AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880042470.01

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MsG0880042470.01.T01 AT5G18610 41.724 290 159 6 388 668 69 357 3.91e-70 238
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MsG0880042470.01.T01 AT3G24550 39.527 296 164 6 390 674 268 559 5.50e-69 238
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MsG0880042470.01.T01 AT5G38560 39.535 301 173 5 377 668 314 614 7.54e-69 239
MsG0880042470.01.T01 AT5G28680 42.808 292 163 3 388 675 507 798 8.53e-69 242
MsG0880042470.01.T01 AT5G28680 42.808 292 163 3 388 675 507 798 8.53e-69 242
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MsG0880042470.01.T01 AT5G01020 39.932 293 161 7 390 669 57 347 3.97e-65 221
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MsG0880042470.01.T01 AT5G54590 42.244 303 151 7 389 680 102 391 9.91e-65 221
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MsG0880042470.01.T01 AT2G07180 39.527 296 163 7 390 670 78 372 2.74e-64 220
MsG0880042470.01.T01 AT4G13190 38.870 301 174 6 377 668 46 345 3.42e-64 218
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MsG0880042470.01.T01 AT1G69790 36.977 311 175 7 388 683 70 374 4.80e-64 218
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MsG0880042470.01.T01 AT3G17420 38.434 281 166 4 390 664 142 421 1.29e-63 219
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MsG0880042470.01.T01 AT1G07570 35.694 353 204 9 355 688 20 368 5.49e-63 216
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MsG0880042470.01.T01 AT4G01330 38.983 295 168 6 403 692 165 452 5.24e-62 215
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MsG0880042470.01.T01 AT2G05940 38.567 293 167 6 390 670 75 366 3.35e-61 213
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MsG0880042470.01.T01 AT1G09440 37.762 286 171 4 390 669 145 429 4.76e-61 212
MsG0880042470.01.T01 AT1G49270 38.776 294 171 5 390 675 324 616 4.94e-61 218
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MsG0880042470.01.T01 AT5G01950 40.940 298 163 7 383 672 607 899 7.37e-61 221
MsG0880042470.01.T01 AT5G01950 40.940 298 163 7 383 672 607 899 7.37e-61 221
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MsG0880042470.01.T01 AT3G59420 38.870 301 175 5 384 676 494 793 1.34e-60 219
MsG0880042470.01.T01 AT4G05200 37.217 309 188 4 363 665 307 615 1.39e-60 216
MsG0880042470.01.T01 AT2G13800 37.457 291 172 6 388 669 144 433 1.82e-60 211
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MsG0880042470.01.T01 AT3G55450 38.667 300 163 7 388 668 84 381 2.02e-60 209
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MsG0880042470.01.T01 AT2G13800 37.457 291 172 6 388 669 261 550 3.36e-59 210
MsG0880042470.01.T01 AT1G34210 38.488 291 169 6 388 669 291 580 3.80e-59 211
MsG0880042470.01.T01 AT1G34210 38.488 291 169 6 388 669 291 580 3.80e-59 211
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MsG0880042470.01.T01 AT1G67520 38.961 308 176 6 378 674 265 571 4.60e-59 210
MsG0880042470.01.T01 AT1G67520 38.961 308 176 6 378 674 265 571 4.60e-59 210
MsG0880042470.01.T01 AT4G23180 39.298 285 168 3 389 668 335 619 4.71e-59 211
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MsG0880042470.01.T01 AT2G42960 39.544 263 154 3 406 664 189 450 6.01e-59 207
MsG0880042470.01.T01 AT2G42960 39.544 263 154 3 406 664 189 450 6.01e-59 207
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MsG0880042470.01.T01 AT4G00330 39.667 300 167 8 375 663 95 391 9.01e-59 204
MsG0880042470.01.T01 AT1G72540 36.137 321 187 8 390 698 72 386 9.54e-59 205
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MsG0880042470.01.T01 AT1G56720 36.585 287 173 5 390 669 167 451 2.90e-57 202
MsG0880042470.01.T01 AT1G56720 36.585 287 173 5 390 669 167 451 2.90e-57 202
MsG0880042470.01.T01 AT1G56140 40.339 295 162 6 382 668 673 961 2.97e-57 211
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MsG0880042470.01.T01 AT3G17410 37.113 291 169 5 394 672 61 349 3.29e-57 199
MsG0880042470.01.T01 AT2G39660 36.877 301 170 7 388 670 53 351 3.91e-57 199
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MsG0880042470.01.T01 AT5G37450 40.830 289 159 6 388 669 617 900 5.79e-57 209
MsG0880042470.01.T01 AT2G25220 33.002 403 235 11 313 687 36 431 7.11e-57 200
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MsG0880042470.01.T01 AT1G79670 39.661 295 172 4 380 669 362 655 8.09e-57 206
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MsG0880042470.01.T01 AT5G10290 36.770 291 174 5 388 669 276 565 9.23e-57 204
MsG0880042470.01.T01 AT1G16670 38.732 284 165 4 390 665 29 311 9.24e-57 198
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MsG0880042470.01.T01 AT2G48010 35.241 332 204 6 348 669 228 558 9.31e-57 204
MsG0880042470.01.T01 AT1G79670 39.661 295 172 4 380 669 399 692 1.24e-56 206
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MsG0880042470.01.T01 AT1G48210 36.082 291 172 5 394 672 60 348 1.35e-56 197
MsG0880042470.01.T01 AT1G48210 36.082 291 172 5 394 672 60 348 1.35e-56 197
MsG0880042470.01.T01 AT1G48210 36.082 291 172 5 394 672 60 348 1.35e-56 197
MsG0880042470.01.T01 AT4G04540 38.127 299 174 6 371 665 325 616 1.37e-56 204
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MsG0880042470.01.T01 AT2G23950 37.979 287 171 5 388 669 285 569 1.45e-56 204
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MsG0880042470.01.T01 AT5G58940 39.933 298 168 7 382 668 124 421 1.54e-55 197
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MsG0880042470.01.T01 AT4G23320 37.063 286 174 3 389 668 170 455 1.20e-54 196
MsG0880042470.01.T01 AT5G18910 35.275 309 191 5 384 687 174 478 1.38e-54 196
MsG0880042470.01.T01 AT4G04500 36.700 297 179 4 389 676 332 628 1.38e-54 198
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MsG0880042470.01.T01 AT4G23320 37.063 286 174 3 389 668 191 476 1.75e-54 196
MsG0880042470.01.T01 AT1G52540 35.789 285 175 6 390 668 28 310 2.14e-54 191
MsG0880042470.01.T01 AT4G32000 36.184 304 182 6 388 685 116 413 2.24e-54 192
MsG0880042470.01.T01 AT4G32000 36.184 304 182 6 388 685 115 412 2.27e-54 192
MsG0880042470.01.T01 AT1G24030 43.612 227 118 5 390 607 50 275 2.38e-54 188
MsG0880042470.01.T01 AT5G11020 36.972 284 170 5 399 676 77 357 2.95e-54 191
MsG0880042470.01.T01 AT1G66880 39.726 292 160 8 388 669 334 619 3.01e-54 198
MsG0880042470.01.T01 AT4G23220 36.170 282 173 4 389 664 324 604 3.10e-54 197
MsG0880042470.01.T01 AT5G11020 36.972 284 170 5 399 676 138 418 3.18e-54 192
MsG0880042470.01.T01 AT1G56130 40.339 295 160 8 383 668 476 763 3.29e-54 200
MsG0880042470.01.T01 AT4G23130 35.664 286 178 3 389 668 327 612 3.54e-54 197
MsG0880042470.01.T01 AT1G61360 36.565 361 201 7 327 668 339 690 3.60e-54 199
MsG0880042470.01.T01 AT1G61360 36.565 361 201 7 327 668 339 690 3.60e-54 199
MsG0880042470.01.T01 AT1G61360 36.565 361 201 7 327 668 339 690 3.60e-54 199
MsG0880042470.01.T01 AT4G23130 35.664 286 178 3 389 668 331 616 3.61e-54 197
MsG0880042470.01.T01 AT4G39400 37.755 294 167 7 388 670 869 1157 3.68e-54 202
MsG0880042470.01.T01 AT4G23260 36.111 288 178 3 383 664 320 607 3.72e-54 197
MsG0880042470.01.T01 AT5G65240 35.739 291 177 5 388 669 270 559 3.87e-54 196
MsG0880042470.01.T01 AT5G11020 36.972 284 170 5 399 676 104 384 3.91e-54 191
MsG0880042470.01.T01 AT1G16260 38.380 284 169 4 390 668 369 651 3.96e-54 198
MsG0880042470.01.T01 AT2G47060 36.093 302 181 4 392 682 63 363 4.18e-54 190
MsG0880042470.01.T01 AT2G47060 36.093 302 181 4 392 682 63 363 4.18e-54 190
MsG0880042470.01.T01 AT1G51620 40.840 262 147 5 430 687 2 259 4.30e-54 187
MsG0880042470.01.T01 AT1G16260 38.380 284 169 4 390 668 378 660 4.43e-54 198
MsG0880042470.01.T01 AT1G16260 38.380 284 169 4 390 668 378 660 4.43e-54 198
MsG0880042470.01.T01 AT5G65240 35.739 291 177 5 388 669 270 559 4.67e-54 197
MsG0880042470.01.T01 AT4G23260 36.879 282 172 3 389 664 315 596 4.78e-54 197
MsG0880042470.01.T01 AT1G69730 38.699 292 172 6 383 668 428 718 5.07e-54 199
MsG0880042470.01.T01 AT3G59350 36.149 296 175 5 390 672 59 353 5.25e-54 190
MsG0880042470.01.T01 AT1G61480 37.386 329 189 7 390 704 484 809 5.31e-54 199
MsG0880042470.01.T01 AT5G53890 37.919 298 177 5 388 679 740 1035 5.37e-54 201
MsG0880042470.01.T01 AT1G56130 40.339 295 160 8 383 668 527 814 5.83e-54 200
MsG0880042470.01.T01 AT1G61440 37.003 327 194 4 390 704 466 792 5.86e-54 199
MsG0880042470.01.T01 AT3G21630 36.202 337 179 12 361 673 271 595 6.44e-54 196
MsG0880042470.01.T01 AT4G30520 37.282 287 173 5 388 669 289 573 6.55e-54 197
MsG0880042470.01.T01 AT5G11020 36.972 284 170 5 399 676 100 380 6.71e-54 191
MsG0880042470.01.T01 AT1G61360 36.565 361 201 7 327 668 420 771 6.97e-54 199
MsG0880042470.01.T01 AT4G23240 35.786 299 186 3 376 668 309 607 7.08e-54 197
MsG0880042470.01.T01 AT1G61440 37.003 327 194 4 390 704 471 797 7.25e-54 199
MsG0880042470.01.T01 AT5G38210 39.597 298 166 7 381 669 339 631 7.44e-54 197
MsG0880042470.01.T01 AT5G38210 39.597 298 166 7 381 669 333 625 8.59e-54 197
MsG0880042470.01.T01 AT1G06700 34.680 297 178 6 390 672 56 350 9.30e-54 189
MsG0880042470.01.T01 AT1G06700 34.680 297 178 6 390 672 56 350 9.30e-54 189
MsG0880042470.01.T01 AT1G06700 34.680 297 178 6 390 672 56 350 9.30e-54 189
MsG0880042470.01.T01 AT3G53840 40.203 296 163 6 390 672 342 636 9.74e-54 196
MsG0880042470.01.T01 AT4G23190 37.631 287 171 3 390 668 260 546 9.77e-54 195
MsG0880042470.01.T01 AT4G23190 37.631 287 171 3 390 668 260 546 9.77e-54 195
MsG0880042470.01.T01 AT4G11460 36.014 286 177 3 389 668 258 543 1.04e-53 196
MsG0880042470.01.T01 AT1G70740 36.786 280 171 4 390 664 50 328 1.07e-53 191
MsG0880042470.01.T01 AT1G78940 38.488 291 159 8 386 668 361 639 1.09e-53 196
MsG0880042470.01.T01 AT1G56130 40.339 295 160 8 383 668 675 962 1.11e-53 200
MsG0880042470.01.T01 AT5G38210 39.597 298 166 7 381 669 351 643 1.12e-53 197
MsG0880042470.01.T01 AT4G32000 36.184 304 182 6 388 685 158 455 1.14e-53 192
MsG0880042470.01.T01 AT3G59350 36.149 296 175 5 390 672 101 395 1.24e-53 190
MsG0880042470.01.T01 AT3G59350 36.149 296 175 5 390 672 101 395 1.24e-53 190
MsG0880042470.01.T01 AT3G59350 36.149 296 175 5 390 672 116 410 1.26e-53 191
MsG0880042470.01.T01 AT1G11330 35.948 306 188 4 371 668 488 793 1.36e-53 198
MsG0880042470.01.T01 AT4G11460 35.986 289 176 3 389 668 333 621 1.58e-53 196
MsG0880042470.01.T01 AT1G11330 35.974 303 186 4 371 665 490 792 1.58e-53 198
MsG0880042470.01.T01 AT5G55830 36.934 287 171 5 388 665 351 636 1.63e-53 196
MsG0880042470.01.T01 AT1G72300 37.627 295 177 4 381 669 782 1075 1.70e-53 199
MsG0880042470.01.T01 AT4G11470 35.315 286 179 3 389 668 326 611 1.71e-53 196
MsG0880042470.01.T01 AT4G11470 35.315 286 179 3 389 668 331 616 1.80e-53 196
MsG0880042470.01.T01 AT1G55610 37.374 297 167 7 388 670 845 1136 1.91e-53 199
MsG0880042470.01.T01 AT1G55610 37.374 297 167 7 388 670 845 1136 1.91e-53 199
MsG0880042470.01.T01 AT1G11303 37.895 285 163 4 390 668 497 773 2.20e-53 197
MsG0880042470.01.T01 AT1G69270 39.860 286 165 5 390 669 249 533 2.24e-53 193
MsG0880042470.01.T01 AT4G23190 37.631 287 171 3 390 668 338 624 2.56e-53 195
MsG0880042470.01.T01 AT5G65600 39.446 289 161 6 388 663 336 623 2.62e-53 195
MsG0880042470.01.T01 AT1G66880 39.726 292 160 8 388 669 576 861 2.70e-53 198
MsG0880042470.01.T01 AT4G11460 36.014 286 177 3 389 668 333 618 2.72e-53 196
MsG0880042470.01.T01 AT2G28250 37.755 294 165 8 389 665 197 489 2.99e-53 193
MsG0880042470.01.T01 AT2G28250 37.755 294 165 8 389 665 197 489 2.99e-53 193
MsG0880042470.01.T01 AT2G28250 37.755 294 165 8 389 665 197 489 2.99e-53 193
MsG0880042470.01.T01 AT2G28250 37.755 294 165 8 389 665 197 489 2.99e-53 193
MsG0880042470.01.T01 AT2G28250 37.755 294 165 8 389 665 197 489 2.99e-53 193
MsG0880042470.01.T01 AT2G28250 37.755 294 165 8 389 665 197 489 2.99e-53 193
MsG0880042470.01.T01 AT1G61490 39.274 303 165 7 380 668 314 611 3.00e-53 195
MsG0880042470.01.T01 AT2G23450 39.792 289 164 6 390 670 336 622 3.45e-53 196
MsG0880042470.01.T01 AT2G23450 39.792 289 164 6 390 670 336 622 3.45e-53 196
MsG0880042470.01.T01 AT1G79680 37.631 287 172 4 390 670 421 706 3.49e-53 196
MsG0880042470.01.T01 AT1G11280 34.454 357 214 6 327 668 427 778 3.69e-53 197
MsG0880042470.01.T01 AT1G11410 38.298 282 166 5 390 665 396 675 3.74e-53 196
MsG0880042470.01.T01 AT5G49770 38.462 273 142 5 425 683 659 919 4.13e-53 198

Find 123 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 319 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CCACAATTTGATCTTTATTT+TGG 0.120871 8:+9276348 MsG0880042470.01.T01:CDS
ATCAGAGCTTCTTTCTATTA+TGG 0.182771 8:+9276300 MsG0880042470.01.T01:CDS
CATGCAAAGATTTCTGATTT+TGG 0.190779 8:+9280382 MsG0880042470.01.T01:CDS
AATATCTCCAGCTTTAATTA+TGG 0.195909 8:-9281213 None:intergenic
TGGTGTCCTTACTACTATTT+TGG 0.197665 8:+9275941 MsG0880042470.01.T01:CDS
TATACCAGTATCTATGAATT+TGG 0.222396 8:-9276157 None:intergenic
CCTTTAGCTCTGCCAATATT+TGG 0.229251 8:-9281352 None:intergenic
ATTAAACAGCAACTAGAATA+TGG 0.234568 8:+9276210 MsG0880042470.01.T01:CDS
TTGAATTCTCTGTCATATAA+AGG 0.253834 8:-9277093 None:intergenic
GATTGTTCATCATAGAAATT+TGG 0.259780 8:+9279600 MsG0880042470.01.T01:CDS
GATAACTTCAAAACTACTAT+TGG 0.265311 8:+9279331 MsG0880042470.01.T01:CDS
AAGGGAAATTTGATACCTTT+TGG 0.271863 8:-9277074 None:intergenic
ATCATCAATGCAAGGTTATA+AGG 0.287528 8:+9279429 MsG0880042470.01.T01:CDS
ATAACTTCAAAACTACTATT+GGG 0.295524 8:+9279332 MsG0880042470.01.T01:CDS
ACTATTGGGGAAGGAGGATT+TGG 0.299966 8:+9279346 MsG0880042470.01.T01:CDS
CTTTCCTTTCGATCTGATAT+AGG 0.304274 8:+9276576 MsG0880042470.01.T01:CDS
ATATCTCCAGCTTTAATTAT+GGG 0.314276 8:-9281212 None:intergenic
CATAAATCAATGCTTTGATT+TGG 0.345053 8:-9279651 None:intergenic
ACTCGCCTTGCTGGTACATT+TGG 0.357302 8:+9280448 MsG0880042470.01.T01:CDS
ACCAGACATAAGCCAAATAT+TGG 0.357337 8:+9281340 MsG0880042470.01.T01:CDS
GACTAATGTACCAGATCATT+TGG 0.368731 8:-9281524 None:intergenic
GAGCCCCTTTACAATTTCAT+TGG 0.370448 8:+9276870 MsG0880042470.01.T01:CDS
GCCAATATTTGGCTTATGTC+TGG 0.372492 8:-9281341 None:intergenic
TGAATTCTCTGTCATATAAA+GGG 0.373598 8:-9277092 None:intergenic
GCTAAAGGAATGTCTCTCTT+TGG 0.378524 8:+9281367 MsG0880042470.01.T01:CDS
AAAATGATATCTACAGCTTT+GGG 0.378641 8:+9281105 MsG0880042470.01.T01:CDS
CATTCCAATGAAATTGTAAA+GGG 0.379161 8:-9276874 None:intergenic
TTCAAAATATTGTTGATATG+AGG 0.379237 8:+9281234 MsG0880042470.01.T01:CDS
AGAAATTTGGTCTCTCTCAT+TGG 0.380123 8:+9279613 MsG0880042470.01.T01:CDS
TTTGGTCTAAGTAGAGCTTT+TGG 0.381649 8:+9280400 MsG0880042470.01.T01:CDS
GGATTGGATTATCTGCATAA+TGG 0.383279 8:+9280295 MsG0880042470.01.T01:intron
CTTAATAGATATCAGAGAAC+AGG 0.385459 8:+9281068 MsG0880042470.01.T01:intron
TTCAAATCTCTATGCATAAT+AGG 0.389612 8:-9280328 None:intergenic
AAAACATTCACATACTTCAA+TGG 0.393496 8:+9281183 MsG0880042470.01.T01:CDS
TCATCTAATAATATGTTTGA+AGG 0.400624 8:-9280352 None:intergenic
TTTGGAGTGACATTGAATAT+AGG 0.403328 8:-9281506 None:intergenic
CATATATCTACTCGCCTTGC+TGG 0.406547 8:+9280439 MsG0880042470.01.T01:CDS
GATGCCAAATTCATAGATAC+TGG 0.408214 8:+9276153 MsG0880042470.01.T01:CDS
TTAATCTCATTCAATTGAAA+AGG 0.418383 8:-9276755 None:intergenic
CTTAATAAAGCAAAGAATGA+TGG 0.419639 8:+9275887 None:intergenic
AAAATTCAAATATCTTAAGT+TGG 0.420204 8:+9280164 MsG0880042470.01.T01:CDS
CCAAATATTGGCAGAGCTAA+AGG 0.421625 8:+9281352 MsG0880042470.01.T01:CDS
ATTCTATTTGAGTTGATCAC+TGG 0.422615 8:+9281131 MsG0880042470.01.T01:CDS
GCAGTGCTCATCACAATTGC+TGG 0.426743 8:-9276827 None:intergenic
AAACATTCACATACTTCAAT+GGG 0.434627 8:+9281184 MsG0880042470.01.T01:CDS
AAACTCAAGTCGCTGTTAAG+AGG 0.436850 8:+9279398 MsG0880042470.01.T01:CDS
CAATGAGGATCTATCAAGTC+AGG 0.439782 8:+9276790 MsG0880042470.01.T01:CDS
CTCATTGGATATTGTGATGA+AGG 0.442089 8:+9279628 MsG0880042470.01.T01:CDS
TGTCTTGTTAACACAGGTAA+AGG 0.451764 8:+9276468 MsG0880042470.01.T01:CDS
ATACAAGCTCAGGATCAATC+AGG 0.453587 8:+9275969 MsG0880042470.01.T01:CDS
AAAGGGGCTCTGGCATCTAC+TGG 0.458097 8:-9276857 None:intergenic
ATGAAATTGTAAAGGGGCTC+TGG 0.459348 8:-9276867 None:intergenic
GTGAATGACAAGGTATGGTT+TGG 0.463876 8:+9276989 MsG0880042470.01.T01:CDS
GGATTTGGAAAAGTTTACTT+TGG 0.469458 8:+9279361 MsG0880042470.01.T01:CDS
CAATGTCACTCCAAATGATC+TGG 0.471092 8:+9281514 MsG0880042470.01.T01:three_prime_UTR
GTATTTACCGACCGATATAC+AGG 0.474346 8:-9277022 None:intergenic
AAAGCTATAGTGAGAGCATC+CGG 0.477097 8:+9281158 MsG0880042470.01.T01:CDS
TTAAACAGCAACTAGAATAT+GGG 0.479786 8:+9276211 MsG0880042470.01.T01:CDS
GTCTTCATATTCAAACGAAA+GGG 0.481073 8:+9279252 MsG0880042470.01.T01:CDS
GTCTTGTTAACACAGGTAAA+GGG 0.482488 8:+9276469 MsG0880042470.01.T01:CDS
GCAGAATAGCTCATATGTTC+AGG 0.482624 8:-9276102 None:intergenic
ATGATGTTTATGATCGCATC+TGG 0.482959 8:+9276729 MsG0880042470.01.T01:CDS
TCAAAACCAAAATAGTAGTA+AGG 0.487944 8:-9275947 None:intergenic
TCATTTCAGCTATAGAATTG+AGG 0.489668 8:+9276499 MsG0880042470.01.T01:CDS
CCATCACAAACTTACAATAC+AGG 0.490059 8:+9276601 MsG0880042470.01.T01:CDS
TTATAACCTTGCATTGATGA+TGG 0.493034 8:-9279427 None:intergenic
GCATTCCAATGAAATTGTAA+AGG 0.493066 8:-9276875 None:intergenic
CTGACTTGATAGATCCTCAT+TGG 0.493210 8:-9276789 None:intergenic
GTTATTCCCATAATTAAAGC+TGG 0.495004 8:+9281206 MsG0880042470.01.T01:CDS
CCTCTACATGCACTTTAATG+AGG 0.501913 8:+9276922 MsG0880042470.01.T01:CDS
ACCAATCCTCAATGCCTATG+AGG 0.502541 8:+9277123 MsG0880042470.01.T01:CDS
TAACAATTTCTCACTCCACT+TGG 0.503228 8:-9276243 None:intergenic
TATAAACCTCATAGGCATTG+AGG 0.507508 8:-9277129 None:intergenic
ACCTCATAGGCATTGAGGAT+TGG 0.513775 8:-9277124 None:intergenic
AATTCTATAGCTGAAATGAA+TGG 0.520346 8:-9276495 None:intergenic
AAAGTGTTGGAGATTTCCAT+TGG 0.522599 8:-9279683 None:intergenic
AGCTATTCTGCGTCGGACAC+AGG 0.523189 8:+9276114 MsG0880042470.01.T01:CDS
AGCATTGATTTATGAATACA+TGG 0.524548 8:+9279660 MsG0880042470.01.T01:CDS
TCATAGGCATTGAGGATTGG+TGG 0.529450 8:-9277121 None:intergenic
TTAATAAAGCAAAGAATGAT+GGG 0.533064 8:+9275888 None:intergenic
ATTTATGAATACATGGCCAA+TGG 0.533355 8:+9279667 MsG0880042470.01.T01:CDS
CGTCTTCATATTCAAACGAA+AGG 0.535279 8:+9279251 MsG0880042470.01.T01:CDS
TAGATACTGGTATAACTAAG+AGG 0.535335 8:+9276166 MsG0880042470.01.T01:CDS
ATATCTTAAGTTGGAATGAG+AGG 0.537026 8:+9280173 MsG0880042470.01.T01:CDS
TCACAGTGAATGACAAGGTA+TGG 0.540858 8:+9276984 MsG0880042470.01.T01:CDS
CCTGTATTGTAAGTTTGTGA+TGG 0.545012 8:-9276601 None:intergenic
AGTTGTATGTAATCTAATGA+TGG 0.551696 8:-9276444 None:intergenic
TATTGTTGATATGAGGTTGA+AGG 0.551865 8:+9281241 MsG0880042470.01.T01:CDS
GACCTTTGACTGGAGCCAAA+AGG 0.552462 8:+9277059 MsG0880042470.01.T01:CDS
TTAGAAACTCAACAAGATGA+TGG 0.559338 8:+9277172 MsG0880042470.01.T01:CDS
TCTAGTAGAAGACCTTTGAC+TGG 0.562519 8:+9277049 MsG0880042470.01.T01:CDS
TTCTATTTGAGTTGATCACT+GGG 0.570172 8:+9281132 MsG0880042470.01.T01:CDS
TTATAAGGAATTTCAATCAG+AGG 0.570275 8:+9279444 MsG0880042470.01.T01:CDS
TGTGAAGAGTGATGCATTGG+AGG 0.574769 8:-9276400 None:intergenic
GGAACCTATATCAGATCGAA+AGG 0.576900 8:-9276580 None:intergenic
TTCAAAACTACTATTGGGGA+AGG 0.577014 8:+9279337 MsG0880042470.01.T01:CDS
ATGCATCACTCTTCACAACC+AGG 0.583295 8:+9276406 MsG0880042470.01.T01:CDS
GGTTGTGAAGAGTGATGCAT+TGG 0.585470 8:-9276403 None:intergenic
AAAACTACTATTGGGGAAGG+AGG 0.593423 8:+9279340 MsG0880042470.01.T01:CDS
AATTCATCATCAATTCAGCA+TGG 0.612023 8:+9281267 MsG0880042470.01.T01:CDS
ATTGTTGATATGAGGTTGAA+GGG 0.612773 8:+9281242 MsG0880042470.01.T01:CDS
GGATTCATTAGCATAGATTG+TGG 0.612915 8:+9276075 MsG0880042470.01.T01:intron
CTTTCACCATCATCAATGCA+AGG 0.613023 8:+9279421 MsG0880042470.01.T01:CDS
ACATATGAGCTATTCTGCGT+CGG 0.623040 8:+9276107 MsG0880042470.01.T01:CDS
CCAAAATAAAGATCAAATTG+TGG 0.625699 8:-9276348 None:intergenic
TAACTTCAAAACTACTATTG+GGG 0.625982 8:+9279333 MsG0880042470.01.T01:CDS
AAATAAAGATCAAATTGTGG+TGG 0.633713 8:-9276345 None:intergenic
TGGAGTGTAAATTATCTCCC+TGG 0.637856 8:-9276424 None:intergenic
AACAGCAACTAGAATATGGG+AGG 0.640097 8:+9276214 MsG0880042470.01.T01:CDS
TCTTCATATTCAAACGAAAG+GGG 0.644101 8:+9279253 MsG0880042470.01.T01:CDS
AATGAGGATCTATCAAGTCA+GGG 0.645843 8:+9276791 MsG0880042470.01.T01:CDS
AAATCTCTATGCATAATAGG+TGG 0.646358 8:-9280325 None:intergenic
TAAACGATTAAGCACCAATG+AGG 0.651048 8:+9276775 MsG0880042470.01.T01:CDS
AATAGCTCATATGTTCAGGT+AGG 0.651624 8:-9276098 None:intergenic
CCTCATTAAAGTGCATGTAG+AGG 0.653095 8:-9276922 None:intergenic
TGCATCACTCTTCACAACCA+GGG 0.653363 8:+9276407 MsG0880042470.01.T01:CDS
CAACTATGTCTTGTTAACAC+AGG 0.654862 8:+9276462 MsG0880042470.01.T01:CDS
CGTAACCAAATGTACCAGCA+AGG 0.656074 8:-9280453 None:intergenic
CAACATCACAGTGAATGACA+AGG 0.674366 8:+9276979 MsG0880042470.01.T01:CDS
ATTCCAATGAAATTGTAAAG+GGG 0.683059 8:-9276873 None:intergenic
ATTGCAGTTGACACAGCACA+TGG 0.685152 8:+9280202 MsG0880042470.01.T01:CDS
TTATTGTATATGTTACAACA+AGG 0.716395 8:-9281546 None:intergenic
TATGGGAGGAGCTTTCCAAG+TGG 0.717317 8:+9276228 MsG0880042470.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! GCTAATAAATTAATTAATTA+AGG - Chr8:9276650-9276669 None:intergenic 10.0%
!! TAAATGCTAATATTAAAATA+CGG - Chr8:9280522-9280541 None:intergenic 10.0%
!! TAATTTAGAAAAGAAAAATA+TGG - Chr8:9278054-9278073 None:intergenic 10.0%
!! TATAAAAAATCAAATTAGAT+TGG + Chr8:9280496-9280515 MsG0880042470.01.T01:intron 10.0%
!!! TAATATAATACTATTTTAGT+TGG + Chr8:9280965-9280984 MsG0880042470.01.T01:intron 10.0%
!!! TTTATTTTAGTTAAGTAATA+AGG + Chr8:9279507-9279526 MsG0880042470.01.T01:intron 10.0%
!! AAAATTCAAATATCTTAAGT+TGG + Chr8:9280164-9280183 MsG0880042470.01.T01:CDS 15.0%
!! AATGAAGAATCATATAAAAT+AGG - Chr8:9280629-9280648 None:intergenic 15.0%
!! AGGAGAAATTATTATTAATA+AGG + Chr8:9279918-9279937 MsG0880042470.01.T01:intron 15.0%
!! GATTAAATAAATAGTATGTT+TGG + Chr8:9278001-9278020 MsG0880042470.01.T01:intron 15.0%
!! GGAGAAATTATTATTAATAA+GGG + Chr8:9279919-9279938 MsG0880042470.01.T01:intron 15.0%
!! TATTATTAAGATTACAAGAA+GGG - Chr8:9278657-9278676 None:intergenic 15.0%
!! TATTCAAAGAAATAGTTAAA+AGG - Chr8:9277656-9277675 None:intergenic 15.0%
!! TTATTATTAAGATTACAAGA+AGG - Chr8:9278658-9278677 None:intergenic 15.0%
!! TTATTTAATCAAATGAGATT+AGG - Chr8:9277991-9278010 None:intergenic 15.0%
!!! ATGTTTTTCAATTAAACAAA+GGG - Chr8:9277206-9277225 None:intergenic 15.0%
!!! ATTTAAATTGTTTTCTTTCA+GGG + Chr8:9278307-9278326 MsG0880042470.01.T01:intron 15.0%
!!! TATGTTTTTCAATTAAACAA+AGG - Chr8:9277207-9277226 None:intergenic 15.0%
!!! TTTTTTAAAAAAATTGGGAA+AGG + Chr8:9279898-9279917 MsG0880042470.01.T01:intron 15.0%
!!! TTTTTTTTTTTTTTTTGTGG+TGG - Chr8:9277452-9277471 None:intergenic 15.0%
!! AAATTGGATGAAAATATGTA+AGG - Chr8:9279210-9279229 None:intergenic 20.0%
!! AATAACATAAACAAGGTAAA+GGG + Chr8:9280764-9280783 MsG0880042470.01.T01:intron 20.0%
!! AGAATAATTTCCAAATTGAT+TGG - Chr8:9278254-9278273 None:intergenic 20.0%
!! ATAACTTCAAAACTACTATT+GGG + Chr8:9279332-9279351 MsG0880042470.01.T01:CDS 20.0%
!! ATGAAAATATGTAAGGATTT+GGG - Chr8:9279203-9279222 None:intergenic 20.0%
!! ATTCATCAATAACATAAACA+AGG + Chr8:9280757-9280776 MsG0880042470.01.T01:intron 20.0%
!! CATTTATTCAACATATTCAA+GGG + Chr8:9277567-9277586 MsG0880042470.01.T01:intron 20.0%
!! GAATTTATGCATATAGTTTA+AGG - Chr8:9277843-9277862 None:intergenic 20.0%
!! TCATCTAATAATATGTTTGA+AGG - Chr8:9280355-9280374 None:intergenic 20.0%
!! TTAATCTCATTCAATTGAAA+AGG - Chr8:9276758-9276777 None:intergenic 20.0%
!! TTATTGTATATGTTACAACA+AGG - Chr8:9281549-9281568 None:intergenic 20.0%
!! TTCAAAATATTGTTGATATG+AGG + Chr8:9281234-9281253 MsG0880042470.01.T01:CDS 20.0%
!!! ACAATATAGCTAAAGTTTTA+TGG - Chr8:9279122-9279141 None:intergenic 20.0%
!!! AGAGATAAAATTTAAAATGC+AGG + Chr8:9279564-9279583 MsG0880042470.01.T01:intron 20.0%
!!! ATAAATTACCTAAAAAGTGT+TGG - Chr8:9279699-9279718 None:intergenic 20.0%
!!! CATTTAAATTGTTTTCTTTC+AGG + Chr8:9278306-9278325 MsG0880042470.01.T01:intron 20.0%
!!! GTTTTTCTTATATATATCTC+AGG + Chr8:9276054-9276073 MsG0880042470.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTCAGAATAACTGAATTTT+TGG - Chr8:9279297-9279316 None:intergenic 20.0%
!!! TTTTACTTTATAAACCTCAT+AGG - Chr8:9277140-9277159 None:intergenic 20.0%
!!! TTTTTATATTACACTTACAC+TGG - Chr8:9280484-9280503 None:intergenic 20.0%
! AAAAATGATATCTACAGCTT+TGG + Chr8:9281104-9281123 MsG0880042470.01.T01:CDS 25.0%
! AAAACATTCACATACTTCAA+TGG + Chr8:9281183-9281202 MsG0880042470.01.T01:CDS 25.0%
! AAAATCCAAGAGAAATCAAA+AGG - Chr8:9278880-9278899 None:intergenic 25.0%
! AAAATGATATCTACAGCTTT+GGG + Chr8:9281105-9281124 MsG0880042470.01.T01:CDS 25.0%
! AAACATTCACATACTTCAAT+GGG + Chr8:9281184-9281203 MsG0880042470.01.T01:CDS 25.0%
! AAATAAAGATCAAATTGTGG+TGG - Chr8:9276348-9276367 None:intergenic 25.0%
! AATTAACAGTTAACACCTTA+TGG + Chr8:9280025-9280044 MsG0880042470.01.T01:intron 25.0%
! AATTCTATAGCTGAAATGAA+TGG - Chr8:9276498-9276517 None:intergenic 25.0%
! ACAGCTGTTGTAAATAAAAT+TGG - Chr8:9279226-9279245 None:intergenic 25.0%
! AGTATCATATTCTCATGATA+TGG + Chr8:9280586-9280605 MsG0880042470.01.T01:intron 25.0%
! AGTTAAGAATGCCAATTATT+GGG - Chr8:9280674-9280693 None:intergenic 25.0%
! AGTTGTATGTAATCTAATGA+TGG - Chr8:9276447-9276466 None:intergenic 25.0%
! ATAATAGATTTACTACTTCC+AGG + Chr8:9279743-9279762 MsG0880042470.01.T01:intron 25.0%
! ATTAAACAGCAACTAGAATA+TGG + Chr8:9276210-9276229 MsG0880042470.01.T01:CDS 25.0%
! ATTCCAATGAAATTGTAAAG+GGG - Chr8:9276876-9276895 None:intergenic 25.0%
! ATTTCCAAATTGATTGGATT+TGG - Chr8:9278248-9278267 None:intergenic 25.0%
! CAAAGAGGATACTATATTTA+AGG - Chr8:9277243-9277262 None:intergenic 25.0%
! CAATAACATAAACAAGGTAA+AGG + Chr8:9280763-9280782 MsG0880042470.01.T01:intron 25.0%
! CAGTTGAAAATATATCAAAG+AGG - Chr8:9277258-9277277 None:intergenic 25.0%
! CATAAATCAATGCTTTGATT+TGG - Chr8:9279654-9279673 None:intergenic 25.0%
! CATATTATATGTAAGGTTAG+GGG + Chr8:9277414-9277433 MsG0880042470.01.T01:intron 25.0%
! CATTCCAATGAAATTGTAAA+GGG - Chr8:9276877-9276896 None:intergenic 25.0%
! CCAAAATAAAGATCAAATTG+TGG - Chr8:9276351-9276370 None:intergenic 25.0%
! GACAATGCATATTATATGTA+AGG + Chr8:9277407-9277426 MsG0880042470.01.T01:intron 25.0%
! GAGATGTTTCAGAAAAATAA+TGG + Chr8:9281389-9281408 MsG0880042470.01.T01:CDS 25.0%
! GATAACTTCAAAACTACTAT+TGG + Chr8:9279331-9279350 MsG0880042470.01.T01:CDS 25.0%
! GATGAAAATATGTAAGGATT+TGG - Chr8:9279204-9279223 None:intergenic 25.0%
! GATTGTTCATCATAGAAATT+TGG + Chr8:9279600-9279619 MsG0880042470.01.T01:CDS 25.0%
! GCATATTATATGTAAGGTTA+GGG + Chr8:9277413-9277432 MsG0880042470.01.T01:intron 25.0%
! GCATTTATTCAACATATTCA+AGG + Chr8:9277566-9277585 MsG0880042470.01.T01:intron 25.0%
! GGAAATTATTCTCTCTTTAT+TGG + Chr8:9278262-9278281 MsG0880042470.01.T01:intron 25.0%
! TAAATAGTATGTTTGGATGA+AGG + Chr8:9278008-9278027 MsG0880042470.01.T01:intron 25.0%
! TAACTTCAAAACTACTATTG+GGG + Chr8:9279333-9279352 MsG0880042470.01.T01:CDS 25.0%
! TATACCAGTATCTATGAATT+TGG - Chr8:9276160-9276179 None:intergenic 25.0%
! TCAAAACCAAAATAGTAGTA+AGG - Chr8:9275950-9275969 None:intergenic 25.0%
! TCATAGTATCAACTTGTATT+CGG - Chr8:9277679-9277698 None:intergenic 25.0%
! TGAATAGTGTAATAATCCAT+TGG + Chr8:9278981-9279000 MsG0880042470.01.T01:intron 25.0%
! TGAATATGTTGAATAAATGC+CGG - Chr8:9277566-9277585 None:intergenic 25.0%
! TGAATTCTCTGTCATATAAA+GGG - Chr8:9277095-9277114 None:intergenic 25.0%
! TGCATATTATATGTAAGGTT+AGG + Chr8:9277412-9277431 MsG0880042470.01.T01:intron 25.0%
! TGGAAGTAGTAAATCTATTA+TGG - Chr8:9279744-9279763 None:intergenic 25.0%
! TGGATATTCAGAAGAAAAAA+AGG + Chr8:9278899-9278918 MsG0880042470.01.T01:intron 25.0%
! TTAAACAGCAACTAGAATAT+GGG + Chr8:9276211-9276230 MsG0880042470.01.T01:CDS 25.0%
! TTAGAATTTCAAAGAGAACT+AGG + Chr8:9280800-9280819 MsG0880042470.01.T01:intron 25.0%
! TTATAAGGAATTTCAATCAG+AGG + Chr8:9279444-9279463 MsG0880042470.01.T01:CDS 25.0%
! TTATCAAACAATAGCTTGAA+TGG + Chr8:9278332-9278351 MsG0880042470.01.T01:intron 25.0%
! TTCAAATCTCTATGCATAAT+AGG - Chr8:9280331-9280350 None:intergenic 25.0%
! TTGAATTCTCTGTCATATAA+AGG - Chr8:9277096-9277115 None:intergenic 25.0%
!! AATATCTCCAGCTTTAATTA+TGG - Chr8:9281216-9281235 None:intergenic 25.0%
!! AATGTTACAGCATTTTCTTT+TGG + Chr8:9275911-9275930 MsG0880042470.01.T01:CDS 25.0%
!! ACATGGTAATGTATTGTTTA+TGG + Chr8:9280219-9280238 MsG0880042470.01.T01:intron 25.0%
!! ATATCTCCAGCTTTAATTAT+GGG - Chr8:9281215-9281234 None:intergenic 25.0%
!! CATTTTCTTTTGGTATTGTT+TGG + Chr8:9275921-9275940 MsG0880042470.01.T01:CDS 25.0%
!! GACATTTTATACCTGTATAT+CGG + Chr8:9277011-9277030 MsG0880042470.01.T01:CDS 25.0%
!!! AACTAATAATTTTTTTGGCC+AGG + Chr8:9276699-9276718 MsG0880042470.01.T01:intron 25.0%
!!! AACTAATTCTCTGTTTTGAA+AGG + Chr8:9277480-9277499 MsG0880042470.01.T01:intron 25.0%
!!! AGCATTGATTTATGAATACA+TGG + Chr8:9279660-9279679 MsG0880042470.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATAGTTTTAAATTGTCGTTG+TGG + Chr8:9279032-9279051 MsG0880042470.01.T01:intron 25.0%
!!! CCACAATTTGATCTTTATTT+TGG + Chr8:9276348-9276367 MsG0880042470.01.T01:CDS 25.0%
!!! TAGTATATTAGTGTCATTTG+TGG + Chr8:9277596-9277615 MsG0880042470.01.T01:intron 25.0%
!!! TTATCCTCTGAAGTTTTATT+TGG + Chr8:9277874-9277893 MsG0880042470.01.T01:intron 25.0%
!!! TTATTTTGGAGCTAATGTTT+GGG + Chr8:9276362-9276381 MsG0880042470.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTATTTTGGAGCTAATGTT+TGG + Chr8:9276361-9276380 MsG0880042470.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTTGATTTCTCTTGGATTT+TGG + Chr8:9278879-9278898 MsG0880042470.01.T01:intron 25.0%
AAAAATATGTGACAGAAAGC+AGG - Chr8:9276017-9276036 None:intergenic 30.0%
AAACATCAAGAACACTTATG+GGG + Chr8:9277700-9277719 MsG0880042470.01.T01:intron 30.0%
AAATCTCTATGCATAATAGG+TGG - Chr8:9280328-9280347 None:intergenic 30.0%
AACTTACAATACAGGTAAGA+TGG + Chr8:9276609-9276628 MsG0880042470.01.T01:intron 30.0%
AAGATATACATGCAAACCAA+TGG - Chr8:9279000-9279019 None:intergenic 30.0%
AAGGATTTGGGAAAAAAATG+TGG - Chr8:9279191-9279210 None:intergenic 30.0%
AATCCTGAAAATTCACACTA+AGG - Chr8:9280280-9280299 None:intergenic 30.0%
AATTCATCATCAATTCAGCA+TGG + Chr8:9281267-9281286 MsG0880042470.01.T01:CDS 30.0%
ACAAACATCAAGAACACTTA+TGG + Chr8:9277698-9277717 MsG0880042470.01.T01:intron 30.0%
ACTTACAAAGATGTGATTCT+TGG - Chr8:9277812-9277831 None:intergenic 30.0%
ATAAACATCATCTTTGTACC+TGG - Chr8:9276720-9276739 None:intergenic 30.0%
ATACATACCGAAATATAGAC+CGG + Chr8:9278170-9278189 MsG0880042470.01.T01:intron 30.0%
ATATTTCCCGGTCTATATTT+CGG - Chr8:9278180-9278199 None:intergenic 30.0%
ATCAGAGCTTCTTTCTATTA+TGG + Chr8:9276300-9276319 MsG0880042470.01.T01:CDS 30.0%
ATCATCAATGCAAGGTTATA+AGG + Chr8:9279429-9279448 MsG0880042470.01.T01:CDS 30.0%
ATCCTGAAAATTCACACTAA+GGG - Chr8:9280279-9280298 None:intergenic 30.0%
ATTGTTGATATGAGGTTGAA+GGG + Chr8:9281242-9281261 MsG0880042470.01.T01:CDS 30.0%
ATTTATGAATACATGGCCAA+TGG + Chr8:9279667-9279686 MsG0880042470.01.T01:CDS 30.0%
CAAACATCAAGAACACTTAT+GGG + Chr8:9277699-9277718 MsG0880042470.01.T01:intron 30.0%
CCAATTATTGGGTAATTTGA+TGG - Chr8:9280663-9280682 None:intergenic 30.0%
CCAGGTTATCTATACTTTAA+AGG + Chr8:9279761-9279780 MsG0880042470.01.T01:intron 30.0%
CCATCAAATTACCCAATAAT+TGG + Chr8:9280660-9280679 MsG0880042470.01.T01:intron 30.0%
CTTAATAGATATCAGAGAAC+AGG + Chr8:9281068-9281087 MsG0880042470.01.T01:intron 30.0%
CTTACAAAGATGTGATTCTT+GGG - Chr8:9277811-9277830 None:intergenic 30.0%
GAAACCAAATCCAATCAATT+TGG + Chr8:9278241-9278260 MsG0880042470.01.T01:intron 30.0%
GACGACAAAAATTATGAACA+AGG + Chr8:9280047-9280066 MsG0880042470.01.T01:intron 30.0%
GAGGATACTATATTTAAGGA+CGG - Chr8:9277239-9277258 None:intergenic 30.0%
GAGTTAAGAATGCCAATTAT+TGG - Chr8:9280675-9280694 None:intergenic 30.0%
GATGAAACCATATTCATGTT+AGG - Chr8:9278717-9278736 None:intergenic 30.0%
GCATTCCAATGAAATTGTAA+AGG - Chr8:9276878-9276897 None:intergenic 30.0%
GGATTTGGAAAAGTTTACTT+TGG + Chr8:9279361-9279380 MsG0880042470.01.T01:CDS 30.0%
GTCTTCATATTCAAACGAAA+GGG + Chr8:9279252-9279271 MsG0880042470.01.T01:CDS 30.0%
GTTAACTGTGAAAATAATGC+AGG - Chr8:9279538-9279557 None:intergenic 30.0%
GTTATTCCCATAATTAAAGC+TGG + Chr8:9281206-9281225 MsG0880042470.01.T01:CDS 30.0%
GTTTCCAAATAAAACTTCAG+AGG - Chr8:9277881-9277900 None:intergenic 30.0%
TACATTTGATGCATCAACAA+GGG - Chr8:9278409-9278428 None:intergenic 30.0%
TAGATACTGGTATAACTAAG+AGG + Chr8:9276166-9276185 MsG0880042470.01.T01:CDS 30.0%
TATTGTTGATATGAGGTTGA+AGG + Chr8:9281241-9281260 MsG0880042470.01.T01:CDS 30.0%
TCATTTCAGCTATAGAATTG+AGG + Chr8:9276499-9276518 MsG0880042470.01.T01:CDS 30.0%
TCTTCATATTCAAACGAAAG+GGG + Chr8:9279253-9279272 MsG0880042470.01.T01:CDS 30.0%
TCTTCATCCTAACATGAATA+TGG + Chr8:9278707-9278726 MsG0880042470.01.T01:intron 30.0%
TGAATGATTGCAATAGCATT+TGG - Chr8:9280742-9280761 None:intergenic 30.0%
TTACATTTGATGCATCAACA+AGG - Chr8:9278410-9278429 None:intergenic 30.0%
TTAGAAACTCAACAAGATGA+TGG + Chr8:9277172-9277191 MsG0880042470.01.T01:CDS 30.0%
TTTGCAGACTATATATCTAC+AGG - Chr8:9280892-9280911 None:intergenic 30.0%
! AAGGGAAATTTGATACCTTT+TGG - Chr8:9277077-9277096 None:intergenic 30.0%
! AAGTATGTGAATGTTTTCTC+CGG - Chr8:9281180-9281199 None:intergenic 30.0%
! AGCATTTAAAACGAAAGGAT+AGG - Chr8:9280103-9280122 None:intergenic 30.0%
! ATTTCAAGCTAATTTGCACA+TGG - Chr8:9277633-9277652 None:intergenic 30.0%
! ATTTTACAACTGTCCCATAT+GGG + Chr8:9279955-9279974 MsG0880042470.01.T01:intron 30.0%
! ATTTTGTGAAATGCATGACA+TGG - Chr8:9281309-9281328 None:intergenic 30.0%
! CATAATTTTTGTCGTCCATA+AGG - Chr8:9280043-9280062 None:intergenic 30.0%
! CATGCAAAGATTTCTGATTT+TGG + Chr8:9280382-9280401 MsG0880042470.01.T01:CDS 30.0%
! GAACAAGCATTTAAAACGAA+AGG - Chr8:9280108-9280127 None:intergenic 30.0%
! TATGTTTGGATGAAGGATTT+TGG + Chr8:9278015-9278034 MsG0880042470.01.T01:intron 30.0%
! TCTATACTTTAAAGGTTAGC+AGG + Chr8:9279769-9279788 MsG0880042470.01.T01:intron 30.0%
! TTATAACCTTGCATTGATGA+TGG - Chr8:9279430-9279449 None:intergenic 30.0%
! TTGTATTCTTGATGTTTTCG+AGG + Chr8:9281570-9281589 MsG0880042470.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
! TTTGGAGTGACATTGAATAT+AGG - Chr8:9281509-9281528 None:intergenic 30.0%
! TTTTATACCTGTATATCGGT+CGG + Chr8:9277015-9277034 MsG0880042470.01.T01:CDS 30.0%
!! ATATCTTAAGTTGGAATGAG+AGG + Chr8:9280173-9280192 MsG0880042470.01.T01:CDS 30.0%
!! ATTCTATTTGAGTTGATCAC+TGG + Chr8:9281131-9281150 MsG0880042470.01.T01:CDS 30.0%
!! CCTTTAAAGTATAGATAACC+TGG - Chr8:9279764-9279783 None:intergenic 30.0%
!! TTAGTGTGAATTTTCAGGAT+TGG + Chr8:9280279-9280298 MsG0880042470.01.T01:intron 30.0%
!! TTCTATTTGAGTTGATCACT+GGG + Chr8:9281132-9281151 MsG0880042470.01.T01:CDS 30.0%
!! TTTTATTTGGAAACACAACC+AGG + Chr8:9277887-9277906 MsG0880042470.01.T01:intron 30.0%
!!! GTAATCCTTTTGATTTCTCT+TGG + Chr8:9278872-9278891 MsG0880042470.01.T01:intron 30.0%
!!! TTTTTTTTTTTTGTGGTGGC+CGG - Chr8:9277448-9277467 None:intergenic 30.0%
AAACAGGTTCACTATCATTG+AGG + Chr8:9278551-9278570 MsG0880042470.01.T01:intron 35.0%
AATAGCTCATATGTTCAGGT+AGG - Chr8:9276101-9276120 None:intergenic 35.0%
AATGAGGATCTATCAAGTCA+GGG + Chr8:9276791-9276810 MsG0880042470.01.T01:CDS 35.0%
ACAGAGTTCAAATCCCATAT+GGG - Chr8:9279971-9279990 None:intergenic 35.0%
ACCAGACATAAGCCAAATAT+TGG + Chr8:9281340-9281359 MsG0880042470.01.T01:CDS 35.0%
ACCAGGAATTTGTCTTCAAT+TGG + Chr8:9277904-9277923 MsG0880042470.01.T01:intron 35.0%
ACCTTTATCTTCTTTCAGTG+TGG + Chr8:9278763-9278782 MsG0880042470.01.T01:intron 35.0%
AGAAATTTGGTCTCTCTCAT+TGG + Chr8:9279613-9279632 MsG0880042470.01.T01:CDS 35.0%
ATGATGTTTATGATCGCATC+TGG + Chr8:9276729-9276748 MsG0880042470.01.T01:CDS 35.0%
CAGGGAGAATAAATCTCATT+TGG + Chr8:9278209-9278228 MsG0880042470.01.T01:intron 35.0%
CATATGGGACAGTTGTAAAA+TGG - Chr8:9279956-9279975 None:intergenic 35.0%
CCATCACAAACTTACAATAC+AGG + Chr8:9276601-9276620 MsG0880042470.01.T01:CDS 35.0%
CCTGTATTGTAAGTTTGTGA+TGG - Chr8:9276604-9276623 None:intergenic 35.0%
CGAGTTCATGTTCTCAAATA+AGG + Chr8:9278944-9278963 MsG0880042470.01.T01:intron 35.0%
CGTCTTCATATTCAAACGAA+AGG + Chr8:9279251-9279270 MsG0880042470.01.T01:CDS 35.0%
CTCATTGGATATTGTGATGA+AGG + Chr8:9279628-9279647 MsG0880042470.01.T01:CDS 35.0%
CTTTCCTTTCGATCTGATAT+AGG + Chr8:9276576-9276595 MsG0880042470.01.T01:CDS 35.0%
GACTAATGTACCAGATCATT+TGG - Chr8:9281527-9281546 None:intergenic 35.0%
GATACTATATTTAAGGACGG+AGG - Chr8:9277236-9277255 None:intergenic 35.0%
GATGCCAAATTCATAGATAC+TGG + Chr8:9276153-9276172 MsG0880042470.01.T01:CDS 35.0%
GGATTCATTAGCATAGATTG+TGG + Chr8:9276075-9276094 MsG0880042470.01.T01:intron 35.0%
GGATTGGATTATCTGCATAA+TGG + Chr8:9280295-9280314 MsG0880042470.01.T01:intron 35.0%
GGTGTTAACTGTTAATTCAG+TGG - Chr8:9280022-9280041 None:intergenic 35.0%
TAAACGATTAAGCACCAATG+AGG + Chr8:9276775-9276794 MsG0880042470.01.T01:CDS 35.0%
TAACAATTTCTCACTCCACT+TGG - Chr8:9276246-9276265 None:intergenic 35.0%
TACATACCGAAATATAGACC+GGG + Chr8:9278171-9278190 MsG0880042470.01.T01:intron 35.0%
TCCAATTGAAGACAAATTCC+TGG - Chr8:9277908-9277927 None:intergenic 35.0%
TCCACACTGAAAGAAGATAA+AGG - Chr8:9278767-9278786 None:intergenic 35.0%
TGCATCAGAAAATCAGGTAA+AGG - Chr8:9278359-9278378 None:intergenic 35.0%
TTCAAAACTACTATTGGGGA+AGG + Chr8:9279337-9279356 MsG0880042470.01.T01:CDS 35.0%
TTCCATCAATAGTGCAGTTT+AGG - Chr8:9277781-9277800 None:intergenic 35.0%
TTCTGTGTTAGCAGAAATGT+GGG + Chr8:9278478-9278497 MsG0880042470.01.T01:intron 35.0%
TTGTCTTCAATTGGATTGAC+AGG + Chr8:9277913-9277932 MsG0880042470.01.T01:intron 35.0%
! AACGATGTTCTTCTTTTTGC+AGG - Chr8:9278819-9278838 None:intergenic 35.0%
! AGGTACTTTTCAGATGACAT+AGG + Chr8:9278919-9278938 MsG0880042470.01.T01:intron 35.0%
! CAACTATGTCTTGTTAACAC+AGG + Chr8:9276462-9276481 MsG0880042470.01.T01:CDS 35.0%
! CATTTTACAACTGTCCCATA+TGG + Chr8:9279954-9279973 MsG0880042470.01.T01:intron 35.0%
! CTGGAAAACTTTTGTCAGAA+GGG - Chr8:9280848-9280867 None:intergenic 35.0%
! CTTTTGTCAGAAGGGATAAT+AGG - Chr8:9280840-9280859 None:intergenic 35.0%
! GTCTTGTTAACACAGGTAAA+GGG + Chr8:9276469-9276488 MsG0880042470.01.T01:CDS 35.0%
! TATAAACCTCATAGGCATTG+AGG - Chr8:9277132-9277151 None:intergenic 35.0%
! TGGTGTCCTTACTACTATTT+TGG + Chr8:9275941-9275960 MsG0880042470.01.T01:CDS 35.0%
! TGTCTTGTTAACACAGGTAA+AGG + Chr8:9276468-9276487 MsG0880042470.01.T01:CDS 35.0%
! TTTGGTCTAAGTAGAGCTTT+TGG + Chr8:9280400-9280419 MsG0880042470.01.T01:CDS 35.0%
!! AAAGTGTTGGAGATTTCCAT+TGG - Chr8:9279686-9279705 None:intergenic 35.0%
!! ATTAATTAAGGTGCTGCTAG+AGG - Chr8:9276638-9276657 None:intergenic 35.0%
!! GGAAATCTCCAACACTTTTT+AGG + Chr8:9279688-9279707 MsG0880042470.01.T01:CDS 35.0%
!! TAACATAGTGAGCTTTGAGA+TGG - Chr8:9277953-9277972 None:intergenic 35.0%
!! TAGCTTTGACTTTGAGTATG+AGG - Chr8:9278581-9278600 None:intergenic 35.0%
!! TTGGATGAAGGATTTTGGAA+TGG + Chr8:9278020-9278039 MsG0880042470.01.T01:intron 35.0%
!!! AACCTGTTTTTGATCTCTCA+AGG - Chr8:9278540-9278559 None:intergenic 35.0%
!!! TTTGGTTTTGATACAAGCTC+AGG + Chr8:9275959-9275978 MsG0880042470.01.T01:CDS 35.0%
!!! TTTTTTTTTTTGTGGTGGCC+GGG - Chr8:9277447-9277466 None:intergenic 35.0%
AAAACTACTATTGGGGAAGG+AGG + Chr8:9279340-9279359 MsG0880042470.01.T01:CDS 40.0%
AAACTCAAGTCGCTGTTAAG+AGG + Chr8:9279398-9279417 MsG0880042470.01.T01:CDS 40.0%
AACAGCAACTAGAATATGGG+AGG + Chr8:9276214-9276233 MsG0880042470.01.T01:CDS 40.0%
AATGCCGGAATTAAGCAAGT+TGG - Chr8:9277551-9277570 None:intergenic 40.0%
ACATATGAGCTATTCTGCGT+CGG + Chr8:9276107-9276126 MsG0880042470.01.T01:CDS 40.0%
ACTATATTTAAGGACGGAGG+AGG - Chr8:9277233-9277252 None:intergenic 40.0%
ATACAAGCTCAGGATCAATC+AGG + Chr8:9275969-9275988 MsG0880042470.01.T01:CDS 40.0%
ATGAAATTGTAAAGGGGCTC+TGG - Chr8:9276870-9276889 None:intergenic 40.0%
CAACATCACAGTGAATGACA+AGG + Chr8:9276979-9276998 MsG0880042470.01.T01:CDS 40.0%
CAATGAGGATCTATCAAGTC+AGG + Chr8:9276790-9276809 MsG0880042470.01.T01:CDS 40.0%
CAATGTCACTCCAAATGATC+TGG + Chr8:9281514-9281533 MsG0880042470.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
CCAAATATTGGCAGAGCTAA+AGG + Chr8:9281352-9281371 MsG0880042470.01.T01:CDS 40.0%
CCTCATTAAAGTGCATGTAG+AGG - Chr8:9276925-9276944 None:intergenic 40.0%
CCTCTACATGCACTTTAATG+AGG + Chr8:9276922-9276941 MsG0880042470.01.T01:CDS 40.0%
CTCAGTTGCATCAGAAAATC+AGG - Chr8:9278365-9278384 None:intergenic 40.0%
CTCCTTGAGAGATCAAAAAC+AGG + Chr8:9278535-9278554 MsG0880042470.01.T01:intron 40.0%
CTTACAGGGTTAATTCCAAG+TGG + Chr8:9278511-9278530 MsG0880042470.01.T01:intron 40.0%
CTTATGGGGTGGTTAGAAAT+TGG + Chr8:9277714-9277733 MsG0880042470.01.T01:intron 40.0%
CTTTCACCATCATCAATGCA+AGG + Chr8:9279421-9279440 MsG0880042470.01.T01:CDS 40.0%
GACAGAGTTCAAATCCCATA+TGG - Chr8:9279972-9279991 None:intergenic 40.0%
GAGCCCCTTTACAATTTCAT+TGG + Chr8:9276870-9276889 MsG0880042470.01.T01:CDS 40.0%
GCAGAATAGCTCATATGTTC+AGG - Chr8:9276105-9276124 None:intergenic 40.0%
GCTAAAGGAATGTCTCTCTT+TGG + Chr8:9281367-9281386 MsG0880042470.01.T01:CDS 40.0%
GCTGAAAATGATGCAACAAG+TGG - Chr8:9278845-9278864 None:intergenic 40.0%
GGAACCTATATCAGATCGAA+AGG - Chr8:9276583-9276602 None:intergenic 40.0%
GTATTTACCGACCGATATAC+AGG - Chr8:9277025-9277044 None:intergenic 40.0%
GTGAATGACAAGGTATGGTT+TGG + Chr8:9276989-9277008 MsG0880042470.01.T01:CDS 40.0%
GTTCTGTGTTAGCAGAAATG+TGG + Chr8:9278477-9278496 MsG0880042470.01.T01:intron 40.0%
TATGAACAAGGCAGAGAGAA+GGG + Chr8:9280059-9280078 MsG0880042470.01.T01:intron 40.0%
TCACAGTGAATGACAAGGTA+TGG + Chr8:9276984-9277003 MsG0880042470.01.T01:CDS 40.0%
TCAGAAGGGATAATAGGCAA+CGG - Chr8:9280834-9280853 None:intergenic 40.0%
TCTAGTAGAAGACCTTTGAC+TGG + Chr8:9277049-9277068 MsG0880042470.01.T01:CDS 40.0%
TCTGTGTTAGCAGAAATGTG+GGG + Chr8:9278479-9278498 MsG0880042470.01.T01:intron 40.0%
TCTTGTGAGCTTAGCTCAAT+TGG + Chr8:9277380-9277399 MsG0880042470.01.T01:intron 40.0%
TGAGCTTAGCTCAATTGGTA+TGG + Chr8:9277385-9277404 MsG0880042470.01.T01:intron 40.0%
TGCTCCTGTGAATTACATGT+GGG + Chr8:9277751-9277770 MsG0880042470.01.T01:intron 40.0%
TGGAGTGTAAATTATCTCCC+TGG - Chr8:9276427-9276446 None:intergenic 40.0%
TGGGGAAGAACAAACTTACA+GGG + Chr8:9278497-9278516 MsG0880042470.01.T01:intron 40.0%
TTAAATTGTCGTTGTGGTCG+TGG + Chr8:9279038-9279057 MsG0880042470.01.T01:intron 40.0%
TTATGAACAAGGCAGAGAGA+AGG + Chr8:9280058-9280077 MsG0880042470.01.T01:intron 40.0%
TTCAACATATTCAAGGGCGA+AGG + Chr8:9277573-9277592 MsG0880042470.01.T01:intron 40.0%
! ATGTAATTCACAGGAGCACA+TGG - Chr8:9277749-9277768 None:intergenic 40.0%
! CTGACTTGATAGATCCTCAT+TGG - Chr8:9276792-9276811 None:intergenic 40.0%
! CTGATTTTCTGATGCAACTG+AGG + Chr8:9278363-9278382 MsG0880042470.01.T01:intron 40.0%
! GCCAATATTTGGCTTATGTC+TGG - Chr8:9281344-9281363 None:intergenic 40.0%
! GCTACCAACTTGCTTAATTC+CGG + Chr8:9277544-9277563 MsG0880042470.01.T01:intron 40.0%
! GCTGGAAAACTTTTGTCAGA+AGG - Chr8:9280849-9280868 None:intergenic 40.0%
! TGCCCTTAGTGTGAATTTTC+AGG + Chr8:9280274-9280293 MsG0880042470.01.T01:intron 40.0%
!! AAAGCTATAGTGAGAGCATC+CGG + Chr8:9281158-9281177 MsG0880042470.01.T01:CDS 40.0%
!! CCTTTAGCTCTGCCAATATT+TGG - Chr8:9281355-9281374 None:intergenic 40.0%
!!! GATGAAGGATTTTGGAATGG+AGG + Chr8:9278023-9278042 MsG0880042470.01.T01:intron 40.0%
!!! TTTTTTTTTTGTGGTGGCCG+GGG - Chr8:9277446-9277465 None:intergenic 40.0%
ACCAATCCTCAATGCCTATG+AGG + Chr8:9277123-9277142 MsG0880042470.01.T01:CDS 45.0%
ACTATTGGGGAAGGAGGATT+TGG + Chr8:9279346-9279365 MsG0880042470.01.T01:CDS 45.0%
ATGAACAAGGCAGAGAGAAG+GGG + Chr8:9280060-9280079 MsG0880042470.01.T01:intron 45.0%
ATGCATCACTCTTCACAACC+AGG + Chr8:9276406-9276425 MsG0880042470.01.T01:CDS 45.0%
ATTGCAGTTGACACAGCACA+TGG + Chr8:9280202-9280221 MsG0880042470.01.T01:CDS 45.0%
CATATATCTACTCGCCTTGC+TGG + Chr8:9280439-9280458 MsG0880042470.01.T01:CDS 45.0%
CATCAAGAACACTTATGGGG+TGG + Chr8:9277703-9277722 MsG0880042470.01.T01:intron 45.0%
CCTGTGAATTACATGTGGGA+AGG + Chr8:9277755-9277774 MsG0880042470.01.T01:intron 45.0%
CCTTCCCACATGTAATTCAC+AGG - Chr8:9277758-9277777 None:intergenic 45.0%
CGTAACCAAATGTACCAGCA+AGG - Chr8:9280456-9280475 None:intergenic 45.0%
GATTCTGTCATGCAAAGACG+AGG - Chr8:9278797-9278816 None:intergenic 45.0%
GGCAACGACAGAATAGACAA+CGG - Chr8:9280871-9280890 None:intergenic 45.0%
GGCCTAAACTGCACTATTGA+TGG + Chr8:9277776-9277795 MsG0880042470.01.T01:intron 45.0%
GGTTGTGAAGAGTGATGCAT+TGG - Chr8:9276406-9276425 None:intergenic 45.0%
GTGCTCCTGTGAATTACATG+TGG + Chr8:9277750-9277769 MsG0880042470.01.T01:intron 45.0%
GTGGGGAAGAACAAACTTAC+AGG + Chr8:9278496-9278515 MsG0880042470.01.T01:intron 45.0%
TGCATCACTCTTCACAACCA+GGG + Chr8:9276407-9276426 MsG0880042470.01.T01:CDS 45.0%
TGTGAAGAGTGATGCATTGG+AGG - Chr8:9276403-9276422 None:intergenic 45.0%
!! ACCTCATAGGCATTGAGGAT+TGG - Chr8:9277127-9277146 None:intergenic 45.0%
!! TCATAGGCATTGAGGATTGG+TGG - Chr8:9277124-9277143 None:intergenic 45.0%
!!! TACCTTTTGGCTCCAGTCAA+AGG - Chr8:9277064-9277083 None:intergenic 45.0%
!! AAAAAAAATATAAGATAATT+AGG - Chr8:9277308-9277327 None:intergenic 5.0%
!! GAATTTATATTATTATAATA+AGG + Chr8:9279871-9279890 MsG0880042470.01.T01:intron 5.0%
!!! TATATAACTAATAATTTTTT+TGG + Chr8:9276694-9276713 MsG0880042470.01.T01:intron 5.0%
!!! TTTTTTTTTTTTTTTTTTTG+TGG - Chr8:9277455-9277474 None:intergenic 5.0%
AAGGGATAATAGGCAACGGC+TGG - Chr8:9280830-9280849 None:intergenic 50.0%
ACGACAGAATAGACAACGGC+TGG - Chr8:9280867-9280886 None:intergenic 50.0%
ACTCGCCTTGCTGGTACATT+TGG + Chr8:9280448-9280467 MsG0880042470.01.T01:CDS 50.0%
GACCTTTGACTGGAGCCAAA+AGG + Chr8:9277059-9277078 MsG0880042470.01.T01:CDS 50.0%
GATCTCTCAAGGAGTCCACT+TGG - Chr8:9278529-9278548 None:intergenic 50.0%
GATTTATTCTCCCTGCGTGC+AGG - Chr8:9278204-9278223 None:intergenic 50.0%
GCAGTGCTCATCACAATTGC+TGG - Chr8:9276830-9276849 None:intergenic 50.0%
GGGGTGGTTAGAAATTGGCA+AGG + Chr8:9277719-9277738 MsG0880042470.01.T01:intron 50.0%
GTTACGAGCAATGCGCAACA+CGG - Chr8:9279082-9279101 None:intergenic 50.0%
TATGGGAGGAGCTTTCCAAG+TGG + Chr8:9276228-9276247 MsG0880042470.01.T01:CDS 50.0%
AAGGTTAGGGGTTCGAACCC+CGG + Chr8:9277426-9277445 MsG0880042470.01.T01:intron 55.0%
AGCTATTCTGCGTCGGACAC+AGG + Chr8:9276114-9276133 MsG0880042470.01.T01:CDS 55.0%
CTGCGTGCAGGCATATTTCC+CGG - Chr8:9278192-9278211 None:intergenic 55.0%
GGGAAATATGCCTGCACGCA+GGG + Chr8:9278191-9278210 MsG0880042470.01.T01:intron 55.0%
TGTCGTTGTGGTCGTGGATG+TGG + Chr8:9279044-9279063 MsG0880042470.01.T01:intron 55.0%
! AAAGGGGCTCTGGCATCTAC+TGG - Chr8:9276860-9276879 None:intergenic 55.0%
CGGGAAATATGCCTGCACGC+AGG + Chr8:9278190-9278209 MsG0880042470.01.T01:intron 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr8 gene 9275898 9281604 9275898 ID=MsG0880042470.01;Name=MsG0880042470.01
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