AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780039913.01

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MsG0780039913.01.T01 AT2G28970 30.966 352 199 8 13 355 273 589 4.73e-36 139
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MsG0780039913.01.T01 AT1G51870 31.322 348 206 9 24 355 397 727 6.85e-36 139
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MsG0780039913.01.T01 AT5G63710 28.841 371 210 10 1 355 105 437 1.05e-35 137
MsG0780039913.01.T01 AT2G01210 27.033 418 229 14 1 355 148 552 5.40e-35 136
MsG0780039913.01.T01 AT4G33430 31.153 321 183 6 42 355 194 483 1.45e-34 134
MsG0780039913.01.T01 AT1G75640 28.103 427 227 10 1 355 566 984 2.39e-34 134
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MsG0780039913.01.T01 AT1G75640 35.338 133 56 4 1 104 446 577 6.48e-12 67.4
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MsG0780039913.01.T01 AT5G58300 27.848 395 232 12 1 355 124 505 6.11e-31 124
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MsG0780039913.01.T01 AT1G79620 32.773 238 133 5 131 355 559 782 3.43e-30 122
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MsG0780039913.01.T01 AT1G06700 38.922 167 92 2 193 353 56 218 4.33e-30 118
MsG0780039913.01.T01 AT1G07550 31.065 338 199 10 20 355 399 704 4.62e-30 122
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MsG0780039913.01.T01 AT4G23740 26.799 403 223 15 1 355 105 483 5.12e-30 121
MsG0780039913.01.T01 AT1G49730 31.365 271 163 6 100 355 239 501 5.93e-30 121
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MsG0780039913.01.T01 AT5G60300 33.784 222 128 6 141 359 287 492 6.30e-30 121
MsG0780039913.01.T01 AT5G60300 33.784 222 128 6 141 359 287 492 6.81e-30 121
MsG0780039913.01.T01 AT1G16120 33.628 226 136 4 138 355 355 574 6.91e-30 121
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MsG0780039913.01.T01 AT1G07650 30.045 223 140 4 135 355 591 799 6.36e-28 115
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MsG0780039913.01.T01 AT1G07650 30.045 223 140 4 135 355 617 825 7.82e-28 115
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MsG0780039913.01.T01 AT2G43700 32.864 213 126 6 145 355 259 456 2.58e-27 113
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MsG0780039913.01.T01 AT4G11900 31.197 234 144 5 129 355 459 682 2.65e-27 113
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MsG0780039913.01.T01 AT1G68690 37.888 161 93 2 195 355 367 520 3.67e-27 113
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MsG0780039913.01.T01 AT3G45430 31.416 226 137 6 136 359 283 492 3.67e-27 113
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MsG0780039913.01.T01 AT4G04500 31.925 213 129 4 148 355 289 490 6.68e-27 112
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MsG0780039913.01.T01 AT4G23140 34.756 164 102 1 192 355 338 496 9.84e-27 112
MsG0780039913.01.T01 AT4G23160 34.756 164 102 1 192 355 346 504 1.04e-26 112
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MsG0780039913.01.T01 AT4G34500 37.342 158 91 3 201 355 141 293 1.16e-26 110
MsG0780039913.01.T01 AT2G37710 31.818 220 131 5 141 355 287 492 1.20e-26 111
MsG0780039913.01.T01 AT1G52290 29.032 310 173 10 70 355 1 287 1.20e-26 110
MsG0780039913.01.T01 AT4G21410 36.025 161 98 1 195 355 222 377 1.22e-26 111
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MsG0780039913.01.T01 AT1G51790 27.078 373 201 14 39 355 415 772 1.36e-26 111
MsG0780039913.01.T01 AT4G23130 37.267 161 96 1 195 355 334 489 1.46e-26 111
MsG0780039913.01.T01 AT1G56145 28.000 250 141 3 132 355 622 858 1.60e-26 111
MsG0780039913.01.T01 AT4G23130 37.267 161 96 1 195 355 334 489 1.73e-26 110
MsG0780039913.01.T01 AT3G59350 36.527 167 96 2 193 353 59 221 1.74e-26 108
MsG0780039913.01.T01 AT4G23240 34.161 161 101 1 195 355 18 173 1.79e-26 108
MsG0780039913.01.T01 AT5G63940 39.506 162 91 2 195 355 352 507 1.85e-26 111
MsG0780039913.01.T01 AT5G56890 38.365 159 92 3 198 355 716 869 1.87e-26 111
MsG0780039913.01.T01 AT4G29050 31.718 227 138 5 130 355 279 489 2.05e-26 110
MsG0780039913.01.T01 AT1G56720 34.118 170 104 3 187 355 163 325 2.16e-26 110
MsG0780039913.01.T01 AT1G56720 34.118 170 104 3 187 355 163 325 2.16e-26 110
MsG0780039913.01.T01 AT1G56720 34.118 170 104 3 187 355 163 325 2.16e-26 110
MsG0780039913.01.T01 AT1G56720 34.118 170 104 3 187 355 163 325 2.16e-26 110
MsG0780039913.01.T01 AT4G29050 31.718 227 138 5 130 355 293 503 2.23e-26 110
MsG0780039913.01.T01 AT1G61610 34.783 161 100 1 195 355 515 670 2.24e-26 111
MsG0780039913.01.T01 AT4G23300 32.308 195 123 2 161 355 313 498 2.31e-26 110
MsG0780039913.01.T01 AT3G59350 36.527 167 96 2 193 353 116 278 2.32e-26 109
MsG0780039913.01.T01 AT4G23180 35.976 164 100 1 192 355 335 493 2.32e-26 110
MsG0780039913.01.T01 AT1G61610 34.783 161 100 1 195 355 515 670 2.36e-26 110
MsG0780039913.01.T01 AT4G21410 36.025 161 98 1 195 355 347 502 2.39e-26 110
MsG0780039913.01.T01 AT4G32300 36.364 165 96 3 192 355 482 638 2.41e-26 110
MsG0780039913.01.T01 AT1G26150 36.646 161 96 2 195 355 420 574 2.41e-26 110
MsG0780039913.01.T01 AT3G59350 36.527 167 96 2 193 353 101 263 2.42e-26 108
MsG0780039913.01.T01 AT5G18500 34.706 170 103 3 187 355 150 312 2.50e-26 109
MsG0780039913.01.T01 AT5G18500 34.706 170 103 3 187 355 150 312 2.50e-26 109
MsG0780039913.01.T01 AT5G18500 34.706 170 103 3 187 355 150 312 2.50e-26 109
MsG0780039913.01.T01 AT5G18500 34.706 170 103 3 187 355 150 312 2.50e-26 109
MsG0780039913.01.T01 AT5G18500 34.706 170 103 3 187 355 150 312 2.50e-26 109
MsG0780039913.01.T01 AT5G18500 34.706 170 103 3 187 355 150 312 2.50e-26 109
MsG0780039913.01.T01 AT1G26150 36.646 161 96 2 195 355 420 574 2.68e-26 110
MsG0780039913.01.T01 AT5G01560 29.302 215 135 5 144 355 311 511 2.80e-26 110
MsG0780039913.01.T01 AT4G39270 25.059 427 234 14 1 352 234 649 2.89e-26 110
MsG0780039913.01.T01 AT4G39270 43.137 102 54 2 1 98 162 263 7.15e-11 63.9
MsG0780039913.01.T01 AT4G39270 25.059 427 234 14 1 352 234 649 2.89e-26 110
MsG0780039913.01.T01 AT4G39270 43.137 102 54 2 1 98 162 263 7.15e-11 63.9
MsG0780039913.01.T01 AT4G39270 25.059 427 234 14 1 352 234 649 2.89e-26 110
MsG0780039913.01.T01 AT4G39270 43.137 102 54 2 1 98 162 263 7.15e-11 63.9
MsG0780039913.01.T01 AT4G39270 25.059 427 234 14 1 352 234 649 2.89e-26 110
MsG0780039913.01.T01 AT4G39270 43.137 102 54 2 1 98 162 263 7.15e-11 63.9
MsG0780039913.01.T01 AT4G39270 25.059 427 234 14 1 352 234 649 2.89e-26 110
MsG0780039913.01.T01 AT4G39270 43.137 102 54 2 1 98 162 263 7.15e-11 63.9
MsG0780039913.01.T01 AT4G21410 36.025 161 98 1 195 355 347 502 3.03e-26 110
MsG0780039913.01.T01 AT2G32800 36.905 168 93 4 195 355 107 268 3.06e-26 110
MsG0780039913.01.T01 AT2G32800 27.922 154 105 2 195 346 522 671 1.17e-14 75.9
MsG0780039913.01.T01 AT3G59350 36.527 167 96 2 193 353 101 263 3.15e-26 108
MsG0780039913.01.T01 AT3G59350 36.527 167 96 2 193 353 101 263 3.15e-26 108
MsG0780039913.01.T01 AT4G23320 32.394 213 131 4 145 355 148 349 3.48e-26 109
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MsG0780039913.01.T01 AT4G23320 32.394 213 131 4 145 355 127 328 3.70e-26 109
MsG0780039913.01.T01 AT4G23320 32.394 213 131 4 145 355 127 328 3.70e-26 109
MsG0780039913.01.T01 AT3G45410 30.769 208 128 4 152 359 299 490 3.82e-26 110
MsG0780039913.01.T01 AT1G21230 31.624 234 144 4 133 355 325 553 4.06e-26 110
MsG0780039913.01.T01 AT3G53590 35.616 219 123 6 143 355 559 765 4.08e-26 110
MsG0780039913.01.T01 AT4G00960 33.136 169 105 2 190 355 38 201 4.31e-26 105
MsG0780039913.01.T01 AT4G27300 34.194 155 97 1 201 355 496 645 5.16e-26 110
MsG0780039913.01.T01 AT1G69910 33.628 226 133 4 141 355 259 478 5.29e-26 109
MsG0780039913.01.T01 AT4G11470 36.025 161 98 1 195 355 329 484 5.36e-26 109
MsG0780039913.01.T01 AT4G11470 36.025 161 98 1 195 355 334 489 5.61e-26 109
MsG0780039913.01.T01 AT1G11300 31.163 215 136 3 147 355 431 639 5.73e-26 109
MsG0780039913.01.T01 AT5G63410 24.439 446 224 13 3 355 131 556 5.90e-26 109
MsG0780039913.01.T01 AT1G06840 32.394 213 136 4 144 355 564 769 6.18e-26 109
MsG0780039913.01.T01 AT3G45390 32.812 192 114 4 161 352 315 491 7.20e-26 109
MsG0780039913.01.T01 AT4G34440 36.025 161 97 2 195 355 302 456 7.85e-26 109
MsG0780039913.01.T01 AT4G34440 36.025 161 97 2 195 355 302 456 7.85e-26 109
MsG0780039913.01.T01 AT2G39360 36.709 158 95 1 198 355 480 632 8.14e-26 109
MsG0780039913.01.T01 AT4G00960 33.136 169 105 2 190 355 38 201 8.59e-26 107
MsG0780039913.01.T01 AT1G29740 29.762 252 153 4 104 355 594 821 8.92e-26 109
MsG0780039913.01.T01 AT1G61400 30.317 221 146 3 137 355 431 645 9.02e-26 109
MsG0780039913.01.T01 AT3G45860 34.783 161 100 1 195 355 341 496 9.19e-26 108
MsG0780039913.01.T01 AT1G49270 36.420 162 96 3 195 355 326 481 9.28e-26 108
MsG0780039913.01.T01 AT1G29740 29.762 252 153 4 104 355 594 821 9.56e-26 109

Find 51 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 67 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CTCTCACATAATATGCTTTC+AGG 0.234939 7:+70367165 MsG0780039913.01.T01:CDS
TCAGTTTCACTTTCTTCATT+TGG 0.243048 7:-70367474 None:intergenic
CACAAGCCGTTGCATTTGAT+TGG 0.280406 7:+70367865 MsG0780039913.01.T01:CDS
GATATATCACGATGAATTAT+AGG 0.299333 7:-70367957 None:intergenic
ACCAACAGCTCTTGAAGATT+TGG 0.303247 7:+70367122 MsG0780039913.01.T01:CDS
CAATCGACATTCATTGCTTT+AGG 0.303509 7:+70367387 MsG0780039913.01.T01:CDS
ATATCAGACAACCACTTAGA+AGG 0.353769 7:+70367231 MsG0780039913.01.T01:CDS
GGTAGCTTCATAACTTCTTT+CGG 0.361622 7:-70366985 None:intergenic
AAGAGGGTGAATGTTGTTAA+AGG 0.370953 7:+70367891 MsG0780039913.01.T01:CDS
GGCAGAGTTATCAGCAGGTT+TGG 0.382784 7:+70367632 MsG0780039913.01.T01:CDS
GTGTGGAAATATCATAGGTT+TGG 0.385055 7:+70367320 MsG0780039913.01.T01:CDS
GATTTGTGTGGAAATATCAT+AGG 0.406036 7:+70367315 MsG0780039913.01.T01:CDS
TTTGATGACAAATATCTCAT+TGG 0.408588 7:+70367582 MsG0780039913.01.T01:CDS
TTGAGCAGAAACAGAATTGA+AGG 0.411816 7:+70367027 MsG0780039913.01.T01:CDS
GGAAGTATTCCCTCTCAGTT+TGG 0.419913 7:+70367048 MsG0780039913.01.T01:CDS
ACAAGCCGTTGCATTTGATT+GGG 0.451323 7:+70367866 MsG0780039913.01.T01:CDS
CCTATGTTTAATTCCTGTCA+AGG 0.455591 7:-70367739 None:intergenic
GACAAATATCTCATTGGAGT+TGG 0.456840 7:+70367588 MsG0780039913.01.T01:CDS
AGGAACATCATAAAACTTCA+TGG 0.467967 7:+70367759 MsG0780039913.01.T01:CDS
AAGCAATGAATGTCGATTGA+AGG 0.475537 7:-70367383 None:intergenic
ATATTAGTGTTGTGTGTGGT+TGG 0.476638 7:+70367417 MsG0780039913.01.T01:CDS
TACAAGGCAGAGTTATCAGC+AGG 0.496125 7:+70367627 MsG0780039913.01.T01:CDS
CTCATTGGAGTTGGAAGTCA+AGG 0.496213 7:+70367597 MsG0780039913.01.T01:CDS
GAAGCTCATGTCTCCGACTC+GGG 0.505454 7:+70368011 MsG0780039913.01.T01:CDS
TTTGGTGCAGTTGTCAATGT+TGG 0.507908 7:+70367140 MsG0780039913.01.T01:CDS
TGCATTTGATTGGGAAAAGA+GGG 0.516004 7:+70367875 MsG0780039913.01.T01:CDS
AATGATGCAAGAAGAAAAGC+TGG 0.521628 7:-70367270 None:intergenic
TTGGTTTACAAGTTCTTGGA+AGG 0.527506 7:+70367810 MsG0780039913.01.T01:CDS
TTGCATTTGATTGGGAAAAG+AGG 0.531593 7:+70367874 MsG0780039913.01.T01:CDS
ACCAAATCTTCAAGAGCTGT+TGG 0.548346 7:-70367123 None:intergenic
TATCAGACAACCACTTAGAA+GGG 0.556371 7:+70367232 MsG0780039913.01.T01:CDS
TGAAACTGAAGAAGTACAGA+GGG 0.557043 7:+70367488 MsG0780039913.01.T01:CDS
GTTTACAAGTTCTTGGAAGG+TGG 0.557729 7:+70367813 MsG0780039913.01.T01:CDS
CGACTATGGCTTGTAGCACA+AGG 0.568934 7:-70367345 None:intergenic
AGTGAGATTGAAACCTTGAC+AGG 0.569619 7:+70367726 MsG0780039913.01.T01:CDS
TGAAGCTCATGTCTCCGACT+CGG 0.573098 7:+70368010 MsG0780039913.01.T01:CDS
AAGTCAAGGAAATGTTTACA+AGG 0.576156 7:+70367611 MsG0780039913.01.T01:CDS
TTGGAAGCGGCCCTTCTAAG+TGG 0.585973 7:-70367242 None:intergenic
CCTTGACAGGAATTAAACAT+AGG 0.595597 7:+70367739 MsG0780039913.01.T01:CDS
TGTAATATTAGTGTTGTGTG+TGG 0.600496 7:+70367413 MsG0780039913.01.T01:CDS
GAAACTTTGCTGTCCCGAGT+CGG 0.601453 7:-70368024 None:intergenic
AGATCTGAACCAAACTGAGA+GGG 0.610781 7:-70367057 None:intergenic
TGAGCAATCATGATGCAAGT+AGG 0.613248 7:-70367931 None:intergenic
GTGAAACTGAAGAAGTACAG+AGG 0.616782 7:+70367487 MsG0780039913.01.T01:CDS
ATGCAAGTAGGACAAAGCAT+TGG 0.639422 7:-70367919 None:intergenic
AAGATCTGAACCAAACTGAG+AGG 0.653784 7:-70367058 None:intergenic
CTTGAATCACTTGACCTCAG+TGG 0.658436 7:+70367078 MsG0780039913.01.T01:CDS
TCTAGGAGGAAACGAATGAG+TGG 0.681732 7:+70366955 None:intergenic
AAGAAGTTATGAAGCTACCG+AGG 0.694572 7:+70366989 MsG0780039913.01.T01:CDS
GGTGAATGTTGTTAAAGGTG+TGG 0.702882 7:+70367896 MsG0780039913.01.T01:CDS
GAAACTGAAGAAGTACAGAG+GGG 0.785616 7:+70367489 MsG0780039913.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAAAATAACAAAGATTTGTG+TGG + Chr7:70367303-70367322 MsG0780039913.01.T01:CDS 20.0%
!!! AAACTCCTTTTAAAATTTTG+AGG - Chr7:70367198-70367217 None:intergenic 20.0%
!!! AAATTCAATTTTTGTAACCT+CGG - Chr7:70367009-70367028 None:intergenic 20.0%
!!! ACATTCTAAATTCTCATTTT+TGG + Chr7:70367791-70367810 MsG0780039913.01.T01:CDS 20.0%
!!! TCAAAATTTTAAAAGGAGTT+TGG + Chr7:70367197-70367216 MsG0780039913.01.T01:CDS 20.0%
! GATATATCACGATGAATTAT+AGG - Chr7:70367960-70367979 None:intergenic 25.0%
!! CCATTCCTCAAAATTTTAAA+AGG + Chr7:70367190-70367209 MsG0780039913.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTGATGACAAATATCTCAT+TGG + Chr7:70367582-70367601 MsG0780039913.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATTTTTGGTTTACAAGTTCT+TGG + Chr7:70367806-70367825 MsG0780039913.01.T01:CDS 25.0%
!!! CCTTTTAAAATTTTGAGGAA+TGG - Chr7:70367193-70367212 None:intergenic 25.0%
AAGTCAAGGAAATGTTTACA+AGG + Chr7:70367611-70367630 MsG0780039913.01.T01:CDS 30.0%
AGGAACATCATAAAACTTCA+TGG + Chr7:70367759-70367778 MsG0780039913.01.T01:CDS 30.0%
GATTTGTGTGGAAATATCAT+AGG + Chr7:70367315-70367334 MsG0780039913.01.T01:CDS 30.0%
TCAGTTTCACTTTCTTCATT+TGG - Chr7:70367477-70367496 None:intergenic 30.0%
TGTAATATTAGTGTTGTGTG+TGG + Chr7:70367413-70367432 MsG0780039913.01.T01:CDS 30.0%
! AGAAGAAAAGCTGGAATTTT+TGG - Chr7:70367264-70367283 None:intergenic 30.0%
AAGAGGGTGAATGTTGTTAA+AGG + Chr7:70367891-70367910 MsG0780039913.01.T01:CDS 35.0%
AATGATGCAAGAAGAAAAGC+TGG - Chr7:70367273-70367292 None:intergenic 35.0%
ATATCAGACAACCACTTAGA+AGG + Chr7:70367231-70367250 MsG0780039913.01.T01:CDS 35.0%
ATATTAGTGTTGTGTGTGGT+TGG + Chr7:70367417-70367436 MsG0780039913.01.T01:CDS 35.0%
CAATCGACATTCATTGCTTT+AGG + Chr7:70367387-70367406 MsG0780039913.01.T01:CDS 35.0%
CATTCAAAAAATTGCCACTG+AGG - Chr7:70367095-70367114 None:intergenic 35.0%
CCTATGTTTAATTCCTGTCA+AGG - Chr7:70367742-70367761 None:intergenic 35.0%
CCTTGACAGGAATTAAACAT+AGG + Chr7:70367739-70367758 MsG0780039913.01.T01:CDS 35.0%
CTCTCACATAATATGCTTTC+AGG + Chr7:70367165-70367184 MsG0780039913.01.T01:CDS 35.0%
GACAAATATCTCATTGGAGT+TGG + Chr7:70367588-70367607 MsG0780039913.01.T01:CDS 35.0%
GGTAGCTTCATAACTTCTTT+CGG - Chr7:70366988-70367007 None:intergenic 35.0%
GTGTGGAAATATCATAGGTT+TGG + Chr7:70367320-70367339 MsG0780039913.01.T01:CDS 35.0%
TATCAGACAACCACTTAGAA+GGG + Chr7:70367232-70367251 MsG0780039913.01.T01:CDS 35.0%
TGCATTTGATTGGGAAAAGA+GGG + Chr7:70367875-70367894 MsG0780039913.01.T01:CDS 35.0%
TTGAGCAGAAACAGAATTGA+AGG + Chr7:70367027-70367046 MsG0780039913.01.T01:CDS 35.0%
TTGCATTTGATTGGGAAAAG+AGG + Chr7:70367874-70367893 MsG0780039913.01.T01:CDS 35.0%
TTGGTTTACAAGTTCTTGGA+AGG + Chr7:70367810-70367829 MsG0780039913.01.T01:CDS 35.0%
! AAGCAATGAATGTCGATTGA+AGG - Chr7:70367386-70367405 None:intergenic 35.0%
! CATTTTTGCTCTTTCGACTA+TGG - Chr7:70367362-70367381 None:intergenic 35.0%
! CTTTTCCCAATCAAATGCAA+CGG - Chr7:70367874-70367893 None:intergenic 35.0%
! TGAAACTGAAGAAGTACAGA+GGG + Chr7:70367488-70367507 MsG0780039913.01.T01:CDS 35.0%
! TTTTCCATCATGACTCCAAA+TGG - Chr7:70367526-70367545 None:intergenic 35.0%
!! AAAGCTGGAATTTTTGGAAG+CGG - Chr7:70367258-70367277 None:intergenic 35.0%
!! TTTTCCATTTGGAGTCATGA+TGG + Chr7:70367519-70367538 MsG0780039913.01.T01:CDS 35.0%
!!! CTCAGTGGCAATTTTTTGAA+TGG + Chr7:70367093-70367112 MsG0780039913.01.T01:CDS 35.0%
AAGAAGTTATGAAGCTACCG+AGG + Chr7:70366989-70367008 MsG0780039913.01.T01:CDS 40.0%
AAGATCTGAACCAAACTGAG+AGG - Chr7:70367061-70367080 None:intergenic 40.0%
ACAAGCCGTTGCATTTGATT+GGG + Chr7:70367866-70367885 MsG0780039913.01.T01:CDS 40.0%
ACCAAATCTTCAAGAGCTGT+TGG - Chr7:70367126-70367145 None:intergenic 40.0%
ACCAACAGCTCTTGAAGATT+TGG + Chr7:70367122-70367141 MsG0780039913.01.T01:CDS 40.0%
AGATCTGAACCAAACTGAGA+GGG - Chr7:70367060-70367079 None:intergenic 40.0%
AGTGAGATTGAAACCTTGAC+AGG + Chr7:70367726-70367745 MsG0780039913.01.T01:CDS 40.0%
ATGCAAGTAGGACAAAGCAT+TGG - Chr7:70367922-70367941 None:intergenic 40.0%
GGTGAATGTTGTTAAAGGTG+TGG + Chr7:70367896-70367915 MsG0780039913.01.T01:CDS 40.0%
GTTTACAAGTTCTTGGAAGG+TGG + Chr7:70367813-70367832 MsG0780039913.01.T01:CDS 40.0%
TGAGCAATCATGATGCAAGT+AGG - Chr7:70367934-70367953 None:intergenic 40.0%
! GAAACTGAAGAAGTACAGAG+GGG + Chr7:70367489-70367508 MsG0780039913.01.T01:CDS 40.0%
! GTGAAACTGAAGAAGTACAG+AGG + Chr7:70367487-70367506 MsG0780039913.01.T01:CDS 40.0%
! TTTGGTGCAGTTGTCAATGT+TGG + Chr7:70367140-70367159 MsG0780039913.01.T01:CDS 40.0%
!!! GGGGAGTACTATTTTCCATT+TGG + Chr7:70367508-70367527 MsG0780039913.01.T01:CDS 40.0%
CACAAGCCGTTGCATTTGAT+TGG + Chr7:70367865-70367884 MsG0780039913.01.T01:CDS 45.0%
CTCATTGGAGTTGGAAGTCA+AGG + Chr7:70367597-70367616 MsG0780039913.01.T01:CDS 45.0%
CTTGAATCACTTGACCTCAG+TGG + Chr7:70367078-70367097 MsG0780039913.01.T01:CDS 45.0%
TACAAGGCAGAGTTATCAGC+AGG + Chr7:70367627-70367646 MsG0780039913.01.T01:CDS 45.0%
!! GGAAGTATTCCCTCTCAGTT+TGG + Chr7:70367048-70367067 MsG0780039913.01.T01:CDS 45.0%
GGCAGAGTTATCAGCAGGTT+TGG + Chr7:70367632-70367651 MsG0780039913.01.T01:CDS 50.0%
TGAAGCTCATGTCTCCGACT+CGG + Chr7:70368010-70368029 MsG0780039913.01.T01:CDS 50.0%
! CGACTATGGCTTGTAGCACA+AGG - Chr7:70367348-70367367 None:intergenic 50.0%
! GAAACTTTGCTGTCCCGAGT+CGG - Chr7:70368027-70368046 None:intergenic 50.0%
GAAGCTCATGTCTCCGACTC+GGG + Chr7:70368011-70368030 MsG0780039913.01.T01:CDS 55.0%
TTGGAAGCGGCCCTTCTAAG+TGG - Chr7:70367245-70367264 None:intergenic 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 70366970 70368049 70366970 ID=MsG0780039913.01;Name=MsG0780039913.01
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Chr7 exon 70366970 70368049 70366970 ID=MsG0780039913.01.T01:exon:13168;Parent=MsG0780039913.01.T01
Chr7 CDS 70366970 70368049 70366970 ID=MsG0780039913.01.T01:cds;Parent=MsG0780039913.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780039913.01.T01

ATGAGTGGCACGATACCGAAAGAAGTTATGAAGCTACCGAGGTTACAAAAATTGAATTTGAGCAGAAACAGAATTGAAGGAAGTATTCCCTCTCAGTTTGGTTCAGATCTTGAATCACTTGACCTCAGTGGCAATTTTTTGAATGGAAAAATACCAACAGCTCTTGAAGATTTGGTGCAGTTGTCAATGTTGGATCTCTCACATAATATGCTTTCAGGAACCATTCCTCAAAATTTTAAAAGGAGTTTGGTTTTTGATAATATATCAGACAACCACTTAGAAGGGCCGCTTCCAAAAATTCCAGCTTTTCTTCTTGCATCATTTGCATCATTAAAAAATAACAAAGATTTGTGTGGAAATATCATAGGTTTGGATCCTTGTGCTACAAGCCATAGTCGAAAGAGCAAAAATGTCCTTCAATCGACATTCATTGCTTTAGGAGCTGTAATATTAGTGTTGTGTGTGGTTGGAGCTTTGATGTATATAATGTGTCGAAGAAAAAAACCAAATGAAGAAAGTGAAACTGAAGAAGTACAGAGGGGAGTACTATTTTCCATTTGGAGTCATGATGGAAAAATGATGTTTGAAAATATTATTGAAGCTACTGAGAATTTTGATGACAAATATCTCATTGGAGTTGGAAGTCAAGGAAATGTTTACAAGGCAGAGTTATCAGCAGGTTTGGCTGTTGCTGTGAAGAAACTACATCTAGTAACAGATGAAGAAATGTCATGTTTCAGTTCAAAGTCTTTTAAGAGTGAGATTGAAACCTTGACAGGAATTAAACATAGGAACATCATAAAACTTCATGGATTTTGCTCACATTCTAAATTCTCATTTTTGGTTTACAAGTTCTTGGAAGGTGGAAGCTTAGATCAAATACTAAACAATGACACACAAGCCGTTGCATTTGATTGGGAAAAGAGGGTGAATGTTGTTAAAGGTGTGGCCAATGCTTTGTCCTACTTGCATCATGATTGCTCAACTCCTATAATTCATCGTGATATATCAAGCAAGAATATTCTTCTGAATCTTGACTATGAAGCTCATGTCTCCGACTCGGGACAGCAAAGTTTCTAA
Protein sequence

>MsG0780039913.01.T01

MSGTIPKEVMKLPRLQKLNLSRNRIEGSIPSQFGSDLESLDLSGNFLNGKIPTALEDLVQLSMLDLSHNMLSGTIPQNFKRSLVFDNISDNHLEGPLPKIPAFLLASFASLKNNKDLCGNIIGLDPCATSHSRKSKNVLQSTFIALGAVILVLCVVGALMYIMCRRKKPNEESETEEVQRGVLFSIWSHDGKMMFENIIEATENFDDKYLIGVGSQGNVYKAELSAGLAVAVKKLHLVTDEEMSCFSSKSFKSEIETLTGIKHRNIIKLHGFCSHSKFSFLVYKFLEGGSLDQILNNDTQAVAFDWEKRVNVVKGVANALSYLHHDCSTPIIHRDISSKNILLNLDYEAHVSDSGQQSF*