AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880042854.01

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MsG0880042854.01.T01 AT1G26150 51.456 206 98 1 423 628 432 635 9.75e-62 219
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MsG0880042854.01.T01 AT2G42960 45.813 203 110 0 426 628 188 390 2.11e-61 213
MsG0880042854.01.T01 AT2G42960 45.813 203 110 0 426 628 188 390 2.11e-61 213
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MsG0880042854.01.T01 AT5G65700 30.015 663 319 19 73 623 268 897 6.20e-57 208
MsG0880042854.01.T01 AT5G65700 27.606 518 201 15 45 407 46 544 2.14e-25 112
MsG0880042854.01.T01 AT4G02630 43.961 207 115 1 422 627 163 369 7.66e-57 200
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MsG0880042854.01.T01 AT2G20300 49.020 204 99 1 425 628 353 551 2.28e-56 204
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MsG0880042854.01.T01 AT1G74360 27.500 480 253 17 26 425 41 505 8.16e-24 107
MsG0880042854.01.T01 AT1G71830 44.000 225 119 2 410 627 285 509 1.22e-55 200
MsG0880042854.01.T01 AT4G33430 44.444 225 118 2 410 627 319 543 1.26e-55 201
MsG0880042854.01.T01 AT2G13800 31.881 436 277 6 201 627 58 482 1.28e-55 199
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MsG0880042854.01.T01 AT2G24130 28.692 237 135 8 70 302 347 553 1.41e-11 68.6
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MsG0880042854.01.T01 AT5G65240 31.951 410 258 6 223 627 98 491 2.10e-50 186
MsG0880042854.01.T01 AT1G09970 30.860 593 308 18 67 625 361 885 2.56e-50 189
MsG0880042854.01.T01 AT1G09970 30.484 351 194 11 89 407 191 523 2.16e-24 109
MsG0880042854.01.T01 AT1G09970 26.577 444 230 15 10 409 14 405 3.03e-20 96.3
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MsG0880042854.01.T01 AT5G18610 47.549 204 105 2 426 627 88 291 1.24e-48 178
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MsG0880042854.01.T01 AT1G55200 44.495 218 112 3 413 629 377 586 5.66e-47 176
MsG0880042854.01.T01 AT4G29180 42.489 233 114 5 406 621 550 779 6.69e-47 178
MsG0880042854.01.T01 AT4G29180 42.489 233 114 5 406 621 548 777 7.03e-47 178
MsG0880042854.01.T01 AT3G21340 32.477 428 250 8 208 629 406 800 8.66e-47 177
MsG0880042854.01.T01 AT1G66150 42.584 209 117 2 426 631 593 801 9.07e-47 178
MsG0880042854.01.T01 AT1G49100 46.341 205 108 2 426 629 586 789 1.28e-46 177
MsG0880042854.01.T01 AT5G11020 44.196 224 119 3 418 638 77 297 1.43e-46 169
MsG0880042854.01.T01 AT5G13160 45.813 203 108 2 428 628 93 295 1.51e-46 171
MsG0880042854.01.T01 AT4G23180 44.615 195 106 2 428 621 355 548 1.66e-46 174
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MsG0880042854.01.T01 AT3G13690 39.519 291 130 10 367 629 346 618 1.80e-46 176
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MsG0880042854.01.T01 AT1G17230 26.421 299 188 7 128 407 39 324 5.10e-12 69.7
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MsG0880042854.01.T01 AT3G09830 43.636 220 107 7 423 629 86 301 2.50e-45 167
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MsG0880042854.01.T01 AT2G33170 30.618 356 201 10 92 428 396 724 6.68e-24 107
MsG0880042854.01.T01 AT2G33170 28.758 459 258 18 2 428 14 435 1.28e-21 100
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MsG0880042854.01.T01 AT1G61430 40.000 235 135 3 392 621 456 689 5.28e-45 171
MsG0880042854.01.T01 AT1G06840 45.413 218 106 4 414 623 619 831 5.31e-45 172
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MsG0880042854.01.T01 AT1G06700 42.466 219 119 4 422 633 69 287 1.81e-44 163
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MsG0880042854.01.T01 AT5G37450 45.070 213 109 3 416 623 603 812 6.67e-44 169
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MsG0880042854.01.T01 AT1G61430 39.916 238 134 4 392 621 456 692 1.04e-43 167
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MsG0880042854.01.T01 AT1G26970 41.921 229 111 7 426 638 88 310 1.23e-43 162
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MsG0880042854.01.T01 AT3G53590 45.146 206 105 2 423 622 623 826 1.24e-43 168
MsG0880042854.01.T01 AT3G53590 27.489 462 212 21 1 412 11 399 6.97e-13 72.4
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MsG0880042854.01.T01 AT4G23190 42.564 195 110 2 428 621 279 472 1.64e-43 165
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MsG0880042854.01.T01 AT3G46370 44.811 212 115 2 428 638 494 704 1.67e-43 167
MsG0880042854.01.T01 AT1G56145 42.487 193 109 1 428 620 694 884 1.68e-43 168
MsG0880042854.01.T01 AT1G56145 27.376 263 149 6 158 408 120 352 7.94e-12 69.3
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MsG0880042854.01.T01 AT5G02290 37.449 243 134 4 403 628 44 285 2.54e-43 160
MsG0880042854.01.T01 AT1G11050 42.661 218 114 3 413 625 293 504 2.56e-43 165
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MsG0880042854.01.T01 AT5G01950 46.569 204 97 4 424 619 629 828 2.89e-43 167
MsG0880042854.01.T01 AT5G01950 46.569 204 97 4 424 619 629 828 2.89e-43 167
MsG0880042854.01.T01 AT5G01950 46.569 204 97 4 424 619 629 828 2.89e-43 167
MsG0880042854.01.T01 AT2G28960 43.256 215 120 2 425 638 445 658 2.95e-43 166
MsG0880042854.01.T01 AT1G69990 41.885 191 106 1 433 623 307 492 2.98e-43 164
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MsG0880042854.01.T01 AT5G58940 41.121 214 112 5 427 632 153 360 3.23e-43 162
MsG0880042854.01.T01 AT5G58940 41.121 214 112 5 427 632 153 360 3.23e-43 162
MsG0880042854.01.T01 AT5G58940 41.121 214 112 5 427 632 153 360 3.23e-43 162
MsG0880042854.01.T01 AT4G23190 42.564 195 110 2 428 621 357 550 3.27e-43 165
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MsG0880042854.01.T01 AT3G59350 41.553 219 121 4 422 633 129 347 4.59e-43 160
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MsG0880042854.01.T01 AT4G11480 43.842 203 111 3 420 621 324 524 4.91e-43 164
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MsG0880042854.01.T01 AT1G11410 45.408 196 103 3 428 621 415 608 5.48e-43 165
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MsG0880042854.01.T01 AT2G37710 43.284 201 109 3 426 624 352 549 6.80e-43 164
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MsG0880042854.01.T01 AT3G59350 41.553 219 121 4 422 633 114 332 7.78e-43 159
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MsG0880042854.01.T01 AT4G23260 43.590 195 108 2 428 621 346 539 1.87e-42 163

Find 140 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 252 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
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CAATTCTGCTATAAGATTCT+TGG 0.212062 8:-14910613 MsG0880042854.01.T01:CDS
CTAGCCATCAAGAAACTTTC+AGG 0.216037 8:-14908802 MsG0880042854.01.T01:CDS
TTCAGGAGATTTAGGCCTTA+TGG 0.219644 8:-14908785 MsG0880042854.01.T01:CDS
AAGAAACTTTCAGGAGATTT+AGG 0.227898 8:-14908793 MsG0880042854.01.T01:CDS
TGGAAATACTAGTGTTATTC+AGG 0.261494 8:-14910790 MsG0880042854.01.T01:CDS
GAGGCACGTGTTGCTGATTT+CGG 0.267646 8:-14908460 MsG0880042854.01.T01:CDS
TATAAAGCATCATTTCAAAA+TGG 0.285659 8:-14908832 MsG0880042854.01.T01:CDS
GGTTACATTCCTCCGGAGTA+TGG 0.291730 8:-14908376 MsG0880042854.01.T01:CDS
GGTAATATTGAGAAAGGTTT+AGG 0.293376 8:-14910567 MsG0880042854.01.T01:CDS
TACTAGTGTTATTCAGGAAT+TGG 0.296462 8:-14910784 MsG0880042854.01.T01:CDS
TTCTAAGCTTGAGAGATTTA+GGG 0.308457 8:-14910538 MsG0880042854.01.T01:CDS
ATAATAGGATGTGGCGGTTT+CGG 0.328184 8:-14908862 MsG0880042854.01.T01:intron
ATCTCCTGAAAGTTTCTTGA+TGG 0.336359 8:+14908798 None:intergenic
AGGCACGTGTTGCTGATTTC+GGG 0.351849 8:-14908459 MsG0880042854.01.T01:CDS
ACGGAACTTGTAGGTACATT+AGG 0.354985 8:-14908397 MsG0880042854.01.T01:CDS
ACTGGAACTGGAACTGGAAA+TGG 0.361912 8:-14910810 MsG0880042854.01.T01:CDS
ACTGGAACTGGAACTGGAAC+TGG 0.365048 8:-14910816 MsG0880042854.01.T01:CDS
CTCACCTACCACCTCTTAAC+TGG 0.373565 8:-14911121 MsG0880042854.01.T01:CDS
GCATGGGTGGCTACTCTTAG+AGG 0.375627 8:-14908349 MsG0880042854.01.T01:CDS
TTGTCTAGTAATTCATTCAA+TGG 0.382241 8:-14910759 MsG0880042854.01.T01:CDS
AGATACTGAATCAGAGAAAC+TGG 0.382510 8:+14910729 None:intergenic
ATCACAAATCATATGCAAAT+AGG 0.387506 8:+14908540 None:intergenic
CCTAGCAATGGAACTGGAAC+TGG 0.390412 8:-14910828 MsG0880042854.01.T01:CDS
AGAGACATGGACAATGAATA+AGG 0.393387 8:+14911211 None:intergenic
CTTCCATTGATTGTTGCAGT+TGG 0.395918 8:-14911094 MsG0880042854.01.T01:CDS
TTCAGTTGGCCAATCTCAAT+CGG 0.396402 8:+14909490 None:intergenic
CTTTAAATTCCCTTTCCATA+AGG 0.398446 8:+14908770 None:intergenic
CTGTCTGTTAACCTACTTAC+TGG 0.401820 8:-14909703 MsG0880042854.01.T01:CDS
TTGAGTTATAATCACTTCTC+TGG 0.408981 8:-14910873 MsG0880042854.01.T01:CDS
TTCCATTGATTGTTGCAGTT+GGG 0.411876 8:-14911093 MsG0880042854.01.T01:CDS
GTTAAACCTAGCAATGGAAC+TGG 0.416884 8:-14910834 MsG0880042854.01.T01:CDS
ACAAGGAGCAGGTTGTGGTT+TGG 0.417166 8:-14908563 MsG0880042854.01.T01:CDS
GATCCATTAATCTTATTAAG+TGG 0.418789 8:+14910441 None:intergenic
AATATTACCACTAAAATCAT+TGG 0.419196 8:+14910581 None:intergenic
TTGCTAGGTTTAACAAAAGA+TGG 0.419602 8:+14910843 None:intergenic
AGCCTAAAATTTCAAGGAGT+TGG 0.421162 8:-14908258 MsG0880042854.01.T01:CDS
TACCCGATCAAATTTCAAAC+TGG 0.424775 8:-14909420 MsG0880042854.01.T01:intron
AATGGAACTGGAACTGGAAC+TGG 0.436747 8:-14910822 MsG0880042854.01.T01:CDS
CCAGTTCCAGTTCCATTGCT+AGG 0.437412 8:+14910828 None:intergenic
AGAGGAGATGTGTACAGCTT+TGG 0.441971 8:-14908331 MsG0880042854.01.T01:CDS
TTTAGTGGTAATATTGAGAA+AGG 0.442332 8:-14910573 MsG0880042854.01.T01:CDS
TATGCAAGCCTAAAATTTCA+AGG 0.442540 8:-14908264 MsG0880042854.01.T01:CDS
TTCCCAACTGCAACAATCAA+TGG 0.445356 8:+14911091 None:intergenic
TTTCAAGGAGTTGGTCAGTT+GGG 0.446603 8:-14908249 MsG0880042854.01.T01:CDS
TAAGATGAGAAAGAGATTCA+AGG 0.453231 8:+14910973 None:intergenic
AACCGCACAACATGAGAATC+TGG 0.454836 8:-14908728 MsG0880042854.01.T01:CDS
TTGCAACAAAGAAACATTGT+TGG 0.456357 8:+14909579 None:intergenic
ACAGCATCATAAATATCAAT+TGG 0.456665 8:+14910486 None:intergenic
AAACCAGTGAGTCCTCTAGA+AGG 0.457741 8:+14911020 None:intergenic
CATGTTACAACGGAACTTGT+AGG 0.458618 8:-14908406 MsG0880042854.01.T01:CDS
AACCAGTTTGAAATTTGATC+GGG 0.459669 8:+14909418 None:intergenic
GGCAGCATCCCGATTGAGAT+TGG 0.461281 8:-14909499 MsG0880042854.01.T01:CDS
AGATTTAGGCCTTATGGAAA+GGG 0.462229 8:-14908779 MsG0880042854.01.T01:CDS
AGGATGTGGCGGTTTCGGTT+TGG 0.466062 8:-14908857 MsG0880042854.01.T01:CDS
AGAGAGAATCTTTGTCAAGT+TGG 0.467816 8:+14911177 None:intergenic
TACATTAGGTTACATTCCTC+CGG 0.468594 8:-14908383 MsG0880042854.01.T01:CDS
GCTGGTTTCAATGTTCTAGC+AGG 0.472352 8:-14910516 MsG0880042854.01.T01:CDS
CTCCGGAGTATGGGCAAGCA+TGG 0.478712 8:-14908366 MsG0880042854.01.T01:CDS
ACTGCGTGCACGACGGTTAT+CGG 0.480393 8:-14908690 MsG0880042854.01.T01:CDS
ATCGCACAAGGAGCAGGTTG+TGG 0.486571 8:-14908568 MsG0880042854.01.T01:CDS
TTAGGCTTGCATACATCCAT+AGG 0.486689 8:+14908274 None:intergenic
GTAGCACACAATAATCTTCA+AGG 0.487257 8:-14909306 MsG0880042854.01.T01:CDS
TAACCAGTTTGAAATTTGAT+CGG 0.488634 8:+14909417 None:intergenic
TTGAAGATCGCACAAGGAGC+AGG 0.492304 8:-14908574 MsG0880042854.01.T01:CDS
TTGCGAGTTTCCTTCAAAGC+TGG 0.495180 8:+14909242 None:intergenic
CTTCAAGGACAGATACCAAC+TGG 0.495485 8:-14909291 MsG0880042854.01.T01:CDS
GCTTGTTGCGATGCTAGTGC+AGG 0.498706 8:+14909652 None:intergenic
AAGATGAGAAAGAGATTCAA+GGG 0.500615 8:+14910974 None:intergenic
GTTTCCTTCAAAGCTGGTGT+TGG 0.504719 8:+14909248 None:intergenic
AGTGATTATAACTCAAATCA+AGG 0.505562 8:+14910880 None:intergenic
GATGCTGCCACTGAGGTGAT+TGG 0.505694 8:+14909513 None:intergenic
ACTGAAAGCTCTTCTTCAGC+TGG 0.508111 8:-14909473 MsG0880042854.01.T01:CDS
ACTCCTCAATGATAAGTTTG+AGG 0.511260 8:-14908479 MsG0880042854.01.T01:CDS
ATTAATGGATCAATTGATGA+TGG 0.511421 8:-14910429 MsG0880042854.01.T01:CDS
TTGGTTCCGAGATAAATTGC+TGG 0.512989 8:+14909532 None:intergenic
AGAATGGAAGTCTCGACTAC+TGG 0.513046 8:-14908645 MsG0880042854.01.T01:CDS
ACCCATGCTTGCCCATACTC+CGG 0.516129 8:+14908364 None:intergenic
ATATATAATTACATGGAGAA+TGG 0.518735 8:-14908661 MsG0880042854.01.T01:CDS
TAAAGTAGAAAGGACTTACT+TGG 0.519591 8:-14909623 MsG0880042854.01.T01:CDS
GTAAGTAACAACAGTTTCAC+AGG 0.519832 8:-14910675 MsG0880042854.01.T01:CDS
CGAGATAAATTGCTGGTGGA+AGG 0.520357 8:+14909539 None:intergenic
ACAGGTCTATGTAGAAAAGC+TGG 0.522279 8:+14909722 None:intergenic
GTTACATTCCTCCGGAGTAT+GGG 0.525920 8:-14908375 MsG0880042854.01.T01:CDS
ATGGAAGAAGACCAGTTAAG+AGG 0.526632 8:+14911110 None:intergenic
GAGATTTAGGCCTTATGGAA+AGG 0.528333 8:-14908780 MsG0880042854.01.T01:CDS
TTACCTTCTAGAGGACTCAC+TGG 0.529791 8:-14911023 MsG0880042854.01.T01:CDS
AAGGGAATTTAAAGCAGAAG+TGG 0.536112 8:-14908761 MsG0880042854.01.T01:CDS
ATGGTGCATCTCAACTCGAT+TGG 0.539980 8:-14908606 MsG0880042854.01.T01:CDS
TCAGTTGGCCAATCTCAATC+GGG 0.543360 8:+14909491 None:intergenic
ATTGATTGTTGCAGTTGGGA+AGG 0.544109 8:-14911089 MsG0880042854.01.T01:CDS
GTAATGCTTGAGCTTCTCAC+TGG 0.546194 8:-14908304 MsG0880042854.01.T01:CDS
CTGGTTTCAATGTTCTAGCA+GGG 0.546824 8:-14910515 MsG0880042854.01.T01:CDS
CTTCCACCAGCAATTTATCT+CGG 0.548050 8:-14909538 MsG0880042854.01.T01:CDS
AAGCAAATGATAAAGTAGAA+AGG 0.551793 8:-14909633 MsG0880042854.01.T01:CDS
TCTCACTGGAAGGAGACCTA+TGG 0.556333 8:-14908290 MsG0880042854.01.T01:CDS
TTGTTGGCATTAGCAAAGAC+AGG 0.557525 8:+14909595 None:intergenic
ATTTCAAGGAGTTGGTCAGT+TGG 0.557891 8:-14908250 MsG0880042854.01.T01:CDS
CTGATTCAGTATCTTGCACA+AGG 0.560364 8:-14910720 MsG0880042854.01.T01:CDS
ATATCGCGGTGCACGATGTG+CGG 0.570057 8:+14908517 None:intergenic
GCTGAAGAAGAGCTTTCAGT+TGG 0.572336 8:+14909476 None:intergenic
CAGTTAAGAGGTGGTAGGTG+AGG 0.574262 8:+14911122 None:intergenic
TTCAGTATCTTGCACAAGGA+GGG 0.574906 8:-14910716 MsG0880042854.01.T01:CDS
CAGTAAGTAGGTTAACAGAC+AGG 0.575844 8:+14909704 None:intergenic
TCCGGAGTATGGGCAAGCAT+GGG 0.578048 8:-14908365 MsG0880042854.01.T01:CDS
GGAGTATGGGCAAGCATGGG+TGG 0.581507 8:-14908362 MsG0880042854.01.T01:CDS
CAATCGGGATGCTGCCACTG+AGG 0.585397 8:+14909506 None:intergenic
AAGCTTGAGAGATTTAGGGC+TGG 0.589879 8:-14910534 MsG0880042854.01.T01:CDS
TGCTTGAGCTTCTCACTGGA+AGG 0.594075 8:-14908300 MsG0880042854.01.T01:CDS
GTTGTAACATGAGTCTGATA+CGG 0.596403 8:+14908418 None:intergenic
CTTGTTGCGATGCTAGTGCA+GGG 0.601083 8:+14909653 None:intergenic
GTTCCGAGATAAATTGCTGG+TGG 0.605807 8:+14909535 None:intergenic
GAGAATCTGGTATCATTGCA+AGG 0.608623 8:-14908715 MsG0880042854.01.T01:CDS
GCTACTCATATATAATTACA+TGG 0.609847 8:-14908668 MsG0880042854.01.T01:CDS
GGAATTTAAAGCAGAAGTGG+AGG 0.612385 8:-14908758 MsG0880042854.01.T01:CDS
GAAGGAAACTCGCAATTGTG+CGG 0.617015 8:-14909234 MsG0880042854.01.T01:intron
TCGGAAACAGACCAGTAAGT+AGG 0.620473 8:+14909692 None:intergenic
GAAGAAGACCAGTTAAGAGG+TGG 0.624675 8:+14911113 None:intergenic
TGGTTTCAATGTTCTAGCAG+GGG 0.624713 8:-14910514 MsG0880042854.01.T01:CDS
GTAAGAAAAGATGTGTAACA+TGG 0.641209 8:+14911042 None:intergenic
GTATTAAACTGACCACCAGT+TGG 0.645966 8:+14909276 None:intergenic
AAGACCAGTTAAGAGGTGGT+AGG 0.647632 8:+14911117 None:intergenic
GTGCCTCAAACTTATCATTG+AGG 0.655515 8:+14908476 None:intergenic
ATTCAGTATCTTGCACAAGG+AGG 0.658392 8:-14910717 MsG0880042854.01.T01:CDS
TGTGCGATCTTCAAACGAGT+CGG 0.660684 8:+14908583 None:intergenic
ACTCGTTTGAAGATCGCACA+AGG 0.661206 8:-14908580 MsG0880042854.01.T01:CDS
TGGCTGCATGAAAAGTCTGA+TGG 0.664800 8:-14908625 MsG0880042854.01.T01:CDS
GGTCTATGTAGAAAAGCTGG+AGG 0.671778 8:+14909725 None:intergenic
GCGAATATAATAGGATGTGG+CGG 0.675790 8:-14908868 MsG0880042854.01.T01:intron
TTGCTGATTTCGGGTTGTCG+CGG 0.685113 8:-14908450 MsG0880042854.01.T01:CDS
CATGCTTGCCCATACTCCGG+AGG 0.687729 8:+14908367 None:intergenic
TATTGCTTGACTTTATATCG+CGG 0.688579 8:+14908503 None:intergenic
TACCAGATTCTCATGTTGTG+CGG 0.690452 8:+14908726 None:intergenic
GGTTACAAGAAGAAGAGACA+TGG 0.694404 8:+14911198 None:intergenic
CAAGGCTACTGCGTGCACGA+CGG 0.696151 8:-14908697 MsG0880042854.01.T01:CDS
CTCGGAACCAATCACCTCAG+TGG 0.697437 8:-14909520 MsG0880042854.01.T01:CDS
GTATCAGACTCATGTTACAA+CGG 0.718805 8:-14908416 MsG0880042854.01.T01:CDS
CAAGGACAGATACCAACTGG+TGG 0.727958 8:-14909288 MsG0880042854.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AATATTACCACTAAAATCAT+TGG + Chr8:14908904-14908923 None:intergenic 20.0%
!! AATGAATAAGGTTAGAAAAA+AGG + Chr8:14908262-14908281 None:intergenic 20.0%
!! ATATATAATTACATGGAGAA+TGG - Chr8:14910821-14910840 MsG0880042854.01.T01:CDS 20.0%
!! CATTTCATTGTAAAAATTCT+TGG + Chr8:14909555-14909574 None:intergenic 20.0%
!! TTAACACAAAAGATTGAAAT+TGG + Chr8:14908840-14908859 None:intergenic 20.0%
!!! ATTACTATTAGTTTTTTGCT+GGG + Chr8:14910338-14910357 None:intergenic 20.0%
!!! CTTTCACATAATAGATTTTA+TGG - Chr8:14908534-14908553 MsG0880042854.01.T01:CDS 20.0%
!!! TATAAAGCATCATTTCAAAA+TGG - Chr8:14910650-14910669 MsG0880042854.01.T01:CDS 20.0%
!!! TATTACTATTAGTTTTTTGC+TGG + Chr8:14910339-14910358 None:intergenic 20.0%
! AAGCAAATGATAAAGTAGAA+AGG - Chr8:14909849-14909868 MsG0880042854.01.T01:intron 25.0%
! AAGTGACTTACAATCATAAA+GGG + Chr8:14909369-14909388 None:intergenic 25.0%
! ACAGCATCATAAATATCAAT+TGG + Chr8:14908999-14909018 None:intergenic 25.0%
! AGTGATTATAACTCAAATCA+AGG + Chr8:14908605-14908624 None:intergenic 25.0%
! ATCACAAATCATATGCAAAT+AGG + Chr8:14910945-14910964 None:intergenic 25.0%
! CAAACAAAATAATGAAACCA+AGG - Chr8:14910544-14910563 MsG0880042854.01.T01:CDS 25.0%
! GATCCATTAATCTTATTAAG+TGG + Chr8:14909044-14909063 None:intergenic 25.0%
! GCTACTCATATATAATTACA+TGG - Chr8:14910814-14910833 MsG0880042854.01.T01:CDS 25.0%
! TGAAAATTTAAAGAAGCTTG+AGG - Chr8:14909675-14909694 MsG0880042854.01.T01:CDS 25.0%
! TGAACCACTGAATTTATTAT+AGG + Chr8:14909713-14909732 None:intergenic 25.0%
! TTGTCTAGTAATTCATTCAA+TGG - Chr8:14908723-14908742 MsG0880042854.01.T01:CDS 25.0%
! TTGTTACAATTCATCAAAGA+TGG + Chr8:14909217-14909236 None:intergenic 25.0%
! TTTAGTGGTAATATTGAGAA+AGG - Chr8:14908909-14908928 MsG0880042854.01.T01:intron 25.0%
!! ATTAATGGATCAATTGATGA+TGG - Chr8:14909053-14909072 MsG0880042854.01.T01:intron 25.0%
!! TAACCAGTTTGAAATTTGAT+CGG + Chr8:14910068-14910087 None:intergenic 25.0%
!! TATTCTTCCAATGATTTTAG+TGG - Chr8:14908894-14908913 MsG0880042854.01.T01:intron 25.0%
!! TATTTTGTTGAGAAGAACAA+GGG + Chr8:14910289-14910308 None:intergenic 25.0%
!! TCCAAAATATCCAAGTTTTA+GGG - Chr8:14909611-14909630 MsG0880042854.01.T01:CDS 25.0%
!! TTCCAAAATATCCAAGTTTT+AGG - Chr8:14909610-14909629 MsG0880042854.01.T01:CDS 25.0%
!! TTGCCACTTAATAAGATTAA+TGG - Chr8:14909038-14909057 MsG0880042854.01.T01:intron 25.0%
!!! AAAGGTTGTTTTTTTGAAAG+AGG + Chr8:14908244-14908263 None:intergenic 25.0%
!!! CTTGGTTTCATTATTTTGTT+TGG + Chr8:14910546-14910565 None:intergenic 25.0%
!!! TTTAAATTTTCAAGCCAACT+TGG + Chr8:14909667-14909686 None:intergenic 25.0%
AAGAAACTTTCAGGAGATTT+AGG - Chr8:14910689-14910708 MsG0880042854.01.T01:CDS 30.0%
AAGATGAGAAAGAGATTCAA+GGG + Chr8:14908511-14908530 None:intergenic 30.0%
AAGTGTCAATAAGGTTATCA+GGG + Chr8:14910393-14910412 None:intergenic 30.0%
AGATTCTGATAAGATTGAAC+TGG - Chr8:14910446-14910465 MsG0880042854.01.T01:CDS 30.0%
CAAGTGACTTACAATCATAA+AGG + Chr8:14909370-14909389 None:intergenic 30.0%
CAATTCTGCTATAAGATTCT+TGG - Chr8:14908869-14908888 MsG0880042854.01.T01:intron 30.0%
CACTGAATTTATTATAGGAC+AGG + Chr8:14909708-14909727 None:intergenic 30.0%
CTGTCCTATAATAAATTCAG+TGG - Chr8:14909706-14909725 MsG0880042854.01.T01:CDS 30.0%
CTTATTATTGCTGTCTCTTT+CGG - Chr8:14910359-14910378 MsG0880042854.01.T01:intron 30.0%
CTTCATGTCAATAATTTGAC+TGG - Chr8:14909181-14909200 MsG0880042854.01.T01:intron 30.0%
CTTTAAATTCCCTTTCCATA+AGG + Chr8:14910715-14910734 None:intergenic 30.0%
GGTAATATTGAGAAAGGTTT+AGG - Chr8:14908915-14908934 MsG0880042854.01.T01:intron 30.0%
GTAAGAAAAGATGTGTAACA+TGG + Chr8:14908443-14908462 None:intergenic 30.0%
TAAAGTAGAAAGGACTTACT+TGG - Chr8:14909859-14909878 MsG0880042854.01.T01:intron 30.0%
TAAGATGAGAAAGAGATTCA+AGG + Chr8:14908512-14908531 None:intergenic 30.0%
TACAATGAAATGATACCGAA+CGG - Chr8:14909563-14909582 MsG0880042854.01.T01:CDS 30.0%
TATGCAAGCCTAAAATTTCA+AGG - Chr8:14911218-14911237 MsG0880042854.01.T01:CDS 30.0%
TATTGCTTGACTTTATATCG+CGG + Chr8:14910982-14911001 None:intergenic 30.0%
TGATAACCTTATTGACACTT+TGG - Chr8:14910393-14910412 MsG0880042854.01.T01:intron 30.0%
TTACAATTCATCAAAGATGG+TGG + Chr8:14909214-14909233 None:intergenic 30.0%
TTCAGTCAAGCGAATATAAT+AGG - Chr8:14910605-14910624 MsG0880042854.01.T01:CDS 30.0%
TTCTAAGCTTGAGAGATTTA+GGG - Chr8:14908944-14908963 MsG0880042854.01.T01:intron 30.0%
TTGAGTTATAATCACTTCTC+TGG - Chr8:14908609-14908628 MsG0880042854.01.T01:CDS 30.0%
TTGCAACAAAGAAACATTGT+TGG + Chr8:14909906-14909925 None:intergenic 30.0%
TTGCTAGGTTTAACAAAAGA+TGG + Chr8:14908642-14908661 None:intergenic 30.0%
! AAAAATTCTTGGAGAGCATA+AGG + Chr8:14909544-14909563 None:intergenic 30.0%
! AAAATTCTTGGAGAGCATAA+GGG + Chr8:14909543-14909562 None:intergenic 30.0%
! AAAGTGTCAATAAGGTTATC+AGG + Chr8:14910394-14910413 None:intergenic 30.0%
! AACCAGTTTGAAATTTGATC+GGG + Chr8:14910067-14910086 None:intergenic 30.0%
! AAGAAGTAACTTTTCCAACT+TGG + Chr8:14909164-14909183 None:intergenic 30.0%
! ACCCTAAAACTTGGATATTT+TGG + Chr8:14909615-14909634 None:intergenic 30.0%
! GTATTTTGTTGAGAAGAACA+AGG + Chr8:14910290-14910309 None:intergenic 30.0%
! TACTAGTGTTATTCAGGAAT+TGG - Chr8:14908698-14908717 MsG0880042854.01.T01:CDS 30.0%
! TCTTTTGTTAAACCTAGCAA+TGG - Chr8:14908642-14908661 MsG0880042854.01.T01:CDS 30.0%
! TGGAAATACTAGTGTTATTC+AGG - Chr8:14908692-14908711 MsG0880042854.01.T01:CDS 30.0%
!!! AATATCCAAGTTTTAGGGTT+AGG - Chr8:14909616-14909635 MsG0880042854.01.T01:CDS 30.0%
AATCTTATCAGAATCTCCTC+TGG + Chr8:14910442-14910461 None:intergenic 35.0%
ACTCCTCAATGATAAGTTTG+AGG - Chr8:14911003-14911022 MsG0880042854.01.T01:CDS 35.0%
AGAGACATGGACAATGAATA+AGG + Chr8:14908274-14908293 None:intergenic 35.0%
AGAGAGAATCTTTGTCAAGT+TGG + Chr8:14908308-14908327 None:intergenic 35.0%
AGATACTGAATCAGAGAAAC+TGG + Chr8:14908756-14908775 None:intergenic 35.0%
AGCCTAAAATTTCAAGGAGT+TGG - Chr8:14911224-14911243 MsG0880042854.01.T01:CDS 35.0%
ATCTCCTGAAAGTTTCTTGA+TGG + Chr8:14910687-14910706 None:intergenic 35.0%
ATCTTATCAGAATCTCCTCT+GGG + Chr8:14910441-14910460 None:intergenic 35.0%
ATTGATAGGTCCTATTCCTA+GGG - Chr8:14909123-14909142 MsG0880042854.01.T01:intron 35.0%
ATTGTGTGCTACACTGAAAA+AGG + Chr8:14910168-14910187 None:intergenic 35.0%
CAAGCGAATATAATAGGATG+TGG - Chr8:14910611-14910630 MsG0880042854.01.T01:CDS 35.0%
CTCTAATATCGAAAGATCCT+TGG + Chr8:14910564-14910583 None:intergenic 35.0%
CTGAAGAAAAACAACTTCTC+TGG - Chr8:14910034-14910053 MsG0880042854.01.T01:intron 35.0%
CTTGCAACTAATCAACTTGA+GGG - Chr8:14909401-14909420 MsG0880042854.01.T01:intron 35.0%
GAACTTGAGGGTGAATAAAT+TGG - Chr8:14909249-14909268 MsG0880042854.01.T01:CDS 35.0%
GAATAGGACCTATCAATGAT+TGG + Chr8:14909120-14909139 None:intergenic 35.0%
GACTTACAATCATAAAGGGT+CGG + Chr8:14909365-14909384 None:intergenic 35.0%
GCTCTATTCCAATCATTGAT+AGG - Chr8:14909109-14909128 MsG0880042854.01.T01:intron 35.0%
GTAAGTAACAACAGTTTCAC+AGG - Chr8:14908807-14908826 MsG0880042854.01.T01:CDS 35.0%
GTAGCACACAATAATCTTCA+AGG - Chr8:14910176-14910195 MsG0880042854.01.T01:intron 35.0%
GTATCAGACTCATGTTACAA+CGG - Chr8:14911066-14911085 MsG0880042854.01.T01:CDS 35.0%
GTTGTAACATGAGTCTGATA+CGG + Chr8:14911067-14911086 None:intergenic 35.0%
TACATTAGGTTACATTCCTC+CGG - Chr8:14911099-14911118 MsG0880042854.01.T01:CDS 35.0%
TACCCGATCAAATTTCAAAC+TGG - Chr8:14910062-14910081 MsG0880042854.01.T01:intron 35.0%
TATTGGTAGACTTTCCAAGT+TGG - Chr8:14909147-14909166 MsG0880042854.01.T01:intron 35.0%
TCTTTCAGCGTTCAATTTCT+CGG - Chr8:14909279-14909298 MsG0880042854.01.T01:CDS 35.0%
TGTAATCTAGTGAGTGAAAC+AGG + Chr8:14910138-14910157 None:intergenic 35.0%
TGTTTGGAAACAATACCACT+AGG + Chr8:14910530-14910549 None:intergenic 35.0%
TTAGGTGGTTGTAATTTCAC+AGG - Chr8:14909634-14909653 MsG0880042854.01.T01:CDS 35.0%
TTGAGGGTGAATAAATTGGA+AGG - Chr8:14909253-14909272 MsG0880042854.01.T01:CDS 35.0%
TTTGGATACTCTCAAGAGAA+GGG - Chr8:14910411-14910430 MsG0880042854.01.T01:intron 35.0%
! AAGGGAATTTAAAGCAGAAG+TGG - Chr8:14910721-14910740 MsG0880042854.01.T01:CDS 35.0%
! AGATTTAGGCCTTATGGAAA+GGG - Chr8:14910703-14910722 MsG0880042854.01.T01:CDS 35.0%
! ATCTTGTTGTGTTGAACTTG+AGG - Chr8:14909236-14909255 MsG0880042854.01.T01:CDS 35.0%
! CATCTTTTCTTACCTTCTAG+AGG - Chr8:14908450-14908469 MsG0880042854.01.T01:CDS 35.0%
! GACCAACTCCTTGAAATTTT+AGG + Chr8:14911229-14911248 None:intergenic 35.0%
! GAGTATCCAAAGTGTCAATA+AGG + Chr8:14910402-14910421 None:intergenic 35.0%
! GTTCTAAGCTTGAGAGATTT+AGG - Chr8:14908943-14908962 MsG0880042854.01.T01:intron 35.0%
! TAACAAGTTGAGAATATCGC+TGG - Chr8:14909481-14909500 MsG0880042854.01.T01:CDS 35.0%
! TCTTGTTGTGTTGAACTTGA+GGG - Chr8:14909237-14909256 MsG0880042854.01.T01:CDS 35.0%
! TTCCATTGATTGTTGCAGTT+GGG - Chr8:14908389-14908408 MsG0880042854.01.T01:CDS 35.0%
!!! CAGAGAAGTTGTTTTTCTTC+AGG + Chr8:14910036-14910055 None:intergenic 35.0%
!!! GGATATTTTGGAATCCATCA+GGG + Chr8:14909603-14909622 None:intergenic 35.0%
!!! TGGATATTTTGGAATCCATC+AGG + Chr8:14909604-14909623 None:intergenic 35.0%
AAACAGGAATTTCACCGGAT+AGG + Chr8:14910122-14910141 None:intergenic 40.0%
AACCACCTAACCCTAAAACT+TGG + Chr8:14909624-14909643 None:intergenic 40.0%
AACTAATCAACTTGAGGGAC+AGG - Chr8:14909406-14909425 MsG0880042854.01.T01:intron 40.0%
ACAGGTCTATGTAGAAAAGC+TGG + Chr8:14909763-14909782 None:intergenic 40.0%
ACGGAACTTGTAGGTACATT+AGG - Chr8:14911085-14911104 MsG0880042854.01.T01:CDS 40.0%
ATAATAGGATGTGGCGGTTT+CGG - Chr8:14910620-14910639 MsG0880042854.01.T01:CDS 40.0%
ATGGAAGAAGACCAGTTAAG+AGG + Chr8:14908375-14908394 None:intergenic 40.0%
ATTCAGTATCTTGCACAAGG+AGG - Chr8:14908765-14908784 MsG0880042854.01.T01:CDS 40.0%
ATTGATTGTTGCAGTTGGGA+AGG - Chr8:14908393-14908412 MsG0880042854.01.T01:CDS 40.0%
ATTTCCCCATACTCAAACAG+TGG - Chr8:14910474-14910493 MsG0880042854.01.T01:CDS 40.0%
CAGTAAGTAGGTTAACAGAC+AGG + Chr8:14909781-14909800 None:intergenic 40.0%
CATGTTACAACGGAACTTGT+AGG - Chr8:14911076-14911095 MsG0880042854.01.T01:CDS 40.0%
CATTGATAGGTCCTATTCCT+AGG - Chr8:14909122-14909141 MsG0880042854.01.T01:intron 40.0%
CTACCAATATCCCTAGGAAT+AGG + Chr8:14909136-14909155 None:intergenic 40.0%
CTAGCCATCAAGAAACTTTC+AGG - Chr8:14910680-14910699 MsG0880042854.01.T01:CDS 40.0%
CTGATTCAGTATCTTGCACA+AGG - Chr8:14908762-14908781 MsG0880042854.01.T01:CDS 40.0%
CTGGTTTCAATGTTCTAGCA+GGG - Chr8:14908967-14908986 MsG0880042854.01.T01:intron 40.0%
CTGTCTGTTAACCTACTTAC+TGG - Chr8:14909779-14909798 MsG0880042854.01.T01:intron 40.0%
CTTAGAGAAACTAGACCTCT+CGG - Chr8:14910089-14910108 MsG0880042854.01.T01:intron 40.0%
CTTCCACCAGCAATTTATCT+CGG - Chr8:14909944-14909963 MsG0880042854.01.T01:intron 40.0%
CTTTCAGCGTTCAATTTCTC+GGG - Chr8:14909280-14909299 MsG0880042854.01.T01:CDS 40.0%
CTTTGGATACTCTCAAGAGA+AGG - Chr8:14910410-14910429 MsG0880042854.01.T01:intron 40.0%
GAAAGTCTACCAATATCCCT+AGG + Chr8:14909142-14909161 None:intergenic 40.0%
GAGAATCTGGTATCATTGCA+AGG - Chr8:14910767-14910786 MsG0880042854.01.T01:CDS 40.0%
GAGTGAAACAGGAATTTCAC+CGG + Chr8:14910127-14910146 None:intergenic 40.0%
GCGAATATAATAGGATGTGG+CGG - Chr8:14910614-14910633 MsG0880042854.01.T01:CDS 40.0%
GCTTGCAACTAATCAACTTG+AGG - Chr8:14909400-14909419 MsG0880042854.01.T01:intron 40.0%
GGTTACAAGAAGAAGAGACA+TGG + Chr8:14908287-14908306 None:intergenic 40.0%
GTAAGTCACTTGCAGCATTA+AGG - Chr8:14909378-14909397 MsG0880042854.01.T01:intron 40.0%
GTATTAAACTGACCACCAGT+TGG + Chr8:14910209-14910228 None:intergenic 40.0%
GTGCCTCAAACTTATCATTG+AGG + Chr8:14911009-14911028 None:intergenic 40.0%
GTTAAACCTAGCAATGGAAC+TGG - Chr8:14908648-14908667 MsG0880042854.01.T01:CDS 40.0%
TACCAGATTCTCATGTTGTG+CGG + Chr8:14910759-14910778 None:intergenic 40.0%
TGAAAACGTGATAACCCTGA+TGG - Chr8:14909586-14909605 MsG0880042854.01.T01:CDS 40.0%
TGGTTTCAATGTTCTAGCAG+GGG - Chr8:14908968-14908987 MsG0880042854.01.T01:intron 40.0%
TTACAATCATAAAGGGTCGG+CGG + Chr8:14909362-14909381 None:intergenic 40.0%
TTAGAGAAACTAGACCTCTC+GGG - Chr8:14910090-14910109 MsG0880042854.01.T01:intron 40.0%
TTAGGCTTGCATACATCCAT+AGG + Chr8:14911211-14911230 None:intergenic 40.0%
TTCAGGAGATTTAGGCCTTA+TGG - Chr8:14910697-14910716 MsG0880042854.01.T01:CDS 40.0%
TTCAGTATCTTGCACAAGGA+GGG - Chr8:14908766-14908785 MsG0880042854.01.T01:CDS 40.0%
TTCAGTTGGCCAATCTCAAT+CGG + Chr8:14909995-14910014 None:intergenic 40.0%
TTCCCAACTGCAACAATCAA+TGG + Chr8:14908394-14908413 None:intergenic 40.0%
TTGGTTCCGAGATAAATTGC+TGG + Chr8:14909953-14909972 None:intergenic 40.0%
TTGTTGGCATTAGCAAAGAC+AGG + Chr8:14909890-14909909 None:intergenic 40.0%
TTTAAAGAAGCTTGAGGCTG+TGG - Chr8:14909681-14909700 MsG0880042854.01.T01:CDS 40.0%
! ACGCTTGATCTTGGTAACAA+TGG - Chr8:14909319-14909338 MsG0880042854.01.T01:intron 40.0%
! ATTTCAAGGAGTTGGTCAGT+TGG - Chr8:14911232-14911251 MsG0880042854.01.T01:CDS 40.0%
! CAGGTTTCATCTGAGATACT+TGG - Chr8:14909425-14909444 MsG0880042854.01.T01:CDS 40.0%
! CGCTTGATCTTGGTAACAAT+GGG - Chr8:14909320-14909339 MsG0880042854.01.T01:intron 40.0%
! CTTCCATTGATTGTTGCAGT+TGG - Chr8:14908388-14908407 MsG0880042854.01.T01:CDS 40.0%
! CTTGGTAACAATGGGTTTAG+CGG - Chr8:14909328-14909347 MsG0880042854.01.T01:intron 40.0%
! GAGATTTAGGCCTTATGGAA+AGG - Chr8:14910702-14910721 MsG0880042854.01.T01:CDS 40.0%
! GGAATTTAAAGCAGAAGTGG+AGG - Chr8:14910724-14910743 MsG0880042854.01.T01:CDS 40.0%
! GTTATCACGTTTTCACCGTT+CGG + Chr8:14909581-14909600 None:intergenic 40.0%
! TTTCAAGGAGTTGGTCAGTT+GGG - Chr8:14911233-14911252 MsG0880042854.01.T01:CDS 40.0%
!! TTTTCCAACACCAGCTTTGA+AGG - Chr8:14910230-14910249 MsG0880042854.01.T01:intron 40.0%
!!! ATCCAAGTTTTAGGGTTAGG+TGG - Chr8:14909619-14909638 MsG0880042854.01.T01:CDS 40.0%
AAACCAGTGAGTCCTCTAGA+AGG + Chr8:14908465-14908484 None:intergenic 45.0%
AAACTCGCAATTGTGCGGTT+TGG - Chr8:14910253-14910272 MsG0880042854.01.T01:intron 45.0%
AACCGCACAACATGAGAATC+TGG - Chr8:14910754-14910773 MsG0880042854.01.T01:CDS 45.0%
AACGCCACTGTTTGAGTATG+GGG + Chr8:14910481-14910500 None:intergenic 45.0%
AAGACCAGTTAAGAGGTGGT+AGG + Chr8:14908368-14908387 None:intergenic 45.0%
AATGGAACTGGAACTGGAAC+TGG - Chr8:14908660-14908679 MsG0880042854.01.T01:CDS 45.0%
ACTCGTTTGAAGATCGCACA+AGG - Chr8:14910902-14910921 MsG0880042854.01.T01:CDS 45.0%
ACTGAAAGCTCTTCTTCAGC+TGG - Chr8:14910009-14910028 MsG0880042854.01.T01:intron 45.0%
ACTGGAACTGGAACTGGAAA+TGG - Chr8:14908672-14908691 MsG0880042854.01.T01:CDS 45.0%
AGAATATCGCTGGTGCTCTT+AGG - Chr8:14909491-14909510 MsG0880042854.01.T01:CDS 45.0%
AGAATGGAAGTCTCGACTAC+TGG - Chr8:14910837-14910856 MsG0880042854.01.T01:CDS 45.0%
AGAGGAGATGTGTACAGCTT+TGG - Chr8:14911151-14911170 MsG0880042854.01.T01:CDS 45.0%
ATGGTGCATCTCAACTCGAT+TGG - Chr8:14910876-14910895 MsG0880042854.01.T01:CDS 45.0%
CGAGATAAATTGCTGGTGGA+AGG + Chr8:14909946-14909965 None:intergenic 45.0%
CGCTTGACTGAAATGTTCAG+TGG + Chr8:14910597-14910616 None:intergenic 45.0%
CTTCAAGGACAGATACCAAC+TGG - Chr8:14910191-14910210 MsG0880042854.01.T01:intron 45.0%
GAACGCCACTGTTTGAGTAT+GGG + Chr8:14910482-14910501 None:intergenic 45.0%
GAAGAAGACCAGTTAAGAGG+TGG + Chr8:14908372-14908391 None:intergenic 45.0%
GAAGGAAACTCGCAATTGTG+CGG - Chr8:14910248-14910267 MsG0880042854.01.T01:intron 45.0%
GCGTTCAATTTCTCGGGATT+CGG - Chr8:14909286-14909305 MsG0880042854.01.T01:CDS 45.0%
GCTGAAGAAGAGCTTTCAGT+TGG + Chr8:14910009-14910028 None:intergenic 45.0%
GGTCCTATTCCTAGGGATAT+TGG - Chr8:14909130-14909149 MsG0880042854.01.T01:intron 45.0%
GGTCTATGTAGAAAAGCTGG+AGG + Chr8:14909760-14909779 None:intergenic 45.0%
GGTTCAATTCCTTCCTGGTT+AGG - Chr8:14909727-14909746 MsG0880042854.01.T01:CDS 45.0%
GTAATGCTTGAGCTTCTCAC+TGG - Chr8:14911178-14911197 MsG0880042854.01.T01:CDS 45.0%
GTTACATTCCTCCGGAGTAT+GGG - Chr8:14911107-14911126 MsG0880042854.01.T01:CDS 45.0%
GTTCCGAGATAAATTGCTGG+TGG + Chr8:14909950-14909969 None:intergenic 45.0%
GTTTCCTTCAAAGCTGGTGT+TGG + Chr8:14910237-14910256 None:intergenic 45.0%
TCACAGGTCAGATACCAAGT+TGG - Chr8:14909650-14909669 MsG0880042854.01.T01:CDS 45.0%
TCAGTGGTTCAATTCCTTCC+TGG - Chr8:14909722-14909741 MsG0880042854.01.T01:CDS 45.0%
TCAGTTGGCCAATCTCAATC+GGG + Chr8:14909994-14910013 None:intergenic 45.0%
TCGGAAACAGACCAGTAAGT+AGG + Chr8:14909793-14909812 None:intergenic 45.0%
TGAACGCCACTGTTTGAGTA+TGG + Chr8:14910483-14910502 None:intergenic 45.0%
TGGCTGCATGAAAAGTCTGA+TGG - Chr8:14910857-14910876 MsG0880042854.01.T01:CDS 45.0%
TGTGCGATCTTCAAACGAGT+CGG + Chr8:14910902-14910921 None:intergenic 45.0%
TTGCGAGTTTCCTTCAAAGC+TGG + Chr8:14910243-14910262 None:intergenic 45.0%
! AAGCTTGAGAGATTTAGGGC+TGG - Chr8:14908948-14908967 MsG0880042854.01.T01:intron 45.0%
! GCTGGTTTCAATGTTCTAGC+AGG - Chr8:14908966-14908985 MsG0880042854.01.T01:intron 45.0%
! TTACCTTCTAGAGGACTCAC+TGG - Chr8:14908459-14908478 MsG0880042854.01.T01:CDS 45.0%
!! AGACTTGCTACGCTTGATCT+TGG - Chr8:14909310-14909329 MsG0880042854.01.T01:CDS 45.0%
!! CGTTCATCCTGAGGTTGATA+AGG - Chr8:14910497-14910516 MsG0880042854.01.T01:CDS 45.0%
!! TCATCCTGAGGTTGATAAGG+AGG - Chr8:14910500-14910519 MsG0880042854.01.T01:CDS 45.0%
AAACAGTGGCGTTCATCCTG+AGG - Chr8:14910488-14910507 MsG0880042854.01.T01:CDS 50.0%
ACAAGGAGCAGGTTGTGGTT+TGG - Chr8:14910919-14910938 MsG0880042854.01.T01:CDS 50.0%
ACTGGAACTGGAACTGGAAC+TGG - Chr8:14908666-14908685 MsG0880042854.01.T01:CDS 50.0%
CAAGAGAAGGGTAATCCCAG+AGG - Chr8:14910423-14910442 MsG0880042854.01.T01:CDS 50.0%
CAAGGACAGATACCAACTGG+TGG - Chr8:14910194-14910213 MsG0880042854.01.T01:intron 50.0%
CAGTTAAGAGGTGGTAGGTG+AGG + Chr8:14908363-14908382 None:intergenic 50.0%
CCAGTTCCAGTTCCATTGCT+AGG + Chr8:14908657-14908676 None:intergenic 50.0%
CCTAGCAATGGAACTGGAAC+TGG - Chr8:14908654-14908673 MsG0880042854.01.T01:CDS 50.0%
CTAGCCTCCTTATCAACCTC+AGG + Chr8:14910507-14910526 None:intergenic 50.0%
CTCACCTACCACCTCTTAAC+TGG - Chr8:14908361-14908380 MsG0880042854.01.T01:CDS 50.0%
CTCTCGGGAAACAACCTATC+CGG - Chr8:14910105-14910124 MsG0880042854.01.T01:intron 50.0%
CTTGTTGCGATGCTAGTGCA+GGG + Chr8:14909832-14909851 None:intergenic 50.0%
GGTGCTCTTAGGATACTCAC+TGG - Chr8:14909502-14909521 MsG0880042854.01.T01:CDS 50.0%
GGTTACATTCCTCCGGAGTA+TGG - Chr8:14911106-14911125 MsG0880042854.01.T01:CDS 50.0%
TCTCACTGGAAGGAGACCTA+TGG - Chr8:14911192-14911211 MsG0880042854.01.T01:CDS 50.0%
TGCTTGAGCTTCTCACTGGA+AGG - Chr8:14911182-14911201 MsG0880042854.01.T01:CDS 50.0%
TTGAAGATCGCACAAGGAGC+AGG - Chr8:14910908-14910927 MsG0880042854.01.T01:CDS 50.0%
! GGAAGTGTACCTAACCAGGA+AGG + Chr8:14909739-14909758 None:intergenic 50.0%
! TGGAGGAAGTGTACCTAACC+AGG + Chr8:14909743-14909762 None:intergenic 50.0%
!! AGGCACGTGTTGCTGATTTC+GGG - Chr8:14911023-14911042 MsG0880042854.01.T01:CDS 50.0%
!! GAGGCACGTGTTGCTGATTT+CGG - Chr8:14911022-14911041 MsG0880042854.01.T01:CDS 50.0%
!! GGGAGTTTTGTGAGCTCGAT+CGG + Chr8:14909812-14909831 None:intergenic 50.0%
!! TGATAAGGAGGCTAGCCTAG+TGG - Chr8:14910512-14910531 MsG0880042854.01.T01:CDS 50.0%
!! TTGCTGATTTCGGGTTGTCG+CGG - Chr8:14911032-14911051 MsG0880042854.01.T01:CDS 50.0%
ACCCATGCTTGCCCATACTC+CGG + Chr8:14911121-14911140 None:intergenic 55.0%
ACTGCGTGCACGACGGTTAT+CGG - Chr8:14910792-14910811 MsG0880042854.01.T01:CDS 55.0%
AGGATGTGGCGGTTTCGGTT+TGG - Chr8:14910625-14910644 MsG0880042854.01.T01:CDS 55.0%
ATATCGCGGTGCACGATGTG+CGG + Chr8:14910968-14910987 None:intergenic 55.0%
ATCGCACAAGGAGCAGGTTG+TGG - Chr8:14910914-14910933 MsG0880042854.01.T01:CDS 55.0%
CTCGGAACCAATCACCTCAG+TGG - Chr8:14909962-14909981 MsG0880042854.01.T01:intron 55.0%
GATGCTGCCACTGAGGTGAT+TGG + Chr8:14909972-14909991 None:intergenic 55.0%
GCATGGGTGGCTACTCTTAG+AGG - Chr8:14911133-14911152 MsG0880042854.01.T01:CDS 55.0%
GGCAGCATCCCGATTGAGAT+TGG - Chr8:14909983-14910002 MsG0880042854.01.T01:intron 55.0%
TCCGGAGTATGGGCAAGCAT+GGG - Chr8:14911117-14911136 MsG0880042854.01.T01:CDS 55.0%
! CGGATAGGTTGTTTCCCGAG+AGG + Chr8:14910107-14910126 None:intergenic 55.0%
! GCTTGTTGCGATGCTAGTGC+AGG + Chr8:14909833-14909852 None:intergenic 55.0%
CAAGGCTACTGCGTGCACGA+CGG - Chr8:14910785-14910804 MsG0880042854.01.T01:CDS 60.0%
CAATCGGGATGCTGCCACTG+AGG + Chr8:14909979-14909998 None:intergenic 60.0%
CATGCTTGCCCATACTCCGG+AGG + Chr8:14911118-14911137 None:intergenic 60.0%
CTCCGGAGTATGGGCAAGCA+TGG - Chr8:14911116-14911135 MsG0880042854.01.T01:CDS 60.0%
GGAGTATGGGCAAGCATGGG+TGG - Chr8:14911120-14911139 MsG0880042854.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr8 gene 14908237 14911267 14908237 ID=MsG0880042854.01;Name=MsG0880042854.01
Chr8 mRNA 14908237 14911267 14908237 ID=MsG0880042854.01.T01;Parent=MsG0880042854.01;Name=MsG0880042854.01.T01;_AED=0.24;_eAED=0.24;_QI=0|0|0|1|0.66|0.75|4|0|640
Chr8 exon 14910416 14911267 14910416 ID=MsG0880042854.01.T01:exon:479;Parent=MsG0880042854.01.T01
Chr8 exon 14909421 14909755 14909421 ID=MsG0880042854.01.T01:exon:478;Parent=MsG0880042854.01.T01
Chr8 exon 14909235 14909329 14909235 ID=MsG0880042854.01.T01:exon:477;Parent=MsG0880042854.01.T01
Chr8 exon 14908237 14908877 14908237 ID=MsG0880042854.01.T01:exon:476;Parent=MsG0880042854.01.T01
Chr8 CDS 14910416 14911267 14910416 ID=MsG0880042854.01.T01:cds;Parent=MsG0880042854.01.T01
Chr8 CDS 14909421 14909755 14909421 ID=MsG0880042854.01.T01:cds;Parent=MsG0880042854.01.T01
Chr8 CDS 14909235 14909329 14909235 ID=MsG0880042854.01.T01:cds;Parent=MsG0880042854.01.T01
Chr8 CDS 14908237 14908877 14908237 ID=MsG0880042854.01.T01:cds;Parent=MsG0880042854.01.T01
Gene Sequence

>MsG0880042854.01.T01

ATGTCCTCTTTCAAAAAAACAACCTTTTTTCTAACCTTATTCATTGTCCATGTCTCTTCTTCTTGTAACCAACTTGACAAAGATTCTCTCTTATCTTTCTCTTCAAATTTCTCAACTTTTTCACCTCACCTACCACCTCTTAACTGGTCTTCTTCCATTGATTGTTGCAGTTGGGAAGGTATAACTTGTGATCAAAATAATCACCATGTTACACATCTTTTCTTACCTTCTAGAGGACTCACTGGTTTCATTTCATTTTCTCTTATAACTTCCCTTGAATCTCTTTCTCATCTTAATCTTTCACATAATAGATTTTATGGTAATCTTCAAAATCACTTTTTTGATCTTCTTAATCAACTTTTAGTCCTTGATTTGAGTTATAATCACTTCTCTGGTGAATTACCATCTTTTGTTAAACCTAGCAATGGAACTGGAACTGGAACTGGAACTGGAAATGGAAATACTAGTGTTATTCAGGAATTGGATTTGTCTAGTAATTCATTCAATGGAACATTACCAGTTTCTCTGATTCAGTATCTTGCACAAGGAGGGAATTTGATTTCTTTCAATGTAAGTAACAACAGTTTCACAGGTCAAATTCCAATTTCAATCTTTTGTGTTAATGAATTGAACAATTCTGCTATAAGATTCTTGGATTATTCTTCCAATGATTTTAGTGGTAATATTGAGAAAGGTTTAGGAGCATGTTCTAAGCTTGAGAGATTTAGGGCTGGTTTCAATGTTCTAGCAGGGGAAATACCAATTGATATTTATGATGCTGTTTCACTCATTGAAATATCATTGCCACTTAATAAGATTAATGGATCAATTGATGATGGAGTTGTCAATCTTGTACACTTCCTCCAGCTTTTCTACATAGACCTGTCTGTTAACCTACTTACTGGTCTGTTTCCGATCGAGCTCACAAAACTCCCTGCACTAGCATCGCAACAAGCAAATGATAAAGTAGAAAGGACTTACTTGGAGTTACCTGTCTTTGCTAATGCCAACAATGTTTCTTTGTTGCAATACAATCAACTTTCAAGCCTTCCACCAGCAATTTATCTCGGAACCAATCACCTCAGTGGCAGCATCCCGATTGAGATTGGCCAACTGAAAGCTCTTCTTCAGCTGGACCTGAAGAAAAACAACTTCTCTGGCAATATACCCGATCAAATTTCAAACTGTGTAGCACACAATAATCTTCAAGGACAGATACCAACTGGTGGTCAGTTTAATACTTTTTCCAACACCAGCTTTGAAGGAAACTCGCAATTGTGCGGATGTGGCGGTTTCGGTTTGGTTTATAAAGCATCATTTCAAAATGGAACTAAGCTAGCCATCAAGAAACTTTCAGGAGATTTAGGCCTTATGGAAAGGGAATTTAAAGCAGAAGTGGAGGCTTTGTCAACCGCACAACATGAGAATCTGGTATCATTGCAAGGCTACTGCGTGCACGACGGTTATCGGCTACTCATATATAATTACATGGAGAATGGAAGTCTCGACTACTGGCTGCATGAAAAGTCTGATGGTGCATCTCAACTCGATTGGCCGACTCGTTTGAAGATCGCACAAGGAGCAGGTTGTGGTTTGGCCTATTTGCATATGATTTGTGATCCGCACATCGTGCACCGCGATATAAAGTCAAGCAATATACTCCTCAATGATAAGTTTGAGGCACGTGTTGCTGATTTCGGGTTGTCGCGGTTGATTCTTCCGTATCAGACTCATGTTACAACGGAACTTGTAGGTACATTAGGTTACATTCCTCCGGAGTATGGGCAAGCATGGGTGGCTACTCTTAGAGGAGATGTGTACAGCTTTGGTGTTGTAATGCTTGAGCTTCTCACTGGAAGGAGACCTATGGATGTATGCAAGCCTAAAATTTCAAGGAGTTGGTCAGTTGGGTTCAACAGATGA
Protein sequence

>MsG0880042854.01.T01

MSSFKKTTFFLTLFIVHVSSSCNQLDKDSLLSFSSNFSTFSPHLPPLNWSSSIDCCSWEGITCDQNNHHVTHLFLPSRGLTGFISFSLITSLESLSHLNLSHNRFYGNLQNHFFDLLNQLLVLDLSYNHFSGELPSFVKPSNGTGTGTGTGNGNTSVIQELDLSSNSFNGTLPVSLIQYLAQGGNLISFNVSNNSFTGQIPISIFCVNELNNSAIRFLDYSSNDFSGNIEKGLGACSKLERFRAGFNVLAGEIPIDIYDAVSLIEISLPLNKINGSIDDGVVNLVHFLQLFYIDLSVNLLTGLFPIELTKLPALASQQANDKVERTYLELPVFANANNVSLLQYNQLSSLPPAIYLGTNHLSGSIPIEIGQLKALLQLDLKKNNFSGNIPDQISNCVAHNNLQGQIPTGGQFNTFSNTSFEGNSQLCGCGGFGLVYKASFQNGTKLAIKKLSGDLGLMEREFKAEVEALSTAQHENLVSLQGYCVHDGYRLLIYNYMENGSLDYWLHEKSDGASQLDWPTRLKIAQGAGCGLAYLHMICDPHIVHRDIKSSNILLNDKFEARVADFGLSRLILPYQTHVTTELVGTLGYIPPEYGQAWVATLRGDVYSFGVVMLELLTGRRPMDVCKPKISRSWSVGFNR*