AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880046832.01


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MsG0880046832.01.T01 AT4G21400 37.745 204 112 4 216 406 346 547 3.45e-30 124
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MsG0880046832.01.T01 AT4G34440 38.021 192 93 6 223 411 304 472 3.44e-28 118
MsG0880046832.01.T01 AT1G76370 35.354 198 101 6 219 411 63 238 3.47e-28 115
MsG0880046832.01.T01 AT2G18470 37.220 223 108 7 192 411 251 444 3.75e-28 118
MsG0880046832.01.T01 AT2G18470 37.220 223 108 7 192 411 251 444 3.75e-28 118
MsG0880046832.01.T01 AT2G18470 37.220 223 108 7 192 411 251 444 3.75e-28 118
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MsG0880046832.01.T01 AT5G16900 36.444 225 112 8 190 411 539 735 2.90e-26 113
MsG0880046832.01.T01 AT1G05700 38.235 204 104 7 208 411 580 761 2.91e-26 113
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MsG0880046832.01.T01 AT4G31110 38.860 193 100 5 219 411 419 593 3.01e-25 110
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MsG0880046832.01.T01 AT4G13190 36.058 208 107 7 208 411 50 235 3.65e-25 107
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MsG0880046832.01.T01 AT1G74490 36.041 197 102 5 219 411 79 255 4.09e-25 107
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MsG0880046832.01.T01 AT3G15890 32.727 220 130 5 219 438 27 228 4.54e-25 106
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MsG0880046832.01.T01 AT1G16110 37.566 189 101 5 223 411 424 595 7.96e-24 105
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MsG0880046832.01.T01 AT2G42960 32.870 216 122 6 199 411 150 345 8.42e-24 104
MsG0880046832.01.T01 AT2G42960 32.870 216 122 6 199 411 150 345 8.42e-24 104
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MsG0880046832.01.T01 AT2G19210 31.525 295 140 12 218 477 565 832 8.72e-24 105
MsG0880046832.01.T01 AT4G23250 37.037 189 98 4 211 397 339 508 9.20e-24 105
MsG0880046832.01.T01 AT1G11330 36.735 196 104 7 213 406 505 682 9.31e-24 105
MsG0880046832.01.T01 AT1G79670 36.649 191 98 5 223 411 376 545 9.33e-24 105
MsG0880046832.01.T01 AT2G30730 34.225 187 105 4 219 401 45 217 9.33e-24 102
MsG0880046832.01.T01 AT1G61610 27.778 288 164 5 219 479 513 783 9.77e-24 105
MsG0880046832.01.T01 AT4G23320 38.251 183 92 5 216 396 168 331 9.80e-24 104
MsG0880046832.01.T01 AT4G23320 38.251 183 92 5 216 396 168 331 9.80e-24 104
MsG0880046832.01.T01 AT1G21230 36.979 192 96 7 224 412 401 570 1.00e-23 105
MsG0880046832.01.T01 AT1G78530 38.830 188 89 5 226 411 70 233 1.03e-23 101
MsG0880046832.01.T01 AT1G70520 36.816 201 98 7 216 411 310 486 1.11e-23 105
MsG0880046832.01.T01 AT1G79670 36.649 191 98 5 223 411 413 582 1.14e-23 105
MsG0880046832.01.T01 AT4G23320 38.251 183 92 5 216 396 189 352 1.20e-23 104
MsG0880046832.01.T01 AT5G35580 36.979 192 92 6 228 411 73 243 1.21e-23 103
MsG0880046832.01.T01 AT1G61420 36.464 181 94 6 219 397 332 493 1.24e-23 104
MsG0880046832.01.T01 AT1G61420 36.464 181 94 6 219 397 334 495 1.28e-23 104
MsG0880046832.01.T01 AT5G35580 36.979 192 92 6 228 411 85 255 1.41e-23 103
MsG0880046832.01.T01 AT1G11303 36.364 198 102 6 213 406 490 667 1.43e-23 105
MsG0880046832.01.T01 AT1G78530 38.830 188 89 5 226 411 70 233 1.48e-23 102
MsG0880046832.01.T01 AT1G61440 37.222 180 94 4 219 397 466 627 1.49e-23 104
MsG0880046832.01.T01 AT1G61440 37.222 180 94 4 219 397 471 632 1.61e-23 104
MsG0880046832.01.T01 AT3G26700 33.163 196 111 4 199 393 47 223 1.63e-23 102
MsG0880046832.01.T01 AT3G26700 33.163 196 111 4 199 393 47 223 1.63e-23 102
MsG0880046832.01.T01 AT3G26700 33.163 196 111 4 199 393 47 223 1.63e-23 102
MsG0880046832.01.T01 AT3G01300 36.410 195 94 5 227 411 132 306 1.65e-23 103
MsG0880046832.01.T01 AT1G61370 35.912 181 95 5 219 397 338 499 1.82e-23 104
MsG0880046832.01.T01 AT1G61420 36.464 181 94 6 219 397 484 645 1.88e-23 104
MsG0880046832.01.T01 AT1G61420 36.464 181 94 6 219 397 484 645 1.88e-23 104
MsG0880046832.01.T01 AT2G28250 33.333 195 104 4 211 396 185 362 1.91e-23 103
MsG0880046832.01.T01 AT2G28250 33.333 195 104 4 211 396 185 362 1.91e-23 103
MsG0880046832.01.T01 AT2G28250 33.333 195 104 4 211 396 185 362 1.91e-23 103
MsG0880046832.01.T01 AT2G28250 33.333 195 104 4 211 396 185 362 1.91e-23 103
MsG0880046832.01.T01 AT2G28250 33.333 195 104 4 211 396 185 362 1.91e-23 103
MsG0880046832.01.T01 AT2G28250 33.333 195 104 4 211 396 185 362 1.91e-23 103
MsG0880046832.01.T01 AT1G61420 36.464 181 94 6 219 397 482 643 1.98e-23 104
MsG0880046832.01.T01 AT5G38250 34.848 198 98 6 204 397 285 455 2.02e-23 103
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MsG0880046832.01.T01 AT2G13800 34.135 208 112 5 209 412 136 322 2.19e-23 103
MsG0880046832.01.T01 AT4G23250 37.297 185 95 4 215 397 338 503 2.28e-23 104
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MsG0880046832.01.T01 AT1G61370 35.912 181 95 5 219 397 489 650 2.57e-23 103
MsG0880046832.01.T01 AT4G23290 31.058 293 144 11 216 473 305 574 2.73e-23 103
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MsG0880046832.01.T01 AT5G03320 33.858 254 129 11 171 411 25 252 2.77e-23 102
MsG0880046832.01.T01 AT2G30740 31.390 223 116 4 193 411 51 240 2.87e-23 101
MsG0880046832.01.T01 AT2G30740 31.390 223 116 4 193 411 51 240 2.87e-23 101
MsG0880046832.01.T01 AT2G30740 31.390 223 116 4 193 411 51 240 2.87e-23 101
MsG0880046832.01.T01 AT2G30740 31.390 223 116 4 193 411 51 240 2.87e-23 101
MsG0880046832.01.T01 AT2G30740 31.390 223 116 4 193 411 51 240 2.87e-23 101
MsG0880046832.01.T01 AT2G30740 31.390 223 116 4 193 411 51 240 2.87e-23 101
MsG0880046832.01.T01 AT2G30740 31.390 223 116 4 193 411 51 240 2.87e-23 101
MsG0880046832.01.T01 AT2G30740 31.390 223 116 4 193 411 51 240 2.87e-23 101
MsG0880046832.01.T01 AT2G30740 31.390 223 116 4 193 411 51 240 2.87e-23 101
MsG0880046832.01.T01 AT2G30740 31.390 223 116 4 193 411 51 240 2.87e-23 101
MsG0880046832.01.T01 AT2G30740 31.390 223 116 4 193 411 51 240 2.87e-23 101
MsG0880046832.01.T01 AT2G30740 31.390 223 116 4 193 411 51 240 2.87e-23 101
MsG0880046832.01.T01 AT2G30740 31.390 223 116 4 193 411 51 240 2.87e-23 101
MsG0880046832.01.T01 AT2G30740 31.390 223 116 4 193 411 51 240 2.87e-23 101

Find 112 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 294 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
AACATCAACTCACTTGAATT+TGG 0.113511 8:-78880892 None:intergenic
TTTACAGCTTCTTGCATTAA+AGG 0.122689 8:-78884098 None:intergenic
ACAATATTTGTATTCAAATA+TGG 0.184779 8:+78882002 MsG0880046832.01.T01:CDS
CGAGCTAAAGTAGCCGATTT+TGG 0.189151 8:+78882769 MsG0880046832.01.T01:CDS
GTAAAATTGAATGTGGATTT+TGG 0.208310 8:+78884598 MsG0880046832.01.T01:three_prime_UTR
GGATGTTACTGTTGTGTTCT+TGG 0.211813 8:+78880283 MsG0880046832.01.T01:CDS
CAAATAGGAGAAGGAGGTTT+TGG 0.222709 8:+78881530 MsG0880046832.01.T01:CDS
TTTGCTCTTGCAGTGGAATT+AGG 0.233044 8:+78881341 MsG0880046832.01.T01:CDS
ATCATGCCTAAAAGTGTTTC+AGG 0.233660 8:+78884368 MsG0880046832.01.T01:three_prime_UTR
GGCAACTTCTCATGCTGTTC+TGG 0.280389 8:+78880861 MsG0880046832.01.T01:CDS
TTGACATGTTAATTTCATTT+GGG 0.284286 8:+78884395 MsG0880046832.01.T01:three_prime_UTR
AAAGGGTTGTGGCGATAATT+TGG 0.284437 8:+78880358 MsG0880046832.01.T01:CDS
GTTGTTTGTCCTTGTTTCTA+TGG 0.288044 8:+78880826 MsG0880046832.01.T01:CDS
CATTTGGGGTTTAATCTAGA+TGG 0.294087 8:+78884410 MsG0880046832.01.T01:three_prime_UTR
GTTAGATTTGGATGTCTCTT+TGG 0.307171 8:+78880526 MsG0880046832.01.T01:CDS
TTTGACATGTTAATTTCATT+TGG 0.310930 8:+78884394 MsG0880046832.01.T01:three_prime_UTR
GACTGAAGTCTGCTGAGTTT+TGG 0.319257 8:-78881449 None:intergenic
AAGGTTTCGATGATCAATTT+TGG 0.320591 8:-78881867 None:intergenic
TTGCCACAAACTCCGTAATA+AGG 0.327103 8:-78881931 None:intergenic
TGGCTGTAAAACGTGCAAAA+AGG 0.327174 8:+78881591 MsG0880046832.01.T01:CDS
AATATGGAAACTAATTTGTT+TGG 0.328573 8:+78882018 MsG0880046832.01.T01:CDS
CAACAACTGTGTGTTAGATT+TGG 0.358722 8:+78880514 MsG0880046832.01.T01:CDS
GTGAGCAATTGTGGGCAATA+AGG 0.360166 8:+78884208 MsG0880046832.01.T01:three_prime_UTR
CTTAATGTAACTCGCTCTTC+AGG 0.364661 8:-78882980 None:intergenic
TGTGTATGGTCGTTGTTTAC+AGG 0.366598 8:-78882808 None:intergenic
AGTTTCCTTCCTGCCTTTGA+AGG 0.372344 8:-78880695 None:intergenic
ACATCAACTCACTTGAATTT+GGG 0.375068 8:-78880891 None:intergenic
GACTTCAGAATATCATATAA+TGG 0.389548 8:-78884286 None:intergenic
TGGTACTCTTCGAGAACATT+TGG 0.397809 8:+78881955 MsG0880046832.01.T01:CDS
TGCTGTGAAGATGTTTGATT+TGG 0.399908 8:+78884130 MsG0880046832.01.T01:CDS
TCGTCCTGTGGAGCTGAAAA+AGG 0.415906 8:+78882956 MsG0880046832.01.T01:CDS
CGAAACCTTGTGAAGCTACT+TGG 0.416679 8:+78881881 MsG0880046832.01.T01:CDS
TGAGCAATTGTGGGCAATAA+GGG 0.419425 8:+78884209 MsG0880046832.01.T01:three_prime_UTR
GCAACATCCTTGCAATTTCA+AGG 0.426551 8:-78882237 None:intergenic
AACCATTCGCAATATACAAT+TGG 0.429815 8:-78880466 None:intergenic
TTCTCATGCTGTTCTGGAAA+AGG 0.431491 8:+78880867 MsG0880046832.01.T01:CDS
CAGCAGTGAAGTCGAACTTC+TGG 0.433967 8:+78881844 MsG0880046832.01.T01:CDS
ATTACGGAGTTTGTGGCAAA+TGG 0.437344 8:+78881935 MsG0880046832.01.T01:CDS
CATTCTGAAGTTTAGATTGT+GGG 0.438222 8:+78884473 MsG0880046832.01.T01:three_prime_UTR
ATTTGGATGTCTCTTTGGTA+TGG 0.439440 8:+78880531 MsG0880046832.01.T01:CDS
GTTAATTTGCCTTCAAAGGC+AGG 0.446182 8:+78880686 MsG0880046832.01.T01:intron
ATTACATCTCAACCTGAGTC+AGG 0.448193 8:+78881472 MsG0880046832.01.T01:CDS
TATCCTTATTACGGAGTTTG+TGG 0.450614 8:+78881928 MsG0880046832.01.T01:CDS
GGAGACATTGAGAATCTTGA+CGG 0.458728 8:-78881428 None:intergenic
TTTAGACGACGGCCTGGTTG+TGG 0.459421 8:+78881571 MsG0880046832.01.T01:CDS
TTGTTTGTCCTTGTTTCTAT+GGG 0.461186 8:+78880827 MsG0880046832.01.T01:CDS
AAGCTTTGCAAATCCAAAAT+CGG 0.466093 8:-78882782 None:intergenic
GATCCCGGCTAGTCCACTTC+GGG 0.470734 8:+78881394 MsG0880046832.01.T01:CDS
GGCACCCGAAGTGGACTAGC+CGG 0.472365 8:-78881398 None:intergenic
CAACGGCAAGAGAGAATGAT+TGG 0.476318 8:+78884256 MsG0880046832.01.T01:three_prime_UTR
AAACGAACGTATCCTTATTA+CGG 0.477704 8:+78881919 MsG0880046832.01.T01:CDS
ATTATATGATATTCTGAAGT+CGG 0.483807 8:+78884288 MsG0880046832.01.T01:three_prime_UTR
CTTTGGTAGAAATGTGTGTA+TGG 0.486802 8:-78882822 None:intergenic
TTCAGTTAATTTGCCTTCAA+AGG 0.486885 8:+78880682 MsG0880046832.01.T01:intron
TTTCTATGGGAAGAGAAGAA+AGG 0.495384 8:+78880840 MsG0880046832.01.T01:CDS
GCTTTCAGTCAGAAGAATGT+TGG 0.509778 8:-78882743 None:intergenic
TCTGACTGGCCGTCGTCCTG+TGG 0.512929 8:+78882944 MsG0880046832.01.T01:CDS
AGCCGACTGTTCCTTCACTT+TGG 0.514543 8:-78882839 None:intergenic
CTTCTCTTCCCATAGAAACA+AGG 0.521374 8:-78880835 None:intergenic
GAAGTTGTGTTACAGACAAA+GGG 0.521985 8:+78880341 MsG0880046832.01.T01:CDS
AAGAGCGAGTTACATTAAGA+TGG 0.522640 8:+78882984 MsG0880046832.01.T01:CDS
TGTGATGTGAAGGATTACTT+TGG 0.523028 8:+78880488 MsG0880046832.01.T01:CDS
GGCTCATTTAGACGACGGCC+TGG 0.523224 8:+78881565 MsG0880046832.01.T01:CDS
AAGTAGTAGAATAGAGTCAA+GGG 0.524644 8:-78884557 None:intergenic
TGAAGTTGTGTTACAGACAA+AGG 0.524870 8:+78880340 MsG0880046832.01.T01:CDS
AAACAGTGGGTGAGCAATTG+TGG 0.527503 8:+78884199 MsG0880046832.01.T01:three_prime_UTR
CTCCAATTGTATATTGCGAA+TGG 0.528095 8:+78880464 MsG0880046832.01.T01:CDS
GCACCCGAAGTGGACTAGCC+GGG 0.531645 8:-78881397 None:intergenic
TCATTCTGAAGTTTAGATTG+TGG 0.542732 8:+78884472 MsG0880046832.01.T01:three_prime_UTR
TGACATGTTAATTTCATTTG+GGG 0.545421 8:+78884396 MsG0880046832.01.T01:three_prime_UTR
ATCAGAAACTGATGGTTCAA+AGG 0.546450 8:-78881369 None:intergenic
CAAGTGTCAAGCAGCCAAGT+TGG 0.547377 8:+78880766 MsG0880046832.01.T01:CDS
TTTCCTTGTAAAATTGAATG+TGG 0.547937 8:+78884591 MsG0880046832.01.T01:three_prime_UTR
AGATCCCGGCTAGTCCACTT+CGG 0.553615 8:+78881393 MsG0880046832.01.T01:CDS
CAAGTAGTAGAATAGAGTCA+AGG 0.557708 8:-78884558 None:intergenic
GCAAATTCATATTCTAGTCA+TGG 0.560142 8:+78880383 MsG0880046832.01.T01:CDS
GTGTATGGTCGTTGTTTACA+GGG 0.560231 8:-78882807 None:intergenic
TGCGAATGGTTGTGATGTGA+AGG 0.560498 8:+78880478 MsG0880046832.01.T01:CDS
AATCACGCCTTGAAATTGCA+AGG 0.560811 8:+78882230 MsG0880046832.01.T01:CDS
GTGTTACAGACAAAGGGTTG+TGG 0.565801 8:+78880347 MsG0880046832.01.T01:CDS
CCGTTGTGCTACTACTCTTG+AGG 0.566160 8:-78884239 None:intergenic
GGACTAGGTGGCACCCGAAG+TGG 0.567503 8:-78881407 None:intergenic
ATCAGTTTCTGATAAGATCC+CGG 0.569707 8:+78881379 MsG0880046832.01.T01:CDS
GAAATATAATGAAGGAAGTG+TGG 0.580856 8:+78884061 MsG0880046832.01.T01:CDS
ATTGAGAATCTTGACGGACT+AGG 0.584446 8:-78881422 None:intergenic
AACAGTGGGTGAGCAATTGT+GGG 0.589188 8:+78884200 MsG0880046832.01.T01:three_prime_UTR
ATTTGCCTTCAAAGGCAGGA+AGG 0.590231 8:+78880690 MsG0880046832.01.T01:CDS
GAAACATTACAAATAGGAGA+AGG 0.594509 8:+78881521 MsG0880046832.01.T01:CDS
CTACTTGGCTATATTGACAA+AGG 0.595946 8:+78881896 MsG0880046832.01.T01:CDS
AGAGCGAGTTACATTAAGAT+GGG 0.606183 8:+78882985 MsG0880046832.01.T01:CDS
GAACAATAATCGACGTCACA+AGG 0.607263 8:+78880733 MsG0880046832.01.T01:CDS
ACTCTTCGAGAACATTTGGA+TGG 0.607314 8:+78881959 MsG0880046832.01.T01:CDS
TAGCTTTAGAAACCTGACTC+AGG 0.608297 8:-78881484 None:intergenic
GCGTTCAGGAAATATAATGA+AGG 0.608849 8:+78884053 MsG0880046832.01.T01:CDS
AATTGCAAGGATGTTGCACA+TGG 0.610325 8:+78882243 MsG0880046832.01.T01:CDS
ACATTACAAATAGGAGAAGG+AGG 0.614749 8:+78881524 MsG0880046832.01.T01:CDS
GGTATTGATGGCAGGTTGCG+TGG 0.618315 8:+78882192 MsG0880046832.01.T01:intron
GGTAGAGATAAACACACTAG+TGG 0.619858 8:-78884536 None:intergenic
GACCTGCATACAGATGAGAT+AGG 0.620548 8:-78882271 None:intergenic
TTCATATTCTAGTCATGGTG+AGG 0.625289 8:+78880388 MsG0880046832.01.T01:CDS
ACACATTTCTACCAAAGTGA+AGG 0.626169 8:+78882828 MsG0880046832.01.T01:CDS
TGGATGATTTCACATCCCGA+TGG 0.626789 8:-78882723 None:intergenic
ATATAATGAAGGAAGTGTGG+TGG 0.627695 8:+78884064 MsG0880046832.01.T01:CDS
AGAAACTGATGGTTCAAAGG+AGG 0.644221 8:-78881366 None:intergenic
AGACCTGACATGAAAACAGT+GGG 0.650314 8:+78884186 MsG0880046832.01.T01:exon
TACAAGGCTCATTTAGACGA+CGG 0.660891 8:+78881560 MsG0880046832.01.T01:CDS
GGGATCTTATCAGAAACTGA+TGG 0.663836 8:-78881377 None:intergenic
TATAGCCAAGTAGCTTCACA+AGG 0.665872 8:-78881886 None:intergenic
GAGAATCTTGACGGACTAGG+TGG 0.679579 8:-78881419 None:intergenic
ATAGAAACAAGGACAAACAA+CGG 0.698270 8:-78880824 None:intergenic
TAGACCTGACATGAAAACAG+TGG 0.699696 8:+78884185 MsG0880046832.01.T01:exon
CCTCAAGAGTAGTAGCACAA+CGG 0.748480 8:+78884239 MsG0880046832.01.T01:three_prime_UTR

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! GTTTACATAATAAATATTAA+AGG - Chr8:78882304-78882323 None:intergenic 10.0%
!! ACAATATTTGTATTCAAATA+TGG + Chr8:78882002-78882021 MsG0880046832.01.T01:CDS 15.0%
!!! GATCATTGATATTTTTTATT+AGG + Chr8:78882543-78882562 MsG0880046832.01.T01:intron 15.0%
!!! TTTTATAAATGAAAACTGTT+TGG - Chr8:78880993-78881012 None:intergenic 15.0%
!! AAAAAAAGAAACAACTTTAC+CGG + Chr8:78882460-78882479 MsG0880046832.01.T01:intron 20.0%
!! ACAATGGAAACTAAAAATTA+AGG - Chr8:78881274-78881293 None:intergenic 20.0%
!! AGCTTCTTCAAAAAAAAAAA+AGG - Chr8:78883646-78883665 None:intergenic 20.0%
!! CAATGGAAACTAAAAATTAA+GGG - Chr8:78881273-78881292 None:intergenic 20.0%
!! TTCCCTATAATTTATGAAAA+CGG - Chr8:78881175-78881194 None:intergenic 20.0%
!! TTGACATGTTAATTTCATTT+GGG + Chr8:78884395-78884414 MsG0880046832.01.T01:three_prime_UTR 20.0%
!! TTTGACATGTTAATTTCATT+TGG + Chr8:78884394-78884413 MsG0880046832.01.T01:three_prime_UTR 20.0%
!!! AATATGGAAACTAATTTGTT+TGG + Chr8:78882018-78882037 MsG0880046832.01.T01:CDS 20.0%
!!! AATCCGTTTTCATAAATTAT+AGG + Chr8:78881169-78881188 MsG0880046832.01.T01:intron 20.0%
!!! ATCCGTTTTCATAAATTATA+GGG + Chr8:78881170-78881189 MsG0880046832.01.T01:intron 20.0%
!!! ATTATATGATATTCTGAAGT+CGG + Chr8:78884288-78884307 MsG0880046832.01.T01:three_prime_UTR 20.0%
!!! GTAATGTTTCTGAAAAATTA+CGG - Chr8:78881511-78881530 None:intergenic 20.0%
!!! TAATGTTTCTGAAAAATTAC+GGG - Chr8:78881510-78881529 None:intergenic 20.0%
!!! TCATTTTAAACTAATTTTGC+AGG - Chr8:78883611-78883630 None:intergenic 20.0%
!!! TGCAAAATTAGTTTAAAATG+AGG + Chr8:78883610-78883629 MsG0880046832.01.T01:intron 20.0%
!!! TTGAATAGATTTTGTAAGTT+AGG + Chr8:78883281-78883300 MsG0880046832.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTTCAGAAACATTACAAAT+AGG + Chr8:78881515-78881534 MsG0880046832.01.T01:CDS 20.0%
! AAAAGTGATGTTTACTCATT+TGG + Chr8:78882903-78882922 MsG0880046832.01.T01:intron 25.0%
! AATCAAACAACATCTAATTC+CGG - Chr8:78882482-78882501 None:intergenic 25.0%
! ACCTATTTATAAACATTAGG+GGG - Chr8:78882613-78882632 None:intergenic 25.0%
! AGAAAAACAAATTATCCATC+GGG + Chr8:78882708-78882727 MsG0880046832.01.T01:CDS 25.0%
! AGATGATATAACTTAATAGC+TGG + Chr8:78883098-78883117 MsG0880046832.01.T01:intron 25.0%
! AGATTGTACTTTATTACCTT+AGG + Chr8:78880954-78880973 MsG0880046832.01.T01:intron 25.0%
! ATATAGGATAGACTTTGATA+CGG + Chr8:78883570-78883589 MsG0880046832.01.T01:intron 25.0%
! CAGAAAAACAAATTATCCAT+CGG + Chr8:78882707-78882726 MsG0880046832.01.T01:CDS 25.0%
! CAGAAATATTCTTAACTTAC+AGG - Chr8:78883146-78883165 None:intergenic 25.0%
! CCTATAAAATCGATCTTTAA+GGG + Chr8:78883523-78883542 MsG0880046832.01.T01:intron 25.0%
! CGACCTATTTATAAACATTA+GGG - Chr8:78882615-78882634 None:intergenic 25.0%
! CTTCAAAAAAAAAAAAGGCT+TGG - Chr8:78883641-78883660 None:intergenic 25.0%
! GACAAATATTAGACATCAAT+TGG - Chr8:78882676-78882695 None:intergenic 25.0%
! GACCTATTTATAAACATTAG+GGG - Chr8:78882614-78882633 None:intergenic 25.0%
! GACTTCAGAATATCATATAA+TGG - Chr8:78884289-78884308 None:intergenic 25.0%
! GATTGTACTTTATTACCTTA+GGG + Chr8:78880955-78880974 MsG0880046832.01.T01:intron 25.0%
! GTAGTAATAGATGAAAAACT+TGG + Chr8:78883973-78883992 MsG0880046832.01.T01:intron 25.0%
! TAAAGGAATTAAGGAGTTAA+AGG - Chr8:78882106-78882125 None:intergenic 25.0%
! TCGACCTATTTATAAACATT+AGG - Chr8:78882616-78882635 None:intergenic 25.0%
! TCTATCCTATATCTCTTATA+AGG - Chr8:78883562-78883581 None:intergenic 25.0%
! TGACATGTTAATTTCATTTG+GGG + Chr8:78884396-78884415 MsG0880046832.01.T01:three_prime_UTR 25.0%
! TTAACTATCAATTTAAGCAC+TGG + Chr8:78883063-78883082 MsG0880046832.01.T01:intron 25.0%
! TTGATCTAAAAATCTATGAC+AGG + Chr8:78883457-78883476 MsG0880046832.01.T01:intron 25.0%
! TTGATGCTATCCTAAAATTT+GGG + Chr8:78883482-78883501 MsG0880046832.01.T01:intron 25.0%
! TTTCCTTGTAAAATTGAATG+TGG + Chr8:78884591-78884610 MsG0880046832.01.T01:three_prime_UTR 25.0%
! TTTGATGCTATCCTAAAATT+TGG + Chr8:78883481-78883500 MsG0880046832.01.T01:intron 25.0%
!! AATCCACATTCAATTTTACA+AGG - Chr8:78884597-78884616 None:intergenic 25.0%
!! GAAGTACTTTCTTATCTTAA+TGG + Chr8:78881768-78881787 MsG0880046832.01.T01:intron 25.0%
!! GTAAAATTGAATGTGGATTT+TGG + Chr8:78884598-78884617 MsG0880046832.01.T01:three_prime_UTR 25.0%
!! TCAATGATACAAAATCCTTT+TGG - Chr8:78883245-78883264 None:intergenic 25.0%
!! TGCAATTGTCAACAATTTTT+GGG + Chr8:78880315-78880334 MsG0880046832.01.T01:CDS 25.0%
!!! AAATGCTGTTTTGAAAATTC+TGG - Chr8:78880630-78880649 None:intergenic 25.0%
!!! AAGTTCTGGATTCTTTTTAT+CGG + Chr8:78881671-78881690 MsG0880046832.01.T01:intron 25.0%
!!! AATGAGTAAACATCACTTTT+TGG - Chr8:78882903-78882922 None:intergenic 25.0%
!!! CCTTAAAGATCGATTTTATA+GGG - Chr8:78883525-78883544 None:intergenic 25.0%
!!! CTTTAAGCTTTTGACTTTTT+TGG + Chr8:78882566-78882585 MsG0880046832.01.T01:intron 25.0%
!!! TATAAATAGGTCGATTTTTG+TGG + Chr8:78882622-78882641 MsG0880046832.01.T01:intron 25.0%
!!! TTTTGAAGAAGCTAAATTAG+TGG + Chr8:78883653-78883672 MsG0880046832.01.T01:intron 25.0%
AAACGAACGTATCCTTATTA+CGG + Chr8:78881919-78881938 MsG0880046832.01.T01:CDS 30.0%
AAACTGTTTGGTAAGTAAAC+AGG - Chr8:78880981-78881000 None:intergenic 30.0%
AAATATTCCACCGAGAATAA+CGG - Chr8:78883197-78883216 None:intergenic 30.0%
AACATCAACTCACTTGAATT+TGG - Chr8:78880895-78880914 None:intergenic 30.0%
AACCATTCGCAATATACAAT+TGG - Chr8:78880469-78880488 None:intergenic 30.0%
AAGCTTTGCAAATCCAAAAT+CGG - Chr8:78882785-78882804 None:intergenic 30.0%
AAGTAGTAGAATAGAGTCAA+GGG - Chr8:78884560-78884579 None:intergenic 30.0%
ACATCAACTCACTTGAATTT+GGG - Chr8:78880894-78880913 None:intergenic 30.0%
AGTAGTGCTTGTAACTTATA+AGG - Chr8:78883734-78883753 None:intergenic 30.0%
ATAAGTTACAAGCACTACTT+AGG + Chr8:78883735-78883754 MsG0880046832.01.T01:intron 30.0%
ATAGAAACAAGGACAAACAA+CGG - Chr8:78880827-78880846 None:intergenic 30.0%
CCAAACCTTATAAGAGATAT+AGG + Chr8:78883554-78883573 MsG0880046832.01.T01:intron 30.0%
CCCTATAAAATCGATCTTTA+AGG + Chr8:78883522-78883541 MsG0880046832.01.T01:intron 30.0%
CCTATATCTCTTATAAGGTT+TGG - Chr8:78883557-78883576 None:intergenic 30.0%
CTAAGGGATTAAAGGAATTA+AGG - Chr8:78882115-78882134 None:intergenic 30.0%
CTAATGTGTACCACTAAAAT+TGG + Chr8:78881743-78881762 MsG0880046832.01.T01:intron 30.0%
CTACTAGTTATCAAACTATG+AGG - Chr8:78880936-78880955 None:intergenic 30.0%
GAAACATTACAAATAGGAGA+AGG + Chr8:78881521-78881540 MsG0880046832.01.T01:CDS 30.0%
GAAATATAATGAAGGAAGTG+TGG + Chr8:78884061-78884080 MsG0880046832.01.T01:CDS 30.0%
GAGGAATTGTTCTACAAAAA+TGG + Chr8:78880407-78880426 MsG0880046832.01.T01:CDS 30.0%
GCAAATTCATATTCTAGTCA+TGG + Chr8:78880383-78880402 MsG0880046832.01.T01:CDS 30.0%
GGAATATTTGATATGAGTTG+CGG + Chr8:78883208-78883227 MsG0880046832.01.T01:intron 30.0%
GTTATCAAACTATGAGGTAA+AGG - Chr8:78880930-78880949 None:intergenic 30.0%
GTTCTACAAAAATGGAAATG+TGG + Chr8:78880415-78880434 MsG0880046832.01.T01:CDS 30.0%
TATAACTTAATAGCTGGCAA+TGG + Chr8:78883104-78883123 MsG0880046832.01.T01:intron 30.0%
TATCCTAAAATTTGGGCTTA+GGG + Chr8:78883489-78883508 MsG0880046832.01.T01:intron 30.0%
TCACAAAACTGACATGTAAA+GGG + Chr8:78883305-78883324 MsG0880046832.01.T01:intron 30.0%
TCCCCCTAATGTTTATAAAT+AGG + Chr8:78882609-78882628 MsG0880046832.01.T01:intron 30.0%
TTCATATCTCTAGTCAATGT+GGG + Chr8:78883359-78883378 MsG0880046832.01.T01:intron 30.0%
TTTACAGCTTCTTGCATTAA+AGG - Chr8:78884101-78884120 None:intergenic 30.0%
! AAAATGCCTGAAACACTTTT+AGG - Chr8:78884377-78884396 None:intergenic 30.0%
! AAGGTTTCGATGATCAATTT+TGG - Chr8:78881870-78881889 None:intergenic 30.0%
! ACATGCAGTGTACTTTTATT+TGG - Chr8:78882357-78882376 None:intergenic 30.0%
! ACTAATGCTGAATATCGTTT+TGG + Chr8:78882171-78882190 MsG0880046832.01.T01:intron 30.0%
! AGAATGACTTTTGCAGTTTA+TGG - Chr8:78884459-78884478 None:intergenic 30.0%
! AGTACTTCTACCAATTTTAG+TGG - Chr8:78881756-78881775 None:intergenic 30.0%
! AGTATTGAATGTGATGTTGT+AGG + Chr8:78882054-78882073 MsG0880046832.01.T01:intron 30.0%
! ATAAAATCGATCTTTAAGGG+AGG + Chr8:78883526-78883545 MsG0880046832.01.T01:intron 30.0%
! CTGCAATTGTCAACAATTTT+TGG + Chr8:78880314-78880333 MsG0880046832.01.T01:CDS 30.0%
! GATAATTTTGCCGTTATTCT+CGG + Chr8:78883184-78883203 MsG0880046832.01.T01:intron 30.0%
! GGTATGTTTTCATATACTCA+GGG - Chr8:78882872-78882891 None:intergenic 30.0%
! GTAGTCTTGATTATAAGTCT+TGG - Chr8:78883339-78883358 None:intergenic 30.0%
! TATGATTCTGATCTTTTTGC+AGG + Chr8:78884031-78884050 MsG0880046832.01.T01:intron 30.0%
! TGGTATGTTTTCATATACTC+AGG - Chr8:78882873-78882892 None:intergenic 30.0%
! TGTTCTCTTTGGACATTTTA+CGG + Chr8:78883832-78883851 MsG0880046832.01.T01:intron 30.0%
!! CATTCTGAAGTTTAGATTGT+GGG + Chr8:78884473-78884492 MsG0880046832.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
!! CCCTTAAAGATCGATTTTAT+AGG - Chr8:78883526-78883545 None:intergenic 30.0%
!! GAATATCGTTTTGGTATTGA+TGG + Chr8:78882180-78882199 MsG0880046832.01.T01:intron 30.0%
!! TCATTCTGAAGTTTAGATTG+TGG + Chr8:78884472-78884491 MsG0880046832.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
!! TTCAGTTAATTTGCCTTCAA+AGG + Chr8:78880682-78880701 MsG0880046832.01.T01:intron 30.0%
!! TTGCTTTTAGAAATTCTGAC+TGG + Chr8:78882930-78882949 MsG0880046832.01.T01:intron 30.0%
!! TTGTTTGTCCTTGTTTCTAT+GGG + Chr8:78880827-78880846 MsG0880046832.01.T01:CDS 30.0%
AAGAGCGAGTTACATTAAGA+TGG + Chr8:78882984-78883003 MsG0880046832.01.T01:CDS 35.0%
AATTAAGGAGTTAAAGGTCC+AGG - Chr8:78882100-78882119 None:intergenic 35.0%
ACACATTTCTACCAAAGTGA+AGG + Chr8:78882828-78882847 MsG0880046832.01.T01:CDS 35.0%
ACATTACAAATAGGAGAAGG+AGG + Chr8:78881524-78881543 MsG0880046832.01.T01:CDS 35.0%
ACATTAGAGTGAGAAAGTTC+TGG + Chr8:78881657-78881676 MsG0880046832.01.T01:intron 35.0%
ACGACATGACTTAATCATAC+AGG + Chr8:78881793-78881812 MsG0880046832.01.T01:intron 35.0%
ACTAGTCATTCAAAGGTAAG+AGG - Chr8:78881311-78881330 None:intergenic 35.0%
AGAAGACAGACAGATAGTTA+GGG + Chr8:78881083-78881102 MsG0880046832.01.T01:intron 35.0%
AGAGCGAGTTACATTAAGAT+GGG + Chr8:78882985-78883004 MsG0880046832.01.T01:CDS 35.0%
ATCAGAAACTGATGGTTCAA+AGG - Chr8:78881372-78881391 None:intergenic 35.0%
ATCAGTTTCTGATAAGATCC+CGG + Chr8:78881379-78881398 MsG0880046832.01.T01:CDS 35.0%
ATGGAGGGAGTAATGTTTAT+AGG + Chr8:78882646-78882665 MsG0880046832.01.T01:intron 35.0%
ATTCAGCATTAGTTCCACAT+GGG - Chr8:78882164-78882183 None:intergenic 35.0%
ATTTGGAGAATGGACACATA+TGG + Chr8:78883417-78883436 MsG0880046832.01.T01:intron 35.0%
ATTTGGATGTCTCTTTGGTA+TGG + Chr8:78880531-78880550 MsG0880046832.01.T01:CDS 35.0%
CAACAACTGTGTGTTAGATT+TGG + Chr8:78880514-78880533 MsG0880046832.01.T01:CDS 35.0%
CAAGTAGTAGAATAGAGTCA+AGG - Chr8:78884561-78884580 None:intergenic 35.0%
CTACTTGGCTATATTGACAA+AGG + Chr8:78881896-78881915 MsG0880046832.01.T01:CDS 35.0%
CTATCCTAAAATTTGGGCTT+AGG + Chr8:78883488-78883507 MsG0880046832.01.T01:intron 35.0%
CTCACAAAACTGACATGTAA+AGG + Chr8:78883304-78883323 MsG0880046832.01.T01:intron 35.0%
CTCCAATTGTATATTGCGAA+TGG + Chr8:78880464-78880483 MsG0880046832.01.T01:CDS 35.0%
CTTCATATCTCTAGTCAATG+TGG + Chr8:78883358-78883377 MsG0880046832.01.T01:intron 35.0%
CTTTGGTAGAAATGTGTGTA+TGG - Chr8:78882825-78882844 None:intergenic 35.0%
GAAGTTGTGTTACAGACAAA+GGG + Chr8:78880341-78880360 MsG0880046832.01.T01:CDS 35.0%
GCGTTCAGGAAATATAATGA+AGG + Chr8:78884053-78884072 MsG0880046832.01.T01:CDS 35.0%
GTTAGATTTGGATGTCTCTT+TGG + Chr8:78880526-78880545 MsG0880046832.01.T01:CDS 35.0%
GTTCATCACTAGTCATTCAA+AGG - Chr8:78881318-78881337 None:intergenic 35.0%
TATCCTTATTACGGAGTTTG+TGG + Chr8:78881928-78881947 MsG0880046832.01.T01:CDS 35.0%
TATTCAGCATTAGTTCCACA+TGG - Chr8:78882165-78882184 None:intergenic 35.0%
TCTTAACTTACAGGATCACT+TGG - Chr8:78883137-78883156 None:intergenic 35.0%
TGAAGTTGTGTTACAGACAA+AGG + Chr8:78880340-78880359 MsG0880046832.01.T01:CDS 35.0%
TGCAACTACAGTTCTTCAAA+GGG - Chr8:78883809-78883828 None:intergenic 35.0%
TGCTGTGAAGATGTTTGATT+TGG + Chr8:78884130-78884149 MsG0880046832.01.T01:CDS 35.0%
TGCTTGTAACTTATAAGGCT+TGG - Chr8:78883729-78883748 None:intergenic 35.0%
TGTGATGTGAAGGATTACTT+TGG + Chr8:78880488-78880507 MsG0880046832.01.T01:CDS 35.0%
TTCATATTCTAGTCATGGTG+AGG + Chr8:78880388-78880407 MsG0880046832.01.T01:CDS 35.0%
TTGAAGAGAAGATGAAAAGC+AGG + Chr8:78881227-78881246 MsG0880046832.01.T01:intron 35.0%
TTGAGTGCTTAAGAATGAAG+AGG - Chr8:78884007-78884026 None:intergenic 35.0%
TTGCAACTACAGTTCTTCAA+AGG - Chr8:78883810-78883829 None:intergenic 35.0%
TTTCTATGGGAAGAGAAGAA+AGG + Chr8:78880840-78880859 MsG0880046832.01.T01:CDS 35.0%
TTTGGAGAATGGACACATAT+GGG + Chr8:78883418-78883437 MsG0880046832.01.T01:intron 35.0%
! ATATAATGAAGGAAGTGTGG+TGG + Chr8:78884064-78884083 MsG0880046832.01.T01:CDS 35.0%
! CATTTGGGGTTTAATCTAGA+TGG + Chr8:78884410-78884429 MsG0880046832.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
! CTAAATTAGTGGACCCAAAT+TGG + Chr8:78883664-78883683 MsG0880046832.01.T01:intron 35.0%
! GATTTTGGATTTGCAAAGCT+TGG + Chr8:78882784-78882803 MsG0880046832.01.T01:CDS 35.0%
! GGAAGTGCAATCTATAACAA+TGG - Chr8:78881290-78881309 None:intergenic 35.0%
! GTTCTCTTTGGACATTTTAC+GGG + Chr8:78883833-78883852 MsG0880046832.01.T01:intron 35.0%
! TAGTTGCAACTTGTTCTCTT+TGG + Chr8:78883821-78883840 MsG0880046832.01.T01:intron 35.0%
!! ATAGGTCGATTTTTGTGGAA+TGG + Chr8:78882627-78882646 MsG0880046832.01.T01:intron 35.0%
!! ATCATGCCTAAAAGTGTTTC+AGG + Chr8:78884368-78884387 MsG0880046832.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
!! GTTGTTTGTCCTTGTTTCTA+TGG + Chr8:78880826-78880845 MsG0880046832.01.T01:CDS 35.0%
!! TTCATTTTAAGTCGCTGACA+AGG + Chr8:78881019-78881038 MsG0880046832.01.T01:intron 35.0%
AAAGGGTTGTGGCGATAATT+TGG + Chr8:78880358-78880377 MsG0880046832.01.T01:CDS 40.0%
AATCACGCCTTGAAATTGCA+AGG + Chr8:78882230-78882249 MsG0880046832.01.T01:CDS 40.0%
AATTGCAAGGATGTTGCACA+TGG + Chr8:78882243-78882262 MsG0880046832.01.T01:CDS 40.0%
ACTCTTCGAGAACATTTGGA+TGG + Chr8:78881959-78881978 MsG0880046832.01.T01:CDS 40.0%
AGAAACTGATGGTTCAAAGG+AGG - Chr8:78881369-78881388 None:intergenic 40.0%
AGACCTGACATGAAAACAGT+GGG + Chr8:78884186-78884205 MsG0880046832.01.T01:exon 40.0%
AGGATCGTACATTTGGAGAA+TGG + Chr8:78883407-78883426 MsG0880046832.01.T01:intron 40.0%
AGGTCATATCTCAGTAGAAG+TGG + Chr8:78883755-78883774 MsG0880046832.01.T01:intron 40.0%
ATTACATCTCAACCTGAGTC+AGG + Chr8:78881472-78881491 MsG0880046832.01.T01:CDS 40.0%
ATTACGGAGTTTGTGGCAAA+TGG + Chr8:78881935-78881954 MsG0880046832.01.T01:CDS 40.0%
ATTCTTCCCGGTACCAATTT+GGG - Chr8:78883680-78883699 None:intergenic 40.0%
CTTAATGTAACTCGCTCTTC+AGG - Chr8:78882983-78883002 None:intergenic 40.0%
CTTCTCTTCCCATAGAAACA+AGG - Chr8:78880838-78880857 None:intergenic 40.0%
GAACAATAATCGACGTCACA+AGG + Chr8:78880733-78880752 MsG0880046832.01.T01:CDS 40.0%
GAGAAGACAGACAGATAGTT+AGG + Chr8:78881082-78881101 MsG0880046832.01.T01:intron 40.0%
GCAACATCCTTGCAATTTCA+AGG - Chr8:78882240-78882259 None:intergenic 40.0%
GCAACTACAGTTCTTCAAAG+GGG - Chr8:78883808-78883827 None:intergenic 40.0%
GCTTTCAGTCAGAAGAATGT+TGG - Chr8:78882746-78882765 None:intergenic 40.0%
GGAGACATTGAGAATCTTGA+CGG - Chr8:78881431-78881450 None:intergenic 40.0%
GGATGTTACTGTTGTGTTCT+TGG + Chr8:78880283-78880302 MsG0880046832.01.T01:CDS 40.0%
GGCTGTAAAACGTGCAAAAA+GGG + Chr8:78881592-78881611 MsG0880046832.01.T01:CDS 40.0%
GGGATCTTATCAGAAACTGA+TGG - Chr8:78881380-78881399 None:intergenic 40.0%
GGTAGAGATAAACACACTAG+TGG - Chr8:78884539-78884558 None:intergenic 40.0%
GGTCATATCTCAGTAGAAGT+GGG + Chr8:78883756-78883775 MsG0880046832.01.T01:intron 40.0%
GTCATATCTCAGTAGAAGTG+GGG + Chr8:78883757-78883776 MsG0880046832.01.T01:intron 40.0%
GTGAACTAGTAATCGTGAGA+CGG + Chr8:78883917-78883936 MsG0880046832.01.T01:intron 40.0%
GTGTATGGTCGTTGTTTACA+GGG - Chr8:78882810-78882829 None:intergenic 40.0%
TACAAGGCTCATTTAGACGA+CGG + Chr8:78881560-78881579 MsG0880046832.01.T01:CDS 40.0%
TACCAAAGTGAAGGAACAGT+CGG + Chr8:78882837-78882856 MsG0880046832.01.T01:intron 40.0%
TAGACCTGACATGAAAACAG+TGG + Chr8:78884185-78884204 MsG0880046832.01.T01:exon 40.0%
TATAGCCAAGTAGCTTCACA+AGG - Chr8:78881889-78881908 None:intergenic 40.0%
TGAGCAATTGTGGGCAATAA+GGG + Chr8:78884209-78884228 MsG0880046832.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
TGGCTGTAAAACGTGCAAAA+AGG + Chr8:78881591-78881610 MsG0880046832.01.T01:CDS 40.0%
TGGTACTCTTCGAGAACATT+TGG + Chr8:78881955-78881974 MsG0880046832.01.T01:CDS 40.0%
TGGTTGAGCTAAGGGATTAA+AGG - Chr8:78882123-78882142 None:intergenic 40.0%
TGTGTATGGTCGTTGTTTAC+AGG - Chr8:78882811-78882830 None:intergenic 40.0%
TTCTCCAAATGTACGATCCT+AGG - Chr8:78883407-78883426 None:intergenic 40.0%
TTGCCACAAACTCCGTAATA+AGG - Chr8:78881934-78881953 None:intergenic 40.0%
TTTACGGGCATTTGCAACAT+GGG + Chr8:78883848-78883867 MsG0880046832.01.T01:intron 40.0%
TTTGCTCTTGCAGTGGAATT+AGG + Chr8:78881341-78881360 MsG0880046832.01.T01:CDS 40.0%
! AATTTTGCCGTTATTCTCGG+TGG + Chr8:78883187-78883206 MsG0880046832.01.T01:intron 40.0%
! AGACCCTAAGCCCAAATTTT+AGG - Chr8:78883495-78883514 None:intergenic 40.0%
! CAAATAGGAGAAGGAGGTTT+TGG + Chr8:78881530-78881549 MsG0880046832.01.T01:CDS 40.0%
! GAACAATTTTGCTCTTGCAG+TGG + Chr8:78881334-78881353 MsG0880046832.01.T01:CDS 40.0%
! TTTTACGGGCATTTGCAACA+TGG + Chr8:78883847-78883866 MsG0880046832.01.T01:intron 40.0%
!! AGCCAAGTTGGAATTTTTGC+GGG + Chr8:78880778-78880797 MsG0880046832.01.T01:CDS 40.0%
!! ATTGAGAATCTTGACGGACT+AGG - Chr8:78881425-78881444 None:intergenic 40.0%
!! CAGCCAAGTTGGAATTTTTG+CGG + Chr8:78880777-78880796 MsG0880046832.01.T01:CDS 40.0%
!! GTCGATTTTTGTGGAATGGA+GGG + Chr8:78882631-78882650 MsG0880046832.01.T01:intron 40.0%
!! GTTAATTTGCCTTCAAAGGC+AGG + Chr8:78880686-78880705 MsG0880046832.01.T01:intron 40.0%
!! TAGCTTTAGAAACCTGACTC+AGG - Chr8:78881487-78881506 None:intergenic 40.0%
!! TTCTCATGCTGTTCTGGAAA+AGG + Chr8:78880867-78880886 MsG0880046832.01.T01:CDS 40.0%
!!! AGGTTTTGGAACTGTCTACA+AGG + Chr8:78881544-78881563 MsG0880046832.01.T01:CDS 40.0%
!!! ATCGTTTTGGTATTGATGGC+AGG + Chr8:78882184-78882203 MsG0880046832.01.T01:intron 40.0%
!!! CATCACTTTTTGGAGTGAGA+TGG - Chr8:78882893-78882912 None:intergenic 40.0%
AAACAGTGGGTGAGCAATTG+TGG + Chr8:78884199-78884218 MsG0880046832.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
AACAGTGGGTGAGCAATTGT+GGG + Chr8:78884200-78884219 MsG0880046832.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
AACTTACAGGATCACTTGGC+TGG - Chr8:78883133-78883152 None:intergenic 45.0%
AGAATGGACACATATGGGTG+GGG + Chr8:78883423-78883442 MsG0880046832.01.T01:intron 45.0%
AGCATTAGTTCCACATGGGA+GGG - Chr8:78882160-78882179 None:intergenic 45.0%
AGCTCACTTGGTTGAGCTAA+GGG - Chr8:78882131-78882150 None:intergenic 45.0%
AGTTTCCTTCCTGCCTTTGA+AGG - Chr8:78880698-78880717 None:intergenic 45.0%
ATTTGCCTTCAAAGGCAGGA+AGG + Chr8:78880690-78880709 MsG0880046832.01.T01:CDS 45.0%
CAACGGCAAGAGAGAATGAT+TGG + Chr8:78884256-78884275 MsG0880046832.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
CACCCGCAAAAATTCCAACT+TGG - Chr8:78880783-78880802 None:intergenic 45.0%
CCTCAAGAGTAGTAGCACAA+CGG + Chr8:78884239-78884258 MsG0880046832.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
CGAAACCTTGTGAAGCTACT+TGG + Chr8:78881881-78881900 MsG0880046832.01.T01:CDS 45.0%
GACCTATCTCATCTGTATGC+AGG + Chr8:78882269-78882288 MsG0880046832.01.T01:intron 45.0%
GACCTGCATACAGATGAGAT+AGG - Chr8:78882274-78882293 None:intergenic 45.0%
GAGAATGGACACATATGGGT+GGG + Chr8:78883422-78883441 MsG0880046832.01.T01:intron 45.0%
GATTCTTCCCGGTACCAATT+TGG - Chr8:78883681-78883700 None:intergenic 45.0%
GTGAGCAATTGTGGGCAATA+AGG + Chr8:78884208-78884227 MsG0880046832.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
GTGTTACAGACAAAGGGTTG+TGG + Chr8:78880347-78880366 MsG0880046832.01.T01:CDS 45.0%
TAGCTCACTTGGTTGAGCTA+AGG - Chr8:78882132-78882151 None:intergenic 45.0%
TGAAGGAACAGTCGGCTATT+TGG + Chr8:78882845-78882864 MsG0880046832.01.T01:intron 45.0%
TGCGAATGGTTGTGATGTGA+AGG + Chr8:78880478-78880497 MsG0880046832.01.T01:CDS 45.0%
TGGATGATTTCACATCCCGA+TGG - Chr8:78882726-78882745 None:intergenic 45.0%
TGGTAAGTAAACAGGCCCTA+AGG - Chr8:78880973-78880992 None:intergenic 45.0%
TTAGGGGGAATTATGCATGC+AGG - Chr8:78882598-78882617 None:intergenic 45.0%
! GACTGAAGTCTGCTGAGTTT+TGG - Chr8:78881452-78881471 None:intergenic 45.0%
! GCGGACTGATTCAATCCAAA+AGG + Chr8:78883227-78883246 MsG0880046832.01.T01:intron 45.0%
! TAGTGGACCCAAATTGGTAC+CGG + Chr8:78883670-78883689 MsG0880046832.01.T01:intron 45.0%
! TCACCCACTGTTTTCATGTC+AGG - Chr8:78884192-78884211 None:intergenic 45.0%
! TGATCTTTTTGCAGGCGTTC+AGG + Chr8:78884039-78884058 MsG0880046832.01.T01:intron 45.0%
!! CAAGTTGGAATTTTTGCGGG+TGG + Chr8:78880781-78880800 MsG0880046832.01.T01:CDS 45.0%
!! CGAGCTAAAGTAGCCGATTT+TGG + Chr8:78882769-78882788 MsG0880046832.01.T01:CDS 45.0%
!! GGTCGATTTTTGTGGAATGG+AGG + Chr8:78882630-78882649 MsG0880046832.01.T01:intron 45.0%
!! TTTACATAATAAATATTAAA+GGG - Chr8:78882303-78882322 None:intergenic 5.0%
AGCCGACTGTTCCTTCACTT+TGG - Chr8:78882842-78882861 None:intergenic 50.0%
AGTGGACCCAAATTGGTACC+GGG + Chr8:78883671-78883690 MsG0880046832.01.T01:intron 50.0%
CAAGTGTCAAGCAGCCAAGT+TGG + Chr8:78880766-78880785 MsG0880046832.01.T01:CDS 50.0%
CACGCCTAGGATCGTACATT+TGG + Chr8:78883400-78883419 MsG0880046832.01.T01:intron 50.0%
CAGCAGTGAAGTCGAACTTC+TGG + Chr8:78881844-78881863 MsG0880046832.01.T01:CDS 50.0%
CAGCATTAGTTCCACATGGG+AGG - Chr8:78882161-78882180 None:intergenic 50.0%
GAATCGAACCTGAGACCTTG+AGG + Chr8:78883696-78883715 MsG0880046832.01.T01:intron 50.0%
GCAGGTTGCGTGGAAAAATC+TGG + Chr8:78882202-78882221 MsG0880046832.01.T01:intron 50.0%
GCATTAGTTCCACATGGGAG+GGG - Chr8:78882159-78882178 None:intergenic 50.0%
GGAGAATGGACACATATGGG+TGG + Chr8:78883421-78883440 MsG0880046832.01.T01:intron 50.0%
GGCAACTTCTCATGCTGTTC+TGG + Chr8:78880861-78880880 MsG0880046832.01.T01:CDS 50.0%
GTCTCAGGTTCGATTCTTCC+CGG - Chr8:78883692-78883711 None:intergenic 50.0%
TCGTCCTGTGGAGCTGAAAA+AGG + Chr8:78882956-78882975 MsG0880046832.01.T01:CDS 50.0%
TTAAAGGTCCAGGTTCGCCA+TGG - Chr8:78882090-78882109 None:intergenic 50.0%
TTGTAGGTTCTCCCTTGCCA+TGG + Chr8:78882070-78882089 MsG0880046832.01.T01:intron 50.0%
! CACGTTTTACAGCCACAACC+AGG - Chr8:78881586-78881605 None:intergenic 50.0%
! CCGTTGTGCTACTACTCTTG+AGG - Chr8:78884242-78884261 None:intergenic 50.0%
! TTTTCAGCTCCACAGGACGA+CGG - Chr8:78882956-78882975 None:intergenic 50.0%
!! GAGAATCTTGACGGACTAGG+TGG - Chr8:78881422-78881441 None:intergenic 50.0%
!! TTTTGCGGGTGGAGCTTTGT+TGG + Chr8:78880792-78880811 MsG0880046832.01.T01:CDS 50.0%
!!! AGGACCTTTTTCAGCTCCAC+AGG - Chr8:78882963-78882982 None:intergenic 50.0%
AGGCTTGGATCTCCTCCTCA+AGG - Chr8:78883714-78883733 None:intergenic 55.0%
GATCTCCTCCTCAAGGTCTC+AGG - Chr8:78883707-78883726 None:intergenic 55.0%
GTACGATCCTAGGCGTGAGA+GGG - Chr8:78883397-78883416 None:intergenic 55.0%
TAGTTCCACATGGGAGGGGT+GGG - Chr8:78882155-78882174 None:intergenic 55.0%
TCGAACCTGAGACCTTGAGG+AGG + Chr8:78883699-78883718 MsG0880046832.01.T01:intron 55.0%
TGTACGATCCTAGGCGTGAG+AGG - Chr8:78883398-78883417 None:intergenic 55.0%
TTAGTTCCACATGGGAGGGG+TGG - Chr8:78882156-78882175 None:intergenic 55.0%
TTTAGACGACGGCCTGGTTG+TGG + Chr8:78881571-78881590 MsG0880046832.01.T01:CDS 55.0%
! AGATCCCGGCTAGTCCACTT+CGG + Chr8:78881393-78881412 MsG0880046832.01.T01:CDS 55.0%
!! GGTATTGATGGCAGGTTGCG+TGG + Chr8:78882192-78882211 MsG0880046832.01.T01:intron 55.0%
ATGCACACCCTCTCACGCCT+AGG + Chr8:78883387-78883406 MsG0880046832.01.T01:intron 60.0%
GGCTCATTTAGACGACGGCC+TGG + Chr8:78881565-78881584 MsG0880046832.01.T01:CDS 60.0%
GTCCAGGTTCGCCATGGCAA+GGG - Chr8:78882084-78882103 None:intergenic 60.0%
! GATCCCGGCTAGTCCACTTC+GGG + Chr8:78881394-78881413 MsG0880046832.01.T01:CDS 60.0%
AGCTACCCACCCCTCCCATG+TGG + Chr8:78882147-78882166 MsG0880046832.01.T01:intron 65.0%
CTCCCTTGCCATGGCGAACC+TGG + Chr8:78882079-78882098 MsG0880046832.01.T01:intron 65.0%
GGACTAGGTGGCACCCGAAG+TGG - Chr8:78881410-78881429 None:intergenic 65.0%
GGAGGGGTGGGTAGCTCACT+TGG - Chr8:78882143-78882162 None:intergenic 65.0%
GGTCCAGGTTCGCCATGGCA+AGG - Chr8:78882085-78882104 None:intergenic 65.0%
! TCTGACTGGCCGTCGTCCTG+TGG + Chr8:78882944-78882963 MsG0880046832.01.T01:CDS 65.0%
!! GCACCCGAAGTGGACTAGCC+GGG - Chr8:78881400-78881419 None:intergenic 65.0%
!! GGCACCCGAAGTGGACTAGC+CGG - Chr8:78881401-78881420 None:intergenic 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr8 gene 78880281 78884621 78880281 ID=MsG0880046832.01;Name=MsG0880046832.01
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Protein sequence

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