AlfalfaGEDB | MsG0180000828.01

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180000828.01

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Find 158 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 191 sgRNAs with CRISPR-GE

CRISPR-Local

CRISPR-Local
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ATAGTTGCATTTGGTTCAAT+TGG	0.356130	1:+11813959	None:intergenic
TGAGTTTGCGTTGTCGAGTT+TGG	0.367785	1:-11814755	MsG0180000828.01.T01:CDS
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AATTTCCAAACTCCCACATT+TGG	0.380112	1:+11814927	None:intergenic
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GGTGAAGGAGAGGAGGCTTT+GGG	0.383156	1:-11814514	MsG0180000828.01.T01:CDS
TGCGAGGTGTGGGGAGTTAA+GGG	0.385491	1:-11814617	MsG0180000828.01.T01:CDS
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TCATGCACATATGATGAAAT+CGG	0.391394	1:-11814383	MsG0180000828.01.T01:CDS
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ATGGGTGTTGTTGGAAATAT+GGG	0.398034	1:-11814684	MsG0180000828.01.T01:CDS
TAAACTTAGAATTCATCAAA+TGG	0.400796	1:+11814992	None:intergenic
CATTTGGTGGTGTTATCGTC+TGG	0.406063	1:+11815207	None:intergenic
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ACATGCACATGACTTGTATC+AGG	0.420029	1:+11813602	None:intergenic
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GAAAGGAATGTTATACCATT+GGG	0.424514	1:+11814151	None:intergenic
GTTGATCTTCTTGGTCGAGC+TGG	0.427188	1:-11814019	MsG0180000828.01.T01:CDS
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GCATGTCTTTGTAGATCAAC+AGG	0.431465	1:-11813585	MsG0180000828.01.T01:CDS
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GGTCTTTGGAGCAAGGGAAA+TGG	0.440531	1:-11814408	MsG0180000828.01.T01:CDS
GTGGAATGTGGAGGTGTAGA+TGG	0.442573	1:+11815234	None:intergenic
GCAGTATCATAGTGAGAAGT+TGG	0.445464	1:-11813546	MsG0180000828.01.T01:CDS
GTCGTGTAGTGTGAGAGTTT+TGG	0.446162	1:+11814046	None:intergenic
CAACAATGGTTCACTCCAAC+CGG	0.446244	1:-11815091	MsG0180000828.01.T01:CDS
GCTCCCCAGATAGTTGCATT+TGG	0.448762	1:+11813950	None:intergenic
AGAAGGAACCGGCTTGTAGT+TGG	0.450200	1:-11813745	MsG0180000828.01.T01:CDS
GTTGATGGGAAGCAGATTCA+TGG	0.452900	1:-11814703	MsG0180000828.01.T01:CDS
GAAGGAACCGGCTTGTAGTT+GGG	0.454917	1:-11813744	MsG0180000828.01.T01:CDS
ACTATCTGGGGAGCTTTGCT+TGG	0.455267	1:-11813941	MsG0180000828.01.T01:CDS
GATAGCAGTGTATGAGCTCC+TGG	0.457007	1:+11813842	None:intergenic
AAGAAGTTGGTTGGTTACGT+GGG	0.458652	1:-11814358	MsG0180000828.01.T01:CDS
AGAAAGGAATGTTATACCAT+TGG	0.459430	1:+11814150	None:intergenic
AGAGTTTGTTGTAAATGGTT+CGG	0.460390	1:+11815067	None:intergenic
TTTCTTGAGATGGTTAGAGA+TGG	0.462834	1:-11814790	MsG0180000828.01.T01:CDS
TCCAATATTTATGCCTCTGC+TGG	0.466704	1:-11813821	MsG0180000828.01.T01:CDS
TCGAGCTGGTCGTCTTGATC+AGG	0.470820	1:-11814005	MsG0180000828.01.T01:CDS
TTGTTTGAGTTTGCCTAACA+TGG	0.471603	1:+11815032	None:intergenic
GGGTGCTTACGCCGCTCAAA+AGG	0.473398	1:-11813888	MsG0180000828.01.T01:CDS
GAATATTTGTGATGCGAAGA+AGG	0.473534	1:-11814302	MsG0180000828.01.T01:CDS
TCTTCATATGTATGCGAAGT+CGG	0.475848	1:-11814326	MsG0180000828.01.T01:CDS
ATAATACGTATGGTGGATCC+TGG	0.476104	1:+11813494	None:intergenic
CTTACAGCCTGTAGCCATGC+TGG	0.478984	1:-11814124	MsG0180000828.01.T01:CDS
TTCAGGAGAATGTGTTTGTG+GGG	0.479865	1:-11814660	MsG0180000828.01.T01:CDS
TCATTGTTAGAGACACCAAT+AGG	0.481324	1:-11813400	MsG0180000828.01.T01:CDS
TCCTGGTTTAGTATTTAAAA+GGG	0.482500	1:+11813511	None:intergenic
GTTTCAGGAGAATGTGTTTG+TGG	0.483478	1:-11814662	MsG0180000828.01.T01:CDS
CGTGGACTTCGATGATTACT+GGG	0.483524	1:-11814861	MsG0180000828.01.T01:CDS
TGAACCAAATGCAACTATCT+GGG	0.484013	1:-11813954	MsG0180000828.01.T01:CDS
GATGAAATCGGGAAAGAAGT+TGG	0.484095	1:-11814371	MsG0180000828.01.T01:CDS
AAACTTAGAATTCATCAAAT+GGG	0.484509	1:+11814993	None:intergenic
CTTGCAATTCCATGCTGATA+GGG	0.486250	1:-11814246	MsG0180000828.01.T01:CDS
TGGATATGTATGCGAGGTGT+GGG	0.486609	1:-11814627	MsG0180000828.01.T01:CDS
GAAGGATAGTGGGTTGAAGA+AGG	0.489708	1:-11813762	MsG0180000828.01.T01:CDS
CATGCACATATGATGAAATC+GGG	0.491918	1:-11814382	MsG0180000828.01.T01:CDS
GGATGTTGCAAAAGTGAGAA+AGG	0.492578	1:-11813789	MsG0180000828.01.T01:CDS
CAAAAGTCCAGCATGGCTAC+AGG	0.500743	1:+11814117	None:intergenic
GAAAGGAGATGAAGGATAGT+GGG	0.501053	1:-11813772	MsG0180000828.01.T01:CDS
ATGTGAGATGTTCCATTTGG+TGG	0.502198	1:+11815194	None:intergenic
CGTGCTCTTGTAGAGACTAC+TGG	0.506812	1:-11813355	MsG0180000828.01.T01:CDS
AAAAGTGAGAAAGGAGATGA+AGG	0.508322	1:-11813780	MsG0180000828.01.T01:CDS
GGAGTTAAGGGAAGCGCGGT+TGG	0.508369	1:-11814605	MsG0180000828.01.T01:CDS
GATTGAGACTTGGACGGAGG+AGG	0.510669	1:+11815151	None:intergenic
AAAGAAGTTGGTTGGTTACG+TGG	0.512478	1:-11814359	MsG0180000828.01.T01:CDS
TTGTTGTAAATGGTTCGGTC+CGG	0.513264	1:+11815072	None:intergenic
TGAGCTTGAGAGTAGAAATG+AGG	0.513541	1:-11814575	MsG0180000828.01.T01:CDS
TGCAAGGAAAGGTGAAGGAG+AGG	0.515673	1:-11814524	MsG0180000828.01.T01:CDS
GATGATTACTGGGTATTCGC+AGG	0.519593	1:-11814851	MsG0180000828.01.T01:CDS
CACGCATTTCATCAAACACC+TGG	0.522164	1:+11814899	None:intergenic
GTAATGTGAGATGTTCCATT+TGG	0.526268	1:+11815191	None:intergenic
TTCTTGAGATGGTTAGAGAT+GGG	0.529898	1:-11814789	MsG0180000828.01.T01:CDS
TAGTGGGTTGAAGAAGGAAC+CGG	0.530024	1:-11813756	MsG0180000828.01.T01:CDS
TTTGTGAAGATGCAAAGGGA+GGG	0.533859	1:-11814487	MsG0180000828.01.T01:CDS
TCATAAATCTTATCTTTCTG+TGG	0.535314	1:+11813671	None:intergenic
CAGACGATAACACCACCAAA+TGG	0.543024	1:-11815206	MsG0180000828.01.T01:CDS
AAATCGGGAAAGAAGTTGGT+TGG	0.544471	1:-11814367	MsG0180000828.01.T01:CDS
TTTATTTGTGAAGATGCAAA+GGG	0.548557	1:-11814491	MsG0180000828.01.T01:CDS
TGCCTCTGCTGGTCAGTGGA+AGG	0.549114	1:-11813810	MsG0180000828.01.T01:CDS
TGTAAATGGTTCGGTCCGGT+TGG	0.549631	1:+11815076	None:intergenic
CTTTGATATCTGGTTATGCA+AGG	0.552913	1:-11814540	MsG0180000828.01.T01:CDS
CTTTGTAGATCAACAGGAGA+AGG	0.553589	1:-11813579	MsG0180000828.01.T01:CDS
GTTTATTTGTGAAGATGCAA+AGG	0.553951	1:-11814492	MsG0180000828.01.T01:CDS
ACTACGGGGTCTTTGGAGCA+AGG	0.556095	1:-11814415	MsG0180000828.01.T01:CDS
ATTACTGGGTATTCGCAGGA+TGG	0.557259	1:-11814847	MsG0180000828.01.T01:CDS
GTGGATATGTATGCGAGGTG+TGG	0.560502	1:-11814628	MsG0180000828.01.T01:CDS
TCGTCTGGAACGGTGGAATG+TGG	0.569068	1:+11815222	None:intergenic
ATTTGTGAAGATGCAAAGGG+AGG	0.569720	1:-11814488	MsG0180000828.01.T01:CDS
TTGTTTATGTATGCCAAATG+TGG	0.571845	1:-11814940	MsG0180000828.01.T01:CDS
TTGGATTGAGACTTGGACGG+AGG	0.582257	1:+11815148	None:intergenic
GTTGAGTTTGGATTGAGACT+TGG	0.584336	1:+11815141	None:intergenic
TGTTTATGTATGCCAAATGT+GGG	0.584499	1:-11814939	MsG0180000828.01.T01:CDS
AGATAAGATTTATGAAACGT+GGG	0.586149	1:-11813663	MsG0180000828.01.T01:CDS
ATATCTGGTTATGCAAGGAA+AGG	0.588937	1:-11814535	MsG0180000828.01.T01:CDS
GGTGTTATCGTCTGGAACGG+TGG	0.592906	1:+11815215	None:intergenic
ACGAGCCATCACGAAAATGA+TGG	0.595561	1:+11813375	None:intergenic
AGAAGTTGGTTGGTTACGTG+GGG	0.595984	1:-11814357	MsG0180000828.01.T01:CDS
GTTTGTGGGGAGTTCGCTTG+TGG	0.606305	1:-11814647	MsG0180000828.01.T01:CDS
CTACGGGGTCTTTGGAGCAA+GGG	0.607136	1:-11814414	MsG0180000828.01.T01:CDS
CTGATAGGGTATGCTCAACA+TGG	0.607477	1:-11814232	MsG0180000828.01.T01:CDS
AAGAAACAAAACAAGCGCGC+TGG	0.610223	1:+11814807	None:intergenic
ATCCTTCCACTGACCAGCAG+AGG	0.610900	1:+11813808	None:intergenic
AAGGAAAGGTGAAGGAGAGG+AGG	0.617536	1:-11814521	MsG0180000828.01.T01:CDS
GGAGTGAACCATTGTTGATG+AGG	0.618252	1:+11815097	None:intergenic
TTTATGCCTCTGCTGGTCAG+TGG	0.619837	1:-11813814	MsG0180000828.01.T01:CDS
AAGATAAGATTTATGAAACG+TGG	0.623068	1:-11813664	MsG0180000828.01.T01:CDS
TTCATATGTATGCGAAGTCG+GGG	0.623124	1:-11814324	MsG0180000828.01.T01:CDS
GGTGGTGTTATCGTCTGGAA+CGG	0.623154	1:+11815212	None:intergenic
GAGGTCTAGAACATGAAGAC+CGG	0.625419	1:+11815116	None:intergenic
AGTTTGGATTGAGACTTGGA+CGG	0.627082	1:+11815145	None:intergenic
TACAGGCTGTAAGAACAGAA+AGG	0.630289	1:+11814134	None:intergenic
GAACCAAATGCAACTATCTG+GGG	0.632542	1:-11813953	MsG0180000828.01.T01:CDS
TTGATGGGAAGCAGATTCAT+GGG	0.632643	1:-11814702	MsG0180000828.01.T01:CDS
TTACTGGGTATTCGCAGGAT+GGG	0.632834	1:-11814846	MsG0180000828.01.T01:CDS
TGGGTTCAGATTGAACCCAA+TGG	0.634358	1:-11814166	MsG0180000828.01.T01:CDS
GGTTATGCAAGGAAAGGTGA+AGG	0.639455	1:-11814529	MsG0180000828.01.T01:CDS
TTGAGCATACCCTATCAGCA+TGG	0.640995	1:+11814237	None:intergenic
ATCTCAACCCAACTACAAGC+CGG	0.645304	1:+11813737	None:intergenic
CTGCGGATTGATAGAGTGTG+CGG	0.651231	1:+11815259	None:intergenic
GTTCTAGACCTCATCAACAA+TGG	0.660636	1:-11815105	MsG0180000828.01.T01:CDS
CCTCGTCCAAAAGTCCAGCA+TGG	0.668625	1:+11814110	None:intergenic
CGCTTGTGGATATGTATGCG+AGG	0.670481	1:-11814633	MsG0180000828.01.T01:CDS
GGATATGTATGCGAGGTGTG+GGG	0.671917	1:-11814626	MsG0180000828.01.T01:CDS
GGATTGATAGAGTGTGCGGA+AGG	0.674594	1:+11815263	None:intergenic
TGTGTTCTTCTTCGACTACG+GGG	0.678258	1:-11814429	MsG0180000828.01.T01:CDS
ATGTTAGGCAAACTCAAACA+AGG	0.687481	1:-11815030	MsG0180000828.01.T01:CDS
GTGGGGAGTTAAGGGAAGCG+CGG	0.696053	1:-11814609	MsG0180000828.01.T01:CDS
TCTGGAACGGTGGAATGTGG+AGG	0.708347	1:+11815225	None:intergenic
TGGAGGTGTAGATGGAGCTG+CGG	0.727350	1:+11815242	None:intergenic
AAAACTCTCACACTACACGA+CGG	0.736988	1:-11814044	MsG0180000828.01.T01:CDS
GTGTGAGAGATGTTGTGACG+TGG	0.778287	1:-11814879	MsG0180000828.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning	sgRNA_sequence	Strand	Position	Region	GC_content
!!	AAACTTAGAATTCATCAAAT+GGG	+	Chr1:11813662-11813681	None:intergenic	20.0%
!!	AATCAGAAAATTAAAGAGAT+TGG	-	Chr1:11815020-11815039	MsG0180000828.01.T01:CDS	20.0%
!!	ACGTATTATGAAAAATATCA+GGG	-	Chr1:11815172-11815191	MsG0180000828.01.T01:CDS	20.0%
!!	ATTTGATGAATTCTAAGTTT+AGG	-	Chr1:11813662-11813681	MsG0180000828.01.T01:CDS	20.0%
!!	TAAACTTAGAATTCATCAAA+TGG	+	Chr1:11813663-11813682	None:intergenic	20.0%
!!	TACGTATTATGAAAAATATC+AGG	-	Chr1:11815171-11815190	MsG0180000828.01.T01:CDS	20.0%
!!!	GATATTTTTCATAATACGTA+TGG	+	Chr1:11815171-11815190	None:intergenic	20.0%
!!!	GTCTAAAATGCATAAAAATA+CGG	-	Chr1:11814737-11814756	MsG0180000828.01.T01:CDS	20.0%
!!!	TTTTAAGAGTTTGTTGTAAA+TGG	+	Chr1:11813593-11813612	None:intergenic	20.0%
!	AAGATAAGATTTATGAAACG+TGG	-	Chr1:11814988-11815007	MsG0180000828.01.T01:CDS	25.0%
!	AATGCATAAAAATACGGAAA+TGG	-	Chr1:11814743-11814762	MsG0180000828.01.T01:CDS	25.0%
!	AGATAAGATTTATGAAACGT+GGG	-	Chr1:11814989-11815008	MsG0180000828.01.T01:CDS	25.0%
!	AGCAATAAAATATGTGTCTT+TGG	-	Chr1:11815214-11815233	MsG0180000828.01.T01:CDS	25.0%
!	ATCCTGGTTTAGTATTTAAA+AGG	+	Chr1:11815145-11815164	None:intergenic	25.0%
!	ATGCATAAAAATACGGAAAT+GGG	-	Chr1:11814744-11814763	MsG0180000828.01.T01:CDS	25.0%
!	TCATAAATCTTATCTTTCTG+TGG	+	Chr1:11814984-11815003	None:intergenic	25.0%
!	TCCTGGTTTAGTATTTAAAA+GGG	+	Chr1:11815144-11815163	None:intergenic	25.0%
!	TTTATTTGTGAAGATGCAAA+GGG	-	Chr1:11814161-11814180	MsG0180000828.01.T01:CDS	25.0%
!!	ATTTTTCATAATACGTATGG+TGG	+	Chr1:11815168-11815187	None:intergenic	25.0%
!!	GAATTCTGTCCATATATTTT+CGG	-	Chr1:11814941-11814960	MsG0180000828.01.T01:CDS	25.0%
!!!	TTTTAAAGAGATGATGTTGT+GGG	-	Chr1:11814467-11814486	MsG0180000828.01.T01:CDS	25.0%
!!!	TTTTTAAAGAGATGATGTTG+TGG	-	Chr1:11814466-11814485	MsG0180000828.01.T01:CDS	25.0%
	AGAAAGGAATGTTATACCAT+TGG	+	Chr1:11814505-11814524	None:intergenic	30.0%
	AGCAACTGAGTTTACTTATT+CGG	-	Chr1:11814194-11814213	MsG0180000828.01.T01:CDS	30.0%
	CAAACTCAAACAAGGAAAAT+TGG	-	Chr1:11813630-11813649	MsG0180000828.01.T01:CDS	30.0%
	GAAAGGAATGTTATACCATT+GGG	+	Chr1:11814504-11814523	None:intergenic	30.0%
	GTTTATTTGTGAAGATGCAA+AGG	-	Chr1:11814160-11814179	MsG0180000828.01.T01:CDS	30.0%
	TCATGCACATATGATGAAAT+CGG	-	Chr1:11814269-11814288	MsG0180000828.01.T01:CDS	30.0%
	TGTTTATGTATGCCAAATGT+GGG	-	Chr1:11813713-11813732	MsG0180000828.01.T01:CDS	30.0%
	TTAAAAAGATGCACCATGTT+AGG	-	Chr1:11813607-11813626	MsG0180000828.01.T01:CDS	30.0%
	TTGTTTATGTATGCCAAATG+TGG	-	Chr1:11813712-11813731	MsG0180000828.01.T01:CDS	30.0%
!	ACACATATTTTATTGCTGAG+TGG	+	Chr1:11815211-11815230	None:intergenic	30.0%
!	ATAGTTGCATTTGGTTCAAT+TGG	+	Chr1:11814696-11814715	None:intergenic	30.0%
!	TGTCATTTGCCGAAAATATA+TGG	+	Chr1:11814953-11814972	None:intergenic	30.0%
!!	AGAGTTTGTTGTAAATGGTT+CGG	+	Chr1:11813588-11813607	None:intergenic	30.0%
!!	TTAAGTGTTGTGCGTTTTTA+GGG	-	Chr1:11813920-11813939	MsG0180000828.01.T01:CDS	30.0%
	AAAAGTGAGAAAGGAGATGA+AGG	-	Chr1:11814872-11814891	MsG0180000828.01.T01:CDS	35.0%
	AATTTCCAAACTCCCACATT+TGG	+	Chr1:11813728-11813747	None:intergenic	35.0%
	AGAGTAGAAATGAGGTTTCT+TGG	-	Chr1:11814085-11814104	MsG0180000828.01.T01:CDS	35.0%
	ATATCTGGTTATGCAAGGAA+AGG	-	Chr1:11814117-11814136	MsG0180000828.01.T01:CDS	35.0%
	ATGAAAAATATCAGGGTCTG+TGG	-	Chr1:11815179-11815198	MsG0180000828.01.T01:CDS	35.0%
	ATGTTAGGCAAACTCAAACA+AGG	-	Chr1:11813622-11813641	MsG0180000828.01.T01:CDS	35.0%
	ATTGTGTTCTTCTTCGACTA+CGG	-	Chr1:11814221-11814240	MsG0180000828.01.T01:CDS	35.0%
	CATGCACATATGATGAAATC+GGG	-	Chr1:11814270-11814289	MsG0180000828.01.T01:CDS	35.0%
	CTTTGATATCTGGTTATGCA+AGG	-	Chr1:11814112-11814131	MsG0180000828.01.T01:CDS	35.0%
	GAATATTTGTGATGCGAAGA+AGG	-	Chr1:11814350-11814369	MsG0180000828.01.T01:CDS	35.0%
	GTAATGTGAGATGTTCCATT+TGG	+	Chr1:11813464-11813483	None:intergenic	35.0%
	TATGAGCTCCTGGATAAAAA+GGG	+	Chr1:11814803-11814822	None:intergenic	35.0%
	TCATTGTTAGAGACACCAAT+AGG	-	Chr1:11815252-11815271	MsG0180000828.01.T01:CDS	35.0%
	TCTTCATATGTATGCGAAGT+CGG	-	Chr1:11814326-11814345	MsG0180000828.01.T01:CDS	35.0%
	TCTTGGAATGCTTTGATATC+TGG	-	Chr1:11814102-11814121	MsG0180000828.01.T01:CDS	35.0%
	TGAACCAAATGCAACTATCT+GGG	-	Chr1:11814698-11814717	MsG0180000828.01.T01:CDS	35.0%
	TTCTTGAGATGGTTAGAGAT+GGG	-	Chr1:11813863-11813882	MsG0180000828.01.T01:CDS	35.0%
	TTGAACCAAATGCAACTATC+TGG	-	Chr1:11814697-11814716	MsG0180000828.01.T01:CDS	35.0%
	TTGTTGGAAATATGGGTTTC+AGG	-	Chr1:11813975-11813994	MsG0180000828.01.T01:CDS	35.0%
	TTTCAGGAGAATGTGTTTGT+GGG	-	Chr1:11813991-11814010	MsG0180000828.01.T01:CDS	35.0%
	TTTCTTGAGATGGTTAGAGA+TGG	-	Chr1:11813862-11813881	MsG0180000828.01.T01:CDS	35.0%
!	ACGAAAATGATGGAACCTAT+TGG	+	Chr1:11815270-11815289	None:intergenic	35.0%
!	ATGCGAAGAAGGTTTTTGAT+CGG	-	Chr1:11814361-11814380	MsG0180000828.01.T01:CDS	35.0%
!	CTGCAGAAATTCTTTTGCAT+TGG	+	Chr1:11813360-11813379	None:intergenic	35.0%
!	GCCCTTTTAAATACTAAACC+AGG	-	Chr1:11815140-11815159	MsG0180000828.01.T01:CDS	35.0%
!	TTGTTTGAGTTTGCCTAACA+TGG	+	Chr1:11813623-11813642	None:intergenic	35.0%
!!	ATGGGTGTTGTTGGAAATAT+GGG	-	Chr1:11813968-11813987	MsG0180000828.01.T01:CDS	35.0%
!!	GTTAAGTGTTGTGCGTTTTT+AGG	-	Chr1:11813919-11813938	MsG0180000828.01.T01:CDS	35.0%
!!	TTTTAGGGAGTTGTGTTGAT+GGG	-	Chr1:11813935-11813954	MsG0180000828.01.T01:CDS	35.0%
!!	TTTTTAGGGAGTTGTGTTGA+TGG	-	Chr1:11813934-11813953	MsG0180000828.01.T01:CDS	35.0%
!!!	AAGCTCTAAAACCTTTTGAG+CGG	+	Chr1:11814778-11814797	None:intergenic	35.0%
!!!	GCTTGTTTTGTTTCTTGAGA+TGG	-	Chr1:11813852-11813871	MsG0180000828.01.T01:CDS	35.0%
	AAAACTCTCACACTACACGA+CGG	-	Chr1:11814608-11814627	MsG0180000828.01.T01:CDS	40.0%
	AGAAAGGAGATGAAGGATAG+TGG	-	Chr1:11814879-11814898	MsG0180000828.01.T01:CDS	40.0%
	AGTTTGGATTGAGACTTGGA+CGG	+	Chr1:11813510-11813529	None:intergenic	40.0%
	ATGTGAGATGTTCCATTTGG+TGG	+	Chr1:11813461-11813480	None:intergenic	40.0%
	ATTTGTGAAGATGCAAAGGG+AGG	-	Chr1:11814164-11814183	MsG0180000828.01.T01:CDS	40.0%
	CTCAATCCAAACTCAACAAC+CGG	-	Chr1:11813517-11813536	MsG0180000828.01.T01:CDS	40.0%
	CTTCATATGTATGCGAAGTC+GGG	-	Chr1:11814327-11814346	MsG0180000828.01.T01:CDS	40.0%
	CTTGCAATTCCATGCTGATA+GGG	-	Chr1:11814406-11814425	MsG0180000828.01.T01:CDS	40.0%
	CTTTGTAGATCAACAGGAGA+AGG	-	Chr1:11815073-11815092	MsG0180000828.01.T01:CDS	40.0%
	GAAAGGAGATGAAGGATAGT+GGG	-	Chr1:11814880-11814899	MsG0180000828.01.T01:CDS	40.0%
	GAACCAAATGCAACTATCTG+GGG	-	Chr1:11814699-11814718	MsG0180000828.01.T01:CDS	40.0%
	GATGAAATCGGGAAAGAAGT+TGG	-	Chr1:11814281-11814300	MsG0180000828.01.T01:CDS	40.0%
	GCAGTATCATAGTGAGAAGT+TGG	-	Chr1:11815106-11815125	MsG0180000828.01.T01:CDS	40.0%
	GCATGTCTTTGTAGATCAAC+AGG	-	Chr1:11815067-11815086	MsG0180000828.01.T01:CDS	40.0%
	GGATGTTGCAAAAGTGAGAA+AGG	-	Chr1:11814863-11814882	MsG0180000828.01.T01:CDS	40.0%
	GTATGAGCTCCTGGATAAAA+AGG	+	Chr1:11814804-11814823	None:intergenic	40.0%
	GTTGAGTTTGGATTGAGACT+TGG	+	Chr1:11813514-11813533	None:intergenic	40.0%
	GTTTCAGGAGAATGTGTTTG+TGG	-	Chr1:11813990-11814009	MsG0180000828.01.T01:CDS	40.0%
	TACAGGCTGTAAGAACAGAA+AGG	+	Chr1:11814521-11814540	None:intergenic	40.0%
	TCCAATATTTATGCCTCTGC+TGG	-	Chr1:11814831-11814850	MsG0180000828.01.T01:CDS	40.0%
	TCTTGCAATTCCATGCTGAT+AGG	-	Chr1:11814405-11814424	MsG0180000828.01.T01:CDS	40.0%
	TGAGCTTGAGAGTAGAAATG+AGG	-	Chr1:11814077-11814096	MsG0180000828.01.T01:CDS	40.0%
	TTCAGGAGAATGTGTTTGTG+GGG	-	Chr1:11813992-11814011	MsG0180000828.01.T01:CDS	40.0%
	TTCATATGTATGCGAAGTCG+GGG	-	Chr1:11814328-11814347	MsG0180000828.01.T01:CDS	40.0%
	TTGATGGGAAGCAGATTCAT+GGG	-	Chr1:11813950-11813969	MsG0180000828.01.T01:CDS	40.0%
	TTGTGTTCTTCTTCGACTAC+GGG	-	Chr1:11814222-11814241	MsG0180000828.01.T01:CDS	40.0%
	TTTGTGAAGATGCAAAGGGA+GGG	-	Chr1:11814165-11814184	MsG0180000828.01.T01:CDS	40.0%
!	AAAGAAGTTGGTTGGTTACG+TGG	-	Chr1:11814293-11814312	MsG0180000828.01.T01:CDS	40.0%
!	AAATCGGGAAAGAAGTTGGT+TGG	-	Chr1:11814285-11814304	MsG0180000828.01.T01:CDS	40.0%
!	AAGAAGTTGGTTGGTTACGT+GGG	-	Chr1:11814294-11814313	MsG0180000828.01.T01:CDS	40.0%
!	ACATGCACATGACTTGTATC+AGG	+	Chr1:11815053-11815072	None:intergenic	40.0%
!	ACCAGCAGAGGCATAAATAT+TGG	+	Chr1:11814835-11814854	None:intergenic	40.0%
!	AGGTTCCATCATTTTCGTGA+TGG	-	Chr1:11815272-11815291	MsG0180000828.01.T01:CDS	40.0%
!	GAAGAAGGTTTTTGATCGGT+TGG	-	Chr1:11814365-11814384	MsG0180000828.01.T01:CDS	40.0%
!	GTTCTAGACCTCATCAACAA+TGG	-	Chr1:11813547-11813566	MsG0180000828.01.T01:CDS	40.0%
!!	ATAATACGTATGGTGGATCC+TGG	+	Chr1:11815161-11815180	None:intergenic	40.0%
!!	CATGGGTGTTGTTGGAAATA+TGG	-	Chr1:11813967-11813986	MsG0180000828.01.T01:CDS	40.0%
!!	GGTTTTTGATCGGTTGGTTA+AGG	-	Chr1:11814371-11814390	MsG0180000828.01.T01:CDS	40.0%
!!	TTGTTGTAAATGGTTCGGTC+CGG	+	Chr1:11813583-11813602	None:intergenic	40.0%
!!!	AGTGTGAGAGTTTTGGTTCA+AGG	+	Chr1:11814602-11814621	None:intergenic	40.0%
!!!	TGCTCAACATGGTTTTGGAA+AGG	-	Chr1:11814431-11814450	MsG0180000828.01.T01:CDS	40.0%
	AAGAAACAAAACAAGCGCGC+TGG	+	Chr1:11813848-11813867	None:intergenic	45.0%
	ACGACGGTTGTTGATCTTCT+TGG	-	Chr1:11814624-11814643	MsG0180000828.01.T01:CDS	45.0%
	ACGAGCCATCACGAAAATGA+TGG	+	Chr1:11815280-11815299	None:intergenic	45.0%
	ACGTGGACTTCGATGATTAC+TGG	-	Chr1:11813790-11813809	MsG0180000828.01.T01:CDS	45.0%
	ATCTCAACCCAACTACAAGC+CGG	+	Chr1:11814918-11814937	None:intergenic	45.0%
	ATTACTGGGTATTCGCAGGA+TGG	-	Chr1:11813805-11813824	MsG0180000828.01.T01:CDS	45.0%
	CAACAATGGTTCACTCCAAC+CGG	-	Chr1:11813561-11813580	MsG0180000828.01.T01:CDS	45.0%
	CACGCATTTCATCAAACACC+TGG	+	Chr1:11813756-11813775	None:intergenic	45.0%
	CAGACGATAACACCACCAAA+TGG	-	Chr1:11813446-11813465	MsG0180000828.01.T01:CDS	45.0%
	CGTGGACTTCGATGATTACT+GGG	-	Chr1:11813791-11813810	MsG0180000828.01.T01:CDS	45.0%
	CTCGACAACGCAAACTCATT+TGG	+	Chr1:11813895-11813914	None:intergenic	45.0%
	CTGATAGGGTATGCTCAACA+TGG	-	Chr1:11814420-11814439	MsG0180000828.01.T01:CDS	45.0%
	GATGATTACTGGGTATTCGC+AGG	-	Chr1:11813801-11813820	MsG0180000828.01.T01:CDS	45.0%
	GGAGTGAACCATTGTTGATG+AGG	+	Chr1:11813558-11813577	None:intergenic	45.0%
	GGTTATGCAAGGAAAGGTGA+AGG	-	Chr1:11814123-11814142	MsG0180000828.01.T01:CDS	45.0%
	GTATGCCAAATGTGGGAGTT+TGG	-	Chr1:11813720-11813739	MsG0180000828.01.T01:CDS	45.0%
	TGAAGACCGGTTGTTGAGTT+TGG	+	Chr1:11813526-11813545	None:intergenic	45.0%
	TGAGTTTGCGTTGTCGAGTT+TGG	-	Chr1:11813897-11813916	MsG0180000828.01.T01:CDS	45.0%
	TGGATATGTATGCGAGGTGT+GGG	-	Chr1:11814025-11814044	MsG0180000828.01.T01:CDS	45.0%
	TGGGTTCAGATTGAACCCAA+TGG	-	Chr1:11814486-11814505	MsG0180000828.01.T01:CDS	45.0%
	TGTGTTCTTCTTCGACTACG+GGG	-	Chr1:11814223-11814242	MsG0180000828.01.T01:CDS	45.0%
	TTACTGGGTATTCGCAGGAT+GGG	-	Chr1:11813806-11813825	MsG0180000828.01.T01:CDS	45.0%
	TTGAGCATACCCTATCAGCA+TGG	+	Chr1:11814418-11814437	None:intergenic	45.0%
!	AAGATGCAAAGGGAGGGTTT+TGG	-	Chr1:11814171-11814190	MsG0180000828.01.T01:CDS	45.0%
!	AGAAGTTGGTTGGTTACGTG+GGG	-	Chr1:11814295-11814314	MsG0180000828.01.T01:CDS	45.0%
!	AGCAGATTCATGGGTGTTGT+TGG	-	Chr1:11813959-11813978	MsG0180000828.01.T01:CDS	45.0%
!	GAGCTTGACCCTTTTTATCC+AGG	-	Chr1:11814792-11814811	MsG0180000828.01.T01:CDS	45.0%
!	GAGGTCTAGAACATGAAGAC+CGG	+	Chr1:11813539-11813558	None:intergenic	45.0%
!	GGGTATGCTCAACATGGTTT+TGG	-	Chr1:11814426-11814445	MsG0180000828.01.T01:CDS	45.0%
!	GTCGTGTAGTGTGAGAGTTT+TGG	+	Chr1:11814609-11814628	None:intergenic	45.0%
!	GTTGATGGGAAGCAGATTCA+TGG	-	Chr1:11813949-11813968	MsG0180000828.01.T01:CDS	45.0%
!!	CATTTGGTGGTGTTATCGTC+TGG	+	Chr1:11813448-11813467	None:intergenic	45.0%
!!	GAAGGATAGTGGGTTGAAGA+AGG	-	Chr1:11814890-11814909	MsG0180000828.01.T01:CDS	45.0%
!!	TAGTGGGTTGAAGAAGGAAC+CGG	-	Chr1:11814896-11814915	MsG0180000828.01.T01:CDS	45.0%
!!!	TGGTTTTGGAAAGGAAGCTG+TGG	-	Chr1:11814440-11814459	MsG0180000828.01.T01:CDS	45.0%
	AAGGAAAGGTGAAGGAGAGG+AGG	-	Chr1:11814131-11814150	MsG0180000828.01.T01:CDS	50.0%
	ACTATCTGGGGAGCTTTGCT+TGG	-	Chr1:11814711-11814730	MsG0180000828.01.T01:CDS	50.0%
	CAAAAGTCCAGCATGGCTAC+AGG	+	Chr1:11814538-11814557	None:intergenic	50.0%
	CGCTTGTGGATATGTATGCG+AGG	-	Chr1:11814019-11814038	MsG0180000828.01.T01:CDS	50.0%
	CGTGCTCTTGTAGAGACTAC+TGG	-	Chr1:11815297-11815316	MsG0180000828.01.T01:CDS	50.0%
	GATAGCAGTGTATGAGCTCC+TGG	+	Chr1:11814813-11814832	None:intergenic	50.0%
	GCTCCCCAGATAGTTGCATT+TGG	+	Chr1:11814705-11814724	None:intergenic	50.0%
	GGATATGTATGCGAGGTGTG+GGG	-	Chr1:11814026-11814045	MsG0180000828.01.T01:CDS	50.0%
	GGATTGATAGAGTGTGCGGA+AGG	+	Chr1:11813392-11813411	None:intergenic	50.0%
	GTGGATATGTATGCGAGGTG+TGG	-	Chr1:11814024-11814043	MsG0180000828.01.T01:CDS	50.0%
	GTGTGAGAGATGTTGTGACG+TGG	-	Chr1:11813773-11813792	MsG0180000828.01.T01:CDS	50.0%
	GTTGATCTTCTTGGTCGAGC+TGG	-	Chr1:11814633-11814652	MsG0180000828.01.T01:CDS	50.0%
	TGCAAGGAAAGGTGAAGGAG+AGG	-	Chr1:11814128-11814147	MsG0180000828.01.T01:CDS	50.0%
	TTCTTCGACTACGGGGTCTT+TGG	-	Chr1:11814230-11814249	MsG0180000828.01.T01:CDS	50.0%
	TTGGATTGAGACTTGGACGG+AGG	+	Chr1:11813507-11813526	None:intergenic	50.0%
	TTTATGCCTCTGCTGGTCAG+TGG	-	Chr1:11814838-11814857	MsG0180000828.01.T01:CDS	50.0%
!	CATGCTGGACTTTTGGACGA+GGG	-	Chr1:11814543-11814562	MsG0180000828.01.T01:CDS	50.0%
!	CTGCGGATTGATAGAGTGTG+CGG	+	Chr1:11813396-11813415	None:intergenic	50.0%
!	CTGTAGCCATGCTGGACTTT+TGG	-	Chr1:11814536-11814555	MsG0180000828.01.T01:CDS	50.0%
!	GTGGAATGTGGAGGTGTAGA+TGG	+	Chr1:11813421-11813440	None:intergenic	50.0%
!!	AGAAGGAACCGGCTTGTAGT+TGG	-	Chr1:11814907-11814926	MsG0180000828.01.T01:CDS	50.0%
!!	GAAGGAACCGGCTTGTAGTT+GGG	-	Chr1:11814908-11814927	MsG0180000828.01.T01:CDS	50.0%
!!	GGTCTTTGGAGCAAGGGAAA+TGG	-	Chr1:11814244-11814263	MsG0180000828.01.T01:CDS	50.0%
!!	GGTGGTGTTATCGTCTGGAA+CGG	+	Chr1:11813443-11813462	None:intergenic	50.0%
!!	TGTAAATGGTTCGGTCCGGT+TGG	+	Chr1:11813579-11813598	None:intergenic	50.0%
	AGGTGAAGGAGAGGAGGCTT+TGG	-	Chr1:11814137-11814156	MsG0180000828.01.T01:CDS	55.0%
	ATCCTTCCACTGACCAGCAG+AGG	+	Chr1:11814847-11814866	None:intergenic	55.0%
	ATGCGAGGTGTGGGGAGTTA+AGG	-	Chr1:11814034-11814053	MsG0180000828.01.T01:CDS	55.0%
	CCTCGTCCAAAAGTCCAGCA+TGG	+	Chr1:11814545-11814564	None:intergenic	55.0%
	CTTACAGCCTGTAGCCATGC+TGG	-	Chr1:11814528-11814547	MsG0180000828.01.T01:CDS	55.0%
	GAGTTTGGAAATTGCGCGCC+AGG	-	Chr1:11813735-11813754	MsG0180000828.01.T01:CDS	55.0%
	GATTGAGACTTGGACGGAGG+AGG	+	Chr1:11813504-11813523	None:intergenic	55.0%
	GGTGAAGGAGAGGAGGCTTT+GGG	-	Chr1:11814138-11814157	MsG0180000828.01.T01:CDS	55.0%
	GTTTGTGGGGAGTTCGCTTG+TGG	-	Chr1:11814005-11814024	MsG0180000828.01.T01:CDS	55.0%
	TCGAGCTGGTCGTCTTGATC+AGG	-	Chr1:11814647-11814666	MsG0180000828.01.T01:CDS	55.0%
	TGCGAGGTGTGGGGAGTTAA+GGG	-	Chr1:11814035-11814054	MsG0180000828.01.T01:CDS	55.0%
!	CCATGCTGGACTTTTGGACG+AGG	-	Chr1:11814542-11814561	MsG0180000828.01.T01:CDS	55.0%
!	GGTGTTATCGTCTGGAACGG+TGG	+	Chr1:11813440-11813459	None:intergenic	55.0%
!	TCGTCTGGAACGGTGGAATG+TGG	+	Chr1:11813433-11813452	None:intergenic	55.0%
!	TCTGGAACGGTGGAATGTGG+AGG	+	Chr1:11813430-11813449	None:intergenic	55.0%
!	TGGAGGTGTAGATGGAGCTG+CGG	+	Chr1:11813413-11813432	None:intergenic	55.0%
!!	ACTACGGGGTCTTTGGAGCA+AGG	-	Chr1:11814237-11814256	MsG0180000828.01.T01:CDS	55.0%
!!	CTACGGGGTCTTTGGAGCAA+GGG	-	Chr1:11814238-11814257	MsG0180000828.01.T01:CDS	55.0%
	GGGTGCTTACGCCGCTCAAA+AGG	-	Chr1:11814764-11814783	MsG0180000828.01.T01:CDS	60.0%
	GTGGGGAGTTAAGGGAAGCG+CGG	-	Chr1:11814043-11814062	MsG0180000828.01.T01:CDS	60.0%
	TGCCTCTGCTGGTCAGTGGA+AGG	-	Chr1:11814842-11814861	MsG0180000828.01.T01:CDS	60.0%
!	GGAGTTAAGGGAAGCGCGGT+TGG	-	Chr1:11814047-11814066	MsG0180000828.01.T01:CDS	60.0%

Chromosome	Type	Strat	End	Strand	Name
Chr1	gene	11813352	11815322	11813352	ID=MsG0180000828.01;Name=MsG0180000828.01
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Gene Sequence

>MsG0180000828.01.T01

ATGATCCAATGCAAAAGAATTTCTGCAGTTTCTAGAACCTTCCGCACACTCTATCAATCCGCAGCTCCATCTACACCTCCACATTCCACCGTTCCAGACGATAACACCACCAAATGGAACATCTCACATTACATCATAGACGACACAAACCTCCTCCGTCCAAGTCTCAATCCAAACTCAACAACCGGTCTTCATGTTCTAGACCTCATCAACAATGGTTCACTCCAACCGGACCGAACCATTTACAACAAACTCTTAAAAAGATGCACCATGTTAGGCAAACTCAAACAAGGAAAATTGGTTCATACCCATTTGATGAATTCTAAGTTTAGGAATGATTTAGTCATTAAAAATTCAATTTTGTTTATGTATGCCAAATGTGGGAGTTTGGAAATTGCGCGCCAGGTGTTTGATGAAATGCGTGTGAGAGATGTTGTGACGTGGACTTCGATGATTACTGGGTATTCGCAGGATGGGTGTGTGAGTAGTGCTACCAGCGCGCTTGTTTTGTTTCTTGAGATGGTTAGAGATGGGTTGAGACCAAATGAGTTTGCGTTGTCGAGTTTGGTTAAGTGTTGTGCGTTTTTAGGGAGTTGTGTTGATGGGAAGCAGATTCATGGGTGTTGTTGGAAATATGGGTTTCAGGAGAATGTGTTTGTGGGGAGTTCGCTTGTGGATATGTATGCGAGGTGTGGGGAGTTAAGGGAAGCGCGGTTGGTTTTTGATGAGCTTGAGAGTAGAAATGAGGTTTCTTGGAATGCTTTGATATCTGGTTATGCAAGGAAAGGTGAAGGAGAGGAGGCTTTGGGTTTATTTGTGAAGATGCAAAGGGAGGGTTTTGGAGCAACTGAGTTTACTTATTCGGCTTTATTGTGTTCTTCTTCGACTACGGGGTCTTTGGAGCAAGGGAAATGGCTTCATGCACATATGATGAAATCGGGAAAGAAGTTGGTTGGTTACGTGGGGAATACTCTTCTTCATATGTATGCGAAGTCGGGGAATATTTGTGATGCGAAGAAGGTTTTTGATCGGTTGGTTAAGGTTGATGTTGTTTCTTGCAATTCCATGCTGATAGGGTATGCTCAACATGGTTTTGGAAAGGAAGCTGTGGAACTTTTTAAAGAGATGATGTTGTGGGTTCAGATTGAACCCAATGGTATAACATTCCTTTCTGTTCTTACAGCCTGTAGCCATGCTGGACTTTTGGACGAGGGTTTATATTATTTTGAGTTAATGAAGAAGTATAGCCTTGAACCAAAACTCTCACACTACACGACGGTTGTTGATCTTCTTGGTCGAGCTGGTCGTCTTGATCAGGCTAAGAGTTTCATTGAAAAAATACCAATTGAACCAAATGCAACTATCTGGGGAGCTTTGCTTGGTGCGTCTAAAATGCATAAAAATACGGAAATGGGTGCTTACGCCGCTCAAAAGGTTTTAGAGCTTGACCCTTTTTATCCAGGAGCTCATACACTGCTATCCAATATTTATGCCTCTGCTGGTCAGTGGAAGGATGTTGCAAAAGTGAGAAAGGAGATGAAGGATAGTGGGTTGAAGAAGGAACCGGCTTGTAGTTGGGTTGAGATTGCGAATTCTGTCCATATATTTTCGGCAAATGACATTTCTCATCCACAGAAAGATAAGATTTATGAAACGTGGGAGAATCTAAATCAGAAAATTAAAGAGATTGGATATGTTCCTGATACAAGTCATGTGCATGTCTTTGTAGATCAACAGGAGAAGGAATTGAATTTGCAGTATCATAGTGAGAAGTTGGCTCTTGCTTTTGCCCTTTTAAATACTAAACCAGGATCCACCATACGTATTATGAAAAATATCAGGGTCTGTGGTGATTGCCACTCAGCAATAAAATATGTGTCTTTGGTTGTGAAGAGAGAAATCATTGTTAGAGACACCAATAGGTTCCATCATTTTCGTGATGGCTCGTGCTCTTGTAGAGACTACTGGTAG

Protein sequence

>MsG0180000828.01.T01

MIQCKRISAVSRTFRTLYQSAAPSTPPHSTVPDDNTTKWNISHYIIDDTNLLRPSLNPNSTTGLHVLDLINNGSLQPDRTIYNKLLKRCTMLGKLKQGKLVHTHLMNSKFRNDLVIKNSILFMYAKCGSLEIARQVFDEMRVRDVVTWTSMITGYSQDGCVSSATSALVLFLEMVRDGLRPNEFALSSLVKCCAFLGSCVDGKQIHGCCWKYGFQENVFVGSSLVDMYARCGELREARLVFDELESRNEVSWNALISGYARKGEGEEALGLFVKMQREGFGATEFTYSALLCSSSTTGSLEQGKWLHAHMMKSGKKLVGYVGNTLLHMYAKSGNICDAKKVFDRLVKVDVVSCNSMLIGYAQHGFGKEAVELFKEMMLWVQIEPNGITFLSVLTACSHAGLLDEGLYYFELMKKYSLEPKLSHYTTVVDLLGRAGRLDQAKSFIEKIPIEPNATIWGALLGASKMHKNTEMGAYAAQKVLELDPFYPGAHTLLSNIYASAGQWKDVAKVRKEMKDSGLKKEPACSWVEIANSVHIFSANDISHPQKDKIYETWENLNQKIKEIGYVPDTSHVHVFVDQQEKELNLQYHSEKLALAFALLNTKPGSTIRIMKNIRVCGDCHSAIKYVSLVVKREIIVRDTNRFHHFRDGSCSCRDYW*