AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880042563.01

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MsG0880042563.01.T01 AT4G16920 28.986 276 176 8 193 458 907 1172 3.76e-12 70.1
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MsG0880042563.01.T01 AT3G44480 26.163 344 203 11 190 490 708 1043 1.63e-12 71.2
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MsG0880042563.01.T01 AT4G19510 32.812 192 128 1 1 192 333 523 1.50e-22 103
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MsG0880042563.01.T01 AT4G19510 32.812 192 128 1 1 192 373 563 2.18e-22 102
MsG0880042563.01.T01 AT4G19510 32.812 192 128 1 1 192 333 523 2.19e-22 102
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MsG0880042563.01.T01 AT2G17050 26.637 443 273 16 4 425 159 570 4.24e-22 102
MsG0880042563.01.T01 AT5G38850 23.570 437 303 11 5 425 327 748 4.87e-22 101
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MsG0880042563.01.T01 AT1G63870 22.667 525 346 13 4 479 335 848 6.98e-22 101
MsG0880042563.01.T01 AT5G46520 31.707 205 138 2 4 207 338 541 7.29e-22 101
MsG0880042563.01.T01 AT5G46510 31.707 205 138 2 4 207 337 540 8.36e-22 101
MsG0880042563.01.T01 AT4G19510 34.066 182 119 1 11 192 356 536 8.71e-22 100
MsG0880042563.01.T01 AT4G19510 34.066 182 119 1 11 192 356 536 1.36e-21 100
MsG0880042563.01.T01 AT1G63880 24.886 438 260 15 4 427 336 718 2.25e-21 99.8
MsG0880042563.01.T01 AT1G63880 26.014 296 149 8 190 481 623 852 5.41e-14 75.9
MsG0880042563.01.T01 AT3G25505 25.629 437 255 12 4 426 157 537 2.89e-21 98.2
MsG0880042563.01.T01 AT1G63880 24.886 438 260 15 4 427 336 718 2.91e-21 99.0
MsG0880042563.01.T01 AT5G41740 30.319 188 128 2 4 191 173 357 1.27e-20 97.1
MsG0880042563.01.T01 AT4G16900 26.151 478 270 15 5 426 324 774 1.35e-20 97.1
MsG0880042563.01.T01 AT4G16900 26.151 478 270 15 5 426 324 774 1.37e-20 97.1
MsG0880042563.01.T01 AT1G56540 30.526 190 127 2 4 191 172 358 1.56e-20 97.1
MsG0880042563.01.T01 AT1G17600 32.105 190 121 4 4 189 333 518 1.76e-20 96.7
MsG0880042563.01.T01 AT1G56540 30.526 190 127 2 4 191 336 522 1.78e-20 96.7
MsG0880042563.01.T01 AT5G41740 30.319 188 128 2 4 191 325 509 2.02e-20 96.7
MsG0880042563.01.T01 AT5G41740 30.319 188 128 2 4 191 325 509 2.12e-20 96.7
MsG0880042563.01.T01 AT5G40100 30.159 189 122 3 4 189 334 515 3.13e-20 95.9
MsG0880042563.01.T01 AT1G31540 30.851 188 125 3 4 189 338 522 3.16e-20 95.9
MsG0880042563.01.T01 AT1G31540 30.851 188 125 3 4 189 338 522 3.77e-20 95.5
MsG0880042563.01.T01 AT1G31540 30.851 188 125 3 4 189 338 522 3.77e-20 95.5
MsG0880042563.01.T01 AT1G64070 29.534 193 125 3 4 192 336 521 4.87e-20 95.5
MsG0880042563.01.T01 AT5G45250 31.016 187 113 6 3 179 353 533 8.71e-20 94.7
MsG0880042563.01.T01 AT5G45060 23.696 460 266 17 1 426 359 767 1.23e-19 94.4
MsG0880042563.01.T01 AT5G45060 23.696 460 266 17 1 426 359 767 1.23e-19 94.4
MsG0880042563.01.T01 AT5G45230 34.270 178 101 5 3 172 361 530 1.34e-19 94.0
MsG0880042563.01.T01 AT4G09360 23.518 523 297 18 4 475 145 615 1.55e-19 93.6
MsG0880042563.01.T01 AT3G51570 30.108 186 123 4 9 191 361 542 1.73e-19 93.6
MsG0880042563.01.T01 AT3G51570 30.108 186 123 4 9 191 361 542 1.98e-19 93.6
MsG0880042563.01.T01 AT4G16900 30.909 165 109 1 5 169 324 483 5.91e-19 91.7
MsG0880042563.01.T01 AT5G58120 27.273 198 141 1 9 206 343 537 5.97e-19 92.0
MsG0880042563.01.T01 AT5G45200 24.834 451 288 15 4 425 120 548 1.80e-18 90.5
MsG0880042563.01.T01 AT3G44670 27.835 194 135 2 4 192 418 611 2.36e-18 90.1
MsG0880042563.01.T01 AT3G44670 27.835 194 135 2 4 192 418 611 2.36e-18 90.1
MsG0880042563.01.T01 AT5G45200 24.834 451 288 15 4 425 364 792 2.88e-18 89.7
MsG0880042563.01.T01 AT5G45200 24.834 451 288 15 4 425 364 792 3.53e-18 89.7
MsG0880042563.01.T01 AT1G56510 29.101 189 128 3 4 190 334 518 9.24e-18 88.2
MsG0880042563.01.T01 AT1G56510 24.667 300 165 8 184 481 612 852 6.47e-11 66.2
MsG0880042563.01.T01 AT1G56520 27.136 199 137 3 1 194 169 364 3.39e-17 85.9
MsG0880042563.01.T01 AT1G56520 27.136 199 137 3 1 194 331 526 3.73e-17 86.3
MsG0880042563.01.T01 AT1G56520 27.136 199 137 3 1 194 331 526 4.34e-17 85.9
MsG0880042563.01.T01 AT1G56520 27.273 198 136 3 1 193 331 525 6.09e-17 85.5
MsG0880042563.01.T01 AT3G44630 28.497 193 107 3 4 168 418 607 6.41e-17 85.5
MsG0880042563.01.T01 AT3G44630 28.497 193 107 3 4 168 418 607 7.05e-17 85.5
MsG0880042563.01.T01 AT3G44630 28.497 193 107 3 4 168 418 607 7.05e-17 85.5
MsG0880042563.01.T01 AT3G44630 28.497 193 107 3 4 168 418 607 7.05e-17 85.5
MsG0880042563.01.T01 AT1G56520 27.136 199 137 3 1 194 331 526 7.30e-17 84.7
MsG0880042563.01.T01 AT4G19510 29.167 192 98 1 1 192 373 526 9.61e-17 85.1
MsG0880042563.01.T01 AT4G19510 29.167 192 98 1 1 192 373 526 9.61e-17 85.1
MsG0880042563.01.T01 AT1G63730 23.034 534 338 15 5 484 337 851 1.91e-16 84.0
MsG0880042563.01.T01 AT3G44400 31.481 162 105 3 4 163 363 520 1.23e-15 81.3
MsG0880042563.01.T01 AT3G44400 31.481 162 105 3 4 163 363 520 1.23e-15 81.3
MsG0880042563.01.T01 AT3G44400 31.481 162 105 3 4 163 363 520 1.23e-15 81.3
MsG0880042563.01.T01 AT3G44400 31.481 162 105 3 4 163 363 520 1.23e-15 81.3
MsG0880042563.01.T01 AT3G44400 31.481 162 105 3 4 163 363 520 1.23e-15 81.3
MsG0880042563.01.T01 AT1G63740 23.932 468 265 13 5 448 367 767 1.91e-15 80.9
MsG0880042563.01.T01 AT1G63740 23.932 468 265 13 5 448 296 696 1.96e-15 80.5
MsG0880042563.01.T01 AT2G16870 27.368 285 148 7 195 479 348 573 1.10e-14 78.2
MsG0880042563.01.T01 AT2G16870 27.368 285 148 7 195 479 348 573 1.10e-14 78.2
MsG0880042563.01.T01 AT2G16870 27.368 285 148 7 195 479 622 847 1.15e-14 78.2
MsG0880042563.01.T01 AT1G63860 26.380 163 117 1 30 192 333 492 3.30e-13 73.6
MsG0880042563.01.T01 AT1G63860 26.380 163 117 1 30 192 333 492 3.30e-13 73.6
MsG0880042563.01.T01 AT1G63860 26.380 163 117 1 30 192 333 492 3.30e-13 73.6
MsG0880042563.01.T01 AT1G63860 26.380 163 117 1 30 192 333 492 8.16e-13 72.4
MsG0880042563.01.T01 AT1G63860 26.380 163 117 1 30 192 333 492 8.54e-13 72.0
MsG0880042563.01.T01 AT1G63860 26.380 163 117 1 30 192 333 492 8.64e-13 72.0
MsG0880042563.01.T01 AT5G17880 26.852 216 138 8 5 204 354 565 2.75e-12 70.5
MsG0880042563.01.T01 AT5G17880 26.852 216 138 8 5 204 354 565 3.10e-12 70.5
MsG0880042563.01.T01 AT4G19530 24.691 324 187 7 184 482 653 944 4.77e-12 69.7
MsG0880042563.01.T01 AT4G19530 27.322 183 123 6 5 179 357 537 5.42e-11 66.6
MsG0880042563.01.T01 AT4G19530 24.765 319 183 7 184 477 653 939 7.63e-12 69.3
MsG0880042563.01.T01 AT4G19530 27.322 183 123 6 5 179 357 537 5.94e-11 66.2
MsG0880042563.01.T01 AT2G17060 30.909 165 107 5 6 164 367 530 9.35e-12 68.9
MsG0880042563.01.T01 AT2G17060 30.909 165 107 5 6 164 367 530 1.22e-11 68.6

Find 99 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 230 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GGTTCTTTCTCAAGGACTTA+TGG 0.195009 8:+10664446 MsG0880042563.01.T01:CDS
GGAAGATACTTAATGGTTTC+AGG 0.217612 8:-10664003 None:intergenic
TGCAAATCAACGGAAGAAAA+TGG 0.232135 8:-10663655 None:intergenic
TCATTCCAAGTTTGTCTGTC+TGG 0.262768 8:+10664091 MsG0880042563.01.T01:CDS
CCCTTTAGCTTTGCAAGTAT+TGG 0.271473 8:+10661313 MsG0880042563.01.T01:CDS
GCAAATTCAGAAAATGAAAA+TGG 0.294450 8:+10664294 MsG0880042563.01.T01:CDS
GTTCTTTCTCAAGGACTTAT+GGG 0.296417 8:+10664447 MsG0880042563.01.T01:CDS
CCTTTAGCTTTGCAAGTATT+GGG 0.303693 8:+10661314 MsG0880042563.01.T01:CDS
ATAGAATCAATTTCGTTGTT+TGG 0.305622 8:-10661401 None:intergenic
GGCTGGTGAGCAAGTGTTAC+TGG 0.312777 8:-10663581 None:intergenic
GCATGGCTTAATACAGGAAA+TGG 0.317153 8:+10661619 MsG0880042563.01.T01:CDS
GCTCCTTAACTGCTACAAAT+TGG 0.329503 8:+10664188 MsG0880042563.01.T01:CDS
GAGTCGGGGAAGATACTTAA+TGG 0.330057 8:-10664010 None:intergenic
TAACTTGCTTCAATCTATTC+CGG 0.333217 8:+10664056 MsG0880042563.01.T01:CDS
ATGGGATTTGATGTAGGTTT+TGG 0.342087 8:+10664465 MsG0880042563.01.T01:CDS
CATTCCAAGTTTGTCTGTCT+GGG 0.346990 8:+10664092 MsG0880042563.01.T01:CDS
TGTGGATTCTTCACTGATAT+AGG 0.361845 8:+10661536 MsG0880042563.01.T01:CDS
TGAGCTTCCATCTAATTTGT+TGG 0.363394 8:+10664407 MsG0880042563.01.T01:CDS
GAGCTTCCATCTAATTTGTT+GGG 0.367146 8:+10664408 MsG0880042563.01.T01:CDS
ACTAGAAAGTACTTTATCTA+AGG 0.381020 8:-10663851 None:intergenic
ATGGACACAATGATATTGAT+TGG 0.385445 8:+10664313 MsG0880042563.01.T01:CDS
AATATTAACCCGTTTGAGTC+GGG 0.392222 8:-10664025 None:intergenic
AATACATCATAAACTTCCTT+AGG 0.394739 8:-10661704 None:intergenic
TCCACAAGATAATCACTAAT+AGG 0.394983 8:-10663757 None:intergenic
CCATATGGCAAACCTATTCC+TGG 0.395639 8:+10664156 MsG0880042563.01.T01:CDS
GATCCAATTTGTAGCAGTTA+AGG 0.396161 8:-10664191 None:intergenic
CCAATACTTGCAAAGCTAAA+GGG 0.400059 8:-10661313 None:intergenic
TCCTATTAGTGATTATCTTG+TGG 0.401485 8:+10663756 MsG0880042563.01.T01:CDS
GGGTTTAAGACTAATTGATA+TGG 0.405181 8:+10663966 MsG0880042563.01.T01:CDS
AAAATTGATGAATCAACTTC+AGG 0.409500 8:-10663499 None:intergenic
CCAGGAATAGGTTTGCCATA+TGG 0.411294 8:-10664156 None:intergenic
GCAAAACCCAACAAATTAGA+TGG 0.411562 8:-10664414 None:intergenic
CTCCTCACTGTCGTCATTAG+AGG 0.418154 8:+10663945 MsG0880042563.01.T01:CDS
TGTTACTTGGACAATAGTTC+AGG 0.418544 8:+10664495 MsG0880042563.01.T01:CDS
ACATAATCTACTGCGTTGTC+CGG 0.422252 8:-10661678 None:intergenic
GTAGATTGAAGGATCATTCC+AGG 0.423476 8:-10664568 None:intergenic
GTTGTAAAAGTGAAATAGAA+TGG 0.430330 8:+10661348 MsG0880042563.01.T01:CDS
GTGGATTCTTCACTGATATA+GGG 0.439508 8:+10661537 MsG0880042563.01.T01:CDS
CCCAATACTTGCAAAGCTAA+AGG 0.440579 8:-10661314 None:intergenic
AGTATCTTCCCCGACTCAAA+CGG 0.441519 8:+10664016 MsG0880042563.01.T01:CDS
GACAGTGAGGAGATACGGTC+TGG 0.444950 8:-10663934 None:intergenic
CTCTGTCATTTGAATGCTAC+GGG 0.445640 8:+10663604 MsG0880042563.01.T01:CDS
AGTTCAACGGTTGAACCATA+TGG 0.446478 8:+10664141 MsG0880042563.01.T01:CDS
ATTCCAGGGATATTTGTAGA+AGG 0.448709 8:-10664553 None:intergenic
CAATCCCAGACAGACAAACT+TGG 0.467179 8:-10664096 None:intergenic
CCTCTGTCATTTGAATGCTA+CGG 0.468582 8:+10663603 MsG0880042563.01.T01:CDS
TCTGAAATCATGTAGATTGA+AGG 0.469026 8:-10664579 None:intergenic
GGACTTATGGGATTTGATGT+AGG 0.469574 8:+10664459 MsG0880042563.01.T01:CDS
TTGTAAAAGTGAAATAGAAT+GGG 0.472978 8:+10661349 MsG0880042563.01.T01:CDS
GCAAATCAACGGAAGAAAAT+GGG 0.475326 8:-10663654 None:intergenic
AACTTGTTACCTGCTATGCC+TGG 0.478299 8:+10664336 MsG0880042563.01.T01:CDS
ACAAATGCATGGCTTAATAC+AGG 0.482328 8:+10661613 MsG0880042563.01.T01:CDS
CAGGGTTATTACAAAATTCG+TGG 0.484063 8:-10664624 None:intergenic
AGCTCCACATATCCATCCTC+AGG 0.495170 8:-10661257 None:intergenic
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CRISPR-GE

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AAAAAGTCTGAGGGAATTTC+GGG - Chr8:10661210-10661229 None:intergenic 35.0%
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CTGAGATATATTCTATGGGA+TGG + Chr8:10661994-10662013 MsG0880042563.01.T01:intron 35.0%
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TTTAGACAAGGCTCTTGTAA+GGG + Chr8:10661571-10661590 MsG0880042563.01.T01:CDS 35.0%
! ATGGGATTTGATGTAGGTTT+TGG + Chr8:10664465-10664484 MsG0880042563.01.T01:CDS 35.0%
! CATGTGGAAAAACTTTGGAA+TGG + Chr8:10662087-10662106 MsG0880042563.01.T01:intron 35.0%
! CATTCCAAAGTTTTTCCACA+TGG - Chr8:10662089-10662108 None:intergenic 35.0%
! TCCATCTTTTCAAATGCATC+GGG - Chr8:10661888-10661907 None:intergenic 35.0%
! TGAGCTTCCATCTAATTTGT+TGG + Chr8:10664407-10664426 MsG0880042563.01.T01:CDS 35.0%
! TGGACATTCTATCAGCTTTT+TGG - Chr8:10663422-10663441 None:intergenic 35.0%
! TGTTACTTGGACAATAGTTC+AGG + Chr8:10664495-10664514 MsG0880042563.01.T01:CDS 35.0%
! TTTTAACAAAGTCTCACCTG+AGG + Chr8:10661241-10661260 MsG0880042563.01.T01:CDS 35.0%
! TTTTAGACAAGGCTCTTGTA+AGG + Chr8:10661570-10661589 MsG0880042563.01.T01:CDS 35.0%
!! AAAACTTTGGAATGGAGTAG+TGG + Chr8:10662095-10662114 MsG0880042563.01.T01:intron 35.0%
!! CCTTTAGCTTTGCAAGTATT+GGG + Chr8:10661314-10661333 MsG0880042563.01.T01:CDS 35.0%
!! GAGCTTCCATCTAATTTGTT+GGG + Chr8:10664408-10664427 MsG0880042563.01.T01:CDS 35.0%
!! TGAGAAAGTGTTGAGTTCAA+CGG + Chr8:10664128-10664147 MsG0880042563.01.T01:CDS 35.0%
!! TTTTGGATGTGAGTGTTACT+TGG + Chr8:10664482-10664501 MsG0880042563.01.T01:CDS 35.0%
!!! GATATTGCGTGCTTTTTCAA+AGG + Chr8:10661476-10661495 MsG0880042563.01.T01:CDS 35.0%
!!! GCTTTTTCAAAGGACATGAA+AGG + Chr8:10661486-10661505 MsG0880042563.01.T01:CDS 35.0%
ACACCTTCTACAAATATCCC+TGG + Chr8:10664550-10664569 MsG0880042563.01.T01:CDS 40.0%
ACATAATCTACTGCGTTGTC+CGG - Chr8:10661681-10661700 None:intergenic 40.0%
ACCCGATGCATTTGAAAAGA+TGG + Chr8:10661884-10661903 MsG0880042563.01.T01:intron 40.0%
AGAGCAATTGATTATGCCAG+AGG + Chr8:10661287-10661306 MsG0880042563.01.T01:CDS 40.0%
AGCACAGTAAAACCAGGAAT+AGG - Chr8:10664171-10664190 None:intergenic 40.0%
AGTTCAACGGTTGAACCATA+TGG + Chr8:10664141-10664160 MsG0880042563.01.T01:CDS 40.0%
ATATTAACCCGTTTGAGTCG+GGG - Chr8:10664027-10664046 None:intergenic 40.0%
ATTAGATGGAAGCTCAAGAG+TGG - Chr8:10664403-10664422 None:intergenic 40.0%
CATTCCAAGTTTGTCTGTCT+GGG + Chr8:10664092-10664111 MsG0880042563.01.T01:CDS 40.0%
CCAGAAAAAAAAGTTGGGGT+GGG + Chr8:10662143-10662162 MsG0880042563.01.T01:intron 40.0%
CCCAATACTTGCAAAGCTAA+AGG - Chr8:10661317-10661336 None:intergenic 40.0%
CGGAGCCAGAAAAAAAAGTT+GGG + Chr8:10662138-10662157 MsG0880042563.01.T01:intron 40.0%
CGTAGCATTCAAATGACAGA+GGG - Chr8:10663605-10663624 None:intergenic 40.0%
CTTCCTGACTGTAAAAGACT+TGG + Chr8:10663879-10663898 MsG0880042563.01.T01:CDS 40.0%
GCATGGCTTAATACAGGAAA+TGG + Chr8:10661619-10661638 MsG0880042563.01.T01:CDS 40.0%
GCTCCTTAACTGCTACAAAT+TGG + Chr8:10664188-10664207 MsG0880042563.01.T01:CDS 40.0%
GGACTTATGGGATTTGATGT+AGG + Chr8:10664459-10664478 MsG0880042563.01.T01:CDS 40.0%
GGAGCCAGAAAAAAAAGTTG+GGG + Chr8:10662139-10662158 MsG0880042563.01.T01:intron 40.0%
GGTTCTTTCTCAAGGACTTA+TGG + Chr8:10664446-10664465 MsG0880042563.01.T01:CDS 40.0%
GTAGATTGAAGGATCATTCC+AGG - Chr8:10664571-10664590 None:intergenic 40.0%
TCATTCCAAGTTTGTCTGTC+TGG + Chr8:10664091-10664110 MsG0880042563.01.T01:CDS 40.0%
TCGAAACAATTTACCATGCC+AGG - Chr8:10664357-10664376 None:intergenic 40.0%
! AGACCAAGTCTTTTACAGTC+AGG - Chr8:10663885-10663904 None:intergenic 40.0%
! CAAGTCTTTTACAGTCAGGA+AGG - Chr8:10663881-10663900 None:intergenic 40.0%
! CCTCTGTCATTTGAATGCTA+CGG + Chr8:10663603-10663622 MsG0880042563.01.T01:CDS 40.0%
! CTCTGTCATTTGAATGCTAC+GGG + Chr8:10663604-10663623 MsG0880042563.01.T01:CDS 40.0%
! GGTTTCAGGCAAGCTTTTAA+TGG - Chr8:10663992-10664011 None:intergenic 40.0%
! TCTGGGATTTCAGACAACAT+AGG - Chr8:10663919-10663938 None:intergenic 40.0%
! TTAAGGAGCACAGTAAAACC+AGG - Chr8:10664177-10664196 None:intergenic 40.0%
!! CCCTTTAGCTTTGCAAGTAT+TGG + Chr8:10661313-10661332 MsG0880042563.01.T01:CDS 40.0%
AACAAAGTCTCACCTGAGGA+TGG + Chr8:10661245-10661264 MsG0880042563.01.T01:CDS 45.0%
AGCAATAAACCAAGACCGTG+TGG - Chr8:10661967-10661986 None:intergenic 45.0%
AGCATTTCAAGACAGGAGGT+TGG - Chr8:10662042-10662061 None:intergenic 45.0%
AGTATCTTCCCCGACTCAAA+CGG + Chr8:10664016-10664035 MsG0880042563.01.T01:CDS 45.0%
ATGACGACAGTGAGGAGATA+CGG - Chr8:10663942-10663961 None:intergenic 45.0%
ATTTCAAGACAGGAGGTTGG+AGG - Chr8:10662039-10662058 None:intergenic 45.0%
CAAAGCTAAAGGGTTTCCTC+TGG - Chr8:10661306-10661325 None:intergenic 45.0%
CAATCCCAGACAGACAAACT+TGG - Chr8:10664099-10664118 None:intergenic 45.0%
CACAAGCATTTCAAGACAGG+AGG - Chr8:10662046-10662065 None:intergenic 45.0%
CATAATCTACTGCGTTGTCC+GGG - Chr8:10661680-10661699 None:intergenic 45.0%
CCAGGAATAGGTTTGCCATA+TGG - Chr8:10664159-10664178 None:intergenic 45.0%
CCATATGGCAAACCTATTCC+TGG + Chr8:10664156-10664175 MsG0880042563.01.T01:CDS 45.0%
CCGTAGCATTCAAATGACAG+AGG - Chr8:10663606-10663625 None:intergenic 45.0%
CTCCACAAGCATTTCAAGAC+AGG - Chr8:10662049-10662068 None:intergenic 45.0%
CTCCTGTCTTGAAATGCTTG+TGG + Chr8:10662044-10662063 MsG0880042563.01.T01:intron 45.0%
GAGTCGGGGAAGATACTTAA+TGG - Chr8:10664013-10664032 None:intergenic 45.0%
GCCAGAAAAAAAAGTTGGGG+TGG + Chr8:10662142-10662161 MsG0880042563.01.T01:intron 45.0%
GCGGAGCCAGAAAAAAAAGT+TGG + Chr8:10662137-10662156 MsG0880042563.01.T01:intron 45.0%
GCTATCGATGGGATTGAACT+TGG + Chr8:10664243-10664262 MsG0880042563.01.T01:CDS 45.0%
TACACCACTTTGCGGGAATT+TGG + Chr8:10662252-10662271 MsG0880042563.01.T01:intron 45.0%
TCCTCACTGTCGTCATTAGA+GGG + Chr8:10663946-10663965 MsG0880042563.01.T01:CDS 45.0%
TGATCCAAATTCCCGCAAAG+TGG - Chr8:10662259-10662278 None:intergenic 45.0%
TGGCTTCAACTTTCTATCCC+TGG - Chr8:10661824-10661843 None:intergenic 45.0%
TTTCAAGACAGGAGGTTGGA+GGG - Chr8:10662038-10662057 None:intergenic 45.0%
! GTGAGCAAGTGTTACTGGAA+AGG - Chr8:10663579-10663598 None:intergenic 45.0%
! GTTGGAGGGAGAGTTTTCAA+TGG - Chr8:10662024-10662043 None:intergenic 45.0%
! GTTGGGTTTTGCCTACTACA+TGG + Chr8:10664425-10664444 MsG0880042563.01.T01:CDS 45.0%
! TCTTTTACAGTCAGGAAGGC+AGG - Chr8:10663877-10663896 None:intergenic 45.0%
! TGCTTTTGTCAGAGTGGGAT+GGG + Chr8:10663680-10663699 MsG0880042563.01.T01:CDS 45.0%
!! AACTTGTTACCTGCTATGCC+TGG + Chr8:10664336-10664355 MsG0880042563.01.T01:CDS 45.0%
!! CTTGCTTTTCAAGACCGCAA+AGG + Chr8:10661922-10661941 MsG0880042563.01.T01:intron 45.0%
!! TTGCTTTTGTCAGAGTGGGA+TGG + Chr8:10663679-10663698 MsG0880042563.01.T01:CDS 45.0%
!!! CCCACCCCAACTTTTTTTTC+TGG - Chr8:10662146-10662165 None:intergenic 45.0%
!!! GCAGTTGCTTTTGTCAGAGT+GGG + Chr8:10663675-10663694 MsG0880042563.01.T01:CDS 45.0%
!!! TCAGCTTTTTGGAGTGACTG+AGG - Chr8:10663411-10663430 None:intergenic 45.0%
!!! TGCAGTTGCTTTTGTCAGAG+TGG + Chr8:10663674-10663693 MsG0880042563.01.T01:CDS 45.0%
!! AATTTAAATAATTCAATTAT+AGG - Chr8:10662217-10662236 None:intergenic 5.0%
!!! ATTGAATTATTTAAATTTTT+CGG + Chr8:10662220-10662239 MsG0880042563.01.T01:intron 5.0%
ACAGTGAGGAGATACGGTCT+GGG - Chr8:10663936-10663955 None:intergenic 50.0%
ACCCTCTAATGACGACAGTG+AGG - Chr8:10663950-10663969 None:intergenic 50.0%
AGCTCCACATATCCATCCTC+AGG - Chr8:10661260-10661279 None:intergenic 50.0%
ATAAGCGTTCCACACGGTCT+TGG + Chr8:10661955-10661974 MsG0880042563.01.T01:intron 50.0%
ATTCCCGCAAAGTGGTGTAG+TGG - Chr8:10662251-10662270 None:intergenic 50.0%
CTCACCTGAGGATGGATATG+TGG + Chr8:10661253-10661272 MsG0880042563.01.T01:CDS 50.0%
CTCCTCACTGTCGTCATTAG+AGG + Chr8:10663945-10663964 MsG0880042563.01.T01:CDS 50.0%
GCATTCAAATGACAGAGGGC+TGG - Chr8:10663601-10663620 None:intergenic 50.0%
GTATCTTCCCCGACTCAAAC+GGG + Chr8:10664017-10664036 MsG0880042563.01.T01:CDS 50.0%
TGGACCACTACACCACTTTG+CGG + Chr8:10662358-10662377 MsG0880042563.01.T01:intron 50.0%
TGGGTCACTACACCACTTTG+CGG + Chr8:10662244-10662263 MsG0880042563.01.T01:intron 50.0%
TTGGGGGAACCAGACACATT+TGG - Chr8:10663442-10663461 None:intergenic 50.0%
TTTACCATGCCAGGCATAGC+AGG - Chr8:10664348-10664367 None:intergenic 50.0%
GACAGTGAGGAGATACGGTC+TGG - Chr8:10663937-10663956 None:intergenic 55.0%
GGAATGAAGCGATGAAGCGC+CGG - Chr8:10664078-10664097 None:intergenic 55.0%
GGACCACTACACCACTTTGC+GGG + Chr8:10662359-10662378 MsG0880042563.01.T01:intron 55.0%
GGCTGGTGAGCAAGTGTTAC+TGG - Chr8:10663584-10663603 None:intergenic 55.0%
GGGTCACTACACCACTTTGC+GGG + Chr8:10662245-10662264 MsG0880042563.01.T01:intron 55.0%
GTTACCTGCTATGCCTGGCA+TGG + Chr8:10664341-10664360 MsG0880042563.01.T01:CDS 55.0%
! TAATTTTTCCGGGTGGGCCG+TGG + Chr8:10662461-10662480 MsG0880042563.01.T01:intron 55.0%
! ACAGTGGCGGAGCCCTTCAT+GGG - Chr8:10662497-10662516 None:intergenic 60.0%
! CACAGTGGCGGAGCCCTTCA+TGG - Chr8:10662498-10662517 None:intergenic 65.0%
!! AGCCCTTCATGGGCTGGGGT+GGG - Chr8:10662487-10662506 None:intergenic 65.0%
GGCCCACCCCAGCCCATGAA+GGG + Chr8:10662482-10662501 MsG0880042563.01.T01:intron 70.0%
GGCGGAGCCCTTCATGGGCT+GGG - Chr8:10662492-10662511 None:intergenic 70.0%
TGGCCCACCCCAGCCCATGA+AGG + Chr8:10662481-10662500 MsG0880042563.01.T01:intron 70.0%
TGGCGGAGCCCTTCATGGGC+TGG - Chr8:10662493-10662512 None:intergenic 70.0%
! GCGGAGCCCTTCATGGGCTG+GGG - Chr8:10662491-10662510 None:intergenic 70.0%
!! GAGCCCTTCATGGGCTGGGG+TGG - Chr8:10662488-10662507 None:intergenic 70.0%
!! TCATGGGCTGGGGTGGGCCA+CGG - Chr8:10662481-10662500 None:intergenic 70.0%
! GGGGTGGGCCACGGCCCACC+CGG - Chr8:10662472-10662491 None:intergenic 85.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr8 gene 10661161 10664638 10661161 ID=MsG0880042563.01;Name=MsG0880042563.01
Chr8 mRNA 10661161 10664638 10661161 ID=MsG0880042563.01.T01;Parent=MsG0880042563.01;Name=MsG0880042563.01.T01;_AED=0.41;_eAED=0.41;_QI=0|0|0|1|1|1|2|0|611
Chr8 exon 10661161 10661739 10661161 ID=MsG0880042563.01.T01:exon:2823;Parent=MsG0880042563.01.T01
Chr8 exon 10663382 10664638 10663382 ID=MsG0880042563.01.T01:exon:2824;Parent=MsG0880042563.01.T01
Chr8 CDS 10661161 10661739 10661161 ID=MsG0880042563.01.T01:cds;Parent=MsG0880042563.01.T01
Chr8 CDS 10663382 10664638 10663382 ID=MsG0880042563.01.T01:cds;Parent=MsG0880042563.01.T01
Gene Sequence

>MsG0880042563.01.T01

ATGCGGGGAGGAATTGAAACAATTTATGAAGTTAAGAAGATGAACTCCCGAAATTCCCTCAGACTTTTTAGTTTGAATGCTTTTAACAAAGTCTCACCTGAGGATGGATATGTGGAGCTCTCAAAAAGAGCAATTGATTATGCCAGAGGAAACCCTTTAGCTTTGCAAGTATTGGGATCATTACTTAGTTGTAAAAGTGAAATAGAATGGGATTGTGCATTAGCTAAACTGAAAAAAATGCCAAACAACGAAATTGATTCTATATTTAGAATGAGTTTTAATGAATTGGATGAAACAGAGCAAAATATATTTTTGGATATTGCGTGCTTTTTCAAAGGACATGAAAGGAATAGCATAACAAAAATATTGAATGAGTGTGGATTCTTCACTGATATAGGGATAAGTCATCTTTTAGACAAGGCTCTTGTAAGGGTTGACTCTGAAAATTGCATACAAATGCATGGCTTAATACAGGAAATGGGAAAACAAATTGTTCGTGAAGAATCACTTAAGAATCCCGGACAACGCAGTAGATTATGTGATCCTAAGGAAGTTTATGATGTATTGAAAAATAATAGAAATTTGCCAAAGTTAGAGAAAATTGACCTCAGTCACTCCAAAAAGCTGATAGAATGTCCAAATGTGTCTGGTTCCCCCAATTTAAAACATGTAATACTTCGTTATTGTGAAAGCATGCCTGAAGTTGATTCATCAATTTTCCATCTCCAAAAGCTTAAATTTTTAAGCTTGAAAGGATGTTTGTCGCTTAAGAGCCTTTCCAGTAACACTTGCTCACCAGCCCTCTGTCATTTGAATGCTACGGGTTGCATCAATCTCAAAGAATTCTCAGTCCCATTTTCTTCCGTTGATTTGCAGTTGCTTTTGTCAGAGTGGGATGGGAATGAATTTCCATCATCTATATTGCATACACAAAATATTAAAAACTTTGCCTTTCCTATTAGTGATTATCTTGTGGATCTTCCTGAAAACTTTTGCAATTATATTTGGCTTATGAGACAACAGAATCGTGAACAAGACCCTTTCAACACCTTAGATAAAGTACTTTCTAGTCCTGCCTTCCTGACTGTAAAAGACTTGGTCTTTTATGGTATTCCTATGTTGTCTGAAATCCCAGACCGTATCTCCTCACTGTCGTCATTAGAGGGTTTAAGACTAATTGATATGGCCATTAAAAGCTTGCCTGAAACCATTAAGTATCTTCCCCGACTCAAACGGGTTAATATTTACAATTGTAACTTGCTTCAATCTATTCCGGCGCTTCATCGCTTCATTCCAAGTTTGTCTGTCTGGGATTGTGAATCTCTTGAGAAAGTGTTGAGTTCAACGGTTGAACCATATGGCAAACCTATTCCTGGTTTTACTGTGCTCCTTAACTGCTACAAATTGGATCCACATTCATACCAAACAGTTTTAAAAGATGCTATCGATGGGATTGAACTTGGTGCAAGAGAATATTCAGAAAATGAAGATGCAAATTCAGAAAATGAAAATGGACACAATGATATTGATTGGAACTTGTTACCTGCTATGCCTGGCATGGTAAATTGTTTCGATTTCTCTTCTACACAAGTTTCTGCCACTCTTGAGCTTCCATCTAATTTGTTGGGTTTTGCCTACTACATGGTTCTTTCTCAAGGACTTATGGGATTTGATGTAGGTTTTGGATGTGAGTGTTACTTGGACAATAGTTCAGGTGAAAGCATCTGTATAACAAGTTTCATAAAAGACACCTTCTACAAATATCCCTGGAATGATCCTTCAATCTACATGATTTCAGATCATTTGCTTTTATGGTATGATCCACGAATTTTGTAA
Protein sequence

>MsG0880042563.01.T01

MRGGIETIYEVKKMNSRNSLRLFSLNAFNKVSPEDGYVELSKRAIDYARGNPLALQVLGSLLSCKSEIEWDCALAKLKKMPNNEIDSIFRMSFNELDETEQNIFLDIACFFKGHERNSITKILNECGFFTDIGISHLLDKALVRVDSENCIQMHGLIQEMGKQIVREESLKNPGQRSRLCDPKEVYDVLKNNRNLPKLEKIDLSHSKKLIECPNVSGSPNLKHVILRYCESMPEVDSSIFHLQKLKFLSLKGCLSLKSLSSNTCSPALCHLNATGCINLKEFSVPFSSVDLQLLLSEWDGNEFPSSILHTQNIKNFAFPISDYLVDLPENFCNYIWLMRQQNREQDPFNTLDKVLSSPAFLTVKDLVFYGIPMLSEIPDRISSLSSLEGLRLIDMAIKSLPETIKYLPRLKRVNIYNCNLLQSIPALHRFIPSLSVWDCESLEKVLSSTVEPYGKPIPGFTVLLNCYKLDPHSYQTVLKDAIDGIELGAREYSENEDANSENENGHNDIDWNLLPAMPGMVNCFDFSSTQVSATLELPSNLLGFAYYMVLSQGLMGFDVGFGCECYLDNSSGESICITSFIKDTFYKYPWNDPSIYMISDHLLLWYDPRIL*