AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880042878.01

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MsG0880042878.01.T01 AT3G24540 26.946 334 205 9 309 617 137 456 2.65e-26 113
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MsG0880042878.01.T01 AT3G13380 31.939 263 151 7 336 576 838 1094 2.92e-26 115
MsG0880042878.01.T01 AT5G07280 28.974 390 211 15 280 617 814 1189 5.06e-26 114
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MsG0880042878.01.T01 AT2G18470 29.766 299 169 10 346 617 272 556 8.18e-24 107
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MsG0880042878.01.T01 AT1G61360 28.986 276 172 7 292 549 346 615 3.25e-23 105
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MsG0880042878.01.T01 AT3G46420 29.123 285 170 9 353 617 528 800 7.25e-21 98.2
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MsG0880042878.01.T01 AT2G43230 25.896 251 161 5 350 576 137 386 7.55e-21 96.3
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MsG0880042878.01.T01 AT2G04300 26.426 333 207 12 307 617 535 851 7.64e-21 98.2
MsG0880042878.01.T01 AT4G23190 26.316 323 203 8 294 591 290 602 7.97e-21 97.8
MsG0880042878.01.T01 AT2G04300 26.426 333 207 12 307 617 494 810 8.30e-21 97.8
MsG0880042878.01.T01 AT5G18500 28.328 293 180 8 346 617 154 437 8.39e-21 96.7
MsG0880042878.01.T01 AT5G18500 28.328 293 180 8 346 617 154 437 8.39e-21 96.7
MsG0880042878.01.T01 AT5G18500 28.328 293 180 8 346 617 154 437 8.39e-21 96.7
MsG0880042878.01.T01 AT5G18500 28.328 293 180 8 346 617 154 437 8.39e-21 96.7
MsG0880042878.01.T01 AT5G18500 28.328 293 180 8 346 617 154 437 8.39e-21 96.7
MsG0880042878.01.T01 AT5G18500 28.328 293 180 8 346 617 154 437 8.39e-21 96.7
MsG0880042878.01.T01 AT5G49770 26.936 297 184 8 343 617 619 904 8.41e-21 98.2
MsG0880042878.01.T01 AT2G25220 27.841 352 207 13 313 627 85 426 8.46e-21 96.3
MsG0880042878.01.T01 AT1G07870 28.727 275 169 8 342 593 87 357 8.58e-21 97.1
MsG0880042878.01.T01 AT4G21230 27.660 329 198 11 286 586 261 577 9.06e-21 97.4
MsG0880042878.01.T01 AT3G13690 29.961 257 147 9 344 576 397 644 9.10e-21 97.8
MsG0880042878.01.T01 AT3G13690 29.961 257 147 9 344 576 397 644 9.10e-21 97.8
MsG0880042878.01.T01 AT3G13690 29.961 257 147 9 344 576 397 644 9.10e-21 97.8
MsG0880042878.01.T01 AT5G62230 25.723 346 226 10 297 621 535 870 9.13e-21 97.8
MsG0880042878.01.T01 AT5G62230 25.723 346 226 10 297 621 583 918 9.55e-21 97.8
MsG0880042878.01.T01 AT4G13190 29.565 230 145 5 339 555 52 277 9.84e-21 93.6
MsG0880042878.01.T01 AT4G23230 26.582 316 195 9 294 587 277 577 9.95e-21 97.1
MsG0880042878.01.T01 AT5G61480 28.839 267 163 9 370 613 731 993 1.05e-20 97.8
MsG0880042878.01.T01 AT5G38990 26.962 293 192 7 344 617 511 800 1.14e-20 97.4
MsG0880042878.01.T01 AT1G28440 27.988 343 184 17 299 599 620 941 1.14e-20 97.8
MsG0880042878.01.T01 AT1G61610 30.734 218 132 6 345 549 512 723 1.28e-20 97.1
MsG0880042878.01.T01 AT4G23190 26.316 323 203 8 294 591 212 524 1.28e-20 96.7
MsG0880042878.01.T01 AT4G23190 26.316 323 203 8 294 591 212 524 1.28e-20 96.7
MsG0880042878.01.T01 AT3G45420 25.965 285 178 8 336 599 328 600 1.32e-20 97.1
MsG0880042878.01.T01 AT3G26700 27.219 338 215 14 316 632 36 363 1.34e-20 94.7
MsG0880042878.01.T01 AT3G26700 27.219 338 215 14 316 632 36 363 1.34e-20 94.7
MsG0880042878.01.T01 AT3G26700 27.219 338 215 14 316 632 36 363 1.34e-20 94.7
MsG0880042878.01.T01 AT5G39000 26.599 297 188 7 344 617 504 793 1.34e-20 97.4
MsG0880042878.01.T01 AT3G28690 26.101 318 182 10 340 620 8 309 1.37e-20 94.7
MsG0880042878.01.T01 AT3G25560 25.826 333 197 9 291 591 246 560 1.43e-20 96.7
MsG0880042878.01.T01 AT3G25560 25.826 333 197 9 291 591 245 559 1.50e-20 96.7
MsG0880042878.01.T01 AT3G14840 26.690 281 176 8 332 591 650 921 1.50e-20 97.4
MsG0880042878.01.T01 AT3G20530 29.018 224 143 5 345 555 69 289 1.59e-20 93.2
MsG0880042878.01.T01 AT2G24370 26.023 342 212 9 341 658 463 787 1.68e-20 97.1
MsG0880042878.01.T01 AT2G25220 28.758 306 187 10 343 627 136 431 1.71e-20 95.1
MsG0880042878.01.T01 AT3G59350 30.303 165 112 2 350 512 105 268 1.74e-20 92.8
MsG0880042878.01.T01 AT5G49780 26.168 321 209 9 343 643 519 831 1.81e-20 97.1
MsG0880042878.01.T01 AT5G49780 26.168 321 209 9 343 643 640 952 1.81e-20 97.1
MsG0880042878.01.T01 AT3G25560 25.826 333 197 9 291 591 245 559 1.93e-20 96.3
MsG0880042878.01.T01 AT2G23950 28.309 272 161 6 344 591 285 546 1.96e-20 96.3
MsG0880042878.01.T01 AT3G21340 28.024 339 202 15 341 654 577 898 2.30e-20 96.7
MsG0880042878.01.T01 AT5G55830 23.718 312 207 6 286 583 299 593 2.39e-20 96.3
MsG0880042878.01.T01 AT3G03770 28.070 285 163 11 344 601 463 732 2.48e-20 96.3
MsG0880042878.01.T01 AT3G03770 28.070 285 163 11 344 601 463 732 2.48e-20 96.3
MsG0880042878.01.T01 AT3G03770 28.070 285 163 11 344 601 463 732 2.48e-20 96.3
MsG0880042878.01.T01 AT5G18910 26.667 270 166 6 325 576 165 420 2.62e-20 95.1
MsG0880042878.01.T01 AT3G28690 25.472 318 184 9 340 620 108 409 2.95e-20 94.7
MsG0880042878.01.T01 AT2G45340 27.852 298 185 10 345 623 404 690 3.02e-20 95.9
MsG0880042878.01.T01 AT4G04490 28.926 242 148 7 354 577 336 571 3.04e-20 95.9
MsG0880042878.01.T01 AT1G11280 26.592 267 174 8 260 510 391 651 3.04e-20 95.9
MsG0880042878.01.T01 AT5G57670 26.689 296 179 9 346 611 255 542 3.04e-20 95.5
MsG0880042878.01.T01 AT1G09970 26.421 299 176 8 286 555 602 885 3.18e-20 96.3
MsG0880042878.01.T01 AT1G69790 24.691 324 205 9 344 638 70 383 3.24e-20 93.6
MsG0880042878.01.T01 AT2G23950 29.778 225 134 4 344 554 285 499 3.33e-20 95.1
MsG0880042878.01.T01 AT5G18610 27.632 304 189 8 346 626 71 366 3.39e-20 95.1
MsG0880042878.01.T01 AT5G18610 27.632 304 189 8 346 626 71 366 3.39e-20 95.1
MsG0880042878.01.T01 AT5G18610 27.632 304 189 8 346 626 71 366 3.39e-20 95.1
MsG0880042878.01.T01 AT4G35030 27.679 224 143 5 344 553 90 308 3.40e-20 92.8
MsG0880042878.01.T01 AT3G28690 26.101 318 182 10 340 620 57 358 3.47e-20 94.0
MsG0880042878.01.T01 AT1G69790 24.691 324 205 9 344 638 59 372 3.48e-20 93.6
MsG0880042878.01.T01 AT1G61380 26.300 327 202 10 240 549 235 539 3.56e-20 95.5
MsG0880042878.01.T01 AT1G61550 26.708 322 193 9 260 549 377 687 3.64e-20 95.9
MsG0880042878.01.T01 AT1G29730 28.571 273 165 8 342 591 624 889 3.87e-20 95.9
MsG0880042878.01.T01 AT4G21390 25.381 394 231 13 229 574 382 760 3.96e-20 95.9
MsG0880042878.01.T01 AT1G51880 27.507 349 204 15 293 617 529 852 4.15e-20 95.9

Find 97 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 166 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CATTAGCCTTGAAGAAAATT+AGG 0.146614 8:-15304303 MsG0880042878.01.T01:CDS
TTCACAAAACTATCCCATTT+TGG 0.179883 8:-15306552 MsG0880042878.01.T01:CDS
ATCTGAAAAGAATTCCAAAA+TGG 0.246039 8:+15306538 None:intergenic
AGAAATGTTGCATCAATTCT+TGG 0.256648 8:-15304736 MsG0880042878.01.T01:CDS
TCTGTCAAGATTGCAGGATT+TGG 0.281003 8:-15304469 MsG0880042878.01.T01:CDS
TTTAGGTTATGATGGAATAT+TGG 0.305264 8:+15304523 None:intergenic
TGTGAAACAGTTAATCTTCC+TGG 0.324605 8:-15306353 MsG0880042878.01.T01:CDS
CACTTTCTGATCATAGTATA+TGG 0.325314 8:-15306286 MsG0880042878.01.T01:CDS
ATTAGCCTTGAAGAAAATTA+GGG 0.333733 8:-15304302 MsG0880042878.01.T01:CDS
TGTTGGAGGGAAGAAGTTAA+AGG 0.336350 8:+15306749 None:intergenic
GGAAGATGCAACTAGACTTT+AGG 0.341911 8:+15304506 None:intergenic
TGTCGACACGATGAGGTTCC+TGG 0.343963 8:+15306497 None:intergenic
AGGTAAAAGAGGGGTAAAAT+TGG 0.345065 8:-15306180 MsG0880042878.01.T01:CDS
GTGAATGCTACAGCAGTTAA+AGG 0.345149 8:-15306101 MsG0880042878.01.T01:CDS
ACAATGTTTGCTGGTGTTCT+TGG 0.346727 8:-15304862 MsG0880042878.01.T01:CDS
TGCTCGGAATCGAACATTCC+TGG 0.362521 8:+15305009 None:intergenic
TTCCTTTCCATCCTTGATAC+AGG 0.377208 8:+15305305 None:intergenic
AGAGGGGTAAAATTGGAGTT+TGG 0.377347 8:-15306173 MsG0880042878.01.T01:CDS
TTGACAAAAGATAGTGTTGA+TGG 0.380200 8:-15304115 MsG0880042878.01.T01:CDS
TACAACGATTTGAATTCATT+TGG 0.386874 8:-15306473 MsG0880042878.01.T01:CDS
AAGATAGAATAGTGTAACTA+AGG 0.387599 8:+15305050 None:intergenic
CAAGGAACATTCATAGAATC+AGG 0.388821 8:+15304019 None:intergenic
TCCTTCAAATGGTACCTTAG+AGG 0.391547 8:-15304668 MsG0880042878.01.T01:CDS
GATCATAGTATATGGCATAT+TGG 0.392207 8:-15306278 MsG0880042878.01.T01:CDS
TGACATAGGTTTGTTGCTAC+TGG 0.398165 8:-15304362 MsG0880042878.01.T01:CDS
AGTGTTGGTGGTGGTTCTCT+TGG 0.406551 8:-15306320 MsG0880042878.01.T01:CDS
ACAAGATGTTTGCTGTTTAG+TGG 0.414552 8:-15304184 MsG0880042878.01.T01:CDS
GATTGATGTTGCTAGGGAAT+TGG 0.417141 8:-15304143 MsG0880042878.01.T01:CDS
AACTTGGTTTACATTGGTAT+AGG 0.418779 8:-15304609 MsG0880042878.01.T01:CDS
TATCTACGGAACAAATCAAT+TGG 0.435558 8:-15304335 MsG0880042878.01.T01:CDS
TTGGTGTAAATGATCCTCTA+AGG 0.438830 8:+15304654 None:intergenic
TTTGCTGGTGTTCTTGGTGA+TGG 0.443512 8:-15304856 MsG0880042878.01.T01:CDS
AAGGAGGCAACAATAAGAAC+TGG 0.449941 8:+15305069 None:intergenic
AATTGGAGTTTGGTATTCCT+AGG 0.451627 8:-15306163 MsG0880042878.01.T01:CDS
GTTTATGAATATCCTTCAAA+TGG 0.461057 8:-15304679 MsG0880042878.01.T01:CDS
AAGGATGGAAAGGAAGCATA+TGG 0.461859 8:-15305297 MsG0880042878.01.T01:CDS
GTATCAGTTGATAATGTTGT+TGG 0.471810 8:-15306416 MsG0880042878.01.T01:CDS
TCTGAAAAGAATTCCAAAAT+GGG 0.477383 8:+15306539 None:intergenic
AACTAGACTTTAGGTTATGA+TGG 0.481273 8:+15304515 None:intergenic
TGTTTGCTGTTTAGTGGAGA+TGG 0.486378 8:-15304178 MsG0880042878.01.T01:CDS
GGTTTGTTAGTAGACTTTCC+AGG 0.486530 8:-15306515 MsG0880042878.01.T01:CDS
CGGTGGCTTCCTCTAGCTCA+TGG 0.486810 8:+15304929 None:intergenic
TCCTCTAAGGTACCATTTGA+AGG 0.488600 8:+15304667 None:intergenic
TTGTTGATGTAGAAAGGAAA+TGG 0.488866 8:+15306650 None:intergenic
AAGTCTAGTTGCATCTTCCT+AGG 0.491087 8:-15304502 MsG0880042878.01.T01:CDS
TTTGATGGAAGAAACTACTT+TGG 0.495817 8:-15306440 MsG0880042878.01.T01:CDS
AGGTTATGATGGAATATTGG+AGG 0.504906 8:+15304526 None:intergenic
TTGTGCTAAGAATGCAGAAA+TGG 0.511558 8:-15306123 MsG0880042878.01.T01:CDS
GTTAATCTTCCTGGTTGTGA+TGG 0.512359 8:-15306344 MsG0880042878.01.T01:CDS
TTTAGTGGAGATGGAAAGAT+GGG 0.514266 8:-15304169 MsG0880042878.01.T01:CDS
CCTGGTTGTGATGGAAGTGT+TGG 0.515995 8:-15306335 MsG0880042878.01.T01:CDS
TTGCTACTGGAGATTATCTA+CGG 0.516675 8:-15304349 MsG0880042878.01.T01:CDS
GTTTGTCAAGATGGATATGT+TGG 0.519661 8:-15306065 MsG0880042878.01.T01:CDS
TTCTATGTACAATTGCAGAT+AGG 0.521526 8:+15304755 None:intergenic
AAACTCATGCAATGCAATAA+CGG 0.521526 8:-15304886 MsG0880042878.01.T01:CDS
CAGCAGTTAAAGGTGGCATA+AGG 0.523593 8:-15306091 MsG0880042878.01.T01:CDS
TCCCACTGCAGCCTGTATCA+AGG 0.524024 8:-15305316 MsG0880042878.01.T01:intron
GGTTGTGATGGAAGTGTTGG+TGG 0.529654 8:-15306332 MsG0880042878.01.T01:CDS
TGGATGAATTTGAGCAAGAG+AGG 0.537451 8:+15306594 None:intergenic
CAAGATGGATATGTTGGTGA+TGG 0.539524 8:-15306059 MsG0880042878.01.T01:CDS
ATCTCCTTAGAAAAGTTCCT+AGG 0.547728 8:+15306146 None:intergenic
AGTATATGGCATATTGGTGA+AGG 0.547804 8:-15306272 MsG0880042878.01.T01:CDS
TGTAGAAAGGAAATGGAACA+TGG 0.548693 8:+15306657 None:intergenic
GGGTCTTATTCAGGTAAAAG+AGG 0.548985 8:-15306191 MsG0880042878.01.T01:CDS
GAAGTGTTGTTGATGTAGAA+AGG 0.556079 8:+15306644 None:intergenic
TGTGATGGAAGTGTTGGTGG+TGG 0.557424 8:-15306329 MsG0880042878.01.T01:CDS
GGTCTTATTCAGGTAAAAGA+GGG 0.565035 8:-15306190 MsG0880042878.01.T01:CDS
GTTGTGGTAATAAGCTTGCT+CGG 0.566171 8:+15304993 None:intergenic
TGTTCGTGATAATTAAGAAG+TGG 0.567702 8:+15304253 None:intergenic
ATGAATTTGAGCAAGAGAGG+TGG 0.568326 8:+15306597 None:intergenic
AATAACGGCACAATGTTTGC+TGG 0.570444 8:-15304871 MsG0880042878.01.T01:CDS
TGGGAATGATTGATGTTGCT+AGG 0.572928 8:-15304150 MsG0880042878.01.T01:CDS
CACCAAAAGTTCCAAAACAT+AGG 0.574813 8:-15304637 MsG0880042878.01.T01:CDS
ACTGCAGCCTGTATCAAGGA+TGG 0.583727 8:-15305312 MsG0880042878.01.T01:intron
CATATACTATGATCAGAAAG+TGG 0.584121 8:+15306287 None:intergenic
TTCTAACTACACTCCTCTAG+TGG 0.585166 8:-15304701 MsG0880042878.01.T01:CDS
ACAAAAGATAGTGTTGATGG+AGG 0.588882 8:-15304112 MsG0880042878.01.T01:CDS
GGGAATGATTGATGTTGCTA+GGG 0.589178 8:-15304149 MsG0880042878.01.T01:CDS
GCCTTGAAGAAAATTAGGGA+TGG 0.589590 8:-15304298 MsG0880042878.01.T01:CDS
AATTCATGCAATGAAACATG+TGG 0.592430 8:-15306686 MsG0880042878.01.T01:CDS
GTTTAGTGGAGATGGAAAGA+TGG 0.593878 8:-15304170 MsG0880042878.01.T01:CDS
ACTAAACAGCAAACATCTTG+TGG 0.598638 8:+15304186 None:intergenic
GTATATGGCATATTGGTGAA+GGG 0.605880 8:-15306271 MsG0880042878.01.T01:CDS
ATAAGGTGTGTTTGTCAAGA+TGG 0.608090 8:-15306074 MsG0880042878.01.T01:CDS
AGCCTGTATCAAGGATGGAA+AGG 0.609223 8:-15305307 MsG0880042878.01.T01:CDS
ATAGAATAGTGTAACTAAGG+AGG 0.617758 8:+15305053 None:intergenic
GGATATTCATAAACCACTAG+AGG 0.622942 8:+15304688 None:intergenic
ACAGCAAACATCTTGTGGCA+AGG 0.626070 8:+15304191 None:intergenic
ATTCAGCCACCATGAGCTAG+AGG 0.630323 8:-15304938 MsG0880042878.01.T01:CDS
GAGCTAGAGGAAGCCACCGA+TGG 0.632480 8:-15304925 MsG0880042878.01.T01:CDS
CCAACACTTCCATCACAACC+AGG 0.640725 8:+15306335 None:intergenic
TAGTAACAAAAGATTTCATG+AGG 0.644140 8:+15306798 None:intergenic
GTTGATGGAGGAAATGTGAA+AGG 0.655390 8:-15304100 MsG0880042878.01.T01:CDS
GTTGTACTGTCGACACGATG+AGG 0.667307 8:+15306490 None:intergenic
AATGCTACAGCAGTTAAAGG+TGG 0.685014 8:-15306098 MsG0880042878.01.T01:CDS
GTCTTATTCAGGTAAAAGAG+GGG 0.692973 8:-15306189 MsG0880042878.01.T01:CDS
TGGCTTCCTCTAGCTCATGG+TGG 0.714315 8:+15304932 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! TCTTATGTATATAAGTTATA+AGG - Chr8:15304918-15304937 MsG0880042878.01.T01:CDS 15.0%
!! AATACATAATGATGTTGAAA+AGG + Chr8:15304842-15304861 None:intergenic 20.0%
!! ATACATAATGATGTTGAAAA+GGG + Chr8:15304841-15304860 None:intergenic 20.0%
!! TTATGCAGATTATCAAAATA+AGG + Chr8:15304877-15304896 None:intergenic 20.0%
!!! TTTTGCTATCATAAAGTAAT+TGG - Chr8:15305647-15305666 MsG0880042878.01.T01:intron 20.0%
! AAAAATGATGTCTATGACAT+AGG - Chr8:15306457-15306476 MsG0880042878.01.T01:CDS 25.0%
! AAATTTCGCCTTAATAGTTT+AGG + Chr8:15305219-15305238 None:intergenic 25.0%
! AAGACATGATCAAAGAAAAA+TGG - Chr8:15305577-15305596 MsG0880042878.01.T01:intron 25.0%
! AAGATAGAATAGTGTAACTA+AGG + Chr8:15305786-15305805 None:intergenic 25.0%
! ATCTGAAAAGAATTCCAAAA+TGG + Chr8:15304298-15304317 None:intergenic 25.0%
! GTTTATGAATATCCTTCAAA+TGG - Chr8:15306154-15306173 MsG0880042878.01.T01:CDS 25.0%
! TACAACGATTTGAATTCATT+TGG - Chr8:15304360-15304379 MsG0880042878.01.T01:CDS 25.0%
! TAGTAACAAAAGATTTCATG+AGG + Chr8:15304038-15304057 None:intergenic 25.0%
! TCTGAAAAGAATTCCAAAAT+GGG + Chr8:15304297-15304316 None:intergenic 25.0%
!! ATCTTTATCGATTGCATAAA+TGG - Chr8:15305398-15305417 MsG0880042878.01.T01:intron 25.0%
!! TGGCTCTATTTAGAAATTAA+TGG + Chr8:15305134-15305153 None:intergenic 25.0%
!! TTCCAAATTTTCTTCCTTTT+AGG + Chr8:15305475-15305494 None:intergenic 25.0%
!! TTTAGGTTATGATGGAATAT+TGG + Chr8:15306313-15306332 None:intergenic 25.0%
!!! ATTAGCCTTGAAGAAAATTA+GGG - Chr8:15306531-15306550 MsG0880042878.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATTTTGGAATTCTTTTCAGA+TGG - Chr8:15304297-15304316 MsG0880042878.01.T01:CDS 25.0%
!!! GTTTCATTGCATGAATTTTT+TGG + Chr8:15304144-15304163 None:intergenic 25.0%
!!! TGAACCTATTTTGATCAAAA+GGG + Chr8:15304265-15304284 None:intergenic 25.0%
AAACTCATGCAATGCAATAA+CGG - Chr8:15305947-15305966 MsG0880042878.01.T01:intron 30.0%
AACTTGGTTTACATTGGTAT+AGG - Chr8:15306224-15306243 MsG0880042878.01.T01:CDS 30.0%
AATTCATGCAATGAAACATG+TGG - Chr8:15304147-15304166 MsG0880042878.01.T01:CDS 30.0%
AGAAAAATGGTTATCATTGC+TGG - Chr8:15305590-15305609 MsG0880042878.01.T01:intron 30.0%
AGAAATGTTGCATCAATTCT+TGG - Chr8:15306097-15306116 MsG0880042878.01.T01:CDS 30.0%
ATAGAATAGTGTAACTAAGG+AGG + Chr8:15305783-15305802 None:intergenic 30.0%
CAAAACATAGGACAAAAACT+TGG - Chr8:15306208-15306227 MsG0880042878.01.T01:CDS 30.0%
CACTTTCTGATCATAGTATA+TGG - Chr8:15304547-15304566 MsG0880042878.01.T01:CDS 30.0%
CATATACTATGATCAGAAAG+TGG + Chr8:15304549-15304568 None:intergenic 30.0%
CATGAGATTGACATAATAGA+AGG + Chr8:15305715-15305734 None:intergenic 30.0%
CTAAAAAGAAAACAAAAGCC+AGG - Chr8:15305806-15305825 MsG0880042878.01.T01:intron 30.0%
CTCCTAAAAGGAAGAAAATT+TGG - Chr8:15305470-15305489 MsG0880042878.01.T01:intron 30.0%
GAATACATCAAGCAATACTT+AGG + Chr8:15305499-15305518 None:intergenic 30.0%
GACAAAAACTTGGTTTACAT+TGG - Chr8:15306218-15306237 MsG0880042878.01.T01:CDS 30.0%
GATCATAGTATATGGCATAT+TGG - Chr8:15304555-15304574 MsG0880042878.01.T01:CDS 30.0%
TACATGTTGAATGAAGTCAA+CGG + Chr8:15305099-15305118 None:intergenic 30.0%
TATCTACGGAACAAATCAAT+TGG - Chr8:15306498-15306517 MsG0880042878.01.T01:CDS 30.0%
TATGATATAAGCACTTATGC+AGG - Chr8:15305263-15305282 MsG0880042878.01.T01:CDS 30.0%
TGAAACTGCAAATAAAAGCA+TGG - Chr8:15305162-15305181 MsG0880042878.01.T01:intron 30.0%
TGTTCGTGATAATTAAGAAG+TGG + Chr8:15306583-15306602 None:intergenic 30.0%
TTCTATGTACAATTGCAGAT+AGG + Chr8:15306081-15306100 None:intergenic 30.0%
TTGTTGATGTAGAAAGGAAA+TGG + Chr8:15304186-15304205 None:intergenic 30.0%
TTTGATGGAAGAAACTACTT+TGG - Chr8:15304393-15304412 MsG0880042878.01.T01:CDS 30.0%
! AACTAGACTTTAGGTTATGA+TGG + Chr8:15306321-15306340 None:intergenic 30.0%
! ATTTTCTTCAAGGCTAATGT+AGG + Chr8:15306529-15306548 None:intergenic 30.0%
! CAAGTTTTTGTCCTATGTTT+TGG + Chr8:15306210-15306229 None:intergenic 30.0%
! CTCTAAACTAGCTTATGTAA+AGG - Chr8:15305354-15305373 MsG0880042878.01.T01:intron 30.0%
! TATTCCTAGGAACTTTTCTA+AGG - Chr8:15304683-15304702 MsG0880042878.01.T01:CDS 30.0%
! TCTGTTTTCTTCAAAACCAT+CGG + Chr8:15305927-15305946 None:intergenic 30.0%
! TTCACAAAACTATCCCATTT+TGG - Chr8:15304281-15304300 MsG0880042878.01.T01:CDS 30.0%
! TTGACAAAAGATAGTGTTGA+TGG - Chr8:15306718-15306737 MsG0880042878.01.T01:CDS 30.0%
!! CATTAGCCTTGAAGAAAATT+AGG - Chr8:15306530-15306549 MsG0880042878.01.T01:CDS 30.0%
!! GTATCAGTTGATAATGTTGT+TGG - Chr8:15304417-15304436 MsG0880042878.01.T01:CDS 30.0%
!! TTTTTCGGAATGAAATGTTG+TGG + Chr8:15305859-15305878 None:intergenic 30.0%
!!! CATGAATTTTTTGGAAGCAA+AGG + Chr8:15304135-15304154 None:intergenic 30.0%
!!! GTGAACCTATTTTGATCAAA+AGG + Chr8:15304266-15304285 None:intergenic 30.0%
!!! TTTTCCGTTTTTTCTCAGTT+TGG - Chr8:15304585-15304604 MsG0880042878.01.T01:CDS 30.0%
AATTGGAGTTTGGTATTCCT+AGG - Chr8:15304670-15304689 MsG0880042878.01.T01:CDS 35.0%
ACTAAACAGCAAACATCTTG+TGG + Chr8:15306650-15306669 None:intergenic 35.0%
AGGTAAAAGAGGGGTAAAAT+TGG - Chr8:15304653-15304672 MsG0880042878.01.T01:CDS 35.0%
AGTATATGGCATATTGGTGA+AGG - Chr8:15304561-15304580 MsG0880042878.01.T01:CDS 35.0%
ATAAGGTGTGTTTGTCAAGA+TGG - Chr8:15304759-15304778 MsG0880042878.01.T01:CDS 35.0%
ATCTCCTTAGAAAAGTTCCT+AGG + Chr8:15304690-15304709 None:intergenic 35.0%
CAAGGAACATTCATAGAATC+AGG + Chr8:15306817-15306836 None:intergenic 35.0%
CACCAAAAGTTCCAAAACAT+AGG - Chr8:15306196-15306215 MsG0880042878.01.T01:CDS 35.0%
CAGTTCGACCTAAACTATTA+AGG - Chr8:15305208-15305227 MsG0880042878.01.T01:intron 35.0%
CATGACATCATATATCATGC+AGG - Chr8:15305731-15305750 MsG0880042878.01.T01:intron 35.0%
GACATAATAGAAGGACAATG+TGG + Chr8:15305706-15305725 None:intergenic 35.0%
GACATCATTGACATGTCTAT+AGG + Chr8:15304993-15305012 None:intergenic 35.0%
GCAACCAAACTGAGAAAAAA+CGG + Chr8:15304592-15304611 None:intergenic 35.0%
GGATATTCATAAACCACTAG+AGG + Chr8:15306148-15306167 None:intergenic 35.0%
GTATATGGCATATTGGTGAA+GGG - Chr8:15304562-15304581 MsG0880042878.01.T01:CDS 35.0%
GTTATGGATTTAGCGTATGA+TGG - Chr8:15305298-15305317 MsG0880042878.01.T01:CDS 35.0%
GTTTGTCAAGATGGATATGT+TGG - Chr8:15304768-15304787 MsG0880042878.01.T01:CDS 35.0%
TGACAGAAAAATCATCACCT+AGG + Chr8:15306351-15306370 None:intergenic 35.0%
TGTAGAAAGGAAATGGAACA+TGG + Chr8:15304179-15304198 None:intergenic 35.0%
TGTGAAACAGTTAATCTTCC+TGG - Chr8:15304480-15304499 MsG0880042878.01.T01:CDS 35.0%
TTATCCAAACGTCTCCTAAA+AGG - Chr8:15305458-15305477 MsG0880042878.01.T01:intron 35.0%
TTGCTACTGGAGATTATCTA+CGG - Chr8:15306484-15306503 MsG0880042878.01.T01:CDS 35.0%
TTGGTGTAAATGATCCTCTA+AGG + Chr8:15306182-15306201 None:intergenic 35.0%
TTGTGCTAAGAATGCAGAAA+TGG - Chr8:15304710-15304729 MsG0880042878.01.T01:CDS 35.0%
TTTAGTGGAGATGGAAAGAT+GGG - Chr8:15306664-15306683 MsG0880042878.01.T01:CDS 35.0%
TTTGCAGTTTCACAACATTC+TGG + Chr8:15305154-15305173 None:intergenic 35.0%
! AGGTTATGATGGAATATTGG+AGG + Chr8:15306310-15306329 None:intergenic 35.0%
! GATTTTTCTGTCAAGATTGC+AGG - Chr8:15306358-15306377 MsG0880042878.01.T01:CDS 35.0%
! GTCTTATTCAGGTAAAAGAG+GGG - Chr8:15304644-15304663 MsG0880042878.01.T01:CDS 35.0%
! TCCACCCTTTTGATCAAAAT+AGG - Chr8:15304258-15304277 MsG0880042878.01.T01:CDS 35.0%
! TCCATCCCTAATTTTCTTCA+AGG + Chr8:15306539-15306558 None:intergenic 35.0%
!! ACAAAAGATAGTGTTGATGG+AGG - Chr8:15306721-15306740 MsG0880042878.01.T01:CDS 35.0%
!! ACAAGATGTTTGCTGTTTAG+TGG - Chr8:15306649-15306668 MsG0880042878.01.T01:CDS 35.0%
!! GAAGTGTTGTTGATGTAGAA+AGG + Chr8:15304192-15304211 None:intergenic 35.0%
!! GGTCTTATTCAGGTAAAAGA+GGG - Chr8:15304643-15304662 MsG0880042878.01.T01:CDS 35.0%
!! TTTGGTGAGAAGAGTTTTGA+TGG - Chr8:15304378-15304397 MsG0880042878.01.T01:CDS 35.0%
!! TTTTGTTTGCACTTGTTGGA+GGG + Chr8:15304100-15304119 None:intergenic 35.0%
!!! ACCTATTTTGATCAAAAGGG+TGG + Chr8:15304262-15304281 None:intergenic 35.0%
!!! CTAGTTTTGTTTGCACTTGT+TGG + Chr8:15304104-15304123 None:intergenic 35.0%
!!! GAATTTTTTGGAAGCAAAGG+TGG + Chr8:15304132-15304151 None:intergenic 35.0%
!!! GATGGTTTTGTTAATGGAAC+AGG - Chr8:15304792-15304811 MsG0880042878.01.T01:CDS 35.0%
!!! GTCCTATGTTTTGGAACTTT+TGG + Chr8:15306201-15306220 None:intergenic 35.0%
!!! GTTGGTGATGGTTTTGTTAA+TGG - Chr8:15304786-15304805 MsG0880042878.01.T01:CDS 35.0%
!!! TTGCAGAGGATTTTCTAGTT+GGG - Chr8:15304608-15304627 MsG0880042878.01.T01:CDS 35.0%
AAGGAGGCAACAATAAGAAC+TGG + Chr8:15305767-15305786 None:intergenic 40.0%
AAGTCTAGTTGCATCTTCCT+AGG - Chr8:15306331-15306350 MsG0880042878.01.T01:CDS 40.0%
AATAACGGCACAATGTTTGC+TGG - Chr8:15305962-15305981 MsG0880042878.01.T01:intron 40.0%
AATGCTACAGCAGTTAAAGG+TGG - Chr8:15304735-15304754 MsG0880042878.01.T01:CDS 40.0%
AGAGGGGTAAAATTGGAGTT+TGG - Chr8:15304660-15304679 MsG0880042878.01.T01:CDS 40.0%
ATGAATTTGAGCAAGAGAGG+TGG + Chr8:15304239-15304258 None:intergenic 40.0%
CAGGTGTTTGCAAGAAGTTA+TGG - Chr8:15305282-15305301 MsG0880042878.01.T01:CDS 40.0%
GACATAAGTACCTGTAAGAC+TGG + Chr8:15305043-15305062 None:intergenic 40.0%
GATTGATGTTGCTAGGGAAT+TGG - Chr8:15306690-15306709 MsG0880042878.01.T01:CDS 40.0%
GCCTTGAAGAAAATTAGGGA+TGG - Chr8:15306535-15306554 MsG0880042878.01.T01:CDS 40.0%
GGAAGATGCAACTAGACTTT+AGG + Chr8:15306330-15306349 None:intergenic 40.0%
GGGAATGATTGATGTTGCTA+GGG - Chr8:15306684-15306703 MsG0880042878.01.T01:CDS 40.0%
GTGAATGCTACAGCAGTTAA+AGG - Chr8:15304732-15304751 MsG0880042878.01.T01:CDS 40.0%
GTTAATCTTCCTGGTTGTGA+TGG - Chr8:15304489-15304508 MsG0880042878.01.T01:CDS 40.0%
GTTTAGTGGAGATGGAAAGA+TGG - Chr8:15306663-15306682 MsG0880042878.01.T01:CDS 40.0%
TAGTTTAGGTCGAACTGAGA+AGG + Chr8:15305205-15305224 None:intergenic 40.0%
TCCTTCAAATGGTACCTTAG+AGG - Chr8:15306165-15306184 MsG0880042878.01.T01:CDS 40.0%
TCTGTCAAGATTGCAGGATT+TGG - Chr8:15306364-15306383 MsG0880042878.01.T01:CDS 40.0%
TGGATGAATTTGAGCAAGAG+AGG + Chr8:15304242-15304261 None:intergenic 40.0%
TGGGAATGATTGATGTTGCT+AGG - Chr8:15306683-15306702 MsG0880042878.01.T01:CDS 40.0%
TGTTGGAGGGAAGAAGTTAA+AGG + Chr8:15304087-15304106 None:intergenic 40.0%
TTCCTTTCCATCCTTGATAC+AGG + Chr8:15305531-15305550 None:intergenic 40.0%
TTCTAACTACACTCCTCTAG+TGG - Chr8:15306132-15306151 MsG0880042878.01.T01:CDS 40.0%
! AAGGATGGAAAGGAAGCATA+TGG - Chr8:15305536-15305555 MsG0880042878.01.T01:intron 40.0%
! ACAATGTTTGCTGGTGTTCT+TGG - Chr8:15305971-15305990 MsG0880042878.01.T01:intron 40.0%
! CAAGATGGATATGTTGGTGA+TGG - Chr8:15304774-15304793 MsG0880042878.01.T01:CDS 40.0%
! GTCGAGTTCTACACGTTTTT+CGG + Chr8:15305874-15305893 None:intergenic 40.0%
! GTTGATGGAGGAAATGTGAA+AGG - Chr8:15306733-15306752 MsG0880042878.01.T01:CDS 40.0%
! GTTGTGGTAATAAGCTTGCT+CGG + Chr8:15305843-15305862 None:intergenic 40.0%
! GTTTTCTTCAAAACCATCGG+TGG + Chr8:15305924-15305943 None:intergenic 40.0%
! TTTTCTCAGTTTGGTTGCAG+AGG - Chr8:15304594-15304613 MsG0880042878.01.T01:CDS 40.0%
!! GGGTCTTATTCAGGTAAAAG+AGG - Chr8:15304642-15304661 MsG0880042878.01.T01:CDS 40.0%
!! GGTTTGTTAGTAGACTTTCC+AGG - Chr8:15304318-15304337 MsG0880042878.01.T01:CDS 40.0%
!! GTTGCAGAGGATTTTCTAGT+TGG - Chr8:15304607-15304626 MsG0880042878.01.T01:CDS 40.0%
!! TCCTCTAAGGTACCATTTGA+AGG + Chr8:15306169-15306188 None:intergenic 40.0%
!! TCTTCCTTTTAGGAGACGTT+TGG + Chr8:15305465-15305484 None:intergenic 40.0%
!! TGACATAGGTTTGTTGCTAC+TGG - Chr8:15306471-15306490 MsG0880042878.01.T01:CDS 40.0%
!! TGTTTGCTGTTTAGTGGAGA+TGG - Chr8:15306655-15306674 MsG0880042878.01.T01:CDS 40.0%
!!! GTTTTGAGAGGGTCTTATTC+AGG - Chr8:15304633-15304652 MsG0880042878.01.T01:CDS 40.0%
!!! GTTTTGTTTGCACTTGTTGG+AGG + Chr8:15304101-15304120 None:intergenic 40.0%
ACAGCAAACATCTTGTGGCA+AGG + Chr8:15306645-15306664 None:intergenic 45.0%
ACTCTCTCAACCAGTCTTAC+AGG - Chr8:15305030-15305049 MsG0880042878.01.T01:CDS 45.0%
AGCCTGTATCAAGGATGGAA+AGG - Chr8:15305526-15305545 MsG0880042878.01.T01:intron 45.0%
CAGCAGTTAAAGGTGGCATA+AGG - Chr8:15304742-15304761 MsG0880042878.01.T01:CDS 45.0%
TTTGCTGGTGTTCTTGGTGA+TGG - Chr8:15305977-15305996 MsG0880042878.01.T01:intron 45.0%
!! TCTAGTTGGGCTGTTTTGAG+AGG - Chr8:15304621-15304640 MsG0880042878.01.T01:CDS 45.0%
!!! CTAGTTGGGCTGTTTTGAGA+GGG - Chr8:15304622-15304641 MsG0880042878.01.T01:CDS 45.0%
ACTGCAGCCTGTATCAAGGA+TGG - Chr8:15305521-15305540 MsG0880042878.01.T01:intron 50.0%
ATCCTTGATACAGGCTGCAG+TGG + Chr8:15305522-15305541 None:intergenic 50.0%
ATTCAGCCACCATGAGCTAG+AGG - Chr8:15305895-15305914 MsG0880042878.01.T01:intron 50.0%
CCAACACTTCCATCACAACC+AGG + Chr8:15304501-15304520 None:intergenic 50.0%
GTTGTACTGTCGACACGATG+AGG + Chr8:15304346-15304365 None:intergenic 50.0%
TCCTTGATACAGGCTGCAGT+GGG + Chr8:15305521-15305540 None:intergenic 50.0%
TGCTCGGAATCGAACATTCC+TGG + Chr8:15305827-15305846 None:intergenic 50.0%
! CCTGGTTGTGATGGAAGTGT+TGG - Chr8:15304498-15304517 MsG0880042878.01.T01:CDS 50.0%
!! AGTGTTGGTGGTGGTTCTCT+TGG - Chr8:15304513-15304532 MsG0880042878.01.T01:CDS 50.0%
!! GGTTGTGATGGAAGTGTTGG+TGG - Chr8:15304501-15304520 MsG0880042878.01.T01:CDS 50.0%
!! TGTGATGGAAGTGTTGGTGG+TGG - Chr8:15304504-15304523 MsG0880042878.01.T01:CDS 50.0%
TCCCACTGCAGCCTGTATCA+AGG - Chr8:15305517-15305536 MsG0880042878.01.T01:intron 55.0%
TGTCGACACGATGAGGTTCC+TGG + Chr8:15304339-15304358 None:intergenic 55.0%
! TGGCTTCCTCTAGCTCATGG+TGG + Chr8:15305904-15305923 None:intergenic 55.0%
GAGCTAGAGGAAGCCACCGA+TGG - Chr8:15305908-15305927 MsG0880042878.01.T01:intron 60.0%
! CGGTGGCTTCCTCTAGCTCA+TGG + Chr8:15305907-15305926 None:intergenic 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr8 gene 15304018 15306837 15304018 ID=MsG0880042878.01;Name=MsG0880042878.01
Chr8 mRNA 15304018 15306837 15304018 ID=MsG0880042878.01.T01;Parent=MsG0880042878.01;Name=MsG0880042878.01.T01;_AED=0.05;_eAED=0.06;_QI=0|0|0|1|1|1|3|0|658
Chr8 exon 15306030 15306837 15306030 ID=MsG0880042878.01.T01:exon:36998;Parent=MsG0880042878.01.T01
Chr8 exon 15305244 15305327 15305244 ID=MsG0880042878.01.T01:exon:36997;Parent=MsG0880042878.01.T01
Chr8 exon 15304018 15305102 15304018 ID=MsG0880042878.01.T01:exon:36996;Parent=MsG0880042878.01.T01
Chr8 CDS 15306030 15306837 15306030 ID=MsG0880042878.01.T01:cds;Parent=MsG0880042878.01.T01
Chr8 CDS 15305244 15305327 15305244 ID=MsG0880042878.01.T01:cds;Parent=MsG0880042878.01.T01
Chr8 CDS 15304018 15305102 15304018 ID=MsG0880042878.01.T01:cds;Parent=MsG0880042878.01.T01
Gene Sequence

>MsG0880042878.01.T01

ATGTTTAATGTTGTTGTCCTCATGAAATCTTTTGTTACTAACATTTTTCTACTTCTTTTGTTCTTTCCTTTAACTTCTTCCCTCCAACAAGTGCAAACAAAACTAGTTGAACCACCTTTGCTTCCAAAAAATTCATGCAATGAAACATGTGGAAAACTCCATGTTCCATTTCCTTTCTACATCAACAACACTTCATGTGCTTCATTGTCAAGTTCTTTCCACCTCTCTTGCTCAAATTCATCCACCCTTTTGATCAAAATAGGTTCACAAAACTATCCCATTTTGGAATTCTTTTCAGATGGTTTGTTAGTAGACTTTCCAGGAACCTCATCGTGTCGACAGTACAACGATTTGAATTCATTTGGTGAGAAGAGTTTTGATGGAAGAAACTACTTTGGTGTATCAGTTGATAATGTTGTTGGTCTCTATGATTGTGAAGATTCTTCACTTTGTAAAGCAGATTGTGAAACAGTTAATCTTCCTGGTTGTGATGGAAGTGTTGGTGGTGGTTCTCTTGGATGTTGTTATCCACTTTCTGATCATAGTATATGGCATATTGGTGAAGGGTTTTCCGTTTTTTCTCAGTTTGGTTGCAGAGGATTTTCTAGTTGGGCTGTTTTGAGAGGGTCTTATTCAGGTAAAAGAGGGGTAAAATTGGAGTTTGGTATTCCTAGGAACTTTTCTAAGGAGATTTGTGCTAAGAATGCAGAAATGGTGAATGCTACAGCAGTTAAAGGTGGCATAAGGTGTGTTTGTCAAGATGGATATGTTGGTGATGGTTTTGTTAATGGAACAGGATGCTTACTATCCTGTATCAAGGATGGAAAGGAAGCATATGGAAGTGACTGCTACATCAAAAGACATGATCAAAGAAAAATGGTTATCATTGCTGGAATTCTCTGTCCAGTTCTTATTGTTGCCTCCTTAGTTACACTATTCTATCTTCTAAAAAGAAAACAAAAGCCAGGAATGTTCGATTCCGAGCAAGCTTATTACCACAACATTTCATTCCGAAAAACGTGTAGAACTCGACTATTCAGCCACCATGAGCTAGAGGAAGCCACCGATGGTTTTGAAGAAAACAGAAAACTCATGCAATGCAATAACGGCACAATGTTTGCTGGTGTTCTTGGTGATGGATCACATGTAGCTATACACAAGTTATTAAAATGTGAGAATGAAAAAGACATGATGCAAGTCATGTCACAAATTGAAGTCCTATCTGCAATTGTACATAGAAATGTTGCATCAATTCTTGGTTGTTGCATTGATTCTAACTACACTCCTCTAGTGGTTTATGAATATCCTTCAAATGGTACCTTAGAGGATCATTTACACCAAAAGTTCCAAAACATAGGACAAAAACTTGGTTTACATTGGTATAGGAGATTGAATATTGCAACAGAAATAGCTAGTACTATTGCATTGTTACATTATGATAAATCTCCTCCAATATTCCATCATAACCTAAAGTCTAGTTGCATCTTCCTAGGTGATGATTTTTCTGTCAAGATTGCAGGATTTGGAATACATAATTCTGATGTTAATAATTATGATTACAAGAATTGTGAAAATCGCGAACGCTTTCGCTTGTGCAAAAATGATGTCTATGACATAGGTTTGTTGCTACTGGAGATTATCTACGGAACAAATCAATTGGACTCACCTACATTAGCCTTGAAGAAAATTAGGGATGGAAAGATCGAAGAAATTGTCGATCCACTTCTTAATTATCACGAACAACTGCGTCATTGTCAAGAACAGATTCAGATCATTGCTGACCTTGCCACAAGATGTTTGCTGTTTAGTGGAGATGGAAAGATGGGAATGATTGATGTTGCTAGGGAATTGGTTCATTTGACAAAAGATAGTGTTGATGGAGGAAATGTGAAAGGAATTGCACTTGAAGAAACATTCTCAAATTCTAGTCTTCTTCAAATGATATCTTTGTCTCCTGATTCTATGAATGTTCCTTGA
Protein sequence

>MsG0880042878.01.T01

MFNVVVLMKSFVTNIFLLLLFFPLTSSLQQVQTKLVEPPLLPKNSCNETCGKLHVPFPFYINNTSCASLSSSFHLSCSNSSTLLIKIGSQNYPILEFFSDGLLVDFPGTSSCRQYNDLNSFGEKSFDGRNYFGVSVDNVVGLYDCEDSSLCKADCETVNLPGCDGSVGGGSLGCCYPLSDHSIWHIGEGFSVFSQFGCRGFSSWAVLRGSYSGKRGVKLEFGIPRNFSKEICAKNAEMVNATAVKGGIRCVCQDGYVGDGFVNGTGCLLSCIKDGKEAYGSDCYIKRHDQRKMVIIAGILCPVLIVASLVTLFYLLKRKQKPGMFDSEQAYYHNISFRKTCRTRLFSHHELEEATDGFEENRKLMQCNNGTMFAGVLGDGSHVAIHKLLKCENEKDMMQVMSQIEVLSAIVHRNVASILGCCIDSNYTPLVVYEYPSNGTLEDHLHQKFQNIGQKLGLHWYRRLNIATEIASTIALLHYDKSPPIFHHNLKSSCIFLGDDFSVKIAGFGIHNSDVNNYDYKNCENRERFRLCKNDVYDIGLLLLEIIYGTNQLDSPTLALKKIRDGKIEEIVDPLLNYHEQLRHCQEQIQIIADLATRCLLFSGDGKMGMIDVARELVHLTKDSVDGGNVKGIALEETFSNSSLLQMISLSPDSMNVP*