AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780039580.01

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MsG0780039580.01.T01 AT2G19230 38.542 288 165 4 83 369 563 839 1.52e-56 201
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MsG0780039580.01.T01 AT5G15730 35.435 333 192 8 56 386 81 392 2.47e-56 192
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MsG0780039580.01.T01 AT1G51890 38.217 314 157 6 79 368 560 860 2.74e-56 200
MsG0780039580.01.T01 AT1G18390 36.389 360 208 9 37 389 292 637 2.97e-56 197
MsG0780039580.01.T01 AT4G02410 37.631 287 171 3 83 368 347 626 3.02e-56 197
MsG0780039580.01.T01 AT5G49660 41.639 305 153 8 75 368 643 933 3.28e-56 200
MsG0780039580.01.T01 AT1G51910 38.602 329 172 10 79 393 563 875 3.36e-56 199
MsG0780039580.01.T01 AT3G05140 36.770 291 171 5 79 368 131 409 3.57e-56 192
MsG0780039580.01.T01 AT4G03230 36.778 329 188 6 45 368 491 804 3.79e-56 199
MsG0780039580.01.T01 AT1G18390 36.389 360 208 9 37 389 286 631 4.05e-56 196
MsG0780039580.01.T01 AT1G79680 39.867 301 169 6 78 375 420 711 4.15e-56 198
MsG0780039580.01.T01 AT5G59650 41.045 268 153 4 123 388 604 868 4.23e-56 199
MsG0780039580.01.T01 AT4G03230 36.778 329 188 6 45 368 483 796 4.39e-56 199
MsG0780039580.01.T01 AT5G59650 41.045 268 153 4 123 388 612 876 4.50e-56 199
MsG0780039580.01.T01 AT3G25490 38.580 324 178 7 79 391 96 409 4.54e-56 191
MsG0780039580.01.T01 AT1G16130 38.591 298 172 6 79 374 404 692 4.67e-56 198
MsG0780039580.01.T01 AT1G21240 40.203 296 166 5 79 372 403 689 4.82e-56 197
MsG0780039580.01.T01 AT5G57670 35.374 294 178 5 76 368 252 534 5.34e-56 195
MsG0780039580.01.T01 AT5G66790 37.987 308 176 6 79 379 302 601 5.63e-56 196
MsG0780039580.01.T01 AT1G66880 40.584 308 160 10 73 372 951 1243 5.81e-56 200
MsG0780039580.01.T01 AT3G05140 36.770 291 171 5 79 368 179 457 6.15e-56 193
MsG0780039580.01.T01 AT4G03230 36.778 329 188 6 45 368 548 861 6.34e-56 199
MsG0780039580.01.T01 AT4G03230 36.778 329 188 6 45 368 548 861 6.34e-56 199
MsG0780039580.01.T01 AT1G29730 44.770 239 119 6 78 312 627 856 7.26e-56 199
MsG0780039580.01.T01 AT2G19190 38.435 294 168 5 79 371 564 845 7.39e-56 199
MsG0780039580.01.T01 AT4G23190 34.513 339 187 7 37 368 314 624 8.24e-56 196
MsG0780039580.01.T01 AT1G66460 37.377 305 174 6 76 369 114 412 8.75e-56 192
MsG0780039580.01.T01 AT2G13800 39.057 297 166 7 79 369 263 550 8.77e-56 194
MsG0780039580.01.T01 AT2G13800 39.057 297 166 7 79 369 263 550 8.77e-56 194
MsG0780039580.01.T01 AT4G03230 36.778 329 188 6 45 368 576 889 8.85e-56 199
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MsG0780039580.01.T01 AT1G31420 40.433 277 154 7 94 369 309 575 9.57e-56 194
MsG0780039580.01.T01 AT4G03230 36.778 329 188 6 45 368 490 803 1.04e-55 198
MsG0780039580.01.T01 AT1G69730 38.462 299 172 6 77 372 433 722 1.14e-55 197
MsG0780039580.01.T01 AT4G23270 35.621 306 188 3 65 368 300 598 1.16e-55 195
MsG0780039580.01.T01 AT4G23270 35.621 306 188 3 65 368 300 598 1.16e-55 195
MsG0780039580.01.T01 AT3G13065 38.462 299 169 5 76 371 400 686 1.17e-55 196
MsG0780039580.01.T01 AT1G66460 37.377 305 174 6 76 369 141 439 1.18e-55 192
MsG0780039580.01.T01 AT4G23270 35.621 306 188 3 65 368 300 598 1.20e-55 195
MsG0780039580.01.T01 AT4G30520 38.776 294 168 7 78 369 290 573 1.21e-55 195
MsG0780039580.01.T01 AT4G03230 36.778 329 188 6 45 368 648 961 1.27e-55 199
MsG0780039580.01.T01 AT4G03230 36.778 329 188 6 45 368 648 961 1.27e-55 199
MsG0780039580.01.T01 AT4G00970 37.248 298 163 9 83 368 333 618 1.36e-55 195
MsG0780039580.01.T01 AT5G49760 41.270 252 138 4 123 369 656 902 1.46e-55 198
MsG0780039580.01.T01 AT4G00960 38.129 278 157 7 97 368 62 330 1.54e-55 189
MsG0780039580.01.T01 AT5G35370 37.942 311 162 8 79 369 505 804 1.55e-55 197
MsG0780039580.01.T01 AT5G15730 35.030 334 194 8 56 386 81 394 1.56e-55 190
MsG0780039580.01.T01 AT5G15730 35.030 334 194 8 56 386 81 394 1.56e-55 190
MsG0780039580.01.T01 AT1G17910 39.130 299 170 7 79 374 442 731 2.00e-55 196
MsG0780039580.01.T01 AT4G23240 37.162 296 173 7 77 368 14 300 2.09e-55 187

Find 141 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 242 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ACAGCCAAGCTTTCTGATTT+TGG 0.093716 7:-66184286 MsG0780039580.01.T01:CDS
GCACCACCTGGTGAGCAATT+TGG 0.177316 7:+66183139 None:intergenic
TTTCGTGCTGATTATATTCT+TGG 0.178780 7:-66185505 MsG0780039580.01.T01:CDS
CATAATTCAGTCAATCTAAA+TGG 0.209686 7:+66182745 None:intergenic
TAGCTTCGGGGTTGTTCTTT+TGG 0.221261 7:-66183560 MsG0780039580.01.T01:CDS
CACCACCTGGTGAGCAATTT+GGG 0.230765 7:+66183140 None:intergenic
ATCGCTTCCCGTTGCGGTTA+AGG 0.240679 7:-66185419 MsG0780039580.01.T01:CDS
ATTCTTGTAGCCCATGTTAA+AGG 0.256126 7:+66184510 None:intergenic
GTTTGGTATTCTGTTAATTT+TGG 0.257055 7:-66182940 MsG0780039580.01.T01:three_prime_UTR
TTACTGGCCTTTCAGCATTA+TGG 0.261919 7:+66184448 None:intergenic
CTCATTAGCGGCCTTGCTTT+GGG 0.295579 7:+66183343 None:intergenic
ACTCATTAGCGGCCTTGCTT+TGG 0.303381 7:+66183342 None:intergenic
ATACCAGTCATTACATATTC+TGG 0.320288 7:+66184187 None:intergenic
GTTTATGTTTCGAGGAAGTT+TGG 0.321256 7:-66185182 MsG0780039580.01.T01:CDS
AAACTGTACAAAACTCAAAA+AGG 0.323032 7:+66182676 None:intergenic
GCTTTGTAAATGATATATTA+TGG 0.338682 7:-66182999 MsG0780039580.01.T01:three_prime_UTR
CTGGAAAAGAAAGAAGAAAA+AGG 0.342394 7:-66186048 MsG0780039580.01.T01:five_prime_UTR
TGGTGGAATCAGAACTAATA+TGG 0.343765 7:-66182875 MsG0780039580.01.T01:three_prime_UTR
GGGTTTGGTACTGTTTATAA+AGG 0.346693 7:-66185475 MsG0780039580.01.T01:CDS
CCTGGTGAGCAATTTGGGTT+TGG 0.361214 7:+66183145 None:intergenic
CCGAATCTTGTGAAGTTGAT+TGG 0.363065 7:-66185244 MsG0780039580.01.T01:CDS
TCCTCCTCCTCTTGAATGAA+TGG 0.366561 7:-66185913 MsG0780039580.01.T01:exon
TCCTCTCGCCGGTGCCGGAA+AGG 0.374839 7:+66185686 None:intergenic
CCATGACTCGGGTGGATACA+TGG 0.383988 7:+66184230 None:intergenic
AGGAACAAAGCTTGGTAGAT+TGG 0.386135 7:-66183492 MsG0780039580.01.T01:CDS
ATTCTTGGTGAAGGAGGGTT+TGG 0.386135 7:-66185490 MsG0780039580.01.T01:CDS
GCATAAGCCTGCAAGTCTAT+TGG 0.387652 7:-66182837 MsG0780039580.01.T01:three_prime_UTR
GCTTTGTTCCTTACCCGGTC+TGG 0.390818 7:+66183504 None:intergenic
GCAGACGAAGTCTCATTATC+AGG 0.393458 7:-66183274 MsG0780039580.01.T01:CDS
AGAAACCAAACCTCCCTTTC+CGG 0.393499 7:-66185700 MsG0780039580.01.T01:CDS
GTGGTGCGCCTGCAGCATTA+CGG 0.399495 7:-66183123 MsG0780039580.01.T01:CDS
TTGAAGTCACGATAGATTAC+TGG 0.403142 7:+66184432 None:intergenic
ATACATCACTCCTAGCTGTT+AGG 0.410862 7:+66183584 None:intergenic
TTGAATAAAGAAGGTCTTCA+AGG 0.412245 7:-66185394 MsG0780039580.01.T01:CDS
ACAAATAATCGATCCAAGAT+TGG 0.414256 7:-66183434 MsG0780039580.01.T01:CDS
ACCAACACTAGAACTTTGTA+AGG 0.416456 7:+66183297 None:intergenic
TTCAAAACCTTAACCGCAAC+GGG 0.419283 7:+66185412 None:intergenic
AGGAGGAGGAGTGGTTGAAG+TGG 0.420597 7:+66185959 None:intergenic
CCAATCAACTTCACAAGATT+CGG 0.421504 7:+66185244 None:intergenic
CCTCTCGCCGGTGCCGGAAA+GGG 0.422726 7:+66185687 None:intergenic
AGGAGTGATGTATATAGCTT+CGG 0.424056 7:-66183574 MsG0780039580.01.T01:CDS
GGAGTGATGTATATAGCTTC+GGG 0.424945 7:-66183573 MsG0780039580.01.T01:CDS
CGGTGCCGGAAAGGGAGGTT+TGG 0.426382 7:+66185695 None:intergenic
AGGAGGAGTGGTTGAAGTGG+AGG 0.427001 7:+66185962 None:intergenic
GGAACAAAGCTTGGTAGATT+GGG 0.433031 7:-66183491 MsG0780039580.01.T01:CDS
GGAGGAGTGGTTGAAGTGGA+GGG 0.434253 7:+66185963 None:intergenic
CAAGACGTCTAATATATTGT+TGG 0.437244 7:-66184412 MsG0780039580.01.T01:CDS
TACCAGTCATTACATATTCT+GGG 0.437954 7:+66184188 None:intergenic
TGGTGCGCCTGCAGCATTAC+GGG 0.438333 7:-66183122 MsG0780039580.01.T01:CDS
ATCTTGGATCGATTATTTGT+AGG 0.446767 7:+66183437 None:intergenic
TTTCGCTTATCATTGAGCTT+TGG 0.461031 7:+66183463 None:intergenic
TCATTATCAGGATCAAATAG+TGG 0.470729 7:-66183262 MsG0780039580.01.T01:CDS
CCAAACCCAAATTGCTCACC+AGG 0.471531 7:-66183145 MsG0780039580.01.T01:CDS
CTAATATGGTTCCACACAAA+AGG 0.471930 7:-66182861 MsG0780039580.01.T01:three_prime_UTR
GTTTATGAGTTTATGTTTCG+AGG 0.472121 7:-66185190 MsG0780039580.01.T01:CDS
TGACAAAACCAGACCGGGTA+AGG 0.472841 7:-66183512 MsG0780039580.01.T01:CDS
ATGGAGAAAAGCAAGTCCTT+TGG 0.475652 7:+66184467 None:intergenic
CCTCCTCCTCTTGAATGAAT+GGG 0.476865 7:-66185912 MsG0780039580.01.T01:exon
TGAAACGACGTCGGAGGAGG+AGG 0.478055 7:+66185945 None:intergenic
GCTTAGATCTGATGCAGAAT+CGG 0.478386 7:+66185636 None:intergenic
ACTTAAATCGCTTCCCGTTG+CGG 0.480964 7:-66185425 MsG0780039580.01.T01:CDS
CCATGTATCCACCCGAGTCA+TGG 0.482809 7:-66184230 MsG0780039580.01.T01:CDS
ATAATTCAGTCAATCTAAAT+GGG 0.485797 7:+66182746 None:intergenic
CATTCAAGAGGAGGAGGAGG+AGG 0.485943 7:+66185918 None:intergenic
GGAGGTTTGGTTTCTAGCTC+CGG 0.486867 7:+66185708 None:intergenic
TCATGCTATGAATCTCCATC+TGG 0.488228 7:-66183086 MsG0780039580.01.T01:three_prime_UTR
TTGGTCCAGGTGCAACTTGT+CGG 0.488313 7:-66183171 MsG0780039580.01.T01:CDS
CATCTGACCCGTAATGCTGC+AGG 0.497923 7:+66183115 None:intergenic
CAAACCTCCCTTTCCGGCAC+CGG 0.505234 7:-66185694 MsG0780039580.01.T01:CDS
TTGAAAACTTGTGACGCATT+CGG 0.507062 7:+66183200 None:intergenic
AGCACAGAAAGCATGTAGTC+TGG 0.507315 7:-66183389 MsG0780039580.01.T01:CDS
CAACCCAAAATCAGAAAGCT+TGG 0.513212 7:+66184282 None:intergenic
CCCATTCATTCAAGAGGAGG+AGG 0.514588 7:+66185912 None:intergenic
TTTCTGTGTAGTTGTAATCA+TGG 0.517084 7:-66182895 MsG0780039580.01.T01:three_prime_UTR
CCCTTACAAAGTTCTAGTGT+TGG 0.524224 7:-66183298 MsG0780039580.01.T01:CDS
AATGCTGCAGGCGCACCACC+TGG 0.525262 7:+66183127 None:intergenic
ATTGATGAGAATGTTAGAGT+TGG 0.526160 7:-66185448 MsG0780039580.01.T01:CDS
GGATGAAACGACGTCGGAGG+AGG 0.526878 7:+66185942 None:intergenic
AGGCAACTGTTCCTTTAACA+TGG 0.527785 7:-66184521 MsG0780039580.01.T01:CDS
AGTGGAGGGGATGATGTTGT+TGG 0.528266 7:+66185977 None:intergenic
ACCAAGCTTTGTTCCTTACC+CGG 0.530364 7:+66183499 None:intergenic
AACCGTATGTACCCATGACT+CGG 0.531156 7:+66184218 None:intergenic
ACCGGGTAAGGAACAAAGCT+TGG 0.534067 7:-66183500 MsG0780039580.01.T01:CDS
GCTGATTATATTCTTGGTGA+AGG 0.534167 7:-66185499 MsG0780039580.01.T01:CDS
CATGTATCCACCCGAGTCAT+GGG 0.536773 7:-66184229 MsG0780039580.01.T01:CDS
GGCAACTGTTCCTTTAACAT+GGG 0.542068 7:-66184520 MsG0780039580.01.T01:CDS
CTCGCCGGTGCCGGAAAGGG+AGG 0.545588 7:+66185690 None:intergenic
ATTATATTCTTGGTGAAGGA+GGG 0.553550 7:-66185495 MsG0780039580.01.T01:CDS
TTTACAAAGCAACAACTACA+AGG 0.555365 7:+66183012 None:intergenic
TTGGCTAAAGCAGGGCCTCA+AGG 0.555724 7:-66184262 MsG0780039580.01.T01:CDS
AGATCTGAGACCTTGAGCAT+TGG 0.557224 7:+66185854 None:intergenic
ATTCATTCAAGAGGAGGAGG+AGG 0.560203 7:+66185915 None:intergenic
GTCCGTTGACAAAACCAGAC+CGG 0.561175 7:-66183518 MsG0780039580.01.T01:CDS
ATTCAAAACCTTAACCGCAA+CGG 0.563141 7:+66185411 None:intergenic
TGGTTTCTAGCTCCGGTAGG+TGG 0.565266 7:+66185715 None:intergenic
ATTGCACTTGGTGCTGCCAA+AGG 0.566421 7:-66184483 MsG0780039580.01.T01:CDS
GTTTGGTTTCTAGCTCCGGT+AGG 0.567335 7:+66185712 None:intergenic
CCCTTTCCGGCACCGGCGAG+AGG 0.569578 7:-66185687 MsG0780039580.01.T01:CDS
TTAAAACAAGACAAGAGTAC+AGG 0.570211 7:+66182779 None:intergenic
GATTATATTCTTGGTGAAGG+AGG 0.571545 7:-66185496 MsG0780039580.01.T01:CDS
GGAGACCGACAAGTTGCACC+TGG 0.572499 7:+66183166 None:intergenic
ACAGTTCAGCATCCACCTAC+CGG 0.574546 7:-66185727 MsG0780039580.01.T01:intron
CGACGTCGGAGGAGGAGGAG+TGG 0.577365 7:+66185950 None:intergenic
ACCCGAGTCATGGGTACATA+CGG 0.578252 7:-66184220 MsG0780039580.01.T01:CDS
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TTGTTCGCGTTGTTCCACCG+CGG 0.758241 7:+66185598 None:intergenic

CRISPR-GE

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!! TCAAATTTATTAATATGCAT+TGG + Chr7:66184682-66184701 None:intergenic 15.0%
!! TGATTTGAAAATTAAATTTG+AGG + Chr7:66184891-66184910 None:intergenic 15.0%
!!! TTTTAGCATGATAAATTTTA+AGG - Chr7:66183916-66183935 MsG0780039580.01.T01:intron 15.0%
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!! AAAACAAATTGCAAGATTAA+AGG + Chr7:66184827-66184846 None:intergenic 20.0%
!! ATAATTCAGTCAATCTAAAT+GGG + Chr7:66185989-66186008 None:intergenic 20.0%
!! GCTTTGTAAATGATATATTA+TGG - Chr7:66185733-66185752 MsG0780039580.01.T01:intron 20.0%
!! TTGTAAATGATATATTATGG+TGG - Chr7:66185736-66185755 MsG0780039580.01.T01:intron 20.0%
!! TTTGAATTTGAATTTGATGA+TGG + Chr7:66182911-66182930 None:intergenic 20.0%
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!!! AAATTTGGCATATTTGAAAT+TGG - Chr7:66185117-66185136 MsG0780039580.01.T01:intron 20.0%
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! ACAATACATTTCAATTGGAT+TGG + Chr7:66183874-66183893 None:intergenic 25.0%
! CAATTGAAATGTATTGTAAC+TGG - Chr7:66183877-66183896 MsG0780039580.01.T01:intron 25.0%
! CAGTTACAATACATTTCAAT+TGG + Chr7:66183879-66183898 None:intergenic 25.0%
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! TGATACAAAAATCATCAACT+AGG + Chr7:66185770-66185789 None:intergenic 25.0%
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! TTGTTAGGAATTGAATTGAA+TGG - Chr7:66183635-66183654 MsG0780039580.01.T01:intron 25.0%
! TTTAGCACAAAACATATACT+AGG + Chr7:66184935-66184954 None:intergenic 25.0%
!! GAGATTTTATTCATAGCAAA+AGG + Chr7:66185506-66185525 None:intergenic 25.0%
!! GTTTGGTATTCTGTTAATTT+TGG - Chr7:66185792-66185811 MsG0780039580.01.T01:intron 25.0%
!! TTTCTGGTATATTGAAGTTT+AGG - Chr7:66184353-66184372 MsG0780039580.01.T01:intron 25.0%
!!! GAATATTGATTTTCCAATCT+TGG + Chr7:66185314-66185333 None:intergenic 25.0%
!!! GTTAAGGTTTTGAATAAAGA+AGG - Chr7:66183329-66183348 MsG0780039580.01.T01:CDS 25.0%
!!! TGCATATGTTTTAGTATGAA+TGG - Chr7:66185084-66185103 MsG0780039580.01.T01:intron 25.0%
!!! TTTTTGATTGTTAGGTAACT+GGG - Chr7:66185920-66185939 MsG0780039580.01.T01:five_prime_UTR 25.0%
!!! TTTTTTGATTGTTAGGTAAC+TGG - Chr7:66185919-66185938 MsG0780039580.01.T01:five_prime_UTR 25.0%
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AAGGACTGGAAACAAAAAAT+GGG + Chr7:66184808-66184827 None:intergenic 30.0%
AATGAATAAGACCAACTTCA+TGG + Chr7:66184637-66184656 None:intergenic 30.0%
AATGGATGCACATCTAAATT+TGG - Chr7:66185102-66185121 MsG0780039580.01.T01:intron 30.0%
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ATTATATTCTTGGTGAAGGA+GGG - Chr7:66183237-66183256 MsG0780039580.01.T01:CDS 30.0%
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CAATTTATAGCATGTTTGAC+CGG + Chr7:66184012-66184031 None:intergenic 30.0%
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CTGGAAAAGAAAGAAGAAAA+AGG - Chr7:66182684-66182703 MsG0780039580.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
GGAAAATCAATATTCAGTGA+GGG - Chr7:66185319-66185338 MsG0780039580.01.T01:intron 30.0%
GTCGGATAACATAGTTATTA+TGG - Chr7:66185036-66185055 MsG0780039580.01.T01:intron 30.0%
GTTTATGAGTTTATGTTTCG+AGG - Chr7:66183542-66183561 MsG0780039580.01.T01:CDS 30.0%
TAATTCCTTCCTATATTACG+TGG - Chr7:66184704-66184723 MsG0780039580.01.T01:intron 30.0%
TACCAGTCATTACATATTCT+GGG + Chr7:66184547-66184566 None:intergenic 30.0%
TCATTATCAGGATCAAATAG+TGG - Chr7:66185470-66185489 MsG0780039580.01.T01:CDS 30.0%
TGGAAAATCAATATTCAGTG+AGG - Chr7:66185318-66185337 MsG0780039580.01.T01:intron 30.0%
TTACAAAGCAACAACTACAA+GGG + Chr7:66185722-66185741 None:intergenic 30.0%
TTGAATAAAGAAGGTCTTCA+AGG - Chr7:66183338-66183357 MsG0780039580.01.T01:CDS 30.0%
TTTACAAAGCAACAACTACA+AGG + Chr7:66185723-66185742 None:intergenic 30.0%
TTTCTGTGTAGTTGTAATCA+TGG - Chr7:66185837-66185856 MsG0780039580.01.T01:intron 30.0%
! GAATGTTTCTATCTCTTTAC+AGG - Chr7:66184777-66184796 MsG0780039580.01.T01:intron 30.0%
! GGAATTGAATTGAATGGATT+TGG - Chr7:66183641-66183660 MsG0780039580.01.T01:intron 30.0%
! TGGTATTCTGTTAATTTTGG+TGG - Chr7:66185795-66185814 MsG0780039580.01.T01:intron 30.0%
! TTAAAACAAGACAAGAGTAC+AGG + Chr7:66185956-66185975 None:intergenic 30.0%
!! AAGTTGGTCTTATTCATTGT+GGG - Chr7:66184639-66184658 MsG0780039580.01.T01:intron 30.0%
!! AGTATTTGCTGTTAAAAACG+TGG - Chr7:66185690-66185709 MsG0780039580.01.T01:CDS 30.0%
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!! TTTCGTGCTGATTATATTCT+TGG - Chr7:66183227-66183246 MsG0780039580.01.T01:CDS 30.0%
!!! TGCTTTTTTCAAGTGTCTAT+CGG - Chr7:66186013-66186032 MsG0780039580.01.T01:five_prime_UTR 30.0%
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ACAAGAATGATGATTGCACT+TGG - Chr7:66184237-66184256 MsG0780039580.01.T01:CDS 35.0%
ACATAGTTTACAGTTCAAGC+TGG - Chr7:66184982-66185001 MsG0780039580.01.T01:intron 35.0%
ACATATACTAGGAAAGACCA+TGG + Chr7:66184924-66184943 None:intergenic 35.0%
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ACCAGTCATTACATATTCTG+GGG + Chr7:66184546-66184565 None:intergenic 35.0%
AGGAGTGATGTATATAGCTT+CGG - Chr7:66185158-66185177 MsG0780039580.01.T01:intron 35.0%
ATGTTATCCGACATGCTTAA+TGG + Chr7:66185028-66185047 None:intergenic 35.0%
ATTCAAAACCTTAACCGCAA+CGG + Chr7:66183324-66183343 None:intergenic 35.0%
ATTCTTGTAGCCCATGTTAA+AGG + Chr7:66184225-66184244 None:intergenic 35.0%
CAAATCAATTTCCTGTTCCA+TGG - Chr7:66184904-66184923 MsG0780039580.01.T01:intron 35.0%
CATAGTTATTATGGCTCTCA+TGG - Chr7:66185045-66185064 MsG0780039580.01.T01:intron 35.0%
CATTGATATGAACTTTCCTG+AGG - Chr7:66184181-66184200 MsG0780039580.01.T01:intron 35.0%
CCAACACTAGAACTTTGTAA+GGG + Chr7:66185437-66185456 None:intergenic 35.0%
CCAATCAACTTCACAAGATT+CGG + Chr7:66183491-66183510 None:intergenic 35.0%
CTAATATGGTTCCACACAAA+AGG - Chr7:66185871-66185890 MsG0780039580.01.T01:CDS 35.0%
GATTATATTCTTGGTGAAGG+AGG - Chr7:66183236-66183255 MsG0780039580.01.T01:CDS 35.0%
GCTGATTATATTCTTGGTGA+AGG - Chr7:66183233-66183252 MsG0780039580.01.T01:CDS 35.0%
GTTTATGTTTCGAGGAAGTT+TGG - Chr7:66183550-66183569 MsG0780039580.01.T01:CDS 35.0%
TAGCAAGAATTTCTCCTAAG+TGG - Chr7:66183960-66183979 MsG0780039580.01.T01:intron 35.0%
TATATTAGCACTGCAGTGTA+GGG - Chr7:66183753-66183772 MsG0780039580.01.T01:intron 35.0%
TGGTGGAATCAGAACTAATA+TGG - Chr7:66185857-66185876 MsG0780039580.01.T01:intron 35.0%
TGTTATCCGACATGCTTAAT+GGG + Chr7:66185027-66185046 None:intergenic 35.0%
TGTTCCAAACATGCTCAATT+TGG - Chr7:66184576-66184595 MsG0780039580.01.T01:intron 35.0%
TTGAAAACTTGTGACGCATT+CGG + Chr7:66185535-66185554 None:intergenic 35.0%
TTGAAGTCACGATAGATTAC+TGG + Chr7:66184303-66184322 None:intergenic 35.0%
TTTCGCTTATCATTGAGCTT+TGG + Chr7:66185272-66185291 None:intergenic 35.0%
! AATTTCTCCTAAGTGGCTTT+TGG - Chr7:66183967-66183986 MsG0780039580.01.T01:intron 35.0%
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! CACAAGTTTTCAAACAACGT+TGG - Chr7:66185542-66185561 MsG0780039580.01.T01:CDS 35.0%
! CTTTTCTCCATAATGCTGAA+AGG - Chr7:66184277-66184296 MsG0780039580.01.T01:CDS 35.0%
! GGGTTTGGTACTGTTTATAA+AGG - Chr7:66183257-66183276 MsG0780039580.01.T01:CDS 35.0%
! TAGACGGAAGTGAATTTTCT+TGG - Chr7:66183452-66183471 MsG0780039580.01.T01:CDS 35.0%
! TGAATTTTCTTGGGCAGTTA+AGG - Chr7:66183462-66183481 MsG0780039580.01.T01:CDS 35.0%
! TGGCATATTTGAAATTGGTC+AGG - Chr7:66185122-66185141 MsG0780039580.01.T01:intron 35.0%
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!!! GTTCTTTTGGAGCTTTTAAC+AGG - Chr7:66185185-66185204 MsG0780039580.01.T01:CDS 35.0%
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!!! TTTTGGAGCTTTTAACAGGA+AGG - Chr7:66185189-66185208 MsG0780039580.01.T01:CDS 35.0%
AAGTATGGGTACCATGAAGT+TGG - Chr7:66184623-66184642 MsG0780039580.01.T01:intron 40.0%
AGGAACAAAGCTTGGTAGAT+TGG - Chr7:66185240-66185259 MsG0780039580.01.T01:CDS 40.0%
AGGCAACTGTTCCTTTAACA+TGG - Chr7:66184211-66184230 MsG0780039580.01.T01:CDS 40.0%
ATACATCACTCCTAGCTGTT+AGG + Chr7:66185151-66185170 None:intergenic 40.0%
ATATTAGCACTGCAGTGTAG+GGG - Chr7:66183754-66183773 MsG0780039580.01.T01:intron 40.0%
ATGGAGAAAAGCAAGTCCTT+TGG + Chr7:66184268-66184287 None:intergenic 40.0%
CAACCCAAAATCAGAAAGCT+TGG + Chr7:66184453-66184472 None:intergenic 40.0%
CATGTACCCATTAAGCATGT+CGG - Chr7:66185018-66185037 MsG0780039580.01.T01:intron 40.0%
CTATATTAGCACTGCAGTGT+AGG - Chr7:66183752-66183771 MsG0780039580.01.T01:intron 40.0%
CTGTGTAGTTGTAATCATGG+TGG - Chr7:66185840-66185859 MsG0780039580.01.T01:intron 40.0%
GAGTGATGTATATAGCTTCG+GGG - Chr7:66185160-66185179 MsG0780039580.01.T01:intron 40.0%
GCTTAGATCTGATGCAGAAT+CGG + Chr7:66183099-66183118 None:intergenic 40.0%
GGAACAAAGCTTGGTAGATT+GGG - Chr7:66185241-66185260 MsG0780039580.01.T01:CDS 40.0%
GGAGTGATGTATATAGCTTC+GGG - Chr7:66185159-66185178 MsG0780039580.01.T01:intron 40.0%
GGCAACTGTTCCTTTAACAT+GGG - Chr7:66184212-66184231 MsG0780039580.01.T01:CDS 40.0%
GTCAGTTAGCCACGTAATAT+AGG + Chr7:66184716-66184735 None:intergenic 40.0%
GTTAGCCACGTAATATAGGA+AGG + Chr7:66184712-66184731 None:intergenic 40.0%
TCATGCTATGAATCTCCATC+TGG - Chr7:66185646-66185665 MsG0780039580.01.T01:CDS 40.0%
TCGACTACATCACTCATTAG+CGG + Chr7:66185404-66185423 None:intergenic 40.0%
TGAGTCAAAATCCCAAAGCA+AGG - Chr7:66185378-66185397 MsG0780039580.01.T01:CDS 40.0%
TGTTGGACTCTGTAAGTTTC+TGG - Chr7:66184337-66184356 MsG0780039580.01.T01:intron 40.0%
TTCAAAACCTTAACCGCAAC+GGG + Chr7:66183323-66183342 None:intergenic 40.0%
TTTATAGCATGTTTGACCGG+CGG + Chr7:66184009-66184028 None:intergenic 40.0%
! ACAGCCAAGCTTTCTGATTT+TGG - Chr7:66184446-66184465 MsG0780039580.01.T01:CDS 40.0%
! CAGCCAAGCTTTCTGATTTT+GGG - Chr7:66184447-66184466 MsG0780039580.01.T01:CDS 40.0%
! CCCTTACAAAGTTCTAGTGT+TGG - Chr7:66185434-66185453 MsG0780039580.01.T01:CDS 40.0%
! CCGAATCTTGTGAAGTTGAT+TGG - Chr7:66183488-66183507 MsG0780039580.01.T01:CDS 40.0%
! GTTGATTGGTTATTGCTGTG+AGG - Chr7:66183502-66183521 MsG0780039580.01.T01:CDS 40.0%
! TTTTCAAACAACGTTGGTCC+AGG - Chr7:66185548-66185567 MsG0780039580.01.T01:CDS 40.0%
!! CAAGCTTTCTGATTTTGGGT+TGG - Chr7:66184451-66184470 MsG0780039580.01.T01:CDS 40.0%
!! GATTGACAGCACTGATTCTT+AGG - Chr7:66183810-66183829 MsG0780039580.01.T01:intron 40.0%
!! TTACTGGCCTTTCAGCATTA+TGG + Chr7:66184287-66184306 None:intergenic 40.0%
!!! ATTTTGGGTTGGCTAAAGCA+GGG - Chr7:66184462-66184481 MsG0780039580.01.T01:CDS 40.0%
AACCGTATGTACCCATGACT+CGG + Chr7:66184517-66184536 None:intergenic 45.0%
AACTTTCCTGAGGTTTCCAG+AGG - Chr7:66184191-66184210 MsG0780039580.01.T01:CDS 45.0%
ACTAGGAAAGACCATGGAAC+AGG + Chr7:66184918-66184937 None:intergenic 45.0%
ACTTAAATCGCTTCCCGTTG+CGG - Chr7:66183307-66183326 MsG0780039580.01.T01:CDS 45.0%
AGAAACCAAACCTCCCTTTC+CGG - Chr7:66183032-66183051 MsG0780039580.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
AGTGCAACCAAAAGCCACTT+AGG + Chr7:66183977-66183996 None:intergenic 45.0%
ATTCATTCAAGAGGAGGAGG+AGG + Chr7:66182820-66182839 None:intergenic 45.0%
ATTCTTGGTGAAGGAGGGTT+TGG - Chr7:66183242-66183261 MsG0780039580.01.T01:CDS 45.0%
CAGTTGCCCATTCATTCAAG+AGG + Chr7:66182829-66182848 None:intergenic 45.0%
CCTCCTCCTCTTGAATGAAT+GGG - Chr7:66182820-66182839 MsG0780039580.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
CGAGTAGTGGTAAAATGCAG+TGG - Chr7:66183697-66183716 MsG0780039580.01.T01:intron 45.0%
CTTGAATGAATGGGCAACTG+CGG - Chr7:66182829-66182848 MsG0780039580.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
GCAGACGAAGTCTCATTATC+AGG - Chr7:66185458-66185477 MsG0780039580.01.T01:CDS 45.0%
GCATAAGCCTGCAAGTCTAT+TGG - Chr7:66185895-66185914 MsG0780039580.01.T01:CDS 45.0%
GCCCCAGAATATGTAATGAC+TGG - Chr7:66184542-66184561 MsG0780039580.01.T01:intron 45.0%
GTCTTCAAGGACATAGAGAG+TGG - Chr7:66183351-66183370 MsG0780039580.01.T01:CDS 45.0%
GTTAAAGGAACAGTTGCCTC+TGG + Chr7:66184210-66184229 None:intergenic 45.0%
TCCTCCTCCTCTTGAATGAA+TGG - Chr7:66182819-66182838 MsG0780039580.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
TGATGTTGTTGGTATGCACG+AGG + Chr7:66182747-66182766 None:intergenic 45.0%
TTGACAAGTAGCACACCAGA+TGG + Chr7:66185664-66185683 None:intergenic 45.0%
TTGCCCATTCATTCAAGAGG+AGG + Chr7:66182826-66182845 None:intergenic 45.0%
! AGATCTGAGACCTTGAGCAT+TGG + Chr7:66182881-66182900 None:intergenic 45.0%
! AGCACAGAAAGCATGTAGTC+TGG - Chr7:66185343-66185362 MsG0780039580.01.T01:intron 45.0%
! AGGCTTATGCACCTTTTGTG+TGG + Chr7:66185885-66185904 None:intergenic 45.0%
! CATTGTGGGTTGTGATCAGA+TGG - Chr7:66184653-66184672 MsG0780039580.01.T01:intron 45.0%
! GGATCAAATAGTGGGAGTAG+TGG - Chr7:66185479-66185498 MsG0780039580.01.T01:CDS 45.0%
! TAGCTTCGGGGTTGTTCTTT+TGG - Chr7:66185172-66185191 MsG0780039580.01.T01:CDS 45.0%
!! ACCAAGCTTTGTTCCTTACC+CGG + Chr7:66185236-66185255 None:intergenic 45.0%
!! ACCTTGAGCATTGGAAACGA+CGG + Chr7:66182872-66182891 None:intergenic 45.0%
!!! GATTTTGGGTTGGCTAAAGC+AGG - Chr7:66184461-66184480 MsG0780039580.01.T01:CDS 45.0%
!!! TCTGTTGCTTTTGGCTCTAC+AGG - Chr7:66184418-66184437 MsG0780039580.01.T01:CDS 45.0%
AACCCAAATTGCTCACCAGG+TGG - Chr7:66185590-66185609 MsG0780039580.01.T01:CDS 50.0%
ACAGTTCAGCATCCACCTAC+CGG - Chr7:66183005-66183024 MsG0780039580.01.T01:three_prime_UTR 50.0%
ACATGGGTTTCATCGCCTTG+AGG + Chr7:66184488-66184507 None:intergenic 50.0%
ACCCGAGTCATGGGTACATA+CGG - Chr7:66184512-66184531 MsG0780039580.01.T01:CDS 50.0%
ACCGGGTAAGGAACAAAGCT+TGG - Chr7:66185232-66185251 MsG0780039580.01.T01:CDS 50.0%
ACCGTATGTACCCATGACTC+GGG + Chr7:66184516-66184535 None:intergenic 50.0%
ACTCATTAGCGGCCTTGCTT+TGG + Chr7:66185393-66185412 None:intergenic 50.0%
AGTGGAGGGGATGATGTTGT+TGG + Chr7:66182758-66182777 None:intergenic 50.0%
CACCACCTGGTGAGCAATTT+GGG + Chr7:66185595-66185614 None:intergenic 50.0%
CATGTATCCACCCGAGTCAT+GGG - Chr7:66184503-66184522 MsG0780039580.01.T01:CDS 50.0%
CCAAACCCAAATTGCTCACC+AGG - Chr7:66185587-66185606 MsG0780039580.01.T01:CDS 50.0%
CCCATTCATTCAAGAGGAGG+AGG + Chr7:66182823-66182842 None:intergenic 50.0%
CTCATTAGCGGCCTTGCTTT+GGG + Chr7:66185392-66185411 None:intergenic 50.0%
GTAGCTGTGTTGTCGAGTAG+TGG - Chr7:66183684-66183703 MsG0780039580.01.T01:intron 50.0%
GTCCGTTGACAAAACCAGAC+CGG - Chr7:66185214-66185233 MsG0780039580.01.T01:CDS 50.0%
TCCGTTGACAAAACCAGACC+GGG - Chr7:66185215-66185234 MsG0780039580.01.T01:CDS 50.0%
TGACAAAACCAGACCGGGTA+AGG - Chr7:66185220-66185239 MsG0780039580.01.T01:CDS 50.0%
TTGGTCCAGGTGCAACTTGT+CGG - Chr7:66185561-66185580 MsG0780039580.01.T01:CDS 50.0%
! CATGACTCGGGTGGATACAT+GGG + Chr7:66184504-66184523 None:intergenic 50.0%
! CCTGGTGAGCAATTTGGGTT+TGG + Chr7:66185590-66185609 None:intergenic 50.0%
! TGTGGGTTGTGATCAGATGG+AGG - Chr7:66184656-66184675 MsG0780039580.01.T01:intron 50.0%
!! ATTGCACTTGGTGCTGCCAA+AGG - Chr7:66184249-66184268 MsG0780039580.01.T01:CDS 50.0%
!! GGAGGTTTGGTTTCTAGCTC+CGG + Chr7:66183027-66183046 None:intergenic 50.0%
!! GTTTGGTTTCTAGCTCCGGT+AGG + Chr7:66183023-66183042 None:intergenic 50.0%
!! TTGAGCATTGGAAACGACGG+CGG + Chr7:66182869-66182888 None:intergenic 50.0%
!!! ACCCGGTCTGGTTTTGTCAA+CGG + Chr7:66185219-66185238 None:intergenic 50.0%
!!! ACTGCTGTTTTTCCTCTCGC+CGG + Chr7:66183060-66183079 None:intergenic 50.0%
AGGAGGAGGAGTGGTTGAAG+TGG + Chr7:66182776-66182795 None:intergenic 55.0%
AGGAGGAGTGGTTGAAGTGG+AGG + Chr7:66182773-66182792 None:intergenic 55.0%
ATCGCTTCCCGTTGCGGTTA+AGG - Chr7:66183313-66183332 MsG0780039580.01.T01:CDS 55.0%
CATCTGACCCGTAATGCTGC+AGG + Chr7:66185620-66185639 None:intergenic 55.0%
CATTCAAGAGGAGGAGGAGG+AGG + Chr7:66182817-66182836 None:intergenic 55.0%
CCATGTATCCACCCGAGTCA+TGG - Chr7:66184502-66184521 MsG0780039580.01.T01:CDS 55.0%
GAGGAGTGGTTGAAGTGGAG+GGG + Chr7:66182771-66182790 None:intergenic 55.0%
GCACCACCTGGTGAGCAATT+TGG + Chr7:66185596-66185615 None:intergenic 55.0%
GCCGTCGTTTCCAATGCTCA+AGG - Chr7:66182868-66182887 MsG0780039580.01.T01:three_prime_UTR 55.0%
GGAGGAGGATGAAACGACGT+CGG + Chr7:66182799-66182818 None:intergenic 55.0%
GGAGGAGTGGTTGAAGTGGA+GGG + Chr7:66182772-66182791 None:intergenic 55.0%
GGTCAGGTCACCTAACAGCT+AGG - Chr7:66185138-66185157 MsG0780039580.01.T01:intron 55.0%
TTGGCTAAAGCAGGGCCTCA+AGG - Chr7:66184470-66184489 MsG0780039580.01.T01:CDS 55.0%
TTGTTCGCGTTGTTCCACCG+CGG + Chr7:66183137-66183156 None:intergenic 55.0%
! CAGTTGCCTCTGGAAACCTC+AGG + Chr7:66184200-66184219 None:intergenic 55.0%
! CCATGACTCGGGTGGATACA+TGG + Chr7:66184505-66184524 None:intergenic 55.0%
! GCTTTGTTCCTTACCCGGTC+TGG + Chr7:66185231-66185250 None:intergenic 55.0%
! GTATGTACCCATGACTCGGG+TGG + Chr7:66184513-66184532 None:intergenic 55.0%
!! TGGTTTCTAGCTCCGGTAGG+TGG + Chr7:66183020-66183039 None:intergenic 55.0%
AGCATGTTTGACCGGCGGCA+CGG + Chr7:66184004-66184023 None:intergenic 60.0%
CAAACCTCCCTTTCCGGCAC+CGG - Chr7:66183038-66183057 MsG0780039580.01.T01:three_prime_UTR 60.0%
GGAGACCGACAAGTTGCACC+TGG + Chr7:66185569-66185588 None:intergenic 60.0%
GGAGGATGAAACGACGTCGG+AGG + Chr7:66182796-66182815 None:intergenic 60.0%
GGATGAAACGACGTCGGAGG+AGG + Chr7:66182793-66182812 None:intergenic 60.0%
GTGGTGCGCCTGCAGCATTA+CGG - Chr7:66185609-66185628 MsG0780039580.01.T01:CDS 60.0%
TCAAGAGGAGGAGGAGGAGG+AGG + Chr7:66182814-66182833 None:intergenic 60.0%
TGAAACGACGTCGGAGGAGG+AGG + Chr7:66182790-66182809 None:intergenic 60.0%
TGGTGCGCCTGCAGCATTAC+GGG - Chr7:66185610-66185629 MsG0780039580.01.T01:CDS 60.0%
TTGCACTTGTTCCGTGCCGC+CGG - Chr7:66183990-66184009 MsG0780039580.01.T01:intron 60.0%
! AGACTTGTTCAACGCCGCGG+TGG - Chr7:66183120-66183139 MsG0780039580.01.T01:CDS 60.0%
! GCGAGACTTGTTCAACGCCG+CGG - Chr7:66183117-66183136 MsG0780039580.01.T01:CDS 60.0%
! GTTTTTCCTCTCGCCGGTGC+CGG + Chr7:66183054-66183073 None:intergenic 60.0%
AATGCTGCAGGCGCACCACC+TGG + Chr7:66185608-66185627 None:intergenic 65.0%
! CGGTGCCGGAAAGGGAGGTT+TGG + Chr7:66183040-66183059 None:intergenic 65.0%
CGACGTCGGAGGAGGAGGAG+TGG + Chr7:66182785-66182804 None:intergenic 70.0%
! CCTCTCGCCGGTGCCGGAAA+GGG + Chr7:66183048-66183067 None:intergenic 70.0%
! TCCTCTCGCCGGTGCCGGAA+AGG + Chr7:66183049-66183068 None:intergenic 70.0%
! CTCGCCGGTGCCGGAAAGGG+AGG + Chr7:66183045-66183064 None:intergenic 75.0%
!! CCCTTTCCGGCACCGGCGAG+AGG - Chr7:66183045-66183064 MsG0780039580.01.T01:three_prime_UTR 75.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 66182683 66186071 66182683 ID=MsG0780039580.01;Name=MsG0780039580.01
Chr7 mRNA 66182683 66186071 66182683 ID=MsG0780039580.01.T01;Parent=MsG0780039580.01;Name=MsG0780039580.01.T01;_AED=0.23;_eAED=0.23;_QI=155|1|1|1|1|1|6|431|437
Chr7 exon 66182683 66183610 66182683 ID=MsG0780039580.01.T01:exon:10516;Parent=MsG0780039580.01.T01
Chr7 exon 66184191 66184314 66184191 ID=MsG0780039580.01.T01:exon:10515;Parent=MsG0780039580.01.T01
Chr7 exon 66184407 66184543 66184407 ID=MsG0780039580.01.T01:exon:10514;Parent=MsG0780039580.01.T01
Chr7 exon 66185164 66185299 66185164 ID=MsG0780039580.01.T01:exon:10513;Parent=MsG0780039580.01.T01
Chr7 exon 66185378 66185745 66185378 ID=MsG0780039580.01.T01:exon:10512;Parent=MsG0780039580.01.T01
Chr7 exon 66185865 66186071 66185865 ID=MsG0780039580.01.T01:exon:10511;Parent=MsG0780039580.01.T01
Chr7 five_prime_UTR 66185917 66186071 66185917 ID=MsG0780039580.01.T01:five_prime_utr;Parent=MsG0780039580.01.T01
Chr7 CDS 66185865 66185916 66185865 ID=MsG0780039580.01.T01:cds;Parent=MsG0780039580.01.T01
Chr7 CDS 66185378 66185745 66185378 ID=MsG0780039580.01.T01:cds;Parent=MsG0780039580.01.T01
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