AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880044214.01

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MsG0880044214.01.T01 AT4G11460 41.214 313 121 4 393 653 362 663 3.10e-69 239
MsG0880044214.01.T01 AT4G11530 43.493 292 103 3 393 632 368 649 3.86e-69 238
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MsG0880044214.01.T01 AT1G67520 42.812 313 114 6 393 650 304 606 1.51e-67 233
MsG0880044214.01.T01 AT4G23270 41.584 303 112 4 393 643 342 631 3.19e-67 232
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MsG0880044214.01.T01 AT4G23270 41.584 303 112 4 393 643 342 631 3.73e-67 232
MsG0880044214.01.T01 AT4G11470 43.158 285 100 3 393 625 360 634 8.13e-67 232
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MsG0880044214.01.T01 AT1G11300 28.090 178 117 5 78 248 74 247 1.74e-13 74.3
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MsG0880044214.01.T01 AT4G23320 35.309 405 177 8 321 652 111 503 3.76e-63 218
MsG0880044214.01.T01 AT4G23290 39.683 315 125 4 393 655 379 680 5.58e-63 222
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MsG0880044214.01.T01 AT4G23190 39.869 306 118 4 393 644 288 581 2.80e-61 215
MsG0880044214.01.T01 AT4G27300 41.613 310 114 5 371 628 498 792 2.97e-61 219
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MsG0880044214.01.T01 AT4G23250 41.754 285 104 3 393 625 370 644 2.98e-60 215
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MsG0880044214.01.T01 AT4G03230 41.115 287 105 4 393 626 634 909 5.26e-60 217
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MsG0880044214.01.T01 AT4G03230 41.115 287 105 4 393 626 606 881 5.40e-60 216
MsG0880044214.01.T01 AT4G00970 41.053 285 104 3 393 623 360 634 5.91e-60 213
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MsG0880044214.01.T01 AT4G03230 41.115 287 105 4 393 626 706 981 1.11e-59 216
MsG0880044214.01.T01 AT4G00960 39.583 288 104 6 393 623 72 346 3.28e-59 204
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MsG0880044214.01.T01 AT1G61430 42.105 285 101 4 393 625 482 754 9.03e-59 211
MsG0880044214.01.T01 AT1G61430 42.105 285 101 4 393 625 505 777 1.16e-58 211
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MsG0880044214.01.T01 AT4G27290 25.670 261 175 8 24 273 16 268 1.30e-12 71.6
MsG0880044214.01.T01 AT1G61490 39.935 308 120 4 393 649 356 649 1.59e-58 209
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MsG0880044214.01.T01 AT1G61440 41.608 286 103 4 392 625 523 796 1.93e-58 211
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MsG0880044214.01.T01 AT1G61500 42.215 289 101 5 393 627 512 788 3.09e-58 210
MsG0880044214.01.T01 AT1G11410 39.185 319 128 5 393 657 424 730 3.18e-58 209
MsG0880044214.01.T01 AT1G61400 39.936 313 124 5 393 653 516 816 6.62e-58 209
MsG0880044214.01.T01 AT1G61490 39.935 308 120 4 393 649 480 773 6.70e-58 209
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MsG0880044214.01.T01 AT1G61420 31.073 177 113 5 46 218 37 208 2.70e-11 67.4
MsG0880044214.01.T01 AT1G61420 40.418 287 107 4 393 627 510 784 1.26e-55 203
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MsG0880044214.01.T01 AT1G61360 39.683 315 123 6 393 653 433 734 1.22e-52 194
MsG0880044214.01.T01 AT1G61360 39.683 315 123 6 393 653 514 815 1.79e-52 194
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MsG0880044214.01.T01 AT1G56130 32.812 320 147 5 393 657 710 1016 2.26e-39 156
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MsG0880044214.01.T01 AT1G56120 32.808 317 144 6 393 654 726 1028 6.09e-39 154
MsG0880044214.01.T01 AT3G55550 32.971 276 125 2 397 622 367 632 6.62e-39 153
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MsG0880044214.01.T01 AT4G23190 42.365 203 56 2 393 544 366 558 9.04e-39 151
MsG0880044214.01.T01 AT4G04570 42.714 199 53 2 393 540 364 552 5.07e-38 149
MsG0880044214.01.T01 AT4G04540 42.211 199 54 2 393 540 369 557 1.64e-37 148
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MsG0880044214.01.T01 AT1G61430 44.500 200 48 3 393 540 482 670 2.06e-37 149
MsG0880044214.01.T01 AT1G61430 44.724 199 47 3 394 540 509 696 2.87e-37 149
MsG0880044214.01.T01 AT4G00970 39.815 216 67 2 393 555 360 565 3.03e-37 147
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MsG0880044214.01.T01 AT1G29740 32.372 312 149 3 393 653 693 993 1.04e-36 148
MsG0880044214.01.T01 AT4G23280 36.866 217 85 2 476 640 383 599 1.46e-36 145
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MsG0880044214.01.T01 AT1G68690 33.088 272 104 5 393 604 393 646 1.95e-33 137
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MsG0880044214.01.T01 AT3G18810 31.834 289 121 5 386 616 348 618 2.97e-33 136
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MsG0880044214.01.T01 AT2G18470 29.758 289 127 6 386 616 295 565 4.90e-33 135
MsG0880044214.01.T01 AT1G68690 33.579 271 102 5 393 603 393 645 5.30e-33 135
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MsG0880044214.01.T01 AT3G45430 33.210 271 119 3 393 613 360 618 2.04e-32 133
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MsG0880044214.01.T01 AT5G18610 31.559 263 119 3 398 608 105 358 5.28e-31 127
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MsG0880044214.01.T01 AT4G04500 53.211 109 41 1 393 501 361 459 8.28e-29 121
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MsG0880044214.01.T01 AT3G45440 29.412 289 123 7 393 621 358 625 1.51e-28 121
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MsG0880044214.01.T01 AT1G48210 28.679 265 133 3 394 607 85 344 1.20e-25 109
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MsG0880044214.01.T01 AT2G43690 27.715 267 133 2 397 613 356 612 1.26e-25 112
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MsG0880044214.01.T01 AT1G07570 30.337 267 120 6 397 609 98 352 1.98e-25 109
MsG0880044214.01.T01 AT1G15530 27.444 266 130 4 393 607 377 630 2.12e-25 112
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MsG0880044214.01.T01 AT3G17410 31.481 270 119 5 394 607 86 345 2.19e-25 108
MsG0880044214.01.T01 AT2G26290 28.571 266 128 3 399 613 117 371 2.21e-25 109
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MsG0880044214.01.T01 AT5G38990 28.155 309 157 4 395 647 544 843 2.45e-25 112
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MsG0880044214.01.T01 AT3G16030 66.667 78 26 0 393 470 564 641 3.29e-25 111
MsG0880044214.01.T01 AT3G16030 38.674 181 105 6 81 259 85 261 1.01e-22 103
MsG0880044214.01.T01 AT3G16030 66.667 78 26 0 393 470 564 641 3.29e-25 111
MsG0880044214.01.T01 AT3G16030 38.674 181 105 6 81 259 85 261 1.01e-22 103
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MsG0880044214.01.T01 AT4G35030 27.941 272 135 2 393 612 120 382 4.08e-25 109
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MsG0880044214.01.T01 AT4G11900 52.294 109 42 1 393 501 553 651 5.02e-25 110
MsG0880044214.01.T01 AT5G49780 26.562 320 162 6 395 655 651 956 5.29e-25 111
MsG0880044214.01.T01 AT3G46340 29.811 265 115 4 395 604 604 852 5.31e-25 111
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MsG0880044214.01.T01 AT4G11900 52.294 109 42 1 393 501 553 651 5.51e-25 110
MsG0880044214.01.T01 AT2G19190 28.794 257 120 3 399 604 595 839 6.02e-25 111
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MsG0880044214.01.T01 AT2G28960 29.699 266 124 3 393 607 589 842 6.61e-25 110
MsG0880044214.01.T01 AT4G11900 52.294 109 42 1 393 501 553 651 6.62e-25 110
MsG0880044214.01.T01 AT2G28930 29.811 265 120 6 397 607 102 354 7.09e-25 108
MsG0880044214.01.T01 AT5G49760 27.698 278 129 4 395 616 649 910 7.55e-25 110
MsG0880044214.01.T01 AT1G29730 34.653 202 71 2 393 544 689 879 8.34e-25 110
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MsG0880044214.01.T01 AT5G18500 29.137 278 128 5 388 610 177 440 9.71e-25 108
MsG0880044214.01.T01 AT5G18500 29.137 278 128 5 388 610 177 440 9.71e-25 108
MsG0880044214.01.T01 AT5G18500 29.137 278 128 5 388 610 177 440 9.71e-25 108
MsG0880044214.01.T01 AT5G18500 29.137 278 128 5 388 610 177 440 9.71e-25 108
MsG0880044214.01.T01 AT5G18500 29.137 278 128 5 388 610 177 440 9.71e-25 108
MsG0880044214.01.T01 AT2G28930 29.811 265 120 6 397 607 110 362 9.99e-25 107
MsG0880044214.01.T01 AT1G76370 28.814 295 141 5 393 627 91 376 1.11e-24 107
MsG0880044214.01.T01 AT5G56790 29.851 268 120 4 394 607 407 660 1.13e-24 109
MsG0880044214.01.T01 AT2G37050 30.116 259 116 5 399 603 626 873 1.22e-24 110
MsG0880044214.01.T01 AT5G60320 29.278 263 124 3 401 613 372 622 1.26e-24 109
MsG0880044214.01.T01 AT2G19210 25.833 360 180 7 320 607 502 846 1.28e-24 110
MsG0880044214.01.T01 AT1G20650 28.625 269 127 4 393 607 94 351 1.28e-24 106
MsG0880044214.01.T01 AT2G37050 30.116 259 116 5 399 603 625 872 1.29e-24 110
MsG0880044214.01.T01 AT1G61590 29.389 262 123 3 399 609 128 378 1.47e-24 107
MsG0880044214.01.T01 AT2G18470 31.443 194 72 2 393 536 300 482 1.48e-24 108
MsG0880044214.01.T01 AT4G35030 28.517 263 127 2 393 603 120 373 1.63e-24 106
MsG0880044214.01.T01 AT1G34300 28.058 278 130 6 393 614 500 763 1.69e-24 109
MsG0880044214.01.T01 AT3G59420 31.716 268 120 5 393 607 528 785 1.81e-24 109
MsG0880044214.01.T01 AT1G60800 29.779 272 130 5 388 607 245 507 2.51e-24 108
MsG0880044214.01.T01 AT5G18910 26.490 302 142 8 388 631 203 482 2.72e-24 107
MsG0880044214.01.T01 AT1G60800 29.779 272 130 5 388 607 312 574 3.31e-24 108
MsG0880044214.01.T01 AT1G09440 28.975 283 122 5 388 610 168 431 3.83e-24 106
MsG0880044214.01.T01 AT1G09440 28.975 283 122 5 388 610 168 431 3.83e-24 106
MsG0880044214.01.T01 AT1G66150 26.619 278 137 6 393 613 604 871 3.90e-24 108
MsG0880044214.01.T01 AT1G69790 28.846 260 125 3 397 607 103 351 4.12e-24 105
MsG0880044214.01.T01 AT1G30570 28.947 266 121 6 393 604 536 787 4.49e-24 108
MsG0880044214.01.T01 AT3G62220 30.070 286 134 5 388 617 80 355 4.83e-24 104
MsG0880044214.01.T01 AT3G62220 30.070 286 134 5 388 617 80 355 4.83e-24 104
MsG0880044214.01.T01 AT1G69790 28.846 260 125 3 397 607 114 362 5.09e-24 105
MsG0880044214.01.T01 AT4G02010 28.889 315 152 7 393 644 396 701 5.42e-24 107
MsG0880044214.01.T01 AT5G65530 26.545 275 132 5 393 613 160 418 5.46e-24 105
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MsG0880044214.01.T01 AT3G55450 29.545 264 121 6 398 607 92 344 7.37e-24 104
MsG0880044214.01.T01 AT1G21590 28.364 275 132 4 392 613 424 686 7.46e-24 107
MsG0880044214.01.T01 AT5G28680 28.137 263 127 2 393 604 537 788 7.67e-24 107
MsG0880044214.01.T01 AT5G28680 28.137 263 127 2 393 604 537 788 7.67e-24 107
MsG0880044214.01.T01 AT3G13380 29.044 272 133 3 396 615 877 1140 7.89e-24 107
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MsG0880044214.01.T01 AT1G51805 28.839 267 125 4 393 607 569 822 9.57e-24 107
MsG0880044214.01.T01 AT2G13790 28.881 277 117 7 393 607 310 568 1.01e-23 106
MsG0880044214.01.T01 AT1G26150 32.683 205 74 3 393 547 446 636 1.29e-23 106
MsG0880044214.01.T01 AT5G59680 29.811 265 119 5 393 604 596 846 1.38e-23 106
MsG0880044214.01.T01 AT2G04300 29.167 264 122 4 393 604 557 807 1.60e-23 106
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MsG0880044214.01.T01 AT3G46330 30.189 265 119 4 393 604 558 809 1.96e-23 106
MsG0880044214.01.T01 AT1G56720 27.473 273 139 2 388 610 190 453 2.00e-23 104
MsG0880044214.01.T01 AT1G56720 27.473 273 139 2 388 610 190 453 2.00e-23 104
MsG0880044214.01.T01 AT1G56720 27.473 273 139 2 388 610 190 453 2.00e-23 104
MsG0880044214.01.T01 AT1G56720 27.473 273 139 2 388 610 190 453 2.00e-23 104
MsG0880044214.01.T01 AT4G20450 29.104 268 123 5 393 607 607 860 2.00e-23 106
MsG0880044214.01.T01 AT1G51830 27.536 345 160 9 337 604 328 659 2.14e-23 105
MsG0880044214.01.T01 AT1G51830 27.246 345 161 8 337 604 321 652 2.14e-23 105
MsG0880044214.01.T01 AT3G46330 30.189 265 119 4 393 604 582 833 2.22e-23 106
MsG0880044214.01.T01 AT1G29730 34.483 203 71 3 393 544 656 847 2.36e-23 106
MsG0880044214.01.T01 AT4G17660 29.434 265 117 4 402 612 125 373 2.38e-23 103
MsG0880044214.01.T01 AT3G46400 25.381 394 187 9 338 655 515 877 2.43e-23 105
MsG0880044214.01.T01 AT2G02800 28.626 262 125 3 397 607 113 363 2.72e-23 103
MsG0880044214.01.T01 AT2G02800 28.626 262 125 3 397 607 113 363 2.72e-23 103
MsG0880044214.01.T01 AT2G41970 28.736 261 130 3 399 607 94 350 3.06e-23 102
MsG0880044214.01.T01 AT4G30520 30.337 267 121 5 393 607 319 572 3.25e-23 105
MsG0880044214.01.T01 AT3G49670 28.662 314 133 9 393 644 706 990 4.09e-23 105
MsG0880044214.01.T01 AT2G29000 29.323 266 125 3 393 607 581 834 4.10e-23 105

Find 113 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 210 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CTTCGACAATTTCACCTTAA+TGG 0.149770 8:+37765711 MsG0880044214.01.T01:CDS
AGTGGCCAAAGTGTTGTTTA+TGG 0.220692 8:-37765664 None:intergenic
GGTGAAGAGTAAATGATTAT+TGG 0.246270 8:-37765636 None:intergenic
CAAAGTGTTGTTTATGGGTT+GGG 0.250555 8:-37765658 None:intergenic
TAAATTCACCCGAAGTTTCT+TGG 0.250671 8:-37765857 None:intergenic
ATGATCAATTCACCTTGTTT+TGG 0.258596 8:-37765894 None:intergenic
GCACAGTCTTTGACCCATTA+AGG 0.271217 8:-37765725 None:intergenic
ACATAGAATGCTGGTCTTCT+TGG 0.291640 8:-37768916 None:intergenic
TTCGACAATTTCACCTTAAT+GGG 0.294015 8:+37765712 MsG0880044214.01.T01:CDS
TATTATGCCCACTCATTATA+TGG 0.294790 8:+37767346 MsG0880044214.01.T01:CDS
ACTCCTTCCATGGCATATTC+TGG 0.300723 8:-37768511 None:intergenic
TGGATTATTCGAGATTATTC+CGG 0.322540 8:+37765965 MsG0880044214.01.T01:CDS
GGATTATTCGAGATTATTCC+GGG 0.346829 8:+37765966 MsG0880044214.01.T01:CDS
TCTCCTTTCCAAGAAACTTC+GGG 0.352319 8:+37765849 MsG0880044214.01.T01:CDS
TCTACCTCATGTGAAGTAGA+AGG 0.352480 8:+37769012 MsG0880044214.01.T01:CDS
TGGTGGAGACTGCTCTCAAC+AGG 0.353434 8:+37766086 MsG0880044214.01.T01:CDS
TTTACAACTTCAGGGAATCT+TGG 0.354273 8:+37767633 MsG0880044214.01.T01:CDS
GATCGCCCACTAAATCTAAT+AGG 0.360550 8:+37768622 MsG0880044214.01.T01:CDS
ATTAATAGGCATGGGAGTTA+TGG 0.395167 8:+37768716 MsG0880044214.01.T01:intron
AATATGCACTACAAGGTATA+CGG 0.399107 8:+37767388 MsG0880044214.01.T01:CDS
GGGAGGATATACCAACTTGC+AGG 0.400993 8:+37766189 MsG0880044214.01.T01:CDS
ACGGGTACTGAAGGAGGTAT+TGG 0.401357 8:+37766116 MsG0880044214.01.T01:CDS
GTCTCCTTTCCAAGAAACTT+CGG 0.403710 8:+37765848 MsG0880044214.01.T01:CDS
TTACAACTTCAGGGAATCTT+GGG 0.408975 8:+37767634 MsG0880044214.01.T01:CDS
AAGCGTTTCAACATAATAGA+AGG 0.410503 8:+37768200 MsG0880044214.01.T01:CDS
AGCTTGGACTTGTATCTGTT+TGG 0.418115 8:+37767835 MsG0880044214.01.T01:CDS
GTGGCCAAAGTGTTGTTTAT+GGG 0.418834 8:-37765663 None:intergenic
GTTGTTGAATTATCTATGTA+TGG 0.419547 8:-37766248 None:intergenic
ATGCACCTTTGCACTTCATC+AGG 0.422247 8:-37768793 None:intergenic
ACATGTCCTATTAGATTTAG+TGG 0.436146 8:-37768628 None:intergenic
CCAAAGTGTTGTTTATGGGT+TGG 0.439040 8:-37765659 None:intergenic
GGTGTCGGTGTCTTTCCCTT+TGG 0.445399 8:-37768971 None:intergenic
AGAAATTGTTGTCGTAGAAT+AGG 0.445993 8:-37768992 None:intergenic
AGAAAAGCGGCAAAGCGTAT+TGG 0.449051 8:+37765919 MsG0880044214.01.T01:CDS
AAGTCTGACGTCTACAGCTT+TGG 0.450533 8:+37768544 MsG0880044214.01.T01:CDS
TCAAAATAGAATCACAGAAT+AGG 0.451274 8:+37765610 MsG0880044214.01.T01:CDS
TGGTGAGTATCTAAAGCTAA+TGG 0.461240 8:+37768744 MsG0880044214.01.T01:CDS
TGCTTCTTGAAATCGTTTGT+GGG 0.462298 8:+37768572 MsG0880044214.01.T01:CDS
TTGATCCCAACGATGAAGTT+AGG 0.463971 8:+37765780 MsG0880044214.01.T01:CDS
CTCTCAACAGGGAATTTAAC+GGG 0.465518 8:+37766098 MsG0880044214.01.T01:CDS
TTGCTTCTTGAAATCGTTTG+TGG 0.466921 8:+37768571 MsG0880044214.01.T01:CDS
GATATAACATCAGACATTGT+AGG 0.467178 8:-37768859 None:intergenic
GGAAATGCAGATATGTGTTA+TGG 0.470259 8:+37766137 MsG0880044214.01.T01:CDS
CTTCAGGGAATCTTGGGAAC+AGG 0.470752 8:+37767640 MsG0880044214.01.T01:CDS
GAATTCCACAATTCCTTGCC+CGG 0.471383 8:-37767698 None:intergenic
AAAGTGTTGTTTATGGGTTG+GGG 0.472034 8:-37765657 None:intergenic
ACAAATCTTGTACAACTACT+TGG 0.476240 8:+37767757 MsG0880044214.01.T01:CDS
AACAGGACATAATTGGTCAT+TGG 0.476286 8:+37765815 MsG0880044214.01.T01:CDS
ACAAATGTGTCGTTTAATGT+TGG 0.477509 8:-37768769 None:intergenic
TAACGCCTAACTTCATCGTT+GGG 0.479963 8:-37765785 None:intergenic
TATTGATATACCTATGGTTG+TGG 0.483408 8:+37765331 MsG0880044214.01.T01:CDS
GTTACCTGTGTCTAATAAAG+TGG 0.483738 8:-37765682 None:intergenic
GCTCTCAACAGGGAATTTAA+CGG 0.484149 8:+37766097 MsG0880044214.01.T01:CDS
TAATTCAACAACGATGGAAC+AGG 0.484813 8:+37766259 MsG0880044214.01.T01:CDS
GCTGCATTCATGAAGAAGAA+AGG 0.491057 8:+37767782 MsG0880044214.01.T01:CDS
GAATGCTGGTCTTCTTGGTA+AGG 0.494868 8:-37768911 None:intergenic
AGCGGAAAACTTAAAAGCAA+TGG 0.506956 8:+37765945 MsG0880044214.01.T01:CDS
ATATATGCCAAACAAAAGCT+TGG 0.510271 8:+37767819 MsG0880044214.01.T01:CDS
ATACCAACTTGCAGGGAACC+TGG 0.512863 8:+37766197 MsG0880044214.01.T01:CDS
CCCTGAAGTTGTAAAACATA+CGG 0.513082 8:-37767625 None:intergenic
TTAACGCCTAACTTCATCGT+TGG 0.513459 8:-37765786 None:intergenic
AACATCCGGGCAAGGAATTG+TGG 0.513748 8:+37767693 MsG0880044214.01.T01:CDS
AAGTTGTATTGATATACCTA+TGG 0.522610 8:+37765325 MsG0880044214.01.T01:CDS
TCACCCGAAGTTTCTTGGAA+AGG 0.525128 8:-37765852 None:intergenic
CGGGTGAATTTAGTCTTGAG+TGG 0.525335 8:+37765868 MsG0880044214.01.T01:CDS
TTTCTTTGAAACACCTCACC+AGG 0.529314 8:-37766215 None:intergenic
TGGTGAGGTGTTTCAAAGAA+AGG 0.535700 8:+37766217 MsG0880044214.01.T01:CDS
CATGTCCTATTAGATTTAGT+GGG 0.541561 8:-37768627 None:intergenic
TGGCTAGCCATATAATGAGT+GGG 0.544683 8:-37767353 None:intergenic
GCAAGTGATAGTTTGAAGCC+AGG 0.547403 8:+37765387 MsG0880044214.01.T01:CDS
CTACCTCATGTGAAGTAGAA+GGG 0.547478 8:+37769013 MsG0880044214.01.T01:CDS
CCAACCCATAAACAACACTT+TGG 0.550256 8:+37765659 MsG0880044214.01.T01:CDS
GGGTGAATTTAGTCTTGAGT+GGG 0.552191 8:+37765869 MsG0880044214.01.T01:CDS
AGGAGGAAACAACTTCCAAA+GGG 0.554805 8:+37768956 MsG0880044214.01.T01:CDS
GAGGAGGAAACAACTTCCAA+AGG 0.556897 8:+37768955 MsG0880044214.01.T01:CDS
TGTAGAACAAACTCCTTCCA+TGG 0.562420 8:-37768521 None:intergenic
AGAATTATAAGACGTTATCA+TGG 0.567373 8:+37766066 MsG0880044214.01.T01:CDS
TGTTAGACGAGAGATATTTG+AGG 0.567809 8:+37768936 MsG0880044214.01.T01:CDS
TCTCGTCTAACATAGAATGC+TGG 0.568089 8:-37768925 None:intergenic
TTTGCATCAAATTTATCACC+TGG 0.577339 8:-37765405 None:intergenic
GTTGGGATCAAAGTGTCTGA+TGG 0.580335 8:-37765768 None:intergenic
TAGTGTTCCACCACAACCAT+AGG 0.583033 8:-37765341 None:intergenic
TTGGCTAGCCATATAATGAG+TGG 0.584615 8:-37767354 None:intergenic
GCATGGGAGTTATGGAATGA+TGG 0.585144 8:+37768724 MsG0880044214.01.T01:CDS
GAGGTGTTTCAAAGAAAGGC+GGG 0.592277 8:+37766221 MsG0880044214.01.T01:CDS
ATAATAGAAGGAATTGCTCA+AGG 0.593195 8:+37768212 MsG0880044214.01.T01:CDS
GGGAATTTAACGGGTACTGA+AGG 0.596511 8:+37766107 MsG0880044214.01.T01:CDS
CATAGATAATTCAACAACGA+TGG 0.601908 8:+37766253 MsG0880044214.01.T01:CDS
CTTGAGTGGGAACCAAAACA+AGG 0.602343 8:+37765882 MsG0880044214.01.T01:CDS
TAGACGAGAGATATTTGAGG+AGG 0.605461 8:+37768939 MsG0880044214.01.T01:CDS
AACTTGCAGGGAACCTGGTG+AGG 0.606111 8:+37766202 MsG0880044214.01.T01:CDS
GGCAAAGCGTATTGGAAAAG+CGG 0.609584 8:+37765927 MsG0880044214.01.T01:CDS
TGATATACCTATGGTTGTGG+TGG 0.612146 8:+37765334 MsG0880044214.01.T01:CDS
TGTTATGGATATAATAGTGA+TGG 0.613097 8:+37766152 MsG0880044214.01.T01:CDS
AATTTAACGGGTACTGAAGG+AGG 0.615870 8:+37766110 MsG0880044214.01.T01:CDS
TATGGATATAATAGTGATGG+AGG 0.618660 8:+37766155 MsG0880044214.01.T01:CDS
TCACCAGGTTCCCTGCAAGT+TGG 0.618893 8:-37766200 None:intergenic
TTGGCCACTTTATTAGACAC+AGG 0.619139 8:+37765678 MsG0880044214.01.T01:CDS
TTTCCCTTCTACTTCACATG+AGG 0.619457 8:-37769016 None:intergenic
CATGTCTCCAGAATATGCCA+TGG 0.619976 8:+37768504 MsG0880044214.01.T01:CDS
TCTCCAGAATATGCCATGGA+AGG 0.622019 8:+37768508 MsG0880044214.01.T01:CDS
TCCACGCTATATTCAAAACA+AGG 0.625296 8:+37765429 MsG0880044214.01.T01:CDS
GGAGGATATACCAACTTGCA+GGG 0.636612 8:+37766190 MsG0880044214.01.T01:CDS
ATGATTGTCGCTCAATAGTG+TGG 0.644949 8:+37765520 MsG0880044214.01.T01:CDS
GAATTGATCATCAAGAAAAG+CGG 0.655124 8:+37765906 MsG0880044214.01.T01:CDS
GGTGGAGACTGCTCTCAACA+GGG 0.655974 8:+37766087 MsG0880044214.01.T01:CDS
GTACATTATCATCTCTAACA+AGG 0.662352 8:+37766010 MsG0880044214.01.T01:CDS
TGTTGTCGTAGAATAGGTGT+CGG 0.664980 8:-37768986 None:intergenic
ATTATAAGACGTTATCATGG+TGG 0.666231 8:+37766069 MsG0880044214.01.T01:CDS
TGAGGTGTTTCAAAGAAAGG+CGG 0.669604 8:+37766220 MsG0880044214.01.T01:CDS
TTGTTCCTGATGAAGTGCAA+AGG 0.675769 8:+37768788 MsG0880044214.01.T01:CDS
GTGCAAAGGTGCATTCATGT+TGG 0.682981 8:+37768802 MsG0880044214.01.T01:CDS
ATGGGTCAAAGACTGTGCTG+TGG 0.724557 8:+37765730 MsG0880044214.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AATTCGATTAAATTATTAAT+AGG + Chr8:37768702-37768721 MsG0880044214.01.T01:intron 10.0%
!! ATTAATAATTTAATCGAATT+AGG - Chr8:37768702-37768721 None:intergenic 10.0%
!! AATTGATATAAAAAAGGTTA+TGG - Chr8:37766783-37766802 None:intergenic 15.0%
!! ATAATAAAAGTTTGTGAAAA+TGG - Chr8:37767013-37767032 None:intergenic 15.0%
!! ATCTCAAATTGATATAAAAA+AGG - Chr8:37766789-37766808 None:intergenic 15.0%
!! ATTAAATTATTAATAGGCAT+GGG + Chr8:37768708-37768727 MsG0880044214.01.T01:intron 15.0%
!! ATTGATATAAAAAAGGTTAT+GGG - Chr8:37766782-37766801 None:intergenic 15.0%
!!! AAAACATATATGCATTTTTT+AGG + Chr8:37767423-37767442 MsG0880044214.01.T01:CDS 15.0%
!!! TAATATCATTTTAACAAGAT+CGG + Chr8:37766312-37766331 MsG0880044214.01.T01:intron 15.0%
!!! TATTTTTATGTGATTTTTGT+TGG + Chr8:37767878-37767897 MsG0880044214.01.T01:intron 15.0%
!!! TGATTTTGAATTAGAAATAT+AGG + Chr8:37767180-37767199 MsG0880044214.01.T01:intron 15.0%
!! ACATAATTATCTTGATATAC+TGG - Chr8:37766814-37766833 None:intergenic 20.0%
!! ATCTGTTATGATATATTTGT+AGG - Chr8:37767051-37767070 None:intergenic 20.0%
!! CATAAAACAAGATATTTACT+TGG - Chr8:37768048-37768067 None:intergenic 20.0%
!! CATAATTATCTTGATATACT+GGG - Chr8:37766813-37766832 None:intergenic 20.0%
!! GATTAAATTATTAATAGGCA+TGG + Chr8:37768707-37768726 MsG0880044214.01.T01:intron 20.0%
!!! AAAACATACGGAAAAATTTT+AGG - Chr8:37767616-37767635 None:intergenic 20.0%
!!! AAATTGATTTTGTATAATGC+AGG + Chr8:37767272-37767291 MsG0880044214.01.T01:intron 20.0%
!!! AGAAAACTAAAATAGCATTT+TGG + Chr8:37768087-37768106 MsG0880044214.01.T01:intron 20.0%
!!! AGCATTTTATGAAATTATTG+TGG + Chr8:37767981-37768000 MsG0880044214.01.T01:intron 20.0%
!!! ATCGTTTCAAATTTGATTTT+TGG - Chr8:37767161-37767180 None:intergenic 20.0%
!!! ATTTATTCTTCTTTTTCCTA+AGG - Chr8:37766936-37766955 None:intergenic 20.0%
!!! TCGTTTCAAATTTGATTTTT+GGG - Chr8:37767160-37767179 None:intergenic 20.0%
!!! TGCATATTTTTGTTTCTTTT+TGG - Chr8:37767376-37767395 None:intergenic 20.0%
!!! TTATAACTACAAAAAGTGTT+CGG + Chr8:37767522-37767541 MsG0880044214.01.T01:intron 20.0%
!!! TTCCTTAGATAATTTTAACA+CGG - Chr8:37767588-37767607 None:intergenic 20.0%
! AAAAGACTTTCAAAAACATC+CGG + Chr8:37767679-37767698 MsG0880044214.01.T01:CDS 25.0%
! AAACAAAAATATGCACTACA+AGG + Chr8:37767381-37767400 MsG0880044214.01.T01:CDS 25.0%
! AACCGTGTTAAAATTATCTA+AGG + Chr8:37767583-37767602 MsG0880044214.01.T01:intron 25.0%
! AAGAAGAATAAATCAATCTG+AGG + Chr8:37766943-37766962 MsG0880044214.01.T01:intron 25.0%
! AAGATAATTATGTGACTATC+TGG + Chr8:37766821-37766840 MsG0880044214.01.T01:intron 25.0%
! AGAAGAATAAATCAATCTGA+GGG + Chr8:37766944-37766963 MsG0880044214.01.T01:intron 25.0%
! AGAATTATAAGACGTTATCA+TGG + Chr8:37766066-37766085 MsG0880044214.01.T01:CDS 25.0%
! AGATAATTATGTGACTATCT+GGG + Chr8:37766822-37766841 MsG0880044214.01.T01:intron 25.0%
! ATAGCTTACTATACTTGATA+AGG - Chr8:37766697-37766716 None:intergenic 25.0%
! CAGAGTGATTATTTACAAAT+AGG + Chr8:37766337-37766356 MsG0880044214.01.T01:intron 25.0%
! GAATTAGAAATATAGGACTA+GGG + Chr8:37767187-37767206 MsG0880044214.01.T01:intron 25.0%
! GTTGTTGAATTATCTATGTA+TGG - Chr8:37766251-37766270 None:intergenic 25.0%
! TAATGCAGGTAAAAAAAAAG+TGG + Chr8:37767286-37767305 MsG0880044214.01.T01:intron 25.0%
! TAATTCATGCATTAGGATAT+TGG + Chr8:37766377-37766396 MsG0880044214.01.T01:intron 25.0%
! TCAAAATAGAATCACAGAAT+AGG + Chr8:37765610-37765629 MsG0880044214.01.T01:CDS 25.0%
! TGAATTAGAAATATAGGACT+AGG + Chr8:37767186-37767205 MsG0880044214.01.T01:intron 25.0%
! TGTTATGGATATAATAGTGA+TGG + Chr8:37766152-37766171 MsG0880044214.01.T01:CDS 25.0%
!! AACCCAAAAATTTCTGATTT+TGG + Chr8:37768320-37768339 MsG0880044214.01.T01:intron 25.0%
!! AAGTTGTATTGATATACCTA+TGG + Chr8:37765325-37765344 MsG0880044214.01.T01:CDS 25.0%
!! ATGCCAAAATCAGAAATTTT+TGG - Chr8:37768326-37768345 None:intergenic 25.0%
!! GTTTTATCATTAGACTACTT+TGG + Chr8:37765582-37765601 MsG0880044214.01.T01:CDS 25.0%
!! TGCCAAAATCAGAAATTTTT+GGG - Chr8:37768325-37768344 None:intergenic 25.0%
!!! AAAAATTTCTGATTTTGGCA+TGG + Chr8:37768325-37768344 MsG0880044214.01.T01:intron 25.0%
!!! ACAGTTTGATAATGATCAAA+CGG - Chr8:37766489-37766508 None:intergenic 25.0%
!!! CATCTCAAACTTTTAGTTTT+TGG - Chr8:37767231-37767250 None:intergenic 25.0%
!!! TACTTGGTTATTTTCAAGTT+AGG - Chr8:37768032-37768051 None:intergenic 25.0%
AAAGACTTTCAAAAACATCC+GGG + Chr8:37767680-37767699 MsG0880044214.01.T01:CDS 30.0%
AACATAGTCACTTATACAAG+TGG + Chr8:37766588-37766607 MsG0880044214.01.T01:intron 30.0%
AAGCGTTTCAACATAATAGA+AGG + Chr8:37768200-37768219 MsG0880044214.01.T01:CDS 30.0%
AATATGCACTACAAGGTATA+CGG + Chr8:37767388-37767407 MsG0880044214.01.T01:CDS 30.0%
AATCATTCATAGAGACTTGA+AGG + Chr8:37768268-37768287 MsG0880044214.01.T01:intron 30.0%
AATCCTGTTGGTATTTACTA+CGG - Chr8:37768375-37768394 None:intergenic 30.0%
ACAAATCTTGTACAACTACT+TGG + Chr8:37767757-37767776 MsG0880044214.01.T01:CDS 30.0%
ACATGTCCTATTAGATTTAG+TGG - Chr8:37768631-37768650 None:intergenic 30.0%
AGAAAATTATGAGTGGTTGA+CGG + Chr8:37767079-37767098 MsG0880044214.01.T01:intron 30.0%
AGAAATTGTTGTCGTAGAAT+AGG - Chr8:37768995-37769014 None:intergenic 30.0%
AGGTAAAAAAAAAGTGGATG+TGG + Chr8:37767292-37767311 MsG0880044214.01.T01:intron 30.0%
ATAAAAAAGGTTATGGGAAG+TGG - Chr8:37766776-37766795 None:intergenic 30.0%
ATAATAGAAGGAATTGCTCA+AGG + Chr8:37768212-37768231 MsG0880044214.01.T01:CDS 30.0%
ATATATGCCAAACAAAAGCT+TGG + Chr8:37767819-37767838 MsG0880044214.01.T01:CDS 30.0%
ATCGAAAAACAGGACATAAT+TGG + Chr8:37765808-37765827 MsG0880044214.01.T01:CDS 30.0%
ATTATAAGACGTTATCATGG+TGG + Chr8:37766069-37766088 MsG0880044214.01.T01:CDS 30.0%
CATAGATAATTCAACAACGA+TGG + Chr8:37766253-37766272 MsG0880044214.01.T01:CDS 30.0%
CATGTCCTATTAGATTTAGT+GGG - Chr8:37768630-37768649 None:intergenic 30.0%
CATTTACTCAAAGTAACCTT+AGG + Chr8:37766917-37766936 MsG0880044214.01.T01:intron 30.0%
GAATTGATCATCAAGAAAAG+CGG + Chr8:37765906-37765925 MsG0880044214.01.T01:CDS 30.0%
GAGTTATCAAAATGACTTTG+AGG + Chr8:37766654-37766673 MsG0880044214.01.T01:intron 30.0%
GATATAACATCAGACATTGT+AGG - Chr8:37768862-37768881 None:intergenic 30.0%
GGTGAAGAGTAAATGATTAT+TGG - Chr8:37765639-37765658 None:intergenic 30.0%
GTACATTATCATCTCTAACA+AGG + Chr8:37766010-37766029 MsG0880044214.01.T01:CDS 30.0%
GTCAACTTAATTCATGCATT+AGG + Chr8:37766370-37766389 MsG0880044214.01.T01:intron 30.0%
GTTAGACATGAAAATGTCAT+TGG + Chr8:37766966-37766985 MsG0880044214.01.T01:intron 30.0%
TAAAAAAGGTTATGGGAAGT+GGG - Chr8:37766775-37766794 None:intergenic 30.0%
TAAATACCAACAGGATTGTT+GGG + Chr8:37768378-37768397 MsG0880044214.01.T01:intron 30.0%
TATGGATATAATAGTGATGG+AGG + Chr8:37766155-37766174 MsG0880044214.01.T01:CDS 30.0%
TATTATGCCCACTCATTATA+TGG + Chr8:37767346-37767365 MsG0880044214.01.T01:CDS 30.0%
TATTGATATACCTATGGTTG+TGG + Chr8:37765331-37765350 MsG0880044214.01.T01:CDS 30.0%
TGGATTATTCGAGATTATTC+CGG + Chr8:37765965-37765984 MsG0880044214.01.T01:CDS 30.0%
TTCGACAATTTCACCTTAAT+GGG + Chr8:37765712-37765731 MsG0880044214.01.T01:CDS 30.0%
TTGAATGCGTGAAAAACTAA+CGG + Chr8:37766517-37766536 MsG0880044214.01.T01:intron 30.0%
TTTGCATCAAATTTATCACC+TGG - Chr8:37765408-37765427 None:intergenic 30.0%
! AACCACTCATAATTTTCTCT+TGG - Chr8:37767077-37767096 None:intergenic 30.0%
! GTGAGTTTTCTAGACTTTTA+TGG + Chr8:37768406-37768425 MsG0880044214.01.T01:intron 30.0%
! GTTATGAATTTTGTGTGTAG+TGG + Chr8:37768478-37768497 MsG0880044214.01.T01:intron 30.0%
!! AAAATGGATTGCGAATTGTA+TGG - Chr8:37766997-37767016 None:intergenic 30.0%
!! ACAAATGTGTCGTTTAATGT+TGG - Chr8:37768772-37768791 None:intergenic 30.0%
!! ATGATCAATTCACCTTGTTT+TGG - Chr8:37765897-37765916 None:intergenic 30.0%
!! CATGAATTAAGTTGACTGTT+GGG - Chr8:37766366-37766385 None:intergenic 30.0%
!! TACATATTTTGAACATTGCC+CGG - Chr8:37765987-37766006 None:intergenic 30.0%
!!! AACTGCTGATTTTATGTCTA+TGG - Chr8:37765565-37765584 None:intergenic 30.0%
!!! ACTGCTGATTTTATGTCTAT+GGG - Chr8:37765564-37765583 None:intergenic 30.0%
AAAACCATTCCTATCGCAAA+AGG + Chr8:37766846-37766865 MsG0880044214.01.T01:intron 35.0%
AACAGGACATAATTGGTCAT+TGG + Chr8:37765815-37765834 MsG0880044214.01.T01:CDS 35.0%
AATCCGTAGTAAATACCAAC+AGG + Chr8:37768369-37768388 MsG0880044214.01.T01:intron 35.0%
ACAGGATGTGACTTAATTCA+TGG + Chr8:37766277-37766296 MsG0880044214.01.T01:intron 35.0%
AGAAATATAGGACTAGGGTT+TGG + Chr8:37767192-37767211 MsG0880044214.01.T01:intron 35.0%
AGCCAAGAGAAAATTATGAG+TGG + Chr8:37767072-37767091 MsG0880044214.01.T01:intron 35.0%
AGCGGAAAACTTAAAAGCAA+TGG + Chr8:37765945-37765964 MsG0880044214.01.T01:CDS 35.0%
ATTAATAGGCATGGGAGTTA+TGG + Chr8:37768716-37768735 MsG0880044214.01.T01:intron 35.0%
CCCTGAAGTTGTAAAACATA+CGG - Chr8:37767628-37767647 None:intergenic 35.0%
CTTCGACAATTTCACCTTAA+TGG + Chr8:37765711-37765730 MsG0880044214.01.T01:CDS 35.0%
GGAAATGCAGATATGTGTTA+TGG + Chr8:37766137-37766156 MsG0880044214.01.T01:CDS 35.0%
GGATTATTCGAGATTATTCC+GGG + Chr8:37765966-37765985 MsG0880044214.01.T01:CDS 35.0%
GTAAATACCAACAGGATTGT+TGG + Chr8:37768377-37768396 MsG0880044214.01.T01:intron 35.0%
GTTACCTGTGTCTAATAAAG+TGG - Chr8:37765685-37765704 None:intergenic 35.0%
TAAATTCACCCGAAGTTTCT+TGG - Chr8:37765860-37765879 None:intergenic 35.0%
TAATTCAACAACGATGGAAC+AGG + Chr8:37766259-37766278 MsG0880044214.01.T01:CDS 35.0%
TCCACGCTATATTCAAAACA+AGG + Chr8:37765429-37765448 MsG0880044214.01.T01:CDS 35.0%
TGCTTCTTGAAATCGTTTGT+GGG + Chr8:37768572-37768591 MsG0880044214.01.T01:CDS 35.0%
TGTTAGACGAGAGATATTTG+AGG + Chr8:37768936-37768955 MsG0880044214.01.T01:CDS 35.0%
TTACAACTTCAGGGAATCTT+GGG + Chr8:37767634-37767653 MsG0880044214.01.T01:CDS 35.0%
TTAGGCGTTAATCGAAAAAC+AGG + Chr8:37765798-37765817 MsG0880044214.01.T01:CDS 35.0%
TTGCTTCTTGAAATCGTTTG+TGG + Chr8:37768571-37768590 MsG0880044214.01.T01:CDS 35.0%
TTTACAACTTCAGGGAATCT+TGG + Chr8:37767633-37767652 MsG0880044214.01.T01:CDS 35.0%
! AATTCCTTTTGCGATAGGAA+TGG - Chr8:37766853-37766872 None:intergenic 35.0%
! CACAAAATTCCTTTTGCGAT+AGG - Chr8:37766858-37766877 None:intergenic 35.0%
! CCGTATGTTTTACAACTTCA+GGG + Chr8:37767625-37767644 MsG0880044214.01.T01:CDS 35.0%
! TACAAGTCCAAGCTTTTGTT+TGG - Chr8:37767829-37767848 None:intergenic 35.0%
! TCCGTATGTTTTACAACTTC+AGG + Chr8:37767624-37767643 MsG0880044214.01.T01:CDS 35.0%
! TGGTGAGTATCTAAAGCTAA+TGG + Chr8:37768744-37768763 MsG0880044214.01.T01:CDS 35.0%
! TTGGTATATCCTCCCATTTT+TGG - Chr8:37766184-37766203 None:intergenic 35.0%
!! AAAGTGTTGTTTATGGGTTG+GGG - Chr8:37765660-37765679 None:intergenic 35.0%
!! CAAAGTGTTGTTTATGGGTT+GGG - Chr8:37765661-37765680 None:intergenic 35.0%
!! GCATGAATTAAGTTGACTGT+TGG - Chr8:37766367-37766386 None:intergenic 35.0%
AACGGCAATGGAACATAATC+TGG + Chr8:37766535-37766554 MsG0880044214.01.T01:intron 40.0%
AGCTTGGACTTGTATCTGTT+TGG + Chr8:37767835-37767854 MsG0880044214.01.T01:CDS 40.0%
AGGAGGAAACAACTTCCAAA+GGG + Chr8:37768956-37768975 MsG0880044214.01.T01:CDS 40.0%
ATGATTGTCGCTCAATAGTG+TGG + Chr8:37765520-37765539 MsG0880044214.01.T01:CDS 40.0%
CCAACCCATAAACAACACTT+TGG + Chr8:37765659-37765678 MsG0880044214.01.T01:CDS 40.0%
CGAAAAAGAAGCTGCTAGAT+TGG + Chr8:37768174-37768193 MsG0880044214.01.T01:CDS 40.0%
CTACCTCATGTGAAGTAGAA+GGG + Chr8:37769013-37769032 MsG0880044214.01.T01:CDS 40.0%
CTCTCAACAGGGAATTTAAC+GGG + Chr8:37766098-37766117 MsG0880044214.01.T01:CDS 40.0%
GATCGCCCACTAAATCTAAT+AGG + Chr8:37768622-37768641 MsG0880044214.01.T01:CDS 40.0%
GCTCTCAACAGGGAATTTAA+CGG + Chr8:37766097-37766116 MsG0880044214.01.T01:CDS 40.0%
GCTGCATTCATGAAGAAGAA+AGG + Chr8:37767782-37767801 MsG0880044214.01.T01:CDS 40.0%
GGCAAGAATGTTCACACAAT+AGG + Chr8:37768346-37768365 MsG0880044214.01.T01:intron 40.0%
GTCTCCTTTCCAAGAAACTT+CGG + Chr8:37765848-37765867 MsG0880044214.01.T01:CDS 40.0%
TAACGCCTAACTTCATCGTT+GGG - Chr8:37765788-37765807 None:intergenic 40.0%
TAGACGAGAGATATTTGAGG+AGG + Chr8:37768939-37768958 MsG0880044214.01.T01:CDS 40.0%
TCTACCTCATGTGAAGTAGA+AGG + Chr8:37769012-37769031 MsG0880044214.01.T01:CDS 40.0%
TCTCCTTTCCAAGAAACTTC+GGG + Chr8:37765849-37765868 MsG0880044214.01.T01:CDS 40.0%
TCTCGTCTAACATAGAATGC+TGG - Chr8:37768928-37768947 None:intergenic 40.0%
TGATATACCTATGGTTGTGG+TGG + Chr8:37765334-37765353 MsG0880044214.01.T01:CDS 40.0%
TGATGGAGGATGCCAAAAAT+GGG + Chr8:37766169-37766188 MsG0880044214.01.T01:CDS 40.0%
TGTAGAACAAACTCCTTCCA+TGG - Chr8:37768524-37768543 None:intergenic 40.0%
TGTTGTCGTAGAATAGGTGT+CGG - Chr8:37768989-37769008 None:intergenic 40.0%
TTAACGCCTAACTTCATCGT+TGG - Chr8:37765789-37765808 None:intergenic 40.0%
TTGATCCCAACGATGAAGTT+AGG + Chr8:37765780-37765799 MsG0880044214.01.T01:CDS 40.0%
TTGTTCCTGATGAAGTGCAA+AGG + Chr8:37768788-37768807 MsG0880044214.01.T01:CDS 40.0%
TTTCCCTTCTACTTCACATG+AGG - Chr8:37769019-37769038 None:intergenic 40.0%
! TGAGGTGTTTCAAAGAAAGG+CGG + Chr8:37766220-37766239 MsG0880044214.01.T01:CDS 40.0%
! TGGCTAGCCATATAATGAGT+GGG - Chr8:37767356-37767375 None:intergenic 40.0%
! TGGTGAGGTGTTTCAAAGAA+AGG + Chr8:37766217-37766236 MsG0880044214.01.T01:CDS 40.0%
! TTGGCCACTTTATTAGACAC+AGG + Chr8:37765678-37765697 MsG0880044214.01.T01:CDS 40.0%
! TTGGCTAGCCATATAATGAG+TGG - Chr8:37767357-37767376 None:intergenic 40.0%
!! AATTTAACGGGTACTGAAGG+AGG + Chr8:37766110-37766129 MsG0880044214.01.T01:CDS 40.0%
!! ACATAGAATGCTGGTCTTCT+TGG - Chr8:37768919-37768938 None:intergenic 40.0%
!! AGTGGCCAAAGTGTTGTTTA+TGG - Chr8:37765667-37765686 None:intergenic 40.0%
!! CCAAAGTGTTGTTTATGGGT+TGG - Chr8:37765662-37765681 None:intergenic 40.0%
!! GGGTGAATTTAGTCTTGAGT+GGG + Chr8:37765869-37765888 MsG0880044214.01.T01:CDS 40.0%
!! GTGGCCAAAGTGTTGTTTAT+GGG - Chr8:37765666-37765685 None:intergenic 40.0%
!! TTTCTTTGAAACACCTCACC+AGG - Chr8:37766218-37766237 None:intergenic 40.0%
!!! GCCTTGTTTTGAATATAGCG+TGG - Chr8:37765433-37765452 None:intergenic 40.0%
AAGTCTGACGTCTACAGCTT+TGG + Chr8:37768544-37768563 MsG0880044214.01.T01:CDS 45.0%
ACTCCTTCCATGGCATATTC+TGG - Chr8:37768514-37768533 None:intergenic 45.0%
AGAAAAGCGGCAAAGCGTAT+TGG + Chr8:37765919-37765938 MsG0880044214.01.T01:CDS 45.0%
ATGCACCTTTGCACTTCATC+AGG - Chr8:37768796-37768815 None:intergenic 45.0%
CATGTCTCCAGAATATGCCA+TGG + Chr8:37768504-37768523 MsG0880044214.01.T01:CDS 45.0%
CTATGTCCCAACAATCCTGT+TGG - Chr8:37768387-37768406 None:intergenic 45.0%
CTTGAGTGGGAACCAAAACA+AGG + Chr8:37765882-37765901 MsG0880044214.01.T01:CDS 45.0%
CTTTCAAAAACATCCGGGCA+AGG + Chr8:37767685-37767704 MsG0880044214.01.T01:CDS 45.0%
GAAGAATTCTCTTTGCCCGT+CGG - Chr8:37766623-37766642 None:intergenic 45.0%
GAATTCCACAATTCCTTGCC+CGG - Chr8:37767701-37767720 None:intergenic 45.0%
GAGGAGGAAACAACTTCCAA+AGG + Chr8:37768955-37768974 MsG0880044214.01.T01:CDS 45.0%
GCACAGTCTTTGACCCATTA+AGG - Chr8:37765728-37765747 None:intergenic 45.0%
GCATGGGAGTTATGGAATGA+TGG + Chr8:37768724-37768743 MsG0880044214.01.T01:CDS 45.0%
GCGTGAAAAACTAACGGCAA+TGG + Chr8:37766523-37766542 MsG0880044214.01.T01:intron 45.0%
GGAGGATATACCAACTTGCA+GGG + Chr8:37766190-37766209 MsG0880044214.01.T01:CDS 45.0%
GGCAAAGCGTATTGGAAAAG+CGG + Chr8:37765927-37765946 MsG0880044214.01.T01:CDS 45.0%
TAGTGTTCCACCACAACCAT+AGG - Chr8:37765344-37765363 None:intergenic 45.0%
TCACCCGAAGTTTCTTGGAA+AGG - Chr8:37765855-37765874 None:intergenic 45.0%
TCTCCAGAATATGCCATGGA+AGG + Chr8:37768508-37768527 MsG0880044214.01.T01:CDS 45.0%
! GAGGTGTTTCAAAGAAAGGC+GGG + Chr8:37766221-37766240 MsG0880044214.01.T01:CDS 45.0%
! GCAAGTGATAGTTTGAAGCC+AGG + Chr8:37765387-37765406 MsG0880044214.01.T01:CDS 45.0%
! GTGATGGAGGATGCCAAAAA+TGG + Chr8:37766168-37766187 MsG0880044214.01.T01:CDS 45.0%
! GTGCAAAGGTGCATTCATGT+TGG + Chr8:37768802-37768821 MsG0880044214.01.T01:CDS 45.0%
! GTTGGGATCAAAGTGTCTGA+TGG - Chr8:37765771-37765790 None:intergenic 45.0%
!! CGGGTGAATTTAGTCTTGAG+TGG + Chr8:37765868-37765887 MsG0880044214.01.T01:CDS 45.0%
!! GAATGCTGGTCTTCTTGGTA+AGG - Chr8:37768914-37768933 None:intergenic 45.0%
!! GGGAATTTAACGGGTACTGA+AGG + Chr8:37766107-37766126 MsG0880044214.01.T01:CDS 45.0%
AACATCCGGGCAAGGAATTG+TGG + Chr8:37767693-37767712 MsG0880044214.01.T01:CDS 50.0%
AAGTGGACATTCTCTCCGAC+GGG + Chr8:37766605-37766624 MsG0880044214.01.T01:intron 50.0%
ATACCAACTTGCAGGGAACC+TGG + Chr8:37766197-37766216 MsG0880044214.01.T01:CDS 50.0%
ATGGGTCAAAGACTGTGCTG+TGG + Chr8:37765730-37765749 MsG0880044214.01.T01:CDS 50.0%
CAAGTGGACATTCTCTCCGA+CGG + Chr8:37766604-37766623 MsG0880044214.01.T01:intron 50.0%
CTTCAGGGAATCTTGGGAAC+AGG + Chr8:37767640-37767659 MsG0880044214.01.T01:CDS 50.0%
GGGAGGATATACCAACTTGC+AGG + Chr8:37766189-37766208 MsG0880044214.01.T01:CDS 50.0%
TGGAGGATGCCAAAAATGGG+AGG + Chr8:37766172-37766191 MsG0880044214.01.T01:CDS 50.0%
!! ACGGGTACTGAAGGAGGTAT+TGG + Chr8:37766116-37766135 MsG0880044214.01.T01:CDS 50.0%
AACTTGCAGGGAACCTGGTG+AGG + Chr8:37766202-37766221 MsG0880044214.01.T01:CDS 55.0%
GGTGGAGACTGCTCTCAACA+GGG + Chr8:37766087-37766106 MsG0880044214.01.T01:CDS 55.0%
TCACCAGGTTCCCTGCAAGT+TGG - Chr8:37766203-37766222 None:intergenic 55.0%
TGGTGGAGACTGCTCTCAAC+AGG + Chr8:37766086-37766105 MsG0880044214.01.T01:CDS 55.0%
!! GGTGTCGGTGTCTTTCCCTT+TGG - Chr8:37768974-37768993 None:intergenic 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr8 gene 37765297 37769044 37765297 ID=MsG0880044214.01;Name=MsG0880044214.01
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Chr8 exon 37765297 37766283 37765297 ID=MsG0880044214.01.T01:exon:2800;Parent=MsG0880044214.01.T01
Chr8 exon 37767294 37767444 37767294 ID=MsG0880044214.01.T01:exon:2799;Parent=MsG0880044214.01.T01
Chr8 exon 37767605 37767886 37767605 ID=MsG0880044214.01.T01:exon:2798;Parent=MsG0880044214.01.T01
Chr8 exon 37768168 37768252 37768168 ID=MsG0880044214.01.T01:exon:2797;Parent=MsG0880044214.01.T01
Chr8 exon 37768498 37768648 37768498 ID=MsG0880044214.01.T01:exon:2796;Parent=MsG0880044214.01.T01
Chr8 exon 37768724 37769044 37768724 ID=MsG0880044214.01.T01:exon:2795;Parent=MsG0880044214.01.T01
Chr8 CDS 37765297 37766283 37765297 ID=MsG0880044214.01.T01:cds;Parent=MsG0880044214.01.T01
Chr8 CDS 37767294 37767444 37767294 ID=MsG0880044214.01.T01:cds;Parent=MsG0880044214.01.T01
Chr8 CDS 37767605 37767886 37767605 ID=MsG0880044214.01.T01:cds;Parent=MsG0880044214.01.T01
Chr8 CDS 37768168 37768252 37768168 ID=MsG0880044214.01.T01:cds;Parent=MsG0880044214.01.T01
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Chr8 CDS 37768724 37769044 37768724 ID=MsG0880044214.01.T01:cds;Parent=MsG0880044214.01.T01
Gene Sequence

>MsG0880044214.01.T01

ATGATGATAAGCTTTGAAATAAAGAAACAAGTTGTATTGATATACCTATGGTTGTGGTGGAACACTACTGCTAATATTTGTGTTAAAGCAGCAAGTGATAGTTTGAAGCCAGGTGATAAATTTGATGCAAATTCCACGCTATATTCAAAACAAGGCAAGTATTGTCTATTTTTCGATCGATCATTAGATAGCGAAGATGCTCACTTGATTATAACTGTGAATGATGATTGTCGCTCAATAGTGTGGATGTACGATAGAAATCAACCCATAGACATAAAATCAGCAGTTTTATCATTAGACTACTTTGGTGTGCTCAAAATAGAATCACAGAATAGGAAACCAATAATCATTTACTCTTCACCCCAACCCATAAACAACACTTTGGCCACTTTATTAGACACAGGTAACTTTGTTCTTCGACAATTTCACCTTAATGGGTCAAAGACTGTGCTGTGGCAGAGTTTTGATTATCCATCAGACACTTTGATCCCAACGATGAAGTTAGGCGTTAATCGAAAAACAGGACATAATTGGTCATTGGTATCATGCTTGTCTCCTTTCCAAGAAACTTCGGGTGAATTTAGTCTTGAGTGGGAACCAAAACAAGGTGAATTGATCATCAAGAAAAGCGGCAAAGCGTATTGGAAAAGCGGAAAACTTAAAAGCAATGGATTATTCGAGATTATTCCGGGCAATGTTCAAAATATGTATCAGTACATTATCATCTCTAACAAGGATGAAGATTCTTTCACTTATAAAATCAAAGATCAGAATTATAAGACGTTATCATGGTGGAGACTGCTCTCAACAGGGAATTTAACGGGTACTGAAGGAGGTATTGGAAATGCAGATATGTGTTATGGATATAATAGTGATGGAGGATGCCAAAAATGGGAGGATATACCAACTTGCAGGGAACCTGGTGAGGTGTTTCAAAGAAAGGCGGGCAGACCATACATAGATAATTCAACAACGATGGAACAGGATGTAAAAAAAAAGTGGATGTGGATATGTTCTGCAATCGCAATTGCTTTACTCATATTATGCCCACTCATTATATGGCTAGCCAAAAAGAAACAAAAATATGCACTACAAGGTATACGGATACTTGATAAAAAAACATATATGCATTTTTTAGGAAATGTTCCTAAAATTTTTCCGTATGTTTTACAACTTCAGGGAATCTTGGGAACAGGACAAGAAGTTGTTGTAAAAAGACTTTCAAAAACATCCGGGCAAGGAATTGTGGAATTCAAAAATGAATTAGTACTTATATGTGAACTTCAGCACACAAATCTTGTACAACTACTTGGTTGCTGCATTCATGAAGAAGAAAGGATTCTGATTTACGAATATATGCCAAACAAAAGCTTGGACTTGTATCTGTTTGGTGAGAATATGTTGAAGTCTATATTTTTATATTGTACGAAAAAGAAGCTGCTAGATTGGAAGAAGCGTTTCAACATAATAGAAGGAATTGCTCAAGGATTGCTCTATCTTCATAATGGATACATGTCTCCAGAATATGCCATGGAAGGAGTTTGTTCTACAAAGTCTGACGTCTACAGCTTTGGAGTGTTGCTTCTTGAAATCGTTTGTGGGAGAAAAAACAATAGCTTCTATGATGTTGATCGCCCACTAAATCTAATAGGACATGCATGGGAGTTATGGAATGATGGTGAGTATCTAAAGCTAATGGATCCAACATTAAACGACACATTTGTTCCTGATGAAGTGCAAAGGTGCATTCATGTTGGTCTCTTATGTGTAGAGCATTATGCAATTGATCGACCTACAATGTCTGATGTTATATCTGTGTTAACAAACAAATATGAACTCAGAACCTTACCAAGAAGACCAGCATTCTATGTTAGACGAGAGATATTTGAGGAGGAAACAACTTCCAAAGGGAAAGACACCGACACCTATTCTACGACAACAATTTCTACCTCATGTGAAGTAGAAGGGAAAATATAA
Protein sequence

>MsG0880044214.01.T01

MMISFEIKKQVVLIYLWLWWNTTANICVKAASDSLKPGDKFDANSTLYSKQGKYCLFFDRSLDSEDAHLIITVNDDCRSIVWMYDRNQPIDIKSAVLSLDYFGVLKIESQNRKPIIIYSSPQPINNTLATLLDTGNFVLRQFHLNGSKTVLWQSFDYPSDTLIPTMKLGVNRKTGHNWSLVSCLSPFQETSGEFSLEWEPKQGELIIKKSGKAYWKSGKLKSNGLFEIIPGNVQNMYQYIIISNKDEDSFTYKIKDQNYKTLSWWRLLSTGNLTGTEGGIGNADMCYGYNSDGGCQKWEDIPTCREPGEVFQRKAGRPYIDNSTTMEQDVKKKWMWICSAIAIALLILCPLIIWLAKKKQKYALQGIRILDKKTYMHFLGNVPKIFPYVLQLQGILGTGQEVVVKRLSKTSGQGIVEFKNELVLICELQHTNLVQLLGCCIHEEERILIYEYMPNKSLDLYLFGENMLKSIFLYCTKKKLLDWKKRFNIIEGIAQGLLYLHNGYMSPEYAMEGVCSTKSDVYSFGVLLLEIVCGRKNNSFYDVDRPLNLIGHAWELWNDGEYLKLMDPTLNDTFVPDEVQRCIHVGLLCVEHYAIDRPTMSDVISVLTNKYELRTLPRRPAFYVRREIFEEETTSKGKDTDTYSTTTISTSCEVEGKI*