AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780039286.01

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MsG0780039286.01.T01 AT5G48940 36.232 207 124 3 56 256 354 558 8.52e-20 95.1
MsG0780039286.01.T01 AT5G48940 35.393 178 113 2 79 256 407 582 2.32e-18 90.5
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MsG0780039286.01.T01 AT4G20940 32.857 210 119 7 38 237 380 577 1.66e-15 81.3
MsG0780039286.01.T01 AT4G20940 37.968 187 102 8 72 254 276 452 6.53e-14 76.3
MsG0780039286.01.T01 AT4G28650 28.350 709 384 20 41 711 350 972 4.59e-65 233
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MsG0780039286.01.T01 AT4G28650 38.172 186 113 2 69 254 142 325 2.76e-20 96.7
MsG0780039286.01.T01 AT4G28650 34.921 189 119 3 81 269 274 458 4.71e-19 92.8
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MsG0780039286.01.T01 AT1G28440 29.986 717 353 23 49 718 348 962 5.38e-64 230
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MsG0780039286.01.T01 AT5G10290 35.000 180 110 2 1 180 11 183 7.09e-16 82.0
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MsG0780039286.01.T01 AT5G10020 28.879 232 137 7 50 255 61 290 1.29e-12 72.0
MsG0780039286.01.T01 AT3G09010 36.420 324 175 8 401 717 19 318 1.02e-45 168
MsG0780039286.01.T01 AT4G23260 38.276 290 153 7 429 715 334 600 2.22e-45 172
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MsG0780039286.01.T01 AT1G17750 33.708 178 116 2 79 256 280 455 1.55e-16 84.7
MsG0780039286.01.T01 AT1G17750 30.732 205 135 3 68 267 293 495 1.92e-15 81.3
MsG0780039286.01.T01 AT1G17750 33.516 182 120 1 72 253 488 668 2.65e-15 80.9
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MsG0780039286.01.T01 AT1G26970 35.045 331 175 11 404 718 59 365 5.20e-41 155
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MsG0780039286.01.T01 AT1G69790 34.743 331 175 11 404 718 49 354 6.76e-41 154
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MsG0780039286.01.T01 AT1G07570 34.036 332 180 9 404 718 44 353 7.27e-40 152
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MsG0780039286.01.T01 AT3G02130 35.294 136 83 3 124 255 567 701 4.83e-11 67.0
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MsG0780039286.01.T01 AT4G11900 34.982 283 163 5 429 711 474 735 4.12e-39 155
MsG0780039286.01.T01 AT5G35580 34.472 322 173 8 404 718 78 368 4.16e-39 152
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MsG0780039286.01.T01 AT1G56145 32.558 215 142 3 67 280 142 354 7.85e-18 89.0
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MsG0780039286.01.T01 AT3G07070 33.152 368 210 10 350 711 12 349 7.76e-38 146
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MsG0780039286.01.T01 AT4G23310 33.798 287 170 6 429 715 514 780 9.02e-38 151
MsG0780039286.01.T01 AT1G72540 33.750 320 174 8 406 718 76 364 1.01e-37 147
MsG0780039286.01.T01 AT1G70530 41.176 238 116 6 407 638 302 521 1.06e-37 148
MsG0780039286.01.T01 AT4G38830 32.209 326 194 9 393 711 309 614 1.10e-37 150
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MsG0780039286.01.T01 AT5G16900 35.739 291 162 8 428 717 392 658 1.89e-36 146
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MsG0780039286.01.T01 AT5G56040 37.895 190 116 2 69 258 219 406 5.23e-27 118
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MsG0780039286.01.T01 AT5G56040 38.764 178 107 2 77 254 203 378 1.49e-22 103
MsG0780039286.01.T01 AT5G56040 36.066 183 115 2 72 254 318 498 2.70e-20 96.7
MsG0780039286.01.T01 AT5G56040 32.609 230 126 5 71 275 413 638 4.15e-20 96.3
MsG0780039286.01.T01 AT5G56040 33.721 172 84 6 72 240 532 676 2.50e-11 67.8
MsG0780039286.01.T01 AT1G61610 34.375 288 167 6 429 716 531 796 2.37e-36 147
MsG0780039286.01.T01 AT4G21390 34.722 288 166 6 429 716 535 800 2.39e-36 147
MsG0780039286.01.T01 AT3G59350 35.669 314 169 10 415 716 100 392 2.56e-36 142
MsG0780039286.01.T01 AT3G59350 35.669 314 169 10 415 716 100 392 2.56e-36 142
MsG0780039286.01.T01 AT1G56130 35.577 312 171 9 406 711 472 759 2.56e-36 147
MsG0780039286.01.T01 AT1G56130 32.663 199 130 3 78 276 7 201 2.79e-12 70.9
MsG0780039286.01.T01 AT1G56130 33.540 161 99 5 67 226 44 197 1.68e-11 68.2
MsG0780039286.01.T01 AT2G30730 33.221 298 171 9 428 718 52 328 2.60e-36 140
MsG0780039286.01.T01 AT2G32800 34.268 321 185 8 403 711 106 412 2.61e-36 147
MsG0780039286.01.T01 AT2G32800 26.460 291 196 5 424 711 533 808 1.55e-22 103
MsG0780039286.01.T01 AT4G32000 27.126 435 220 11 283 715 40 379 2.62e-36 141
MsG0780039286.01.T01 AT1G52290 33.974 312 171 11 416 716 131 418 2.88e-36 144
MsG0780039286.01.T01 AT4G23210 33.788 293 159 7 429 715 364 627 2.99e-36 145
MsG0780039286.01.T01 AT1G07870 31.044 364 208 11 371 711 30 373 3.00e-36 144
MsG0780039286.01.T01 AT1G56130 35.577 312 171 9 406 711 523 810 3.06e-36 147
MsG0780039286.01.T01 AT1G56130 32.353 204 135 3 78 280 10 211 5.93e-16 82.8
MsG0780039286.01.T01 AT1G56130 31.915 235 150 5 48 276 22 252 5.60e-14 76.3
MsG0780039286.01.T01 AT2G30730 33.221 298 171 9 428 718 62 338 3.55e-36 140
MsG0780039286.01.T01 AT5G01560 32.166 314 183 9 410 717 345 634 3.67e-36 145
MsG0780039286.01.T01 AT1G56130 35.577 312 171 9 406 711 671 958 3.87e-36 147
MsG0780039286.01.T01 AT1G56130 28.409 264 134 5 68 280 100 359 1.20e-15 81.6
MsG0780039286.01.T01 AT1G56130 31.915 235 150 5 48 276 170 400 7.80e-14 75.9
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MsG0780039286.01.T01 AT1G56145 32.722 327 170 8 414 711 673 978 4.04e-36 147
MsG0780039286.01.T01 AT1G56145 32.558 215 142 3 67 280 142 354 6.59e-18 89.0
MsG0780039286.01.T01 AT4G04570 39.189 222 119 3 424 645 349 554 4.78e-36 144
MsG0780039286.01.T01 AT2G28940 36.721 305 158 10 428 718 107 390 5.38e-36 142
MsG0780039286.01.T01 AT1G06840 36.013 311 167 10 415 718 612 897 5.52e-36 146
MsG0780039286.01.T01 AT1G06840 38.418 177 104 3 79 254 167 339 2.03e-20 97.1
MsG0780039286.01.T01 AT1G51890 29.307 505 267 19 217 711 138 562 5.65e-36 144
MsG0780039286.01.T01 AT5G38990 33.562 292 171 6 428 716 530 801 6.15e-36 145
MsG0780039286.01.T01 AT4G03390 36.913 298 158 10 424 715 486 759 6.50e-36 145
MsG0780039286.01.T01 AT4G03390 36.913 298 158 10 424 715 486 759 6.50e-36 145
MsG0780039286.01.T01 AT5G16900 35.739 291 162 8 428 717 578 844 7.07e-36 145
MsG0780039286.01.T01 AT5G16900 35.739 291 162 8 428 717 578 844 7.07e-36 145
MsG0780039286.01.T01 AT2G19190 28.854 506 278 17 217 718 418 845 7.09e-36 145
MsG0780039286.01.T01 AT4G04540 39.640 222 118 3 424 645 354 559 7.50e-36 144
MsG0780039286.01.T01 AT2G30740 34.448 299 168 9 425 716 73 350 7.73e-36 139
MsG0780039286.01.T01 AT2G30740 34.448 299 168 9 425 716 73 350 7.73e-36 139
MsG0780039286.01.T01 AT2G30740 34.448 299 168 9 425 716 73 350 7.73e-36 139
MsG0780039286.01.T01 AT2G30740 34.448 299 168 9 425 716 73 350 7.73e-36 139

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CAACCCCTCATTTCTGATTT+TGG 0.097347 7:+61369423 MsG0780039286.01.T01:CDS
CAAATACTTTCTTTCCTATC+TGG 0.152380 7:+61370036 MsG0780039286.01.T01:three_prime_UTR
CACAGCTAGTACTTCTTTCT+TGG 0.195996 7:-61369784 None:intergenic
ACATAATTTATTAAATTTCT+TGG 0.206751 7:-61370151 None:intergenic
TTCATTCTAGGCCTGACTTC+AGG 0.222131 7:-61369840 None:intergenic
TTAAGTTAAGAGCTTATTAT+TGG 0.225437 7:+61367107 MsG0780039286.01.T01:CDS
TGTACTTTGAAGAGAAAATT+TGG 0.233560 7:+61366707 MsG0780039286.01.T01:CDS
GCTCTTAACTTAACAATATT+AGG 0.241928 7:-61367097 None:intergenic
TGGACTTTAGGTTGTGTAAA+AGG 0.255082 7:+61366776 MsG0780039286.01.T01:CDS
TAGTGTTATTGTTACTTAAT+TGG 0.266584 7:+61370233 MsG0780039286.01.T01:three_prime_UTR
TGGAAAATTCATATGTAATA+TGG 0.270202 7:+61370253 MsG0780039286.01.T01:three_prime_UTR
TGTTGTTTGTGTTGGACTTT+AGG 0.275551 7:+61366764 MsG0780039286.01.T01:CDS
GGGTCTGCAGCCTGGTACTT+TGG 0.289647 7:-61369568 None:intergenic
CCTGTGGCTGTTAGGAGATT+AGG 0.294545 7:+61367007 MsG0780039286.01.T01:CDS
AGAGCTTCTGCATATGTGTT+AGG 0.295249 7:+61366935 MsG0780039286.01.T01:CDS
GGATCAACCATTTCAGATAA+AGG 0.313149 7:-61369738 None:intergenic
CAGCCTGGTACTTTGGCTTC+AGG 0.318821 7:-61369561 None:intergenic
TAAACCTCTGGCTGTTCCTT+TGG 0.326033 7:-61369319 None:intergenic
AAGGAGTGAGAGAGGGTAAT+GGG 0.327181 7:+61366837 MsG0780039286.01.T01:CDS
CTGTGGCTGTTAGGAGATTA+GGG 0.329219 7:+61367008 MsG0780039286.01.T01:CDS
TTCAGGAGCTTTATAGTTGT+TGG 0.335378 7:-61369544 None:intergenic
TAGAGACTTCGGAACTTTAC+CGG 0.339553 7:-61366345 None:intergenic
GCTACTGAAGTTCAAGCAAT+TGG 0.341365 7:+61367061 MsG0780039286.01.T01:CDS
GTGTTAGGGAAAAGTGGGTT+AGG 0.345071 7:+61366950 MsG0780039286.01.T01:CDS
AGAAAGCCCTTTATCTGAAA+TGG 0.347332 7:+61369731 MsG0780039286.01.T01:CDS
CTGATTGACCATGAAAGATT+TGG 0.347446 7:-61369285 None:intergenic
GTCTGTGTCGAGGAGGATAT+TGG 0.349895 7:-61369397 None:intergenic
AAACGAAAGGTTTAGCGTTC+CGG 0.353835 7:-61366312 None:intergenic
AAATGGGATGTATATTCATT+TGG 0.354127 7:+61369597 MsG0780039286.01.T01:CDS
GATGCTCCTGGAGAAGAATC+TGG 0.359882 7:-61369654 None:intergenic
AGAGGAAACCCACATAGTTT+TGG 0.360981 7:-61366479 None:intergenic
TTATTAAATTTCTTGGTCAT+TGG 0.363363 7:-61370144 None:intergenic
TGGGTTAGGGATTGTGTATA+AGG 0.366407 7:+61366964 MsG0780039286.01.T01:CDS
CGGCGGATTTGAGTGTTAGA+AGG 0.368812 7:-61365737 None:intergenic
AAGCTAGTTATCATTGATAA+TGG 0.369632 7:-61370302 None:intergenic
AAATCCTAGTGATCAGATTC+TGG 0.371159 7:-61370201 None:intergenic
AAGAGAAAATTTGGTGGTAA+TGG 0.376793 7:+61366716 MsG0780039286.01.T01:CDS
GAATTGGTGGCAATTGATAA+AGG 0.379341 7:+61366884 MsG0780039286.01.T01:CDS
TCATTCTAGGCCTGACTTCA+GGG 0.381053 7:-61369839 None:intergenic
AGAGGGTAATGGGAGAGGGG+AGG 0.383706 7:+61366847 MsG0780039286.01.T01:CDS
TAATTTCTCCGGTGACATTC+CGG 0.386432 7:+61366187 MsG0780039286.01.T01:CDS
CAAATCTTTCATGGTCAATC+AGG 0.388024 7:+61369286 MsG0780039286.01.T01:CDS
TTTAACTCACCGATTTGTTC+CGG 0.388257 7:-61366281 None:intergenic
CTTTCGTTTAATCATTTATC+CGG 0.391462 7:+61366326 MsG0780039286.01.T01:CDS
TAAGTTAAGAGCTTATTATT+GGG 0.394952 7:+61367108 MsG0780039286.01.T01:CDS
AAAGGAGTGAGAGAGGGTAA+TGG 0.396406 7:+61366836 MsG0780039286.01.T01:CDS
GATCAACCATTTCAGATAAA+GGG 0.397701 7:-61369737 None:intergenic
GAAACATGCACTTCAGTTCC+AGG 0.399654 7:+61369946 MsG0780039286.01.T01:three_prime_UTR
GAGGGTAATGGGAGAGGGGA+GGG 0.399871 7:+61366848 MsG0780039286.01.T01:CDS
AAATACTTTCTTTCCTATCT+GGG 0.403352 7:+61370037 MsG0780039286.01.T01:three_prime_UTR
AGGTGGTGAACAAAGGTATA+AGG 0.405195 7:+61367033 MsG0780039286.01.T01:CDS
TTATCAGCAAATGTTCTAGA+AGG 0.408588 7:+61366251 MsG0780039286.01.T01:CDS
AGTATTTATGCAGGAAGAAA+TGG 0.412145 7:+61369252 MsG0780039286.01.T01:intron
GTGAGAGAGGGTAATGGGAG+AGG 0.412531 7:+61366842 MsG0780039286.01.T01:CDS
TTCTTGGTCATTGGAAGATA+AGG 0.413681 7:-61370135 None:intergenic
AGCTTCTTCCATGGCGTCAC+CGG 0.417385 7:-61366206 None:intergenic
GCCGGTCGAGGGATTGTTGC+CGG 0.417748 7:-61369469 None:intergenic
GAGATGGAAGAGAGTGAGAA+AGG 0.419814 7:+61366818 MsG0780039286.01.T01:CDS
TGTTCTAGAAGGTTCAATTC+CGG 0.420266 7:+61366262 MsG0780039286.01.T01:CDS
TGAGAGAGGGTAATGGGAGA+GGG 0.420886 7:+61366843 MsG0780039286.01.T01:CDS
GCTGCTGCAGTGGCATTGAT+TGG 0.424516 7:+61366629 MsG0780039286.01.T01:CDS
GGACTTTAGGTTGTGTAAAA+GGG 0.426784 7:+61366777 MsG0780039286.01.T01:CDS
CGAATTCGTGTTGTTTGTGT+TGG 0.427325 7:+61366756 MsG0780039286.01.T01:CDS
AATTTGGCTAATGCTCTTAG+AGG 0.427896 7:+61367175 MsG0780039286.01.T01:CDS
AGCGGTGAAATTCCTCAAAC+CGG 0.428836 7:+61366416 MsG0780039286.01.T01:CDS
TGTTAGGGAAAAGTGGGTTA+GGG 0.429196 7:+61366951 MsG0780039286.01.T01:CDS
CTACTGAAGTTCAAGCAATT+GGG 0.430888 7:+61367062 MsG0780039286.01.T01:CDS
ATGGTGTGCCTGTGGCTGTT+AGG 0.433480 7:+61366999 MsG0780039286.01.T01:CDS
CTGAGGGCAACCCTGAAGTC+AGG 0.437882 7:+61369829 MsG0780039286.01.T01:CDS
TTCGAAAATGACCCGGTTTG+AGG 0.440965 7:-61366428 None:intergenic
AGAGGGGAGGGTGAAGGAGA+AGG 0.440984 7:+61366860 MsG0780039286.01.T01:CDS
GACTCCCGTGTCGTCGGTAT+CGG 0.444631 7:+61365864 MsG0780039286.01.T01:CDS
AACCATCTCCAAATCTTTCA+TGG 0.447351 7:+61369277 MsG0780039286.01.T01:CDS
ATTAGCTGCTCCAACATCTC+CGG 0.447718 7:+61365834 MsG0780039286.01.T01:CDS
GAGTGAGAAAGGAGTGAGAG+AGG 0.447902 7:+61366829 MsG0780039286.01.T01:CDS
GGGTGAAGGAGAAGGTGAAT+TGG 0.448972 7:+61366868 MsG0780039286.01.T01:CDS
TTTACCCACCTTACCAAGTC+AGG 0.452950 7:-61369693 None:intergenic
GAGAGAGGGTAATGGGAGAG+GGG 0.454515 7:+61366844 MsG0780039286.01.T01:CDS
TGCGGTGTCGCTGCCGTCGA+CGG 0.456074 7:-61365757 None:intergenic
CTACTCGACAACGCGTGAAC+CGG 0.458161 7:+61366555 MsG0780039286.01.T01:CDS
GAAGTCTCTAGGAAAATTGC+CGG 0.462903 7:+61366358 MsG0780039286.01.T01:CDS
TTGTAGTGGTGTATGTGTAT+TGG 0.463223 7:+61366654 MsG0780039286.01.T01:CDS
GCTAATGCCGGACCAGTGAC+AGG 0.464694 7:-61365817 None:intergenic
GGAGGATATTGGAGGGTTTG+AGG 0.466855 7:-61369386 None:intergenic
AATGGGAGAGGGGAGGGTGA+AGG 0.467700 7:+61366854 MsG0780039286.01.T01:CDS
GAGCTTCTGCATATGTGTTA+GGG 0.467847 7:+61366936 MsG0780039286.01.T01:CDS
GTAGCATTGAAGAGCTGAAC+GGG 0.467973 7:-61365990 None:intergenic
ACTTCAAAACAGAAGCTAAA+GGG 0.469858 7:-61370066 None:intergenic
CGGATAAATGATTAAACGAA+AGG 0.470727 7:-61366325 None:intergenic
GGTTATCTCCCGTCGGAGCT+CGG 0.473931 7:+61365909 MsG0780039286.01.T01:CDS
GTCAGGCTCCCCGGAGATGT+TGG 0.474159 7:-61365844 None:intergenic
GTTTGTGACGACTTCATGTA+AGG 0.474654 7:-61369513 None:intergenic
TGGTTCACTCGACGCTGAAC+CGG 0.474766 7:-61366516 None:intergenic
GGTATCGGTCTCGCCGGAAA+AGG 0.474890 7:+61365879 MsG0780039286.01.T01:CDS
AAGTCCCCAGATTCTTCTCC+AGG 0.475791 7:+61369648 MsG0780039286.01.T01:CDS
TAAAGGGACAAATCCCAGAT+AGG 0.486114 7:-61370050 None:intergenic
ATACCGACGACACGGGAGTC+AGG 0.486942 7:-61365861 None:intergenic
TCCTCGCGAGAATCAGTCTC+TGG 0.488205 7:-61366163 None:intergenic
CGCGTGAACCGGTCTAAGAA+AGG 0.488401 7:+61366566 MsG0780039286.01.T01:CDS
ACCCATAAAACCGCCGGTCG+AGG 0.489550 7:-61369481 None:intergenic
TCGACAGAAGTCGATGCTCC+TGG 0.492231 7:-61369666 None:intergenic
GCTCCTGAAGCCAAAGTACC+AGG 0.492781 7:+61369558 MsG0780039286.01.T01:CDS
TTCGTTCCAGTCGGAGAATG+TGG 0.493029 7:-61365781 None:intergenic
TGCCGGTGATGCTTATTAGC+CGG 0.494812 7:-61369452 None:intergenic
AGCCATGGAAGAGGTTTGTA+TGG 0.495401 7:-61365962 None:intergenic
ATGCTCCTGGAGAAGAATCT+GGG 0.495436 7:-61369653 None:intergenic
TCTAAGAAAGGTTTGAGTCC+TGG 0.497175 7:+61366578 MsG0780039286.01.T01:CDS
CTGAACAATCCAAAACTATG+TGG 0.500605 7:+61366470 MsG0780039286.01.T01:CDS
GACTTCAAAACAGAAGCTAA+AGG 0.500715 7:-61370067 None:intergenic
CTCACACCCTGTCACTGGTC+CGG 0.509834 7:+61365810 MsG0780039286.01.T01:CDS
GACTCAAACCTTTCTTAGAC+CGG 0.512238 7:-61366574 None:intergenic
TTGGTAAGGTGGGTAAAGAA+AGG 0.512436 7:+61369699 MsG0780039286.01.T01:CDS
AGTCCAAGAAAATTTGTTCA+CGG 0.512967 7:+61369360 MsG0780039286.01.T01:CDS
GCATATGTGTTAGGGAAAAG+TGG 0.513705 7:+61366944 MsG0780039286.01.T01:CDS
ATTGTGTATAAGGTAGTGCT+TGG 0.514504 7:+61366974 MsG0780039286.01.T01:CDS
TGGTAAGGTGGGTAAAGAAA+GGG 0.514647 7:+61369700 MsG0780039286.01.T01:CDS
TGAATTTCTTGAAGAAGTGA+TGG 0.515957 7:-61369759 None:intergenic
GGTAAAGTTCCGAAGTCTCT+AGG 0.516142 7:+61366347 MsG0780039286.01.T01:CDS
TTAGCTGCTCCAACATCTCC+GGG 0.521979 7:+61365835 MsG0780039286.01.T01:CDS
CTTCACAGTATCTTCCTCCA+TGG 0.522667 7:+61366017 MsG0780039286.01.T01:CDS
GGTTCAATTCCGGAACAAAT+CGG 0.526872 7:+61366272 MsG0780039286.01.T01:CDS
TTGTGTATAAGGTAGTGCTT+GGG 0.527156 7:+61366975 MsG0780039286.01.T01:CDS
ATGGAGATATGCTAAACCTC+TGG 0.527742 7:-61369331 None:intergenic
TCGAAGTACCTGACTTGGTA+AGG 0.528645 7:+61369685 MsG0780039286.01.T01:CDS
CACTCCAGAATCTGATCACT+AGG 0.529910 7:+61370197 MsG0780039286.01.T01:three_prime_UTR
GATGTTGGAGCAGCTAATGC+CGG 0.531744 7:-61365829 None:intergenic
TCATGTTCACTACTTTCAGC+TGG 0.531778 7:-61369914 None:intergenic
TAAGACCAAAATCAGAAATG+AGG 0.531899 7:-61369428 None:intergenic
ATTGAAGAGCTGAACGGGAA+TGG 0.532796 7:-61365985 None:intergenic
GAAAGTAGTGAACATGAGAC+TGG 0.533443 7:+61369920 MsG0780039286.01.T01:three_prime_UTR
CACCGACGGGGAGAGGCTAC+CGG 0.534795 7:-61366051 None:intergenic
GGTTACACACCGACGGGGAG+AGG 0.537949 7:-61366058 None:intergenic
ACGACCTCACACCCTGTCAC+TGG 0.538030 7:+61365805 MsG0780039286.01.T01:CDS
CGGGAATGGAGCCATGGAAG+AGG 0.539099 7:-61365971 None:intergenic
CTCGCGAGGAATAATTTCTC+CGG 0.539487 7:+61366176 MsG0780039286.01.T01:CDS
AGATTCTTCAGCTTCTTCCA+TGG 0.539850 7:-61366215 None:intergenic
TGAAGGAGAAGGTGAATTGG+TGG 0.540152 7:+61366871 MsG0780039286.01.T01:CDS
GGTTCAGCGTCGAGTGAACC+AGG 0.541705 7:+61366518 MsG0780039286.01.T01:CDS
ATGAAAGATTTGGAGATGGT+TGG 0.541850 7:-61369275 None:intergenic
GAGCCTGACTCCCGTGTCGT+CGG 0.543493 7:+61365858 MsG0780039286.01.T01:CDS
CAAAATCAGAAATGAGGGGT+TGG 0.544489 7:-61369422 None:intergenic
GTGAATTATCAGAGAGGTCA+AGG 0.546065 7:-61366097 None:intergenic
TGAACAATCCAAAACTATGT+GGG 0.546496 7:+61366471 MsG0780039286.01.T01:CDS
CTCCATGGGAACAATCTCTC+CGG 0.546505 7:+61366032 MsG0780039286.01.T01:CDS
ACCGGCAACAATCCCTCGAC+CGG 0.547897 7:+61369468 MsG0780039286.01.T01:CDS
AAGACCAAAATCAGAAATGA+GGG 0.548585 7:-61369427 None:intergenic
TGGCGTCACCGGAATGTCAC+CGG 0.548765 7:-61366195 None:intergenic
CTCCGGTAGCCTCTCCCCGT+CGG 0.550219 7:+61366049 MsG0780039286.01.T01:CDS
GAGGTCATTGTCATCATCGC+AGG 0.553534 7:+61370107 MsG0780039286.01.T01:three_prime_UTR
GTGACATTCCGGTGACGCCA+TGG 0.554414 7:+61366198 MsG0780039286.01.T01:CDS
GTAGAACCAGGACTAGCTCC+TGG 0.556018 7:-61366536 None:intergenic
CTCTCTGATAATTCACTCGC+CGG 0.557960 7:+61366104 MsG0780039286.01.T01:CDS
TAGGGGAAGGTGGTGAACAA+AGG 0.563082 7:+61367026 MsG0780039286.01.T01:CDS
AGTGAGAAAGGAGTGAGAGA+GGG 0.563134 7:+61366830 MsG0780039286.01.T01:CDS
CCCATAAAACCGCCGGTCGA+GGG 0.564794 7:-61369480 None:intergenic
GACACGGGAGTCAGGCTCCC+CGG 0.565366 7:-61365853 None:intergenic
GAGGAAGGTTACACACCGAC+GGG 0.565523 7:-61366064 None:intergenic
ATTTGAGTGTTAGAAGGGCG+AGG 0.567287 7:-61365731 None:intergenic
TAAGAGTGATGATTCTGAGA+TGG 0.567632 7:+61366802 MsG0780039286.01.T01:CDS
CCTAATCTCCTAACAGCCAC+AGG 0.570515 7:-61367007 None:intergenic
AGATCAAAACTAACCGTCAC+CGG 0.570717 7:-61366377 None:intergenic
CCGCAACCACATTCTCCGAC+TGG 0.573405 7:+61365775 MsG0780039286.01.T01:CDS
GACCATGAAAGATTTGGAGA+TGG 0.574571 7:-61369279 None:intergenic
TGTTAGAAGGGCGAGGCCGT+CGG 0.577406 7:-61365724 None:intergenic
GGCGGATTTGAGTGTTAGAA+GGG 0.577460 7:-61365736 None:intergenic
GTCGTCGGTATCGGTCTCGC+CGG 0.579677 7:+61365873 MsG0780039286.01.T01:CDS
CATATGTGTTAGGGAAAAGT+GGG 0.582414 7:+61366945 MsG0780039286.01.T01:CDS
TCCTTGATTCGAAAATGACC+CGG 0.582907 7:-61366435 None:intergenic
AGTGAACCAGGAGCTAGTCC+TGG 0.583124 7:+61366530 MsG0780039286.01.T01:CDS
TGAGGTTTCCGAGCTCCGAC+GGG 0.583866 7:-61365917 None:intergenic
GGCATTGATTGGTCTTGTAG+TGG 0.584401 7:+61366640 MsG0780039286.01.T01:CDS
CTCCATACAAACCTCTTCCA+TGG 0.584839 7:+61365960 MsG0780039286.01.T01:CDS
CGAGACCGATACCGACGACA+CGG 0.585373 7:-61365869 None:intergenic
TTCACAGTATCTTCCTCCAT+GGG 0.585759 7:+61366018 MsG0780039286.01.T01:CDS
AACCGGCTAATAAGCATCAC+CGG 0.586637 7:+61369450 MsG0780039286.01.T01:CDS
GTTAGGAGATTAGGGGAAGG+TGG 0.589278 7:+61367016 MsG0780039286.01.T01:CDS
GTCGTTTCTCTCTCCTCCGA+CGG 0.589647 7:+61365708 MsG0780039286.01.T01:CDS
TCTAGGAAAATTGCCGGTGA+CGG 0.590065 7:+61366364 MsG0780039286.01.T01:CDS
TTGTATGGAGACTAAGACGA+CGG 0.591417 7:-61365947 None:intergenic
TACCGGAGAGATTGTTCCCA+TGG 0.592200 7:-61366034 None:intergenic
TTCTGTCGAAGTACCTGACT+TGG 0.593631 7:+61369680 MsG0780039286.01.T01:CDS
GTAGCGCTGTCATGCACTGA+GGG 0.594950 7:+61369813 MsG0780039286.01.T01:CDS
GCTTGGGAATGGTGTGCCTG+TGG 0.595010 7:+61366991 MsG0780039286.01.T01:CDS
ATGAGGTTTCCGAGCTCCGA+CGG 0.599315 7:-61365918 None:intergenic
ACACTCAAATCCGCCGTCGA+CGG 0.603227 7:+61365744 MsG0780039286.01.T01:CDS
TATAAGGTAGTGCTTGGGAA+TGG 0.603266 7:+61366980 MsG0780039286.01.T01:CDS
GGTGTCGCTGCCGTCGACGG+CGG 0.603506 7:-61365754 None:intergenic
GGAGATATTTCTGAGTCTAT+CGG 0.603709 7:+61366125 MsG0780039286.01.T01:CDS
AGTAGCTGATGCTGCTGCAG+TGG 0.606005 7:+61366619 MsG0780039286.01.T01:CDS
CCAGTCGGAGAATGTGGTTG+CGG 0.611723 7:-61365775 None:intergenic
AAGTACCTGACTTGGTAAGG+TGG 0.612609 7:+61369688 MsG0780039286.01.T01:CDS
TCGGAGGAGAGAGAAACGAC+GGG 0.613688 7:-61365705 None:intergenic
GATAGACTCAGAAATATCTC+CGG 0.615701 7:-61366123 None:intergenic
GGCAACAATCCCTCGACCGG+CGG 0.616053 7:+61369471 MsG0780039286.01.T01:CDS
TAAGACGACGGAGGTAGATG+AGG 0.618199 7:-61365935 None:intergenic
ACGCGTTGTCGAGTAGAACC+AGG 0.621949 7:-61366548 None:intergenic
TGTGTCGAGGAGGATATTGG+AGG 0.624469 7:-61369394 None:intergenic
CGAGGAAGGTTACACACCGA+CGG 0.625713 7:-61366065 None:intergenic
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GCGGTGAAATTCCTCAAACC+GGG 0.629010 7:+61366417 MsG0780039286.01.T01:CDS
CCGGTACAATCTTTCTGCAG+AGG 0.629089 7:-61366497 None:intergenic
CGGACCAGTGACAGGGTGTG+AGG 0.629219 7:-61365809 None:intergenic
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AGTAGCATTGAAGAGCTGAA+CGG 0.632087 7:-61365991 None:intergenic
GTGTCGAGGAGGATATTGGA+GGG 0.632235 7:-61369393 None:intergenic
GCTGAACGGGAATGGAGCCA+TGG 0.634530 7:-61365977 None:intergenic
TAGAAGGGCGAGGCCGTCGG+AGG 0.634899 7:-61365721 None:intergenic
CCTCTGCAGAAAGATTGTAC+CGG 0.635693 7:+61366497 MsG0780039286.01.T01:CDS
AGCACCACCCATAAAACCGC+CGG 0.636759 7:-61369487 None:intergenic
TCCAGAGACTGATTCTCGCG+AGG 0.637691 7:+61366162 MsG0780039286.01.T01:CDS
AGTACCTGACTTGGTAAGGT+GGG 0.638513 7:+61369689 MsG0780039286.01.T01:CDS
GTCGGAGGAGAGAGAAACGA+CGG 0.639933 7:-61365706 None:intergenic
TGCTCCTGGAGAAGAATCTG+GGG 0.642743 7:-61369652 None:intergenic
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ATGGAGGAAGATACTGTGAA+GGG 0.648492 7:-61366015 None:intergenic
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GGATTGTTCAGAAACGCCGT+CGG 0.650186 7:-61366458 None:intergenic
GGTGAGTTAAACTCACTCAC+CGG 0.654508 7:+61366293 MsG0780039286.01.T01:CDS
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ATAGCCAAAGGAACAGCCAG+AGG 0.655599 7:+61369315 MsG0780039286.01.T01:CDS
CGGAGAGATTGTTCCCATGG+AGG 0.656593 7:-61366031 None:intergenic
GAGACCGATACCGACGACAC+GGG 0.660616 7:-61365868 None:intergenic
GCTGTTAGGAGATTAGGGGA+AGG 0.663294 7:+61367013 MsG0780039286.01.T01:CDS
GTTGGAAGTCTGTGTCGAGG+AGG 0.669779 7:-61369404 None:intergenic
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GGGGTTGGAAGTCTGTGTCG+AGG 0.688135 7:-61369407 None:intergenic
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CTCGCCGGAAAAGGTCTCCG+TGG 0.691092 7:+61365888 MsG0780039286.01.T01:CDS
AGACCAAAATCAGAAATGAG+GGG 0.693537 7:-61369426 None:intergenic
GTTATAATAATAATCAAACC+AGG 0.703153 7:-61366596 None:intergenic
GCTCCGACGGGAGATAACCA+CGG 0.719955 7:-61365905 None:intergenic
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CGGCGAGTGAATTATCAGAG+AGG 0.737267 7:-61366103 None:intergenic
TAGCTGCTCCAACATCTCCG+GGG 0.742371 7:+61365836 MsG0780039286.01.T01:CDS
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TATGGAGACTAAGACGACGG+AGG 0.773748 7:-61365944 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! ATTTTTATTTTTTTTATAAA+TGG - Chr7:61369058-61369077 None:intergenic 0.0%
!! ACATAATTTATTAAATTTCT+TGG - Chr7:61370154-61370173 None:intergenic 10.0%
!! AAGAAAAAAGATAAGAATAA+TGG + Chr7:61366677-61366696 MsG0780039286.01.T01:CDS 15.0%
!! AATAAATAAGCATCTAAATA+AGG - Chr7:61368153-61368172 None:intergenic 15.0%
!! ATAACAAAAGAAATCAAATT+TGG + Chr7:61367915-61367934 MsG0780039286.01.T01:intron 15.0%
!! ATAATCATGAATAAATTAGT+TGG - Chr7:61369024-61369043 None:intergenic 15.0%
!! ATATACTAGTATTAACAAAT+TGG - Chr7:61367549-61367568 None:intergenic 15.0%
!! ATATTGTATATTTGAATTTG+AGG + Chr7:61368099-61368118 MsG0780039286.01.T01:intron 15.0%
!! TTTAGATGCTTATTTATTAT+TGG + Chr7:61368155-61368174 MsG0780039286.01.T01:intron 15.0%
!!! AAATTTTCTTTTTAGTTGTT+TGG + Chr7:61368544-61368563 MsG0780039286.01.T01:intron 15.0%
!!! ACTTGAATTTTATGTAATAT+AGG + Chr7:61367723-61367742 MsG0780039286.01.T01:intron 15.0%
!! AATAGTGTAATATGTTATGT+AGG + Chr7:61368986-61369005 MsG0780039286.01.T01:intron 20.0%
!! ATGCTTATTTATTATTGGTA+AGG + Chr7:61368160-61368179 MsG0780039286.01.T01:intron 20.0%
!! ATTAAATTTCTACTTTGTCT+TGG + Chr7:61368052-61368071 MsG0780039286.01.T01:intron 20.0%
!! CATACATAAACAAAATGTAA+AGG - Chr7:61367215-61367234 None:intergenic 20.0%
!! GTTATAATAATAATCAAACC+AGG - Chr7:61366599-61366618 None:intergenic 20.0%
!! GTTATTCTATATGAAAAAAG+TGG + Chr7:61367628-61367647 MsG0780039286.01.T01:intron 20.0%
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!! TGCTTATTTATTATTGGTAA+GGG + Chr7:61368161-61368180 MsG0780039286.01.T01:intron 20.0%
!! TGGAAAATTCATATGTAATA+TGG + Chr7:61370253-61370272 MsG0780039286.01.T01:three_prime_UTR 20.0%
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!! TTAATGATAACATGTGAAAT+TGG + Chr7:61367428-61367447 MsG0780039286.01.T01:intron 20.0%
!! TTATAAAAAGAAAGAGACAA+TGG - Chr7:61367955-61367974 None:intergenic 20.0%
!! TTATTAAATTTCTTGGTCAT+TGG - Chr7:61370147-61370166 None:intergenic 20.0%
!!! ATTAGTGATTTTGTTTCTAA+TGG + Chr7:61367151-61367170 MsG0780039286.01.T01:CDS 20.0%
!!! TACTTTAAAAGATTCTATGA+AGG - Chr7:61368605-61368624 None:intergenic 20.0%
!!! TAGTGTTATTGTTACTTAAT+TGG + Chr7:61370233-61370252 MsG0780039286.01.T01:three_prime_UTR 20.0%
!!! TGTTACATTATTAATCCTTT+TGG + Chr7:61368793-61368812 MsG0780039286.01.T01:intron 20.0%
!!! TTAAACTCTATCATCATTTT+AGG + Chr7:61367658-61367677 MsG0780039286.01.T01:intron 20.0%
!!! TTAGTTTTAGCTGAAATTAA+AGG - Chr7:61367776-61367795 None:intergenic 20.0%
!!! TTATTGTTTTGTGATACAAT+GGG + Chr7:61367987-61368006 MsG0780039286.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTATTGTTTTGTGATACAA+TGG + Chr7:61367986-61368005 MsG0780039286.01.T01:intron 20.0%
! AAATACTTTCTTTCCTATCT+GGG + Chr7:61370037-61370056 MsG0780039286.01.T01:three_prime_UTR 25.0%
! AAATGGGATGTATATTCATT+TGG + Chr7:61369597-61369616 MsG0780039286.01.T01:CDS 25.0%
! AAGCTAGTTATCATTGATAA+TGG - Chr7:61370305-61370324 None:intergenic 25.0%
! ACTGCTTACATCAATTTAAT+TGG + Chr7:61367472-61367491 MsG0780039286.01.T01:intron 25.0%
! ACTTATGTTTGGCTATTATA+TGG + Chr7:61368919-61368938 MsG0780039286.01.T01:intron 25.0%
! AGAATCTAGATAGAAGTTAA+TGG - Chr7:61368309-61368328 None:intergenic 25.0%
! CACTAAACTAACCAAAAATT+AGG + Chr7:61368360-61368379 MsG0780039286.01.T01:intron 25.0%
! CTTTCGTTTAATCATTTATC+CGG + Chr7:61366326-61366345 MsG0780039286.01.T01:CDS 25.0%
! GAGTAAATCTAGCATATTAT+AGG - Chr7:61367887-61367906 None:intergenic 25.0%
! GCTCTTAACTTAACAATATT+AGG - Chr7:61367100-61367119 None:intergenic 25.0%
! TAAACTAACCAAAAATTAGG+CGG + Chr7:61368363-61368382 MsG0780039286.01.T01:intron 25.0%
! TTGTGCCAAAACAAATTATT+GGG - Chr7:61369211-61369230 None:intergenic 25.0%
! TTTGTGCCAAAACAAATTAT+TGG - Chr7:61369212-61369231 None:intergenic 25.0%
!! AACAAATTGGTCTAATATCT+AGG - Chr7:61367536-61367555 None:intergenic 25.0%
!! ATATAGGTTTGATGATCATT+TGG + Chr7:61367739-61367758 MsG0780039286.01.T01:intron 25.0%
!! ATGAATATACATCCCATTTT+TGG - Chr7:61369596-61369615 None:intergenic 25.0%
!! TGTACTTTGAAGAGAAAATT+TGG + Chr7:61366707-61366726 MsG0780039286.01.T01:CDS 25.0%
!! TTATCAATGATAACTAGCTT+TGG + Chr7:61370305-61370324 MsG0780039286.01.T01:three_prime_UTR 25.0%
!!! CTAATTTTTGGTTAGTTTAG+TGG - Chr7:61368362-61368381 None:intergenic 25.0%
!!! TGAATATACATCCCATTTTT+GGG - Chr7:61369595-61369614 None:intergenic 25.0%
!!! TTTTGTGCCTTTATTTCATT+CGG + Chr7:61368684-61368703 MsG0780039286.01.T01:intron 25.0%
!!! TTTTGTTTCTAATGGCAATT+TGG + Chr7:61367159-61367178 MsG0780039286.01.T01:CDS 25.0%
AAGACCAAAATCAGAAATGA+GGG - Chr7:61369430-61369449 None:intergenic 30.0%
AATATGCTAGATTTACTCTC+AGG + Chr7:61367889-61367908 MsG0780039286.01.T01:intron 30.0%
ACTTCAAAACAGAAGCTAAA+GGG - Chr7:61370069-61370088 None:intergenic 30.0%
ACTTTAGCCGAATGAAATAA+AGG - Chr7:61368694-61368713 None:intergenic 30.0%
AGTATTTATGCAGGAAGAAA+TGG + Chr7:61369252-61369271 MsG0780039286.01.T01:intron 30.0%
CAAATACTTTCTTTCCTATC+TGG + Chr7:61370036-61370055 MsG0780039286.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
CGGATAAATGATTAAACGAA+AGG - Chr7:61366328-61366347 None:intergenic 30.0%
CTAACTAACCATCTTATTCT+TGG - Chr7:61368014-61368033 None:intergenic 30.0%
GATCAACCATTTCAGATAAA+GGG - Chr7:61369740-61369759 None:intergenic 30.0%
TAAGACCAAAATCAGAAATG+AGG - Chr7:61369431-61369450 None:intergenic 30.0%
TATGAAGGTGAGTGTAAAAA+TGG - Chr7:61367318-61367337 None:intergenic 30.0%
TCATAATCAGCATTTGCATT+TGG + Chr7:61369167-61369186 MsG0780039286.01.T01:intron 30.0%
TCTACATAGTGAGATGTATT+AGG + Chr7:61367594-61367613 MsG0780039286.01.T01:intron 30.0%
TGAACAATCCAAAACTATGT+GGG + Chr7:61366471-61366490 MsG0780039286.01.T01:CDS 30.0%
TGAATTTCTTGAAGAAGTGA+TGG - Chr7:61369762-61369781 None:intergenic 30.0%
TGGAATCTTAGATAATGTAG+TGG + Chr7:61367448-61367467 MsG0780039286.01.T01:intron 30.0%
TTCTTCCTGCATAAATACTT+CGG - Chr7:61369251-61369270 None:intergenic 30.0%
! AAGAGAAAATTTGGTGGTAA+TGG + Chr7:61366716-61366735 MsG0780039286.01.T01:CDS 30.0%
! ACATTCAGAAGATTTTCTTG+TGG + Chr7:61369985-61370004 MsG0780039286.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
! ACTTTGAAGAGAAAATTTGG+TGG + Chr7:61366710-61366729 MsG0780039286.01.T01:CDS 30.0%
! AGTCCAAGAAAATTTGTTCA+CGG + Chr7:61369360-61369379 MsG0780039286.01.T01:CDS 30.0%
! ATGAAATAAAGGCACAAAAG+CGG - Chr7:61368683-61368702 None:intergenic 30.0%
! ATTCAGAAGATTTTCTTGTG+GGG + Chr7:61369987-61370006 MsG0780039286.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
! CATTCAGAAGATTTTCTTGT+GGG + Chr7:61369986-61370005 MsG0780039286.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
! GTTTTACTTGAATTGCTAAC+TGG + Chr7:61369624-61369643 MsG0780039286.01.T01:CDS 30.0%
! TAATTCCGAAGTATTTATGC+AGG + Chr7:61369243-61369262 MsG0780039286.01.T01:intron 30.0%
! TGAATGTCTTCCTTTCTTTT+GGG - Chr7:61368241-61368260 None:intergenic 30.0%
! TGTTGAAACAATTGATAGCA+AGG + Chr7:61367821-61367840 MsG0780039286.01.T01:intron 30.0%
! TTATCAGCAAATGTTCTAGA+AGG + Chr7:61366251-61366270 MsG0780039286.01.T01:CDS 30.0%
! TTTATTATTGGTAAGGGCAT+TGG + Chr7:61368167-61368186 MsG0780039286.01.T01:intron 30.0%
!! ATCATTTTAGGTAGATGAAG+TGG + Chr7:61367670-61367689 MsG0780039286.01.T01:intron 30.0%
!!! AACCTTTTTTGCTTTCAAAG+AGG + Chr7:61368819-61368838 MsG0780039286.01.T01:intron 30.0%
!!! AAGTCAGAGCAATTTTTTGA+CGG + Chr7:61370085-61370104 MsG0780039286.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
!!! ATCGTCCCAATAATTTGTTT+TGG + Chr7:61369203-61369222 MsG0780039286.01.T01:intron 30.0%
!!! TTTCTGATTTTGGTCTTAAC+CGG + Chr7:61369433-61369452 MsG0780039286.01.T01:CDS 30.0%
AAATCCTAGTGATCAGATTC+TGG - Chr7:61370204-61370223 None:intergenic 35.0%
AACCATCTCCAAATCTTTCA+TGG + Chr7:61369277-61369296 MsG0780039286.01.T01:CDS 35.0%
AAGACATTCACCATGTGTTA+GGG + Chr7:61368251-61368270 MsG0780039286.01.T01:intron 35.0%
AATTTGGCTAATGCTCTTAG+AGG + Chr7:61367175-61367194 MsG0780039286.01.T01:CDS 35.0%
AGAAAGCCCTTTATCTGAAA+TGG + Chr7:61369731-61369750 MsG0780039286.01.T01:CDS 35.0%
AGACCAAAATCAGAAATGAG+GGG - Chr7:61369429-61369448 None:intergenic 35.0%
ATGAAAGATTTGGAGATGGT+TGG - Chr7:61369278-61369297 None:intergenic 35.0%
ATTGTGTATAAGGTAGTGCT+TGG + Chr7:61366974-61366993 MsG0780039286.01.T01:CDS 35.0%
CAAATCTTTCATGGTCAATC+AGG + Chr7:61369286-61369305 MsG0780039286.01.T01:CDS 35.0%
CACGATCACTTGATTCAATT+GGG + Chr7:61368855-61368874 MsG0780039286.01.T01:intron 35.0%
CATAAGTGTAGTAGAAGCAA+AGG - Chr7:61368906-61368925 None:intergenic 35.0%
CATATCATTTCCCTAACACA+TGG - Chr7:61368264-61368283 None:intergenic 35.0%
CATATGTGTTAGGGAAAAGT+GGG + Chr7:61366945-61366964 MsG0780039286.01.T01:CDS 35.0%
CATGTGTTAGGGAAATGATA+TGG + Chr7:61368262-61368281 MsG0780039286.01.T01:intron 35.0%
CATTGGATCGAGAAATTGTT+TGG + Chr7:61368184-61368203 MsG0780039286.01.T01:intron 35.0%
CTACTGAAGTTCAAGCAATT+GGG + Chr7:61367062-61367081 MsG0780039286.01.T01:CDS 35.0%
CTGAACAATCCAAAACTATG+TGG + Chr7:61366470-61366489 MsG0780039286.01.T01:CDS 35.0%
CTGATTGACCATGAAAGATT+TGG - Chr7:61369288-61369307 None:intergenic 35.0%
GACTTCAAAACAGAAGCTAA+AGG - Chr7:61370070-61370089 None:intergenic 35.0%
GATAGACTCAGAAATATCTC+CGG - Chr7:61366126-61366145 None:intergenic 35.0%
GATGATCATTTGGTCAATTG+TGG + Chr7:61367749-61367768 MsG0780039286.01.T01:intron 35.0%
GCAAAAAAGGTTTAGCCAAA+AGG - Chr7:61368811-61368830 None:intergenic 35.0%
GCTTCTACTACACTTATGTT+TGG + Chr7:61368908-61368927 MsG0780039286.01.T01:intron 35.0%
GGATCAACCATTTCAGATAA+AGG - Chr7:61369741-61369760 None:intergenic 35.0%
GTCATCATAAAAATGCATCC+TGG - Chr7:61369967-61369986 None:intergenic 35.0%
TACAAATAGCTAGCTCAAGT+AGG + Chr7:61369079-61369098 MsG0780039286.01.T01:intron 35.0%
TCACGATCACTTGATTCAAT+TGG + Chr7:61368854-61368873 MsG0780039286.01.T01:intron 35.0%
TGTTGCATTTGTTCATGAAG+AGG + Chr7:61367284-61367303 MsG0780039286.01.T01:intron 35.0%
TTATCTCATTCTCACCACAT+GGG + Chr7:61368335-61368354 MsG0780039286.01.T01:intron 35.0%
TTCTTGGTCATTGGAAGATA+AGG - Chr7:61370138-61370157 None:intergenic 35.0%
TTGTAGTGGTGTATGTGTAT+TGG + Chr7:61366654-61366673 MsG0780039286.01.T01:CDS 35.0%
TTGTGTATAAGGTAGTGCTT+GGG + Chr7:61366975-61366994 MsG0780039286.01.T01:CDS 35.0%
TTTATCTCATTCTCACCACA+TGG + Chr7:61368334-61368353 MsG0780039286.01.T01:intron 35.0%
! ATTTTCTTGGACTGCATTCA+TGG - Chr7:61369353-61369372 None:intergenic 35.0%
! CAACTTTTCCGCCTAATTTT+TGG - Chr7:61368374-61368393 None:intergenic 35.0%
! GAATAAGATGGTTAGTTAGC+TGG + Chr7:61368015-61368034 MsG0780039286.01.T01:intron 35.0%
! GAATGTCTTCCTTTCTTTTG+GGG - Chr7:61368240-61368259 None:intergenic 35.0%
! GAATTGGTGGCAATTGATAA+AGG + Chr7:61366884-61366903 MsG0780039286.01.T01:CDS 35.0%
! GACCTCTTTGAAAGCAAAAA+AGG - Chr7:61368824-61368843 None:intergenic 35.0%
! GGAGATATTTCTGAGTCTAT+CGG + Chr7:61366125-61366144 MsG0780039286.01.T01:CDS 35.0%
! GTGAATGTCTTCCTTTCTTT+TGG - Chr7:61368242-61368261 None:intergenic 35.0%
! TAAGAGTGATGATTCTGAGA+TGG + Chr7:61366802-61366821 MsG0780039286.01.T01:CDS 35.0%
! TCAGACACAGTTTTCATTCT+AGG - Chr7:61369855-61369874 None:intergenic 35.0%
! TGAATTTGAGGTGAGAATGT+GGG + Chr7:61368111-61368130 MsG0780039286.01.T01:intron 35.0%
! TGTTGTTTGTGTTGGACTTT+AGG + Chr7:61366764-61366783 MsG0780039286.01.T01:CDS 35.0%
! TTCAGAAGATTTTCTTGTGG+GGG + Chr7:61369988-61370007 MsG0780039286.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
! TTCAGGAGCTTTATAGTTGT+TGG - Chr7:61369547-61369566 None:intergenic 35.0%
! TTGAATTTGAGGTGAGAATG+TGG + Chr7:61368110-61368129 MsG0780039286.01.T01:intron 35.0%
!! ATATACATCCCATTTTTGGG+TGG - Chr7:61369592-61369611 None:intergenic 35.0%
!! GGACTTTAGGTTGTGTAAAA+GGG + Chr7:61366777-61366796 MsG0780039286.01.T01:CDS 35.0%
!! TGGACTTTAGGTTGTGTAAA+AGG + Chr7:61366776-61366795 MsG0780039286.01.T01:CDS 35.0%
!! TGGGAAACATAGTTCTAGTA+GGG - Chr7:61368881-61368900 None:intergenic 35.0%
!! TGTTCTAGAAGGTTCAATTC+CGG + Chr7:61366262-61366281 MsG0780039286.01.T01:CDS 35.0%
!! TTTAACTCACCGATTTGTTC+CGG - Chr7:61366284-61366303 None:intergenic 35.0%
!!! TATACATCCCATTTTTGGGT+GGG - Chr7:61369591-61369610 None:intergenic 35.0%
!!! TATCTCTCTGTTTTTGCTCT+TGG + Chr7:61367246-61367265 MsG0780039286.01.T01:intron 35.0%
!!! TGACGGTTAGTTTTGATCTT+CGG + Chr7:61366381-61366400 MsG0780039286.01.T01:CDS 35.0%
AAACGAAAGGTTTAGCGTTC+CGG - Chr7:61366315-61366334 None:intergenic 40.0%
AACCTGCTACTCTGATATGA+AGG - Chr7:61367333-61367352 None:intergenic 40.0%
AATGTCAATGAGATGCCCTT+TGG + Chr7:61368209-61368228 MsG0780039286.01.T01:intron 40.0%
AGAGCTTCTGCATATGTGTT+AGG + Chr7:61366935-61366954 MsG0780039286.01.T01:CDS 40.0%
AGATCAAAACTAACCGTCAC+CGG - Chr7:61366380-61366399 None:intergenic 40.0%
AGATTCTTCAGCTTCTTCCA+TGG - Chr7:61366218-61366237 None:intergenic 40.0%
ATGGAGATATGCTAAACCTC+TGG - Chr7:61369334-61369353 None:intergenic 40.0%
ATGGAGGAAGATACTGTGAA+GGG - Chr7:61366018-61366037 None:intergenic 40.0%
ATGTCAATGAGATGCCCTTT+GGG + Chr7:61368210-61368229 MsG0780039286.01.T01:intron 40.0%
CAAAATCAGAAATGAGGGGT+TGG - Chr7:61369425-61369444 None:intergenic 40.0%
CAATGGGACCAAGAATAAGA+TGG + Chr7:61368003-61368022 MsG0780039286.01.T01:intron 40.0%
CACAGCTAGTACTTCTTTCT+TGG - Chr7:61369787-61369806 None:intergenic 40.0%
GAAAGTAGTGAACATGAGAC+TGG + Chr7:61369920-61369939 MsG0780039286.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
GAAGACATTCACCATGTGTT+AGG + Chr7:61368250-61368269 MsG0780039286.01.T01:intron 40.0%
GAAGGTGAGTGTAAAAATGG+AGG - Chr7:61367315-61367334 None:intergenic 40.0%
GACCATGAAAGATTTGGAGA+TGG - Chr7:61369282-61369301 None:intergenic 40.0%
GACTCAAACCTTTCTTAGAC+CGG - Chr7:61366577-61366596 None:intergenic 40.0%
GAGCTTCTGCATATGTGTTA+GGG + Chr7:61366936-61366955 MsG0780039286.01.T01:CDS 40.0%
GCATATGTGTTAGGGAAAAG+TGG + Chr7:61366944-61366963 MsG0780039286.01.T01:CDS 40.0%
GCTACTGAAGTTCAAGCAAT+TGG + Chr7:61367061-61367080 MsG0780039286.01.T01:CDS 40.0%
GGTTCAATTCCGGAACAAAT+CGG + Chr7:61366272-61366291 MsG0780039286.01.T01:CDS 40.0%
GTGAATTATCAGAGAGGTCA+AGG - Chr7:61366100-61366119 None:intergenic 40.0%
GTTTGTGACGACTTCATGTA+AGG - Chr7:61369516-61369535 None:intergenic 40.0%
TAAAGGGACAAATCCCAGAT+AGG - Chr7:61370053-61370072 None:intergenic 40.0%
TAATTTCTCCGGTGACATTC+CGG + Chr7:61366187-61366206 MsG0780039286.01.T01:CDS 40.0%
TAGAGACTTCGGAACTTTAC+CGG - Chr7:61366348-61366367 None:intergenic 40.0%
TATAAGGTAGTGCTTGGGAA+TGG + Chr7:61366980-61366999 MsG0780039286.01.T01:CDS 40.0%
TATCTCATTCTCACCACATG+GGG + Chr7:61368336-61368355 MsG0780039286.01.T01:intron 40.0%
TCATGTTCACTACTTTCAGC+TGG - Chr7:61369917-61369936 None:intergenic 40.0%
TCTAAGAAAGGTTTGAGTCC+TGG + Chr7:61366578-61366597 MsG0780039286.01.T01:CDS 40.0%
TGCAGGAACATGACTTACTA+AGG - Chr7:61368407-61368426 None:intergenic 40.0%
TGGTAAGGTGGGTAAAGAAA+GGG + Chr7:61369700-61369719 MsG0780039286.01.T01:CDS 40.0%
TGTAGTAGAAGCAAAGGAGT+GGG - Chr7:61368900-61368919 None:intergenic 40.0%
TTCACAGTATCTTCCTCCAT+GGG + Chr7:61366018-61366037 MsG0780039286.01.T01:CDS 40.0%
TTGGTAAGGTGGGTAAAGAA+AGG + Chr7:61369699-61369718 MsG0780039286.01.T01:CDS 40.0%
TTGTATGGAGACTAAGACGA+CGG - Chr7:61365950-61365969 None:intergenic 40.0%
! AGAGGAAACCCACATAGTTT+TGG - Chr7:61366482-61366501 None:intergenic 40.0%
! AGATTTGACTCGAAAGCAAG+AGG - Chr7:61368455-61368474 None:intergenic 40.0%
! AGGTGGTGAACAAAGGTATA+AGG + Chr7:61367033-61367052 MsG0780039286.01.T01:CDS 40.0%
! AGTAGCATTGAAGAGCTGAA+CGG - Chr7:61365994-61366013 None:intergenic 40.0%
! ATGGCAGTGTTATTCATGTC+TGG + Chr7:61368281-61368300 MsG0780039286.01.T01:intron 40.0%
! ATTTTCGAATCAAGGACCGA+CGG + Chr7:61366442-61366461 MsG0780039286.01.T01:CDS 40.0%
! CAACCCCTCATTTCTGATTT+TGG + Chr7:61369423-61369442 MsG0780039286.01.T01:CDS 40.0%
! GAAGTCTCTAGGAAAATTGC+CGG + Chr7:61366358-61366377 MsG0780039286.01.T01:CDS 40.0%
! GATTTGACTCGAAAGCAAGA+GGG - Chr7:61368454-61368473 None:intergenic 40.0%
! GGCAATTTTCCTAGAGACTT+CGG - Chr7:61366359-61366378 None:intergenic 40.0%
! TCCTTGATTCGAAAATGACC+CGG - Chr7:61366438-61366457 None:intergenic 40.0%
! TCGCCGTGAACAAATTTTCT+TGG - Chr7:61369366-61369385 None:intergenic 40.0%
! TGGCAGTGTTATTCATGTCT+GGG + Chr7:61368282-61368301 MsG0780039286.01.T01:intron 40.0%
! TGGGTTAGGGATTGTGTATA+AGG + Chr7:61366964-61366983 MsG0780039286.01.T01:CDS 40.0%
! TTGACTCGAGAGGATTCAAA+GGG + Chr7:61368505-61368524 MsG0780039286.01.T01:intron 40.0%
! TTTGACTCGAGAGGATTCAA+AGG + Chr7:61368504-61368523 MsG0780039286.01.T01:intron 40.0%
!! CGAATTCGTGTTGTTTGTGT+TGG + Chr7:61366756-61366775 MsG0780039286.01.T01:CDS 40.0%
!! GTGGGAAACATAGTTCTAGT+AGG - Chr7:61368882-61368901 None:intergenic 40.0%
!! TGTTAGGGAAAAGTGGGTTA+GGG + Chr7:61366951-61366970 MsG0780039286.01.T01:CDS 40.0%
!!! TCAGAGCAATTTTTTGACGG+AGG + Chr7:61370088-61370107 MsG0780039286.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
AAAGGAGTGAGAGAGGGTAA+TGG + Chr7:61366836-61366855 MsG0780039286.01.T01:CDS 45.0%
AACCGGCTAATAAGCATCAC+CGG + Chr7:61369450-61369469 MsG0780039286.01.T01:CDS 45.0%
AAGGAGTGAGAGAGGGTAAT+GGG + Chr7:61366837-61366856 MsG0780039286.01.T01:CDS 45.0%
AGCCATGGAAGAGGTTTGTA+TGG - Chr7:61365965-61365984 None:intergenic 45.0%
AGCGGTGAAATTCCTCAAAC+CGG + Chr7:61366416-61366435 MsG0780039286.01.T01:CDS 45.0%
AGTGAGAAAGGAGTGAGAGA+GGG + Chr7:61366830-61366849 MsG0780039286.01.T01:CDS 45.0%
ATCAGGCTGAGAATAGCCAA+AGG + Chr7:61369303-61369322 MsG0780039286.01.T01:CDS 45.0%
ATTAGCTGCTCCAACATCTC+CGG + Chr7:61365834-61365853 MsG0780039286.01.T01:CDS 45.0%
ATTGAAGAGCTGAACGGGAA+TGG - Chr7:61365988-61366007 None:intergenic 45.0%
ATTTGAGTGTTAGAAGGGCG+AGG - Chr7:61365734-61365753 None:intergenic 45.0%
CACCTTCATATCAGAGTAGC+AGG + Chr7:61367328-61367347 MsG0780039286.01.T01:intron 45.0%
CACTCCAGAATCTGATCACT+AGG + Chr7:61370197-61370216 MsG0780039286.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
CATGGAGGAAGATACTGTGA+AGG - Chr7:61366019-61366038 None:intergenic 45.0%
CCTCTGCAGAAAGATTGTAC+CGG + Chr7:61366497-61366516 MsG0780039286.01.T01:CDS 45.0%
CTCCATACAAACCTCTTCCA+TGG + Chr7:61365960-61365979 MsG0780039286.01.T01:CDS 45.0%
CTCGCGAGGAATAATTTCTC+CGG + Chr7:61366176-61366195 MsG0780039286.01.T01:CDS 45.0%
CTCTCTGATAATTCACTCGC+CGG + Chr7:61366104-61366123 MsG0780039286.01.T01:CDS 45.0%
CTGTGGCTGTTAGGAGATTA+GGG + Chr7:61367008-61367027 MsG0780039286.01.T01:CDS 45.0%
CTTCACAGTATCTTCCTCCA+TGG + Chr7:61366017-61366036 MsG0780039286.01.T01:CDS 45.0%
CTTCGGAGTAATGATCTGAG+CGG + Chr7:61366398-61366417 MsG0780039286.01.T01:CDS 45.0%
GAAACATGCACTTCAGTTCC+AGG + Chr7:61369946-61369965 MsG0780039286.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
GAATCAAGTGATCGTGAAGC+TGG - Chr7:61368851-61368870 None:intergenic 45.0%
GAGATGGAAGAGAGTGAGAA+AGG + Chr7:61366818-61366837 MsG0780039286.01.T01:CDS 45.0%
GGTAAAGTTCCGAAGTCTCT+AGG + Chr7:61366347-61366366 MsG0780039286.01.T01:CDS 45.0%
GGTGAGTTAAACTCACTCAC+CGG + Chr7:61366293-61366312 MsG0780039286.01.T01:CDS 45.0%
GTGTAGTAGAAGCAAAGGAG+TGG - Chr7:61368901-61368920 None:intergenic 45.0%
TAAACCTCTGGCTGTTCCTT+TGG - Chr7:61369322-61369341 None:intergenic 45.0%
TCATTCTAGGCCTGACTTCA+GGG - Chr7:61369842-61369861 None:intergenic 45.0%
TCTAGGAAAATTGCCGGTGA+CGG + Chr7:61366364-61366383 MsG0780039286.01.T01:CDS 45.0%
TGAAGGAGAAGGTGAATTGG+TGG + Chr7:61366871-61366890 MsG0780039286.01.T01:CDS 45.0%
TGTCAATGAGATGCCCTTTG+GGG + Chr7:61368211-61368230 MsG0780039286.01.T01:intron 45.0%
TGTGGCTGTTAGGAGATTAG+GGG + Chr7:61367009-61367028 MsG0780039286.01.T01:CDS 45.0%
TTCATTCTAGGCCTGACTTC+AGG - Chr7:61369843-61369862 None:intergenic 45.0%
TTGGGGATACCCCAAAAGAA+AGG + Chr7:61368228-61368247 MsG0780039286.01.T01:intron 45.0%
TTTACCCACCTTACCAAGTC+AGG - Chr7:61369696-61369715 None:intergenic 45.0%
! ATAACCACGGAGACCTTTTC+CGG - Chr7:61365895-61365914 None:intergenic 45.0%
! CGATTGAGATTTGACTCGAG+AGG + Chr7:61368495-61368514 MsG0780039286.01.T01:intron 45.0%
! GCTTTCTAGTGTTGGACTCT+TGG + Chr7:61368750-61368769 MsG0780039286.01.T01:intron 45.0%
! GGCGGATTTGAGTGTTAGAA+GGG - Chr7:61365739-61365758 None:intergenic 45.0%
! GTAGCATTGAAGAGCTGAAC+GGG - Chr7:61365993-61366012 None:intergenic 45.0%
! GTGTTAGGGAAAAGTGGGTT+AGG + Chr7:61366950-61366969 MsG0780039286.01.T01:CDS 45.0%
! TCAGTCGAGCTTTCTAGTGT+TGG + Chr7:61368742-61368761 MsG0780039286.01.T01:intron 45.0%
! TTCGAAAATGACCCGGTTTG+AGG - Chr7:61366431-61366450 None:intergenic 45.0%
! TTCTGTCGAAGTACCTGACT+TGG + Chr7:61369680-61369699 MsG0780039286.01.T01:CDS 45.0%
! TTGTGGGGGCATATCAAGAT+GGG + Chr7:61370002-61370021 MsG0780039286.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
!! AAGTACCTGACTTGGTAAGG+TGG + Chr7:61369688-61369707 MsG0780039286.01.T01:CDS 45.0%
!! ACCGGGTCATTTTCGAATCA+AGG + Chr7:61366434-61366453 MsG0780039286.01.T01:CDS 45.0%
!! AGTACCTGACTTGGTAAGGT+GGG + Chr7:61369689-61369708 MsG0780039286.01.T01:CDS 45.0%
!! GGCATTGATTGGTCTTGTAG+TGG + Chr7:61366640-61366659 MsG0780039286.01.T01:CDS 45.0%
!! TCGAAGTACCTGACTTGGTA+AGG + Chr7:61369685-61369704 MsG0780039286.01.T01:CDS 45.0%
!!! AGGTCAAGGTTTTGAAGACG+AGG - Chr7:61366086-61366105 None:intergenic 45.0%
!!! CAAGGTTTTGAAGACGAGGA+AGG - Chr7:61366082-61366101 None:intergenic 45.0%
!!! TCTTTTGGGGTATCCCCAAA+GGG - Chr7:61368227-61368246 None:intergenic 45.0%
!!! TTCTTTTGGGGTATCCCCAA+AGG - Chr7:61368228-61368247 None:intergenic 45.0%
ACTCGAGAGGATTCAAAGGG+CGG + Chr7:61368508-61368527 MsG0780039286.01.T01:intron 50.0%
ATAGCCAAAGGAACAGCCAG+AGG + Chr7:61369315-61369334 MsG0780039286.01.T01:CDS 50.0%
CCGGTACAATCTTTCTGCAG+AGG - Chr7:61366500-61366519 None:intergenic 50.0%
CCTAATCTCCTAACAGCCAC+AGG - Chr7:61367010-61367029 None:intergenic 50.0%
CCTGTGGCTGTTAGGAGATT+AGG + Chr7:61367007-61367026 MsG0780039286.01.T01:CDS 50.0%
CGGCGAGTGAATTATCAGAG+AGG - Chr7:61366106-61366125 None:intergenic 50.0%
CTCCATGGGAACAATCTCTC+CGG + Chr7:61366032-61366051 MsG0780039286.01.T01:CDS 50.0%
CTGCAGACCCACCCAAAAAT+GGG + Chr7:61369581-61369600 MsG0780039286.01.T01:CDS 50.0%
GAGGTCATTGTCATCATCGC+AGG + Chr7:61370107-61370126 MsG0780039286.01.T01:three_prime_UTR 50.0%
GAGTGAGAAAGGAGTGAGAG+AGG + Chr7:61366829-61366848 MsG0780039286.01.T01:CDS 50.0%
GATGTTGGAGCAGCTAATGC+CGG - Chr7:61365832-61365851 None:intergenic 50.0%
GCGGTGAAATTCCTCAAACC+GGG + Chr7:61366417-61366436 MsG0780039286.01.T01:CDS 50.0%
GCTGTTAGGAGATTAGGGGA+AGG + Chr7:61367013-61367032 MsG0780039286.01.T01:CDS 50.0%
GGAGGATATTGGAGGGTTTG+AGG - Chr7:61369389-61369408 None:intergenic 50.0%
GGATTGTTCAGAAACGCCGT+CGG - Chr7:61366461-61366480 None:intergenic 50.0%
GGGTGAAGGAGAAGGTGAAT+TGG + Chr7:61366868-61366887 MsG0780039286.01.T01:CDS 50.0%
GTCATGTTCCTGCACTTAGC+TGG + Chr7:61368413-61368432 MsG0780039286.01.T01:intron 50.0%
GTCTGTGTCGAGGAGGATAT+TGG - Chr7:61369400-61369419 None:intergenic 50.0%
GTGTCGAGGAGGATATTGGA+GGG - Chr7:61369396-61369415 None:intergenic 50.0%
GTTAGGAGATTAGGGGAAGG+TGG + Chr7:61367016-61367035 MsG0780039286.01.T01:CDS 50.0%
TAAGACGACGGAGGTAGATG+AGG - Chr7:61365938-61365957 None:intergenic 50.0%
TACCGGAGAGATTGTTCCCA+TGG - Chr7:61366037-61366056 None:intergenic 50.0%
TAGGGGAAGGTGGTGAACAA+AGG + Chr7:61367026-61367045 MsG0780039286.01.T01:CDS 50.0%
TATGGAGACTAAGACGACGG+AGG - Chr7:61365947-61365966 None:intergenic 50.0%
TGCCGGTGATGCTTATTAGC+CGG - Chr7:61369455-61369474 None:intergenic 50.0%
TGTGTCGAGGAGGATATTGG+AGG - Chr7:61369397-61369416 None:intergenic 50.0%
TTAGCTGCTCCAACATCTCC+GGG + Chr7:61365835-61365854 MsG0780039286.01.T01:CDS 50.0%
TTCGTTCCAGTCGGAGAATG+TGG - Chr7:61365784-61365803 None:intergenic 50.0%
! CGGCGGATTTGAGTGTTAGA+AGG - Chr7:61365740-61365759 None:intergenic 50.0%
! CTTGTGGGGGCATATCAAGA+TGG + Chr7:61370001-61370020 MsG0780039286.01.T01:three_prime_UTR 50.0%
! GTTAGTTTAGTGGCCCCATG+TGG - Chr7:61368352-61368371 None:intergenic 50.0%
! TGTGGGGGCATATCAAGATG+GGG + Chr7:61370003-61370022 MsG0780039286.01.T01:three_prime_UTR 50.0%
!! GAGGTCGTTTTCGTTCCAGT+CGG - Chr7:61365793-61365812 None:intergenic 50.0%
!! TGAGAGAGGGTAATGGGAGA+GGG + Chr7:61366843-61366862 MsG0780039286.01.T01:CDS 50.0%
ACACTCAAATCCGCCGTCGA+CGG + Chr7:61365744-61365763 MsG0780039286.01.T01:CDS 55.0%
ACGCGTTGTCGAGTAGAACC+AGG - Chr7:61366551-61366570 None:intergenic 55.0%
AGCACCACCCATAAAACCGC+CGG - Chr7:61369490-61369509 None:intergenic 55.0%
AGCTTCTTCCATGGCGTCAC+CGG - Chr7:61366209-61366228 None:intergenic 55.0%
AGGAAGGTTACACACCGACG+GGG - Chr7:61366066-61366085 None:intergenic 55.0%
AGTAGCTGATGCTGCTGCAG+TGG + Chr7:61366619-61366638 MsG0780039286.01.T01:CDS 55.0%
AGTGAACCAGGAGCTAGTCC+TGG + Chr7:61366530-61366549 MsG0780039286.01.T01:CDS 55.0%
ATGAGGTTTCCGAGCTCCGA+CGG - Chr7:61365921-61365940 None:intergenic 55.0%
ATGGTGTGCCTGTGGCTGTT+AGG + Chr7:61366999-61367018 MsG0780039286.01.T01:CDS 55.0%
CCAGTCGGAGAATGTGGTTG+CGG - Chr7:61365778-61365797 None:intergenic 55.0%
CGAGGAAGGTTACACACCGA+CGG - Chr7:61366068-61366087 None:intergenic 55.0%
CGCGTGAACCGGTCTAAGAA+AGG + Chr7:61366566-61366585 MsG0780039286.01.T01:CDS 55.0%
CGGAGAGATTGTTCCCATGG+AGG - Chr7:61366034-61366053 None:intergenic 55.0%
CTAATGCCGGACCAGTGACA+GGG - Chr7:61365819-61365838 None:intergenic 55.0%
CTACTCGACAACGCGTGAAC+CGG + Chr7:61366555-61366574 MsG0780039286.01.T01:CDS 55.0%
GAGGAAGGTTACACACCGAC+GGG - Chr7:61366067-61366086 None:intergenic 55.0%
GCTGCAGACCCACCCAAAAA+TGG + Chr7:61369580-61369599 MsG0780039286.01.T01:CDS 55.0%
GGTGAGAATGTGGGTGTAGC+TGG + Chr7:61368120-61368139 MsG0780039286.01.T01:intron 55.0%
GTAGCGCTGTCATGCACTGA+GGG + Chr7:61369813-61369832 MsG0780039286.01.T01:CDS 55.0%
GTCGGAGGAGAGAGAAACGA+CGG - Chr7:61365709-61365728 None:intergenic 55.0%
GTCGTTTCTCTCTCCTCCGA+CGG + Chr7:61365708-61365727 MsG0780039286.01.T01:CDS 55.0%
GTTGGAAGTCTGTGTCGAGG+AGG - Chr7:61369407-61369426 None:intergenic 55.0%
TAGCTGCTCCAACATCTCCG+GGG + Chr7:61365836-61365855 MsG0780039286.01.T01:CDS 55.0%
TCCTCGCGAGAATCAGTCTC+TGG - Chr7:61366166-61366185 None:intergenic 55.0%
TCGGAGGAGAGAGAAACGAC+GGG - Chr7:61365708-61365727 None:intergenic 55.0%
TCTCCGTGGTTATCTCCCGT+CGG + Chr7:61365902-61365921 MsG0780039286.01.T01:CDS 55.0%
TGGTTCACTCGACGCTGAAC+CGG - Chr7:61366519-61366538 None:intergenic 55.0%
TGTAGCGCTGTCATGCACTG+AGG + Chr7:61369812-61369831 MsG0780039286.01.T01:CDS 55.0%
TGTTCCTGCACTTAGCTGGC+TGG + Chr7:61368417-61368436 MsG0780039286.01.T01:intron 55.0%
! CAGCCTGGTACTTTGGCTTC+AGG - Chr7:61369564-61369583 None:intergenic 55.0%
! GCTCCTGAAGCCAAAGTACC+AGG + Chr7:61369558-61369577 MsG0780039286.01.T01:CDS 55.0%
! TCCAGAGACTGATTCTCGCG+AGG + Chr7:61366162-61366181 MsG0780039286.01.T01:CDS 55.0%
!! GAGAGAGGGTAATGGGAGAG+GGG + Chr7:61366844-61366863 MsG0780039286.01.T01:CDS 55.0%
!! GCTGCTGCAGTGGCATTGAT+TGG + Chr7:61366629-61366648 MsG0780039286.01.T01:CDS 55.0%
!! GTAGAACCAGGACTAGCTCC+TGG - Chr7:61366539-61366558 None:intergenic 55.0%
!! GTGAGAGAGGGTAATGGGAG+AGG + Chr7:61366842-61366861 MsG0780039286.01.T01:CDS 55.0%
AATGGGAGAGGGGAGGGTGA+AGG + Chr7:61366854-61366873 MsG0780039286.01.T01:CDS 60.0%
ACCCATAAAACCGCCGGTCG+AGG - Chr7:61369484-61369503 None:intergenic 60.0%
ACCGGCAACAATCCCTCGAC+CGG + Chr7:61369468-61369487 MsG0780039286.01.T01:CDS 60.0%
ACGACCTCACACCCTGTCAC+TGG + Chr7:61365805-61365824 MsG0780039286.01.T01:CDS 60.0%
AGAGGGGAGGGTGAAGGAGA+AGG + Chr7:61366860-61366879 MsG0780039286.01.T01:CDS 60.0%
ATACCGACGACACGGGAGTC+AGG - Chr7:61365864-61365883 None:intergenic 60.0%
CCCATAAAACCGCCGGTCGA+GGG - Chr7:61369483-61369502 None:intergenic 60.0%
CCGCAACCACATTCTCCGAC+TGG + Chr7:61365775-61365794 MsG0780039286.01.T01:CDS 60.0%
CGAGACCGATACCGACGACA+CGG - Chr7:61365872-61365891 None:intergenic 60.0%
CGGGAATGGAGCCATGGAAG+AGG - Chr7:61365974-61365993 None:intergenic 60.0%
CTCACACCCTGTCACTGGTC+CGG + Chr7:61365810-61365829 MsG0780039286.01.T01:CDS 60.0%
CTGAGGGCAACCCTGAAGTC+AGG + Chr7:61369829-61369848 MsG0780039286.01.T01:CDS 60.0%
GACTCCCGTGTCGTCGGTAT+CGG + Chr7:61365864-61365883 MsG0780039286.01.T01:CDS 60.0%
GAGACCGATACCGACGACAC+GGG - Chr7:61365871-61365890 None:intergenic 60.0%
GCATCCAGCCAGCTAAGTGC+AGG - Chr7:61368424-61368443 None:intergenic 60.0%
GCTAATGCCGGACCAGTGAC+AGG - Chr7:61365820-61365839 None:intergenic 60.0%
GCTCCGACGGGAGATAACCA+CGG - Chr7:61365908-61365927 None:intergenic 60.0%
GCTGAACGGGAATGGAGCCA+TGG - Chr7:61365980-61365999 None:intergenic 60.0%
GCTTGGGAATGGTGTGCCTG+TGG + Chr7:61366991-61367010 MsG0780039286.01.T01:CDS 60.0%
GGGGTTGGAAGTCTGTGTCG+AGG - Chr7:61369410-61369429 None:intergenic 60.0%
GGGTCTGCAGCCTGGTACTT+TGG - Chr7:61369571-61369590 None:intergenic 60.0%
GGTTATCTCCCGTCGGAGCT+CGG + Chr7:61365909-61365928 MsG0780039286.01.T01:CDS 60.0%
GTGACATTCCGGTGACGCCA+TGG + Chr7:61366198-61366217 MsG0780039286.01.T01:CDS 60.0%
TGAGGTTTCCGAGCTCCGAC+GGG - Chr7:61365920-61365939 None:intergenic 60.0%
TGGCGTCACCGGAATGTCAC+CGG - Chr7:61366198-61366217 None:intergenic 60.0%
TGTTAGAAGGGCGAGGCCGT+CGG - Chr7:61365727-61365746 None:intergenic 60.0%
! GGTTCAGCGTCGAGTGAACC+AGG + Chr7:61366518-61366537 MsG0780039286.01.T01:CDS 60.0%
! TCCCTCGACCGGCGGTTTTA+TGG + Chr7:61369479-61369498 MsG0780039286.01.T01:CDS 60.0%
!! AGAGGGTAATGGGAGAGGGG+AGG + Chr7:61366847-61366866 MsG0780039286.01.T01:CDS 60.0%
!! CCCTCGACCGGCGGTTTTAT+GGG + Chr7:61369480-61369499 MsG0780039286.01.T01:CDS 60.0%
!! GAGGGTAATGGGAGAGGGGA+GGG + Chr7:61366848-61366867 MsG0780039286.01.T01:CDS 60.0%
!! GGTATCGGTCTCGCCGGAAA+AGG + Chr7:61365879-61365898 MsG0780039286.01.T01:CDS 60.0%
!! TCGACCGGCGGTTTTATGGG+TGG + Chr7:61369483-61369502 MsG0780039286.01.T01:CDS 60.0%
!! TTTTGGGTGGGTCTGCAGCC+TGG - Chr7:61369579-61369598 None:intergenic 60.0%
CGGACCAGTGACAGGGTGTG+AGG - Chr7:61365812-61365831 None:intergenic 65.0%
CTCGCCGGAAAAGGTCTCCG+TGG + Chr7:61365888-61365907 MsG0780039286.01.T01:CDS 65.0%
GAGCCTGACTCCCGTGTCGT+CGG + Chr7:61365858-61365877 MsG0780039286.01.T01:CDS 65.0%
GCCGGTCGAGGGATTGTTGC+CGG - Chr7:61369472-61369491 None:intergenic 65.0%
GGCAACAATCCCTCGACCGG+CGG + Chr7:61369471-61369490 MsG0780039286.01.T01:CDS 65.0%
GGTTACACACCGACGGGGAG+AGG - Chr7:61366061-61366080 None:intergenic 65.0%
GTCAGGCTCCCCGGAGATGT+TGG - Chr7:61365847-61365866 None:intergenic 65.0%
!! GTCGTCGGTATCGGTCTCGC+CGG + Chr7:61365873-61365892 MsG0780039286.01.T01:CDS 65.0%
CACCGACGGGGAGAGGCTAC+CGG - Chr7:61366054-61366073 None:intergenic 70.0%
CTCCGGTAGCCTCTCCCCGT+CGG + Chr7:61366049-61366068 MsG0780039286.01.T01:CDS 70.0%
GACACGGGAGTCAGGCTCCC+CGG - Chr7:61365856-61365875 None:intergenic 70.0%
TAGAAGGGCGAGGCCGTCGG+AGG - Chr7:61365724-61365743 None:intergenic 70.0%
!! TGCGGTGTCGCTGCCGTCGA+CGG - Chr7:61365760-61365779 None:intergenic 70.0%
!! GGTGTCGCTGCCGTCGACGG+CGG - Chr7:61365757-61365776 None:intergenic 75.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 61365669 61370325 61365669 ID=MsG0780039286.01;Name=MsG0780039286.01
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Chr7 exon 61369265 61370325 61369265 ID=MsG0780039286.01.T01:exon:16385;Parent=MsG0780039286.01.T01
Chr7 exon 61365669 61367196 61365669 ID=MsG0780039286.01.T01:exon:16384;Parent=MsG0780039286.01.T01
Chr7 CDS 61365669 61367196 61365669 ID=MsG0780039286.01.T01:cds;Parent=MsG0780039286.01.T01
Chr7 CDS 61369265 61369893 61369265 ID=MsG0780039286.01.T01:cds;Parent=MsG0780039286.01.T01
Chr7 three_prime_UTR 61369894 61370325 61369894 ID=MsG0780039286.01.T01:three_prime_utr;Parent=MsG0780039286.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780039286.01.T01

ATGCTAATCAGAATCTTTTTCTTTTTCTTTTTTCATCCCGTCGTTTCTCTCTCCTCCGACGGCCTCGCCCTTCTAACACTCAAATCCGCCGTCGACGGCAGCGACACCGCAACCACATTCTCCGACTGGAACGAAAACGACCTCACACCCTGTCACTGGTCCGGCATTAGCTGCTCCAACATCTCCGGGGAGCCTGACTCCCGTGTCGTCGGTATCGGTCTCGCCGGAAAAGGTCTCCGTGGTTATCTCCCGTCGGAGCTCGGAAACCTCATCTACCTCCGTCGTCTTAGTCTCCATACAAACCTCTTCCATGGCTCCATTCCCGTTCAGCTCTTCAATGCTACTTCCCTTCACAGTATCTTCCTCCATGGGAACAATCTCTCCGGTAGCCTCTCCCCGTCGGTGTGTAACCTTCCTCGTCTTCAAAACCTTGACCTCTCTGATAATTCACTCGCCGGAGATATTTCTGAGTCTATCGGAAACTGTTCGCAGCTCCAGAGACTGATTCTCGCGAGGAATAATTTCTCCGGTGACATTCCGGTGACGCCATGGAAGAAGCTGAAGAATCTCGTTCAGCTAGACTTATCAGCAAATGTTCTAGAAGGTTCAATTCCGGAACAAATCGGTGAGTTAAACTCACTCACCGGAACGCTAAACCTTTCGTTTAATCATTTATCCGGTAAAGTTCCGAAGTCTCTAGGAAAATTGCCGGTGACGGTTAGTTTTGATCTTCGGAGTAATGATCTGAGCGGTGAAATTCCTCAAACCGGGTCATTTTCGAATCAAGGACCGACGGCGTTTCTGAACAATCCAAAACTATGTGGGTTTCCTCTGCAGAAAGATTGTACCGGTTCAGCGTCGAGTGAACCAGGAGCTAGTCCTGGTTCTACTCGACAACGCGTGAACCGGTCTAAGAAAGGTTTGAGTCCTGGTTTGATTATTATTATAACAGTAGCTGATGCTGCTGCAGTGGCATTGATTGGTCTTGTAGTGGTGTATGTGTATTGGAAGAAAAAAGATAAGAATAATGGTTGTAGTTGTACTTTGAAGAGAAAATTTGGTGGTAATGGTAGTAACAATGAAAGATCGAATTCGTGTTGTTTGTGTTGGACTTTAGGTTGTGTAAAAGGGTTTAAGAGTGATGATTCTGAGATGGAAGAGAGTGAGAAAGGAGTGAGAGAGGGTAATGGGAGAGGGGAGGGTGAAGGAGAAGGTGAATTGGTGGCAATTGATAAAGGTTTTAGCTTTGAACTTGATGAATTGTTAAGAGCTTCTGCATATGTGTTAGGGAAAAGTGGGTTAGGGATTGTGTATAAGGTAGTGCTTGGGAATGGTGTGCCTGTGGCTGTTAGGAGATTAGGGGAAGGTGGTGAACAAAGGTATAAGGAGTTTGCTACTGAAGTTCAAGCAATTGGGAAAGTGAAACATCCTAATATTGTTAAGTTAAGAGCTTATTATTGGGCTCATGATGAAAAGCTTTTGATTAGTGATTTTGTTTCTAATGGCAATTTGGCTAATGCTCTTAGAGGAAGAAATGGCCAACCATCTCCAAATCTTTCATGGTCAATCAGGCTGAGAATAGCCAAAGGAACAGCCAGAGGTTTAGCATATCTCCATGAATGCAGTCCAAGAAAATTTGTTCACGGCGACCTCAAACCCTCCAATATCCTCCTCGACACAGACTTCCAACCCCTCATTTCTGATTTTGGTCTTAACCGGCTAATAAGCATCACCGGCAACAATCCCTCGACCGGCGGTTTTATGGGTGGTGCTCTTCCTTACATGAAGTCGTCACAAACAGAACGAACCAACAACTATAAAGCTCCTGAAGCCAAAGTACCAGGCTGCAGACCCACCCAAAAATGGGATGTATATTCATTTGGAGTTGTTTTACTTGAATTGCTAACTGGTAAGTCCCCAGATTCTTCTCCAGGAGCATCGACTTCTGTCGAAGTACCTGACTTGGTAAGGTGGGTAAAGAAAGGGTTTGAACAAGAAAGCCCTTTATCTGAAATGGTTGATCCATCACTTCTTCAAGAAATTCATGCCAAGAAAGAAGTACTAGCTGTGTTTCATGTAGCGCTGTCATGCACTGAGGGCAACCCTGAAGTCAGGCCTAGAATGAAAACTGTGTCTGACAATCTTGAAAGAATTTGA
Protein sequence

>MsG0780039286.01.T01

MLIRIFFFFFFHPVVSLSSDGLALLTLKSAVDGSDTATTFSDWNENDLTPCHWSGISCSNISGEPDSRVVGIGLAGKGLRGYLPSELGNLIYLRRLSLHTNLFHGSIPVQLFNATSLHSIFLHGNNLSGSLSPSVCNLPRLQNLDLSDNSLAGDISESIGNCSQLQRLILARNNFSGDIPVTPWKKLKNLVQLDLSANVLEGSIPEQIGELNSLTGTLNLSFNHLSGKVPKSLGKLPVTVSFDLRSNDLSGEIPQTGSFSNQGPTAFLNNPKLCGFPLQKDCTGSASSEPGASPGSTRQRVNRSKKGLSPGLIIIITVADAAAVALIGLVVVYVYWKKKDKNNGCSCTLKRKFGGNGSNNERSNSCCLCWTLGCVKGFKSDDSEMEESEKGVREGNGRGEGEGEGELVAIDKGFSFELDELLRASAYVLGKSGLGIVYKVVLGNGVPVAVRRLGEGGEQRYKEFATEVQAIGKVKHPNIVKLRAYYWAHDEKLLISDFVSNGNLANALRGRNGQPSPNLSWSIRLRIAKGTARGLAYLHECSPRKFVHGDLKPSNILLDTDFQPLISDFGLNRLISITGNNPSTGGFMGGALPYMKSSQTERTNNYKAPEAKVPGCRPTQKWDVYSFGVVLLELLTGKSPDSSPGASTSVEVPDLVRWVKKGFEQESPLSEMVDPSLLQEIHAKKEVLAVFHVALSCTEGNPEVRPRMKTVSDNLERI*