AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880043124.01

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MsG0880043124.01.T01 AT1G55200 41.967 305 174 2 132 435 365 667 4.58e-74 246
MsG0880043124.01.T01 AT1G55200 41.967 305 174 2 132 435 365 667 4.58e-74 246
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MsG0880043124.01.T01 AT3G26940 40.854 328 182 4 100 418 28 352 6.00e-74 239
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MsG0880043124.01.T01 AT1G06700 39.863 291 168 3 135 418 57 347 4.90e-69 224
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MsG0880043124.01.T01 AT4G23190 38.983 295 171 4 134 422 260 551 2.62e-67 226
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MsG0880043124.01.T01 AT5G24010 34.414 401 209 8 24 418 408 760 5.38e-67 230
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MsG0880043124.01.T01 AT5G10290 39.867 301 178 2 128 425 272 572 5.39e-67 226
MsG0880043124.01.T01 AT2G01820 36.387 393 219 11 37 419 494 865 5.67e-67 231
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MsG0880043124.01.T01 AT4G11470 40.210 286 168 3 134 417 332 616 1.37e-66 226
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MsG0880043124.01.T01 AT4G23220 41.259 286 164 4 134 417 325 608 1.42e-66 226
MsG0880043124.01.T01 AT4G23190 38.983 295 171 4 134 422 338 629 1.46e-66 226
MsG0880043124.01.T01 AT4G23290 40.559 286 167 3 134 417 308 592 1.51e-66 226
MsG0880043124.01.T01 AT2G29000 42.763 304 166 5 132 434 553 849 1.60e-66 229
MsG0880043124.01.T01 AT5G16900 42.345 307 168 6 116 418 356 657 1.75e-66 226
MsG0880043124.01.T01 AT2G43230 41.751 297 154 4 135 418 100 390 1.81e-66 219
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MsG0880043124.01.T01 AT3G17410 39.936 313 165 5 138 438 61 362 2.24e-66 218
MsG0880043124.01.T01 AT1G56145 40.705 312 159 3 134 420 675 985 2.26e-66 231
MsG0880043124.01.T01 AT4G21400 38.291 316 162 6 136 419 313 627 2.30e-66 226
MsG0880043124.01.T01 AT4G23200 40.206 291 171 3 136 424 326 615 2.30e-66 226
MsG0880043124.01.T01 AT2G14510 42.708 288 158 5 131 417 550 831 2.38e-66 229
MsG0880043124.01.T01 AT2G43230 41.751 297 154 4 135 418 134 424 2.41e-66 220
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MsG0880043124.01.T01 AT1G07560 42.424 297 160 5 134 429 560 846 2.80e-66 229
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MsG0880043124.01.T01 AT5G63710 38.435 294 177 3 128 418 236 528 3.69e-66 223
MsG0880043124.01.T01 AT4G20450 40.397 302 172 5 132 432 579 873 3.79e-66 229
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MsG0880043124.01.T01 AT4G23320 39.860 286 169 3 134 417 192 476 7.27e-66 221
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MsG0880043124.01.T01 AT1G21270 37.224 317 190 4 104 419 368 676 5.90e-65 223
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MsG0880043124.01.T01 AT2G04300 40.134 299 171 5 132 429 570 861 1.00e-64 225
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MsG0880043124.01.T01 AT1G51850 39.130 299 174 5 132 429 546 837 3.63e-64 223
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MsG0880043124.01.T01 AT1G61420 39.161 286 172 2 133 417 483 767 8.55e-64 221
MsG0880043124.01.T01 AT4G11900 38.356 292 178 2 133 423 524 814 9.26e-64 221
MsG0880043124.01.T01 AT5G35960 38.112 286 163 6 132 413 120 395 1.11e-63 212
MsG0880043124.01.T01 AT1G51890 39.016 305 177 6 132 435 286 582 1.16e-63 217
MsG0880043124.01.T01 AT1G21250 37.224 317 190 4 104 419 373 681 1.25e-63 219
MsG0880043124.01.T01 AT5G24080 38.112 286 175 1 134 419 520 803 1.38e-63 221
MsG0880043124.01.T01 AT1G55610 39.041 292 172 4 132 418 845 1135 1.43e-63 223
MsG0880043124.01.T01 AT1G55610 39.041 292 172 4 132 418 845 1135 1.43e-63 223
MsG0880043124.01.T01 AT2G37050 35.354 396 205 8 21 413 526 873 1.53e-63 222
MsG0880043124.01.T01 AT2G37050 35.516 397 202 8 21 413 526 872 1.77e-63 222
MsG0880043124.01.T01 AT1G61380 38.014 292 178 3 133 422 475 765 1.90e-63 220
MsG0880043124.01.T01 AT4G23180 44.298 228 125 2 137 363 339 565 1.92e-63 216
MsG0880043124.01.T01 AT1G65800 38.796 299 175 4 137 429 514 810 1.93e-63 221
MsG0880043124.01.T01 AT1G21230 36.909 317 191 4 104 419 372 680 2.16e-63 219
MsG0880043124.01.T01 AT2G25220 45.339 236 127 2 129 364 129 362 2.23e-63 210
MsG0880043124.01.T01 AT1G51880 39.935 308 177 6 132 438 572 872 2.69e-63 221
MsG0880043124.01.T01 AT1G61480 39.373 287 172 2 132 417 482 767 2.76e-63 220
MsG0880043124.01.T01 AT2G41970 38.225 293 169 5 135 418 62 351 2.85e-63 210
MsG0880043124.01.T01 AT1G48210 45.833 240 107 5 138 363 60 290 2.97e-63 208
MsG0880043124.01.T01 AT1G48210 45.833 240 107 5 138 363 60 290 2.97e-63 208
MsG0880043124.01.T01 AT1G48210 45.833 240 107 5 138 363 60 290 2.97e-63 208
MsG0880043124.01.T01 AT1G51880 39.935 308 177 6 132 438 554 854 3.13e-63 220
MsG0880043124.01.T01 AT1G51880 39.935 308 177 6 132 438 580 880 3.17e-63 221
MsG0880043124.01.T01 AT5G54590 39.860 286 158 6 134 417 103 376 3.43e-63 212
MsG0880043124.01.T01 AT5G54590 39.860 286 158 6 134 417 103 376 3.43e-63 212
MsG0880043124.01.T01 AT5G54590 39.860 286 158 6 134 417 103 376 3.43e-63 212
MsG0880043124.01.T01 AT4G13190 44.048 252 139 2 168 417 5 256 3.57e-63 207
MsG0880043124.01.T01 AT1G61360 37.243 341 200 6 133 463 404 740 3.82e-63 218
MsG0880043124.01.T01 AT1G61360 37.243 341 200 6 133 463 404 740 3.82e-63 218
MsG0880043124.01.T01 AT1G61360 37.243 341 200 6 133 463 404 740 3.82e-63 218
MsG0880043124.01.T01 AT1G07550 40.070 287 166 4 131 417 547 827 5.01e-63 220
MsG0880043124.01.T01 AT1G65790 38.435 294 175 3 141 429 514 806 6.48e-63 219
MsG0880043124.01.T01 AT2G25220 39.932 293 170 4 101 389 49 339 6.66e-63 209
MsG0880043124.01.T01 AT2G14440 41.522 289 160 6 131 417 551 832 7.32e-63 219
MsG0880043124.01.T01 AT5G49770 39.763 337 185 7 124 455 612 935 7.54e-63 220
MsG0880043124.01.T01 AT5G59670 43.494 269 148 4 151 418 569 834 7.63e-63 219
MsG0880043124.01.T01 AT5G59670 43.494 269 148 4 151 418 569 834 7.63e-63 219
MsG0880043124.01.T01 AT4G04570 48.529 204 103 2 142 344 180 382 7.81e-63 210
MsG0880043124.01.T01 AT1G25390 39.863 291 165 5 134 418 279 565 8.05e-63 215
MsG0880043124.01.T01 AT1G25390 39.863 291 165 5 134 418 279 565 8.05e-63 215
MsG0880043124.01.T01 AT1G61360 37.243 341 200 6 133 463 485 821 9.51e-63 218
MsG0880043124.01.T01 AT5G49760 40.303 330 184 6 124 448 609 930 9.56e-63 220
MsG0880043124.01.T01 AT1G51810 39.057 297 173 5 134 429 440 729 9.80e-63 217
MsG0880043124.01.T01 AT3G51550 36.364 341 212 4 132 469 522 860 1.07e-62 219
MsG0880043124.01.T01 AT3G53380 40.203 296 165 5 134 420 364 656 1.09e-62 217
MsG0880043124.01.T01 AT2G25220 40.210 286 165 4 101 382 98 381 1.19e-62 210
MsG0880043124.01.T01 AT3G49670 42.049 283 146 7 144 417 688 961 1.27e-62 220
MsG0880043124.01.T01 AT1G61490 38.112 286 175 2 133 417 327 611 1.32e-62 215
MsG0880043124.01.T01 AT1G51830 38.926 298 172 7 134 429 383 672 1.42e-62 216
MsG0880043124.01.T01 AT1G48220 39.590 293 159 4 138 418 60 346 1.45e-62 208
MsG0880043124.01.T01 AT1G51860 40.066 302 172 6 132 432 428 721 1.45e-62 217
MsG0880043124.01.T01 AT1G70520 39.519 291 169 2 134 418 313 602 1.55e-62 215
MsG0880043124.01.T01 AT1G51830 38.926 298 172 7 134 429 376 665 1.70e-62 216
MsG0880043124.01.T01 AT5G10530 38.339 313 180 6 112 417 301 607 1.78e-62 215
MsG0880043124.01.T01 AT2G23450 36.364 330 201 3 133 455 335 662 1.83e-62 216
MsG0880043124.01.T01 AT2G23450 36.364 330 201 3 133 455 335 662 1.83e-62 216
MsG0880043124.01.T01 AT1G79670 40.418 287 170 1 132 418 370 655 2.09e-62 216
MsG0880043124.01.T01 AT4G04960 38.255 298 172 5 130 420 331 623 2.11e-62 215
MsG0880043124.01.T01 AT2G28990 38.973 331 187 8 134 463 567 883 2.13e-62 218
MsG0880043124.01.T01 AT2G28990 38.973 331 187 8 134 463 567 883 2.13e-62 218
MsG0880043124.01.T01 AT1G11280 38.127 299 170 6 133 422 480 772 2.78e-62 217
MsG0880043124.01.T01 AT1G34300 40.138 289 166 5 134 419 474 758 2.84e-62 217
MsG0880043124.01.T01 AT3G46400 43.071 267 148 3 149 414 579 842 2.97e-62 218
MsG0880043124.01.T01 AT1G24030 43.443 244 131 5 180 418 8 249 3.10e-62 204
MsG0880043124.01.T01 AT1G11280 38.127 299 170 6 133 422 490 782 3.17e-62 217
MsG0880043124.01.T01 AT1G51890 39.016 305 177 6 132 435 494 790 3.31e-62 217
MsG0880043124.01.T01 AT2G23950 43.333 240 130 3 128 365 281 516 3.33e-62 211
MsG0880043124.01.T01 AT1G67520 38.676 287 172 4 134 417 276 561 3.34e-62 213
MsG0880043124.01.T01 AT1G67520 38.676 287 172 4 134 417 276 561 3.34e-62 213
MsG0880043124.01.T01 AT1G79670 40.418 287 170 1 132 418 407 692 3.61e-62 216
MsG0880043124.01.T01 AT1G67520 38.328 287 173 4 134 417 247 532 3.76e-62 213

Find 142 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 279 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GGGTGAGCTTGGTGGGTTTA+TGG 0.130401 8:-19341247 None:intergenic
AAGATTCTTAACAGCAATTT+TGG 0.144781 8:-19341585 None:intergenic
CAATCTTCGGTCTCCGTCTC+TGG 0.150962 8:+19341132 MsG0880043124.01.T01:CDS
AACCCTAAGGTTTCTGATTT+CGG 0.232754 8:+19343433 MsG0880043124.01.T01:CDS
ACTATAGGGTGGCACAAATT+TGG 0.240859 8:-19340687 None:intergenic
ACTATTATACCACTATAATT+TGG 0.249054 8:+19340655 MsG0880043124.01.T01:five_prime_UTR
GATAGCTTGTTCCCTCATTA+AGG 0.285574 8:-19344747 None:intergenic
GAGCATAAGGGTTCGAGTTT+AGG 0.288030 8:+19344570 MsG0880043124.01.T01:CDS
ACATCTCGGTGGACAACTTT+TGG 0.301307 8:-19343376 None:intergenic
TTGATCCTGATTCCATAAAA+AGG 0.307385 8:+19344001 MsG0880043124.01.T01:CDS
GTGTATGAATTTGTTGATAA+TGG 0.307954 8:+19342908 MsG0880043124.01.T01:CDS
AATTGGATTCAGTGTGAAAA+TGG 0.311506 8:-19340971 None:intergenic
AAAGTTGAGGTAGAAGTAAT+TGG 0.324882 8:+19342704 MsG0880043124.01.T01:CDS
TATAGTGGTGTTCTTGTTGA+TGG 0.330216 8:+19341560 MsG0880043124.01.T01:CDS
GGACCGGAAGTTTCGCATCT+TGG 0.331847 8:+19341443 MsG0880043124.01.T01:CDS
TTGTGTGAAGATAATGTTAT+TGG 0.334206 8:+19341515 MsG0880043124.01.T01:CDS
GTTATTGGTGAAGGTGGTTA+TGG 0.340458 8:+19341530 MsG0880043124.01.T01:CDS
ACTCGAGTGATGGGGACATT+TGG 0.349825 8:+19343496 MsG0880043124.01.T01:CDS
AAAAGAAATACTAAACAAAA+AGG 0.357635 8:-19340755 None:intergenic
GTGAAGTGGGTGAGCTTGGT+GGG 0.364363 8:-19341254 None:intergenic
GATGATCTCTTGGATTTCCT+TGG 0.373983 8:-19341288 None:intergenic
GAACTTGAAGCTGCTACTAA+TGG 0.374351 8:+19341491 MsG0880043124.01.T01:CDS
GGATAGATAAATTATACTAT+AGG 0.379467 8:-19340702 None:intergenic
GACGGCTTCTCTGAAATCTT+AGG 0.383295 8:-19343934 None:intergenic
AGCATACCTCACGAAATAAA+AGG 0.383828 8:-19344065 None:intergenic
TCCCATGTCATAGGGCTTAT+AGG 0.384424 8:-19342965 None:intergenic
GAAGTTTCGCATCTTGGGTG+GGG 0.384624 8:+19341449 MsG0880043124.01.T01:CDS
CTCGAGTGATGGGGACATTT+GGG 0.391448 8:+19343497 MsG0880043124.01.T01:CDS
AGGAGTGACGTGTATAGCTT+TGG 0.397685 8:+19343675 MsG0880043124.01.T01:CDS
TGTGAAACTGCGTCTTCTAT+TGG 0.401882 8:+19341413 MsG0880043124.01.T01:CDS
GCCCTATGACATGGGATATC+CGG 0.403463 8:+19342972 MsG0880043124.01.T01:CDS
CTTTAAATTCTTTCTCAGCT+TGG 0.407334 8:-19342685 None:intergenic
CACCCAAGATGCGAAACTTC+CGG 0.408591 8:-19341446 None:intergenic
GACCGGAAGTTTCGCATCTT+GGG 0.411036 8:+19341444 MsG0880043124.01.T01:CDS
CATTCCAGTGCACGCATACT+CGG 0.411424 8:-19343643 None:intergenic
AGAGTGTTAAGGTAGGATTT+AGG 0.411946 8:-19340837 None:intergenic
GCTATACACGTCACTCCTTT+CGG 0.413996 8:-19343670 None:intergenic
ATCCGGATATCCCATGTCAT+AGG 0.417879 8:-19342974 None:intergenic
CGATTATCAACGAGAGCATA+AGG 0.419895 8:+19344557 MsG0880043124.01.T01:CDS
ATGCAGGATCGAAGGATTGC+CGG 0.422110 8:+19344513 MsG0880043124.01.T01:intron
AGACCGAAATCAGAAACCTT+AGG 0.433660 8:-19343436 None:intergenic
TTGGATTTCCTTGGAGACTA+CGG 0.435354 8:-19341279 None:intergenic
GAAGAGAGAGTGTGAGTGAG+TGG 0.439572 8:-19340939 None:intergenic
GATAGATAAATTATACTATA+GGG 0.445995 8:-19340701 None:intergenic
GTGGCGCGTGGATGATCTCT+TGG 0.453127 8:-19341298 None:intergenic
ACTGTGTCTACGTGGATCTC+TGG 0.454426 8:-19341326 None:intergenic
CTCCGTCTCTGGGTTGTCAT+CGG 0.458231 8:+19341143 MsG0880043124.01.T01:CDS
TACTATCATCTCAACTTAGT+TGG 0.459702 8:-19344663 None:intergenic
GAGTGTGAGTGAGTGGAAGA+TGG 0.463238 8:-19340932 None:intergenic
GGCTCTAAAACGTGCGCTGT+TGG 0.468068 8:+19343963 MsG0880043124.01.T01:CDS
TCCTCCTTTACTCTCTCCAC+TGG 0.468243 8:-19341381 None:intergenic
GGTTATGGAATTGTTTATAG+TGG 0.470632 8:+19341545 MsG0880043124.01.T01:CDS
ATTAATCACCGGGAGAAATC+CGG 0.471774 8:+19343713 MsG0880043124.01.T01:CDS
TGGATTTCCTTGGAGACTAC+GGG 0.472129 8:-19341278 None:intergenic
TGAGCTTGGTGGGTTTATGG+TGG 0.473379 8:-19341244 None:intergenic
TAGAAGTAATTGGTCGTGTT+CGG 0.475211 8:+19342714 MsG0880043124.01.T01:CDS
TTGCTCGGATATTGTGTTGA+AGG 0.475652 8:+19342755 MsG0880043124.01.T01:CDS
GAGAGAGAGAGTGTTAAGGT+AGG 0.476624 8:-19340844 None:intergenic
TATTTATTTCTACCTTAATG+AGG 0.477268 8:+19344735 MsG0880043124.01.T01:three_prime_UTR
AATCTTCGGTCTCCGTCTCT+GGG 0.477393 8:+19341133 MsG0880043124.01.T01:CDS
TGTGGTCTGCTATAATCAAC+CGG 0.478201 8:-19343732 None:intergenic
TCCTTTACTCTCTCCACTGG+TGG 0.483880 8:-19341378 None:intergenic
GTGTGAAGTTAATGAAGAAG+AGG 0.488709 8:-19340872 None:intergenic
GGAAGTTTCGCATCTTGGGT+GGG 0.492011 8:+19341448 MsG0880043124.01.T01:CDS
ACATACTCATTGATCGTCAA+TGG 0.496675 8:+19343410 MsG0880043124.01.T01:CDS
CTCATCATGGAATTAATCAC+CGG 0.498061 8:+19343702 MsG0880043124.01.T01:CDS
TTCGGCACAAGAATCTAGTT+AGG 0.498849 8:+19342732 MsG0880043124.01.T01:CDS
CGGAAGTTTCGCATCTTGGG+TGG 0.500835 8:+19341447 MsG0880043124.01.T01:CDS
TAGATTGGCTTATCTTCATG+AGG 0.504404 8:+19343345 MsG0880043124.01.T01:intron
GGGAGTGAAGTGGGTGAGCT+TGG 0.504411 8:-19341258 None:intergenic
ATTTATTTCTACCTTAATGA+GGG 0.508699 8:+19344736 MsG0880043124.01.T01:three_prime_UTR
TGCCCAATAAAATGTTCATC+CGG 0.509690 8:-19342991 None:intergenic
GGAGTGACGTGTATAGCTTT+GGG 0.509872 8:+19343676 MsG0880043124.01.T01:CDS
AAGTTTCGCATCTTGGGTGG+GGG 0.511316 8:+19341450 MsG0880043124.01.T01:CDS
TTCTATTGGAAGTGTTGGAC+CGG 0.515356 8:+19341427 MsG0880043124.01.T01:CDS
CAACATCTCCATGCAGCCAC+TGG 0.515559 8:-19342940 None:intergenic
AGTGAAGTGGGTGAGCTTGG+TGG 0.516001 8:-19341255 None:intergenic
TAAATGTCACCAAATTATAG+TGG 0.521571 8:-19340664 None:intergenic
CTCTCGTTGATAATCGCGAT+TGG 0.522393 8:-19344550 None:intergenic
TAGCTTTGGGATACTCATCA+TGG 0.525461 8:+19343689 MsG0880043124.01.T01:CDS
TATGTCACGACTCGAGTGAT+GGG 0.530124 8:+19343487 MsG0880043124.01.T01:CDS
TGAGAAAGAATTTAAAGTTG+AGG 0.531797 8:+19342691 MsG0880043124.01.T01:CDS
TGCAGGTTAATTTAGTTGAG+TGG 0.533113 8:+19343866 MsG0880043124.01.T01:intron
TCCGGATATCCCATGTCATA+GGG 0.533549 8:-19342973 None:intergenic
TTCAGAGAAGCCGTCTTCAA+AGG 0.533920 8:+19343942 MsG0880043124.01.T01:CDS
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CRISPR-GE

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GTGATTGAATATGCATACAT+TGG + Chr8:19343037-19343056 MsG0880043124.01.T01:intron 30.0%
TAATACAAAAAGAGAGACCA+TGG - Chr8:19342216-19342235 None:intergenic 30.0%
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TTTGGGAGAATCATAAGTTT+AGG + Chr8:19342247-19342266 MsG0880043124.01.T01:intron 30.0%
! ATCCGGATGAACATTTTATT+GGG + Chr8:19342989-19343008 MsG0880043124.01.T01:CDS 30.0%
! ATGTACTTTAATGGACCAAA+AGG + Chr8:19344111-19344130 MsG0880043124.01.T01:intron 30.0%
! GAAAACAAATATACGCCTTT+TGG - Chr8:19344129-19344148 None:intergenic 30.0%
! GTGTAGAAATGTTTGGTAAT+CGG + Chr8:19341728-19341747 MsG0880043124.01.T01:intron 30.0%
! GTTCGAGTTTAGGTAAAAAT+CGG + Chr8:19344580-19344599 MsG0880043124.01.T01:CDS 30.0%
! TACAGCAATGTTGAACTTTT+CGG - Chr8:19344457-19344476 None:intergenic 30.0%
! TAGGTTGAACAATACATTCA+TGG - Chr8:19344282-19344301 None:intergenic 30.0%
! TATCCGGATGAACATTTTAT+TGG + Chr8:19342988-19343007 MsG0880043124.01.T01:CDS 30.0%
! TCAAATTTAAGCCTTGTAGA+TGG - Chr8:19341876-19341895 None:intergenic 30.0%
! TCAAATTTGAGGTCAATTGA+CGG + Chr8:19343582-19343601 MsG0880043124.01.T01:intron 30.0%
! TGTGTTTAACTCATTTTCAG+AGG + Chr8:19342662-19342681 MsG0880043124.01.T01:intron 30.0%
!! TGTTGTTTCATTCTGTTGTT+TGG + Chr8:19341692-19341711 MsG0880043124.01.T01:intron 30.0%
!!! ACCGAAGATTGATGTTTTTT+TGG - Chr8:19341123-19341142 None:intergenic 30.0%
!!! AGGTTTTGTTTGAATGAGAA+TGG - Chr8:19340912-19340931 None:intergenic 30.0%
!!! TTTCGATGAGTTTTAGGAAT+TGG - Chr8:19340991-19341010 None:intergenic 30.0%
AACAACTTTACCAGTTTCCA+TGG + Chr8:19342196-19342215 MsG0880043124.01.T01:intron 35.0%
AACCCTAAGGTTTCTGATTT+CGG + Chr8:19343433-19343452 MsG0880043124.01.T01:CDS 35.0%
ACACACAGAAACACACAAAA+TGG - Chr8:19342380-19342399 None:intergenic 35.0%
ACATACTCATTGATCGTCAA+TGG + Chr8:19343410-19343429 MsG0880043124.01.T01:CDS 35.0%
AGCATACCTCACGAAATAAA+AGG - Chr8:19344068-19344087 None:intergenic 35.0%
ATTCAAACTACCTCAGTAAG+GGG - Chr8:19343843-19343862 None:intergenic 35.0%
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CAATTCAAACTACCTCAGTA+AGG - Chr8:19343845-19343864 None:intergenic 35.0%
CTCATCATGGAATTAATCAC+CGG + Chr8:19343702-19343721 MsG0880043124.01.T01:CDS 35.0%
GATAATGTTATTGGTGAAGG+TGG + Chr8:19341524-19341543 MsG0880043124.01.T01:CDS 35.0%
GATTCAGTTGCAAGAAAACA+AGG - Chr8:19342496-19342515 None:intergenic 35.0%
GTAGATGGAAAAAACGTAGT+TGG - Chr8:19341861-19341880 None:intergenic 35.0%
GTGTGAAGTTAATGAAGAAG+AGG - Chr8:19340875-19340894 None:intergenic 35.0%
GTTCTCAAGTAGAGTGAATT+TGG + Chr8:19344209-19344228 MsG0880043124.01.T01:intron 35.0%
TAGAAGTAATTGGTCGTGTT+CGG + Chr8:19342714-19342733 MsG0880043124.01.T01:CDS 35.0%
TATAGTGGTGTTCTTGTTGA+TGG + Chr8:19341560-19341579 MsG0880043124.01.T01:CDS 35.0%
TCATCATGGAATTAATCACC+GGG + Chr8:19343703-19343722 MsG0880043124.01.T01:CDS 35.0%
TCTCCAAACAATACAAGACA+AGG - Chr8:19342418-19342437 None:intergenic 35.0%
TGACTAATCTTCTGTGAACT+TGG + Chr8:19341807-19341826 MsG0880043124.01.T01:intron 35.0%
TGCAAGAAAACAAGGACTTA+AGG - Chr8:19342488-19342507 None:intergenic 35.0%
TGCAGGTTAATTTAGTTGAG+TGG + Chr8:19343866-19343885 MsG0880043124.01.T01:intron 35.0%
TGCCCAATAAAATGTTCATC+CGG - Chr8:19342994-19343013 None:intergenic 35.0%
TTAGGTAAAAATCGGATAGG+TGG + Chr8:19344588-19344607 MsG0880043124.01.T01:CDS 35.0%
! AAGAATCTAGTTAGGTTGCT+CGG + Chr8:19342740-19342759 MsG0880043124.01.T01:CDS 35.0%
! AATCTGAGTCTAGTTTCACT+CGG + Chr8:19341909-19341928 MsG0880043124.01.T01:intron 35.0%
! AGAGTGTTAAGGTAGGATTT+AGG - Chr8:19340840-19340859 None:intergenic 35.0%
! AGTTCACAGAAGATTAGTCA+TGG - Chr8:19341807-19341826 None:intergenic 35.0%
! ATTTTATTGGGCACAGCAAA+AGG + Chr8:19343001-19343020 MsG0880043124.01.T01:CDS 35.0%
! GATTATCAACGAGAGCATAA+GGG + Chr8:19344558-19344577 MsG0880043124.01.T01:CDS 35.0%
! TCCCATTTTAGGCCTTTTTA+TGG - Chr8:19344016-19344035 None:intergenic 35.0%
! TGTTGCTTGATTTCACATCT+CGG - Chr8:19343393-19343412 None:intergenic 35.0%
! TTAGGCCTTTTTATGGAATC+AGG - Chr8:19344009-19344028 None:intergenic 35.0%
! TTTTATTGGGCACAGCAAAA+GGG + Chr8:19343002-19343021 MsG0880043124.01.T01:CDS 35.0%
!! AGATTGGCTTATCTTCATGA+GGG + Chr8:19343346-19343365 MsG0880043124.01.T01:intron 35.0%
!! TAGATTGGCTTATCTTCATG+AGG + Chr8:19343345-19343364 MsG0880043124.01.T01:intron 35.0%
!!! ACTTGGCTGGTCATTTTTAA+TGG + Chr8:19341824-19341843 MsG0880043124.01.T01:intron 35.0%
!!! CTACGTTTTTTCCATCTACA+AGG + Chr8:19341862-19341881 MsG0880043124.01.T01:intron 35.0%
!!! TTACCCTGTTTTTACACAAG+AGG + Chr8:19342131-19342150 MsG0880043124.01.T01:intron 35.0%
AAAAGAGAGACCATGGAAAC+TGG - Chr8:19342209-19342228 None:intergenic 40.0%
AATAGTGTGTGACAGTGTGA+TGG - Chr8:19340641-19340660 None:intergenic 40.0%
ACAGCCTCTTGTGTAAAAAC+AGG - Chr8:19342138-19342157 None:intergenic 40.0%
ACCTATAAGCCCTATGACAT+GGG + Chr8:19342964-19342983 MsG0880043124.01.T01:CDS 40.0%
ACTATAGGGTGGCACAAATT+TGG - Chr8:19340690-19340709 None:intergenic 40.0%
AGACCGAAATCAGAAACCTT+AGG - Chr8:19343439-19343458 None:intergenic 40.0%
ATAATCAACCGGATTTCTCC+CGG - Chr8:19343724-19343743 None:intergenic 40.0%
ATAATGGCAATCTAGACCAG+TGG + Chr8:19342924-19342943 MsG0880043124.01.T01:CDS 40.0%
ATCTCAACTTAGTTGGCTGA+TGG - Chr8:19344659-19344678 None:intergenic 40.0%
ATTAATCACCGGGAGAAATC+CGG + Chr8:19343713-19343732 MsG0880043124.01.T01:CDS 40.0%
CAGCCTCTTGTGTAAAAACA+GGG - Chr8:19342137-19342156 None:intergenic 40.0%
CGTACAATACACCAAATGGT+GGG - Chr8:19342106-19342125 None:intergenic 40.0%
CTTAGGATCAACTACTTCCT+CGG - Chr8:19343920-19343939 None:intergenic 40.0%
GAACTTGAAGCTGCTACTAA+TGG + Chr8:19341491-19341510 MsG0880043124.01.T01:CDS 40.0%
GACCGAAATCAGAAACCTTA+GGG - Chr8:19343438-19343457 None:intergenic 40.0%
GAGGCAAATACTCATTGTAG+AGG - Chr8:19344243-19344262 None:intergenic 40.0%
GAGGTAGTTTGAATTGTTGC+AGG + Chr8:19343849-19343868 MsG0880043124.01.T01:intron 40.0%
GATGATCTCTTGGATTTCCT+TGG - Chr8:19341291-19341310 None:intergenic 40.0%
GTTATTGGTGAAGGTGGTTA+TGG + Chr8:19341530-19341549 MsG0880043124.01.T01:CDS 40.0%
GTTGATTATAGCAGACCACA+AGG + Chr8:19343735-19343754 MsG0880043124.01.T01:CDS 40.0%
GTTGTTGTCATGTGACTGTA+CGG - Chr8:19342182-19342201 None:intergenic 40.0%
TAATCTTCTGTGAACTTGGC+TGG + Chr8:19341811-19341830 MsG0880043124.01.T01:intron 40.0%
TCTTTCTCGTTCTTGTATGC+AGG + Chr8:19344497-19344516 MsG0880043124.01.T01:intron 40.0%
TGTGAAACTGCGTCTTCTAT+TGG + Chr8:19341413-19341432 MsG0880043124.01.T01:CDS 40.0%
TGTGGTCTGCTATAATCAAC+CGG - Chr8:19343735-19343754 None:intergenic 40.0%
TTAGTCATGGACAAAGTCAG+TGG - Chr8:19341794-19341813 None:intergenic 40.0%
TTCAAACTACCTCAGTAAGG+GGG - Chr8:19343842-19343861 None:intergenic 40.0%
TTCGGCACAAGAATCTAGTT+AGG + Chr8:19342732-19342751 MsG0880043124.01.T01:CDS 40.0%
TTGCCTCTACAATTGTTCTC+TGG + Chr8:19344256-19344275 MsG0880043124.01.T01:intron 40.0%
TTGCTCGGATATTGTGTTGA+AGG + Chr8:19342755-19342774 MsG0880043124.01.T01:CDS 40.0%
TTGGATTTCCTTGGAGACTA+CGG - Chr8:19341282-19341301 None:intergenic 40.0%
! CGATTATCAACGAGAGCATA+AGG + Chr8:19344557-19344576 MsG0880043124.01.T01:CDS 40.0%
! TGGATCACATGTCCCATTTT+AGG - Chr8:19344027-19344046 None:intergenic 40.0%
! TGGGTTTATGGTGGTTTTTG+CGG - Chr8:19341238-19341257 None:intergenic 40.0%
!! GATAGCTTGTTCCCTCATTA+AGG - Chr8:19344750-19344769 None:intergenic 40.0%
!! TAGAGAGAGAGAGAGTGTTA+AGG - Chr8:19340851-19340870 None:intergenic 40.0%
!! TAGCTTTGGGATACTCATCA+TGG + Chr8:19343689-19343708 MsG0880043124.01.T01:CDS 40.0%
!! TGACGACCTTTTATTTCGTG+AGG + Chr8:19344059-19344078 MsG0880043124.01.T01:CDS 40.0%
!! TTCTATTGGAAGTGTTGGAC+CGG + Chr8:19341427-19341446 MsG0880043124.01.T01:CDS 40.0%
!!! CGTTTTAGAGCCTTTGAAGA+CGG - Chr8:19343955-19343974 None:intergenic 40.0%
ACATGTGATCCACATGCTTG+AGG + Chr8:19344035-19344054 MsG0880043124.01.T01:CDS 45.0%
AGGAGTGACGTGTATAGCTT+TGG + Chr8:19343675-19343694 MsG0880043124.01.T01:CDS 45.0%
AGGTGAGACATAGAGAGAGA+AGG - Chr8:19341205-19341224 None:intergenic 45.0%
ATCCGGATATCCCATGTCAT+AGG - Chr8:19342977-19342996 None:intergenic 45.0%
ATGTCTCTAACCTCTCCTTG+TGG - Chr8:19343753-19343772 None:intergenic 45.0%
CTAGTTTCACTGTGTCTACG+TGG - Chr8:19341337-19341356 None:intergenic 45.0%
GACAAGTGAACAGACGAACA+TGG + Chr8:19343239-19343258 MsG0880043124.01.T01:intron 45.0%
GACCTATAAGCCCTATGACA+TGG + Chr8:19342963-19342982 MsG0880043124.01.T01:CDS 45.0%
GCGTACAATACACCAAATGG+TGG - Chr8:19342107-19342126 None:intergenic 45.0%
GCTATACACGTCACTCCTTT+CGG - Chr8:19343673-19343692 None:intergenic 45.0%
GCTGCGTACAATACACCAAA+TGG - Chr8:19342110-19342129 None:intergenic 45.0%
GGAGTGACGTGTATAGCTTT+GGG + Chr8:19343676-19343695 MsG0880043124.01.T01:CDS 45.0%
GTTCTTGTATGCAGGATCGA+AGG + Chr8:19344505-19344524 MsG0880043124.01.T01:intron 45.0%
TATGTCACGACTCGAGTGAT+GGG + Chr8:19343487-19343506 MsG0880043124.01.T01:CDS 45.0%
TCCCATGTCATAGGGCTTAT+AGG - Chr8:19342968-19342987 None:intergenic 45.0%
TCCGGATATCCCATGTCATA+GGG - Chr8:19342976-19342995 None:intergenic 45.0%
TGATCGTCAATGGAACCCTA+AGG + Chr8:19343420-19343439 MsG0880043124.01.T01:CDS 45.0%
TGCTTGATTTCACATCTCGG+TGG - Chr8:19343390-19343409 None:intergenic 45.0%
TGGACAAAGTCAGTGGAAAG+TGG - Chr8:19341787-19341806 None:intergenic 45.0%
TGGATTTCCTTGGAGACTAC+GGG - Chr8:19341281-19341300 None:intergenic 45.0%
TGGCCAGAGAACAATTGTAG+AGG - Chr8:19344262-19344281 None:intergenic 45.0%
TTATAGCAGACCACAAGGAG+AGG + Chr8:19343740-19343759 MsG0880043124.01.T01:CDS 45.0%
TTATGTCACGACTCGAGTGA+TGG + Chr8:19343486-19343505 MsG0880043124.01.T01:CDS 45.0%
TTCAGAGAAGCCGTCTTCAA+AGG + Chr8:19343942-19343961 MsG0880043124.01.T01:CDS 45.0%
! ACATCTCGGTGGACAACTTT+TGG - Chr8:19343379-19343398 None:intergenic 45.0%
! AGAGGAGACAGAGTTGATTC+TGG + Chr8:19344155-19344174 MsG0880043124.01.T01:intron 45.0%
! ATTGTGTTGAAGGCGCATAC+AGG + Chr8:19342765-19342784 MsG0880043124.01.T01:CDS 45.0%
! CAAGTAACTAGTCTGCAGTC+AGG - Chr8:19343270-19343289 None:intergenic 45.0%
! GAGCATAAGGGTTCGAGTTT+AGG + Chr8:19344570-19344589 MsG0880043124.01.T01:CDS 45.0%
! GCGTCTTCTATTGGAAGTGT+TGG + Chr8:19341422-19341441 MsG0880043124.01.T01:CDS 45.0%
! GTTTATGGTGGTTTTTGCGG+CGG - Chr8:19341235-19341254 None:intergenic 45.0%
! TTACACAAGAGGCTGTTTCC+AGG + Chr8:19342142-19342161 MsG0880043124.01.T01:intron 45.0%
!! CTCTCGTTGATAATCGCGAT+TGG - Chr8:19344553-19344572 None:intergenic 45.0%
!! GACGGCTTCTCTGAAATCTT+AGG - Chr8:19343937-19343956 None:intergenic 45.0%
!! GAGAGAGAGAGTGTTAAGGT+AGG - Chr8:19340847-19340866 None:intergenic 45.0%
AAGTTTCGCATCTTGGGTGG+GGG + Chr8:19341450-19341469 MsG0880043124.01.T01:CDS 50.0%
AATCTAGACCAGTGGCTGCA+TGG + Chr8:19342932-19342951 MsG0880043124.01.T01:CDS 50.0%
AATCTTCGGTCTCCGTCTCT+GGG + Chr8:19341133-19341152 MsG0880043124.01.T01:CDS 50.0%
ACCAGTGGAGAGAGTAAAGG+AGG + Chr8:19341380-19341399 MsG0880043124.01.T01:CDS 50.0%
ACTGTGTCTACGTGGATCTC+TGG - Chr8:19341329-19341348 None:intergenic 50.0%
AGTGGAGAGAGTAAAGGAGG+AGG + Chr8:19341383-19341402 MsG0880043124.01.T01:CDS 50.0%
ATGCAGGATCGAAGGATTGC+CGG + Chr8:19344513-19344532 MsG0880043124.01.T01:intron 50.0%
ATGTCACGACTCGAGTGATG+GGG + Chr8:19343488-19343507 MsG0880043124.01.T01:CDS 50.0%
ATTCCAGTGCACGCATACTC+GGG - Chr8:19343645-19343664 None:intergenic 50.0%
CACCCAAGATGCGAAACTTC+CGG - Chr8:19341449-19341468 None:intergenic 50.0%
CATTCCAGTGCACGCATACT+CGG - Chr8:19343646-19343665 None:intergenic 50.0%
CTCGAGTCGTGACATAACTG+TGG - Chr8:19343483-19343502 None:intergenic 50.0%
GAAGTTTCGCATCTTGGGTG+GGG + Chr8:19341449-19341468 MsG0880043124.01.T01:CDS 50.0%
GACCGGAAGTTTCGCATCTT+GGG + Chr8:19341444-19341463 MsG0880043124.01.T01:CDS 50.0%
GAGTGTGAGTGAGTGGAAGA+TGG - Chr8:19340935-19340954 None:intergenic 50.0%
GCCCTATGACATGGGATATC+CGG + Chr8:19342972-19342991 MsG0880043124.01.T01:CDS 50.0%
GGAAGTTTCGCATCTTGGGT+GGG + Chr8:19341448-19341467 MsG0880043124.01.T01:CDS 50.0%
GTCATGTGACTGTACGGTCA+CGG - Chr8:19342176-19342195 None:intergenic 50.0%
GTTGTCATCGGAATCCTCGT+CGG + Chr8:19341155-19341174 MsG0880043124.01.T01:CDS 50.0%
TACCTCAGTAAGGGGGAAAG+CGG - Chr8:19343835-19343854 None:intergenic 50.0%
TCATGTGACTGTACGGTCAC+GGG - Chr8:19342175-19342194 None:intergenic 50.0%
TCCACCAGTGGAGAGAGTAA+AGG + Chr8:19341377-19341396 MsG0880043124.01.T01:CDS 50.0%
TCCTCCTTTACTCTCTCCAC+TGG - Chr8:19341384-19341403 None:intergenic 50.0%
TCCTTTACTCTCTCCACTGG+TGG - Chr8:19341381-19341400 None:intergenic 50.0%
TCTACGTGGATCTCTGGCAT+CGG - Chr8:19341323-19341342 None:intergenic 50.0%
TCTCTCCACTGGTGGAAACA+CGG - Chr8:19341373-19341392 None:intergenic 50.0%
TGTGAGTGAGTGGAAGATGG+AGG - Chr8:19340932-19340951 None:intergenic 50.0%
TTCCGATGACAACCCAGAGA+CGG - Chr8:19341148-19341167 None:intergenic 50.0%
! ACTCGAGTGATGGGGACATT+TGG + Chr8:19343496-19343515 MsG0880043124.01.T01:CDS 50.0%
! CTCGAGTGATGGGGACATTT+GGG + Chr8:19343497-19343516 MsG0880043124.01.T01:CDS 50.0%
! GAAGAGAGAGTGTGAGTGAG+TGG - Chr8:19340942-19340961 None:intergenic 50.0%
! GGAGACAGAGTTGATTCTGG+AGG + Chr8:19344158-19344177 MsG0880043124.01.T01:intron 50.0%
!! TGAGCTTGGTGGGTTTATGG+TGG - Chr8:19341247-19341266 None:intergenic 50.0%
AGACGATGAGAGAACCGACG+AGG - Chr8:19341172-19341191 None:intergenic 55.0%
AGTGAAGTGGGTGAGCTTGG+TGG - Chr8:19341258-19341277 None:intergenic 55.0%
CAACATCTCCATGCAGCCAC+TGG - Chr8:19342943-19342962 None:intergenic 55.0%
CAATCTTCGGTCTCCGTCTC+TGG + Chr8:19341132-19341151 MsG0880043124.01.T01:CDS 55.0%
CACTGGTGGAAACACGGTGA+TGG - Chr8:19341367-19341386 None:intergenic 55.0%
CAGTGGCTGCATGGAGATGT+TGG + Chr8:19342941-19342960 MsG0880043124.01.T01:CDS 55.0%
CATCACCGTGTTTCCACCAG+TGG + Chr8:19341365-19341384 MsG0880043124.01.T01:CDS 55.0%
CGGAAGTTTCGCATCTTGGG+TGG + Chr8:19341447-19341466 MsG0880043124.01.T01:CDS 55.0%
CTCCGTCTCTGGGTTGTCAT+CGG + Chr8:19341143-19341162 MsG0880043124.01.T01:CDS 55.0%
CTTCACTCCCGTAGTCTCCA+AGG + Chr8:19341271-19341290 MsG0880043124.01.T01:CDS 55.0%
GCACTGGAATGCTGACCGAA+AGG + Chr8:19343655-19343674 MsG0880043124.01.T01:CDS 55.0%
GGAAAGCGGCAGAACTGCAT+AGG - Chr8:19343821-19343840 None:intergenic 55.0%
GGACCGGAAGTTTCGCATCT+TGG + Chr8:19341443-19341462 MsG0880043124.01.T01:CDS 55.0%
GGAGACTACGGGAGTGAAGT+GGG - Chr8:19341270-19341289 None:intergenic 55.0%
GTGAAGTGGGTGAGCTTGGT+GGG - Chr8:19341257-19341276 None:intergenic 55.0%
TCATGGTCTCTACGGCAACC+CGG + Chr8:19342040-19342059 MsG0880043124.01.T01:intron 55.0%
TGGAGACTACGGGAGTGAAG+TGG - Chr8:19341271-19341290 None:intergenic 55.0%
! TATGGTGGTTTTTGCGGCGG+CGG - Chr8:19341232-19341251 None:intergenic 55.0%
!! GGCTCTAAAACGTGCGCTGT+TGG + Chr8:19343963-19343982 MsG0880043124.01.T01:CDS 55.0%
!! GGGTGAGCTTGGTGGGTTTA+TGG - Chr8:19341250-19341269 None:intergenic 55.0%
ACGGTCACGGGTTCAAGTCC+TGG - Chr8:19342163-19342182 None:intergenic 60.0%
ATGCGGGAGCTTCAGTGCAC+CGG - Chr8:19342062-19342081 None:intergenic 60.0%
CATACGCAGAGTCCGGGAAG+GGG + Chr8:19342079-19342098 MsG0880043124.01.T01:intron 60.0%
CTTCCCGGACTCTGCGTATG+CGG - Chr8:19342079-19342098 None:intergenic 60.0%
GCATACGCAGAGTCCGGGAA+GGG + Chr8:19342078-19342097 MsG0880043124.01.T01:intron 60.0%
GGGAGTGAAGTGGGTGAGCT+TGG - Chr8:19341261-19341280 None:intergenic 60.0%
GGTCGTCAGCCTCAAGCATG+TGG - Chr8:19344047-19344066 None:intergenic 60.0%
GTGGCGCGTGGATGATCTCT+TGG - Chr8:19341301-19341320 None:intergenic 60.0%
TTCCCGGACTCTGCGTATGC+GGG - Chr8:19342078-19342097 None:intergenic 60.0%
! ACGTGGATCTCTGGCATCGG+TGG - Chr8:19341320-19341339 None:intergenic 60.0%
! CAAATGGTGGGACCCCTTCC+CGG - Chr8:19342094-19342113 None:intergenic 60.0%
!! TGCCGCTTTCCCCCTTACTG+AGG + Chr8:19343830-19343849 MsG0880043124.01.T01:intron 60.0%
CGCATACGCAGAGTCCGGGA+AGG + Chr8:19342077-19342096 MsG0880043124.01.T01:intron 65.0%
CGCATCTTGGGTGGGGGAGA+TGG + Chr8:19341456-19341475 MsG0880043124.01.T01:CDS 65.0%
CGGGAAGGGGTCCCACCATT+TGG + Chr8:19342092-19342111 MsG0880043124.01.T01:intron 65.0%
CTCCCGCATACGCAGAGTCC+GGG + Chr8:19342073-19342092 MsG0880043124.01.T01:intron 65.0%
GCTCCCGCATACGCAGAGTC+CGG + Chr8:19342072-19342091 MsG0880043124.01.T01:intron 65.0%
TGCGGGAGCTTCAGTGCACC+GGG - Chr8:19342061-19342080 None:intergenic 65.0%
! GTGGTTTTTGCGGCGGCGGT+GGG - Chr8:19341228-19341247 None:intergenic 65.0%
GCGCCCGAGTATGCGTGCAC+TGG + Chr8:19343639-19343658 MsG0880043124.01.T01:CDS 70.0%
GGTCGGGAGTCGAAGAGCCG+AGG + Chr8:19343900-19343919 MsG0880043124.01.T01:CDS 70.0%
! GGTGGTTTTTGCGGCGGCGG+TGG - Chr8:19341229-19341248 None:intergenic 70.0%
! GTTTTTGCGGCGGCGGTGGG+AGG - Chr8:19341225-19341244 None:intergenic 70.0%
!! TCTCTGGCATCGGTGGCGCG+TGG - Chr8:19341313-19341332 None:intergenic 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr8 gene 19340632 19344851 19340632 ID=MsG0880043124.01;Name=MsG0880043124.01
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Protein sequence

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