AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0280006772.01

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MsG0280006772.01.T01 AT1G63330 24.342 456 304 2 45 466 40 488 5.03e-52 185
MsG0280006772.01.T01 AT1G63330 29.155 367 237 4 100 466 5 348 3.41e-49 177
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MsG0280006772.01.T01 AT3G06920 25.123 406 295 3 45 450 142 538 7.73e-39 150
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MsG0280006772.01.T01 AT3G22670 23.554 242 174 4 228 466 168 401 4.82e-14 74.7
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MsG0280006772.01.T01 AT5G62370 22.573 443 313 4 52 466 514 954 1.98e-30 125
MsG0280006772.01.T01 AT5G62370 22.391 460 306 8 44 466 407 852 5.14e-23 103
MsG0280006772.01.T01 AT5G62370 21.687 332 217 2 145 476 467 755 2.98e-20 94.7
MsG0280006772.01.T01 AT5G62370 21.600 500 323 12 43 479 159 652 6.09e-20 94.0
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MsG0280006772.01.T01 AT1G02420 30.224 268 180 4 103 369 198 459 2.11e-23 103
MsG0280006772.01.T01 AT1G02420 27.711 249 179 1 111 359 237 484 1.77e-18 88.6
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MsG0280006772.01.T01 AT1G10910 25.305 328 224 3 104 421 144 460 2.68e-26 112
MsG0280006772.01.T01 AT1G10910 24.033 362 262 7 91 450 104 454 5.57e-25 108
MsG0280006772.01.T01 AT1G10910 22.647 340 243 7 13 348 168 491 3.67e-15 78.6
MsG0280006772.01.T01 AT1G10910 23.462 260 149 5 205 458 112 327 2.11e-13 72.8
MsG0280006772.01.T01 AT3G18110 25.581 301 210 6 139 434 281 572 3.19e-26 113
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MsG0280006772.01.T01 AT3G04130 26.568 271 195 4 51 318 225 494 2.54e-18 88.2
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MsG0280006772.01.T01 AT3G46610 21.886 297 179 4 139 425 400 653 4.40e-18 87.8
MsG0280006772.01.T01 AT3G46610 21.281 437 303 7 60 465 194 620 2.76e-12 69.7
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MsG0280006772.01.T01 AT1G33350 22.222 324 230 10 21 338 132 439 4.58e-11 65.5

Find 96 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 112 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
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CTTGTGTCAATCTAATAATT+TGG 0.282486 2:+6019662 MsG0280006772.01.T01:CDS
ACATATGGTACGTTGATTAA+TGG 0.286624 2:+6019534 MsG0280006772.01.T01:CDS
TGTATTAATGTGTGGAATTT+GGG 0.297791 2:+6020298 MsG0280006772.01.T01:CDS
CTCGAAGAGATGATAATAAA+TGG 0.305688 2:+6019702 MsG0280006772.01.T01:CDS
GAACAAAGCTACTCGAATTC+TGG 0.331117 2:+6020229 MsG0280006772.01.T01:CDS
TTAACTATATGTAGAGGTTA+TGG 0.331533 2:+6019222 MsG0280006772.01.T01:CDS
CGTCATGATCACAATACTTT+CGG 0.338279 2:+6019096 MsG0280006772.01.T01:CDS
TGTATCTTAGCATGCGTACT+AGG 0.338525 2:+6020141 MsG0280006772.01.T01:CDS
CATATGGTACGTTGATTAAT+GGG 0.347931 2:+6019535 MsG0280006772.01.T01:CDS
CTTTCGGTGCAATGATTCAT+AGG 0.350111 2:+6019112 MsG0280006772.01.T01:CDS
AGTGAATTTGTAATTTGCTT+TGG 0.371292 2:-6018985 None:intergenic
CTAGTAAAACTTTGTTTAAG+TGG 0.376913 2:+6018962 MsG0280006772.01.T01:CDS
CTTGACAGGATGCGGCTTCA+AGG 0.381833 2:+6019912 MsG0280006772.01.T01:CDS
GAATTCGAGTAGCTTTGTTC+AGG 0.383912 2:-6020226 None:intergenic
AACCATGTGAAAAGGGCTAT+TGG 0.385588 2:+6019357 MsG0280006772.01.T01:CDS
CTCTCCAGCATTCCTTCAGC+TGG 0.388784 2:-6019159 None:intergenic
CTCCCGTACATCCCTGCATC+TGG 0.391895 2:-6019942 None:intergenic
TAGTTTCTGTGAATCAGTTT+AGG 0.393592 2:+6019136 MsG0280006772.01.T01:CDS
GTACTATAAGTGACCATGTT+AGG 0.400289 2:-6019837 None:intergenic
ACATTCCACATTCCCTCATC+TGG 0.405452 2:-6020278 None:intergenic
AAGCTCCAACTTGCTCGATT+AGG 0.409800 2:-6020047 None:intergenic
ATTAATGGGCTGTGCAAACT+TGG 0.420033 2:+6019549 MsG0280006772.01.T01:CDS
ATAGGCCACTTGATGCCATC+AGG 0.421765 2:+6019253 MsG0280006772.01.T01:CDS
GCAAGAAGATTGCGAGGTTA+CGG 0.426679 2:+6019188 MsG0280006772.01.T01:CDS
ACTTATAGTACTTTAATCAA+TGG 0.427389 2:+6019849 MsG0280006772.01.T01:CDS
ATCAGGCTGGCATCCACGAT+TGG 0.427630 2:-6019505 None:intergenic
TGGAGGAAAACCATGTGAAA+AGG 0.441201 2:+6019349 MsG0280006772.01.T01:CDS
TACAAGGAGATGAGAGAAAA+GGG 0.450664 2:+6019384 MsG0280006772.01.T01:CDS
TACGCATGCTAAGATACAAT+TGG 0.453192 2:-6020136 None:intergenic
CTTATAGTACTTTAATCAAT+GGG 0.453485 2:+6019850 MsG0280006772.01.T01:CDS
GTACCATATGTATACGAATC+AGG 0.455428 2:-6019522 None:intergenic
CTGGAGGAGATGATAGTAGA+TGG 0.456406 2:+6020248 MsG0280006772.01.T01:CDS
AGGAGCTACTGAGCTATTGC+TGG 0.458525 2:+6020337 MsG0280006772.01.T01:CDS
TTACAAGGAGATGAGAGAAA+AGG 0.463501 2:+6019383 MsG0280006772.01.T01:CDS
TTGGATGAGATGGAGGAGAA+AGG 0.469622 2:+6019597 MsG0280006772.01.T01:CDS
CAGCCTGATTCGTATACATA+TGG 0.475246 2:+6019519 MsG0280006772.01.T01:CDS
ATCAATGGGCTGTGTAAAGA+AGG 0.476486 2:+6019864 MsG0280006772.01.T01:CDS
ATGGATGGTTTGTGTAAAAG+TGG 0.477196 2:+6019759 MsG0280006772.01.T01:CDS
GTATCTTAGCATGCGTACTA+GGG 0.479861 2:+6020142 MsG0280006772.01.T01:CDS
CAACATTATTACAAAGACCT+TGG 0.487470 2:-6020097 None:intergenic
AAACCAGATGCAGGGATGTA+CGG 0.487990 2:+6019939 MsG0280006772.01.T01:CDS
ACTTATAGTTCTTTAATGGA+TGG 0.489822 2:+6019744 MsG0280006772.01.T01:CDS
TCAGGCTGGCATCCACGATT+GGG 0.490719 2:-6019504 None:intergenic
CAGTCAGGCAAAGGAACTGT+TGG 0.492201 2:+6019578 MsG0280006772.01.T01:CDS
TTGACAGGATGCGGCTTCAA+GGG 0.502557 2:+6019913 MsG0280006772.01.T01:CDS
CGCCTTGATCAAAATATTGA+GGG 0.505835 2:-6019427 None:intergenic
AGGGGTATCTCTGTTGAGAT+TGG 0.508364 2:+6020161 MsG0280006772.01.T01:CDS
CAAGGGTTGAAACCAGATGC+AGG 0.510190 2:+6019930 MsG0280006772.01.T01:CDS
GGAGGAAAACCATGTGAAAA+GGG 0.510951 2:+6019350 MsG0280006772.01.T01:CDS
AACCAGATGCAGGGATGTAC+GGG 0.512657 2:+6019940 MsG0280006772.01.T01:CDS
TAGAGATTCTTGACAGGATG+CGG 0.517119 2:+6019904 MsG0280006772.01.T01:CDS
GAAGCTAATAAAATCCGAAA+AGG 0.524926 2:+6019014 MsG0280006772.01.T01:CDS
AAGCTGTAGAGATTCTTGAC+AGG 0.525923 2:+6019898 MsG0280006772.01.T01:CDS
TACAATTGGAATGCGCGAGT+TGG 0.526055 2:-6020122 None:intergenic
AATGGAGTTGTTAGAAGTGA+TGG 0.527796 2:+6019797 MsG0280006772.01.T01:CDS
AGCAAACTTCATTGATGAGA+TGG 0.529445 2:+6020007 MsG0280006772.01.T01:CDS
AAAGGAACTGTTGGATGAGA+TGG 0.530854 2:+6019587 MsG0280006772.01.T01:CDS
TACGGTATTTGATATTCTCG+TGG 0.536727 2:+6019329 MsG0280006772.01.T01:CDS
GCGCCTTGATCAAAATATTG+AGG 0.536873 2:-6019428 None:intergenic
TTCATTGATGAGATGGCTCT+CGG 0.540376 2:+6020014 MsG0280006772.01.T01:CDS
TAGGCCAGCTGAAGGAATGC+TGG 0.540897 2:+6019155 MsG0280006772.01.T01:CDS
TAATGTGTGGAATTTGGGAT+CGG 0.541339 2:+6020303 MsG0280006772.01.T01:CDS
TGGACATTCTTCACAAGCAA+TGG 0.541650 2:+6019779 MsG0280006772.01.T01:CDS
GACGCAGAAGTCTTACCTTA+CGG 0.549292 2:+6019311 MsG0280006772.01.T01:CDS
AGTTACACTAGTTTGATACA+TGG 0.553978 2:+6019639 MsG0280006772.01.T01:CDS
AATGAAGCAAGAAGATTGCG+AGG 0.566982 2:+6019182 MsG0280006772.01.T01:CDS
GCATTCCAGATGAGGGAATG+TGG 0.568206 2:+6020273 MsG0280006772.01.T01:CDS
TTGAGGGAAACAACACTTGG+CGG 0.570375 2:-6019411 None:intergenic
CATATGTATACGAATCAGGC+TGG 0.574821 2:-6019518 None:intergenic
GAGGTTATGGACGTGTGCAT+AGG 0.579303 2:+6019235 MsG0280006772.01.T01:CDS
AGATGGCTGCATTCCAGATG+AGG 0.579324 2:+6020265 MsG0280006772.01.T01:CDS
CGAGAATATCAAATACCGTA+AGG 0.580878 2:-6019326 None:intergenic
TAGGCCACTTGATGCCATCA+GGG 0.594845 2:+6019254 MsG0280006772.01.T01:CDS
GCAACAGATGAGTATAGCAA+TGG 0.595505 2:+6019069 MsG0280006772.01.T01:CDS
ATGCATAACATGGTTGTCCA+AGG 0.596435 2:+6020080 MsG0280006772.01.T01:CDS
CTAGTGTAACTAACAACAGA+AGG 0.598033 2:-6019627 None:intergenic
GATGGCTGCATTCCAGATGA+GGG 0.601814 2:+6020266 MsG0280006772.01.T01:CDS
CATCTTATGGAAAACCCTGA+TGG 0.602104 2:-6019268 None:intergenic
GGAACTGTTGGATGAGATGG+AGG 0.611124 2:+6019590 MsG0280006772.01.T01:CDS
TCTCACCTAATCGAGCAAGT+TGG 0.613681 2:+6020042 MsG0280006772.01.T01:CDS
AGAAGATTGCGAGGTTACGG+AGG 0.616046 2:+6019191 MsG0280006772.01.T01:CDS
AATCAGTTTAGGCCAGCTGA+AGG 0.616680 2:+6019147 MsG0280006772.01.T01:CDS
TTTCGTGAAATGCCCAATCG+TGG 0.626478 2:+6019492 MsG0280006772.01.T01:CDS
AAGGGTTGAAACCAGATGCA+GGG 0.632193 2:+6019931 MsG0280006772.01.T01:CDS
GGTATTTGATATTCTCGTGG+AGG 0.632439 2:+6019332 MsG0280006772.01.T01:CDS
TCATGTCAGAATGCATAACA+TGG 0.636786 2:+6020070 MsG0280006772.01.T01:CDS
ATGTGGAATGTATTAATGTG+TGG 0.640901 2:+6020290 MsG0280006772.01.T01:CDS
TATCTTAGCATGCGTACTAG+GGG 0.654059 2:+6020143 MsG0280006772.01.T01:CDS
AAAACCCTGATGGCATCAAG+TGG 0.657234 2:-6019258 None:intergenic
CAAAGCTACTCGAATTCTGG+AGG 0.661635 2:+6020232 MsG0280006772.01.T01:CDS
GATAGCTGCAAGCAGCACAA+AGG 0.667925 2:-6019977 None:intergenic
GTAAGGTAAGACTTCTGCGT+CGG 0.668696 2:-6019309 None:intergenic
ATATTGAGGGAAACAACACT+TGG 0.670436 2:-6019414 None:intergenic
ATTGATGAGATGGCTCTCGG+CGG 0.719426 2:+6020017 MsG0280006772.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! TTTTACTTATAGTTCTTTAA+TGG + Chr2:6019740-6019759 MsG0280006772.01.T01:CDS 15.0%
!! ACTTATAGTACTTTAATCAA+TGG + Chr2:6019849-6019868 MsG0280006772.01.T01:CDS 20.0%
!! CTTATAGTACTTTAATCAAT+GGG + Chr2:6019850-6019869 MsG0280006772.01.T01:CDS 20.0%
!! GAACTATAAGTAAAAACATT+TGG - Chr2:6019735-6019754 None:intergenic 20.0%
! ACTTATAGTTCTTTAATGGA+TGG + Chr2:6019744-6019763 MsG0280006772.01.T01:CDS 25.0%
! ATGTATTAATGTGTGGAATT+TGG + Chr2:6020297-6020316 MsG0280006772.01.T01:CDS 25.0%
! CTTGTGTCAATCTAATAATT+TGG + Chr2:6019662-6019681 MsG0280006772.01.T01:CDS 25.0%
! TGTATTAATGTGTGGAATTT+GGG + Chr2:6020298-6020317 MsG0280006772.01.T01:CDS 25.0%
! TTAACTATATGTAGAGGTTA+TGG + Chr2:6019222-6019241 MsG0280006772.01.T01:CDS 25.0%
!! CTAGTAAAACTTTGTTTAAG+TGG + Chr2:6018962-6018981 MsG0280006772.01.T01:CDS 25.0%
!!! AGTGAATTTGTAATTTGCTT+TGG - Chr2:6018988-6019007 None:intergenic 25.0%
!!! GTCTTTTTAACTATATGTAG+AGG + Chr2:6019216-6019235 MsG0280006772.01.T01:CDS 25.0%
ATGTGGAATGTATTAATGTG+TGG + Chr2:6020290-6020309 MsG0280006772.01.T01:CDS 30.0%
CAACATTATTACAAAGACCT+TGG - Chr2:6020100-6020119 None:intergenic 30.0%
CTCGAAGAGATGATAATAAA+TGG + Chr2:6019702-6019721 MsG0280006772.01.T01:CDS 30.0%
GAAGCTAATAAAATCCGAAA+AGG + Chr2:6019014-6019033 MsG0280006772.01.T01:CDS 30.0%
TAGTTTCTGTGAATCAGTTT+AGG + Chr2:6019136-6019155 MsG0280006772.01.T01:CDS 30.0%
! ACATATGGTACGTTGATTAA+TGG + Chr2:6019534-6019553 MsG0280006772.01.T01:CDS 30.0%
! AGTTACACTAGTTTGATACA+TGG + Chr2:6019639-6019658 MsG0280006772.01.T01:CDS 30.0%
! CATATGGTACGTTGATTAAT+GGG + Chr2:6019535-6019554 MsG0280006772.01.T01:CDS 30.0%
!! GTCAAATGTTTTTGCAAGAA+AGG + Chr2:6020200-6020219 MsG0280006772.01.T01:CDS 30.0%
!!! AGCTTTGTTTATGTCCTTTT+CGG - Chr2:6019031-6019050 None:intergenic 30.0%
!!! TTCCCTCAATATTTTGATCA+AGG + Chr2:6019425-6019444 MsG0280006772.01.T01:CDS 30.0%
AATGGAGTTGTTAGAAGTGA+TGG + Chr2:6019797-6019816 MsG0280006772.01.T01:CDS 35.0%
AGCAAACTTCATTGATGAGA+TGG + Chr2:6020007-6020026 MsG0280006772.01.T01:CDS 35.0%
ATATTGAGGGAAACAACACT+TGG - Chr2:6019417-6019436 None:intergenic 35.0%
CAAACTTGGAAAAATCAGTC+AGG + Chr2:6019563-6019582 MsG0280006772.01.T01:CDS 35.0%
CGAGAATATCAAATACCGTA+AGG - Chr2:6019329-6019348 None:intergenic 35.0%
CGCCTTGATCAAAATATTGA+GGG - Chr2:6019430-6019449 None:intergenic 35.0%
CGTCATGATCACAATACTTT+CGG + Chr2:6019096-6019115 MsG0280006772.01.T01:CDS 35.0%
CTAGTGTAACTAACAACAGA+AGG - Chr2:6019630-6019649 None:intergenic 35.0%
GTACCATATGTATACGAATC+AGG - Chr2:6019525-6019544 None:intergenic 35.0%
GTACTATAAGTGACCATGTT+AGG - Chr2:6019840-6019859 None:intergenic 35.0%
TACAAGGAGATGAGAGAAAA+GGG + Chr2:6019384-6019403 MsG0280006772.01.T01:CDS 35.0%
TACGCATGCTAAGATACAAT+TGG - Chr2:6020139-6020158 None:intergenic 35.0%
TACGGTATTTGATATTCTCG+TGG + Chr2:6019329-6019348 MsG0280006772.01.T01:CDS 35.0%
TCATGTCAGAATGCATAACA+TGG + Chr2:6020070-6020089 MsG0280006772.01.T01:CDS 35.0%
TTACAAGGAGATGAGAGAAA+AGG + Chr2:6019383-6019402 MsG0280006772.01.T01:CDS 35.0%
! ATGGATGGTTTGTGTAAAAG+TGG + Chr2:6019759-6019778 MsG0280006772.01.T01:CDS 35.0%
! TAATGTGTGGAATTTGGGAT+CGG + Chr2:6020303-6020322 MsG0280006772.01.T01:CDS 35.0%
!!! AAGGGCTATTGGTTTTTACA+AGG + Chr2:6019368-6019387 MsG0280006772.01.T01:CDS 35.0%
AAAGGAACTGTTGGATGAGA+TGG + Chr2:6019587-6019606 MsG0280006772.01.T01:CDS 40.0%
AACCATGTGAAAAGGGCTAT+TGG + Chr2:6019357-6019376 MsG0280006772.01.T01:CDS 40.0%
AAGCTGTAGAGATTCTTGAC+AGG + Chr2:6019898-6019917 MsG0280006772.01.T01:CDS 40.0%
AATGAAGCAAGAAGATTGCG+AGG + Chr2:6019182-6019201 MsG0280006772.01.T01:CDS 40.0%
ATGCATAACATGGTTGTCCA+AGG + Chr2:6020080-6020099 MsG0280006772.01.T01:CDS 40.0%
CATATGTATACGAATCAGGC+TGG - Chr2:6019521-6019540 None:intergenic 40.0%
CATCTTATGGAAAACCCTGA+TGG - Chr2:6019271-6019290 None:intergenic 40.0%
CCTGAAAACCTTCCATCTTA+TGG - Chr2:6019284-6019303 None:intergenic 40.0%
GAACAAAGCTACTCGAATTC+TGG + Chr2:6020229-6020248 MsG0280006772.01.T01:CDS 40.0%
GCAACAGATGAGTATAGCAA+TGG + Chr2:6019069-6019088 MsG0280006772.01.T01:CDS 40.0%
GCGCCTTGATCAAAATATTG+AGG - Chr2:6019431-6019450 None:intergenic 40.0%
GGAGGAAAACCATGTGAAAA+GGG + Chr2:6019350-6019369 MsG0280006772.01.T01:CDS 40.0%
GGTATTTGATATTCTCGTGG+AGG + Chr2:6019332-6019351 MsG0280006772.01.T01:CDS 40.0%
GTATCTTAGCATGCGTACTA+GGG + Chr2:6020142-6020161 MsG0280006772.01.T01:CDS 40.0%
TAGAGATTCTTGACAGGATG+CGG + Chr2:6019904-6019923 MsG0280006772.01.T01:CDS 40.0%
TATCTTAGCATGCGTACTAG+GGG + Chr2:6020143-6020162 MsG0280006772.01.T01:CDS 40.0%
TGGAAAAATCAGTCAGGCAA+AGG + Chr2:6019569-6019588 MsG0280006772.01.T01:CDS 40.0%
TGGACATTCTTCACAAGCAA+TGG + Chr2:6019779-6019798 MsG0280006772.01.T01:CDS 40.0%
TGGAGGAAAACCATGTGAAA+AGG + Chr2:6019349-6019368 MsG0280006772.01.T01:CDS 40.0%
TGTATCTTAGCATGCGTACT+AGG + Chr2:6020141-6020160 MsG0280006772.01.T01:CDS 40.0%
TTCATTGATGAGATGGCTCT+CGG + Chr2:6020014-6020033 MsG0280006772.01.T01:CDS 40.0%
! AACCAATAGCCCTTTTCACA+TGG - Chr2:6019362-6019381 None:intergenic 40.0%
! AAGACGTCTTTTGCCTAACA+TGG + Chr2:6019824-6019843 MsG0280006772.01.T01:CDS 40.0%
! AGGGTTTTCCATAAGATGGA+AGG + Chr2:6019273-6019292 MsG0280006772.01.T01:CDS 40.0%
! CAGCCTGATTCGTATACATA+TGG + Chr2:6019519-6019538 MsG0280006772.01.T01:CDS 40.0%
! CATCAGGGTTTTCCATAAGA+TGG + Chr2:6019269-6019288 MsG0280006772.01.T01:CDS 40.0%
! CCATAAGATGGAAGGTTTTC+AGG + Chr2:6019281-6019300 MsG0280006772.01.T01:CDS 40.0%
! CTTTCGGTGCAATGATTCAT+AGG + Chr2:6019112-6019131 MsG0280006772.01.T01:CDS 40.0%
!! ATCAATGGGCTGTGTAAAGA+AGG + Chr2:6019864-6019883 MsG0280006772.01.T01:CDS 40.0%
!! ATTAATGGGCTGTGCAAACT+TGG + Chr2:6019549-6019568 MsG0280006772.01.T01:CDS 40.0%
!! GAATTCGAGTAGCTTTGTTC+AGG - Chr2:6020229-6020248 None:intergenic 40.0%
AAAACCCTGATGGCATCAAG+TGG - Chr2:6019261-6019280 None:intergenic 45.0%
AAACCAGATGCAGGGATGTA+CGG + Chr2:6019939-6019958 MsG0280006772.01.T01:CDS 45.0%
AAGGGTTGAAACCAGATGCA+GGG + Chr2:6019931-6019950 MsG0280006772.01.T01:CDS 45.0%
AATCAGTTTAGGCCAGCTGA+AGG + Chr2:6019147-6019166 MsG0280006772.01.T01:CDS 45.0%
ACATTCCACATTCCCTCATC+TGG - Chr2:6020281-6020300 None:intergenic 45.0%
CAAAGCTACTCGAATTCTGG+AGG + Chr2:6020232-6020251 MsG0280006772.01.T01:CDS 45.0%
CTGGAGGAGATGATAGTAGA+TGG + Chr2:6020248-6020267 MsG0280006772.01.T01:CDS 45.0%
GACGCAGAAGTCTTACCTTA+CGG + Chr2:6019311-6019330 MsG0280006772.01.T01:CDS 45.0%
GCAAGAAGATTGCGAGGTTA+CGG + Chr2:6019188-6019207 MsG0280006772.01.T01:CDS 45.0%
GTAAGGTAAGACTTCTGCGT+CGG - Chr2:6019312-6019331 None:intergenic 45.0%
TACAATTGGAATGCGCGAGT+TGG - Chr2:6020125-6020144 None:intergenic 45.0%
TCTCACCTAATCGAGCAAGT+TGG + Chr2:6020042-6020061 MsG0280006772.01.T01:CDS 45.0%
TGGGATCGGAAAAAAGTTCG+AGG + Chr2:6020317-6020336 MsG0280006772.01.T01:CDS 45.0%
TTGAGGGAAACAACACTTGG+CGG - Chr2:6019414-6019433 None:intergenic 45.0%
TTGGATGAGATGGAGGAGAA+AGG + Chr2:6019597-6019616 MsG0280006772.01.T01:CDS 45.0%
TTTCGTGAAATGCCCAATCG+TGG + Chr2:6019492-6019511 MsG0280006772.01.T01:CDS 45.0%
! AAGCTCCAACTTGCTCGATT+AGG - Chr2:6020050-6020069 None:intergenic 45.0%
!! AGGGGTATCTCTGTTGAGAT+TGG + Chr2:6020161-6020180 MsG0280006772.01.T01:CDS 45.0%
AACCAGATGCAGGGATGTAC+GGG + Chr2:6019940-6019959 MsG0280006772.01.T01:CDS 50.0%
AGAAGATTGCGAGGTTACGG+AGG + Chr2:6019191-6019210 MsG0280006772.01.T01:CDS 50.0%
AGATGGCTGCATTCCAGATG+AGG + Chr2:6020265-6020284 MsG0280006772.01.T01:CDS 50.0%
AGGAGCTACTGAGCTATTGC+TGG + Chr2:6020337-6020356 MsG0280006772.01.T01:CDS 50.0%
ATAGGCCACTTGATGCCATC+AGG + Chr2:6019253-6019272 MsG0280006772.01.T01:CDS 50.0%
ATTGATGAGATGGCTCTCGG+CGG + Chr2:6020017-6020036 MsG0280006772.01.T01:CDS 50.0%
CAAGGGTTGAAACCAGATGC+AGG + Chr2:6019930-6019949 MsG0280006772.01.T01:CDS 50.0%
CAGTCAGGCAAAGGAACTGT+TGG + Chr2:6019578-6019597 MsG0280006772.01.T01:CDS 50.0%
GAGGTTATGGACGTGTGCAT+AGG + Chr2:6019235-6019254 MsG0280006772.01.T01:CDS 50.0%
GATAGCTGCAAGCAGCACAA+AGG - Chr2:6019980-6019999 None:intergenic 50.0%
GATGGCTGCATTCCAGATGA+GGG + Chr2:6020266-6020285 MsG0280006772.01.T01:CDS 50.0%
GCATTCCAGATGAGGGAATG+TGG + Chr2:6020273-6020292 MsG0280006772.01.T01:CDS 50.0%
GGAACTGTTGGATGAGATGG+AGG + Chr2:6019590-6019609 MsG0280006772.01.T01:CDS 50.0%
TAGGCCACTTGATGCCATCA+GGG + Chr2:6019254-6019273 MsG0280006772.01.T01:CDS 50.0%
TTGACAGGATGCGGCTTCAA+GGG + Chr2:6019913-6019932 MsG0280006772.01.T01:CDS 50.0%
ATCAGGCTGGCATCCACGAT+TGG - Chr2:6019508-6019527 None:intergenic 55.0%
CTCTCCAGCATTCCTTCAGC+TGG - Chr2:6019162-6019181 None:intergenic 55.0%
CTTGACAGGATGCGGCTTCA+AGG + Chr2:6019912-6019931 MsG0280006772.01.T01:CDS 55.0%
TAGGCCAGCTGAAGGAATGC+TGG + Chr2:6019155-6019174 MsG0280006772.01.T01:CDS 55.0%
TCAGGCTGGCATCCACGATT+GGG - Chr2:6019507-6019526 None:intergenic 55.0%
! CAAGGCGCTCTGCAAAAACG+AGG + Chr2:6019443-6019462 MsG0280006772.01.T01:CDS 55.0%
CTCCCGTACATCCCTGCATC+TGG - Chr2:6019945-6019964 None:intergenic 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr2 gene 6018958 6020397 6018958 ID=MsG0280006772.01;Name=MsG0280006772.01
Chr2 mRNA 6018958 6020397 6018958 ID=MsG0280006772.01.T01;Parent=MsG0280006772.01;Name=MsG0280006772.01.T01;_AED=0.19;_eAED=0.19;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|479
Chr2 exon 6018958 6020397 6018958 ID=MsG0280006772.01.T01:exon:767;Parent=MsG0280006772.01.T01
Chr2 CDS 6018958 6020397 6018958 ID=MsG0280006772.01.T01:cds;Parent=MsG0280006772.01.T01
Gene Sequence

>MsG0280006772.01.T01

ATGGCTAGTAAAACTTTGTTTAAGTGGCCAAAGCAAATTACAAATTCACTAGTTGAGAAGCTAATAAAATCCGAAAAGGACATAAACAAAGCTCTTGTTATGTTTGATTCTGCAACAGATGAGTATAGCAATGGATTTCGTCATGATCACAATACTTTCGGTGCAATGATTCATAGGCTAGTTTCTGTGAATCAGTTTAGGCCAGCTGAAGGAATGCTGGAGAGAATGAAGCAAGAAGATTGCGAGGTTACGGAGGACGTCTTTTTAACTATATGTAGAGGTTATGGACGTGTGCATAGGCCACTTGATGCCATCAGGGTTTTCCATAAGATGGAAGGTTTTCAGGTTAAGCCGACGCAGAAGTCTTACCTTACGGTATTTGATATTCTCGTGGAGGAAAACCATGTGAAAAGGGCTATTGGTTTTTACAAGGAGATGAGAGAAAAGGGCATTCCGCCAAGTGTTGTTTCCCTCAATATTTTGATCAAGGCGCTCTGCAAAAACGAGGAAACTGTCGAGTCTGCTTTTCGAATATTTCGTGAAATGCCCAATCGTGGATGCCAGCCTGATTCGTATACATATGGTACGTTGATTAATGGGCTGTGCAAACTTGGAAAAATCAGTCAGGCAAAGGAACTGTTGGATGAGATGGAGGAGAAAGGTTTGTCACCTTCTGTTGTTAGTTACACTAGTTTGATACATGGCTTGTGTCAATCTAATAATTTGGACGAAGCTATAGAATTGCTCGAAGAGATGATAATAAATGGCATCGAGCCAAATGTTTTTACTTATAGTTCTTTAATGGATGGTTTGTGTAAAAGTGGACATTCTTCACAAGCAATGGAGTTGTTAGAAGTGATGGTCAGAAGACGTCTTTTGCCTAACATGGTCACTTATAGTACTTTAATCAATGGGCTGTGTAAAGAAGGAAAGCATAGAGAAGCTGTAGAGATTCTTGACAGGATGCGGCTTCAAGGGTTGAAACCAGATGCAGGGATGTACGGGAGAATCATACGCGACCTTTGTGCTGCTTGCAGCTATCAAGAAGCAGCAAACTTCATTGATGAGATGGCTCTCGGCGGTATCTCACCTAATCGAGCAAGTTGGAGCTTTCATGTCAGAATGCATAACATGGTTGTCCAAGGTCTTTGTAATAATGTTGATCCAACTCGCGCATTCCAATTGTATCTTAGCATGCGTACTAGGGGTATCTCTGTTGAGATTGGCACTTTTGATTGTTTAGTCAAATGTTTTTGCAAGAAAGGAGACCTGAACAAAGCTACTCGAATTCTGGAGGAGATGATAGTAGATGGCTGCATTCCAGATGAGGGAATGTGGAATGTATTAATGTGTGGAATTTGGGATCGGAAAAAAGTTCGAGGAGCTACTGAGCTATTGCTGGCTGAGCTGAAGCAGAAGTTTGTTGAAGCTGAGAGTTGA
Protein sequence

>MsG0280006772.01.T01

MASKTLFKWPKQITNSLVEKLIKSEKDINKALVMFDSATDEYSNGFRHDHNTFGAMIHRLVSVNQFRPAEGMLERMKQEDCEVTEDVFLTICRGYGRVHRPLDAIRVFHKMEGFQVKPTQKSYLTVFDILVEENHVKRAIGFYKEMREKGIPPSVVSLNILIKALCKNEETVESAFRIFREMPNRGCQPDSYTYGTLINGLCKLGKISQAKELLDEMEEKGLSPSVVSYTSLIHGLCQSNNLDEAIELLEEMIINGIEPNVFTYSSLMDGLCKSGHSSQAMELLEVMVRRRLLPNMVTYSTLINGLCKEGKHREAVEILDRMRLQGLKPDAGMYGRIIRDLCAACSYQEAANFIDEMALGGISPNRASWSFHVRMHNMVVQGLCNNVDPTRAFQLYLSMRTRGISVEIGTFDCLVKCFCKKGDLNKATRILEEMIVDGCIPDEGMWNVLMCGIWDRKKVRGATELLLAELKQKFVEAES*