AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880047513.01

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MsG0880047513.01.T01 AT3G59350 32.229 332 180 6 254 578 113 406 3.78e-51 182
MsG0880047513.01.T01 AT5G65240 33.428 353 186 8 254 599 269 579 3.91e-51 187
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MsG0880047513.01.T01 AT1G11300 32.110 327 177 5 254 580 479 760 1.07e-44 171
MsG0880047513.01.T01 AT2G28960 30.650 323 176 5 255 574 561 838 1.15e-44 171
MsG0880047513.01.T01 AT4G04960 33.133 332 162 10 259 578 337 620 1.20e-44 169
MsG0880047513.01.T01 AT2G37050 31.806 371 192 10 212 574 555 872 1.23e-44 171
MsG0880047513.01.T01 AT4G11900 32.456 342 180 8 261 597 460 755 1.29e-44 170
MsG0880047513.01.T01 AT4G29050 34.925 335 155 11 257 578 332 616 1.44e-44 169
MsG0880047513.01.T01 AT4G29050 34.627 335 156 10 257 578 346 630 1.51e-44 169
MsG0880047513.01.T01 AT4G11900 32.456 342 180 8 261 597 529 824 1.60e-44 170
MsG0880047513.01.T01 AT4G28350 31.138 334 181 6 259 587 339 628 1.70e-44 169
MsG0880047513.01.T01 AT1G61480 33.333 357 187 8 254 605 481 791 1.70e-44 170
MsG0880047513.01.T01 AT4G29990 31.385 325 172 6 255 575 562 839 1.77e-44 170
MsG0880047513.01.T01 AT1G51820 30.447 358 201 6 257 611 306 618 1.78e-44 168
MsG0880047513.01.T01 AT2G39110 32.277 347 176 8 248 578 69 372 1.90e-44 164
MsG0880047513.01.T01 AT2G19190 31.642 335 175 7 248 575 552 839 1.91e-44 170
MsG0880047513.01.T01 AT1G61370 32.831 332 175 7 257 583 338 626 1.97e-44 168
MsG0880047513.01.T01 AT5G59670 29.573 328 181 6 255 578 552 833 2.10e-44 170
MsG0880047513.01.T01 AT5G59670 29.573 328 181 6 255 578 552 833 2.10e-44 170
MsG0880047513.01.T01 AT2G41970 30.120 332 186 7 254 578 58 350 2.11e-44 162
MsG0880047513.01.T01 AT2G28940 31.608 367 188 11 254 602 87 408 2.13e-44 165
MsG0880047513.01.T01 AT2G39110 32.853 347 174 9 248 578 54 357 2.15e-44 164
MsG0880047513.01.T01 AT1G51805 31.481 324 174 6 255 575 541 819 2.16e-44 170
MsG0880047513.01.T01 AT3G51550 31.928 332 170 8 253 575 520 804 2.19e-44 170
MsG0880047513.01.T01 AT1G51805 31.481 324 174 6 255 575 565 843 2.20e-44 170
MsG0880047513.01.T01 AT1G26970 31.105 344 173 8 252 578 66 362 2.25e-44 164
MsG0880047513.01.T01 AT1G66920 32.941 340 169 9 254 583 294 584 2.43e-44 167
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MsG0880047513.01.T01 AT3G16030 33.934 333 168 8 254 578 389 677 2.50e-44 169
MsG0880047513.01.T01 AT4G23220 31.003 329 179 6 257 580 325 610 2.60e-44 168
MsG0880047513.01.T01 AT4G02410 33.735 332 158 9 259 578 345 626 2.62e-44 168
MsG0880047513.01.T01 AT2G37050 31.081 370 197 9 212 574 555 873 2.66e-44 170
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MsG0880047513.01.T01 AT2G25220 31.940 335 172 8 225 553 107 391 3.01e-44 164
MsG0880047513.01.T01 AT3G59750 33.131 329 168 8 257 578 291 574 3.03e-44 167
MsG0880047513.01.T01 AT1G76360 32.164 342 173 8 252 578 146 443 3.12e-44 165
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MsG0880047513.01.T01 AT5G62230 33.333 324 167 7 258 578 637 914 3.20e-44 170
MsG0880047513.01.T01 AT1G66920 32.941 340 169 9 254 583 286 576 3.25e-44 167
MsG0880047513.01.T01 AT2G23950 35.740 277 126 5 254 524 284 514 3.54e-44 166
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MsG0880047513.01.T01 AT5G60320 33.028 327 168 8 257 578 336 616 3.92e-44 167
MsG0880047513.01.T01 AT1G61590 33.129 326 160 8 266 578 96 376 4.01e-44 163
MsG0880047513.01.T01 AT1G49730 31.231 333 177 7 257 583 347 633 4.05e-44 168
MsG0880047513.01.T01 AT4G29450 30.058 346 179 6 252 578 547 848 4.22e-44 169
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MsG0880047513.01.T01 AT1G51850 30.435 322 176 6 257 575 548 824 4.50e-44 169
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MsG0880047513.01.T01 AT1G61370 32.831 332 175 7 257 583 489 777 5.34e-44 169
MsG0880047513.01.T01 AT1G51880 31.902 326 171 7 257 578 574 852 5.77e-44 169
MsG0880047513.01.T01 AT1G51880 31.902 326 171 7 257 578 582 860 5.91e-44 169
MsG0880047513.01.T01 AT1G51880 31.902 326 171 7 257 578 556 834 6.51e-44 169
MsG0880047513.01.T01 AT2G24230 31.657 338 203 8 251 580 529 846 7.19e-44 168
MsG0880047513.01.T01 AT2G26290 29.023 348 189 8 254 588 73 375 9.38e-44 162
MsG0880047513.01.T01 AT5G01540 32.486 354 191 7 259 609 357 665 1.04e-43 166
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MsG0880047513.01.T01 AT4G23180 38.039 255 112 6 259 511 338 548 1.50e-43 165
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MsG0880047513.01.T01 AT4G13190 31.973 294 154 6 291 579 5 257 1.85e-43 158
MsG0880047513.01.T01 AT1G51820 30.447 358 201 6 257 611 568 880 1.94e-43 167
MsG0880047513.01.T01 AT1G61400 33.138 341 190 6 252 588 483 789 2.09e-43 167
MsG0880047513.01.T01 AT1G72300 31.366 322 171 7 265 580 799 1076 2.47e-43 167

Find 129 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 207 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TCCTAATACTGCATCTTTAT+TGG 0.177710 8:-87374769 MsG0880047513.01.T01:CDS
TTGGGCTACTGCTTTGAAAA+TGG 0.178399 8:-87374750 MsG0880047513.01.T01:CDS
TGCATTTGGTGTTCTTCTTC+TGG 0.183568 8:-87373904 MsG0880047513.01.T01:CDS
ATATATTAGATTACTGATTT+TGG 0.183972 8:-87374050 MsG0880047513.01.T01:intron
CTTATGGAGTTGGGTATTAT+TGG 0.185116 8:-87374804 MsG0880047513.01.T01:CDS
GTTTGGATCTTTGTTGTCTT+TGG 0.194639 8:+87374842 None:intergenic
ACATCATTATCAGGTAAATT+TGG 0.198041 8:-87375797 MsG0880047513.01.T01:intron
TCATATCTACCTTCCATTCT+TGG 0.227174 8:+87373517 None:intergenic
TAAAGCCTCCAATGTTCTTC+TGG 0.230662 8:-87374191 MsG0880047513.01.T01:CDS
TCCTCTTCTAGAATACTAAT+TGG 0.246386 8:-87376679 MsG0880047513.01.T01:CDS
ATACTTTGTAATTCCTTTAG+AGG 0.257427 8:+87375561 None:intergenic
CCTAATACTGCATCTTTATT+GGG 0.293001 8:-87374768 MsG0880047513.01.T01:CDS
ATTGTTGCTGTGCATATTCT+TGG 0.303278 8:-87376580 MsG0880047513.01.T01:intron
AAAGTTTACTTCCGATGAAT+TGG 0.316117 8:-87373129 MsG0880047513.01.T01:CDS
TGCAACATTTATGAAGATAA+TGG 0.317465 8:+87374239 None:intergenic
GAAAATCACAATTATCGTTC+AGG 0.318058 8:-87375182 MsG0880047513.01.T01:CDS
AGAAGCTCCTTGCTATCATT+TGG 0.320235 8:+87376643 None:intergenic
CTTCTTCTGGAGATTGTAAC+TGG 0.344543 8:-87373891 MsG0880047513.01.T01:CDS
CACAGTAGGTGGTGGTTTAG+TGG 0.349769 8:-87375752 MsG0880047513.01.T01:CDS
CCATCTAGAAGTACTGTTCT+TGG 0.350334 8:+87375318 None:intergenic
ATCCCAGTGGAGGGAACATT+TGG 0.355780 8:-87373984 MsG0880047513.01.T01:CDS
TGCACTGAAATGAATATATC+AGG 0.358524 8:-87374328 MsG0880047513.01.T01:CDS
GCATGGTGAGTCCATTTGTT+AGG 0.369497 8:+87374011 None:intergenic
CCCAATAAAGATGCAGTATT+AGG 0.373147 8:+87374768 None:intergenic
GAGAATTTGCACAGACTTGT+TGG 0.384109 8:-87376344 MsG0880047513.01.T01:CDS
AATTCATCGGAAGTAAACTT+TGG 0.388295 8:+87373131 None:intergenic
TTTGAAATTAATTACCTGTT+TGG 0.394124 8:+87376320 None:intergenic
GTAAGATACAAAATAGCTAT+TGG 0.394242 8:-87374277 MsG0880047513.01.T01:CDS
TGGGCTACTGCTTTGAAAAT+GGG 0.396140 8:-87374749 MsG0880047513.01.T01:CDS
TCTACCTGTGGTTCATAATC+AGG 0.398323 8:+87374166 None:intergenic
ATTCATCGGAAGTAAACTTT+GGG 0.402441 8:+87373132 None:intergenic
GCAAAGCCTCTGATGGAGTC+AGG 0.402737 8:-87373562 MsG0880047513.01.T01:CDS
TATCCAAATGTTCCCTCCAC+TGG 0.406300 8:+87373981 None:intergenic
ATGATGTAGAGCAACTGTAT+AGG 0.407590 8:-87373498 MsG0880047513.01.T01:CDS
CAAAGCAAAACATTCTCCTA+TGG 0.409174 8:-87373848 MsG0880047513.01.T01:CDS
GAAGCTCCTTGCTATCATTT+GGG 0.413888 8:+87376644 None:intergenic
TACAAAGGTGATCTTTCTAA+TGG 0.414385 8:-87374891 MsG0880047513.01.T01:CDS
TCAACTGCATTGCATGGTTA+TGG 0.416591 8:-87374687 MsG0880047513.01.T01:CDS
CATTGGGAGTTGAGGGTACA+AGG 0.421084 8:+87374656 None:intergenic
CATAGAATTGGAACCTCTAA+AGG 0.421751 8:-87375574 MsG0880047513.01.T01:intron
AAAGCCTCCAATGTTCTTCT+GGG 0.424734 8:-87374190 MsG0880047513.01.T01:CDS
AAAAGAATTCCTTATGGAGT+TGG 0.433131 8:-87374814 MsG0880047513.01.T01:CDS
ACAGCAACAATGGTATCATT+TGG 0.439525 8:+87376592 None:intergenic
TGTGTCATCTTCTGTGCTGT+TGG 0.440245 8:+87375278 None:intergenic
TGATGTAGAGCAACTGTATA+GGG 0.440900 8:-87373497 MsG0880047513.01.T01:CDS
CAATAATACCCAACTCCATA+AGG 0.443105 8:+87374805 None:intergenic
TAGTTCACCTCGGTCATTGC+AGG 0.443404 8:+87373427 None:intergenic
CCAAGAACAGTACTTCTAGA+TGG 0.443450 8:-87375318 MsG0880047513.01.T01:CDS
AAAGAATTCCTTATGGAGTT+GGG 0.446946 8:-87374813 MsG0880047513.01.T01:CDS
CTTCTAGATGGACTACTAGA+AGG 0.448481 8:-87375306 MsG0880047513.01.T01:CDS
CAAAGTGGCTTCCTAACAAA+TGG 0.448969 8:-87374022 MsG0880047513.01.T01:CDS
ACAGACTTGTTGGTCCAAAC+AGG 0.455080 8:-87376334 MsG0880047513.01.T01:intron
TCCACACAGGTAATAACATT+GGG 0.459343 8:+87374640 None:intergenic
TCTTTCCAACTTCATAGTCT+TGG 0.467951 8:+87373165 None:intergenic
GGCTAATCTCTTCACAGCAA+TGG 0.469886 8:+87374863 None:intergenic
ATAGATAATTTGGTTGGAAG+AGG 0.470052 8:-87374930 MsG0880047513.01.T01:intron
AACTTCATAGTCTTGGCCAT+TGG 0.471892 8:+87373172 None:intergenic
GATAATTTGGTTGGAAGAGG+AGG 0.479141 8:-87374927 MsG0880047513.01.T01:CDS
GTGTTAGACAAACTGCCATT+TGG 0.481016 8:-87373453 MsG0880047513.01.T01:CDS
TAACACAGTATGAAGCTGTT+AGG 0.482095 8:+87373470 None:intergenic
GTCAGGGAATATTGCTGAGC+TGG 0.484342 8:-87373545 MsG0880047513.01.T01:CDS
TCCAATTAGTATTCTAGAAG+AGG 0.493308 8:+87376678 None:intergenic
TTGAGTTCCACAGTAGGTGG+TGG 0.497579 8:-87375760 MsG0880047513.01.T01:CDS
TTTAAAATAGATAATTTGGT+TGG 0.499274 8:-87374936 MsG0880047513.01.T01:intron
GGTCATTGCAGGACGCCAAA+TGG 0.502257 8:+87373438 None:intergenic
GGCTGCACAATGGTCTCAGT+TGG 0.506363 8:-87375517 MsG0880047513.01.T01:CDS
ATGAATATATCAGGTAAAGC+AGG 0.508106 8:-87374319 MsG0880047513.01.T01:CDS
AATGGCCAAGACTATGAAGT+TGG 0.512119 8:-87373170 MsG0880047513.01.T01:CDS
ATGACATATACACCTTCATC+TGG 0.512891 8:-87375234 MsG0880047513.01.T01:CDS
AGGTTCATAATATCATTCCT+TGG 0.514023 8:-87375162 MsG0880047513.01.T01:CDS
GTAATAACATTGGGAGTTGA+GGG 0.516228 8:+87374649 None:intergenic
GGTAATAACATTGGGAGTTG+AGG 0.517102 8:+87374648 None:intergenic
ATCCACACAGGTAATAACAT+TGG 0.518391 8:+87374639 None:intergenic
ATAGCAAGGAGCTTCTATCA+TGG 0.520181 8:-87376636 MsG0880047513.01.T01:CDS
AAGCAGGAAATTCACTTGAC+TGG 0.538240 8:-87374303 MsG0880047513.01.T01:CDS
AAAGCAAAACATTCTCCTAT+GGG 0.539372 8:-87373847 MsG0880047513.01.T01:intron
GCATATGTTATATCTGTGCT+TGG 0.542620 8:-87376366 MsG0880047513.01.T01:CDS
GCGCCAGAGGTCTTTATGCA+TGG 0.545742 8:-87373954 MsG0880047513.01.T01:CDS
TCATTATCAGGTAAATTTGG+AGG 0.547070 8:-87375794 MsG0880047513.01.T01:intron
TAGCTGAAGCACTTCAACAA+GGG 0.551061 8:+87375087 None:intergenic
AAATAGCTATTGGAGTTGCA+AGG 0.553003 8:-87374267 MsG0880047513.01.T01:CDS
ATCAGGACCCAGAAGAACAT+TGG 0.553953 8:+87374183 None:intergenic
ATCCAAATGTTCCCTCCACT+GGG 0.554221 8:+87373982 None:intergenic
AAGACAATCACAACTTAGGC+AGG 0.556686 8:-87376394 MsG0880047513.01.T01:CDS
AATAGCTATTGGAGTTGCAA+GGG 0.557819 8:-87374266 MsG0880047513.01.T01:CDS
CACTAAACCACCACCTACTG+TGG 0.559488 8:+87375753 None:intergenic
ATAATTTGGTTGGAAGAGGA+GGG 0.562047 8:-87374926 MsG0880047513.01.T01:CDS
GAAGAAGACAATCACAACTT+AGG 0.564061 8:-87376398 MsG0880047513.01.T01:CDS
AAGAATATGCACAGCAACAA+TGG 0.565460 8:+87376582 None:intergenic
GGGTCCTGATTATGAACCAC+AGG 0.566074 8:-87374170 MsG0880047513.01.T01:intron
CATACAGGCAAAGCCTCTGA+TGG 0.568796 8:-87373569 MsG0880047513.01.T01:intron
ACTATGAAGTTGGAAAGAGT+TGG 0.569263 8:-87373160 MsG0880047513.01.T01:CDS
ATACCATGCATAAAGACCTC+TGG 0.572491 8:+87373951 None:intergenic
TGCTTTGAGCATGTGCATGA+AGG 0.579766 8:-87375538 MsG0880047513.01.T01:CDS
ATTAGTATTCTAGAAGAGGA+AGG 0.583047 8:+87376682 None:intergenic
AGAGTAATCATCCAATTCAT+CGG 0.584185 8:+87373118 None:intergenic
TTAATCTTAGGACCAGATGA+AGG 0.589416 8:+87375222 None:intergenic
TCCTCTAGAGATATGTCTGA+GGG 0.592471 8:+87373075 None:intergenic
TAGCAAGGAGCTTCTATCAT+GGG 0.594014 8:-87376635 MsG0880047513.01.T01:CDS
TTTAGACCCAAATGATAGCA+AGG 0.594704 8:-87376650 MsG0880047513.01.T01:CDS
AAAATCAGCAGAAATTGACT+TGG 0.596249 8:+87375723 None:intergenic
CAAAGCCTCTGATGGAGTCA+GGG 0.597134 8:-87373561 MsG0880047513.01.T01:CDS
GCATTGAGTTCCACAGTAGG+TGG 0.597818 8:-87375763 MsG0880047513.01.T01:CDS
CTGGCAGATCCAAGAATGGA+AGG 0.597995 8:-87373526 MsG0880047513.01.T01:CDS
AGGACCCAGAAGAACATTGG+AGG 0.606090 8:+87374186 None:intergenic
GCACAATGGTCTCAGTTGGA+AGG 0.607821 8:-87375513 MsG0880047513.01.T01:CDS
ATTTGGATATTTAGCGCCAG+AGG 0.609156 8:-87373967 MsG0880047513.01.T01:CDS
GTGTTGGAGCTGCTAACCAA+TGG 0.609764 8:-87373188 MsG0880047513.01.T01:CDS
TCCCTCAGACATATCTCTAG+AGG 0.611680 8:-87373076 None:intergenic
CCATGCTGTAATCCCAGTGG+AGG 0.611747 8:-87373994 MsG0880047513.01.T01:CDS
GGTCTTTATGCATGGTATCG+TGG 0.619385 8:-87373946 MsG0880047513.01.T01:CDS
ATATTCCCTGACTCCATCAG+AGG 0.625821 8:+87373556 None:intergenic
CCTCCACTGGGATTACAGCA+TGG 0.628194 8:+87373994 None:intergenic
ATAGCTGAAGCACTTCAACA+AGG 0.632799 8:+87375086 None:intergenic
ATCCTCTAGAGATATGTCTG+AGG 0.633384 8:+87373074 None:intergenic
TTATTCTGAATGGTGAACCA+AGG 0.636672 8:+87375145 None:intergenic
AACTTGTCAACTGCATTGCA+TGG 0.636779 8:-87374693 MsG0880047513.01.T01:CDS
TGAGCTGGCAGATCCAAGAA+TGG 0.644621 8:-87373530 MsG0880047513.01.T01:CDS
GTTGCATTGAGTTCCACAGT+AGG 0.653054 8:-87375766 MsG0880047513.01.T01:CDS
ATAGCTATTGGAGTTGCAAG+GGG 0.659025 8:-87374265 MsG0880047513.01.T01:CDS
AGTAGGTGGTGGTTTAGTGG+AGG 0.665674 8:-87375749 MsG0880047513.01.T01:CDS
AGACAACAAAGATCCAAACA+AGG 0.677813 8:-87374838 MsG0880047513.01.T01:CDS
CATGCTGTAATCCCAGTGGA+GGG 0.678579 8:-87373993 MsG0880047513.01.T01:CDS
TTGGCGTCCTGCAATGACCG+AGG 0.679901 8:-87373434 MsG0880047513.01.T01:intron
GGGTACTCAGAAGTATACAA+AGG 0.689937 8:-87374906 MsG0880047513.01.T01:CDS
TCACCATGCTGTAATCCCAG+TGG 0.706750 8:-87373997 MsG0880047513.01.T01:CDS
GCTACTAATGACTTTCACCA+AGG 0.707074 8:-87375048 MsG0880047513.01.T01:intron
TGCATTGCATGGTTATGGTG+AGG 0.708934 8:-87374682 MsG0880047513.01.T01:CDS
TGTGCATGAAGGCTGCACAA+TGG 0.745969 8:-87375527 MsG0880047513.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ATAACATAAATAATGATAAA+AGG + Chr8:87374173-87374192 None:intergenic 10.0%
!!! AAATTTTTTTAAAATTTACG+TGG + Chr8:87373691-87373710 None:intergenic 10.0%
!!! CTAAAATTTTCTTTTAAATT+TGG + Chr8:87373834-87373853 None:intergenic 10.0%
!! ATAACATTAATTATATACCT+TGG + Chr8:87374742-87374761 None:intergenic 15.0%
!! GATAAAAAAGAAAAATATCA+AGG + Chr8:87374405-87374424 None:intergenic 15.0%
!!! ATATATTAGATTACTGATTT+TGG - Chr8:87375720-87375739 MsG0880047513.01.T01:CDS 15.0%
!!! TTATTGGTTATACTTTAATA+TGG - Chr8:87373919-87373938 MsG0880047513.01.T01:CDS 15.0%
!!! TTTAAAATAGATAATTTGGT+TGG - Chr8:87374834-87374853 MsG0880047513.01.T01:CDS 15.0%
!! AGACTATTTAAATGAGTTTA+TGG + Chr8:87375344-87375363 None:intergenic 20.0%
!! CAAAAAAACAACAATCAATA+GGG - Chr8:87373783-87373802 MsG0880047513.01.T01:intron 20.0%
!! TAATAATAACAGTAAAGTGT+TGG - Chr8:87376175-87376194 MsG0880047513.01.T01:intron 20.0%
!! TTATGTTATGTTCATAGAAT+TGG - Chr8:87374184-87374203 MsG0880047513.01.T01:CDS 20.0%
!!! AAAACTGATATTTTTGCATT+TGG - Chr8:87375852-87375871 MsG0880047513.01.T01:intron 20.0%
!!! ATGATTACTCTATGATTTTT+GGG - Chr8:87376664-87376683 MsG0880047513.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATTTTAGTCAATCACATTTT+TGG - Chr8:87373544-87373563 MsG0880047513.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATTTTCAATTACTCTCAAAA+TGG - Chr8:87375053-87375072 MsG0880047513.01.T01:CDS 20.0%
!!! CGTAAACTTTTTAAATTATG+TGG + Chr8:87373723-87373742 None:intergenic 20.0%
!!! TATTGATTGTTGTTTTTTTG+CGG + Chr8:87373783-87373802 None:intergenic 20.0%
!!! TATTGCTTAATTTTTGTTCT+TGG - Chr8:87373641-87373660 MsG0880047513.01.T01:intron 20.0%
!!! TTAATTTTTGTTCTTGGATA+GGG - Chr8:87373647-87373666 MsG0880047513.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTGAAATTAATTACCTGTT+TGG + Chr8:87373453-87373472 None:intergenic 20.0%
!!! TTTGATTTTCTCTTAATCTT+AGG + Chr8:87374563-87374582 None:intergenic 20.0%
!!! TTTTTTCCCAATTTTATTGA+TGG + Chr8:87373513-87373532 None:intergenic 20.0%
! AATAAGCTGAAAACAACTTA+TGG - Chr8:87375302-87375321 MsG0880047513.01.T01:CDS 25.0%
! ACATCATTATCAGGTAAATT+TGG - Chr8:87373973-87373992 MsG0880047513.01.T01:CDS 25.0%
! AGTTGAAAATTTGAACTTTG+AGG + Chr8:87373234-87373253 None:intergenic 25.0%
! ATACTTTGTAATTCCTTTAG+AGG + Chr8:87374212-87374231 None:intergenic 25.0%
! CAAAAACACTAATTCTTGAT+CGG + Chr8:87375404-87375423 None:intergenic 25.0%
! GCAAAAAAACAACAATCAAT+AGG - Chr8:87373782-87373801 MsG0880047513.01.T01:intron 25.0%
! GTAAGATACAAAATAGCTAT+TGG - Chr8:87375493-87375512 MsG0880047513.01.T01:CDS 25.0%
! TCTTATGAAACATTGAATTG+AGG - Chr8:87374771-87374790 MsG0880047513.01.T01:CDS 25.0%
! TGCAACATTTATGAAGATAA+TGG + Chr8:87375534-87375553 None:intergenic 25.0%
! TTTAGAAAAACTGAATTACC+TGG + Chr8:87374328-87374347 None:intergenic 25.0%
!! CTTAATTTTTGTTCTTGGAT+AGG - Chr8:87373646-87373665 MsG0880047513.01.T01:intron 25.0%
!! GATGATTACTCTATGATTTT+TGG - Chr8:87376663-87376682 MsG0880047513.01.T01:CDS 25.0%
!! GTTTCTAATATGCTCATTTT+TGG - Chr8:87374793-87374812 MsG0880047513.01.T01:CDS 25.0%
!! TAATTTTTGTTCTTGGATAG+GGG - Chr8:87373648-87373667 MsG0880047513.01.T01:intron 25.0%
!! TCAAATTCAATAGATTTTCC+AGG - Chr8:87374307-87374326 MsG0880047513.01.T01:CDS 25.0%
!! TCTTCTTGTTTATTATACAC+AGG - Chr8:87376560-87376579 MsG0880047513.01.T01:intron 25.0%
!! TTGAAGGTTTTTATTCTGAA+TGG + Chr8:87374638-87374657 None:intergenic 25.0%
!!! AAGATGAAGAGTATTTTAGA+GGG - Chr8:87373862-87373881 MsG0880047513.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATAGCTATTTTGTATCTTAC+TGG + Chr8:87375493-87375512 None:intergenic 25.0%
!!! ATTTACAGAGACATTTTTAG+AGG + Chr8:87376130-87376149 None:intergenic 25.0%
!!! CTTTATTTTATCTCTCGTTA+TGG + Chr8:87375230-87375249 None:intergenic 25.0%
!!! TAAGATGAAGAGTATTTTAG+AGG - Chr8:87373861-87373880 MsG0880047513.01.T01:CDS 25.0%
AAAACAACAATCAATAGGGA+TGG - Chr8:87373787-87373806 MsG0880047513.01.T01:intron 30.0%
AAAAGAATTCCTTATGGAGT+TGG - Chr8:87374956-87374975 MsG0880047513.01.T01:intron 30.0%
AAAATCAGCAGAAATTGACT+TGG + Chr8:87374050-87374069 None:intergenic 30.0%
AAAGAATTCCTTATGGAGTT+GGG - Chr8:87374957-87374976 MsG0880047513.01.T01:intron 30.0%
AAAGCAAAACATTCTCCTAT+GGG - Chr8:87375923-87375942 MsG0880047513.01.T01:intron 30.0%
AAAGTTTACTTCCGATGAAT+TGG - Chr8:87376641-87376660 MsG0880047513.01.T01:CDS 30.0%
AATAAACCTTAAGGTCTGTT+TGG + Chr8:87376496-87376515 None:intergenic 30.0%
AATTCATCGGAAGTAAACTT+TGG + Chr8:87376642-87376661 None:intergenic 30.0%
ACCAATAACCATTATATGAC+AGG + Chr8:87373907-87373926 None:intergenic 30.0%
AGAGTAATCATCCAATTCAT+CGG + Chr8:87376655-87376674 None:intergenic 30.0%
AGGTTCATAATATCATTCCT+TGG - Chr8:87374608-87374627 MsG0880047513.01.T01:intron 30.0%
ATAGATAATTTGGTTGGAAG+AGG - Chr8:87374840-87374859 MsG0880047513.01.T01:CDS 30.0%
ATGAATATATCAGGTAAAGC+AGG - Chr8:87375451-87375470 MsG0880047513.01.T01:intron 30.0%
ATTAAGCTATTTATCCACAC+AGG + Chr8:87375146-87375165 None:intergenic 30.0%
ATTCATCGGAAGTAAACTTT+GGG + Chr8:87376641-87376660 None:intergenic 30.0%
CAAGGAAAAAGAATTCCTTA+TGG - Chr8:87374950-87374969 MsG0880047513.01.T01:intron 30.0%
CACTAAACGTGAAAACATAT+AGG + Chr8:87376380-87376399 None:intergenic 30.0%
CCAATAACCATTATATGACA+GGG + Chr8:87373906-87373925 None:intergenic 30.0%
CCTAATACTGCATCTTTATT+GGG - Chr8:87375002-87375021 MsG0880047513.01.T01:intron 30.0%
CTGATGAAAACATCATTATC+AGG - Chr8:87373964-87373983 MsG0880047513.01.T01:CDS 30.0%
GAAAATCACAATTATCGTTC+AGG - Chr8:87374588-87374607 MsG0880047513.01.T01:intron 30.0%
GAAGTTGTGTGAATTGAATT+AGG + Chr8:87375671-87375690 None:intergenic 30.0%
GTATCATGGATGAAATGAAA+AGG + Chr8:87375957-87375976 None:intergenic 30.0%
GTGTCTCCATCAATAAAATT+GGG - Chr8:87373504-87373523 MsG0880047513.01.T01:CDS 30.0%
TACAAAGGTGATCTTTCTAA+TGG - Chr8:87374879-87374898 MsG0880047513.01.T01:CDS 30.0%
TATTCTATAGTATCTACCTG+TGG + Chr8:87375619-87375638 None:intergenic 30.0%
TATTTGACCCTGTCATATAA+TGG - Chr8:87373896-87373915 MsG0880047513.01.T01:CDS 30.0%
TCATTATCAGGTAAATTTGG+AGG - Chr8:87373976-87373995 MsG0880047513.01.T01:CDS 30.0%
TCCTAATACTGCATCTTTAT+TGG - Chr8:87375001-87375020 MsG0880047513.01.T01:intron 30.0%
TGAGACACAAATAAACCTTA+AGG + Chr8:87376505-87376524 None:intergenic 30.0%
TGCACTGAAATGAATATATC+AGG - Chr8:87375442-87375461 MsG0880047513.01.T01:intron 30.0%
TGTGTCTCCATCAATAAAAT+TGG - Chr8:87373503-87373522 MsG0880047513.01.T01:CDS 30.0%
TGTTTATTATACACAGGTGT+TGG - Chr8:87376566-87376585 MsG0880047513.01.T01:intron 30.0%
! AATTTTTGTTCTTGGATAGG+GGG - Chr8:87373649-87373668 MsG0880047513.01.T01:intron 30.0%
! ACTGTTTTCATAAGCTATCT+TGG - Chr8:87375267-87375286 MsG0880047513.01.T01:CDS 30.0%
! AGGAATTCTTTTTCCTTGTT+TGG + Chr8:87374948-87374967 None:intergenic 30.0%
! ATTAGTATTCTAGAAGAGGA+AGG + Chr8:87373091-87373110 None:intergenic 30.0%
! CTATATGTTTTCACGTTTAG+TGG - Chr8:87376378-87376397 MsG0880047513.01.T01:CDS 30.0%
! TCCAATTAGTATTCTAGAAG+AGG + Chr8:87373095-87373114 None:intergenic 30.0%
! TGTTATTTGTTAGTTCACCT+CGG + Chr8:87376356-87376375 None:intergenic 30.0%
! TTCAATTTTGGACATGTTGA+AGG + Chr8:87374654-87374673 None:intergenic 30.0%
! TTTTGCTTTGATGAATCAAC+AGG + Chr8:87375912-87375931 None:intergenic 30.0%
!! TCCTCTTCTAGAATACTAAT+TGG - Chr8:87373091-87373110 MsG0880047513.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTTTTTGCGGATTAAACAGA+AGG + Chr8:87373770-87373789 None:intergenic 30.0%
AAATAGCTATTGGAGTTGCA+AGG - Chr8:87375503-87375522 MsG0880047513.01.T01:CDS 35.0%
AAGAATATGCACAGCAACAA+TGG + Chr8:87373191-87373210 None:intergenic 35.0%
AATAGCTATTGGAGTTGCAA+GGG - Chr8:87375504-87375523 MsG0880047513.01.T01:CDS 35.0%
ACAGCAACAATGGTATCATT+TGG + Chr8:87373181-87373200 None:intergenic 35.0%
ACTATGAAGTTGGAAAGAGT+TGG - Chr8:87376610-87376629 MsG0880047513.01.T01:CDS 35.0%
AGACAACAAAGATCCAAACA+AGG - Chr8:87374932-87374951 MsG0880047513.01.T01:intron 35.0%
ATAATTTGGTTGGAAGAGGA+GGG - Chr8:87374844-87374863 MsG0880047513.01.T01:CDS 35.0%
ATCCACACAGGTAATAACAT+TGG + Chr8:87375134-87375153 None:intergenic 35.0%
ATGACATATACACCTTCATC+TGG - Chr8:87374536-87374555 MsG0880047513.01.T01:intron 35.0%
ATGATGTAGAGCAACTGTAT+AGG - Chr8:87376272-87376291 MsG0880047513.01.T01:intron 35.0%
ATTGTTGCTGTGCATATTCT+TGG - Chr8:87373190-87373209 MsG0880047513.01.T01:CDS 35.0%
CAAAGCAAAACATTCTCCTA+TGG - Chr8:87375922-87375941 MsG0880047513.01.T01:intron 35.0%
CAAATACCAAACAGACCTTA+AGG - Chr8:87376487-87376506 MsG0880047513.01.T01:intron 35.0%
CAATAATACCCAACTCCATA+AGG + Chr8:87374968-87374987 None:intergenic 35.0%
CATAGAATTGGAACCTCTAA+AGG - Chr8:87374196-87374215 MsG0880047513.01.T01:CDS 35.0%
CCAATGTAGCATCTAAACTT+CGG - Chr8:87375976-87375995 MsG0880047513.01.T01:intron 35.0%
CCCAATAAAGATGCAGTATT+AGG + Chr8:87375005-87375024 None:intergenic 35.0%
CCCTGTCATATAATGGTTAT+TGG - Chr8:87373903-87373922 MsG0880047513.01.T01:CDS 35.0%
CTTATGGAGTTGGGTATTAT+TGG - Chr8:87374966-87374985 MsG0880047513.01.T01:intron 35.0%
GAAGAAGACAATCACAACTT+AGG - Chr8:87373372-87373391 MsG0880047513.01.T01:intron 35.0%
GCATATGTTATATCTGTGCT+TGG - Chr8:87373404-87373423 MsG0880047513.01.T01:intron 35.0%
GTAATAACATTGGGAGTTGA+GGG + Chr8:87375124-87375143 None:intergenic 35.0%
TAACACAGTATGAAGCTGTT+AGG + Chr8:87376303-87376322 None:intergenic 35.0%
TAGATGCTACATTGGTATCA+TGG + Chr8:87375971-87375990 None:intergenic 35.0%
TCATATCTACCTTCCATTCT+TGG + Chr8:87376256-87376275 None:intergenic 35.0%
TCCACACAGGTAATAACATT+GGG + Chr8:87375133-87375152 None:intergenic 35.0%
TCTTTCCAACTTCATAGTCT+TGG + Chr8:87376608-87376627 None:intergenic 35.0%
TGATGTAGAGCAACTGTATA+GGG - Chr8:87376273-87376292 MsG0880047513.01.T01:intron 35.0%
TTAATCTTAGGACCAGATGA+AGG + Chr8:87374551-87374570 None:intergenic 35.0%
TTATTCTGAATGGTGAACCA+AGG + Chr8:87374628-87374647 None:intergenic 35.0%
TTTAGACCCAAATGATAGCA+AGG - Chr8:87373120-87373139 MsG0880047513.01.T01:CDS 35.0%
! GAAAAGGTGTATTTACCCAT+AGG + Chr8:87375941-87375960 None:intergenic 35.0%
! GTTTGGATCTTTGTTGTCTT+TGG + Chr8:87374931-87374950 None:intergenic 35.0%
!! GTAAAGTGTTGGTAACATAC+AGG - Chr8:87376186-87376205 MsG0880047513.01.T01:intron 35.0%
!!! GGGTTGATGCTTTTCAATTT+TGG + Chr8:87374666-87374685 None:intergenic 35.0%
AAAGCCTCCAATGTTCTTCT+GGG - Chr8:87375580-87375599 MsG0880047513.01.T01:intron 40.0%
AACTTGTCAACTGCATTGCA+TGG - Chr8:87375077-87375096 MsG0880047513.01.T01:CDS 40.0%
AAGACAATCACAACTTAGGC+AGG - Chr8:87373376-87373395 MsG0880047513.01.T01:intron 40.0%
AAGCAGGAAATTCACTTGAC+TGG - Chr8:87375467-87375486 MsG0880047513.01.T01:CDS 40.0%
AATGGCCAAGACTATGAAGT+TGG - Chr8:87376600-87376619 MsG0880047513.01.T01:CDS 40.0%
ATACCATGCATAAAGACCTC+TGG + Chr8:87375822-87375841 None:intergenic 40.0%
ATAGCAAGGAGCTTCTATCA+TGG - Chr8:87373134-87373153 MsG0880047513.01.T01:CDS 40.0%
ATAGCTATTGGAGTTGCAAG+GGG - Chr8:87375505-87375524 MsG0880047513.01.T01:CDS 40.0%
ATTTGGATATTTAGCGCCAG+AGG - Chr8:87375803-87375822 MsG0880047513.01.T01:intron 40.0%
CAAAGTGGCTTCCTAACAAA+TGG - Chr8:87375748-87375767 MsG0880047513.01.T01:CDS 40.0%
CCAAGAACAGTACTTCTAGA+TGG - Chr8:87374452-87374471 MsG0880047513.01.T01:intron 40.0%
CCGAAGTTTAGATGCTACAT+TGG + Chr8:87375979-87375998 None:intergenic 40.0%
GAGAATTTGCACAGACTTGT+TGG - Chr8:87373426-87373445 MsG0880047513.01.T01:intron 40.0%
GATAATTTGGTTGGAAGAGG+AGG - Chr8:87374843-87374862 MsG0880047513.01.T01:CDS 40.0%
GCTACTAATGACTTTCACCA+AGG - Chr8:87374722-87374741 MsG0880047513.01.T01:CDS 40.0%
GGTAATAACATTGGGAGTTG+AGG + Chr8:87375125-87375144 None:intergenic 40.0%
GTGTTAGACAAACTGCCATT+TGG - Chr8:87376317-87376336 MsG0880047513.01.T01:intron 40.0%
TAAAGCCTCCAATGTTCTTC+TGG - Chr8:87375579-87375598 MsG0880047513.01.T01:intron 40.0%
TAGCAAGGAGCTTCTATCAT+GGG - Chr8:87373135-87373154 MsG0880047513.01.T01:CDS 40.0%
TCAACTGCATTGCATGGTTA+TGG - Chr8:87375083-87375102 MsG0880047513.01.T01:CDS 40.0%
TCCCAATGTTATTACCTGTG+TGG - Chr8:87375129-87375148 MsG0880047513.01.T01:CDS 40.0%
TCTACCTGTGGTTCATAATC+AGG + Chr8:87375607-87375626 None:intergenic 40.0%
! AACTTCATAGTCTTGGCCAT+TGG + Chr8:87376601-87376620 None:intergenic 40.0%
! AGAAGCTCCTTGCTATCATT+TGG + Chr8:87373130-87373149 None:intergenic 40.0%
! ATAGCTGAAGCACTTCAACA+AGG + Chr8:87374687-87374706 None:intergenic 40.0%
! ATGGATTCTAGAGACATGGA+GGG - Chr8:87373806-87373825 MsG0880047513.01.T01:intron 40.0%
! CTTCTTCTGGAGATTGTAAC+TGG - Chr8:87375879-87375898 MsG0880047513.01.T01:intron 40.0%
! GAAGCTCCTTGCTATCATTT+GGG + Chr8:87373129-87373148 None:intergenic 40.0%
! GGGTACTCAGAAGTATACAA+AGG - Chr8:87374864-87374883 MsG0880047513.01.T01:CDS 40.0%
! TAGCTGAAGCACTTCAACAA+GGG + Chr8:87374686-87374705 None:intergenic 40.0%
! TCACGTTTAGTGGTTCTGTT+TGG - Chr8:87376388-87376407 MsG0880047513.01.T01:CDS 40.0%
!! CCATCTAGAAGTACTGTTCT+TGG + Chr8:87374455-87374474 None:intergenic 40.0%
!! CTTCTAGATGGACTACTAGA+AGG - Chr8:87374464-87374483 MsG0880047513.01.T01:intron 40.0%
!! GCTGATTTTCTTCTTCTTCG+CGG - Chr8:87374061-87374080 MsG0880047513.01.T01:intron 40.0%
!! TGCATTTGGTGTTCTTCTTC+TGG - Chr8:87375866-87375885 MsG0880047513.01.T01:intron 40.0%
!! TGGGCTACTGCTTTGAAAAT+GGG - Chr8:87375021-87375040 MsG0880047513.01.T01:intron 40.0%
!! TTGGGCTACTGCTTTGAAAA+TGG - Chr8:87375020-87375039 MsG0880047513.01.T01:intron 40.0%
!!! CTGATTTTGGACTAGCAAAG+TGG - Chr8:87375733-87375752 MsG0880047513.01.T01:CDS 40.0%
ACAGACATGTGACATGACAC+TGG + Chr8:87376004-87376023 None:intergenic 45.0%
ATATTCCCTGACTCCATCAG+AGG + Chr8:87376217-87376236 None:intergenic 45.0%
ATCAGGACCCAGAAGAACAT+TGG + Chr8:87375590-87375609 None:intergenic 45.0%
ATCCAAATGTTCCCTCCACT+GGG + Chr8:87375791-87375810 None:intergenic 45.0%
GCATGGTGAGTCCATTTGTT+AGG + Chr8:87375762-87375781 None:intergenic 45.0%
GGCTAATCTCTTCACAGCAA+TGG + Chr8:87374910-87374929 None:intergenic 45.0%
GGTCTTTATGCATGGTATCG+TGG - Chr8:87375824-87375843 MsG0880047513.01.T01:intron 45.0%
GTTGCATTGAGTTCCACAGT+AGG - Chr8:87374004-87374023 MsG0880047513.01.T01:CDS 45.0%
TATCCAAATGTTCCCTCCAC+TGG + Chr8:87375792-87375811 None:intergenic 45.0%
TGCATTGCATGGTTATGGTG+AGG - Chr8:87375088-87375107 MsG0880047513.01.T01:CDS 45.0%
TGTGTCATCTTCTGTGCTGT+TGG + Chr8:87374495-87374514 None:intergenic 45.0%
! AGGGATGGATTCTAGAGACA+TGG - Chr8:87373802-87373821 MsG0880047513.01.T01:intron 45.0%
! GATGGATTCTAGAGACATGG+AGG - Chr8:87373805-87373824 MsG0880047513.01.T01:intron 45.0%
! TGCTTTGAGCATGTGCATGA+AGG - Chr8:87374232-87374251 MsG0880047513.01.T01:CDS 45.0%
! TGGATTCTAGAGACATGGAG+GGG - Chr8:87373807-87373826 MsG0880047513.01.T01:intron 45.0%
!! ACAGACTTGTTGGTCCAAAC+AGG - Chr8:87373436-87373455 MsG0880047513.01.T01:CDS 45.0%
!!! TTTTTTTAAAATAGATAATT+TGG - Chr8:87374830-87374849 MsG0880047513.01.T01:CDS 5.0%
AGGACCCAGAAGAACATTGG+AGG + Chr8:87375587-87375606 None:intergenic 50.0%
ATCCCAGTGGAGGGAACATT+TGG - Chr8:87375786-87375805 MsG0880047513.01.T01:CDS 50.0%
CAAAGCCTCTGATGGAGTCA+GGG - Chr8:87376209-87376228 MsG0880047513.01.T01:intron 50.0%
CACTAAACCACCACCTACTG+TGG + Chr8:87374020-87374039 None:intergenic 50.0%
CATACAGGCAAAGCCTCTGA+TGG - Chr8:87376201-87376220 MsG0880047513.01.T01:intron 50.0%
CATGCTGTAATCCCAGTGGA+GGG - Chr8:87375777-87375796 MsG0880047513.01.T01:CDS 50.0%
CTGGCAGATCCAAGAATGGA+AGG - Chr8:87376244-87376263 MsG0880047513.01.T01:intron 50.0%
GCACAATGGTCTCAGTTGGA+AGG - Chr8:87374257-87374276 MsG0880047513.01.T01:CDS 50.0%
GCATTGAGTTCCACAGTAGG+TGG - Chr8:87374007-87374026 MsG0880047513.01.T01:CDS 50.0%
GGGTCCTGATTATGAACCAC+AGG - Chr8:87375600-87375619 MsG0880047513.01.T01:intron 50.0%
GTCAGGGAATATTGCTGAGC+TGG - Chr8:87376225-87376244 MsG0880047513.01.T01:intron 50.0%
GTGTTGGAGCTGCTAACCAA+TGG - Chr8:87376582-87376601 MsG0880047513.01.T01:CDS 50.0%
TAGTTCACCTCGGTCATTGC+AGG + Chr8:87376346-87376365 None:intergenic 50.0%
TCACCATGCTGTAATCCCAG+TGG - Chr8:87375773-87375792 MsG0880047513.01.T01:CDS 50.0%
TGAGCTGGCAGATCCAAGAA+TGG - Chr8:87376240-87376259 MsG0880047513.01.T01:intron 50.0%
TGTGCATGAAGGCTGCACAA+TGG - Chr8:87374243-87374262 MsG0880047513.01.T01:CDS 50.0%
TTATGTCTGCGTCGTGCAAG+TGG - Chr8:87376032-87376051 MsG0880047513.01.T01:intron 50.0%
TTGAGTTCCACAGTAGGTGG+TGG - Chr8:87374010-87374029 MsG0880047513.01.T01:CDS 50.0%
! AGTAGGTGGTGGTTTAGTGG+AGG - Chr8:87374021-87374040 MsG0880047513.01.T01:CDS 50.0%
! CACAGTAGGTGGTGGTTTAG+TGG - Chr8:87374018-87374037 MsG0880047513.01.T01:CDS 50.0%
! CATTGGGAGTTGAGGGTACA+AGG + Chr8:87375117-87375136 None:intergenic 50.0%
CCATGCTGTAATCCCAGTGG+AGG - Chr8:87375776-87375795 MsG0880047513.01.T01:CDS 55.0%
CCTCCACTGGGATTACAGCA+TGG + Chr8:87375779-87375798 None:intergenic 55.0%
GCAAAGCCTCTGATGGAGTC+AGG - Chr8:87376208-87376227 MsG0880047513.01.T01:intron 55.0%
GCGCCAGAGGTCTTTATGCA+TGG - Chr8:87375816-87375835 MsG0880047513.01.T01:intron 55.0%
GGCTGCACAATGGTCTCAGT+TGG - Chr8:87374253-87374272 MsG0880047513.01.T01:CDS 55.0%
GGTCATTGCAGGACGCCAAA+TGG + Chr8:87376335-87376354 None:intergenic 55.0%
TTGGCGTCCTGCAATGACCG+AGG - Chr8:87376336-87376355 MsG0880047513.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr8 gene 87373079 87376713 87373079 ID=MsG0880047513.01;Name=MsG0880047513.01
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