTGCGTGTGCTAACCA+AGG - Chr7:60947995-60948014 MsG0780039262.01.T01:intron 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 60943187 60948220 60943187 ID=MsG0780039262.01;Name=MsG0780039262.01
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Protein sequence

>MsG0780039262.01.T01

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