AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880043308.01

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MsG0880043308.01.T01 AT2G03380 33.013 312 201 4 129 439 50 354 7.72e-41 158
MsG0880043308.01.T01 AT2G03380 24.342 304 196 6 246 516 61 363 1.17e-18 90.5
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MsG0880043308.01.T01 AT3G22690 29.032 217 149 3 246 457 49 265 9.26e-21 97.4
MsG0880043308.01.T01 AT3G02330 31.518 606 385 6 20 604 285 881 2.77e-101 328
MsG0880043308.01.T01 AT3G02330 28.794 514 332 7 3 486 30 539 5.05e-57 207
MsG0880043308.01.T01 AT3G02330 27.865 445 274 7 80 490 12 443 1.83e-37 149
MsG0880043308.01.T01 AT4G14850 31.980 591 387 5 17 604 11 589 2.82e-101 322
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MsG0880043308.01.T01 AT5G39350 29.243 489 323 7 32 511 31 505 5.96e-51 187
MsG0880043308.01.T01 AT5G39350 24.889 225 152 3 19 239 329 540 9.65e-18 87.8
MsG0880043308.01.T01 AT3G49142 33.213 554 329 3 52 605 75 587 3.43e-101 322
MsG0880043308.01.T01 AT3G49142 26.510 298 206 6 246 538 59 348 3.17e-20 95.5
MsG0880043308.01.T01 AT3G25970 32.075 583 380 7 35 609 120 694 7.41e-101 322
MsG0880043308.01.T01 AT3G25970 28.953 449 306 8 39 483 23 462 9.25e-50 184
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MsG0880043308.01.T01 AT5G09950 26.025 488 337 8 30 505 15 490 9.75e-43 165
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MsG0880043308.01.T01 AT2G40720 27.708 480 314 11 32 493 76 540 2.70e-41 160
MsG0880043308.01.T01 AT2G40720 29.262 393 265 6 125 507 62 451 1.39e-38 152
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MsG0880043308.01.T01 AT3G18840 28.741 675 382 10 32 609 4 676 1.78e-87 286
MsG0880043308.01.T01 AT2G37310 29.228 609 394 4 37 610 43 649 2.20e-87 285
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MsG0880043308.01.T01 AT2G37310 26.161 409 256 7 35 407 151 549 1.46e-38 151
MsG0880043308.01.T01 AT2G37310 23.052 308 192 6 35 307 253 550 6.14e-18 88.2
MsG0880043308.01.T01 AT3G22690 30.718 599 343 6 22 587 140 699 7.86e-87 288
MsG0880043308.01.T01 AT3G22690 28.155 412 256 7 111 487 122 528 3.50e-40 157
MsG0880043308.01.T01 AT4G21065 36.264 364 231 1 244 606 6 369 1.32e-86 278
MsG0880043308.01.T01 AT4G21065 29.242 277 183 5 138 407 3 273 2.99e-37 144
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MsG0880043308.01.T01 AT1G13410 30.244 205 134 4 30 231 99 297 2.56e-19 91.7
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MsG0880043308.01.T01 AT1G05670 24.910 277 199 4 291 559 280 555 2.55e-14 77.0
MsG0880043308.01.T01 AT1G05670 23.060 464 321 12 30 471 189 638 2.13e-18 89.7
MsG0880043308.01.T01 AT1G05670 24.910 277 199 4 291 559 280 555 2.55e-14 77.0
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MsG0880043308.01.T01 AT1G63150 21.823 417 305 8 102 503 132 542 9.62e-12 68.6
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MsG0880043308.01.T01 AT1G64583 23.249 357 249 9 102 440 95 444 4.11e-12 69.3
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MsG0880043308.01.T01 AT1G74750 22.780 259 190 3 188 438 393 649 1.54e-11 68.2
MsG0880043308.01.T01 AT1G74750 24.681 235 137 5 295 490 362 595 5.78e-12 69.3
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MsG0880043308.01.T01 AT1G74750 24.681 235 137 5 295 490 362 595 5.78e-12 69.3
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MsG0880043308.01.T01 AT3G59040 19.525 379 284 7 123 486 139 511 6.79e-12 68.9
MsG0880043308.01.T01 AT4G28010 23.970 267 188 4 239 491 114 379 7.28e-12 68.9
MsG0880043308.01.T01 AT4G28010 21.543 311 227 6 189 487 212 517 2.18e-11 67.4
MsG0880043308.01.T01 AT3G59040 19.525 379 284 7 123 486 146 518 7.96e-12 68.6
MsG0880043308.01.T01 AT1G74850 19.881 337 248 6 164 484 147 477 1.19e-11 68.6
MsG0880043308.01.T01 AT3G53170 25.510 294 193 8 202 478 106 390 1.29e-11 67.4
MsG0880043308.01.T01 AT2G18940 19.205 453 342 6 19 455 284 728 1.77e-11 67.8
MsG0880043308.01.T01 AT3G53170 25.510 294 193 8 202 478 156 440 1.83e-11 67.4
MsG0880043308.01.T01 AT3G53170 25.510 294 193 8 202 478 156 440 1.83e-11 67.4
MsG0880043308.01.T01 AT1G11710 22.414 406 262 12 58 431 194 578 1.97e-11 67.4
MsG0880043308.01.T01 AT3G48810 25.097 259 154 7 253 503 238 464 2.17e-11 67.4
MsG0880043308.01.T01 AT1G11710 21.655 411 259 13 58 431 223 607 2.38e-11 67.4
MsG0880043308.01.T01 AT1G18900 24.603 252 173 8 251 490 354 600 2.89e-11 67.0
MsG0880043308.01.T01 AT1G18900 21.756 262 189 5 188 438 398 654 3.10e-11 67.0
MsG0880043308.01.T01 AT1G18900 24.603 252 173 8 251 490 354 600 3.03e-11 67.0
MsG0880043308.01.T01 AT1G18900 21.756 262 189 5 188 438 398 654 3.57e-11 67.0
MsG0880043308.01.T01 AT1G18900 24.603 252 173 8 251 490 354 600 3.03e-11 67.0
MsG0880043308.01.T01 AT1G18900 21.756 262 189 5 188 438 398 654 3.57e-11 67.0
MsG0880043308.01.T01 AT1G18900 24.603 252 173 8 251 490 354 600 3.03e-11 67.0
MsG0880043308.01.T01 AT1G18900 21.756 262 189 5 188 438 398 654 3.57e-11 67.0
MsG0880043308.01.T01 AT2G39230 20.243 494 339 11 28 490 322 791 3.37e-11 67.0
MsG0880043308.01.T01 AT2G39230 21.769 294 209 5 55 335 558 843 7.31e-11 65.9
MsG0880043308.01.T01 AT5G39980 21.120 393 279 11 117 495 94 469 5.47e-11 66.2
MsG0880043308.01.T01 AT3G16010 21.446 415 238 13 57 440 274 631 6.28e-11 65.9

Find 95 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 117 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TCTTTGGAATGTTATGATTT+TGG 0.158754 8:-22345218 MsG0880043308.01.T01:CDS
ACTTGTCTTGTTGATCTTCT+AGG 0.191638 8:-22344528 MsG0880043308.01.T01:CDS
CCTCAAAATCTCTGCCAAAA+AGG 0.241045 8:-22345864 MsG0880043308.01.T01:CDS
GATACCTTAGGAGCATTTAT+TGG 0.245833 8:-22344441 MsG0880043308.01.T01:CDS
TGTAATAAGTGATGATTCTT+TGG 0.247891 8:-22345234 MsG0880043308.01.T01:CDS
CATGCCCATTTGATAAAGTT+TGG 0.255093 8:-22345815 MsG0880043308.01.T01:CDS
ACATACATTTCTAAAGCATT+AGG 0.294610 8:+22344171 None:intergenic
TCTTTGAAATGGGTTTGATT+TGG 0.313287 8:+22345920 None:intergenic
TTGCAAACTACATTCAAATA+TGG 0.316885 8:-22344415 MsG0880043308.01.T01:CDS
TGTATACAAATGAATTGATT+TGG 0.319094 8:+22344208 None:intergenic
ACATGGACTTCATTGATATA+TGG 0.322491 8:-22344747 MsG0880043308.01.T01:CDS
TAAGATAAACACTCAAAATC+TGG 0.323122 8:+22345765 None:intergenic
GGTTGTAGTTGGATTGAAAT+TGG 0.329440 8:-22344234 MsG0880043308.01.T01:CDS
CAAAACAAATGAACATGGTT+AGG 0.334832 8:+22345896 None:intergenic
CTCTGAGAAATGTTGTTTCA+TGG 0.335761 8:-22345697 MsG0880043308.01.T01:CDS
GGTGAAAGTTGGATTTGATT+TGG 0.337925 8:-22345483 MsG0880043308.01.T01:CDS
CATGGTTAGGGTCTTTGAAA+TGG 0.356637 8:+22345909 None:intergenic
CTAGAAATAGTCGGTTCATC+TGG 0.368906 8:+22344957 None:intergenic
CGCTTGTAGTGTTTCGGTAA+TGG 0.375835 8:+22344905 None:intergenic
CAAGTATAATGTTCTGAATC+AGG 0.379283 8:+22344546 None:intergenic
TATGCATTCCATGGTCTTGC+TGG 0.380047 8:-22344723 MsG0880043308.01.T01:CDS
AAATGGGTTTGATTTGGAAT+TGG 0.383532 8:+22345926 None:intergenic
AAAATCCAAACTTTATCAAA+TGG 0.385303 8:+22345810 None:intergenic
CATACATTTCTAAAGCATTA+GGG 0.387738 8:+22344172 None:intergenic
CCGAGAAAAGCGATTTGATC+TGG 0.389173 8:+22344654 None:intergenic
GTTGATCTTCTAGGAAGATA+TGG 0.392902 8:-22344519 MsG0880043308.01.T01:CDS
TCTCGGCTTGTGCTCATTGT+GGG 0.392969 8:-22344626 MsG0880043308.01.T01:CDS
ATAAGCACTAATCAAAGAAT+TGG 0.398495 8:+22344836 None:intergenic
TGTTGTTCCATGTAGAGATT+TGG 0.405705 8:-22345384 MsG0880043308.01.T01:CDS
GAAAGTGCTAAAAGCCTCTT+CGG 0.412315 8:+22345316 None:intergenic
CAAAAGTTCCTGGTTGTAGT+TGG 0.418084 8:-22344245 MsG0880043308.01.T01:CDS
AGCATGCGCTTGTAGTGTTT+CGG 0.420860 8:+22344899 None:intergenic
ATTATGATTTGCGGTATTGT+TGG 0.422974 8:-22345671 MsG0880043308.01.T01:CDS
TGCGGTTAGAAGCTGCGAAC+GGG 0.423270 8:-22345286 MsG0880043308.01.T01:CDS
ACTACATTCAAATATGGAAC+TGG 0.428092 8:-22344409 MsG0880043308.01.T01:CDS
CATGTAGAGATTTGGTTATG+TGG 0.428766 8:-22345376 MsG0880043308.01.T01:CDS
AAACGTGATGCAAAAGTTCC+TGG 0.431696 8:-22344255 MsG0880043308.01.T01:CDS
ATGGTTAGGGTCTTTGAAAT+GGG 0.437279 8:+22345910 None:intergenic
TTACATTAAACATGCTGCTT+AGG 0.437635 8:-22344149 MsG0880043308.01.T01:CDS
AGGCCAATGAAGGAACAAAA+TGG 0.446795 8:-22344129 MsG0880043308.01.T01:CDS
AAGGATGTTGTTGGAAATGA+TGG 0.458785 8:-22345594 MsG0880043308.01.T01:CDS
CTCTCGGCTTGTGCTCATTG+TGG 0.460995 8:-22344627 MsG0880043308.01.T01:CDS
GAAGTCCATGTAACTAGATC+AGG 0.461392 8:+22344759 None:intergenic
TCATGGAATATTATGATTTG+CGG 0.466852 8:-22345680 MsG0880043308.01.T01:CDS
AAATCCAAACTTTATCAAAT+GGG 0.479807 8:+22345811 None:intergenic
TTAGAAGCTGCGAACGGGGA+TGG 0.480611 8:-22345281 MsG0880043308.01.T01:CDS
GAAGCTGATTCAGATACCTT+AGG 0.481924 8:-22344453 MsG0880043308.01.T01:CDS
CATGGACTACCATGATTGTT+GGG 0.499320 8:-22345049 MsG0880043308.01.T01:CDS
TTTACGCTTCTCAAAAGCAT+TGG 0.499941 8:-22344314 MsG0880043308.01.T01:CDS
TAGAAGCTGCGAACGGGGAT+GGG 0.501245 8:-22345280 MsG0880043308.01.T01:CDS
AGATGCAAAGAAACTGTTTG+AGG 0.502200 8:-22345726 MsG0880043308.01.T01:CDS
CTTTAACTGTTTACCCGAAG+AGG 0.503870 8:-22345330 MsG0880043308.01.T01:CDS
TCAGTTTCATGATATTGAGA+TGG 0.506280 8:-22345528 MsG0880043308.01.T01:CDS
AAAGTGCTAAAAGCCTCTTC+GGG 0.506926 8:+22345317 None:intergenic
CCATTAAAAGTTATATGATC+AGG 0.507789 8:+22345569 None:intergenic
ATTGTTGGGTATGGGAATAA+TGG 0.508613 8:-22345035 MsG0880043308.01.T01:CDS
AGATCCAATAAATGCTCCTA+AGG 0.513844 8:+22344437 None:intergenic
AAAACAAATGAACATGGTTA+GGG 0.519318 8:+22345897 None:intergenic
TCTAGCATTATCAGTTCTTG+TGG 0.521220 8:-22344939 MsG0880043308.01.T01:CDS
CACATAACCAAATCTCTACA+TGG 0.528912 8:+22345377 None:intergenic
CAGTTTCATGATATTGAGAT+GGG 0.529806 8:-22345527 MsG0880043308.01.T01:CDS
ACTACCATGATTGTTGGGTA+TGG 0.530255 8:-22345044 MsG0880043308.01.T01:CDS
CATGCTGCTTAGGCCAATGA+AGG 0.531235 8:-22344139 MsG0880043308.01.T01:CDS
GTATCTGAATCAGCTTCAAT+CGG 0.533339 8:+22344459 None:intergenic
GCATGGACTACCATGATTGT+TGG 0.536064 8:-22345050 MsG0880043308.01.T01:CDS
CTTTGTTGAGAATGCAAGGA+GGG 0.544465 8:-22345414 MsG0880043308.01.T01:CDS
TACAGCCTGATCTAGTTACA+TGG 0.546691 8:-22344764 MsG0880043308.01.T01:CDS
ATTCCCATACCCAACAATCA+TGG 0.553627 8:+22345040 None:intergenic
CTGATAATGCTAGAAATAGT+CGG 0.554409 8:+22344948 None:intergenic
TGAGAGAGATGCTTCGCGAA+GGG 0.555892 8:-22344986 MsG0880043308.01.T01:CDS
TCAAAAGCATTGGTATGATG+TGG 0.558823 8:-22344304 MsG0880043308.01.T01:CDS
ATATATGGATATGCATTCCA+TGG 0.574390 8:-22344732 MsG0880043308.01.T01:CDS
GGGTATGGGAATAATGGTGA+TGG 0.580168 8:-22345029 MsG0880043308.01.T01:CDS
ATTAGTGCTTATTCAAAGTG+TGG 0.588612 8:-22344825 MsG0880043308.01.T01:CDS
CTACCATGATTGTTGGGTAT+GGG 0.595836 8:-22345043 MsG0880043308.01.T01:CDS
AGGAACAATCTGATACGCAT+TGG 0.597347 8:+22344566 None:intergenic
ATGAGAGAGATGCTTCGCGA+AGG 0.601763 8:-22344987 MsG0880043308.01.T01:CDS
ATGCGGTTAGAAGCTGCGAA+CGG 0.607036 8:-22345287 MsG0880043308.01.T01:CDS
GAATAATGGTGATGGTAATG+AGG 0.612551 8:-22345021 MsG0880043308.01.T01:CDS
GTGGCTTTGTTGAGAATGCA+AGG 0.623149 8:-22345418 MsG0880043308.01.T01:CDS
CGATTCGAAATGTTGTGGCA+TGG 0.626239 8:-22345067 MsG0880043308.01.T01:CDS
GTTGATTTATATGCAAAATG+TGG 0.628596 8:-22345437 MsG0880043308.01.T01:CDS
CATTGTGGGCTAGTGACGAA+GGG 0.629994 8:-22344612 MsG0880043308.01.T01:CDS
GCGGTTAGAAGCTGCGAACG+GGG 0.638247 8:-22345285 MsG0880043308.01.T01:CDS
TCATTGTGGGCTAGTGACGA+AGG 0.638749 8:-22344613 MsG0880043308.01.T01:CDS
ACTAATCAAAGAATTGGCAA+CGG 0.645535 8:+22344842 None:intergenic
GGAAAGAATACGCAAAACGA+TGG 0.646887 8:-22344283 MsG0880043308.01.T01:CDS
TTAGCACTTTCAACTCGATG+CGG 0.651971 8:-22345304 MsG0880043308.01.T01:CDS
TGGAACAAAACAAATGAACA+TGG 0.665398 8:+22345891 None:intergenic
ATTTCAATCCAACTACAACC+AGG 0.671930 8:+22344237 None:intergenic
CATGAAACAACATTTCTCAG+AGG 0.672378 8:+22345698 None:intergenic
TTTGAGAAAATGCTATCATG+TGG 0.706695 8:-22344684 MsG0880043308.01.T01:CDS
GACGATGAAAATGAATCGAG+TGG 0.724826 8:-22345644 MsG0880043308.01.T01:CDS
GCTTTGTTGAGAATGCAAGG+AGG 0.764341 8:-22345415 MsG0880043308.01.T01:CDS
GATGTCGATTCGAAATGTTG+TGG 0.775217 8:-22345072 MsG0880043308.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAAATCCAAACTTTATCAAA+TGG + Chr8:22344238-22344257 None:intergenic 20.0%
!! AAATCCAAACTTTATCAAAT+GGG + Chr8:22344237-22344256 None:intergenic 20.0%
!! TGTATACAAATGAATTGATT+TGG + Chr8:22345840-22345859 None:intergenic 20.0%
!!! ATCGATAATATTTTCGTTTT+TGG + Chr8:22344933-22344952 None:intergenic 20.0%
! AAAACAAATGAACATGGTTA+GGG + Chr8:22344151-22344170 None:intergenic 25.0%
! ATAAGCACTAATCAAAGAAT+TGG + Chr8:22345212-22345231 None:intergenic 25.0%
! CCATTAAAAGTTATATGATC+AGG + Chr8:22344479-22344498 None:intergenic 25.0%
! TAAGATAAACACTCAAAATC+TGG + Chr8:22344283-22344302 None:intergenic 25.0%
! TCATGGAATATTATGATTTG+CGG - Chr8:22344365-22344384 MsG0880043308.01.T01:CDS 25.0%
! TGTAATAAGTGATGATTCTT+TGG - Chr8:22344811-22344830 MsG0880043308.01.T01:CDS 25.0%
! TTGCAAACTACATTCAAATA+TGG - Chr8:22345630-22345649 MsG0880043308.01.T01:CDS 25.0%
!! CCTGATCATATAACTTTTAA+TGG - Chr8:22344476-22344495 MsG0880043308.01.T01:CDS 25.0%
!! GTTGATTTATATGCAAAATG+TGG - Chr8:22344608-22344627 MsG0880043308.01.T01:CDS 25.0%
!!! ACATACATTTCTAAAGCATT+AGG + Chr8:22345877-22345896 None:intergenic 25.0%
!!! ATTTGATTCAGATGTTTTAG+TGG - Chr8:22344883-22344902 MsG0880043308.01.T01:CDS 25.0%
!!! CATACATTTCTAAAGCATTA+GGG + Chr8:22345876-22345895 None:intergenic 25.0%
!!! TCTTTGGAATGTTATGATTT+TGG - Chr8:22344827-22344846 MsG0880043308.01.T01:CDS 25.0%
!!! TGTGTTTTTCTTATTTTCGA+AGG - Chr8:22344432-22344451 MsG0880043308.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTGATTTGGATTGTTTTGT+TGG - Chr8:22344575-22344594 MsG0880043308.01.T01:CDS 25.0%
ACATGGACTTCATTGATATA+TGG - Chr8:22345298-22345317 MsG0880043308.01.T01:CDS 30.0%
ACTAATCAAAGAATTGGCAA+CGG + Chr8:22345206-22345225 None:intergenic 30.0%
ACTACATTCAAATATGGAAC+TGG - Chr8:22345636-22345655 MsG0880043308.01.T01:CDS 30.0%
ATATATGGATATGCATTCCA+TGG - Chr8:22345313-22345332 MsG0880043308.01.T01:CDS 30.0%
ATTAGTGCTTATTCAAAGTG+TGG - Chr8:22345220-22345239 MsG0880043308.01.T01:CDS 30.0%
CAAAACAAATGAACATGGTT+AGG + Chr8:22344152-22344171 None:intergenic 30.0%
CAGTTTCATGATATTGAGAT+GGG - Chr8:22344518-22344537 MsG0880043308.01.T01:CDS 30.0%
TCAGTTTCATGATATTGAGA+TGG - Chr8:22344517-22344536 MsG0880043308.01.T01:CDS 30.0%
TGGAACAAAACAAATGAACA+TGG + Chr8:22344157-22344176 None:intergenic 30.0%
TTTGAGAAAATGCTATCATG+TGG - Chr8:22345361-22345380 MsG0880043308.01.T01:CDS 30.0%
! ATACCATTTTGTTCCTTCAT+TGG + Chr8:22345922-22345941 None:intergenic 30.0%
! ATTATGATTTGCGGTATTGT+TGG - Chr8:22344374-22344393 MsG0880043308.01.T01:CDS 30.0%
! CAAGTATAATGTTCTGAATC+AGG + Chr8:22345502-22345521 None:intergenic 30.0%
! CTGATAATGCTAGAAATAGT+CGG + Chr8:22345100-22345119 None:intergenic 30.0%
! TTACATTAAACATGCTGCTT+AGG - Chr8:22345896-22345915 MsG0880043308.01.T01:CDS 30.0%
! TTATTTTCGAAGGATGTTGT+TGG - Chr8:22344442-22344461 MsG0880043308.01.T01:CDS 30.0%
!! AAATGGGTTTGATTTGGAAT+TGG + Chr8:22344122-22344141 None:intergenic 30.0%
!! AGTTCAGTTGCATTGTTTTA+TGG - Chr8:22344541-22344560 MsG0880043308.01.T01:CDS 30.0%
!! CATTGTTTTATGGTGAAAGT+TGG - Chr8:22344551-22344570 MsG0880043308.01.T01:CDS 30.0%
!! TCTTTGAAATGGGTTTGATT+TGG + Chr8:22344128-22344147 None:intergenic 30.0%
!!! ACTCAAAATCTGGTTTTGTA+AGG + Chr8:22344273-22344292 None:intergenic 30.0%
AAGGATGTTGTTGGAAATGA+TGG - Chr8:22344451-22344470 MsG0880043308.01.T01:CDS 35.0%
AGATCCAATAAATGCTCCTA+AGG + Chr8:22345611-22345630 None:intergenic 35.0%
AGATGCAAAGAAACTGTTTG+AGG - Chr8:22344319-22344338 MsG0880043308.01.T01:CDS 35.0%
ATTGTTGGGTATGGGAATAA+TGG - Chr8:22345010-22345029 MsG0880043308.01.T01:CDS 35.0%
ATTTCAATCCAACTACAACC+AGG + Chr8:22345811-22345830 None:intergenic 35.0%
CACATAACCAAATCTCTACA+TGG + Chr8:22344671-22344690 None:intergenic 35.0%
CATGAAACAACATTTCTCAG+AGG + Chr8:22344350-22344369 None:intergenic 35.0%
CATGCCCATTTGATAAAGTT+TGG - Chr8:22344230-22344249 MsG0880043308.01.T01:CDS 35.0%
CTCAAAATCTCTGCCAAAAA+GGG - Chr8:22344182-22344201 MsG0880043308.01.T01:CDS 35.0%
GGTGAAAGTTGGATTTGATT+TGG - Chr8:22344562-22344581 MsG0880043308.01.T01:CDS 35.0%
GGTTGTAGTTGGATTGAAAT+TGG - Chr8:22345811-22345830 MsG0880043308.01.T01:CDS 35.0%
GTATCTGAATCAGCTTCAAT+CGG + Chr8:22345589-22345608 None:intergenic 35.0%
TCTAGCATTATCAGTTCTTG+TGG - Chr8:22345106-22345125 MsG0880043308.01.T01:CDS 35.0%
TGTTGTTCCATGTAGAGATT+TGG - Chr8:22344661-22344680 MsG0880043308.01.T01:CDS 35.0%
! ACTTGTCTTGTTGATCTTCT+AGG - Chr8:22345517-22345536 MsG0880043308.01.T01:CDS 35.0%
! CATGTAGAGATTTGGTTATG+TGG - Chr8:22344669-22344688 MsG0880043308.01.T01:CDS 35.0%
! GCATAGTTTACACTCTTTTC+TGG + Chr8:22345697-22345716 None:intergenic 35.0%
! GTTGATCTTCTAGGAAGATA+TGG - Chr8:22345526-22345545 MsG0880043308.01.T01:CDS 35.0%
! TTTACGCTTCTCAAAAGCAT+TGG - Chr8:22345731-22345750 MsG0880043308.01.T01:CDS 35.0%
!! ATGGTTAGGGTCTTTGAAAT+GGG + Chr8:22344138-22344157 None:intergenic 35.0%
!! CTCTGAGAAATGTTGTTTCA+TGG - Chr8:22344348-22344367 MsG0880043308.01.T01:CDS 35.0%
!! CTTTTTGGCAGAGATTTTGA+GGG + Chr8:22344183-22344202 None:intergenic 35.0%
!! GAATAATGGTGATGGTAATG+AGG - Chr8:22345024-22345043 MsG0880043308.01.T01:CDS 35.0%
!! GATACCTTAGGAGCATTTAT+TGG - Chr8:22345604-22345623 MsG0880043308.01.T01:CDS 35.0%
!! TCAAAAGCATTGGTATGATG+TGG - Chr8:22345741-22345760 MsG0880043308.01.T01:CDS 35.0%
AAAAAGGGCTATCTTCCTGA+AGG - Chr8:22344197-22344216 MsG0880043308.01.T01:CDS 40.0%
AAACGTGATGCAAAAGTTCC+TGG - Chr8:22345790-22345809 MsG0880043308.01.T01:CDS 40.0%
ACTACCATGATTGTTGGGTA+TGG - Chr8:22345001-22345020 MsG0880043308.01.T01:CDS 40.0%
AGGAACAATCTGATACGCAT+TGG + Chr8:22345482-22345501 None:intergenic 40.0%
AGGCCAATGAAGGAACAAAA+TGG - Chr8:22345916-22345935 MsG0880043308.01.T01:CDS 40.0%
ATTCCCATACCCAACAATCA+TGG + Chr8:22345008-22345027 None:intergenic 40.0%
CAAAAGTTCCTGGTTGTAGT+TGG - Chr8:22345800-22345819 MsG0880043308.01.T01:CDS 40.0%
CCTCAAAATCTCTGCCAAAA+AGG - Chr8:22344181-22344200 MsG0880043308.01.T01:CDS 40.0%
CTACCATGATTGTTGGGTAT+GGG - Chr8:22345002-22345021 MsG0880043308.01.T01:CDS 40.0%
CTTTAACTGTTTACCCGAAG+AGG - Chr8:22344715-22344734 MsG0880043308.01.T01:CDS 40.0%
CTTTGTTGAGAATGCAAGGA+GGG - Chr8:22344631-22344650 MsG0880043308.01.T01:CDS 40.0%
GAAGTCCATGTAACTAGATC+AGG + Chr8:22345289-22345308 None:intergenic 40.0%
GACGATGAAAATGAATCGAG+TGG - Chr8:22344401-22344420 MsG0880043308.01.T01:CDS 40.0%
GGAAAGAATACGCAAAACGA+TGG - Chr8:22345762-22345781 MsG0880043308.01.T01:CDS 40.0%
TACAGCCTGATCTAGTTACA+TGG - Chr8:22345281-22345300 MsG0880043308.01.T01:CDS 40.0%
TTAGCACTTTCAACTCGATG+CGG - Chr8:22344741-22344760 MsG0880043308.01.T01:CDS 40.0%
! AAAGTGCTAAAAGCCTCTTC+GGG + Chr8:22344731-22344750 None:intergenic 40.0%
! CATGGACTACCATGATTGTT+GGG - Chr8:22344996-22345015 MsG0880043308.01.T01:CDS 40.0%
! CATGGTTAGGGTCTTTGAAA+TGG + Chr8:22344139-22344158 None:intergenic 40.0%
! CTAGAAATAGTCGGTTCATC+TGG + Chr8:22345091-22345110 None:intergenic 40.0%
! GAAGCTGATTCAGATACCTT+AGG - Chr8:22345592-22345611 MsG0880043308.01.T01:CDS 40.0%
! GCATGTAACTGTTTTCCTTC+AGG + Chr8:22344215-22344234 None:intergenic 40.0%
! TTCAGGAAGATAGCCCTTTT+TGG + Chr8:22344198-22344217 None:intergenic 40.0%
!! CCAGATCAAATCGCTTTTCT+CGG - Chr8:22345391-22345410 MsG0880043308.01.T01:CDS 40.0%
!! CCTTTTTGGCAGAGATTTTG+AGG + Chr8:22344184-22344203 None:intergenic 40.0%
!! GAAAGTGCTAAAAGCCTCTT+CGG + Chr8:22344732-22344751 None:intergenic 40.0%
!! GATGTCGATTCGAAATGTTG+TGG - Chr8:22344973-22344992 MsG0880043308.01.T01:CDS 40.0%
AGCATGCGCTTGTAGTGTTT+CGG + Chr8:22345149-22345168 None:intergenic 45.0%
CCGAGAAAAGCGATTTGATC+TGG + Chr8:22345394-22345413 None:intergenic 45.0%
CGATTCGAAATGTTGTGGCA+TGG - Chr8:22344978-22344997 MsG0880043308.01.T01:CDS 45.0%
CGCTTGTAGTGTTTCGGTAA+TGG + Chr8:22345143-22345162 None:intergenic 45.0%
GGGTATGGGAATAATGGTGA+TGG - Chr8:22345016-22345035 MsG0880043308.01.T01:CDS 45.0%
! ACTACAAGCGCATGCTTTTG+CGG - Chr8:22345153-22345172 MsG0880043308.01.T01:CDS 45.0%
! GCATGGACTACCATGATTGT+TGG - Chr8:22344995-22345014 MsG0880043308.01.T01:CDS 45.0%
! GCTTTGTTGAGAATGCAAGG+AGG - Chr8:22344630-22344649 MsG0880043308.01.T01:CDS 45.0%
! TATGCATTCCATGGTCTTGC+TGG - Chr8:22345322-22345341 MsG0880043308.01.T01:CDS 45.0%
!! GTGGCTTTGTTGAGAATGCA+AGG - Chr8:22344627-22344646 MsG0880043308.01.T01:CDS 45.0%
!! TTGCTTTTCCAGCAAGACCA+TGG + Chr8:22345333-22345352 None:intergenic 45.0%
ATGAGAGAGATGCTTCGCGA+AGG - Chr8:22345058-22345077 MsG0880043308.01.T01:CDS 50.0%
ATGCGGTTAGAAGCTGCGAA+CGG - Chr8:22344758-22344777 MsG0880043308.01.T01:CDS 50.0%
TGAGAGAGATGCTTCGCGAA+GGG - Chr8:22345059-22345078 MsG0880043308.01.T01:CDS 50.0%
! CATGCTGCTTAGGCCAATGA+AGG - Chr8:22345906-22345925 MsG0880043308.01.T01:CDS 50.0%
! TCTCGGCTTGTGCTCATTGT+GGG - Chr8:22345419-22345438 MsG0880043308.01.T01:CDS 50.0%
!! CATTGTGGGCTAGTGACGAA+GGG - Chr8:22345433-22345452 MsG0880043308.01.T01:CDS 50.0%
!! TCATTGTGGGCTAGTGACGA+AGG - Chr8:22345432-22345451 MsG0880043308.01.T01:CDS 50.0%
TAGAAGCTGCGAACGGGGAT+GGG - Chr8:22344765-22344784 MsG0880043308.01.T01:CDS 55.0%
TGCGGTTAGAAGCTGCGAAC+GGG - Chr8:22344759-22344778 MsG0880043308.01.T01:CDS 55.0%
TTAGAAGCTGCGAACGGGGA+TGG - Chr8:22344764-22344783 MsG0880043308.01.T01:CDS 55.0%
! CGCTTTTCTCGGCGTTCTCT+CGG - Chr8:22345402-22345421 MsG0880043308.01.T01:CDS 55.0%
! CTCTCGGCTTGTGCTCATTG+TGG - Chr8:22345418-22345437 MsG0880043308.01.T01:CDS 55.0%
!! GGCAGAGATTTTGAGGGCGT+TGG + Chr8:22344177-22344196 None:intergenic 55.0%
GCGGTTAGAAGCTGCGAACG+GGG - Chr8:22344760-22344779 MsG0880043308.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr8 gene 22344116 22345951 22344116 ID=MsG0880043308.01;Name=MsG0880043308.01
Chr8 mRNA 22344116 22345951 22344116 ID=MsG0880043308.01.T01;Parent=MsG0880043308.01;Name=MsG0880043308.01.T01;_AED=0.50;_eAED=0.50;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|611
Chr8 exon 22344116 22345951 22344116 ID=MsG0880043308.01.T01:exon:1246;Parent=MsG0880043308.01.T01
Chr8 CDS 22344116 22345951 22344116 ID=MsG0880043308.01.T01:cds;Parent=MsG0880043308.01.T01
Gene Sequence

>MsG0880043308.01.T01

ATGCCAATTCCAAATCAAACCCATTTCAAAGACCCTAACCATGTTCATTTGTTTTGTTCCAACGCCCTCAAAATCTCTGCCAAAAAGGGCTATCTTCCTGAAGGAAAACAGTTACATGCCCATTTGATAAAGTTTGGATTTTGTCAAGTTCTTTCCTTACAAAACCAGATTTTGAGTGTTTATCTTAAATGTCAAGAAACTGAAGATGCAAAGAAACTGTTTGAGGAATTGCCTCTGAGAAATGTTGTTTCATGGAATATTATGATTTGCGGTATTGTTGGATGTGACGATGAAAATGAATCGAGTGGTATGCGATTGTGTTTTTCTTATTTTCGAAGGATGTTGTTGGAAATGATGGTTCCTGATCATATAACTTTTAATGGTTTGATTTGTTTGTGTACTCAGTTTCATGATATTGAGATGGGAGTTCAGTTGCATTGTTTTATGGTGAAAGTTGGATTTGATTTGGATTGTTTTGTTGGTTGTGCTCTTGTTGATTTATATGCAAAATGTGGCTTTGTTGAGAATGCAAGGAGGGTTTTTTGTGTTGTTCCATGTAGAGATTTGGTTATGTGGAATGTGATGATTTCTTGTTATGTCTTTAACTGTTTACCCGAAGAGGCTTTTAGCACTTTCAACTCGATGCGGTTAGAAGCTGCGAACGGGGATGGGTTCACTTTTAGTAGCTTGCTTAGTGTAATAAGTGATGATTCTTTGGAATGTTATGATTTTGGAAAGCAAGTTCATAGTCTAGTTCTGAGACAATCATTTGATTCAGATGTTTTAGTGGCTAGTGCATTGATCAACATGTATGCCAAAAACGAAAATATTATCGATGCACGAAGAGTATTTGATGAGATGTCGATTCGAAATGTTGTGGCATGGACTACCATGATTGTTGGGTATGGGAATAATGGTGATGGTAATGAGGTTATGAAGCTTATGAGAGAGATGCTTCGCGAAGGGTTTCTTCCAGATGAACCGACTATTTCTAGCATTATCAGTTCTTGTGGCTATGCTTCTGCCATTACCGAAACACTACAAGCGCATGCTTTTGCGGTTAAATTATCATGTCAAGATTTTTTATCCGTTGCCAATTCTTTGATTAGTGCTTATTCAAAGTGTGGTAGCATTACTAGCGCATTTAAATGCTTTGAATTAACTTTACAGCCTGATCTAGTTACATGGACTTCATTGATATATGGATATGCATTCCATGGTCTTGCTGGAAAAGCAACTGAGATGTTTGAGAAAATGCTATCATGTGGCATAAAACCAGATCAAATCGCTTTTCTCGGCGTTCTCTCGGCTTGTGCTCATTGTGGGCTAGTGACGAAGGGACTTTACTACTTCAAATTAATGACCAATGCGTATCAGATTGTTCCTGATTCAGAACATTATACTTGTCTTGTTGATCTTCTAGGAAGATATGGTCTTATTAATGAAGCTTTTGAAATCTTGAGATTAATGCCGATTGAAGCTGATTCAGATACCTTAGGAGCATTTATTGGATCTTGCAAACTACATTCAAATATGGAACTGGCTAAATTAGCTGCAGAAAAAATCTTCTTCATTGAACCAGAAAAGAGTGTAAACTATGCAGTGATGTCGAACATTTACGCTTCTCAAAAGCATTGGTATGATGTGGAAAGAATACGCAAAACGATGGAAGACAAACGTGATGCAAAAGTTCCTGGTTGTAGTTGGATTGAAATTGGTAACCAAATCAATTCATTTGTATACAATGATAAATCACACCCTAATGCTTTAGAAATGTATGTTACATTAAACATGCTGCTTAGGCCAATGAAGGAACAAAATGGTATTCATTTGTAA
Protein sequence

>MsG0880043308.01.T01

MPIPNQTHFKDPNHVHLFCSNALKISAKKGYLPEGKQLHAHLIKFGFCQVLSLQNQILSVYLKCQETEDAKKLFEELPLRNVVSWNIMICGIVGCDDENESSGMRLCFSYFRRMLLEMMVPDHITFNGLICLCTQFHDIEMGVQLHCFMVKVGFDLDCFVGCALVDLYAKCGFVENARRVFCVVPCRDLVMWNVMISCYVFNCLPEEAFSTFNSMRLEAANGDGFTFSSLLSVISDDSLECYDFGKQVHSLVLRQSFDSDVLVASALINMYAKNENIIDARRVFDEMSIRNVVAWTTMIVGYGNNGDGNEVMKLMREMLREGFLPDEPTISSIISSCGYASAITETLQAHAFAVKLSCQDFLSVANSLISAYSKCGSITSAFKCFELTLQPDLVTWTSLIYGYAFHGLAGKATEMFEKMLSCGIKPDQIAFLGVLSACAHCGLVTKGLYYFKLMTNAYQIVPDSEHYTCLVDLLGRYGLINEAFEILRLMPIEADSDTLGAFIGSCKLHSNMELAKLAAEKIFFIEPEKSVNYAVMSNIYASQKHWYDVERIRKTMEDKRDAKVPGCSWIEIGNQINSFVYNDKSHPNALEMYVTLNMLLRPMKEQNGIHL*