AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780040281.01

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MsG0780040281.01.T01 AT1G20120 26.685 371 219 14 31 384 62 396 7.98e-28 114
MsG0780040281.01.T01 AT5G45960 29.333 300 180 11 41 325 41 323 1.94e-27 112
MsG0780040281.01.T01 AT1G73610 30.636 346 186 14 47 381 35 337 1.94e-27 111
MsG0780040281.01.T01 AT4G26790 28.691 359 203 16 44 385 26 348 2.06e-27 112
MsG0780040281.01.T01 AT4G26790 28.691 359 203 16 44 385 26 348 2.06e-27 112
MsG0780040281.01.T01 AT1G28570 31.220 205 129 4 187 388 11 206 2.13e-27 108
MsG0780040281.01.T01 AT5G03980 28.406 345 190 9 34 375 16 306 3.88e-27 110
MsG0780040281.01.T01 AT2G04570 26.075 372 223 15 27 384 13 346 4.20e-27 110
MsG0780040281.01.T01 AT1G33811 27.143 350 219 12 34 372 21 345 4.27e-27 111
MsG0780040281.01.T01 AT1G28570 31.220 205 129 4 187 388 102 297 5.54e-27 110
MsG0780040281.01.T01 AT1G71250 26.316 380 232 12 19 386 18 361 1.29e-26 110
MsG0780040281.01.T01 AT5G33370 27.401 354 204 15 47 383 30 347 1.46e-26 109
MsG0780040281.01.T01 AT1G20130 27.479 353 218 14 45 384 202 529 1.52e-26 111
MsG0780040281.01.T01 AT1G23500 29.155 343 198 11 47 382 35 339 1.56e-26 109
MsG0780040281.01.T01 AT1G20130 27.479 353 218 14 45 384 182 509 2.02e-26 111
MsG0780040281.01.T01 AT1G53990 26.579 380 236 11 14 382 1 348 2.03e-26 109
MsG0780040281.01.T01 AT1G54030 29.377 337 180 12 48 375 53 340 2.44e-26 110
MsG0780040281.01.T01 AT5G03610 25.974 385 222 17 17 381 9 350 8.87e-26 107
MsG0780040281.01.T01 AT2G19060 25.526 380 226 13 22 387 5 341 2.61e-25 105
MsG0780040281.01.T01 AT1G71691 28.623 276 171 8 46 313 54 311 3.17e-25 105
MsG0780040281.01.T01 AT1G59406 26.913 379 227 14 17 385 8 346 6.21e-25 104
MsG0780040281.01.T01 AT1G59030 26.913 379 227 14 17 385 8 346 6.21e-25 104
MsG0780040281.01.T01 AT1G58725 26.913 379 227 14 17 385 8 346 6.21e-25 104
MsG0780040281.01.T01 AT1G20132 26.934 349 212 13 46 380 60 379 1.13e-24 104
MsG0780040281.01.T01 AT5G42170 27.536 345 210 11 45 380 48 361 1.20e-24 104
MsG0780040281.01.T01 AT4G28780 25.840 387 233 14 14 384 1 349 1.60e-24 103
MsG0780040281.01.T01 AT1G74460 26.901 342 201 11 49 375 25 332 1.61e-24 103
MsG0780040281.01.T01 AT5G18430 27.083 384 226 16 16 383 2 347 1.80e-24 103
MsG0780040281.01.T01 AT1G28600 36.364 198 106 8 34 221 17 204 4.97e-24 99.4
MsG0780040281.01.T01 AT5G15720 28.417 278 175 9 46 313 29 292 9.74e-24 100
MsG0780040281.01.T01 AT1G20135 27.299 348 190 13 45 376 27 327 4.24e-23 99.4
MsG0780040281.01.T01 AT1G58430 25.797 345 211 10 45 375 33 346 4.48e-23 99.8
MsG0780040281.01.T01 AT1G53940 29.073 313 189 9 13 315 10 299 5.68e-23 98.6
MsG0780040281.01.T01 AT5G37690 27.114 343 201 13 51 379 31 338 6.54e-23 99.4
MsG0780040281.01.T01 AT3G04290 26.062 353 210 14 47 383 29 346 6.78e-23 99.4
MsG0780040281.01.T01 AT2G31540 27.483 302 187 9 38 325 26 309 9.11e-23 99.0
MsG0780040281.01.T01 AT1G28610 34.872 195 113 6 34 221 17 204 9.50e-23 96.7
MsG0780040281.01.T01 AT2G19050 25.852 352 210 11 46 387 30 340 1.02e-22 98.6
MsG0780040281.01.T01 AT1G75890 27.010 311 199 11 26 325 26 319 1.86e-22 98.2
MsG0780040281.01.T01 AT1G54020 25.698 358 206 13 48 393 34 343 2.05e-22 98.2
MsG0780040281.01.T01 AT1G75890 27.010 311 199 11 26 325 55 348 3.29e-22 97.8
MsG0780040281.01.T01 AT1G75920 26.039 361 208 15 37 381 19 336 3.34e-22 97.1
MsG0780040281.01.T01 AT1G75880 24.289 387 239 11 19 385 20 372 4.90e-22 97.1
MsG0780040281.01.T01 AT5G15720 25.161 310 193 10 73 375 33 310 6.17e-22 96.3
MsG0780040281.01.T01 AT1G75880 24.359 390 234 12 19 385 20 371 9.23e-22 96.3
MsG0780040281.01.T01 AT1G58520 27.143 350 206 13 46 385 29 339 1.89e-21 94.7
MsG0780040281.01.T01 AT1G58525 27.143 350 206 13 46 385 29 339 1.89e-21 94.7
MsG0780040281.01.T01 AT2G24560 24.462 372 228 12 21 375 10 345 2.22e-21 95.1
MsG0780040281.01.T01 AT1G54000 24.297 391 245 13 13 393 2 351 2.34e-21 95.5
MsG0780040281.01.T01 AT2G30220 25.434 346 211 12 45 375 31 344 3.21e-21 94.4
MsG0780040281.01.T01 AT1G75890 26.087 322 201 11 26 325 26 332 8.00e-21 93.6
MsG0780040281.01.T01 AT5G55050 27.493 371 208 15 45 391 37 370 1.06e-20 93.2
MsG0780040281.01.T01 AT2G03980 27.434 339 203 13 45 372 41 347 1.27e-20 92.8
MsG0780040281.01.T01 AT2G03980 27.434 339 203 13 45 372 41 347 1.27e-20 92.8
MsG0780040281.01.T01 AT2G03980 27.434 339 203 13 45 372 41 347 1.27e-20 92.8
MsG0780040281.01.T01 AT2G03980 27.434 339 203 13 45 372 41 347 1.27e-20 92.8
MsG0780040281.01.T01 AT3G14820 26.801 347 207 11 46 380 31 342 4.57e-20 90.9
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MsG0780040281.01.T01 AT2G30310 24.348 345 216 11 45 375 32 345 6.57e-20 90.9
MsG0780040281.01.T01 AT1G54030 29.545 264 143 10 47 301 52 281 4.71e-19 87.4
MsG0780040281.01.T01 AT5G33370 27.465 284 166 12 47 313 30 290 9.02e-19 87.0
MsG0780040281.01.T01 AT3G43550 26.885 305 192 11 19 313 3 286 1.30e-18 85.9
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MsG0780040281.01.T01 AT1G71691 24.211 285 180 8 93 372 3 256 1.96e-18 85.1
MsG0780040281.01.T01 AT2G19050 26.692 266 163 8 46 302 30 272 2.12e-18 85.1
MsG0780040281.01.T01 AT3G14220 26.437 348 194 15 44 375 29 330 2.42e-18 86.3
MsG0780040281.01.T01 AT1G54010 24.679 389 234 16 19 393 8 351 3.95e-18 85.9
MsG0780040281.01.T01 AT5G37690 26.239 343 196 14 51 379 31 330 3.98e-18 85.5
MsG0780040281.01.T01 AT5G03600 25.556 360 204 15 41 386 8 317 5.80e-18 84.7
MsG0780040281.01.T01 AT3G09930 23.754 341 216 11 48 379 40 345 6.96e-18 84.7
MsG0780040281.01.T01 AT3G09930 23.754 341 216 11 48 379 40 345 6.96e-18 84.7
MsG0780040281.01.T01 AT5G03600 25.556 360 204 15 41 386 43 352 7.16e-18 84.7
MsG0780040281.01.T01 AT1G75920 24.615 325 189 13 70 381 27 308 8.69e-18 84.0
MsG0780040281.01.T01 AT4G16230 28.049 246 138 10 19 245 3 228 1.16e-15 76.6
MsG0780040281.01.T01 AT2G24560 24.169 331 208 11 21 334 10 314 1.36e-15 77.4
MsG0780040281.01.T01 AT2G31550 26.797 153 104 2 177 325 20 168 4.24e-14 71.6
MsG0780040281.01.T01 AT2G04020 28.571 210 131 7 45 247 41 238 3.89e-13 69.3
MsG0780040281.01.T01 AT2G04020 28.571 210 131 7 45 247 41 238 5.23e-13 69.7
MsG0780040281.01.T01 AT2G36325 24.928 349 207 14 48 383 48 354 9.86e-13 69.3
MsG0780040281.01.T01 AT4G16233 32.576 132 76 3 262 393 6 124 4.23e-11 60.8
MsG0780040281.01.T01 AT1G54020 23.024 291 169 11 111 393 14 257 7.25e-11 63.2
MsG0780040281.01.T01 AT1G54020 23.024 291 169 11 111 393 14 257 7.25e-11 63.2
MsG0780040281.01.T01 AT1G54020 23.024 291 169 11 111 393 14 257 7.25e-11 63.2

Find 89 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 153 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ATATGCTTTAACTTGATTTA+TGG 0.068484 7:+75390033 None:intergenic
ATCCATCTGTGGTGGTTAAT+TGG 0.177018 7:-75389306 MsG0780040281.01.T01:CDS
CCTGCTTTGTCTACTTTATC+TGG 0.177190 7:+75389763 None:intergenic
CTCATGGAGGAAGATCATTT+TGG 0.218514 7:-75389846 MsG0780040281.01.T01:CDS
TGACTCAGGCTGCTAATAAA+TGG 0.231451 7:-75389270 MsG0780040281.01.T01:CDS
AATTGAACATCCAAAGAAAA+AGG 0.233803 7:+75390334 None:intergenic
AACTTAGCCACTTCATTATA+AGG 0.238151 7:+75389730 None:intergenic
AGCATATGTTCCTGATGTTT+TGG 0.243035 7:-75390017 MsG0780040281.01.T01:CDS
ATAGCAGCTGGTACTATTAA+AGG 0.253287 7:+75391414 None:intergenic
CGTCTTCTTGTTGATTTCAT+TGG 0.269431 7:-75391168 MsG0780040281.01.T01:intron
GGACAACCTGGCTTTCCTTA+TGG 0.281982 7:-75391234 MsG0780040281.01.T01:CDS
GGAGGTCTTTCTGCTGCCTT+TGG 0.306582 7:-75391255 MsG0780040281.01.T01:CDS
TCAAGGTATGCATTCAAATA+TGG 0.308505 7:+75390457 None:intergenic
GCATTATACACGTTTGATAT+TGG 0.317147 7:-75390094 MsG0780040281.01.T01:CDS
ACTTAGCCACTTCATTATAA+GGG 0.344280 7:+75389731 None:intergenic
TCACCAAAGTTGAAAATTGC+TGG 0.388065 7:+75391294 None:intergenic
GGAGCAAAGGTTAAGATTCA+TGG 0.408806 7:-75389361 MsG0780040281.01.T01:CDS
CCATCACAGTAGCGACCAAC+AGG 0.409888 7:+75391192 None:intergenic
TCAATTCAAGAACACAATAA+AGG 0.412827 7:-75389993 MsG0780040281.01.T01:intron
GGAGCCAACTTTGCAACTGC+TGG 0.422001 7:-75390409 MsG0780040281.01.T01:CDS
AATACAACTCTTCATCAAAC+TGG 0.427865 7:-75390367 MsG0780040281.01.T01:CDS
TCTGCTGCCTTTGGACAACC+TGG 0.429255 7:-75391246 MsG0780040281.01.T01:CDS
TTGAATTGATCCAAAACATC+AGG 0.437871 7:+75390007 None:intergenic
TCCATCTGTGGTGGTTAATT+GGG 0.442380 7:-75389305 MsG0780040281.01.T01:CDS
GGTCAAAATGACTTGGCATC+CGG 0.460476 7:-75390073 MsG0780040281.01.T01:CDS
CAAGCCATGTTCAAGGGAAT+AGG 0.461736 7:+75389208 None:intergenic
TGATCCAGCAGTTGCAAAGT+TGG 0.463033 7:+75390405 None:intergenic
TCAGCAGTAACACTAGTTAG+TGG 0.466899 7:-75391336 MsG0780040281.01.T01:CDS
GTGTTTGAGCAAATTGTAGA+TGG 0.472083 7:-75389247 MsG0780040281.01.T01:CDS
GACTCAGGCTGCTAATAAAT+GGG 0.473136 7:-75389269 MsG0780040281.01.T01:CDS
GACTCTCCATAAGGAAAGCC+AGG 0.473826 7:+75391228 None:intergenic
AATGCATACCTTGATGCTGT+TGG 0.480352 7:-75390448 MsG0780040281.01.T01:CDS
TTGAGGGCTTGTTGTGGACA+TGG 0.484154 7:-75389418 MsG0780040281.01.T01:CDS
TTGTGAAGTTCAATGATGTA+TGG 0.487532 7:+75389793 None:intergenic
ATACAGTACCACTAAACAAA+AGG 0.496475 7:+75391383 None:intergenic
GGACATGTTGTGGAAGTAAC+CGG 0.497129 7:+75390054 None:intergenic
GTAAACGTCGACATAGGTTA+TGG 0.499723 7:+75389648 None:intergenic
TAACACTAGTTAGTGGTTCA+AGG 0.505275 7:-75391329 MsG0780040281.01.T01:CDS
ATGTATGGCAAACAACCAAC+AGG 0.506091 7:+75389808 None:intergenic
TCCTTCTTTCACCACCCTGT+TGG 0.506908 7:-75391207 MsG0780040281.01.T01:CDS
TTGACTAATGAGAGAGTACT+TGG 0.511767 7:+75389621 None:intergenic
TACAATTTACACATTGGATG+TGG 0.518591 7:-75389382 MsG0780040281.01.T01:CDS
TGATATTGGTCAAAATGACT+TGG 0.520496 7:-75390080 MsG0780040281.01.T01:CDS
TCCTCCTATTCCCTTGAACA+TGG 0.531228 7:-75389212 MsG0780040281.01.T01:CDS
GGGCTTGTTGTGGACATGGT+GGG 0.531926 7:-75389414 MsG0780040281.01.T01:CDS
CTTATGACAAGCCATGTTCA+AGG 0.535412 7:+75389201 None:intergenic
ACCAACAGGGTGGTGAAAGA+AGG 0.539045 7:+75391206 None:intergenic
CACCAAAGTTGAAAATTGCT+GGG 0.541123 7:+75391295 None:intergenic
CCTGTTGGTCGCTACTGTGA+TGG 0.541893 7:-75391192 MsG0780040281.01.T01:CDS
GGATGGTGTTCATTTGACTC+AGG 0.543315 7:-75389284 MsG0780040281.01.T01:CDS
TCCCAATTAACCACCACAGA+TGG 0.546790 7:+75389304 None:intergenic
GAATTAAAAGCTGAGAAGCT+AGG 0.546817 7:-75390484 MsG0780040281.01.T01:intron
CAGTTGCAAAGTTGGCTCCA+TGG 0.550873 7:+75390413 None:intergenic
CTTAGCCACTTCATTATAAG+GGG 0.551282 7:+75389732 None:intergenic
TTTGATTGGAAAACCATGCA+AGG 0.551912 7:-75389329 MsG0780040281.01.T01:CDS
AGTTGTATTCTGAGGTCTGA+TGG 0.553054 7:+75390381 None:intergenic
TGAAAGAAGGACTCTCCATA+AGG 0.553709 7:+75391219 None:intergenic
TTCAACCCCTTATAATGAAG+TGG 0.555517 7:-75389737 MsG0780040281.01.T01:CDS
CTTGATTTATGGACATGTTG+TGG 0.556822 7:+75390044 None:intergenic
GTATAGAATATATATGCTCA+TGG 0.563872 7:-75389862 MsG0780040281.01.T01:intron
AGGGCTTGTTGTGGACATGG+TGG 0.566998 7:-75389415 MsG0780040281.01.T01:CDS
TACAACTACAATTTACACAT+TGG 0.572481 7:-75389388 MsG0780040281.01.T01:CDS
GTTCACAATACTGGTCCTGT+TGG 0.576239 7:-75389823 MsG0780040281.01.T01:CDS
AAGGTGTTCATAATAGCAGC+TGG 0.577261 7:+75391402 None:intergenic
GACATAGGTTATGGCAGCCG+AGG 0.579197 7:+75389657 None:intergenic
TGATGAAGAGTTGTATTCTG+AGG 0.579498 7:+75390373 None:intergenic
ACACATTGGATGTGGAGCAA+AGG 0.582418 7:-75389374 MsG0780040281.01.T01:CDS
GCCATGTTCAAGGGAATAGG+AGG 0.583130 7:+75389211 None:intergenic
ACCACAGATGGATCCTTGCA+TGG 0.587054 7:+75389316 None:intergenic
TCTGTGGTGGTTAATTGGGA+TGG 0.590715 7:-75389301 MsG0780040281.01.T01:CDS
GAACCTTTGAGGGCTTGTTG+TGG 0.593370 7:-75389424 MsG0780040281.01.T01:CDS
GGTGACTCAAATTCAGACAC+TGG 0.594860 7:-75391276 MsG0780040281.01.T01:CDS
CCAGATAAAGTAGACAAAGC+AGG 0.602609 7:-75389763 MsG0780040281.01.T01:CDS
ACAACTCTTCATCAAACTGG+TGG 0.606278 7:-75390364 MsG0780040281.01.T01:CDS
GGTATGCATTCAAATATGGA+AGG 0.610676 7:+75390461 None:intergenic
AGTTCAATGATTTCCAGCGA+AGG 0.615077 7:-75390306 MsG0780040281.01.T01:CDS
AATTTGATCCAACAGCATCA+AGG 0.617273 7:+75390440 None:intergenic
TGTCCACAACAAGCCCTCAA+AGG 0.625061 7:+75389421 None:intergenic
TTATGACAAGCCATGTTCAA+GGG 0.636911 7:+75389202 None:intergenic
ACATAGGTTATGGCAGCCGA+GGG 0.638528 7:+75389658 None:intergenic
AGGAAAGCCAGGTTGTCCAA+AGG 0.645326 7:+75391239 None:intergenic
GGCTGAGTAAACGTCGACAT+AGG 0.647748 7:+75389642 None:intergenic
ATGCAAGGATCCATCTGTGG+TGG 0.648662 7:-75389314 MsG0780040281.01.T01:CDS
GACTCAAATTCAGACACTGG+AGG 0.665978 7:-75391273 MsG0780040281.01.T01:CDS
ACCATGCAAGGATCCATCTG+TGG 0.679547 7:-75389317 MsG0780040281.01.T01:CDS
ATTAGTCAAGCATACAAACA+TGG 0.686369 7:-75389607 MsG0780040281.01.T01:intron
TAGAATATATATGCTCATGG+AGG 0.722896 7:-75389859 MsG0780040281.01.T01:CDS
CACAGTAGCGACCAACAGGG+TGG 0.731365 7:+75391196 None:intergenic
CATCACAGTAGCGACCAACA+GGG 0.741125 7:+75391193 None:intergenic

CRISPR-GE

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!! CAAAGAAAATAAATATGTAT+TGG + Chr7:75389731-75389750 None:intergenic 15.0%
!! AATTGCATCAAAAATCAAAA+TGG + Chr7:75390658-75390677 None:intergenic 20.0%
!! ACTAATAAAGGTTTCTTTAT+GGG - Chr7:75389817-75389836 MsG0780040281.01.T01:CDS 20.0%
!! TACTAATAAAGGTTTCTTTA+TGG - Chr7:75389816-75389835 MsG0780040281.01.T01:CDS 20.0%
!! TCCAAAATCAAAATAACAAA+AGG + Chr7:75389975-75389994 None:intergenic 20.0%
!!! AATTGAAAGTGTGTTTTTTA+TGG - Chr7:75391147-75391166 MsG0780040281.01.T01:intron 20.0%
!!! ATATGCTTTAACTTGATTTA+TGG + Chr7:75390591-75390610 None:intergenic 20.0%
!!! TCCTTTTGTTATTTTGATTT+TGG - Chr7:75389971-75389990 MsG0780040281.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTGTTATTTTGATTTTGGA+TGG - Chr7:75389975-75389994 MsG0780040281.01.T01:intron 20.0%
! AAAACACACTTTCAATTTCT+TGG + Chr7:75391144-75391163 None:intergenic 25.0%
! AAACCTTTATTAGTACTTTG+TGG + Chr7:75389811-75389830 None:intergenic 25.0%
! AACCTTTATTAGTACTTTGT+GGG + Chr7:75389810-75389829 None:intergenic 25.0%
! AAGTAAATTACCACTAATCA+TGG + Chr7:75389679-75389698 None:intergenic 25.0%
! AATTGAACATCCAAAGAAAA+AGG + Chr7:75390290-75390309 None:intergenic 25.0%
! AGTAAATTACCACTAATCAT+GGG + Chr7:75389678-75389697 None:intergenic 25.0%
! ATAGTAGTGATAAATGAAAG+TGG + Chr7:75389510-75389529 None:intergenic 25.0%
! ATTGAACATCCAAAGAAAAA+GGG + Chr7:75390289-75390308 None:intergenic 25.0%
! GTATAGAATATATATGCTCA+TGG - Chr7:75390759-75390778 MsG0780040281.01.T01:intron 25.0%
! TACAACTACAATTTACACAT+TGG - Chr7:75391233-75391252 MsG0780040281.01.T01:CDS 25.0%
! TAGTAGTGATAAATGAAAGT+GGG + Chr7:75389509-75389528 None:intergenic 25.0%
! TATAACACGAATATACATGT+GGG - Chr7:75389776-75389795 MsG0780040281.01.T01:CDS 25.0%
! TCAATTCAAGAACACAATAA+AGG - Chr7:75390628-75390647 MsG0780040281.01.T01:intron 25.0%
! TGGATAGATATTGTCTATTT+AGG - Chr7:75389995-75390014 MsG0780040281.01.T01:CDS 25.0%
! TTATAACACGAATATACATG+TGG - Chr7:75389775-75389794 MsG0780040281.01.T01:CDS 25.0%
!! CTTGATTAAAACAGGTTTTA+AGG - Chr7:75391175-75391194 MsG0780040281.01.T01:CDS 25.0%
AACTTAGCCACTTCATTATA+AGG + Chr7:75390894-75390913 None:intergenic 30.0%
AATACAACTCTTCATCAAAC+TGG - Chr7:75390254-75390273 MsG0780040281.01.T01:intron 30.0%
ACCTTTGTTGCGAAAAAATT+GGG + Chr7:75390342-75390361 None:intergenic 30.0%
ACTTAGAAAAAAACTTCCCT+CGG - Chr7:75390947-75390966 MsG0780040281.01.T01:intron 30.0%
ACTTAGCCACTTCATTATAA+GGG + Chr7:75390893-75390912 None:intergenic 30.0%
AGTTGTAGCAATTAAGCTAA+TGG - Chr7:75390694-75390713 MsG0780040281.01.T01:intron 30.0%
ATACAGTACCACTAAACAAA+AGG + Chr7:75389241-75389260 None:intergenic 30.0%
ATTAGTCAAGCATACAAACA+TGG - Chr7:75391014-75391033 MsG0780040281.01.T01:intron 30.0%
CCTAAGAGGAAAAATATTGA+TGG + Chr7:75390461-75390480 None:intergenic 30.0%
GCATTATACACGTTTGATAT+TGG - Chr7:75390527-75390546 MsG0780040281.01.T01:intron 30.0%
GTGGGAGAAATTAAAATGAA+TGG + Chr7:75389491-75389510 None:intergenic 30.0%
GTTGTAGCAATTAAGCTAAT+GGG - Chr7:75390695-75390714 MsG0780040281.01.T01:intron 30.0%
TACAATTTACACATTGGATG+TGG - Chr7:75391239-75391258 MsG0780040281.01.T01:CDS 30.0%
TACCTTTGTTGCGAAAAAAT+TGG + Chr7:75390343-75390362 None:intergenic 30.0%
TAGAATATATATGCTCATGG+AGG - Chr7:75390762-75390781 MsG0780040281.01.T01:intron 30.0%
TCAAGGTATGCATTCAAATA+TGG + Chr7:75390167-75390186 None:intergenic 30.0%
TCTTTATGGGCAAGAATAAA+GGG - Chr7:75389830-75389849 MsG0780040281.01.T01:CDS 30.0%
TGATATTGGTCAAAATGACT+TGG - Chr7:75390541-75390560 MsG0780040281.01.T01:intron 30.0%
TGTATTAGTGTGTAAAGCTA+AGG - Chr7:75389591-75389610 MsG0780040281.01.T01:intron 30.0%
TTCTTTATGGGCAAGAATAA+AGG - Chr7:75389829-75389848 MsG0780040281.01.T01:CDS 30.0%
TTGAATTGATCCAAAACATC+AGG + Chr7:75390617-75390636 None:intergenic 30.0%
TTGTGAAGTTCAATGATGTA+TGG + Chr7:75390831-75390850 None:intergenic 30.0%
TTTCATTCTTTCTCTGTGTT+TGG - Chr7:75389559-75389578 MsG0780040281.01.T01:intron 30.0%
! CCATCAATATTTTTCCTCTT+AGG - Chr7:75390458-75390477 MsG0780040281.01.T01:CDS 30.0%
! TCAATATTTTTCCTCTTAGG+TGG - Chr7:75390461-75390480 MsG0780040281.01.T01:CDS 30.0%
!! AAAATATTGATGGCTTGTTG+AGG + Chr7:75390451-75390470 None:intergenic 30.0%
!! ATTTAGGCTAGCTGTTATTT+TGG - Chr7:75390011-75390030 MsG0780040281.01.T01:CDS 30.0%
!! CATGGAAAAGAGATTTTGAT+TGG - Chr7:75391278-75391297 MsG0780040281.01.T01:CDS 30.0%
!! TATGAACACCTTTTGTTTAG+TGG - Chr7:75389230-75389249 MsG0780040281.01.T01:CDS 30.0%
!! TGGTTTTGCTTGATTAAAAC+AGG - Chr7:75391167-75391186 MsG0780040281.01.T01:intron 30.0%
AATTTGATCCAACAGCATCA+AGG + Chr7:75390184-75390203 None:intergenic 35.0%
AGATAAGATCCCATGATTAG+TGG - Chr7:75389666-75389685 MsG0780040281.01.T01:CDS 35.0%
ATAGAGACAGATTGAGTATG+AGG + Chr7:75391068-75391087 None:intergenic 35.0%
ATAGCAGCTGGTACTATTAA+AGG + Chr7:75389210-75389229 None:intergenic 35.0%
CACCAAAGTTGAAAATTGCT+GGG + Chr7:75389329-75389348 None:intergenic 35.0%
CTTAGCCACTTCATTATAAG+GGG + Chr7:75390892-75390911 None:intergenic 35.0%
CTTGATTTATGGACATGTTG+TGG + Chr7:75390580-75390599 None:intergenic 35.0%
GAATTAAAAGCTGAGAAGCT+AGG - Chr7:75390137-75390156 MsG0780040281.01.T01:CDS 35.0%
GACAAGAATATCATCATCCA+TGG + Chr7:75389899-75389918 None:intergenic 35.0%
GGTATGCATTCAAATATGGA+AGG + Chr7:75390163-75390182 None:intergenic 35.0%
GTAATGTCGATGCATATAGT+CGG - Chr7:75390360-75390379 MsG0780040281.01.T01:CDS 35.0%
GTGTTTGAGCAAATTGTAGA+TGG - Chr7:75391374-75391393 MsG0780040281.01.T01:CDS 35.0%
TAACACTAGTTAGTGGTTCA+AGG - Chr7:75389292-75389311 MsG0780040281.01.T01:CDS 35.0%
TCACCAAAGTTGAAAATTGC+TGG + Chr7:75389330-75389349 None:intergenic 35.0%
TGATGAAGAGTTGTATTCTG+AGG + Chr7:75390251-75390270 None:intergenic 35.0%
TGGACCAATGCTGATATTTA+CGG + Chr7:75391124-75391143 None:intergenic 35.0%
TTATGACAAGCCATGTTCAA+GGG + Chr7:75391422-75391441 None:intergenic 35.0%
TTCAACCCCTTATAATGAAG+TGG - Chr7:75390884-75390903 MsG0780040281.01.T01:intron 35.0%
TTGTCCGTAAATATCAGCAT+TGG - Chr7:75391117-75391136 MsG0780040281.01.T01:intron 35.0%
TTTGATTGGAAAACCATGCA+AGG - Chr7:75391292-75391311 MsG0780040281.01.T01:CDS 35.0%
! AGCATATGTTCCTGATGTTT+TGG - Chr7:75390604-75390623 MsG0780040281.01.T01:intron 35.0%
! CGAGAAAAATCTTCTGCTTT+TGG + Chr7:75390506-75390525 None:intergenic 35.0%
! GTCCCACAAAGTACTAATAA+AGG - Chr7:75389805-75389824 MsG0780040281.01.T01:CDS 35.0%
! TCATGGAGGAAGATCATTTT+GGG - Chr7:75390776-75390795 MsG0780040281.01.T01:intron 35.0%
! TTCCCAGCAATTTTCAACTT+TGG - Chr7:75389324-75389343 MsG0780040281.01.T01:CDS 35.0%
! TTTTGTATATGCCACCTAAG+AGG + Chr7:75390475-75390494 None:intergenic 35.0%
!! CGTCTTCTTGTTGATTTCAT+TGG - Chr7:75389453-75389472 MsG0780040281.01.T01:intron 35.0%
!! GTTGGATCAAATTTTAGCCA+TGG - Chr7:75390191-75390210 MsG0780040281.01.T01:intron 35.0%
!! TTGACTAATGAGAGAGTACT+TGG + Chr7:75391003-75391022 None:intergenic 35.0%
!!! ACCCAATTTTTTCGCAACAA+AGG - Chr7:75390338-75390357 MsG0780040281.01.T01:CDS 35.0%
!!! AGGTTTTAAGGAACCTTTGA+GGG - Chr7:75391187-75391206 MsG0780040281.01.T01:CDS 35.0%
!!! TCATTTTGGGTTCACAATAC+TGG - Chr7:75390789-75390808 MsG0780040281.01.T01:intron 35.0%
AATGCATACCTTGATGCTGT+TGG - Chr7:75390173-75390192 MsG0780040281.01.T01:intron 40.0%
ACAACTCTTCATCAAACTGG+TGG - Chr7:75390257-75390276 MsG0780040281.01.T01:intron 40.0%
AGTTCAATGATTTCCAGCGA+AGG - Chr7:75390315-75390334 MsG0780040281.01.T01:CDS 40.0%
ATCCATCTGTGGTGGTTAAT+TGG - Chr7:75391315-75391334 MsG0780040281.01.T01:CDS 40.0%
ATGTATGGCAAACAACCAAC+AGG + Chr7:75390816-75390835 None:intergenic 40.0%
CCAGATAAAGTAGACAAAGC+AGG - Chr7:75390858-75390877 MsG0780040281.01.T01:intron 40.0%
CCTGCTTTGTCTACTTTATC+TGG + Chr7:75390861-75390880 None:intergenic 40.0%
CTTATGACAAGCCATGTTCA+AGG + Chr7:75391423-75391442 None:intergenic 40.0%
GACTCAGGCTGCTAATAAAT+GGG - Chr7:75391352-75391371 MsG0780040281.01.T01:CDS 40.0%
GGAGCAAAGGTTAAGATTCA+TGG - Chr7:75391260-75391279 MsG0780040281.01.T01:CDS 40.0%
GTAAACGTCGACATAGGTTA+TGG + Chr7:75390976-75390995 None:intergenic 40.0%
TATTAGTACTTTGTGGGACC+TGG + Chr7:75389804-75389823 None:intergenic 40.0%
TCAGCAGTAACACTAGTTAG+TGG - Chr7:75389285-75389304 MsG0780040281.01.T01:CDS 40.0%
TCATCATCCATGGATACTGT+CGG + Chr7:75389889-75389908 None:intergenic 40.0%
TCCATCTGTGGTGGTTAATT+GGG - Chr7:75391316-75391335 MsG0780040281.01.T01:CDS 40.0%
TGAAAGAAGGACTCTCCATA+AGG + Chr7:75389405-75389424 None:intergenic 40.0%
TGACTCAGGCTGCTAATAAA+TGG - Chr7:75391351-75391370 MsG0780040281.01.T01:CDS 40.0%
! AAGGTGTTCATAATAGCAGC+TGG + Chr7:75389222-75389241 None:intergenic 40.0%
! CATATAGTCGGTTCTTGGAT+CGG - Chr7:75390372-75390391 MsG0780040281.01.T01:CDS 40.0%
! CTCATGGAGGAAGATCATTT+TGG - Chr7:75390775-75390794 MsG0780040281.01.T01:intron 40.0%
! TGGTTTCAGCCCTTTTTCTT+TGG - Chr7:75390277-75390296 MsG0780040281.01.T01:intron 40.0%
!! AGTTGTATTCTGAGGTCTGA+TGG + Chr7:75390243-75390262 None:intergenic 40.0%
!!! CAGGTTTTAAGGAACCTTTG+AGG - Chr7:75391186-75391205 MsG0780040281.01.T01:CDS 40.0%
ACACATTGGATGTGGAGCAA+AGG - Chr7:75391247-75391266 MsG0780040281.01.T01:CDS 45.0%
CAAGCCATGTTCAAGGGAAT+AGG + Chr7:75391416-75391435 None:intergenic 45.0%
CGAATATACATGTGGGATCC+AGG - Chr7:75389783-75389802 MsG0780040281.01.T01:CDS 45.0%
GAAAAAATTGGGTCCTTCGC+TGG + Chr7:75390331-75390350 None:intergenic 45.0%
GACTCAAATTCAGACACTGG+AGG - Chr7:75389348-75389367 MsG0780040281.01.T01:CDS 45.0%
GGACATGTTGTGGAAGTAAC+CGG + Chr7:75390570-75390589 None:intergenic 45.0%
GGATGGTGTTCATTTGACTC+AGG - Chr7:75391337-75391356 MsG0780040281.01.T01:CDS 45.0%
GGTGACTCAAATTCAGACAC+TGG - Chr7:75389345-75389364 MsG0780040281.01.T01:CDS 45.0%
GTTCACAATACTGGTCCTGT+TGG - Chr7:75390798-75390817 MsG0780040281.01.T01:intron 45.0%
TCCCAATTAACCACCACAGA+TGG + Chr7:75391320-75391339 None:intergenic 45.0%
TCCTCCTATTCCCTTGAACA+TGG - Chr7:75391409-75391428 MsG0780040281.01.T01:CDS 45.0%
TCTGTGGTGGTTAATTGGGA+TGG - Chr7:75391320-75391339 MsG0780040281.01.T01:CDS 45.0%
TGATCCAGCAGTTGCAAAGT+TGG + Chr7:75390219-75390238 None:intergenic 45.0%
TTATCCACCGACAGTATCCA+TGG - Chr7:75389879-75389898 MsG0780040281.01.T01:intron 45.0%
! CGATGCATATAGTCGGTTCT+TGG - Chr7:75390367-75390386 MsG0780040281.01.T01:CDS 45.0%
! GGTCAAAATGACTTGGCATC+CGG - Chr7:75390548-75390567 MsG0780040281.01.T01:intron 45.0%
!! ATAAAAAGAAATAAAATATT+TGG + Chr7:75389759-75389778 None:intergenic 5.0%
ACATAGGTTATGGCAGCCGA+GGG + Chr7:75390966-75390985 None:intergenic 50.0%
ACCAACAGGGTGGTGAAAGA+AGG + Chr7:75389418-75389437 None:intergenic 50.0%
ACCACAGATGGATCCTTGCA+TGG + Chr7:75391308-75391327 None:intergenic 50.0%
ACCATGCAAGGATCCATCTG+TGG - Chr7:75391304-75391323 MsG0780040281.01.T01:CDS 50.0%
AGGAAAGCCAGGTTGTCCAA+AGG + Chr7:75389385-75389404 None:intergenic 50.0%
ATGCAAGGATCCATCTGTGG+TGG - Chr7:75391307-75391326 MsG0780040281.01.T01:CDS 50.0%
CATCACAGTAGCGACCAACA+GGG + Chr7:75389431-75389450 None:intergenic 50.0%
GACTCTCCATAAGGAAAGCC+AGG + Chr7:75389396-75389415 None:intergenic 50.0%
GCCATGTTCAAGGGAATAGG+AGG + Chr7:75391413-75391432 None:intergenic 50.0%
GGCTGAGTAAACGTCGACAT+AGG + Chr7:75390982-75391001 None:intergenic 50.0%
TCATCCATGGATACTGTCGG+TGG + Chr7:75389886-75389905 None:intergenic 50.0%
TCCTTCTTTCACCACCCTGT+TGG - Chr7:75389414-75389433 MsG0780040281.01.T01:CDS 50.0%
TGTCCACAACAAGCCCTCAA+AGG + Chr7:75391203-75391222 None:intergenic 50.0%
! CAGTTGCAAAGTTGGCTCCA+TGG + Chr7:75390211-75390230 None:intergenic 50.0%
! GGACAACCTGGCTTTCCTTA+TGG - Chr7:75389387-75389406 MsG0780040281.01.T01:CDS 50.0%
!! GAACCTTTGAGGGCTTGTTG+TGG - Chr7:75391197-75391216 MsG0780040281.01.T01:CDS 50.0%
!! TTGAGGGCTTGTTGTGGACA+TGG - Chr7:75391203-75391222 MsG0780040281.01.T01:CDS 50.0%
CCATCACAGTAGCGACCAAC+AGG + Chr7:75389432-75389451 None:intergenic 55.0%
CCTGTTGGTCGCTACTGTGA+TGG - Chr7:75389429-75389448 MsG0780040281.01.T01:CDS 55.0%
GACATAGGTTATGGCAGCCG+AGG + Chr7:75390967-75390986 None:intergenic 55.0%
GGAGCCAACTTTGCAACTGC+TGG - Chr7:75390212-75390231 MsG0780040281.01.T01:intron 55.0%
GGAGGTCTTTCTGCTGCCTT+TGG - Chr7:75389366-75389385 MsG0780040281.01.T01:CDS 55.0%
TCTGCTGCCTTTGGACAACC+TGG - Chr7:75389375-75389394 MsG0780040281.01.T01:CDS 55.0%
!! AGGGCTTGTTGTGGACATGG+TGG - Chr7:75391206-75391225 MsG0780040281.01.T01:CDS 55.0%
!! GGGCTTGTTGTGGACATGGT+GGG - Chr7:75391207-75391226 MsG0780040281.01.T01:CDS 55.0%
CACAGTAGCGACCAACAGGG+TGG + Chr7:75389428-75389447 None:intergenic 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 75389192 75391451 75389192 ID=MsG0780040281.01;Name=MsG0780040281.01
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Chr7 exon 75391169 75391451 75391169 ID=MsG0780040281.01.T01:exon:14758;Parent=MsG0780040281.01.T01
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Chr7 exon 75389994 75390163 75389994 ID=MsG0780040281.01.T01:exon:14756;Parent=MsG0780040281.01.T01
Chr7 exon 75389608 75389878 75389608 ID=MsG0780040281.01.T01:exon:14755;Parent=MsG0780040281.01.T01
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Chr7 CDS 75391169 75391451 75391169 ID=MsG0780040281.01.T01:cds;Parent=MsG0780040281.01.T01
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Chr7 CDS 75389192 75389454 75389192 ID=MsG0780040281.01.T01:cds;Parent=MsG0780040281.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780040281.01.T01

ATGATGAATATGAAGCCTTTAATAGTACCAGCTGCTATTATGAACACCTTTTGTTTAGTGGTACTGTATTGTTCAATTATTATTGCAAATAATTCAGCAGTAACACTAGTTAGTGGTTCAAGGAAGTGTGAATTCCCAGCAATTTTCAACTTTGGTGACTCAAATTCAGACACTGGAGGTCTTTCTGCTGCCTTTGGACAACCTGGCTTTCCTTATGGAGAGTCCTTCTTTCACCACCCTGTTGGTCGCTACTGTGATGGTCGTCTTCTTGTTGATTTCATTGCTGAGAAGCTAGGCCTTCCATATTTGAATGCATACCTTGATGCTGTTGGATCAAATTTTAGCCATGGAGCCAACTTTGCAACTGCTGGATCAACCATCAGACCTCAGAATACAACTCTTCATCAAACTGGTGGTTTCAGCCCTTTTTCTTTGGATGTTCAATTCAATCAGTTCAATGATTTCCAGCGAAGGACCCAATTTTTTCGCAACAAAGGTGGCATATACAAAACATTGTTACCAAAAGCAGAAGATTTTTCTCGAGCATTATACACGTTTGATATTGGTCAAAATGACTTGGCATCCGGTTACTTCCACAACATGTCCATAAATCAAGTTAAAGCATATGTTCCTGATGTTTTGGATCAATTCAAGAACACAATAAAGAATATATATGCTCATGGAGGAAGATCATTTTGGGTTCACAATACTGGTCCTGTTGGTTGTTTGCCATACATCATTGAACTTCACAAAGTAACACCAGATAAAGTAGACAAAGCAGGATGTTCAACCCCTTATAATGAAGTGGCTAAGTTCTTCAATCATGAATTGAAACAAGCTGTTGTTCAACTTAGAAAAAAACTTCCCTCGGCTGCCATAACCTATGTCGACGTTTACTCAGCCAAGTACTCTCTCATTAGTCAAGCATACAAACATGGTTTTAAGGAACCTTTGAGGGCTTGTTGTGGACATGGTGGGAAGTACAACTACAATTTACACATTGGATGTGGAGCAAAGGTTAAGATTCATGGAAAAGAGATTTTGATTGGAAAACCATGCAAGGATCCATCTGTGGTGGTTAATTGGGATGGTGTTCATTTGACTCAGGCTGCTAATAAATGGGTGTTTGAGCAAATTGTAGATGGTTCACTTTCTGATCCTCCTATTCCCTTGAACATGGCTTGTCATAAGCACTCTTAA
Protein sequence

>MsG0780040281.01.T01

MMNMKPLIVPAAIMNTFCLVVLYCSIIIANNSAVTLVSGSRKCEFPAIFNFGDSNSDTGGLSAAFGQPGFPYGESFFHHPVGRYCDGRLLVDFIAEKLGLPYLNAYLDAVGSNFSHGANFATAGSTIRPQNTTLHQTGGFSPFSLDVQFNQFNDFQRRTQFFRNKGGIYKTLLPKAEDFSRALYTFDIGQNDLASGYFHNMSINQVKAYVPDVLDQFKNTIKNIYAHGGRSFWVHNTGPVGCLPYIIELHKVTPDKVDKAGCSTPYNEVAKFFNHELKQAVVQLRKKLPSAAITYVDVYSAKYSLISQAYKHGFKEPLRACCGHGGKYNYNLHIGCGAKVKIHGKEILIGKPCKDPSVVVNWDGVHLTQAANKWVFEQIVDGSLSDPPIPLNMACHKHS*