AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0080048779.01

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MsG0080048779.01.T01 AT2G39230 18.605 688 519 15 2 656 165 844 4.97e-23 105
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CRISPR-Local

CRISPR-Local
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CAAGGGCAATTCTCTCACTA+TGG 0.460622 contig438end:-13476 MsG0080048779.01.T01:intergenic
AATTTCTAGATTATTGGTAG+TGG 0.467828 contig438end:+13694 MsG0080048779.01.T01:exon
TACACGGCAATTTGGAGCTC+GGG 0.473488 contig438end:+13109 MsG0080048779.01.T01:exon
AGAGAATGTCAGAAAGCAAA+TGG 0.473754 contig438end:+13233 MsG0080048779.01.T01:exon
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AGATACAGATGAAGAACAAA+AGG 0.489935 contig438end:+13437 MsG0080048779.01.T01:exon
TACCGGTTTCATCATTTCCA+TGG 0.491739 contig438end:+13633 MsG0080048779.01.T01:exon
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TACACAAATCTATGCAAAGT+TGG 0.496758 contig438end:+13353 MsG0080048779.01.T01:exon
AATTCTAAGAGGCGAGCCTT+CGG 0.500145 contig438end:-13520 MsG0080048779.01.T01:intergenic
CACCATGGAAATGATGAAAC+CGG 0.502543 contig438end:-13635 MsG0080048779.01.T01:intergenic
CTATGCCACACGAATTCATT+CGG 0.522767 contig438end:-13066 MsG0080048779.01.T01:intergenic
TGTAACGCATAGCTTGTGTC+TGG 0.524321 contig438end:-13414 MsG0080048779.01.T01:intergenic
TTTCAACTTGATCCAACTAC+AGG 0.528140 contig438end:-13283 MsG0080048779.01.T01:intergenic
TATTGTACATTTGGGACTGG+TGG 0.542921 contig438end:-13802 MsG0080048779.01.T01:intergenic
TCATAGTAAGGGATTCATAC+CGG 0.544003 contig438end:+13616 MsG0080048779.01.T01:exon
CTGTGCATCTACTCAAAGGT+GGG 0.546167 contig438end:+13203 MsG0080048779.01.T01:exon
ATACACGGCAATTTGGAGCT+CGG 0.548997 contig438end:+13108 MsG0080048779.01.T01:exon
TAGTTAGTAAAATTGTTGGT+AGG 0.549378 contig438end:+13589 MsG0080048779.01.T01:exon
AACAAGAACACTTGCCACCA+TGG 0.555394 contig438end:-13650 MsG0080048779.01.T01:intergenic
AACTTGATCCAACTACAGGC+AGG 0.560113 contig438end:-13279 MsG0080048779.01.T01:intergenic
GGGTTGATCAATAGTGCCGA+AGG 0.567037 contig438end:+13504 MsG0080048779.01.T01:exon
TAACTAGCTTGAAAACAGAA+TGG 0.570526 contig438end:-13572 MsG0080048779.01.T01:intergenic
CCGGTCAGGAAGGCTTGCTG+AGG 0.571095 contig438end:+13011 MsG0080048779.01.T01:intron
AGAAAGATGACTAGAGAGGA+AGG 0.574261 contig438end:+13384 MsG0080048779.01.T01:exon
TGGTAGGAAAATCATAGTAA+GGG 0.577531 contig438end:+13605 MsG0080048779.01.T01:exon
GCATAGATTTGTGTAGATTG+TGG 0.583161 contig438end:-13345 MsG0080048779.01.T01:intergenic
TCTGTGCATCTACTCAAAGG+TGG 0.592330 contig438end:+13202 MsG0080048779.01.T01:exon
ATGTCTGTGCATCTACTCAA+AGG 0.596982 contig438end:+13199 MsG0080048779.01.T01:exon
TATTGATCAACCCAAAAGCA+AGG 0.599004 contig438end:-13494 MsG0080048779.01.T01:intergenic
AACGTATCAAAATCAAACTC+AGG 0.599467 contig438end:-13742 MsG0080048779.01.T01:intergenic
GACATTTGAATAAAGAACAT+AGG 0.599890 contig438end:-13181 MsG0080048779.01.T01:intergenic
CGGTTTCATCATTTCCATGG+TGG 0.600902 contig438end:+13636 MsG0080048779.01.T01:exon
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ACGGCAATTTGGAGCTCGGG+AGG 0.616668 contig438end:+13112 MsG0080048779.01.T01:exon
GCCACACGAATTCATTCGGT+GGG 0.616987 contig438end:-13062 MsG0080048779.01.T01:intergenic
GCTCAGAAAGATGACTAGAG+AGG 0.622117 contig438end:+13380 MsG0080048779.01.T01:exon
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TTGGCTGCTTGCAAAATACA+CGG 0.641367 contig438end:+13093 MsG0080048779.01.T01:exon
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CAGCTCGAAAAGACGATCAG+CGG 0.666674 contig438end:-13139 None:intergenic

CRISPR-GE

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!! CAATAAAATTTAGAAAATAT+GGG + contig438end:13820-13839 MsG0080048779.01.T01:exon 10.0%
!! AAGAAGTTCTTAATATTTAT+CGG + contig438end:11305-11324 MsG0080048779.01.T01:CDS 15.0%
!!! ATAGTAATATAATCTGTTTT+TGG - contig438end:11655-11674 MsG0080048779.01.T01:intergenic 15.0%
!!! CTAAATTTTATTGTACATTT+GGG - contig438end:13813-13832 MsG0080048779.01.T01:intergenic 15.0%
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!!! TCTAAATTTTATTGTACATT+TGG - contig438end:13814-13833 MsG0080048779.01.T01:intergenic 15.0%
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!! CTAATAAAAATTCTAGTACT+TGG + contig438end:12451-12470 MsG0080048779.01.T01:CDS 20.0%
!!! GAATTGAATTTCTAGATTAT+TGG + contig438end:13688-13707 MsG0080048779.01.T01:exon 20.0%
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! AAGCTAGTTAGTAAAATTGT+TGG + contig438end:13585-13604 MsG0080048779.01.T01:exon 25.0%
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! AATTTGTACTGGAAATACAA+TGG + contig438end:11348-11367 MsG0080048779.01.T01:CDS 25.0%
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! ATTACCAAACATGGATATAA+GGG - contig438end:11485-11504 MsG0080048779.01.T01:intergenic 25.0%
! ATTACTATTGTCAATCTTCT+TGG + contig438end:12264-12283 MsG0080048779.01.T01:CDS 25.0%
! GACATTTGAATAAAGAACAT+AGG - contig438end:13184-13203 MsG0080048779.01.T01:intergenic 25.0%
! TAGTTAGTAAAATTGTTGGT+AGG + contig438end:13589-13608 MsG0080048779.01.T01:exon 25.0%
! TCTAATAACAAAATCTGGAT+TGG + contig438end:11738-11757 MsG0080048779.01.T01:CDS 25.0%
! TTCATGGAATAACATGATAT+CGG + contig438end:10952-10971 MsG0080048779.01.T01:CDS 25.0%
!! AAAAACAAGGTTATGACTTT+TGG + contig438end:13303-13322 MsG0080048779.01.T01:exon 25.0%
!! AAAACAAGGTTATGACTTTT+GGG + contig438end:13304-13323 MsG0080048779.01.T01:exon 25.0%
!! AATTTCTAGATTATTGGTAG+TGG + contig438end:13694-13713 MsG0080048779.01.T01:exon 25.0%
!!! ATACGTTTTAAATGCTACAA+TGG + contig438end:12674-12693 MsG0080048779.01.T01:CDS 25.0%
!!! GAACATTTTAATATCAGCAT+TGG + contig438end:12776-12795 MsG0080048779.01.T01:CDS 25.0%
AACGTATCAAAATCAAACTC+AGG - contig438end:13745-13764 MsG0080048779.01.T01:intergenic 30.0%
AATACTTTCCATCTTCAACA+TGG - contig438end:11894-11913 MsG0080048779.01.T01:intergenic 30.0%
AATGCTACAATGGATATGTA+CGG + contig438end:12684-12703 MsG0080048779.01.T01:CDS 30.0%
AATTCCCTTATATCCATGTT+TGG + contig438end:11478-11497 MsG0080048779.01.T01:CDS 30.0%
AATTTCATGGAATTCCATGA+TGG + contig438end:11864-11883 MsG0080048779.01.T01:CDS 30.0%
ACAGCTGGATTATTAAACTT+GGG + contig438end:12637-12656 MsG0080048779.01.T01:CDS 30.0%
ACATTGTAATTAAGGAGCTT+TGG - contig438end:12380-12399 MsG0080048779.01.T01:intergenic 30.0%
AGATACAGATGAAGAACAAA+AGG + contig438end:13437-13456 MsG0080048779.01.T01:exon 30.0%
AGTGTTCTTGTTCAGATTAT+TGG + contig438end:13661-13680 MsG0080048779.01.T01:exon 30.0%
ATGATAGAAATGATGCTTCA+TGG + contig438end:10936-10955 MsG0080048779.01.T01:CDS 30.0%
ATTATAACACGCAGATAATG+CGG - contig438end:11986-12005 MsG0080048779.01.T01:intergenic 30.0%
CAGTTATGTAATTGCTAGTA+TGG + contig438end:11051-11070 MsG0080048779.01.T01:CDS 30.0%
CATCTCAATCAAAAGTAGAA+TGG - contig438end:11923-11942 MsG0080048779.01.T01:intergenic 30.0%
CATGAAATTAAATCTCTCTC+TGG - contig438end:11853-11872 MsG0080048779.01.T01:intergenic 30.0%
CATGGTCTAATAACAAAATC+TGG + contig438end:11733-11752 MsG0080048779.01.T01:CDS 30.0%
CCATGTTTCAAAAGATAATC+AGG - contig438end:12303-12322 MsG0080048779.01.T01:intergenic 30.0%
CTGTGTGTTTAATAACATGA+AGG + contig438end:11528-11547 MsG0080048779.01.T01:CDS 30.0%
CTTAATCATAGGTAACACAT+TGG + contig438end:12062-12081 MsG0080048779.01.T01:CDS 30.0%
CTTCATGTTATTAAACACAC+AGG - contig438end:11530-11549 MsG0080048779.01.T01:intergenic 30.0%
GTACATCACAACTTAATCAT+AGG + contig438end:12051-12070 MsG0080048779.01.T01:CDS 30.0%
TACACAAATCTATGCAAAGT+TGG + contig438end:13353-13372 MsG0080048779.01.T01:exon 30.0%
TACACCAAAATGAATCACAA+AGG - contig438end:12034-12053 MsG0080048779.01.T01:intergenic 30.0%
TCATGGAATAACATGATATC+GGG + contig438end:10953-10972 MsG0080048779.01.T01:CDS 30.0%
TGGTAGGAAAATCATAGTAA+GGG + contig438end:13605-13624 MsG0080048779.01.T01:exon 30.0%
TTCAACTTAATGAGAAGAGA+AGG + contig438end:12225-12244 MsG0080048779.01.T01:CDS 30.0%
TTGATGTCTAATGTGTTTGT+TGG + contig438end:11148-11167 MsG0080048779.01.T01:CDS 30.0%
TTGGTAGGAAAATCATAGTA+AGG + contig438end:13604-13623 MsG0080048779.01.T01:exon 30.0%
TTTAAGAATCTTCGTGTTTG+TGG + contig438end:13543-13562 MsG0080048779.01.T01:exon 30.0%
! AACAAAAGGAGCATAATCTA+TGG + contig438end:13451-13470 MsG0080048779.01.T01:exon 30.0%
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! TAATTATGATAGTGTAGAGG+AGG + contig438end:11501-11520 MsG0080048779.01.T01:CDS 30.0%
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! TTTTGCCACATGTTTGAAAA+TGG + contig438end:11016-11035 MsG0080048779.01.T01:CDS 30.0%
!! TCTTTTAAGTATGTATGCTC+AGG + contig438end:11786-11805 MsG0080048779.01.T01:CDS 30.0%
!! TTGGATCAAGTTGAAAAACA+AGG + contig438end:13290-13309 MsG0080048779.01.T01:exon 30.0%
!! TTTTATTGTACATTTGGGAC+TGG - contig438end:13808-13827 MsG0080048779.01.T01:intergenic 30.0%
!!! CCTGATTATCTTTTGAAACA+TGG + contig438end:12300-12319 MsG0080048779.01.T01:CDS 30.0%
AAATCAGGTCAAAGAGATCT+TGG + contig438end:12754-12773 MsG0080048779.01.T01:CDS 35.0%
AATGTTTGGGGATAAAACCA+TGG + contig438end:11393-11412 MsG0080048779.01.T01:CDS 35.0%
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AGGAACCAAATATAGTCTCT+TGG + contig438end:11242-11261 MsG0080048779.01.T01:CDS 35.0%
ATGAGCATTTGCAGAAAGAA+TGG - contig438end:12481-12500 MsG0080048779.01.T01:intergenic 35.0%
ATGGATATGTACGGAAAATG+TGG + contig438end:12693-12712 MsG0080048779.01.T01:CDS 35.0%
ATGTTTGGGGATAAAACCAT+GGG + contig438end:11394-11413 MsG0080048779.01.T01:CDS 35.0%
ATTAGAACTTGCGGAATGTT+TGG + contig438end:11379-11398 MsG0080048779.01.T01:CDS 35.0%
ATTGATCAACCCAAAAGCAA+GGG - contig438end:13496-13515 MsG0080048779.01.T01:intergenic 35.0%
ATTGCAAGGATGAGAAATGA+TGG + contig438end:12531-12550 MsG0080048779.01.T01:CDS 35.0%
CACAGCTGGATTATTAAACT+TGG + contig438end:12636-12655 MsG0080048779.01.T01:CDS 35.0%
CATGGAATAACATGATATCG+GGG + contig438end:10954-10973 MsG0080048779.01.T01:CDS 35.0%
CATGGTTATGTTGTCAAATG+CGG + contig438end:11124-11143 MsG0080048779.01.T01:CDS 35.0%
CTAGCAATTACATAACTGCT+TGG - contig438end:11049-11068 MsG0080048779.01.T01:intergenic 35.0%
CTGGGCATACATTGTAATTA+AGG - contig438end:12388-12407 MsG0080048779.01.T01:intergenic 35.0%
CTTTCTGCAAATGCTCATTA+TGG + contig438end:12483-12502 MsG0080048779.01.T01:CDS 35.0%
GAAGTCCAAGAGACTATATT+TGG - contig438end:11250-11269 MsG0080048779.01.T01:intergenic 35.0%
GCATAGATTTGTGTAGATTG+TGG - contig438end:13348-13367 MsG0080048779.01.T01:intergenic 35.0%
GCTACAGTTATTAGAACTTG+CGG + contig438end:11370-11389 MsG0080048779.01.T01:CDS 35.0%
GTATGCGTAATTGATCTTCT+TGG + contig438end:12988-13007 MsG0080048779.01.T01:intron 35.0%
TATTGATCAACCCAAAAGCA+AGG - contig438end:13497-13516 MsG0080048779.01.T01:intergenic 35.0%
TCATAGTAAGGGATTCATAC+CGG + contig438end:13616-13635 MsG0080048779.01.T01:exon 35.0%
TCTTCAATGACCACTGAATT+TGG + contig438end:12940-12959 MsG0080048779.01.T01:intron 35.0%
TGAGATGCTCAAAACAAGAA+AGG + contig438end:11936-11955 MsG0080048779.01.T01:CDS 35.0%
TGTATTAAGATCACCACACT+GGG - contig438end:12406-12425 MsG0080048779.01.T01:intergenic 35.0%
TTAGAACTTGCGGAATGTTT+GGG + contig438end:11380-11399 MsG0080048779.01.T01:CDS 35.0%
TTGCAAAATACACGGCAATT+TGG + contig438end:13101-13120 MsG0080048779.01.T01:exon 35.0%
TTGCAAGGATGAGAAATGAT+GGG + contig438end:12532-12551 MsG0080048779.01.T01:CDS 35.0%
TTGTATTAAGATCACCACAC+TGG - contig438end:12407-12426 MsG0080048779.01.T01:intergenic 35.0%
TTTCAACTTGATCCAACTAC+AGG - contig438end:13286-13305 MsG0080048779.01.T01:intergenic 35.0%
TTTGATGAGATGCTTGATCT+CGG + contig438end:12834-12853 MsG0080048779.01.T01:CDS 35.0%
! AAAAGAATTGCATAGCCTTG+TGG - contig438end:11000-11019 MsG0080048779.01.T01:intergenic 35.0%
! AATGCTTGAATTGAGGCATT+TGG - contig438end:12207-12226 MsG0080048779.01.T01:intergenic 35.0%
! CATGCCTTTGTGATTCATTT+TGG + contig438end:12027-12046 MsG0080048779.01.T01:CDS 35.0%
! CTTTTATGGTACACATGGTT+CGG + contig438end:11186-11205 MsG0080048779.01.T01:CDS 35.0%
! GATCTCTTTGACCTGATTTT+CGG - contig438end:12753-12772 MsG0080048779.01.T01:intergenic 35.0%
! TATCGGCATTTAAGACACAA+CGG + contig438end:11322-11341 MsG0080048779.01.T01:CDS 35.0%
! TATTGGTAACTTGACAGTAC+TGG + contig438end:12596-12615 MsG0080048779.01.T01:CDS 35.0%
! TGACACCATTTTCAAACATG+TGG - contig438end:11024-11043 MsG0080048779.01.T01:intergenic 35.0%
! TGAGGCTAACAAACTTTTTG+AGG + contig438end:11213-11232 MsG0080048779.01.T01:CDS 35.0%
! TTCTGCACAACATTTGAAGT+GGG + contig438end:11699-11718 MsG0080048779.01.T01:CDS 35.0%
!! ATGGTTTGCTATGCAGATAA+TGG + contig438end:11274-11293 MsG0080048779.01.T01:CDS 35.0%
!! CAAACTTTTTGAGGAGATTG+AGG + contig438end:11222-11241 MsG0080048779.01.T01:CDS 35.0%
!! TGGTTTGCTATGCAGATAAT+GGG + contig438end:11275-11294 MsG0080048779.01.T01:CDS 35.0%
!!! AAGGTTATGACTTTTGGGAT+GGG + contig438end:13309-13328 MsG0080048779.01.T01:exon 35.0%
!!! AATCTCTAGGACACTTCTTT+TGG + contig438end:11614-11633 MsG0080048779.01.T01:CDS 35.0%
!!! ACTAGTTTGCTGCACTTTTA+TGG + contig438end:11172-11191 MsG0080048779.01.T01:CDS 35.0%
AACACATTGGTCACCATGTA+TGG + contig438end:12075-12094 MsG0080048779.01.T01:CDS 40.0%
AATCTCTCTCTGGCATTGTA+TGG - contig438end:11843-11862 MsG0080048779.01.T01:intergenic 40.0%
AATTATGCCTGAGAGAGATG+TGG + contig438end:12137-12156 MsG0080048779.01.T01:CDS 40.0%
ACACAATGCTCTATTCCAGT+AGG - contig438end:12970-12989 MsG0080048779.01.T01:intergenic 40.0%
ACACATTGGTCACCATGTAT+GGG + contig438end:12076-12095 MsG0080048779.01.T01:CDS 40.0%
ACCAATAGTAGCAAGAGCTA+CGG - contig438end:12583-12602 MsG0080048779.01.T01:intergenic 40.0%
AGAAAGATGACTAGAGAGGA+AGG + contig438end:13384-13403 MsG0080048779.01.T01:exon 40.0%
AGTCTCTTGGACTTCTTTGA+TGG + contig438end:11255-11274 MsG0080048779.01.T01:CDS 40.0%
ATGTCTGTGCATCTACTCAA+AGG + contig438end:13199-13218 MsG0080048779.01.T01:exon 40.0%
ATTACAATGTATGCCCAGTG+TGG + contig438end:12390-12409 MsG0080048779.01.T01:CDS 40.0%
ATTACTGCAAGTGCACGTAA+TGG + contig438end:11580-11599 MsG0080048779.01.T01:CDS 40.0%
CAATCCAAACTTCCCATACA+TGG - contig438end:12091-12110 MsG0080048779.01.T01:intergenic 40.0%
CACAATGCTCTATTCCAGTA+GGG - contig438end:12969-12988 MsG0080048779.01.T01:intergenic 40.0%
CACCATGGAAATGATGAAAC+CGG - contig438end:13638-13657 MsG0080048779.01.T01:intergenic 40.0%
CTATGCCACACGAATTCATT+CGG - contig438end:13069-13088 MsG0080048779.01.T01:intergenic 40.0%
CTTGGAGATGTCATCAAATC+TGG + contig438end:11427-11446 MsG0080048779.01.T01:CDS 40.0%
GAAACAAATGTGACGTGATC+AGG - contig438end:12867-12886 MsG0080048779.01.T01:intergenic 40.0%
GAGATCAAGCATCTCATCAA+AGG - contig438end:12835-12854 MsG0080048779.01.T01:intergenic 40.0%
GTATGGGAAGTTTGGATTGA+TGG + contig438end:12092-12111 MsG0080048779.01.T01:CDS 40.0%
GTGTAGATTGTGGATGAAAC+TGG - contig438end:13338-13357 MsG0080048779.01.T01:intergenic 40.0%
GTTCTGCACAACATTTGAAG+TGG + contig438end:11698-11717 MsG0080048779.01.T01:CDS 40.0%
TAGAACTTGCGGAATGTTTG+GGG + contig438end:11381-11400 MsG0080048779.01.T01:CDS 40.0%
TGCAAGGATGAGAAATGATG+GGG + contig438end:12533-12552 MsG0080048779.01.T01:CDS 40.0%
TTAAGTATGTATGCTCAGGC+TGG + contig438end:11790-11809 MsG0080048779.01.T01:CDS 40.0%
TTGATGAGATGCTTGATCTC+GGG + contig438end:12835-12854 MsG0080048779.01.T01:CDS 40.0%
TTGGATCTTTGTCATCAGCA+TGG - contig438end:12188-12207 MsG0080048779.01.T01:intergenic 40.0%
TTGGCTGCTTGCAAAATACA+CGG + contig438end:13093-13112 MsG0080048779.01.T01:exon 40.0%
! ATCGGCATTTAAGACACAAC+GGG + contig438end:11323-11342 MsG0080048779.01.T01:CDS 40.0%
! CAGATTTGATGACATCTCCA+AGG - contig438end:11429-11448 MsG0080048779.01.T01:intergenic 40.0%
! CTGCACTTTTATGGTACACA+TGG + contig438end:11181-11200 MsG0080048779.01.T01:CDS 40.0%
! GTAACATGGAATGCACTGAT+AGG + contig438end:12159-12178 MsG0080048779.01.T01:CDS 40.0%
! TATTGTACATTTGGGACTGG+TGG - contig438end:13805-13824 MsG0080048779.01.T01:intergenic 40.0%
! TCTGCACAACATTTGAAGTG+GGG + contig438end:11700-11719 MsG0080048779.01.T01:CDS 40.0%
! TTTGACCTGATTTTCGGCAT+CGG - contig438end:12747-12766 MsG0080048779.01.T01:intergenic 40.0%
!! AATTTTAGTGCTTCCTCACC+AGG - contig438end:12510-12529 MsG0080048779.01.T01:intergenic 40.0%
!! AGAGAATTGCCCTTGCTTTT+GGG + contig438end:13484-13503 MsG0080048779.01.T01:exon 40.0%
!! CAAGGTTATGACTTTTGGGA+TGG + contig438end:13308-13327 MsG0080048779.01.T01:exon 40.0%
!! TACCGGTTTCATCATTTCCA+TGG + contig438end:13633-13652 MsG0080048779.01.T01:exon 40.0%
!! TACTATCTCAGCCTTGTTAC+CGG + contig438end:11669-11688 MsG0080048779.01.T01:CDS 40.0%
!!! GGTCGTTTTGAAGAATCTCT+AGG + contig438end:11601-11620 MsG0080048779.01.T01:CDS 40.0%
AACAAGAACACTTGCCACCA+TGG - contig438end:13653-13672 MsG0080048779.01.T01:intergenic 45.0%
AACTTGATCCAACTACAGGC+AGG - contig438end:13282-13301 MsG0080048779.01.T01:intergenic 45.0%
ACCATGGGATATCAGATCCT+TGG + contig438end:11409-11428 MsG0080048779.01.T01:CDS 45.0%
AGAAGAAACCTGCCTGTAGT+TGG + contig438end:13271-13290 MsG0080048779.01.T01:exon 45.0%
AGGAACGAGACACTATTTCG+TGG + contig438end:11548-11567 MsG0080048779.01.T01:CDS 45.0%
AGTAGGGACACCAAATTCAG+TGG - contig438end:12953-12972 MsG0080048779.01.T01:intergenic 45.0%
ATGGCAAGCCATGTTGAAGA+TGG + contig438end:11883-11902 MsG0080048779.01.T01:CDS 45.0%
CAAGGGCAATTCTCTCACTA+TGG - contig438end:13479-13498 MsG0080048779.01.T01:intergenic 45.0%
CATGTTACCACATCTCTCTC+AGG - contig438end:12147-12166 MsG0080048779.01.T01:intergenic 45.0%
CGGTTTCATCATTTCCATGG+TGG + contig438end:13636-13655 MsG0080048779.01.T01:exon 45.0%
CTGAGAGAGATGTGGTAACA+TGG + contig438end:12145-12164 MsG0080048779.01.T01:CDS 45.0%
CTGTGCATCTACTCAAAGGT+GGG + contig438end:13203-13222 MsG0080048779.01.T01:exon 45.0%
GCAAATGCTCATTATGGTCC+TGG + contig438end:12489-12508 MsG0080048779.01.T01:CDS 45.0%
GCGTAATTGATCTTCTTGGC+CGG + contig438end:12992-13011 MsG0080048779.01.T01:intron 45.0%
GCTCAGAAAGATGACTAGAG+AGG + contig438end:13380-13399 MsG0080048779.01.T01:exon 45.0%
GTCACCATGTATGGGAAGTT+TGG + contig438end:12084-12103 MsG0080048779.01.T01:CDS 45.0%
TCCAAGGATCTGATATCCCA+TGG - contig438end:11413-11432 MsG0080048779.01.T01:intergenic 45.0%
TCCGTAGCTCTTGCTACTAT+TGG + contig438end:12579-12598 MsG0080048779.01.T01:CDS 45.0%
TCTGTGCATCTACTCAAAGG+TGG + contig438end:13202-13221 MsG0080048779.01.T01:exon 45.0%
TGTGCATCTACTCAAAGGTG+GGG + contig438end:13204-13223 MsG0080048779.01.T01:exon 45.0%
! AACTTGACAGTACTGGACGA+GGG + contig438end:12603-12622 MsG0080048779.01.T01:CDS 45.0%
! AATTCTAAGAGGCGAGCCTT+CGG - contig438end:13523-13542 MsG0080048779.01.T01:intergenic 45.0%
! ACATGGAATGCACTGATAGG+TGG + contig438end:12162-12181 MsG0080048779.01.T01:CDS 45.0%
! ATACACGGCAATTTGGAGCT+CGG + contig438end:13108-13127 MsG0080048779.01.T01:exon 45.0%
! ATATCGGGGTTTGTTCGAGT+GGG + contig438end:10968-10987 MsG0080048779.01.T01:CDS 45.0%
! ATTCGTGTGGCATAGCTTGT+TGG + contig438end:13074-13093 MsG0080048779.01.T01:exon 45.0%
! CAACATTTGAAGTGGGGAAG+AGG + contig438end:11706-11725 MsG0080048779.01.T01:CDS 45.0%
! GAGAAATGATGGGGTTGACT+TGG + contig438end:12542-12561 MsG0080048779.01.T01:CDS 45.0%
! GAGAGAATTGCCCTTGCTTT+TGG + contig438end:13483-13502 MsG0080048779.01.T01:exon 45.0%
! TAACTTGACAGTACTGGACG+AGG + contig438end:12602-12621 MsG0080048779.01.T01:CDS 45.0%
! TGTAACGCATAGCTTGTGTC+TGG - contig438end:13417-13436 MsG0080048779.01.T01:intergenic 45.0%
! TTCAACATGGCTTGCCATCA+TGG - contig438end:11881-11900 MsG0080048779.01.T01:intergenic 45.0%
!! ACTGAATTTGGTGTCCCTAC+TGG + contig438end:12952-12971 MsG0080048779.01.T01:intron 45.0%
!! ATATCAGCATTGGCCAGACA+CGG + contig438end:12786-12805 MsG0080048779.01.T01:CDS 45.0%
!! CACAACGGGCTAATTTGTAC+TGG + contig438end:11337-11356 MsG0080048779.01.T01:CDS 45.0%
!! TACACATGGTTCGGTTTCTG+AGG + contig438end:11195-11214 MsG0080048779.01.T01:CDS 45.0%
AAGTGGGGAAGAGGACTTCA+TGG + contig438end:11715-11734 MsG0080048779.01.T01:CDS 50.0%
AATCCACGCACGCATAGTTG+TGG + contig438end:12329-12348 MsG0080048779.01.T01:CDS 50.0%
ACAACTATGCGTGCGTGGAT+TGG - contig438end:12330-12349 MsG0080048779.01.T01:intergenic 50.0%
AGAACCACATGCCGGTAACA+AGG - contig438end:11683-11702 MsG0080048779.01.T01:intergenic 50.0%
ATTGATCTTCTTGGCCGGTC+AGG + contig438end:12997-13016 MsG0080048779.01.T01:intron 50.0%
CAGCTCGAAAAGACGATCAG+CGG - contig438end:13142-13161 MsG0080048779.01.T01:intergenic 50.0%
GCCACACGAATTCATTCGGT+GGG - contig438end:13065-13084 MsG0080048779.01.T01:intergenic 50.0%
GTATGGTGACTGCGTGTGAT+AGG + contig438end:11068-11087 MsG0080048779.01.T01:CDS 50.0%
TCCCACCGAATGAATTCGTG+TGG + contig438end:13061-13080 MsG0080048779.01.T01:exon 50.0%
TCCTTCCGATGCCGAAAATC+AGG + contig438end:12739-12758 MsG0080048779.01.T01:CDS 50.0%
TGACTGCGTGTGATAGGTCA+GGG + contig438end:11074-11093 MsG0080048779.01.T01:CDS 50.0%
TGCCACACGAATTCATTCGG+TGG - contig438end:13066-13085 MsG0080048779.01.T01:intergenic 50.0%
TGCTCATTATGGTCCTGGTG+AGG + contig438end:12494-12513 MsG0080048779.01.T01:CDS 50.0%
TGTTGTGCAGAACCACATGC+CGG - contig438end:11691-11710 MsG0080048779.01.T01:intergenic 50.0%
! ACGAATTCATTCGGTGGGAC+AGG - contig438end:13060-13079 MsG0080048779.01.T01:intergenic 50.0%
! CATAGCTTGTGTCTGGCATG+TGG - contig438end:13410-13429 MsG0080048779.01.T01:intergenic 50.0%
! GATATCGGGGTTTGTTCGAG+TGG + contig438end:10967-10986 MsG0080048779.01.T01:CDS 50.0%
! GGGTTGATCAATAGTGCCGA+AGG + contig438end:13504-13523 MsG0080048779.01.T01:exon 50.0%
! TACACGGCAATTTGGAGCTC+GGG + contig438end:13109-13128 MsG0080048779.01.T01:exon 50.0%
!! ACCTGATTTTCGGCATCGGA+AGG - contig438end:12743-12762 MsG0080048779.01.T01:intergenic 50.0%
!! TATCAGCATTGGCCAGACAC+GGG + contig438end:12787-12806 MsG0080048779.01.T01:CDS 50.0%
AGGTCAGGGTGCATGACTGA+AGG + contig438end:11088-11107 MsG0080048779.01.T01:CDS 55.0%
ATCTTCTTGGCCGGTCAGGA+AGG + contig438end:13001-13020 MsG0080048779.01.T01:intron 55.0%
CATCAAAGGCCTCTGTAGCC+TGG - contig438end:12821-12840 MsG0080048779.01.T01:intergenic 55.0%
GGTCAGGGTGCATGACTGAA+GGG + contig438end:11089-11108 MsG0080048779.01.T01:CDS 55.0%
GTCAGGGTGCATGACTGAAG+GGG + contig438end:11090-11109 MsG0080048779.01.T01:CDS 55.0%
GTGACTGCGTGTGATAGGTC+AGG + contig438end:11073-11092 MsG0080048779.01.T01:CDS 55.0%
TGCTCAGGCTGGATCATCTG+AGG + contig438end:11801-11820 MsG0080048779.01.T01:CDS 55.0%
TTCTGTCTGCCTGCAGCCAT+GGG + contig438end:12889-12908 MsG0080048779.01.T01:CDS 55.0%
! GAAGGGGCACGTCAGATTCA+TGG + contig438end:11106-11125 MsG0080048779.01.T01:CDS 55.0%
! GTTTTTCCGCCAGGCTACAG+AGG + contig438end:12809-12828 MsG0080048779.01.T01:CDS 55.0%
!! CATGGGGGTTTGGTGGATGA+GGG + contig438end:12906-12925 MsG0080048779.01.T01:CDS 55.0%
!! TCAGCCTTGTTACCGGCATG+TGG + contig438end:11676-11695 MsG0080048779.01.T01:CDS 55.0%
!! TCGAGTGGGTTGGTACCACA+AGG + contig438end:10982-11001 MsG0080048779.01.T01:CDS 55.0%
AGGGTCAGCAGCTTCACAGC+TGG + contig438end:12622-12641 MsG0080048779.01.T01:CDS 60.0%
CAAAGGCCTCTGTAGCCTGG+CGG - contig438end:12818-12837 MsG0080048779.01.T01:intergenic 60.0%
CACGCACGCATAGTTGTGGC+AGG + contig438end:12333-12352 MsG0080048779.01.T01:CDS 60.0%
CCTCAGCAAGCCTTCCTGAC+CGG - contig438end:13014-13033 MsG0080048779.01.T01:intergenic 60.0%
CCTCATCCACCAAACCCCCA+TGG - contig438end:12908-12927 MsG0080048779.01.T01:intergenic 60.0%
CTGCCACAACTATGCGTGCG+TGG - contig438end:12335-12354 MsG0080048779.01.T01:intergenic 60.0%
CTGGCGGAAAAACCCGTGTC+TGG - contig438end:12802-12821 MsG0080048779.01.T01:intergenic 60.0%
CTTCTGTCTGCCTGCAGCCA+TGG + contig438end:12888-12907 MsG0080048779.01.T01:CDS 60.0%
TCTGTCTGCCTGCAGCCATG+GGG + contig438end:12890-12909 MsG0080048779.01.T01:CDS 60.0%
! ACGGCAATTTGGAGCTCGGG+AGG + contig438end:13112-13131 MsG0080048779.01.T01:exon 60.0%
! CAGACACGGGTTTTTCCGCC+AGG + contig438end:12800-12819 MsG0080048779.01.T01:CDS 60.0%
! CGGGGTTTGTTCGAGTGGGT+TGG + contig438end:10972-10991 MsG0080048779.01.T01:CDS 60.0%
!! CCATGGGGGTTTGGTGGATG+AGG + contig438end:12905-12924 MsG0080048779.01.T01:CDS 60.0%
CACCAAACCCCCATGGCTGC+AGG - contig438end:12901-12920 MsG0080048779.01.T01:intergenic 65.0%
CTGCAGCCATGGGGGTTTGG+TGG + contig438end:12899-12918 MsG0080048779.01.T01:CDS 65.0%
CTGTCTGCCTGCAGCCATGG+GGG + contig438end:12891-12910 MsG0080048779.01.T01:CDS 65.0%
TGCCTGCAGCCATGGGGGTT+TGG + contig438end:12896-12915 MsG0080048779.01.T01:CDS 65.0%
!! CCGGTCAGGAAGGCTTGCTG+AGG + contig438end:13011-13030 MsG0080048779.01.T01:intron 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
contig438end gene 10896 13840 10896 ID=MsG0080048779.01;
contig438end mRNA 10896 13840 10896 ID=MsG0080048779.01.T01;Parent=MsG0080048779.01
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contig438end CDS 10932 12927 10932 ID=MsG0080048779.01.T01.cds;Parent=MsG0080048779.01.T01
contig438end CDS 13019 13686 13019 ID=MsG0080048779.01.T01.cds;Parent=MsG0080048779.01.T01
contig438end exon 13019 13840 13019 ID=MsG0080048779.01.T01.exon;Parent=MsG0080048779.01.T01
Gene Sequence

>MsG0080048779.01.T01

ATGTATGATAGAAATGATGCTTCATGGAATAACATGATATCGGGGTTTGTTCGAGTGGGTTGGTACCACAAGGCTATGCAATTCTTTTGCCACATGTTTGAAAATGGTGTCACACCAAGCAGTTATGTAATTGCTAGTATGGTGACTGCGTGTGATAGGTCAGGGTGCATGACTGAAGGGGCACGTCAGATTCATGGTTATGTTGTCAAATGCGGTTTGATGTCTAATGTGTTTGTTGGTACTAGTTTGCTGCACTTTTATGGTACACATGGTTCGGTTTCTGAGGCTAACAAACTTTTTGAGGAGATTGAGGAACCAAATATAGTCTCTTGGACTTCTTTGATGGTTTGCTATGCAGATAATGGGCATACAAAAGAAGTTCTTAATATTTATCGGCATTTAAGACACAACGGGCTAATTTGTACTGGAAATACAATGGCTACAGTTATTAGAACTTGCGGAATGTTTGGGGATAAAACCATGGGATATCAGATCCTTGGAGATGTCATCAAATCTGGATTAGACACTAGCAGTGTCTCTGTCGCAAATTCCCTTATATCCATGTTTGGTAATTATGATAGTGTAGAGGAGGCGTCCTGTGTGTTTAATAACATGAAGGAACGAGACACTATTTCGTGGAATTCAATTATTACTGCAAGTGCACGTAATGGTCGTTTTGAAGAATCTCTAGGACACTTCTTTTGGATGCGTCGTACTCACCCAAAAACAGATTATATTACTATCTCAGCCTTGTTACCGGCATGTGGTTCTGCACAACATTTGAAGTGGGGAAGAGGACTTCATGGTCTAATAACAAAATCTGGATTGGAATCAAATGTTTGTGTATGTAATAGTCTTTTAAGTATGTATGCTCAGGCTGGATCATCTGAGGATGCAGAGTTTGTTTTCCATACAATGCCAGAGAGAGATTTAATTTCATGGAATTCCATGATGGCAAGCCATGTTGAAGATGGAAAGTATTCACATGCCATTCTACTTTTGATTGAGATGCTCAAAACAAGAAAGGCAACAAACTATGTAACTTTTACAACCGCATTATCTGCGTGTTATAATTTAGAAAAACTAAAGATTGTTCATGCCTTTGTGATTCATTTTGGTGTACATCACAACTTAATCATAGGTAACACATTGGTCACCATGTATGGGAAGTTTGGATTGATGGATGAAGCACAAAAAGTGTGCAAAATTATGCCTGAGAGAGATGTGGTAACATGGAATGCACTGATAGGTGGCCATGCTGATGACAAAGATCCAAATGCCTCAATTCAAGCATTCAACTTAATGAGAAGAGAAGGTTTGCCTTCAAACTACATTACTATTGTCAATCTTCTTGGCGCTTGTATGTCTCCTGATTATCTTTTGAAACATGGAATGCCAATCCACGCACGCATAGTTGTGGCAGGATTTGAATTAGATACGTATGTCCAAAGCTCCTTAATTACAATGTATGCCCAGTGTGGTGATCTTAATACAAGTAGCTATATTTTTGATGTATTAGCTAATAAAAATTCTAGTACTTGGAATGCCATTCTTTCTGCAAATGCTCATTATGGTCCTGGTGAGGAAGCACTAAAATTTATTGCAAGGATGAGAAATGATGGGGTTGACTTGGATCAATTTAGCTTCTCCGTAGCTCTTGCTACTATTGGTAACTTGACAGTACTGGACGAGGGTCAGCAGCTTCACAGCTGGATTATTAAACTTGGGTTTGAGTTAGATGAATACGTTTTAAATGCTACAATGGATATGTACGGAAAATGTGGAGAAATTGATGATGTATTTAGAATCCTTCCGATGCCGAAAATCAGGTCAAAGAGATCTTGGAACATTTTAATATCAGCATTGGCCAGACACGGGTTTTTCCGCCAGGCTACAGAGGCCTTTGATGAGATGCTTGATCTCGGGCTGAGACCTGATCACGTCACATTTGTTTCACTTCTGTCTGCCTGCAGCCATGGGGGTTTGGTGGATGAGGGAAGGCTTGCTGAGGCTGAAGCTTTCATTGATAAGATGCCTGTCCCACCGAATGAATTCGTGTGGCATAGCTTGTTGGCTGCTTGCAAAATACACGGCAATTTGGAGCTCGGGAGGAAAGCCGCTGATCGTCTTTTCGAGCTGAACTCGTCTGATGATTCAGCCTATGTTCTTTATTCAAATGTCTGTGCATCTACTCAAAGGTGGGGAGATGTAGAGAATGTCAGAAAGCAAATGGAATCACAGAGTTTAAAGAAGAAACCTGCCTGTAGTTGGATCAAGTTGAAAAACAAGGTTATGACTTTTGGGATGGGAGACCAGTTTCATCCACAATCTACACAAATCTATGCAAAGTTGGAAGAGCTCAGAAAGATGACTAGAGAGGAAGGCCACATGCCAGACACAAGCTATGCGTTACAAGATACAGATGAAGAACAAAAGGAGCATAATCTATGGAACCATAGTGAGAGAATTGCCCTTGCTTTTGGGTTGATCAATAGTGCCGAAGGCTCGCCTCTTAGAATTTTTAAGAATCTTCGTGTTTGTGGTGATTGCCATTCTGTTTTCAAGCTAGTTAGTAAAATTGTTGGTAGGAAAATCATAGTAAGGGATTCATACCGGTTTCATCATTTCCATGGTGGCAAGTGTTCTTGTTCAGATTATTGGTAG
Protein sequence

>MsG0080048779.01.T01

MYDRNDASWNNMISGFVRVGWYHKAMQFFCHMFENGVTPSSYVIASMVTACDRSGCMTEGARQIHGYVVKCGLMSNVFVGTSLLHFYGTHGSVSEANKLFEEIEEPNIVSWTSLMVCYADNGHTKEVLNIYRHLRHNGLICTGNTMATVIRTCGMFGDKTMGYQILGDVIKSGLDTSSVSVANSLISMFGNYDSVEEASCVFNNMKERDTISWNSIITASARNGRFEESLGHFFWMRRTHPKTDYITISALLPACGSAQHLKWGRGLHGLITKSGLESNVCVCNSLLSMYAQAGSSEDAEFVFHTMPERDLISWNSMMASHVEDGKYSHAILLLIEMLKTRKATNYVTFTTALSACYNLEKLKIVHAFVIHFGVHHNLIIGNTLVTMYGKFGLMDEAQKVCKIMPERDVVTWNALIGGHADDKDPNASIQAFNLMRREGLPSNYITIVNLLGACMSPDYLLKHGMPIHARIVVAGFELDTYVQSSLITMYAQCGDLNTSSYIFDVLANKNSSTWNAILSANAHYGPGEEALKFIARMRNDGVDLDQFSFSVALATIGNLTVLDEGQQLHSWIIKLGFELDEYVLNATMDMYGKCGEIDDVFRILPMPKIRSKRSWNILISALARHGFFRQATEAFDEMLDLGLRPDHVTFVSLLSACSHGGLVDEGRLAEAEAFIDKMPVPPNEFVWHSLLAACKIHGNLELGRKAADRLFELNSSDDSAYVLYSNVCASTQRWGDVENVRKQMESQSLKKKPACSWIKLKNKVMTFGMGDQFHPQSTQIYAKLEELRKMTREEGHMPDTSYALQDTDEEQKEHNLWNHSERIALAFGLINSAEGSPLRIFKNLRVCGDCHSVFKLVSKIVGRKIIVRDSYRFHHFHGGKCSCSDYW*