AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780039635.01

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MsG0780039635.01.T01 AT3G07040 29.492 295 179 11 1 280 376 656 2.22e-16 81.6
MsG0780039635.01.T01 AT1G59620 26.543 324 204 13 1 302 225 536 4.04e-16 80.9
MsG0780039635.01.T01 AT3G46710 28.169 284 177 11 10 279 368 638 6.59e-16 80.1
MsG0780039635.01.T01 AT5G47250 26.286 350 201 13 1 328 348 662 6.64e-16 80.1
MsG0780039635.01.T01 AT4G10780 26.578 301 187 11 1 279 348 636 7.77e-16 80.1
MsG0780039635.01.T01 AT4G10780 26.578 301 187 11 1 279 348 636 7.78e-16 80.1
MsG0780039635.01.T01 AT1G59780 27.350 351 197 13 1 302 350 691 1.78e-15 79.0
MsG0780039635.01.T01 AT1G59780 27.350 351 197 13 1 302 355 696 2.01e-15 79.0
MsG0780039635.01.T01 AT1G12210 25.392 319 190 11 1 302 351 638 2.30e-14 75.5
MsG0780039635.01.T01 AT1G12210 25.392 319 190 11 1 302 309 596 2.90e-14 75.1
MsG0780039635.01.T01 AT1G12210 25.392 319 190 11 1 302 309 596 2.90e-14 75.1
MsG0780039635.01.T01 AT4G27190 25.688 327 216 10 1 308 338 656 2.94e-14 75.1
MsG0780039635.01.T01 AT5G43730 26.220 328 202 12 1 302 346 659 4.26e-14 74.7
MsG0780039635.01.T01 AT5G43730 26.220 328 202 12 1 302 346 659 4.26e-14 74.7
MsG0780039635.01.T01 AT5G43730 26.220 328 202 12 1 302 346 659 4.26e-14 74.7
MsG0780039635.01.T01 AT5G43730 26.220 328 202 12 1 302 346 659 4.26e-14 74.7
MsG0780039635.01.T01 AT5G43730 26.220 328 202 12 1 302 346 659 4.26e-14 74.7
MsG0780039635.01.T01 AT1G58807 26.243 362 239 14 40 386 412 760 7.18e-14 73.9
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MsG0780039635.01.T01 AT1G58807 26.243 362 239 14 40 386 412 760 9.23e-14 73.6
MsG0780039635.01.T01 AT1G59124 26.243 362 239 14 40 386 412 760 9.23e-14 73.6
MsG0780039635.01.T01 AT1G12220 26.087 322 188 12 1 304 230 519 9.96e-14 73.6
MsG0780039635.01.T01 AT1G12220 26.087 322 188 12 1 304 351 640 1.10e-13 73.6
MsG0780039635.01.T01 AT1G12220 26.087 322 188 12 1 304 351 640 1.10e-13 73.6
MsG0780039635.01.T01 AT5G47260 25.347 288 170 10 1 276 339 593 1.96e-13 72.8
MsG0780039635.01.T01 AT1G61190 25.116 430 243 17 1 365 348 763 3.42e-13 72.0
MsG0780039635.01.T01 AT1G61190 27.758 281 166 12 1 257 348 615 4.35e-13 71.6
MsG0780039635.01.T01 AT1G61190 27.758 281 166 12 1 257 348 615 5.70e-13 71.2
MsG0780039635.01.T01 AT1G61190 27.758 281 166 12 1 257 348 615 5.70e-13 71.2
MsG0780039635.01.T01 AT1G12280 27.698 278 169 11 1 257 351 617 5.83e-13 71.2
MsG0780039635.01.T01 AT1G50180 25.556 270 165 9 1 250 365 618 1.41e-12 70.1
MsG0780039635.01.T01 AT1G58602 25.562 356 220 11 1 336 367 697 2.97e-12 68.9
MsG0780039635.01.T01 AT1G58602 25.562 356 220 11 1 336 367 697 2.97e-12 68.9
MsG0780039635.01.T01 AT1G61300 25.459 436 251 17 1 376 236 657 3.04e-12 68.9
MsG0780039635.01.T01 AT5G35450 27.273 308 177 15 1 279 357 646 3.08e-12 68.9
MsG0780039635.01.T01 AT5G35450 27.273 308 177 15 1 279 357 646 3.08e-12 68.9
MsG0780039635.01.T01 AT4G26090 23.493 481 240 22 1 364 348 817 4.07e-12 68.6
MsG0780039635.01.T01 AT1G69550 39.103 156 87 6 205 356 1101 1252 5.60e-12 68.2
MsG0780039635.01.T01 AT1G69550 36.723 177 105 5 213 385 967 1140 9.60e-12 67.4
MsG0780039635.01.T01 AT1G58848 27.059 340 207 14 40 368 412 721 6.81e-12 67.8
MsG0780039635.01.T01 AT1G59218 27.059 340 207 14 40 368 412 721 6.81e-12 67.8
MsG0780039635.01.T01 AT1G59218 27.059 340 207 14 40 368 412 721 6.81e-12 67.8
MsG0780039635.01.T01 AT1G59218 27.059 340 207 14 40 368 412 721 6.81e-12 67.8
MsG0780039635.01.T01 AT1G58848 27.059 340 207 14 40 368 412 721 6.81e-12 67.8
MsG0780039635.01.T01 AT1G61300 25.347 288 161 12 1 269 236 488 7.91e-12 67.4
MsG0780039635.01.T01 AT5G17680 33.333 168 84 3 206 348 719 883 1.05e-11 67.4
MsG0780039635.01.T01 AT5G17680 33.333 168 84 3 206 348 720 884 1.08e-11 67.4
MsG0780039635.01.T01 AT1G62630 22.977 309 221 7 1 302 347 645 2.08e-11 66.2
MsG0780039635.01.T01 AT5G48620 26.685 371 189 19 1 312 363 709 3.00e-11 65.9
MsG0780039635.01.T01 AT5G48620 26.685 371 189 19 1 312 363 709 3.00e-11 65.9
MsG0780039635.01.T01 AT5G48620 26.685 371 189 19 1 312 363 709 3.00e-11 65.9
MsG0780039635.01.T01 AT5G48620 26.685 371 189 19 1 312 363 709 3.00e-11 65.9
MsG0780039635.01.T01 AT5G48620 26.685 371 189 19 1 312 363 709 3.00e-11 65.9
MsG0780039635.01.T01 AT5G48620 26.685 371 189 19 1 312 363 709 3.00e-11 65.9
MsG0780039635.01.T01 AT1G63350 24.146 410 253 16 1 364 347 744 4.21e-11 65.5
MsG0780039635.01.T01 AT5G43470 27.988 343 193 17 1 309 363 685 5.29e-11 65.1
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MsG0780039635.01.T01 AT5G43470 27.988 343 193 17 1 309 363 685 5.29e-11 65.1
MsG0780039635.01.T01 AT5G43470 27.988 343 193 17 1 309 363 685 5.29e-11 65.1
MsG0780039635.01.T01 AT1G15890 26.736 288 176 9 1 266 348 622 7.90e-11 64.3
MsG0780039635.01.T01 AT1G15890 26.736 288 176 9 1 266 188 462 7.91e-11 64.3

Find 73 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 82 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ACCAAATTCTATTGCTAAAT+TGG 0.111732 7:-67028347 MsG0780039635.01.T01:CDS
ATATGAAGAGTATGTAATTT+TGG 0.153716 7:+67027977 None:intergenic
TATTTGCAAACTCCAAAATT+TGG 0.162569 7:-67028266 MsG0780039635.01.T01:CDS
ACTATCAAAGCTATAGTCTT+TGG 0.241618 7:+67028813 None:intergenic
TCCAATTTAGCAATAGAATT+TGG 0.285760 7:+67028346 None:intergenic
TATATTTCAGCTTTAGTGTT+AGG 0.289068 7:+67027906 None:intergenic
GGATGTTGCAAGAGAGTATA+TGG 0.297595 7:-67028716 MsG0780039635.01.T01:CDS
GGGTATTTGTAAGGGACTTA+TGG 0.298741 7:-67028939 MsG0780039635.01.T01:CDS
ATGAACCATCTTAGAACTTT+GGG 0.314476 7:-67028115 MsG0780039635.01.T01:CDS
GAAACACTGCCTGAAGGATT+AGG 0.317360 7:-67028211 MsG0780039635.01.T01:CDS
GTGAAACTCTGCTAGATATA+TGG 0.325008 7:-67028429 MsG0780039635.01.T01:CDS
ATCTACTCGCATTGCCTAGA+TGG 0.333025 7:-67027862 MsG0780039635.01.T01:CDS
TAAATAAGTGGGTATTTGTA+AGG 0.340597 7:-67028948 MsG0780039635.01.T01:CDS
TTTGATCATAACTTAACTTC+AGG 0.350941 7:+67028881 None:intergenic
AATGAACCATCTTAGAACTT+TGG 0.360612 7:-67028116 MsG0780039635.01.T01:CDS
ATCAAATTCCCTAATCCTTC+AGG 0.366667 7:+67028202 None:intergenic
TCACTAGCTGTCAAAACATT+AGG 0.377596 7:-67028997 MsG0780039635.01.T01:CDS
AGTTCTCACGCTTGGTGACT+TGG 0.395882 7:+67028486 None:intergenic
AGCAAAACACTGCCTCAAAT+AGG 0.402115 7:+67028852 None:intergenic
CTATCAAAGCTATAGTCTTT+GGG 0.403551 7:+67028814 None:intergenic
AAACACTGCCTGAAGGATTA+GGG 0.412960 7:-67028210 MsG0780039635.01.T01:CDS
TGCACTTTATGTTGGAAAAG+AGG 0.416169 7:-67028605 MsG0780039635.01.T01:CDS
AGCAAGACCCAGTCCTTTGA+TGG 0.427192 7:+67028453 None:intergenic
TCTGCATGAGTTTGAAGACT+TGG 0.431618 7:-67028671 MsG0780039635.01.T01:CDS
TGGGAAAATATTAAGAGGTA+AGG 0.439017 7:+67027997 None:intergenic
TCAAATCATGTACTTTGAAC+TGG 0.439181 7:+67028638 None:intergenic
GTTCTCACGCTTGGTGACTT+GGG 0.440563 7:+67028487 None:intergenic
ATTATTTCCCATCAAAGGAC+TGG 0.444704 7:-67028461 MsG0780039635.01.T01:CDS
TGTTGTATCATGTGGGAGCC+TGG 0.447003 7:-67028023 MsG0780039635.01.T01:CDS
CAAAGCTTGATTTAAATAAG+TGG 0.447932 7:-67028960 MsG0780039635.01.T01:CDS
CATGATCTTGCACTTTATGT+TGG 0.449515 7:-67028613 MsG0780039635.01.T01:CDS
AGCTATAGTCTTTGGGATAG+AGG 0.450398 7:+67028821 None:intergenic
TGTTGGAAAAGAGGAATTTG+TGG 0.459047 7:-67028596 MsG0780039635.01.T01:CDS
CTGAAATATATACACCTTGA+GGG 0.460876 7:-67027893 MsG0780039635.01.T01:CDS
CAAACTCTTTGGATAGCACT+TGG 0.461750 7:-67028781 MsG0780039635.01.T01:CDS
AATAATAAAGTTCTCACGCT+TGG 0.467062 7:+67028478 None:intergenic
ATACAACAAACAATGTTTCA+AGG 0.478460 7:+67028038 None:intergenic
ATCAAATGCCATCCTATTTG+AGG 0.480090 7:-67028864 MsG0780039635.01.T01:CDS
TTGATCATAACTTAACTTCA+GGG 0.486229 7:+67028882 None:intergenic
ACAAACAATGTTTCAAGGGA+TGG 0.500016 7:+67028043 None:intergenic
TTATTTCCCATCAAAGGACT+GGG 0.508681 7:-67028460 MsG0780039635.01.T01:CDS
TATTAAGAGGTAAGGACTCC+AGG 0.508747 7:+67028005 None:intergenic
CTGCATGAGTTTGAAGACTT+GGG 0.509025 7:-67028670 MsG0780039635.01.T01:CDS
AAAGCTTGATTTAAATAAGT+GGG 0.510576 7:-67028959 MsG0780039635.01.T01:CDS
TGGAGTTTGCAAATAGAAGA+GGG 0.511109 7:+67028274 None:intergenic
TAAATCAAGCTTTGAAAACA+AGG 0.511990 7:+67028969 None:intergenic
CAAAACCCAAAGTTCTAAGA+TGG 0.516564 7:+67028110 None:intergenic
CTAAAGCCTTCCATCCATCT+AGG 0.528191 7:+67027848 None:intergenic
AAATAAGTGGGTATTTGTAA+GGG 0.528942 7:-67028947 MsG0780039635.01.T01:CDS
GCTATAGTCTTTGGGATAGA+GGG 0.530359 7:+67028822 None:intergenic
TTCTCACGCTTGGTGACTTG+GGG 0.532416 7:+67028488 None:intergenic
ACTTTATTATTTCCCATCAA+AGG 0.535544 7:-67028466 MsG0780039635.01.T01:CDS
TTGGAGTTTGCAAATAGAAG+AGG 0.542401 7:+67028273 None:intergenic
TCATAACTTAACTTCAGGGC+AGG 0.542524 7:+67028886 None:intergenic
ACTCGCATTGCCTAGATGGA+TGG 0.547796 7:-67027858 MsG0780039635.01.T01:CDS
ATTTAGCAATAGAATTTGGT+AGG 0.548719 7:+67028350 None:intergenic
TTTGTCATTTAGCGGATGCA+CGG 0.563733 7:-67028239 MsG0780039635.01.T01:CDS
GATTAGTTCACTCTCACTCT+CGG 0.566550 7:-67028759 MsG0780039635.01.T01:CDS
GTGACTTGGGGAACAGAACA+TGG 0.577773 7:+67028500 None:intergenic
TACAACAAACAATGTTTCAA+GGG 0.578642 7:+67028039 None:intergenic
ACATTGTTTGTTGTATCATG+TGG 0.580999 7:-67028031 MsG0780039635.01.T01:CDS
CAAACAATGTTTCAAGGGAT+GGG 0.581651 7:+67028044 None:intergenic
CATTGTTTGTTGTATCATGT+GGG 0.584089 7:-67028030 MsG0780039635.01.T01:CDS
GCTGAAATATATACACCTTG+AGG 0.593827 7:-67027894 MsG0780039635.01.T01:CDS
CAGAAAGATCGAGAGCTCGC+AGG 0.594128 7:+67028320 None:intergenic
GCAAGACCCAGTCCTTTGAT+GGG 0.611342 7:+67028454 None:intergenic
AAACACTGCCTCAAATAGGA+TGG 0.615147 7:+67028856 None:intergenic
GAACTTGAAACACTGCCTGA+AGG 0.618268 7:-67028217 MsG0780039635.01.T01:CDS
GGGAACAGAACATGGCCTTG+TGG 0.618893 7:+67028508 None:intergenic
GCATTGCCTAGATGGATGGA+AGG 0.639573 7:-67027854 MsG0780039635.01.T01:CDS
GTTCACTCTCACTCTCGGAA+CGG 0.664556 7:-67028754 MsG0780039635.01.T01:CDS
GAACGGAAGTGAAAAGCTAG+AGG 0.667642 7:-67028737 MsG0780039635.01.T01:CDS
GTTGTTGAAAATAATCCACA+AGG 0.669281 7:-67028523 MsG0780039635.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAAGCTTGATTTAAATAAGT+GGG - Chr7:67027873-67027892 MsG0780039635.01.T01:CDS 20.0%
!!! AATTTTGGGAAAATATTAAG+AGG + Chr7:67028843-67028862 None:intergenic 20.0%
!!! AGGGAATATTTTTTATTTTG+CGG + Chr7:67028542-67028561 None:intergenic 20.0%
!!! ATATGAAGAGTATGTAATTT+TGG + Chr7:67028858-67028877 None:intergenic 20.0%
!!! ATGACAAAAATTCCAAATTT+TGG + Chr7:67028581-67028600 None:intergenic 20.0%
!!! TATGAAGAGTATGTAATTTT+GGG + Chr7:67028857-67028876 None:intergenic 20.0%
!!! TTTGAAGTTTTTATTTAGCA+AGG - Chr7:67028758-67028777 MsG0780039635.01.T01:CDS 20.0%
! AAATAAGTGGGTATTTGTAA+GGG - Chr7:67027885-67027904 MsG0780039635.01.T01:CDS 25.0%
! ACCAAATTCTATTGCTAAAT+TGG - Chr7:67028485-67028504 MsG0780039635.01.T01:CDS 25.0%
! ACTTTATTATTTCCCATCAA+AGG - Chr7:67028366-67028385 MsG0780039635.01.T01:CDS 25.0%
! ATACAACAAACAATGTTTCA+AGG + Chr7:67028797-67028816 None:intergenic 25.0%
! ATTTAGCAATAGAATTTGGT+AGG + Chr7:67028485-67028504 None:intergenic 25.0%
! CAAAGCTTGATTTAAATAAG+TGG - Chr7:67027872-67027891 MsG0780039635.01.T01:CDS 25.0%
! TAAATAAGTGGGTATTTGTA+AGG - Chr7:67027884-67027903 MsG0780039635.01.T01:CDS 25.0%
! TACAACAAACAATGTTTCAA+GGG + Chr7:67028796-67028815 None:intergenic 25.0%
! TATTTGCAAACTCCAAAATT+TGG - Chr7:67028566-67028585 MsG0780039635.01.T01:CDS 25.0%
! TCCAATTTAGCAATAGAATT+TGG + Chr7:67028489-67028508 None:intergenic 25.0%
! TTGATCATAACTTAACTTCA+GGG + Chr7:67027953-67027972 None:intergenic 25.0%
! TTTGATCATAACTTAACTTC+AGG + Chr7:67027954-67027973 None:intergenic 25.0%
!! TATATTTCAGCTTTAGTGTT+AGG + Chr7:67028929-67028948 None:intergenic 25.0%
!!! GTTTTGAAATTCAAACTCTT+TGG - Chr7:67028040-67028059 MsG0780039635.01.T01:CDS 25.0%
!!! TAAATCAAGCTTTGAAAACA+AGG + Chr7:67027866-67027885 None:intergenic 25.0%
!!! TTGGAATTTTTGTCATTTAG+CGG - Chr7:67028585-67028604 MsG0780039635.01.T01:CDS 25.0%
AATAATAAAGTTCTCACGCT+TGG + Chr7:67028357-67028376 None:intergenic 30.0%
AATGAACCATCTTAGAACTT+TGG - Chr7:67028716-67028735 MsG0780039635.01.T01:CDS 30.0%
ACTATCAAAGCTATAGTCTT+TGG + Chr7:67028022-67028041 None:intergenic 30.0%
ATGAACCATCTTAGAACTTT+GGG - Chr7:67028717-67028736 MsG0780039635.01.T01:CDS 30.0%
CTATCAAAGCTATAGTCTTT+GGG + Chr7:67028021-67028040 None:intergenic 30.0%
CTGAAATATATACACCTTGA+GGG - Chr7:67028939-67028958 MsG0780039635.01.T01:CDS 30.0%
GTTGTTGAAAATAATCCACA+AGG - Chr7:67028309-67028328 MsG0780039635.01.T01:CDS 30.0%
TCAAATCATGTACTTTGAAC+TGG + Chr7:67028197-67028216 None:intergenic 30.0%
TGGGAAAATATTAAGAGGTA+AGG + Chr7:67028838-67028857 None:intergenic 30.0%
!! ACATTGTTTGTTGTATCATG+TGG - Chr7:67028801-67028820 MsG0780039635.01.T01:CDS 30.0%
!! CATTGTTTGTTGTATCATGT+GGG - Chr7:67028802-67028821 MsG0780039635.01.T01:CDS 30.0%
ACAAACAATGTTTCAAGGGA+TGG + Chr7:67028792-67028811 None:intergenic 35.0%
ATCAAATGCCATCCTATTTG+AGG - Chr7:67027968-67027987 MsG0780039635.01.T01:CDS 35.0%
ATCAAATTCCCTAATCCTTC+AGG + Chr7:67028633-67028652 None:intergenic 35.0%
ATTATTTCCCATCAAAGGAC+TGG - Chr7:67028371-67028390 MsG0780039635.01.T01:CDS 35.0%
CAAACAATGTTTCAAGGGAT+GGG + Chr7:67028791-67028810 None:intergenic 35.0%
CATGATCTTGCACTTTATGT+TGG - Chr7:67028219-67028238 MsG0780039635.01.T01:CDS 35.0%
GCTGAAATATATACACCTTG+AGG - Chr7:67028938-67028957 MsG0780039635.01.T01:CDS 35.0%
GTAGATCATAAAAACCCTCA+AGG + Chr7:67028956-67028975 None:intergenic 35.0%
GTGAAACTCTGCTAGATATA+TGG - Chr7:67028403-67028422 MsG0780039635.01.T01:CDS 35.0%
TCACTAGCTGTCAAAACATT+AGG - Chr7:67027835-67027854 MsG0780039635.01.T01:CDS 35.0%
TGCACTTTATGTTGGAAAAG+AGG - Chr7:67028227-67028246 MsG0780039635.01.T01:CDS 35.0%
TGGAGTTTGCAAATAGAAGA+GGG + Chr7:67028561-67028580 None:intergenic 35.0%
TGTTGGAAAAGAGGAATTTG+TGG - Chr7:67028236-67028255 MsG0780039635.01.T01:CDS 35.0%
TTATTTCCCATCAAAGGACT+GGG - Chr7:67028372-67028391 MsG0780039635.01.T01:CDS 35.0%
TTGGAGTTTGCAAATAGAAG+AGG + Chr7:67028562-67028581 None:intergenic 35.0%
!! CAAAACCCAAAGTTCTAAGA+TGG + Chr7:67028725-67028744 None:intergenic 35.0%
!! TGACAAGACAGATTGTTTTG+TGG + Chr7:67028679-67028698 None:intergenic 35.0%
AAACACTGCCTCAAATAGGA+TGG + Chr7:67027979-67027998 None:intergenic 40.0%
AAACACTGCCTGAAGGATTA+GGG - Chr7:67028622-67028641 MsG0780039635.01.T01:CDS 40.0%
AGCAAAACACTGCCTCAAAT+AGG + Chr7:67027983-67028002 None:intergenic 40.0%
CAAACTCTTTGGATAGCACT+TGG - Chr7:67028051-67028070 MsG0780039635.01.T01:CDS 40.0%
CTGCATGAGTTTGAAGACTT+GGG - Chr7:67028162-67028181 MsG0780039635.01.T01:CDS 40.0%
GGGTATTTGTAAGGGACTTA+TGG - Chr7:67027893-67027912 MsG0780039635.01.T01:CDS 40.0%
TATTAAGAGGTAAGGACTCC+AGG + Chr7:67028830-67028849 None:intergenic 40.0%
TCATAACTTAACTTCAGGGC+AGG + Chr7:67027949-67027968 None:intergenic 40.0%
TCTGCATGAGTTTGAAGACT+TGG - Chr7:67028161-67028180 MsG0780039635.01.T01:CDS 40.0%
! GATTAGTTCACTCTCACTCT+CGG - Chr7:67028073-67028092 MsG0780039635.01.T01:CDS 40.0%
! GGATGTTGCAAGAGAGTATA+TGG - Chr7:67028116-67028135 MsG0780039635.01.T01:CDS 40.0%
! TTTGTCATTTAGCGGATGCA+CGG - Chr7:67028593-67028612 MsG0780039635.01.T01:CDS 40.0%
!! AGCTATAGTCTTTGGGATAG+AGG + Chr7:67028014-67028033 None:intergenic 40.0%
!! GCTATAGTCTTTGGGATAGA+GGG + Chr7:67028013-67028032 None:intergenic 40.0%
ATCTACTCGCATTGCCTAGA+TGG - Chr7:67028970-67028989 MsG0780039635.01.T01:CDS 45.0%
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GAAACACTGCCTGAAGGATT+AGG - Chr7:67028621-67028640 MsG0780039635.01.T01:CDS 45.0%
GAACGGAAGTGAAAAGCTAG+AGG - Chr7:67028095-67028114 MsG0780039635.01.T01:CDS 45.0%
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ACTCGCATTGCCTAGATGGA+TGG - Chr7:67028974-67028993 MsG0780039635.01.T01:CDS 50.0%
AGCAAGACCCAGTCCTTTGA+TGG + Chr7:67028382-67028401 None:intergenic 50.0%
GCAAGACCCAGTCCTTTGAT+GGG + Chr7:67028381-67028400 None:intergenic 50.0%
GCATTGCCTAGATGGATGGA+AGG - Chr7:67028978-67028997 MsG0780039635.01.T01:CDS 50.0%
GTTCACTCTCACTCTCGGAA+CGG - Chr7:67028078-67028097 MsG0780039635.01.T01:CDS 50.0%
TGTTGTATCATGTGGGAGCC+TGG - Chr7:67028809-67028828 MsG0780039635.01.T01:CDS 50.0%
! AGTTCTCACGCTTGGTGACT+TGG + Chr7:67028349-67028368 None:intergenic 50.0%
! GTGACTTGGGGAACAGAACA+TGG + Chr7:67028335-67028354 None:intergenic 50.0%
! GTTCTCACGCTTGGTGACTT+GGG + Chr7:67028348-67028367 None:intergenic 50.0%
! TTCTCACGCTTGGTGACTTG+GGG + Chr7:67028347-67028366 None:intergenic 50.0%
CAGAAAGATCGAGAGCTCGC+AGG + Chr7:67028515-67028534 None:intergenic 55.0%
! GGGAACAGAACATGGCCTTG+TGG + Chr7:67028327-67028346 None:intergenic 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 67027832 67029022 67027832 ID=MsG0780039635.01;Name=MsG0780039635.01
Chr7 mRNA 67027832 67029022 67027832 ID=MsG0780039635.01.T01;Parent=MsG0780039635.01;Name=MsG0780039635.01.T01;_AED=0.15;_eAED=0.15;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|396
Chr7 exon 67027832 67029022 67027832 ID=MsG0780039635.01.T01:exon:11320;Parent=MsG0780039635.01.T01
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Chr7 exon 67027832 67028881 67027832 ID=MsG0780039635.01.T02:exon:11321;Parent=MsG0780039635.01.T02
Chr7 CDS 67027832 67028881 67027832 ID=MsG0780039635.01.T02:cds;Parent=MsG0780039635.01.T02
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Chr7 exon 67027832 67028719 67027832 ID=MsG0780039635.01.T03:exon:11322;Parent=MsG0780039635.01.T03
Chr7 CDS 67027832 67028719 67027832 ID=MsG0780039635.01.T03:cds;Parent=MsG0780039635.01.T03
Gene Sequence

>MsG0780039635.01.T02

ATGCCATCCTATTTGAGGCAGTGTTTTGCTTACTTTTCCCTCTATCCCAAAGACTATAGCTTTGATAGTTTTGAAATTCAAACTCTTTGGATAGCACTTGGATTAGTTCACTCTCACTCTCGGAACGGAAGTGAAAAGCTAGAGGATGTTGCAAGAGAGTATATGGATGAATTACACTCACTGTCATTTCTGCATGAGTTTGAAGACTTGGGCTATGTTTGCCAGTTCAAAGTACATGATTTGATACATGATCTTGCACTTTATGTTGGAAAAGAGGAATTTGTGGCATTAGATTTGCATACACAAAACATATCTAAGCAAGTAAGACATATTTCAGTTGTTGAAAATAATCCACAAGGCCATGTTCTGTTCCCCAAGTCACCAAGCGTGAGAACTTTATTATTTCCCATCAAAGGACTGGGTCTTGCTAGTGAAACTCTGCTAGATATATGGATATCAAGATACAAATACTTAAGATATTTAGATTTAAGTAATTCTTCATTTGATATCCTACCAAATTCTATTGCTAAATTGGAGCACCTGCGAGCTCTCGATCTTTCTGATAACCGCAAAATAAAAAATATTCCCTCTTCTATTTGCAAACTCCAAAATTTGGAATTTTTGTCATTTAGCGGATGCACGGAACTTGAAACACTGCCTGAAGGATTAGGGAATTTGATCAGTCTGCGACAACTGATTATATCCACAAAACAATCTGTCTTGTCAGATAATGAATTTGCAAGAATGAACCATCTTAGAACTTTGGGTTTTGATTGTTGTCACAATTTGAAGTTTTTATTTAGCAAGGATCAACTCCCATCCCTTGAAACATTGTTTGTTGTATCATGTGGGAGCCTGGAGTCCTTACCTCTTAATATTTTCCCAAAATTACATACTCTTCATATTAGTGACTGTAGATATTTAAACTTGTTGTTGAACAATGAAAGCTCAATCCTAACACTAAAGCTGAAATATATACACCTTGAGGGTTTTTATGATCTACTCGCATTGCCTAGATGGATGGAAGGCTTTAGAGACCTTGATAATTGA

>MsG0780039635.01.T03

ATGGATGAATTACACTCACTGTCATTTCTGCATGAGTTTGAAGACTTGGGCTATGTTTGCCAGTTCAAAGTACATGATTTGATACATGATCTTGCACTTTATGTTGGAAAAGAGGAATTTGTGGCATTAGATTTGCATACACAAAACATATCTAAGCAAGTAAGACATATTTCAGTTGTTGAAAATAATCCACAAGGCCATGTTCTGTTCCCCAAGTCACCAAGCGTGAGAACTTTATTATTTCCCATCAAAGGACTGGGTCTTGCTAGTGAAACTCTGCTAGATATATGGATATCAAGATACAAATACTTAAGATATTTAGATTTAAGTAATTCTTCATTTGATATCCTACCAAATTCTATTGCTAAATTGGAGCACCTGCGAGCTCTCGATCTTTCTGATAACCGCAAAATAAAAAATATTCCCTCTTCTATTTGCAAACTCCAAAATTTGGAATTTTTGTCATTTAGCGGATGCACGGAACTTGAAACACTGCCTGAAGGATTAGGGAATTTGATCAGTCTGCGACAACTGATTATATCCACAAAACAATCTGTCTTGTCAGATAATGAATTTGCAAGAATGAACCATCTTAGAACTTTGGGTTTTGATTGTTGTCACAATTTGAAGTTTTTATTTAGCAAGGATCAACTCCCATCCCTTGAAACATTGTTTGTTGTATCATGTGGGAGCCTGGAGTCCTTACCTCTTAATATTTTCCCAAAATTACATACTCTTCATATTAGTGACTGTAGATATTTAAACTTGTTGTTGAACAATGAAAGCTCAATCCTAACACTAAAGCTGAAATATATACACCTTGAGGGTTTTTATGATCTACTCGCATTGCCTAGATGGATGGAAGGCTTTAGAGACCTTGATAATTGA

>MsG0780039635.01.T01

ATGTCACTAGCTGTCAAAACATTAGGAAGTTCCTTGTTTTCAAAGCTTGATTTAAATAAGTGGGTATTTGTAAGGGACTTATGGAATCTAGAGCAGAAGAAAGATGATATTTTACCTGCCCTGAAGTTAAGTTATGATCAAATGCCATCCTATTTGAGGCAGTGTTTTGCTTACTTTTCCCTCTATCCCAAAGACTATAGCTTTGATAGTTTTGAAATTCAAACTCTTTGGATAGCACTTGGATTAGTTCACTCTCACTCTCGGAACGGAAGTGAAAAGCTAGAGGATGTTGCAAGAGAGTATATGGATGAATTACACTCACTGTCATTTCTGCATGAGTTTGAAGACTTGGGCTATGTTTGCCAGTTCAAAGTACATGATTTGATACATGATCTTGCACTTTATGTTGGAAAAGAGGAATTTGTGGCATTAGATTTGCATACACAAAACATATCTAAGCAAGTAAGACATATTTCAGTTGTTGAAAATAATCCACAAGGCCATGTTCTGTTCCCCAAGTCACCAAGCGTGAGAACTTTATTATTTCCCATCAAAGGACTGGGTCTTGCTAGTGAAACTCTGCTAGATATATGGATATCAAGATACAAATACTTAAGATATTTAGATTTAAGTAATTCTTCATTTGATATCCTACCAAATTCTATTGCTAAATTGGAGCACCTGCGAGCTCTCGATCTTTCTGATAACCGCAAAATAAAAAATATTCCCTCTTCTATTTGCAAACTCCAAAATTTGGAATTTTTGTCATTTAGCGGATGCACGGAACTTGAAACACTGCCTGAAGGATTAGGGAATTTGATCAGTCTGCGACAACTGATTATATCCACAAAACAATCTGTCTTGTCAGATAATGAATTTGCAAGAATGAACCATCTTAGAACTTTGGGTTTTGATTGTTGTCACAATTTGAAGTTTTTATTTAGCAAGGATCAACTCCCATCCCTTGAAACATTGTTTGTTGTATCATGTGGGAGCCTGGAGTCCTTACCTCTTAATATTTTCCCAAAATTACATACTCTTCATATTAGTGACTGTAGATATTTAAACTTGTTGTTGAACAATGAAAGCTCAATCCTAACACTAAAGCTGAAATATATACACCTTGAGGGTTTTTATGATCTACTCGCATTGCCTAGATGGATGGAAGGCTTTAGAGACCTTGATAATTGA
Protein sequence

>MsG0780039635.01.T02

MPSYLRQCFAYFSLYPKDYSFDSFEIQTLWIALGLVHSHSRNGSEKLEDVAREYMDELHSLSFLHEFEDLGYVCQFKVHDLIHDLALYVGKEEFVALDLHTQNISKQVRHISVVENNPQGHVLFPKSPSVRTLLFPIKGLGLASETLLDIWISRYKYLRYLDLSNSSFDILPNSIAKLEHLRALDLSDNRKIKNIPSSICKLQNLEFLSFSGCTELETLPEGLGNLISLRQLIISTKQSVLSDNEFARMNHLRTLGFDCCHNLKFLFSKDQLPSLETLFVVSCGSLESLPLNIFPKLHTLHISDCRYLNLLLNNESSILTLKLKYIHLEGFYDLLALPRWMEGFRDLDN*

>MsG0780039635.01.T03

MDELHSLSFLHEFEDLGYVCQFKVHDLIHDLALYVGKEEFVALDLHTQNISKQVRHISVVENNPQGHVLFPKSPSVRTLLFPIKGLGLASETLLDIWISRYKYLRYLDLSNSSFDILPNSIAKLEHLRALDLSDNRKIKNIPSSICKLQNLEFLSFSGCTELETLPEGLGNLISLRQLIISTKQSVLSDNEFARMNHLRTLGFDCCHNLKFLFSKDQLPSLETLFVVSCGSLESLPLNIFPKLHTLHISDCRYLNLLLNNESSILTLKLKYIHLEGFYDLLALPRWMEGFRDLDN*

>MsG0780039635.01.T01

MSLAVKTLGSSLFSKLDLNKWVFVRDLWNLEQKKDDILPALKLSYDQMPSYLRQCFAYFSLYPKDYSFDSFEIQTLWIALGLVHSHSRNGSEKLEDVAREYMDELHSLSFLHEFEDLGYVCQFKVHDLIHDLALYVGKEEFVALDLHTQNISKQVRHISVVENNPQGHVLFPKSPSVRTLLFPIKGLGLASETLLDIWISRYKYLRYLDLSNSSFDILPNSIAKLEHLRALDLSDNRKIKNIPSSICKLQNLEFLSFSGCTELETLPEGLGNLISLRQLIISTKQSVLSDNEFARMNHLRTLGFDCCHNLKFLFSKDQLPSLETLFVVSCGSLESLPLNIFPKLHTLHISDCRYLNLLLNNESSILTLKLKYIHLEGFYDLLALPRWMEGFRDLDN*