AlfalfaGEDB | MS.gene56606

M. sativa cultivar XinJiangDaYe / MS.gene56606

KEGG: -
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PFAM: PF00580.24 PF13086.9 PF13087.9 PF13361.9 PF20073.2

Nr:

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Swissprot:

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MS.gene56606.t1	Q8BV79	26.7	1092	636	33	949	1924	967	2010	7.0e-77	292.0

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Trembl:

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MS.gene56606.t1	A0A396GQ35	91.8	2752	159	4	13	2699	105	2855	0.0e+00	5001.0

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TFs/TRs:

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Gene ID	Type	Classification
No data available in table

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Protein Kinases:

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Gene ID	Type	Classification
No data available in table

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Network:

Co-expression Network:

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Gene1	Gene2	correlation coefficient	p_value	FDR
MS.gene049142	MS.gene56606	0.805357	1.39E-49	-1.69E-46
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PPI:

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Gene1	Gene2	Type
No data available in table

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MS.gene56606.t1	MTR_0189s0030	84.695	2411	341	10	13	2415	1	2391	0.0	4153
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Showing 1 to 10 of 33 entries

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MS.gene56606.t1	AT1G65810	38.133	1007	542	20	13	1001	44	987	0.0	628
MS.gene56606.t1	AT1G65810	38.133	1007	542	20	13	1001	44	987	0.0	627
MS.gene56606.t1	AT1G65780	37.830	1097	570	23	13	1077	33	1049	0.0	620
MS.gene56606.t1	AT1G65810	36.816	1005	524	18	13	1001	44	953	0.0	593
MS.gene56606.t1	AT5G37150	37.902	839	455	17	20	851	36	815	2.09e-157	511
MS.gene56606.t1	AT5G37140	40.955	691	370	13	165	851	12	668	7.87e-156	501
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MS.gene56606.t1	AT5G37165	41.928	446	229	7	432	873	1	420	2.38e-102	336
MS.gene56606.t1	AT5G37030	53.357	283	129	2	564	844	348	629	3.52e-93	318

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Find 470 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 0 sgRNAs with CRISPR-GE

CRISPR-Local

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CRISPR-Local
sgRNA_sequence	on_target_score	Position	Region
AAAACAATAGATGGTTTCCA+GGG	0.652966	2.1:-26326481	MS.gene56606:CDS
AAAACAATATTTCCAACCAT+TGG	0.400224	2.1:+26328349	None:intergenic
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AAACAAAGCAATTTGACTCA+TGG	0.486031	2.1:+26323485	None:intergenic
AAACAATATTTCCAACCATT+GGG	0.458237	2.1:+26328350	None:intergenic
AAACAGTTAATGATTTGCAA+AGG	0.586271	2.1:-26330537	MS.gene56606:CDS
AAAGAACTGTGTTGACTTTC+TGG	0.092556	2.1:+26327960	None:intergenic

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CRISPR-GE

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badsite warning	sgRNA_sequence	Strand	Position	Region	GC_content
No data available in table

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Chromosome	Type	Strat	End	Strand	Name
chr2.1	gene	26318123	26331283	26318123	ID=MS.gene56606
chr2.1	mRNA	26318123	26331283	26318123	ID=MS.gene56606.t1;Parent=MS.gene56606
chr2.1	exon	26331248	26331283	26331248	ID=MS.gene56606.t1.exon1;Parent=MS.gene56606.t1
chr2.1	CDS	26331248	26331283	26331248	ID=cds.MS.gene56606.t1;Parent=MS.gene56606.t1
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chr2.1	CDS	26330282	26330845	26330282	ID=cds.MS.gene56606.t1;Parent=MS.gene56606.t1
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chr2.1	exon	26318123	26318297	26318123	ID=MS.gene56606.t1.exon15;Parent=MS.gene56606.t1
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Gene Sequence

>MS.gene56606

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Protein sequence

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