AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880046085.01

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MsG0880046085.01.T01 AT4G32710 41.667 312 167 5 56 362 376 677 8.41e-68 228
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MsG0880046085.01.T01 AT1G05700 38.835 309 175 4 50 358 584 878 1.04e-60 210
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MsG0880046085.01.T01 AT3G53380 38.667 300 166 7 57 350 364 651 6.54e-56 195
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MsG0880046085.01.T01 AT5G01950 37.778 315 162 6 54 357 526 817 7.88e-56 196
MsG0880046085.01.T01 AT5G01950 37.658 316 166 6 54 357 611 907 8.37e-56 197
MsG0880046085.01.T01 AT1G51940 36.182 351 192 9 20 354 293 627 1.05e-55 193
MsG0880046085.01.T01 AT5G60270 38.679 318 179 8 49 363 321 625 1.13e-55 194
MsG0880046085.01.T01 AT5G01950 37.778 315 162 6 54 357 611 902 1.38e-55 196
MsG0880046085.01.T01 AT5G01950 37.778 315 162 6 54 357 611 902 1.38e-55 196
MsG0880046085.01.T01 AT5G01950 37.778 315 162 6 54 357 611 902 1.38e-55 196
MsG0880046085.01.T01 AT5G01950 37.778 315 162 6 54 357 611 902 1.38e-55 196
MsG0880046085.01.T01 AT4G33430 38.000 300 169 7 57 351 277 564 1.68e-55 192
MsG0880046085.01.T01 AT1G61420 35.802 324 196 6 28 350 453 765 1.90e-55 195
MsG0880046085.01.T01 AT5G60280 37.179 312 181 6 49 360 319 615 2.09e-55 193
MsG0880046085.01.T01 AT1G61390 39.032 310 171 10 44 350 495 789 2.10e-55 195
MsG0880046085.01.T01 AT1G11350 38.643 339 176 11 30 363 480 791 2.84e-55 194
MsG0880046085.01.T01 AT1G61420 35.714 322 195 6 30 350 457 767 3.45e-55 194
MsG0880046085.01.T01 AT1G61420 35.714 322 195 6 30 350 457 767 3.45e-55 194
MsG0880046085.01.T01 AT4G23290 37.618 319 183 10 38 353 290 595 3.60e-55 192
MsG0880046085.01.T01 AT1G70130 35.714 322 190 6 57 378 322 626 3.69e-55 192
MsG0880046085.01.T01 AT4G23160 38.305 295 158 9 59 346 349 626 3.72e-55 192
MsG0880046085.01.T01 AT4G33430 38.000 300 169 7 57 351 324 611 3.77e-55 192
MsG0880046085.01.T01 AT1G11330 41.281 281 147 7 21 295 473 741 4.23e-55 193
MsG0880046085.01.T01 AT1G21240 37.793 299 173 7 54 351 400 686 4.26e-55 193
MsG0880046085.01.T01 AT4G04540 36.391 338 181 12 47 374 301 614 4.70e-55 191
MsG0880046085.01.T01 AT3G23750 36.145 332 194 7 26 350 534 854 5.05e-55 194
MsG0880046085.01.T01 AT4G00970 42.411 224 116 4 59 279 334 547 5.15e-55 190
MsG0880046085.01.T01 AT4G04490 38.095 294 165 7 65 357 336 613 5.37e-55 192
MsG0880046085.01.T01 AT4G04570 38.264 311 158 12 47 347 325 611 5.80e-55 191
MsG0880046085.01.T01 AT1G11050 43.210 243 126 5 57 294 283 518 6.25e-55 191
MsG0880046085.01.T01 AT3G46355 39.310 290 141 9 66 354 2 257 6.41e-55 182
MsG0880046085.01.T01 AT5G59650 36.826 334 190 8 27 354 534 852 6.44e-55 194
MsG0880046085.01.T01 AT1G67720 37.838 296 169 7 62 356 601 882 6.54e-55 194
MsG0880046085.01.T01 AT5G59650 36.826 334 190 8 27 354 542 860 7.37e-55 194
MsG0880046085.01.T01 AT5G40380 47.111 225 103 8 57 278 303 514 7.78e-55 189
MsG0880046085.01.T01 AT4G04540 36.391 338 181 12 47 374 330 643 8.03e-55 191
MsG0880046085.01.T01 AT4G23290 37.618 319 183 10 38 353 333 638 8.15e-55 192
MsG0880046085.01.T01 AT2G47060 44.130 247 120 5 56 295 60 295 8.56e-55 183
MsG0880046085.01.T01 AT5G54590 36.120 299 171 6 57 355 103 381 8.98e-55 186
MsG0880046085.01.T01 AT5G54590 36.120 299 171 6 57 355 103 381 8.98e-55 186
MsG0880046085.01.T01 AT5G54590 36.120 299 171 6 57 355 103 381 8.98e-55 186
MsG0880046085.01.T01 AT1G51890 34.722 360 192 8 19 354 524 864 9.00e-55 194
MsG0880046085.01.T01 AT5G59680 41.797 256 141 4 100 354 605 853 9.35e-55 194
MsG0880046085.01.T01 AT2G13790 37.748 302 167 8 57 351 282 569 9.41e-55 190
MsG0880046085.01.T01 AT1G61380 38.312 308 176 8 48 353 320 615 9.72e-55 191
MsG0880046085.01.T01 AT2G13800 36.721 305 172 8 54 351 143 433 1.01e-54 187
MsG0880046085.01.T01 AT2G13800 36.721 305 172 8 54 351 143 433 1.01e-54 187
MsG0880046085.01.T01 AT4G23220 38.435 294 163 9 57 346 325 604 1.19e-54 191

Find 107 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 234 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CCCAAAAGCTTAACCAAATT+TGG 0.098980 8:+68867418 None:intergenic
TCCAAATTTGGTTAAGCTTT+TGG 0.153653 8:-68867419 MsG0880046085.01.T01:CDS
CATTGTTAATCATCCAAATT+TGG 0.187649 8:-68867431 MsG0880046085.01.T01:CDS
GCTTAACACTCGTGGATTTC+AGG 0.188075 8:-68868328 MsG0880046085.01.T01:intron
AGCACGCAAAATTGCGAAAT+TGG 0.206141 8:-68865825 MsG0880046085.01.T01:CDS
TGTTTAACTGATAAGATTCT+TGG 0.237528 8:+68865609 None:intergenic
CACCCGAAGCTATCTGATTT+TGG 0.250135 8:-68866700 MsG0880046085.01.T01:CDS
CTGCAATTCAGGAGCTGATT+TGG 0.256826 8:+68868611 None:intergenic
ATTGAGTAAAAGTGAAGTTT+TGG 0.297047 8:+68868754 None:intergenic
CTCATAGATGGTCTATCTTC+TGG 0.324445 8:+68865779 None:intergenic
AGTTGAATTAGAAGCAGTTT+TGG 0.334194 8:-68865584 MsG0880046085.01.T01:three_prime_UTR
GGTAGAGTTTGCGGCCCGTT+TGG 0.366540 8:+68868560 None:intergenic
TTGGGATATTGCTCAGTAGA+TGG 0.371438 8:-68867400 MsG0880046085.01.T01:CDS
CAAATCTTCAAACGTTCTAC+TGG 0.379886 8:-68866734 MsG0880046085.01.T01:CDS
CAAAGTGACATGTGGAGTTT+TGG 0.380749 8:-68866010 MsG0880046085.01.T01:CDS
ATTTCTTGTTATCAGGTTGT+TGG 0.386707 8:-68866085 MsG0880046085.01.T01:intron
TTTAATAGGATGCTTAAGAT+TGG 0.389741 8:-68868435 MsG0880046085.01.T01:CDS
GAAAAGAGGAAGAACAAAAG+TGG 0.390428 8:+68868776 None:intergenic
TAGCAGATTCAGCATGATAA+TGG 0.391521 8:-68865882 MsG0880046085.01.T01:CDS
ACTGGATCACCTTGTCCATC+AGG 0.394830 8:+68868369 None:intergenic
ATCCCCTTGTGGTCCTTCCC+TGG 0.400405 8:+68866672 None:intergenic
GTGCTGCAACAATGGGATAT+TGG 0.416976 8:+68865843 None:intergenic
TCTCACGGGAAGACGATCAT+TGG 0.420054 8:-68865969 MsG0880046085.01.T01:CDS
CGATGATTAAATGAAGGGAA+TGG 0.426866 8:+68868803 None:intergenic
TGTAAAAGGGTCATAAAGAA+TGG 0.434868 8:-68867477 MsG0880046085.01.T01:intron
AGCTTATTTACATGAGGGAT+TGG 0.439758 8:-68867239 MsG0880046085.01.T01:CDS
AGAAGAGTCCGGCGTCCAAA+CGG 0.442136 8:-68868575 MsG0880046085.01.T01:CDS
GAAGAGTCCGGCGTCCAAAC+GGG 0.447650 8:-68868574 MsG0880046085.01.T01:CDS
AGACCAAAATCAGATAGCTT+CGG 0.454517 8:+68866697 None:intergenic
CAAAACTCCACATGTCACTT+TGG 0.456114 8:+68866011 None:intergenic
GCACCAGAGTACATCGAAAC+AGG 0.457697 8:-68866046 MsG0880046085.01.T01:CDS
TCTTATACTTTGTCAACCAT+TGG 0.458587 8:-68865460 MsG0880046085.01.T01:three_prime_UTR
CAGTTATAGTTGCCATCAAA+AGG 0.458693 8:-68868350 MsG0880046085.01.T01:CDS
TGATAATGGACCCGCGTCTC+AGG 0.459066 8:-68865868 MsG0880046085.01.T01:CDS
TCCACTATCTGACTCATAGA+TGG 0.460940 8:+68865767 None:intergenic
CCTTCCATGGAAAACAAGAT+TGG 0.461043 8:-68867290 MsG0880046085.01.T01:CDS
ATACAAATCCTTCACACTCC+TGG 0.469604 8:+68868521 None:intergenic
TGTATGAGTTCATGCCGAAC+AGG 0.474183 8:-68867351 MsG0880046085.01.T01:CDS
AAGCATCCTATTAAAACCAT+TGG 0.475777 8:+68868443 None:intergenic
GATGATTAAATGAAGGGAAT+GGG 0.481177 8:+68868804 None:intergenic
TGAATCATCTCGGTCAAGAT+TGG 0.481567 8:-68865687 MsG0880046085.01.T01:CDS
GGGAAACGATGATTAAATGA+AGG 0.485850 8:+68868797 None:intergenic
CAGGGAGAGTTCTACTGAAA+AGG 0.491506 8:+68867314 None:intergenic
ACCATCTATGAGTCAGATAG+TGG 0.492083 8:-68865768 MsG0880046085.01.T01:CDS
GTTGAGATAAAGATAAAGAC+GGG 0.494321 8:+68868842 None:intergenic
ACATGAGGGATTGGAGATAC+AGG 0.495364 8:-68867230 MsG0880046085.01.T01:intron
TTCAAACGTTCTACTGGATG+AGG 0.496296 8:-68866728 MsG0880046085.01.T01:CDS
AGGATGCTTAAGATTGGAGA+AGG 0.497642 8:-68868429 MsG0880046085.01.T01:CDS
CTGAATCTGCTAGTGTCAGC+AGG 0.498646 8:+68865893 None:intergenic
TACAAATCCTTCACACTCCT+GGG 0.502365 8:+68868522 None:intergenic
GACCAAAATCAGATAGCTTC+GGG 0.503413 8:+68866698 None:intergenic
CGTTTGAAGATTTGAAATCT+CGG 0.509284 8:+68866743 None:intergenic
TATAGAGCCGGTAGAGTTTG+CGG 0.510054 8:+68868551 None:intergenic
ATTCTTCTTTAAGCAACTAT+CGG 0.516985 8:+68865802 None:intergenic
ATTCACAACAACAAAGCTCT+TGG 0.517450 8:-68868683 MsG0880046085.01.T01:five_prime_UTR
CTGAACAGAAGCTATTAGAC+TGG 0.517651 8:-68865928 MsG0880046085.01.T01:CDS
GATATTGGTTCCTGAGACGC+GGG 0.519895 8:+68865858 None:intergenic
TGCTCAGTAGATGGAGAAAG+AGG 0.525755 8:-68867391 MsG0880046085.01.T01:CDS
GTTCATGCCGAACAGGAGCT+TGG 0.526941 8:-68867344 MsG0880046085.01.T01:CDS
TTTGCGGCCCGTTTGGACGC+CGG 0.528582 8:+68868567 None:intergenic
GAACTCTCCCTGTCCTTCCA+TGG 0.530145 8:-68867303 MsG0880046085.01.T01:CDS
ATCATGCTTGGTGCTGCTGA+AGG 0.535820 8:-68867265 MsG0880046085.01.T01:CDS
GGTTGAGATAAAGATAAAGA+CGG 0.538049 8:+68868841 None:intergenic
AATGAAGGGAATGGGAACAT+AGG 0.538409 8:+68868812 None:intergenic
CTGGATCACCTTGTCCATCA+GGG 0.539378 8:+68868370 None:intergenic
CTTGCCAGGGAAGGACCACA+AGG 0.542622 8:-68866676 MsG0880046085.01.T01:CDS
GGAAACGATGATTAAATGAA+GGG 0.544758 8:+68868798 None:intergenic
GGATGCTTAAGATTGGAGAA+GGG 0.556643 8:-68868428 MsG0880046085.01.T01:CDS
TATCAGGTTGTTGGAACACA+AGG 0.557366 8:-68866076 MsG0880046085.01.T01:intron
ACAAGATTGGAGATCATGCT+TGG 0.560603 8:-68867277 MsG0880046085.01.T01:CDS
AGGATTAGCTTATTTACATG+AGG 0.561817 8:-68867245 MsG0880046085.01.T01:CDS
AATAGCTTCTGTTCAGCTGT+CGG 0.563840 8:+68865935 None:intergenic
TCTATGAGTCAGATAGTGGA+AGG 0.568309 8:-68865764 MsG0880046085.01.T01:CDS
AAAAGAGGAAGAACAAAAGT+GGG 0.568928 8:+68868777 None:intergenic
AAACGGGCCGCAAACTCTAC+CGG 0.571619 8:-68868558 MsG0880046085.01.T01:CDS
ATGCTTAAGATTGGAGAAGG+GGG 0.575451 8:-68868426 MsG0880046085.01.T01:CDS
ATCAAAAGGCTTAACACTCG+TGG 0.575575 8:-68868336 MsG0880046085.01.T01:CDS
TCAAAACAATTAAAAGCCAA+TGG 0.575657 8:+68865444 None:intergenic
GCTTCTGTTCAGCTGTCGGA+CGG 0.577652 8:+68865939 None:intergenic
TGACCTGTTTCGATGTACTC+TGG 0.579557 8:+68866043 None:intergenic
GAATGGGAACATAGGAGAAG+TGG 0.581128 8:+68868820 None:intergenic
ATCTTCTCCCAGGAGTGTGA+AGG 0.581917 8:-68868529 MsG0880046085.01.T01:CDS
GGATTAGCTTATTTACATGA+GGG 0.583362 8:-68867244 MsG0880046085.01.T01:CDS
ATGATAATGCTGAATCATCT+CGG 0.584880 8:-68865697 MsG0880046085.01.T01:CDS
GATGCTTAAGATTGGAGAAG+GGG 0.597171 8:-68868427 MsG0880046085.01.T01:CDS
GGATATTGGTTCCTGAGACG+CGG 0.601080 8:+68865857 None:intergenic
AAGAGGAATCCAACGGCTGT+TGG 0.601268 8:-68867374 MsG0880046085.01.T01:CDS
CCGGCTCTATATCTTCTCCC+AGG 0.609163 8:-68868539 MsG0880046085.01.T01:CDS
GAACTTAGAGATGCTACCAA+TGG 0.614404 8:-68868459 MsG0880046085.01.T01:CDS
TGCCAGGGAAGGACCACAAG+GGG 0.615074 8:-68866674 MsG0880046085.01.T01:CDS
GATGATTCAGCATTATCATG+AGG 0.618783 8:+68865701 None:intergenic
TGGATCACCTTGTCCATCAG+GGG 0.625481 8:+68868371 None:intergenic
ACTCATACACCAACAGCCGT+TGG 0.628701 8:+68867365 None:intergenic
CGGGAAGACGATCATTGGAA+AGG 0.634704 8:-68865964 MsG0880046085.01.T01:CDS
CCTGGGAGAAGATATAGAGC+CGG 0.637847 8:+68868539 None:intergenic
TAACAAGAAAATTCAAACCA+AGG 0.638896 8:+68865511 None:intergenic
TCAAAGTCCAAAGTGACATG+TGG 0.643443 8:-68866018 MsG0880046085.01.T01:CDS
CGTACTCTACGAAATTCTCA+CGG 0.645780 8:-68865984 MsG0880046085.01.T01:CDS
GTACTCTACGAAATTCTCAC+GGG 0.646070 8:-68865983 MsG0880046085.01.T01:CDS
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CRISPR-GE

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CCTAAAGCGAGTTCATATTT+GGG - Chr8:68867836-68867855 MsG0880046085.01.T01:intron 35.0%
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CTACACACACATTTCACTTA+AGG + Chr8:68867468-68867487 None:intergenic 35.0%
CTCGAGTTCTATCAAATCAT+TGG - Chr8:68866739-68866758 MsG0880046085.01.T01:CDS 35.0%
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CTTTCTTTGGTTAAGTCTTC+TGG - Chr8:68866498-68866517 MsG0880046085.01.T01:intron 35.0%
GAAAAGAGGAAGAACAAAAG+TGG + Chr8:68865556-68865575 None:intergenic 35.0%
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GGGAAACGATGATTAAATGA+AGG + Chr8:68865535-68865554 None:intergenic 35.0%
GTAGGAGTTTATTGCTTCAA+TGG - Chr8:68866081-68866100 MsG0880046085.01.T01:intron 35.0%
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TCCTAAAGCGAGTTCATATT+TGG - Chr8:68867835-68867854 MsG0880046085.01.T01:intron 35.0%
TGAACAGAAGCTATTAGACT+GGG - Chr8:68868402-68868421 MsG0880046085.01.T01:CDS 35.0%
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TGCGGTAGGTTTATATATGT+TGG - Chr8:68867697-68867716 MsG0880046085.01.T01:intron 35.0%
TTATTGTTGTCATCTGGTGA+AGG - Chr8:68866347-68866366 MsG0880046085.01.T01:intron 35.0%
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!! ATATGAACTCGCTTTAGGAA+TGG + Chr8:68867834-68867853 None:intergenic 35.0%
!! CTTTTGATGGCAACTATAAC+TGG + Chr8:68865981-68866000 None:intergenic 35.0%
!! GAAAGAGGTATCATTGAACA+TGG - Chr8:68866238-68866257 MsG0880046085.01.T01:intron 35.0%
!! GAACGTTCTTGATAATGATG+CGG - Chr8:68867247-68867266 MsG0880046085.01.T01:CDS 35.0%
!! TATGAACTCGCTTTAGGAAT+GGG + Chr8:68867833-68867852 None:intergenic 35.0%
!! TTTACCATGCTTGATTTGGT+AGG - Chr8:68866063-68866082 MsG0880046085.01.T01:CDS 35.0%
!!! ATCTCCAATCTTGTTTTCCA+TGG + Chr8:68867046-68867065 None:intergenic 35.0%
!!! GAAGCAGTTTTGGTTAATCT+TGG - Chr8:68868755-68868774 MsG0880046085.01.T01:five_prime_UTR 35.0%
AACTCCTACCAAATCAAGCA+TGG + Chr8:68866070-68866089 None:intergenic 40.0%
AAGGGTAAACTTCAAGCAGA+AGG - Chr8:68866594-68866613 MsG0880046085.01.T01:intron 40.0%
AATAGCTTCTGTTCAGCTGT+CGG + Chr8:68868397-68868416 None:intergenic 40.0%
AATGAAGGGAATGGGAACAT+AGG + Chr8:68865520-68865539 None:intergenic 40.0%
ACAAGATTGGAGATCATGCT+TGG - Chr8:68867052-68867071 MsG0880046085.01.T01:intron 40.0%
ACCATCTATGAGTCAGATAG+TGG - Chr8:68868561-68868580 MsG0880046085.01.T01:CDS 40.0%
AGCACGCAAAATTGCGAAAT+TGG - Chr8:68868504-68868523 MsG0880046085.01.T01:CDS 40.0%
AGGATGCTTAAGATTGGAGA+AGG - Chr8:68865900-68865919 MsG0880046085.01.T01:CDS 40.0%
ATACAAATCCTTCACACTCC+TGG + Chr8:68865811-68865830 None:intergenic 40.0%
ATCAAAAGGCTTAACACTCG+TGG - Chr8:68865993-68866012 MsG0880046085.01.T01:CDS 40.0%
ATGCTTAAGATTGGAGAAGG+GGG - Chr8:68865903-68865922 MsG0880046085.01.T01:CDS 40.0%
ATGGAGAAAGAGGAATCCAA+CGG - Chr8:68866948-68866967 MsG0880046085.01.T01:intron 40.0%
CACACAAGTCCCTACAATTT+AGG + Chr8:68867788-68867807 None:intergenic 40.0%
CCCAAATATGAACTCGCTTT+AGG + Chr8:68867839-68867858 None:intergenic 40.0%
CCTTCCATGGAAAACAAGAT+TGG - Chr8:68867039-68867058 MsG0880046085.01.T01:intron 40.0%
CGTACTCTACGAAATTCTCA+CGG - Chr8:68868345-68868364 MsG0880046085.01.T01:CDS 40.0%
CTCATAGATGGTCTATCTTC+TGG + Chr8:68868553-68868572 None:intergenic 40.0%
CTGAACAGAAGCTATTAGAC+TGG - Chr8:68868401-68868420 MsG0880046085.01.T01:CDS 40.0%
GAACTTAGAGATGCTACCAA+TGG - Chr8:68865870-68865889 MsG0880046085.01.T01:CDS 40.0%
GACCAAAATCAGATAGCTTC+GGG + Chr8:68867634-68867653 None:intergenic 40.0%
GATGCTTAAGATTGGAGAAG+GGG - Chr8:68865902-68865921 MsG0880046085.01.T01:CDS 40.0%
GGATGCTTAAGATTGGAGAA+GGG - Chr8:68865901-68865920 MsG0880046085.01.T01:CDS 40.0%
GTACTCTACGAAATTCTCAC+GGG - Chr8:68868346-68868365 MsG0880046085.01.T01:CDS 40.0%
TAAATCGTGACTTAAGGGAC+TGG + Chr8:68868144-68868163 None:intergenic 40.0%
TACAAATCCTTCACACTCCT+GGG + Chr8:68865810-68865829 None:intergenic 40.0%
TCAAAGTCCAAAGTGACATG+TGG - Chr8:68868311-68868330 MsG0880046085.01.T01:intron 40.0%
TCAGACTCATGTATCTACTG+CGG - Chr8:68867679-68867698 MsG0880046085.01.T01:intron 40.0%
TCCACTATCTGACTCATAGA+TGG + Chr8:68868565-68868584 None:intergenic 40.0%
TGAATCATCTCGGTCAAGAT+TGG - Chr8:68868642-68868661 MsG0880046085.01.T01:CDS 40.0%
TTCAAACGTTCTACTGGATG+AGG - Chr8:68867601-68867620 MsG0880046085.01.T01:intron 40.0%
TTGGGATATTGCTCAGTAGA+TGG - Chr8:68866929-68866948 MsG0880046085.01.T01:intron 40.0%
! AATTTTGCGTGCTGCAACAA+TGG + Chr8:68868497-68868516 None:intergenic 40.0%
! ACGAGTGTTAAGCCTTTTGA+TGG + Chr8:68865994-68866013 None:intergenic 40.0%
! ATTTTGCGTGCTGCAACAAT+GGG + Chr8:68868496-68868515 None:intergenic 40.0%
! CAAAACTCCACATGTCACTT+TGG + Chr8:68868321-68868340 None:intergenic 40.0%
! CAAAGTGACATGTGGAGTTT+TGG - Chr8:68868319-68868338 MsG0880046085.01.T01:intron 40.0%
! TATCAGGTTGTTGGAACACA+AGG - Chr8:68868253-68868272 MsG0880046085.01.T01:intron 40.0%
! TGATTTTCCAAGCTCCTGTT+CGG + Chr8:68866995-68867014 None:intergenic 40.0%
! TTATCGGTGTTTACGTGTTG+TGG - Chr8:68866153-68866172 MsG0880046085.01.T01:intron 40.0%
! TTGTTTTCCATGGAAGGACA+GGG + Chr8:68867036-68867055 None:intergenic 40.0%
!! AGGGACTGGTTATATGGTAT+AGG + Chr8:68868130-68868149 None:intergenic 40.0%
!! ATGAACTCGCTTTAGGAATG+GGG + Chr8:68867832-68867851 None:intergenic 40.0%
!! ATTTTGACCTTTTGGGTCCA+TGG - Chr8:68866372-68866391 MsG0880046085.01.T01:intron 40.0%
!! CTATGAGTCAGATAGTGGAA+GGG - Chr8:68868566-68868585 MsG0880046085.01.T01:CDS 40.0%
!! GACTTAAGGGACTGGTTATA+TGG + Chr8:68868136-68868155 None:intergenic 40.0%
!! TCTATGAGTCAGATAGTGGA+AGG - Chr8:68868565-68868584 MsG0880046085.01.T01:CDS 40.0%
!!! ATCTGATTTTGGTCTTGCCA+GGG - Chr8:68867640-68867659 MsG0880046085.01.T01:intron 40.0%
!!! CCAATCTTGTTTTCCATGGA+AGG + Chr8:68867042-68867061 None:intergenic 40.0%
!!! TATCTGATTTTGGTCTTGCC+AGG - Chr8:68867639-68867658 MsG0880046085.01.T01:intron 40.0%
ACATGAGGGATTGGAGATAC+AGG - Chr8:68867099-68867118 MsG0880046085.01.T01:intron 45.0%
ACTCATGTATCTACTGCGGT+AGG - Chr8:68867683-68867702 MsG0880046085.01.T01:intron 45.0%
CAAAATCAGATAGCTTCGGG+TGG + Chr8:68867631-68867650 None:intergenic 45.0%
CAAACAACCATGGACCCAAA+AGG + Chr8:68866382-68866401 None:intergenic 45.0%
CAGGGAGAGTTCTACTGAAA+AGG + Chr8:68867018-68867037 None:intergenic 45.0%
CTGCAATTCAGGAGCTGATT+TGG + Chr8:68865721-68865740 None:intergenic 45.0%
GAATGGGAACATAGGAGAAG+TGG + Chr8:68865512-68865531 None:intergenic 45.0%
GCTTAACACTCGTGGATTTC+AGG - Chr8:68866001-68866020 MsG0880046085.01.T01:CDS 45.0%
GGACCTCCCAACAAATCTAT+AGG - Chr8:68867442-68867461 MsG0880046085.01.T01:CDS 45.0%
GTGCTGCAACAATGGGATAT+TGG + Chr8:68868489-68868508 None:intergenic 45.0%
TATAGAGCCGGTAGAGTTTG+CGG + Chr8:68865781-68865800 None:intergenic 45.0%
TGACCTGTTTCGATGTACTC+TGG + Chr8:68868289-68868308 None:intergenic 45.0%
TGCTCAGTAGATGGAGAAAG+AGG - Chr8:68866938-68866957 MsG0880046085.01.T01:intron 45.0%
TGTATGAGTTCATGCCGAAC+AGG - Chr8:68866978-68866997 MsG0880046085.01.T01:intron 45.0%
! AAGATTGGAGAAGGGGGTTT+TGG - Chr8:68865909-68865928 MsG0880046085.01.T01:CDS 45.0%
! CACCCGAAGCTATCTGATTT+TGG - Chr8:68867629-68867648 MsG0880046085.01.T01:intron 45.0%
!! ACACTCGTGGATTTCAGGTT+TGG - Chr8:68866006-68866025 MsG0880046085.01.T01:CDS 45.0%
!! AGGCCTATAGATTTGTTGGG+AGG + Chr8:68867448-68867467 None:intergenic 45.0%
!! CTTGTTTTCCATGGAAGGAC+AGG + Chr8:68867037-68867056 None:intergenic 45.0%
!! CTTTTGGGTCCATGGTTGTT+TGG - Chr8:68866380-68866399 MsG0880046085.01.T01:intron 45.0%
!! TAGATTTGTTGGGAGGTCCT+AGG + Chr8:68867441-68867460 None:intergenic 45.0%
AAGAGGAATCCAACGGCTGT+TGG - Chr8:68866955-68866974 MsG0880046085.01.T01:intron 50.0%
ACATGAGTCTGATCCCCTTG+TGG + Chr8:68867671-68867690 None:intergenic 50.0%
ACTCATACACCAACAGCCGT+TGG + Chr8:68866967-68866986 None:intergenic 50.0%
ACTGGATCACCTTGTCCATC+AGG + Chr8:68865963-68865982 None:intergenic 50.0%
CCACATGTGGGTGCTTTCTT+TGG - Chr8:68866485-68866504 MsG0880046085.01.T01:intron 50.0%
CCTGGGAGAAGATATAGAGC+CGG + Chr8:68865793-68865812 None:intergenic 50.0%
CGGGAAGACGATCATTGGAA+AGG - Chr8:68868365-68868384 MsG0880046085.01.T01:CDS 50.0%
CTGAATCTGCTAGTGTCAGC+AGG + Chr8:68868439-68868458 None:intergenic 50.0%
CTGGATCACCTTGTCCATCA+GGG + Chr8:68865962-68865981 None:intergenic 50.0%
GCACCAGAGTACATCGAAAC+AGG - Chr8:68868283-68868302 MsG0880046085.01.T01:intron 50.0%
TCTCACGGGAAGACGATCAT+TGG - Chr8:68868360-68868379 MsG0880046085.01.T01:CDS 50.0%
TGGATCACCTTGTCCATCAG+GGG + Chr8:68865961-68865980 None:intergenic 50.0%
TGTTGGGAGGTCCTAGGTTT+AGG + Chr8:68867435-68867454 None:intergenic 50.0%
TTGTCCATCAGGGGGCTTAA+TGG + Chr8:68865952-68865971 None:intergenic 50.0%
! ATCTTCTCCCAGGAGTGTGA+AGG - Chr8:68865800-68865819 MsG0880046085.01.T01:CDS 50.0%
! ATTAAGCCCCCTGATGGACA+AGG - Chr8:68865951-68865970 MsG0880046085.01.T01:CDS 50.0%
! GGAGGTCCTAGGTTTAGGTT+TGG + Chr8:68867430-68867449 None:intergenic 50.0%
!! ATCATGCTTGGTGCTGCTGA+AGG - Chr8:68867064-68867083 MsG0880046085.01.T01:intron 50.0%
!! CCAAAGAAAGCACCCACATG+TGG + Chr8:68866488-68866507 None:intergenic 50.0%
!! GATATTGGTTCCTGAGACGC+GGG + Chr8:68868474-68868493 None:intergenic 50.0%
!! GGATATTGGTTCCTGAGACG+CGG + Chr8:68868475-68868494 None:intergenic 50.0%
!!! GATTTTGGTCTTGCCAGGGA+AGG - Chr8:68867644-68867663 MsG0880046085.01.T01:intron 50.0%
AAACGGGCCGCAAACTCTAC+CGG - Chr8:68865771-68865790 MsG0880046085.01.T01:CDS 55.0%
AGAAGAGTCCGGCGTCCAAA+CGG - Chr8:68865754-68865773 MsG0880046085.01.T01:CDS 55.0%
CCGGCTCTATATCTTCTCCC+AGG - Chr8:68865790-68865809 MsG0880046085.01.T01:CDS 55.0%
GAACTCTCCCTGTCCTTCCA+TGG - Chr8:68867026-68867045 MsG0880046085.01.T01:intron 55.0%
GCTTCTGTTCAGCTGTCGGA+CGG + Chr8:68868393-68868412 None:intergenic 55.0%
GGATCACCTTGTCCATCAGG+GGG + Chr8:68865960-68865979 None:intergenic 55.0%
GGATCCATTAAGCCCCCTGA+TGG - Chr8:68865945-68865964 MsG0880046085.01.T01:CDS 55.0%
GTTCATGCCGAACAGGAGCT+TGG - Chr8:68866985-68867004 MsG0880046085.01.T01:intron 55.0%
TTGCCAGGGAAGGACCACAA+GGG - Chr8:68867654-68867673 MsG0880046085.01.T01:intron 55.0%
!! TGATAATGGACCCGCGTCTC+AGG - Chr8:68868461-68868480 MsG0880046085.01.T01:CDS 55.0%
ATCCCCTTGTGGTCCTTCCC+TGG + Chr8:68867660-68867679 None:intergenic 60.0%
CTTGCCAGGGAAGGACCACA+AGG - Chr8:68867653-68867672 MsG0880046085.01.T01:intron 60.0%
GAAGAGTCCGGCGTCCAAAC+GGG - Chr8:68865755-68865774 MsG0880046085.01.T01:CDS 60.0%
GGTAGAGTTTGCGGCCCGTT+TGG + Chr8:68865772-68865791 None:intergenic 60.0%
TGCCAGGGAAGGACCACAAG+GGG - Chr8:68867655-68867674 MsG0880046085.01.T01:intron 60.0%
TTTGCGGCCCGTTTGGACGC+CGG + Chr8:68865765-68865784 None:intergenic 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr8 gene 68865427 68868924 68865427 ID=MsG0880046085.01;Name=MsG0880046085.01
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Chr8 exon 68865427 68866092 68865427 ID=MsG0880046085.01.T01:exon:757;Parent=MsG0880046085.01.T01
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Chr8 exon 68868329 68868924 68868329 ID=MsG0880046085.01.T01:exon:754;Parent=MsG0880046085.01.T01
Chr8 five_prime_UTR 68868662 68868924 68868662 ID=MsG0880046085.01.T01:five_prime_utr;Parent=MsG0880046085.01.T01
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Chr8 three_prime_UTR 68865427 68865669 68865427 ID=MsG0880046085.01.T01:three_prime_utr;Parent=MsG0880046085.01.T01
Gene Sequence

>MsG0880046085.01.T01

ATGAAGTGTTTCTTCTTCAAAGAGAAATCCAAATCAGCTCCTGAATTGCAGAACAAAAACAAAAAGAAGAGTCCGGCGTCCAAACGGGCCGCAAACTCTACCGGCTCTATATCTTCTCCCAGGAGTGTGAAGGATTTGTATAGAGAGAAAGAGCAAAGCTTCAGAGTTTTCACTTTTCAAGAACTTAGAGATGCTACCAATGGTTTTAATAGGATGCTTAAGATTGGAGAAGGGGGTTTTGGAAGTGTTTATAAAGGATCCATTAAGCCCCCTGATGGACAAGGTGATCCAGTTATAGTTGCCATCAAAAGGCTTAACACTCGTGGATTTCAGGGTCATAAAGAATGGCTTGCAGAAGTTCAATTTCTCAGCATTGTTAATCATCCAAATTTGGTTAAGCTTTTGGGATATTGCTCAGTAGATGGAGAAAGAGGAATCCAACGGCTGTTGGTGTATGAGTTCATGCCGAACAGGAGCTTGGAAAATCACCTTTTCAGTAGAACTCTCCCTGTCCTTCCATGGAAAACAAGATTGGAGATCATGCTTGGTGCTGCTGAAGGATTAGCTTATTTACATGAGGGATTGGAGATACAGGTGATTTACCGAGATTTCAAATCTTCAAACGTTCTACTGGATGAGGATTTCCACCCGAAGCTATCTGATTTTGGTCTTGCCAGGGAAGGACCACAAGGGGATCAGACTCATGTATCTACTGCGGTTGTTGGAACACAAGGATATGCTGCACCAGAGTACATCGAAACAGGTCATCTCAAAGTCCAAAGTGACATGTGGAGTTTTGGTGTCGTACTCTACGAAATTCTCACGGGAAGACGATCATTGGAAAGGAACCGTCCGACAGCTGAACAGAAGCTATTAGACTGGGTTAAACAATATCCTGCTGACACTAGCAGATTCAGCATGATAATGGACCCGCGTCTCAGGAACCAATATCCCATTGTTGCAGCACGCAAAATTGCGAAATTGGCCGATAGTTGCTTAAAGAAGAATCCAGAAGATAGACCATCTATGAGTCAGATAGTGGAAGGGTTGAAGCAAGCATTGCAATTTTCAGAAATGTCAAACACTCCTCATGATAATGCTGAATCATCTCGGTCAAGATTGGTTAAAAAAGGTAAATAA
Protein sequence

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