AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880044388.01

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MsG0880044388.01.T01 AT1G61420 47.000 200 100 3 477 675 615 809 8.51e-48 181
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MsG0880044388.01.T01 AT3G16030 28.853 558 293 24 2 478 30 564 5.64e-32 133
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MsG0880044388.01.T01 AT1G67520 29.081 533 272 23 2 478 30 512 9.15e-32 132
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MsG0880044388.01.T01 AT1G67520 29.081 533 272 23 2 478 37 519 9.12e-32 132
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MsG0880044388.01.T01 AT1G61430 27.036 577 359 16 7 551 34 580 7.42e-50 184
MsG0880044388.01.T01 AT4G23320 53.293 167 76 1 479 643 304 470 7.64e-50 182
MsG0880044388.01.T01 AT4G23320 53.293 167 76 1 479 643 304 470 7.64e-50 182
MsG0880044388.01.T01 AT1G61430 27.036 577 359 16 7 551 43 589 7.89e-50 184
MsG0880044388.01.T01 AT4G23320 53.293 167 76 1 479 643 325 491 1.15e-49 182
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MsG0880044388.01.T01 AT1G56120 43.114 167 92 3 478 643 811 975 1.15e-32 135
MsG0880044388.01.T01 AT1G56120 43.114 167 92 3 478 643 829 993 1.15e-32 135
MsG0880044388.01.T01 AT1G53430 46.405 153 80 2 477 628 748 899 1.17e-32 135
MsG0880044388.01.T01 AT1G70520 42.778 180 95 4 478 650 445 623 1.25e-32 134
MsG0880044388.01.T01 AT1G53430 46.405 153 80 2 477 628 789 940 1.52e-32 135
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MsG0880044388.01.T01 AT3G16030 28.853 558 293 24 2 478 30 564 2.93e-32 133
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MsG0880044388.01.T01 AT3G09010 36.464 181 112 3 479 658 168 346 5.88e-32 128
MsG0880044388.01.T01 AT1G53420 41.830 153 87 2 477 628 744 895 5.97e-32 133
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MsG0880044388.01.T01 AT3G16030 68.085 47 15 0 477 523 667 713 4.91e-13 73.2
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MsG0880044388.01.T01 AT2G35620 39.506 162 94 4 478 638 422 580 5.29e-29 122
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MsG0880044388.01.T01 AT2G42960 38.217 157 91 3 478 631 304 457 2.70e-27 116
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MsG0880044388.01.T01 AT5G18610 35.673 171 108 2 479 647 206 376 1.65e-25 111
MsG0880044388.01.T01 AT1G70130 36.041 197 113 5 479 674 455 639 1.74e-25 112
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MsG0880044388.01.T01 AT1G09440 36.774 155 96 2 478 631 278 431 1.91e-25 110
MsG0880044388.01.T01 AT4G34500 36.184 152 95 2 478 628 268 418 1.96e-25 110
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MsG0880044388.01.T01 AT2G07180 38.816 152 91 2 479 628 216 367 2.36e-25 110
MsG0880044388.01.T01 AT1G01540 34.211 152 98 2 478 628 275 425 2.47e-25 110
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MsG0880044388.01.T01 AT2G18470 38.065 155 91 2 478 628 403 556 6.63e-25 110
MsG0880044388.01.T01 AT2G18470 38.065 155 91 2 478 628 403 556 6.63e-25 110
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MsG0880044388.01.T01 AT1G55200 35.065 154 98 2 479 631 500 652 7.32e-25 110
MsG0880044388.01.T01 AT1G55200 35.065 154 98 2 479 631 500 652 7.32e-25 110
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MsG0880044388.01.T01 AT3G45430 39.394 165 86 6 479 638 464 619 1.08e-24 109
MsG0880044388.01.T01 AT4G28350 34.641 153 95 2 478 628 470 619 1.10e-24 109
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MsG0880044388.01.T01 AT5G60300 38.650 163 96 4 479 640 464 623 1.81e-24 109
MsG0880044388.01.T01 AT5G60300 38.650 163 96 4 479 640 464 623 2.11e-24 109
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MsG0880044388.01.T01 AT5G02290 40.000 155 87 4 478 628 198 350 2.30e-24 106
MsG0880044388.01.T01 AT1G09970 38.816 152 90 3 479 628 801 951 2.58e-24 109
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MsG0880044388.01.T01 AT1G68690 40.385 156 81 4 478 625 495 646 1.12e-23 106
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MsG0880044388.01.T01 AT5G18500 36.184 152 95 2 478 628 287 437 1.26e-23 105
MsG0880044388.01.T01 AT5G18500 36.184 152 95 2 478 628 287 437 1.26e-23 105
MsG0880044388.01.T01 AT5G18500 36.184 152 95 2 478 628 287 437 1.26e-23 105
MsG0880044388.01.T01 AT5G18500 36.184 152 95 2 478 628 287 437 1.26e-23 105
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MsG0880044388.01.T01 AT2G28250 38.554 166 88 3 478 632 334 496 1.29e-23 105
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MsG0880044388.01.T01 AT4G29450 34.437 151 98 1 479 628 698 848 2.73e-23 105
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MsG0880044388.01.T01 AT5G63940 36.196 163 94 4 478 634 482 640 2.91e-23 105
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MsG0880044388.01.T01 AT5G65700 34.118 170 108 3 479 646 816 983 2.94e-23 105
MsG0880044388.01.T01 AT1G24030 34.000 150 96 3 479 625 96 245 2.95e-23 100
MsG0880044388.01.T01 AT3G17420 33.548 155 101 2 478 631 275 428 3.24e-23 103
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MsG0880044388.01.T01 AT2G13800 36.306 157 96 2 478 631 280 435 3.33e-23 103
MsG0880044388.01.T01 AT1G26970 37.908 153 93 2 478 628 210 362 3.39e-23 103
MsG0880044388.01.T01 AT5G65600 33.143 175 105 4 479 642 471 644 3.63e-23 105
MsG0880044388.01.T01 AT5G56790 35.220 159 101 2 479 636 511 668 4.08e-23 105
MsG0880044388.01.T01 AT3G59700 32.704 159 104 3 479 636 460 616 4.18e-23 104
MsG0880044388.01.T01 AT5G60320 36.364 165 97 5 479 640 468 627 4.18e-23 105
MsG0880044388.01.T01 AT3G55450 36.145 166 103 3 475 638 190 354 4.36e-23 102
MsG0880044388.01.T01 AT1G70530 53.409 88 40 1 477 564 442 528 4.42e-23 104
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MsG0880044388.01.T01 AT5G56460 38.255 149 90 2 479 625 205 353 4.85e-23 102
MsG0880044388.01.T01 AT1G70450 36.478 159 95 4 478 631 169 326 4.99e-23 102
MsG0880044388.01.T01 AT5G38240 33.668 199 123 5 473 664 378 574 5.04e-23 104
MsG0880044388.01.T01 AT3G13380 39.355 155 86 4 478 627 980 1131 6.32e-23 105
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MsG0880044388.01.T01 AT2G13800 36.306 157 96 2 478 631 397 552 6.43e-23 103
MsG0880044388.01.T01 AT4G34440 37.736 159 92 4 478 631 431 587 6.47e-23 104
MsG0880044388.01.T01 AT4G34440 37.736 159 92 4 478 631 431 587 6.47e-23 104
MsG0880044388.01.T01 AT1G24030 34.000 150 96 3 479 625 133 282 6.55e-23 100
MsG0880044388.01.T01 AT5G38240 33.668 199 123 5 473 664 424 620 6.65e-23 103
MsG0880044388.01.T01 AT1G69790 37.255 153 94 2 478 628 210 362 6.68e-23 102
MsG0880044388.01.T01 AT1G69790 37.255 153 94 2 478 628 199 351 6.79e-23 101
MsG0880044388.01.T01 AT3G55450 36.145 166 103 3 475 638 227 391 6.89e-23 102
MsG0880044388.01.T01 AT1G09970 38.562 153 90 4 479 628 801 952 6.94e-23 104
MsG0880044388.01.T01 AT2G33170 33.871 186 93 6 478 641 947 1124 6.99e-23 104
MsG0880044388.01.T01 AT2G33170 33.871 186 93 6 478 641 947 1124 6.99e-23 104
MsG0880044388.01.T01 AT2G23950 37.179 156 95 2 478 631 417 571 7.11e-23 103
MsG0880044388.01.T01 AT4G32710 41.104 163 87 5 479 633 509 670 7.23e-23 104
MsG0880044388.01.T01 AT1G34210 36.306 157 96 2 478 631 427 582 7.49e-23 103
MsG0880044388.01.T01 AT1G34210 36.306 157 96 2 478 631 427 582 7.49e-23 103
MsG0880044388.01.T01 AT1G23540 37.736 159 93 4 478 631 490 647 7.53e-23 104
MsG0880044388.01.T01 AT5G38240 33.668 199 123 5 473 664 442 638 8.84e-23 103
MsG0880044388.01.T01 AT4G30520 38.462 156 93 2 478 631 421 575 1.17e-22 103
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MsG0880044388.01.T01 AT1G24030 34.000 150 96 3 479 625 201 350 1.28e-22 100
MsG0880044388.01.T01 AT5G07180 38.926 149 83 4 478 624 675 817 1.53e-22 103
MsG0880044388.01.T01 AT5G45780 36.601 153 94 2 478 628 378 529 1.59e-22 102
MsG0880044388.01.T01 AT1G70460 37.179 156 92 4 478 628 472 626 1.62e-22 103
MsG0880044388.01.T01 AT5G07180 38.926 149 83 4 478 624 771 913 1.87e-22 103
MsG0880044388.01.T01 AT5G15730 38.272 162 86 5 468 628 225 373 1.93e-22 101
MsG0880044388.01.T01 AT5G15730 38.272 162 86 5 468 628 227 375 2.10e-22 101
MsG0880044388.01.T01 AT5G15730 38.272 162 86 5 468 628 227 375 2.10e-22 101
MsG0880044388.01.T01 AT5G48940 33.553 152 95 2 479 628 916 1063 2.45e-22 103
MsG0880044388.01.T01 AT5G38250 36.723 177 100 7 473 640 421 594 2.55e-22 102
MsG0880044388.01.T01 AT3G02130 40.260 154 86 5 476 625 989 1140 2.60e-22 103
MsG0880044388.01.T01 AT3G02130 40.260 154 86 5 476 625 972 1123 2.60e-22 103
MsG0880044388.01.T01 AT5G45780 36.601 153 94 2 478 628 421 572 2.81e-22 102
MsG0880044388.01.T01 AT3G24540 38.235 170 84 7 478 634 302 463 3.12e-22 100
MsG0880044388.01.T01 AT1G17750 35.669 157 88 3 479 625 917 1070 3.38e-22 102
MsG0880044388.01.T01 AT2G01950 35.758 165 89 2 478 626 961 1124 3.42e-22 102
MsG0880044388.01.T01 AT1G21230 37.162 148 91 2 479 625 529 675 3.66e-22 102
MsG0880044388.01.T01 AT1G55610 37.419 155 91 4 478 628 982 1134 3.77e-22 102
MsG0880044388.01.T01 AT1G55610 37.419 155 91 4 478 628 982 1134 3.77e-22 102
MsG0880044388.01.T01 AT1G66980 36.683 199 107 8 478 664 906 1097 4.19e-22 102
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MsG0880044388.01.T01 AT1G66980 36.683 199 107 8 478 664 952 1143 4.45e-22 102
MsG0880044388.01.T01 AT1G66980 36.683 199 107 8 478 664 950 1141 4.56e-22 102
MsG0880044388.01.T01 AT4G28490 35.758 165 100 4 479 640 815 976 4.61e-22 102
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MsG0880044388.01.T01 AT1G75820 33.918 171 90 4 479 635 813 974 4.87e-22 102
MsG0880044388.01.T01 AT1G66980 36.683 199 107 8 478 664 923 1114 5.03e-22 102
MsG0880044388.01.T01 AT1G48210 36.184 152 96 1 478 628 193 344 5.28e-22 99.0
MsG0880044388.01.T01 AT1G48210 36.184 152 96 1 478 628 193 344 5.28e-22 99.0
MsG0880044388.01.T01 AT1G48210 36.184 152 96 1 478 628 193 344 5.28e-22 99.0
MsG0880044388.01.T01 AT1G48210 36.184 152 96 1 478 628 193 344 5.28e-22 99.0
MsG0880044388.01.T01 AT1G52540 35.526 152 95 2 478 628 158 307 5.49e-22 98.6
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MsG0880044388.01.T01 AT5G49780 37.576 165 79 6 479 630 654 807 5.72e-22 101
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MsG0880044388.01.T01 AT1G08590 36.306 157 89 5 479 629 850 1001 6.42e-22 101
MsG0880044388.01.T01 AT4G29050 34.171 199 118 8 479 668 479 673 6.52e-22 101
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MsG0880044388.01.T01 AT2G43230 34.524 168 104 2 479 640 273 440 7.29e-22 99.4
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MsG0880044388.01.T01 AT5G49780 37.576 165 79 6 479 630 753 906 7.32e-22 101
MsG0880044388.01.T01 AT5G35580 34.416 154 99 2 479 630 214 367 7.54e-22 100
MsG0880044388.01.T01 AT1G67000 34.872 195 99 7 473 646 670 857 7.83e-22 101
MsG0880044388.01.T01 AT4G29050 34.171 199 118 8 479 668 465 659 8.08e-22 100
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MsG0880044388.01.T01 AT1G21210 35.762 151 95 2 479 628 531 680 8.17e-22 100
MsG0880044388.01.T01 AT3G25560 36.538 156 96 2 478 631 430 584 8.31e-22 100
MsG0880044388.01.T01 AT5G49780 37.576 165 79 6 479 630 775 928 8.40e-22 101
MsG0880044388.01.T01 AT1G67520 35.789 190 110 4 2 181 30 217 8.50e-22 100
MsG0880044388.01.T01 AT1G67520 68.085 47 15 0 477 523 540 586 1.89e-13 73.9
MsG0880044388.01.T01 AT3G25560 36.538 156 96 2 478 631 430 584 8.50e-22 100
MsG0880044388.01.T01 AT2G26330 35.542 166 98 4 478 642 768 925 8.69e-22 101

Find 136 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 231 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GGTGGAGTTCTCTCTGTTTC+TGG 0.102884 8:-41190081 None:intergenic
CACATTAGAACCTTTATTTA+TGG 0.124530 8:-41190516 None:intergenic
AGTCCAATATTCACGTATTT+TGG 0.166294 8:-41193041 None:intergenic
TACCAAAGGACAAGATTATT+TGG 0.167310 8:+41190135 MsG0880044388.01.T01:CDS
AACACCTTCAATAGATAAAT+TGG 0.177399 8:-41190558 None:intergenic
ACAAATTCCTTCAATCTTCT+TGG 0.179868 8:+41192806 MsG0880044388.01.T01:CDS
CGATGTTCATTCCAGGTAAA+AGG 0.211877 8:-41190382 None:intergenic
TTTGGAATGGCGAGAATATT+TGG 0.229143 8:+41192506 MsG0880044388.01.T01:CDS
TGATTGGTTTATTTGTTTAC+TGG 0.234659 8:+41191548 MsG0880044388.01.T01:CDS
TTTCAATTGGTAGCAATTCT+AGG 0.243243 8:+41190624 MsG0880044388.01.T01:CDS
TTCCGAGTCTTTAACATTCA+TGG 0.273098 8:-41191754 None:intergenic
CCATAAAATCGCTTTGTTAG+AGG 0.273534 8:-41190333 None:intergenic
TATTCAAGGCTTGGGATCTA+TGG 0.274893 8:+41192952 MsG0880044388.01.T01:intron
GTACCAAAATACGTGAATAT+TGG 0.287884 8:+41193038 MsG0880044388.01.T01:CDS
AACCGTTTGATGCTGATTCT+TGG 0.290880 8:+41190813 MsG0880044388.01.T01:CDS
ACGCCTTCCATAGCATATTC+TGG 0.291446 8:-41192698 None:intergenic
CCAAGTACTATGTGGGTATA+TGG 0.309580 8:+41190102 MsG0880044388.01.T01:CDS
AGGTTGGTATTGGAAGTGTC+TGG 0.317871 8:+41190644 MsG0880044388.01.T01:CDS
TGTGGGTATATGGTTTAAAA+AGG 0.319629 8:+41190112 MsG0880044388.01.T01:CDS
CTAATATTGCTTATACTGAT+TGG 0.334716 8:+41191532 MsG0880044388.01.T01:CDS
GCGAGTCTAACCATAAATAA+AGG 0.339829 8:+41190506 MsG0880044388.01.T01:CDS
GATCTATGGACCAACAATTC+TGG 0.343679 8:+41192966 MsG0880044388.01.T01:CDS
CCAACTGCAGTCGTTACATT+AGG 0.355476 8:-41191454 None:intergenic
AAACTTGGCGAAGGTGGCTT+TGG 0.357741 8:+41191885 MsG0880044388.01.T01:CDS
GACATGGTTGGTCTATCTTC+TGG 0.373322 8:-41193083 None:intergenic
GGACTTGATTGATTCAAAAC+TGG 0.385489 8:+41192992 MsG0880044388.01.T01:CDS
AAATCTGACGTGTTTAGCTT+TGG 0.393199 8:+41192731 MsG0880044388.01.T01:CDS
ACCAAAGGACAAGATTATTT+GGG 0.394404 8:+41190136 MsG0880044388.01.T01:CDS
GACCCTTGTCACTGTCTCAA+TGG 0.394862 8:+41190785 MsG0880044388.01.T01:CDS
TCGCAAAGCCGGCGTCATAT+TGG 0.399299 8:-41190487 None:intergenic
CAGACAAGGGTACAAAAGTT+AGG 0.405267 8:+41191787 MsG0880044388.01.T01:CDS
TAGCAATTCTAGGTTGGTAT+TGG 0.408468 8:+41190634 MsG0880044388.01.T01:CDS
ACCCAAATAATCTTGTCCTT+TGG 0.413011 8:-41190137 None:intergenic
TTAAATCTCGGTGAATGATT+CGG 0.416670 8:-41192433 None:intergenic
GCGTCATATTGGAGAGTATA+TGG 0.416947 8:-41190476 None:intergenic
ATAGCTGTTATTTGAAATGT+TGG 0.423208 8:-41190261 None:intergenic
TCTAATGTGTTGTGGGTTGA+TGG 0.423540 8:+41190530 MsG0880044388.01.T01:CDS
CGCCTTCCATAGCATATTCT+GGG 0.423767 8:-41192697 None:intergenic
AGAATTGTTTGTTCCGCACT+TGG 0.431007 8:-41190726 None:intergenic
TCTGATGTTGTAACAATGAT+TGG 0.431612 8:+41193104 MsG0880044388.01.T01:CDS
ATACGGTGGAAACTATGAAC+TGG 0.432332 8:+41190049 MsG0880044388.01.T01:CDS
AACTGTAGGTTCAATTCATA+TGG 0.432505 8:-41190941 None:intergenic
GGTAACATTGTGATCATAGA+TGG 0.433570 8:+41190218 MsG0880044388.01.T01:CDS
GCAAATACAAATCGCATAGT+TGG 0.435189 8:+41192545 MsG0880044388.01.T01:CDS
AATGCTGGTGGCTTTGGACT+AGG 0.445765 8:-41193146 None:intergenic
ACGCTCACAAGACTAAATAA+TGG 0.450421 8:-41191828 None:intergenic
CACTTATAATCTCTAACAAA+AGG 0.451424 8:-41192757 None:intergenic
ACTGCAGAAGACCCTGCTCC+TGG 0.451681 8:+41190452 MsG0880044388.01.T01:CDS
TAGATTCCTCTGACCAGCCT+TGG 0.452838 8:-41190679 None:intergenic
ATTCTTGGAGAAAGGGGAAT+AGG 0.454249 8:+41190828 MsG0880044388.01.T01:CDS
TACATATCCAAGAAGATTGA+AGG 0.454874 8:-41192813 None:intergenic
AATCCTAAAATATCAGACTT+TGG 0.455209 8:+41192488 MsG0880044388.01.T01:CDS
TTCGCCAAGTTTATTTGTAT+CGG 0.455580 8:-41191874 None:intergenic
AGAGTATATGGTCCAGGAGC+AGG 0.455839 8:-41190464 None:intergenic
TGATGCTGATTCTTGGAGAA+AGG 0.456084 8:+41190820 MsG0880044388.01.T01:CDS
CAAGTCCATTCCAGAATTGT+TGG 0.457189 8:-41192976 None:intergenic
AATTCCAATTTATCTATTGA+AGG 0.457980 8:+41190554 MsG0880044388.01.T01:CDS
TCGTGTCCGATGTTCATTCC+AGG 0.458687 8:-41190389 None:intergenic
CCATATACCCACATAGTACT+TGG 0.461566 8:-41190102 None:intergenic
GGTTGGTATTGGAAGTGTCT+GGG 0.468073 8:+41190645 MsG0880044388.01.T01:CDS
ACGATCTTGCGGATTACAAA+TGG 0.473301 8:-41190762 None:intergenic
ACACTCTGTCTTTGAGATCA+TGG 0.485882 8:+41190426 MsG0880044388.01.T01:CDS
GATGCTGATTCTTGGAGAAA+GGG 0.492644 8:+41190821 MsG0880044388.01.T01:CDS
TATGCAACGCTCTTGGACTC+AGG 0.493207 8:+41190290 MsG0880044388.01.T01:CDS
ATAGGTCAGCTGGATGTGTC+AGG 0.493686 8:+41190846 MsG0880044388.01.T01:CDS
ACAAATAAACTTGGCGAAGG+TGG 0.493941 8:+41191879 MsG0880044388.01.T01:CDS
TATGGTTAGACTCGCAAAGC+CGG 0.501865 8:-41190498 None:intergenic
CTCCAAGAATCAGCATCAAA+CGG 0.504283 8:-41190815 None:intergenic
GCTCTTGGACTCAGGAAACT+TGG 0.505605 8:+41190298 MsG0880044388.01.T01:CDS
TAAAGGTTCTAATGTGTTGT+GGG 0.506827 8:+41190523 MsG0880044388.01.T01:CDS
AATGTTACCATCAGGATGAA+TGG 0.507237 8:-41190204 None:intergenic
TAGTGCCTATGCAACGCTCT+TGG 0.514871 8:+41190283 MsG0880044388.01.T01:CDS
ATAAAGGTTCTAATGTGTTG+TGG 0.515066 8:+41190522 MsG0880044388.01.T01:CDS
AATTGGTAGCAATTCTAGGT+TGG 0.521498 8:+41190628 MsG0880044388.01.T01:CDS
ATGATCACAATGTTACCATC+AGG 0.522376 8:-41190212 None:intergenic
TCAGACACGGTTGTTTCATA+CGG 0.529328 8:+41190032 MsG0880044388.01.T01:CDS
GAAGACATGAAAACAGAAAG+AGG 0.531611 8:+41191476 MsG0880044388.01.T01:CDS
GGGATCTTAAATACCAAGGC+TGG 0.533403 8:+41190666 MsG0880044388.01.T01:CDS
AGAAAGGGGAATAGGTCAGC+TGG 0.533740 8:+41190836 MsG0880044388.01.T01:CDS
GATGTTCATTCCAGGTAAAA+GGG 0.535401 8:-41190381 None:intergenic
CCTAATGTAACGACTGCAGT+TGG 0.543279 8:+41191454 MsG0880044388.01.T01:CDS
GACCATGAATGTTAAAGACT+CGG 0.551399 8:+41191752 MsG0880044388.01.T01:CDS
GTGATAGCGCATCGAACTGT+AGG 0.556751 8:-41190955 None:intergenic
ATGCTGATTCTTGGAGAAAG+GGG 0.557684 8:+41190822 MsG0880044388.01.T01:CDS
GACACGGTTGTTTCATACGG+TGG 0.558495 8:+41190035 MsG0880044388.01.T01:CDS
TATTGGAGAGTATATGGTCC+AGG 0.558711 8:-41190470 None:intergenic
TTACTTACCATTCATCCTGA+TGG 0.571245 8:+41190197 MsG0880044388.01.T01:CDS
GTTGGTATTGGAAGTGTCTG+GGG 0.572669 8:+41190646 MsG0880044388.01.T01:CDS
TGCGGAACAAACAATTCTTG+TGG 0.573180 8:+41190731 MsG0880044388.01.T01:CDS
ATGGACCAACAATTCTGGAA+TGG 0.574268 8:+41192971 MsG0880044388.01.T01:CDS
TAAAATATCAGACTTTGGAA+TGG 0.575051 8:+41192493 MsG0880044388.01.T01:CDS
CATTGTTACAACATCAGACA+TGG 0.576573 8:-41193099 None:intergenic
CATGTCCCCAGAATATGCTA+TGG 0.579384 8:+41192691 MsG0880044388.01.T01:CDS
TTAACGGCAACTGCAAGTTG+TGG 0.581016 8:+41191032 MsG0880044388.01.T01:CDS
ACTAGAAAGCAAAGGAGGAA+AGG 0.582644 8:+41191571 MsG0880044388.01.T01:CDS
TTGATTGATTCAAAACTGGA+TGG 0.583869 8:+41192996 MsG0880044388.01.T01:CDS
TGAGTCCAAGAGCGTTGCAT+AGG 0.586295 8:-41190288 None:intergenic
GAGTATATGGTCCAGGAGCA+GGG 0.587972 8:-41190463 None:intergenic
CACCAGCATTTGAAAATGTG+AGG 0.589512 8:+41193159 MsG0880044388.01.T01:CDS
TTTACTGGACTAGAAAGCAA+AGG 0.589631 8:+41191563 MsG0880044388.01.T01:CDS
ACCAGCATTTGAAAATGTGA+GGG 0.590786 8:+41193160 MsG0880044388.01.T01:CDS
TTGAAATGCGTAATCTCTGT+TGG 0.597845 8:-41190162 None:intergenic
GGTCAGAGGAATCTAAGCAT+TGG 0.599193 8:+41190687 MsG0880044388.01.T01:CDS
CCAGGTAAAAGGGTATCCGT+AGG 0.599599 8:-41190371 None:intergenic
CTGGTGGCTTTGGACTAGGA+AGG 0.600616 8:-41193142 None:intergenic
TCCCCAGAATATGCTATGGA+AGG 0.602385 8:+41192695 MsG0880044388.01.T01:CDS
TATACCCACATAGTACTTGG+TGG 0.602419 8:-41190099 None:intergenic
ATCCGTCAAAATTTCAGACA+CGG 0.604940 8:+41190019 MsG0880044388.01.T01:CDS
TTACGCATTTCAAACATCCT+CGG 0.605199 8:+41190172 MsG0880044388.01.T01:CDS
ATAAGCAACACAAGAACAGT+TGG 0.606073 8:-41190999 None:intergenic
GGAAATTACTAAAGCAGACA+AGG 0.606099 8:+41191773 MsG0880044388.01.T01:CDS
TACGGTGGAAACTATGAACT+GGG 0.607791 8:+41190050 MsG0880044388.01.T01:CDS
TGACAAGGGTCACGATCTTG+CGG 0.608640 8:-41190773 None:intergenic
GTTACAACATCAGACATGGT+TGG 0.612700 8:-41193095 None:intergenic
GAACTCCACCAAGTACTATG+TGG 0.613482 8:+41190094 MsG0880044388.01.T01:CDS
ATCGGACACGATATTAACAC+AGG 0.618890 8:+41190401 MsG0880044388.01.T01:CDS
CAGGTAAAAGGGTATCCGTA+GGG 0.621880 8:-41190370 None:intergenic
AACTCCACCAAGTACTATGT+GGG 0.629155 8:+41190095 MsG0880044388.01.T01:CDS
GATACAAATAAACTTGGCGA+AGG 0.631166 8:+41191876 MsG0880044388.01.T01:CDS
TGTAGGTTCAATTCATATGG+AGG 0.639202 8:-41190938 None:intergenic
ATCTCAACTGATATTCAAGA+CGG 0.643314 8:+41191082 MsG0880044388.01.T01:CDS
TGGTGGCTTTGGACTAGGAA+GGG 0.643756 8:-41193141 None:intergenic
AACCATTGAGACAGTGACAA+GGG 0.645361 8:-41190787 None:intergenic
TAAATACCAAGGCTGGTCAG+AGG 0.646976 8:+41190673 MsG0880044388.01.T01:CDS
TATTTGAAATGTTGGTCACG+AGG 0.648334 8:-41190253 None:intergenic
ACAAGGGTACAAAAGTTAGG+AGG 0.649680 8:+41191790 MsG0880044388.01.T01:CDS
ACTGGACTAGAAAGCAAAGG+AGG 0.650677 8:+41191566 MsG0880044388.01.T01:CDS
TATACTCTCCAATATGACGC+CGG 0.662615 8:+41190479 MsG0880044388.01.T01:CDS
AAACCATTGAGACAGTGACA+AGG 0.676910 8:-41190788 None:intergenic
TCTGGGGATCTTAAATACCA+AGG 0.677556 8:+41190662 MsG0880044388.01.T01:CDS
GAAATTACTAAAGCAGACAA+GGG 0.679631 8:+41191774 MsG0880044388.01.T01:CDS
GCCTTCCATAGCATATTCTG+GGG 0.686231 8:-41192696 None:intergenic
TCTCTACAGTCATCCAAGTG+CGG 0.690209 8:+41190713 MsG0880044388.01.T01:CDS
CCAGCATTTGAAAATGTGAG+GGG 0.696490 8:+41193161 MsG0880044388.01.T01:CDS
ATGAATGGTAAGTAACGCCG+AGG 0.702768 8:-41190189 None:intergenic
TCGGACACGATATTAACACA+GGG 0.750112 8:+41190402 MsG0880044388.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! AATGAGAATATTTTTACAAT+GGG - Chr8:41192917-41192936 None:intergenic 15.0%
!!! TAATGAGAATATTTTTACAA+TGG - Chr8:41192918-41192937 None:intergenic 15.0%
!! AATTCCAATTTATCTATTGA+AGG + Chr8:41190554-41190573 MsG0880044388.01.T01:CDS 20.0%
!! ACTATAACTCTTATATTTCT+AGG + Chr8:41191699-41191718 MsG0880044388.01.T01:intron 20.0%
!! AGAAAATTTGTAATGCTTAA+CGG - Chr8:41191665-41191684 None:intergenic 20.0%
!! CAAATGATGTAAAAAAGAAA+AGG - Chr8:41191206-41191225 None:intergenic 20.0%
!! CCTATAAAAATATGTGTAAA+TGG - Chr8:41192008-41192027 None:intergenic 20.0%
!!! AAAAAAATCCAAGCTTTTAT+TGG - Chr8:41192230-41192249 None:intergenic 20.0%
!!! AAAAAATCCAAGCTTTTATT+GGG - Chr8:41192229-41192248 None:intergenic 20.0%
!!! ATTTTATTCGTCACTAATTT+CGG - Chr8:41191264-41191283 None:intergenic 20.0%
!!! CCATTTACACATATTTTTAT+AGG + Chr8:41192005-41192024 MsG0880044388.01.T01:intron 20.0%
!!! CTATAACTCTTATATTTCTA+GGG + Chr8:41191700-41191719 MsG0880044388.01.T01:intron 20.0%
!!! TATAACTCTTATATTTCTAG+GGG + Chr8:41191701-41191720 MsG0880044388.01.T01:intron 20.0%
!!! TATTACTTGCTAAATATTCA+AGG + Chr8:41192938-41192957 MsG0880044388.01.T01:intron 20.0%
!!! TTCTTTTTTACATCATTTGA+AGG + Chr8:41191207-41191226 MsG0880044388.01.T01:intron 20.0%
! AACACCTTCAATAGATAAAT+TGG - Chr8:41190561-41190580 None:intergenic 25.0%
! AACTAAGAACTCTTTAATGA+TGG + Chr8:41192654-41192673 MsG0880044388.01.T01:intron 25.0%
! AATAATCTTGTTAGACTTCT+CGG + Chr8:41192157-41192176 MsG0880044388.01.T01:intron 25.0%
! AATCCTAAAATATCAGACTT+TGG + Chr8:41192488-41192507 MsG0880044388.01.T01:CDS 25.0%
! ATAAGTGGAAAAAAGAATAC+TGG + Chr8:41192773-41192792 MsG0880044388.01.T01:CDS 25.0%
! CACTTATAATCTCTAACAAA+AGG - Chr8:41192760-41192779 None:intergenic 25.0%
! CTAATATTGCTTATACTGAT+TGG + Chr8:41191532-41191551 MsG0880044388.01.T01:CDS 25.0%
! GATGTAAAAAAGAAAAGGAA+AGG - Chr8:41191201-41191220 None:intergenic 25.0%
! TACATCATTTGAAGGAATAT+AGG + Chr8:41191215-41191234 MsG0880044388.01.T01:intron 25.0%
!! AATGCAATTTTCGGAATAAA+TGG + Chr8:41191395-41191414 MsG0880044388.01.T01:intron 25.0%
!! ACCAAACTAAATGCAATTTT+CGG + Chr8:41191386-41191405 MsG0880044388.01.T01:intron 25.0%
!! ATAGCTGTTATTTGAAATGT+TGG - Chr8:41190264-41190283 None:intergenic 25.0%
!! ATAGTTTGGGTTAAATAGAA+TGG - Chr8:41192287-41192306 None:intergenic 25.0%
!! ATTCCAAAGTCTGATATTTT+AGG - Chr8:41192494-41192513 None:intergenic 25.0%
!! CACATTAGAACCTTTATTTA+TGG - Chr8:41190519-41190538 None:intergenic 25.0%
!! CTTTTGTTAGAGATTATAAG+TGG + Chr8:41192758-41192777 MsG0880044388.01.T01:CDS 25.0%
!! GCTTATGCTTATGATTTTAA+CGG + Chr8:41191016-41191035 MsG0880044388.01.T01:CDS 25.0%
!! TAAAATATCAGACTTTGGAA+TGG + Chr8:41192493-41192512 MsG0880044388.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTTCCGATACAAATAAACT+TGG + Chr8:41191870-41191889 MsG0880044388.01.T01:CDS 25.0%
!!! AGCTTGGATTTTTTTCTTTT+TGG + Chr8:41192235-41192254 MsG0880044388.01.T01:intron 25.0%
!!! GATTTGCTAAATTTTGAAGT+AGG + Chr8:41191726-41191745 MsG0880044388.01.T01:CDS 25.0%
!!! TGATAAGTTGAGTTGAAATT+AGG - Chr8:41192843-41192862 None:intergenic 25.0%
!!! TGATATTTTAGGATTCATGT+TGG - Chr8:41192483-41192502 None:intergenic 25.0%
!!! TGATTGGTTTATTTGTTTAC+TGG + Chr8:41191548-41191567 MsG0880044388.01.T01:CDS 25.0%
AAAAAGAAGGATGCTAGATT+GGG + Chr8:41192343-41192362 MsG0880044388.01.T01:intron 30.0%
AAACAGATGCAGTAAAAAGA+AGG + Chr8:41192330-41192349 MsG0880044388.01.T01:intron 30.0%
AACTGTAGGTTCAATTCATA+TGG - Chr8:41190944-41190963 None:intergenic 30.0%
ACAAATTCCTTCAATCTTCT+TGG + Chr8:41192806-41192825 MsG0880044388.01.T01:CDS 30.0%
ACCAAAGGACAAGATTATTT+GGG + Chr8:41190136-41190155 MsG0880044388.01.T01:CDS 30.0%
AGATGTCACAAACTATAGTT+TGG - Chr8:41192301-41192320 None:intergenic 30.0%
AGGTAACATAAAGGTAAAGT+AGG - Chr8:41191181-41191200 None:intergenic 30.0%
ATCTCAACTGATATTCAAGA+CGG + Chr8:41191082-41191101 MsG0880044388.01.T01:CDS 30.0%
GAAAAGGAAAGGTAACATAA+AGG - Chr8:41191190-41191209 None:intergenic 30.0%
GAAATTACTAAAGCAGACAA+GGG + Chr8:41191774-41191793 MsG0880044388.01.T01:CDS 30.0%
GATGTCACAAACTATAGTTT+GGG - Chr8:41192300-41192319 None:intergenic 30.0%
GCTACTGAGAATACATAAAT+TGG - Chr8:41191357-41191376 None:intergenic 30.0%
GTACCAAAATACGTGAATAT+TGG + Chr8:41193038-41193057 MsG0880044388.01.T01:CDS 30.0%
GTCTAACAAGATTATTGTGT+TGG - Chr8:41192153-41192172 None:intergenic 30.0%
TAAAAAGAAGGATGCTAGAT+TGG + Chr8:41192342-41192361 MsG0880044388.01.T01:intron 30.0%
TACATATCCAAGAAGATTGA+AGG - Chr8:41192816-41192835 None:intergenic 30.0%
TACCAAAGGACAAGATTATT+TGG + Chr8:41190135-41190154 MsG0880044388.01.T01:CDS 30.0%
TCCGAAAATTGCATTTAGTT+TGG - Chr8:41191390-41191409 None:intergenic 30.0%
TCTGATGTTGTAACAATGAT+TGG + Chr8:41193104-41193123 MsG0880044388.01.T01:CDS 30.0%
TGAGAATACATAAATTGGAG+AGG - Chr8:41191352-41191371 None:intergenic 30.0%
TGGAATATTGATGCAGATAA+AGG - Chr8:41192409-41192428 None:intergenic 30.0%
TGTGGGTATATGGTTTAAAA+AGG + Chr8:41190112-41190131 MsG0880044388.01.T01:CDS 30.0%
TTAAATCTCGGTGAATGATT+CGG - Chr8:41192436-41192455 None:intergenic 30.0%
TTCGCCAAGTTTATTTGTAT+CGG - Chr8:41191877-41191896 None:intergenic 30.0%
TTGCTAAATATTCAAGGCTT+GGG + Chr8:41192944-41192963 MsG0880044388.01.T01:intron 30.0%
! AGTCCAATATTCACGTATTT+TGG - Chr8:41193044-41193063 None:intergenic 30.0%
! ATAAAGGTTCTAATGTGTTG+TGG + Chr8:41190522-41190541 MsG0880044388.01.T01:CDS 30.0%
! TAAAGGTTCTAATGTGTTGT+GGG + Chr8:41190523-41190542 MsG0880044388.01.T01:CDS 30.0%
! TTGATTGATTCAAAACTGGA+TGG + Chr8:41192996-41193015 MsG0880044388.01.T01:CDS 30.0%
! TTTCAATTGGTAGCAATTCT+AGG + Chr8:41190624-41190643 MsG0880044388.01.T01:CDS 30.0%
! TTTTGGTACTAAATGCTTGT+TGG - Chr8:41193027-41193046 None:intergenic 30.0%
!! ATGGTTTAAAAAGGTACCAA+AGG + Chr8:41190121-41190140 MsG0880044388.01.T01:CDS 30.0%
!! CTTTAATGATGGTTTTTCAG+TGG + Chr8:41192665-41192684 MsG0880044388.01.T01:intron 30.0%
!! TGTAATAACTTGCACTCTTT+TGG + Chr8:41191949-41191968 MsG0880044388.01.T01:intron 30.0%
!!! GACTATGACACTTTTTCAAT+TGG + Chr8:41190611-41190630 MsG0880044388.01.T01:CDS 30.0%
!!! TGTTGCTAGCTTTTAAATCT+CGG - Chr8:41192448-41192467 None:intergenic 30.0%
AATGTTACCATCAGGATGAA+TGG - Chr8:41190207-41190226 None:intergenic 35.0%
ACCAGCATTTGAAAATGTGA+GGG + Chr8:41193160-41193179 MsG0880044388.01.T01:CDS 35.0%
ACCCAAATAATCTTGTCCTT+TGG - Chr8:41190140-41190159 None:intergenic 35.0%
ACGCTCACAAGACTAAATAA+TGG - Chr8:41191831-41191850 None:intergenic 35.0%
ATAAGCAACACAAGAACAGT+TGG - Chr8:41191002-41191021 None:intergenic 35.0%
ATCCGTCAAAATTTCAGACA+CGG + Chr8:41190019-41190038 MsG0880044388.01.T01:CDS 35.0%
ATGATCACAATGTTACCATC+AGG - Chr8:41190215-41190234 None:intergenic 35.0%
ATGTATTCTCAGTAGCGTTA+TGG + Chr8:41191361-41191380 MsG0880044388.01.T01:intron 35.0%
ATTCATGCCCAATAAAAGCT+TGG + Chr8:41192219-41192238 MsG0880044388.01.T01:intron 35.0%
CATTGTTACAACATCAGACA+TGG - Chr8:41193102-41193121 None:intergenic 35.0%
CTTGCTAAATATTCAAGGCT+TGG + Chr8:41192943-41192962 MsG0880044388.01.T01:intron 35.0%
GAAGACATGAAAACAGAAAG+AGG + Chr8:41191476-41191495 MsG0880044388.01.T01:CDS 35.0%
GACCATGAATGTTAAAGACT+CGG + Chr8:41191752-41191771 MsG0880044388.01.T01:CDS 35.0%
GATACAAATAAACTTGGCGA+AGG + Chr8:41191876-41191895 MsG0880044388.01.T01:CDS 35.0%
GATGTTCATTCCAGGTAAAA+GGG - Chr8:41190384-41190403 None:intergenic 35.0%
GCAAATACAAATCGCATAGT+TGG + Chr8:41192545-41192564 MsG0880044388.01.T01:CDS 35.0%
GCAAGTCGGAGATAAAAATT+TGG - Chr8:41191121-41191140 None:intergenic 35.0%
GCGAGTCTAACCATAAATAA+AGG + Chr8:41190506-41190525 MsG0880044388.01.T01:CDS 35.0%
GGAAATTACTAAAGCAGACA+AGG + Chr8:41191773-41191792 MsG0880044388.01.T01:CDS 35.0%
GGTAACATTGTGATCATAGA+TGG + Chr8:41190218-41190237 MsG0880044388.01.T01:CDS 35.0%
TCCAGGGTACATTATTGAAT+GGG + Chr8:41192041-41192060 MsG0880044388.01.T01:intron 35.0%
TGTAGGTTCAATTCATATGG+AGG - Chr8:41190941-41190960 None:intergenic 35.0%
TTACGCATTTCAAACATCCT+CGG + Chr8:41190172-41190191 MsG0880044388.01.T01:CDS 35.0%
TTACTTACCATTCATCCTGA+TGG + Chr8:41190197-41190216 MsG0880044388.01.T01:CDS 35.0%
TTCAAACATGCCTTATACAC+AGG - Chr8:41191912-41191931 None:intergenic 35.0%
TTCAATAATGTACCCTGGAA+AGG - Chr8:41192040-41192059 None:intergenic 35.0%
TTCCAGGGTACATTATTGAA+TGG + Chr8:41192040-41192059 MsG0880044388.01.T01:intron 35.0%
TTCCGAGTCTTTAACATTCA+TGG - Chr8:41191757-41191776 None:intergenic 35.0%
TTGAAATGCGTAATCTCTGT+TGG - Chr8:41190165-41190184 None:intergenic 35.0%
! AAATCTGACGTGTTTAGCTT+TGG + Chr8:41192731-41192750 MsG0880044388.01.T01:CDS 35.0%
! AATTGGTAGCAATTCTAGGT+TGG + Chr8:41190628-41190647 MsG0880044388.01.T01:CDS 35.0%
! AGGACAAATTTTCCTTTCCA+GGG + Chr8:41192025-41192044 MsG0880044388.01.T01:intron 35.0%
! CCATAAAATCGCTTTGTTAG+AGG - Chr8:41190336-41190355 None:intergenic 35.0%
! CCTCTAACAAAGCGATTTTA+TGG + Chr8:41190333-41190352 MsG0880044388.01.T01:CDS 35.0%
! CTTTTACCTGGAATGAACAT+CGG + Chr8:41190383-41190402 MsG0880044388.01.T01:CDS 35.0%
! GGACTTGATTGATTCAAAAC+TGG + Chr8:41192992-41193011 MsG0880044388.01.T01:CDS 35.0%
! TAGGACAAATTTTCCTTTCC+AGG + Chr8:41192024-41192043 MsG0880044388.01.T01:intron 35.0%
! TATTTGAAATGTTGGTCACG+AGG - Chr8:41190256-41190275 None:intergenic 35.0%
! TTTACTGGACTAGAAAGCAA+AGG + Chr8:41191563-41191582 MsG0880044388.01.T01:CDS 35.0%
! TTTGGAATGGCGAGAATATT+TGG + Chr8:41192506-41192525 MsG0880044388.01.T01:CDS 35.0%
!! AACCGTGTCTGAAATTTTGA+CGG - Chr8:41190024-41190043 None:intergenic 35.0%
!! AATTTTTATCTCCGACTTGC+TGG + Chr8:41191121-41191140 MsG0880044388.01.T01:intron 35.0%
!! TAGCAATTCTAGGTTGGTAT+TGG + Chr8:41190634-41190653 MsG0880044388.01.T01:CDS 35.0%
AAAAGGCTATCTCGAAGATC+AGG + Chr8:41192079-41192098 MsG0880044388.01.T01:intron 40.0%
AAACCATTGAGACAGTGACA+AGG - Chr8:41190791-41190810 None:intergenic 40.0%
AACCATTGAGACAGTGACAA+GGG - Chr8:41190790-41190809 None:intergenic 40.0%
AACTCCACCAAGTACTATGT+GGG + Chr8:41190095-41190114 MsG0880044388.01.T01:CDS 40.0%
ACAAATAAACTTGGCGAAGG+TGG + Chr8:41191879-41191898 MsG0880044388.01.T01:CDS 40.0%
ACACGGGTTCGAATAATTGA+CGG + Chr8:41192368-41192387 MsG0880044388.01.T01:intron 40.0%
ACTAGAAAGCAAAGGAGGAA+AGG + Chr8:41191571-41191590 MsG0880044388.01.T01:CDS 40.0%
AGAATTGTTTGTTCCGCACT+TGG - Chr8:41190729-41190748 None:intergenic 40.0%
AGGTTCCTTCAACTTACTTG+TGG - Chr8:41191161-41191180 None:intergenic 40.0%
ATAATTGACGGGATTGCACA+AGG + Chr8:41192380-41192399 MsG0880044388.01.T01:intron 40.0%
ATACGGTGGAAACTATGAAC+TGG + Chr8:41190049-41190068 MsG0880044388.01.T01:CDS 40.0%
ATCGGACACGATATTAACAC+AGG + Chr8:41190401-41190420 MsG0880044388.01.T01:CDS 40.0%
ATTCTTGGAGAAAGGGGAAT+AGG + Chr8:41190828-41190847 MsG0880044388.01.T01:CDS 40.0%
CAAGTCCATTCCAGAATTGT+TGG - Chr8:41192979-41192998 None:intergenic 40.0%
CACCAGCATTTGAAAATGTG+AGG + Chr8:41193159-41193178 MsG0880044388.01.T01:CDS 40.0%
CAGGGTACATTATTGAATGG+GGG + Chr8:41192043-41192062 MsG0880044388.01.T01:intron 40.0%
CCAAGTACTATGTGGGTATA+TGG + Chr8:41190102-41190121 MsG0880044388.01.T01:CDS 40.0%
CCAGCATTTGAAAATGTGAG+GGG + Chr8:41193161-41193180 MsG0880044388.01.T01:CDS 40.0%
CCAGGGTACATTATTGAATG+GGG + Chr8:41192042-41192061 MsG0880044388.01.T01:intron 40.0%
CCATATACCCACATAGTACT+TGG - Chr8:41190105-41190124 None:intergenic 40.0%
CGATGTTCATTCCAGGTAAA+AGG - Chr8:41190385-41190404 None:intergenic 40.0%
CGTTACATTAGGATCTGCAA+AGG - Chr8:41191446-41191465 None:intergenic 40.0%
CTCCAAGAATCAGCATCAAA+CGG - Chr8:41190818-41190837 None:intergenic 40.0%
GATCTATGGACCAACAATTC+TGG + Chr8:41192966-41192985 MsG0880044388.01.T01:CDS 40.0%
GGTTCCTTCAACTTACTTGT+GGG - Chr8:41191160-41191179 None:intergenic 40.0%
GTTACAACATCAGACATGGT+TGG - Chr8:41193098-41193117 None:intergenic 40.0%
TACATTATTGAATGGGGGTG+AGG + Chr8:41192048-41192067 MsG0880044388.01.T01:intron 40.0%
TACGGTGGAAACTATGAACT+GGG + Chr8:41190050-41190069 MsG0880044388.01.T01:CDS 40.0%
TATACCCACATAGTACTTGG+TGG - Chr8:41190102-41190121 None:intergenic 40.0%
TATACTCTCCAATATGACGC+CGG + Chr8:41190479-41190498 MsG0880044388.01.T01:CDS 40.0%
TATTCAAGGCTTGGGATCTA+TGG + Chr8:41192952-41192971 MsG0880044388.01.T01:intron 40.0%
TCGGACACGATATTAACACA+GGG + Chr8:41190402-41190421 MsG0880044388.01.T01:CDS 40.0%
TCTGGGGATCTTAAATACCA+AGG + Chr8:41190662-41190681 MsG0880044388.01.T01:CDS 40.0%
TGCGGAACAAACAATTCTTG+TGG + Chr8:41190731-41190750 MsG0880044388.01.T01:CDS 40.0%
! ACAAGGGTACAAAAGTTAGG+AGG + Chr8:41191790-41191809 MsG0880044388.01.T01:CDS 40.0%
! ACGATCTTGCGGATTACAAA+TGG - Chr8:41190765-41190784 None:intergenic 40.0%
! ATGGACCAACAATTCTGGAA+TGG + Chr8:41192971-41192990 MsG0880044388.01.T01:CDS 40.0%
! CAGACAAGGGTACAAAAGTT+AGG + Chr8:41191787-41191806 MsG0880044388.01.T01:CDS 40.0%
! CTCACATTTTCAAATGCTGG+TGG - Chr8:41193161-41193180 None:intergenic 40.0%
! GCGTCATATTGGAGAGTATA+TGG - Chr8:41190479-41190498 None:intergenic 40.0%
! TATTGGAGAGTATATGGTCC+AGG - Chr8:41190473-41190492 None:intergenic 40.0%
! TCAGACACGGTTGTTTCATA+CGG + Chr8:41190032-41190051 MsG0880044388.01.T01:CDS 40.0%
! TCTAATGTGTTGTGGGTTGA+TGG + Chr8:41190530-41190549 MsG0880044388.01.T01:CDS 40.0%
! TTTTCAAATGCTGGTGGCTT+TGG - Chr8:41193155-41193174 None:intergenic 40.0%
!! AACCGTTTGATGCTGATTCT+TGG + Chr8:41190813-41190832 MsG0880044388.01.T01:CDS 40.0%
!! ACACTCTGTCTTTGAGATCA+TGG + Chr8:41190426-41190445 MsG0880044388.01.T01:CDS 40.0%
!! ATGCTGATTCTTGGAGAAAG+GGG + Chr8:41190822-41190841 MsG0880044388.01.T01:CDS 40.0%
!! GATGCTGATTCTTGGAGAAA+GGG + Chr8:41190821-41190840 MsG0880044388.01.T01:CDS 40.0%
!! GCAGAGTTTTAATCACCCTA+CGG + Chr8:41190355-41190374 MsG0880044388.01.T01:CDS 40.0%
!! TGATGCTGATTCTTGGAGAA+AGG + Chr8:41190820-41190839 MsG0880044388.01.T01:CDS 40.0%
ACGCCTTCCATAGCATATTC+TGG - Chr8:41192701-41192720 None:intergenic 45.0%
ATGAATGGTAAGTAACGCCG+AGG - Chr8:41190192-41190211 None:intergenic 45.0%
CACGGGTTCGAATAATTGAC+GGG + Chr8:41192369-41192388 MsG0880044388.01.T01:intron 45.0%
CATCGTTAAGTTTAGCGACG+AGG - Chr8:41191303-41191322 None:intergenic 45.0%
CATGTCCCCAGAATATGCTA+TGG + Chr8:41192691-41192710 MsG0880044388.01.T01:CDS 45.0%
CCAACTGCAGTCGTTACATT+AGG - Chr8:41191457-41191476 None:intergenic 45.0%
CCCCATTCAATAATGTACCC+TGG - Chr8:41192045-41192064 None:intergenic 45.0%
CCTAATGTAACGACTGCAGT+TGG + Chr8:41191454-41191473 MsG0880044388.01.T01:CDS 45.0%
CGCCTTCCATAGCATATTCT+GGG - Chr8:41192700-41192719 None:intergenic 45.0%
CTATCTCGAAGATCAGGTCA+AGG + Chr8:41192085-41192104 MsG0880044388.01.T01:intron 45.0%
CTCGTCGCTAAACTTAACGA+TGG + Chr8:41191301-41191320 MsG0880044388.01.T01:intron 45.0%
GAACTCCACCAAGTACTATG+TGG + Chr8:41190094-41190113 MsG0880044388.01.T01:CDS 45.0%
GATGCTAGATTGGGAAACAC+GGG + Chr8:41192352-41192371 MsG0880044388.01.T01:intron 45.0%
GCCTTCCATAGCATATTCTG+GGG - Chr8:41192699-41192718 None:intergenic 45.0%
GGATGCTAGATTGGGAAACA+CGG + Chr8:41192351-41192370 MsG0880044388.01.T01:intron 45.0%
GGGATCTTAAATACCAAGGC+TGG + Chr8:41190666-41190685 MsG0880044388.01.T01:CDS 45.0%
GGTCAGAGGAATCTAAGCAT+TGG + Chr8:41190687-41190706 MsG0880044388.01.T01:CDS 45.0%
TATGGTTAGACTCGCAAAGC+CGG - Chr8:41190501-41190520 None:intergenic 45.0%
TCCCCAGAATATGCTATGGA+AGG + Chr8:41192695-41192714 MsG0880044388.01.T01:CDS 45.0%
TCGAAGATCAGGTCAAGGAT+GGG + Chr8:41192090-41192109 MsG0880044388.01.T01:intron 45.0%
TCTCTACAGTCATCCAAGTG+CGG + Chr8:41190713-41190732 MsG0880044388.01.T01:CDS 45.0%
TTAACGGCAACTGCAAGTTG+TGG + Chr8:41191032-41191051 MsG0880044388.01.T01:CDS 45.0%
! ACTGGACTAGAAAGCAAAGG+AGG + Chr8:41191566-41191585 MsG0880044388.01.T01:CDS 45.0%
! CCCCTCACATTTTCAAATGC+TGG - Chr8:41193164-41193183 None:intergenic 45.0%
! GCTTCCCACAAGTAAGTTGA+AGG + Chr8:41191153-41191172 MsG0880044388.01.T01:intron 45.0%
! TAAATACCAAGGCTGGTCAG+AGG + Chr8:41190673-41190692 MsG0880044388.01.T01:CDS 45.0%
! TCGGTGAATGATTCGGAATC+TGG - Chr8:41192429-41192448 None:intergenic 45.0%
!! AGGTTGGTATTGGAAGTGTC+TGG + Chr8:41190644-41190663 MsG0880044388.01.T01:CDS 45.0%
!! CAGGTAAAAGGGTATCCGTA+GGG - Chr8:41190373-41190392 None:intergenic 45.0%
!! GACATGGTTGGTCTATCTTC+TGG - Chr8:41193086-41193105 None:intergenic 45.0%
!! GGTTGGTATTGGAAGTGTCT+GGG + Chr8:41190645-41190664 MsG0880044388.01.T01:CDS 45.0%
!! GTTGGTATTGGAAGTGTCTG+GGG + Chr8:41190646-41190665 MsG0880044388.01.T01:CDS 45.0%
!! TGGCTTTGGACCTGTGTATA+AGG + Chr8:41191899-41191918 MsG0880044388.01.T01:intron 45.0%
!!! GATACTGTTTTTGCTGCTGC+AGG - Chr8:41190885-41190904 None:intergenic 45.0%
AAACTTGGCGAAGGTGGCTT+TGG + Chr8:41191885-41191904 MsG0880044388.01.T01:CDS 50.0%
AAGATCAGGTCAAGGATGGG+AGG + Chr8:41192093-41192112 MsG0880044388.01.T01:intron 50.0%
AGAAAGGGGAATAGGTCAGC+TGG + Chr8:41190836-41190855 MsG0880044388.01.T01:CDS 50.0%
AGAGTATATGGTCCAGGAGC+AGG - Chr8:41190467-41190486 None:intergenic 50.0%
ATAGGTCAGCTGGATGTGTC+AGG + Chr8:41190846-41190865 MsG0880044388.01.T01:CDS 50.0%
CTCGAAGATCAGGTCAAGGA+TGG + Chr8:41192089-41192108 MsG0880044388.01.T01:intron 50.0%
GACCCTTGTCACTGTCTCAA+TGG + Chr8:41190785-41190804 MsG0880044388.01.T01:CDS 50.0%
GAGTATATGGTCCAGGAGCA+GGG - Chr8:41190466-41190485 None:intergenic 50.0%
GCTCTTGGACTCAGGAAACT+TGG + Chr8:41190298-41190317 MsG0880044388.01.T01:CDS 50.0%
GGGGTGAGGTCGCAATAAAA+AGG + Chr8:41192062-41192081 MsG0880044388.01.T01:intron 50.0%
GGTGGAGTTCTCTCTGTTTC+TGG - Chr8:41190084-41190103 None:intergenic 50.0%
TAGATTCCTCTGACCAGCCT+TGG - Chr8:41190682-41190701 None:intergenic 50.0%
TAGTGCCTATGCAACGCTCT+TGG + Chr8:41190283-41190302 MsG0880044388.01.T01:CDS 50.0%
TATGCAACGCTCTTGGACTC+AGG + Chr8:41190290-41190309 MsG0880044388.01.T01:CDS 50.0%
TCGTGTCCGATGTTCATTCC+AGG - Chr8:41190392-41190411 None:intergenic 50.0%
TGACAAGGGTCACGATCTTG+CGG - Chr8:41190776-41190795 None:intergenic 50.0%
! CCTACGGATACCCTTTTACC+TGG + Chr8:41190371-41190390 MsG0880044388.01.T01:CDS 50.0%
! GACACGGTTGTTTCATACGG+TGG + Chr8:41190035-41190054 MsG0880044388.01.T01:CDS 50.0%
! GTGATAGCGCATCGAACTGT+AGG - Chr8:41190958-41190977 None:intergenic 50.0%
!! AATGCTGGTGGCTTTGGACT+AGG - Chr8:41193149-41193168 None:intergenic 50.0%
!! CCAGGTAAAAGGGTATCCGT+AGG - Chr8:41190374-41190393 None:intergenic 50.0%
!! TGAGTCCAAGAGCGTTGCAT+AGG - Chr8:41190291-41190310 None:intergenic 50.0%
!! TGGTGGCTTTGGACTAGGAA+GGG - Chr8:41193144-41193163 None:intergenic 50.0%
GCAAGTCTGAGCCAGCAAGT+CGG - Chr8:41191135-41191154 None:intergenic 55.0%
TCGCAAAGCCGGCGTCATAT+TGG - Chr8:41190490-41190509 None:intergenic 55.0%
TTCTCGGCTGCTGCATTGAG+CGG + Chr8:41192173-41192192 MsG0880044388.01.T01:intron 55.0%
!! CTGGTGGCTTTGGACTAGGA+AGG - Chr8:41193145-41193164 None:intergenic 55.0%
ACTGCAGAAGACCCTGCTCC+TGG + Chr8:41190452-41190471 MsG0880044388.01.T01:CDS 60.0%
TCTCGGCTGCTGCATTGAGC+GGG + Chr8:41192174-41192193 MsG0880044388.01.T01:intron 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr8 gene 41190011 41193268 41190011 ID=MsG0880044388.01;Name=MsG0880044388.01
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Protein sequence

>MsG0880044388.01.T01

MGQSVKISDTVVSYGGNYELGFFTRNRENSTKYYVGIWFKKVPKDKIIWVANRDYAFQTSSALLTIHPDGNIVIIDGQMMYLVTNISNNSYSAYATLLDSGNLVLLNTSNKAILWQSFNHPTDTLLPGMNIGHDINTGYTLSLRSWTTAEDPAPGPYTLQYDAGFASLTINKGSNVLWVDGNSNLSIEGVLNRVDLQLKRDYDTFSIGSNSRLVLEVSGDLKYQGWSEESKHWLSLQSSKCGTNNSCGIFSICNPQDRDPCHCLNGFEPFDADSWRKGNRSAGCVRIKELSCSSKNSIDVFERFSSVELPPYELNLQFDALSQCSNTCYTNCSCVAYAYDFNGNCKLWNDQVQTLKNISTDIQDDPNVTTAVGRHENRKRNLILIATLISFLILLILIGLFVYWTRKQRRKGDDLLNFEVGMTMNVKDSEITKADKGTKVRRKEVKLPLFSLVSVSAATNNFSDTNKLGEGGFGPVFRIIHRDLKASNILLDANMNPKISDFGMARIFGENVLQANTNRIVGTYGYMSPEYAMEGVYSIKSDVFSFGVLLLEIISGKKNTGFYQTNSFNLLGYAWDLWTNNSGMDLIDSKLDGISNKHLVPKYVNIGLLCVQQSPEDRPTMSDVVTMIGNDTASLPSPKPPAFENVRGIENSRLSRSIEENVSVNVVTNSLVEAR*