AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0080048750.01

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MsG0080048750.01.T01 AT1G53600 27.317 410 255 7 1 374 214 616 8.36e-37 147
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MsG0080048750.01.T01 AT2G26790 23.411 299 187 6 283 576 302 563 8.89e-12 68.9
MsG0080048750.01.T01 AT1G16830 22.478 347 225 10 279 617 88 398 2.14e-11 67.4
MsG0080048750.01.T01 AT3G13160 27.072 181 123 2 356 527 163 343 2.47e-11 66.6
MsG0080048750.01.T01 AT3G13160 20.677 266 200 4 103 358 112 376 2.70e-11 66.6
MsG0080048750.01.T01 AT3G13160 24.775 222 151 7 1 207 112 332 2.80e-11 66.2
MsG0080048750.01.T01 AT1G79490 21.939 392 281 7 188 563 132 514 3.79e-11 67.0
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MsG0080048750.01.T01 AT1G13630 22.998 487 246 13 119 584 178 556 5.87e-11 66.2
MsG0080048750.01.T01 AT5G46100 21.123 374 267 12 10 360 66 434 5.98e-11 65.9
MsG0080048750.01.T01 AT5G38730 22.785 395 258 13 129 503 82 449 5.99e-11 66.2
MsG0080048750.01.T01 AT5G38730 24.409 254 179 5 336 578 135 386 6.42e-11 65.9
MsG0080048750.01.T01 AT1G13630 22.998 487 246 13 119 584 225 603 6.11e-11 66.2
MsG0080048750.01.T01 AT1G13630 22.998 487 246 13 119 584 220 598 6.41e-11 66.2
MsG0080048750.01.T01 AT1G13630 22.998 487 246 13 119 584 212 590 6.78e-11 66.2

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CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CTTTGGAATTCTATGCTTTC+TGG 0.030226 contig418end:-6816 MsG0080048750.01.T01:CDS
TTGGATATGTATGTTAAATT+TGG 0.131913 contig418end:-7302 MsG0080048750.01.T01:CDS
TTCATGGAACACACTCATTC+TGG 0.216509 contig418end:-7225 MsG0080048750.01.T01:CDS
CCAAATAAAATCACCATTCT+AGG 0.249971 contig418end:-6117 MsG0080048750.01.T01:CDS
ACCATACAATTGTAATGTTC+TGG 0.262803 contig418end:+6003 MsG0080048750.01.T01:intergenic
GTATTCGAGTTTCAAGTTAT+TGG 0.267308 contig418end:-6901 MsG0080048750.01.T01:CDS
GTCTCTGCATTCACTAATTC+TGG 0.287134 contig418end:-7515 MsG0080048750.01.T01:CDS
GCTTGGTCGAGTTTGATTAC+TGG 0.301875 contig418end:-6513 MsG0080048750.01.T01:CDS
TTTCATGAATATGATTCATT+TGG 0.308799 contig418end:-6451 MsG0080048750.01.T01:CDS
CATTGATCTATATGCAAAAC+AGG 0.309737 contig418end:-6592 MsG0080048750.01.T01:CDS
CATGCTATACAAGGTCTAAT+TGG 0.314373 contig418end:-5239 MsG0080048750.01.T01:CDS
CGACTTTGATAACTTGAGTT+TGG 0.314955 contig418end:-6682 MsG0080048750.01.T01:CDS
TATTCGAGTTTCAAGTTATT+GGG 0.315013 contig418end:-6900 MsG0080048750.01.T01:CDS
ATTTCTCATATGCATCATTC+TGG 0.317924 contig418end:-6753 MsG0080048750.01.T01:CDS
GCATGCGAAGGGCCTTAAAA+TGG 0.320470 contig418end:-7060 MsG0080048750.01.T01:CDS
TGGATATGTATGTTAAATTT+GGG 0.334827 contig418end:-7301 MsG0080048750.01.T01:CDS
GCTAAAAGCTTGCTCAAGTT+TGG 0.348952 contig418end:-6394 MsG0080048750.01.T01:CDS
CTCACAGGAACATAGTTTCT+TGG 0.351236 contig418end:-7547 MsG0080048750.01.T01:CDS
TGCAGTGATGAATTAATGTT+AGG 0.353079 contig418end:-6999 MsG0080048750.01.T01:CDS
CATGTGAAGGTTCTACTTCA+TGG 0.361932 contig418end:-5279 MsG0080048750.01.T01:intron
CATTGTTATATTATTAAGTC+AGG 0.365761 contig418end:-6966 MsG0080048750.01.T01:CDS
CTGTTCCAAGATACAATATC+TGG 0.367833 contig418end:+7143 MsG0080048750.01.T01:intergenic
TATGAGTTAGATTGTGTTGT+TGG 0.370560 contig418end:-6624 MsG0080048750.01.T01:CDS
TTCATGAATATGATTCATTT+GGG 0.372209 contig418end:-6450 MsG0080048750.01.T01:CDS
TAGGTGTTCTCACTGCTTGT+AGG 0.373861 contig418end:-6098 MsG0080048750.01.T01:CDS
GAGGATGCCTTATCTTTGTT+TGG 0.376022 contig418end:-6258 MsG0080048750.01.T01:CDS
CTCTTCTATTTCTGAAAGCT+TGG 0.383426 contig418end:-6841 MsG0080048750.01.T01:CDS
TTTCTGAAAGCTTGGCGCTT+TGG 0.387607 contig418end:-6833 MsG0080048750.01.T01:CDS
GAAACTGATTTATCCAATAC+TGG 0.395976 contig418end:-5207 MsG0080048750.01.T01:CDS
TGTGAGGCATTTCGTCGAAT+AGG 0.399671 contig418end:+7564 MsG0080048750.01.T01:intergenic
TCATATATTTCAATCTAAGT+TGG 0.401399 contig418end:-7354 MsG0080048750.01.T01:CDS
TTTGGAATTCTATGCTTTCT+GGG 0.401805 contig418end:-6815 MsG0080048750.01.T01:CDS
TCTTGTGGGAAATGTTGAAT+TGG 0.403649 contig418end:-7393 MsG0080048750.01.T01:CDS
CAAGCCACAACATCTTTATC+TGG 0.406007 contig418end:+6531 MsG0080048750.01.T01:intergenic
ATGTATACAGAAACATCTTC+TGG 0.407648 contig418end:+5814 MsG0080048750.01.T01:intergenic
AATGAATCATATTCATGAAA+AGG 0.410727 contig418end:+6454 MsG0080048750.01.T01:intergenic
CCCAGAACATTACAATTGTA+TGG 0.415435 contig418end:-6004 MsG0080048750.01.T01:CDS
CTTCATGGAAGCCTTCATAC+TGG 0.418659 contig418end:-5264 MsG0080048750.01.T01:CDS
TCAAATGTTTATGCAGCTCT+TGG 0.419743 contig418end:-5784 MsG0080048750.01.T01:CDS
GTCTAGCTGTTATTGTATAT+CGG 0.421645 contig418end:-6937 MsG0080048750.01.T01:CDS
AATTCTATTGAAACAAATCA+TGG 0.427097 contig418end:-6039 MsG0080048750.01.T01:CDS
ACTATATGGTCTTCCTTGCT+TGG 0.430207 contig418end:-5904 MsG0080048750.01.T01:CDS
CTCACTGCTTGTAGGCATGC+TGG 0.439070 contig418end:-6090 MsG0080048750.01.T01:CDS
TCATGGAACACACTCATTCT+GGG 0.442629 contig418end:-7224 MsG0080048750.01.T01:CDS
ATGAGTTAGATTGTGTTGTT+GGG 0.442901 contig418end:-6623 MsG0080048750.01.T01:CDS
AGTCTCTACAATGAGATGAT+TGG 0.445071 contig418end:-7473 MsG0080048750.01.T01:CDS
TTAAGCCCGACAAAACTATA+TGG 0.445211 contig418end:-5918 MsG0080048750.01.T01:CDS
CTCAAAGCGTGCGGTCTTGT+GGG 0.445854 contig418end:-7407 MsG0080048750.01.T01:CDS
TCTTGGAACAGCATCATTGC+TGG 0.446841 contig418end:-7131 MsG0080048750.01.T01:CDS
CCATACAATTGTAATGTTCT+GGG 0.449255 contig418end:+6004 MsG0080048750.01.T01:intergenic
TCATTCTTTATGTCTTAAGA+AGG 0.449258 contig418end:-6346 MsG0080048750.01.T01:CDS
AATTGTATGGTCGATATACT+TGG 0.449350 contig418end:-5991 MsG0080048750.01.T01:CDS
GAGCTTGAGGGATGCTCGAC+AGG 0.451062 contig418end:-7279 MsG0080048750.01.T01:CDS
ATGATGTTGTTCCAAGATAC+AGG 0.454528 contig418end:+5176 MsG0080048750.01.T01:intergenic
GCAGAGTATAAGAACTGATT+CGG 0.455071 contig418end:+7434 MsG0080048750.01.T01:intergenic
TCTTGGAACAACATCATTGC+TGG 0.457070 contig418end:-5170 MsG0080048750.01.T01:CDS
ATTTAACATACATATCCAAA+AGG 0.457551 contig418end:+7306 MsG0080048750.01.T01:intergenic
CCGCAAGCTTTGATCACACT+TGG 0.457803 contig418end:+7023 MsG0080048750.01.T01:intergenic
TGGAGCAAGATCCTGTATCT+TGG 0.460292 contig418end:-5187 MsG0080048750.01.T01:CDS
ATGAATCATATTCATGAAAA+GGG 0.461766 contig418end:+6455 MsG0080048750.01.T01:intergenic
TGTAGAGACTAAGAGCTTCA+TGG 0.462419 contig418end:+7486 MsG0080048750.01.T01:intergenic
TCTCAAAGCGTGCGGTCTTG+TGG 0.462910 contig418end:-7408 MsG0080048750.01.T01:CDS
CTTTCTGGGTATGTTGTCAA+TGG 0.471809 contig418end:-6801 MsG0080048750.01.T01:CDS
AAGAGCTAACTTATCTGAAC+CGG 0.473530 contig418end:+6479 MsG0080048750.01.T01:intergenic
ATTACTGGTTGTGCTAGATC+CGG 0.475010 contig418end:-6498 MsG0080048750.01.T01:CDS
ACAGGATCTTGCTCCAGTAT+TGG 0.483248 contig418end:+5194 MsG0080048750.01.T01:intergenic
GTAGAGACTAAGAGCTTCAT+GGG 0.487447 contig418end:+7487 MsG0080048750.01.T01:intergenic
CATTCTTTATGTCTTAAGAA+GGG 0.488174 contig418end:-6345 MsG0080048750.01.T01:CDS
AAATGTTGAATTGGGAAAGA+TGG 0.495398 contig418end:-7384 MsG0080048750.01.T01:CDS
CTGCATAAGATGATAGAGTC+TGG 0.503395 contig418end:-6147 MsG0080048750.01.T01:CDS
GCAGTGATGAATTAATGTTA+GGG 0.504863 contig418end:-6998 MsG0080048750.01.T01:CDS
TCTGTTCTTGTAAGTTCCAC+AGG 0.504892 contig418end:+5879 MsG0080048750.01.T01:intergenic
GTCGATATACTTGGTCAAGC+AGG 0.506259 contig418end:-5982 MsG0080048750.01.T01:CDS
CGAAAATTGATACCATGAGT+TGG 0.506539 contig418end:-6227 MsG0080048750.01.T01:CDS
ATGTTAAATTTGGGAGCTTG+AGG 0.509858 contig418end:-7292 MsG0080048750.01.T01:CDS
TCTTCCTTGCTTGGTGCCTG+TGG 0.514021 contig418end:-5895 MsG0080048750.01.T01:CDS
CATCCCATGCCTCTTCAACT+AGG 0.520912 contig418end:+6067 MsG0080048750.01.T01:intergenic
CGGAGCCAGATATTGTATCT+TGG 0.523667 contig418end:-7148 MsG0080048750.01.T01:CDS
CTGGCCTAGTTGAAGAGGCA+TGG 0.525558 contig418end:-6071 MsG0080048750.01.T01:CDS
TATAGCATGTCCCAGTATGA+AGG 0.534499 contig418end:+5253 MsG0080048750.01.T01:intergenic
CAAGATACAATATCTGGCTC+CGG 0.534669 contig418end:+7149 MsG0080048750.01.T01:intergenic
AGCAGTGAGAACACCTAGAA+TGG 0.535392 contig418end:+6104 MsG0080048750.01.T01:intergenic
GATCTTTAAAATAGTACTGA+AGG 0.536922 contig418end:+6710 MsG0080048750.01.T01:intergenic
AGTTTGGCATCTCAAGTGCA+TGG 0.538469 contig418end:-6666 MsG0080048750.01.T01:CDS
CTTGTGGGAAATGTTGAATT+GGG 0.539548 contig418end:-7392 MsG0080048750.01.T01:CDS
CAACATCATTGCTGGTCTTG+CGG 0.540783 contig418end:-5162 MsG0080048750.01.T01:CDS
GGCATCTCAAGTGCATGGAT+TGG 0.542884 contig418end:-6661 MsG0080048750.01.T01:CDS
TAAGAAGGGGTATGAATCAG+AGG 0.546718 contig418end:-6331 MsG0080048750.01.T01:CDS
AAGACAACCAAACAAAGATA+AGG 0.547261 contig418end:+6251 MsG0080048750.01.T01:intergenic
ATGCGTTAAGATTGTTTGAG+AGG 0.548771 contig418end:-6557 MsG0080048750.01.T01:CDS
ATTCTTTATGTCTTAAGAAG+GGG 0.552111 contig418end:-6344 MsG0080048750.01.T01:CDS
TTTAACATACATATCCAAAA+GGG 0.557915 contig418end:+7307 MsG0080048750.01.T01:intergenic
ATCGTGGGATGTGCACAAAA+CGG 0.558722 contig418end:-6195 MsG0080048750.01.T01:CDS
TGTTAAATTTGGGAGCTTGA+GGG 0.561192 contig418end:-7291 MsG0080048750.01.T01:CDS
GAAACTGTTTGATAAAATGC+CGG 0.567576 contig418end:-7168 MsG0080048750.01.T01:CDS
GCTATACAAGGTCTAATTGG+TGG 0.569898 contig418end:-5236 MsG0080048750.01.T01:CDS
TTCATGGAAGCCTTCATACT+GGG 0.571285 contig418end:-5263 MsG0080048750.01.T01:CDS
CAATTGTAATGTTCTGGGCA+AGG 0.573208 contig418end:+6009 MsG0080048750.01.T01:intergenic
ATTGTTATATTATTAAGTCA+GGG 0.574869 contig418end:-6965 MsG0080048750.01.T01:CDS
TGAGGTAGCAACGAGATGCT+CGG 0.576670 contig418end:+5837 MsG0080048750.01.T01:intergenic
AGTTCCACAGGCACCAAGCA+AGG 0.579539 contig418end:+5891 MsG0080048750.01.T01:intergenic
TATTCGACGAAATGCCTCAC+AGG 0.582598 contig418end:-7562 MsG0080048750.01.T01:CDS
CGCAAGCTTTGATCACACTT+GGG 0.582698 contig418end:+7024 MsG0080048750.01.T01:intergenic
GTTGCCAGATAAAGATGTTG+TGG 0.584829 contig418end:-6535 MsG0080048750.01.T01:CDS
GCATGCTGGCCTAGTTGAAG+AGG 0.585959 contig418end:-6076 MsG0080048750.01.T01:CDS
CATAGTTTCTTGGACTACAA+TGG 0.587131 contig418end:-7537 MsG0080048750.01.T01:CDS
GATAATACTTGTCCAACTCA+TGG 0.593999 contig418end:+6215 MsG0080048750.01.T01:intergenic
CAGATAAAGATGTTGTGGCT+TGG 0.594502 contig418end:-6530 MsG0080048750.01.T01:CDS
CAGTGATGAATTAATGTTAG+GGG 0.601148 contig418end:-6997 MsG0080048750.01.T01:CDS
GCGGATAATGCTAGTCCACA+TGG 0.608066 contig418end:-5143 MsG0080048750.01.T01:CDS
CATGGATTGGTCATCACTAG+TGG 0.611972 contig418end:-6648 MsG0080048750.01.T01:CDS
TGGCCTAGTTGAAGAGGCAT+GGG 0.613802 contig418end:-6070 MsG0080048750.01.T01:CDS
GTTGCTGTGATGCATGCGAA+GGG 0.616418 contig418end:-7071 MsG0080048750.01.T01:CDS
TGTTGCTGTGATGCATGCGA+AGG 0.617137 contig418end:-7072 MsG0080048750.01.T01:CDS
GAGTTGGACAAGTATTATCG+TGG 0.618523 contig418end:-6211 MsG0080048750.01.T01:CDS
ATACTGGGACATGCTATACA+AGG 0.622494 contig418end:-5248 MsG0080048750.01.T01:CDS
AGTGATGAATTAATGTTAGG+GGG 0.632451 contig418end:-6996 MsG0080048750.01.T01:CDS
AGTTGGACAAGTATTATCGT+GGG 0.634144 contig418end:-6210 MsG0080048750.01.T01:CDS
TACAGAAACATCTTCTGGTG+AGG 0.634824 contig418end:+5819 MsG0080048750.01.T01:intergenic
CCAAGTGTGATCAAAGCTTG+CGG 0.636520 contig418end:-7023 MsG0080048750.01.T01:CDS
AAGAAGGGGTATGAATCAGA+GGG 0.638109 contig418end:-6330 MsG0080048750.01.T01:CDS
CATGGAACACACTCATTCTG+GGG 0.653037 contig418end:-7223 MsG0080048750.01.T01:CDS
ATTCTGGGGTATGCAAAACA+AGG 0.659094 contig418end:-7209 MsG0080048750.01.T01:CDS
GAAACAAATTGCATTCCATG+TGG 0.666728 contig418end:+5128 MsG0080048750.01.T01:intergenic
ATTGATATGTATGCAAAATG+TGG 0.679160 contig418end:-6288 MsG0080048750.01.T01:CDS
AGTTTGGCATCTCATCAACA+TGG 0.688194 contig418end:-6378 MsG0080048750.01.T01:CDS
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CRISPR-GE

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AATTGTATGGTCGATATACT+TGG - contig418end:6744-6763 MsG0080048750.01.T01:CDS 30.0%
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TTAAGCCCGACAAAACTATA+TGG - contig418end:6817-6836 MsG0080048750.01.T01:CDS 35.0%
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! GAAAGGCAATCTTCATGTTT+TGG - contig418end:7173-7192 MsG0080048750.01.T01:CDS 35.0%
!! CTCTTCTATTTCTGAAAGCT+TGG - contig418end:5894-5913 MsG0080048750.01.T01:CDS 35.0%
!! CTTTGGAATTCTATGCTTTC+TGG - contig418end:5919-5938 MsG0080048750.01.T01:CDS 35.0%
!! TTCTTTGAAATCCCATGTGA+AGG - contig418end:7443-7462 MsG0080048750.01.T01:CDS 35.0%
!!! ATAGTTTTGTCGGGCTTAAA+TGG + contig418end:6816-6835 MsG0080048750.01.T01:intergenic 35.0%
!!! CAATCTTCATGTTTTGGTGA+TGG - contig418end:7179-7198 MsG0080048750.01.T01:CDS 35.0%
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!!! GGAAGACCATATAGTTTTGT+CGG + contig418end:6826-6845 MsG0080048750.01.T01:intergenic 35.0%
AAAAAGGAGCTGGAAAAAGC+TGG - contig418end:7024-7043 MsG0080048750.01.T01:CDS 40.0%
AAAATCGGCAAAAAAGGAGC+TGG - contig418end:7014-7033 MsG0080048750.01.T01:CDS 40.0%
ACTATATGGTCTTCCTTGCT+TGG - contig418end:6831-6850 MsG0080048750.01.T01:CDS 40.0%
AGAATAATCAGTGCCTCATC+TGG + contig418end:7114-7133 MsG0080048750.01.T01:intergenic 40.0%
AGCTTGTACATTGTAATGCC+TGG - contig418end:7322-7341 MsG0080048750.01.T01:CDS 40.0%
AGTTTGGCATCTCATCAACA+TGG - contig418end:6357-6376 MsG0080048750.01.T01:CDS 40.0%
ATACTGGGACATGCTATACA+AGG - contig418end:7487-7506 MsG0080048750.01.T01:CDS 40.0%
CAAGAAACTATGTTCCTGTG+AGG + contig418end:5190-5209 MsG0080048750.01.T01:intergenic 40.0%
CAAGCCACAACATCTTTATC+TGG + contig418end:6207-6226 MsG0080048750.01.T01:intergenic 40.0%
CAGATAAAGATGTTGTGGCT+TGG - contig418end:6205-6224 MsG0080048750.01.T01:CDS 40.0%
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CATGTGAAGGTTCTACTTCA+TGG - contig418end:7456-7475 MsG0080048750.01.T01:CDS 40.0%
CATTTGATCATCGTGGAGTA+GGG + contig418end:7412-7431 MsG0080048750.01.T01:intergenic 40.0%
CTCACAGGAACATAGTTTCT+TGG - contig418end:5188-5207 MsG0080048750.01.T01:CDS 40.0%
CTGCATAAGATGATAGAGTC+TGG - contig418end:6588-6607 MsG0080048750.01.T01:CDS 40.0%
CTTTCTGGGTATGTTGTCAA+TGG - contig418end:5934-5953 MsG0080048750.01.T01:CDS 40.0%
GAGGATGCCTTATCTTTGTT+TGG - contig418end:6477-6496 MsG0080048750.01.T01:CDS 40.0%
GAGTTGGACAAGTATTATCG+TGG - contig418end:6524-6543 MsG0080048750.01.T01:CDS 40.0%
GCTATACAAGGTCTAATTGG+TGG - contig418end:7499-7518 MsG0080048750.01.T01:CDS 40.0%
GTAGAGACTAAGAGCTTCAT+GGG + contig418end:5251-5270 MsG0080048750.01.T01:intergenic 40.0%
GTCTCTGCATTCACTAATTC+TGG - contig418end:5220-5239 MsG0080048750.01.T01:CDS 40.0%
GTTGCCAGATAAAGATGTTG+TGG - contig418end:6200-6219 MsG0080048750.01.T01:CDS 40.0%
TACAGAAACATCTTCTGGTG+AGG + contig418end:6919-6938 MsG0080048750.01.T01:intergenic 40.0%
TAGAGACTAAGAGCTTCATG+GGG + contig418end:5250-5269 MsG0080048750.01.T01:intergenic 40.0%
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TCATGGAACACACTCATTCT+GGG - contig418end:5511-5530 MsG0080048750.01.T01:intron 40.0%
TCATTTGATCATCGTGGAGT+AGG + contig418end:7413-7432 MsG0080048750.01.T01:intergenic 40.0%
TCTGTTCTTGTAAGTTCCAC+AGG + contig418end:6859-6878 MsG0080048750.01.T01:intergenic 40.0%
TCTTGGAACAACATCATTGC+TGG - contig418end:7565-7584 MsG0080048750.01.T01:CDS 40.0%
TGTAGAGACTAAGAGCTTCA+TGG + contig418end:5252-5271 MsG0080048750.01.T01:intergenic 40.0%
TTATGCAGCTCTTGGAATGT+GGG - contig418end:6959-6978 MsG0080048750.01.T01:CDS 40.0%
TTCATGGAACACACTCATTC+TGG - contig418end:5510-5529 MsG0080048750.01.T01:intron 40.0%
TTCATGGAAGCCTTCATACT+GGG - contig418end:7472-7491 MsG0080048750.01.T01:CDS 40.0%
TTTATGCAGCTCTTGGAATG+TGG - contig418end:6958-6977 MsG0080048750.01.T01:CDS 40.0%
! AAGAAGGGGTATGAATCAGA+GGG - contig418end:6405-6424 MsG0080048750.01.T01:CDS 40.0%
! ATTACTGGTTGTGCTAGATC+CGG - contig418end:6237-6256 MsG0080048750.01.T01:CDS 40.0%
! CAAGATACAATATCTGGCTC+CGG + contig418end:5589-5608 MsG0080048750.01.T01:intergenic 40.0%
! CAATTGTAATGTTCTGGGCA+AGG + contig418end:6729-6748 MsG0080048750.01.T01:intergenic 40.0%
! CGCGTAAAAATGCTACTTCA+TGG - contig418end:5494-5513 MsG0080048750.01.T01:intron 40.0%
! GCTAAAAGCTTGCTCAAGTT+TGG - contig418end:6341-6360 MsG0080048750.01.T01:CDS 40.0%
! TAAGAAGGGGTATGAATCAG+AGG - contig418end:6404-6423 MsG0080048750.01.T01:CDS 40.0%
!! AGATCTCAAGTTGAGAATGC+TGG - contig418end:7051-7070 MsG0080048750.01.T01:CDS 40.0%
!! ATTCTGGGGTATGCAAAACA+AGG - contig418end:5526-5545 MsG0080048750.01.T01:intron 40.0%
ACAGGATCTTGCTCCAGTAT+TGG + contig418end:7544-7563 MsG0080048750.01.T01:intergenic 45.0%
ACCTTATGGCAATAGCAACC+AGG + contig418end:7343-7362 MsG0080048750.01.T01:intergenic 45.0%
AGCAGTGAGAACACCTAGAA+TGG + contig418end:6634-6653 MsG0080048750.01.T01:intergenic 45.0%
AGTTTGGCATCTCAAGTGCA+TGG - contig418end:6069-6088 MsG0080048750.01.T01:CDS 45.0%
ATCGTGGGATGTGCACAAAA+CGG - contig418end:6540-6559 MsG0080048750.01.T01:CDS 45.0%
CATGGAACACACTCATTCTG+GGG - contig418end:5512-5531 MsG0080048750.01.T01:intron 45.0%
CCAAGTGTGATCAAAGCTTG+CGG - contig418end:5712-5731 MsG0080048750.01.T01:intron 45.0%
CGGAGCCAGATATTGTATCT+TGG - contig418end:5587-5606 MsG0080048750.01.T01:intron 45.0%
CTTCATGGAAGCCTTCATAC+TGG - contig418end:7471-7490 MsG0080048750.01.T01:CDS 45.0%
GCTTGGTCGAGTTTGATTAC+TGG - contig418end:6222-6241 MsG0080048750.01.T01:CDS 45.0%
GTCGATATACTTGGTCAAGC+AGG - contig418end:6753-6772 MsG0080048750.01.T01:CDS 45.0%
TAGGTGTTCTCACTGCTTGT+AGG - contig418end:6637-6656 MsG0080048750.01.T01:CDS 45.0%
TATTCGACGAAATGCCTCAC+AGG - contig418end:5173-5192 MsG0080048750.01.T01:CDS 45.0%
TCTTGGAACAGCATCATTGC+TGG - contig418end:5604-5623 MsG0080048750.01.T01:intron 45.0%
TGCAAAATGTGGTGACATCG+AGG - contig418end:6458-6477 MsG0080048750.01.T01:CDS 45.0%
TGGAGCAAGATCCTGTATCT+TGG - contig418end:7548-7567 MsG0080048750.01.T01:CDS 45.0%
! CGCAAGCTTTGATCACACTT+GGG + contig418end:5714-5733 MsG0080048750.01.T01:intergenic 45.0%
! TGTGAGGCATTTCGTCGAAT+AGG + contig418end:5174-5193 MsG0080048750.01.T01:intergenic 45.0%
! TTTCTGAAAGCTTGGCGCTT+TGG - contig418end:5902-5921 MsG0080048750.01.T01:CDS 45.0%
!! CAACATCATTGCTGGTCTTG+CGG - contig418end:7573-7592 MsG0080048750.01.T01:CDS 45.0%
!! CATGGATTGGTCATCACTAG+TGG - contig418end:6087-6106 MsG0080048750.01.T01:CDS 45.0%
CATCCCATGCCTCTTCAACT+AGG + contig418end:6671-6690 MsG0080048750.01.T01:intergenic 50.0%
GCATGCGAAGGGCCTTAAAA+TGG - contig418end:5675-5694 MsG0080048750.01.T01:intron 50.0%
GCGGATAATGCTAGTCCACA+TGG - contig418end:7592-7611 MsG0080048750.01.T01:CDS 50.0%
GGCATCTCAAGTGCATGGAT+TGG - contig418end:6074-6093 MsG0080048750.01.T01:CDS 50.0%
GTTGCTGTGATGCATGCGAA+GGG - contig418end:5664-5683 MsG0080048750.01.T01:intron 50.0%
TCTGCAGTTCTCAAAGCGTG+CGG - contig418end:5319-5338 MsG0080048750.01.T01:intron 50.0%
TGAGGTAGCAACGAGATGCT+CGG + contig418end:6901-6920 MsG0080048750.01.T01:intergenic 50.0%
TGTTGCTGTGATGCATGCGA+AGG - contig418end:5663-5682 MsG0080048750.01.T01:intron 50.0%
TTGATCATCGTGGAGTAGGG+AGG + contig418end:7409-7428 MsG0080048750.01.T01:intergenic 50.0%
! CCGCAAGCTTTGATCACACT+TGG + contig418end:5715-5734 MsG0080048750.01.T01:intergenic 50.0%
! GCCTGGTTGCTATTGCCATA+AGG - contig418end:7339-7358 MsG0080048750.01.T01:CDS 50.0%
! TGGCCTAGTTGAAGAGGCAT+GGG - contig418end:6665-6684 MsG0080048750.01.T01:CDS 50.0%
AGTTCCACAGGCACCAAGCA+AGG + contig418end:6847-6866 MsG0080048750.01.T01:intergenic 55.0%
CTCACTGCTTGTAGGCATGC+TGG - contig418end:6645-6664 MsG0080048750.01.T01:CDS 55.0%
CTGGCCTAGTTGAAGAGGCA+TGG - contig418end:6664-6683 MsG0080048750.01.T01:CDS 55.0%
TCTCAAAGCGTGCGGTCTTG+TGG - contig418end:5327-5346 MsG0080048750.01.T01:intron 55.0%
! CTCAAAGCGTGCGGTCTTGT+GGG - contig418end:5328-5347 MsG0080048750.01.T01:intron 55.0%
! GCATGCTGGCCTAGTTGAAG+AGG - contig418end:6659-6678 MsG0080048750.01.T01:CDS 55.0%
!! TCTTCCTTGCTTGGTGCCTG+TGG - contig418end:6840-6859 MsG0080048750.01.T01:CDS 55.0%
GAGCTTGAGGGATGCTCGAC+AGG - contig418end:5456-5475 MsG0080048750.01.T01:intron 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
contig418end gene 5124 7633 5124 ID=MsG0080048750.01;Name=MsG0080048750.01
contig418end mRNA 5124 7633 5124 ID=MsG0080048750.01.T01;Parent=MsG0080048750.01;Name=MsG0080048750.01.T01;_AED=0.06;_eAED=0.06;_QI=0|0|0|1|1|1|2|0|673
contig418end exon 5781 7633 5781 ID=MsG0080048750.01.T01:exon:7887;Parent=MsG0080048750.01.T01
contig418end exon 5124 5292 5124 ID=MsG0080048750.01.T01:exon:7888;Parent=MsG0080048750.01.T01
contig418end CDS 5781 7633 5781 ID=MsG0080048750.01.T01:cds;Parent=MsG0080048750.01.T01
contig418end CDS 5124 5292 5124 ID=MsG0080048750.01.T01:cds;Parent=MsG0080048750.01.T01
Gene Sequence

>MsG0080048750.01.T01

ATGATCTCAGTTTATGCAAAATGTTGTAGTTTCAATGATGCACGTAACCTATTCGACGAAATGCCTCACAGGAACATAGTTTCTTGGACTACAATGGTCTCTGCATTCACTAATTCTGGCATGCCCCATGAAGCTCTTAGTCTCTACAATGAGATGATTGGATCAAAAATTGAACAGCCGAATCAGTTCTTATACTCTGCAGTTCTCAAAGCGTGCGGTCTTGTGGGAAATGTTGAATTGGGAAAGATGGTTCATTATCATATATTTCAATCTAAGTTGGATGTTGATATTGTTTTAATGAATGCCCTTTTGGATATGTATGTTAAATTTGGGAGCTTGAGGGATGCTCGACAGGTTTTCTGTGATATTCCGCGTAAAAATGCTACTTCATGGAACACACTCATTCTGGGGTATGCAAAACAAGGTTTGATTGATGATGCGATGAAACTGTTTGATAAAATGCCGGAGCCAGATATTGTATCTTGGAACAGCATCATTGCTGGTCTTGTAGATAATGCTAGTTCATGTGCGTTGCAATTTGTTGCTGTGATGCATGCGAAGGGCCTTAAAATGGACGAATTCACATTCCCAAGTGTGATCAAAGCTTGCGGTTGCAGTGATGAATTAATGTTAGGGGGAGAGATTCATTGTTATATTATTAAGTCAGGGTTTGAGTCTAGCTGTTATTGTATATCGGCGTTGATTGATATGTATTCGAGTTTCAAGTTATTGGGTGAAGCAACAAAGATTTTTGATCAATACTTCAGGAACTCTTCTATTTCTGAAAGCTTGGCGCTTTGGAATTCTATGCTTTCTGGGTATGTTGTCAATGGAGATTATGTTGAGGCTCTCAGTATGATTTCTCATATGCATCATTCTGGTGTACGTTTTGATTTTTATACCTTCAGTACTATTTTAAAGATCTGCATCGACTTTGATAACTTGAGTTTGGCATCTCAAGTGCATGGATTGGTCATCACTAGTGGCTATGAGTTAGATTGTGTTGTTGGGAGCATTCTCATTGATCTATATGCAAAACAGGGCAGTATTAACAATGCGTTAAGATTGTTTGAGAGGTTGCCAGATAAAGATGTTGTGGCTTGGTCGAGTTTGATTACTGGTTGTGCTAGATCCGGTTCAGATAAGTTAGCTCTTTCCCTTTTCATGAATATGATTCATTTGGGTCTTCAGATTGATCATTATGTTATTTCAATTGTGCTAAAAGCTTGCTCAAGTTTGGCATCTCATCAACATGGCAAGCAAGTTCATTCTTTATGTCTTAAGAAGGGGTATGAATCAGAGGGAGTAATTACAACTGCTCTGATTGATATGTATGCAAAATGTGGTGACATCGAGGATGCCTTATCTTTGTTTGGTTGTCTTTCGAAAATTGATACCATGAGTTGGACAAGTATTATCGTGGGATGTGCACAAAACGGAAGAGCAGATGAAGCAATAAGTCTTCTGCATAAGATGATAGAGTCTGGTACAAAGCCAAATAAAATCACCATTCTAGGTGTTCTCACTGCTTGTAGGCATGCTGGCCTAGTTGAAGAGGCATGGGATGTGTTTAATTCTATTGAAACAAATCATGGATTGATACCTTGCCCAGAACATTACAATTGTATGGTCGATATACTTGGTCAAGCAGGACGTTTTGAAGAAGCAGTAAAATTGATTAGTGAAATGCCATTTAAGCCCGACAAAACTATATGGTCTTCCTTGCTTGGTGCCTGTGGAACTTACAAGAACAGACATCTTGCAAATATTGTTGCCGAGCATCTCGTTGCTACCTCACCAGAAGATGTTTCTGTATACATAATGCTGTCAAATGTTTATGCAGCTCTTGGAATGTTCTACTTCATGGAAGCCTTCATACTGGGACATGCTATACAAGGTCTAATTGGTGGAGTGATGAAACTGATTTATCCAATACTGGAGCAAGATCCTGTATCTTGGAACAACATCATTGCTGGTCTTGCGGATAATGCTAGTCCACATGGAATGCAATTTGTTTCATGA
Protein sequence

>MsG0080048750.01.T01

MISVYAKCCSFNDARNLFDEMPHRNIVSWTTMVSAFTNSGMPHEALSLYNEMIGSKIEQPNQFLYSAVLKACGLVGNVELGKMVHYHIFQSKLDVDIVLMNALLDMYVKFGSLRDARQVFCDIPRKNATSWNTLILGYAKQGLIDDAMKLFDKMPEPDIVSWNSIIAGLVDNASSCALQFVAVMHAKGLKMDEFTFPSVIKACGCSDELMLGGEIHCYIIKSGFESSCYCISALIDMYSSFKLLGEATKIFDQYFRNSSISESLALWNSMLSGYVVNGDYVEALSMISHMHHSGVRFDFYTFSTILKICIDFDNLSLASQVHGLVITSGYELDCVVGSILIDLYAKQGSINNALRLFERLPDKDVVAWSSLITGCARSGSDKLALSLFMNMIHLGLQIDHYVISIVLKACSSLASHQHGKQVHSLCLKKGYESEGVITTALIDMYAKCGDIEDALSLFGCLSKIDTMSWTSIIVGCAQNGRADEAISLLHKMIESGTKPNKITILGVLTACRHAGLVEEAWDVFNSIETNHGLIPCPEHYNCMVDILGQAGRFEEAVKLISEMPFKPDKTIWSSLLGACGTYKNRHLANIVAEHLVATSPEDVSVYIMLSNVYAALGMFYFMEAFILGHAIQGLIGGVMKLIYPILEQDPVSWNNIIAGLADNASPHGMQFVS*