AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780039676.01

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MsG0780039676.01.T01 AT5G18610 32.890 301 176 9 44 321 71 368 1.71e-36 140
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MsG0780039676.01.T01 AT2G20300 28.963 328 189 8 40 348 333 635 3.86e-34 136
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MsG0780039676.01.T01 AT1G61360 28.161 348 202 11 8 320 363 697 6.46e-34 135
MsG0780039676.01.T01 AT1G61360 28.161 348 202 11 8 320 363 697 6.46e-34 135
MsG0780039676.01.T01 AT1G61550 29.814 322 190 10 31 323 464 778 7.17e-34 135
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MsG0780039676.01.T01 AT5G16500 29.722 360 202 11 30 349 48 396 1.05e-33 134
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MsG0780039676.01.T01 AT4G23240 26.897 290 188 5 43 311 15 301 1.51e-33 129
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MsG0780039676.01.T01 AT3G09830 27.181 298 184 9 40 307 68 362 2.19e-30 122
MsG0780039676.01.T01 AT1G24030 29.167 288 175 6 49 310 1 285 2.64e-30 119
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MsG0780039676.01.T01 AT4G11470 27.703 296 186 7 39 311 322 612 3.69e-30 124
MsG0780039676.01.T01 AT4G21390 30.420 286 177 5 44 310 517 799 3.82e-30 124
MsG0780039676.01.T01 AT1G52290 29.577 213 140 3 44 249 131 340 4.14e-30 120
MsG0780039676.01.T01 AT4G23190 31.950 241 149 5 27 258 324 558 4.32e-30 123
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MsG0780039676.01.T01 AT5G18500 27.526 287 185 6 44 310 154 437 9.28e-28 115
MsG0780039676.01.T01 AT5G18500 27.526 287 185 6 44 310 154 437 9.28e-28 115
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MsG0780039676.01.T01 AT1G55200 25.926 297 188 5 38 310 361 649 1.72e-26 113
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MsG0780039676.01.T01 AT5G01950 29.452 292 181 9 42 313 612 898 1.91e-26 113
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MsG0780039676.01.T01 AT5G42440 27.010 311 199 9 25 313 51 355 3.89e-26 109
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MsG0780039676.01.T01 AT2G39110 27.778 252 157 7 84 310 121 372 4.05e-26 110
MsG0780039676.01.T01 AT1G54820 28.713 303 175 11 12 281 105 399 4.14e-26 110
MsG0780039676.01.T01 AT4G31110 25.862 290 191 7 42 310 439 725 4.64e-26 112
MsG0780039676.01.T01 AT1G11303 25.623 281 193 5 44 311 497 774 4.76e-26 112
MsG0780039676.01.T01 AT5G51560 28.920 287 184 10 40 311 393 674 5.03e-26 111
MsG0780039676.01.T01 AT5G11020 29.225 284 178 9 49 313 73 352 5.82e-26 108
MsG0780039676.01.T01 AT3G59700 31.200 250 153 7 34 274 318 557 6.05e-26 111
MsG0780039676.01.T01 AT5G55830 26.647 334 217 9 1 310 310 639 6.58e-26 111
MsG0780039676.01.T01 AT5G11020 29.225 284 178 9 49 313 96 375 7.10e-26 109
MsG0780039676.01.T01 AT3G09010 30.556 216 138 5 42 248 32 244 7.27e-26 107
MsG0780039676.01.T01 AT5G11020 29.225 284 178 9 49 313 100 379 7.46e-26 109
MsG0780039676.01.T01 AT5G11020 29.930 284 176 10 49 313 134 413 7.68e-26 109
MsG0780039676.01.T01 AT1G26150 28.638 213 142 3 44 249 418 627 8.41e-26 110
MsG0780039676.01.T01 AT2G19130 28.000 300 186 9 34 310 474 766 8.67e-26 111
MsG0780039676.01.T01 AT4G29450 28.333 300 179 8 42 310 554 848 8.92e-26 111
MsG0780039676.01.T01 AT1G24030 30.508 236 141 4 98 310 13 248 9.66e-26 106
MsG0780039676.01.T01 AT4G35030 28.136 295 183 9 42 312 90 379 1.00e-25 108
MsG0780039676.01.T01 AT4G13190 33.493 209 117 6 135 321 1 209 1.00e-25 105
MsG0780039676.01.T01 AT4G13190 33.493 209 117 6 135 321 1 209 1.00e-25 105
MsG0780039676.01.T01 AT5G54380 27.778 288 186 7 42 310 496 780 1.06e-25 110
MsG0780039676.01.T01 AT5G60300 28.322 286 181 8 44 310 332 612 1.13e-25 110
MsG0780039676.01.T01 AT5G60300 28.322 286 181 8 44 310 332 612 1.13e-25 110
MsG0780039676.01.T01 AT3G51990 28.947 304 188 11 37 318 40 337 1.20e-25 107
MsG0780039676.01.T01 AT4G23130 27.347 245 164 5 23 258 313 552 1.28e-25 110
MsG0780039676.01.T01 AT2G45340 29.210 291 183 9 44 316 405 690 1.32e-25 110
MsG0780039676.01.T01 AT1G21250 26.910 301 195 8 38 316 388 685 1.33e-25 110
MsG0780039676.01.T01 AT3G59350 26.490 302 190 10 44 317 59 356 1.34e-25 107
MsG0780039676.01.T01 AT4G23140 26.073 303 201 6 49 331 344 643 1.44e-25 110
MsG0780039676.01.T01 AT4G35030 28.669 293 180 9 42 310 90 377 1.64e-25 108
MsG0780039676.01.T01 AT4G35030 28.669 293 180 9 42 310 90 377 1.64e-25 108
MsG0780039676.01.T01 AT4G35030 28.669 293 180 9 42 310 90 377 1.64e-25 108
MsG0780039676.01.T01 AT4G35030 28.669 293 180 9 42 310 90 377 1.64e-25 108
MsG0780039676.01.T01 AT5G61350 28.669 293 182 10 42 310 511 800 1.69e-25 110
MsG0780039676.01.T01 AT5G60300 28.322 286 181 8 44 310 332 612 1.95e-25 110
MsG0780039676.01.T01 AT3G59350 26.490 302 190 10 44 317 116 413 1.96e-25 108
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MsG0780039676.01.T01 AT1G21270 26.403 303 196 8 38 317 383 681 2.25e-25 109
MsG0780039676.01.T01 AT4G33430 26.962 293 188 7 41 310 274 563 2.33e-25 109
MsG0780039676.01.T01 AT1G56145 25.397 315 180 7 44 310 675 982 2.37e-25 110
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MsG0780039676.01.T01 AT2G28250 28.889 315 189 11 34 317 189 499 2.65e-25 109
MsG0780039676.01.T01 AT2G28250 28.889 315 189 11 34 317 189 499 2.65e-25 109
MsG0780039676.01.T01 AT2G28250 28.889 315 189 11 34 317 189 499 2.65e-25 109
MsG0780039676.01.T01 AT2G28250 28.889 315 189 11 34 317 189 499 2.65e-25 109
MsG0780039676.01.T01 AT2G28250 28.889 315 189 11 34 317 189 499 2.65e-25 109
MsG0780039676.01.T01 AT2G28250 28.889 315 189 11 34 317 189 499 2.65e-25 109
MsG0780039676.01.T01 AT3G13380 27.213 305 189 11 41 318 843 1141 2.78e-25 110
MsG0780039676.01.T01 AT3G59350 26.490 302 190 10 44 317 101 398 2.84e-25 107
MsG0780039676.01.T01 AT3G59350 26.490 302 190 10 44 317 101 398 2.84e-25 107
MsG0780039676.01.T01 AT2G13800 26.962 293 188 7 41 310 143 432 2.88e-25 108
MsG0780039676.01.T01 AT2G13800 26.962 293 188 7 41 310 143 432 2.88e-25 108
MsG0780039676.01.T01 AT5G38210 30.464 302 168 10 44 316 342 630 2.90e-25 109
MsG0780039676.01.T01 AT1G51790 26.730 318 206 9 29 326 551 861 2.96e-25 109

Find 120 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 394 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
AAGCTATATATTACACTTTC+TGG 0.168273 7:-67446021 None:intergenic
CTTCAATCTGTTTCTTTGTC+TGG 0.168309 7:+67447920 MsG0780039676.01.T01:CDS
CTGATTTAAGTGTATCAAAA+TGG 0.205133 7:+67442942 MsG0780039676.01.T01:exon
GCTCCAAATGTTGTTTATAA+AGG 0.215212 7:+67443257 MsG0780039676.01.T01:CDS
TCCAAGCCTACCCAATAAAA+AGG 0.230353 7:-67448166 None:intergenic
AATCCTAGGCTTTCAAGTTT+TGG 0.260615 7:+67444852 MsG0780039676.01.T01:CDS
TTAGAAGAAGAAGCTTAAAA+AGG 0.271597 7:+67441968 MsG0780039676.01.T01:five_prime_UTR
GCCACTATCGACTTTGTATT+AGG 0.291441 7:-67446489 None:intergenic
CATCTGGGTTGAAGAATTAC+TGG 0.294707 7:+67441731 MsG0780039676.01.T01:five_prime_UTR
CAATGATGGACCTTCATTTC+GGG 0.302105 7:+67443157 MsG0780039676.01.T01:CDS
CATGAAGTTCTCGAAAATAT+TGG 0.304628 7:+67446929 MsG0780039676.01.T01:CDS
TTCCCTTTATAAACAACATT+TGG 0.311801 7:-67443260 None:intergenic
CCAATGATGGACCTTCATTT+CGG 0.317696 7:+67443156 MsG0780039676.01.T01:CDS
AGAAGAATGATGAAGAAGAT+AGG 0.323130 7:-67441601 None:intergenic
CTCCAAATGTTGTTTATAAA+GGG 0.341966 7:+67443258 MsG0780039676.01.T01:CDS
TTACCAGCATCTGGAACTTC+AGG 0.346647 7:-67443024 None:intergenic
TATTTATTTGCTTCTCCAAC+AGG 0.353828 7:+67448241 MsG0780039676.01.T01:three_prime_UTR
CACAAGTAATTTCCCCTCTA+TGG 0.356494 7:+67447882 MsG0780039676.01.T01:CDS
AGGCTTGGATGTTGTTTGTT+TGG 0.356653 7:+67448180 MsG0780039676.01.T01:three_prime_UTR
TTCAATCTGTTTCTTTGTCT+GGG 0.359687 7:+67447921 MsG0780039676.01.T01:CDS
GGGATTCTCAACCGATGAAA+TGG 0.360478 7:+67444629 MsG0780039676.01.T01:CDS
CGTCCCTACTATTCTTCATA+AGG 0.365077 7:-67444875 None:intergenic
TTGGCCTTATGAAGAATAGT+AGG 0.368826 7:+67444871 MsG0780039676.01.T01:CDS
CGAAGCGCAAGTCGCACTTA+TGG 0.379094 7:+67447958 MsG0780039676.01.T01:CDS
TGATTTAAGTGTATCAAAAT+GGG 0.383334 7:+67442943 MsG0780039676.01.T01:exon
ATAGAACTCTATATGCATTA+AGG 0.389110 7:-67444732 None:intergenic
GATTCCTTCCCACTCATTGA+TGG 0.389358 7:+67446826 MsG0780039676.01.T01:intron
TCTGTTTCTTTGTCTGGGCT+AGG 0.389400 7:+67447926 MsG0780039676.01.T01:CDS
TCTATGAAACTCTAACATAT+TGG 0.399963 7:-67442829 None:intergenic
AAACGAGGATTGTTGTTAAG+AGG 0.421429 7:+67443294 MsG0780039676.01.T01:CDS
AAAGTCGATAGTGGCTGCTT+TGG 0.425243 7:+67446497 MsG0780039676.01.T01:CDS
AATGCTCACAGATTCTTGTC+TGG 0.425641 7:+67446386 MsG0780039676.01.T01:CDS
TCAGCTTCGTAGCGAAAGAT+TGG 0.426345 7:+67443984 MsG0780039676.01.T01:CDS
AATGTGATAATAAATATGTT+AGG 0.427669 7:+67448269 MsG0780039676.01.T01:three_prime_UTR
CTGTTTCTTTGTCTGGGCTA+GGG 0.432369 7:+67447927 MsG0780039676.01.T01:CDS
GAAGAATGATGAAGAAGATA+GGG 0.446280 7:-67441600 None:intergenic
TATATTCTCAACATTAAAAC+CGG 0.449778 7:-67443213 None:intergenic
TGTTGTTTATAAAGGGAAGA+TGG 0.462950 7:+67443265 MsG0780039676.01.T01:CDS
GCTGCTTCGTTGTCCCCACT+TGG 0.465678 7:+67446872 MsG0780039676.01.T01:CDS
ATATGATTCACAGGCATTTG+TGG 0.466839 7:+67442769 MsG0780039676.01.T01:intron
GAAAGATTGGCAAATTTGCT+TGG 0.469024 7:+67443997 MsG0780039676.01.T01:CDS
TTCTGCATCATGATCTGCAT+TGG 0.473213 7:+67448066 MsG0780039676.01.T01:three_prime_UTR
TTCTTTGTCTGGGCTAGGGA+TGG 0.473790 7:+67447931 MsG0780039676.01.T01:CDS
AGTGGAGTGAATGCTGTATT+CGG 0.475513 7:+67442867 MsG0780039676.01.T01:five_prime_UTR
TTTAATATTTATCTTCATCT+GGG 0.478831 7:+67441716 MsG0780039676.01.T01:five_prime_UTR
CCGAAATGAAGGTCCATCAT+TGG 0.479363 7:-67443156 None:intergenic
ATGCATTAAGGTCATGATAG+AGG 0.482314 7:-67444720 None:intergenic
ACCTAATACAAAGTCGATAG+TGG 0.484922 7:+67446488 MsG0780039676.01.T01:CDS
CACATCATTAAAAGTGGAAG+AGG 0.485229 7:+67442902 MsG0780039676.01.T01:five_prime_UTR
ACGAGCTATTACAGTGGAAA+AGG 0.486571 7:-67444089 None:intergenic
TTCTGTCGCGAATCAAATCA+AGG 0.487912 7:-67446356 None:intergenic
AGTCGCATTGCCCATTTCAT+CGG 0.489642 7:-67444640 None:intergenic
TTTGTATTAGGTCGTTCTCT+AGG 0.495550 7:-67446477 None:intergenic
CCTCCAGAGTATCTCAGAAC+TGG 0.497952 7:+67444930 MsG0780039676.01.T01:CDS
ATTTACAGGACGGTAATCCT+AGG 0.500073 7:+67444838 MsG0780039676.01.T01:intron
CAACTTAATAACGCAACGTC+CGG 0.500143 7:+67443194 MsG0780039676.01.T01:CDS
GGATTCTCAACCGATGAAAT+GGG 0.503582 7:+67444630 MsG0780039676.01.T01:CDS
AGTTTCTGAACATGGAGAAA+AGG 0.506089 7:+67443235 MsG0780039676.01.T01:CDS
AACGTAAATTCCCGAAATGA+AGG 0.506432 7:-67443167 None:intergenic
AAATAACACATCATTAAAAG+TGG 0.509179 7:+67442896 MsG0780039676.01.T01:five_prime_UTR
CTGCGACGTGCGTGAACAGT+TGG 0.511715 7:-67447803 None:intergenic
ATTGGTTATAAAGATGATGA+TGG 0.515854 7:+67446947 MsG0780039676.01.T01:CDS
CAGCAATAGTAGCACTATGT+TGG 0.516333 7:-67446853 None:intergenic
AATAAGATGACTTACATGAC+TGG 0.525733 7:-67446088 None:intergenic
CACATGTAGTTCATTGACGT+TGG 0.526631 7:+67447767 MsG0780039676.01.T01:intron
AGGCCAAAACTTGAAAGCCT+AGG 0.526765 7:-67444855 None:intergenic
GAAAGTGTAATATATAGCTT+CGG 0.527713 7:+67446024 MsG0780039676.01.T01:CDS
ATTCCTTCCCACTCATTGAT+GGG 0.531514 7:+67446827 MsG0780039676.01.T01:CDS
GTTCCTGAAGTTCCAGATGC+TGG 0.531923 7:+67443021 MsG0780039676.01.T01:CDS
TAAGACGCAATGTGCCATAG+AGG 0.538706 7:-67447896 None:intergenic
AATAGAATTGAGACCAATGA+TGG 0.540362 7:+67443143 MsG0780039676.01.T01:CDS
CTTGAGGCATGTCGTTAATG+AGG 0.541668 7:-67447835 None:intergenic
TGCATTAAGGTCATGATAGA+GGG 0.542543 7:-67444719 None:intergenic
AGAGGTTTAACAGAAGTGCT+TGG 0.543317 7:+67443312 MsG0780039676.01.T01:CDS
TGGCCTTATGAAGAATAGTA+GGG 0.544419 7:+67444872 MsG0780039676.01.T01:CDS
ACACCAGTTCTGAGATACTC+TGG 0.545585 7:-67444933 None:intergenic
GTTCATTGACGTTGGAACAA+TGG 0.546971 7:+67447775 MsG0780039676.01.T01:intron
GGATATGCTTCCCACTAAGA+AGG 0.548057 7:-67446062 None:intergenic
AGCGCAAGTCGCACTTATGG+AGG 0.557584 7:+67447961 MsG0780039676.01.T01:CDS
GAGAAACGAAACACACCTAC+CGG 0.558663 7:+67447998 MsG0780039676.01.T01:CDS
TTCATTTCGGGAATTTACGT+TGG 0.562106 7:+67443169 MsG0780039676.01.T01:CDS
ACTGTAGGAGGAAGCTAGAT+CGG 0.562397 7:+67443957 MsG0780039676.01.T01:intron
TGGCGATGCATGTTCAAGAA+AGG 0.562859 7:+67446892 MsG0780039676.01.T01:CDS
GCGTCGTTCATTGCTTCTTG+AGG 0.565029 7:-67447851 None:intergenic
AAGACGCAATGTGCCATAGA+GGG 0.566632 7:-67447895 None:intergenic
TATTACAGATATATGAGCGC+TGG 0.568916 7:+67442800 MsG0780039676.01.T01:five_prime_UTR
CTAGAATACTGCACAAGCAA+TGG 0.569762 7:+67444691 MsG0780039676.01.T01:CDS
CACACAACATGGTATCAAGC+TGG 0.570012 7:-67442977 None:intergenic
CTCACAGATTCTTGTCTGGA+AGG 0.570145 7:+67446390 MsG0780039676.01.T01:CDS
TGGGACTGAGTTGGTGCGGT+TGG 0.577316 7:+67446431 MsG0780039676.01.T01:CDS
GAATGATTTGATGAGTGAGT+TGG 0.580016 7:+67448130 MsG0780039676.01.T01:three_prime_UTR
TGATGATGGAGTGGCAAATG+AGG 0.580841 7:+67446961 MsG0780039676.01.T01:CDS
TTGAACATGCATCGCCAAGT+GGG 0.591495 7:-67446886 None:intergenic
TGAAGATGATGGGACTGAGT+TGG 0.594598 7:+67446422 MsG0780039676.01.T01:CDS
CTTGAACATGCATCGCCAAG+TGG 0.598699 7:-67446887 None:intergenic
ATAAGATGACTTACATGACT+GGG 0.602944 7:-67446087 None:intergenic
CAGCTTGATACCATGTTGTG+TGG 0.603291 7:+67442978 MsG0780039676.01.T01:CDS
ACTTGTGAGTCCACACAACA+TGG 0.604330 7:-67442988 None:intergenic
TAGGAGGAAGCTAGATCGGT+CGG 0.610913 7:+67443961 MsG0780039676.01.T01:intron
GATTTAAGTGTATCAAAATG+GGG 0.611726 7:+67442944 MsG0780039676.01.T01:exon
TTGGATACCCATCAATGAGT+GGG 0.612281 7:-67446834 None:intergenic
GTTGGATACCCATCAATGAG+TGG 0.621467 7:-67446835 None:intergenic
GCGCAAGTCGCACTTATGGA+GGG 0.632128 7:+67447962 MsG0780039676.01.T01:CDS
ATATAGAGTTCTATTTGATG+AGG 0.635338 7:+67444741 MsG0780039676.01.T01:CDS
GAGAATATAGTTTCTGAACA+TGG 0.635340 7:+67443227 MsG0780039676.01.T01:CDS
TGAACATGCATCGCCAAGTG+GGG 0.636504 7:-67446885 None:intergenic
TCTGTCGCGAATCAAATCAA+GGG 0.644082 7:-67446355 None:intergenic
ACTTATGGAGGGAACAACGC+TGG 0.646564 7:+67447973 MsG0780039676.01.T01:CDS
CTTATGAAGAATAGTAGGGA+CGG 0.649835 7:+67444876 MsG0780039676.01.T01:CDS
GATGACTTACATGACTGGGA+GGG 0.664851 7:-67446083 None:intergenic
ATACCCATCAATGAGTGGGA+AGG 0.665147 7:-67446830 None:intergenic
AGACGCAATGTGCCATAGAG+GGG 0.665835 7:-67447894 None:intergenic
GTTGTTGTGAAGACGATGAG+AGG 0.666603 7:+67444022 MsG0780039676.01.T01:CDS
AGAGTCTGTGTGTAGCTGAG+TGG 0.673767 7:+67442849 MsG0780039676.01.T01:five_prime_UTR
AGATGACTTACATGACTGGG+AGG 0.678619 7:-67446084 None:intergenic
ATGATGGGACTGAGTTGGTG+CGG 0.694282 7:+67446427 MsG0780039676.01.T01:CDS
AGACGATGAGAGGTTGCTTG+TGG 0.695750 7:+67444032 MsG0780039676.01.T01:CDS
TTATAAAGATGATGATGGAG+TGG 0.699043 7:+67446952 MsG0780039676.01.T01:CDS
GGAAGATGGAGAATCAAACG+AGG 0.704081 7:+67443279 MsG0780039676.01.T01:CDS
CCAGTTCTGAGATACTCTGG+AGG 0.730233 7:-67444930 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
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!! AATAATATGTTAATATTTAC+AGG + Chr7:67444824-67444843 MsG0780039676.01.T01:intron 10.0%
!! TACATATAAATATACAAATA+TGG - Chr7:67446301-67446320 None:intergenic 10.0%
!! TAGTATAATAATAAAGTAAT+TGG + Chr7:67447627-67447646 MsG0780039676.01.T01:intron 10.0%
!!! TTAGATATTTTATTTTTGTA+TGG + Chr7:67442184-67442203 MsG0780039676.01.T01:intron 10.0%
!! ATTCATAATAGTCAATAAAA+TGG + Chr7:67443826-67443845 MsG0780039676.01.T01:intron 15.0%
!! TTGATTAAAAAAATAGTTCA+AGG - Chr7:67445433-67445452 None:intergenic 15.0%
!! TTTAATATTTATCTTCATCT+GGG + Chr7:67441716-67441735 MsG0780039676.01.T01:five_prime_UTR 15.0%
!!! ATTTTATTTTTGTATGGTTT+TGG + Chr7:67442190-67442209 MsG0780039676.01.T01:intron 15.0%
!!! ATTTTGAGAGATATATTAAA+AGG - Chr7:67447007-67447026 None:intergenic 15.0%
!!! CTATCTTTTCAAATTATTAT+CGG + Chr7:67442629-67442648 MsG0780039676.01.T01:intron 15.0%
!!! TGGTAAATATTTTTATCAAT+TGG - Chr7:67446224-67446243 None:intergenic 15.0%
!!! TTCATTTTTTTATTGATCAT+CGG + Chr7:67444210-67444229 MsG0780039676.01.T01:intron 15.0%
!!! TTTTAATATTTATCTTCATC+TGG + Chr7:67441715-67441734 MsG0780039676.01.T01:five_prime_UTR 15.0%
!!! TTTTATTTTTGTATGGTTTT+GGG + Chr7:67442191-67442210 MsG0780039676.01.T01:intron 15.0%
!! AAAAAATTGAATTGTGATGA+TGG - Chr7:67444295-67444314 None:intergenic 20.0%
!! AAAAAGTTATAGCACAAATT+TGG + Chr7:67444899-67444918 MsG0780039676.01.T01:CDS 20.0%
!! AAAATTTAGTACAGAATCTA+TGG + Chr7:67442432-67442451 MsG0780039676.01.T01:intron 20.0%
!! AAATAACACATCATTAAAAG+TGG + Chr7:67442896-67442915 MsG0780039676.01.T01:five_prime_UTR 20.0%
!! AATAAGTACTTTCCTTAAAA+TGG - Chr7:67444342-67444361 None:intergenic 20.0%
!! ACATTAAACTCTCATTAAAT+AGG - Chr7:67447717-67447736 None:intergenic 20.0%
!! ACTTTATGTTTAATCTAAGT+TGG - Chr7:67445141-67445160 None:intergenic 20.0%
!! ATATGTTAATATTTACAGGA+CGG + Chr7:67444828-67444847 MsG0780039676.01.T01:intron 20.0%
!! CTCAAGAATCAATTTATAAT+AGG + Chr7:67445300-67445319 MsG0780039676.01.T01:intron 20.0%
!! GTCAAATAACAGTTTAAAAA+AGG + Chr7:67445068-67445087 MsG0780039676.01.T01:intron 20.0%
!! TAATATATTCCGTTATAAGA+AGG + Chr7:67445718-67445737 MsG0780039676.01.T01:intron 20.0%
!! TATATTCTCAACATTAAAAC+CGG - Chr7:67443216-67443235 None:intergenic 20.0%
!! TGATTTAAGTGTATCAAAAT+GGG + Chr7:67442943-67442962 MsG0780039676.01.T01:exon 20.0%
!!! AAAATTTTCCAAATAGTTTG+AGG - Chr7:67445344-67445363 None:intergenic 20.0%
!!! AAATCATTTAAAATTTTGGG+AGG - Chr7:67445490-67445509 None:intergenic 20.0%
!!! ATACCTGATTTGAATTTTTT+TGG + Chr7:67446326-67446345 MsG0780039676.01.T01:intron 20.0%
!!! ATTGTTAGTAGTTTGTAATT+AGG - Chr7:67445624-67445643 None:intergenic 20.0%
!!! CATATCATTTTTTCCTTTAT+AGG - Chr7:67442303-67442322 None:intergenic 20.0%
!!! GTTCTAAACTTCAAAAAATT+TGG - Chr7:67445575-67445594 None:intergenic 20.0%
!!! TATAAATTGATTCTTGAGTA+TGG - Chr7:67445298-67445317 None:intergenic 20.0%
!!! TATGCAAAGAAATAATTTTG+AGG + Chr7:67444410-67444429 MsG0780039676.01.T01:intron 20.0%
!!! TTATTTTTTTTATCAGCTTC+AGG + Chr7:67441934-67441953 MsG0780039676.01.T01:five_prime_UTR 20.0%
!!! TTCTTATAACGGAATATATT+AGG - Chr7:67445719-67445738 None:intergenic 20.0%
!!! TTGTTAGTAGTTTGTAATTA+GGG - Chr7:67445623-67445642 None:intergenic 20.0%
!!! TTTATTTTTGTATGGTTTTG+GGG + Chr7:67442192-67442211 MsG0780039676.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTGTTTTAGTTAAGGTAAA+TGG - Chr7:67442741-67442760 None:intergenic 20.0%
!!! TTTTCTTATGTAACCAAAAA+AGG + Chr7:67445221-67445240 MsG0780039676.01.T01:intron 20.0%
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! AAGCTATATATTACACTTTC+TGG - Chr7:67446024-67446043 None:intergenic 25.0%
! ACAAACTACTAACAATTTCA+GGG + Chr7:67445628-67445647 MsG0780039676.01.T01:intron 25.0%
! ACAAATTATTCGAGAGTTTA+GGG - Chr7:67445522-67445541 None:intergenic 25.0%
! ACTAAATTGTAAGCAAAAAG+GGG + Chr7:67447202-67447221 MsG0780039676.01.T01:intron 25.0%
! ACTTCAATACTTCATATTGA+AGG + Chr7:67442507-67442526 MsG0780039676.01.T01:intron 25.0%
! AGAAATTATTCAAGAGTTCA+GGG - Chr7:67445458-67445477 None:intergenic 25.0%
! ATAGAACTCTATATGCATTA+AGG - Chr7:67444735-67444754 None:intergenic 25.0%
! ATATAGAGTTCTATTTGATG+AGG + Chr7:67444741-67444760 MsG0780039676.01.T01:CDS 25.0%
! ATATTCCTACTTACATATCT+TGG + Chr7:67446693-67446712 MsG0780039676.01.T01:intron 25.0%
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! ATTGGTTATAAAGATGATGA+TGG + Chr7:67446947-67446966 MsG0780039676.01.T01:CDS 25.0%
! CACAAGAATTGAAAGTTTAA+GGG - Chr7:67443402-67443421 None:intergenic 25.0%
! CACTAAATTGTAAGCAAAAA+GGG + Chr7:67447201-67447220 MsG0780039676.01.T01:intron 25.0%
! CATATTATGCCTTCTTATAA+CGG - Chr7:67445730-67445749 None:intergenic 25.0%
! CTCTTGAATAATTTCTAACT+AGG + Chr7:67445462-67445481 MsG0780039676.01.T01:intron 25.0%
! CTGATTTAAGTGTATCAAAA+TGG + Chr7:67442942-67442961 MsG0780039676.01.T01:exon 25.0%
! CTTTCAATTATTCAAGCTTA+GGG - Chr7:67443672-67443691 None:intergenic 25.0%
! GAAATTAGTAGGAAATATCT+TGG - Chr7:67446800-67446819 None:intergenic 25.0%
! GAATCTAGAAAGAAATTAGT+AGG - Chr7:67446811-67446830 None:intergenic 25.0%
! GATTTAAGTGTATCAAAATG+GGG + Chr7:67442944-67442963 MsG0780039676.01.T01:exon 25.0%
! GTCATATTTCTTTAATGCTA+TGG + Chr7:67444956-67444975 MsG0780039676.01.T01:intron 25.0%
! GTTAAAAACGTATTAAGAAG+TGG - Chr7:67444780-67444799 None:intergenic 25.0%
! TAAACTCTCATTAAATAGGA+AGG - Chr7:67447713-67447732 None:intergenic 25.0%
! TAAATACTTCAGACAAATTC+AGG - Chr7:67445403-67445422 None:intergenic 25.0%
! TACAAACTACTAACAATTTC+AGG + Chr7:67445627-67445646 MsG0780039676.01.T01:intron 25.0%
! TACAAATTATTCGAGAGTTT+AGG - Chr7:67445523-67445542 None:intergenic 25.0%
! TAGAAATTATTCAAGAGTTC+AGG - Chr7:67445459-67445478 None:intergenic 25.0%
! TATGCATCAATATGTTTATG+TGG + Chr7:67447603-67447622 MsG0780039676.01.T01:intron 25.0%
! TATGGATACTAAATGAAACA+TGG - Chr7:67446283-67446302 None:intergenic 25.0%
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! TCTATGAAACTCTAACATAT+TGG - Chr7:67442832-67442851 None:intergenic 25.0%
! TTAGAAGAAGAAGCTTAAAA+AGG + Chr7:67441968-67441987 MsG0780039676.01.T01:five_prime_UTR 25.0%
! TTCCCTTTATAAACAACATT+TGG - Chr7:67443263-67443282 None:intergenic 25.0%
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!! ACTCTCGAATAATTTGTATT+TGG + Chr7:67445525-67445544 MsG0780039676.01.T01:intron 25.0%
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!! TATTTTTCTATGCGAAAATG+TGG + Chr7:67441855-67441874 MsG0780039676.01.T01:five_prime_UTR 25.0%
!! TCATAATGTTCACCATTTTA+AGG + Chr7:67444327-67444346 MsG0780039676.01.T01:intron 25.0%
!! TTAAACTGTTATTTGACACA+CGG - Chr7:67445065-67445084 None:intergenic 25.0%
!! TTATCACATTATTTTCCTGT+TGG - Chr7:67448259-67448278 None:intergenic 25.0%
!! TTTGTTATGAGTCAATACTA+AGG + Chr7:67444234-67444253 MsG0780039676.01.T01:intron 25.0%
!!! AATGTTTTAAAAAGCAAACC+AGG - Chr7:67447527-67447546 None:intergenic 25.0%
!!! AGAAAGCTTTGTTTTAGTTA+AGG - Chr7:67442748-67442767 None:intergenic 25.0%
!!! ATGTAAGTCATCTTATTTTG+GGG + Chr7:67446094-67446113 MsG0780039676.01.T01:intron 25.0%
!!! CATGTAAGTCATCTTATTTT+GGG + Chr7:67446093-67446112 MsG0780039676.01.T01:intron 25.0%
!!! GAACAAATTTTGATTACTGT+AGG + Chr7:67443942-67443961 MsG0780039676.01.T01:intron 25.0%
!!! TATTTGTTATAATGCAAGAC+AGG - Chr7:67445936-67445955 None:intergenic 25.0%
!!! TCATGTAAGTCATCTTATTT+TGG + Chr7:67446092-67446111 MsG0780039676.01.T01:intron 25.0%
!!! TGGTTTGCTTTTTAAAACAT+TGG + Chr7:67447526-67447545 MsG0780039676.01.T01:intron 25.0%
!!! TTTGATTATTTTTCTGAAGC+TGG + Chr7:67443854-67443873 MsG0780039676.01.T01:intron 25.0%
AAAAAATTCTTGACTGTCTG+TGG + Chr7:67441772-67441791 MsG0780039676.01.T01:five_prime_UTR 30.0%
AAAAACCAAACCAAACTTGA+TGG + Chr7:67447371-67447390 MsG0780039676.01.T01:intron 30.0%
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AACTACCTCATTTAAGAAAG+AGG - Chr7:67442336-67442355 None:intergenic 30.0%
AATAAGATGACTTACATGAC+TGG - Chr7:67446091-67446110 None:intergenic 30.0%
AATAGAATTGAGACCAATGA+TGG + Chr7:67443143-67443162 MsG0780039676.01.T01:CDS 30.0%
ACATTGTTAAACTGCAAGAA+GGG - Chr7:67445902-67445921 None:intergenic 30.0%
AGAAGAATGATGAAGAAGAT+AGG - Chr7:67441604-67441623 None:intergenic 30.0%
AGTATTGTCAGTATTATGCT+AGG + Chr7:67445794-67445813 MsG0780039676.01.T01:intron 30.0%
AGTTAAAGAGTGGAGTTATA+AGG - Chr7:67445844-67445863 None:intergenic 30.0%
AGTTGTGTTTAGCGATTAAA+TGG + Chr7:67443500-67443519 MsG0780039676.01.T01:intron 30.0%
ATAACATATTGTTGCAACCA+TGG - Chr7:67443799-67443818 None:intergenic 30.0%
ATAAGATGACTTACATGACT+GGG - Chr7:67446090-67446109 None:intergenic 30.0%
CAACAACTGTAGAATATTGA+CGG - Chr7:67447336-67447355 None:intergenic 30.0%
CAACTAATAATCATGCACAT+CGG - Chr7:67445879-67445898 None:intergenic 30.0%
CATCACTTATAAGTATGTGT+TGG + Chr7:67443526-67443545 MsG0780039676.01.T01:intron 30.0%
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CCTTTCAATTATTCAAGCTT+AGG - Chr7:67443673-67443692 None:intergenic 30.0%
CTTGAAAAATACCTCTATGT+AGG + Chr7:67446605-67446624 MsG0780039676.01.T01:intron 30.0%
CTTGGTTAGACAAAATAATC+AGG - Chr7:67446782-67446801 None:intergenic 30.0%
GAAATTATTCAAGAGTTCAG+GGG - Chr7:67445457-67445476 None:intergenic 30.0%
GAAGAATGATGAAGAAGATA+GGG - Chr7:67441603-67441622 None:intergenic 30.0%
GAAGATTATTACAAGCTGTT+AGG + Chr7:67442232-67442251 MsG0780039676.01.T01:intron 30.0%
GAGAATATAGTTTCTGAACA+TGG + Chr7:67443227-67443246 MsG0780039676.01.T01:CDS 30.0%
GATCACTATCAATCCTATAA+AGG + Chr7:67442287-67442306 MsG0780039676.01.T01:intron 30.0%
GCACAAGAATTGAAAGTTTA+AGG - Chr7:67443403-67443422 None:intergenic 30.0%
GCTCCAAAAAAATTCAAATC+AGG - Chr7:67446332-67446351 None:intergenic 30.0%
GTGTGAAAATCATCTTGTAA+GGG + Chr7:67444432-67444451 MsG0780039676.01.T01:intron 30.0%
GTTTGTCTTGTCTTTAATTC+TGG + Chr7:67442377-67442396 MsG0780039676.01.T01:intron 30.0%
TAATCTGGTAAAGTGTAAAC+TGG + Chr7:67443607-67443626 MsG0780039676.01.T01:intron 30.0%
TAATTGCATTTCACCAAAGT+GGG - Chr7:67442154-67442173 None:intergenic 30.0%
TACTACTAAGAAGTGATACT+TGG - Chr7:67446583-67446602 None:intergenic 30.0%
TATTTATTTGCTTCTCCAAC+AGG + Chr7:67448241-67448260 MsG0780039676.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
TCTTCAACTTCACAAATCAA+TGG - Chr7:67446244-67446263 None:intergenic 30.0%
TTAATTGCATTTCACCAAAG+TGG - Chr7:67442155-67442174 None:intergenic 30.0%
TTGCAACAATATGTTATCTG+TGG + Chr7:67443802-67443821 MsG0780039676.01.T01:intron 30.0%
TTGTTTACTGATAAGTGAAC+AGG + Chr7:67443559-67443578 MsG0780039676.01.T01:intron 30.0%
! ATCTTTTTACTGTTGAACCA+TGG + Chr7:67443779-67443798 MsG0780039676.01.T01:intron 30.0%
! GCTCCAAATGTTGTTTATAA+AGG + Chr7:67443257-67443276 MsG0780039676.01.T01:CDS 30.0%
! TGTCTGTGGAAAATTTTAAG+TGG + Chr7:67441786-67441805 MsG0780039676.01.T01:five_prime_UTR 30.0%
! TGTTGTTTATAAAGGGAAGA+TGG + Chr7:67443265-67443284 MsG0780039676.01.T01:CDS 30.0%
! TGTTTTGCAAGTGTTTCATT+TGG - Chr7:67444069-67444088 None:intergenic 30.0%
! TTAGCATCGGAAGAAAATAA+TGG - Chr7:67447116-67447135 None:intergenic 30.0%
! TTCAATCTGTTTCTTTGTCT+GGG + Chr7:67447921-67447940 MsG0780039676.01.T01:CDS 30.0%
! TTCATTCCTTTCCTTCTTTT+AGG - Chr7:67446147-67446166 None:intergenic 30.0%
!! ATTTTCGAGAACTTCATGTA+TGG - Chr7:67446927-67446946 None:intergenic 30.0%
!! GACAATTTTCTGAAGATGAT+GGG + Chr7:67446412-67446431 MsG0780039676.01.T01:CDS 30.0%
!! GTCTGTGGAAAATTTTAAGT+GGG + Chr7:67441787-67441806 MsG0780039676.01.T01:five_prime_UTR 30.0%
!! TTATAAAGATGATGATGGAG+TGG + Chr7:67446952-67446971 MsG0780039676.01.T01:CDS 30.0%
!!! ACAAACTCTTCACTTTTTTC+CGG - Chr7:67448020-67448039 None:intergenic 30.0%
!!! CAAATTTTGATTACTGTAGG+AGG + Chr7:67443945-67443964 MsG0780039676.01.T01:intron 30.0%
!!! GATTTGAATTTTTTTGGAGC+AGG + Chr7:67446332-67446351 MsG0780039676.01.T01:intron 30.0%
!!! TTATTTTGGTGCTTCAATCA+CGG + Chr7:67447436-67447455 MsG0780039676.01.T01:intron 30.0%
!!! TTTTTTTTATCAGCTTCAGG+TGG + Chr7:67441937-67441956 MsG0780039676.01.T01:five_prime_UTR 30.0%
AAAAAAGGAGACAGATTCTG+TGG + Chr7:67445236-67445255 MsG0780039676.01.T01:intron 35.0%
AAAAATCCTCAGACAGTTCA+GGG + Chr7:67445676-67445695 MsG0780039676.01.T01:intron 35.0%
AAACAGGTCCCTAAACTAAT+TGG - Chr7:67445656-67445675 None:intergenic 35.0%
AAATAAGTGAGCCGTAGTAA+AGG - Chr7:67447422-67447441 None:intergenic 35.0%
AACGTAAATTCCCGAAATGA+AGG - Chr7:67443170-67443189 None:intergenic 35.0%
AAGAAGAGTCGTAAGAAATC+TGG - Chr7:67445980-67445999 None:intergenic 35.0%
AAGCATGAAATGCCGTTAAT+GGG + Chr7:67443455-67443474 MsG0780039676.01.T01:intron 35.0%
AATTGCATTTCACCAAAGTG+GGG - Chr7:67442153-67442172 None:intergenic 35.0%
ACATTGGTATCAAAGAAGAC+AGG - Chr7:67444571-67444590 None:intergenic 35.0%
ACCTAATACAAAGTCGATAG+TGG + Chr7:67446488-67446507 MsG0780039676.01.T01:CDS 35.0%
ACCTATATCCTCCTAAAAGA+AGG + Chr7:67446133-67446152 MsG0780039676.01.T01:intron 35.0%
ACTGAAAAAGACAGAGTCAA+AGG - Chr7:67443906-67443925 None:intergenic 35.0%
AGAACACAACTAATCAAGCT+TGG + Chr7:67446746-67446765 MsG0780039676.01.T01:intron 35.0%
AGCTTTCTGATATGATTCAC+AGG + Chr7:67442760-67442779 MsG0780039676.01.T01:intron 35.0%
AGTCAATACTAAGGCTTCAT+TGG + Chr7:67444243-67444262 MsG0780039676.01.T01:intron 35.0%
AGTTTCTGAACATGGAGAAA+AGG + Chr7:67443235-67443254 MsG0780039676.01.T01:CDS 35.0%
ATATGATTCACAGGCATTTG+TGG + Chr7:67442769-67442788 MsG0780039676.01.T01:intron 35.0%
ATGCATTAAGGTCATGATAG+AGG - Chr7:67444723-67444742 None:intergenic 35.0%
CAAAGACCAAATGTGATCAA+TGG + Chr7:67446647-67446666 MsG0780039676.01.T01:intron 35.0%
CAACAATGCAATCATGACAT+TGG - Chr7:67444587-67444606 None:intergenic 35.0%
CACATCATTAAAAGTGGAAG+AGG + Chr7:67442902-67442921 MsG0780039676.01.T01:five_prime_UTR 35.0%
CAGCATAACAGAATGTACTA+CGG - Chr7:67443064-67443083 None:intergenic 35.0%
CATTGTACAGTCCTTTACTA+CGG + Chr7:67447408-67447427 MsG0780039676.01.T01:intron 35.0%
CTGAAAGAAAACCTACATAG+AGG - Chr7:67446619-67446638 None:intergenic 35.0%
CTTATGAAGAATAGTAGGGA+CGG + Chr7:67444876-67444895 MsG0780039676.01.T01:CDS 35.0%
GAAAAGCCATTGATCACATT+TGG - Chr7:67446656-67446675 None:intergenic 35.0%
GAACTCAAACAGTTAAACTG+TGG + Chr7:67444492-67444511 MsG0780039676.01.T01:intron 35.0%
GAATGATTTGATGAGTGAGT+TGG + Chr7:67448130-67448149 MsG0780039676.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
GACAGGTTCTCAAAAGAAAA+AGG - Chr7:67444554-67444573 None:intergenic 35.0%
GAGTTAGGTTCCTAAACTTA+GGG - Chr7:67445553-67445572 None:intergenic 35.0%
GCTTCATTGGTGTATAGTAT+GGG + Chr7:67444256-67444275 MsG0780039676.01.T01:intron 35.0%
GGTGTGAAAATCATCTTGTA+AGG + Chr7:67444431-67444450 MsG0780039676.01.T01:intron 35.0%
GTTATCTTTCCAAATGTGGA+CGG + Chr7:67447163-67447182 MsG0780039676.01.T01:intron 35.0%
TAAAAATCCTCAGACAGTTC+AGG + Chr7:67445675-67445694 MsG0780039676.01.T01:intron 35.0%
TAAAGAGTGGAGTTATAAGG+AGG - Chr7:67445841-67445860 None:intergenic 35.0%
TATCCTCCTAAAAGAAGGAA+AGG + Chr7:67446138-67446157 MsG0780039676.01.T01:intron 35.0%
TATTACAGATATATGAGCGC+TGG + Chr7:67442800-67442819 MsG0780039676.01.T01:five_prime_UTR 35.0%
TCATGATTGCATTGTTGAAG+CGG + Chr7:67444590-67444609 MsG0780039676.01.T01:intron 35.0%
TCCTCTTCAAAAAGAAACAG+AGG + Chr7:67446521-67446540 MsG0780039676.01.T01:CDS 35.0%
TGCAGTTATCTTTCCAAATG+TGG + Chr7:67447159-67447178 MsG0780039676.01.T01:intron 35.0%
TGCATTAAGGTCATGATAGA+GGG - Chr7:67444722-67444741 None:intergenic 35.0%
TTCAAAAAGAAACAGAGGTG+TGG + Chr7:67446526-67446545 MsG0780039676.01.T01:intron 35.0%
TTCATTTCGGGAATTTACGT+TGG + Chr7:67443169-67443188 MsG0780039676.01.T01:CDS 35.0%
TTGAACCATCAAGTTTGGTT+TGG - Chr7:67447379-67447398 None:intergenic 35.0%
TTGTCTTTAATTCTGGCAGA+AGG + Chr7:67442384-67442403 MsG0780039676.01.T01:intron 35.0%
TTTGTATTAGGTCGTTCTCT+AGG - Chr7:67446480-67446499 None:intergenic 35.0%
! AAACGAGGATTGTTGTTAAG+AGG + Chr7:67443294-67443313 MsG0780039676.01.T01:CDS 35.0%
! AAGAAGGCATAATATGTGCA+TGG + Chr7:67445734-67445753 MsG0780039676.01.T01:intron 35.0%
! AAGCATTTCAGTAGCACTTT+TGG + Chr7:67447685-67447704 MsG0780039676.01.T01:intron 35.0%
! ATTCCTTTCCTTCTTTTAGG+AGG - Chr7:67446144-67446163 None:intergenic 35.0%
! CTGTCTGAGGATTTTTAAAC+AGG - Chr7:67445672-67445691 None:intergenic 35.0%
! CTGTTGTTTAGCAGTAATCA+AGG + Chr7:67442467-67442486 MsG0780039676.01.T01:intron 35.0%
! CTTCAATCTGTTTCTTTGTC+TGG + Chr7:67447920-67447939 MsG0780039676.01.T01:CDS 35.0%
! GAAAGATTGGCAAATTTGCT+TGG + Chr7:67443997-67444016 MsG0780039676.01.T01:CDS 35.0%
! TAGGTTTTCTTTCAGAGTCA+AGG + Chr7:67446624-67446643 MsG0780039676.01.T01:intron 35.0%
! TCAGGGATCCAATTAGTTTA+GGG + Chr7:67445645-67445664 MsG0780039676.01.T01:intron 35.0%
! TTACTACGGCTCACTTATTT+TGG + Chr7:67447422-67447441 MsG0780039676.01.T01:intron 35.0%
! TTCAGGGATCCAATTAGTTT+AGG + Chr7:67445644-67445663 MsG0780039676.01.T01:intron 35.0%
! TTTTGCTTGACCTTCTTAGT+GGG + Chr7:67446052-67446071 MsG0780039676.01.T01:CDS 35.0%
!! ACCTCTGTTTCTTTTTGAAG+AGG - Chr7:67446525-67446544 None:intergenic 35.0%
!! GGACAATTTTCTGAAGATGA+TGG + Chr7:67446411-67446430 MsG0780039676.01.T01:CDS 35.0%
!! TCCTTCTTTTAGGAGGATAT+AGG - Chr7:67446137-67446156 None:intergenic 35.0%
!! TGGCCTTATGAAGAATAGTA+GGG + Chr7:67444872-67444891 MsG0780039676.01.T01:CDS 35.0%
!! TTGAATTGTGATGATGGCTT+TGG - Chr7:67444289-67444308 None:intergenic 35.0%
!! TTGGCCTTATGAAGAATAGT+AGG + Chr7:67444871-67444890 MsG0780039676.01.T01:CDS 35.0%
!!! AATCCTAGGCTTTCAAGTTT+TGG + Chr7:67444852-67444871 MsG0780039676.01.T01:CDS 35.0%
!!! ACAGAATCTGTCTCCTTTTT+TGG - Chr7:67445237-67445256 None:intergenic 35.0%
!!! ATTTTTGTATGGTTTTGGGG+AGG + Chr7:67442195-67442214 MsG0780039676.01.T01:intron 35.0%
!!! TTTTTGTATGGTTTTGGGGA+GGG + Chr7:67442196-67442215 MsG0780039676.01.T01:intron 35.0%
AAGCCTACCCAATAAAAAGG+GGG - Chr7:67448166-67448185 None:intergenic 40.0%
AATGCTCACAGATTCTTGTC+TGG + Chr7:67446386-67446405 MsG0780039676.01.T01:CDS 40.0%
ACCAGTTGAACCATCAAGTT+TGG - Chr7:67447384-67447403 None:intergenic 40.0%
ACGACTCTTCTTTGTTCTGT+AGG + Chr7:67445988-67446007 MsG0780039676.01.T01:intron 40.0%
ACGAGCTATTACAGTGGAAA+AGG - Chr7:67444092-67444111 None:intergenic 40.0%
ACTGGCTGCTGAAGAAAAAA+AGG + Chr7:67441749-67441768 MsG0780039676.01.T01:five_prime_UTR 40.0%
AGTGGAGTGAATGCTGTATT+CGG + Chr7:67442867-67442886 MsG0780039676.01.T01:five_prime_UTR 40.0%
ATGGAATGAGCTTAGACTTC+AGG - Chr7:67445279-67445298 None:intergenic 40.0%
ATTCCTTCCCACTCATTGAT+GGG + Chr7:67446827-67446846 MsG0780039676.01.T01:CDS 40.0%
ATTTACAGGACGGTAATCCT+AGG + Chr7:67444838-67444857 MsG0780039676.01.T01:intron 40.0%
CAACTTAATAACGCAACGTC+CGG + Chr7:67443194-67443213 MsG0780039676.01.T01:CDS 40.0%
CAAGCATGAAATGCCGTTAA+TGG + Chr7:67443454-67443473 MsG0780039676.01.T01:intron 40.0%
CAAGCCTACCCAATAAAAAG+GGG - Chr7:67448167-67448186 None:intergenic 40.0%
CACAAGTAATTTCCCCTCTA+TGG + Chr7:67447882-67447901 MsG0780039676.01.T01:CDS 40.0%
CACATGTAGTTCATTGACGT+TGG + Chr7:67447767-67447786 MsG0780039676.01.T01:intron 40.0%
CACTAGCATGTTCCCATTAA+CGG - Chr7:67443470-67443489 None:intergenic 40.0%
CAGCAATAGTAGCACTATGT+TGG - Chr7:67446856-67446875 None:intergenic 40.0%
CATGAAACGAGCTATTACAG+TGG - Chr7:67444098-67444117 None:intergenic 40.0%
CCAAGCCTACCCAATAAAAA+GGG - Chr7:67448168-67448187 None:intergenic 40.0%
CGACTCTTCTTTGTTCTGTA+GGG + Chr7:67445989-67446008 MsG0780039676.01.T01:intron 40.0%
CGTCCCTACTATTCTTCATA+AGG - Chr7:67444878-67444897 None:intergenic 40.0%
CTAGAATACTGCACAAGCAA+TGG + Chr7:67444691-67444710 MsG0780039676.01.T01:CDS 40.0%
CTGTTCGTCCTCAAACTATT+TGG + Chr7:67445333-67445352 MsG0780039676.01.T01:intron 40.0%
GATTATGCACAGGTTAGCAT+CGG - Chr7:67447129-67447148 None:intergenic 40.0%
GGAAAGATAACTGCAGTTCA+GGG - Chr7:67447154-67447173 None:intergenic 40.0%
GGAGTTAGGTTCCTAAACTT+AGG - Chr7:67445554-67445573 None:intergenic 40.0%
GGATTCTCAACCGATGAAAT+GGG + Chr7:67444630-67444649 MsG0780039676.01.T01:CDS 40.0%
GGCTTCATTGGTGTATAGTA+TGG + Chr7:67444255-67444274 MsG0780039676.01.T01:intron 40.0%
GTATTTGGGTCCCTAAGTTT+AGG + Chr7:67445540-67445559 MsG0780039676.01.T01:intron 40.0%
GTCAGTATTATGCTAGGAGT+GGG + Chr7:67445800-67445819 MsG0780039676.01.T01:intron 40.0%
GTTATTTGACACACGGAGAA+TGG - Chr7:67445058-67445077 None:intergenic 40.0%
GTTCATTGACGTTGGAACAA+TGG + Chr7:67447775-67447794 MsG0780039676.01.T01:intron 40.0%
TAAAGTGTAAACTGGACCGT+AGG + Chr7:67443615-67443634 MsG0780039676.01.T01:intron 40.0%
TAATAATCATGCACATCGGC+TGG - Chr7:67445875-67445894 None:intergenic 40.0%
TACCAAAAACTGACGAGCAT+CGG - Chr7:67443339-67443358 None:intergenic 40.0%
TCAGTATTATGCTAGGAGTG+GGG + Chr7:67445801-67445820 MsG0780039676.01.T01:intron 40.0%
TCCAAGCCTACCCAATAAAA+AGG - Chr7:67448169-67448188 None:intergenic 40.0%
TCTGTCGCGAATCAAATCAA+GGG - Chr7:67446358-67446377 None:intergenic 40.0%
TGGAAAGATAACTGCAGTTC+AGG - Chr7:67447155-67447174 None:intergenic 40.0%
TGTCAGTATTATGCTAGGAG+TGG + Chr7:67445799-67445818 MsG0780039676.01.T01:intron 40.0%
TTCTGCATCATGATCTGCAT+TGG + Chr7:67448066-67448085 MsG0780039676.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
TTCTGTCGCGAATCAAATCA+AGG - Chr7:67446359-67446378 None:intergenic 40.0%
TTGGATACCCATCAATGAGT+GGG - Chr7:67446837-67446856 None:intergenic 40.0%
! ACCAAACTTGATGGTTCAAC+TGG + Chr7:67447380-67447399 MsG0780039676.01.T01:intron 40.0%
! AGGATGAGAACTTTTCTTGC+TGG + Chr7:67442710-67442729 MsG0780039676.01.T01:intron 40.0%
! AGGCTTGGATGTTGTTTGTT+TGG + Chr7:67448180-67448199 MsG0780039676.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
! CAAGTTTGAAGTCTTTGTGC+CGG - Chr7:67447238-67447257 None:intergenic 40.0%
! CACTTTTACTTACCAGCATC+TGG - Chr7:67443036-67443055 None:intergenic 40.0%
! CATCTGGGTTGAAGAATTAC+TGG + Chr7:67441731-67441750 MsG0780039676.01.T01:five_prime_UTR 40.0%
! CTTTTGCTTGACCTTCTTAG+TGG + Chr7:67446051-67446070 MsG0780039676.01.T01:CDS 40.0%
! GTTTATGATTTGCCCCACTT+TGG + Chr7:67442138-67442157 MsG0780039676.01.T01:intron 40.0%
! TACACCTTCAAGTGTTGTGT+CGG - Chr7:67442552-67442571 None:intergenic 40.0%
! TTGAAGTGTCACTGCTAGAT+AGG - Chr7:67442494-67442513 None:intergenic 40.0%
!! AGAGGTTTAACAGAAGTGCT+TGG + Chr7:67443312-67443331 MsG0780039676.01.T01:CDS 40.0%
!! CAATGATGGACCTTCATTTC+GGG + Chr7:67443157-67443176 MsG0780039676.01.T01:CDS 40.0%
!! CCAATGATGGACCTTCATTT+CGG + Chr7:67443156-67443175 MsG0780039676.01.T01:CDS 40.0%
!! GCCACTATCGACTTTGTATT+AGG - Chr7:67446492-67446511 None:intergenic 40.0%
!!! ACTCTTCACTTTTTTCCGGT+AGG - Chr7:67448016-67448035 None:intergenic 40.0%
!!! ATCACGGTTTTTTCGTGGTT+CGG + Chr7:67447452-67447471 MsG0780039676.01.T01:intron 40.0%
!!! CTTCAATCACGGTTTTTTCG+TGG + Chr7:67447447-67447466 MsG0780039676.01.T01:intron 40.0%
!!! GTGTCTGGTTTTCGTATATG+TGG + Chr7:67442665-67442684 MsG0780039676.01.T01:intron 40.0%
AAGACGCAATGTGCCATAGA+GGG - Chr7:67447898-67447917 None:intergenic 45.0%
AAGCGGTATGTGTCTATGTC+AGG + Chr7:67444607-67444626 MsG0780039676.01.T01:intron 45.0%
AATCGGAGAGTAGGCACAAT+TGG + Chr7:67443710-67443729 MsG0780039676.01.T01:intron 45.0%
AATGTGGACGGATCAAATGC+AGG + Chr7:67447175-67447194 MsG0780039676.01.T01:intron 45.0%
ACCAAAAACTGACGAGCATC+GGG - Chr7:67443338-67443357 None:intergenic 45.0%
ACTGTAGGAGGAAGCTAGAT+CGG + Chr7:67443957-67443976 MsG0780039676.01.T01:intron 45.0%
ACTTGTGAGTCCACACAACA+TGG - Chr7:67442991-67443010 None:intergenic 45.0%
AGATGACTTACATGACTGGG+AGG - Chr7:67446087-67446106 None:intergenic 45.0%
AGCGGTATGTGTCTATGTCA+GGG + Chr7:67444608-67444627 MsG0780039676.01.T01:intron 45.0%
AGGCCAAAACTTGAAAGCCT+AGG - Chr7:67444858-67444877 None:intergenic 45.0%
AGTCGCATTGCCCATTTCAT+CGG - Chr7:67444643-67444662 None:intergenic 45.0%
ATACCCATCAATGAGTGGGA+AGG - Chr7:67446833-67446852 None:intergenic 45.0%
CACACAACATGGTATCAAGC+TGG - Chr7:67442980-67442999 None:intergenic 45.0%
CACGACACTAGTAGCACATT+TGG + Chr7:67442591-67442610 MsG0780039676.01.T01:intron 45.0%
CAGCTTGATACCATGTTGTG+TGG + Chr7:67442978-67442997 MsG0780039676.01.T01:CDS 45.0%
CAGTATTATGCTAGGAGTGG+GGG + Chr7:67445802-67445821 MsG0780039676.01.T01:intron 45.0%
CCGAAATGAAGGTCCATCAT+TGG - Chr7:67443159-67443178 None:intergenic 45.0%
CTACCCAATAAAAAGGGGGA+GGG - Chr7:67448162-67448181 None:intergenic 45.0%
CTCACAGATTCTTGTCTGGA+AGG + Chr7:67446390-67446409 MsG0780039676.01.T01:CDS 45.0%
CTTGAGGCATGTCGTTAATG+AGG - Chr7:67447838-67447857 None:intergenic 45.0%
GAGAAACGAAACACACCTAC+CGG + Chr7:67447998-67448017 MsG0780039676.01.T01:CDS 45.0%
GATGACTTACATGACTGGGA+GGG - Chr7:67446086-67446105 None:intergenic 45.0%
GATTCCTTCCCACTCATTGA+TGG + Chr7:67446826-67446845 MsG0780039676.01.T01:intron 45.0%
GCATTTGATCCGTCCACATT+TGG - Chr7:67447175-67447194 None:intergenic 45.0%
GGAAGATGGAGAATCAAACG+AGG + Chr7:67443279-67443298 MsG0780039676.01.T01:CDS 45.0%
GGATATGCTTCCCACTAAGA+AGG - Chr7:67446065-67446084 None:intergenic 45.0%
GGGATTCTCAACCGATGAAA+TGG + Chr7:67444629-67444648 MsG0780039676.01.T01:CDS 45.0%
GTGCGCCAAGATATGTAAGT+AGG - Chr7:67446701-67446720 None:intergenic 45.0%
GTTCAGGGAAGATTATGCAC+AGG - Chr7:67447139-67447158 None:intergenic 45.0%
GTTGGATACCCATCAATGAG+TGG - Chr7:67446838-67446857 None:intergenic 45.0%
GTTGTTGTGAAGACGATGAG+AGG + Chr7:67444022-67444041 MsG0780039676.01.T01:CDS 45.0%
TAAGACGCAATGTGCCATAG+AGG - Chr7:67447899-67447918 None:intergenic 45.0%
TCAGCTTCGTAGCGAAAGAT+TGG + Chr7:67443984-67444003 MsG0780039676.01.T01:CDS 45.0%
TGGAGTTATAAGGAGGTCGA+GGG - Chr7:67445834-67445853 None:intergenic 45.0%
TGGCGATGCATGTTCAAGAA+AGG + Chr7:67446892-67446911 MsG0780039676.01.T01:CDS 45.0%
TTGAACATGCATCGCCAAGT+GGG - Chr7:67446889-67446908 None:intergenic 45.0%
! AAAGTCGATAGTGGCTGCTT+TGG + Chr7:67446497-67446516 MsG0780039676.01.T01:CDS 45.0%
! ACATCCCTCCCCCTTTTTAT+TGG + Chr7:67448155-67448174 MsG0780039676.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
! ATGTGCTACTAGTGTCGTGT+CGG - Chr7:67442590-67442609 None:intergenic 45.0%
! CATCCCTCCCCCTTTTTATT+GGG + Chr7:67448156-67448175 MsG0780039676.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
! CCCTTTTTATTGGGTAGGCT+TGG + Chr7:67448165-67448184 MsG0780039676.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
! CTGTTTCTTTGTCTGGGCTA+GGG + Chr7:67447927-67447946 MsG0780039676.01.T01:CDS 45.0%
! GTGGTAGTGTTGCTCAAAAG+TGG + Chr7:67442684-67442703 MsG0780039676.01.T01:intron 45.0%
! GTGTTGCTCAAAAGTGGACT+AGG + Chr7:67442690-67442709 MsG0780039676.01.T01:intron 45.0%
! TCTGTTTCTTTGTCTGGGCT+AGG + Chr7:67447926-67447945 MsG0780039676.01.T01:CDS 45.0%
! TGCAATAGAGTGCTACACAC+AGG + Chr7:67447256-67447275 MsG0780039676.01.T01:intron 45.0%
! TTACCAGCATCTGGAACTTC+AGG - Chr7:67443027-67443046 None:intergenic 45.0%
!! ACACCAGTTCTGAGATACTC+TGG - Chr7:67444936-67444955 None:intergenic 45.0%
!! ACGCTGTTTTGTGTAGTGCA+AGG - Chr7:67443432-67443451 None:intergenic 45.0%
!! TGAAGATGATGGGACTGAGT+TGG + Chr7:67446422-67446441 MsG0780039676.01.T01:CDS 45.0%
!! TGATGATGGAGTGGCAAATG+AGG + Chr7:67446961-67446980 MsG0780039676.01.T01:CDS 45.0%
!!! TCACGGTTTTTTCGTGGTTC+GGG + Chr7:67447453-67447472 MsG0780039676.01.T01:intron 45.0%
!!! AATTTTAAATGATTTTAATT+AGG + Chr7:67445495-67445514 MsG0780039676.01.T01:intron 5.0%
!!! ATTAAAATCATTTAAAATTT+TGG - Chr7:67445494-67445513 None:intergenic 5.0%
!!! ATTTTAAATGATTTTAATTA+GGG + Chr7:67445496-67445515 MsG0780039676.01.T01:intron 5.0%
!!! TATTTATTTATTTTTTGTAA+CGG + Chr7:67445762-67445781 MsG0780039676.01.T01:intron 5.0%
!!! TTAAAATCATTTAAAATTTT+GGG - Chr7:67445493-67445512 None:intergenic 5.0%
!!! TTATTTATTTTTAATTTTGA+AGG + Chr7:67444466-67444485 MsG0780039676.01.T01:intron 5.0%
ACTTATGGAGGGAACAACGC+TGG + Chr7:67447973-67447992 MsG0780039676.01.T01:CDS 50.0%
AGACGATGAGAGGTTGCTTG+TGG + Chr7:67444032-67444051 MsG0780039676.01.T01:CDS 50.0%
AGACGCAATGTGCCATAGAG+GGG - Chr7:67447897-67447916 None:intergenic 50.0%
AGAGTCTGTGTGTAGCTGAG+TGG + Chr7:67442849-67442868 MsG0780039676.01.T01:five_prime_UTR 50.0%
CCTACCCAATAAAAAGGGGG+AGG - Chr7:67448163-67448182 None:intergenic 50.0%
CTTGAACATGCATCGCCAAG+TGG - Chr7:67446890-67446909 None:intergenic 50.0%
GACACCGACACAACACTTGA+AGG + Chr7:67442545-67442564 MsG0780039676.01.T01:intron 50.0%
GCGGTATGTGTCTATGTCAG+GGG + Chr7:67444609-67444628 MsG0780039676.01.T01:intron 50.0%
GCGTCGTTCATTGCTTCTTG+AGG - Chr7:67447854-67447873 None:intergenic 50.0%
GCTGTTGAACCATGATCCAG+AGG + Chr7:67447485-67447504 MsG0780039676.01.T01:intron 50.0%
GGAGTGAGGGAGTTAAAGAG+TGG - Chr7:67445854-67445873 None:intergenic 50.0%
GGTACGGTTTAGGGGTAATC+TGG + Chr7:67443592-67443611 MsG0780039676.01.T01:intron 50.0%
GTGGAGTTATAAGGAGGTCG+AGG - Chr7:67445835-67445854 None:intergenic 50.0%
GTTCCTGAAGTTCCAGATGC+TGG + Chr7:67443021-67443040 MsG0780039676.01.T01:CDS 50.0%
TAGGAGGAAGCTAGATCGGT+CGG + Chr7:67443961-67443980 MsG0780039676.01.T01:intron 50.0%
TATTGCAGCCGCTCTGCAAT+CGG + Chr7:67443693-67443712 MsG0780039676.01.T01:intron 50.0%
TGAACATGCATCGCCAAGTG+GGG - Chr7:67446888-67446907 None:intergenic 50.0%
! CCTCCAGAGTATCTCAGAAC+TGG + Chr7:67444930-67444949 MsG0780039676.01.T01:CDS 50.0%
! CCTCCCCCTTTTTATTGGGT+AGG + Chr7:67448160-67448179 MsG0780039676.01.T01:three_prime_UTR 50.0%
! TCAAGTGTTGTGTCGGTGTC+AGG - Chr7:67442545-67442564 None:intergenic 50.0%
! TTCTTTGTCTGGGCTAGGGA+TGG + Chr7:67447931-67447950 MsG0780039676.01.T01:CDS 50.0%
!! ATGATGGGACTGAGTTGGTG+CGG + Chr7:67446427-67446446 MsG0780039676.01.T01:CDS 50.0%
!! CCAGTTCTGAGATACTCTGG+AGG - Chr7:67444933-67444952 None:intergenic 50.0%
!! GGTGTTGATGTGTCAGTGTC+TGG + Chr7:67442650-67442669 MsG0780039676.01.T01:intron 50.0%
AAAAAGGGGACGCTGCGTTC+CGG + Chr7:67447216-67447235 MsG0780039676.01.T01:intron 55.0%
ACCCCTAAACCGTACCACTC+AGG - Chr7:67443588-67443607 None:intergenic 55.0%
AGCGCAAGTCGCACTTATGG+AGG + Chr7:67447961-67447980 MsG0780039676.01.T01:CDS 55.0%
CCTAAACCGTACCACTCAGG+CGG - Chr7:67443585-67443604 None:intergenic 55.0%
CCTACTCTCCGATTGCAGAG+CGG - Chr7:67443704-67443723 None:intergenic 55.0%
CGAAGCGCAAGTCGCACTTA+TGG + Chr7:67447958-67447977 MsG0780039676.01.T01:CDS 55.0%
CGCCTGAGTGGTACGGTTTA+GGG + Chr7:67443583-67443602 MsG0780039676.01.T01:intron 55.0%
CGTAGTCCCTGAACTGTCTG+AGG - Chr7:67445685-67445704 None:intergenic 55.0%
CTGACGAGACCTCTGGATCA+TGG - Chr7:67447497-67447516 None:intergenic 55.0%
GCCTGAGTGGTACGGTTTAG+GGG + Chr7:67443584-67443603 MsG0780039676.01.T01:intron 55.0%
GCGCAAGTCGCACTTATGGA+GGG + Chr7:67447962-67447981 MsG0780039676.01.T01:CDS 55.0%
GCTGGTGCACAAAGTTGTGC+TGG + Chr7:67443872-67443891 MsG0780039676.01.T01:intron 55.0%
! ATGCACATCGGCTGGAGTGA+GGG - Chr7:67445867-67445886 None:intergenic 55.0%
! GCCCGATGCTCGTCAGTTTT+TGG + Chr7:67443334-67443353 MsG0780039676.01.T01:CDS 55.0%
!!! CGGTTTTTTCGTGGTTCGGG+CGG + Chr7:67447456-67447475 MsG0780039676.01.T01:intron 55.0%
!!! GGTTTTTTCGTGGTTCGGGC+GGG + Chr7:67447457-67447476 MsG0780039676.01.T01:intron 55.0%
AACAGGCCGCCTGAGTGGTA+CGG + Chr7:67443576-67443595 MsG0780039676.01.T01:intron 60.0%
AAGTGAACAGGCCGCCTGAG+TGG + Chr7:67443571-67443590 MsG0780039676.01.T01:intron 60.0%
CCGCCTGAGTGGTACGGTTT+AGG + Chr7:67443582-67443601 MsG0780039676.01.T01:intron 60.0%
CCGCTCTGCAATCGGAGAGT+AGG + Chr7:67443701-67443720 MsG0780039676.01.T01:intron 60.0%
CGTCGAACTGACGAGACCTC+TGG - Chr7:67447504-67447523 None:intergenic 60.0%
CTGCGACGTGCGTGAACAGT+TGG - Chr7:67447806-67447825 None:intergenic 60.0%
GCTGCTTCGTTGTCCCCACT+TGG + Chr7:67446872-67446891 MsG0780039676.01.T01:CDS 60.0%
! CATGCACATCGGCTGGAGTG+AGG - Chr7:67445868-67445887 None:intergenic 60.0%
!! TGGGACTGAGTTGGTGCGGT+TGG + Chr7:67446431-67446450 MsG0780039676.01.T01:CDS 60.0%
!! TTCGTGGTTCGGGCGGGTTA+AGG + Chr7:67447463-67447482 MsG0780039676.01.T01:intron 60.0%
GGTCTCGTCAGTTCGACGCC+TGG + Chr7:67447506-67447525 MsG0780039676.01.T01:intron 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 67441598 67448288 67441598 ID=MsG0780039676.01;Name=MsG0780039676.01
Chr7 mRNA 67441598 67448288 67441598 ID=MsG0780039676.01.T01;Parent=MsG0780039676.01;Name=MsG0780039676.01.T01;_AED=0.34;_eAED=0.34;_QI=571|0.88|1|1|0.88|0.8|10|258|454
Chr7 exon 67441598 67441989 67441598 ID=MsG0780039676.01.T01:exon:11331;Parent=MsG0780039676.01.T01
Chr7 exon 67442782 67443042 67442782 ID=MsG0780039676.01.T01:exon:11332;Parent=MsG0780039676.01.T01
Chr7 exon 67443135 67443355 67443135 ID=MsG0780039676.01.T01:exon:11333;Parent=MsG0780039676.01.T01
Chr7 exon 67443964 67444099 67443964 ID=MsG0780039676.01.T01:exon:11334;Parent=MsG0780039676.01.T01
Chr7 exon 67444629 67444762 67444629 ID=MsG0780039676.01.T01:exon:11335;Parent=MsG0780039676.01.T01
Chr7 exon 67444846 67444951 67444846 ID=MsG0780039676.01.T01:exon:11336;Parent=MsG0780039676.01.T01
Chr7 exon 67446010 67446095 67446010 ID=MsG0780039676.01.T01:exon:11337;Parent=MsG0780039676.01.T01
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