AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0080048371.01

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MsG0080048371.01.T01 AT1G53430 33.463 257 159 7 367 618 116 365 1.50e-23 108
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MsG0080048371.01.T01 AT5G63710 41.284 109 61 1 389 497 93 198 1.02e-11 69.3
MsG0080048371.01.T01 AT5G63710 35.606 132 79 4 785 915 87 213 1.41e-11 68.9
MsG0080048371.01.T01 AT5G63710 40.217 92 55 0 438 529 94 185 6.34e-11 67.0
MsG0080048371.01.T01 AT5G63710 41.284 109 61 1 389 497 92 197 1.06e-11 69.3
MsG0080048371.01.T01 AT5G63710 35.606 132 79 4 785 915 86 212 1.39e-11 68.9
MsG0080048371.01.T01 AT5G63710 40.217 92 55 0 438 529 93 184 6.78e-11 66.6
MsG0080048371.01.T01 AT1G60630 35.333 150 93 3 544 693 51 196 1.17e-11 69.3
MsG0080048371.01.T01 AT5G65240 41.584 101 58 1 403 503 102 201 1.23e-11 69.3
MsG0080048371.01.T01 AT5G65240 41.584 101 58 1 403 503 102 201 1.32e-11 68.9
MsG0080048371.01.T01 AT3G08680 32.727 165 96 4 558 722 69 218 1.32e-11 68.9
MsG0080048371.01.T01 AT3G08680 32.727 165 96 4 558 722 69 218 1.32e-11 68.9
MsG0080048371.01.T01 AT1G54470 31.606 193 128 3 483 673 231 421 1.84e-11 68.2
MsG0080048371.01.T01 AT5G45800 29.565 230 144 6 367 589 82 300 2.20e-11 68.2
MsG0080048371.01.T01 AT5G45800 32.632 190 114 6 415 597 57 239 4.04e-11 67.0
MsG0080048371.01.T01 AT5G45800 28.163 245 138 8 235 477 31 239 9.37e-11 65.9
MsG0080048371.01.T01 AT5G05160 34.392 189 87 7 413 595 73 230 2.56e-11 68.2
MsG0080048371.01.T01 AT5G45800 29.565 230 144 6 367 589 82 300 2.85e-11 68.2
MsG0080048371.01.T01 AT5G45800 32.632 190 114 6 415 597 57 239 5.62e-11 67.0
MsG0080048371.01.T01 AT5G10290 42.045 88 51 0 442 529 75 162 3.94e-11 67.4
MsG0080048371.01.T01 AT5G10290 42.045 88 51 0 442 529 75 162 3.94e-11 67.4
MsG0080048371.01.T01 AT5G67200 39.831 118 68 2 385 502 93 207 4.51e-11 67.4
MsG0080048371.01.T01 AT1G60800 33.117 154 90 4 777 924 83 229 4.84e-11 67.4
MsG0080048371.01.T01 AT5G35390 33.333 123 79 1 527 649 92 211 5.36e-11 67.0
MsG0080048371.01.T01 AT3G50230 31.606 193 85 5 718 910 92 237 5.63e-11 67.0
MsG0080048371.01.T01 AT1G60800 33.117 154 90 4 777 924 16 162 6.59e-11 66.6
MsG0080048371.01.T01 AT3G50230 31.606 193 85 5 718 910 104 249 7.37e-11 66.6
MsG0080048371.01.T01 AT5G24100 30.882 136 93 1 558 693 74 208 7.39e-11 66.6
MsG0080048371.01.T01 AT5G24100 34.884 129 77 2 430 558 90 211 8.85e-11 66.2
MsG0080048371.01.T01 AT3G28450 40.000 120 62 3 796 910 106 220 7.82e-11 66.6
MsG0080048371.01.T01 AT3G28450 36.842 114 71 1 537 649 82 195 8.60e-11 66.2
MsG0080048371.01.T01 AT1G63430 35.897 156 76 5 490 624 74 226 9.95e-11 66.2
MsG0080048371.01.T01 AT1G63430 35.897 156 76 5 490 624 74 226 9.95e-11 66.2

Find 187 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 234 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GTTCAAATATCTCAATTATT+TGG 0.158225 contig289end:+12542 MsG0080048371.01.T01:CDS
GTGAGGTTTCCAAGGTTATT+TGG 0.168944 contig289end:-12672 None:intergenic
TTGGATTTGCTACTGGCTTT+TGG 0.183119 contig289end:+15109 MsG0080048371.01.T01:CDS
GAACAGATTCAATGTTGTTT+TGG 0.211682 contig289end:-13175 None:intergenic
GATGATTGTGTGACAGATTT+AGG 0.218979 contig289end:-14750 None:intergenic
CTTGGAAACAACCTCATAAA+TGG 0.227147 contig289end:+14052 MsG0080048371.01.T01:CDS
AATCTATCTCACTTACTTCT+TGG 0.227537 contig289end:+14034 MsG0080048371.01.T01:CDS
CTCATGTCCCCTGTAGTTAT+TGG 0.232562 contig289end:-14787 None:intergenic
TCCAAACTCCTTAGGAAAAC+TGG 0.237461 contig289end:+13577 MsG0080048371.01.T01:CDS
GCAGTTTGTGAGCAATATTT+TGG 0.237649 contig289end:-14009 None:intergenic
AACTGGTTTCCTTGTGGAAT+TGG 0.251304 contig289end:-14925 None:intergenic
TTGTCCTACAACAACCTTTC+CGG 0.252657 contig289end:+14901 MsG0080048371.01.T01:CDS
ATGATTGTCACTGTTCATTT+TGG 0.265409 contig289end:-12886 None:intergenic
CATCACTCAGGTAAAGGTTT+TGG 0.267846 contig289end:-12776 None:intergenic
CATGAGGTCACTTGAATCTT+TGG 0.269115 contig289end:+14804 MsG0080048371.01.T01:CDS
AGACTTGTCTCAAAACAATT+TGG 0.270654 contig289end:+13904 MsG0080048371.01.T01:CDS
GCACAATTGCCTAACCAAAA+TGG 0.272291 contig289end:-13056 None:intergenic
TTAGGCAATTGTGCTAAATT+AGG 0.273061 contig289end:+13065 MsG0080048371.01.T01:CDS
TACACTCTGATGACATCTAT+TGG 0.284439 contig289end:+12733 MsG0080048371.01.T01:CDS
GGGAAATTTCCTGATAGTTT+TGG 0.290577 contig289end:+13857 MsG0080048371.01.T01:CDS
GGGTCTCTTCCTAATTGTTT+TGG 0.293538 contig289end:+13713 MsG0080048371.01.T01:CDS
CAGATAATTTGTTTGATGAT+AGG 0.301899 contig289end:-14195 None:intergenic
GTTAATGACAGAGGTGAAAA+TGG 0.302049 contig289end:+15024 MsG0080048371.01.T01:CDS
GTATCAGTTCAGTTCCATTT+TGG 0.305253 contig289end:+13042 MsG0080048371.01.T01:CDS
TGAGGTTTCCAAGGTTATTT+GGG 0.305708 contig289end:-12671 None:intergenic
CTTGCAAATAATCAACTTGA+TGG 0.312414 contig289end:+12954 MsG0080048371.01.T01:CDS
CTCAATTATTTGGACCTTAG+TGG 0.313538 contig289end:+12552 MsG0080048371.01.T01:CDS
CAACTGTTAATCTTAGATAT+TGG 0.323349 contig289end:+14319 MsG0080048371.01.T01:CDS
CTATCATCAAACAAATTATC+TGG 0.327926 contig289end:+14196 MsG0080048371.01.T01:CDS
GGTTGTTGTAGGACAAGTTT+AGG 0.328166 contig289end:-14894 None:intergenic
CTACCAGTTTCTATAAATTC+AGG 0.335236 contig289end:+14559 MsG0080048371.01.T01:CDS
TGAGTTAAATTCCAACAATC+AGG 0.345894 contig289end:-14154 None:intergenic
ATCATGTTTCACTAATCAAC+AGG 0.345926 contig289end:-15267 None:intergenic
GGCTCTCTAACAACAATTAT+AGG 0.346883 contig289end:+13269 MsG0080048371.01.T01:CDS
TTGGGATCATACCACTCAAT+TGG 0.348726 contig289end:-12653 None:intergenic
TGCTTTAAATTCTTCAATGA+TGG 0.357394 contig289end:-14298 None:intergenic
CTTTCAGACAACAAATTTGT+TGG 0.363305 contig289end:+14124 MsG0080048371.01.T01:CDS
ACTCCTGAATTTATAGAAAC+TGG 0.365689 contig289end:-14562 None:intergenic
GGGGAAGTGACCCAGTGATA+TGG 0.365724 contig289end:-13988 None:intergenic
GTGACTTAGAAAAGTTAAAC+TGG 0.366370 contig289end:-14872 None:intergenic
ACACTCTGATGACATCTATT+GGG 0.368421 contig289end:+12734 MsG0080048371.01.T01:CDS
TATCTAATAACAACTTGATT+GGG 0.369548 contig289end:+13621 MsG0080048371.01.T01:CDS
ATGATGATGGTAAACATGAT+AGG 0.372508 contig289end:+15052 MsG0080048371.01.T01:CDS
AAGAAGTAAGTGAGATAGAT+TGG 0.372786 contig289end:-14032 None:intergenic
AAATTGATAAACTTTGGTAT+TGG 0.376319 contig289end:-12594 None:intergenic
GTTGCGGCAACTTGAAAATC+TGG 0.376713 contig289end:+13442 MsG0080048371.01.T01:CDS
GATGTCAGCGAGAGCATTAA+AGG 0.378154 contig289end:+14613 MsG0080048371.01.T01:CDS
ATATCTAATAACAACTTGAT+TGG 0.381140 contig289end:+13620 MsG0080048371.01.T01:CDS
AATCCTTGCTACCCACAAAA+AGG 0.381461 contig289end:+12444 MsG0080048371.01.T01:CDS
TAGAGGGTTTGCAAATTTGA+TGG 0.382866 contig289end:-13812 None:intergenic
TTGTTGCCAACATAAATAGA+TGG 0.383075 contig289end:-14964 None:intergenic
TTCATAAAATTGATAAACTT+TGG 0.385166 contig289end:-12600 None:intergenic
ATTCACATAGGCTAGTGAAT+TGG 0.387363 contig289end:-13954 None:intergenic
GGTACAATCCCACAAAATAT+TGG 0.394529 contig289end:+13785 MsG0080048371.01.T01:CDS
CATCATTAAGACTTTCCTCT+TGG 0.396892 contig289end:+12343 MsG0080048371.01.T01:CDS
TGACCCAGTGATATGGTTAT+TGG 0.399495 contig289end:-13981 None:intergenic
CTGAACAACAATAATTTGAC+TGG 0.410229 contig289end:+13692 MsG0080048371.01.T01:CDS
GAATCTGTTCCATTGTGGTT+AGG 0.410256 contig289end:+13188 MsG0080048371.01.T01:CDS
TTCACATAGGCTAGTGAATT+GGG 0.410619 contig289end:-13953 None:intergenic
TTCCTTGAACCATTGCTGTA+AGG 0.413058 contig289end:-14531 None:intergenic
AATTTGCAATCAGGATGTAT+TGG 0.413093 contig289end:+13359 MsG0080048371.01.T01:CDS
TGGTCCGGAAAGGTTGTTGT+AGG 0.417408 contig289end:-14905 None:intergenic
CCTTTCCAACAACATGTTGA+TGG 0.417551 contig289end:+14483 MsG0080048371.01.T01:CDS
TCTCTTTAATGCAAATTCTC+AGG 0.417874 contig289end:+14389 MsG0080048371.01.T01:CDS
GATGTCATCAGAGTGTAAAT+AGG 0.421559 contig289end:-12727 None:intergenic
AAAAGTTGACCAAAACTATC+AGG 0.421856 contig289end:-13866 None:intergenic
GTAGCACTTGGATTTGCTAC+TGG 0.425043 contig289end:+15102 MsG0080048371.01.T01:CDS
ATGTATTGGATATGATTTAG+AGG 0.426151 contig289end:+13373 MsG0080048371.01.T01:CDS
TTATACAAGAAATCTGAAAC+TGG 0.431063 contig289end:+14648 MsG0080048371.01.T01:CDS
TTTGGGAAAATTGTCAAACT+TGG 0.432194 contig289end:+13514 MsG0080048371.01.T01:CDS
AATTGAAATTGTTTCCACTA+AGG 0.435408 contig289end:-12566 None:intergenic
AGAGTTATTCCTGTAGGAAT+AGG 0.436020 contig289end:-14709 None:intergenic
TTGCAAGGTTAAAGAAAAGA+TGG 0.436588 contig289end:+15235 MsG0080048371.01.T01:CDS
GGATCTATTCCAAACTCCTT+AGG 0.445089 contig289end:+13569 MsG0080048371.01.T01:CDS
GTAAGGTTTCCTATGCAGTC+AGG 0.446390 contig289end:-14514 None:intergenic
GGAGTTATTCCGAGCTCGTT+TGG 0.449176 contig289end:+14217 MsG0080048371.01.T01:CDS
CAACAAATTTGTTGTCTGAA+AGG 0.450836 contig289end:-14123 None:intergenic
TGTCAGGGACTATACCTTCA+TGG 0.453109 contig289end:+14353 MsG0080048371.01.T01:CDS
AAATTAGGTTATCTTTCTCT+TGG 0.453431 contig289end:+13080 MsG0080048371.01.T01:CDS
TGGGATCATACCACTCAATT+GGG 0.454628 contig289end:-12652 None:intergenic
CTTGGTAACAATCACTTGAA+TGG 0.454638 contig289end:+13548 MsG0080048371.01.T01:CDS
GTTTCCTTGTGGAATTGGTC+CGG 0.455350 contig289end:-14920 None:intergenic
GGTAAAATTCCAATAACTAC+AGG 0.457571 contig289end:+14778 MsG0080048371.01.T01:CDS
TTGGCAACATTCCTGATTGT+TGG 0.458449 contig289end:+14143 MsG0080048371.01.T01:CDS
CTCGTCGGTAATTTGCAATC+AGG 0.459393 contig289end:+13350 MsG0080048371.01.T01:CDS
TTGGAATGGAACCATTTATG+AGG 0.459926 contig289end:-14063 None:intergenic
ATGATAGGGTTGAGAAATTG+TGG 0.460994 contig289end:+15067 MsG0080048371.01.T01:CDS
ATGTTGTCAAAATTGACCTT+AGG 0.466510 contig289end:+12421 MsG0080048371.01.T01:CDS
ATTGGAGAGAATCAAATGTC+AGG 0.471721 contig289end:+14337 MsG0080048371.01.T01:CDS
GTCAAATTTCTAAGTGGTGA+TGG 0.473285 contig289end:-13128 None:intergenic
ATCATTAAGACTTTCCTCTT+GGG 0.475524 contig289end:+12344 MsG0080048371.01.T01:CDS
TGAGCCCATCAACATGTTGT+TGG 0.476760 contig289end:-14488 None:intergenic
AACGATCCATCTATTTATGT+TGG 0.481322 contig289end:+14958 MsG0080048371.01.T01:CDS
TGTTGTTGAAGAAGGGTTGG+AGG 0.484513 contig289end:+15148 MsG0080048371.01.T01:CDS
ATGGAATCATGTAAATCATA+TGG 0.486856 contig289end:+13244 MsG0080048371.01.T01:CDS
AGATTTGCAAAGCTGAAAGT+TGG 0.489706 contig289end:-14456 None:intergenic
TTGAATAATAATAGTCTGCA+TGG 0.491543 contig289end:+14268 MsG0080048371.01.T01:CDS
CTCACCAATAACCATATCAC+TGG 0.491584 contig289end:+13977 MsG0080048371.01.T01:CDS
CTGTCACACAATCATCTGTC+AGG 0.492492 contig289end:+14757 MsG0080048371.01.T01:CDS
TCTGTTCCATTGTGGTTAGG+AGG 0.496759 contig289end:+13191 MsG0080048371.01.T01:CDS
AACCTTACAGCAATGGTTCA+AGG 0.497806 contig289end:+14529 MsG0080048371.01.T01:CDS
AACTTGGAATATGTAATCCT+TGG 0.498437 contig289end:+13530 MsG0080048371.01.T01:CDS
ATTGGGAATCAGCGAGAGAA+AGG 0.500870 contig289end:-12635 None:intergenic
TCAATGATCAGCTGCCAACT+TGG 0.501710 contig289end:+13420 MsG0080048371.01.T01:CDS
CCAAACTCCTTAGGAAAACT+GGG 0.505150 contig289end:+13578 MsG0080048371.01.T01:CDS
GTTTGGTCACCTTTCTACTC+TGG 0.505477 contig289end:+14234 MsG0080048371.01.T01:CDS
TTTGCACAATGAATTTGGAA+TGG 0.506007 contig289end:-14077 None:intergenic
AGAAGTAAGTGAGATAGATT+GGG 0.506708 contig289end:-14031 None:intergenic
ATCAGCTGCCAACTTGGTTG+CGG 0.508664 contig289end:+13426 MsG0080048371.01.T01:CDS
ACTCTTCTTACAAATTTACA+AGG 0.509114 contig289end:+14727 MsG0080048371.01.T01:CDS
TTGAGTGGACCTATTCCTAC+AGG 0.509743 contig289end:+14700 MsG0080048371.01.T01:CDS
ATTGAAACTGAGATCAAGAA+AGG 0.510298 contig289end:-12703 None:intergenic
ACAAATTTGTGAGGTTTCCA+AGG 0.514125 contig289end:-12680 None:intergenic
CTTGTGGAATTGGTCCGGAA+AGG 0.517884 contig289end:-14915 None:intergenic
TGCAAGTTATACCTTTCCAT+TGG 0.518624 contig289end:-12383 None:intergenic
GTGGGTAGCAAGGATTCCTA+AGG 0.524367 contig289end:-12437 None:intergenic
CTGTTCCATTGTGGTTAGGA+GGG 0.525217 contig289end:+13192 MsG0080048371.01.T01:CDS
TGAATAATAATAGTCTGCAT+GGG 0.527355 contig289end:+14269 MsG0080048371.01.T01:CDS
CATTCAAGTGATTGTTACCA+AGG 0.533407 contig289end:-13547 None:intergenic
CGTTTGGAATACAGTTTGCA+AGG 0.536410 contig289end:+15220 MsG0080048371.01.T01:CDS
TTAAGACTTTCCTCTTGGGA+AGG 0.539491 contig289end:+12348 MsG0080048371.01.T01:CDS
AGGTTAAAGAAAAGATGGAC+AGG 0.544531 contig289end:+15240 MsG0080048371.01.T01:CDS
GTAAGAAGAGTTATTCCTGT+AGG 0.544732 contig289end:-14715 None:intergenic
CTTGGAAGTAATGCTCTCAA+TGG 0.545338 contig289end:+13098 MsG0080048371.01.T01:CDS
GTCACCTTTCTACTCTGGTG+TGG 0.552907 contig289end:+14239 MsG0080048371.01.T01:CDS
CCATCAACATGTTGTTGGAA+AGG 0.556147 contig289end:-14483 None:intergenic
CTTTCCAACAACATGTTGAT+GGG 0.559532 contig289end:+14484 MsG0080048371.01.T01:CDS
GTTAAACTGGACATGGTGTA+CGG 0.560897 contig289end:-14859 None:intergenic
GGTATGATCCCAAATAACCT+TGG 0.566308 contig289end:+12663 MsG0080048371.01.T01:CDS
TTGTCTCAAAACAATTTGGA+AGG 0.566547 contig289end:+13908 MsG0080048371.01.T01:CDS
AACTCTATTTCTAACAAGGA+AGG 0.566977 contig289end:-12846 None:intergenic
GAGACAAGTCTAAATTGCGC+AGG 0.567026 contig289end:-13892 None:intergenic
ATCTAATAACAACTTGATTG+GGG 0.569136 contig289end:+13622 MsG0080048371.01.T01:CDS
GTGTCAGAAAACTCTCTGAA+TGG 0.571418 contig289end:+13764 MsG0080048371.01.T01:CDS
AAAGAAGTCAAATTTCTAAG+TGG 0.572091 contig289end:-13134 None:intergenic
TTATGTACCTCAGTCTAGCA+TGG 0.573719 contig289end:+13225 MsG0080048371.01.T01:CDS
GAAAGGTGACCAAACGAGCT+CGG 0.575024 contig289end:-14226 None:intergenic
TAAGGTTTCCTATGCAGTCA+GGG 0.575502 contig289end:-14513 None:intergenic
GTTATTGGTGAGATTCACAT+AGG 0.575980 contig289end:-13966 None:intergenic
GGGACTATACCTTCATGGAT+AGG 0.578386 contig289end:+14358 MsG0080048371.01.T01:CDS
TTAAGACAAAATAAGTTCCA+AGG 0.578822 contig289end:+14412 MsG0080048371.01.T01:CDS
GGCTCAATCCCTGACTGCAT+AGG 0.578932 contig289end:+14505 MsG0080048371.01.T01:CDS
AAAATGTCGCCTATCCATGA+AGG 0.579482 contig289end:-14367 None:intergenic
GCAACCACACCAGAGTAGAA+AGG 0.579682 contig289end:-14243 None:intergenic
ACAAGTGCTGTTATACTACA+AGG 0.581325 contig289end:-13650 None:intergenic
CAAGAAAGGACAAATTTGTG+AGG 0.581761 contig289end:-12689 None:intergenic
CTCGCTGATTCCCAATTGAG+TGG 0.581767 contig289end:+12642 MsG0080048371.01.T01:CDS
TCAAGTTGCCGCAACCAAGT+TGG 0.582231 contig289end:-13434 None:intergenic
CAAGCGCTTCTTGAACTCAA+AGG 0.582535 contig289end:+12306 MsG0080048371.01.T01:CDS
CTTCAAGGAGATGCGCTCGT+CGG 0.585545 contig289end:+13335 MsG0080048371.01.T01:CDS
TTGGAGAGAATCAAATGTCA+GGG 0.586959 contig289end:+14338 MsG0080048371.01.T01:CDS
GAAAGTTGGCAAAGTTGTGA+TGG 0.587256 contig289end:-14442 None:intergenic
ACTGGGAAATCTAATCCACT+TGG 0.591601 contig289end:+13595 MsG0080048371.01.T01:CDS
TGAACTGTGAAAGAGAAGGA+TGG 0.593609 contig289end:-12524 None:intergenic
TCTGAAACTGGTGGCCAATG+TGG 0.594039 contig289end:+14660 MsG0080048371.01.T01:CDS
AAGGAAATGACTGTTGCCAA+TGG 0.594408 contig289end:+12367 MsG0080048371.01.T01:CDS
GAATCATGTAAATCATATGG+AGG 0.594917 contig289end:+13247 MsG0080048371.01.T01:CDS
TGATGATGGTAAACATGATA+GGG 0.600935 contig289end:+15053 MsG0080048371.01.T01:CDS
ACATTGAATCTGTTCCATTG+TGG 0.601928 contig289end:+13183 MsG0080048371.01.T01:CDS
GATCAACTCTATTTCTAACA+AGG 0.607080 contig289end:-12850 None:intergenic
GTTGTGATGGAATGTTACCT+TGG 0.610520 contig289end:-14429 None:intergenic
GAAAATGGAGACGATGATGA+TGG 0.619999 contig289end:+15039 MsG0080048371.01.T01:CDS
AATGACTGTTGCCAATGGAA+AGG 0.620694 contig289end:+12372 MsG0080048371.01.T01:CDS
CTTTGTCATGTTAATGACAG+AGG 0.621406 contig289end:+15015 MsG0080048371.01.T01:CDS
TTGGTTGCATGGAACAAGAG+AGG 0.622513 contig289end:+12283 None:intergenic
TGAACAACAATAATTTGACT+GGG 0.624226 contig289end:+13693 MsG0080048371.01.T01:CDS
CATAGGAAACCTTACAGCAA+TGG 0.625776 contig289end:+14522 MsG0080048371.01.T01:CDS
GTAAAATTCCAATAACTACA+GGG 0.630318 contig289end:+14779 MsG0080048371.01.T01:CDS
CTATAAATTCAGGAGTGCCG+AGG 0.635928 contig289end:+14569 MsG0080048371.01.T01:CDS
CAATAACTACAGGGGACATG+AGG 0.641786 contig289end:+14788 MsG0080048371.01.T01:CDS
AATCATGTAAATCATATGGA+GGG 0.646076 contig289end:+13248 MsG0080048371.01.T01:CDS
GAATAATAATAGTCTGCATG+GGG 0.647871 contig289end:+14270 MsG0080048371.01.T01:CDS
TACAAGAAATCTGAAACTGG+TGG 0.648835 contig289end:+14651 MsG0080048371.01.T01:CDS
TAGAAAAGTTAAACTGGACA+TGG 0.652945 contig289end:-14866 None:intergenic
TCATACCATTCAAAATACCT+CGG 0.658341 contig289end:-14586 None:intergenic
TCTAATAACAACTTGATTGG+GGG 0.658654 contig289end:+13623 MsG0080048371.01.T01:CDS
ACAGTCATTTCCTTCCCAAG+AGG 0.659840 contig289end:-12358 None:intergenic
CTTTCCGGACCAATTCCACA+AGG 0.661141 contig289end:+14916 MsG0080048371.01.T01:CDS
CATGATTCCATGCTAGACTG+AGG 0.662031 contig289end:-13232 None:intergenic
TGTTATTAGATATGTCCAAG+TGG 0.665378 contig289end:-13610 None:intergenic
TCACCAATAACCATATCACT+GGG 0.674603 contig289end:+13978 MsG0080048371.01.T01:CDS
TAAAATTCCAATAACTACAG+GGG 0.675374 contig289end:+14780 MsG0080048371.01.T01:CDS
TCATGTTTCACTAATCAACA+GGG 0.680317 contig289end:-15266 None:intergenic
TATTTGAACTGTGAAAGAGA+AGG 0.681941 contig289end:-12528 None:intergenic
ACATGACAAAGATTCGACAA+TGG 0.685285 contig289end:-15003 None:intergenic
TCTAACCCTCCTAACCACAA+TGG 0.713684 contig289end:-13197 None:intergenic
GTTGGCAACAAATATCTCTG+TGG 0.758578 contig289end:+14976 MsG0080048371.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! TTCATAAAATTGATAAACTT+TGG - contig289end:12603-12622 None:intergenic 15.0%
!!! AATTATTTTTACTAAGATAG+AGG - contig289end:13832-13851 None:intergenic 15.0%
!!! ATTATTTTTACTAAGATAGA+GGG - contig289end:13831-13850 None:intergenic 15.0%
!!! TTAGTAAAAATAATTTGCAA+GGG + contig289end:13837-13856 MsG0080048371.01.T01:CDS 15.0%
!! AAATTGATAAACTTTGGTAT+TGG - contig289end:12597-12616 None:intergenic 20.0%
!! ATATCTAATAACAACTTGAT+TGG + contig289end:13620-13639 MsG0080048371.01.T01:CDS 20.0%
!! GTTCAAATATCTCAATTATT+TGG + contig289end:12542-12561 MsG0080048371.01.T01:CDS 20.0%
!! TATCTAATAACAACTTGATT+GGG + contig289end:13621-13640 MsG0080048371.01.T01:CDS 20.0%
!!! CTTAGTAAAAATAATTTGCA+AGG + contig289end:13836-13855 MsG0080048371.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTATTTTGCACAATGAATT+TGG - contig289end:14085-14104 None:intergenic 20.0%
!!! TTTTCAAACAATAATTTGAG+TGG + contig289end:14685-14704 MsG0080048371.01.T01:CDS 20.0%
! AAAGAAGTCAAATTTCTAAG+TGG - contig289end:13137-13156 None:intergenic 25.0%
! AAATTAGGTTATCTTTCTCT+TGG + contig289end:13080-13099 MsG0080048371.01.T01:CDS 25.0%
! AATCATGTAAATCATATGGA+GGG + contig289end:13248-13267 MsG0080048371.01.T01:CDS 25.0%
! AATTGAAATTGTTTCCACTA+AGG - contig289end:12569-12588 None:intergenic 25.0%
! ACTCTTCTTACAAATTTACA+AGG + contig289end:14727-14746 MsG0080048371.01.T01:CDS 25.0%
! ATCTAATAACAACTTGATTG+GGG + contig289end:13622-13641 MsG0080048371.01.T01:CDS 25.0%
! ATGGAATCATGTAAATCATA+TGG + contig289end:13244-13263 MsG0080048371.01.T01:CDS 25.0%
! ATGTATTGGATATGATTTAG+AGG + contig289end:13373-13392 MsG0080048371.01.T01:CDS 25.0%
! ATTGTTTGAAAAATCCACAT+TGG - contig289end:14677-14696 None:intergenic 25.0%
! CAACTGTTAATCTTAGATAT+TGG + contig289end:14319-14338 MsG0080048371.01.T01:CDS 25.0%
! CTATCATCAAACAAATTATC+TGG + contig289end:14196-14215 MsG0080048371.01.T01:CDS 25.0%
! GTAAAATTCCAATAACTACA+GGG + contig289end:14779-14798 MsG0080048371.01.T01:CDS 25.0%
! TAAAATTCCAATAACTACAG+GGG + contig289end:14780-14799 MsG0080048371.01.T01:CDS 25.0%
! TGAACAACAATAATTTGACT+GGG + contig289end:13693-13712 MsG0080048371.01.T01:CDS 25.0%
! TGAATAATAATAGTCTGCAT+GGG + contig289end:14269-14288 MsG0080048371.01.T01:CDS 25.0%
! TTAAGACAAAATAAGTTCCA+AGG + contig289end:14412-14431 MsG0080048371.01.T01:CDS 25.0%
! TTGAATAATAATAGTCTGCA+TGG + contig289end:14268-14287 MsG0080048371.01.T01:CDS 25.0%
!! ACAACTTTTCCAAAACAATT+AGG - contig289end:13725-13744 None:intergenic 25.0%
!! GACAATTTTCCCAAAAATTT+TGG - contig289end:13509-13528 None:intergenic 25.0%
!! TGCTTTAAATTCTTCAATGA+TGG - contig289end:14301-14320 None:intergenic 25.0%
!! TTATACAAGAAATCTGAAAC+TGG + contig289end:14648-14667 MsG0080048371.01.T01:CDS 25.0%
!!! AACAGATTCAATGTTGTTTT+GGG - contig289end:13177-13196 None:intergenic 25.0%
!!! CAGATAATTTGTTTGATGAT+AGG - contig289end:14198-14217 None:intergenic 25.0%
!!! TTTCCCAAAAATTTTGGAAT+AGG - contig289end:13503-13522 None:intergenic 25.0%
AAAAACTTGAATCAAGTGTG+AGG - contig289end:13472-13491 None:intergenic 30.0%
AAAAATCTAGTGTCACAAGA+TGG - contig289end:13304-13323 None:intergenic 30.0%
AAAAGTTGACCAAAACTATC+AGG - contig289end:13869-13888 None:intergenic 30.0%
AACGATCCATCTATTTATGT+TGG + contig289end:14958-14977 MsG0080048371.01.T01:CDS 30.0%
AACTTGGAATATGTAATCCT+TGG + contig289end:13530-13549 MsG0080048371.01.T01:CDS 30.0%
AAGAAGTAAGTGAGATAGAT+TGG - contig289end:14035-14054 None:intergenic 30.0%
AATCTATCTCACTTACTTCT+TGG + contig289end:14034-14053 MsG0080048371.01.T01:CDS 30.0%
AATTTGCAATCAGGATGTAT+TGG + contig289end:13359-13378 MsG0080048371.01.T01:CDS 30.0%
ACTCCTGAATTTATAGAAAC+TGG - contig289end:14565-14584 None:intergenic 30.0%
AGAAGTAAGTGAGATAGATT+GGG - contig289end:14034-14053 None:intergenic 30.0%
AGACTTGTCTCAAAACAATT+TGG + contig289end:13904-13923 MsG0080048371.01.T01:CDS 30.0%
ATCATTAAGACTTTCCTCTT+GGG + contig289end:12344-12363 MsG0080048371.01.T01:CDS 30.0%
ATGTTGTCAAAATTGACCTT+AGG + contig289end:12421-12440 MsG0080048371.01.T01:CDS 30.0%
ATTGAAACTGAGATCAAGAA+AGG - contig289end:12706-12725 None:intergenic 30.0%
CAAAAAATAGATGTGACGTT+TGG + contig289end:15204-15223 MsG0080048371.01.T01:CDS 30.0%
CTACCAGTTTCTATAAATTC+AGG + contig289end:14559-14578 MsG0080048371.01.T01:CDS 30.0%
CTGAACAACAATAATTTGAC+TGG + contig289end:13692-13711 MsG0080048371.01.T01:CDS 30.0%
CTTGCAAATAATCAACTTGA+TGG + contig289end:12954-12973 MsG0080048371.01.T01:CDS 30.0%
CTTTCAGACAACAAATTTGT+TGG + contig289end:14124-14143 MsG0080048371.01.T01:CDS 30.0%
GAATAATAATAGTCTGCATG+GGG + contig289end:14270-14289 MsG0080048371.01.T01:CDS 30.0%
GAATCATGTAAATCATATGG+AGG + contig289end:13247-13266 MsG0080048371.01.T01:CDS 30.0%
GATCGTTAAGTGTTAAAAAC+TGG - contig289end:14945-14964 None:intergenic 30.0%
GGTAAAATTCCAATAACTAC+AGG + contig289end:14778-14797 MsG0080048371.01.T01:CDS 30.0%
GTGACTTAGAAAAGTTAAAC+TGG - contig289end:14875-14894 None:intergenic 30.0%
TAGAAAAGTTAAACTGGACA+TGG - contig289end:14869-14888 None:intergenic 30.0%
TATTTGAACTGTGAAAGAGA+AGG - contig289end:12531-12550 None:intergenic 30.0%
TCATACCATTCAAAATACCT+CGG - contig289end:14589-14608 None:intergenic 30.0%
TCTAATAACAACTTGATTGG+GGG + contig289end:13623-13642 MsG0080048371.01.T01:CDS 30.0%
TCTCTTTAATGCAAATTCTC+AGG + contig289end:14389-14408 MsG0080048371.01.T01:CDS 30.0%
TGAGTTAAATTCCAACAATC+AGG - contig289end:14157-14176 None:intergenic 30.0%
TGTTATTAGATATGTCCAAG+TGG - contig289end:13613-13632 None:intergenic 30.0%
TTAGGCAATTGTGCTAAATT+AGG + contig289end:13065-13084 MsG0080048371.01.T01:CDS 30.0%
TTGCAAGGTTAAAGAAAAGA+TGG + contig289end:15235-15254 MsG0080048371.01.T01:CDS 30.0%
TTGTCTCAAAACAATTTGGA+AGG + contig289end:13908-13927 MsG0080048371.01.T01:CDS 30.0%
TTGTTGCCAACATAAATAGA+TGG - contig289end:14967-14986 None:intergenic 30.0%
TTTGCACAATGAATTTGGAA+TGG - contig289end:14080-14099 None:intergenic 30.0%
TTTGGGAAAATTGTCAAACT+TGG + contig289end:13514-13533 MsG0080048371.01.T01:CDS 30.0%
! AGTTTGTGAGCAATATTTTG+GGG - contig289end:14010-14029 None:intergenic 30.0%
! ATGATTGTCACTGTTCATTT+TGG - contig289end:12889-12908 None:intergenic 30.0%
! ATGGTTGACCAATATTTTGT+GGG - contig289end:13796-13815 None:intergenic 30.0%
! CAGTTTGTGAGCAATATTTT+GGG - contig289end:14011-14030 None:intergenic 30.0%
! GATAATCTTCTCCTTTTTGT+GGG - contig289end:12458-12477 None:intergenic 30.0%
! GCTAGTTACACAAATTTTTC+TGG + contig289end:12915-12934 MsG0080048371.01.T01:CDS 30.0%
! GGTCCTATTCCAAAATTTTT+GGG + contig289end:13497-13516 MsG0080048371.01.T01:CDS 30.0%
! TGATAATCTTCTCCTTTTTG+TGG - contig289end:12459-12478 None:intergenic 30.0%
! TGGTCCTATTCCAAAATTTT+TGG + contig289end:13496-13515 MsG0080048371.01.T01:CDS 30.0%
!! AACTCTATTTCTAACAAGGA+AGG - contig289end:12849-12868 None:intergenic 30.0%
!! ATGATGATGGTAAACATGAT+AGG + contig289end:15052-15071 MsG0080048371.01.T01:CDS 30.0%
!! CAACAAATTTGTTGTCTGAA+AGG - contig289end:14126-14145 None:intergenic 30.0%
!! GAAATTGTGGTTTTACTTTG+TGG + contig289end:15080-15099 MsG0080048371.01.T01:CDS 30.0%
!! GAACAGATTCAATGTTGTTT+TGG - contig289end:13178-13197 None:intergenic 30.0%
!! GATCAACTCTATTTCTAACA+AGG - contig289end:12853-12872 None:intergenic 30.0%
!! TGATGATGGTAAACATGATA+GGG + contig289end:15053-15072 MsG0080048371.01.T01:CDS 30.0%
!! TTGAAGCTTATTTTCTGAGA+AGG - contig289end:12493-12512 None:intergenic 30.0%
!! TTTTCTGGAAATAGACTTCA+AGG + contig289end:13320-13339 MsG0080048371.01.T01:CDS 30.0%
!!! AAAATTTTGGAATAGGACCA+TGG - contig289end:13496-13515 None:intergenic 30.0%
!!! ATTCAATGTTGTTTTGGGAA+AGG - contig289end:13172-13191 None:intergenic 30.0%
!!! CTTGATTCAAGTTTTTTCCA+TGG + contig289end:13476-13495 MsG0080048371.01.T01:CDS 30.0%
ACAAATTTGTGAGGTTTCCA+AGG - contig289end:12683-12702 None:intergenic 35.0%
ACACTCTGATGACATCTATT+GGG + contig289end:12734-12753 MsG0080048371.01.T01:CDS 35.0%
ACATGACAAAGATTCGACAA+TGG - contig289end:15006-15025 None:intergenic 35.0%
ACATTGAATCTGTTCCATTG+TGG + contig289end:13183-13202 MsG0080048371.01.T01:CDS 35.0%
AGAGTTATTCCTGTAGGAAT+AGG - contig289end:14712-14731 None:intergenic 35.0%
AGATTTGCAAAGCTGAAAGT+TGG - contig289end:14459-14478 None:intergenic 35.0%
AGGTTAAAGAAAAGATGGAC+AGG + contig289end:15240-15259 MsG0080048371.01.T01:CDS 35.0%
ATGATAGGGTTGAGAAATTG+TGG + contig289end:15067-15086 MsG0080048371.01.T01:CDS 35.0%
ATTCACATAGGCTAGTGAAT+TGG - contig289end:13957-13976 None:intergenic 35.0%
ATTGGAGAGAATCAAATGTC+AGG + contig289end:14337-14356 MsG0080048371.01.T01:CDS 35.0%
CAAGAAAGGACAAATTTGTG+AGG - contig289end:12692-12711 None:intergenic 35.0%
CATCATTAAGACTTTCCTCT+TGG + contig289end:12343-12362 MsG0080048371.01.T01:CDS 35.0%
CATTCAAGTGATTGTTACCA+AGG - contig289end:13550-13569 None:intergenic 35.0%
CTCAATTATTTGGACCTTAG+TGG + contig289end:12552-12571 MsG0080048371.01.T01:CDS 35.0%
CTTGGAAACAACCTCATAAA+TGG + contig289end:14052-14071 MsG0080048371.01.T01:CDS 35.0%
CTTTCCAACAACATGTTGAT+GGG + contig289end:14484-14503 MsG0080048371.01.T01:CDS 35.0%
CTTTGTCATGTTAATGACAG+AGG + contig289end:15015-15034 MsG0080048371.01.T01:CDS 35.0%
GAAAAACATCACTCAGGTAA+AGG - contig289end:12785-12804 None:intergenic 35.0%
GATGATTGTGTGACAGATTT+AGG - contig289end:14753-14772 None:intergenic 35.0%
GATGTCATCAGAGTGTAAAT+AGG - contig289end:12730-12749 None:intergenic 35.0%
GGCTCTCTAACAACAATTAT+AGG + contig289end:13269-13288 MsG0080048371.01.T01:CDS 35.0%
GGTACAATCCCACAAAATAT+TGG + contig289end:13785-13804 MsG0080048371.01.T01:CDS 35.0%
GTAAGAAGAGTTATTCCTGT+AGG - contig289end:14718-14737 None:intergenic 35.0%
GTCAAATTTCTAAGTGGTGA+TGG - contig289end:13131-13150 None:intergenic 35.0%
GTTAATGACAGAGGTGAAAA+TGG + contig289end:15024-15043 MsG0080048371.01.T01:CDS 35.0%
GTTATTGGTGAGATTCACAT+AGG - contig289end:13969-13988 None:intergenic 35.0%
TACACTCTGATGACATCTAT+TGG + contig289end:12733-12752 MsG0080048371.01.T01:CDS 35.0%
TAGAGGGTTTGCAAATTTGA+TGG - contig289end:13815-13834 None:intergenic 35.0%
TCACCAATAACCATATCACT+GGG + contig289end:13978-13997 MsG0080048371.01.T01:CDS 35.0%
TGAGGTTTCCAAGGTTATTT+GGG - contig289end:12674-12693 None:intergenic 35.0%
TGCAAGTTATACCTTTCCAT+TGG - contig289end:12386-12405 None:intergenic 35.0%
TTCACATAGGCTAGTGAATT+GGG - contig289end:13956-13975 None:intergenic 35.0%
TTGGAATGGAACCATTTATG+AGG - contig289end:14066-14085 None:intergenic 35.0%
TTGGAGAGAATCAAATGTCA+GGG + contig289end:14338-14357 MsG0080048371.01.T01:CDS 35.0%
! ACAAGTGCTGTTATACTACA+AGG - contig289end:13653-13672 None:intergenic 35.0%
! CTTGGTAACAATCACTTGAA+TGG + contig289end:13548-13567 MsG0080048371.01.T01:CDS 35.0%
! CTTGTGACACTAGATTTTTC+TGG + contig289end:13305-13324 MsG0080048371.01.T01:CDS 35.0%
! GATGGTTGACCAATATTTTG+TGG - contig289end:13797-13816 None:intergenic 35.0%
! GCAGTTTGTGAGCAATATTT+TGG - contig289end:14012-14031 None:intergenic 35.0%
! GGGAAATTTCCTGATAGTTT+TGG + contig289end:13857-13876 MsG0080048371.01.T01:CDS 35.0%
! GTATCAGTTCAGTTCCATTT+TGG + contig289end:13042-13061 MsG0080048371.01.T01:CDS 35.0%
! GTTAAAAACTGGTTTCCTTG+TGG - contig289end:14934-14953 None:intergenic 35.0%
! TACAAGAAATCTGAAACTGG+TGG + contig289end:14651-14670 MsG0080048371.01.T01:CDS 35.0%
! TACCTGAGTGATGTTTTTCT+CGG + contig289end:12786-12805 MsG0080048371.01.T01:CDS 35.0%
! TAGATTTCCCAGTTTTCCTA+AGG - contig289end:13588-13607 None:intergenic 35.0%
! TTTTACTTTGTGGTAGCACT+TGG + contig289end:15090-15109 MsG0080048371.01.T01:CDS 35.0%
! TTTTCTCACTGTCAACTTTC+AGG + contig289end:14829-14848 MsG0080048371.01.T01:CDS 35.0%
!!! ACTGGCTTTTGGGTTTTTAT+TGG + contig289end:15120-15139 MsG0080048371.01.T01:CDS 35.0%
!!! AGTTCAGTTCCATTTTGGTT+AGG + contig289end:13047-13066 MsG0080048371.01.T01:CDS 35.0%
!!! GGTGTTTTGTTGTTGAAGAA+GGG + contig289end:15141-15160 MsG0080048371.01.T01:CDS 35.0%
!!! TGGTGTTTTGTTGTTGAAGA+AGG + contig289end:15140-15159 MsG0080048371.01.T01:CDS 35.0%
!!! TTTTGTTGTTGAAGAAGGGT+TGG + contig289end:15145-15164 MsG0080048371.01.T01:CDS 35.0%
AAAATGTCGCCTATCCATGA+AGG - contig289end:14370-14389 None:intergenic 40.0%
AACCTTACAGCAATGGTTCA+AGG + contig289end:14529-14548 MsG0080048371.01.T01:CDS 40.0%
AAGGAAATGACTGTTGCCAA+TGG + contig289end:12367-12386 MsG0080048371.01.T01:CDS 40.0%
AATCCTTGCTACCCACAAAA+AGG + contig289end:12444-12463 MsG0080048371.01.T01:CDS 40.0%
AATGACTGTTGCCAATGGAA+AGG + contig289end:12372-12391 MsG0080048371.01.T01:CDS 40.0%
ACTGGGAAATCTAATCCACT+TGG + contig289end:13595-13614 MsG0080048371.01.T01:CDS 40.0%
CATAGGAAACCTTACAGCAA+TGG + contig289end:14522-14541 MsG0080048371.01.T01:CDS 40.0%
CATGAGGTCACTTGAATCTT+TGG + contig289end:14804-14823 MsG0080048371.01.T01:CDS 40.0%
CCAAACTCCTTAGGAAAACT+GGG + contig289end:13578-13597 MsG0080048371.01.T01:CDS 40.0%
CCATCAACATGTTGTTGGAA+AGG - contig289end:14486-14505 None:intergenic 40.0%
CCTTTCCAACAACATGTTGA+TGG + contig289end:14483-14502 MsG0080048371.01.T01:CDS 40.0%
CTCACCAATAACCATATCAC+TGG + contig289end:13977-13996 MsG0080048371.01.T01:CDS 40.0%
CTTGGAAGTAATGCTCTCAA+TGG + contig289end:13098-13117 MsG0080048371.01.T01:CDS 40.0%
GAAAATGGAGACGATGATGA+TGG + contig289end:15039-15058 MsG0080048371.01.T01:CDS 40.0%
GAAAGTTGGCAAAGTTGTGA+TGG - contig289end:14445-14464 None:intergenic 40.0%
GAATCTGTTCCATTGTGGTT+AGG + contig289end:13188-13207 MsG0080048371.01.T01:CDS 40.0%
GCACAATTGCCTAACCAAAA+TGG - contig289end:13059-13078 None:intergenic 40.0%
GGATCTATTCCAAACTCCTT+AGG + contig289end:13569-13588 MsG0080048371.01.T01:CDS 40.0%
GGTATGATCCCAAATAACCT+TGG + contig289end:12663-12682 MsG0080048371.01.T01:CDS 40.0%
GGTTGTTGTAGGACAAGTTT+AGG - contig289end:14897-14916 None:intergenic 40.0%
GTGAGGTTTCCAAGGTTATT+TGG - contig289end:12675-12694 None:intergenic 40.0%
GTGTCAGAAAACTCTCTGAA+TGG + contig289end:13764-13783 MsG0080048371.01.T01:CDS 40.0%
GTTAAACTGGACATGGTGTA+CGG - contig289end:14862-14881 None:intergenic 40.0%
GTTGGCAACAAATATCTCTG+TGG + contig289end:14976-14995 MsG0080048371.01.T01:CDS 40.0%
TAAGGTTTCCTATGCAGTCA+GGG - contig289end:14516-14535 None:intergenic 40.0%
TCCAAACTCCTTAGGAAAAC+TGG + contig289end:13577-13596 MsG0080048371.01.T01:CDS 40.0%
TGAACTGTGAAAGAGAAGGA+TGG - contig289end:12527-12546 None:intergenic 40.0%
TGACCCAGTGATATGGTTAT+TGG - contig289end:13984-14003 None:intergenic 40.0%
TGGGATCATACCACTCAATT+GGG - contig289end:12655-12674 None:intergenic 40.0%
TTAAGACTTTCCTCTTGGGA+AGG + contig289end:12348-12367 MsG0080048371.01.T01:CDS 40.0%
TTATGTACCTCAGTCTAGCA+TGG + contig289end:13225-13244 MsG0080048371.01.T01:CDS 40.0%
TTCCTTGAACCATTGCTGTA+AGG - contig289end:14534-14553 None:intergenic 40.0%
TTGGCAACATTCCTGATTGT+TGG + contig289end:14143-14162 MsG0080048371.01.T01:CDS 40.0%
TTGGGATCATACCACTCAAT+TGG - contig289end:12656-12675 None:intergenic 40.0%
TTGTCCTACAACAACCTTTC+CGG + contig289end:14901-14920 MsG0080048371.01.T01:CDS 40.0%
! AACTGGTTTCCTTGTGGAAT+TGG - contig289end:14928-14947 None:intergenic 40.0%
! ACCTGAGTGATGTTTTTCTC+GGG + contig289end:12787-12806 MsG0080048371.01.T01:CDS 40.0%
! CATCACTCAGGTAAAGGTTT+TGG - contig289end:12779-12798 None:intergenic 40.0%
! CGTTTGGAATACAGTTTGCA+AGG + contig289end:15220-15239 MsG0080048371.01.T01:CDS 40.0%
! GGGTCTCTTCCTAATTGTTT+TGG + contig289end:13713-13732 MsG0080048371.01.T01:CDS 40.0%
! GTTGTGATGGAATGTTACCT+TGG - contig289end:14432-14451 None:intergenic 40.0%
!!! TGGATTTGCTACTGGCTTTT+GGG + contig289end:15110-15129 MsG0080048371.01.T01:CDS 40.0%
!!! TTGGATTTGCTACTGGCTTT+TGG + contig289end:15109-15128 MsG0080048371.01.T01:CDS 40.0%
ACAGTCATTTCCTTCCCAAG+AGG - contig289end:12361-12380 None:intergenic 45.0%
ATTGGGAATCAGCGAGAGAA+AGG - contig289end:12638-12657 None:intergenic 45.0%
CAAGCGCTTCTTGAACTCAA+AGG + contig289end:12306-12325 MsG0080048371.01.T01:CDS 45.0%
CAATAACTACAGGGGACATG+AGG + contig289end:14788-14807 MsG0080048371.01.T01:CDS 45.0%
CATGATTCCATGCTAGACTG+AGG - contig289end:13235-13254 None:intergenic 45.0%
CTCATGTCCCCTGTAGTTAT+TGG - contig289end:14790-14809 None:intergenic 45.0%
CTGTCACACAATCATCTGTC+AGG + contig289end:14757-14776 MsG0080048371.01.T01:CDS 45.0%
CTGTTCCATTGTGGTTAGGA+GGG + contig289end:13192-13211 MsG0080048371.01.T01:CDS 45.0%
GAGACAAGTCTAAATTGCGC+AGG - contig289end:13895-13914 None:intergenic 45.0%
GGGACTATACCTTCATGGAT+AGG + contig289end:14358-14377 MsG0080048371.01.T01:CDS 45.0%
GTAAGGTTTCCTATGCAGTC+AGG - contig289end:14517-14536 None:intergenic 45.0%
GTTGCGGCAACTTGAAAATC+TGG + contig289end:13442-13461 MsG0080048371.01.T01:CDS 45.0%
GTTTCCTTGTGGAATTGGTC+CGG - contig289end:14923-14942 None:intergenic 45.0%
GTTTGGTCACCTTTCTACTC+TGG + contig289end:14234-14253 MsG0080048371.01.T01:CDS 45.0%
TCAATGATCAGCTGCCAACT+TGG + contig289end:13420-13439 MsG0080048371.01.T01:CDS 45.0%
TCCCGAGAAAAACATCACTC+AGG - contig289end:12791-12810 None:intergenic 45.0%
TCTAACCCTCCTAACCACAA+TGG - contig289end:13200-13219 None:intergenic 45.0%
TCTGTTCCATTGTGGTTAGG+AGG + contig289end:13191-13210 MsG0080048371.01.T01:CDS 45.0%
TGAGCCCATCAACATGTTGT+TGG - contig289end:14491-14510 None:intergenic 45.0%
TGTCAGGGACTATACCTTCA+TGG + contig289end:14353-14372 MsG0080048371.01.T01:CDS 45.0%
TGTTGTTGAAGAAGGGTTGG+AGG + contig289end:15148-15167 MsG0080048371.01.T01:CDS 45.0%
TTGAGTGGACCTATTCCTAC+AGG + contig289end:14700-14719 MsG0080048371.01.T01:CDS 45.0%
! CCCAGTTTTCCTAAGGAGTT+TGG - contig289end:13581-13600 None:intergenic 45.0%
! CTCGTCGGTAATTTGCAATC+AGG + contig289end:13350-13369 MsG0080048371.01.T01:CDS 45.0%
! GAGTGATGTTTTTCTCGGGA+GGG + contig289end:12791-12810 MsG0080048371.01.T01:CDS 45.0%
! TCTCCTTTTTGTGGGTAGCA+AGG - contig289end:12450-12469 None:intergenic 45.0%
! TGAGTGATGTTTTTCTCGGG+AGG + contig289end:12790-12809 MsG0080048371.01.T01:CDS 45.0%
!! CTATAAATTCAGGAGTGCCG+AGG + contig289end:14569-14588 MsG0080048371.01.T01:CDS 45.0%
!! GATGTCAGCGAGAGCATTAA+AGG + contig289end:14613-14632 MsG0080048371.01.T01:CDS 45.0%
!! GTAGCACTTGGATTTGCTAC+TGG + contig289end:15102-15121 MsG0080048371.01.T01:CDS 45.0%
!!! GAGTGCCGAGGTATTTTGAA+TGG + contig289end:14581-14600 MsG0080048371.01.T01:CDS 45.0%
ATCAGCTGCCAACTTGGTTG+CGG + contig289end:13426-13445 MsG0080048371.01.T01:CDS 50.0%
CTTGTGGAATTGGTCCGGAA+AGG - contig289end:14918-14937 None:intergenic 50.0%
CTTTCCGGACCAATTCCACA+AGG + contig289end:14916-14935 MsG0080048371.01.T01:CDS 50.0%
GAAAGGTGACCAAACGAGCT+CGG - contig289end:14229-14248 None:intergenic 50.0%
GCAACCACACCAGAGTAGAA+AGG - contig289end:14246-14265 None:intergenic 50.0%
GGAGTTATTCCGAGCTCGTT+TGG + contig289end:14217-14236 MsG0080048371.01.T01:CDS 50.0%
GTCACCTTTCTACTCTGGTG+TGG + contig289end:14239-14258 MsG0080048371.01.T01:CDS 50.0%
GTGGGTAGCAAGGATTCCTA+AGG - contig289end:12440-12459 None:intergenic 50.0%
TGGTCCGGAAAGGTTGTTGT+AGG - contig289end:14908-14927 None:intergenic 50.0%
! TCAAGTTGCCGCAACCAAGT+TGG - contig289end:13437-13456 None:intergenic 50.0%
! TCTGAAACTGGTGGCCAATG+TGG + contig289end:14660-14679 MsG0080048371.01.T01:CDS 50.0%
!! CTCGCTGATTCCCAATTGAG+TGG + contig289end:12642-12661 MsG0080048371.01.T01:CDS 50.0%
CTTCAAGGAGATGCGCTCGT+CGG + contig289end:13335-13354 MsG0080048371.01.T01:CDS 55.0%
GGCTCAATCCCTGACTGCAT+AGG + contig289end:14505-14524 MsG0080048371.01.T01:CDS 55.0%
GGGGAAGTGACCCAGTGATA+TGG - contig289end:13991-14010 None:intergenic 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
contig289end gene 12291 15278 12291 ID=MsG0080048371.01;Name=MsG0080048371.01
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contig289end exon 12291 15278 12291 ID=MsG0080048371.01.T01:exon:10858;Parent=MsG0080048371.01.T01
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