AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880042458.01

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MsG0880042458.01.T01 AT5G18610 36.538 364 208 10 496 850 8 357 3.34e-65 228
MsG0880042458.01.T01 AT2G13800 32.222 450 276 10 412 851 3 433 6.80e-65 226
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MsG0880042458.01.T01 AT5G65240 31.304 460 282 8 412 851 114 559 1.01e-64 229
MsG0880042458.01.T01 AT5G65240 30.913 482 298 9 412 872 114 581 1.13e-64 229
MsG0880042458.01.T01 AT5G63710 30.726 537 307 16 362 851 10 528 2.18e-64 227
MsG0880042458.01.T01 AT5G63710 30.726 537 307 16 362 851 10 528 2.18e-64 227
MsG0880042458.01.T01 AT1G30570 40.506 316 169 6 559 867 506 809 2.84e-64 232
MsG0880042458.01.T01 AT3G46290 36.119 371 203 7 508 856 403 761 3.15e-64 232
MsG0880042458.01.T01 AT1G24650 33.394 554 291 21 339 845 296 818 3.15e-64 233
MsG0880042458.01.T01 AT5G63710 30.726 537 307 16 362 851 46 564 4.23e-64 227
MsG0880042458.01.T01 AT5G28680 35.884 379 203 6 507 856 430 797 6.51e-64 231
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MsG0880042458.01.T01 AT5G63710 30.726 537 307 16 362 851 45 563 6.81e-64 227
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MsG0880042458.01.T01 AT2G18470 36.275 306 176 5 561 859 272 565 4.53e-57 208
MsG0880042458.01.T01 AT5G35580 38.361 305 162 8 561 852 64 355 4.67e-57 204
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MsG0880042458.01.T01 AT1G07570 35.629 334 183 11 543 857 37 357 2.42e-56 200
MsG0880042458.01.T01 AT1G07570 35.629 334 183 11 543 857 48 368 2.43e-56 200
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MsG0880042458.01.T01 AT2G48010 34.734 357 203 9 513 851 214 558 3.51e-56 205
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MsG0880042458.01.T01 AT3G09830 38.462 312 164 8 552 847 63 362 8.65e-56 199
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MsG0880042458.01.T01 AT2G35620 28.522 575 300 19 361 851 25 572 1.30e-54 200
MsG0880042458.01.T01 AT2G35620 28.522 575 300 19 361 851 25 572 1.30e-54 200
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MsG0880042458.01.T01 AT5G37450 37.705 305 167 6 559 856 414 702 4.53e-54 201
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MsG0880042458.01.T01 AT1G61370 34.358 358 212 8 509 856 283 627 2.34e-53 197
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MsG0880042458.01.T01 AT1G61370 34.358 358 212 8 509 856 434 778 1.07e-52 198
MsG0880042458.01.T01 AT1G16150 35.043 351 198 8 518 851 358 695 1.09e-52 197
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MsG0880042458.01.T01 AT1G29740 33.424 368 220 8 521 883 633 980 1.61e-52 199
MsG0880042458.01.T01 AT2G25220 33.866 313 171 8 507 796 62 361 1.81e-52 188
MsG0880042458.01.T01 AT4G23200 36.012 336 191 8 522 850 290 608 1.84e-52 195
MsG0880042458.01.T01 AT4G20140 30.655 473 267 13 413 841 771 1226 1.96e-52 199
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MsG0880042458.01.T01 AT5G58940 37.736 318 172 9 546 850 117 421 1.33e-51 188
MsG0880042458.01.T01 AT5G58940 37.736 318 172 9 546 850 117 421 1.33e-51 188
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MsG0880042458.01.T01 AT4G23270 34.218 339 206 6 522 854 275 602 5.88e-51 190
MsG0880042458.01.T01 AT4G11530 35.673 342 199 10 538 870 316 645 6.99e-51 191
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MsG0880042458.01.T01 AT2G23450 38.000 300 165 7 561 852 336 622 2.37e-50 190
MsG0880042458.01.T01 AT1G79680 33.687 377 214 9 496 852 346 706 2.56e-50 190
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MsG0880042458.01.T01 AT1G61490 33.756 394 231 10 505 884 422 799 2.81e-50 191
MsG0880042458.01.T01 AT1G61490 33.756 394 231 10 505 884 422 799 2.81e-50 191
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MsG0880042458.01.T01 AT2G42960 33.956 321 191 8 561 873 171 478 2.87e-50 185
MsG0880042458.01.T01 AT2G42960 33.956 321 191 8 561 873 171 478 2.87e-50 185
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MsG0880042458.01.T01 AT2G28250 35.312 320 180 9 560 863 197 505 3.04e-50 187
MsG0880042458.01.T01 AT2G28250 35.312 320 180 9 560 863 197 505 3.04e-50 187
MsG0880042458.01.T01 AT2G28250 35.312 320 180 9 560 863 197 505 3.04e-50 187
MsG0880042458.01.T01 AT2G28250 35.312 320 180 9 560 863 197 505 3.04e-50 187
MsG0880042458.01.T01 AT5G65600 33.526 346 204 8 514 845 290 623 3.73e-50 189
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MsG0880042458.01.T01 AT2G33170 30.638 470 285 12 414 852 642 1101 4.41e-50 192
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MsG0880042458.01.T01 AT2G30740 34.431 334 190 10 536 854 34 353 4.50e-50 181
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MsG0880042458.01.T01 AT2G30740 34.431 334 190 10 536 854 34 353 4.50e-50 181
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MsG0880042458.01.T01 AT2G30740 34.431 334 190 10 536 854 34 353 4.50e-50 181
MsG0880042458.01.T01 AT2G30740 34.431 334 190 10 536 854 34 353 4.50e-50 181
MsG0880042458.01.T01 AT2G30740 34.431 334 190 10 536 854 34 353 4.50e-50 181
MsG0880042458.01.T01 AT2G30740 34.431 334 190 10 536 854 34 353 4.50e-50 181
MsG0880042458.01.T01 AT2G30740 34.431 334 190 10 536 854 34 353 4.50e-50 181
MsG0880042458.01.T01 AT2G30740 34.431 334 190 10 536 854 34 353 4.50e-50 181
MsG0880042458.01.T01 AT4G31110 33.967 368 206 8 505 851 353 704 4.59e-50 190
MsG0880042458.01.T01 AT4G31110 33.967 368 206 8 505 851 375 726 4.84e-50 190
MsG0880042458.01.T01 AT5G18910 35.093 322 184 9 555 869 174 477 5.06e-50 185
MsG0880042458.01.T01 AT1G09440 33.893 298 177 7 561 851 145 429 5.25e-50 184
MsG0880042458.01.T01 AT1G09440 33.893 298 177 7 561 851 145 429 5.25e-50 184
MsG0880042458.01.T01 AT3G55950 36.127 346 180 12 552 868 473 806 5.57e-50 190
MsG0880042458.01.T01 AT1G61420 33.083 399 232 11 505 884 272 654 5.89e-50 187
MsG0880042458.01.T01 AT5G49760 34.160 363 198 8 529 869 578 921 6.20e-50 191
MsG0880042458.01.T01 AT5G16500 35.780 327 182 11 538 850 37 349 6.67e-50 187
MsG0880042458.01.T01 AT4G11490 33.714 350 211 9 506 850 260 593 7.12e-50 187
MsG0880042458.01.T01 AT4G31100 33.967 368 206 8 505 851 366 717 7.56e-50 189
MsG0880042458.01.T01 AT1G65800 36.088 363 190 10 518 850 448 798 7.69e-50 190
MsG0880042458.01.T01 AT1G52540 32.166 314 194 6 543 850 7 307 7.74e-50 180
MsG0880042458.01.T01 AT4G13190 40.458 262 136 10 596 850 8 256 8.94e-50 178
MsG0880042458.01.T01 AT1G53440 32.987 385 228 11 509 884 612 975 9.55e-50 191
MsG0880042458.01.T01 AT2G43700 30.458 371 231 8 495 856 235 587 1.04e-49 186
MsG0880042458.01.T01 AT2G43700 30.458 371 231 8 495 856 235 587 1.04e-49 186
MsG0880042458.01.T01 AT2G43700 30.458 371 231 8 495 856 235 587 1.04e-49 186
MsG0880042458.01.T01 AT2G43700 30.458 371 231 8 495 856 235 587 1.04e-49 186
MsG0880042458.01.T01 AT1G11330 33.880 366 215 9 537 886 486 840 1.19e-49 189
MsG0880042458.01.T01 AT1G11330 33.880 366 215 9 537 886 488 842 1.21e-49 189
MsG0880042458.01.T01 AT4G23130 33.929 336 201 10 524 850 293 616 1.25e-49 187
MsG0880042458.01.T01 AT4G11470 33.828 337 199 10 522 850 296 616 1.26e-49 187
MsG0880042458.01.T01 AT5G06740 32.070 343 207 9 522 850 276 606 1.36e-49 186
MsG0880042458.01.T01 AT4G11470 33.828 337 199 10 522 850 291 611 1.39e-49 187
MsG0880042458.01.T01 AT5G06740 32.070 343 207 9 522 850 288 618 1.54e-49 186
MsG0880042458.01.T01 AT5G56040 31.224 474 280 16 409 860 598 1047 1.55e-49 190
MsG0880042458.01.T01 AT5G60320 31.928 332 202 7 529 856 311 622 1.57e-49 187
MsG0880042458.01.T01 AT1G61420 32.746 397 234 10 505 884 422 802 1.68e-49 188
MsG0880042458.01.T01 AT2G26330 32.033 487 256 16 409 846 450 910 1.71e-49 190
MsG0880042458.01.T01 AT4G23320 33.815 346 203 10 513 850 128 455 1.72e-49 183
MsG0880042458.01.T01 AT4G23320 33.815 346 203 10 513 850 128 455 1.72e-49 183
MsG0880042458.01.T01 AT5G47070 34.516 310 173 8 561 854 74 369 1.76e-49 181
MsG0880042458.01.T01 AT1G21230 38.246 285 157 6 572 851 409 679 1.78e-49 187
MsG0880042458.01.T01 AT2G24230 28.249 531 270 14 415 852 334 846 1.97e-49 189
MsG0880042458.01.T01 AT4G23190 43.321 277 132 10 509 780 294 550 1.97e-49 185
MsG0880042458.01.T01 AT1G52540 33.108 296 179 6 561 850 28 310 2.01e-49 179
MsG0880042458.01.T01 AT5G49770 36.755 302 176 4 559 856 620 910 2.07e-49 189
MsG0880042458.01.T01 AT3G59700 31.903 373 219 12 501 860 274 624 2.08e-49 186
MsG0880042458.01.T01 AT2G43700 30.458 371 231 8 495 856 259 611 2.09e-49 186
MsG0880042458.01.T01 AT2G18470 40.417 240 128 4 561 797 272 499 2.81e-49 183
MsG0880042458.01.T01 AT3G45420 31.532 333 206 6 523 852 307 620 2.82e-49 186
MsG0880042458.01.T01 AT1G11340 33.073 384 219 11 489 850 418 785 3.04e-49 188
MsG0880042458.01.T01 AT1G79670 33.983 359 201 9 517 852 311 656 3.22e-49 186
MsG0880042458.01.T01 AT1G11410 33.943 383 216 11 489 847 306 675 3.53e-49 186
MsG0880042458.01.T01 AT1G61420 33.083 399 232 11 505 884 422 804 3.56e-49 187
MsG0880042458.01.T01 AT1G61420 33.083 399 232 11 505 884 422 804 3.56e-49 187
MsG0880042458.01.T01 AT4G23320 33.815 346 203 10 513 850 149 476 3.59e-49 183
MsG0880042458.01.T01 AT4G23240 35.103 339 196 9 519 850 286 607 3.77e-49 185
MsG0880042458.01.T01 AT5G03140 32.778 360 212 11 499 847 304 644 3.83e-49 186
MsG0880042458.01.T01 AT1G79670 33.983 359 201 9 517 852 348 693 3.91e-49 187
MsG0880042458.01.T01 AT5G07180 30.020 503 267 14 409 846 335 817 3.92e-49 188
MsG0880042458.01.T01 AT1G72300 38.225 293 163 6 565 851 795 1075 3.98e-49 189
MsG0880042458.01.T01 AT1G34300 28.704 432 265 10 470 885 398 802 4.03e-49 187
MsG0880042458.01.T01 AT5G38210 37.651 332 175 12 553 875 340 648 4.04e-49 186
MsG0880042458.01.T01 AT1G80640 30.811 370 222 8 505 858 69 420 4.60e-49 180

Find 163 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 273 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
AACAACAACTAAACTATTTA+AGG 0.104908 8:+9129157 MsG0880042458.01.T01:CDS
CCACAATTTGATCTTCATTT+TGG 0.138412 8:+9129291 MsG0880042458.01.T01:CDS
GATAACTTCAAAACTATTAT+TGG 0.177303 8:+9132127 MsG0880042458.01.T01:CDS
CATGCAAAGATTGCAGATTT+TGG 0.184807 8:+9133151 MsG0880042458.01.T01:CDS
ATCAGAGTTTCTTTCTATTA+TGG 0.211532 8:+9129243 MsG0880042458.01.T01:CDS
AATATCTCCGCTCTTAACTA+TGG 0.218632 8:-9133695 None:intergenic
TTATCTAATAATAGCTTAAA+TGG 0.227337 8:+9131071 MsG0880042458.01.T01:CDS
AAAGGGAAATTTGATATGTT+TGG 0.254931 8:-9130028 None:intergenic
GATTGTTCATCATAGAAATT+TGG 0.259780 8:+9132391 MsG0880042458.01.T01:CDS
TGTACTTACTACTTTGGTTT+TGG 0.266771 8:+9128874 MsG0880042458.01.T01:CDS
ATGAACATCAAGAACACTTA+TGG 0.267283 8:+9130510 MsG0880042458.01.T01:CDS
AAACTTCAAATATCTTAAAT+TGG 0.281143 8:+9132933 MsG0880042458.01.T01:CDS
CTTATGGGTTGGCTAGAAAT+TGG 0.281348 8:+9130526 MsG0880042458.01.T01:CDS
ATTATTGGAGAAGGAGGATT+TGG 0.287014 8:+9132142 MsG0880042458.01.T01:CDS
ACTTACAAAGATGTGATTCT+TGG 0.311861 8:-9130621 None:intergenic
TAACAATTTCTCACTCCATT+TGG 0.314619 8:-9129186 None:intergenic
AAGGGAAATTTGATATGTTT+GGG 0.315594 8:-9130027 None:intergenic
TCTCACTAAAGCTTTCTTTC+CGG 0.319868 8:-9133632 None:intergenic
GCTAAAGGAATGTCTATCTT+TGG 0.327562 8:+9133849 MsG0880042458.01.T01:CDS
AATCTCCAACAACATTTGTT+AGG 0.328859 8:+9132482 MsG0880042458.01.T01:CDS
GACATGGTTCGGAGAAATAA+TGG 0.332647 8:+9133871 MsG0880042458.01.T01:CDS
AAACTAAATATCGTAGTATA+TGG 0.336379 8:-9129987 None:intergenic
CGGAGATATTGAAAACATTA+TGG 0.346753 8:+9133708 MsG0880042458.01.T01:CDS
TCTCGGTGAATGACAAGTTT+TGG 0.350872 8:+9129934 MsG0880042458.01.T01:CDS
TAACATAGTGAGCTTTGATA+TGG 0.354423 8:-9130766 None:intergenic
TCTTAACAGCGACTTGAGTT+TGG 0.355056 8:-9132192 None:intergenic
GCCAGACATAAGCGAAATAT+TGG 0.358172 8:+9133822 MsG0880042458.01.T01:CDS
GTATATGGTGTCCGGTATAT+AGG 0.362662 8:-9129972 None:intergenic
ACACGCCCTGCTGGTACATT+TGG 0.365833 8:+9133217 MsG0880042458.01.T01:CDS
GTGGAGAAGAACAATCTTAC+AGG 0.368667 8:+9131248 MsG0880042458.01.T01:CDS
AAAGCTTTAGTGAGAGCATC+TGG 0.380421 8:+9133640 MsG0880042458.01.T01:CDS
GGATTGGATTATCTGCATAA+TGG 0.383279 8:+9133064 MsG0880042458.01.T01:intron
TTTGGTCTAAGTAGAGCTTT+TGG 0.384088 8:+9133169 MsG0880042458.01.T01:CDS
TGAGAATAGTTCAAATGTTC+CGG 0.384888 8:-9129045 None:intergenic
TTCAAATCTCTATGCATAAT+AGG 0.389612 8:-9133097 None:intergenic
ATTTGATATGTTTGGGCGCT+AGG 0.391063 8:-9130020 None:intergenic
CCGCAGTTGCATCAGAAAAT+CGG 0.391619 8:-9131102 None:intergenic
ATGATGTTTATGACCGCATC+TGG 0.392486 8:+9129673 MsG0880042458.01.T01:CDS
GCCAATATTTCGCTTATGTC+TGG 0.397907 8:-9133823 None:intergenic
CATTATGGACATGAAGTTGC+AGG 0.398001 8:+9133723 MsG0880042458.01.T01:CDS
TGCCATCAATACTACAGTTT+AGG 0.404295 8:-9130590 None:intergenic
GCTTGGTGTACTTACTACTT+TGG 0.407419 8:+9128868 MsG0880042458.01.T01:CDS
TGTCTCGTTAATACAGGAAA+AGG 0.409045 8:+9129408 MsG0880042458.01.T01:CDS
TCATCTAGTAGTATGTTAGA+AGG 0.414905 8:-9133121 None:intergenic
GTCTATCTTTGGACATGGTT+CGG 0.422285 8:+9133860 MsG0880042458.01.T01:CDS
AGAAATTTGGTCTCCCTCCT+TGG 0.427486 8:+9132404 MsG0880042458.01.T01:CDS
CTTAATAGATTTCAGATAGC+AGG 0.428821 8:+9133550 MsG0880042458.01.T01:intron
TTGTCTTCAAGTGGATTGAC+AGG 0.430730 8:+9130729 MsG0880042458.01.T01:CDS
CGAAATATTGGCAGAGCTAA+AGG 0.431478 8:+9133834 MsG0880042458.01.T01:CDS
CTGAACTAATTGATCATCAT+TGG 0.432339 8:-9129739 None:intergenic
CGCAGTTGCATCAGAAAATC+GGG 0.437241 8:-9131101 None:intergenic
GGCCTAAACTGTAGTATTGA+TGG 0.437324 8:+9130588 MsG0880042458.01.T01:CDS
TTGAATTCTCTGTCTTAGAA+AGG 0.437604 8:-9130046 None:intergenic
CTTACAAAGATGTGATTCTT+GGG 0.437760 8:-9130620 None:intergenic
AAACTCAAGTCGCTGTTAAG+AGG 0.438313 8:+9132194 MsG0880042458.01.T01:CDS
CGCCTTCAAAATCTAAGAAA+AGG 0.438823 8:+9132047 MsG0880042458.01.T01:CDS
AATTACCTAACAAATGTTGT+TGG 0.448267 8:-9132487 None:intergenic
TGAACATCAAGAACACTTAT+GGG 0.450773 8:+9130511 MsG0880042458.01.T01:CDS
ATGTTGTTGGAGATTTCCTT+TGG 0.455629 8:-9132474 None:intergenic
CTCACAATCAGAAACTGAAC+AGG 0.460312 8:+9130118 MsG0880042458.01.T01:CDS
ACATTTGAACTATTCTCAAC+CGG 0.461228 8:+9129050 MsG0880042458.01.T01:CDS
GTACAAGCTCAGGATCAATC+AGG 0.461922 8:+9128896 MsG0880042458.01.T01:CDS
TCATTTCAGTTATAGAATTG+AGG 0.465509 8:+9129439 MsG0880042458.01.T01:CDS
AAAGCACTCACATACTTCAA+TGG 0.466225 8:+9133665 MsG0880042458.01.T01:CDS
CGTTTAAAACTCGATTGAAA+AGG 0.467050 8:-9129699 None:intergenic
GATGCAGAGTTCATAGATAC+AGG 0.475578 8:+9129096 MsG0880042458.01.T01:CDS
GGATTTGGAAAAGTTTACTT+TGG 0.476489 8:+9132157 MsG0880042458.01.T01:CDS
CCATCGCAAACTTCGAATAC+AGG 0.477646 8:+9129538 MsG0880042458.01.T01:CDS
TTCACTGTAACCCAAACATT+AGG 0.482503 8:-9129315 None:intergenic
ATTCTATTTGTGTTGATCAC+CGG 0.488540 8:+9133613 MsG0880042458.01.T01:CDS
AACATTGATTTATGAATACA+TGG 0.488837 8:+9132451 MsG0880042458.01.T01:CDS
CAACCATGTCTCGTTAATAC+AGG 0.489254 8:+9129402 MsG0880042458.01.T01:CDS
AATTCTATAACTGAAATGAA+TGG 0.490541 8:-9129435 None:intergenic
TTATAACCTTGCATCGATGA+TGG 0.490770 8:-9132223 None:intergenic
AAGCACTCACATACTTCAAT+GGG 0.491094 8:+9133666 MsG0880042458.01.T01:CDS
AAAATCCAAGAGAAATCAAA+AGG 0.491798 8:-9131573 None:intergenic
AGAGATAAAATTTAAAATGC+AGG 0.498360 8:+9132355 MsG0880042458.01.T01:CDS
TGAATTCTCTGTCTTAGAAA+GGG 0.498564 8:-9130045 None:intergenic
TTCAAAACTATTATTGGAGA+AGG 0.502648 8:+9132133 MsG0880042458.01.T01:CDS
CTTTAACGAGGTTGAAGAGC+TGG 0.502983 8:+9129884 MsG0880042458.01.T01:CDS
CTCTTCATACGATATGATAT+AGG 0.504022 8:+9129513 MsG0880042458.01.T01:CDS
AAAACTATTATTGGAGAAGG+AGG 0.505118 8:+9132136 MsG0880042458.01.T01:CDS
CAGTTTCATCACAGTATCCA+AGG 0.505373 8:-9132421 None:intergenic
CATGTATCCACACGCCCTGC+TGG 0.506967 8:+9133208 MsG0880042458.01.T01:CDS
TGTTTAATAATATTCTCTGT+AGG 0.508558 8:-9129138 None:intergenic
GACCTGTGGCGCCTATATAC+CGG 0.510772 8:+9129961 MsG0880042458.01.T01:CDS
ATACACCTTTAAAATTTGCA+TGG 0.514054 8:+9129820 MsG0880042458.01.T01:CDS
ACCAGGAATTTGTCTTCAAG+TGG 0.515998 8:+9130720 MsG0880042458.01.T01:intron
GATCTCTCAAGGAGTCCACT+TGG 0.518986 8:-9131278 None:intergenic
TGCATCAGAAAATCGGGTAT+AGG 0.519115 8:-9131095 None:intergenic
ATATCGTAGTATATGGTGTC+CGG 0.520148 8:-9129980 None:intergenic
ATGTAACCAAATGTACCAGC+AGG 0.520385 8:-9133223 None:intergenic
ATGTAATTTATGCCTGTGTC+CGG 0.522115 8:-9129069 None:intergenic
CAAAGATGTGATTCTTGGGA+TGG 0.530653 8:-9130616 None:intergenic
ATATCTCCGCTCTTAACTAT+GGG 0.532444 8:-9133694 None:intergenic
TAGCATAGATTGTGGCCTAC+CGG 0.534173 8:+9129026 MsG0880042458.01.T01:CDS
TAGCATTGAGGATGGGTGGA+AGG 0.534892 8:-9130070 None:intergenic
AAGACTGGTTTCTGATACAG+TGG 0.539012 8:-9133929 None:intergenic
AACTAGAGTATTCAATATCT+CGG 0.541642 8:+9129917 MsG0880042458.01.T01:CDS
TATTTAAGGAGCTTTCCAAA+TGG 0.543381 8:+9129171 MsG0880042458.01.T01:CDS
GTCTCGTTAATACAGGAAAA+GGG 0.544215 8:+9129409 MsG0880042458.01.T01:CDS
GTGAGCTTTGATATGGAAGA+TGG 0.544618 8:-9130759 None:intergenic
TATGTTTGGGCGCTAGGCAA+AGG 0.552053 8:-9130014 None:intergenic
GCAGTGTTCATCACAACTGC+TGG 0.557737 8:-9129777 None:intergenic
TGGTTATCTAGCTGAAAGAC+TGG 0.558048 8:-9133944 None:intergenic
ATATCTTAAATTGGAACGAG+AGG 0.561455 8:+9132942 MsG0880042458.01.T01:CDS
TACACCTTTAAAATTTGCAT+GGG 0.562057 8:+9129821 MsG0880042458.01.T01:CDS
GTGGTCCTGTGAAGTATATG+TGG 0.565018 8:+9130562 MsG0880042458.01.T01:CDS
CATCAAGAACACTTATGGGT+TGG 0.566407 8:+9130515 MsG0880042458.01.T01:CDS
TCAGAAACTGAACAGGAAGA+TGG 0.568571 8:+9130125 MsG0880042458.01.T01:CDS
TTATAATGAATTTCAATCAG+AGG 0.570275 8:+9132240 MsG0880042458.01.T01:CDS
ATTTATGAATACATGGCCAA+AGG 0.570371 8:+9132458 MsG0880042458.01.T01:CDS
GTCCGGTATATAGGCGCCAC+AGG 0.575005 8:-9129963 None:intergenic
GGTTACGATGCGAGATACAT+TGG 0.575819 8:-9129343 None:intergenic
CCTGTATTCGAAGTTTGCGA+TGG 0.576396 8:-9129538 None:intergenic
CCTTCCCACATATACTTCAC+AGG 0.582917 8:-9130567 None:intergenic
AACTATTCTCAACCGGACAC+AGG 0.584564 8:+9129057 MsG0880042458.01.T01:CDS
AGCATTGAGGATGGGTGGAA+GGG 0.589474 8:-9130069 None:intergenic
TTTCCTGTATTAACGAGACA+TGG 0.592732 8:-9129405 None:intergenic
AACCTCGATAGCATTGAGGA+TGG 0.593329 8:-9130078 None:intergenic
GTCCTTTGATGGCAGAAACG+TGG 0.595104 8:+9131229 MsG0880042458.01.T01:intron
AAATGTACCAGCAGGGCGTG+TGG 0.599436 8:-9133215 None:intergenic
TGGAGTGTAAATGATCTCAC+TGG 0.600632 8:-9129364 None:intergenic
TTGATCATCATTGGTAAGTG+AGG 0.603277 8:-9129730 None:intergenic
ATTTCAGCATCAGTTCTGCA+TGG 0.610062 8:+9133749 MsG0880042458.01.T01:CDS
ACCTCGATAGCATTGAGGAT+GGG 0.611892 8:-9130077 None:intergenic
GATAAACCTCGATAGCATTG+AGG 0.612836 8:-9130082 None:intergenic
GGATTCATTAGCATAGATTG+TGG 0.612915 8:+9129018 MsG0880042458.01.T01:intron
CTTTCACCATCATCGATGCA+AGG 0.613023 8:+9132217 MsG0880042458.01.T01:CDS
CCTCTACATGCACTTTAACG+AGG 0.616842 8:+9129872 MsG0880042458.01.T01:CDS
GGAATGTCTATCTTTGGACA+TGG 0.617487 8:+9133855 MsG0880042458.01.T01:CDS
TCGATAGCATTGAGGATGGG+TGG 0.618503 8:-9130074 None:intergenic
GGTTGTATGTAATCTAGCGA+TGG 0.619635 8:-9129384 None:intergenic
AAATGAAGATCAAATTGTGG+TGG 0.620507 8:-9129288 None:intergenic
AAATCTCTATGCATAATAGG+TGG 0.620528 8:-9133094 None:intergenic
CCAAAATGAAGATCAAATTG+TGG 0.622537 8:-9129291 None:intergenic
CTTCACAAACTGTAACTGAA+AGG 0.625073 8:+9133800 MsG0880042458.01.T01:CDS
ATATACTTCACAGGACCACA+TGG 0.626470 8:-9130558 None:intergenic
GCTGAAAACGATGCAACAAG+TGG 0.629394 8:-9131538 None:intergenic
TTCATCACAGTATCCAAGGA+GGG 0.630316 8:-9132417 None:intergenic
GTCTTCAAGTGGATTGACAG+GGG 0.630396 8:+9130731 MsG0880042458.01.T01:CDS
TGTCTTCAAGTGGATTGACA+GGG 0.631425 8:+9130730 MsG0880042458.01.T01:CDS
ACCCATCCTCAATGCTATCG+AGG 0.638571 8:+9130076 MsG0880042458.01.T01:CDS
AATACTGAAAGAAAATGCAA+AGG 0.638815 8:-9128845 None:intergenic
CTTACAGGGTTAGTTCCAAG+TGG 0.640690 8:+9131263 MsG0880042458.01.T01:CDS
ATTGCAATTGACGCAGCACA+TGG 0.645891 8:+9132971 MsG0880042458.01.T01:CDS
ATTTCGTCGTACAAAGACCA+AGG 0.648384 8:-9131489 None:intergenic
AGTCTGTGATATAAGAGTCA+CGG 0.652333 8:-9129470 None:intergenic
AATAGTTCAAATGTTCCGGT+AGG 0.654269 8:-9129041 None:intergenic
GGGTTGGCTAGAAATTGGCA+AGG 0.658430 8:+9130531 MsG0880042458.01.T01:CDS
ATTATGGACATGAAGTTGCA+GGG 0.659563 8:+9133724 MsG0880042458.01.T01:CDS
CCTCGTTAAAGTGCATGTAG+AGG 0.662679 8:-9129872 None:intergenic
AGTGTGGATGATGATAACCT+TGG 0.669190 8:+9131472 MsG0880042458.01.T01:intron
TGGAGAAGAACAATCTTACA+GGG 0.670108 8:+9131249 MsG0880042458.01.T01:CDS
CCTGTGAAGTATATGTGGGA+AGG 0.675663 8:+9130567 MsG0880042458.01.T01:CDS
AAACAGGTTCACTATCTCTG+AGG 0.681886 8:+9131303 MsG0880042458.01.T01:CDS
GTTATTCCCATAGTTAAGAG+CGG 0.682697 8:+9133688 MsG0880042458.01.T01:CDS
TGTAACCAAATGTACCAGCA+GGG 0.690029 8:-9133222 None:intergenic
ATTGAAAAGGAAACCAGATG+CGG 0.693844 8:-9129686 None:intergenic
AGTTTGTGAAGTGCATGACA+TGG 0.703136 8:-9133788 None:intergenic
TTTCATCACAGTATCCAAGG+AGG 0.715466 8:-9132418 None:intergenic
TGGTCCTGTGAAGTATATGT+GGG 0.728754 8:+9130563 MsG0880042458.01.T01:CDS
AATTGGCAAGGAGATCCATG+TGG 0.779024 8:+9130543 MsG0880042458.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAACTTCAAATATCTTAAAT+TGG + Chr8:9132933-9132952 MsG0880042458.01.T01:CDS 15.0%
!! GAATTAAAAAAGTTGTTAAT+TGG - Chr8:9130362-9130381 None:intergenic 15.0%
!! TGTGATATAAAAAATCAAAT+TGG + Chr8:9133257-9133276 MsG0880042458.01.T01:intron 15.0%
!! TTATCTAATAATAGCTTAAA+TGG + Chr8:9131071-9131090 MsG0880042458.01.T01:CDS 15.0%
!! TTATGCATATAGTTTATTTA+AGG - Chr8:9130655-9130674 None:intergenic 15.0%
!!! AATAATAGTTTTGAAGTTAT+CGG - Chr8:9132128-9132147 None:intergenic 15.0%
!!! TTTTTATTATTAGGATAACA+AGG + Chr8:9132647-9132666 MsG0880042458.01.T01:intron 15.0%
!! AAAAAGAAAAAACAGTTCAA+AGG - Chr8:9130464-9130483 None:intergenic 20.0%
!! AAAAATGATATCTATAGCTT+TGG + Chr8:9133586-9133605 MsG0880042458.01.T01:CDS 20.0%
!! AAAAGAAAAAACAGTTCAAA+GGG - Chr8:9130463-9130482 None:intergenic 20.0%
!! AAACTAAATATCGTAGTATA+TGG - Chr8:9129990-9130009 None:intergenic 20.0%
!! AACAACAACTAAACTATTTA+AGG + Chr8:9129157-9129176 MsG0880042458.01.T01:CDS 20.0%
!! AATTCTATAACTGAAATGAA+TGG - Chr8:9129438-9129457 None:intergenic 20.0%
!! ACATATACTACTATTTCATT+TGG + Chr8:9133451-9133470 MsG0880042458.01.T01:intron 20.0%
!! ACCTTATATTTAGAAATAGT+TGG - Chr8:9130175-9130194 None:intergenic 20.0%
!! CTACAAAAATTAATAAGATC+TGG - Chr8:9133288-9133307 None:intergenic 20.0%
!! GATAACTTCAAAACTATTAT+TGG + Chr8:9132127-9132146 MsG0880042458.01.T01:CDS 20.0%
!! GATTAAATAAACAGTATGTT+TGG + Chr8:9130817-9130836 MsG0880042458.01.T01:intron 20.0%
!! TAAAATTGAATGAAAATGCA+AGG - Chr8:9132008-9132027 None:intergenic 20.0%
!! TGTTTAATAATATTCTCTGT+AGG - Chr8:9129141-9129160 None:intergenic 20.0%
!! TTATAATGAATTTCAATCAG+AGG + Chr8:9132240-9132259 MsG0880042458.01.T01:CDS 20.0%
!! TTGAAGTAGTAAATCTATTA+TGG - Chr8:9132538-9132557 None:intergenic 20.0%
!!! AACATTGATTTATGAATACA+TGG + Chr8:9132451-9132470 MsG0880042458.01.T01:CDS 20.0%
!!! AAGGATTCCATTAAAAATTT+TGG + Chr8:9132666-9132685 MsG0880042458.01.T01:intron 20.0%
!!! AATAATCTATGTTTTTGTCA+AGG - Chr8:9130231-9130250 None:intergenic 20.0%
!!! ACCAACTATTTCTAAATATA+AGG + Chr8:9130171-9130190 MsG0880042458.01.T01:intron 20.0%
!!! ACTATATAGCTAAAGTTTTA+TGG - Chr8:9131922-9131941 None:intergenic 20.0%
!!! AGAGATAAAATTTAAAATGC+AGG + Chr8:9132355-9132374 MsG0880042458.01.T01:CDS 20.0%
!!! AGGATTCCATTAAAAATTTT+GGG + Chr8:9132667-9132686 MsG0880042458.01.T01:intron 20.0%
!!! CAAGTTTATGTACATTTTAA+AGG + Chr8:9132555-9132574 MsG0880042458.01.T01:intron 20.0%
!!! CAATTACTGATAATTTTTGT+TGG + Chr8:9129625-9129644 MsG0880042458.01.T01:intron 20.0%
!!! GATTTTTTATATCACACTTA+CGG - Chr8:9133253-9133272 None:intergenic 20.0%
!!! TTTTATCATTTAACCATATG+AGG - Chr8:9130965-9130984 None:intergenic 20.0%
! AAAATCCAAGAGAAATCAAA+AGG - Chr8:9131576-9131595 None:intergenic 25.0%
! AAAGGGAAATTTGATATGTT+TGG - Chr8:9130031-9130050 None:intergenic 25.0%
! AAGGGAAATTTGATATGTTT+GGG - Chr8:9130030-9130049 None:intergenic 25.0%
! AATAAGTTCATACATATCTC+AGG + Chr8:9128997-9129016 MsG0880042458.01.T01:intron 25.0%
! AATACTGAAAGAAAATGCAA+AGG - Chr8:9128848-9128867 None:intergenic 25.0%
! AATATAGCTTAAACCTCATA+TGG + Chr8:9130949-9130968 MsG0880042458.01.T01:intron 25.0%
! AATTACCTAACAAATGTTGT+TGG - Chr8:9132490-9132509 None:intergenic 25.0%
! AGAAGACAAAAAAGACAAAA+AGG + Chr8:9131604-9131623 MsG0880042458.01.T01:CDS 25.0%
! AGTGAAACAATGTTGATATT+AGG - Chr8:9131408-9131427 None:intergenic 25.0%
! ATCAGAGTTTCTTTCTATTA+TGG + Chr8:9129243-9129262 MsG0880042458.01.T01:CDS 25.0%
! ATTCATAATCCTTGTCTATA+AGG - Chr8:9132816-9132835 None:intergenic 25.0%
! ATTTCCAAATAATACTTCAG+AGG - Chr8:9130697-9130716 None:intergenic 25.0%
! CATATTTATTTGTCCTTTGA+TGG + Chr8:9131218-9131237 MsG0880042458.01.T01:intron 25.0%
! GATTGTTCATCATAGAAATT+TGG + Chr8:9132391-9132410 MsG0880042458.01.T01:CDS 25.0%
! GCAATAGAAAATATATCAAG+AGG - Chr8:9130198-9130217 None:intergenic 25.0%
! GGAGATTAAAATTTGTAACA+TGG + Chr8:9131022-9131041 MsG0880042458.01.T01:intron 25.0%
! TCATTTCAGTTATAGAATTG+AGG + Chr8:9129439-9129458 MsG0880042458.01.T01:CDS 25.0%
! TGTGATTAATACAACCTATA+AGG - Chr8:9131676-9131695 None:intergenic 25.0%
! TTCAAAACTATTATTGGAGA+AGG + Chr8:9132133-9132152 MsG0880042458.01.T01:CDS 25.0%
! TTCAAATCTCTATGCATAAT+AGG - Chr8:9133100-9133119 None:intergenic 25.0%
! TTTATCTTATACACAAGACT+TGG - Chr8:9131193-9131212 None:intergenic 25.0%
!! AACTAGAGTATTCAATATCT+CGG + Chr8:9129917-9129936 MsG0880042458.01.T01:CDS 25.0%
!! ACATGGTAATGTATTGTTTA+CGG + Chr8:9132988-9133007 MsG0880042458.01.T01:intron 25.0%
!! ATTATTTTCACAGCTAACTT+TGG + Chr8:9132331-9132350 MsG0880042458.01.T01:intron 25.0%
!! GGATTCCATTAAAAATTTTG+GGG + Chr8:9132668-9132687 MsG0880042458.01.T01:intron 25.0%
!!! AAGTCTCATATCGATTTTAT+AGG + Chr8:9131141-9131160 MsG0880042458.01.T01:intron 25.0%
!!! AGTCTCATATCGATTTTATA+GGG + Chr8:9131142-9131161 MsG0880042458.01.T01:intron 25.0%
!!! ATACACCTTTAAAATTTGCA+TGG + Chr8:9129820-9129839 MsG0880042458.01.T01:CDS 25.0%
!!! CATTTGCATTGTTTTATTTC+AGG + Chr8:9131045-9131064 MsG0880042458.01.T01:intron 25.0%
!!! TACACCTTTAAAATTTGCAT+GGG + Chr8:9129821-9129840 MsG0880042458.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTATCCTCTGAAGTATTATT+TGG + Chr8:9130690-9130709 MsG0880042458.01.T01:intron 25.0%
!!! TTTTGATTTCTCTTGGATTT+TGG + Chr8:9131575-9131594 MsG0880042458.01.T01:CDS 25.0%
AAAACTATTATTGGAGAAGG+AGG + Chr8:9132136-9132155 MsG0880042458.01.T01:CDS 30.0%
AAATCTCTATGCATAATAGG+TGG - Chr8:9133097-9133116 None:intergenic 30.0%
AAATGAAGATCAAATTGTGG+TGG - Chr8:9129291-9129310 None:intergenic 30.0%
AAGAATTAGTATAGCAACAG+TGG - Chr8:9131798-9131817 None:intergenic 30.0%
AAGAGAGAATAACTTCCAAA+TGG - Chr8:9130998-9131017 None:intergenic 30.0%
AAGATGAAACCTTATAGACA+AGG + Chr8:9132804-9132823 MsG0880042458.01.T01:intron 30.0%
AATCACATCAAACACACAAA+AGG + Chr8:9131689-9131708 MsG0880042458.01.T01:intron 30.0%
AATCCTGAAAATTCACACAA+AGG - Chr8:9133049-9133068 None:intergenic 30.0%
AATCTCCAACAACATTTGTT+AGG + Chr8:9132482-9132501 MsG0880042458.01.T01:CDS 30.0%
ACATTTGAACTATTCTCAAC+CGG + Chr8:9129050-9129069 MsG0880042458.01.T01:CDS 30.0%
ACTTACAAAGATGTGATTCT+TGG - Chr8:9130624-9130643 None:intergenic 30.0%
ATATCTTAAATTGGAACGAG+AGG + Chr8:9132942-9132961 MsG0880042458.01.T01:CDS 30.0%
ATCCTGAAAATTCACACAAA+GGG - Chr8:9133048-9133067 None:intergenic 30.0%
ATGAAATCCTCTACTTGAAA+TGG - Chr8:9133331-9133350 None:intergenic 30.0%
ATGAACATCAAGAACACTTA+TGG + Chr8:9130510-9130529 MsG0880042458.01.T01:CDS 30.0%
ATTTATGAATACATGGCCAA+AGG + Chr8:9132458-9132477 MsG0880042458.01.T01:CDS 30.0%
CATATCAGACACTTGTAAAA+TGG - Chr8:9132736-9132755 None:intergenic 30.0%
CCAAAATGAAGATCAAATTG+TGG - Chr8:9129294-9129313 None:intergenic 30.0%
CGGAGATATTGAAAACATTA+TGG + Chr8:9133708-9133727 MsG0880042458.01.T01:CDS 30.0%
CTCTTCATACGATATGATAT+AGG + Chr8:9129513-9129532 MsG0880042458.01.T01:CDS 30.0%
CTGAACTAATTGATCATCAT+TGG - Chr8:9129742-9129761 None:intergenic 30.0%
CTTAATAGATTTCAGATAGC+AGG + Chr8:9133550-9133569 MsG0880042458.01.T01:intron 30.0%
CTTACAAAGATGTGATTCTT+GGG - Chr8:9130623-9130642 None:intergenic 30.0%
GGAAGTTATTCTCTCTTTAT+TGG + Chr8:9131001-9131020 MsG0880042458.01.T01:intron 30.0%
GGATTTGGAAAAGTTTACTT+TGG + Chr8:9132157-9132176 MsG0880042458.01.T01:CDS 30.0%
TAAAACAAATCCACTCCATT+TGG + Chr8:9130980-9130999 MsG0880042458.01.T01:intron 30.0%
TAAACAGTATGTTTGGATGA+AGG + Chr8:9130824-9130843 MsG0880042458.01.T01:intron 30.0%
TAACAATTTCTCACTCCATT+TGG - Chr8:9129189-9129208 None:intergenic 30.0%
TAGTAGTAGTAGTAGATTTG+TGG - Chr8:9130303-9130322 None:intergenic 30.0%
TATTATTTGGAAATGCAACC+AGG + Chr8:9130703-9130722 MsG0880042458.01.T01:intron 30.0%
TATTTAAGGAGCTTTCCAAA+TGG + Chr8:9129171-9129190 MsG0880042458.01.T01:CDS 30.0%
TCATCTAGTAGTATGTTAGA+AGG - Chr8:9133124-9133143 None:intergenic 30.0%
TCTATAAGGTTTCATCTTAG+TGG - Chr8:9132802-9132821 None:intergenic 30.0%
TGAACATCAAGAACACTTAT+GGG + Chr8:9130511-9130530 MsG0880042458.01.T01:CDS 30.0%
TGAATTCTCTGTCTTAGAAA+GGG - Chr8:9130048-9130067 None:intergenic 30.0%
TGAGAATAGTTCAAATGTTC+CGG - Chr8:9129048-9129067 None:intergenic 30.0%
TTGAATTCTCTGTCTTAGAA+AGG - Chr8:9130049-9130068 None:intergenic 30.0%
! AGATTATTTCTCTTTCTCGA+AGG + Chr8:9130243-9130262 MsG0880042458.01.T01:intron 30.0%
! AGCATTTAAAACGAAAGCAT+AGG - Chr8:9132873-9132892 None:intergenic 30.0%
! ATTCTATTTGTGTTGATCAC+CGG + Chr8:9133613-9133632 MsG0880042458.01.T01:CDS 30.0%
! CATTTTCTTTCAGTATTGCT+TGG + Chr8:9128851-9128870 MsG0880042458.01.T01:CDS 30.0%
! CCACAATTTGATCTTCATTT+TGG + Chr8:9129291-9129310 MsG0880042458.01.T01:CDS 30.0%
! CGTTTAAAACTCGATTGAAA+AGG - Chr8:9129702-9129721 None:intergenic 30.0%
! CTCCTTTTCTTAGATTTTGA+AGG - Chr8:9132052-9132071 None:intergenic 30.0%
! GATTATTTCTCTTTCTCGAA+GGG + Chr8:9130244-9130263 MsG0880042458.01.T01:intron 30.0%
! TAAACATCCATTTCAAGTAG+AGG + Chr8:9133321-9133340 MsG0880042458.01.T01:intron 30.0%
! TAACATAGTGAGCTTTGATA+TGG - Chr8:9130769-9130788 None:intergenic 30.0%
! TAGGGTCTTATATTTATGGA+AGG + Chr8:9130397-9130416 MsG0880042458.01.T01:intron 30.0%
! TATGTTTGGATGAAGGATTT+TGG + Chr8:9130831-9130850 MsG0880042458.01.T01:intron 30.0%
! TCACTAGGGTCTTATATTTA+TGG + Chr8:9130393-9130412 MsG0880042458.01.T01:intron 30.0%
! TCATTTTGGACCTAATGTTT+GGG + Chr8:9129305-9129324 MsG0880042458.01.T01:CDS 30.0%
! TCCTTCCCCAAAATTTTTAA+TGG - Chr8:9132676-9132695 None:intergenic 30.0%
! TTCATTTTGGACCTAATGTT+TGG + Chr8:9129304-9129323 MsG0880042458.01.T01:CDS 30.0%
! TTTGTATTTTACCTCTGCTA+AGG - Chr8:9132624-9132643 None:intergenic 30.0%
!! AATAGTTGGTAGTATTTGTG+TGG - Chr8:9130161-9130180 None:intergenic 30.0%
!! TCCATTAAAAATTTTGGGGA+AGG + Chr8:9132672-9132691 MsG0880042458.01.T01:intron 30.0%
!! TGTACTTACTACTTTGGTTT+TGG + Chr8:9128874-9128893 MsG0880042458.01.T01:CDS 30.0%
!! TTTGTGTGAATTTTCAGGAT+TGG + Chr8:9133048-9133067 MsG0880042458.01.T01:intron 30.0%
!!! CTAATCCTTTTGATTTCTCT+TGG + Chr8:9131568-9131587 MsG0880042458.01.T01:CDS 30.0%
!!! GTCTCATATCGATTTTATAG+GGG + Chr8:9131143-9131162 MsG0880042458.01.T01:intron 30.0%
AAGCACTCACATACTTCAAT+GGG + Chr8:9133666-9133685 MsG0880042458.01.T01:CDS 35.0%
AAGGTATGCATTCAAACCAA+TGG - Chr8:9131657-9131676 None:intergenic 35.0%
AATAGTTCAAATGTTCCGGT+AGG - Chr8:9129044-9129063 None:intergenic 35.0%
AATATCTCCGCTCTTAACTA+TGG - Chr8:9133698-9133717 None:intergenic 35.0%
AGAATAACTTCCAAATGGAG+TGG - Chr8:9130993-9131012 None:intergenic 35.0%
AGTCTGTGATATAAGAGTCA+CGG - Chr8:9129473-9129492 None:intergenic 35.0%
ATATCGTAGTATATGGTGTC+CGG - Chr8:9129983-9130002 None:intergenic 35.0%
ATATCTCCGCTCTTAACTAT+GGG - Chr8:9133697-9133716 None:intergenic 35.0%
ATGTAATTTATGCCTGTGTC+CGG - Chr8:9129072-9129091 None:intergenic 35.0%
ATGTTGTTGGAGATTTCCTT+TGG - Chr8:9132477-9132496 None:intergenic 35.0%
ATTATGGACATGAAGTTGCA+GGG + Chr8:9133724-9133743 MsG0880042458.01.T01:CDS 35.0%
ATTATTGGAGAAGGAGGATT+TGG + Chr8:9132142-9132161 MsG0880042458.01.T01:CDS 35.0%
ATTCACGTGATTTAGTCACT+AGG + Chr8:9130378-9130397 MsG0880042458.01.T01:intron 35.0%
ATTGAAAAGGAAACCAGATG+CGG - Chr8:9129689-9129708 None:intergenic 35.0%
CGCCTTCAAAATCTAAGAAA+AGG + Chr8:9132047-9132066 MsG0880042458.01.T01:CDS 35.0%
CTTCACAAACTGTAACTGAA+AGG + Chr8:9133800-9133819 MsG0880042458.01.T01:CDS 35.0%
GCTAAAGGAATGTCTATCTT+TGG + Chr8:9133849-9133868 MsG0880042458.01.T01:CDS 35.0%
GGAGTAGTGTATTAATCCAT+TGG + Chr8:9131638-9131657 MsG0880042458.01.T01:intron 35.0%
GGATTCATTAGCATAGATTG+TGG + Chr8:9129018-9129037 MsG0880042458.01.T01:intron 35.0%
GGATTGGATTATCTGCATAA+TGG + Chr8:9133064-9133083 MsG0880042458.01.T01:intron 35.0%
GGTTTGAATGCATACCTTAT+AGG + Chr8:9131659-9131678 MsG0880042458.01.T01:intron 35.0%
GTCTCGTTAATACAGGAAAA+GGG + Chr8:9129409-9129428 MsG0880042458.01.T01:CDS 35.0%
GTTATTCCCATAGTTAAGAG+CGG + Chr8:9133688-9133707 MsG0880042458.01.T01:CDS 35.0%
TATTATGGATGTTGACACTG+CGG - Chr8:9132523-9132542 None:intergenic 35.0%
TCCACACTGAAAAAAGTCAA+AGG - Chr8:9131460-9131479 None:intergenic 35.0%
TCTCACTAAAGCTTTCTTTC+CGG - Chr8:9133635-9133654 None:intergenic 35.0%
TGCCATCAATACTACAGTTT+AGG - Chr8:9130593-9130612 None:intergenic 35.0%
TGGAGAAGAACAATCTTACA+GGG + Chr8:9131249-9131268 MsG0880042458.01.T01:CDS 35.0%
TGTCTCGTTAATACAGGAAA+AGG + Chr8:9129408-9129427 MsG0880042458.01.T01:CDS 35.0%
TTCACGTGATTTAGTCACTA+GGG + Chr8:9130379-9130398 MsG0880042458.01.T01:intron 35.0%
TTCACTGTAACCCAAACATT+AGG - Chr8:9129318-9129337 None:intergenic 35.0%
TTGATCATCATTGGTAAGTG+AGG - Chr8:9129733-9129752 None:intergenic 35.0%
TTTCCTGTATTAACGAGACA+TGG - Chr8:9129408-9129427 None:intergenic 35.0%
! AAAGCACTCACATACTTCAA+TGG + Chr8:9133665-9133684 MsG0880042458.01.T01:CDS 35.0%
! CATGCAAAGATTGCAGATTT+TGG + Chr8:9133151-9133170 MsG0880042458.01.T01:CDS 35.0%
! GCAACAGTGGATTTAAATTG+CGG - Chr8:9131785-9131804 None:intergenic 35.0%
! TTATAACCTTGCATCGATGA+TGG - Chr8:9132226-9132245 None:intergenic 35.0%
! TTTGGTCTAAGTAGAGCTTT+TGG + Chr8:9133169-9133188 MsG0880042458.01.T01:CDS 35.0%
!! GTGAATGACAAGTTTTGGTA+TGG + Chr8:9129939-9129958 MsG0880042458.01.T01:CDS 35.0%
!!! AACCTGTTTTTGATCTCTCA+AGG - Chr8:9131292-9131311 None:intergenic 35.0%
!!! ACCTTTGACTTTTTTCAGTG+TGG + Chr8:9131456-9131475 MsG0880042458.01.T01:intron 35.0%
!!! ATGAAGGATTTTGGAACTGA+GGG + Chr8:9130840-9130859 MsG0880042458.01.T01:intron 35.0%
AAACAGGTTCACTATCTCTG+AGG + Chr8:9131303-9131322 MsG0880042458.01.T01:CDS 40.0%
AAACTCAAGTCGCTGTTAAG+AGG + Chr8:9132194-9132213 MsG0880042458.01.T01:CDS 40.0%
AATCGATCAAACCTTAGCAG+AGG + Chr8:9132610-9132629 MsG0880042458.01.T01:intron 40.0%
ACCAGGAATTTGTCTTCAAG+TGG + Chr8:9130720-9130739 MsG0880042458.01.T01:intron 40.0%
AGTGTGGATGATGATAACCT+TGG + Chr8:9131472-9131491 MsG0880042458.01.T01:intron 40.0%
AGTTTGTGAAGTGCATGACA+TGG - Chr8:9133791-9133810 None:intergenic 40.0%
ATATACTTCACAGGACCACA+TGG - Chr8:9130561-9130580 None:intergenic 40.0%
ATGATGTTTATGACCGCATC+TGG + Chr8:9129673-9129692 MsG0880042458.01.T01:CDS 40.0%
ATGTAACCAAATGTACCAGC+AGG - Chr8:9133226-9133245 None:intergenic 40.0%
ATTTCAGCATCAGTTCTGCA+TGG + Chr8:9133749-9133768 MsG0880042458.01.T01:CDS 40.0%
ATTTCGTCGTACAAAGACCA+AGG - Chr8:9131492-9131511 None:intergenic 40.0%
ATTTGATATGTTTGGGCGCT+AGG - Chr8:9130023-9130042 None:intergenic 40.0%
CAAAGATGTGATTCTTGGGA+TGG - Chr8:9130619-9130638 None:intergenic 40.0%
CAACCATGTCTCGTTAATAC+AGG + Chr8:9129402-9129421 MsG0880042458.01.T01:CDS 40.0%
CAGTTTCATCACAGTATCCA+AGG - Chr8:9132424-9132443 None:intergenic 40.0%
CATCAAGAACACTTATGGGT+TGG + Chr8:9130515-9130534 MsG0880042458.01.T01:CDS 40.0%
CATTATGGACATGAAGTTGC+AGG + Chr8:9133723-9133742 MsG0880042458.01.T01:CDS 40.0%
CGAAATATTGGCAGAGCTAA+AGG + Chr8:9133834-9133853 MsG0880042458.01.T01:CDS 40.0%
CTCACAATCAGAAACTGAAC+AGG + Chr8:9130118-9130137 MsG0880042458.01.T01:CDS 40.0%
CTCCTTGAGAGATCAAAAAC+AGG + Chr8:9131287-9131306 MsG0880042458.01.T01:CDS 40.0%
GATAAACCTCGATAGCATTG+AGG - Chr8:9130085-9130104 None:intergenic 40.0%
GATGCAGAGTTCATAGATAC+AGG + Chr8:9129096-9129115 MsG0880042458.01.T01:CDS 40.0%
GCAAGGATGTGTGAAAAATG+TGG - Chr8:9131991-9132010 None:intergenic 40.0%
GCCAATATTTCGCTTATGTC+TGG - Chr8:9133826-9133845 None:intergenic 40.0%
GCCAGACATAAGCGAAATAT+TGG + Chr8:9133822-9133841 MsG0880042458.01.T01:CDS 40.0%
GGAATGTCTATCTTTGGACA+TGG + Chr8:9133855-9133874 MsG0880042458.01.T01:CDS 40.0%
GGTTGTATGTAATCTAGCGA+TGG - Chr8:9129387-9129406 None:intergenic 40.0%
GTATATGGTGTCCGGTATAT+AGG - Chr8:9129975-9129994 None:intergenic 40.0%
GTCTATCTTTGGACATGGTT+CGG + Chr8:9133860-9133879 MsG0880042458.01.T01:CDS 40.0%
GTGGAGAAGAACAATCTTAC+AGG + Chr8:9131248-9131267 MsG0880042458.01.T01:CDS 40.0%
GTGGATTTAAATTGCGGATG+TGG - Chr8:9131779-9131798 None:intergenic 40.0%
TCACACAAAGGGCAATGTAA+GGG - Chr8:9133037-9133056 None:intergenic 40.0%
TCAGAAACTGAACAGGAAGA+TGG + Chr8:9130125-9130144 MsG0880042458.01.T01:CDS 40.0%
TCCACTTGAAGACAAATTCC+TGG - Chr8:9130724-9130743 None:intergenic 40.0%
TCTTAACAGCGACTTGAGTT+TGG - Chr8:9132195-9132214 None:intergenic 40.0%
TGCATCAGAAAATCGGGTAT+AGG - Chr8:9131098-9131117 None:intergenic 40.0%
TGGAGTGTAAATGATCTCAC+TGG - Chr8:9129367-9129386 None:intergenic 40.0%
TGGTCCTGTGAAGTATATGT+GGG + Chr8:9130563-9130582 MsG0880042458.01.T01:CDS 40.0%
TGTAACCAAATGTACCAGCA+GGG - Chr8:9133225-9133244 None:intergenic 40.0%
TTCACACAAAGGGCAATGTA+AGG - Chr8:9133038-9133057 None:intergenic 40.0%
TTCATCACAGTATCCAAGGA+GGG - Chr8:9132420-9132439 None:intergenic 40.0%
TTTCATCACAGTATCCAAGG+AGG - Chr8:9132421-9132440 None:intergenic 40.0%
! GACATGGTTCGGAGAAATAA+TGG + Chr8:9133871-9133890 MsG0880042458.01.T01:CDS 40.0%
! GCTGCCCATGCAAATTTTAA+AGG - Chr8:9129828-9129847 None:intergenic 40.0%
! GGCCTAAACTGTAGTATTGA+TGG + Chr8:9130588-9130607 MsG0880042458.01.T01:CDS 40.0%
! GTGAGCTTTGATATGGAAGA+TGG - Chr8:9130762-9130781 None:intergenic 40.0%
! TCTCGGTGAATGACAAGTTT+TGG + Chr8:9129934-9129953 MsG0880042458.01.T01:CDS 40.0%
! TGCCCTTTGTGTGAATTTTC+AGG + Chr8:9133043-9133062 MsG0880042458.01.T01:intron 40.0%
!! AAAGCTTTAGTGAGAGCATC+TGG + Chr8:9133640-9133659 MsG0880042458.01.T01:CDS 40.0%
!! AAGACTGGTTTCTGATACAG+TGG - Chr8:9133932-9133951 None:intergenic 40.0%
!! CTTATGGGTTGGCTAGAAAT+TGG + Chr8:9130526-9130545 MsG0880042458.01.T01:CDS 40.0%
!! GACAAAAAGGTACTTCTCAG+AGG + Chr8:9131617-9131636 MsG0880042458.01.T01:intron 40.0%
!! GCTTGGTGTACTTACTACTT+TGG + Chr8:9128868-9128887 MsG0880042458.01.T01:CDS 40.0%
!! TGTCTTCAAGTGGATTGACA+GGG + Chr8:9130730-9130749 MsG0880042458.01.T01:CDS 40.0%
!! TTGTCTTCAAGTGGATTGAC+AGG + Chr8:9130729-9130748 MsG0880042458.01.T01:CDS 40.0%
!!! GATGAAGGATTTTGGAACTG+AGG + Chr8:9130839-9130858 MsG0880042458.01.T01:intron 40.0%
!!! TTTGGTTTTGGTACAAGCTC+AGG + Chr8:9128886-9128905 MsG0880042458.01.T01:CDS 40.0%
AACTATTCTCAACCGGACAC+AGG + Chr8:9129057-9129076 MsG0880042458.01.T01:CDS 45.0%
AATTGGCAAGGAGATCCATG+TGG + Chr8:9130543-9130562 MsG0880042458.01.T01:CDS 45.0%
AGAAATTTGGTCTCCCTCCT+TGG + Chr8:9132404-9132423 MsG0880042458.01.T01:CDS 45.0%
AGGGGCAGAACAATCTTACA+GGG + Chr8:9131161-9131180 MsG0880042458.01.T01:intron 45.0%
ATTGCAATTGACGCAGCACA+TGG + Chr8:9132971-9132990 MsG0880042458.01.T01:CDS 45.0%
CCATCGCAAACTTCGAATAC+AGG + Chr8:9129538-9129557 MsG0880042458.01.T01:CDS 45.0%
CCGCAGTTGCATCAGAAAAT+CGG - Chr8:9131105-9131124 None:intergenic 45.0%
CCTCGTTAAAGTGCATGTAG+AGG - Chr8:9129875-9129894 None:intergenic 45.0%
CCTCTACATGCACTTTAACG+AGG + Chr8:9129872-9129891 MsG0880042458.01.T01:CDS 45.0%
CCTGTATTCGAAGTTTGCGA+TGG - Chr8:9129541-9129560 None:intergenic 45.0%
CCTGTGAAGTATATGTGGGA+AGG + Chr8:9130567-9130586 MsG0880042458.01.T01:CDS 45.0%
CCTTCCCACATATACTTCAC+AGG - Chr8:9130570-9130589 None:intergenic 45.0%
CGCAGTTGCATCAGAAAATC+GGG - Chr8:9131104-9131123 None:intergenic 45.0%
CTTTAACGAGGTTGAAGAGC+TGG + Chr8:9129884-9129903 MsG0880042458.01.T01:CDS 45.0%
CTTTCACCATCATCGATGCA+AGG + Chr8:9132217-9132236 MsG0880042458.01.T01:CDS 45.0%
GCTGAAAACGATGCAACAAG+TGG - Chr8:9131541-9131560 None:intergenic 45.0%
GGTTACGATGCGAGATACAT+TGG - Chr8:9129346-9129365 None:intergenic 45.0%
GTACAAGCTCAGGATCAATC+AGG + Chr8:9128896-9128915 MsG0880042458.01.T01:CDS 45.0%
GTGGTCCTGTGAAGTATATG+TGG + Chr8:9130562-9130581 MsG0880042458.01.T01:CDS 45.0%
GTTGGTCACGTACAAACAAC+AGG + Chr8:9129643-9129662 MsG0880042458.01.T01:intron 45.0%
TAATGCTTGTGTGCATGCAG+TGG + Chr8:9132910-9132929 MsG0880042458.01.T01:intron 45.0%
TACCACGACTACTACTGCTA+CGG + Chr8:9130333-9130352 MsG0880042458.01.T01:intron 45.0%
TAGCATAGATTGTGGCCTAC+CGG + Chr8:9129026-9129045 MsG0880042458.01.T01:CDS 45.0%
TAGGGGCAGAACAATCTTAC+AGG + Chr8:9131160-9131179 MsG0880042458.01.T01:intron 45.0%
! AACCTCGATAGCATTGAGGA+TGG - Chr8:9130081-9130100 None:intergenic 45.0%
! ACCTCGATAGCATTGAGGAT+GGG - Chr8:9130080-9130099 None:intergenic 45.0%
! CCGATTTTCTGATGCAACTG+CGG + Chr8:9131102-9131121 MsG0880042458.01.T01:CDS 45.0%
!! CAAGTTTTGGTATGGACCTG+TGG + Chr8:9129947-9129966 MsG0880042458.01.T01:CDS 45.0%
!! CTTACAGGGTTAGTTCCAAG+TGG + Chr8:9131175-9131194 MsG0880042458.01.T01:intron 45.0%
!! GGTTCACTATCTCTGAGGTA+TGG + Chr8:9131308-9131327 MsG0880042458.01.T01:intron 45.0%
!! GTCTTCAAGTGGATTGACAG+GGG + Chr8:9130731-9130750 MsG0880042458.01.T01:CDS 45.0%
!!! TACAAATTTTTTTTATTATT+AGG + Chr8:9132638-9132657 MsG0880042458.01.T01:intron 5.0%
ACCCATCCTCAATGCTATCG+AGG + Chr8:9130076-9130095 MsG0880042458.01.T01:CDS 50.0%
CTCCACGTTTCTGCCATCAA+AGG - Chr8:9131234-9131253 None:intergenic 50.0%
GATCTCTCAAGGAGTCCACT+TGG - Chr8:9131281-9131300 None:intergenic 50.0%
GCAGTGTTCATCACAACTGC+TGG - Chr8:9129780-9129799 None:intergenic 50.0%
TATGTTTGGGCGCTAGGCAA+AGG - Chr8:9130017-9130036 None:intergenic 50.0%
TTGCGGATGTGGACGCAATA+TGG - Chr8:9131768-9131787 None:intergenic 50.0%
! AGCATTGAGGATGGGTGGAA+GGG - Chr8:9130072-9130091 None:intergenic 50.0%
! GTCCTTTGATGGCAGAAACG+TGG + Chr8:9131229-9131248 MsG0880042458.01.T01:intron 50.0%
! TAGCATTGAGGATGGGTGGA+AGG - Chr8:9130073-9130092 None:intergenic 50.0%
! TCGATAGCATTGAGGATGGG+TGG - Chr8:9130077-9130096 None:intergenic 50.0%
!! GGGTTGGCTAGAAATTGGCA+AGG + Chr8:9130531-9130550 MsG0880042458.01.T01:CDS 50.0%
AAATGTACCAGCAGGGCGTG+TGG - Chr8:9133218-9133237 None:intergenic 55.0%
ACACGCCCTGCTGGTACATT+TGG + Chr8:9133217-9133236 MsG0880042458.01.T01:CDS 55.0%
AGCCGTAGCAGTAGTAGTCG+TGG - Chr8:9130338-9130357 None:intergenic 55.0%
GACCTGTGGCGCCTATATAC+CGG + Chr8:9129961-9129980 MsG0880042458.01.T01:CDS 55.0%
CATGTATCCACACGCCCTGC+TGG + Chr8:9133208-9133227 MsG0880042458.01.T01:CDS 60.0%
GTCCGGTATATAGGCGCCAC+AGG - Chr8:9129966-9129985 None:intergenic 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
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